##fileformat=VCFv4.2
##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele fractions of alternate alleles in the tumor">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth (reads with MQ=255 or with bad mates are filtered)">
##FORMAT=<ID=F1R2,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F1R2 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=F2R1,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F2R1 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=PGT,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing haplotype information, describing how the alternate alleles are phased in relation to one another">
##FORMAT=<ID=PID,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing ID information, where each unique ID within a given sample (but not across samples) connects records within a phasing group">
##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for genotypes as defined in the VCF specification">
##FORMAT=<ID=PS,Number=1,Type=Integer,Description="Phasing set (typically the position of the first variant in the set)">
##FORMAT=<ID=SB,Number=4,Type=Integer,Description="Per-sample component statistics which comprise the Fisher's Exact Test to detect strand bias.">
##GATKCommandLine=<ID=Mutect2,CommandLine="Mutect2  --tumor-sample CAN12_R --panel-of-normals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/HPON.vcf --output /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/08_variant_calling/mutect2/CAN12_R.vcf --max-reads-per-alignment-start 500 --activity-profile-out CAN12_R_activity_profile --assembly-region-out CAN12_R_assembly_region --intervals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/seqCap_VCRome_V2_intervals_list.intervals --interval-set-rule UNION --interval-padding 100 --interval-exclusion-padding 0 --interval-merging-rule ALL --input /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/07_BQSR/BQSR/CAN12_R.bam --read-validation-stringency SILENT --reference /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Reference_genome/ucsc.hg19.fasta  --f1r2-median-mq 50 --f1r2-min-bq 20 --f1r2-max-depth 200 --genotype-pon-sites false --genotype-germline-sites false --af-of-alleles-not-in-resource -1.0 --mitochondria-mode false --tumor-lod-to-emit 3.0 --initial-tumor-lod 2.0 --pcr-snv-qual 40 --pcr-indel-qual 40 --max-population-af 0.01 --downsampling-stride 1 --callable-depth 10 --max-suspicious-reads-per-alignment-start 0 --normal-lod 2.2 --ignore-itr-artifacts false --gvcf-lod-band -2.5 --gvcf-lod-band -2.0 --gvcf-lod-band -1.5 --gvcf-lod-band -1.0 --gvcf-lod-band -0.5 --gvcf-lod-band 0.0 --gvcf-lod-band 0.5 --gvcf-lod-band 1.0 --minimum-allele-fraction 0.0 --genotype-filtered-alleles false --disable-adaptive-pruning false --dont-trim-active-regions false --max-disc-ar-extension 25 --max-gga-ar-extension 300 --padding-around-indels 150 --padding-around-snps 20 --kmer-size 10 --kmer-size 25 --dont-increase-kmer-sizes-for-cycles false --allow-non-unique-kmers-in-ref false --num-pruning-samples 1 --min-dangling-branch-length 4 --recover-all-dangling-branches false --max-num-haplotypes-in-population 128 --min-pruning 2 --adaptive-pruning-initial-error-rate 0.001 --pruning-lod-threshold 2.302585092994046 --max-unpruned-variants 100 --debug-assembly false --debug-graph-transformations false --capture-assembly-failure-bam false --error-correct-reads false --kmer-length-for-read-error-correction 25 --min-observations-for-kmer-to-be-solid 20 --likelihood-calculation-engine PairHMM --base-quality-score-threshold 18 --pair-hmm-gap-continuation-penalty 10 --pair-hmm-implementation FASTEST_AVAILABLE --pcr-indel-model CONSERVATIVE --phred-scaled-global-read-mismapping-rate 45 --native-pair-hmm-threads 4 --native-pair-hmm-use-double-precision false --bam-writer-type CALLED_HAPLOTYPES --dont-use-soft-clipped-bases false --min-base-quality-score 10 --smith-waterman JAVA --emit-ref-confidence NONE --max-mnp-distance 1 --min-assembly-region-size 50 --max-assembly-region-size 300 --assembly-region-padding 100 --active-probability-threshold 0.002 --max-prob-propagation-distance 50 --force-active false --seconds-between-progress-updates 10.0 --disable-sequence-dictionary-validation false --create-output-bam-index true --create-output-bam-md5 false --create-output-variant-index true --create-output-variant-md5 false --lenient false --add-output-sam-program-record true --add-output-vcf-command-line true --cloud-prefetch-buffer 40 --cloud-index-prefetch-buffer -1 --disable-bam-index-caching false --sites-only-vcf-output false --help false --version false --showHidden false --verbosity INFO --QUIET false --use-jdk-deflater false --use-jdk-inflater false --gcs-max-retries 20 --gcs-project-for-requester-pays  --disable-tool-default-read-filters false --max-read-length 2147483647 --min-read-length 30 --minimum-mapping-quality 20 --disable-tool-default-annotations false --enable-all-annotations false",Version="4.1.2.0",Date="March 1, 2022 4:34:34 PM CET">
##INFO=<ID=CONTQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to contamination">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth; some reads may have been filtered">
##INFO=<ID=ECNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of events in this haplotype">
##INFO=<ID=GERMQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not germline variants">
##INFO=<ID=MBQ,Number=R,Type=Integer,Description="median base quality">
##INFO=<ID=MFRL,Number=R,Type=Integer,Description="median fragment length">
##INFO=<ID=MMQ,Number=R,Type=Integer,Description="median mapping quality">
##INFO=<ID=MPOS,Number=A,Type=Integer,Description="median distance from end of read">
##INFO=<ID=NALOD,Number=A,Type=Float,Description="Negative log 10 odds of artifact in normal with same allele fraction as tumor">
##INFO=<ID=NCount,Number=1,Type=Integer,Description="Count of N bases in the pileup">
##INFO=<ID=NLOD,Number=A,Type=Float,Description="Normal log 10 likelihood ratio of diploid het or hom alt genotypes">
##INFO=<ID=OCM,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alt reads whose original alignment doesn't match the current contig.">
##INFO=<ID=PON,Number=0,Type=Flag,Description="site found in panel of normals">
##INFO=<ID=POPAF,Number=A,Type=Float,Description="negative log 10 population allele frequencies of alt alleles">
##INFO=<ID=ROQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to read orientation artifact">
##INFO=<ID=RPA,Number=.,Type=Integer,Description="Number of times tandem repeat unit is repeated, for each allele (including reference)">
##INFO=<ID=RU,Number=1,Type=String,Description="Tandem repeat unit (bases)">
##INFO=<ID=SEQQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not sequencing errors">
##INFO=<ID=STR,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is a short tandem repeat">
##INFO=<ID=STRANDQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality of strand bias artifact">
##INFO=<ID=STRQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles in STRs are not polymerase slippage errors">
##INFO=<ID=TLOD,Number=A,Type=Float,Description="Log 10 likelihood ratio score of variant existing versus not existing">
##INFO=<ID=UNIQ_ALT_READ_COUNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of ALT reads with unique start and mate end positions at a variant site">
##MutectVersion=2.2
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##filtering_status=Warning: unfiltered Mutect 2 calls.  Please run FilterMutectCalls to remove false positives.
##source=Mutect2
##tumor_sample=CAN12_R
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	CAN12_R
chr1	566130	.	C	T	.	.	DP=223;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=724.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,219:0.996:219:0,123:0,89:0,0,142,77
chr1	566206	.	A	G	.	.	DP=347;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=1159.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,330:0.994:331:0,167:1,158:0,1,154,176
chr1	566371	.	A	G	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=109,182;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=292.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,84:0.978:85:1,40:0,42:0,1,13,71
chr1	861437	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:861437_G_A:861437:0,2,0,1
chr1	861439	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:861437_G_A:861437:0,2,0,1
chr1	866319	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	866511	.	C	CCCCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=118,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCCT;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	871334	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=194,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	876499	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	880238	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	880390	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,1:4,1,6,0
chr1	883625	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=90.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,9:0,0,8,18
chr1	883666	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:0,7,0,6
chr1	886671	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=166,174;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:3,2:0|1:886671_C_T:886671:0,13,0,2
chr1	886677	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=166,174;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:886671_C_T:886671:0,13,0,2
chr1	887560	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,5:0,0,1,13
chr1	889158	.	GA	CC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	892460	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:4,2,1,1
chr1	892745	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	897730	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.302:23:9,4:7,1:12,4,5,2
chr1	901806	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,5:7,5:13,0,9,1
chr1	902069	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=197,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:1,5,1,3
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chr1	906688	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=135,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.346:9:5,1:1,2:0|1:906683_A_ACGGC:906683:1,5,3,0
chr1	906694	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=154,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:7,0:1,2:0|1:906683_A_ACGGC:906683:3,6,2,0
chr1	909289	.	C	CTTT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=170,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,2:4,0:0|1:909289_C_CTTT:909289:3,5,1,1
chr1	909290	.	C	CCCT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=170,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:909289_C_CTTT:909289:3,5,1,1
chr1	909292	.	C	CGCCTTCCACCA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=170,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:3,0:0|1:909289_C_CTTT:909289:3,5,1,1
chr1	909309	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=171,204;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,1:4,1:2,3,1,1
chr1	914192	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=159,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,0:2,3:4,0,3,1
chr1	948846	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=53.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr1	948870	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,4:6,6:11,1,9,1
chr1	948921	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,26:0.588:44:12,11:5,13:12,6,20,6
chr1	957879	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=198764920,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:957879_G_A:957879:1,0,0,1
chr1	957881	.	CA	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=198764920,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:957879_G_A:957879:1,0,0,1
chr1	977330	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,8,4
chr1	978603	.	CCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,6,2
chr1	980460	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,9:0,0,19,1
chr1	981087	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr1	982941	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,8:0,0,12,5
chr1	982957	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.222:18:5,1:7,0:7,7,4,0
chr1	985266	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	986720	.	T	TGTGGAG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.224:11:7,2:1,0:0|1:986720_T_TGTGGAG:986720:2,7,1,1
chr1	986721	.	C	CCACAGTTGTGCTGTG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=165,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.224:11:7,2:2,0:0|1:986720_T_TGTGGAG:986720:2,7,1,1
chr1	988930	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:988930_C_A:988930:0,0,0,1
chr1	988932	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:988930_C_A:988930:0,0,0,1
chr1	1019383	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=152,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,4:0,5,3,2
chr1	1021415	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,0,6
chr1	1025656	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=121,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:6,0,4,0
chr1	1026801	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:5,3,8,0
chr1	1115809	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0|1:1115809_A_C:1115809:0,5,3,0
chr1	1115810	.	T	TGCC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,0:0|1:1115809_A_C:1115809:0,5,3,0
chr1	1115814	.	CAA	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,1:0|1:1115809_A_C:1115809:0,5,3,0
chr1	1154193	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,1:8,1:10,9,2,0
chr1	1158682	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:12,2:9,0:13,11,1,1
chr1	1159391	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	1201742	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=183,173;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr1	1229680	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr1	1235328	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=250,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,0:1,0:2,2,3,0
chr1	1246831	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1247578	.	T	TGGGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,14;RU=G;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr1	1247600	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=213,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,0:0|1:1247600_G_C:1247600:1,2,2,0
chr1	1247604	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=213,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0|1:1247600_G_C:1247600:1,2,2,0
chr1	1247625	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=259,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr1	1247943	.	A	ACCCTGCCCTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=CCCTG;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:4,0:0,1:3,1,1,1
chr1	1254136	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,18,0
chr1	1254953	.	T	TTTTAAAAGTTAGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=16,33;MFRL=145,234;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	1257273	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.148:33:17,0:10,0:11,16,6,0
chr1	1257278	.	T	TACCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.363:28:10,3:8,0:3,15,10,0
chr1	1257282	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.428:28:9,1:7,0:1,15,12,0
chr1	1257286	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:10,2:9,0:5,15,7,0
chr1	1268847	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,5:0,0,0,6
chr1	1271623	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=201,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1271623_CA_C:1271623:1,0,0,1
chr1	1271629	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=201,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1271623_CA_C:1271623:1,0,0,1
chr1	1271631	.	CCCCCGGG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=201,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:1271623_CA_C:1271623:1,0,0,1
chr1	1273278	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	1275935	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=14,13;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.587:7:1,0:0,1:1,2,0,4
chr1	1276973	.	G	GACAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AC;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,0:0,0,4,1
chr1	1278237	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1284490	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	1288583	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr1	1288823	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,1,4
chr1	1289367	.	CTG	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,17,2
chr1	1289911	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr1	1292119	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,8:0.159:48:12,0:21,0:0|1:1292119_A_C:1292119:6,34,8,0
chr1	1292121	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,8:0.159:48:16,0:21,0:0|1:1292119_A_C:1292119:6,34,8,0
chr1	1292127	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,6:0.152:42:14,1:19,5:0|1:1292119_A_C:1292119:3,33,6,0
chr1	1292131	.	AG	CC	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.159:40:14,1:17,4:0|1:1292119_A_C:1292119:1,33,6,0
chr1	1293764	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,3:0,0,13,0
chr1	1323078	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	1323143	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	1342612	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.543:9:2,1:2,4:2,2,2,3
chr1	1354538	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:4,2:2,4:0,6,1,6
chr1	1361530	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:5,7:4,7:6,3,12,3
chr1	1375292	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	1387667	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,17,1
chr1	1417696	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	1420637	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,248;MMQ=40,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,2,3
chr1	1430994	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=181,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:5,3,1,1
chr1	1451489	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=18,13;MFRL=176,201;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.552:9:1,0:1,2:1,3,0,5
chr1	1458109	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,163;MMQ=50,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:7,6:6,6:10,3,12,0
chr1	1469394	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:6,2:7,3:6,7,1,5
chr1	1469546	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	1470503	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1470503_T_TG:1470503:0,0,1,0
chr1	1470512	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1470503_T_TG:1470503:0,0,1,0
chr1	1475738	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:1475738_G_C:1475738:0,1,1,0
chr1	1475743	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:1475738_G_C:1475738:0,1,1,0
chr1	1475747	.	CGGAG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:1475738_G_C:1475738:0,1,1,0
chr1	1509825	.	A	G	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=286.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,90:0.989:90:0,42:0,47:0,0,55,35
chr1	1510035	.	GGC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr1	1560100	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	1563789	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	1564952	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	1572458	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,157;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,21:0.458:46:14,8:11,13:18,7,13,8
chr1	1572939	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,0,17
chr1	1574019	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=172,153;MMQ=27,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,12:0.255:49:14,7:22,5:3,34,1,11
chr1	1575616	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	1575836	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=166,137;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:6,3:12,7:4,14,2,8
chr1	1599888	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=153,150;MMQ=27,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,6:0.143:47:19,4:19,2:8,33,5,1
chr1	1599940	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=156,111;MMQ=40,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:4,1:5,2:1,8,0,3
chr1	1599974	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=158,160;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,2:2,2:0,8,0,4
chr1	1599981	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=160,159;MMQ=39,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:2,5:2,1:0,4,0,7
chr1	1601015	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=96.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,12:0,0,28,2
chr1	1601052	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=155.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,25:0,21:0,0,32,15
chr1	1601557	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:10,2:8,0:7,11,0,2
chr1	1635619	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.754:24:3,11:1,6:4,2,15,3
chr1	1639046	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=153,177;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,0:7,2:3,9,0,2
chr1	1639732	.	C	CATTCTTCATGTGGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=232,207;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr1	1647686	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	1647722	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=35,31;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:4,4:5,2:0|1:1647722_G_T:1647722:9,0,7,0
chr1	1647725	.	GT	AG	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:4,5:5,2:0|1:1647722_G_T:1647722:11,1,7,0
chr1	1647729	.	CA	TG	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:4,5:6,2:0|1:1647722_G_T:1647722:11,1,7,0
chr1	1647745	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,17:0.487:35:8,9:8,6:0|1:1647745_G_A:1647745:17,1,16,1
chr1	1647753	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,20:0.488:41:11,12:8,8:0|1:1647745_G_A:1647745:20,1,19,1
chr1	1647778	.	C	G	.	.	DP=57;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.408:52:20,12:11,9:22,9,20,1
chr1	1647814	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=121,118;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,20:0.361:56:21,8:13,11:21,15,11,9
chr1	1647871	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=120,130;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,14:0.255:57:21,7:21,7:18,25,6,8
chr1	1647893	.	C	CTTTCTT	.	.	DP=56;ECNT=8;MBQ=34,34;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTCTT;STR;TLOD=59.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,18:0.378:48:20,10:10,5:5,25,10,8
chr1	1647928	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=119,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.314:30:11,4:9,5:7,14,3,6
chr1	1647968	.	C	CAT	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=27,35;MFRL=196,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:0|1:1647968_C_CAT:1647968:1,4,1,7
chr1	1647971	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=196,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:1,4:2,4:0|1:1647968_C_CAT:1647968:1,4,1,7
chr1	1647983	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=29,31;MFRL=189,120;MMQ=50,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.571:14:2,4:2,4:0|1:1647983_T_A:1647983:0,6,1,7
chr1	1647990	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=189,121;MMQ=40,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:0|1:1647983_T_A:1647983:0,4,1,6
chr1	1648002	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=35,31;MFRL=189,170;MMQ=40,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr1	1650938	.	CGG	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,15:0.500:30:7,6:7,9:0|1:1650938_CGG_C:1650938:3,12,2,13
chr1	1650942	.	A	AAG	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=57.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,15:0.500:30:6,6:8,8:0|1:1650938_CGG_C:1650938:2,13,2,13
chr1	1650960	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,11:0.429:26:4,6:8,5:0|1:1650938_CGG_C:1650938:1,14,0,11
chr1	1650967	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:3,5:7,3:0|1:1650938_CGG_C:1650938:1,10,0,8
chr1	1653004	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr1	1653028	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr1	1653885	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=116.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,18:0,15:0,0,32,1
chr1	1654013	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,27;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	1654038	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=221,139;MMQ=40,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:0,1,9,0
chr1	1654058	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=221,138;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.875:14:0,9:1,4:0|1:1654058_C_T:1654058:0,1,12,1
chr1	1654064	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=221,138;MMQ=40,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.882:15:0,9:1,4:0|1:1654058_C_T:1654058:0,1,13,1
chr1	1654065	.	AGCG	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=221,138;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.882:15:0,9:1,5:0|1:1654058_C_T:1654058:0,1,13,1
chr1	1663831	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:5,5:1,2:0|1:1663831_C_T:1663831:6,0,7,0
chr1	1663851	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,11:0.462:24:6,7:5,4:1|0:1663831_C_T:1663831:13,0,10,1
chr1	1663861	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,10:0.440:23:7,6:5,3:1|0:1663831_C_T:1663831:12,1,9,1
chr1	1664019	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,5:0,0,1,16
chr1	1666338	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr1	1669734	.	G	T	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=149,140;MMQ=45,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=82.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,33:0.504:66:19,12:11,21:24,9,24,9
chr1	1669748	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=138,156;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=82.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,37:0.512:72:15,22:20,14:24,11,26,11
chr1	1670570	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=157,182;MMQ=51,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.370:36:13,6:9,7:1,22,0,13
chr1	1685921	.	TCCCTGGGACCGAAGTCGCCCCA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=202,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.589:10:2,2:1,4:2,2,5,1
chr1	1685973	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,1:6,0:4,3,2,0
chr1	1686943	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=130,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:1686943_T_C:1686943:0,5,0,2
chr1	1686962	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=141,245;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:1686943_T_C:1686943:0,4,0,1
chr1	1687625	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr1	1688469	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,5:0,7:0,0,13,1
chr1	1688513	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:3,8:7,2:9,3,8,2
chr1	1689762	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.366:39:19,8:6,6:16,9,11,3
chr1	1696659	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,17,0
chr1	1696879	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:5,4:6,12:1,10,1,15
chr1	1847856	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,2:3,6:6,0,7,1
chr1	1848109	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr1	1848273	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,0:6,3:10,6,2,1
chr1	1848428	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:16,1:13,1:17,12,2,0
chr1	1848734	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	1850208	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1855775	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	1857566	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	1858309	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:1,3:2,6:2,1,5,5
chr1	1887091	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:4,0:2,7,0,2
chr1	1887111	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,2:3,1:0,7,0,3
chr1	1895177	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=108,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:8,6,2,0
chr1	1903559	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=139,136;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0,5,0,2
chr1	1903570	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=139,136;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:0,2:0,3,0,2
chr1	1903576	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:1903576_G_T:1903576:0,3,0,1
chr1	1903579	.	GT	TA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1903576_G_T:1903576:0,3,0,1
chr1	1903580	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	1903586	.	C	CTTG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=139,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	1922303	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:4,7:11,4:10,6,7,4
chr1	1956362	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,12,6
chr1	1960926	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	1960962	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	1991123	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:0,8,0,4
chr1	2075560	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=147,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,0:0|1:2075560_T_G:2075560:2,0,3,0
chr1	2075570	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:0|1:2075560_T_G:2075560:4,0,6,0
chr1	2075818	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:3,0:8,2:4,11,0,5
chr1	2075822	.	GTC	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,0:8,3:2,15,0,3
chr1	2077409	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:4,0,5,0
chr1	2082458	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=101,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr1	2106840	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	2116865	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=122,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:21,3:17,0:25,13,3,0
chr1	2118539	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,16:0,7:0,0,23,1
chr1	2121118	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,7:0,0,13,6
chr1	2235612	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=17,11;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.215:19:2,0:3,0:4,11,0,4
chr1	2286947	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=112.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,6,25
chr1	2305914	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=99,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:4,2,2,3
chr1	2328714	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=75.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,13:0,0,2,20
chr1	2332391	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=91,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,5:4,3:5,6,2,6
chr1	2338126	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,0:0,9,2,2
chr1	2409892	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,1:2,2,3,0
chr1	2420590	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr1	2422614	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.707:12:3,3:0,3:2,1,7,2
chr1	2431057	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=228,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:2,1,3,1
chr1	2433930	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=113,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr1	2435343	.	TC	GG	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=20,10;MFRL=207,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:2435343_TC_GG:2435343:1,0,1,0
chr1	2435348	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=35,35;MFRL=192,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:2435343_TC_GG:2435343:1,0,1,0
chr1	2435349	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:2435343_TC_GG:2435343:0,0,1,0
chr1	2435352	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:2435343_TC_GG:2435343:0,0,2,0
chr1	2435356	.	CACAGACA	C,CCA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,35,12;MFRL=0,192,207;MMQ=60,60,60;MPOS=14,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,0:0,0,0:0,0,2,0
chr1	2435363	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,12;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,0:0,0:1|0:2435343_TC_GG:2435343:0,0,1,0
chr1	2435367	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=25,35;MFRL=207,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2435343_TC_GG:2435343:1,0,1,0
chr1	2435373	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=24,12;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:2435343_TC_GG:2435343:3,0,1,0
chr1	2435375	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=135,192;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:2435343_TC_GG:2435343:2,0,1,0
chr1	2441358	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:6,3:9,8:5,11,4,7
chr1	2441392	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.436:19:4,3:5,5:2,9,2,6
chr1	2443212	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	2444226	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.767:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr1	2445406	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:11,8:11,7:14,8,10,5
chr1	2445720	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,57;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,0:3,2:2,1,2,0
chr1	2452357	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.370:16:6,3:4,1:2,8,4,2
chr1	2452444	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=202,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:1,5:2,2:3,1,4,3
chr1	2458010	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.530:32:8,13:7,4:3,12,5,12
chr1	2491205	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	2494330	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=116,125;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,7:5,5:5,6,6,7
chr1	2494785	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	2520500	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,1:2,0:0,6,0,2
chr1	2520527	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=175,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	2524205	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:2,1:3,2:3,2,1,2
chr1	2524435	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0,3,0,1
chr1	2524457	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	2524485	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	2528133	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=228,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,1,3
chr1	2535573	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,12;MFRL=161,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0,4,0,1
chr1	2535758	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:3,0,2,4
chr1	2537095	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:9,3:2,4:3,8,1,6
chr1	2537838	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=178,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr1	2538349	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	2542848	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,1:0,0:0|1:2542848_G_T:2542848:2,1,0,1
chr1	2542849	.	G	GCTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:2542848_G_T:2542848:2,1,0,1
chr1	2700372	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=219,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	2702532	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,0:7,2:12,11,0,2
chr1	2938407	.	CAGA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,5:1,5:2,0,6,4
chr1	3312963	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	3347593	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,0:7,2:2,7,0,2
chr1	3347729	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	3383665	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	3385330	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	3386222	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3386222_A_T:3386222:0,0,0,1
chr1	3386224	.	C	CAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3386222_A_T:3386222:0,0,0,1
chr1	3386227	.	A	AGCCAGGAAGCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3386222_A_T:3386222:0,0,0,1
chr1	3386231	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3386222_A_T:3386222:0,0,0,1
chr1	3394456	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	3394640	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	3394674	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	3395078	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.660:33:3,12:7,8:4,7,8,14
chr1	3397188	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	3417131	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	3418565	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	3440647	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	3477414	.	GGGCT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGCT;STR;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:2,3:5,5:0,7,0,8
chr1	3496328	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,18,2
chr1	3519179	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,2:2,3,2,5
chr1	3542106	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.950:15:0,7:0,4:0,0,3,12
chr1	3544187	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=117,102;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:2,7:0,3:1,1,4,6
chr1	3544235	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	3545175	.	GTTCTGGGAGCTCCTCCCCC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCTGGGAGCTCCTCCCCC;STR;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.895:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	3555428	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:0,6,0,7
chr1	3555455	.	AA	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr1	3555460	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=197,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	3566625	.	AGCAGGCTG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:1,6:5,5:1,6,0,11
chr1	3598900	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.349:18:8,3:3,2:0|1:3598900_G_A:3598900:8,4,5,1
chr1	3598910	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:8,3:3,3:0|1:3598900_G_A:3598900:7,4,6,1
chr1	3638834	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.915:10:0,3:0,4:0,0,0,10
chr1	3640081	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=232,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3640081_G_A:3640081:0,1,0,1
chr1	3640085	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=232,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:3640081_G_A:3640081:0,1,0,1
chr1	3644349	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	3644374	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr1	3644817	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr1	3645835	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,0:0,5:0|1:3645835_C_A:3645835:0,0,4,2
chr1	3645844	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.906:8:0,0:0,8:0|1:3645835_C_A:3645835:0,0,5,3
chr1	3647962	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	3659606	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=221,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	3662254	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,111;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:5,2:5,6,0,2
chr1	3672156	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,5:0,3:0,1,1,7
chr1	3673496	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.682:17:2,8:3,3:0,5,5,7
chr1	3679139	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:4,0:1,3:0|1:3679139_T_C:3679139:5,0,4,0
chr1	3679146	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=178,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:5,0:2,3:0|1:3679139_T_C:3679139:6,1,5,0
chr1	3679307	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr1	3684076	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=190,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr1	3684107	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr1	3686415	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=106,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:5,1:4,7:4,5,3,6
chr1	3698017	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:6,8:9,4:13,2,11,1
chr1	3698224	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,2:1,6:0,6,0,8
chr1	3703337	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	3712721	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	3732103	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	3732172	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	3732782	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	3742257	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=121,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr1	3743109	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,2:0,12:0,0,8,6
chr1	3743151	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:3,3:3,3:6,0,6,1
chr1	3743319	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:10,6:8,8:8,10,8,6
chr1	3743391	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=59,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,7:3,6:2,4,3,10
chr1	3743433	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr1	3745787	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	3746254	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	3746585	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:1,7,3,5
chr1	3746589	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=1209,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,7:0,7:1,0,3,11
chr1	3747603	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,20,6
chr1	3761650	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr1	3761772	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,5:3,3:9,1,8,0
chr1	3762002	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=140,134;MMQ=60,35;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:12,0:3,2:0|1:3762002_C_T:3762002:0,15,0,2
chr1	3762003	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=140,134;MMQ=60,35;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:12,0:3,2:0|1:3762002_C_T:3762002:0,15,0,2
chr1	3762009	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=142,134;MMQ=60,35;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:11,0:3,2:0|1:3762002_C_T:3762002:0,16,0,2
chr1	3764216	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:3,1:4,3:1,6,1,4
chr1	3768834	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:1,2:3,1,2,0
chr1	3769033	.	AA	TT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	3774130	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:6,2:7,3:0|1:3774130_A_G:3774130:8,7,4,1
chr1	3774138	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:7,2:7,3:0|1:3774130_A_G:3774130:8,7,4,1
chr1	3775454	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	3782608	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	3784454	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=163,316;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3784454_T_C:3784454:2,0,1,0
chr1	3784464	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,316;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3784454_T_C:3784454:2,0,1,0
chr1	3789194	.	G	GCGGCCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.589:3:1,1:0,1:0|1:3789194_G_GCGGCCC:3789194:0,1,0,2
chr1	3789195	.	T	TGTCCCTGCCGC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,98;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0|1:3789194_G_GCGGCCC:3789194:0,1,1,4
chr1	3800390	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,1:1,0:0|1:3800390_C_G:3800390:0,3,0,1
chr1	3800398	.	T	TTGAGAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3800390_C_G:3800390:0,2,0,1
chr1	3816800	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	4772812	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr1	4829835	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	4832651	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156685662,240;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	4834420	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr1	4834606	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,1:1,2:0,2,1,3
chr1	5924466	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,51;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:20,2:12,0:20,12,1,1
chr1	5928133	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	5934490	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	5934837	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:1,1:2,2:2,2,0,3
chr1	5935162	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	5935222	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	5937091	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.512:39:8,12:11,8:16,3,14,6
chr1	5937391	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.516:23:8,6:3,5:4,7,2,10
chr1	6029086	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=210,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.544:7:0,1:1,2:0,3,3,1
chr1	6046432	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=190,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr1	6142439	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=201,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr1	6145365	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.258:24:7,3:11,2:4,14,2,4
chr1	6150637	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	6154417	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr1	6155332	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr1	6157282	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=132,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,2,1
chr1	6157434	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,1:0,0,2,5
chr1	6162143	.	G	GAAGCTTCGGGGGGTTTGGAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=124,50;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:3,0:2,3:4,3,2,1
chr1	6170424	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr1	6172875	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	6184192	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:3,1:5,1:1,7,0,3
chr1	6185064	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	6185275	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	6185532	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr1	6188546	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr1	6190173	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	6195493	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	6196493	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	6196517	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=178,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr1	6196732	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:1,0:0|1:6196732_T_G:6196732:3,4,1,1
chr1	6196737	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:6196732_T_G:6196732:4,3,1,1
chr1	6196739	.	G	GCCAGACCCCAGA	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:6196732_T_G:6196732:4,3,1,1
chr1	6196741	.	C	CTT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=139,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:6196732_T_G:6196732:4,3,1,1
chr1	6196943	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6196943_A_G:6196943:0,1,0,1
chr1	6196951	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6196943_A_G:6196943:0,1,0,1
chr1	6257826	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=154,57;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:2,3,0,4
chr1	6257856	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	6272136	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=190,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr1	6272137	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.858:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	6279336	.	T	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=116,109;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:17,0:33,3:23,29,0,3
chr1	6279370	.	G	C	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,19:0.349:55:13,9:22,9:17,19,2,17
chr1	6293647	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:9,3:6,8:5,10,5,6
chr1	6304768	.	A	AGAGCACAGTTTGGGCAGGAGTCAAAGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.387:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	6305303	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	6314738	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:7,1:12,1:8,12,2,0
chr1	6453520	.	C	CG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	6517241	.	CAGG	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=142,184;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AGG;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.065:43:23,0:15,2:20,21,0,2
chr1	6522159	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,1:11,1:12,8,2,0
chr1	6529224	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,152;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	6530965	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr1	6533112	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=140,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:13,0:22,2:0|1:6533112_G_C:6533112:13,24,1,1
chr1	6533117	.	C	CTTTTTGGAGATGGG	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=137,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:12,0:20,2:0|1:6533112_G_C:6533112:15,20,1,1
chr1	6579607	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr1	6586070	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,3,12
chr1	6591937	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	6609559	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	6609851	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	6610366	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	6610382	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,9,0
chr1	6610719	.	C	CCACACCAATATGTGTATTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=197,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	6614391	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0|1:6614391_A_C:6614391:0,0,0,14
chr1	6614415	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,6:0,1:0|1:6614391_A_C:6614391:0,0,0,8
chr1	6615690	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:6615690_A_G:6615690:0,0,1,3
chr1	6615695	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:6615690_A_G:6615690:0,0,0,3
chr1	6631319	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	6636606	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,84;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,1:11,1:10,11,0,2
chr1	6674055	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.472:6:0,1:2,0:0|1:6674055_A_C:6674055:2,1,3,0
chr1	6674064	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=120,225;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,0:0|1:6674055_A_C:6674055:2,1,1,0
chr1	6674071	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=94,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:0,0:1,0:1,1,2,0
chr1	6681475	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:12,0:21,2:19,14,0,2
chr1	6681744	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr1	6685442	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	6688471	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=214,200;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:7,0,1,1
chr1	6688639	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=174,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.386:24:10,6:4,3:7,8,4,5
chr1	6694207	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr1	6694574	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,4:0,0,10,0
chr1	6695802	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=118.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,23:0,11:0,0,7,27
chr1	6761702	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	7151479	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	7527996	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,2:2,7:0,3,0,9
chr1	7528032	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=200,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.658:7:1,2:1,1:0,2,0,5
chr1	7723534	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr1	7725195	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:7725195_T_A:7725195:0,0,0,1
chr1	7725197	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7725195_T_A:7725195:0,0,0,1
chr1	7730879	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	7737651	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,5:0,0,8,1
chr1	7797096	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,4:3,7:2,4,1,10
chr1	7807858	.	C	CCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	7807897	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=238,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	7811215	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:5,4:3,5:6,2,7,3
chr1	7845695	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,9:0,9:0,0,0,18
chr1	7861153	.	C	CT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=71.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,26:0.710:36:4,16:6,6:9,1,22,4
chr1	7861304	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,31:0.445:70:25,15:13,16:3,36,4,27
chr1	7861345	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=46.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.461:37:9,8:11,9:0,20,0,17
chr1	7869915	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=140.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,18:0,23:0,0,33,8
chr1	7870144	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=131.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,6:0,27:0,0,0,34
chr1	7880145	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=127,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:15,1:24,0:0|1:7880145_A_G:7880145:29,10,2,1
chr1	7880153	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=131,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.081:47:17,3:25,0:0|1:7880145_A_G:7880145:28,16,2,1
chr1	7880469	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=194,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,3:3,2:7,2,4,1
chr1	7889804	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	7890264	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	7897200	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,85;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:11,2:11,0:7,17,1,1
chr1	7906859	.	T	TAAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGA;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	7913430	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,26:0.370:71:20,11:24,15:22,23,11,15
chr1	7913590	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=143,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:1,1,0,3
chr1	7995033	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:10,1,7,1
chr1	7998963	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	8022800	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.277:5:1,1:1,0:0|1:8022800_CTT_C:8022800:3,1,1,0
chr1	8022824	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=12,15;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,0:1,0:1|0:8022800_CTT_C:8022800:3,1,1,0
chr1	8022827	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=23,16;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:2,0:0|1:8022827_G_T:8022827:2,2,2,0
chr1	8022832	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:2,0:0|1:8022827_G_T:8022827:3,3,2,0
chr1	8029543	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	8073423	.	CCT	C	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=134,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:12,0:26,2:0|1:8073423_CCT_C:8073423:17,25,1,1
chr1	8073427	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=133,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:12,0:25,2:0|1:8073423_CCT_C:8073423:17,22,1,2
chr1	8073432	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=137,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:13,0:24,3:0|1:8073423_CCT_C:8073423:16,26,1,2
chr1	8073433	.	T	TGAG	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=135,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:13,0:22,3:0|1:8073423_CCT_C:8073423:15,26,1,2
chr1	8073435	.	TT	CC	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=139,51;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,3:0.093:41:12,0:23,3:0|1:8073423_CCT_C:8073423:14,24,1,2
chr1	8073437	.	CATAT	C	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=34,36;MFRL=138,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:12,0:24,1:0|1:8073423_CCT_C:8073423:15,26,1,2
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chr1	8390495	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,4:0,0,3,6
chr1	8390998	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8390998_T_TG:8390998:0,1,0,1
chr1	8391000	.	A	ATAAGGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:8390998_T_TG:8390998:0,1,0,1
chr1	8397803	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,4:5,3:6,0,7,0
chr1	8399620	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:15,1:10,3:18,7,3,1
chr1	8399662	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:15,2:14,1:19,13,3,0
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chr1	8415235	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr1	8415290	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=208,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr1	8415418	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=116,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:8415418_G_A:8415418:1,0,1,0
chr1	8415422	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=116,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:8415418_G_A:8415418:1,0,1,0
chr1	8415682	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=154,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:2,2,1,1
chr1	8420087	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:8420087_A_G:8420087:0,2,1,0
chr1	8420091	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:8420087_A_G:8420087:0,2,1,0
chr1	8420248	.	G	GCACA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=205,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:8420248_G_GCACA:8420248:4,0,0,1
chr1	8420252	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=230,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:8420248_G_GCACA:8420248:3,0,0,1
chr1	8420254	.	CA	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=230,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:8420248_G_GCACA:8420248:3,0,0,1
chr1	8422676	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr1	8424039	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr1	8425798	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=219,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	8425900	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:6,6:1,5:4,4,6,5
chr1	8425913	.	G	GGCTATTTTATAATTTGAC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=142,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:7,7,1,1
chr1	8601207	.	TAC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:4,1:7,2:11,2,1,2
chr1	9006104	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	9009577	.	CA	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:9009577_CA_TT:9009577:0,1,0,1
chr1	9009590	.	C	CTTGCAGCTGTTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:9009577_CA_TT:9009577:0,1,0,1
chr1	9017430	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=200,183;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,0:0,1:0|1:9017430_C_T:9017430:0,3,0,1
chr1	9017443	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=200,183;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:9017430_C_T:9017430:0,3,0,1
chr1	9034815	.	C	CAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	9063602	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr1	9063646	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=182,174;MMQ=52,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	9063649	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=152,224;MMQ=60,44;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:9063649_G_A:9063649:0,4,0,1
chr1	9063654	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=152,224;MMQ=60,44;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:9063649_G_A:9063649:0,4,0,1
chr1	9070155	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,0:0|1:9070155_A_C:9070155:0,0,2,0
chr1	9070159	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,10;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.309:7:0,0:1,0:0|1:9070155_A_C:9070155:5,0,2,0
chr1	9073483	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=304,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	9074932	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,0,3
chr1	9171238	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	9307230	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,3:2,0:1,3,0,3
chr1	9633387	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=138,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:6,3:3,0:8,1,0,3
chr1	9649139	.	CGCCCGCCAG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.779:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	9655874	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=174,260;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	9658465	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,13:0,0,21,1
chr1	9658657	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=163,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,1:11,1:1,23,0,2
chr1	9658707	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	9661061	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,0:0,0,9,0
chr1	9670547	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=257,255;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr1	9714177	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,5:1,4:5,0,9,0
chr1	9714247	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.477:42:12,13:9,6:13,9,13,7
chr1	9714538	.	G	GGA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,0,1,4
chr1	9714539	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,0,1,4
chr1	9714541	.	C	CCA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,0,1,4
chr1	9714543	.	A	ACCCC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,0,1,4
chr1	9714544	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:9714538_G_GGA:9714538:0,0,1,4
chr1	9770690	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=36,37;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.366:6:1,0:2,2:0,4,0,2
chr1	9770720	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=139,100;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:9770720_T_G:9770720:0,4,0,1
chr1	9770724	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=139,100;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:9770720_T_G:9770720:0,4,0,1
chr1	9770732	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=134,100;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:9770720_T_G:9770720:0,3,0,1
chr1	9770736	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=197,100;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:9770720_T_G:9770720:0,2,0,1
chr1	9801335	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:7,0:7,2:0|1:9801335_G_A:9801335:0,15,1,1
chr1	9801341	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,8:0.500:16:3,2:5,6:1|0:9801335_G_A:9801335:1,7,0,8
chr1	9811435	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	10041298	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=105,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:6,2:2,1:6,3,1,3
chr1	10041393	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=206,187;MMQ=40,41;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:10041393_T_A:10041393:0,2,0,2
chr1	10041396	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=206,205;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:10041393_T_A:10041393:0,2,0,1
chr1	10041416	.	CTGAG	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10041416_CTGAG_C:10041416:0,0,0,1
chr1	10041421	.	C	CTAAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10041416_CTGAG_C:10041416:0,0,0,1
chr1	10132437	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	10132493	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=126,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.478:7:2,2:1,1:4,0,2,1
chr1	10177680	.	T	TA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.164:25:11,3:9,1:0,21,0,4
chr1	10194985	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,118;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,1:7,1:9,0,2,0
chr1	10342629	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,6:3,1:0,5,1,6
chr1	10357206	.	ATT	A,AT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32,34;MFRL=154,116,180;MMQ=60,60,60;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=5.94,11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,7,8:0.234,0.330:27:5,5,6:6,2,1:11,1,14,1
chr1	10425092	.	CG	AT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,10;MFRL=0,119;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10425092_CG_AT:10425092:0,0,1,0
chr1	10425098	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,10;MFRL=0,119;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10425092_CG_AT:10425092:0,0,1,0
chr1	10425106	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,13;MFRL=0,119;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10425092_CG_AT:10425092:0,0,1,0
chr1	10425110	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,16;MFRL=0,119;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:10425092_CG_AT:10425092:0,0,1,0
chr1	10425115	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,15;MFRL=169,119;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:10425092_CG_AT:10425092:1,1,1,0
chr1	10425126	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=36,10;MFRL=173,119;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:10425092_CG_AT:10425092:1,2,1,0
chr1	10428433	.	G	GGGATTTGGGGATGCTGTCACCAAGTCTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	10435458	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=124,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:11,0:4,2:4,11,1,1
chr1	10435529	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=233,280;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:10435529_G_A:10435529:0,1,0,1
chr1	10435530	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=240,280;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:10435529_G_A:10435529:0,2,0,1
chr1	10435531	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=240,280;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:10435529_G_A:10435529:0,2,0,1
chr1	10438572	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=181,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:10438572_G_A:10438572:0,2,0,1
chr1	10438578	.	C	CACCATCAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=207,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:10438572_G_A:10438572:0,1,0,1
chr1	10478830	.	C	CAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=161,151;MMQ=58,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=A;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.385:10:3,1:3,1:6,0,3,1
chr1	10478857	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=151,166;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:10,0:10,1:12,12,3,0
chr1	10479779	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,1:8,1:7,6,2,0
chr1	10490539	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,12:0.406:30:7,2:9,10:0|1:10490539_G_C:10490539:18,0,12,0
chr1	10490550	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=178,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,18:0.416:44:11,6:13,11:0|1:10490539_G_C:10490539:21,5,17,1
chr1	10502307	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=187,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:1,6:0,5:5,0,10,1
chr1	10529194	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,9:6,2:7,2,9,2
chr1	10555257	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:4,3:3,5:6,2,7,1
chr1	10596388	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=127.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,11:0,24:0,0,2,33
chr1	10714436	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=227,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,4,1
chr1	10753809	.	G	GGCCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=240,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:10753809_G_GGCCC:10753809:1,0,1,0
chr1	10753812	.	CGA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=196,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:1,1:0|1:10753809_G_GGCCC:10753809:1,1,1,0
chr1	10753818	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.659:4:0,0:1,0:0|1:10753809_G_GGCCC:10753809:0,1,3,0
chr1	10753822	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,19;MFRL=196,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,1:0|1:10753809_G_GGCCC:10753809:1,1,2,0
chr1	11008829	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:6,5,1,1
chr1	11015235	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:11015235_G_A:11015235:0,4,0,1
chr1	11015236	.	G	GTCTTTTTATTTTCATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:11015235_G_A:11015235:0,4,0,1
chr1	11076816	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=12,18;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr1	11080723	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,10:0,0:0,0,0,10
chr1	11095039	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=151,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,1:0,1,0,6
chr1	11105106	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,8:0,7:0|1:11105106_C_T:11105106:0,0,1,16
chr1	11105122	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0|1:11105106_C_T:11105106:0,0,0,15
chr1	11105514	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr1	11105545	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=161,79;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:11105545_T_A:11105545:1,1,0,1
chr1	11105548	.	T	TTGCAGTGAGCTGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=161,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:11105545_T_A:11105545:1,1,0,1
chr1	11115177	.	CTTT	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=19,20;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:11115177_CTTT_C:11115177:0,1,0,1
chr1	11115198	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:11115177_CTTT_C:11115177:0,3,0,1
chr1	11115201	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:11115177_CTTT_C:11115177:0,3,0,1
chr1	11115236	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,16;MFRL=205,193;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,0:0|1:11115236_G_A:11115236:0,1,0,2
chr1	11115238	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=36,32;MFRL=205,193;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:11115236_G_A:11115236:0,1,0,2
chr1	11115807	.	CAA	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.221:15:1,1:8,2:0|1:11115807_CAA_C:11115807:3,9,3,0
chr1	11115814	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.194:17:2,1:10,2:0|1:11115807_CAA_C:11115807:4,10,3,0
chr1	11115819	.	CCAGACA	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.151:22:3,0:10,2:0|1:11115807_CAA_C:11115807:9,10,3,0
chr1	11128001	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr1	11128654	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr1	11129848	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	11133934	.	C	CAAA,CAAAAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,34,32;MFRL=140,178,134;MMQ=48,40,40;MPOS=27,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,26,28;RU=A;STR;TLOD=4.38,6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.316,0.416:10:2,0,1:0,3,2:1,2,7,0
chr1	11133956	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=13,32;MFRL=140,120;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=48.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.621:30:2,11:1,8:11,0,9,10
chr1	11133962	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=130,125;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:16,0:9,0:13,13,2,0
chr1	11134157	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,3:0,14:0,0,2,15
chr1	11134483	.	T	TCCCCCTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	11137778	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	11147918	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=147,49;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:9,2:0|1:11147918_T_G:11147918:13,7,1,1
chr1	11147922	.	GGGA	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=153,49;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,0:9,2:0|1:11147918_T_G:11147918:13,10,1,1
chr1	11147932	.	G	GT	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=149,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:11147918_T_G:11147918:11,12,1,1
chr1	11147933	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=149,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:13,0:9,2:0|1:11147918_T_G:11147918:11,12,1,1
chr1	11147936	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=148,49;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,0:8,2:0|1:11147918_T_G:11147918:9,12,1,1
chr1	11184489	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:8,1,2,0
chr1	11187293	.	G	GCTCCTGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=188,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11187293_G_GCTCCTGGC:11187293:0,1,0,1
chr1	11187295	.	G	GGGTTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=188,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11187293_G_GCTCCTGGC:11187293:0,1,0,1
chr1	11187893	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	11269604	.	C	CCTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=166,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:11269604_C_CCTT:11269604:0,1,0,1
chr1	11269608	.	TA	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=166,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11269604_C_CCTT:11269604:0,1,0,1
chr1	11269611	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,21;MFRL=166,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11269604_C_CCTT:11269604:0,1,0,1
chr1	11269615	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=166,219;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11269604_C_CCTT:11269604:0,1,0,1
chr1	11288633	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	11292666	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr1	11317320	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr1	11333812	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:5,3,5,3
chr1	11575375	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:5,7:1,3:5,1,10,0
chr1	11577529	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=113,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,0:3,2:8,5,2,0
chr1	11579354	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=21113223,41695003;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,1:0|1:11579354_A_C:11579354:2,0,2,0
chr1	11579358	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,14;MFRL=21113223,41695003;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,0:0|1:11579354_A_C:11579354:2,0,2,0
chr1	11579367	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,16;MFRL=21113223,41695003;MMQ=60,42;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:0|1:11579354_A_C:11579354:2,0,2,0
chr1	11579372	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,14;MFRL=186,83389808;MMQ=60,23;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:11579354_A_C:11579354:4,0,1,0
chr1	11579470	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=132,89;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:5,1:2,4:3,5,1,4
chr1	11593793	.	T	TGCACACACGCAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=167,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,0:0,2:1,0,3,0
chr1	11593994	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	11594400	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:6,2,3,2
chr1	11708736	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,10,6
chr1	11709052	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=13,34;MFRL=69919332,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:0,1:0,2:2,0,2,1
chr1	11718713	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:2,0:7,4,0,2
chr1	11737082	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=99,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:11737082_CA_C:11737082:0,2,0,1
chr1	11737083	.	AA	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=120,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:0,1:1,0:1|0:11737082_CA_C:11737082:0,2,0,1
chr1	11737091	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=93,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:11737082_CA_C:11737082:0,1,0,1
chr1	11740329	.	AGGCGTGAGCCAC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,156;MMQ=50,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr1	11772303	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr1	11772526	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	11796168	.	CGGGCG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGCG;STR;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr1	11807426	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr1	11808706	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	11832100	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	11832311	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=176.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,32:0,17:0,0,17,32
chr1	11832415	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=182,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr1	11836441	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	11842144	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	11848879	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	11848900	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	11854085	.	TC	AG	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,3:3,7:0,6,1,9
chr1	11854133	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:11854133_G_A:11854133:1,2,0,1
chr1	11854137	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:11854133_G_A:11854133:1,1,0,1
chr1	11854140	.	A	AGTTG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:11854133_G_A:11854133:1,1,0,1
chr1	11854143	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11854133_G_A:11854133:1,0,0,1
chr1	11854146	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11854133_G_A:11854133:1,0,0,1
chr1	11854457	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,11,6
chr1	11854755	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=105.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,16:0,15:0,0,21,10
chr1	11887373	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	11894274	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=131,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,1:11,1:9,10,2,0
chr1	11917720	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.467:32:10,6:7,8:6,11,4,11
chr1	11918927	.	TCTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=184,232;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CTG;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr1	11982544	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,1:5,3:6,0,4,0
chr1	11982676	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.324:41:10,9:18,4:12,16,5,8
chr1	12012808	.	CG	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,1,0
chr1	12014530	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,190;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.195:14:5,2:6,0:0|1:12014530_C_T:12014530:9,3,2,0
chr1	12014533	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=156,190;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.174:16:6,2:6,0:0|1:12014530_C_T:12014530:10,4,2,0
chr1	12018740	.	C	CCTCCCCCACTGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr1	12024378	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=0,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:1,0:2,2:0|1:12024378_G_T:12024378:1,2,1,1
chr1	12024381	.	G	GAGAAGGGAAGTCACAGGCTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:12024378_G_T:12024378:0,1,1,1
chr1	12030954	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	12030957	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	12056440	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	12058802	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=143,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:5,4:1,2:5,1,5,1
chr1	12061417	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	12062005	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:7,1:8,0:0|1:12062005_C_G:12062005:14,4,2,0
chr1	12062010	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=16,13;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:4,0:5,0:0|1:12062005_C_G:12062005:16,4,2,0
chr1	12062017	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.384:21:7,3:6,4:0|1:12062005_C_G:12062005:12,1,5,3
chr1	12062205	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:5,4:6,7:3,9,1,10
chr1	12066813	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=101,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	12069798	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,3:1,1:0,3,1,3
chr1	12071680	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr1	12090001	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr1	12144639	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	12198203	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=207,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr1	12248965	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,229;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr1	12251191	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	12251765	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.440:34:9,9:9,4:18,1,13,2
chr1	12251808	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=66.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.490:45:11,14:12,8:14,9,17,5
chr1	12254201	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,0:1,3:0,6,1,2
chr1	12261972	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr1	12309291	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:4,4:10,7:10,4,10,1
chr1	12368724	.	ATG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:6,2:2,11,0,2
chr1	12368733	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=144,136;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr1	12409086	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,6:3,5:3,5,4,7
chr1	12418700	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr1	12445302	.	GT	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=58.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,24:0.481:50:15,16:10,8:16,10,20,4
chr1	12461852	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	12567232	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	12628431	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:7,2:18,0:11,14,0,2
chr1	12632951	.	G	GCTGAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=96,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12632951_G_GCTGAAAA:12632951:0,2,0,1
chr1	12632957	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=96,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12632951_G_GCTGAAAA:12632951:0,2,0,1
chr1	12639018	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	12776218	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=204,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:2,3:5,0,4,1
chr1	12776344	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=127,117;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:8,2:6,5:6,9,3,4
chr1	12835674	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=101,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.140:25:12,3:9,0:11,11,1,2
chr1	12854021	.	GA	TT	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=171,181;MMQ=25,32;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,1:5,1:0|1:12854021_GA_TT:12854021:9,1,1,1
chr1	12854041	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=158,181;MMQ=25,32;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:0|1:12854021_GA_TT:12854021:8,1,1,1
chr1	12854052	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=150,162;MMQ=39,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:9,2:5,1:0|1:12854021_GA_TT:12854021:12,2,1,2
chr1	12854090	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=153,168;MMQ=31,24;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,8:0.214:40:17,6:13,2:0|1:12854090_T_A:12854090:21,11,7,1
chr1	12854097	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=149,169;MMQ=47,24;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,9:0.233:41:18,6:13,3:0|1:12854090_T_A:12854090:21,11,8,1
chr1	12854105	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=152,169;MMQ=47,24;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,9:0.217:44:19,6:15,3:0|1:12854090_T_A:12854090:23,12,8,1
chr1	12855835	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,37;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0|1:12855835_C_G:12855835:0,0,4,13
chr1	12855845	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,36;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0|1:12855835_C_G:12855835:0,0,5,15
chr1	12856010	.	C	G	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=143,131;MMQ=27,27;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,25:0.320:79:29,10:25,15:0|1:12856010_C_G:12856010:39,15,19,6
chr1	12856030	.	T	C	.	.	DP=111;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,138;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:89,15:0.146:104:48,7:39,7:1|0:12856010_C_G:12856010:52,37,9,6
chr1	12856153	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,169;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.313:33:10,6:13,4:4,19,0,10
chr1	12907199	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=155,163;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr1	12907212	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,162;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,6:3,3:6,0,9,0
chr1	12907313	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=136,144;MMQ=48,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:6,2:11,0:9,11,0,2
chr1	12907316	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=136,148;MMQ=56,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:8,4:12,2:11,9,1,5
chr1	12907350	.	CA	TG	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=120,149;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:12,3:9,2:13,9,1,4
chr1	12907370	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=126,149;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.182:31:10,3:10,2:0|1:12907370_A_T:12907370:14,12,1,4
chr1	12907379	.	TC	CA	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=126,148;MMQ=60,55;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:13,1:9,2:0|1:12907370_A_T:12907370:14,12,1,3
chr1	12907385	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=117,148;MMQ=52,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:13,1:9,1:0|1:12907370_A_T:12907370:13,12,1,3
chr1	12907777	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=141,167;MMQ=52,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,10:0.234:45:18,6:17,2:0|1:12907777_T_C:12907777:17,18,10,0
chr1	12907781	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=142,167;MMQ=52,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,10:0.239:44:17,7:17,3:0|1:12907777_T_C:12907777:16,18,10,0
chr1	12907798	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=141,145;MMQ=52,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=77.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,21:0.379:56:17,10:15,10:0|1:12907777_T_C:12907777:15,20,19,2
chr1	12907802	.	CC	TT	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=140,146;MMQ=51,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,22:0.371:60:18,9:14,11:0|1:12907777_T_C:12907777:18,20,20,2
chr1	12907829	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=143,135;MMQ=51,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,19:0.289:67:25,9:21,9:35,13,9,10
chr1	12907837	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=147,135;MMQ=51,51;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,35:0.461:76:21,20:19,15:19,22,29,6
chr1	12908333	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,256;MMQ=51,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr1	12919587	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,163;MMQ=38,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,2:5,2:8,2,2,2
chr1	12921332	.	TG	CA,CG	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=131,113,219;MMQ=55,37,27;MPOS=17,26;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=41.09,9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,14,5:0.341,0.145:39:9,7,3:11,7,2:9,11,11,8
chr1	12921716	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=185,84;MMQ=24,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.299:24:11,4:6,2:1,16,1,6
chr1	12942842	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=155,151;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.375:24:6,1:7,3:0|1:12942842_G_A:12942842:14,1,9,0
chr1	12942858	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=153,150;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.308:24:7,2:9,5:0|1:12942842_G_A:12942842:16,1,7,0
chr1	12942862	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=153,151;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.291:22:6,2:9,4:0|1:12942842_G_A:12942842:15,1,6,0
chr1	12954729	.	A	AATAATTAAGCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=227,220;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:12954729_A_AATAATTAAGCT:12954729:1,1,0,1
chr1	12954731	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=227,220;MMQ=25,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12954729_A_AATAATTAAGCT:12954729:1,1,0,1
chr1	13182899	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=175,210;MMQ=40,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,0:3,4:10,1,4,0
chr1	13183225	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=156,146;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:13,1:4,2:0|1:13183225_T_C:13183225:8,9,3,0
chr1	13183228	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=156,161;MMQ=27,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:12,1:3,2:0|1:13183225_T_C:13183225:8,9,4,0
chr1	13183237	.	CT	TC	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=156,146;MMQ=27,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:11,4:3,2:0|1:13183225_T_C:13183225:6,9,7,0
chr1	13183243	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=156,149;MMQ=33,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:9,4:4,5:0|1:13183225_T_C:13183225:7,9,9,0
chr1	13183248	.	TC	AA	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=154,148;MMQ=27,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:9,4:5,6:0|1:13183225_T_C:13183225:6,8,10,0
chr1	13183439	.	T	C	.	.	DP=113;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=233.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,80:0.755:106:14,42:10,37:13,13,41,39
chr1	13183511	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=142,139;MMQ=52,49;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=121.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,36:0.457:79:17,15:26,20:0|1:13183511_T_C:13183511:19,24,4,32
chr1	13183528	.	A	C	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=150,148;MMQ=52,45;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,28:0.439:64:14,14:21,11:0|1:13183511_T_C:13183511:18,18,1,27
chr1	13183532	.	CC	TT	.	.	DP=58;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=148,157;MMQ=52,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,22:0.396:56:14,11:19,11:0|1:13183511_T_C:13183511:18,16,0,22
chr1	13183567	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=141,200;MMQ=52,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,10:0.186:57:16,7:28,3:0|1:13183567_C_T:13183567:30,17,0,10
chr1	13183573	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=138,184;MMQ=52,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,9:0.166:58:17,6:30,2:0|1:13183567_C_T:13183567:27,22,0,9
chr1	13183956	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,165;MMQ=27,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:6,1:13,1:0|1:13183956_G_A:13183956:3,16,0,2
chr1	13183966	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=189,139;MMQ=52,27;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,5:0.315:17:5,2:7,3:1|0:13183956_G_A:13183956:2,10,0,5
chr1	13448180	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,37;MFRL=0,196;MMQ=60,24;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:13448180_A_G:13448180:0,0,2,0
chr1	13448184	.	CG	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,24;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:13448180_A_G:13448180:0,0,2,0
chr1	13448199	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,25;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	13933855	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	13936822	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,9:3,1:6,1,8,2
chr1	13937089	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=217,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	14057425	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.620:6:1,2:1,1:2,0,3,1
chr1	14075996	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=147,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,0:8,2:0|1:14075996_G_C:14075996:1,14,3,0
chr1	14076001	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=158,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,0:8,2:0|1:14075996_G_C:14075996:0,12,3,0
chr1	14076005	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,1:7,1:0|1:14075996_G_C:14075996:0,12,3,0
chr1	14076008	.	CGG	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,1:0|1:14075996_G_C:14075996:0,12,2,0
chr1	14107035	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=140,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,2:9,0:0|1:14107035_T_A:14107035:14,5,1,1
chr1	14107040	.	A	ACAGTAACTACC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=140,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:9,0:0|1:14107035_T_A:14107035:14,5,1,1
chr1	14107042	.	T	TGGTAATGGGGAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=140,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,1:9,0:0|1:14107035_T_A:14107035:14,5,1,1
chr1	14108748	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:6,1:3,1:3,6,1,1
chr1	14143137	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=14,20;MFRL=334,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.635:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr1	14149601	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,5:6,5:5,4,6,4
chr1	14149622	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:5,6:6,7:8,3,6,7
chr1	14220186	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,117;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,8:5,6:6,2,8,6
chr1	15386851	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,10;MFRL=163,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,0:5,0:0,7,0,2
chr1	15386856	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=169,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,0:3,0:0,5,0,2
chr1	15390215	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=143,245;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:15390215_A_C:15390215:0,3,0,1
chr1	15390217	.	C	CTTCCTTTGCCAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=143,245;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:15390215_A_C:15390215:0,3,0,1
chr1	15438825	.	ATGTGTGTG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=152,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=TG;STR;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:0,1:1,0,4,0
chr1	15497844	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	15541537	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	15578195	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr1	15616183	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=196,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:0,1:2,1:0,2,1,2
chr1	15651062	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:6,3:11,6:5,12,4,5
chr1	15653503	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:4,4:1,3:0,6,1,6
chr1	15687059	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,11:0,0,9,11
chr1	15687121	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=123,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,0:10,2:10,13,0,2
chr1	15692506	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=182,122;MMQ=60,58;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.339:4:1,0:2,1:0|1:15692506_G_A:15692506:0,3,0,1
chr1	15692510	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=182,122;MMQ=60,58;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.339:4:0,0:2,1:0|1:15692506_G_A:15692506:0,3,0,1
chr1	15692512	.	AG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=195,122;MMQ=60,58;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:15692506_G_A:15692506:0,2,0,1
chr1	15692521	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=208,122;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0|1:15692506_G_A:15692506:0,3,0,1
chr1	15694127	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,0:0,1:0|1:15694127_G_A:15694127:0,1,0,1
chr1	15694131	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15694127_G_A:15694127:0,1,0,1
chr1	15694133	.	GGCCGGGT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15694127_G_A:15694127:0,1,0,1
chr1	15694146	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:15694127_G_A:15694127:0,0,0,1
chr1	15707967	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	15764952	.	CACCTAACCATG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=127,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,2:1,0:5,4,1,1
chr1	15770101	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=176,34891949;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr1	15770124	.	T	TCAGGCAAAAGTCCATAGTGTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=216,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:15770124_T_TCAGGCAAAAGTCCATAGTGTA:15770124:0,4,0,1
chr1	15770126	.	T	TCTCTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=216,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:15770124_T_TCAGGCAAAAGTCCATAGTGTA:15770124:0,4,0,1
chr1	15771310	.	G	GAACCCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	15772057	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:2,1:0,4:3,0,5,0
chr1	15772933	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	15783117	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	15783553	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=186,144;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:4,0,4,2
chr1	15789176	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=135,181;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,6:2,3:3,1,8,1
chr1	15789297	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=117,173;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:4,5:6,5:3,7,5,6
chr1	15789446	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:2,0:2,1:0|1:15789446_C_G:15789446:0,4,0,2
chr1	15789450	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:0,1:2,0:0|1:15789446_C_G:15789446:0,4,0,2
chr1	15809706	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:4,1,5,1
chr1	15813751	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr1	15813969	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,1,1
chr1	15832383	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr1	15834297	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=113,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:1,2:3,0,1,1
chr1	15834491	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=154,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:0,2,1,2
chr1	15844926	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	15850483	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=227,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	15850553	.	C	CGGGGGCG,CGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,34,0;MFRL=210,198,152;MMQ=60,60,60;MPOS=14,50;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.45,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.392,0.243:6:2,1,0:1,1,0:3,0,2,1
chr1	15863359	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15863359_T_TC:15863359:0,1,0,1
chr1	15863363	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=37,32;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15863359_T_TC:15863359:0,1,0,1
chr1	15890358	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,31;MFRL=201,293;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:15890358_A_G:15890358:1,0,1,0
chr1	15890360	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=201,293;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15890358_A_G:15890358:1,0,1,0
chr1	15890630	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.417:5:2,0:0,1:2,1,0,2
chr1	15893862	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	15906725	.	TA	AG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=175,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr1	15909624	.	TGAGTACAG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr1	15909850	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=85,157;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:1,3,2,5
chr1	15909895	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:1,3,2,5
chr1	15956769	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,1:4,2:8,1,3,0
chr1	15959886	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:4,2:3,0:8,0,2,0
chr1	15959977	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:12,3:4,3:10,7,4,2
chr1	15964850	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:18,0:7,2:17,8,2,0
chr1	15965025	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=184,188;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.506:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	15978236	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,3:11,0:11,9,2,1
chr1	16011005	.	G	GGGC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GGC;STR;TLOD=52.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:3,5:7,8:10,0,14,1
chr1	16011192	.	G	GGCGACCCTGCTGCCGCAGGGACTC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.549:16:3,4:4,3:0,7,0,9
chr1	16042724	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:0,0:6,1,0,2
chr1	16043157	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	16045152	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	16047738	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=116,129;MMQ=54,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:1,1:1,0:0|1:16047738_T_TG:16047738:2,0,1,0
chr1	16047742	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=16,20;MFRL=81,140;MMQ=48,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.628:3:0,1:0,0:1,0,2,0
chr1	16047750	.	TC	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,18;MFRL=16864672,129;MMQ=54,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:16047738_T_TG:16047738:2,0,1,0
chr1	16047911	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=145,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:16047911_T_G:16047911:2,13,0,2
chr1	16047914	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=145,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:9,0:4,2:0|1:16047911_T_G:16047911:2,13,0,2
chr1	16053493	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=116,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.475:42:12,10:10,9:14,8,11,9
chr1	16055732	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.335:25:6,2:10,6:0,17,0,8
chr1	16064411	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=82,112;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:9,5:2,3:6,5,3,5
chr1	16065303	.	ACACACT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CACACT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	16096893	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,5:2,2:3,0,6,1
chr1	16096934	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,15,6
chr1	16248740	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.217:15:7,1:5,1:10,2,2,1
chr1	16258454	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,1:14,1:4,19,0,2
chr1	16259499	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,2:10,0:8,14,2,0
chr1	16260367	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	16261936	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,4:0.065:75:35,2:35,2:46,25,3,1
chr1	16271170	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=273,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	16273675	.	T	TCCGTTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:16273675_T_TCCGTTGG:16273675:0,3,0,1
chr1	16273677	.	C	CTTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:16273675_T_TCCGTTGG:16273675:0,3,0,1
chr1	16273680	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0|1:16273675_T_TCCGTTGG:16273675:0,3,0,1
chr1	16330722	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.718:12:3,4:0,5:3,0,8,1
chr1	16330772	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=137,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,3:8,1:16,4,4,0
chr1	16342350	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	16344730	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	16344759	.	C	CCTCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16344759_C_CCTCCA:16344759:0,1,0,1
chr1	16344763	.	TG	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16344759_C_CCTCCA:16344759:0,1,0,1
chr1	16345619	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr1	16346009	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=126,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	16352573	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:4,3:0,2:4,1,4,1
chr1	16352937	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.658:15:1,5:3,5:5,0,10,0
chr1	16354280	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	16354394	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=162,144;MMQ=40,24;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:10,3:5,1:14,1,4,0
chr1	16354433	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=163,156;MMQ=45,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.261:21:10,4:5,1:0|1:16354433_A_AT:16354433:6,10,0,5
chr1	16354435	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=163,156;MMQ=45,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:10,4:6,1:0|1:16354433_A_AT:16354433:6,10,0,5
chr1	16354441	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=167,156;MMQ=59,27;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:9,4:9,0:4,14,0,5
chr1	16354590	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,4:2,5:1,3,4,5
chr1	16355287	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,3:6,4:5,3,3,4
chr1	16355425	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=187,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr1	16356501	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.538:20:7,4:2,5:6,3,7,4
chr1	16356583	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:11,5:9,3:9,11,2,6
chr1	16358148	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	16358685	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr1	16359051	.	CA	AG	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.417:24:7,7:7,2:4,10,5,5
chr1	16359052	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,7,14
chr1	16359106	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:0,6,0,5
chr1	16359123	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr1	16359827	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	16370899	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr1	16371138	.	A	ATGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=171,237;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16371138_A_ATGC:16371138:0,1,0,1
chr1	16371141	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=171,237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:16371138_A_ATGC:16371138:0,1,0,1
chr1	16372003	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	16372971	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	16373199	.	CCTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,2:0,4,0,3
chr1	16374330	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	16374622	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr1	16374952	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=163,198;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:4,0:4,2:4,10,0,3
chr1	16375838	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	16376191	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,5:0,0,19,0
chr1	16376230	.	A	AT	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.936:10:0,6:0,3:0|1:16376230_A_AT:16376230:0,0,8,2
chr1	16376232	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0|1:16376230_A_AT:16376230:0,0,8,2
chr1	16376238	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr1	16376278	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,11:0,0,9,14
chr1	16376458	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr1	16378739	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.309:20:8,1:6,4:9,5,3,3
chr1	16380033	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr1	16382086	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr1	16382827	.	CTCT	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:2,3:4,4:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:6,0,7,0
chr1	16382831	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,1:3,3:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:5,0,7,0
chr1	16382834	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.573:12:2,3:3,4:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:5,0,7,0
chr1	16382877	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=133.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,16:0,27:0,0,30,15
chr1	16383067	.	G	GCCACTCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=102,229;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:16383067_G_GCCACTCCT:16383067:0,1,0,1
chr1	16383071	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16383067_G_GCCACTCCT:16383067:0,0,0,1
chr1	16383329	.	T	TC	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,129;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:10,1:15,5:0,26,0,7
chr1	16383336	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=170,124;MMQ=52,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.258:33:10,2:14,6:0,25,0,8
chr1	16383448	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=134.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,25:0,20:0,0,15,30
chr1	16383605	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=183,201;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr1	16383668	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=69.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,7:0,0,19,1
chr1	16383682	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=157,134;MMQ=33,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.256:25:12,5:7,1:14,5,4,2
chr1	16384986	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=196,229;MMQ=39,57;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.249:22:4,2:10,2:0|1:16384986_G_T:16384986:13,4,3,2
chr1	16384998	.	GG	CA	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=199,229;MMQ=35,57;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:7,3:12,2:0|1:16384986_G_T:16384986:16,4,3,2
chr1	16385007	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=184,205;MMQ=57,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:5,4:12,1:12,5,5,0
chr1	16385042	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=166,160;MMQ=27,27;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.210:25:10,2:10,2:18,2,4,1
chr1	16385248	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=145,161;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:10,1:13,1:0|1:16385248_C_T:16385248:2,24,0,2
chr1	16385250	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=145,161;MMQ=60,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,1:13,1:0|1:16385248_C_T:16385248:2,24,0,2
chr1	16385915	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:18,4,2,0
chr1	16385958	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.366:22:7,2:6,3:0,14,8,0
chr1	16385980	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=156,115;MMQ=60,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:6,6:9,5:3,12,2,9
chr1	16386008	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=166,157;MMQ=53,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.387:24:6,4:8,5:4,11,2,7
chr1	16388556	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=144,111;MMQ=44,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:6,1:1,4:0|1:16388556_C_T:16388556:5,3,3,3
chr1	16388565	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=146,111;MMQ=48,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.367:17:6,1:4,5:0|1:16388556_C_T:16388556:7,4,3,3
chr1	16388580	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=142,163;MMQ=57,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,3:0.180:20:7,2:10,1:1|0:16388556_C_T:16388556:8,9,2,1
chr1	16388709	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=158,155;MMQ=60,33;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,1:1,4:0,5,0,5
chr1	16388756	.	CACCCAT	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=203,176;MMQ=53,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,3:1,1:1,1,1,3
chr1	16388766	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=136,179;MMQ=45,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,2,3
chr1	16389118	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=9,32;MFRL=175,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:0,2:0,1,0,3
chr1	16389135	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=175,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr1	16390007	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,4,2
chr1	16451869	.	CCG	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16451869_CCG_C:16451869:0,0,0,1
chr1	16451872	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16451869_CCG_C:16451869:0,0,0,1
chr1	16451875	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16451869_CCG_C:16451869:0,0,0,1
chr1	16451879	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16451869_CCG_C:16451869:0,0,0,1
chr1	16451881	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16451869_CCG_C:16451869:0,0,0,1
chr1	16458814	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.755:24:2,10:4,8:3,3,10,8
chr1	16459745	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=116,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,5:2,3:2,4,2,6
chr1	16464936	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=159,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:5,7:0,3:0,5,2,8
chr1	16477506	.	G	GCATCACAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr1	16525056	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:4,2,2,1
chr1	16525549	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:8,0,6,0
chr1	16525829	.	G	GTAAGCCTAATAATGTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.525:2:0,1:0,0:0|1:16525829_G_GTAAGCCTAATAATGTA:16525829:0,1,0,1
chr1	16525834	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16525829_G_GTAAGCCTAATAATGTA:16525829:0,0,0,1
chr1	16528218	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=174,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	16528233	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=129,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr1	16528843	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	16529117	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,6:4,3:0,10,2,8
chr1	16534002	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:8,2:3,4:9,2,4,2
chr1	16534730	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr1	16543175	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	16555585	.	G	GCTCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=159,133;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16555585_G_GCTCT:16555585:0,1,0,1
chr1	16555587	.	A	ACCATCCTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=159,133;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16555585_G_GCTCT:16555585:0,1,0,1
chr1	16555589	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=159,133;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:16555585_G_GCTCT:16555585:0,1,0,1
chr1	16555610	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	16559541	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:0,11,0,6
chr1	16583030	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=118,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,1:3,3:4,4,4,0
chr1	16621183	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=188,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,5:0,1:3,0,6,0
chr1	16693725	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=189,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,1:3,0,3,0
chr1	16725330	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:10,6:9,8:6,13,7,7
chr1	16731626	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=170,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:16731626_GT_G:16731626:0,4,0,1
chr1	16731631	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=170,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:16731626_GT_G:16731626:0,4,0,1
chr1	16731632	.	G	GTTCAGGGGAGAGGCAGACACCGTAGT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=130,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	16731633	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=128,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:16731626_GT_G:16731626:0,3,0,1
chr1	16731646	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,681;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	16735579	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=128,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:6,4,2,0
chr1	16736546	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,2:3,5:1,4,2,5
chr1	16775532	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,2:2,1:9,0,3,0
chr1	16775769	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=219,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr1	16778265	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=83.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,20,5
chr1	16890421	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=167,168;MMQ=49,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,12:0.196:64:19,5:31,7:44,8,9,3
chr1	16890428	.	T	A	.	.	DP=78;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=161,161;MMQ=49,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,9:0.133:73:25,4:39,5:53,11,8,1
chr1	16890441	.	C	T	.	.	DP=100;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=164,126;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,21:0.219:98:33,9:44,12:62,15,15,6
chr1	16890639	.	C	T	.	.	DP=111;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=150,179;MMQ=49,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,19:0.181:108:52,7:37,12:40,49,4,15
chr1	16890644	.	C	T	.	.	DP=114;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=151,169;MMQ=49,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,25:0.232:110:45,16:39,9:40,45,8,17
chr1	16890671	.	TG	CA	.	.	DP=105;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=136,180;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=138.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,38:0.387:99:32,13:29,24:32,29,11,27
chr1	16890760	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=166,110;MMQ=51,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:12,0:11,4:7,16,1,3
chr1	16893884	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=172,177;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,23:0.509:45:13,8:8,14:0,22,1,22
chr1	16893943	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=175,192;MMQ=26,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16893943_AAG_A:16893943:0,1,0,1
chr1	16893947	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=175,192;MMQ=26,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16893943_AAG_A:16893943:0,1,0,1
chr1	16895703	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=169,179;MMQ=21,20;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.100:47:16,3:27,1:0,43,0,4
chr1	16895764	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,36;MFRL=214,150;MMQ=21,20;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr1	16895782	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=196,137;MMQ=22,20;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr1	16895788	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=205,163;MMQ=22,20;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	16907164	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=185,179;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,17:0.222:79:27,11:33,6:51,11,14,3
chr1	16907165	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=186,156;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,12:0.164:77:32,6:32,6:53,12,10,2
chr1	16907204	.	G	A	.	.	DP=121;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=161,164;MMQ=25,23;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,14:0.129:111:38,8:58,6:85,12,13,1
chr1	16907466	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,177;MMQ=20,20;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.111:42:22,2:16,2:0,38,0,4
chr1	16908989	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=139,153;MMQ=40,28;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.194:29:13,4:8,1:14,10,4,1
chr1	16909000	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=131,139;MMQ=33,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:12,1:3,4:5,10,1,4
chr1	16914159	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=154,102;MMQ=52,26;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.076:64:31,2:26,1:52,8,4,0
chr1	16914160	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=131,194;MMQ=54,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,15:0.239:65:24,9:23,6:41,9,15,0
chr1	16914168	.	C	G	.	.	DP=90;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=125,178;MMQ=55,29;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=105.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,34:0.384:89:28,13:25,17:43,12,32,2
chr1	16914176	.	C	T	.	.	DP=121;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=130,108;MMQ=40,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,9:0.083:118:55,2:53,7:85,24,8,1
chr1	16914196	.	T	C	.	.	DP=212;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=127,165;MMQ=40,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:181,12:0.066:193:85,9:95,3:123,58,8,4
chr1	16914306	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=160,176;MMQ=27,35;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,11:0.171:68:29,5:26,6:2,55,0,11
chr1	16914339	.	G	C	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=189,169;MMQ=49,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.122:55:24,4:24,2:3,46,0,6
chr1	16915570	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,20;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	16915609	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=149,153;MMQ=20,20;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	16915611	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=153,149;MMQ=20,20;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	16918255	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=189,211;MMQ=23,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.413:8:1,3:2,0:5,0,3,0
chr1	16918605	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=145,258;MMQ=22,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:0|1:16918605_A_C:16918605:2,10,0,2
chr1	16918611	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=231,120;MMQ=35,21;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,7:0.571:12:1,4:4,3:1|0:16918605_A_C:16918605:0,5,1,6
chr1	17251055	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr1	17256313	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,41;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	17264090	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,171;MMQ=50,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:15,2:5,5:15,5,6,1
chr1	17264296	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,172;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:3,2:4,7:1,7,0,9
chr1	17264863	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,127;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,13:0.210:65:34,4:12,9:42,10,10,3
chr1	17265327	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,4:5,1:7,1,5,0
chr1	17265366	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,4:8,0:9,6,5,0
chr1	17266665	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17266665_G_A:17266665:0,1,0,1
chr1	17266674	.	T	TGGGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17266665_G_A:17266665:0,1,0,1
chr1	17266677	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=205,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:17266665_G_A:17266665:0,2,0,1
chr1	17270498	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,221;MMQ=58,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,2:7,1:14,0,3,0
chr1	17275072	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=183,164;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	17281128	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,2:8,0:14,0,2,0
chr1	17297289	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	17299014	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	17301672	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	17303589	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,17,9
chr1	17303792	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	17313157	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	17323449	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	17328621	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,1:11,1:9,11,1,1
chr1	17328731	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,3:7,9:7,4,7,5
chr1	17331886	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:11,3,2,0
chr1	17359676	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,4,14
chr1	17395480	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	17395516	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=148,149;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:5,2:2,0:5,3,2,0
chr1	17395521	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,8,3
chr1	17396498	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	17398066	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:17398066_G_C:17398066:0,0,0,5
chr1	17398069	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:17398066_G_C:17398066:0,0,0,5
chr1	17401283	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr1	17402116	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	17402135	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	17402159	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr1	17402347	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	17402418	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	17405916	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr1	17405949	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr1	17410364	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	17418883	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0|1:17418883_A_G:17418883:0,0,5,1
chr1	17418894	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:17418883_A_G:17418883:0,0,6,3
chr1	17419066	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr1	17422302	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.878:6:0,1:0,3:0,0,6,0
chr1	17431363	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	17431618	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	17550225	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	17551034	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	17555316	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr1	17563957	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:11,2:9,0:8,15,0,2
chr1	17601083	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr1	17607068	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,2:0,0,6,4
chr1	17660718	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=132,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.061:63:27,1:31,2:59,1,3,0
chr1	17660802	.	A	AT,ATT	.	.	DP=74;ECNT=3;MBQ=33,31,25;MFRL=131,118,147;MMQ=60,60,57;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=21.34,4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,14,4:0.393,0.129:36:9,9,1:8,5,1:8,10,9,9
chr1	17660858	.	CA	TG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=161,151;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:14,2:4,0:0,19,0,2
chr1	17662705	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.497:38:9,11:9,7:8,11,9,10
chr1	17674358	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	17674402	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,5:0,1:1,1,6,1
chr1	17681277	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	17683041	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	17690312	.	G	GCTCC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=151,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,1:4,0:0|1:17690312_G_GCTCC:17690312:0,5,0,1
chr1	17690316	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=151,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:0,1:4,0:0|1:17690312_G_GCTCC:17690312:0,5,0,1
chr1	17690320	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=151,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:17690312_G_GCTCC:17690312:0,3,0,1
chr1	17690322	.	G	GAAATTCTTTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=151,223;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:17690312_G_GCTCC:17690312:0,3,0,1
chr1	17707739	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	17714864	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:3,1,5,0
chr1	17715081	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,33;MFRL=130,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr1	17715135	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	17718671	.	AG	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=93.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,18:0,0,7,23
chr1	17718750	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=198,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,0:2,6:0,3,1,5
chr1	17720391	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=117,102;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	17720439	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr1	17720615	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	17721388	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	17722208	.	C	CTTGTGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=89,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	17723476	.	C	CCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,1:2,3:7,0,5,0
chr1	17723739	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr1	17725358	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,2,7
chr1	17736578	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr1	17738570	.	AC	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.484:27:8,7:5,5:11,3,8,5
chr1	17752000	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.432:37:14,7:7,8:17,4,12,4
chr1	17764627	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,0:2,2:3,0,3,0
chr1	17907247	.	T	TTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=14,27;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr1	17914846	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr1	17928678	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=95,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:3,2,2,3
chr1	17930186	.	G	GAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	17944753	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:17944753_C_G:17944753:0,0,1,0
chr1	17944757	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:17944753_C_G:17944753:0,0,1,0
chr1	17945755	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,6:3,3:7,0,8,1
chr1	17945774	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=129,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.526:24:5,4:6,5:8,3,12,1
chr1	17948305	.	G	GGGCCACAGCAGGTACT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=157,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,1:3,0,3,1
chr1	17949680	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=130,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,2:4,5:4,4,2,5
chr1	17975118	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:6,7,2,0
chr1	18023290	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,6:3,3:8,1,7,2
chr1	18023632	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=106,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.762:14:2,6:0,2:3,0,4,7
chr1	18691665	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=83,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	18702988	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	18703208	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	18704862	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr1	18810466	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=113,43;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,2:15,0:14,14,1,1
chr1	18812478	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,4:6,3:13,2,6,1
chr1	18960722	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	18961812	.	G	GTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=195,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	18961817	.	G	GGGCTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=182,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	19166221	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,0:5,2:0|1:19166221_G_T:19166221:5,12,1,1
chr1	19166226	.	G	GAAGTAGTGGTCAGAGTGTTGCCA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=146,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,0:4,2:0|1:19166221_G_T:19166221:5,12,1,1
chr1	19166294	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=141,194;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,2:6,5:4,5,3,4
chr1	19166378	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:13,0:13,4:14,13,2,2
chr1	19166685	.	A	ACCGGAACTGTTCCTATTTGGCCATC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=183,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr1	19200908	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	19202770	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	19202926	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	19204154	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	19204173	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	19208145	.	G	GGGTTGCCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.840:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr1	19208311	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,4:2,0:4,1,2,2
chr1	19209543	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	19215834	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,7:0,9:0,0,14,5
chr1	19238067	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=191,155;MMQ=46,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	19238556	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,0:7,2:10,12,0,2
chr1	19243452	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:9,8,0,2
chr1	19403173	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=159,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr1	19408294	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:3,3:4,4:1,7,1,6
chr1	19408380	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,0,2
chr1	19420392	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,1:1,6:7,0,5,2
chr1	19426199	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,0:4,4:1,4,0,4
chr1	19428032	.	G	GGATTC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=147,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:19428032_G_GGATTC:19428032:5,1,1,1
chr1	19428034	.	G	GGGGCACAGGGCTGAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=147,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:19428032_G_GGATTC:19428032:5,1,1,1
chr1	19428036	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=147,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:0|1:19428032_G_GGATTC:19428032:5,1,1,1
chr1	19430828	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.743:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	19430849	.	A	AAC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19430849_A_AAC:19430849:0,0,0,1
chr1	19430851	.	TCTA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19430849_A_AAC:19430849:0,0,0,1
chr1	19437242	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,101;MMQ=60,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:13,0:7,4:15,5,4,0
chr1	19440107	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=190,334;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	19442056	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,38;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:13,6,1,1
chr1	19442076	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,38;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:8,0:11,2:13,6,1,1
chr1	19448326	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr1	19448608	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	19453219	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:19453219_TT_CA:19453219:0,1,0,1
chr1	19453225	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19453219_TT_CA:19453219:0,0,0,1
chr1	19453227	.	G	GGTCTGGGGCTCTGGGTTCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:19453219_TT_CA:19453219:0,0,0,1
chr1	19474975	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=48,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,0:0,6:2,0,5,1
chr1	19476307	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,10;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.207:44:17,0:11,1:20,14,0,10
chr1	19480373	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,4:0.073:66:30,4:32,0:31,31,4,0
chr1	19483209	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=198,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,5:4,6:9,0,11,0
chr1	19486804	.	GAA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=10,18;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,0:0,0:0,4,0,4
chr1	19486839	.	T	TCAGTATCTACTTAAATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr1	19487656	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:1,7,0,4
chr1	19488493	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	19491857	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,1:6,1:3,9,0,2
chr1	19492232	.	G	GTAATTA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:19492232_G_GTAATTA:19492232:5,5,1,1
chr1	19492234	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,1:6,0:0|1:19492232_G_GTAATTA:19492232:5,5,1,1
chr1	19499835	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:1,7,4,2
chr1	19500729	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	19518659	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,5:4,4:3,2,6,3
chr1	19519887	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	19549343	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:5,2:10,5:4,11,0,7
chr1	19549864	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,3:3,1:8,3,2,2
chr1	19557699	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:7,1,2,0
chr1	19557713	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=138,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:6,1,3,2
chr1	19564650	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=189,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,3:5,1:2,9,1,3
chr1	19566296	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:3,4:11,4:11,3,8,0
chr1	19568972	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:5,1:4,7:2,7,2,7
chr1	19570145	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=118,135;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:9,10,2,0
chr1	19578192	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	19582563	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	19583476	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=180,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:19583476_A_C:19583476:4,0,1,0
chr1	19583479	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=180,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:19583476_A_C:19583476:4,0,1,0
chr1	19583734	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	19595892	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,9:0,14:0,0,7,19
chr1	19597420	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,32:0.451:71:22,14:17,17:20,19,22,10
chr1	19597464	.	AT	GC	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=143,172;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:21,0:21,3:0|1:19597464_AT_GC:19597464:10,33,0,3
chr1	19597467	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=146,172;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.082:47:21,0:16,3:0|1:19597464_AT_GC:19597464:10,34,0,3
chr1	19597482	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=159,167;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:15,0:12,4:1,26,0,4
chr1	19611410	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	19612898	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=122,178;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:19,0:6,2:0|1:19612898_A_G:19612898:5,20,0,2
chr1	19612904	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=122,178;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,0:6,2:0|1:19612898_A_G:19612898:5,20,0,2
chr1	19630893	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=169,186;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:5,2:4,0:0,11,0,2
chr1	19638309	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,15,5
chr1	19651102	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=232,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,3,1
chr1	19651277	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,1:0,3:0,5,0,4
chr1	19651300	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=204,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr1	19651330	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=212,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr1	19669235	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:7,2,3,1
chr1	19683301	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	19981791	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,4:1,4:1,1,5,3
chr1	20027404	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=124,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:3,2,1,5
chr1	20027423	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr1	20027474	.	C	CTCAGCTAATTTTTAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	20066485	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=177,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:20066485_G_A:20066485:0,3,0,4
chr1	20066490	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=177,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:20066485_G_A:20066485:0,3,0,4
chr1	20067186	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=147,213;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	20073139	.	TGGACG	T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=135,92;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:26,0:9,2:0|1:20073139_TGGACG_T:20073139:12,30,1,1
chr1	20073145	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=135,92;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:30,0:11,2:0|1:20073139_TGGACG_T:20073139:12,30,1,1
chr1	20073156	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=135,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.113:33:21,0:9,3:0|1:20073139_TGGACG_T:20073139:5,25,1,2
chr1	20141279	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:3,2,0,2
chr1	20216860	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,13,1
chr1	20221013	.	TCTAAGTCAG	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=111,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.501:10:3,3:1,2:0|1:20221013_TCTAAGTCAG_T:20221013:2,3,0,5
chr1	20221029	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,3:0,2:0|1:20221013_TCTAAGTCAG_T:20221013:0,3,0,5
chr1	20221061	.	A	ATGGTTGTTATGTGTCAAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=170,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:20221061_A_ATGGTTGTTATGTGTCAAG:20221061:0,4,0,1
chr1	20221064	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=170,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:20221061_A_ATGGTTGTTATGTGTCAAG:20221061:0,4,0,1
chr1	20246876	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=118,156;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.512:23:5,2:6,8:4,7,4,8
chr1	20248709	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr1	20249288	.	C	CACCAAGCGATCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	20250021	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:9,7,2,0
chr1	20411234	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=89,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:4,1:1,4,1,1
chr1	20411300	.	GT	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.510:37:5,12:12,7:10,8,12,7
chr1	20411332	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.469:38:10,5:9,11:11,9,6,12
chr1	20490745	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	20501442	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,5:2,3:6,0,7,1
chr1	20519217	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,1:13,1:15,5,1,1
chr1	20649814	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=93,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr1	20657352	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=102,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:9,2:4,4:8,5,4,2
chr1	20664128	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=186,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,2:3,3:8,1,3,2
chr1	20677344	.	C	CAGAAGGGCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=142,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:2,2:4,0:0|1:20677344_C_CAGAAGGGCA:20677344:3,5,1,1
chr1	20677346	.	C	CATGCTTGGCTGAACACTCTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=142,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:20677344_C_CAGAAGGGCA:20677344:3,5,1,1
chr1	20680760	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=165,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr1	20680778	.	T	TTTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	20829808	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.573:19:3,3:1,3:0,8,0,11
chr1	20940258	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	20964328	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,14:0,0,11,8
chr1	20966533	.	ACT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=214,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:20966533_ACT_A:20966533:0,1,0,1
chr1	20966538	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=214,172;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:20966533_ACT_A:20966533:0,1,0,1
chr1	20972048	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,4,5
chr1	20975168	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	20977221	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	20978832	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	20979148	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=126,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.139:19:7,0:9,2:0|1:20979148_C_T:20979148:12,5,0,2
chr1	20979155	.	A	AATTAGGTTTGG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=116,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.128:21:9,0:10,1:0|1:20979148_C_T:20979148:13,6,0,2
chr1	20979307	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,7,6
chr1	20980880	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=99.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,11:0,18:0,0,9,21
chr1	20987660	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.184:41:9,0:11,0:16,17,8,0
chr1	20987662	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.141:40:11,0:11,0:17,17,6,0
chr1	20992606	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	21030902	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	21040079	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	21043913	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr1	21043926	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	21044161	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	21050707	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,27;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:7,0:16,2:8,15,1,1
chr1	21053607	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,0:2,1:0|1:21053607_C_CAA:21053607:1,2,0,1
chr1	21053610	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,15;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:1,0:0|1:21053607_C_CAA:21053607:1,2,0,1
chr1	21071418	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:16,1:15,1:19,12,2,0
chr1	21099846	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	21102502	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=19,18;MFRL=99,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.584:6:0,0:1,0:1,2,0,3
chr1	21174429	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	21175855	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr1	21179969	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr1	21188871	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	21327637	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,12,0
chr1	21377314	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr1	21494634	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=92,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=168.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,52:0.964:53:0,30:1,19:0,1,10,42
chr1	21571601	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:2,3:6,3:2,7,2,4
chr1	21583925	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:5,0,4,0
chr1	21583973	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=115,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.441:23:6,4:7,6:9,4,7,3
chr1	21771724	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=133,159;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.061:63:29,0:30,3:27,33,0,3
chr1	21797996	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,16,2
chr1	21799489	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,5,13
chr1	21799823	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,7:0,0,14,2
chr1	21799834	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=161,84;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,0:3,0:12,1,1,1
chr1	21801346	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	21804815	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr1	21805730	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	21805958	.	A	AAACAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=218,153;MMQ=49,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:1,1:0,0:0|1:21805958_A_AAACAG:21805958:0,2,0,1
chr1	21805962	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=218,153;MMQ=49,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:1,1:0,0:0|1:21805958_A_AAACAG:21805958:0,2,0,1
chr1	21805978	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	21806447	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	21806620	.	TTTGAGTA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=236,120;MMQ=31,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:21806620_TTTGAGTA_T:21806620:0,1,0,1
chr1	21806630	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=236,120;MMQ=31,43;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21806620_TTTGAGTA_T:21806620:0,1,0,1
chr1	21807405	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,159;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:10,2:6,3:16,0,4,1
chr1	21807521	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,136;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:7,1:5,2:0,12,0,4
chr1	21809828	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	21887290	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=191,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr1	21889541	.	CGGG	C,AGGG	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=32,26,17;MFRL=153,167,155;MMQ=60,60,60;MPOS=14,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.71,4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,2,2:0.091,0.091:30:12,0,0:7,1,0:24,2,4,0
chr1	21889547	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=34,17;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=-1073741816;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:15,0:10,1:23,2,4,0
chr1	21889551	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:14,0:13,1:26,3,2,0
chr1	21889635	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,22:0,20:0,0,17,26
chr1	21889663	.	G	GTGTGTGTGTGT	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:22,1:14,1:0|1:21889663_G_GTGTGTGTGTGT:21889663:14,24,0,2
chr1	21889665	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:22,1:12,1:0|1:21889663_G_GTGTGTGTGTGT:21889663:14,24,0,2
chr1	21896767	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=101,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:7,1,6,2
chr1	21902998	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=120,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.405:8:2,0:2,0:0|1:21902998_A_C:21902998:1,4,3,0
chr1	21903004	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=103,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:3,0:2,0:0|1:21902998_A_C:21902998:1,4,3,0
chr1	21903010	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,18;MFRL=102,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,0:2,0:0|1:21902998_A_C:21902998:2,4,2,0
chr1	21929260	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	21929456	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	21934693	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr1	21935467	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,0,10
chr1	21939741	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,4,16
chr1	21940603	.	CA	TT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=135,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:21940603_CA_TT:21940603:0,3,0,1
chr1	21940610	.	G	GGTACCTCGCCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=147,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:21940603_CA_TT:21940603:0,4,0,1
chr1	21940612	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=147,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:21940603_CA_TT:21940603:0,4,0,1
chr1	21940632	.	C	CAATTTCGTTGTGTGGATTTAAAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	21946415	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	21978174	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21978174_A_C:21978174:0,1,1,0
chr1	21978178	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21978174_A_C:21978174:0,1,1,0
chr1	22013561	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	22013771	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,4:0,0,0,10
chr1	22030121	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	22030930	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,37;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22030930_T_C:22030930:0,0,0,1
chr1	22030932	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22030930_T_C:22030930:0,0,0,1
chr1	22030939	.	T	TGAAGTGGGAGATGTAAACCCTTCAGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22030930_T_C:22030930:0,0,0,1
chr1	22033124	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=172,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:9,0:3,3:0|1:22033124_A_T:22033124:6,6,0,3
chr1	22033126	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=172,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:8,0:3,3:0|1:22033124_A_T:22033124:6,6,0,3
chr1	22033338	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:14,0:9,3:7,19,0,3
chr1	22063149	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,2,19
chr1	22082967	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.715:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr1	22142618	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:22142618_G_GC:22142618:0,3,1,1
chr1	22142619	.	G	GGTGACAGAGAGATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:22142618_G_GC:22142618:0,3,1,1
chr1	22150257	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	22157418	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=178,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr1	22157689	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	22158363	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr1	22158988	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:11,3:16,0:15,12,2,1
chr1	22159156	.	C	CAGGACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:22159156_C_CAGGACT:22159156:0,1,0,1
chr1	22159160	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:22159156_C_CAGGACT:22159156:0,1,0,1
chr1	22159162	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=19,27;MFRL=144,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:22159156_C_CAGGACT:22159156:0,1,0,1
chr1	22160148	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	22168216	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr1	22174600	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	22183471	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	22183739	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,3,4
chr1	22186234	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr1	22188320	.	CA	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	22199081	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	22199821	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr1	22200019	.	G	GCCTGGCTATAAAGTGAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	22200835	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	22202109	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	22205130	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=120,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:9,2:6,8,2,0
chr1	22205408	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr1	22205466	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,8,2
chr1	22207804	.	ACCCAGGGTGGCAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,1:0,0,7,1
chr1	22208030	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	22211222	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr1	22213638	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=167,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr1	22215088	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,8,2
chr1	22307743	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	22307757	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	22310139	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=186,164;MMQ=40,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,18:0.905:19:0,8:1,9:0|1:22310139_T_G:22310139:0,1,14,4
chr1	22310145	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=186,158;MMQ=40,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,17:0.902:18:0,7:1,9:0|1:22310139_T_G:22310139:0,1,13,4
chr1	22310411	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:22310411_A_G:22310411:0,0,0,2
chr1	22310413	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:22310411_A_G:22310411:0,0,0,2
chr1	22310662	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,3:0,14:0,0,13,4
chr1	22310674	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,2:0,14:0,0,11,5
chr1	22313161	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,20:0,15:0,0,6,31
chr1	22313197	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=154,157;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,5:5,5:0,11,0,10
chr1	22315662	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=160,159;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,13:0.304:44:10,8:20,5:0|1:22315662_C_T:22315662:26,5,12,1
chr1	22315666	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=158,159;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=46.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,13:0.311:43:8,8:20,5:0|1:22315662_C_T:22315662:25,5,12,1
chr1	22315710	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=160,155;MMQ=39,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:8,2:11,3:1,18,0,5
chr1	22315738	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,0,37
chr1	22328279	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,4:5,7:1,10,2,9
chr1	22329414	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=130,59;MMQ=60,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.703:5:0,1:1,1:1,0,4,0
chr1	22329645	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=169,191;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr1	22333595	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,206;MMQ=56,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:7,1:7,3:0|1:22333595_G_A:22333595:0,14,0,4
chr1	22333597	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=165,220;MMQ=52,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,3:0.220:16:7,0:6,3:1|0:22333595_G_A:22333595:0,13,0,3
chr1	22336120	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=126,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr1	22336277	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,20:0,23:0,0,26,19
chr1	22336305	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,25:0.406:62:13,12:21,12:0|1:22336305_C_T:22336305:26,11,14,11
chr1	22336308	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=153,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,25:0.406:62:16,13:20,12:0|1:22336305_C_T:22336305:26,11,14,11
chr1	22336371	.	C	A	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=121,141;MMQ=27,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.511:47:13,14:10,10:7,16,7,17
chr1	22408106	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	22408199	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,4:5,2:6,3,5,2
chr1	22817133	.	A	AATTCATTCCCACCCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr1	22817160	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	22827931	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.562:16:2,6:4,3:7,0,7,2
chr1	22832743	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,8,14
chr1	22837586	.	CTT	C,CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33,34;MFRL=0,77,174;MMQ=60,50,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=6.33,6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.432,0.431:4:0,1,2:0,1,0:0,0,4,0
chr1	22837606	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,17;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:0,0:0|1:22837606_G_T:22837606:3,0,2,0
chr1	22837609	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=23,16;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:1,0:0|1:22837606_G_T:22837606:4,0,2,0
chr1	22837849	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:0,2:3,2:0,3,1,4
chr1	22838560	.	CAAG	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=132,60;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAG;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:9,0:17,1:7,20,0,2
chr1	22848972	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr1	22849003	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:0|1:22849003_A_C:22849003:0,4,0,2
chr1	22849009	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=180,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:0|1:22849003_A_C:22849003:0,4,0,1
chr1	22924007	.	GGCA	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr1	22924017	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:22924017_G_GC:22924017:1,2,0,1
chr1	22924018	.	G	GGTCT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:22924017_G_GC:22924017:1,2,0,1
chr1	22924020	.	CACCCA	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,24;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:22924017_G_GC:22924017:1,2,0,1
chr1	22924029	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:22924017_G_GC:22924017:0,2,0,1
chr1	22924030	.	A	ACCAAGCAC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	22925292	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	22927617	.	C	CCG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22927617_C_CCG:22927617:0,0,0,1
chr1	22927619	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:22927617_C_CCG:22927617:0,0,0,1
chr1	22987951	.	TT	CC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:22987951_TT_CC:22987951:0,2,0,1
chr1	22987957	.	AACC	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:22987951_TT_CC:22987951:0,2,0,1
chr1	22987958	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.695:1:0,1:0,0:1|0:22987951_TT_CC:22987951:0,0,0,1
chr1	22987961	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22987951_TT_CC:22987951:0,1,0,1
chr1	23108089	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr1	23189433	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	23191746	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:1,3,3,4
chr1	23232400	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	23236826	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	23239142	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	23240245	.	G	GA	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=104,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.125:37:13,2:12,1:18,15,2,2
chr1	23240295	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=140,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.149:51:20,0:16,0:26,18,0,7
chr1	23240380	.	T	TAAAAGCTGGAAGAAGACAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0,8,0,2
chr1	23286503	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,123;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,0:3,3:2,7,0,3
chr1	23289568	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	23380198	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,14,3
chr1	23399932	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	23418153	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,5,9
chr1	23418392	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=122,97;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,3:9,0:8,7,3,0
chr1	23520743	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,40;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:16,8,2,0
chr1	23710805	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr1	23713952	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	23724183	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,4:3,7:0,4,0,11
chr1	23735241	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,12:0,0,5,14
chr1	23743923	.	T	TCTCCCCACTAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:12,3:8,0:0|1:23743923_T_TCTCCCCACTAA:23743923:1,19,0,3
chr1	23743924	.	G	GTCATGCTGGGT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:12,2:8,0:0|1:23743923_T_TCTCCCCACTAA:23743923:1,19,0,3
chr1	23758134	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr1	23768732	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:5,3:5,2:5,7,3,2
chr1	23779324	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,15;MFRL=168,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:23779324_T_G:23779324:0,4,0,1
chr1	23779325	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=168,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:23779324_T_G:23779324:0,4,0,1
chr1	23836364	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=171,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,16:0.327:50:11,7:22,9:22,12,12,4
chr1	23850835	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,14;MFRL=117,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,0:3,1,2,0
chr1	23850846	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=96,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.417:5:0,0:2,0:1,2,2,0
chr1	24022437	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:5,8:7,6:2,10,3,11
chr1	24105906	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:4,0:9,0:5,12,2,0
chr1	24106510	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	24119430	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=192,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:4,0:10,0,0,2
chr1	24119435	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:4,3:4,0:8,0,1,4
chr1	24120262	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,14;MFRL=116,105833819;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.250:9:3,0:3,0:5,2,0,2
chr1	24120821	.	T	TGGGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,14;MFRL=92,113;MMQ=60,42;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,6;RU=G;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:2,2,1,0
chr1	24122554	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.215:22:4,0:10,1:4,13,5,0
chr1	24123717	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24123717_A_T:24123717:0,2,0,1
chr1	24123720	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24123717_A_T:24123717:0,2,0,1
chr1	24123722	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24123717_A_T:24123717:0,2,0,1
chr1	24123734	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:24123717_A_T:24123717:0,2,0,1
chr1	24125096	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=168,106;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:3,1:5,0:0|1:24125096_TG_T:24125096:6,2,1,1
chr1	24125098	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=168,106;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:0|1:24125096_TG_T:24125096:6,2,1,1
chr1	24129126	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr1	24140916	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:24140916_A_G:24140916:0,0,0,1
chr1	24140923	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:24140916_A_G:24140916:0,0,0,1
chr1	24143932	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	24151996	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr1	24172346	.	C	CTT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.121:30:10,0:17,3:0|1:24172346_C_CTT:24172346:6,21,0,3
chr1	24172348	.	G	GTAGTTGAGGTAGTTATGGGGGATT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:8,0:17,3:0|1:24172346_C_CTT:24172346:6,21,0,3
chr1	24189767	.	A	AGTTCTCTCTTAAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=113,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:24189767_A_AGTTCTCTCTTAAAG:24189767:0,3,0,1
chr1	24189769	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=113,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:24189767_A_AGTTCTCTCTTAAAG:24189767:0,3,0,1
chr1	24192200	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	24288404	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=156,163;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=104.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,36:0.463:78:16,16:26,20:13,29,14,22
chr1	24288432	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=170,166;MMQ=60,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,19:0.347:55:18,11:18,7:8,28,7,12
chr1	24288476	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=170,180;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,33:0.523:63:9,22:21,11:16,14,16,17
chr1	24288529	.	TAAAC	T	.	.	DP=81;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=144,162;MMQ=52,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=133.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,36:0.481:75:14,18:25,18:25,14,20,16
chr1	24289891	.	ATGAATG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.503:16:4,5:4,3:0,8,0,8
chr1	24294249	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=147.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,23:0,21:0,0,17,28
chr1	24294362	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,3:6,3:6,5,4,2
chr1	24298263	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=213,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,2:7,1:4,5,3,0
chr1	24301508	.	C	A	.	.	DP=100;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,131;MMQ=60,29;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,3:0.041:95:49,2:43,1:31,61,0,3
chr1	24383819	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,6:0,0,11,2
chr1	24388371	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr1	24388417	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,3:4,3:5,3,5,2
chr1	24390731	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	24393656	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,6:0,12:0,0,2,16
chr1	24400584	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=97.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,26,1
chr1	24400633	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=105.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,12:0,19:0,0,15,18
chr1	24408414	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr1	24408765	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	24421334	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,10,7
chr1	24421804	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	24421875	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,5:0,0,9,8
chr1	24433547	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=187,184;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr1	24434595	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=112,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,2:7,5:5,7,2,5
chr1	24447468	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,156;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,26:0.509:51:13,10:12,16:9,16,9,17
chr1	24485518	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=107.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,17:0,14:0,0,19,14
chr1	24485941	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=89.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,12:0,0,21,5
chr1	24486216	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,34;MFRL=137,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:0,0:0,1,0,3
chr1	24507160	.	C	CCCG	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,23;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:2,1:0|1:24507160_C_CCCG:24507160:0,5,2,0
chr1	24507162	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:3,0:2,1:0|1:24507160_C_CCCG:24507160:0,5,2,0
chr1	24507164	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=35,13;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,0:0|1:24507160_C_CCCG:24507160:0,5,2,0
chr1	24507172	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:24507160_C_CCCG:24507160:1,6,2,0
chr1	24507176	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:24507160_C_CCCG:24507160:1,6,2,0
chr1	24663169	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=183,63;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:24663169_TG_T:24663169:2,6,1,1
chr1	24663173	.	G	GGGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=183,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:0|1:24663169_TG_T:24663169:2,6,1,1
chr1	24671287	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:7,2:7,1:13,1,3,1
chr1	24671464	.	ACCCTCCACACCTGTGCC	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCTCCACACCTGTGCC;STR;TLOD=92.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.978:30:0,14:0,10:0,0,6,24
chr1	24673866	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr1	24706329	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:6,4:3,9:2,7,4,9
chr1	24775967	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.544:44:10,12:9,11:12,8,16,8
chr1	24779873	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,5:1,1:1,1,4,2
chr1	24782719	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.082:35:17,2:12,0:11,22,2,0
chr1	24782810	.	T	TAATACTTCAGG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=191,32;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:0,13,1,1
chr1	24784197	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,1:2,2:8,0,3,0
chr1	24795493	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=121,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:10,1:11,1:13,8,0,2
chr1	24840768	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr1	24932046	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	24972639	.	G	GTAATTTTTTCTGCCAGCTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:24972639_G_GTAATTTTTTCTGCCAGCTA:24972639:0,4,0,1
chr1	24972642	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:24972639_G_GTAATTTTTTCTGCCAGCTA:24972639:0,4,0,1
chr1	24978892	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.736:9:0,5:1,2:2,0,7,0
chr1	24987302	.	G	GT	.	.	DP=189;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=128,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:116,7:0.052:123:71,5:44,1:36,80,2,5
chr1	24989762	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,6:0,0,4,14
chr1	24996704	.	A	C	.	.	DP=115;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=134,150;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,16:0.126:99:35,0:34,2:25,58,15,1
chr1	24996710	.	A	C	.	.	DP=107;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,11:0.075:100:40,0:38,0:30,59,11,0
chr1	24998126	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:10,0:3,2:3,10,0,2
chr1	25153692	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr1	25254317	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	25648349	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=58.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,14,4
chr1	25678002	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=210,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	25678238	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	25679278	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.281:16:8,2:4,2:11,1,4,0
chr1	25689083	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	25717139	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	25717365	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,180;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,4:5,8:6,2,7,5
chr1	25815597	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=208,161;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:25815597_T_C:25815597:4,0,1,0
chr1	25815603	.	GG	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=206,161;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:1,0:0|1:25815597_T_C:25815597:5,0,1,0
chr1	25825048	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	25893242	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	25893462	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,2:8,0:8,12,1,1
chr1	26085048	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr1	26098107	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,5:0,0,12,3
chr1	26098333	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	26107688	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	26109237	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	26110143	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	26135454	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,13;MFRL=217,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.641:6:1,0:0,1:2,0,4,0
chr1	26152828	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,75;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:13,3:9,0:9,13,2,1
chr1	26310394	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=71.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,12:0,8:0,0,16,4
chr1	26310836	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	26357855	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	26357867	.	G	GCTTTCTGGGTTCATCTCTGTCCTCTGGGGACTGGACCACATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	26365549	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	26370136	.	CA	AC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	26371788	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	26510364	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=144,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr1	26510380	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:26510380_C_CAA:26510380:0,4,0,1
chr1	26510384	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:26510380_C_CAA:26510380:0,4,0,1
chr1	26511700	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:8,2:4,3:4,8,0,6
chr1	26513743	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=99,46;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:16,0:9,2:0|1:26513743_G_A:26513743:15,10,1,1
chr1	26513747	.	T	TTA	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=99,46;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:10,0:8,2:0|1:26513743_G_A:26513743:15,10,1,1
chr1	26513748	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=99,46;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:14,0:8,2:0|1:26513743_G_A:26513743:14,11,1,1
chr1	26513750	.	GAT	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=114,46;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:13,0:9,2:0|1:26513743_G_A:26513743:12,11,1,1
chr1	26524706	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=99.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,17:0,9:0,0,24,2
chr1	26526554	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:4,6:2,4:3,3,4,7
chr1	26527255	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=211,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0|1:26527255_G_A:26527255:1,0,4,0
chr1	26527260	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=208,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,2:0,1:0|1:26527255_G_A:26527255:2,0,4,0
chr1	26527304	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=124,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:2,4:2,5:0|1:26527304_T_C:26527304:4,1,9,1
chr1	26527310	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:0|1:26527304_T_C:26527304:4,1,8,1
chr1	26527783	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	26527809	.	AG	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:3,2:6,0,2,0
chr1	26528922	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.368:28:6,9:11,1:15,3,9,1
chr1	26529121	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,1,15
chr1	26566187	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	26583998	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	26594886	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,141;MMQ=60,36;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:7,2:19,0:26,0,2,0
chr1	26597435	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr1	26601385	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,22,0
chr1	26601429	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,87;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:23,1:11,1:29,7,2,0
chr1	26603310	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=152,110;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,0:5,3:0,9,0,3
chr1	26608782	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=180,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,3:3,0:4,4,3,0
chr1	26609307	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr1	26620846	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	26627478	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,12:0,0,8,19
chr1	26629465	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	26658160	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=165,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:26658160_T_A:26658160:1,2,0,1
chr1	26658162	.	C	CTCCCAGCCACCTCATAACCCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=165,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:26658160_T_A:26658160:1,2,0,1
chr1	26658179	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr1	26662774	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:2,8:6,1:6,2,8,2
chr1	26662904	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.440:50:19,10:8,11:10,18,7,15
chr1	26664219	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=227,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,0:1,3:0,3,0,3
chr1	26664914	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:12,2:12,8,2,0
chr1	26665991	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=176,155;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,2:1,1:0,7,0,3
chr1	26669699	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.481:4:1,0:1,0:0|1:26669699_A_C:26669699:0,2,2,0
chr1	26669703	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=188,266;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:1,2,1,0
chr1	26669706	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=188,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.407:5:2,0:1,0:0|1:26669699_A_C:26669699:1,2,2,0
chr1	26673220	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	26689659	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:1,4,0,3
chr1	26689671	.	GCCAA	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=186,34;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:26689671_GCCAA_G:26689671:0,6,1,1
chr1	26689682	.	AG	CA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=193,34;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:26689671_GCCAA_G:26689671:0,4,1,1
chr1	26689688	.	C	CTCTT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=193,34;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:26689671_GCCAA_G:26689671:0,4,1,1
chr1	26691286	.	CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=174,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:5,3:6,7:12,3,9,1
chr1	26694059	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr1	26698938	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,54;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,5:3,3:7,0,8,0
chr1	26699103	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=122,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.564:21:4,7:5,5:3,6,7,5
chr1	26699157	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=188,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:0,11,0,3
chr1	26700795	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,19:0,14:0,0,18,16
chr1	26752992	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=144,132;MMQ=52,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=97.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.944:34:1,14:0,18:1,0,6,27
chr1	26795291	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=239,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:26795291_G_GGC:26795291:1,0,1,0
chr1	26795295	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=14,34;MFRL=239,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:26795291_G_GGC:26795291:1,0,1,0
chr1	26795299	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,10;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0|1:26795291_G_GGC:26795291:0,1,2,0
chr1	26795301	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:26795291_G_GGC:26795291:0,1,2,0
chr1	26795303	.	CC	GG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,17;MFRL=69,239;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:1,0:1|0:26795291_G_GGC:26795291:1,1,1,0
chr1	26795307	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=24,12;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:26795291_G_GGC:26795291:2,1,1,0
chr1	26800588	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=159,94;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:9,0:15,3:5,20,0,3
chr1	26801229	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	26856462	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	26879792	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=213,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr1	26881565	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=215,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	26900735	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr1	27153595	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,0:1,2:1,2,1,1
chr1	27175306	.	G	GTCTGTTTTCATCCTCAAATCTTCTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	27175328	.	G	GTCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	27180425	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=272,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:27180425_C_A:27180425:0,1,0,1
chr1	27180426	.	TGCCAAAGACTCAAGTC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=272,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:27180425_C_A:27180425:0,1,0,1
chr1	27190821	.	GGT	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=150,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=GT;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.488:8:1,2:1,2:1,3,4,0
chr1	27210721	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=131,151;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.460:31:10,5:5,9:6,11,6,8
chr1	27250479	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr1	27428321	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=116,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:2,1:3,6,1,1
chr1	27435976	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27435976_C_G:27435976:0,0,1,0
chr1	27435980	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=153,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27435976_C_G:27435976:1,0,1,0
chr1	27609980	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.822:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	27627999	.	A	ATGAAGG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27627999_A_ATGAAGG:27627999:0,0,0,1
chr1	27628002	.	C	CGTG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,11;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27627999_A_ATGAAGG:27627999:0,0,0,1
chr1	27628008	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27627999_A_ATGAAGG:27627999:0,1,0,1
chr1	27628010	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,30;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27627999_A_ATGAAGG:27627999:0,1,0,1
chr1	27628014	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27627999_A_ATGAAGG:27627999:0,1,0,1
chr1	27628016	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27627999_A_ATGAAGG:27627999:0,1,0,1
chr1	27659965	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	27660033	.	T	TTATACA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=210,246;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	27676248	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27676248_T_A:27676248:0,0,0,1
chr1	27676255	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27676248_T_A:27676248:0,0,0,1
chr1	27682440	.	T	TG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:7,4:4,9:10,1,13,0
chr1	27682481	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=123,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,29:0.508:57:15,11:13,18:21,7,17,12
chr1	27685108	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:0,8,0,4
chr1	27686063	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr1	27687307	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:11,0:13,2:15,10,2,0
chr1	27688361	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:1,7,1,1
chr1	27690644	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr1	27696011	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr1	27708766	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:3,6,2,0
chr1	27738969	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=201,172;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,2:7,0:12,1,2,0
chr1	27738985	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=168,163;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:16,0,2,0
chr1	27744758	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:15,2:21,0:30,6,2,0
chr1	27876452	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:6,0:4,0:3,8,3,0
chr1	27876482	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:2,5:4,2:1,5,1,7
chr1	27876599	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=249,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,1:0,3,2,0
chr1	27941485	.	AG	TT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:6,0:1,13,1,1
chr1	27995077	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,7:0,16:0,0,2,26
chr1	28086955	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=85.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,24,0
chr1	28120170	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,2:3,2:0,5,0,4
chr1	28120198	.	GG	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:0|1:28120198_GG_AT:28120198:0,3,0,1
chr1	28120200	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:28120198_GG_AT:28120198:0,3,0,1
chr1	28128283	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:9,9,1,1
chr1	28169886	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=163,129;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:28169886_GC_G:28169886:0,3,0,1
chr1	28169890	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=163,129;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:28169886_GC_G:28169886:0,3,0,1
chr1	28169894	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=167,129;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28169886_GC_G:28169886:0,2,0,1
chr1	28169896	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=167,129;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28169886_GC_G:28169886:0,2,0,1
chr1	28176984	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,0:0,1:0|1:28176984_A_C:28176984:0,1,0,1
chr1	28176986	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28176984_A_C:28176984:0,1,0,1
chr1	28176988	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:28176984_A_C:28176984:0,1,0,1
chr1	28176989	.	G	GTCCTTGCAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:28176984_A_C:28176984:0,1,0,1
chr1	28176994	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:28176984_A_C:28176984:0,0,0,1
chr1	28206588	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:8,6:3,6:3,8,5,7
chr1	28209479	.	A	AGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:28209479_A_AGG:28209479:0,0,1,0
chr1	28209488	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=265,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,1:0|1:28209479_A_AGG:28209479:0,3,1,0
chr1	28212001	.	T	TTTGCGGCCATG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	28218864	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	28220484	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:4,1,1,1
chr1	28224312	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=198,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr1	28233572	.	G	C,GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,19,24;MFRL=223,194,144;MMQ=60,60,60;MPOS=2,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.05,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.255,0.276:9:2,0,0:2,0,1:4,0,1,4
chr1	28261593	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=213,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr1	28261658	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.502:14:3,2:4,4:4,3,4,3
chr1	28268706	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:5,2,7,0
chr1	28268833	.	C	CG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.521:21:3,7:7,3:0|1:28268833_C_CG:28268833:1,9,5,6
chr1	28268835	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.521:21:3,7:6,3:0|1:28268833_C_CG:28268833:1,9,5,6
chr1	28290231	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=57.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0|1:28290231_C_G:28290231:0,0,6,10
chr1	28290256	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=33,18;MFRL=161,56;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,1:8,0:0|1:28290231_C_G:28290231:3,10,1,1
chr1	28290260	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=32,20;MFRL=171,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:0|1:28290231_C_G:28290231:3,9,1,1
chr1	28290261	.	ATGTTGG	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=31,19;MFRL=171,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,1:7,0:0|1:28290231_C_G:28290231:3,9,1,1
chr1	28290271	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=152,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:28290231_C_G:28290231:0,7,1,1
chr1	28290273	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=152,56;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:3,0:0|1:28290231_C_G:28290231:0,7,1,1
chr1	28290275	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=32,22;MFRL=166,56;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:0|1:28290231_C_G:28290231:0,6,1,1
chr1	28293750	.	G	GTGGTAGTACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	28374815	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,5:4,5:12,0,11,0
chr1	28374836	.	GA	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.135:43:17,1:13,3:26,12,4,1
chr1	28555426	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:6,4:4,6:8,3,8,2
chr1	28555564	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,5:6,6:0,9,0,11
chr1	28559508	.	A	ATAT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=146,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:2,2:1,0:0|1:28559508_A_ATAT:28559508:2,1,1,1
chr1	28559513	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=146,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:28559508_A_ATAT:28559508:2,1,0,1
chr1	28559515	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=162,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:28559508_A_ATAT:28559508:1,1,0,1
chr1	28607398	.	G	GTCTGGGTCCTGATCTCCTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	28793041	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=121.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,41:0.656:62:14,21:7,19:13,8,27,14
chr1	28800758	.	CT	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=191,201;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	28802518	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:28802518_C_G:28802518:13,0,2,0
chr1	28802520	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:28802518_C_G:28802518:13,0,2,0
chr1	28802581	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.650:38:6,16:7,9:11,2,21,4
chr1	28807191	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=217,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	28817351	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=155,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	28817597	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr1	28818151	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:5,9:2,6:7,0,13,2
chr1	28823073	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,0:6,3:0|1:28823073_G_A:28823073:3,11,2,1
chr1	28823075	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:7,0:7,3:0|1:28823073_G_A:28823073:3,11,2,1
chr1	28864435	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:1,3:8,8:3,6,6,5
chr1	28897655	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=114,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	28920880	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=164,180;MMQ=40,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28920880_G_A:28920880:0,2,0,1
chr1	28920885	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=164,180;MMQ=40,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28920880_G_A:28920880:0,2,0,1
chr1	28920887	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,30;MFRL=164,180;MMQ=40,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:28920880_G_A:28920880:0,2,0,1
chr1	28920904	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=180,147;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28920904_TG_CA:28920904:0,1,0,1
chr1	28920910	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=180,147;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28920904_TG_CA:28920904:0,1,0,1
chr1	28920914	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=219,147;MMQ=44,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:28920904_TG_CA:28920904:1,1,0,1
chr1	28932064	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:28932064_T_G:28932064:0,1,0,1
chr1	28932067	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28932064_T_G:28932064:0,1,0,1
chr1	28932069	.	A	AGAGGAAGAAGGCGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28932064_T_G:28932064:0,1,0,1
chr1	28932070	.	T	TTAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28932064_T_G:28932064:0,1,0,1
chr1	28948534	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,2:0.048:60:24,2:29,0:22,36,0,2
chr1	29010090	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=136,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:7,2:10,4,0,2
chr1	29016714	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=61,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,0:1,1:0|1:29016714_T_C:29016714:1,1,0,1
chr1	29016718	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:29016714_T_C:29016714:1,3,0,1
chr1	29016721	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:29016714_T_C:29016714:1,3,0,1
chr1	29037240	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,1:1,2,0,3
chr1	29063559	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,5:0,0,13,1
chr1	29064036	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,2:2,2:9,0,4,0
chr1	29314512	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=194,182;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.252:6:1,0:4,1:0,5,0,1
chr1	29342090	.	GA	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.195:37:10,1:19,6:30,0,7,0
chr1	29345009	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr1	29345027	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,0,4
chr1	29359602	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=141,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,3:11,0:15,3,2,1
chr1	29439016	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:0,4:5,5:1,5,1,8
chr1	29475218	.	CCTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTT;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,2:6,0:3,5,2,0
chr1	29475394	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,5,5
chr1	29475432	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,1:8,2:7,6,0,3
chr1	29475648	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,6,16
chr1	29542435	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	29557224	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,18:0,9:0,0,20,11
chr1	29602368	.	GCTT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=216,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	29631236	.	C	CTA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,3:7,6:5,7,4,7
chr1	29633778	.	T	TCTGTCTGTCCCTTTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:29633778_T_TCTGTCTGTCCCTTTC:29633778:0,2,0,2
chr1	29633779	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:29633778_T_TCTGTCTGTCCCTTTC:29633778:0,2,0,2
chr1	29637136	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=206,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,2:1,2:6,1,4,0
chr1	29638988	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:3,6:6,7:8,1,12,1
chr1	29642681	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.419:45:14,11:11,6:6,20,8,11
chr1	29644184	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	31196255	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr1	31210611	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=31,16;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,0:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210613	.	CCGGGAAT	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210622	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=32,36;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210625	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=31,34;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210626	.	T	TAGACG	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=32,31;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210628	.	C	CACA	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=33,30;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210632	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=34,29;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210634	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=31,29;MFRL=214,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210641	.	A	ACAAAC	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=30,28;MFRL=198,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,4,0,1
chr1	31210646	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=29,22;MFRL=214,158;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31210648	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=214,158;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:0,0:3,1:0|1:31210611_AT_A:31210611:0,3,0,1
chr1	31351684	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31351684_A_C:31351684:0,1,0,1
chr1	31351686	.	C	CTACTCGGGGTCGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31351684_A_C:31351684:0,1,0,1
chr1	31413925	.	AATAAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:0,3:1,0,4,0
chr1	31465300	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=131,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,1:15,1:9,13,2,0
chr1	31656918	.	T	TGAATGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	31658202	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=122,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.117:28:12,1:7,1:16,9,0,3
chr1	31733028	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr1	31740653	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=140,61;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,2:12,0:0|1:31740653_G_A:31740653:16,8,1,1
chr1	31740660	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=140,61;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,2:9,0:0|1:31740653_G_A:31740653:13,9,1,1
chr1	31740668	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=97.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0|1:31740653_G_A:31740653:0,0,12,16
chr1	31744168	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	31762353	.	T	TGAAAACTAAGTAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	31764693	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	31764713	.	C	CAAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,3:0,0,5,1
chr1	31764930	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr1	31765968	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	31769516	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,0:10,2:5,10,0,2
chr1	31838614	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=214,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	31840426	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	31897493	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,9:0,24:0,0,26,8
chr1	31898132	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,22,6
chr1	31898162	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=101.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,16,14
chr1	31898279	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,3:0,0,4,8
chr1	31898536	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	31898661	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=145,37;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:6,8,1,1
chr1	31899684	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,1:0,5:0,0,0,7
chr1	31899704	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	31905730	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	31905889	.	A	ACAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=205,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CAG;STR;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:0,1,6,0
chr1	31906882	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr1	31907102	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.845:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr1	32084904	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:5,4:2,4:4,3,7,2
chr1	32087134	.	C	CAAG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,2:8,0:0|1:32087134_C_CAAG:32087134:5,9,1,1
chr1	32087136	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=112,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,2:7,0:0|1:32087134_C_CAAG:32087134:5,9,1,1
chr1	32092331	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:6,3,2,0
chr1	32118160	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=191,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.426:12:3,1:4,4:7,0,5,0
chr1	32119347	.	AACAC	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=175,197;MMQ=53,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=AC;STR;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.581:5:1,1:0,2:0,2,0,3
chr1	32119431	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,6,1
chr1	32122164	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,5:3,1:0,5,0,6
chr1	32124528	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=149,51;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:5,11,1,1
chr1	32124546	.	C	CTTGG	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=33,16;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,1:0|1:32124546_C_CTTGG:32124546:6,12,1,1
chr1	32124550	.	GAGGCC	G	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:8,2:0|1:32124546_C_CTTGG:32124546:6,12,1,1
chr1	32124557	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:10,2:0|1:32124546_C_CTTGG:32124546:6,13,1,1
chr1	32124560	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:10,2:0|1:32124546_C_CTTGG:32124546:6,12,1,1
chr1	32124565	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=143,51;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,1:0|1:32124546_C_CTTGG:32124546:6,11,1,1
chr1	32126135	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.544:35:8,7:7,12:14,2,14,5
chr1	32127911	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	32128283	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	32134491	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,1:3,4:1,5,0,5
chr1	32136168	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=170.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,17:0,36:0,0,33,20
chr1	32140733	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:2,0,2,4
chr1	32145009	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,10,0
chr1	32146425	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr1	32149893	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32149893_G_A:32149893:0,0,0,1
chr1	32149896	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32149893_G_A:32149893:0,0,0,1
chr1	32155284	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:11,3:7,2:17,2,5,0
chr1	32155911	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:0|1:32155911_G_T:32155911:5,2,3,0
chr1	32155929	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=139,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.389:13:6,3:2,1:0|1:32155911_G_T:32155911:6,2,5,0
chr1	32156869	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,3,10
chr1	32160918	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,2:1,3:0,2,0,6
chr1	32161344	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=115,74;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.158:29:15,4:10,0:13,12,1,3
chr1	32161668	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,10;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,0:4,0:0,5,1,0
chr1	32193773	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,0:2,5:2,1,3,2
chr1	32201495	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=167,52;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,0:1,2,1,1
chr1	32201509	.	A	AAAGAGTCTAGGTAACTAATGTCTTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=122,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,1,1
chr1	32207297	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=117,80;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:11,3:6,0:8,9,2,1
chr1	32209765	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:11,7:6,6:12,5,11,2
chr1	32258805	.	AAGAG	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=AG;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:6,2:16,2,2,0
chr1	32265177	.	G	GGAATAAGCTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:32265177_G_GGAATAAGCTTT:32265177:0,1,0,1
chr1	32265180	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32265177_G_GGAATAAGCTTT:32265177:0,1,0,1
chr1	32266026	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=104,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.591:24:3,9:4,4:6,4,11,3
chr1	32280991	.	GA	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=181,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	32381592	.	TA	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.208:46:12,4:23,3:3,34,1,8
chr1	32538782	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	32541401	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=121,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,0:4,1:0|1:32541401_A_C:32541401:1,9,3,0
chr1	32541405	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=118,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:4,0:0|1:32541401_A_C:32541401:2,10,2,0
chr1	32541409	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,11;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:4,0:0|1:32541401_A_C:32541401:1,10,2,0
chr1	32541413	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,1:0|1:32541401_A_C:32541401:1,10,2,0
chr1	32541415	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=116,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,1:0|1:32541401_A_C:32541401:1,10,2,0
chr1	32557244	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:1,4:1,1:3,0,3,2
chr1	32566187	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:1,1:3,2,0,1
chr1	32568357	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	32635450	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	32658062	.	G	GGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.817:11:0,4:1,4:0,2,0,9
chr1	32667609	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:7,3:2,11:5,4,5,10
chr1	32671827	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,8:0.219:39:11,3:19,5:14,17,5,3
chr1	32677889	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:10,1:19,1:0,29,0,2
chr1	32678024	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=203,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:32678024_T_G:32678024:1,1,1,0
chr1	32678033	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=170,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:32678024_T_G:32678024:1,0,1,0
chr1	32678043	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,13;MFRL=134,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:32678024_T_G:32678024:2,0,1,0
chr1	32678369	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:2,2:10,0:8,4,0,2
chr1	32741242	.	C	CAGGA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:32741242_C_CAGGA:32741242:2,6,1,1
chr1	32741243	.	T	TCCCTAGA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:32741242_C_CAGGA:32741242:2,6,1,1
chr1	32741245	.	C	CTG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:2,0:0|1:32741242_C_CAGGA:32741242:2,6,1,1
chr1	32742140	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=173,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:7,5,2,0
chr1	32757682	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,0:3,0:6,0,3,0
chr1	32757688	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,11;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,0:8,0,2,0
chr1	32832292	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=110,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.415:41:11,7:13,9:12,12,6,11
chr1	32842030	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:0,4:5,2:3,2,3,3
chr1	32846846	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:13,3:12,0:8,17,1,2
chr1	33060846	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,2:9,0:3,20,1,1
chr1	33087367	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=193,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	33093092	.	TG	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,113;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:21,0:16,3:0|1:33093092_TG_T:33093092:18,19,0,3
chr1	33093094	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=130,113;MMQ=60,57;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,3:0.095:40:21,0:16,3:0|1:33093092_TG_T:33093092:18,19,0,3
chr1	33116206	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.602:23:4,5:5,9:1,8,3,11
chr1	33117071	.	T	G	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=233.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.985:65:0,33:0,31:0,0,12,53
chr1	33134774	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,23:0.419:55:18,14:14,8:20,12,13,10
chr1	33134989	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=174.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,26:0,19:0,0,12,36
chr1	33135035	.	AT	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.085:44:19,3:20,0:26,15,1,2
chr1	33135223	.	C	G	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=145,123;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.069:55:34,0:18,2:5,47,1,2
chr1	33135229	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=150,112;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.057:50:28,0:19,2:1,47,0,2
chr1	33138365	.	AC	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:16,0:21,3:16,22,0,3
chr1	33138516	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=121.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,16:0,18:0,0,10,24
chr1	33146113	.	CT	C,CTT	.	.	DP=182;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=121,134,162;MMQ=60,54,57;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=12.19,12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:126,12,13:0.077,0.082:151:70,7,3:46,4,7:82,44,15,10
chr1	33149514	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=161,157;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:33149514_G_A:33149514:2,0,1,0
chr1	33149524	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,28;MFRL=197,157;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:33149514_G_A:33149514:3,0,1,0
chr1	33149527	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=197,157;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:33149514_G_A:33149514:3,0,1,0
chr1	33149529	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=197,157;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:33149514_G_A:33149514:3,0,1,0
chr1	33149534	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=197,157;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:33149514_G_A:33149514:3,0,1,0
chr1	33149535	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=197,157;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:33149514_G_A:33149514:3,0,1,0
chr1	33160492	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=127,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:15,0:4,2:10,10,0,2
chr1	33161212	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,11:0,6:0,0,14,3
chr1	33233323	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	33235974	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr1	33236493	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,33;MFRL=135,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr1	33252099	.	TCACATGCATGACTATTCCTAGCC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=234,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.677:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr1	33256884	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=111,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:3,4:8,6:2,10,0,10
chr1	33276424	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr1	33282964	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33282964_T_A:33282964:0,0,0,1
chr1	33282966	.	G	GTTGGCAGAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33282964_T_A:33282964:0,0,0,1
chr1	33293748	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=103,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:0,13:1,8:0,1,0,23
chr1	33318634	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,8,8
chr1	33318811	.	G	GCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.275:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	33330432	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,0,11
chr1	33360341	.	TG	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=128,33;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,2:12,0:16,4,1,1
chr1	33361134	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,250;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,0:7,3:7,3,3,0
chr1	33402334	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.262:16:2,2:5,2:9,3,4,0
chr1	33409551	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	33430102	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33430102_T_G:33430102:0,0,1,0
chr1	33430104	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:33430102_T_G:33430102:0,0,1,0
chr1	33476292	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:11,1,2,0
chr1	33476353	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=138,183;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:6,4:12,1:11,7,1,4
chr1	33476385	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=154,57;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:15,4:17,2:0|1:33476385_C_G:33476385:19,13,1,5
chr1	33476387	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=157,57;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.167:40:15,3:16,1:0|1:33476385_C_G:33476385:19,15,1,5
chr1	33476396	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=157,57;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:15,4:16,2:0|1:33476385_C_G:33476385:19,13,1,5
chr1	33476404	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=152,57;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,6:0.171:39:18,4:13,1:0|1:33476385_C_G:33476385:22,11,1,5
chr1	33478854	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=9;MBQ=28,29;MFRL=135,128;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:29,1:24,2:41,13,3,0
chr1	33478872	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=136,121;MMQ=60,30;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,4:0.081:60:27,2:26,2:0|1:33478872_G_A:33478872:36,20,4,0
chr1	33478878	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=9;MBQ=29,32;MFRL=132,121;MMQ=60,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,4:0.078:62:27,2:26,2:0|1:33478872_G_A:33478872:31,27,4,0
chr1	33478888	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=130,110;MMQ=60,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,6:0.094:67:29,3:30,2:0|1:33478872_G_A:33478872:32,29,5,1
chr1	33478900	.	T	A	.	.	DP=74;ECNT=9;MBQ=29,20;MFRL=122,110;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,8:0.126:68:28,5:32,3:31,29,4,4
chr1	33478920	.	G	A	.	.	DP=87;ECNT=9;MBQ=32,20;MFRL=121,114;MMQ=60,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,13:0.166:81:33,8:33,5:31,37,3,10
chr1	33478931	.	G	C	.	.	DP=81;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=121,114;MMQ=60,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,11:0.138:79:32,4:33,5:29,39,1,10
chr1	33478959	.	C	G	.	.	DP=73;ECNT=9;MBQ=33,33;MFRL=122,118;MMQ=60,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,10:0.161:66:29,4:25,6:22,34,1,9
chr1	33478983	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.069:56:27,2:24,1:13,40,1,2
chr1	33557671	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:18,3:21,0:27,12,1,2
chr1	33560338	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,14:0,3:0,0,3,16
chr1	33567592	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,6:3,0:0,4,0,6
chr1	33646807	.	C	CAGCAAGTCACATCTTACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	33741615	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	33760743	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=170.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,25:0,22:0,0,40,8
chr1	33778226	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	33778591	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	33795643	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=148,188;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:11,3:11,0:11,12,3,0
chr1	33796855	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=12,33;MFRL=225,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr1	33836796	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	33954331	.	AGAAGGATGTGCAG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=187,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:33954331_AGAAGGATGTGCAG_A:33954331:0,4,0,1
chr1	33954350	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=187,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:33954331_AGAAGGATGTGCAG_A:33954331:0,4,0,1
chr1	33954352	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	33954805	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=135,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:5,2,0,3
chr1	33961147	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,0,13
chr1	33985353	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=198,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.514:27:9,6:4,7:10,3,8,6
chr1	34006382	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:34006382_C_CCT:34006382:0,1,0,1
chr1	34006385	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:34006382_C_CCT:34006382:0,1,0,1
chr1	34008416	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:12,2:7,2:11,8,3,1
chr1	34011710	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=163,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,1:8,2:10,5,2,1
chr1	34033131	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:3,7:2,3:4,2,8,2
chr1	34037317	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=263,108;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,2,0
chr1	34038006	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=208,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.653:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr1	34042810	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=216,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr1	34049389	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:6,3:8,3:9,6,3,3
chr1	34052605	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr1	34070826	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,5:5,2:8,2,7,0
chr1	34071434	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=120,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:5,1,5,1
chr1	34112488	.	T	TTATTTTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34112488_T_TTATTTTA:34112488:0,0,0,1
chr1	34112490	.	G	GTTACTGGGTTCGGGACATGACCCTTCCCAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:34112488_T_TTATTTTA:34112488:0,0,0,1
chr1	34158472	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:34158472_C_T:34158472:0,0,10,2
chr1	34158482	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0|1:34158472_C_T:34158472:0,0,11,2
chr1	34164286	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	34189917	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr1	34189957	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	34663238	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=257,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,2,2
chr1	35135315	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,23:0.544:42:9,12:10,11:6,13,10,13
chr1	35223248	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,1:10,1:15,9,0,2
chr1	35229015	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.137:24:8,2:12,0:10,11,2,1
chr1	35251545	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,14,9
chr1	35251658	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:5,12,1,1
chr1	35261044	.	CAG	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=101.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,12:0,0,7,18
chr1	35321684	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	35331693	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=164,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:5,1,0,2
chr1	35334388	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	35350573	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=97,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,3:2,1:4,3,4,0
chr1	35470946	.	A	C,ACT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,31,29;MFRL=208,202,206;MMQ=60,60,60;MPOS=8,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.29,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,0,1:3,1,0:0,3,0,2
chr1	35470947	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=36,31;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:35470947_CAAA_C:35470947:0,4,0,1
chr1	35470948	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=208,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:35470948_A_AC:35470948:0,3,0,1
chr1	35470950	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=208,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:35470948_A_AC:35470948:0,3,0,1
chr1	35470952	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:35470947_CAAA_C:35470947:0,4,0,1
chr1	35470956	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=208,202;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,0:3,1:0|1:35470947_CAAA_C:35470947:0,3,0,1
chr1	35485285	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=168,187;MMQ=45,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:35485285_TC_T:35485285:0,2,0,1
chr1	35485292	.	CT	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=168,187;MMQ=45,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:35485285_TC_T:35485285:0,2,0,1
chr1	35485300	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=202,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35485285_TC_T:35485285:0,1,0,1
chr1	35561401	.	AT	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.107:45:21,3:11,2:37,3,4,1
chr1	35561510	.	G	A	.	.	DP=108;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=311.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,95:0.990:95:0,39:0,55:0,0,20,75
chr1	35563206	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=118.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,21:0,0,6,26
chr1	35576145	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	35824780	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:11,10,2,0
chr1	35826674	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,17;MFRL=179,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:3,0,1,0
chr1	35835939	.	ATT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=204,68;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=29,27;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	35847032	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.368:36:10,5:13,8:7,16,4,9
chr1	35858313	.	G	C	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,148;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,4:0.068:71:32,0:33,4:0|1:35858313_G_C:35858313:21,46,0,4
chr1	35858319	.	G	T	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=149,148;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,4:0.071:68:32,0:30,4:0|1:35858313_G_C:35858313:16,48,0,4
chr1	35879555	.	C	CT	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,5:0.071:80:37,2:35,3:67,8,5,0
chr1	35879693	.	AT	A,ATT	.	.	DP=153;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=152,137,94;MMQ=60,60,60;MPOS=12,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=3.76,3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:85,6,9:0.055,0.062:100:33,5,3:48,1,4:14,71,3,12
chr1	35925861	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=83.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,14:0,13:0,0,20,7
chr1	35940307	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	36060035	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=219,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,0:1,2:3,1,1,1
chr1	36186425	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=119,149;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:8,5,2,0
chr1	36205166	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr1	36208669	.	CA	TG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=157,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,0:15,0,1,1
chr1	36212655	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=205,176;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr1	36212678	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=184,205;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:36212678_C_A:36212678:0,4,0,1
chr1	36212681	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=186,206;MMQ=60,32;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	36212688	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,17;MFRL=207,205;MMQ=60,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:36212678_C_A:36212678:0,3,0,1
chr1	36212690	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=184,205;MMQ=50,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:36212678_C_A:36212678:0,2,0,1
chr1	36212694	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,31;MFRL=161,205;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:36212678_C_A:36212678:0,1,0,1
chr1	36213712	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	36215172	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,154;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:10,0:20,2:21,9,0,2
chr1	36216835	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	36282417	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,21;MFRL=193,127;MMQ=47,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,4:1,1:2,0,7,0
chr1	36307412	.	CAT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=178,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AT;STR;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.810:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr1	36316401	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=14,14;MFRL=122,160;MMQ=60,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.411:8:1,1:1,0:4,1,3,0
chr1	36316407	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,14;MFRL=134,160;MMQ=60,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.272:13:2,0:1,1:7,3,3,0
chr1	36316415	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=145,160;MMQ=60,36;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,0:4,0:7,6,3,0
chr1	36316418	.	C	CA,CAA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,32,33;MFRL=163,144,145;MMQ=60,60,60;MPOS=10,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=22.79,4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,9,3:0.649,0.250:13:1,4,0:0,3,2:1,0,6,6
chr1	36316571	.	AG	CA,CG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,36,31;MFRL=0,174,158;MMQ=60,60,60;MPOS=25,15;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.26,84.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,27:0.093,0.877:29:0,1,12:0,1,15:0,0,14,15
chr1	36319021	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,0:7,3:17,0,3,0
chr1	36520477	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,161;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:0,1:7,0:7,0,2,0
chr1	36551336	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,164;MMQ=54,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr1	36554442	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	36563158	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,5:0,16:0,0,15,6
chr1	36565584	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr1	36565617	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,20,5
chr1	36602943	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,3,15
chr1	36603867	.	A	AGAAACAATGTTGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	36639103	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:4,1:0,9,0,2
chr1	36641888	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:3,2,1,1
chr1	36643759	.	AG	CC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:0|1:36643759_AG_CC:36643759:0,6,3,0
chr1	36643765	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.361:9:1,0:5,1:0|1:36643759_AG_CC:36643759:0,6,3,0
chr1	36762396	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr1	36773819	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=64.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,11,7
chr1	36785074	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.096:40:18,1:17,2:15,22,1,2
chr1	36785270	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=118,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:12,8:6,6:16,2,12,2
chr1	36788356	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr1	36883946	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	36884473	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=197,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,1:2,8:4,0,9,0
chr1	36884527	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=144,155;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.329:18:6,2:5,3:11,1,4,2
chr1	36884530	.	G	A,GA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,32,34;MFRL=145,151,143;MMQ=60,60,60;MPOS=11,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=39.66,5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,14,3:0.610,0.183:21:2,7,0:2,6,3:4,0,12,5
chr1	36886302	.	A	ATGTGTGTATAATGATATCACTTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=271,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	36887702	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0,0,16,2
chr1	36923494	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=100,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.436:18:6,1:4,5:8,2,5,3
chr1	36929673	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:9,3:3,6:12,0,7,2
chr1	36933663	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=147,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:17,3:14,0:16,15,3,0
chr1	37271670	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.749:2:0,0:0,0:0|1:37271670_A_C:37271670:0,0,2,0
chr1	37271676	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=107,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:0,1:0,0:0|1:37271670_A_C:37271670:3,0,2,0
chr1	37282884	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=203,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr1	37285555	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr1	37335458	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	37335485	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:37335485_A_G:37335485:0,0,0,3
chr1	37335494	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:37335485_A_G:37335485:0,0,0,4
chr1	37959450	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=208.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.986:66:0,32:0,32:0,0,20,46
chr1	37959470	.	C	G	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=209.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,30:0,27:0,0,13,44
chr1	37959499	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=191,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.589:39:8,9:7,14:3,13,4,19
chr1	38006359	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	38019931	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	38022452	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.492:24:5,4:7,6:12,0,12,0
chr1	38027215	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:16,0:12,3:18,11,3,0
chr1	38030696	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,6:6,4:5,6,0,11
chr1	38049552	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	38052867	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:2,2:4,2:6,1,4,0
chr1	38082122	.	GC	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,4:0,2:3,1,6,0
chr1	38167345	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=109,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.712:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	38184399	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,223;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,1:4,1:12,2,2,0
chr1	38185362	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	38288247	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,0:8,2:7,15,1,1
chr1	38301250	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	38301476	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,7:0,0,1,12
chr1	38301512	.	C	A,G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,28,34;MFRL=197,176,160;MMQ=60,30,40;MPOS=14,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,0,1:1,1,0:0,4,0,2
chr1	38301515	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=197,168;MMQ=60,35;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr1	38327982	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,14,6
chr1	38328154	.	GAC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	38341187	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=194,191;MMQ=56,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:38341187_A_G:38341187:4,0,1,0
chr1	38341191	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=194,191;MMQ=56,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:38341187_A_G:38341187:4,0,1,0
chr1	38345896	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	38345940	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:38345940_A_C:38345940:0,0,0,1
chr1	38345942	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=215,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:38345940_A_C:38345940:0,1,0,1
chr1	38352545	.	C	CAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,68;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,3:14,0:20,9,2,1
chr1	38464639	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,18,10
chr1	38483296	.	AT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.211:26:6,3:10,2:13,8,3,2
chr1	38484665	.	G	GTTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=164,315;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,18;RU=T;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,0:3,1:8,0,1,1
chr1	38488506	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.562:12:0,3:4,3:1,4,0,7
chr1	38511708	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:8,1:1,13,0,2
chr1	39305403	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr1	39325063	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,17:0,11:0,0,22,6
chr1	39361569	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,14,0
chr1	39361781	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:12,2:11,0:4,21,0,2
chr1	39466626	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,14:0,17:0,0,28,5
chr1	39466786	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=131.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,18:0,19:0,0,6,32
chr1	39494687	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	39748826	.	GGT	CTA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,0:8,1:16,6,2,0
chr1	39757799	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	39760818	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,0:5,4:4,7,0,4
chr1	39766041	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr1	39796873	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=226,187;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:39796873_A_T:39796873:1,0,1,0
chr1	39796874	.	GGAA	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=219,187;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:39796873_A_T:39796873:2,0,1,0
chr1	39796887	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=211,187;MMQ=60,47;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:39796873_A_T:39796873:3,0,1,0
chr1	39796891	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=211,187;MMQ=60,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:39796873_A_T:39796873:3,0,1,0
chr1	39812620	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,0:0,8:0,0,8,1
chr1	39815143	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,16,1
chr1	39815344	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=95.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,14:0,0,3,26
chr1	39823032	.	A	AT	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=105.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,45:0.942:47:1,21:1,19:2,0,29,16
chr1	39824718	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=99.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,27,0
chr1	39826391	.	A	ATTAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr1	39835817	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,6:0,16:0,0,6,16
chr1	39838290	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=170,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:8,2:0|1:39838290_T_C:39838290:2,18,0,2
chr1	39838291	.	A	AC	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=170,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:8,2:0|1:39838290_T_C:39838290:2,18,0,2
chr1	39838294	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=168,236;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:39838290_T_C:39838290:2,17,0,2
chr1	39838296	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=168,236;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,0:9,2:0|1:39838290_T_C:39838290:2,17,0,2
chr1	39838299	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=168,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:0|1:39838290_T_C:39838290:2,15,0,2
chr1	39880892	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=210.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,37:0,27:0,0,50,14
chr1	39881006	.	AT	A,ATT	.	.	DP=66;ECNT=5;MBQ=30,31,18;MFRL=141,129,131;MMQ=60,60,60;MPOS=20,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.95,5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,8,5:0.192,0.150:36:10,5,2:7,3,0:5,18,5,8
chr1	39881040	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,20:0,9:0,0,1,30
chr1	39881094	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=29,35;MFRL=175,195;MMQ=41,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:9,1:1,1:0,10,0,2
chr1	39881132	.	CG	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=233,178;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	39881152	.	C	CATGT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	39889677	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=130.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,19:0,22:0,0,22,20
chr1	39893093	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,18,8
chr1	39894839	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=174.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,23:0,25:0,0,44,4
chr1	39895460	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,17,2
chr1	39913351	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=98.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,13:0,0,16,10
chr1	39914363	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,10,6
chr1	39927507	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,6,4
chr1	39927689	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:11,0:16,2:13,15,0,2
chr1	39945756	.	TGAAAGAC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:39945756_TGAAAGAC_T:39945756:0,3,0,1
chr1	39945765	.	CCAGTG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:39945756_TGAAAGAC_T:39945756:0,3,0,1
chr1	39945775	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=166,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:39945756_TGAAAGAC_T:39945756:0,2,0,1
chr1	39946801	.	T	TTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39946801_T_TTC:39946801:0,0,0,1
chr1	39946803	.	A	AAATAAGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39946801_T_TTC:39946801:0,0,0,1
chr1	39977575	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,259;MMQ=60,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	40026851	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr1	40028180	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,5:0,6:0,0,1,12
chr1	40035686	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr1	40036847	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr1	40041371	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	40092089	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	40226134	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,174;MMQ=52,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:2,3:2,0:2,3,1,3
chr1	40236321	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	40367169	.	T	TTTAAAAAAATAGAGAGAGGATTCAGAGGGCTCTGACTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,171;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr1	40431215	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,3:6,0:6,8,2,1
chr1	40432577	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=218,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0|1:40432577_C_G:40432577:1,1,0,1
chr1	40432581	.	C	CCCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=218,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:40432577_C_G:40432577:1,1,0,1
chr1	40432582	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=218,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:40432577_C_G:40432577:1,1,0,1
chr1	40533266	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.956:20:0,12:0,8:0|1:40533266_T_G:40533266:0,0,4,16
chr1	40533287	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,11:0,5:0|1:40533266_T_G:40533266:0,0,0,17
chr1	40536074	.	C	CT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=111.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,22:0,8:0,0,25,5
chr1	40545964	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr1	40555274	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	40556922	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr1	40557656	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr1	40558256	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,11:0,0,0,16
chr1	40559555	.	CAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=33,33,33,26;MFRL=124,148,139,114;MMQ=52,60,59,60;MPOS=20,15,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=21,18,19,20;RU=A;STR;TLOD=22.89,18.02,3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,19,15,6:0.291,0.301,0.148:52:2,5,5,3:7,7,5,0:8,4,24,16
chr1	40562744	.	G	A	.	.	DP=113;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,14:0.133:107:44,10:49,3:69,24,11,3
chr1	40562993	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	40703244	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,19:0.389:49:13,9:16,9:19,11,11,8
chr1	40737516	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,7:0,15:0,0,22,1
chr1	40771374	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.276:9:4,0:2,2:0|1:40771374_A_C:40771374:5,2,1,1
chr1	40771380	.	C	CCGAGAGGCTGGGGTGGCGG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=130,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,0:2,2:0|1:40771374_A_C:40771374:5,2,1,1
chr1	40771969	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:40771969_A_C:40771969:0,0,0,1
chr1	40771973	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40771969_A_C:40771969:0,0,0,1
chr1	40771978	.	GG	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40771969_A_C:40771969:0,0,0,1
chr1	40775937	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,85;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:0,6,3,1
chr1	40776492	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:40776492_T_C:40776492:0,2,0,1
chr1	40776496	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:40776492_T_C:40776492:0,2,0,1
chr1	40776500	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:40776492_T_C:40776492:0,2,0,1
chr1	40777842	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,8:0,0,0,12
chr1	40778377	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=99.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,17,11
chr1	40840270	.	T	TGC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.856:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	40840353	.	A	G	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=99,74;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,33:0.390:84:15,11:36,22:16,35,14,19
chr1	40879808	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=61.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,15,3
chr1	40881799	.	AC	CG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=144,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.347:6:2,0:2,0:0|1:40881799_AC_CG:40881799:0,4,2,0
chr1	40881805	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.245:9:2,0:4,0:0|1:40881799_AC_CG:40881799:1,6,2,0
chr1	40881808	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,11;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.245:9:2,0:5,0:0|1:40881799_AC_CG:40881799:1,6,2,0
chr1	40919772	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=206,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:40919772_T_C:40919772:2,0,1,0
chr1	40919777	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=221,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:40919772_T_C:40919772:3,0,1,0
chr1	40955156	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,12,5
chr1	40960770	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=139,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,1:11,2:14,11,2,1
chr1	40961437	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,272;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:15,0:12,3:16,11,3,0
chr1	41101572	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr1	41107348	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:10,0:5,0:0|1:41107348_A_C:41107348:6,14,2,0
chr1	41107360	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=89.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,13:0,12:0|1:41107348_A_C:41107348:0,0,10,18
chr1	41107362	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,11;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.092:30:14,0:12,0:0|1:41107348_A_C:41107348:8,20,2,0
chr1	41213346	.	CTAGAGCTCAAAG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=147,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:41213346_CTAGAGCTCAAAG_C:41213346:1,3,0,1
chr1	41213361	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:41213346_CTAGAGCTCAAAG_C:41213346:1,0,0,1
chr1	41213376	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	41235177	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,8:0,14:0,0,2,20
chr1	41284096	.	TG	CC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	41284366	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	41284406	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	41284509	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=225,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:6,1,4,1
chr1	41284520	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=225,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:0|1:41284520_A_G:41284520:6,1,5,0
chr1	41284527	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=198,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:5,2:2,3:0|1:41284520_A_G:41284520:7,1,5,0
chr1	41289993	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	41290004	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41290004_T_C:41290004:0,1,0,1
chr1	41290008	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41290004_T_C:41290004:0,1,0,1
chr1	41290009	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41290004_T_C:41290004:0,1,0,1
chr1	41290012	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,31;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41290004_T_C:41290004:0,1,0,1
chr1	41290014	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:41290004_T_C:41290004:0,1,0,1
chr1	41296695	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,11;MFRL=152,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,0:2,0,2,0
chr1	41296699	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=169,227;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:2,0:3,0,2,0
chr1	41296705	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,14;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.481:4:0,0:2,0:2,0,2,0
chr1	41298652	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=119,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,3,2
chr1	41298858	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41298858_A_C:41298858:0,0,0,1
chr1	41298863	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:41298858_A_C:41298858:0,0,0,1
chr1	41298883	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	41449135	.	AC	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:19,0:22,3:13,29,0,3
chr1	41456823	.	C	T,G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,25,18;MFRL=147,140,148;MMQ=60,60,60;MPOS=11,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.39,5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.213,0.313:10:2,1,0:1,0,0:2,3,5,0
chr1	41456828	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:4,0:7,3,2,0
chr1	41456830	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=19,15;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.265:12:2,0:2,0:6,3,3,0
chr1	41471699	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=46.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.571:33:6,11:8,8:9,5,11,8
chr1	41475085	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:5,6:5,10:9,1,14,2
chr1	41483805	.	GTCC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=183,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TCC;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	41540853	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=100.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.961:23:0,10:0,12:0|1:41540853_A_T:41540853:0,0,17,6
chr1	41540861	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=112.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.967:27:0,12:0,14:0|1:41540853_A_T:41540853:0,0,20,7
chr1	41618442	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr1	41828044	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=216,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.513:4:0,0:0,0:0|1:41828044_T_TG:41828044:0,2,0,2
chr1	41828050	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,11;MFRL=216,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.513:4:0,0:1,0:0|1:41828044_T_TG:41828044:0,2,0,2
chr1	41847207	.	TCT	CGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr1	41847212	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:41847212_T_G:41847212:0,0,1,0
chr1	41847215	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:41847212_T_G:41847212:0,0,1,0
chr1	41949628	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,12,0
chr1	41950312	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,2,17
chr1	41978932	.	A	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,4:0.082:57:19,0:27,1:0|1:41978932_A_T:41978932:15,38,4,0
chr1	41978936	.	A	C	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=114,95;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.067:56:20,0:28,0:0|1:41978932_A_T:41978932:15,38,3,0
chr1	42629040	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr1	42647509	.	CACCTGCCATCGTTGTTCCTGGAGTGCTCACACACACACACACACACACACACACACTCACTCTCTCTCTCTCTCTT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.093:32:1,2:0,0:22,7,3,0
chr1	42654364	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=175,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:4,3:1,0:4,1,2,1
chr1	42654638	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42654638_G_T:42654638:0,2,0,1
chr1	42654648	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42654638_G_T:42654638:0,2,0,1
chr1	42654652	.	AA	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42654638_G_T:42654638:0,2,0,1
chr1	42654659	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42654638_G_T:42654638:0,2,0,1
chr1	42654661	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42654638_G_T:42654638:0,2,0,1
chr1	42776699	.	GA	G,GAA	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,34,32;MFRL=140,171,148;MMQ=60,60,60;MPOS=16,12;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=11.22,9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:41,8,7:0.142,0.137:56:14,5,5:22,2,0:36,5,12,3
chr1	42915727	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=59,96;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,1,2
chr1	42915753	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	43002199	.	AAG	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AG;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.194:28:9,1:9,4:14,9,3,2
chr1	43011030	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:10,0,5,0
chr1	43021810	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,4:6,4:10,1,7,1
chr1	43054909	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr1	43076576	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=20,14;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:2,0,1,0
chr1	43102844	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,8:5,6:8,1,12,2
chr1	43111741	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr1	43124220	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:5,6:9,7:2,12,1,12
chr1	43124859	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:6,7:5,6:9,2,11,2
chr1	43166409	.	GAGA	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=85.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,24:0.489:50:9,14:17,9:22,4,17,7
chr1	43200855	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=223,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=57.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.771:24:1,10:4,9:3,2,1,18
chr1	43213499	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,6:2,2:1,6,0,8
chr1	43228189	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr1	43239395	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,5:3,5:0,4,0,10
chr1	43240998	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.503:30:8,8:6,7:9,6,6,9
chr1	43296354	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	43300663	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,7:4,3:5,2,8,2
chr1	43300921	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	43302971	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=202,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr1	43393245	.	G	GGGTGAGAAAT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=86.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,9:0,8:0,0,16,4
chr1	43393523	.	G	GGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	43621898	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:13,0:7,2:16,4,0,2
chr1	43652369	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=80.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,13:0,0,8,14
chr1	43663376	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0,0,4,21
chr1	43672636	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	43675843	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	43680855	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr1	43681184	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	43699935	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr1	43700140	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	43738340	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	43771016	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:8,2:9,9:4,13,3,8
chr1	43771090	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=161,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:0,4,1,4
chr1	43773033	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	43774878	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:2,4,0,3
chr1	43777852	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	43782846	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,3,1
chr1	43785180	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:9,6:3,6:5,7,5,7
chr1	43787437	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr1	43804443	.	CAGCT	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=37,33;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:43804443_CAGCT_C:43804443:0,4,0,1
chr1	43804449	.	C	CCTGT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:43804443_CAGCT_C:43804443:0,4,0,1
chr1	43804464	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=199,169;MMQ=60,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:43804464_C_T:43804464:0,3,0,1
chr1	43804474	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=184,169;MMQ=60,31;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:43804464_C_T:43804464:0,4,0,1
chr1	43804476	.	C	CCCCAGAGGTGG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=184,169;MMQ=60,31;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:43804464_C_T:43804464:0,4,0,1
chr1	43804480	.	TC	CT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=184,169;MMQ=60,31;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:43804464_C_T:43804464:0,4,0,1
chr1	43812075	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=98,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:0,4:6,1:4,2,4,2
chr1	43814864	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=193,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr1	43826312	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,4,6
chr1	43855546	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr1	43855578	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	43869235	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=136,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:7,3:3,4:7,3,5,2
chr1	43893285	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:7,2,0,2
chr1	43897633	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:1,0:4,2:0,5,1,2
chr1	43901011	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr1	43903589	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,2:4,1:3,6,0,3
chr1	43905198	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:11,1,2,0
chr1	43905819	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170739782,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	43906138	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,1:10,1:11,8,1,1
chr1	43906329	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:43906329_G_T:43906329:0,2,0,1
chr1	43906331	.	T	TCCC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=27,33;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:43906329_G_T:43906329:0,2,0,1
chr1	43906334	.	CCAG	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,34;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:43906329_G_T:43906329:0,3,0,1
chr1	43906335	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,34;MFRL=207,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:43906335_C_CT:43906335:0,2,0,1
chr1	43906336	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=207,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:43906335_C_CT:43906335:0,2,0,1
chr1	43906337	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=207,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:43906335_C_CT:43906335:0,2,0,1
chr1	43906341	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=207,147;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	43906344	.	A	ACGTTC	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:43906329_G_T:43906329:0,3,0,1
chr1	43907092	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:4,5:5,4:5,4,6,4
chr1	43908274	.	C	CAGGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	43908806	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.273:8:2,0:4,0:3,3,2,0
chr1	43909265	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=195,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,0:3,4:6,1,3,1
chr1	43912590	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	43917409	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.415:27:8,9:8,2:5,11,3,8
chr1	43919081	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=136,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:9,4:4,2:10,3,6,0
chr1	44044468	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:6,2,5,1
chr1	44057257	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	44057668	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=159,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,2:6,6:1,7,1,7
chr1	44057696	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,1:7,2:0,9,0,3
chr1	44064319	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr1	44067859	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr1	44069009	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	44069248	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,106;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:7,1,0,2
chr1	44071853	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	44075123	.	C	CCTCTTCCCAGGA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:12,2:6,0:9,9,0,2
chr1	44075227	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr1	44078359	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,17:0.618:27:6,8:4,8:0|1:44078359_T_A:44078359:10,0,15,2
chr1	44078384	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=159.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,23:0,18:0|1:44078359_T_A:44078359:0,0,32,9
chr1	44078602	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	44079411	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr1	44083015	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	44083110	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:0,5:1,6:1,0,8,4
chr1	44086080	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	44119038	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,2:3,1:0,5,1,3
chr1	44125962	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:4,3:4,3:6,2,3,3
chr1	44137163	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:3,3:3,0:6,1,3,0
chr1	44163720	.	A	AAGTATGTTAACAGAATCCTTGGCAGAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=125,91;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	44163768	.	T	TTTAATCTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	44304056	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,131;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr1	44386305	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	44386615	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr1	44395786	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	44426025	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=90.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,12:0,15:0,0,7,23
chr1	44426707	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=32,18;MFRL=147,75;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:6,0:0|1:44426707_G_T:44426707:7,12,0,2
chr1	44426711	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=30,11;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.211:20:7,0:4,0:8,8,0,4
chr1	44426713	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=30,9;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.197:19:7,0:7,0:0|1:44426707_G_T:44426707:8,8,0,3
chr1	44426716	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=28,18;MFRL=163,75;MMQ=60,49;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.135:21:7,0:3,0:0|1:44426716_A_C:44426716:8,11,0,2
chr1	44426719	.	CT	GG,CGT	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=29,13,24;MFRL=163,203,149;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.23,6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,2,3:0.126,0.163:20:6,0,1:3,0,1:7,8,0,5
chr1	44426720	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=26,12;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.208:18:5,0:3,0:0|1:44426716_A_C:44426716:7,8,0,3
chr1	44426724	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=20,13;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.322:17:3,1:3,1:6,6,0,5
chr1	44426730	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=27,13;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.419:16:2,2:3,0:5,4,0,7
chr1	44426948	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,6,17
chr1	44432500	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr1	44447220	.	CCCAGGGGTGTG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=234,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr1	44457739	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,4,4
chr1	44457823	.	AG	CC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.484:10:1,2:2,0:0|1:44457823_AG_CC:44457823:1,4,5,0
chr1	44457830	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.335:15:3,1:5,0:0|1:44457823_AG_CC:44457823:5,5,5,0
chr1	44457834	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.233:17:7,0:5,0:0|1:44457823_AG_CC:44457823:8,5,4,0
chr1	44474363	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44474363_CT_C:44474363:0,3,0,1
chr1	44474368	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44474363_CT_C:44474363:0,3,0,1
chr1	44474375	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:44474363_CT_C:44474363:0,3,0,1
chr1	44474378	.	T	TCTCTC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=206,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:44474363_CT_C:44474363:0,2,0,1
chr1	44474384	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=247,139;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:44474363_CT_C:44474363:0,1,0,1
chr1	44594966	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,0:3,3:5,0,4,0
chr1	44595113	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.724:27:6,8:1,11:4,3,10,10
chr1	44596379	.	CCAA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAA;STR;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,3:6,5:10,4,5,4
chr1	44679556	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.505:37:8,9:10,7:8,10,4,15
chr1	44684118	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=126,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:12,2:17,0:7,23,1,1
chr1	44685664	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:1,2,0,4
chr1	44686009	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.101:28:13,2:10,0:6,20,0,2
chr1	44686322	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:6,2:3,1:1,9,0,3
chr1	44773973	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=129,72;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,4:6,0:12,4,3,1
chr1	44877843	.	TGA	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:8,2:0|1:44877843_TGA_T:44877843:13,11,0,2
chr1	44877846	.	T	TTG	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:0|1:44877843_TGA_T:44877843:13,11,0,2
chr1	44877851	.	CT	AG	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:9,2:0|1:44877843_TGA_T:44877843:13,11,0,2
chr1	44877856	.	A	AGGGAATAT	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=168,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:11,1:0|1:44877843_TGA_T:44877843:14,12,0,2
chr1	45080030	.	G	GTTCTTCTTAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=223,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	45080061	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	45097931	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,28:0.558:50:10,13:11,15:11,11,19,9
chr1	45120229	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=118,230;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:7,6,2,0
chr1	45120309	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:7,6,1,1
chr1	45155593	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=19,18;MFRL=158,112;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.219:10:2,0:1,1:3,5,1,1
chr1	45166513	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:10,0,8,0
chr1	45166869	.	A	ACGTGGCCTTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr1	45169711	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=116,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.188:20:6,0:8,2:10,7,2,1
chr1	45191105	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=153,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.112:24:9,0:12,2:0|1:45191105_G_T:45191105:4,18,1,1
chr1	45191110	.	C	CTGATACTTTGAGTACTAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=155,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:0|1:45191105_G_T:45191105:3,17,1,1
chr1	45206495	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:1,0,6,1
chr1	45223901	.	TATTAGCTG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTAGCTG;STR;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.752:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr1	45225921	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,4:1,1:5,2,5,0
chr1	45226424	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=228,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:45226424_T_TAA:45226424:0,2,1,1
chr1	45226425	.	T	TAACAGTCATCTGGGTATTATA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=228,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,0:0|1:45226424_T_TAA:45226424:0,2,1,1
chr1	45227548	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,3:2,5:6,3,7,1
chr1	45241374	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:0,2:2,5:0,2,1,7
chr1	45244255	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,5:0.080:73:26,4:42,1:45,23,3,2
chr1	45253091	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=157,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:3,7,1,1
chr1	45266154	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	45266875	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=34,19;MFRL=184,203;MMQ=40,30;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=24,22;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.279:5:0,0:1,0:0|1:45266875_CTT_C:45266875:0,4,0,1
chr1	45266882	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=201,156;MMQ=40,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1|0:45266875_CTT_C:45266875:0,4,0,1
chr1	45266904	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=201,203;MMQ=40,30;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:45266904_TG_CA:45266904:0,4,0,1
chr1	45266907	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=201,203;MMQ=40,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:45266904_TG_CA:45266904:0,4,0,1
chr1	45266912	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=201,203;MMQ=40,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:45266904_TG_CA:45266904:0,4,0,1
chr1	45266918	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=201,203;MMQ=40,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:45266904_TG_CA:45266904:0,4,0,1
chr1	45269973	.	CCAGG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=126,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:11,0:9,9,0,2
chr1	45271785	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,2:16,0:2,26,0,2
chr1	45297657	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.536:22:5,6:5,6:6,4,4,8
chr1	45362992	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr1	45469397	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,0:15,2:11,10,0,2
chr1	45470130	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	45471362	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,2:4,4:4,0,6,0
chr1	45472798	.	TTGTGTG	T,TTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25,27;MFRL=0,155,0;MMQ=60,60,60;MPOS=2,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=TG;STR;TLOD=6.65,7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.455,0.453:6:0,1,2:0,2,0:0,0,4,2
chr1	45473316	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	45474157	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=117,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,3,1
chr1	45474447	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=195,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45474447_C_G:45474447:0,1,0,1
chr1	45474448	.	CTTGAACG	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=214,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:45474447_C_G:45474447:0,2,0,1
chr1	45474458	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=214,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:45474447_C_G:45474447:0,2,0,1
chr1	45474462	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=214,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:45474447_C_G:45474447:0,2,0,1
chr1	45474750	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=78,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:0|1:45474750_A_T:45474750:4,0,5,3
chr1	45474755	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=78,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.644:12:2,5:2,3:0|1:45474750_A_T:45474750:4,0,5,3
chr1	45475566	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	45476069	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	45479772	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:7,8:6,5:5,8,2,11
chr1	45480733	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,7:0,12:0,0,1,19
chr1	45486272	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,8:6,1:7,4,7,2
chr1	45500107	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,5:5,3:3,10,3,5
chr1	45502026	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=20,23,14;MFRL=150,134,148;MMQ=60,60,40;MPOS=20,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,16;RU=T;STR;TLOD=4.90,9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,5:0.214,0.477:11:1,3,1:1,0,0:0,3,0,8
chr1	45502046	.	A	AAG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:13,2:3,0:0|1:45502046_A_AAG:45502046:0,17,0,2
chr1	45502047	.	GAC	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:14,2:3,0:0|1:45502046_A_AAG:45502046:0,18,0,2
chr1	45504524	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr1	45524213	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	45794426	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	45796269	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=122.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,17:0,17:0,0,15,19
chr1	45798555	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,11:0,11:0,0,12,10
chr1	45799143	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,2:8,0:7,4,1,1
chr1	45805550	.	A	C	.	.	DP=82;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,11:0.093:81:30,2:23,0:27,43,11,0
chr1	45805566	.	G	C	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=240.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,34:0,31:0,0,29,38
chr1	45805823	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:17,0,1,1
chr1	45887482	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=146,69;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:9,0:9,4:0|1:45887482_T_A:45887482:5,14,1,3
chr1	45887485	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=146,69;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,0:10,4:0|1:45887482_T_A:45887482:5,14,1,3
chr1	46032311	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,5:1,5:3,1,6,4
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chr1	46073618	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=157,201;MMQ=60,27;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:19,2:17,1:27,9,3,0
chr1	46080947	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:9,6:9,2:5,13,7,1
chr1	46081940	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0,0,17,2
chr1	46081960	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:7,2:4,7:8,4,8,1
chr1	46082431	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.531:17:2,4:5,5:2,6,3,6
chr1	46083706	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=84.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,28:0.453:62:14,10:20,18:24,10,20,8
chr1	46085852	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=83,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:0,1:3,1:2,1,2,0
chr1	46085879	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	46086077	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=100,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:1,2:5,6:5,1,4,4
chr1	46086913	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=95,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,2,1
chr1	46087879	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=181,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,5:1,0:1,0,5,0
chr1	46088753	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,1:4,1:2,10,0,2
chr1	46124663	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=73.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,10:0,0,12,11
chr1	46160260	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:0,9,0,6
chr1	46182597	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=128,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=108.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,40:0.532:75:11,34:23,6:22,13,24,16
chr1	46184896	.	AAC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:10,1:11,9,1,1
chr1	46185098	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=209,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46185098_T_TC:46185098:0,1,0,1
chr1	46185099	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,28;MFRL=209,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:46185098_T_TC:46185098:0,1,0,1
chr1	46185102	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=209,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:46185098_T_TC:46185098:0,1,0,1
chr1	46193275	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=106,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:7,4:5,9:9,3,10,3
chr1	46195211	.	TAAC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:4,3:7,0,3,0
chr1	46206540	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,6:3,5:7,0,11,0
chr1	46207048	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,0:3,2:0,5,0,2
chr1	46269756	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=20,13;MFRL=94,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.425:12:1,0:3,1:4,3,0,5
chr1	46269759	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=18,19;MFRL=113,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.216:12:1,0:3,0:0|1:46269759_G_C:46269759:4,6,0,2
chr1	46269761	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=17,15;MFRL=113,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.250:13:1,0:3,0:4,6,0,3
chr1	46269763	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,13;MFRL=113,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.248:13:3,0:3,0:0|1:46269759_G_C:46269759:4,6,0,3
chr1	46290311	.	GTA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TA;STR;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:4,4:1,7,0,7
chr1	46347910	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,1:2,3:4,1,5,0
chr1	46424964	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	46473902	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr1	46487560	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,2:1,2:7,0,4,0
chr1	46491588	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	46498375	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=136,62;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:3,3:5,1:5,4,2,2
chr1	46521517	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=131,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.496:20:7,8:3,1:6,4,9,1
chr1	46521559	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,6:5,3:6,6,7,3
chr1	46597496	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:5,2:2,1:6,2,3,0
chr1	46650191	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr1	46651164	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=106,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:10,2:7,0:6,12,0,2
chr1	46658328	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	46658846	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:8,2:20,0:20,11,1,1
chr1	46659104	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,6:3,1:0,7,3,4
chr1	46659363	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=178,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:0,2:7,2:0,8,0,4
chr1	46661603	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.596:40:7,17:8,7:11,5,14,10
chr1	46661810	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=156,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	46661812	.	G	GTGCATGGTATCACC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=156,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	46726574	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=126,43;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:17,1:21,1:17,22,2,0
chr1	46726890	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,10;MFRL=163,64;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.361:11:4,0:1,0:4,3,4,0
chr1	46782370	.	T	TGGAATGTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,153;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:0,15,0,2
chr1	46806429	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:2,0,6,1
chr1	46806480	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,6:7,6:8,3,8,4
chr1	46810405	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=137,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,3:3,5:6,0,8,0
chr1	46812519	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=171,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	46826587	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	46827214	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,8,1
chr1	46827485	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,2:1,5:2,4,2,5
chr1	46877180	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=171,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,5:0,3:1,0,6,3
chr1	47013364	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,16,4
chr1	47014821	.	A	AAAAAG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=218,166;MMQ=36,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAG;STR;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.890:25:0,8:2,10:2,0,17,6
chr1	47040532	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=143,84;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:8,1:6,1:14,1,2,0
chr1	47075932	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr1	47108828	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr1	47110766	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	47118168	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:3,5:1,3:0|1:47118168_C_T:47118168:6,0,8,0
chr1	47118189	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.480:23:6,7:6,3:0|1:47118168_C_T:47118168:11,1,10,1
chr1	47123898	.	TA	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.308:32:11,6:8,3:3,19,0,10
chr1	47124479	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	47138444	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	47154272	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=136,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0|1:47154272_C_T:47154272:0,2,0,4
chr1	47154297	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=220,86;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1|0:47154272_C_T:47154272:1,2,0,1
chr1	47182206	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,4:5,2:0,6,0,6
chr1	47398743	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,10:0,0,4,15
chr1	47400059	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=274,143;MMQ=40,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.823:7:0,4:0,2:0,1,5,1
chr1	47402487	.	TTGTGTG	T,TTG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,35,33;MFRL=187,203,102652;MMQ=60,60,55;MPOS=11,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=TG;STR;TLOD=5.16,5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.342,0.422:5:1,0,1:0,2,1:0,1,0,4
chr1	47403120	.	C	CTCAATTCCTAGGTTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=125,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	47403144	.	AT	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=197,125;MMQ=52,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	47548189	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=165,174;MMQ=57,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,3:9,1:0,16,1,3
chr1	47571943	.	CT	C,CTT	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=26,20,25;MFRL=179,138,128;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=15.26,7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,11,7:0.371,0.257:28:5,5,2:4,3,2:1,9,5,13
chr1	47607414	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=173,156;MMQ=60,51;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr1	47685455	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr1	47685485	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,2:4,0:10,2,2,0
chr1	47689842	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	47735280	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr1	47753405	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=76.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,14:0,0,0,23
chr1	47770786	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	47841038	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	47905555	.	AG	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.635:17:5,1:1,10:4,2,5,6
chr1	47905782	.	CTTT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=23,20;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:1,2:0,1:1,3,0,4
chr1	47906338	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,3,13
chr1	47906425	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	48697226	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:1,2,5,2
chr1	48697733	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,5,20
chr1	48697751	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=196,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.566:14:3,4:2,3:1,5,2,6
chr1	48697781	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,4:1,1:1,3,2,3
chr1	48698010	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=115,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr1	48699490	.	T	TCCCTCTC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=202,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.313:4:3,1:0,0:0|1:48699490_T_TCCCTCTC:48699490:0,3,0,1
chr1	48699493	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=202,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.317:4:3,1:0,0:0|1:48699490_T_TCCCTCTC:48699490:0,3,0,1
chr1	48701623	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=105,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	48712985	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=104,78;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:21,3:19,0:21,21,2,1
chr1	48713100	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=178,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.524:23:6,5:4,7:5,6,6,6
chr1	48918698	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:4,6:6,9:4,6,5,10
chr1	49056695	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=84,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:0,1:1,2:0,2,0,3
chr1	49100332	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=211,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:0,4,0,4
chr1	49128720	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=212,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	49226954	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:18,2:3,0:19,2,2,0
chr1	49332969	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:7,5:8,4:1,14,0,9
chr1	50513779	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513782	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513784	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513786	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,14;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513789	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513794	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,12;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513798	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,12;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50513802	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513779_G_C:50513779:0,0,1,0
chr1	50666515	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,3,5
chr1	50886719	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	50957509	.	A	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=237.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.986:70:0,41:0,29:0,0,11,59
chr1	51032698	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:12,0,2,0
chr1	51171589	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,0:1,2:1,5,0,2
chr1	51171615	.	T	TGTGAGACATAAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=104,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.320:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	51253964	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=211,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	51253965	.	G	GCTATAACAGAATACCTGAAACTGGATGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=211,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.385:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr1	51753904	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:7,8:4,5:9,4,7,7
chr1	51827088	.	A	ACTTCCAGAAATTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=200,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	51910566	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:17,0:17,3:21,14,3,0
chr1	52179816	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=152,197;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.122:47:20,1:16,4:2,40,0,5
chr1	52179818	.	GT	G,GTT	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=32,32,23;MFRL=192,131,144;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.31,5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,4,5:0.136,0.170:31:9,3,2:10,0,1:0,22,0,9
chr1	52179820	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=152,197;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.112:42:22,0:15,4:2,36,0,4
chr1	52242432	.	CT	C,GT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,29,31;MFRL=162,138,149;MMQ=60,60,60;MPOS=8,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.79,6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,4,3:0.213,0.148:20:9,1,2:3,2,1:11,2,6,1
chr1	52256665	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:1,14,0,2
chr1	52279650	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=194.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,30:0,29:0,0,38,23
chr1	52293570	.	G	A	.	.	DP=98;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=290.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,87:0.989:87:0,46:0,40:0,0,17,70
chr1	52293638	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,11:0,10:0,0,1,20
chr1	52301711	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,1:2,4:7,0,5,0
chr1	52306027	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=130,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,41:0.488:84:29,19:14,22:20,23,13,28
chr1	52306063	.	ATCT	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCT;STR;TLOD=136.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.976:33:0,14:0,18:0,0,5,28
chr1	52399186	.	T	TACCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	52399192	.	T	TTGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=244,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,0:0,1:0|1:52399192_T_TTGGG:52399192:0,1,0,1
chr1	52399194	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=244,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:52399192_T_TTGGG:52399192:0,1,0,1
chr1	52402956	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	52489322	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	52517412	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,11:0,0,13,2
chr1	52820226	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=86.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,21,3
chr1	52824731	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=104,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr1	52825963	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,5:2,0:0,5,1,4
chr1	52827212	.	TTCCTCC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=TCC;STR;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.761:6:1,3:0,2:1,0,2,3
chr1	52859407	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:10,1:1,19,0,2
chr1	52912122	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,1:1,4:1,1,5,6
chr1	52947350	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,1:3,2:8,2,3,0
chr1	52959245	.	TA	T,TAA	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=150,203,133;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.39,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:39,5,4:0.090,0.092:48:15,1,1:22,3,3:36,3,7,2
chr1	53072454	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr1	53153925	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53153925_T_G:53153925:0,0,0,1
chr1	53153933	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53153925_T_G:53153925:0,0,0,1
chr1	53267497	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:7,0:8,0:14,6,3,0
chr1	53282148	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.189:35:16,5:12,0:29,0,6,0
chr1	53282374	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=159,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.120:31:14,0:14,3:0|1:53282374_T_A:53282374:1,27,0,3
chr1	53282383	.	T	TGCTTCCG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,38;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:12,0:13,3:0|1:53282374_T_A:53282374:0,26,0,3
chr1	53308665	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,3,12
chr1	53320274	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,7,10
chr1	53323492	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr1	53333116	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	53351686	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=216,183;MMQ=40,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:1,1:0,6,0,2
chr1	53352770	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=247,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53352770_T_A:53352770:0,1,0,1
chr1	53352775	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=247,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:53352770_T_A:53352770:0,1,0,1
chr1	53358414	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=161,104;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0|1:53358414_C_T:53358414:2,0,2,0
chr1	53358418	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=164,104;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:53358414_C_T:53358414:3,0,2,0
chr1	53364976	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,2,11
chr1	53372162	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=24,13;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.316:21:4,1:4,1:10,4,7,0
chr1	53372168	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.221:21:9,0:7,0:11,5,5,0
chr1	53372180	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.168:23:9,0:10,0:14,5,4,0
chr1	53387379	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	53407406	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=191,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:2,2:6,2:7,1,4,0
chr1	53413670	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:12,3,2,0
chr1	53513437	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr1	53543112	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	53544324	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=194,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:2,1,0,5
chr1	53559291	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	53569063	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=115,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.084:34:17,1:14,1:21,11,1,1
chr1	53571288	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	53662823	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	53686383	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	53699129	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=205,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr1	53723190	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=78.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,15:0,0,0,21
chr1	53736613	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	53742506	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	53755151	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	53925237	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:15,2:4,0:9,11,0,2
chr1	53932151	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,140;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:6,3:21,0:27,0,3,0
chr1	53974987	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=76.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,3,19
chr1	54269524	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:11,0:14,2,1,2
chr1	54284805	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0,20,0,2
chr1	54337011	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.253:14:5,3:3,0:9,2,3,0
chr1	54354486	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=109,98;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr1	54370306	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=106.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,38:0.548:69:11,25:20,12:22,9,26,12
chr1	54375570	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,12,1
chr1	54375701	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr1	54395673	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=34,34,33;MFRL=161,175,134;MMQ=60,60,60;MPOS=22,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.97,9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,6:0.098,0.297:24:8,1,3:7,1,3:15,1,8,0
chr1	54395697	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=129,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,10:0.157:56:22,0:14,0:33,13,10,0
chr1	54478017	.	A	AAGCCCCTTCCTGTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=168,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	54478042	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=186,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54478042_T_A:54478042:0,1,0,1
chr1	54478050	.	TGGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=186,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:54478042_T_A:54478042:0,1,0,1
chr1	54497937	.	TTG	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:11,0:13,2:6,18,0,2
chr1	54502395	.	G	GA	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=117,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.100:48:22,4:22,0:8,36,2,2
chr1	54514223	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:9,7:5,5:14,0,12,0
chr1	54605319	.	G	GC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,6:0,15:0,0,8,15
chr1	54607157	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=56.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,4,14
chr1	54618435	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,4,0
chr1	54640398	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,171;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,1:6,1:3,11,1,1
chr1	54656651	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=198,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	54656666	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=198,253;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:54656666_T_A:54656666:0,3,0,1
chr1	54656670	.	C	CAGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=198,253;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:54656666_T_A:54656666:0,3,0,1
chr1	54670658	.	CCTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr1	54704567	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr1	54707810	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=20,13;MFRL=118,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.118:29:9,0:5,0:13,13,3,0
chr1	54871566	.	ACCGC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCGC;STR;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:0,2:5,0,4,0
chr1	54871709	.	T	TCGCCGC	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=CGC;STR;TLOD=46.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.445:29:10,4:4,4:1,15,1,12
chr1	55014099	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,6:0,16:0,0,2,20
chr1	55064898	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:3,1,2,0
chr1	55065029	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:22,2:22,1:22,22,0,3
chr1	55072726	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,1:1,3:7,0,4,0
chr1	55074570	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=13,20;MFRL=168,176;MMQ=44,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:0,0:0,1:0|1:55074570_A_C:55074570:3,0,2,0
chr1	55074575	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=21,13;MFRL=168,176;MMQ=44,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:1,0:1,0:0|1:55074570_A_C:55074570:3,0,2,0
chr1	55074577	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=9,14;MFRL=168,176;MMQ=44,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.430:5:0,0:0,0:0|1:55074570_A_C:55074570:3,0,2,0
chr1	55074583	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=16,15;MFRL=144,176;MMQ=48,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:0,0:1,0:0|1:55074570_A_C:55074570:5,0,2,0
chr1	55074587	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,13;MFRL=152,176;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:2,0:0|1:55074570_A_C:55074570:7,0,2,0
chr1	55074840	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=218,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0,2,1,4
chr1	55075554	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:55075554_A_C:55075554:0,2,0,1
chr1	55075556	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:55075554_A_C:55075554:0,2,0,1
chr1	55075557	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:55075554_A_C:55075554:0,2,0,1
chr1	55075995	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	55078466	.	A	AGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55078466_A_AGG:55078466:0,0,0,1
chr1	55078472	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55078466_A_AGG:55078466:0,0,0,1
chr1	55080612	.	GGTGT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=222,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=GT;STR;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.670:7:0,2:2,2:0|1:55080612_GGTGT_G:55080612:0,2,0,5
chr1	55080629	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=223,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,2:0,2:0|1:55080612_GGTGT_G:55080612:0,1,0,5
chr1	55085499	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	55085781	.	GTAC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	55088849	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=264,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,1:1,0,2,1
chr1	55096383	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=175,167;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:14,1:11,2:26,0,3,0
chr1	55118566	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,8,6
chr1	55130931	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:10,3:3,5:4,9,4,4
chr1	55130946	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,2:3,2:2,8,2,3
chr1	55130972	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr1	55131012	.	T	TGCACTCCCTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	55134487	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,4:2,8:4,2,8,4
chr1	55134712	.	A	AGGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	55136067	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr1	55138673	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:6,5:0,1:7,0,6,0
chr1	55139618	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr1	55139877	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=221,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	55151960	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:9,4,2,0
chr1	55199420	.	ATTTTTTTTT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=26,17;RU=T;STR;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.829:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	55223398	.	T	TGGGGGGGGGG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,13;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,15;RU=G;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.210:14:5,0:6,1:9,2,0,3
chr1	55253575	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,10:0,0,4,13
chr1	55253594	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=198,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:0,2:4,7:3,1,2,7
chr1	55266845	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr1	55277430	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,239;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:2,1,1,1
chr1	55279688	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,6:2,3:0,6,1,8
chr1	55279744	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=226,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	55280583	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:18,3,2,0
chr1	55307640	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr1	55318090	.	C	CTTCCCCGAGGTGTACGACAAGATCTGCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=202,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.387:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr1	55318108	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=220,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	55319640	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=107,181022251;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55319640_G_T:55319640:1,0,1,0
chr1	55319645	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=107,181022251;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:55319640_G_T:55319640:1,0,1,0
chr1	55330966	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,10,4
chr1	55336950	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=290,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	55446664	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:55446664_G_C:55446664:0,0,4,0
chr1	55446671	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:55446664_G_C:55446664:0,0,4,0
chr1	55446697	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	55457815	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	55464790	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	55474108	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=131,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.403:20:4,3:8,4:6,6,6,2
chr1	55505533	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=139,64;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:13,0:7,2:0|1:55505533_G_A:55505533:7,13,1,2
chr1	55505546	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=158,64;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,0:6,1:0|1:55505533_G_A:55505533:4,12,1,2
chr1	55505651	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:3,2,2,3
chr1	55505732	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr1	55512378	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55512378_C_A:55512378:0,1,0,1
chr1	55512380	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55512378_C_A:55512378:0,1,0,1
chr1	55512382	.	G	GAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55512378_C_A:55512378:0,1,0,1
chr1	55512386	.	GG	TC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=179,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:55512378_C_A:55512378:0,1,0,1
chr1	55518316	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,13:0,0,26,5
chr1	55518467	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=159,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:12,3:10,7:4,18,2,8
chr1	55524116	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,8:0,0,23,4
chr1	55524375	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55524375_T_C:55524375:0,0,0,1
chr1	55524380	.	GT	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55524375_T_C:55524375:0,0,0,1
chr1	55525400	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	55527323	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,2:0,10:0,0,1,11
chr1	55538385	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr1	55538552	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=130,98;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,3:4,8:1,8,1,10
chr1	55538636	.	T	TCCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55538636_T_TCCA:55538636:0,0,0,1
chr1	55538638	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:55538636_T_TCCA:55538636:0,0,0,1
chr1	55539687	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=174,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:55539687_C_G:55539687:0,4,0,1
chr1	55539690	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=174,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:55539687_C_G:55539687:0,4,0,1
chr1	55543049	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr1	55546895	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	55555285	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=143.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,24:0,19:0,0,29,14
chr1	55557859	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:55557859_A_ATT:55557859:0,0,0,4
chr1	55557864	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:55557859_A_ATT:55557859:0,0,0,5
chr1	55558661	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	55562125	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=200.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,32:0,25:0,0,53,5
chr1	55563224	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=156,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.104:45:19,4:22,0:39,2,3,1
chr1	55563396	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=18,34;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.414:28:3,6:2,4:4,13,1,10
chr1	55566411	.	TTAGTC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=115.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,26,0
chr1	55567410	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr1	55571953	.	T	C	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=115.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,38:0.470:81:19,19:24,19:12,31,8,30
chr1	55572867	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr1	55604404	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr1	55609728	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:14,1:6,2:20,2,3,0
chr1	55614036	.	CAT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	55619422	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr1	55619929	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,1:9,1:12,10,2,0
chr1	55625315	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:12,2:4,0:9,7,1,1
chr1	55643837	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr1	55680540	.	G	GGCC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GCC;STR;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr1	57002613	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.657:36:6,9:6,14:10,2,21,3
chr1	57002815	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.177:20:7,1:7,0:1,16,0,3
chr1	57110998	.	AGGC	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GGC;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:3,1:7,1:11,0,2,0
chr1	57111169	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,3,14
chr1	57140070	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,22:0.426:52:16,8:14,14:24,6,17,5
chr1	57185818	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:10,5:5,3:11,4,5,3
chr1	57216631	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr1	57216888	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=106,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,2:2,5:0,4,3,5
chr1	57219631	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.389:8:3,2:2,1:0,5,1,2
chr1	57224460	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr1	57224483	.	C	CAATTGCCTTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	57258485	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=193,87;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr1	57258512	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=175,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	57349140	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr1	57351502	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:3,0,1,0
chr1	57395251	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	57395280	.	GGT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:57395280_GGT_G:57395280:0,3,0,1
chr1	57395284	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:57395280_GGT_G:57395280:0,3,0,1
chr1	57409556	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:57409556_C_T:57409556:0,2,0,1
chr1	57409559	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:57409556_C_T:57409556:0,2,0,1
chr1	57477034	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr1	57489137	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=117,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,5:1,4:4,2,9,0
chr1	57611047	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=121,27;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,2:9,0:12,13,1,1
chr1	59004979	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr1	59041831	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=184,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.321:10:1,1:4,0:2,5,3,0
chr1	59125894	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0|1:59125894_A_G:59125894:0,0,0,13
chr1	59125899	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0|1:59125894_A_G:59125894:0,0,0,11
chr1	59127024	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,17,4
chr1	59131311	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	59134586	.	G	C	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=330.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,78:0.987:78:0,34:0,34:0|1:59134586_G_C:59134586:0,0,67,11
chr1	59134607	.	C	CAG	.	.	DP=117;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=117,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=461.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,108:0.991:109:1,51:0,49:0|1:59134586_G_C:59134586:0,1,81,27
chr1	59139223	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=88.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,9:0,0,23,2
chr1	59141084	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:10,0,2,0
chr1	59147420	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=129.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.952:39:0,27:1,11:1,0,35,3
chr1	59150941	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=180.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,22:0,32:0,0,11,43
chr1	59150997	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=196,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.774:19:2,3:2,10:0,4,0,15
chr1	59156155	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=74.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,9:0,0,1,21
chr1	59158632	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,9:0,0,5,17
chr1	59160724	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.614:8:0,1:1,4:3,0,5,0
chr1	59165838	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	60228310	.	T	TTC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,1,12
chr1	60331495	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=124.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,40:0.604:66:14,20:11,20:23,3,39,1
chr1	60381791	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr1	60392271	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=117,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.527:32:3,9:12,7:9,6,10,7
chr1	60463520	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:60463520_T_C:60463520:0,1,0,1
chr1	60463523	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:60463520_T_C:60463520:0,1,0,1
chr1	60466814	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.680:20:4,5:2,6:2,4,5,9
chr1	60466840	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=10,17;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,0:0,2:0,3,0,6
chr1	60466911	.	ACAG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=182,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	60505578	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,4,6
chr1	61547750	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	61548379	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=112,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,2:0.045:64:21,2:24,0:44,18,2,0
chr1	61554433	.	C	CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	61743337	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:3,3:3,2:0,6,0,6
chr1	61798127	.	GTTGTCAAATGTCTTGTATTTATGACACTTTGTTTTCTTTTGTTTTTGTTTCCCCAGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTT	G	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,5:0.038:82:15,0:7,3:58,19,3,2
chr1	61870000	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:1,2:7,0:0,8,0,2
chr1	61872215	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=12,32;MFRL=146,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=C;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.303:17:2,1:1,3:0|1:61872215_GC_G:61872215:0,12,0,5
chr1	61872228	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.962:22:0,13:0,9:0|1:61872215_GC_G:61872215:0,0,3,19
chr1	61892301	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	62149067	.	CAT	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.065:43:22,2:18,0:40,1,2,0
chr1	62149153	.	C	T	.	.	DP=130;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,9:0.080:120:62,5:48,4:52,59,5,4
chr1	62149230	.	A	AGTAAGTGATATATATATAT	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:22,2:17,0:1,40,0,2
chr1	62149237	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=162.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,24:0,19:0,0,1,43
chr1	62160525	.	T	TTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.734:9:0,5:2,2:0|1:62160525_T_TTA:62160525:0,2,0,7
chr1	62160542	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:62160525_T_TTA:62160525:0,0,0,7
chr1	62175139	.	A	AT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.118:31:15,1:11,1:1,27,0,3
chr1	62231924	.	T	TTGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGA;STR;TLOD=48.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,2:0,0,9,3
chr1	62257036	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=131,128;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:11,3:4,5:10,5,5,3
chr1	62274257	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=165,148;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.055:53:29,0:21,2:0|1:62274257_C_T:62274257:2,49,0,2
chr1	62274262	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=168,148;MMQ=60,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:24,0:17,2:0|1:62274257_C_T:62274257:1,46,0,2
chr1	62274269	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=167,148;MMQ=60,46;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.072:40:20,0:15,2:0,38,0,2
chr1	62340855	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:13,5:4,7:14,3,11,1
chr1	62350123	.	GTTTTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,325;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.739:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	62366878	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=223,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr1	62380270	.	C	T	.	.	DP=121;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,50:0.457:109:24,23:31,23:20,39,24,26
chr1	62380298	.	G	A	.	.	DP=98;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,49:0.578:85:20,23:14,26:13,23,15,34
chr1	62393394	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:6,2,6,1
chr1	62417950	.	GAA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=140,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=A;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.145:19:7,1:8,1:14,3,2,0
chr1	62516683	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,99;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,6:7,5:1,10,3,8
chr1	62545085	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.571:21:7,7:1,5:8,1,12,0
chr1	62579672	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,0:2,4:5,0,4,0
chr1	62587014	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:3,1:3,3:0,6,0,5
chr1	62594667	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:62594667_G_A:62594667:0,4,0,1
chr1	62594671	.	A	ATGGGGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:62594667_G_A:62594667:0,4,0,1
chr1	62594677	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=225,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	62704134	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:0,5,0,5
chr1	62704153	.	G	GTTTTACATGCATTAAATAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	62729015	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=66,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:2,0,0,3
chr1	62733939	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:7,1:6,3:9,4,3,1
chr1	62747262	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=140,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.177:22:6,3:12,0:5,13,2,2
chr1	62908932	.	C	T	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,5:0.072:81:42,0:33,5:23,53,1,4
chr1	62912919	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr1	62939634	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=126.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,18:0,19:0,0,26,12
chr1	62953183	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr1	62958311	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,6:5,2:11,0,8,0
chr1	62961928	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,15:0,0,20,0
chr1	62973795	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr1	63001120	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:4,0,9,0
chr1	63027411	.	AG	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=128.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,21:0,14:0,0,4,32
chr1	63044464	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.582:41:6,14:10,10:11,6,19,5
chr1	63044645	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.523:17:0,3:2,3:0,8,2,7
chr1	63050598	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,2:6,3:1,8,0,5
chr1	63070537	.	AGTTAATGTG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.476:17:2,5:7,3:0,9,0,8
chr1	63085483	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=60,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.811:14:1,7:1,5:2,0,12,0
chr1	63090858	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=117,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:4,1,6,0
chr1	63113511	.	C	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.500:44:13,14:9,8:2,20,1,21
chr1	63113689	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	63113719	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=174,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr1	63269580	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:7,6:12,3:1,18,0,9
chr1	63270772	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.498:40:11,9:9,10:20,0,19,1
chr1	63270823	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=122;ECNT=3;MBQ=33,35,34,34;MFRL=153,155,146,136;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,16,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.10,16.56,11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:52,7,14,10:0.072,0.143,0.126:83:27,3,7,3:22,4,7,4:45,7,29,2
chr1	63270839	.	C	G	.	.	DP=145;ECNT=3;MBQ=14,18;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,12:0.080:132:29,1:22,1:87,33,11,1
chr1	63271010	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.426:45:12,9:14,10:0,26,0,19
chr1	63285033	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=124,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:8,4:5,5:1,12,1,8
chr1	63294614	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	63871881	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,4:3,0:6,0,4,0
chr1	63872871	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	63885222	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=227,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr1	63912546	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=169,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.427:33:12,8:7,6:0,19,1,13
chr1	63912563	.	ACAATT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=193,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.424:24:6,4:7,6:1,13,0,10
chr1	63991490	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,3:3,4:1,7,1,6
chr1	63997633	.	A	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=122.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,40:0.578:69:15,22:14,18:13,16,17,23
chr1	63998326	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.212:25:8,3:12,2:20,0,5,0
chr1	63999087	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.573:33:10,8:3,9:13,1,16,3
chr1	63999826	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.381:40:13,5:12,10:10,15,4,11
chr1	63999868	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.389:34:12,6:9,7:4,17,2,11
chr1	63999891	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=146,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:10,7:7,5:4,13,1,12
chr1	64021096	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=103.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,37:0.585:63:15,18:11,19:8,18,12,25
chr1	64021109	.	AA	GG	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,2:0.048:60:28,2:25,0:17,41,0,2
chr1	64027617	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64027617_G_T:64027617:0,1,0,1
chr1	64027623	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:64027617_G_T:64027617:0,1,0,1
chr1	64036838	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,28:0.546:51:6,13:17,14:4,19,4,24
chr1	64038107	.	G	T	.	.	DP=147;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=186.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,66:0.504:131:31,32:31,32:31,34,35,31
chr1	64100478	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.422:29:11,7:5,5:14,3,11,1
chr1	64102114	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=218,190;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	64114105	.	TG	CA,GG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32,34;MFRL=149,173,167;MMQ=60,60,44;MPOS=12,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,1,1:2,0,0:4,0,2,0
chr1	64114114	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=155,167;MMQ=60,44;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr1	64114406	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64114406_CTT_C:64114406:0,0,0,1
chr1	64114409	.	A	ACAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64114406_CTT_C:64114406:0,0,0,1
chr1	64125234	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=146,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,2:8,2:7,5,2,2
chr1	64516337	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=132,142;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.135:24:10,1:11,1:13,8,1,2
chr1	64603231	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,1:1,2:0,4,0,4
chr1	64624612	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr1	64624955	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=1592,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	64624957	.	AT	CG,ACCTCAGTGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27,29;MFRL=2969,215,200;MMQ=60,60,60;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:1,1,0:0,1,0,2
chr1	64643277	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,6:0,0,8,10
chr1	64680667	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=157,138;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,1:12,2:2,21,0,3
chr1	64698411	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	64707243	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,26,1
chr1	64709891	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,1,5
chr1	64726414	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,12:0,0,2,14
chr1	65068638	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,4:0,12:0,0,4,15
chr1	65099701	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.452:20:8,5:3,2:0|1:65099701_G_GT:65099701:9,2,7,2
chr1	65099716	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:36,4:0.094:40:8,0:9,0:1|0:65099701_G_GT:65099701:24,12,4,0
chr1	65099978	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=127.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,3,34
chr1	65138787	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=135,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.317:21:8,4:4,2:13,2,6,0
chr1	65141676	.	TTAATAATAA	T,TTAATAA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,32,29;MFRL=167,166,152;MMQ=60,60,60;MPOS=19,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=TAA;STR;TLOD=22.12,26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,7,8:0.362,0.539:16:1,5,6:0,2,2:0,1,0,15
chr1	65255077	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:11,1:8,2:12,7,2,1
chr1	65280599	.	T	TCAGAGGGCCAGGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	65311116	.	GC	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr1	65316675	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	65321388	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=118,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.456:20:7,4:4,5:4,7,3,6
chr1	65325970	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:4,8:3,4:0,7,3,9
chr1	65330744	.	G	GACAACAAGAAAATGGTAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	65855195	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,162;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,0:7,2:17,2,2,0
chr1	65867663	.	G	GGTGCTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=221,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	66036501	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr1	66064293	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:0,5:2,3:2,0,7,1
chr1	66074537	.	C	G	.	.	DP=127;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=138,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:118,6:0.055:124:56,1:62,5:62,56,4,2
chr1	66081738	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,1:11,1:9,8,1,1
chr1	66732445	.	ATTC	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=112,95;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.424:24:6,8:7,2:3,11,2,8
chr1	66732529	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	66829262	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=100.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,13:0,0,5,24
chr1	67098664	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,5,1
chr1	67099952	.	TATCCTTGCTGC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=93,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.403:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr1	67101778	.	AAC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	67101802	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	67109410	.	T	TTGTG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TG;STR;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.352:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr1	67126114	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:5,2:2,3:7,1,4,1
chr1	67136610	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,3:3,5:3,4,6,2
chr1	67142852	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,0:1,2:0,4,0,2
chr1	67145322	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=217,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:0,12:1,7:1,0,19,2
chr1	67149706	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr1	67154730	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.815:16:2,7:1,6:3,0,13,0
chr1	67155862	.	TCTC	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=115.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,21,7
chr1	67160981	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,12,4
chr1	67194911	.	TTC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TC;STR;TLOD=85.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,11:0,10:0,0,16,6
chr1	67396222	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	67423997	.	T	TTTCTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.809:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	67425311	.	T	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=267.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.987:71:0,39:0,31:0,0,63,8
chr1	67425494	.	A	AT	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=67.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,29:0.837:34:1,10:2,16:0,5,0,29
chr1	67487119	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=79.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,22,0
chr1	67508080	.	CCACT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.910:8:0,0:0,8:0,0,2,6
chr1	67512903	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	67512920	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr1	67516191	.	G	GA	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,6:0.103:60:27,2:23,1:7,47,0,6
chr1	67558949	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.173:44:18,2:19,4:8,29,3,4
chr1	67560897	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr1	67560956	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,11:0,0,18,13
chr1	67562106	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,15:0,0,0,22
chr1	67568824	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	67577367	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=120.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,12:0,22:0,0,3,34
chr1	67580945	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,1:13,2:26,1,3,0
chr1	67591347	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	67591660	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	67633963	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=291,312;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	67648460	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr1	67672765	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=195,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:0,4,0,6
chr1	67721513	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,34;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:9,8,1,1
chr1	67796258	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr1	67878789	.	C	CT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=168,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,8:0.156:50:28,1:14,5:42,0,7,1
chr1	67890526	.	A	G	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=318.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,90:0.989:90:0,38:0,51:0,0,72,18
chr1	68151980	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=116.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,18:0,13:0,0,32,0
chr1	68152363	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	68173264	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=97.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,23,6
chr1	68613933	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,4,5
chr1	68620998	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	68905358	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=180,98;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.584:19:3,5:3,6:0,8,2,9
chr1	68943436	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:7,2:4,4:0|1:68943436_G_A:68943436:7,4,4,4
chr1	68943442	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:7,4:5,5:0|1:68943436_G_A:68943436:7,5,5,4
chr1	68943665	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,7:7,3:3,9,2,8
chr1	68944524	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,6,0
chr1	68944792	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:9,8:9,4:10,8,6,6
chr1	68944891	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.099:38:10,1:23,2:0|1:68944891_A_T:68944891:20,15,1,2
chr1	68944894	.	AT	GC	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:10,1:22,2:0|1:68944891_A_T:68944891:21,14,1,2
chr1	68944899	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=153,134;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:11,0:20,1:0|1:68944891_A_T:68944891:22,12,0,2
chr1	68947318	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,5:0,0,1,12
chr1	68948280	.	A	C	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,34:0.387:88:24,22:30,11:15,39,17,17
chr1	68952564	.	AACACAC	A,AACAC	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31,30;MFRL=152,173,166;MMQ=60,60,60;MPOS=11,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,17,19;RU=AC;STR;TLOD=4.19,7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,4:0.166,0.286:17:6,0,2:1,3,2:10,0,7,0
chr1	68955058	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=43.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.549:27:8,9:4,5:12,0,15,0
chr1	68960038	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,22:0.594:37:10,13:4,8:15,0,22,0
chr1	68960349	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=154,146;MMQ=52,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.600:33:8,10:5,10:3,10,4,16
chr1	68960404	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,12:0.482:25:3,3:9,9:0|1:68960404_A_T:68960404:1,12,1,11
chr1	68960411	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:2,2:10,8:0|1:68960404_A_T:68960404:1,11,1,11
chr1	70034370	.	C	CCAGCCGCGTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.721:16:2,4:2,4:0,4,0,12
chr1	70502380	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=258,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70502380_TAA_T:70502380:0,1,0,1
chr1	70502391	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=258,181;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70502380_TAA_T:70502380:0,1,0,1
chr1	70509780	.	A	AAGAGAGAGC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=170,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.172:15:8,2:5,0:2,11,1,1
chr1	70555604	.	T	TTGAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	70614105	.	AAAAAC	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:4,2:6,2,5,0
chr1	70614132	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,239;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,2:12,0:15,4,2,0
chr1	70614427	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=218,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	70621490	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:6,10:7,7:2,11,6,11
chr1	70653068	.	A	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,27:0.406:67:19,13:21,14:6,34,3,24
chr1	70710573	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,5:4,1:0,4,0,6
chr1	70728625	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,14;MFRL=220,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.481:4:0,0:2,0:0,2,0,2
chr1	70742532	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,35,34;MFRL=170,134,64;MMQ=60,60,60;MPOS=26,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=A;STR;TLOD=4.36,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.233,0.263:8:2,1,0:2,1,2:1,3,1,3
chr1	70820688	.	CGCA	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=143,242;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.054:53:24,1:20,1:31,20,0,2
chr1	70883652	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=139,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.161:22:12,3:6,0:10,9,1,2
chr1	70896165	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=213,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr1	71327936	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=151,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,1:3,0,3,0
chr1	71334870	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	71335093	.	T	TGGATGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=218,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	71437471	.	T	TA	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=97.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,39:0.591:66:14,20:11,17:9,18,7,32
chr1	71533287	.	A	T	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=129,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=142.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,51:0.508:101:28,33:19,18:31,19,33,18
chr1	71536463	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=196,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:71536463_G_C:71536463:4,0,2,0
chr1	71536466	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=196,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0|1:71536463_G_C:71536463:4,0,2,0
chr1	71537943	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.354:37:11,4:13,8:4,20,5,8
chr1	71537980	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:8,7:4,10:3,9,2,15
chr1	71542667	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:7,2:0,14,0,2
chr1	71544069	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=163,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.443:18:6,3:4,3:0|1:71544069_G_A:71544069:9,1,8,0
chr1	71544079	.	CAAG	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,11:0.546:20:4,7:3,4:1|0:71544069_G_A:71544069:9,0,10,1
chr1	72058405	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,3:0,0,9,0
chr1	72242039	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	74507711	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	74575182	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.954:39:1,18:0,20:0,1,14,24
chr1	74575212	.	G	GT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:11,2:11,2:7,20,3,1
chr1	74610233	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.314:13:0,0:8,2:2,7,1,3
chr1	74646514	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,0,11
chr1	74701295	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	74737478	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,229;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr1	74819077	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0,0,4,16
chr1	74901739	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.769:6:0,2:1,2:1,0,4,1
chr1	74946718	.	A	ATTAAGTGAGGGAATGGGAAGAAAAAAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	75006027	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,3,19
chr1	75006076	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr1	75036783	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	75036812	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	75037541	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75037541_A_G:75037541:0,1,0,1
chr1	75037546	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75037541_A_G:75037541:0,1,0,1
chr1	75038228	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,14,12
chr1	75100218	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr1	75172756	.	TA	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.162:33:14,3:8,2:17,11,3,2
chr1	75199152	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr1	75214390	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,19:0.431:44:12,11:13,7:16,9,15,4
chr1	75614380	.	CTT	C,CT	.	.	DP=116;ECNT=1;MBQ=31,35,32;MFRL=128,168,146;MMQ=60,60,60;MPOS=28,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.59,120.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,5,56:0.065,0.750:76:6,3,23:5,2,22:6,9,21,40
chr1	75626420	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	75669619	.	T	TTTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTG;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	75679569	.	CT	C,CTT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,34,33;MFRL=152,132,212;MMQ=60,60,60;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=8.04,6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,5,5:0.170,0.167:31:12,1,3:9,4,1:13,8,6,4
chr1	75680433	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=189,264;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr1	75681351	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,21,0
chr1	75684529	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	75685403	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,5:6,3:14,0,8,0
chr1	75702629	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=145,131;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:12,4:15,0:18,10,4,0
chr1	75766186	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	76190569	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=86.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,8:0,17:0,0,4,21
chr1	76194054	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,9,0
chr1	76194229	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr1	76198436	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=201.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,33:0,21:0,0,21,36
chr1	76199345	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=106.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,12:0,17:0,0,3,26
chr1	76205643	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=206.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,23:0,39:0,0,48,14
chr1	76216330	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	76252011	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=170.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,26:0,25:0,0,28,25
chr1	76255883	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	76259677	.	ACCTAAGAGTGAGACTTAACCCACTTTTAAATTGTTCT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.929:10:0,9:0,1:0,0,10,0
chr1	76269372	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr1	76276353	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr1	76333163	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=97.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,17:0,12:0,0,21,8
chr1	76346920	.	C	CAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr1	76378360	.	T	TA,TATA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30,32;MFRL=0,160,81;MMQ=60,60,51;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=28.56,4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,11,2:0.788,0.173:13:0,5,1:0,6,1:0,0,12,1
chr1	76378362	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=88.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,9:0,0,18,4
chr1	76387763	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=125,28;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:0|1:76387763_A_T:76387763:5,4,1,1
chr1	76387768	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=125,28;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,0:3,2:0|1:76387763_A_T:76387763:6,5,1,1
chr1	76387770	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=127,28;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,0:3,1:0|1:76387763_A_T:76387763:5,5,1,1
chr1	77042635	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=98,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	77334268	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,24:0.550:43:9,8:10,13:9,10,8,16
chr1	77334292	.	G	GCAGCAA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.384:21:7,4:6,4:5,8,0,8
chr1	77515954	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=102,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,0:8,2:0|1:77515954_A_T:77515954:9,8,1,1
chr1	77515962	.	C	CTGG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:0|1:77515954_A_T:77515954:9,9,1,1
chr1	77620035	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr1	77627096	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,13:0,0,6,19
chr1	77779629	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=121,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:1,3,0,1
chr1	77883465	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:77883465_T_C:77883465:0,3,0,1
chr1	77883470	.	AAA	TCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:77883465_T_C:77883465:0,3,0,1
chr1	77949160	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	77987583	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:9,3:16,0:15,12,1,2
chr1	78001764	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=136,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,1:5,2:1,6,0,3
chr1	78024345	.	C	CTAT	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAT;STR;TLOD=290.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.987:71:0,32:0,38:0,0,31,40
chr1	78033981	.	AAAATG	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATG;STR;TLOD=209.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.983:49:0,23:0,25:0,0,40,9
chr1	78045369	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr1	78046606	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=127,164;MMQ=60,55;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:2,2:7,0:9,0,2,0
chr1	78098403	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=124.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,22:0,12:0,0,18,17
chr1	78105067	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=193,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	78184423	.	T	TG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.127:21:11,1:7,1:0|1:78184423_T_TG:78184423:0,19,0,2
chr1	78184428	.	A	AC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:0|1:78184423_T_TG:78184423:0,19,0,2
chr1	78184429	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,1:0|1:78184423_T_TG:78184423:0,19,0,2
chr1	78281002	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr1	78383467	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,4,21
chr1	78391020	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,0,19
chr1	78392479	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,30:0.428:70:15,11:25,18:29,11,19,11
chr1	78399207	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=226.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,32:0,29:0,0,5,58
chr1	78430689	.	A	AG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=119.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,18:0,14:0,0,19,14
chr1	78432647	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:12,1:6,2:16,2,3,1
chr1	78435701	.	TA	T,TAA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,25,32;MFRL=163,165,146;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.54,5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,4,5:0.104,0.131:39:11,3,1:7,0,3:2,28,1,8
chr1	78444781	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=213,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	78471060	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.923:11:0,3:1,6:1,0,0,10
chr1	78478675	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,12,3
chr1	78481640	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	78601465	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.938:12:0,4:0,6:0,0,4,8
chr1	78958633	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:10,0:14,3:0|1:78958633_T_C:78958633:13,11,0,3
chr1	78958637	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:11,0:12,2:0|1:78958633_T_C:78958633:12,12,0,3
chr1	79094081	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,3,11
chr1	79094593	.	A	G	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=236.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,33:0,33:0,0,45,22
chr1	79095339	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,8:0,0,16,0
chr1	79095834	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=128,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr1	79102726	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,7:4,6:3,5,7,6
chr1	79106899	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	79107372	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,8:5,6:5,3,10,4
chr1	79115905	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,18:0.373:49:13,10:18,8:20,11,18,0
chr1	79124961	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:5,1,7,1
chr1	79128320	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	79128570	.	G	GT	.	.	DP=108;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=377.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,99:0.990:99:0,52:0,43:0,0,54,45
chr1	79128655	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=142,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.115:50:21,1:24,4:3,42,0,5
chr1	79129514	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:6,0:9,3:1,14,1,2
chr1	79355596	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=90.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,30:0.527:57:8,12:18,17:4,23,2,28
chr1	79358743	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=127,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.560:7:2,1:1,2:2,1,2,2
chr1	79383458	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:12,6:9,10:6,15,4,12
chr1	79386139	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	79387242	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,2:7,1:10,1,3,0
chr1	79401927	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:3,5:0,5:3,0,9,1
chr1	79403450	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:8,1,7,0
chr1	79403751	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:10,7:6,9:13,3,12,4
chr1	79404779	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,243;MMQ=60,59;MPOS=-42;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:2,7:6,5:8,0,13,0
chr1	79411951	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:5,3:8,6:8,5,8,1
chr1	79472244	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.441:34:11,8:7,6:14,5,11,4
chr1	82302600	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:2,4:4,4:5,1,7,1
chr1	82372890	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,0:11,2:6,14,0,2
chr1	82402364	.	TAATC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=126,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:5,2,1,1
chr1	82402597	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=155,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr1	82409541	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:82409541_C_A:82409541:0,3,0,1
chr1	82409543	.	T	TTTATTTTTGAGATGGGATTTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:82409541_C_A:82409541:0,3,0,1
chr1	82415814	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr1	82416220	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,5:5,5:2,10,0,10
chr1	82417552	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:2,2:4,0,4,0
chr1	82437670	.	ATTTGT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:5,2:3,5:0|1:82437670_ATTTGT_A:82437670:0,8,1,6
chr1	82437682	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.501:14:4,2:3,4:0|1:82437670_ATTTGT_A:82437670:0,7,1,6
chr1	82452565	.	GT	G,GTT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=35,35,35;MFRL=145,151,129;MMQ=60,60,60;MPOS=25,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.52,4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,8,5:0.215,0.135:37:12,6,3:12,2,1:22,2,12,1
chr1	84383239	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,32;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:13,0,2,0
chr1	84394792	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.448:29:8,8:8,4:11,5,10,3
chr1	84641416	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=165,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.539:18:2,6:6,4:7,1,6,4
chr1	84765340	.	G	GTA,GTATA	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=32,31,33;MFRL=166,141,138;MMQ=60,60,60;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=TA;STR;TLOD=9.94,21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,5,10:0.148,0.345:28:4,3,3:5,2,6:0,13,0,15
chr1	84765359	.	T	TA	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.131:42:17,2:19,3:2,35,0,5
chr1	84765360	.	T	A,TA,TATA	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=33,33,32,31;MFRL=149,181,199,130;MMQ=60,60,60,40;MPOS=27,28,28;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=4.24,3.67,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:27,2,2,2:0.113,0.099,0.099:33:11,1,1,1:15,1,1,1:0,27,0,6
chr1	84791239	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	84867563	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.311:14:6,0:4,3:0|1:84867563_C_T:84867563:6,4,3,1
chr1	84867569	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.276:16:5,0:6,2:0|1:84867563_C_T:84867563:7,5,3,1
chr1	84867781	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=116,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:84867781_G_C:84867781:0,1,0,1
chr1	84867785	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=116,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:84867781_G_C:84867781:0,1,0,1
chr1	84867788	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=116,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:84867781_G_C:84867781:0,1,0,1
chr1	84876501	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,0:6,5:10,4,5,0
chr1	84946745	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr1	84956161	.	C	CT	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,8:0.118:66:32,3:21,5:7,51,1,7
chr1	84971623	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=11,28;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,0:1,2:6,0,2,0
chr1	84971626	.	AG	CC,CG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,25,13;MFRL=219,179,155;MMQ=60,60,60;MPOS=6,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.07,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.291,0.238:8:1,0,0:2,2,0:4,0,4,0
chr1	84971629	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=21,10;MFRL=185,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.247:9:1,0:4,0:7,0,2,0
chr1	84971646	.	CCCG	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CCG;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:6,2:14,0,2,0
chr1	84986213	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr1	85018771	.	G	GA	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=128,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,8:0.100:68:31,1:28,6:45,15,6,2
chr1	85029376	.	A	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,23:0.407:57:18,12:16,11:31,3,21,2
chr1	85096589	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=30,27;MFRL=156,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:3,2:0,5,0,3
chr1	85096592	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=226,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr1	85096613	.	G	GCATCTGGGC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,12;MFRL=191,137;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:85096613_G_GCATCTGGGC:85096613:0,3,0,1
chr1	85096616	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=191,137;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:85096613_G_GCATCTGGGC:85096613:0,3,0,1
chr1	85096617	.	C	CCTCCTTGA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=191,137;MMQ=60,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:85096613_G_GCATCTGGGC:85096613:0,3,0,1
chr1	85096621	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,22;MFRL=191,137;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:85096613_G_GCATCTGGGC:85096613:0,3,0,1
chr1	85096623	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=191,137;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:85096613_G_GCATCTGGGC:85096613:0,3,0,1
chr1	85097247	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,4:4,3:8,2,6,1
chr1	85128280	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:7,3:1,2:1,7,0,5
chr1	85131982	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=235,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:0,4,0,7
chr1	85135663	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85135663_A_T:85135663:0,0,0,1
chr1	85135664	.	T	TGCTTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85135663_A_T:85135663:0,0,0,1
chr1	85135665	.	A	AGCCCAGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85135663_A_T:85135663:0,0,0,1
chr1	85331808	.	G	GAGA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=64.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.441:41:4,5:19,11:3,20,3,15
chr1	85488154	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr1	85506668	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=139,73;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:14,3:14,0:19,10,2,1
chr1	85537522	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr1	85538655	.	A	G,AG,AAAG	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=22,20,23,33;MFRL=239,139,157,158;MMQ=40,40,40,40;MPOS=14,23,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=8.88,16.43,4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,5,9,4:0.206,0.421,0.309:22:1,2,4,1:1,1,3,2:3,1,16,2
chr1	85547945	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr1	85550156	.	A	AAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AT;STR;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,5:1,2:1,0,7,0
chr1	85551468	.	A	ATCAGTTTTTCT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=120.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,9:0,0,26,1
chr1	85559118	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:5,0,5,0
chr1	85560313	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=81,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	85561546	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,4,1
chr1	85563444	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=217,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:0,1:2,2:0,6,0,3
chr1	85564138	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:4,0,5,0
chr1	85573705	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:4,1,4,0
chr1	85589939	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=58.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,4,14
chr1	85592126	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	85595645	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=170.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,21:0,29:0,0,42,8
chr1	85598527	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=49.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,8,9
chr1	85647713	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=117.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,15:0,17:0,0,27,5
chr1	85648905	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,3,13
chr1	85724409	.	T	TGATTAGATTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=122,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	85724438	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	85741921	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr1	85787114	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0|1:85787114_A_T:85787114:0,0,13,3
chr1	85787118	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0|1:85787114_A_T:85787114:0,0,13,3
chr1	85787323	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr1	85787334	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	85790633	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	85790634	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=165,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:85790634_TG_T:85790634:0,3,0,1
chr1	85790638	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=165,206;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:85790634_TG_T:85790634:0,3,0,1
chr1	85816134	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,13:0,0,15,4
chr1	85817295	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,1,18
chr1	86047311	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=100,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.668:25:3,11:5,6:0,8,2,15
chr1	86146672	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	86167957	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=128.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,19:0,0,3,32
chr1	86171692	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.598:13:2,3:1,5:4,1,8,0
chr1	86203249	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=21,24;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:11,1:7,2:0,20,0,3
chr1	86203277	.	AT	GC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=195,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.181:16:11,3:2,0:0,13,0,3
chr1	86210343	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=119,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,0:4,5:4,3,5,0
chr1	86210546	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr1	86241399	.	GA	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.146:36:12,1:7,4:2,29,0,5
chr1	86246849	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	86247008	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=200,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,0:2,1:0|1:86247008_A_AG:86247008:0,3,0,1
chr1	86247011	.	A	AGAAAGAAAAAGAAAAGTTAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=200,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:86247008_A_AG:86247008:0,3,0,1
chr1	86249063	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	86249357	.	TG	CC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	86249911	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,6,10
chr1	86252025	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr1	86313536	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr1	86334316	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:3,4:5,4:4,4,3,6
chr1	86340262	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=126,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,29:0.647:44:11,12:4,12:13,2,27,2
chr1	86340880	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=128,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,2:2,5:2,0,7,0
chr1	86340892	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,0:6,4:7,0,3,1
chr1	86355414	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,36;MFRL=140,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,0:1,2:0,5,0,2
chr1	86361802	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,5:6,2:0,10,1,6
chr1	86372839	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.674:13:1,5:3,2:3,1,5,4
chr1	86377028	.	C	T	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=110.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,39:0.430:91:23,16:29,23:39,13,32,7
chr1	86435957	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=30,32,31,31;MFRL=127,141,151,147;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,24,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.24,13.02,5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:38,4,11,5:0.068,0.161,0.099:58:17,1,6,0:13,3,4,5:6,32,0,20
chr1	86453265	.	CTCT	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCT;STR;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.085:56:30,1:16,2:46,6,3,1
chr1	86453409	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,26:0.538:48:10,15:12,11:2,20,3,23
chr1	86488259	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,2:0.050:58:33,1:23,1:25,31,0,2
chr1	86554813	.	G	GA,GAA	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=33,34,33;MFRL=99,139,48;MMQ=60,60,56;MPOS=16,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,8,9;RU=A;STR;TLOD=130.13,3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,54,4:0.849,0.074:63:2,29,3:3,18,1:4,1,51,7
chr1	86554821	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=133,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=325.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,80:0.988:81:0,44:0,34:1,0,64,16
chr1	86554830	.	A	G	.	.	DP=111;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=112,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,11:0.109:108:55,10:41,1:75,22,11,0
chr1	86591141	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:7,3:2,6:6,3,9,1
chr1	86611702	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:9,8:8,8:17,0,16,0
chr1	86621992	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.961:24:0,9:0,12:0|1:86621992_C_A:86621992:0,0,16,8
chr1	86621998	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,15:0.593:25:2,7:7,8:0|1:86621992_C_A:86621992:5,5,12,3
chr1	86821194	.	A	ACT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr1	86824675	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=191,203;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:7,2:0,20,0,2
chr1	86848756	.	A	G	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,5:0.075:78:30,5:41,0:45,28,5,0
chr1	86890163	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:86890163_C_CT:86890163:0,1,0,1
chr1	86890166	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:86890163_C_CT:86890163:0,1,0,1
chr1	86890931	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.484:35:7,8:11,8:18,0,17,0
chr1	86896541	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=77.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,34:0.435:77:18,13:25,16:30,13,19,15
chr1	86897973	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=202,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:5,0,8,0
chr1	86906042	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=187,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:86906042_A_T:86906042:0,4,0,1
chr1	86906045	.	T	TTAAAACA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=205,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:86906042_A_T:86906042:0,4,0,1
chr1	86906055	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=214,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	86918965	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	86919011	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:5,0,5,0
chr1	86939390	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=104.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,23,6
chr1	86959014	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr1	86959796	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	87036746	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=142,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,1:5,6:6,6,3,4
chr1	87045896	.	TCCTACA	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.377:30:12,2:3,8:9,10,7,4
chr1	87100226	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr1	87101245	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.439:39:15,9:6,8:17,5,14,3
chr1	87200729	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:4,7:3,5:7,0,10,2
chr1	87333609	.	AAATTTAAATTGAT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:87333609_AAATTTAAATTGAT_A:87333609:0,0,1,0
chr1	87333626	.	TAATATTTGCACATGTTTATGGGGGAA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=95,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:87333609_AAATTTAAATTGAT_A:87333609:2,0,1,0
chr1	87333656	.	ATTTAT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=157,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:87333609_AAATTTAAATTGAT_A:87333609:4,0,1,0
chr1	87458695	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,12:0,3:0,0,10,5
chr1	87549858	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=86.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,13:0,0,22,4
chr1	87563668	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr1	87570398	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	87633761	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=73,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr1	89236029	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=97.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.970:32:0,19:0,12:0,0,25,7
chr1	89237662	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=251,400;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr1	89318880	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:4,8:8,4:10,2,11,1
chr1	89420722	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=246,160;MMQ=58,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:89420722_T_G:89420722:2,0,1,0
chr1	89420729	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=219,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:89420722_T_G:89420722:3,0,1,0
chr1	89430420	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:4,6:11,5:15,0,11,0
chr1	89448539	.	C	G	.	.	DP=106;ECNT=3;MBQ=29,36;MFRL=145,194;MMQ=60,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:101,3:0.038:104:48,2:51,1:0|1:89448539_C_G:89448539:45,56,3,0
chr1	89448556	.	A	G	.	.	DP=102;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=143,185;MMQ=60,26;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,4:0.048:102:45,3:44,1:0|1:89448539_C_G:89448539:43,55,4,0
chr1	89448571	.	A	G	.	.	DP=105;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=146,185;MMQ=60,26;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,4:0.048:102:46,3:50,1:0|1:89448539_C_G:89448539:39,59,4,0
chr1	89448896	.	A	T	.	.	DP=81;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=152,225;MMQ=52,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,6:0.085:80:32,3:39,3:0|1:89448896_A_T:89448896:53,21,5,1
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chr1	89520643	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=221,209;MMQ=27,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:0|1:89520636_G_A:89520636:5,1,3,2
chr1	89522512	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:6,5:10,9:13,3,11,3
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chr1	89582976	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=197,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:0,7,0,3
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chr1	89597755	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr1	89614879	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	89615979	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,9:0,13:0,0,15,7
chr1	89618032	.	C	CGTGCCCCAGACCTGA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:16,2:8,0:10,14,0,2
chr1	89618479	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=201,112;MMQ=60,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.385:3:0,1:1,0:0|1:89618479_A_AG:89618479:0,2,0,1
chr1	89618480	.	A	AGAG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=201,112;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.385:3:0,1:1,0:0|1:89618479_A_AG:89618479:0,2,0,1
chr1	89618483	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=201,112;MMQ=60,34;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:89618479_A_AG:89618479:0,2,0,1
chr1	89618485	.	A	ATC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=201,112;MMQ=60,34;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:89618479_A_AG:89618479:0,2,0,1
chr1	89650850	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:1,6:3,9:4,0,15,0
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chr1	89652078	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,7:0.178:43:22,1:11,5:0|1:89652071_TC_CT:89652071:22,14,5,2
chr1	89652087	.	CC	TG	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=128,182;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,7:0.163:47:22,3:15,4:0|1:89652071_TC_CT:89652071:25,15,4,3
chr1	89652090	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=128,184;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,8:0.180:48:22,3:14,3:0|1:89652071_TC_CT:89652071:25,15,4,4
chr1	89652094	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=125,167;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,9:0.208:46:19,4:15,3:0|1:89652071_TC_CT:89652071:22,15,4,5
chr1	89652097	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=130,179;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,8:0.184:47:20,5:16,1:0|1:89652097_C_T:89652097:23,16,4,4
chr1	89652102	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=125,167;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,9:0.200:48:22,5:17,3:0|1:89652097_C_T:89652097:22,17,4,5
chr1	89652846	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,1:5,4:1,10,0,6
chr1	89659145	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:3,3:6,1:1,8,0,5
chr1	89726592	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=242,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr1	89730723	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	89731959	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:5,7:7,9:11,1,16,0
chr1	89733273	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,4:6,2:0,8,1,5
chr1	89845926	.	GT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=57.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,13:0,7:0,0,11,9
chr1	89847411	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,15:0,17:0,0,14,21
chr1	89847425	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=198,154;MMQ=53,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:5,11:10,10:6,9,9,12
chr1	89847444	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,50;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,15:0,0,12,17
chr1	89849201	.	C	G	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=249.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,73:0.987:73:0,35:0,38:0,0,47,26
chr1	89849350	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=177.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,13:0,39:0,0,14,38
chr1	89849574	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,11:0,0,14,0
chr1	90058242	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,37;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr1	90179284	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=138,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.067:43:23,0:16,2:23,18,0,2
chr1	90401088	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:12,6,2,0
chr1	90401297	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:1,4,1,5
chr1	90478822	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,5:0.067:87:36,0:44,5:8,74,0,5
chr1	90493026	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,32:0.460:70:21,17:15,15:20,18,20,12
chr1	91177998	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:8,4:10,0:10,8,4,0
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chr1	91383683	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=136,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:14,0:20,2:0|1:91383670_T_A:91383670:12,23,1,1
chr1	91447985	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	91728202	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,1,27
chr1	91731756	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	91739208	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	91739414	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	91739457	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=206,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	91781304	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,17,0
chr1	91781576	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:13,6:5,6:9,9,3,9
chr1	91782011	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,23:0.511:45:8,13:14,10:4,18,4,19
chr1	91841301	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=64.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,15:0,3:0,0,3,15
chr1	91844815	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:0,4,0,8
chr1	91846362	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=205,221;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr1	91846374	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	91846595	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=49.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,7:0,0,0,14
chr1	91846654	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	91850826	.	C	CA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.549:38:9,12:8,8:2,15,4,17
chr1	91973557	.	T	G	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=38,33;MFRL=112,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=347.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,97:0.981:98:0,45:1,51:0,1,12,85
chr1	91974034	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=54.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:7,10:4,8:1,10,0,18
chr1	91978963	.	T	TAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=187,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=A;STR;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:4,1:0,7,0,3
chr1	91980649	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	91989572	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,16:0,8:0,0,24,0
chr1	92195601	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	92200593	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	92442039	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.321:7:4,1:1,0:0,5,0,2
chr1	92446112	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	92446398	.	T	A	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=319.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,91:0.990:91:0,39:0,51:0,0,33,58
chr1	92447004	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=191.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,29:0,23:0,0,3,49
chr1	92447227	.	GAGC	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AGC;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.072:52:21,0:20,3:18,31,1,2
chr1	92457969	.	CAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,18;MFRL=193,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,0:0|1:92457969_CAAA_C:92457969:0,2,0,1
chr1	92457980	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=196,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:92457969_CAAA_C:92457969:0,4,0,1
chr1	92457983	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=196,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1|0:92457969_CAAA_C:92457969:0,4,0,1
chr1	92457985	.	A	ATAATAATT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=215,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:92457969_CAAA_C:92457969:0,3,0,1
chr1	92457987	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,35;MFRL=215,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:92457969_CAAA_C:92457969:0,3,0,1
chr1	92457989	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,26;MFRL=215,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1|0:92457969_CAAA_C:92457969:0,3,0,1
chr1	92568263	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,16:0,5:0,0,6,15
chr1	92606870	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,1:5,1:0,12,0,2
chr1	92646665	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,88;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:19,3:21,0:18,23,3,0
chr1	92649335	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	92709753	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,2:11,0:15,8,2,0
chr1	92711312	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,73;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:11,2:0,19,2,0
chr1	92712266	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,3:0,6:0,0,1,10
chr1	92754806	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:92754806_T_TTC:92754806:0,0,0,1
chr1	92754808	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,1:0|1:92754806_T_TTC:92754806:0,0,0,1
chr1	92763091	.	CA	C,CAA	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,35,32;MFRL=158,147,134;MMQ=60,60,60;MPOS=21,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=14.59,9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,9,5:0.242,0.155:36:10,1,2:9,6,1:4,18,4,10
chr1	92852422	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=222,222;MMQ=60,36;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:92852422_A_T:92852422:1,0,1,0
chr1	92852424	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=222,222;MMQ=60,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92852422_A_T:92852422:1,0,1,0
chr1	92852430	.	TGGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=222,222;MMQ=60,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92852422_A_T:92852422:1,0,1,0
chr1	92944314	.	CAG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=AG;STR;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.777:6:0,2:0,0:0,1,0,5
chr1	92979512	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=119,42;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:6,2:13,0:12,8,1,1
chr1	93071048	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	93131557	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:4,6,1,1
chr1	93159821	.	CA	C,CAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=141,133,123;MMQ=60,60,60;MPOS=22,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=7.06,7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,5,5:0.168,0.178:31:10,2,3:7,3,2:15,6,9,1
chr1	93160002	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr1	93163633	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	93167610	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=96.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,16:0,0,29,0
chr1	93167854	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr1	93308853	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=84.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,7:0,0,25,0
chr1	93309503	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:14,6,2,0
chr1	93426866	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,9:0,12:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,21,0
chr1	93426869	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=98.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,9:0,11:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,23,0
chr1	93426874	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.960:22:0,10:0,11:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,22,0
chr1	93545157	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,1,18
chr1	93580992	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,12:0,0,22,8
chr1	93581024	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=161.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,22:0,21:0,0,29,15
chr1	93583818	.	CTT	C,CT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32,33;MFRL=187,209,164;MMQ=60,60,60;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=T;STR;TLOD=4.01,20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,6,11:0.296,0.573:19:1,3,7:1,2,4:2,0,17,0
chr1	93583850	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=13,13;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.173:35:7,0:6,0:28,0,7,0
chr1	93584870	.	CT	C	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,13:0.219:58:22,5:17,8:39,6,10,3
chr1	93584885	.	C	G	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,15:0.242:58:13,2:13,0:24,19,15,0
chr1	93602194	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,13:0,0,25,3
chr1	93620487	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:1,12,0,2
chr1	93621483	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,5:0,0,15,0
chr1	93648816	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	93649732	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	93659350	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=129.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,12:0,26:0,0,0,38
chr1	93676314	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=95.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,20:0,11:0,0,25,7
chr1	93676578	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=157,181;MMQ=50,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	93687528	.	CT	C,CTT	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=161,144,170;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.50,6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,8,6:0.164,0.135:48:13,4,5:15,3,0:4,30,1,13
chr1	93691855	.	GT	G,GTT,GTTTTTTTTTTT	.	.	DP=88;ECNT=3;MBQ=35,34,35,36;MFRL=153,124,142,104;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,23,7;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,15,17,26;RU=T;STR;TLOD=13.94,15.22,6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:22,12,15,5:0.183,0.280,0.099:54:7,8,6,1:14,3,7,1:21,1,25,7
chr1	93691873	.	C	G	.	.	DP=113;ECNT=3;MBQ=20,18;MFRL=86,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,31:0.288:102:24,2:24,0:27,44,30,1
chr1	93691885	.	C	G	.	.	DP=131;ECNT=3;MBQ=24,17;MFRL=93,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,16:0.105:125:44,0:35,0:39,70,16,0
chr1	93697961	.	GAT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,2:9,0:20,1,2,0
chr1	93711782	.	T	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=156.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,23:0,24:0,0,9,38
chr1	93989786	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:16,3:24,0:34,6,3,0
chr1	93998640	.	AT	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=126.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,19:0,19:0,0,7,31
chr1	94018110	.	T	TTTGTTTTGTTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.492:2:1,0:0,0:0|1:94018110_T_TTTGTTTTGTTTG:94018110:0,1,0,1
chr1	94018114	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:94018110_T_TTTGTTTTGTTTG:94018110:0,1,0,1
chr1	94028055	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	94041643	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=131,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:22,0:18,3:18,22,0,3
chr1	94312482	.	T	TC	.	.	DP=168;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=533.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,157:0.994:157:0,80:0,75:0,0,72,85
chr1	94312528	.	G	GC	.	.	DP=68;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=267.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,62:0.985:62:0,26:0,33:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,3,59
chr1	94312533	.	G	GC	.	.	DP=63;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=277.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,63:0.985:63:0,26:0,29:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,2,61
chr1	94312542	.	G	GC	.	.	DP=59;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=263.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,59:0.984:59:0,23:0,28:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,59
chr1	94312544	.	G	GC	.	.	DP=58;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=259.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,58:0.983:58:0,24:0,27:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,58
chr1	94312554	.	A	AG	.	.	DP=52;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=232.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,52:0.981:52:0,19:0,29:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,52
chr1	94312559	.	CGGCTGGGTCGGGCG	C	.	.	DP=50;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=223.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,50:0.981:50:0,20:0,27:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,50
chr1	94312576	.	G	GC	.	.	DP=50;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=223.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,50:0.981:50:0,18:0,26:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,0,50
chr1	94335194	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr1	94341137	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr1	94473802	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,31:0.534:58:8,10:18,20:14,13,14,17
chr1	94476991	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.926:13:0,1:1,11:0,1,0,12
chr1	94487285	.	AAC	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=190.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,24:0,20:0,0,14,30
chr1	94495010	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=164,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:4,0,1,0
chr1	94495930	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	94496602	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=123,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,7:6,2:5,5,7,2
chr1	94502188	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,0:8,2:18,0,2,0
chr1	94502200	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:18,0,2,0
chr1	94528062	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=36,33;MFRL=232,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:0,1,3,0
chr1	94528068	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,35;MFRL=116,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:1,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:1,1,3,0
chr1	94528072	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=30,35;MFRL=162,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,2:3,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:6,1,2,0
chr1	94528078	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=29,21;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:5,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:6,2,2,0
chr1	94528080	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:6,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:6,2,2,0
chr1	94528082	.	CAG	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=33,24;MFRL=140,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,1:6,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:8,2,2,0
chr1	94528086	.	A	AACCCCC	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=29,13;MFRL=140,61;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,0:0|1:94528062_CAG_C:94528062:8,2,2,0
chr1	94544805	.	T	TCA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=CA;STR;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.479:27:9,9:5,2:14,0,11,2
chr1	94549029	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:3,3:0,1:0,3,0,4
chr1	94549083	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	94568491	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr1	94574053	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=128,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr1	94576968	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,3:5,0:6,2,2,1
chr1	94578656	.	GTGGT	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,1:13,1:0|1:94578656_GTGGT_G:94578656:3,22,0,2
chr1	94578662	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,1:12,1:0|1:94578656_GTGGT_G:94578656:2,22,0,2
chr1	94578664	.	AAGAG	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,1:12,1:0|1:94578656_GTGGT_G:94578656:0,22,0,2
chr1	94639337	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,307;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	94667430	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,1:0,0,0,6
chr1	94668046	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	94674295	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=185,136;MMQ=60,38;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,2:15,0:25,0,2,0
chr1	94674296	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=163,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:10,2:13,0:25,0,2,0
chr1	94674306	.	ACC	GTG	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=163,111;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:7,1:11,0:27,0,1,1
chr1	94674311	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=177,111;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:10,2:12,0:25,0,1,1
chr1	94674723	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,2:0,0,7,0
chr1	94674726	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr1	94924046	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=198,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr1	94941376	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,12:0,0,0,26
chr1	94944156	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:31,1:15,2:1,46,0,3
chr1	94964139	.	AT	A,ATT	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,31,32;MFRL=171,162,165;MMQ=60,60,60;MPOS=13,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=10.57,4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,6,5:0.279,0.237:21:6,5,2:4,1,3:10,0,10,1
chr1	94964155	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=18,14;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.354:34:5,4:1,1:16,6,12,0
chr1	94964171	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.132:44:17,0:10,0:26,12,6,0
chr1	94980671	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,9:0,0,18,2
chr1	95286658	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:7,6:9,6:2,14,0,12
chr1	95286675	.	GTCCCAAATGTAAA	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:6,4:6,3:1,11,0,7
chr1	95290003	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=193,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:7,0,4,0
chr1	95294246	.	A	AATCTTTAGACAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	95305440	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=108,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.654:21:5,8:2,6:6,1,12,2
chr1	95330372	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,23:0.691:33:4,11:5,11:6,4,13,10
chr1	95332864	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=115,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.705:25:2,6:5,12:6,1,12,6
chr1	95333068	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	95358096	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:0,7,1,5
chr1	95365129	.	CACA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:0,13,0,2
chr1	95367136	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	95367649	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,2:0,3:3,0,5,0
chr1	95367888	.	T	TCACCACTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:95367888_T_TCACCACTGC:95367888:0,0,0,1
chr1	95367893	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:95367888_T_TCACCACTGC:95367888:0,0,0,1
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chr1	97250520	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
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chr1	97981242	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:3,0,5,0
chr1	98386377	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=14,12;MFRL=195,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.383:8:1,0:1,0:0|1:98386377_A_C:98386377:4,1,3,0
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chr1	98386392	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,19;MFRL=153,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,1:1,0:0|1:98386377_A_C:98386377:6,3,2,0
chr1	98511780	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=157,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:11,3:8,2:0|1:98511780_T_C:98511780:0,20,2,3
chr1	98511783	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:10,2:9,2:0|1:98511780_T_C:98511780:0,19,2,3
chr1	99150635	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=80.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,15:0,0,3,20
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chr1	99358542	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.649:18:3,6:3,6:5,1,9,3
chr1	99358761	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=72,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,4:3,3:0,4,0,7
chr1	99387628	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:0,7,1,1
chr1	99730100	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:3,1,3,0
chr1	100133258	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=121,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,2:0.039:74:25,0:40,1:0|1:100133258_G_A:100133258:31,41,0,2
chr1	100133260	.	G	T	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=120,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,2:0.039:75:25,0:39,2:0|1:100133258_G_A:100133258:32,41,0,2
chr1	100133262	.	TG	CA	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=121,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,2:0.040:72:23,0:41,2:0|1:100133258_G_A:100133258:30,40,0,2
chr1	100152443	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=186.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.982:50:0,24:0,26:0,0,36,14
chr1	100154899	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:3,5:3,6:3,4,6,5
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chr1	100206292	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=146,166;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:6,2:12,2:18,0,4,0
chr1	100206299	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=146,123;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,2:15,0:22,0,2,0
chr1	100206317	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=145,123;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:15,2:21,0:28,12,2,1
chr1	100206324	.	C	CT	.	.	DP=60;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=136,123;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,3:0.059:57:16,3:24,0:0|1:100206324_C_CT:100206324:34,20,2,1
chr1	100206325	.	AGAG	A	.	.	DP=61;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=134,123;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.060:56:19,3:26,0:0|1:100206324_C_CT:100206324:33,20,2,1
chr1	100316765	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr1	100329889	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	100330237	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	100335883	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,13,1
chr1	100340225	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr1	100342227	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr1	100343153	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	100345409	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr1	100346741	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=108.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,20:0,0,11,21
chr1	100353675	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=51,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:1,0,3,7
chr1	100357141	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=93.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,15:0,0,22,7
chr1	100358200	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr1	100366446	.	GTT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.909:6:0,1:0,3:0,0,0,6
chr1	100376448	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=159.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.976:39:0,11:0,27:0|1:100376448_G_A:100376448:0,0,1,38
chr1	100376456	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=145.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,11:0,21:0|1:100376448_G_A:100376448:0,0,0,35
chr1	100381109	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.935:10:0,3:0,4:0,0,0,10
chr1	100381869	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=83.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,24,0
chr1	100480759	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,14;MFRL=162,177;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:100480759_G_T:100480759:3,0,1,0
chr1	100480765	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,15;MFRL=161,170;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:0,0:3,0:0|1:100480759_G_T:100480759:3,0,2,0
chr1	100533960	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr1	100542702	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,31,35;MFRL=141,148,185;MMQ=60,60,60;MPOS=5,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=T;STR;TLOD=5.15,7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,3,4:0.140,0.151:25:10,0,2:6,3,2:17,1,7,0
chr1	100542718	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=20,10;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.376:40:3,0:10,0:16,8,16,0
chr1	100572364	.	CAT	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=140,156;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:8,1:21,1:0|1:100572364_CAT_C:100572364:33,0,2,0
chr1	100572367	.	G	GCA	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=140,156;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.080:35:8,1:25,1:0|1:100572364_CAT_C:100572364:33,0,2,0
chr1	100572385	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=140,158;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.054:53:14,2:37,0:50,1,2,0
chr1	100572613	.	GTAT	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TAT;STR;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.524:23:8,4:3,8:0,11,0,12
chr1	100573293	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,0:12,2:11,16,0,2
chr1	100588105	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,19;MFRL=154,227;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=21,14;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:1,0:0,0:0,2,0,1
chr1	100598866	.	GC	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,16:0,0,14,11
chr1	100617887	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,22,2
chr1	100661991	.	A	AGTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=183,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:0,1:0,3,0,1
chr1	100671866	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:0,2:2,3:0,2,1,6
chr1	100680593	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,0:0,0,0,6
chr1	100715454	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	100732238	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=13,13;MFRL=167,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.539:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr1	100733207	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.889:6:0,2:0,0:0,0,0,6
chr1	100736229	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:19,2:18,1:16,21,3,0
chr1	100750733	.	AGTTTT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=92,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GTTTT;STR;TLOD=64.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.880:18:0,4:0,11:1,1,14,2
chr1	100756884	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:6,0,4,0
chr1	100817438	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	100818464	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr1	100856469	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=183,182;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	101194965	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=181,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,1:0,1,0,4
chr1	101195012	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=205,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:101195012_A_C:101195012:0,2,0,1
chr1	101195014	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=205,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:101195012_A_C:101195012:0,2,0,1
chr1	101199979	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	101203698	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=144.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,30:0,12:0,0,29,14
chr1	101342497	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr1	101372607	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	101377845	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:0,5,1,9
chr1	101456212	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,157;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:3,2:1,7,0,2
chr1	101487373	.	AACACAC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=178,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=AC;STR;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.704:7:2,1:0,2:0,2,0,5
chr1	101706145	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:7,0:5,2:0|1:101706145_A_C:101706145:0,12,2,0
chr1	101706149	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,0:0|1:101706145_A_C:101706145:2,12,2,0
chr1	102269870	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:13,3:17,0:20,10,3,0
chr1	102271774	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,0,11
chr1	102462446	.	GTCAGT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr1	103347416	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	103354939	.	C	CTGTGTGTGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,18;RU=TG;STR;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.815:3:0,1:0,0:0,0,3,0
chr1	103356168	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	103364484	.	AT	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:10,3:19,1:28,3,4,0
chr1	103379870	.	A	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=126,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,29:0.388:75:22,13:21,14:24,22,18,11
chr1	103380379	.	T	TA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=120,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.605:18:4,5:2,6:0,7,1,10
chr1	103380393	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=139,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.237:21:7,3:8,2:1,15,0,5
chr1	103381296	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=175,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.606:31:8,7:4,11:1,11,1,18
chr1	103388990	.	TA	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:10,6:7,9:0,17,0,15
chr1	103400491	.	GA	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr1	103405793	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=79,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,0:0,4:2,0,4,0
chr1	103427381	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=138,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,1:4,1:6,5,2,0
chr1	103427407	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,1:5,2:7,5,1,2
chr1	103428389	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,1,19
chr1	103444497	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,19:0.364:53:18,10:16,9:15,19,9,10
chr1	103455217	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,0,19
chr1	103461508	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=137.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,23:0,17:0,0,19,21
chr1	103463928	.	G	GA	.	.	DP=95;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,5:0.073:69:27,1:27,0:14,50,0,5
chr1	103463976	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=132.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,20:0,16:0,0,0,36
chr1	103467615	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=105.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,10:0,20:0,0,1,29
chr1	103468123	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	103468855	.	TA	T,TAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=144,156,254;MMQ=60,60,60;MPOS=29,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.80,5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,4,4:0.157,0.180:25:8,2,1:8,2,2:1,16,0,8
chr1	103471456	.	CCATCAT	C,CCAT	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,34,33;MFRL=0,134,160;MMQ=60,60,60;MPOS=11,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=CAT;STR;TLOD=5.00,93.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,23:0.086,0.888:25:0,1,9:0,1,11:0,0,5,20
chr1	103471734	.	A	AAAATAAAT,AAAATAAATAAAT,AAAATAAATAAATAAAT	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,31,31,31;MFRL=0,110,155,144;MMQ=60,50,40,40;MPOS=11,15,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=7,9,10,11;RU=AAAT;STR;TLOD=4.69,29.74,41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,8,11:0.083,0.391,0.508:21:0,0,6,7:0,2,1,3:0,0,7,14
chr1	103478069	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:17,0:5,2:1,22,0,2
chr1	103483514	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.600:33:11,10:2,10:0,13,0,20
chr1	103487394	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=194,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,14:0.836:16:2,9:0,5:0|1:103487394_CT_C:103487394:0,2,1,13
chr1	103487406	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=137,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.167:16:9,2:5,0:1|0:103487394_CT_C:103487394:1,13,0,2
chr1	103487408	.	T	TATTTGGGAGGG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=137,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,2:0.167:16:9,2:5,0:1|0:103487394_CT_C:103487394:1,13,0,2
chr1	103496620	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr1	103496805	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,31;MFRL=201,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,1:0,1:0,1,0,3
chr1	103496825	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=140,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:103496825_CA_C:103496825:1,2,0,1
chr1	103496831	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=140,207;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:103496825_CA_C:103496825:1,2,0,1
chr1	103548319	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:0,2:2,2:3,0,4,0
chr1	103573547	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	104094237	.	T	TAAATTAAAAAACCATACTCCCA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAATTAAAAAACCATACTCCCA;STR;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.692:15:2,3:2,2:4,0,11,0
chr1	104116312	.	A	G	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=114.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,41:0.468:88:30,21:16,19:39,8,33,8
chr1	104117921	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,172;MMQ=40,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,33:0.556:60:10,16:13,17:4,23,4,29
chr1	104122193	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=206,194;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:0|1:104122193_C_G:104122193:0,10,0,2
chr1	104122197	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=206,194;MMQ=60,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:104122193_C_G:104122193:0,10,0,2
chr1	104122200	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=205,194;MMQ=60,41;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:5,0:0|1:104122193_C_G:104122193:0,9,0,2
chr1	107691532	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	107867384	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=132,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:10,0:11,2:0|1:107867384_C_T:107867384:9,13,1,1
chr1	107867389	.	C	CTTCCCA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=130,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:0|1:107867384_C_T:107867384:8,14,1,1
chr1	107867390	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=130,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,1:0|1:107867384_C_T:107867384:8,14,1,1
chr1	107961159	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=176,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:1,7:7,1:6,2,7,1
chr1	107961196	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,8:4,5:3,6,6,7
chr1	107961348	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=215,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:107961348_T_C:107961348:0,3,0,1
chr1	107961354	.	C	CAAGCAATTGATGATTCCCAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=215,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:107961348_T_C:107961348:0,3,0,1
chr1	107979445	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:2,19,0,2
chr1	108139003	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:3,5:5,5:0,8,1,9
chr1	108160260	.	GA	G,GAA	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=17,18,17;MFRL=125,151,136;MMQ=60,60,60;MPOS=21,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=40.41,6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,24,5:0.522,0.138:42:1,6,0:3,5,1:4,9,3,26
chr1	108292260	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,1:0,10:0,0,0,11
chr1	108299775	.	ATGTGTG	A,ATGTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,31,30;MFRL=229,191,206;MMQ=60,54,60;MPOS=15,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,16;RU=TG;STR;TLOD=4.83,5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.333,0.406:5:0,2,1:1,0,1:1,0,4,0
chr1	108307642	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=94.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,26,1
chr1	108315305	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	108507209	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=197,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	108507541	.	GGCC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCC;STR;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	108697655	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:23,1:8,1:23,9,1,1
chr1	108697845	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr1	108724518	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=118.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,15:0,17:0,0,29,4
chr1	108724693	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,0,19
chr1	109170710	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,1:12,1:19,0,2,0
chr1	109170746	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,12:0,17:0,0,28,3
chr1	109200108	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:2,9:9,6:5,6,10,5
chr1	109200292	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	109255513	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,13:0,12:0,0,20,5
chr1	109260357	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr1	109289236	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=142,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	109289290	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.343:29:10,4:9,4:16,3,7,3
chr1	109289371	.	GGTGGCAGAGAGGGGGCTAAAGAGCGTCGT	G	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=143,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,2:0.051:57:17,0:14,2:32,23,1,1
chr1	109289487	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.417:24:4,4:9,5:1,13,0,10
chr1	109299453	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.463:39:12,8:9,9:1,20,0,18
chr1	109301250	.	G	C	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=153.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,50:0.537:93:20,17:23,31:1,42,1,49
chr1	109315211	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:11,0,5,0
chr1	109321824	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:3,3:2,4:5,0,5,2
chr1	109325028	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,3:4,4:9,1,7,0
chr1	109325436	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:9,5:3,11:0,12,0,16
chr1	109338764	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.092:32:12,1:16,1:29,0,3,0
chr1	109338772	.	ACTGTAC	A	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=166,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.070:41:14,0:15,2:0|1:109338772_ACTGTAC_A:109338772:39,0,1,1
chr1	109338781	.	A	AT	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=161,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:17,0:18,2:0|1:109338772_ACTGTAC_A:109338772:35,0,1,1
chr1	109338784	.	CAATAATAGATGTTTTTAACTAAAAAATGAATTT	C	.	.	DP=81;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=151,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,2:0.036:81:18,0:19,2:0|1:109338772_ACTGTAC_A:109338772:64,15,1,1
chr1	109339414	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.758:10:1,5:0,2:0,2,0,8
chr1	109350198	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=13,32;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.327:10:0,0:1,2:0,7,0,3
chr1	109358958	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:1,5,0,5
chr1	109363075	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=197,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	109363140	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=170,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,6:1,2:2,0,7,1
chr1	109366370	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:5,3:3,1:0,9,0,4
chr1	109369791	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:0|1:109369791_G_A:109369791:9,2,0,2
chr1	109369797	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:0|1:109369791_G_A:109369791:8,2,2,2
chr1	109373124	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=182,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:109373124_A_C:109373124:4,0,1,0
chr1	109373127	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=182,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:0|1:109373124_A_C:109373124:4,0,1,1
chr1	109373129	.	GCCA	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=182,57;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0|1:109373124_A_C:109373124:4,0,1,1
chr1	109373138	.	GACTCCAATCCACCC	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=181,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:2,0:0|1:109373124_A_C:109373124:5,0,1,1
chr1	109373155	.	GGAA	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=175,57;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0|1:109373124_A_C:109373124:6,0,1,1
chr1	109373160	.	GTA	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=168,57;MMQ=60,60;MPOS=-1073741813;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:109373124_A_C:109373124:7,0,1,1
chr1	109377157	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,2:0,3,0,3
chr1	109377537	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:9,7:10,11:14,5,12,6
chr1	109391486	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,6,10
chr1	109428249	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=115,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.623:22:6,7:2,6:1,7,3,11
chr1	109456850	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=11729,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr1	109465165	.	ACTT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.395:28:10,6:6,5:7,10,5,6
chr1	109466562	.	TTTTTTTG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTTTG;STR;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.523:25:5,7:5,6:10,2,12,1
chr1	109477653	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	109482220	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr1	109482304	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.444:27:8,7:7,4:5,10,4,8
chr1	109482826	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:4,5:0,5:0,4,0,10
chr1	109483975	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,3:0,4:6,1,7,0
chr1	109486016	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,3:2,2:10,0,4,1
chr1	109486196	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=170.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,35:0,16:0,0,33,19
chr1	109486240	.	TA	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=104.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,23:0,13:0,0,12,24
chr1	109493134	.	G	GTTA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TTA;STR;TLOD=44.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.941:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr1	109529322	.	T	TAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=126.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,14:0,0,4,25
chr1	109545046	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	109553439	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=201,246;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr1	109553450	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=246,194;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:3,0,1,0
chr1	109554402	.	A	ATGT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:3,1:0|1:109554402_A_ATGT:109554402:0,3,0,1
chr1	109554403	.	C	CATCTGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:109554402_A_ATGT:109554402:0,3,0,1
chr1	109554405	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:109554402_A_ATGT:109554402:0,3,0,1
chr1	109554408	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:109554402_A_ATGT:109554402:0,3,0,1
chr1	109554411	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:109554402_A_ATGT:109554402:0,3,0,1
chr1	109714488	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,1:8,1:13,7,2,0
chr1	109734157	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	109734541	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	109735504	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=147.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,19:0,23:0,0,12,30
chr1	109737314	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	109741381	.	GC	TT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=197,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.339:4:0,0:3,1:0,3,0,1
chr1	109742452	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	109742485	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	109743622	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	109773427	.	CA	C,CAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32,33;MFRL=165,196,129;MMQ=60,60,60;MPOS=4,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=9.00,4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,3:0.285,0.187:18:6,3,0:4,2,3:10,0,8,0
chr1	109773705	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.535:20:1,3:4,7:0,9,1,10
chr1	109773707	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.373:21:3,0:8,5:1,12,0,8
chr1	109773708	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.420:21:1,3:10,5:0,12,1,8
chr1	109778577	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=133,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr1	109779556	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=75.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,14:0,0,3,20
chr1	109792735	.	A	ACGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CGC;STR;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,0:0,0,6,2
chr1	109806442	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	109808329	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=53,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:2,5,4,1
chr1	109810332	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=219,80;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:109810332_CA_C:109810332:0,2,0,1
chr1	109810336	.	TTTGAGAACGGG	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=211,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:109810332_CA_C:109810332:0,3,0,1
chr1	109810350	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=208,80;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:109810332_CA_C:109810332:0,2,0,1
chr1	109810352	.	C	CAGTGACTGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=208,80;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:109810332_CA_C:109810332:0,2,0,1
chr1	109812406	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,95;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,1:8,1:6,7,0,2
chr1	109813020	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=161,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:4,3:1,1:5,0,4,1
chr1	109813236	.	TTCCCAGTCTTGGGG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:0,6,2,3
chr1	109813276	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=163,98;MMQ=60,60;MPOS=-20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr1	109813510	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:1,0:3,4:4,0,4,1
chr1	109813719	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:1,4,0,3
chr1	109816176	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	109838833	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr1	109839063	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=14,31;MFRL=158,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.503:6:0,0:0,2:0,3,0,3
chr1	109839082	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=162,213;MMQ=48,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr1	109839392	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=118.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,14:0,22:0,0,21,16
chr1	109839575	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,1:15,1:2,19,0,2
chr1	109849424	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,21;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109849424_T_TAC:109849424:1,0,1,0
chr1	109849428	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109849424_T_TAC:109849424:1,0,1,0
chr1	109849431	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,35;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:109849424_T_TAC:109849424:1,0,1,0
chr1	109849434	.	CGG	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:109849424_T_TAC:109849424:1,0,1,0
chr1	109849439	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,12;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:109849424_T_TAC:109849424:1,0,1,0
chr1	109883576	.	C	CAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	109883598	.	C	CTACAAAAAGATTAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=206,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr1	109954610	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:9,2:3,0:4,11,2,0
chr1	109958035	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	110018148	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	110029309	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,2:12,0:0|1:110029309_G_A:110029309:0,16,0,2
chr1	110029310	.	A	AAC	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,2:12,0:0|1:110029309_G_A:110029309:0,17,0,2
chr1	110029312	.	G	GGATT	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,2:12,0:0|1:110029309_G_A:110029309:0,17,0,2
chr1	110029315	.	TCG	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,2:11,0:0|1:110029309_G_A:110029309:0,17,0,2
chr1	110029318	.	T	TCA	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=156,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:2,2:11,0:0|1:110029309_G_A:110029309:0,16,0,2
chr1	110029319	.	AGG	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=156,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:4,2:9,0:0|1:110029309_G_A:110029309:0,16,0,2
chr1	110029672	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.239:27:10,1:9,1:0|1:110029672_A_C:110029672:2,19,6,0
chr1	110029678	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.217:30:9,1:11,2:0|1:110029672_A_C:110029672:3,21,6,0
chr1	110029680	.	C	CGG	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.217:30:12,3:9,2:0|1:110029672_A_C:110029672:4,20,6,0
chr1	110029681	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.205:27:11,3:10,1:0|1:110029672_A_C:110029672:4,18,5,0
chr1	110029683	.	CAG	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=34,13;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.198:28:11,0:10,1:0|1:110029672_A_C:110029672:5,18,5,0
chr1	110050172	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:9,9,1,1
chr1	110129582	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=169,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.261:13:5,2:5,1:0,10,0,3
chr1	110153005	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.517:21:6,7:4,3:9,1,10,1
chr1	110167980	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=116,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.181:26:10,2:6,0:8,14,4,0
chr1	110168865	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=134,55;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:15,2:22,0:0|1:110168865_G_A:110168865:12,25,1,1
chr1	110168870	.	A	AGGCTCCAGCTCCGCATCCC	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=138,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:15,2:19,0:0|1:110168865_G_A:110168865:11,25,1,1
chr1	110168888	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=109.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,7,24
chr1	110169610	.	TG	AC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=216,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:110169610_TG_AC:110169610:1,1,0,1
chr1	110169616	.	G	GGTAATCACTATTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=216,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:110169610_TG_AC:110169610:1,1,0,1
chr1	110169957	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,3,10
chr1	110171705	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,9,5
chr1	110172346	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr1	110172362	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr1	110201580	.	C	T	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=285.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,84:0.989:84:0,51:0,33:0,0,67,17
chr1	110210780	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,17:0,17:0,0,12,24
chr1	110211681	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=163,200;MMQ=25,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:8,1:12,3:3,17,0,4
chr1	110211835	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=126,204;MMQ=52,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:9,2:7,1:12,5,4,0
chr1	110212293	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=241,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,1:0,2:0,3,0,4
chr1	110231815	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	110233056	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	110233138	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,93;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.890:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr1	110300504	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.466:39:8,13:12,5:11,10,14,4
chr1	110300750	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=204,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110300750_C_A:110300750:0,1,0,1
chr1	110300751	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=204,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110300750_C_A:110300750:0,1,0,1
chr1	110300753	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=204,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:110300750_C_A:110300750:0,1,0,1
chr1	110301041	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,10;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.227:13:5,1:5,0:5,5,0,3
chr1	110301766	.	AGT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=181,190;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=GT;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.610:8:0,3:2,2:2,1,3,2
chr1	110456866	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,22:0.521:42:11,7:9,14:14,6,11,11
chr1	110466466	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,5:2,4:4,2,3,6
chr1	110467354	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,0:5,1:9,4,5,0
chr1	110553741	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=149,211;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr1	110560915	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:3,0,5,1
chr1	110582192	.	A	AAAAGATAGGCCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:110582192_A_AAAAGATAGGCCT:110582192:0,4,0,1
chr1	110582194	.	A	ATCCAGCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:110582192_A_AAAAGATAGGCCT:110582192:0,4,0,1
chr1	110587566	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=150,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.068:56:28,1:25,2:18,35,1,2
chr1	110592048	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,1:0,0,2,2
chr1	110735037	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:6,0,6,0
chr1	110738146	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=16,12;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.465:7:0,1:0,0:0|1:110738146_A_C:110738146:4,0,3,0
chr1	110738152	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=16,13;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.465:7:0,1:1,0:0|1:110738146_A_C:110738146:4,0,3,0
chr1	110738164	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,14;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.419:11:1,1:4,1:5,1,5,0
chr1	110740688	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:5,0,5,0
chr1	110765535	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=216,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	110882444	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,15:0,19:0,0,14,20
chr1	110883512	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,189;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:6,11,0,2
chr1	110924211	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=153,164;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:11,3:9,0:20,1,3,0
chr1	110924220	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=153,165;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,2:9,0:22,3,2,0
chr1	110924222	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=29,34;MFRL=153,147;MMQ=60,40;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:16,2:9,0:22,3,3,0
chr1	110924223	.	G	GCA	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=156,142;MMQ=60,50;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:17,2:9,0:24,3,2,0
chr1	110924235	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.458:37:13,10:7,6:18,2,15,2
chr1	110924238	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=157,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:24,2:14,0:34,4,2,0
chr1	110949041	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=132,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,0:5,3:0|1:110949041_G_A:110949041:2,8,0,3
chr1	110949045	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,0:5,3:0|1:110949041_G_A:110949041:2,9,0,3
chr1	110949049	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:6,0:5,3:0|1:110949041_G_A:110949041:2,9,0,3
chr1	111434170	.	CTGGTG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:1,2,0,5
chr1	111436857	.	TC	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	111492807	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	111661413	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=115.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,37:0.522:71:18,20:15,17:25,9,30,7
chr1	111661528	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=86.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,33:0.496:67:18,14:13,18:8,26,10,23
chr1	111667529	.	A	ATC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:111667529_A_ATC:111667529:0,4,0,1
chr1	111667531	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:111667529_A_ATC:111667529:0,4,0,1
chr1	111726026	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:3,0,5,2
chr1	111726213	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,23:0.459:50:12,11:15,11:10,17,6,17
chr1	111770423	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,5,18
chr1	111773568	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr1	111773830	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=128.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,14:0,23:0,0,26,11
chr1	111778241	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr1	111778824	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,2:0,1:0,0,0,5
chr1	111784138	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,2:2,2:0|1:111784138_T_C:111784138:0,4,0,5
chr1	111784148	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:111784138_T_C:111784138:0,0,0,6
chr1	111784158	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0|1:111784138_T_C:111784138:0,2,0,3
chr1	111784816	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:6,1,5,0
chr1	111833441	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:3,0,4,1
chr1	111833488	.	C	CCT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,4:3,1:1,3,4,1
chr1	111833517	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=136,126;MMQ=60,58;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:2,3,2,2
chr1	111853060	.	A	AGCCAATCTAG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.436:23:8,3:5,7:9,4,4,6
chr1	111854207	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	111854223	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:6,2,2,0
chr1	111854741	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=176,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:2,0,4,1
chr1	111854755	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	111857087	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	111861370	.	AA	TT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=232,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr1	111861714	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,22,6
chr1	111889457	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.487:15:5,4:0,3:7,1,5,2
chr1	111890240	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=233,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:111890240_C_T:111890240:1,0,1,0
chr1	111890244	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=233,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:111890240_C_T:111890240:1,0,1,0
chr1	111892905	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:111892905_T_C:111892905:0,0,0,11
chr1	111892909	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0|1:111892905_T_C:111892905:0,4,0,6
chr1	111893788	.	GTTTTT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,15;RU=T;STR;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.696:7:1,1:0,4:1,1,5,0
chr1	111968173	.	G	GTAGGGTGACAAGGGCTCAGCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	111989855	.	T	TCAAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:0|1:111989855_T_TCAAA:111989855:3,5,0,2
chr1	111989856	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:0|1:111989855_T_TCAAA:111989855:3,5,0,2
chr1	111998949	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=220,198;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:111998949_T_A:111998949:0,3,0,2
chr1	111998954	.	G	GGGCCTTGCTCTTGGGGTTAGGCTTTGGCTAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=221,198;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:111998949_T_A:111998949:0,2,0,2
chr1	112020222	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.762:2:0,0:0,1:0|1:112020222_GC_G:112020222:0,0,2,0
chr1	112020233	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.596:3:1,0:0,1:0|1:112020222_GC_G:112020222:1,0,2,0
chr1	112026198	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=199,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr1	112028314	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:2,1:2,1,1,0
chr1	112029325	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr1	112031278	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr1	112032126	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:112032126_T_C:112032126:0,0,2,0
chr1	112032131	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:112032126_T_C:112032126:0,0,1,0
chr1	112032205	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr1	112032347	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:0,5,0,5
chr1	112106444	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	112234084	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.405:40:6,3:18,13:3,21,0,16
chr1	112240038	.	CTT	C,CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=152,145,149;MMQ=60,60,60;MPOS=25,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.11,13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,7:0.208,0.405:18:0,3,3:6,1,4:6,1,11,0
chr1	112270410	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=131,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	112298829	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	112299223	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:9,3:11,0:17,4,3,0
chr1	112302219	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:2,5:4,1:0,7,0,6
chr1	112303260	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,5:4,6:2,5,4,7
chr1	112305228	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=222,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0|1:112305228_A_G:112305228:3,0,3,0
chr1	112305236	.	T	TGATGATGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=173,447;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:112305228_A_G:112305228:4,0,1,0
chr1	112305238	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=173,447;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:112305228_A_G:112305228:4,0,1,0
chr1	112305406	.	TAA	T,TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,23,28;MFRL=158,133,149;MMQ=60,60,60;MPOS=15,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.18,11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,7:0.185,0.362:21:4,3,2:2,1,3:3,7,4,7
chr1	112321032	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=118.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.974:38:0,17:0,16:0,0,28,10
chr1	112524680	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:1,2,7,1
chr1	112997144	.	T	TG	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=108,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.072:61:29,0:27,4:21,36,1,3
chr1	113052053	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	113098714	.	C	CAGAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=202,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:113098714_C_CAGAA:113098714:0,2,0,1
chr1	113098715	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=202,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:113098714_C_CAGAA:113098714:0,2,0,1
chr1	113159371	.	GA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.145:37:13,2:17,3:31,1,5,0
chr1	113196197	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,5:0,0,12,1
chr1	113196326	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:7,1:12,2:4,15,0,3
chr1	113202417	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,11:0,0,2,14
chr1	113231994	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.807:3:0,0:0,0:0|1:113231994_A_C:113231994:0,0,3,0
chr1	113231999	.	T	TGCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.796:3:0,1:0,0:0|1:113231994_A_C:113231994:0,0,3,0
chr1	113232003	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=136,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:113231994_A_C:113231994:0,1,2,0
chr1	113232007	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=136,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:0|1:113231994_A_C:113231994:0,1,2,0
chr1	113232805	.	A	AAGTAGCCCACAAAGCTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	113234456	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,5:0,11:0,0,4,12
chr1	113239478	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,1,12
chr1	113242488	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,10:0,0,13,10
chr1	113244084	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=124,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:18,1:25,2:23,21,0,3
chr1	113244433	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,1,12
chr1	113246229	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=275,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.855:12:1,4:0,4:1,0,11,0
chr1	113254484	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr1	113255718	.	GTTA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=167,185;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:113255718_GTTA_G:113255718:0,1,0,1
chr1	113255724	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,28;MFRL=167,185;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113255718_GTTA_G:113255718:0,1,0,1
chr1	113255726	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=167,185;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113255718_GTTA_G:113255718:0,1,0,1
chr1	113255729	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=167,185;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113255718_GTTA_G:113255718:0,1,0,1
chr1	113456452	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,60;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:11,0:3,2:14,0,2,0
chr1	113456546	.	A	T	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=231.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,75:0.987:75:0,49:0,24:0,0,48,27
chr1	113460676	.	CAATA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,142;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AATA;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.718:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	113636251	.	G	GTGTGTTGTGTATGTGTGTTGTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=164,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr1	113636263	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113636263_C_G:113636263:0,0,0,1
chr1	113636266	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113636263_C_G:113636263:0,0,0,1
chr1	113636924	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,3:0,14:0,0,15,3
chr1	113637047	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=137,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:23,3:23,0:19,28,2,1
chr1	113658887	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,18:0,8:0,0,17,10
chr1	113659065	.	ACT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=156.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,20:0,18:0,0,19,20
chr1	114092111	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.174:26:15,2:6,3:20,1,5,0
chr1	114133022	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	114137013	.	C	CAT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=79.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,18,0
chr1	114162393	.	T	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.055:55:17,0:33,3:35,17,2,1
chr1	114196364	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	114224782	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:7,2:0,2:7,0,4,0
chr1	114226705	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr1	114240319	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=85.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,15:0,0,12,15
chr1	114242250	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr1	114247480	.	AT	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=195,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114247480_AT_CC:114247480:0,3,0,1
chr1	114247486	.	A	AACTGTTTTGCTGTATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=195,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114247480_AT_CC:114247480:0,3,0,1
chr1	114249382	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=107.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,19:0,11:0,0,1,29
chr1	114267347	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr1	114280717	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,9,1
chr1	114309172	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	114339956	.	C	CTAAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=151.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,17:0,14:0,0,26,9
chr1	114372332	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:0,4:1,3:0,1,0,7
chr1	114377093	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,11:0,0,3,14
chr1	114401231	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,5,11
chr1	114401265	.	CT	C,CTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,19,28;MFRL=163,183,183;MMQ=51,54,60;MPOS=9,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.37,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.334,0.332:6:1,0,1:1,0,1:0,2,0,4
chr1	114401545	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=166,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:16,0,3,0
chr1	114401552	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=164,111;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:8,2:10,0:0|1:114401552_A_T:114401552:19,0,2,0
chr1	114401554	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=164,111;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,2:11,0:0|1:114401552_A_T:114401552:19,0,2,0
chr1	114401904	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,5:0,10:0,0,13,2
chr1	114441512	.	A	ATTTTAATTTTGATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	114449874	.	C	CAGACAAAGATGACAGAAAATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=87,291;MMQ=55,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr1	114483366	.	TGTGGATTGAAACGAAAAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,2:6,0:8,2,1,1
chr1	114510633	.	T	TGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114510633_T_TGA:114510633:0,1,0,1
chr1	114510634	.	T	TAGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:114510633_T_TGA:114510633:0,1,0,1
chr1	114522052	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,19;MFRL=114,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.407:5:0,0:2,1:3,0,2,0
chr1	114522285	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr1	114523149	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:28,1:19,2:30,17,0,3
chr1	114641685	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr1	114680709	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=133,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:114680709_G_GT:114680709:0,2,0,1
chr1	114680710	.	G	GACTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=133,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:114680709_G_GT:114680709:0,2,0,1
chr1	114940246	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:10,0:6,2:16,6,6,0
chr1	114940264	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=129,142;MMQ=60,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:23,0:18,1:0|1:114940264_G_T:114940264:30,17,2,0
chr1	114940266	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=32,17;MFRL=129,142;MMQ=60,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:19,0:15,1:0|1:114940264_G_T:114940264:30,17,2,0
chr1	114940547	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:16,3:6,0:11,11,3,0
chr1	114940632	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr1	114947935	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	115112597	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,19:0.392:49:17,11:13,8:21,9,14,5
chr1	115128087	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,9:0,0,15,0
chr1	115130648	.	A	AGGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	115144703	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,11,3
chr1	115144794	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:4,2:10,0:7,7,2,1
chr1	115166347	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:115166347_T_A:115166347:0,4,0,1
chr1	115166348	.	TGA	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:115166347_T_A:115166347:0,4,0,1
chr1	115166350	.	ATTGT	A,TTTGT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,32,32;MFRL=0,180,149;MMQ=60,60,60;MPOS=13,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.75,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,1:0.579,0.284:4:0,0,0:0,3,1:0,0,0,4
chr1	115166353	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:115166347_T_A:115166347:0,1,0,1
chr1	115166357	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:115166347_T_A:115166347:0,4,0,1
chr1	115166360	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr1	115223156	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:3,1:0,3:0,3,0,5
chr1	115238016	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.704:10:2,4:0,3:2,1,7,0
chr1	115252447	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=174,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.429:7:1,2:3,0:0|1:115252447_A_T:115252447:0,4,0,3
chr1	115252450	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:2,0:0|1:115252447_A_T:115252447:0,4,0,2
chr1	115256669	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	115277207	.	T	TCTAGGTGACAAAG	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.082:33:16,2:14,0:1,30,0,2
chr1	115279344	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:19,2:21,0:41,0,2,0
chr1	115279361	.	T	TA	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,18:0.395:47:13,10:15,7:26,3,18,0
chr1	115280193	.	CA	C,CAA	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=34,35,31;MFRL=165,159,165;MMQ=60,60,60;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=14.84,11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:37,13,10:0.205,0.161:60:13,2,4:17,9,3:4,33,3,20
chr1	115317023	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,0:7,2:5,16,0,2
chr1	115398044	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=33.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr1	115399884	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,2:8,3:7,4,5,0
chr1	115401136	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=276.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,80:0.988:80:0,43:0,34:0,0,70,10
chr1	115417093	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:3,8:5,6:6,2,12,3
chr1	115438047	.	A	AT	.	.	DP=125;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,9:0.100:98:37,8:49,1:45,44,7,2
chr1	115469133	.	G	GA	.	.	DP=225;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=134,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:179,9:0.037:188:97,4:74,4:126,53,7,2
chr1	115487404	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=219,162;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr1	115527284	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:10,8:10,9:19,1,18,0
chr1	115600081	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:5,1:0,3:4,2,4,0
chr1	115600137	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:10,8:6,2:12,4,8,2
chr1	115601528	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:11,6:11,8:13,9,5,10
chr1	115601615	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,4,12
chr1	115604681	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=185,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.517:21:4,8:6,2:10,0,11,0
chr1	115604798	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=139,83;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,29:0.408:71:28,12:14,14:20,22,12,17
chr1	115631924	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	115631933	.	G	GGCCCCC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=23,19;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.453:7:2,0:2,1:0|1:115631933_G_GGCCCCC:115631933:3,1,3,0
chr1	115631937	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=21,34;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.384:6:1,2:0,0:0|1:115631933_G_GGCCCCC:115631933:3,1,2,0
chr1	115631940	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,11;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:0,0:0|1:115631933_G_GGCCCCC:115631933:1,1,2,0
chr1	115631943	.	CGG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=163,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.290:5:1,1:1,0:0|1:115631933_G_GGCCCCC:115631933:1,3,1,0
chr1	116225180	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,3:0,5,1,4
chr1	116228220	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,223;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr1	116268231	.	T	TAAGCTATATACATACTAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	116283343	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	116283526	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	116382511	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,6,7
chr1	116383361	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,14;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,0:3,0:1,3,0,3
chr1	116386542	.	CGTGTGT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=10,30;MFRL=102,194;MMQ=40,52;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=24,21;RU=GT;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.544:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr1	116577981	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,0,16
chr1	116609126	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr1	116915991	.	C	CCGGG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:116915991_C_CCGGG:116915991:0,0,1,0
chr1	116915992	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:116915991_C_CCGGG:116915991:0,0,1,0
chr1	116915996	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=265,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:116915991_C_CCGGG:116915991:1,0,1,0
chr1	116916000	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=189,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:116915991_C_CCGGG:116915991:2,0,1,0
chr1	116916004	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=189,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:116915991_C_CCGGG:116915991:2,0,1,0
chr1	116932096	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:11,4,1,1
chr1	116933076	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:11,1:18,1:7,24,0,2
chr1	116940562	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=143,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,1:14,1:13,10,1,1
chr1	117122288	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,2:2,1:1,6,1,2
chr1	117142531	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,215;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	117142700	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,233;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:6,15,2,0
chr1	117142736	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=157,199;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,1:12,1:7,19,2,0
chr1	117142855	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=165,186;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,1:6,2:7,7,1,2
chr1	117142868	.	CA	TG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=159,186;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:9,1:4,2:7,6,2,1
chr1	117142977	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,156;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,2:4,1:0,10,0,3
chr1	117146592	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=207,188;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:2,7,0,2
chr1	117146629	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=181,188;MMQ=40,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr1	117150928	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=163,167;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:9,2:5,1:0|1:117150928_C_T:117150928:3,11,1,2
chr1	117150933	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=163,167;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:9,1:5,1:0|1:117150928_C_T:117150928:3,11,1,2
chr1	117156459	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,150;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,21:0.287:75:29,11:22,10:30,24,10,11
chr1	117156490	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=149,156;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,11:0.179:65:29,6:25,5:26,28,3,8
chr1	117156584	.	TG	CA	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=159,148;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,8:0.157:55:24,4:22,3:21,26,0,8
chr1	117156600	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=163,167;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.114:55:24,3:25,2:23,26,0,6
chr1	117158690	.	G	C	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=139,97;MMQ=46,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,9:0.104:92:33,6:48,3:53,30,3,6
chr1	117158972	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,105;MMQ=25,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.121:47:20,2:21,3:17,25,2,3
chr1	117248731	.	A	ATGTGT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=159,162;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:4,0:0|1:117248731_A_ATGTGT:117248731:0,12,0,2
chr1	117248735	.	GTTGTA	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=159,162;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,2:3,0:0|1:117248731_A_ATGTGT:117248731:0,12,0,2
chr1	117487270	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:4,3:3,1:6,1,3,2
chr1	117504259	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=132,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.149:45:15,0:24,6:17,22,0,6
chr1	117509981	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0|1:117509981_G_A:117509981:1,4,0,4
chr1	117509987	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,1:3,2:0|1:117509981_G_A:117509981:1,4,0,4
chr1	117527645	.	GTCT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=149,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCT;STR;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:3,1:1,4:0,4,1,4
chr1	117529642	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:117529642_G_GT:117529642:0,4,0,1
chr1	117529643	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=163,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:117529642_G_GT:117529642:0,4,0,1
chr1	117554410	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:17,2:12,0:22,8,1,1
chr1	117602960	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=158.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,20:0,26:0,0,25,23
chr1	117605110	.	G	T	.	.	DP=99;ECNT=4;MBQ=32,14;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,6:0.050:93:33,0:35,0:30,57,0,6
chr1	117605121	.	G	T	.	.	DP=74;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,4:0.050:70:24,0:14,0:18,48,0,4
chr1	117605129	.	G	T	.	.	DP=71;ECNT=4;MBQ=30,16;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,6:0.096:66:19,1:21,0:12,48,0,6
chr1	117605130	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=70;ECNT=4;MBQ=22,28,18;MFRL=152,168,180;MMQ=60,60,50;MPOS=24,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,16;RU=T;STR;TLOD=13.21,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,10,2:0.228,0.043:43:10,6,1:14,3,0:2,29,0,12
chr1	117618722	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	117619204	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:11,1,2,0
chr1	117631391	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,8:0,0,9,3
chr1	117634639	.	C	CATCATCTTTGATTCGGGGTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=185,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.388:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr1	117660608	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,15:0,0,16,6
chr1	117663316	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:15,0,0,2
chr1	117690272	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr1	117753455	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:1,5:3,2:2,2,7,1
chr1	117957288	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,16,0
chr1	117984776	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	118065888	.	G	GAAAA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=139,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.170:15:6,2:7,0:0|1:118065888_G_GAAAA:118065888:6,7,1,1
chr1	118065889	.	G	GAAAGACAGGCAACCA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=139,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.170:15:6,2:6,0:0|1:118065888_G_GAAAA:118065888:6,7,1,1
chr1	118166750	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.949:18:0,8:0,7:0,0,3,15
chr1	118166792	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.350:4:2,0:1,1:0|1:118166792_T_G:118166792:0,3,0,1
chr1	118166797	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.350:4:2,0:1,1:0|1:118166792_T_G:118166792:0,3,0,1
chr1	118166800	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:118166792_T_G:118166792:0,2,0,1
chr1	118166805	.	T	TAAGACTGAGGA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:118166792_T_G:118166792:0,2,0,1
chr1	118167727	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:7,1:6,2:6,8,2,1
chr1	118170466	.	CTG	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=122,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TG;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:4,0:5,3:3,6,1,2
chr1	118170496	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=173,65;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:11,2:0|1:118170496_G_A:118170496:4,9,1,1
chr1	118170500	.	A	AACTCATAGAGTTGAACTTTCCTTTAGAAG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=173,65;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,0:11,2:0|1:118170496_G_A:118170496:4,9,1,1
chr1	118477385	.	T	TCAATAAATCCAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118477385_T_TCAATAAATCCAA:118477385:0,1,0,1
chr1	118477386	.	G	GAGCAGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118477385_T_TCAATAAATCCAA:118477385:0,1,0,1
chr1	118486303	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=34,34;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:118486303_T_C:118486303:0,4,0,1
chr1	118486307	.	TG	T,TTTTTTCGAGACAG	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,32,33;MFRL=178,115,165;MMQ=60,60,60;MPOS=15,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,1,1:1,0,0:0,2,0,2
chr1	118486309	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,26;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	118486310	.	TAC	T	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=171,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:118486310_TAC_T:118486310:0,4,0,1
chr1	118486311	.	A	AGTTTCAT	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=26,29;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,0:0,1:0|1:118486303_T_C:118486303:0,2,0,1
chr1	118486314	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=176,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:118486310_TAC_T:118486310:0,3,0,1
chr1	118486316	.	TAAGGG	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=170,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:118486310_TAC_T:118486310:0,2,0,1
chr1	118486324	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=34,30;MFRL=176,115;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118486310_TAC_T:118486310:0,1,0,1
chr1	118486328	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=176,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:118486310_TAC_T:118486310:0,1,0,1
chr1	118495199	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,478;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:13,0,2,0
chr1	118514736	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=202,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118514736_G_A:118514736:0,1,0,1
chr1	118514737	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=202,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118514736_G_A:118514736:0,1,0,1
chr1	118514741	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=202,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:118514736_G_A:118514736:0,1,0,1
chr1	118526592	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	118565949	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=116,55;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:118565949_A_T:118565949:10,8,1,1
chr1	118565956	.	ATC	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=116,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:6,1:0|1:118565949_A_T:118565949:10,8,1,1
chr1	118565965	.	GA	TT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=131,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:0|1:118565949_A_T:118565949:5,7,1,1
chr1	118579360	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,255;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:16,2:15,0:23,10,2,0
chr1	118623681	.	T	TAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=AC;STR;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.760:6:1,2:0,1:1,0,4,1
chr1	118628604	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=144,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:8,0:13,3:10,13,0,3
chr1	119466275	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,1,14
chr1	119530133	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=295,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	119923724	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,8:4,4:7,1,9,3
chr1	119927680	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	120254545	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=216,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:2,0:4,0,2,0
chr1	120277194	.	TTAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=183,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TAA;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr1	120284290	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	120293352	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:7,1,8,0
chr1	120293367	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,14,7
chr1	120293568	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:1,7,0,4
chr1	120296033	.	AAC	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=AC;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.784:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr1	120296049	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:4,0:2,7,0,3
chr1	120302419	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,4:3,2:2,1,5,1
chr1	120307010	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,1:7,1:11,6,1,1
chr1	120378678	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,6,9
chr1	120380008	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=137.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,21:0,22:0,0,5,38
chr1	120384068	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=127,203;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:25,0:23,2:0|1:120384068_C_T:120384068:23,25,1,1
chr1	120384072	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=129,203;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.052:55:22,0:26,2:0|1:120384068_C_T:120384068:27,26,1,1
chr1	120439114	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	120458662	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=180,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:3,0:1,1:2,3,1,1
chr1	120465193	.	G	GGAAGAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	120468028	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,106;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:15,0:17,4:17,17,4,0
chr1	120478285	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	120480394	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr1	120508009	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.184:36:13,0:16,6:30,0,6,0
chr1	120512104	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	120512346	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=139,124;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:9,2:7,17,0,2
chr1	120927081	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=252,148;MMQ=25,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.892:25:1,12:1,11:2,0,23,0
chr1	144013853	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=124,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.470:34:6,7:12,8:13,5,13,3
chr1	144013865	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=116,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.461:37:7,9:13,8:12,8,12,5
chr1	144620151	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,176;MMQ=23,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:14,2:16,2:4,26,1,3
chr1	144825577	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	144825603	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=204,167;MMQ=25,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:144825603_C_A:144825603:0,1,0,1
chr1	144825611	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:144825603_C_A:144825603:0,0,0,1
chr1	144828454	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	144828845	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=280,188;MMQ=24,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	144852249	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	144852321	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=138,152;MMQ=49,32;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr1	144852545	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=180,170;MMQ=48,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr1	144854047	.	CCC	TGG	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=176,142;MMQ=60,32;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,1:9,1:15,2,2,0
chr1	144854052	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=166,186;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,6:7,3:9,2,9,0
chr1	144854083	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.341:45:16,13:12,2:28,2,15,0
chr1	144854087	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=164,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,13:0.269:50:20,8:11,5:0|1:144854087_A_G:144854087:35,2,12,1
chr1	144854095	.	G	T	.	.	DP=57;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=162,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,16:0.298:55:22,11:16,5:0|1:144854087_A_G:144854087:37,2,14,2
chr1	144854245	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,156;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,16:0.309:53:20,10:17,5:1,36,0,16
chr1	144854277	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:3,9:4,7:0,7,0,16
chr1	144854454	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=188,149;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:5,2:4,2:9,1,3,1
chr1	144854491	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=158,185;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:7,2:8,1:0|1:144854491_T_G:144854491:12,3,3,0
chr1	144854497	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=158,142;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.303:21:7,3:8,3:0|1:144854491_T_G:144854491:11,4,4,2
chr1	144854528	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=145,163;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,9:0.213:45:22,3:12,6:0|1:144854528_A_G:144854528:27,9,7,2
chr1	144854537	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=145,174;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,10:0.204:52:26,4:15,6:0|1:144854528_A_G:144854528:30,12,7,3
chr1	144854581	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=139,140;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,10:0.172:60:29,6:18,3:25,25,9,1
chr1	144854594	.	G	T	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=138,127;MMQ=60,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,14:0.230:63:29,10:19,3:15,34,9,5
chr1	144854597	.	TC	CT,CC	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=31,34,32;MFRL=141,127,119;MMQ=60,60,40;MPOS=19,14;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=71.43,42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,20,13:0.340,0.222:59:16,10,11:9,10,2:7,19,14,19
chr1	144854730	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,149;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:1,9,0,3
chr1	144857068	.	A	T	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,134;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=110.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,42:0.429:98:24,21:32,20:2,54,5,37
chr1	144859720	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=119.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,18:0,15:0,0,31,2
chr1	144860026	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:7,7:3,9:3,7,2,14
chr1	144863505	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=195,193;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:0|1:144863505_A_G:144863505:1,4,0,6
chr1	144863528	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=218,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:144863505_A_G:144863505:1,3,0,1
chr1	144863535	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=218,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:144863505_A_G:144863505:1,3,0,1
chr1	144866509	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:3,3:1,1:3,1,5,0
chr1	144868170	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=148,125;MMQ=60,43;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:10,7:11,8:4,17,6,9
chr1	144868204	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.421:29:10,3:6,9:1,16,1,11
chr1	144868239	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,4:3,6:1,7,1,9
chr1	144871782	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=132,155;MMQ=60,51;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.442:41:12,7:11,11:17,6,14,4
chr1	144871889	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.444:41:10,10:12,8:5,18,8,10
chr1	144871910	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.151:24:10,1:11,2:0|1:144871910_G_A:144871910:2,19,1,2
chr1	144871913	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.151:24:8,0:11,2:0|1:144871910_G_A:144871910:2,19,1,2
chr1	144873794	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=152,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:6,1,7,0
chr1	144873818	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:7,10:7,5:11,3,14,1
chr1	144873840	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,23:0.545:42:9,14:10,9:16,3,19,4
chr1	144873962	.	CT	C	.	.	DP=86;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=118.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,39:0.473:83:16,21:27,18:16,28,10,29
chr1	144874038	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=134,153;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:6,5:9,10:2,13,3,12
chr1	144874070	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=176,177;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,3:3,4:1,9,0,7
chr1	144874088	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:5,2:3,3:0,8,1,6
chr1	144874641	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:12,5:5,7:13,4,9,3
chr1	144877366	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=201,182;MMQ=40,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,2:3,8:1,4,1,9
chr1	144879054	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=125,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,12:0.183:69:30,3:27,9:27,30,5,7
chr1	144879264	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,34:0.547:62:15,18:12,15:21,7,21,13
chr1	144879375	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,132;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,26:0.489:53:12,13:15,12:8,19,6,20
chr1	144881389	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.407:42:14,8:10,8:24,1,13,4
chr1	144881711	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=218,178;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr1	144882912	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:5,6:4,3:2,7,0,10
chr1	144886063	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,8:4,2:4,2,9,1
chr1	144886092	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=144,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,7:6,5:5,4,8,5
chr1	144886409	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:0,5,0,4
chr1	144892089	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=210,220;MMQ=46,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr1	144892149	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.503:32:11,6:4,10:15,1,15,1
chr1	144906120	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,135;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,3:0.048:80:36,2:39,1:31,46,1,2
chr1	144915624	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,185;MMQ=52,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,4:6,1:2,11,0,5
chr1	144916486	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:10,2:2,1:0|1:144916486_T_G:144916486:12,0,3,0
chr1	144916493	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:10,2:2,1:0|1:144916486_T_G:144916486:13,0,3,0
chr1	144917827	.	CA	C	.	.	DP=179;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=157,150;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=241.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,83:0.506:164:34,38:44,43:51,30,56,27
chr1	144917841	.	T	C	.	.	DP=199;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=157,148;MMQ=43,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=242.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,93:0.492:189:40,43:55,49:59,37,59,34
chr1	144919008	.	AC	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.488:35:10,7:7,10:4,14,1,16
chr1	144922109	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=92,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,4:6,2:0,6,1,5
chr1	144922171	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:2,2,2,4
chr1	144923823	.	TAGGAAGAAACGGCA	T	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGAAGAAACGGCA;STR;TLOD=255.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.986:58:0,25:0,26:0,0,12,46
chr1	144923887	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.235:41:10,4:20,5:2,30,1,8
chr1	144930571	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.410:53:15,10:16,9:22,9,16,6
chr1	144930596	.	C	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,25:0.449:56:17,17:13,8:18,13,12,13
chr1	144931727	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.684:10:2,4:0,3:0,3,0,7
chr1	144946768	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,2:1,6:1,6,0,8
chr1	145016020	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=228.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,62:0.985:62:0,30:0,30:0|1:145016020_T_G:145016020:0,0,12,50
chr1	145016032	.	C	CA	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,12:0.311:40:15,6:13,6:0|1:145016020_T_G:145016020:6,22,0,12
chr1	145016034	.	A	AC	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=135,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.086:44:20,1:21,2:0|1:145016020_T_G:145016020:5,36,0,3
chr1	145021024	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:13,1:16,4:29,0,5,0
chr1	145074882	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,3:9,1:17,0,4,0
chr1	145074919	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.167:40:16,2:17,4:27,7,6,0
chr1	145074939	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=77.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,29:0.463:63:11,20:22,9:24,10,22,7
chr1	145075923	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	145103844	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,18:0.365:50:16,8:15,10:30,2,17,1
chr1	145103896	.	G	T	.	.	DP=81;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,14:0.181:80:30,7:35,7:42,24,11,3
chr1	145103928	.	G	A	.	.	DP=108;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,35:0.339:104:38,18:31,17:30,39,16,19
chr1	145104052	.	AGT	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,4:5,5:0,14,0,9
chr1	145104075	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,2:9,1:0,16,0,3
chr1	145109456	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,1:11,1:18,1,2,0
chr1	145109468	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=90.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,24,0
chr1	145109493	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.296:35:15,6:10,4:23,2,10,0
chr1	145112284	.	CCG	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=171,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:5,1:4,2:0|1:145112284_CCG_C:145112284:11,1,3,0
chr1	145112288	.	G	GCA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=171,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:7,1:5,2:0|1:145112284_CCG_C:145112284:11,1,3,0
chr1	145112313	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=149,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,3:10,1:13,6,2,2
chr1	145115658	.	TATTTTTAA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:2,1:6,1,2,0
chr1	145248811	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=211,221;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,1:4,2:0,11,0,3
chr1	145273473	.	T	C	.	.	DP=182;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,141;MMQ=51,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=97.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:137,41:0.233:178:77,17:59,24:28,109,3,38
chr1	145273520	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=172,184;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,8:0.144:60:25,3:27,5:1,51,0,8
chr1	145281361	.	TC	T	.	.	DP=149;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,138;MMQ=27,33;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=80.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,36:0.269:135:54,19:39,17:65,34,26,10
chr1	145281780	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,175;MMQ=57,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,12:0.283:44:8,3:23,9:6,26,1,11
chr1	145281794	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,157;MMQ=57,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.108:53:15,2:33,3:12,36,1,4
chr1	145282093	.	G	A	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,175;MMQ=57,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,9:0.108:90:32,4:48,5:5,76,0,9
chr1	145290317	.	C	T	.	.	DP=101;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,15:0.159:97:37,10:38,5:77,5,12,3
chr1	145290320	.	C	T	.	.	DP=101;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,25:0.268:95:37,13:33,11:67,3,20,5
chr1	145290346	.	A	G	.	.	DP=152;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=157,160;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=210.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,66:0.472:140:40,33:33,30:59,15,52,14
chr1	145290351	.	A	G	.	.	DP=175;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=157,158;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:144,16:0.105:160:68,8:66,8:115,29,10,6
chr1	145290377	.	T	C	.	.	DP=240;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=147,169;MMQ=52,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=144.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:184,52:0.221:236:96,28:84,20:127,57,31,21
chr1	145290398	.	G	A	.	.	DP=276;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=149,133;MMQ=52,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=121.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:212,53:0.202:265:109,31:102,22:132,80,31,22
chr1	145290401	.	T	G	.	.	DP=276;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=146,164;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:246,26:0.098:272:128,11:113,14:147,99,15,11
chr1	145290409	.	G	A	.	.	DP=301;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=144,166;MMQ=52,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:260,26:0.093:286:130,11:113,14:158,102,15,11
chr1	145290498	.	T	G	.	.	DP=235;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=149,131;MMQ=52,49;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:181,39:0.179:220:102,25:75,14:53,128,12,27
chr1	145290535	.	C	T	.	.	DP=121;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=149,146;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,15:0.136:115:49,9:51,6:16,84,4,11
chr1	145290547	.	C	A	.	.	DP=95;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=151,162;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,12:0.144:88:33,8:42,4:4,72,2,10
chr1	145290553	.	C	T	.	.	DP=82;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,17:0.227:77:22,9:35,8:3,57,0,17
chr1	145290560	.	T	C	.	.	DP=76;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=156,180;MMQ=60,26;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,4:0.070:68:23,1:38,3:2,62,0,4
chr1	145290570	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,14:0.246:59:13,8:31,6:1,44,1,13
chr1	145298070	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=156,143;MMQ=36,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,1:6,2:15,2,2,1
chr1	145298089	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=156,207;MMQ=36,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,4:6,0:11,4,3,1
chr1	145298095	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=170,128;MMQ=25,36;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:5,6:3,2:6,2,7,2
chr1	145415561	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.508:10:4,5:1,0:0|1:145415561_C_CG:145415561:5,0,5,0
chr1	145415562	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=20,17;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.508:10:4,2:1,0:0|1:145415561_C_CG:145415561:5,0,5,0
chr1	145415568	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=11,35;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.465:11:0,4:0,0:0|1:145415561_C_CG:145415561:6,0,5,0
chr1	145415581	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,33;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.365:9:2,2:1,0:0|1:145415561_C_CG:145415561:6,0,3,0
chr1	145456732	.	GAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=26,30,19,17;MFRL=180,174,178,185;MMQ=60,60,60,60;MPOS=10,16,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.42,3.88,5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,3,3,5:0.138,0.142,0.242:21:1,1,0,1:4,2,1,0:0,10,0,11
chr1	145457039	.	CTCT	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCT;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.098:38:21,3:13,0:10,25,2,1
chr1	145475728	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	145507826	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.439:33:9,3:9,7:0,18,0,15
chr1	145510376	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	145522995	.	ATTCGAATTCT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr1	145528444	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,1:4,12,0,2
chr1	145532994	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.669:7:1,1:0,3:0|1:145532994_GT_G:145532994:2,0,4,1
chr1	145533001	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0|1:145532994_GT_G:145532994:2,0,4,1
chr1	145533314	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,0:0,3:1,3,2,1
chr1	145535921	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:1,6:7,3:3,5,4,5
chr1	145538664	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=185,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	145539527	.	G	GCATTTGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:145539527_G_GCATTTGT:145539527:1,3,0,1
chr1	145539528	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=178,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:145539527_G_GCATTTGT:145539527:1,3,0,1
chr1	145539530	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=178,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1|0:145539527_G_GCATTTGT:145539527:1,3,0,1
chr1	145539532	.	GA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=178,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:145539527_G_GCATTTGT:145539527:1,2,0,1
chr1	145555823	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,1:8,1:5,15,0,2
chr1	145558565	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,2,17
chr1	145561594	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:6,5:9,4:7,9,4,5
chr1	145562087	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.445:34:8,9:11,6:11,8,13,2
chr1	145585317	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,2:0,16:0,0,14,4
chr1	145586780	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:7,4:9,6:4,12,8,2
chr1	145587631	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:145587631_G_C:145587631:0,0,3,0
chr1	145587634	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=305,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0|1:145587631_G_C:145587631:1,0,3,0
chr1	145587640	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0|1:145587631_G_C:145587631:2,0,3,0
chr1	145587643	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,21;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.310:7:0,1:3,0:0|1:145587631_G_C:145587631:5,0,2,0
chr1	145587647	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.353:6:2,0:2,0:0|1:145587631_G_C:145587631:4,0,2,0
chr1	145588536	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.359:26:7,5:8,4:11,6,6,3
chr1	145588654	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.583:34:6,13:8,7:7,7,10,10
chr1	145589491	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	145594220	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:1,3:5,4:1,6,1,6
chr1	145594825	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	145597116	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	145597417	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:3,3:3,3:6,0,7,0
chr1	145598459	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr1	145601861	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,5,11
chr1	145682204	.	AT	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=202,161;MMQ=56,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	145696694	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,6:2,2:0,4,0,8
chr1	145696721	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=161,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:3,1:2,1:0,6,0,2
chr1	145704373	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	145826770	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	146466146	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,128;MMQ=24,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	146656292	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,0,19
chr1	146673178	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	146685089	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=112,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr1	146685121	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	146687250	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	146714281	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	146728149	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.454:29:10,6:5,7:11,5,12,1
chr1	146728162	.	T	TA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=111.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,16:0,17:0,0,24,10
chr1	146739068	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,8:7,4:10,0,11,1
chr1	146739277	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=55.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr1	146740576	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,7:0,17:0,0,4,21
chr1	146747153	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr1	146747232	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	146756222	.	AAAAC	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAC;STR;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.545:22:5,9:3,3:0,10,0,12
chr1	146758257	.	C	CATAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=221,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	146763089	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=73.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,15:0,5:0,0,14,6
chr1	146766069	.	C	CAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,13,1
chr1	147087721	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	147090765	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=144,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:17,3:5,0:10,12,1,2
chr1	147096505	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=183,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,3:6,4:2,6,4,3
chr1	147096794	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=186,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,2:1,1:0,4,0,3
chr1	147096828	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	147096858	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=198,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	147121977	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,8:0,0,12,5
chr1	147131465	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=140.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,20:0,19:0,0,32,9
chr1	147131501	.	A	T	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=74.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,27:0.400:68:18,15:23,12:25,16,16,11
chr1	147131710	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr1	147131945	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr1	147230217	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	147381444	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr1	148009510	.	G	A	.	.	DP=111;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,18:0.177:103:40,7:43,10:29,56,5,13
chr1	148009521	.	A	G	.	.	DP=108;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=149,144;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,16:0.163:102:39,7:45,9:24,62,6,10
chr1	148251814	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=215,223;MMQ=24,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,1:3,3:7,1,4,0
chr1	148252111	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=149,141;MMQ=40,28;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,11:0.173:67:19,8:35,3:25,31,6,5
chr1	148252162	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=145,150;MMQ=47,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.455:42:9,5:12,14:5,18,2,17
chr1	148252164	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=146,150;MMQ=48,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:11,5:22,1:5,29,1,5
chr1	148342066	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,136;MMQ=44,20;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:8,4:10,1:1,18,0,5
chr1	148594466	.	G	A	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,95;MMQ=40,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,3:0.037:106:53,0:49,3:78,25,3,0
chr1	148756432	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=181,135;MMQ=24,23;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:5,1,1,1
chr1	148756448	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=159,184;MMQ=24,24;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,2:3,3:2,1,4,1
chr1	149783886	.	C	T	.	.	DP=155;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,144;MMQ=50,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=239.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,85:0.571:149:30,40:33,45:20,44,32,53
chr1	149859371	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,3:0.058:66:30,1:32,2:10,53,2,1
chr1	149871905	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.540:35:11,7:5,12:11,5,7,12
chr1	149880863	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr1	149880935	.	C	CCACACACACACA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,10;RU=CA;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,2:3,0:6,1,0,2
chr1	149881172	.	C	CCACA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=164,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:149881172_C_CCACA:149881172:0,2,0,1
chr1	149881173	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=137,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:149881172_C_CCACA:149881172:0,2,0,1
chr1	149881174	.	T	TAAGAAGAAGCACAAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=164,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:149881172_C_CCACA:149881172:0,2,0,1
chr1	149881183	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=165,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1|0:149881172_C_CCACA:149881172:1,1,1,1
chr1	149882322	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=182,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:4,5,0,2
chr1	149897966	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:3,1:7,6:1,10,0,7
chr1	149900985	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.870:8:0,3:0,4:0,1,7,0
chr1	149902588	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=217,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.592:12:1,6:2,1:5,0,7,0
chr1	149902647	.	G	GA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=110,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:13,2:18,1:21,12,3,0
chr1	149903122	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:7,9:3,0:7,3,8,2
chr1	149904334	.	C	CGTGATCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149904334_C_CGTGATCT:149904334:0,1,0,1
chr1	149904336	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149904334_C_CGTGATCT:149904334:0,1,0,1
chr1	149904337	.	G	GAGCGTGCATTCAGAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149904334_C_CGTGATCT:149904334:0,1,0,1
chr1	149906167	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.509:43:11,14:10,7:9,12,12,10
chr1	149907169	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=26,18;MFRL=137,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.218:15:5,0:1,0:6,6,2,1
chr1	149907172	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.540:17:3,6:2,3:2,6,6,3
chr1	149907183	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=137,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.511:26:5,5:3,8:4,9,6,7
chr1	149907258	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.662:27:2,13:6,5:3,6,3,15
chr1	149907276	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:4,8:3,7:1,6,4,11
chr1	149916632	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=139,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:1,0:7,1,2,0
chr1	149943157	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:10,7:11,8:8,13,3,12
chr1	150053389	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:9,4:2,5:8,3,9,1
chr1	150082513	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=204,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr1	150122493	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	150128425	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,6:0,0,2,8
chr1	150129267	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr1	150129296	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	150235045	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:6,3:0,13,0,3
chr1	150236314	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=140,153;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:2,0:3,0:7,5,2,0
chr1	150236969	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=128,49;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:9,0:3,2:6,6,1,1
chr1	150236981	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=128,49;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:0|1:150236981_T_C:150236981:6,6,1,1
chr1	150236985	.	C	CGACCCCTGAGGAAGCCAGGGCTCTCTTCT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=128,49;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:150236981_T_C:150236981:6,6,1,1
chr1	150249056	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:6,0:10,2:0|1:150249056_A_C:150249056:7,13,0,2
chr1	150249059	.	G	GTTATATTCCTCT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:9,2:0|1:150249056_A_C:150249056:7,14,0,2
chr1	150253326	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,70;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,3:13,0:6,15,2,1
chr1	150255587	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=214,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	150258838	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.368:36:13,9:10,4:19,4,11,2
chr1	150259400	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,3:2,5:0,4,0,9
chr1	150297334	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=35,34,34;MFRL=155,176,141;MMQ=60,60,60;MPOS=23,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=4.21,5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,5:0.142,0.329:15:4,0,3:4,2,1:8,0,7,0
chr1	150297357	.	AG	TT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=18,13;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:5,0:8,0:0|1:150297357_AG_TT:150297357:17,9,2,0
chr1	150297360	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.098:28:6,0:9,0:0|1:150297357_AG_TT:150297357:17,9,2,0
chr1	150300727	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:5,0,4,1
chr1	150315719	.	AAAAAAAT	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:6,9:3,4:9,1,13,0
chr1	150315724	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.275:19:9,3:6,1:15,0,4,0
chr1	150413358	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:11,0:13,5,2,0
chr1	150432802	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=135,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:0,1:4,7:1,3,2,6
chr1	150432871	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150432871_G_A:150432871:0,0,0,1
chr1	150432875	.	T	TTA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150432871_G_A:150432871:0,0,0,1
chr1	150432878	.	T	TTCAAGGTCA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150432871_G_A:150432871:0,0,0,1
chr1	150437275	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=219,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150437275_T_TA:150437275:0,1,0,1
chr1	150437278	.	CT	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=219,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:150437275_T_TA:150437275:0,1,0,1
chr1	150443793	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:14,1:14,2:9,20,0,3
chr1	150444175	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,2:12,0:6,18,1,1
chr1	150445767	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,4:0.063:76:29,4:43,0:46,26,3,1
chr1	150445819	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,27:0.510:53:11,9:14,17:17,9,7,20
chr1	150463017	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=183,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr1	150465026	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=175,56;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.144:20:11,0:7,2:0|1:150465026_G_A:150465026:0,18,1,1
chr1	150465028	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=175,56;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.144:20:10,0:7,2:0|1:150465026_G_A:150465026:0,18,1,1
chr1	150471496	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:4,11,2,0
chr1	150477061	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:2,2:5,5:5,2,6,2
chr1	150479326	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=192,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr1	150479364	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=174,60;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:150479364_GA_G:150479364:12,0,1,1
chr1	150479367	.	GTT	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=169,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.178:15:7,2:5,0:0|1:150479364_GA_G:150479364:13,0,1,1
chr1	150479370	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=167,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:7,2:4,0:0|1:150479364_GA_G:150479364:12,0,1,1
chr1	150482738	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:0,6,0,7
chr1	150483840	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	150484395	.	ACC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=220,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=C;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	150525546	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.114:32:12,0:16,0:2,27,3,0
chr1	150525550	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.138:33:11,0:16,0:2,27,4,0
chr1	150525555	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.131:32:11,1:17,2:0,28,4,0
chr1	150529322	.	T	TAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	150530548	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:4,9:5,6:7,2,10,6
chr1	150531380	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=207,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,6:2,0:4,0,5,1
chr1	150531730	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,10;MFRL=164,211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:8,0:4,0:0|1:150531730_T_G:150531730:2,11,2,0
chr1	150531735	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,10;MFRL=119,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:8,0:5,0:0|1:150531730_T_G:150531730:3,12,2,0
chr1	150550019	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,0,14
chr1	150552013	.	TCGC	T	.	.	DP=104;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=159,232;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CGC;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,2:0.038:73:19,0:36,1:15,56,0,2
chr1	150552042	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,21:0.468:45:8,7:16,14:1,23,2,19
chr1	150599094	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=187,184;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	150599101	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=187,184;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	150599112	.	A	AACTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=193,184;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	150671045	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=182,200;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,1:14,1:25,3,1,1
chr1	150671243	.	AC	A	.	.	DP=147;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=221.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,69:0.511:135:34,31:31,37:15,51,9,60
chr1	150676485	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=197,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:7,0,1,2
chr1	150676674	.	TAA	T,TA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,33,31;MFRL=151,142,149;MMQ=60,60,60;MPOS=20,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=10.05,11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,6,8:0.241,0.315:26:3,1,1:7,5,6:3,9,0,14
chr1	150679358	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=212,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr1	150686599	.	TA	T	.	.	DP=116;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,7:0.076:103:50,5:40,2:36,60,4,3
chr1	150720164	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,47;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr1	150730279	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,4:5,2:8,2,7,0
chr1	150730556	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=201,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr1	150730557	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=207,200;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	150788637	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:10,0,2,0
chr1	150789884	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:7,5:5,8:4,9,9,5
chr1	150790548	.	A	AAGATTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	150799125	.	C	CT	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=147,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.259:33:13,6:8,2:3,22,2,6
chr1	150799189	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=187,170;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,2:6,0:0,17,0,2
chr1	150804401	.	GAAA	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=136,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:0,2:0,3,1,1
chr1	150804429	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,36;MFRL=114,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:1,1:1,1,0,3
chr1	150804451	.	T	TCCTCTGACTCCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	150804484	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	150815017	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=162,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:2,0:0,1:0,4,0,2
chr1	150849071	.	ACC	A,AC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29,30;MFRL=0,188,174;MMQ=60,60,60;MPOS=15,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=C;STR;TLOD=16.98,12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,6:0.501,0.438:13:0,5,2:0,2,3:0,0,0,13
chr1	150915017	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:5,2,2,3
chr1	150917697	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=199,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0,9,0,2
chr1	150923774	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	150932972	.	G	C,A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=19,13,25;MFRL=95,186,137;MMQ=43,47,50;MPOS=22,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.22,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.286,0.420:4:0,0,0:0,0,1:1,0,2,1
chr1	150932977	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,15;MFRL=204,95;MMQ=54,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,0:0,1:2,0,2,1
chr1	150934769	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	150935080	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:11,0:18,2:13,17,1,1
chr1	150938571	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr1	150938616	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,8:0,0,16,3
chr1	150939478	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,13;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.226:18:5,0:4,0:11,3,4,0
chr1	150939744	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=237,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:2,3,4,2
chr1	150940357	.	GC	TT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:9,12:7,11:7,10,14,11
chr1	150940490	.	G	GCCCAGCCAGCCGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0|1:150940490_G_GCCCAGCCAGCCGC:150940490:0,2,0,1
chr1	150940493	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:150940490_G_GCCCAGCCAGCCGC:150940490:0,2,0,1
chr1	150941381	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.421:19:4,3:7,4:10,1,5,3
chr1	150958977	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.653:27:7,7:2,10:7,2,14,4
chr1	150960593	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=133,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:1,9:7,3:6,2,9,3
chr1	150970836	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150970836_T_A:150970836:0,0,0,1
chr1	150970845	.	C	CTGTTTCTCAAAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150970836_T_A:150970836:0,0,0,1
chr1	150974162	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr1	150981267	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	150990466	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=282,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr1	150997940	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.572:28:2,7:9,9:8,4,11,5
chr1	150998227	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=177,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.431:3:1,0:1,1:0|1:150998227_T_A:150998227:0,2,0,1
chr1	150998234	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=177,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.431:3:1,0:1,1:0|1:150998227_T_A:150998227:0,2,0,1
chr1	150998240	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150998227_T_A:150998227:0,1,0,1
chr1	150999863	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,1:1,5:0,2,0,6
chr1	151006539	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,26:0,18:0,0,19,25
chr1	151011320	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=134,53;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:11,1:15,1:0|1:151011320_G_A:151011320:19,8,2,0
chr1	151011326	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=128,80;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,3:0.123:30:12,1:15,2:1|0:151011320_G_A:151011320:19,8,2,1
chr1	151019180	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,16:0,0,9,21
chr1	151019251	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,23;MFRL=174,120;MMQ=60,60;MPOS=-1073741809;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,1:3,0:0|1:151019251_C_T:151019251:2,7,0,2
chr1	151019255	.	TCCCC	T	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=30,21;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:2,0:0|1:151019251_C_T:151019251:1,5,0,2
chr1	151019260	.	AAC	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,24;MFRL=185,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:0,0:0|1:151019251_C_T:151019251:1,3,0,2
chr1	151019265	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,35;MFRL=88,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:151019251_C_T:151019251:0,2,0,2
chr1	151019271	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=287935,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:0,0:0|1:151019271_C_A:151019271:1,1,0,3
chr1	151019274	.	CG	GT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,30;MFRL=287935,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:1,0:0|1:151019271_C_A:151019271:1,1,0,3
chr1	151026815	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr1	151028234	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=148.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,24:0,19:0,0,11,33
chr1	151039609	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr1	151065918	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=201,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151065918_T_A:151065918:0,1,0,1
chr1	151065920	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=201,234;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151065918_T_A:151065918:0,1,0,1
chr1	151076208	.	TCCAGCAGA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=126,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:151076208_TCCAGCAGA_T:151076208:0,2,0,1
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chr1	151076229	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,0:1,1:0|1:151076208_TCCAGCAGA_T:151076208:0,2,0,1
chr1	151090828	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:4,0:7,2:0,11,0,2
chr1	151104950	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=103.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,13:0,15:0,0,35,2
chr1	151109641	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	151111304	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=213,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151111304_C_T:151111304:0,1,0,1
chr1	151111307	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=213,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151111304_C_T:151111304:0,1,0,1
chr1	151114882	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,9,1
chr1	151115186	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr1	151144321	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=220,139;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:151144321_T_TA:151144321:1,2,0,1
chr1	151144325	.	T	TATTTTATTTTATTTTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=220,139;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:151144321_T_TA:151144321:1,2,0,1
chr1	151144891	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr1	151146186	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	151149601	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=206,122;MMQ=40,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,11:1,9:0,1,1,19
chr1	151188580	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=157,129;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:10,0:3,2:3,10,0,2
chr1	151188607	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=195,137;MMQ=50,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:0,10,0,2
chr1	151209297	.	C	CTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,0;MFRL=188,69;MMQ=53,42;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=22,34;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:1,0:0,0:0,1,0,2
chr1	151210789	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,5:5,4:0,6,1,8
chr1	151211752	.	CT	TA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=144,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:151211752_CT_TA:151211752:0,4,0,1
chr1	151211760	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=144,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:151211752_CT_TA:151211752:0,4,0,1
chr1	151211762	.	TTT	AGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=194,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:151211762_TTT_AGG:151211762:0,2,0,1
chr1	151211767	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=194,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:151211762_TTT_AGG:151211762:0,2,0,1
chr1	151211774	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=172,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:151211752_CT_TA:151211752:0,1,0,1
chr1	151212399	.	C	CCTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	151227353	.	G	GTGGTGAAGGTTTCAAATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=127,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.381:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	151237589	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=100,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.683:17:3,5:2,7:5,0,6,6
chr1	151239570	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:6,2:5,2:6,5,2,3
chr1	151252821	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=166,154;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:2,0:0|1:151252821_C_T:151252821:0,3,0,1
chr1	151252824	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=166,154;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:151252821_C_T:151252821:0,3,0,1
chr1	151252830	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=188,154;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:151252821_C_T:151252821:0,2,0,1
chr1	151252832	.	TT	CC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,29;MFRL=188,154;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:151252821_C_T:151252821:0,2,0,1
chr1	151252847	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=209,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151252847_T_C:151252847:0,1,0,1
chr1	151252849	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,17;MFRL=209,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:151252847_T_C:151252847:0,1,0,1
chr1	151260444	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,1:9,1:15,3,2,0
chr1	151262372	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.381:6:3,1:0,0:0|1:151262372_A_AG:151262372:0,4,0,2
chr1	151262377	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,17;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.439:5:2,0:0,0:0|1:151262372_A_AG:151262372:0,3,0,2
chr1	151262380	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=18,12;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.439:5:1,0:0,0:0|1:151262372_A_AG:151262372:0,3,0,2
chr1	151262384	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	151262390	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.826:4:0,0:0,0:0,0,0,4
chr1	151266714	.	T	TAACAGCATCCATATCCGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr1	151271583	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,0:5,3:2,6,0,3
chr1	151282841	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:1,2:5,8:0,6,0,10
chr1	151314379	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	151337788	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:4,2:0,1:0,4,0,4
chr1	151339353	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:16,3:10,0:9,18,2,1
chr1	151341703	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr1	151341747	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:151341747_G_C:151341747:1,2,0,1
chr1	151341749	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0|1:151341747_G_C:151341747:1,2,0,1
chr1	151345227	.	G	GAGTTTGTAGAGACTGGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.389:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	151373200	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=182.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,27:0,25:0,0,43,12
chr1	151377248	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,1,2
chr1	151380504	.	AAAAG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.515:7:1,4:0,0:3,0,4,0
chr1	151380725	.	GA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=175,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.297:21:3,0:4,4:1,14,1,5
chr1	151381320	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=45.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,6:0,9:0,0,2,13
chr1	151384338	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=163,428;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,1:3,0:0,7,0,2
chr1	151384711	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	151384733	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	151395782	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	151396037	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,1,12
chr1	151400942	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0,0,0,12
chr1	151402045	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,17,3
chr1	151497140	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:7,8:7,3:8,6,6,5
chr1	151497376	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,1:0,1:0,0,0,4
chr1	151499635	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,4:4,7:0,7,1,10
chr1	151501737	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	151505097	.	T	TAAACACATTGTATGAGTTAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0,3,0,1
chr1	151508061	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:1,1:1,2:1,1,2,2
chr1	151535020	.	A	ATC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=TC;STR;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:5,6:1,1:5,1,7,0
chr1	151542099	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:6,7:12,3:17,1,8,2
chr1	151546679	.	C	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.133:18:8,0:7,0:14,2,2,0
chr1	151546931	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:6,6:12,10:0,18,0,16
chr1	151551320	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:2,4,2,5
chr1	151552301	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr1	151553606	.	G	GGATGAATGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151553606_G_GGATGAATGAC:151553606:0,1,0,1
chr1	151553609	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=117,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:151553606_G_GGATGAATGAC:151553606:0,1,0,1
chr1	151634803	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr1	151634822	.	TA	GG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	151634833	.	T	TGGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:151634833_T_TGGA:151634833:0,3,0,1
chr1	151634836	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:151634833_T_TGGA:151634833:0,3,0,1
chr1	151681567	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:8,5:6,0:5,9,1,4
chr1	151688308	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=65,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,0:4,0:1,4,1,0
chr1	151700189	.	C	CCTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=142,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	151701136	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=59,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:2,2,2,0
chr1	151732700	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	151733335	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=126,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:11,3:4,6:9,6,4,5
chr1	151735711	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=10,23;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.740:11:1,0:0,4:0|1:151735711_G_C:151735711:3,0,8,0
chr1	151735714	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=14,21;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.581:14:0,1:0,3:0|1:151735711_G_C:151735711:6,0,8,0
chr1	151735720	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=114,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:2,0:4,1:0|1:151735711_G_C:151735711:7,1,5,0
chr1	151735721	.	CAT	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=118,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:3,0:5,0:0|1:151735711_G_C:151735711:8,1,5,0
chr1	151735724	.	C	CAAG	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=114,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.304:11:2,0:6,1:0|1:151735711_G_C:151735711:7,1,3,0
chr1	151740479	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr1	151742550	.	GGAGAGA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=171,170;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=GA;STR;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,1:2,3:0|1:151742550_GGAGAGA_G:151742550:4,0,4,0
chr1	151742565	.	GGGAGACCATGGGGAGACGGAGAC	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=153,170;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.425:10:1,1:3,3:0|1:151742550_GGAGAGA_G:151742550:6,0,4,0
chr1	151747043	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,4:3,7:1,6,3,8
chr1	151747733	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:1,6,1,2
chr1	151747799	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,9:0,0,8,2
chr1	151748417	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=157,79;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,0:9,3:2,18,0,3
chr1	151748425	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=38,32;MFRL=79,160;MMQ=54,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:0,8:3,6:0,3,1,13
chr1	151751081	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.596:15:4,6:1,3:0,6,3,6
chr1	151754112	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=198,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,0,3
chr1	151774881	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,60;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,2:10,0:6,8,2,0
chr1	151780177	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	151783736	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr1	151789588	.	C	CTGTGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=TG;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.761:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	151789609	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr1	151810304	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	151811226	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	151820845	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr1	151955803	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:3,2:2,1:0,6,1,6
chr1	152057917	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,345;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:11,2:11,13,1,1
chr1	152079823	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,16,1
chr1	152128121	.	G	A	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=111,120;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,52:0.468:110:29,31:22,13:34,24,35,17
chr1	152187807	.	C	CAAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0|1:152187807_C_CAAA:152187807:0,0,0,1
chr1	152187809	.	G	GAACAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:152187807_C_CAAA:152187807:0,0,0,1
chr1	152191469	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:9,4:6,2:9,7,5,1
chr1	152192219	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=130,141;MMQ=48,34;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:13,3:19,2:14,18,0,5
chr1	152193990	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,6,4
chr1	152195728	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr1	152280503	.	C	CACGCGGGCAGCGTCAGCTGGTCG	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=144,2034;MMQ=52,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,2:0.049:58:28,2:27,0:26,30,0,2
chr1	152383429	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=210,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:152383429_A_AG:152383429:0,1,0,1
chr1	152383431	.	A	ACAGAGAAGTGGCAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=210,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:152383429_A_AG:152383429:0,1,0,1
chr1	152484719	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=168,225;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.284:5:4,0:0,1:0|1:152484719_C_CA:152484719:0,4,0,1
chr1	152484722	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.347:4:2,1:1,0:1|0:152484719_C_CA:152484719:0,3,0,1
chr1	152484723	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=168,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.288:5:4,0:0,1:0|1:152484719_C_CA:152484719:0,4,0,1
chr1	152484725	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.347:4:2,1:1,0:1|0:152484719_C_CA:152484719:0,3,0,1
chr1	152538358	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,6:2,2:4,0,7,1
chr1	152552461	.	C	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,27:0.459:59:18,8:14,19:1,31,6,21
chr1	152637150	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:2,3:3,5:2,3,2,6
chr1	152649114	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=224,252;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,0,3
chr1	152681543	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=215.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.986:64:0,29:0,35:0,0,48,16
chr1	152681680	.	C	CAGCTCTGGGGGCTGCTGT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=132.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.974:31:0,15:0,7:0,0,6,25
chr1	152691943	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:3,0,3,1
chr1	152692588	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.617:19:4,7:3,4:3,4,11,1
chr1	152692948	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,10:0.367:28:10,3:6,7:0|1:152692948_T_A:152692948:6,12,4,6
chr1	152692952	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,10:0.379:27:10,2:7,8:0|1:152692948_T_A:152692948:5,12,4,6
chr1	152733415	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:152733415_C_CT:152733415:0,2,0,1
chr1	152733416	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:152733415_C_CT:152733415:0,2,0,1
chr1	152733420	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:152733415_C_CT:152733415:0,2,0,1
chr1	152734187	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,29:0.597:48:9,7:10,20:7,12,13,16
chr1	152759678	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,5:4,6:11,0,11,0
chr1	152759950	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,136;MMQ=52,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:2,5,2,3
chr1	152785348	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:23,0:13,3:21,15,0,3
chr1	152816076	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=118,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.077:42:23,2:16,0:20,19,1,2
chr1	152883278	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:9,1:12,0:0|1:152883278_G_C:152883278:14,9,2,0
chr1	152883279	.	CTGG	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,1:14,0:0|1:152883278_G_C:152883278:14,9,2,0
chr1	152883680	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=107,142;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,23:0.459:51:11,10:13,11:9,19,10,13
chr1	152884246	.	GA	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:6,3:1,1:3,4,3,1
chr1	152884438	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=223,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	152944594	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,11:0,0,19,11
chr1	152957887	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=73,155;MMQ=27,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.845:23:2,10:0,8:2,1,10,10
chr1	152975941	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,17,14
chr1	153004721	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,16,0
chr1	153004778	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=123.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,21:0,16:0,0,35,3
chr1	153004809	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=200.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,37:0,22:0,0,44,17
chr1	153004983	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,16:0,6:0,0,5,20
chr1	153066262	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=215,95;MMQ=60,43;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	153122310	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,13:0,6:0,0,20,0
chr1	153122620	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr1	153177696	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=90,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1,1,0,1
chr1	153190590	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,4:3,6:7,0,10,0
chr1	153191399	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=108,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:0,5,0,2
chr1	153233488	.	C	CGGCGGT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=153,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGCGGT;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.355:9:3,1:1,1:0,6,0,3
chr1	153234602	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=236,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr1	153270362	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr1	153279462	.	TAAG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	153283004	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr1	153283179	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.658:36:6,12:6,12:0,12,5,19
chr1	153314347	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	153315467	.	T	TAAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=35.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr1	153315784	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	153347130	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:153347130_A_T:153347130:0,1,0,1
chr1	153347134	.	C	CTAACTAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:153347130_A_T:153347130:0,1,0,1
chr1	153363054	.	G	GGTATTAGCAAGCAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr1	153391880	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=221,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:0,5,0,7
chr1	153410882	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=151,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.528:6:1,1:0,2:0,3,0,3
chr1	153430249	.	TG	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:6,4:8,9:13,3,12,1
chr1	153509890	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.535:30:6,7:7,9:3,11,6,10
chr1	153535848	.	CA	C,CAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=145,197,171;MMQ=60,60,40;MPOS=11,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.59,6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,5:0.160,0.266:19:4,1,2:5,2,1:9,2,6,2
chr1	153588208	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,3:6,0,8,0
chr1	153603116	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:19,3:13,0:21,11,1,2
chr1	153604112	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=123,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,2:5,1:8,2,3,0
chr1	153609039	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.484:31:7,10:9,5:15,1,11,4
chr1	153615696	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:24,4:21,0:38,7,4,0
chr1	153635425	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:9,1,4,0
chr1	153636462	.	CTACTACTACTAG	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=116,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,14:0.578:24:2,7:4,7:0|1:153636462_CTACTACTACTAG_C:153636462:9,1,14,0
chr1	153636472	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,10:0.695:16:3,5:3,4:1|0:153636462_CTACTACTACTAG_C:153636462:6,0,9,1
chr1	153637617	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:4,0,6,0
chr1	153637885	.	G	GATCATATACT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=200,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:3,1:0,0:0|1:153637885_G_GATCATATACT:153637885:0,3,0,1
chr1	153637886	.	G	GTTTTTGCTTTA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=200,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:3,1:0,0:0|1:153637885_G_GATCATATACT:153637885:0,3,0,1
chr1	153637888	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=200,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:153637885_G_GATCATATACT:153637885:0,3,0,1
chr1	153637899	.	TTTTTTA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.688:1:0,1:0,0:0|1:153637899_TTTTTTA_T:153637899:0,0,0,1
chr1	153637910	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153637899_TTTTTTA_T:153637899:0,0,0,1
chr1	153660492	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.168:26:6,1:10,2:10,12,4,0
chr1	153660514	.	AC	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.537:24:3,4:7,7:2,9,4,9
chr1	153661374	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,2:2,3:3,0,6,0
chr1	153661402	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.299:14:2,0:1,0:7,3,4,0
chr1	153665749	.	AC	CA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=142,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,0:11,2:13,9,1,1
chr1	153665919	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:6,1:3,2:1,8,0,3
chr1	153719841	.	T	TG	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=130,54;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,2:0.047:62:28,0:29,2:0|1:153719841_T_TG:153719841:14,46,1,1
chr1	153719844	.	G	GA	.	.	DP=63;ECNT=6;MBQ=32,19;MFRL=131,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,2:0.046:63:28,0:31,1:0|1:153719841_T_TG:153719841:14,47,1,1
chr1	153719848	.	G	C	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,2:0.045:64:27,0:32,2:0|1:153719841_T_TG:153719841:13,49,1,1
chr1	153719851	.	G	GC	.	.	DP=60;ECNT=6;MBQ=32,17;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,2:0.048:60:24,0:27,1:0|1:153719841_T_TG:153719841:9,49,1,1
chr1	153719853	.	C	CTTAG	.	.	DP=58;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:19,0:31,1:0|1:153719841_T_TG:153719841:9,47,1,1
chr1	153719889	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=33,25;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:10,0:17,3:2,25,0,3
chr1	153745262	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=197,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:153745262_A_T:153745262:1,1,0,1
chr1	153745263	.	TAA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=197,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:153745262_A_T:153745262:1,1,0,1
chr1	153751116	.	G	GACCTGACT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=260,38;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:0,0:0|1:153751116_G_GACCTGACT:153751116:1,3,1,1
chr1	153751118	.	C	CATAATAGTCACTAGTGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=260,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:153751116_G_GACCTGACT:153751116:1,3,1,1
chr1	153751805	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=135,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:11,4:7,4:10,8,3,5
chr1	153784678	.	T	TGTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=187,158;MMQ=58,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	153784680	.	T	TGGAAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=152,221;MMQ=56,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:153784680_T_TGGAAAC:153784680:0,3,0,1
chr1	153784683	.	T	TGCATTTGCCTCTGTTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=152,221;MMQ=56,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:153784680_T_TGGAAAC:153784680:0,3,0,1
chr1	153790501	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.189:35:14,2:15,4:19,10,5,1
chr1	153791209	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:153791209_A_C:153791209:1,0,0,1
chr1	153791210	.	C	CAGATTCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153791209_A_C:153791209:1,0,0,1
chr1	153791214	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	153792300	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.228:14:3,0:6,3:1,10,0,3
chr1	153903386	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:5,0:3,0:0|1:153903386_A_G:153903386:3,5,4,0
chr1	153903390	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:2,1:3,1:0|1:153903386_A_G:153903386:3,5,4,0
chr1	153903394	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,0:3,0:0|1:153903386_A_G:153903386:3,7,3,0
chr1	153903399	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:3,1:5,1:0|1:153903386_A_G:153903386:3,11,3,0
chr1	153906111	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,1:10,1:4,12,1,1
chr1	153906397	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=144,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,3:3,3:1,9,3,3
chr1	153907278	.	CCTGCTGCTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=158,0;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=CTG;STR;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:0,3:4,0:1,4,1,2
chr1	153912354	.	A	AGCTGGCTCAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153912354_A_AGCTGGCTCAGC:153912354:0,1,0,1
chr1	153912357	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153912354_A_AGCTGGCTCAGC:153912354:0,1,0,1
chr1	153913699	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,124;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,4:8,3:14,3,5,2
chr1	153920564	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:9,4:6,1:12,3,5,0
chr1	153927270	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:3,1,6,1
chr1	153930752	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=209,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.570:5:0,0:2,1:0|1:153930752_G_C:153930752:2,0,3,0
chr1	153930757	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:0,0:3,1:0|1:153930752_G_C:153930752:3,0,3,0
chr1	153935208	.	C	CACCCTCCTCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=0,106;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153935208_C_CACCCTCCTCTG:153935208:0,1,0,1
chr1	153935211	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=0,106;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153935208_C_CACCCTCCTCTG:153935208:0,1,0,1
chr1	153935212	.	T	TGGTGCCCATCTGTGTGCTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=0,106;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:153935208_C_CACCCTCCTCTG:153935208:0,1,0,1
chr1	153954674	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=111,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,21:0.400:53:17,9:15,12:8,24,5,16
chr1	153963995	.	A	AAG	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.377:35:9,8:12,3:11,11,7,6
chr1	154000022	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=128,105;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.098:39:15,3:20,0:17,19,3,0
chr1	154027381	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31,31,30;MFRL=167,4438,168,206;MMQ=60,60,60,60;MPOS=15,26,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.39,8.05,3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,4,2:0.230,0.396,0.227:9:1,2,2,2:0,0,2,0:0,1,0,8
chr1	154029450	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,3:2,2:7,2,0,5
chr1	154061855	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,18,1
chr1	154072666	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,94;MMQ=60,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:2,12,1,1
chr1	154141908	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,6:6,3:0,9,0,9
chr1	154144024	.	G	GCACAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	154144673	.	GA	G	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,4:0.075:64:25,0:19,4:30,30,2,2
chr1	154144891	.	AT	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.110:52:24,3:21,2:11,36,1,4
chr1	154178202	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr1	154186918	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,14:0.375:38:12,6:11,8:13,11,8,6
chr1	154192463	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.363:19:6,3:6,2:1,11,0,7
chr1	154207834	.	AT	A,ATT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,31,15;MFRL=166,143,154;MMQ=60,60,60;MPOS=16,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.72,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,4,3:0.121,0.106:33:7,1,0:10,2,1:0,26,0,7
chr1	154218639	.	TTCAG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=199,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,1:7,2:8,1,3,0
chr1	154227292	.	GT	G,GTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,36,35;MFRL=165,141,201;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.01,4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,3:0.326,0.265:12:2,1,0:3,3,3:5,0,7,0
chr1	154227670	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=154,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:0|1:154227670_C_CA:154227670:14,7,1,1
chr1	154227671	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=154,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:0|1:154227670_C_CA:154227670:14,7,1,1
chr1	154228287	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:6,2:3,3:0,9,1,4
chr1	154243385	.	T	TAAGCTCATAACGCATCTCCCCCATCACAC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.161:26:14,3:6,0:11,12,2,1
chr1	154303430	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:5,11,0,3
chr1	154303705	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=213,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:154303705_C_T:154303705:0,3,0,2
chr1	154303709	.	C	CAGAGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.327:4:1,1:2,0:1|0:154303705_C_T:154303705:0,3,0,1
chr1	154303715	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=203,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:154303705_C_T:154303705:0,4,0,1
chr1	154305010	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	154305190	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,15:0.345:44:12,4:16,9:11,18,4,11
chr1	154310223	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=182,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,1:0,2,0,5
chr1	154313625	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=197,0;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr1	154317281	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=75,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:1,3,0,5
chr1	154317418	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:3,2:1,4:4,0,7,0
chr1	154318172	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=204,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:4,1,4,0
chr1	154321072	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	154401972	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=146,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,1:1,3:0,4,1,3
chr1	154407181	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:9,0:5,2:3,13,0,2
chr1	154407419	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr1	154437896	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	154458932	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	154459197	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	154461480	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	154479657	.	C	CAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr1	154479670	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,10,1
chr1	154492702	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	154493721	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr1	154516827	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:14,3:13,4:20,7,6,1
chr1	154520197	.	C	CATCCTTCCCCATCAAACTTGCTGATACACTCCTACCTTT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=161,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.104:38:15,0:17,3:16,19,2,1
chr1	154523588	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	154528086	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	154557685	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.358:37:12,8:12,5:16,8,10,3
chr1	154562594	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:1,1,1,0
chr1	154562614	.	A	AGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,18;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:1,1,1,0
chr1	154562621	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154562621_C_T:154562621:0,0,1,0
chr1	154562625	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154562621_C_T:154562621:0,0,1,0
chr1	154562845	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,1:9,1:13,10,0,2
chr1	154575131	.	A	AAATTGGACATGTAAAGGTGGGCATC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	154580551	.	C	CGTGGGTAA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:13,2:9,0:0|1:154580551_C_CGTGGGTAA:154580551:0,22,0,2
chr1	154580556	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=188,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,2:8,0:0|1:154580551_C_CGTGGGTAA:154580551:0,21,0,2
chr1	154744937	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:6,2:5,4:1,10,0,7
chr1	154832290	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=211,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:0|1:154832290_C_T:154832290:0,4,0,7
chr1	154832304	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=179,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1|0:154832290_C_T:154832290:0,4,0,4
chr1	154832322	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=135,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1|0:154832290_C_T:154832290:0,1,0,4
chr1	154842199	.	G	GGCTGCTGCTGCT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,18;RU=GCT;STR;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.926:9:0,3:0,4:0,0,2,7
chr1	154926102	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=144,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,0:3,0:0|1:154926102_A_C:154926102:0,5,5,0
chr1	154926108	.	CAA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=116,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,2:3,1:0|1:154926102_A_C:154926102:0,8,5,0
chr1	154936832	.	CG	TA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=243,175;MMQ=55,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:154936832_CG_TA:154936832:0,2,0,1
chr1	154936835	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=243,175;MMQ=55,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:154936832_CG_TA:154936832:0,2,0,1
chr1	154936849	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=252,233;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:154936849_C_T:154936849:0,1,0,1
chr1	154936853	.	A	AATAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=252,233;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:154936849_C_T:154936849:0,1,0,1
chr1	154962220	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=140,72;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:154962220_T_TA:154962220:0,4,0,1
chr1	154962221	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=140,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:154962220_T_TA:154962220:0,4,0,1
chr1	154962233	.	A	ATTCTCCCAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=228,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	154987697	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,1:6,0:0|1:154987697_A_C:154987697:1,11,2,0
chr1	154987700	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=29,23;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.168:16:5,1:6,0:0|1:154987697_A_C:154987697:2,12,2,0
chr1	154987703	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,0:0|1:154987697_A_C:154987697:1,13,2,0
chr1	154987706	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=33,11;MFRL=192,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,0:0|1:154987697_A_C:154987697:1,12,2,0
chr1	154987709	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=29,18;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:7,0:0|1:154987697_A_C:154987697:2,13,2,0
chr1	154987712	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,0:0|1:154987697_A_C:154987697:2,13,2,0
chr1	154989048	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:11,1:21,2:24,8,3,0
chr1	154996256	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:4,3:11,4:15,1,5,2
chr1	155002562	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.453:16:4,3:3,4:6,3,5,2
chr1	155003954	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=198,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	155005084	.	CA	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr1	155014219	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:13,0:8,2:16,7,2,0
chr1	155019710	.	A	C	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,28:0.449:63:21,8:12,20:17,18,16,12
chr1	155028496	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=191,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:155028496_A_C:155028496:1,3,1,0
chr1	155028502	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=202,241;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:155028496_A_C:155028496:1,2,1,0
chr1	155028522	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,2,2
chr1	155041513	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=150,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,0:6,2:3,9,0,2
chr1	155057499	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,12:0,0,17,2
chr1	155057942	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,13;MFRL=215,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:0,0:1,2:0,6,0,6
chr1	155059035	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,1:1,1:0,7,0,2
chr1	155103860	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:7,1,2,0
chr1	155103915	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,2:9,1:10,12,2,1
chr1	155105882	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=73,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:1,1:4,0,2,0
chr1	155106550	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,2,14
chr1	155108287	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,2:0,11:0,0,7,6
chr1	155108663	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr1	155108900	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.388:29:11,1:2,3:9,8,0,12
chr1	155108910	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=15,17;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.297:23:4,0:2,2:6,10,0,7
chr1	155109218	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=204,163;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.320:15:4,1:6,4:10,0,5,0
chr1	155109528	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=272,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	155142210	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=263.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,60:0.984:60:0,31:0,29:0|1:155142210_A_G:155142210:0,0,54,6
chr1	155142229	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=340.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,84:0.989:84:0,42:0,42:0|1:155142210_A_G:155142210:0,0,66,18
chr1	155154718	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155154718_T_G:155154718:0,0,0,1
chr1	155154727	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:155154718_T_G:155154718:0,0,0,1
chr1	155162067	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,9,19
chr1	155167786	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.443:39:9,9:11,8:12,10,11,6
chr1	155170372	.	GT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,2:13,0:7,14,0,2
chr1	155171651	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=184,8643790;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155171651_G_C:155171651:1,0,1,0
chr1	155171659	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=184,8643790;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155171651_G_C:155171651:1,0,1,0
chr1	155181843	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	155182164	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,19,9
chr1	155184975	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,8:0,0,2,13
chr1	155205669	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,4:0,0,2,12
chr1	155209360	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,4:3,4:6,3,5,3
chr1	155235769	.	G	GCTGATACCAGTTA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:12,0:2,21,0,2
chr1	155257478	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:3,0:3,3,2,0
chr1	155288511	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:15,3:15,0:14,17,1,2
chr1	155291032	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.187:28:10,1:6,0:7,15,6,0
chr1	155294772	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,12:0,0,6,17
chr1	155313047	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	155313465	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.108:25:11,1:12,1:13,10,0,2
chr1	155313501	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,0:16,2:9,16,1,1
chr1	155330298	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,192;MMQ=52,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr1	155350017	.	AATTCTTTAAGGATTTTTCCATCACC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	155408222	.	TG	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=153,136;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,3:7,0:12,5,3,0
chr1	155686712	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=176,142;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:11,0,2,0
chr1	155686739	.	C	CAA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=A;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.223:20:6,1:8,1:15,1,2,2
chr1	155695904	.	C	CCGGTGCCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.315:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr1	155708017	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=144,43;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.126:22:11,2:7,0:0|1:155708017_A_T:155708017:11,9,1,1
chr1	155708030	.	C	CTTAATTACCCAGCTCTTGTTCATCCTT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=149,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:10,2:7,0:0|1:155708017_A_T:155708017:9,9,1,1
chr1	155724320	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=151,129;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0|1:155724320_T_TG:155724320:2,2,0,2
chr1	155724326	.	T	TGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=158,129;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:155724320_T_TG:155724320:2,5,0,2
chr1	155736285	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,146;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,6:0.107:62:25,2:29,4:22,34,4,2
chr1	155737425	.	AACACAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=192,176;MMQ=39,39;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=AC;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.435:7:3,1:0,1:0,4,0,3
chr1	155744932	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,192;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,4:0.065:74:36,2:32,2:49,21,3,1
chr1	155746340	.	CTT	C,CT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,35,33;MFRL=177,154,154;MMQ=60,60,60;MPOS=26,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.89,52.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,21:0.125,0.747:27:1,1,9:2,2,10:0,3,0,24
chr1	155747369	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.139:27:7,2:10,1:16,8,1,2
chr1	155753676	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,4,6
chr1	155755239	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr1	155785578	.	CAACT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,18:0,10:0,0,24,4
chr1	155822971	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	155823002	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	155870416	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,5:0,0,2,16
chr1	155880760	.	C	CA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=86.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,3,20
chr1	155883864	.	T	TTG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:7,1:0|1:155883864_T_TTG:155883864:19,0,2,0
chr1	155883867	.	TGC	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:8,2:0|1:155883864_T_TTG:155883864:20,0,2,0
chr1	155883872	.	AGAAGAGTCACTGAGGGT	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:10,0:11,2:0|1:155883864_T_TTG:155883864:32,2,2,0
chr1	155891518	.	A	AGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=200,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:2,1:13,1:0|1:155891518_A_AGG:155891518:7,8,0,2
chr1	155891519	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=200,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:2,1:13,1:0|1:155891518_A_AGG:155891518:7,8,0,2
chr1	155899020	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,15,3
chr1	155903408	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,6:0,20:0,0,10,16
chr1	155917880	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=103.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,14:0,17:0,0,2,32
chr1	155928232	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0|1:155928232_T_C:155928232:0,0,7,9
chr1	155928242	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,8:0,3:0|1:155928232_T_C:155928232:0,0,3,10
chr1	155928298	.	C	CAGTTCCAAAATCACTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=151,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	155936789	.	CCC	ATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	155948297	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:0,0:2,2:1,2,1,1
chr1	155981489	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	155981587	.	A	ATCATGAAGT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=156,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:0|1:155981587_A_ATCATGAAGT:155981587:10,4,1,1
chr1	155981596	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=133,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,2:11,0:0|1:155981587_A_ATCATGAAGT:155981587:13,4,1,1
chr1	155990584	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.351:6:1,0:2,0:0|1:155990584_C_A:155990584:3,1,2,0
chr1	155990587	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.308:7:2,0:2,0:0|1:155990584_C_A:155990584:4,1,2,0
chr1	155990591	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.308:7:2,0:3,0:0|1:155990584_C_A:155990584:4,1,2,0
chr1	155990596	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.308:7:2,0:3,0:0|1:155990584_C_A:155990584:4,1,2,0
chr1	156021728	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156021728_T_C:156021728:0,0,0,1
chr1	156021731	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156021728_T_C:156021728:0,0,0,1
chr1	156021732	.	CACT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156021728_T_C:156021728:0,0,0,1
chr1	156028218	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=14,18;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.294:12:1,0:3,1:1,8,0,3
chr1	156051888	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156051888_G_A:156051888:0,1,0,1
chr1	156051889	.	GGTGTGT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:156051888_G_A:156051888:0,1,0,1
chr1	156132909	.	GCA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:2,5,2,3
chr1	156146218	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,9,8
chr1	156169610	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr1	156182710	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:1,0,7,1
chr1	156195246	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=222,220;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:156195246_A_C:156195246:3,0,1,0
chr1	156195253	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,18;MFRL=222,220;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,0:0|1:156195246_A_C:156195246:3,0,1,0
chr1	156202173	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:5,6:1,6:1,5,6,6
chr1	156203572	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:2,1:1,1:0,6,0,3
chr1	156214251	.	CCTCTGGGCCTGCTACTCCCCCATAAATTGAGAAT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156214251_CCTCTGGGCCTGCTACTCCCCCATAAATTGAGAAT_C:156214251:0,0,0,1
chr1	156214289	.	AAAC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156214251_CCTCTGGGCCTGCTACTCCCCCATAAATTGAGAAT_C:156214251:0,0,0,1
chr1	156219450	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,8:0,0,17,1
chr1	156230141	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	156230206	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,8:0,0,13,2
chr1	156231266	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr1	156255833	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	156256135	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,39;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,1:12,1:9,13,1,1
chr1	156261491	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	156264676	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:14,2:15,0:10,19,2,0
chr1	156287403	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	156304782	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=214,211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:0|1:156304782_A_G:156304782:0,1,0,4
chr1	156304784	.	A	ACAGACCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=211,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:156304782_A_G:156304782:0,4,0,1
chr1	156351066	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	156437348	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:21,3:19,0:39,1,3,0
chr1	156446242	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,11:0,0,15,8
chr1	156496188	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	156498384	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=124,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,0:11,3:7,14,1,2
chr1	156502756	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:7,2,0,2
chr1	156502973	.	A	ACACTCTCTCAGGCTCTGTTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.474:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	156503541	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,11:0,0,13,3
chr1	156505063	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:2,12,1,1
chr1	156509552	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	156510582	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:14,2:12,0:16,10,2,0
chr1	156520173	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,1:0,11:0,0,1,11
chr1	156526234	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	156531871	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	156532344	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,14,2
chr1	156532908	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,14:0,0,16,13
chr1	156534525	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,12:0,0,3,21
chr1	156534539	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,7:0,0,3,17
chr1	156536123	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=104.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,10:0,12:0|1:156536123_T_C:156536123:0,0,22,2
chr1	156536133	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=123.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.970:30:0,13:0,16:0|1:156536123_T_C:156536123:0,0,25,5
chr1	156536353	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=62.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,13:0,5:0,0,1,17
chr1	156539154	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=93.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,15:0,0,17,11
chr1	156539329	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=232,153;MMQ=47,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:156539329_T_G:156539329:1,4,0,2
chr1	156539335	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=203,153;MMQ=44,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:156539329_T_G:156539329:0,4,0,2
chr1	156553762	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	156562008	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,6,15
chr1	156562143	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,5:0,0,11,3
chr1	156563898	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,7,15
chr1	156564922	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,6,1
chr1	156565049	.	A	AAC	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=313.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,40:0,28:0,0,46,28
chr1	156566111	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:6,2:2,4:8,0,6,1
chr1	156593462	.	ACTG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:156593462_ACTG_A:156593462:0,3,0,1
chr1	156593465	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:1,1:1,0:1|0:156593462_ACTG_A:156593462:0,2,0,1
chr1	156593468	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:156593462_ACTG_A:156593462:0,3,0,1
chr1	156593470	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:156593462_ACTG_A:156593462:0,3,0,1
chr1	156593472	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:156593462_ACTG_A:156593462:0,3,0,1
chr1	156594656	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	156617560	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	156617965	.	CCCGGGG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=273,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.406:3:0,1:2,0:0|1:156617965_CCCGGGG_C:156617965:0,2,0,1
chr1	156617968	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=348,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:156617965_CCCGGGG_C:156617965:0,1,0,1
chr1	156617974	.	TCTGCAGGA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=213,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:156617965_CCCGGGG_C:156617965:0,3,0,1
chr1	156626920	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	156640156	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,3,4
chr1	156640678	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr1	156645003	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,71;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:14,3:7,0:15,6,1,2
chr1	156670545	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr1	156675066	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr1	156704328	.	CT	C,CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=19,20,28;MFRL=118,140,147;MMQ=53,60,60;MPOS=27,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.77,5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.346,0.342:6:0,1,1:0,0,1:0,2,0,4
chr1	156706559	.	A	C,G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34,24;MFRL=0,151,131;MMQ=60,60,60;MPOS=7,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.58,23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,9:0.250,0.682:12:0,2,6:0,0,3:0,0,3,9
chr1	156707775	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=91.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,12:0,0,22,5
chr1	156713269	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=134,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,3:0.060:64:32,3:26,0:0|1:156713269_G_A:156713269:29,32,2,1
chr1	156713274	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=134,86;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.058:67:34,3:28,0:0|1:156713269_G_A:156713269:30,34,2,1
chr1	156721032	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:3,3:1,1:4,0,5,0
chr1	156722020	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:7,2:19,0:11,15,0,2
chr1	156752231	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	156785650	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=135,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:17,0:13,2:0|1:156785650_T_A:156785650:12,21,1,1
chr1	156785657	.	C	CTACCACTCACT	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=141,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:14,0:15,2:0|1:156785650_T_A:156785650:12,22,1,1
chr1	156785762	.	AG	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=113.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,13:0,11:0|1:156785762_AG_A:156785762:0,0,19,7
chr1	156785771	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=116.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,14:0,11:0|1:156785762_AG_A:156785762:0,0,21,6
chr1	156785779	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=112.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.965:26:0,12:0,10:0|1:156785762_AG_A:156785762:0,0,21,5
chr1	156814385	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,2:12,0:12,13,1,1
chr1	156814478	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=73.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,10,11
chr1	156815668	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=21,13;MFRL=180,222;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.256:18:2,0:5,0:9,5,4,0
chr1	156815705	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,13;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.369:16:3,1:2,0:9,1,6,0
chr1	156818647	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=15736332,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	156838141	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr1	156844188	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=111,59;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:3,1:13,1:5,11,0,2
chr1	156875092	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,2,0
chr1	156875097	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,2,0
chr1	156875107	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:156875092_G_A:156875092:0,0,2,1
chr1	156875985	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	156876737	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	156877457	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=240.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.987:69:0,36:0,32:0,0,26,43
chr1	156883796	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.191:14:3,2:6,0:6,6,2,0
chr1	156893837	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:4,0:0|1:156893837_G_C:156893837:1,17,2,0
chr1	156893843	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:4,0:0|1:156893837_G_C:156893837:2,20,2,0
chr1	156893847	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:17,2:5,0:0|1:156893837_G_C:156893837:2,21,2,0
chr1	156893850	.	CTT	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,2:5,0:0|1:156893837_G_C:156893837:2,21,2,0
chr1	156894355	.	C	CGGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:156894355_C_CGGA:156894355:0,1,1,0
chr1	156894356	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,11;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:156894355_C_CGGA:156894355:0,1,1,0
chr1	156894363	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:156894355_C_CGGA:156894355:0,1,1,0
chr1	156894367	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=158,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,1:0|1:156894355_C_CGGA:156894355:2,1,1,0
chr1	156909772	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156909772_GC_G:156909772:0,0,0,1
chr1	156909775	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156909772_GC_G:156909772:0,0,0,1
chr1	156914240	.	C	CCATT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CATT;STR;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.634:9:2,3:1,2:0,3,0,6
chr1	156926172	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:2,1:14,0:0|1:156926172_A_G:156926172:13,3,2,0
chr1	156926175	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:1,1:14,1:0|1:156926172_A_G:156926172:13,3,2,0
chr1	156933490	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=300,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:156933490_A_T:156933490:0,1,0,1
chr1	156933497	.	T	TAGCTGAGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=300,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:156933490_A_T:156933490:0,1,0,1
chr1	157062364	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr1	157485561	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:6,2:3,7:1,9,7,2
chr1	157485720	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,10:0,0,6,17
chr1	157491173	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=206,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	157504747	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	157508801	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=130,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	157508975	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:8,1:14,1:10,12,1,1
chr1	157519210	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=161,134;MMQ=60,47;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:16,2:26,0:42,0,2,0
chr1	157522016	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr1	157545231	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr1	157548669	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,9:0,0,8,18
chr1	157557957	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	157566019	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,16,0
chr1	157566211	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=93.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,17:0,9:0,0,3,24
chr1	157646631	.	C	CCTGACAGGA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,36;MFRL=170,113;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:157646631_C_CCTGACAGGA:157646631:0,2,0,1
chr1	157646634	.	G	GTATTTACTTGAGA	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=170,113;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:157646631_C_CCTGACAGGA:157646631:0,2,0,1
chr1	157646638	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=128,113;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	157646642	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,26;MFRL=128,113;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:157646631_C_CCTGACAGGA:157646631:0,1,0,1
chr1	157646645	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=128,113;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:157646631_C_CCTGACAGGA:157646631:0,1,0,1
chr1	157646647	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=36,30;MFRL=128,113;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:157646631_C_CCTGACAGGA:157646631:0,1,0,1
chr1	157646659	.	AGG	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:157646659_AGG_A:157646659:0,0,0,1
chr1	157646664	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=23,30;MFRL=224,128;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:157646659_AGG_A:157646659:0,1,0,1
chr1	157652929	.	TA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=54.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.560:41:8,18:10,5:17,1,23,0
chr1	157668378	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.575:38:5,10:10,10:4,12,8,14
chr1	157668390	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.477:38:8,7:11,11:7,13,5,13
chr1	157669580	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,6:6,2:2,8,0,8
chr1	157718231	.	C	CAAAT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=212,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=AAAT;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.495:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	157718283	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=96.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,13:0,0,21,5
chr1	157718325	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,24:0.641:37:7,16:6,8:10,3,10,14
chr1	157718430	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:4,5:7,9:0,11,3,11
chr1	157718645	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,8:3,2:5,1,6,4
chr1	157718780	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=113,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.586:10:2,3:2,3:0,4,0,6
chr1	157718835	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.299:9:1,2:5,0:1,6,0,2
chr1	157737504	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	157740186	.	GTC	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,6:0,12:0|1:157740186_GTC_G:157740186:0,0,14,6
chr1	157740189	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=84.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.956:20:0,6:0,12:0|1:157740186_GTC_G:157740186:0,0,14,6
chr1	157802979	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,3:7,2:9,2,5,0
chr1	157806006	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	157811392	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:5,4:10,7:11,5,11,0
chr1	157811585	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:0,3:3,6:0,3,0,9
chr1	158056299	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:5,0,7,0
chr1	158057691	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:3,4,1,4
chr1	158058109	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=108,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.544:33:6,6:8,11:12,3,12,6
chr1	158063222	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr1	158064107	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.168:40:15,0:10,0:20,14,6,0
chr1	158151218	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:9,5:3,2:10,2,2,5
chr1	158153996	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr1	158227367	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=158,127;MMQ=60,26;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:24,0:18,3:23,20,0,3
chr1	158262497	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:11,2:11,12,1,1
chr1	158262734	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	158298679	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.197:32:11,2:13,3:23,3,5,1
chr1	158325709	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,142;MMQ=41,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,27:0.529:51:16,14:8,13:12,12,15,12
chr1	158368392	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=119,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:6,9:12,9:9,9,10,8
chr1	158389659	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:2,3:8,10:7,3,12,1
chr1	158389693	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,25:0.443:57:9,7:21,18:16,16,13,12
chr1	158390315	.	C	CT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=147,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.110:42:19,0:19,4:18,20,1,3
chr1	158435278	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr1	158436299	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:11,5:8,7:4,15,3,10
chr1	158436354	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr1	158517977	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	158549421	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:6,7:7,10:6,7,6,11
chr1	158584091	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.596:15:4,3:1,5:0,6,2,7
chr1	158584103	.	G	GA,GAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=9,18,13;MFRL=160,161,180;MMQ=60,60,60;MPOS=24,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=6.49,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,2:0.522,0.243:10:1,1,0:0,1,0:0,3,1,6
chr1	158587784	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=157.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,26:0,17:0,0,37,7
chr1	158588916	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	158595824	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=174,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,5:4,1:5,1,6,0
chr1	158595842	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,9:7,2:10,1,10,1
chr1	158606449	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:6,4:3,5:6,3,5,4
chr1	158607788	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	158609300	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=193,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:3,0,4,0
chr1	158614198	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,4:4,1:6,4,3,2
chr1	158624528	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,3:0,9:0,0,1,11
chr1	158627254	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,12;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.317:10:3,0:3,0:0,7,3,0
chr1	158639601	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	158644105	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,9,4
chr1	158647631	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,10:0,0,6,12
chr1	158653164	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=107,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:10,2:17,0:21,6,2,0
chr1	158655162	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr1	158656347	.	C	CAGAG	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=AG;STR;TLOD=57.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.888:19:2,8:0,3:0,2,0,17
chr1	158735475	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=180,82;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:158735475_GT_G:158735475:7,2,1,1
chr1	158735483	.	CTGGG	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=187,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:158735475_GT_G:158735475:7,2,1,1
chr1	158735488	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=187,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:158735475_GT_G:158735475:7,2,1,1
chr1	158815298	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=200,161;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:2,2:9,0:11,0,2,0
chr1	158815319	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=190,161;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,2:13,0:19,0,2,0
chr1	158817474	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr1	158909164	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,13,1
chr1	158913525	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=131.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,28,9
chr1	158986225	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr1	158987941	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,17,1
chr1	158990412	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	159002222	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	159002301	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=107.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,13:0,18:0,0,29,2
chr1	159002557	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.970:24:0,12:0,12:0|1:159002557_A_G:159002557:0,0,0,24
chr1	159002577	.	TGGATTG	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.963:18:0,7:0,10:0|1:159002557_A_G:159002557:0,0,0,18
chr1	159043091	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:21,1:24,2:26,20,2,1
chr1	159163119	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	159174824	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=131.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,24:0,12:0,0,24,13
chr1	159174877	.	TCCC	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=153,187;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:0,16,0,2
chr1	159174884	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,1:5,2:0,13,0,3
chr1	159174886	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:4,2:0,14,0,2
chr1	159272764	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:4,4:0,9,1,8
chr1	159275706	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=200,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr1	159277542	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.429:35:9,8:11,6:13,7,11,4
chr1	159284542	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0|1:159284542_G_GC:159284542:0,0,0,1
chr1	159284544	.	A	AGTT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159284542_G_GC:159284542:0,0,0,1
chr1	159284545	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159284542_G_GC:159284542:0,0,0,1
chr1	159284547	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159284542_G_GC:159284542:0,0,0,1
chr1	159409533	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,15:0,9:0,0,20,5
chr1	159409734	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,8,13
chr1	159684186	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:9,5:8,4:10,7,6,3
chr1	159752066	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.521:27:3,4:9,10:7,6,6,8
chr1	159783184	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=156,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:6,1,1,1
chr1	159799599	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=37.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,4:0,0,8,7
chr1	159825061	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=135,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:2,2:1,6,0,4
chr1	159828128	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=139,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,4:5,5:1,8,0,9
chr1	159842379	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,6:4,6:1,7,3,9
chr1	159854392	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr1	159856577	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=220,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	159858290	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:4,2:0,2:1,4,0,4
chr1	159863105	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:13,0:6,4:6,13,0,4
chr1	159869820	.	A	C	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=132,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,11:0.192:59:17,3:23,0:11,37,11,0
chr1	159869825	.	C	G	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.079:57:16,0:25,0:15,37,5,0
chr1	159869829	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=143,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,5:0.063:67:19,0:29,0:18,44,5,0
chr1	159888585	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:12,1:3,1:16,2,0,3
chr1	159889686	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:2,3:2,3:0,4,1,6
chr1	159897126	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,22:0.324:69:20,9:25,13:37,10,16,6
chr1	159897388	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=156,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,4:7,1:0,11,0,5
chr1	159897681	.	TAA	T,TA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,20,30;MFRL=0,139,142;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=6.74,21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,11:0.309,0.648:16:0,2,5:0,1,4:0,0,0,16
chr1	159899193	.	C	CTGTGA	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=132,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.052:55:22,2:26,0:0|1:159899193_C_CTGTGA:159899193:14,39,1,1
chr1	159899195	.	T	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=132,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.052:55:22,2:28,0:0|1:159899193_C_CTGTGA:159899193:14,39,1,1
chr1	159902526	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=205,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,0:1,2:0,2,0,2
chr1	159906517	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.367:39:11,6:13,8:17,8,5,9
chr1	159907687	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:3,0:5,3:2,6,0,4
chr1	159912993	.	G	GTATTGGT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159912993_G_GTATTGGT:159912993:0,0,0,1
chr1	159912995	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:159912993_G_GTATTGGT:159912993:0,0,0,1
chr1	159912997	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=194,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:159912993_G_GTATTGGT:159912993:1,0,0,1
chr1	159913000	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,16;MFRL=194,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:159912993_G_GTATTGGT:159912993:1,0,0,1
chr1	159922369	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	160064592	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=192,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:5,0,7,0
chr1	160090649	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:2,2:5,2:8,0,4,0
chr1	160090674	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,17,2
chr1	160090681	.	CCCTT	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,10:0,0,18,2
chr1	160093222	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr1	160093294	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=163,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:160093294_G_T:160093294:0,4,0,1
chr1	160093299	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:160093294_G_T:160093294:0,3,0,1
chr1	160093911	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr1	160095127	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	160097666	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:160097666_G_A:160097666:0,0,0,6
chr1	160097689	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=201,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:160097666_G_A:160097666:0,3,0,1
chr1	160097690	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=201,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:160097666_G_A:160097666:0,3,0,1
chr1	160098927	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,4,7
chr1	160105830	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0,7,2,0
chr1	160106877	.	C	CAGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.219:7:3,1:2,0:0|1:160106877_C_CAGT:160106877:1,5,0,1
chr1	160106878	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.222:7:3,1:2,0:0|1:160106877_C_CAGT:160106877:1,5,0,1
chr1	160121746	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr1	160122068	.	A	ACTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=226,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	160124904	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.277:22:7,0:9,0:2,14,6,0
chr1	160128994	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	160137300	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	160140998	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,13:0,0,20,4
chr1	160141285	.	CC	TG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=105,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,7:0,7:0,1,2,12
chr1	160144614	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,1:6,2:0,6,0,3
chr1	160146173	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=235,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr1	160146382	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,1195;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,0:5,2:5,8,2,0
chr1	160147502	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,3:0|1:160147502_T_G:160147502:0,0,0,14
chr1	160147510	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,8:3,1:0|1:160147502_T_G:160147502:0,5,0,9
chr1	160151421	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=134,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,3:1,8:3,0,8,3
chr1	160151450	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,12,9
chr1	160151624	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=42.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,8:0,5:0,0,5,9
chr1	160160801	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:1,5:5,6:3,4,4,7
chr1	160163446	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,2:0,7:0,0,10,0
chr1	160163449	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,0:5,3:10,0,3,0
chr1	160163509	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,10:3,4:5,1,13,1
chr1	160168368	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=193,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr1	160178356	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr1	160251792	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=115,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:6,4:1,4:4,3,7,1
chr1	160252001	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:3,4:0,5,1,6
chr1	160263124	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.505:37:7,6:11,10:13,5,10,9
chr1	160263286	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.577:14:3,4:3,4:1,5,1,7
chr1	160268981	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.530:49:10,15:13,11:12,11,13,13
chr1	160275425	.	TC	GG	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.089:41:10,1:22,0:0|1:160275425_TC_GG:160275425:31,6,0,4
chr1	160275431	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,5:0.101:41:9,0:22,0:0|1:160275425_TC_GG:160275425:31,5,0,5
chr1	160275434	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=391,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=131.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.958:44:0,12:1,23:0,1,31,12
chr1	160295462	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,20:0.389:52:18,12:14,8:8,24,1,19
chr1	160309664	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,3:6,4:9,2,5,2
chr1	160313330	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.405:40:14,3:10,13:3,21,1,15
chr1	160318940	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:2,5:5,7:2,5,4,8
chr1	160318984	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,0:2,5:0,4,0,5
chr1	160320938	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,5:4,3:9,0,8,0
chr1	160321796	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,112;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,0:8,2:12,3,2,0
chr1	160323903	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=152,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.357:20:9,4:3,2:7,6,6,1
chr1	160326778	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,1:14,1:22,3,2,0
chr1	160342162	.	C	CTTAT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTAT;STR;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,3:2,10:4,1,9,5
chr1	160458782	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	160519812	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=57.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0|1:160519812_C_CA:160519812:0,0,1,12
chr1	160519815	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0|1:160519812_C_CA:160519812:0,0,1,12
chr1	160535542	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:3,17,0,2
chr1	160582200	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:2,0:3,3:3,2,3,0
chr1	160616768	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.427:38:8,9:13,7:4,18,3,13
chr1	160650913	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr1	160721958	.	G	GT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=151,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:25,2:16,1:39,2,3,0
chr1	160722064	.	A	G	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=301.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,87:0.989:87:0,39:0,48:0,0,18,69
chr1	160766179	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr1	160783325	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=278,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	160784606	.	CTCTGCTG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.399:3:1,1:1,0:0|1:160784606_CTCTGCTG_C:160784606:0,2,0,1
chr1	160784617	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:160784606_CTCTGCTG_C:160784606:0,1,0,1
chr1	160784622	.	AC	TC,A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28,28;MFRL=0,152,157;MMQ=60,60,60;MPOS=-5,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr1	160784624	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:160784606_CTCTGCTG_C:160784606:0,1,0,1
chr1	160789196	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	160793988	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=140,62;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,0:11,2:14,9,0,2
chr1	160803802	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.399:35:5,5:15,7:11,10,7,7
chr1	160808935	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	160849030	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr1	160849060	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0|1:160849060_G_A:160849060:0,0,12,3
chr1	160849082	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=78.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0|1:160849060_G_A:160849060:0,0,14,7
chr1	160850280	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr1	160850936	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,8,3
chr1	160852022	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,3,12
chr1	160852046	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr1	160854526	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	160854738	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=105,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:160854738_C_T:160854738:2,2,0,1
chr1	160854741	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=71,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:160854738_C_T:160854738:1,2,0,1
chr1	160854744	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=71,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:160854738_C_T:160854738:1,2,0,1
chr1	160854745	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=105,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:160854738_C_T:160854738:0,2,0,1
chr1	160854747	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=139,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:160854738_C_T:160854738:0,1,0,1
chr1	160920809	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=150,152;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,18:0.731:24:3,11:3,7:0|1:160920809_A_G:160920809:5,1,15,3
chr1	160920813	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=112.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0|1:160920809_A_G:160920809:0,0,20,7
chr1	160924672	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	160969585	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr1	161010774	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	161011016	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=193,147;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:0,0:8,2:8,0,2,0
chr1	161011716	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	161013121	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=126.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,18:0,17:0,0,13,26
chr1	161022380	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr1	161022613	.	G	GAGATGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:161022613_G_GAGATGT:161022613:0,3,0,1
chr1	161022614	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:161022613_G_GAGATGT:161022613:0,3,0,1
chr1	161022639	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr1	161023252	.	TTCTCTCTCTC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=22,17;RU=TC;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.722:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	161044056	.	GCAC	G	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=127,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAC;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.069:54:22,0:24,3:28,23,2,1
chr1	161049358	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr1	161089450	.	C	CTAAACT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr1	161126975	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.664:28:3,10:6,7:7,2,17,2
chr1	161131949	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=17,19;MFRL=189,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.313:15:1,0:2,1:2,9,0,4
chr1	161133468	.	G	GAAAGTCAGCCATTTCACTGGGTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.471:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr1	161134340	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=107,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:13,0:10,3:10,13,2,1
chr1	161136843	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.571:21:4,7:4,5:9,0,9,3
chr1	161143312	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:9,0,5,0
chr1	161144908	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:18,0:17,2:13,22,1,1
chr1	161144965	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:4,1:12,6:6,10,2,5
chr1	161160872	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr1	161161449	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	161163633	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.572:14:3,6:2,2:1,5,3,5
chr1	161166723	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr1	161167698	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,3:5,0,6,0
chr1	161167989	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:4,4:6,4:5,6,2,7
chr1	161176137	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,2:3,2:7,2,4,0
chr1	161178901	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:9,0,2,0
chr1	161179877	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,7:3,4:5,1,10,1
chr1	161182281	.	G	GAGAAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	161182293	.	G	GAGAATAATGGAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	161188700	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:16,1:16,1:21,11,2,0
chr1	161192845	.	CCACACACACACA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=143,167;MMQ=54,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=19,13;RU=CA;STR;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.724:8:0,2:1,3:0,2,2,4
chr1	161200586	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,5:2,5:2,1,8,3
chr1	161201350	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=115,166;MMQ=57,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,6:0,2:0|1:161201350_G_T:161201350:0,1,0,9
chr1	161201352	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0|1:161201350_G_T:161201350:0,0,0,9
chr1	161203215	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	161254255	.	A	G	.	.	DP=94;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:88,3:0.043:91:41,1:46,2:0|1:161254255_A_G:161254255:31,57,0,3
chr1	161254280	.	G	C	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,31:0.545:57:14,16:12,13:0|1:161254255_A_G:161254255:5,21,6,25
chr1	161276434	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.957:20:0,10:0,9:0|1:161276434_A_G:161276434:0,0,18,2
chr1	161276438	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=141,152;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.201:21:7,3:10,0:0|1:161276434_A_G:161276434:15,2,4,0
chr1	161276802	.	A	ACTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	161284108	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=196,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:1,0:9,0,2,0
chr1	161284297	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=74.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,11:0,0,7,15
chr1	161332091	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=33,32,32,32;MFRL=140,142,157,151;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,12,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.42,19.98,14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:40,6,13,12:0.076,0.192,0.171:71:18,4,9,4:21,2,4,4:36,4,27,4
chr1	161475798	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=124,82987;MMQ=60,31;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:15,2:13,0:14,14,0,2
chr1	161476204	.	CA	TG	.	.	DP=123;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,155;MMQ=60,51;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=185.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,50:0.429:117:21,23:44,19:36,31,24,26
chr1	161479599	.	G	A	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=135,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,37:0.371:100:23,16:39,20:51,12,29,8
chr1	161479745	.	A	G	.	.	DP=141;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=162.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,63:0.490:128:40,22:24,38:38,27,35,28
chr1	161496010	.	T	G	.	.	DP=121;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,144;MMQ=57,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=164.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,60:0.530:115:24,28:20,31:26,29,24,36
chr1	161518159	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=201,195;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.233:24:9,1:8,4:19,0,5,0
chr1	161518172	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=193,193;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,4:8,4:13,0,8,0
chr1	161519396	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=153,186;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:13,0,2,0
chr1	161519411	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=140,155;MMQ=33,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:6,7:7,4:13,0,9,2
chr1	161519476	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=165,143;MMQ=52,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.127:53:22,3:24,3:29,18,4,2
chr1	161559327	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=75.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,12:0,0,18,7
chr1	161561287	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=155,158;MMQ=52,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	161594226	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,14:0,0,25,4
chr1	161594246	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,17:0,16:0,0,25,8
chr1	161594525	.	GT	CG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,9:0,0,0,16
chr1	161596278	.	C	CAGTTCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=156,214;MMQ=30,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:161596278_C_CAGTTCT:161596278:0,4,0,1
chr1	161596280	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=156,214;MMQ=30,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:161596278_C_CAGTTCT:161596278:0,4,0,1
chr1	161596283	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	161599516	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	161599643	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,24;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	161600104	.	A	T	.	.	DP=123;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,119;MMQ=49,33;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:113,7:0.059:120:59,2:53,4:76,37,7,0
chr1	161600744	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	161600787	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,37;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr1	161600792	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.834:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	161600995	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=182.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,29:0,23:0,0,21,34
chr1	161644976	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=11,31;MFRL=190,150;MMQ=52,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.960:27:0,14:0,10:1,0,22,4
chr1	161680159	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:1,8:4,4:7,0,10,2
chr1	161680413	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,1,1
chr1	161680607	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:161680607_G_T:161680607:9,8,1,1
chr1	161680613	.	C	CATTCA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,17;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:11,0:4,1:0|1:161680607_G_T:161680607:7,8,1,1
chr1	161681661	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	161721402	.	GT	G,GTT	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=34,35,32;MFRL=160,193,184;MMQ=60,60,60;MPOS=18,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.64,5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:40,4,7:0.091,0.136:51:21,1,5:18,3,2:38,2,11,0
chr1	161722272	.	C	A	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,28:0.392:71:28,10:15,16:9,34,4,24
chr1	161722779	.	C	CA,CAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=159,76,147;MMQ=60,56,45;MPOS=25,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.51,13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,4:0.205,0.351:12:1,2,1:5,0,3:6,0,6,0
chr1	161748056	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,4:6,6:6,5,6,4
chr1	161753802	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.605:36:8,12:6,10:13,1,14,8
chr1	161753841	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,24:0.556:43:12,11:7,13:11,8,13,11
chr1	161753917	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.589:22:3,8:5,5:0,9,2,11
chr1	161761276	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.702:18:1,6:4,7:3,2,3,10
chr1	161761312	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.788:17:1,7:2,6:1,2,1,13
chr1	161762190	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=195,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:161762190_T_C:161762190:2,0,0,1
chr1	161762192	.	A	AGAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=195,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:161762190_T_C:161762190:2,0,0,1
chr1	161789625	.	C	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=101.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,34:0.605:56:9,11:12,22:8,14,9,25
chr1	161822959	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	161823011	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,1:7,1:11,3,2,0
chr1	161823197	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	161829973	.	CT	C,CTT	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=33,32,33;MFRL=163,168,169;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=6.70,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:58,10,5:0.111,0.069:73:32,4,2:22,5,2:52,6,13,2
chr1	161976234	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr1	161976272	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	161976309	.	C	CAAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,36;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:161976309_C_CAAT:161976309:0,1,0,1
chr1	161976312	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:161976309_C_CAAT:161976309:0,1,0,1
chr1	162313597	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=132.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,22:0,15:0,0,24,14
chr1	162335052	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr1	162335387	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=121,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:162335387_TTC_T:162335387:0,1,0,1
chr1	162335397	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:162335387_TTC_T:162335387:0,0,0,1
chr1	162344471	.	A	AATACAGGGCGAGATTGCG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:162344471_A_AATACAGGGCGAGATTGCG:162344471:0,3,0,1
chr1	162344474	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:162344471_A_AATACAGGGCGAGATTGCG:162344471:0,3,0,1
chr1	162344507	.	GTTA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	162345199	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.446:41:9,7:12,11:11,12,5,13
chr1	162348662	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,13:0,4:0,0,13,5
chr1	162351586	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,4:6,7:12,0,11,0
chr1	162352941	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,4:2,6:5,2,6,4
chr1	162367235	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	162381833	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:1,7,3,2
chr1	162470961	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=141,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:0,0:0,2,0,2
chr1	162558705	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:0,2,0,6
chr1	162722846	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	162725655	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	162731149	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:20,1:12,1:15,17,1,1
chr1	162742117	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr1	162743418	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr1	162748588	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	162760551	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=148,150;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,28:0.645:43:7,10:8,18:15,0,28,0
chr1	162760554	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=179.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,16:0,27:0,0,43,3
chr1	162766476	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=124,149;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.524:40:9,9:10,12:8,11,6,15
chr1	162775356	.	CCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=192,171;MMQ=52,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	162822771	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,9:0,1:0,0,10,0
chr1	162822807	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=128,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,5:4,2:11,2,6,1
chr1	163038613	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	163038853	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:0,9,1,8
chr1	163117351	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,2:0,5:0,0,1,9
chr1	163122528	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	163187263	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=165,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr1	163297381	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,31:0.387:81:27,19:21,12:13,37,10,21
chr1	163298548	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,5:2,4:5,1,7,2
chr1	163298767	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=16,14;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.187:29:5,0:5,2:4,19,0,6
chr1	163298768	.	T	TA,TAA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,29,21;MFRL=158,154,191;MMQ=60,60,60;MPOS=15,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=7.35,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,7,2:0.376,0.092:19:3,2,0:5,3,1:1,9,0,9
chr1	163307944	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.772:23:3,8:1,10:0,5,3,15
chr1	163309302	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr1	163313695	.	TA	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.096:49:14,0:23,4:2,43,0,4
chr1	163317811	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=85,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr1	164768959	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=123,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,2:7,0:12,9,0,2
chr1	164789444	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr1	165180089	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,16042278;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	165376043	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,6,3
chr1	165376227	.	C	CCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:165376227_C_CCG:165376227:0,0,0,1
chr1	165376231	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:165376227_C_CCG:165376227:0,0,0,1
chr1	165377389	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,11,1
chr1	165378731	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=198,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.386:6:0,1:3,1:0|1:165378731_C_T:165378731:4,0,2,0
chr1	165378733	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=198,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.386:6:0,1:4,1:0|1:165378731_C_T:165378731:4,0,2,0
chr1	165513456	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:165513456_A_T:165513456:0,0,2,0
chr1	165513463	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:165513456_A_T:165513456:0,0,4,0
chr1	165532921	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:8,5,1,1
chr1	165532930	.	G	GTTAATATCAGGATCCTACT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=114,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,0:7,2:5,6,1,1
chr1	165532983	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.140:34:16,4:12,0:17,13,3,1
chr1	165601365	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	165621129	.	C	CAAAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,33;RU=A;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,1:0,3:0,0,4,3
chr1	165648807	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=112,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:17,0:15,3:11,21,0,3
chr1	165651502	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,15:0,0,1,19
chr1	165652445	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	165712554	.	AG	A	.	.	DP=70;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,7:0.103:63:27,2:20,5:13,43,0,7
chr1	165712555	.	G	A,C	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=32,30,19;MFRL=131,161,160;MMQ=60,60,60;MPOS=4,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.30,12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,11,14:0.184,0.260:57:15,3,0:9,5,2:13,19,0,25
chr1	165712556	.	A	C	.	.	DP=65;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,7:0.107:63:28,0:23,0:13,43,0,7
chr1	165721223	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,0:2,4:3,0,3,1
chr1	165859630	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,5,14
chr1	165865547	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:11,1:5,1:7,10,0,2
chr1	166039953	.	A	AGGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=121,172;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr1	166124134	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	166135442	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=167,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr1	166819618	.	ACAC	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:1,1:2,0:0|1:166819618_ACAC_A:166819618:0,3,0,1
chr1	166819623	.	GAAAGC	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:166819618_ACAC_A:166819618:0,3,0,1
chr1	166819641	.	A	AGTC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=236,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:166819641_A_AGTC:166819641:0,1,0,1
chr1	166819642	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=236,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:166819641_A_AGTC:166819641:0,1,0,1
chr1	166819646	.	AA	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=236,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:166819641_A_AGTC:166819641:0,1,0,1
chr1	166826773	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,10:0,0,23,3
chr1	166831404	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,15,3
chr1	166831703	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	166833199	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=95.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,18:0,9:0,0,0,27
chr1	166961951	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=141,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:9,0:15,6,2,0
chr1	167024422	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=187,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:167024422_A_AG:167024422:0,1,0,1
chr1	167024424	.	C	CTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=187,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:167024422_A_AG:167024422:0,1,0,1
chr1	167059575	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr1	167082869	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	167096982	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,2:4,2:1,6,1,3
chr1	167307356	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:8,1,2,0
chr1	167353258	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=51.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.961:20:0,13:0,4:0,0,1,19
chr1	167367193	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:3,2:4,1:4,3,3,1
chr1	167381640	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	167382374	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,15:0,6:0,0,11,10
chr1	167382399	.	AGTGT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=104,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=GT;STR;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.745:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	167385324	.	TAA	T,TA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,30,26;MFRL=159,174,143;MMQ=60,60,60;MPOS=15,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=A;STR;TLOD=7.39,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,3:0.377,0.255:13:2,2,1:1,2,1:0,5,0,8
chr1	167385339	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=173,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,1:4,1:0|1:167385339_A_AG:167385339:0,13,0,2
chr1	167385342	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=174,81;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,1:4,0:0|1:167385339_A_AG:167385339:0,14,0,2
chr1	167385428	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	167410051	.	A	AAAAAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:167410051_A_AAAAAGG:167410051:1,3,0,1
chr1	167410055	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:167410051_A_AAAAAGG:167410051:1,3,0,1
chr1	167515272	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=202,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,4:1,4:3,1,6,2
chr1	167515603	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=178,196;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:167515603_G_A:167515603:0,5,0,2
chr1	167515614	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=209,196;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:1,1:0|1:167515603_G_A:167515603:0,6,0,2
chr1	167515619	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=232,180;MMQ=59,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr1	167666316	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr1	167734717	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:4,0,7,0
chr1	167778843	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=210,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr1	167793670	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=120,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,5:0,4:3,0,7,2
chr1	167794130	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:2,2:2,4:0,4,0,7
chr1	167806647	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	167814733	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,4:3,3:3,0,7,0
chr1	167823512	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,2:6,0,3,1
chr1	167847584	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	167849318	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:2,4:10,4:10,2,8,0
chr1	167889140	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,5:0.078:67:22,5:39,0:62,0,5,0
chr1	167889145	.	CA	C,CAA	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=34,33,34;MFRL=165,180,160;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=9.76,4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:45,10,5:0.151,0.093:60:15,6,1:30,4,3:45,0,14,1
chr1	167893759	.	G	A	.	.	DP=110;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,42:0.410:104:24,26:30,16:39,23,14,28
chr1	167893778	.	GA	G	.	.	DP=100;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,11:0.109:78:27,8:25,2:21,46,3,8
chr1	167905411	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr1	167906280	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.303:36:6,0:10,0:6,18,0,12
chr1	167962753	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:0,8,0,2
chr1	167985057	.	C	T	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=122,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,5:0.065:89:45,5:38,0:24,60,1,4
chr1	167985174	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:16,2:8,0:4,21,0,2
chr1	167992344	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr1	168154020	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:17,5,1,1
chr1	168161538	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=181,243;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:168161538_C_G:168161538:0,3,0,1
chr1	168161540	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=181,243;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:168161538_C_G:168161538:0,3,0,1
chr1	168165767	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,1:7,1:9,1,2,0
chr1	168200733	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:4,7:7,10:11,0,17,0
chr1	168206118	.	GTTTAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTAA;STR;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	168208308	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.527:30:6,8:8,8:9,5,11,5
chr1	168260571	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=181,69;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:15,2:18,0:23,10,2,0
chr1	168274201	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	168282261	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,4,10
chr1	168510122	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=179,176;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:10,4:9,3:19,0,7,0
chr1	168511155	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.490:31:6,9:8,6:16,0,14,1
chr1	168511381	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,1:7,1:0|1:168511381_T_A:168511381:2,18,0,2
chr1	168511383	.	A	AACTGGTACC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,1:7,0:0|1:168511381_T_A:168511381:2,19,0,2
chr1	168549422	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=225.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,34:0,32:0,0,19,48
chr1	168550535	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.578:29:8,7:4,9:0,12,0,17
chr1	168665747	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=110,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,1:4,2:4,6,1,2
chr1	168698455	.	GGTCTGACCGTTTT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:168698455_GGTCTGACCGTTTT_G:168698455:0,0,0,1
chr1	168698470	.	TATAGCTGCC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:168698455_GGTCTGACCGTTTT_G:168698455:0,0,0,1
chr1	168698486	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:168698455_GGTCTGACCGTTTT_G:168698455:0,0,0,1
chr1	169080837	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	169094100	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=118.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,14:0,23:0,0,26,11
chr1	169101935	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,4:1,3:5,1,6,1
chr1	169138868	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	169200111	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:15,1:8,7:0,23,0,8
chr1	169256524	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,34:0.507:67:20,19:13,15:24,9,23,11
chr1	169268023	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:1,3,1,4
chr1	169272299	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:10,8:10,3:20,0,11,0
chr1	169272451	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0|1:169272451_A_T:169272451:0,0,5,32
chr1	169272453	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.974:37:0,18:0,19:0|1:169272451_A_T:169272451:0,0,5,32
chr1	169279196	.	T	TA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=101,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.596:29:5,12:7,5:9,3,14,3
chr1	169279393	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=196,245;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:169279393_T_C:169279393:0,3,0,1
chr1	169279402	.	C	CTTTTGTGTTATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=196,245;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:169279393_T_C:169279393:0,3,0,1
chr1	169345704	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=105,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr1	169351596	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	169388372	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=118,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:10,1:8,0:1,18,1,1
chr1	169388376	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=140,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.145:18:9,2:7,0:0|1:169388376_C_G:169388376:0,16,1,1
chr1	169388381	.	A	ATGTGTCCGTTTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=138,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,2:6,0:0|1:169388376_C_G:169388376:0,15,1,1
chr1	169394226	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,0,24
chr1	169435027	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr1	169447008	.	G	C,T,GA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=18,19,10,17;MFRL=145,142,131,112;MMQ=60,60,60,60;MPOS=28,22,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=5.11,5.52,6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,4,10,5:0.172,0.313,0.232:24:0,0,0,0:0,0,0,0:0,5,0,19
chr1	169455008	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=200,224;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	169483762	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr1	169487821	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,7:3,1:0,5,0,8
chr1	169494196	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:1,3:0,3,0,5
chr1	169498834	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=102.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,20:0,0,18,14
chr1	169509532	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:7,3:13,0:19,2,3,0
chr1	169510475	.	G	T	.	.	DP=118;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=110,119;MMQ=49,45;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,55:0.501:109:24,21:28,29:27,27,27,28
chr1	169511878	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,21:0.512:41:14,10:6,11:9,11,10,11
chr1	169513835	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:169513835_AA_CC:169513835:0,2,0,1
chr1	169513838	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:169513835_AA_CC:169513835:0,2,0,1
chr1	169525808	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	169528384	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:6,5:2,5:8,1,7,3
chr1	169541658	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=242,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:169541658_A_AT:169541658:0,1,0,1
chr1	169541659	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=242,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:169541658_A_AT:169541658:0,1,0,1
chr1	169541660	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=103,242;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	169555367	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,257;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	169559326	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.590:20:4,4:4,6:0|1:169559326_G_A:169559326:7,1,11,1
chr1	169559333	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.564:21:5,5:4,7:0|1:169559326_G_A:169559326:8,1,11,1
chr1	169560727	.	T	TA,TAA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,31,30;MFRL=157,131,149;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=25.18,25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,11,14:0.409,0.499:27:1,4,5:1,2,7:0,2,1,24
chr1	169564130	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.418:17:4,1:4,5:0,10,1,6
chr1	169564167	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:0,4,0,9
chr1	169580972	.	C	CAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	169599254	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,15:0,17:0,0,27,11
chr1	169665632	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:3,2,3,0
chr1	169672595	.	GAA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,18;MFRL=122,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.631:6:1,1:0,0:1,1,1,3
chr1	169678024	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr1	169679472	.	G	GCT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=168,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=54.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.499:32:7,12:9,4:16,0,16,0
chr1	169679553	.	C	T	.	.	DP=106;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=126.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,46:0.476:97:23,24:27,22:42,9,33,13
chr1	169696754	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:3,5,0,5
chr1	169697076	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=230,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:1,6,2,3
chr1	169697166	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=132,81568440;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	169698789	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,2:4,4:2,9,1,5
chr1	169698825	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	169698886	.	TA	AG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=199,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:169698886_TA_AG:169698886:0,4,0,1
chr1	169698890	.	A	ACAGAG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=199,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:169698886_TA_AG:169698886:0,4,0,1
chr1	169698894	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=199,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:169698886_TA_AG:169698886:0,4,0,1
chr1	169699819	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=56,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,5:2,4:0,2,1,8
chr1	169700961	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:7,1,5,1
chr1	169701108	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,3:6,7:2,8,1,9
chr1	169761617	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=222,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,2:7,6:11,0,8,0
chr1	169763046	.	GAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,28;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.316:8:0,1:0,1:0,6,1,1
chr1	169763139	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	169771676	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=173,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,1:10,1:22,0,2,0
chr1	169772285	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:6,1:11,7:14,3,4,4
chr1	169792642	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:10,5:7,3:2,15,2,6
chr1	169792692	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=144,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.593:17:5,3:2,7:2,5,0,10
chr1	169799572	.	C	CTA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,3:4,1:0,8,0,4
chr1	169824068	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.632:22:3,4:4,10:0,8,1,13
chr1	169824104	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=144,187;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,2:1,5:0,2,0,7
chr1	169828098	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=189,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,3:2,1:7,0,4,0
chr1	169828327	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=151,135;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.456:44:11,13:13,7:5,19,11,9
chr1	169828338	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.093:40:17,1:20,2:13,24,1,2
chr1	169831690	.	CTCTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=93,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,4:0,2:4,1,5,1
chr1	169831993	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,1,10
chr1	169835950	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,25,0
chr1	169836175	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.450:36:10,7:9,9:2,18,1,15
chr1	169847683	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	169890933	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,2:4,3:0,5,0,7
chr1	169941761	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:7,5:6,4:1,12,0,10
chr1	169947146	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.540:13:4,5:2,2:6,0,7,0
chr1	169951748	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=173,237;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,2:5,1:10,0,3,0
chr1	169952385	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:5,6:0,2:4,1,6,2
chr1	169993466	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	169993762	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.449:40:12,9:10,8:0,22,1,17
chr1	170004508	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:6,3:10,6:15,1,9,0
chr1	170004707	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=91.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,30:0.704:42:4,12:7,16:1,11,1,29
chr1	170007355	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:8,8:2,1:10,0,9,0
chr1	170115156	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	170501521	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	170511604	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=86.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,13:0,0,23,2
chr1	170521650	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:1,2,0,4
chr1	170927570	.	CTT	C,CT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=134,124,146;MMQ=60,60,60;MPOS=6,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=8.29,19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,8,13:0.236,0.472:30:5,3,7:2,4,2:7,2,18,3
chr1	170993444	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=GT;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	171061990	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	171072862	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,2:6,2:8,0,4,0
chr1	171077165	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.274:16:5,2:7,1:12,0,4,0
chr1	171077198	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=97.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,10:0,18:0,0,22,6
chr1	171077372	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=123,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,5:6,4:1,9,1,8
chr1	171083174	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=109,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.435:23:5,5:8,4:8,5,8,2
chr1	171083242	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=127,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:17,5:5,5:10,12,7,3
chr1	171083546	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=198,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:171083546_G_C:171083546:0,1,0,1
chr1	171083550	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=198,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:171083546_G_C:171083546:0,1,0,1
chr1	171083551	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=198,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:171083546_G_C:171083546:0,1,0,1
chr1	171085314	.	A	AT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.526:32:7,9:8,8:9,6,12,5
chr1	171115567	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,17:0.377:46:16,4:11,13:20,9,11,6
chr1	171115645	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,16:0.350:46:19,8:11,7:9,21,5,11
chr1	171116760	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr1	171227216	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,4:5,4:9,1,4,4
chr1	171251509	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,5:6,3:1,11,2,6
chr1	171302094	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,2,21
chr1	171303925	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=206.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,35:0,25:0,0,25,38
chr1	171311003	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,1,3
chr1	171491264	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=101.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,17:0,0,30,0
chr1	171496868	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=163,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:10,2:18,0:30,0,2,0
chr1	171496875	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.275:31:9,3:12,5:23,0,8,0
chr1	171496895	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=137.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.977:38:0,17:0,20:0,0,33,5
chr1	171504666	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=148,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:11,2:16,1:14,13,1,2
chr1	171509058	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr1	171511442	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	171514848	.	T	TTTTA	.	.	DP=140;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TTTA;STR;TLOD=132.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.979:31:0,17:0,11:0,0,0,31
chr1	171519128	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=158,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,3:6,0,3,0
chr1	171519158	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=14,14;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.312:10:2,0:1,0:7,0,3,0
chr1	171526570	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=233.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,34:0,35:0,0,20,54
chr1	171527322	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,4:0,0,3,13
chr1	171546833	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	171548606	.	G	GAATTGTTCAGCTCCTCACT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=177,595;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.316:4:2,0:1,1:1,2,1,0
chr1	171548617	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr1	171548868	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	171607702	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:6,2:8,5:11,3,7,0
chr1	171621834	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr1	171751051	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=80.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,7:0,16:0,0,22,1
chr1	171755071	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=336,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=111.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.944:33:0,11:1,20:0,1,12,20
chr1	171755182	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=126.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,22:0,15:0,0,21,16
chr1	171761458	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	171763549	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,17:0,10:0,0,14,13
chr1	171765964	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,300;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	171810960	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:1,2,0,2
chr1	172002489	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=150,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0|1:172002489_A_AT:172002489:0,2,0,3
chr1	172002503	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:0,0:1|0:172002489_A_AT:172002489:0,3,0,1
chr1	172011059	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,1:6,1:9,0,2,0
chr1	172013549	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:21,3:43,0:43,22,1,2
chr1	172038079	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:5,2:5,4:3,7,1,6
chr1	172113808	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,2:11,0:5,14,2,0
chr1	172292355	.	C	CTCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=213,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:2,1,1,0
chr1	172356582	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,157;MMQ=40,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,10:1,5:0,2,0,15
chr1	172376809	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=197,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:5,0,6,0
chr1	172411496	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,52;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,19:0,0,22,12
chr1	172412845	.	C	A	.	.	DP=114;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,42:0.385:109:30,19:36,21:36,31,21,21
chr1	172431210	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr1	172434375	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=124.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,22:0,14:0,0,29,7
chr1	172502041	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	172577864	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=115;ECNT=1;MBQ=33,32,34,34;MFRL=130,126,148,147;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,21,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.49,35.42,4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:46,6,21,6:0.058,0.266,0.080:79:21,2,13,6:23,4,6,0:41,5,28,5
chr1	172634734	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	173012997	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:11,4:9,4:19,1,8,0
chr1	173174389	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:2,4:10,0:10,3,4,0
chr1	173490407	.	TAAAAA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,12;RU=A;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,0:4,2:20,3,2,0
chr1	173490547	.	G	GA	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=20,17;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,6:0.118:51:16,0:11,1:10,35,1,5
chr1	173490616	.	CTA	C,CTATA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,35,26;MFRL=171,147,184;MMQ=60,60,60;MPOS=30,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=TA;STR;TLOD=4.75,26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,9:0.157,0.527:16:2,0,5:3,2,1:0,5,0,11
chr1	173499244	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:173499244_G_A:173499244:0,1,0,1
chr1	173499245	.	C	CCCCTTAGGTGTATTAACTTCTTTTAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=37,33;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:173499244_G_A:173499244:0,1,0,1
chr1	173721159	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,183;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0,3,0,1
chr1	173794587	.	C	CATT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,181;MMQ=60,42;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=ATT;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.702:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	173797451	.	TC	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:9,2:14,1:0,24,1,2
chr1	173819421	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.431:12:3,1:3,4:6,1,5,0
chr1	173822735	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,1:2,1:0,9,0,2
chr1	173934311	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.264:16:4,3:8,0:1,11,0,4
chr1	173961807	.	AACAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=133,161;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=AC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	174417231	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,5:5,3:11,0,6,2
chr1	174417968	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,84;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:8,3:16,0:13,11,3,0
chr1	174670295	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:17,0:14,5:10,21,0,5
chr1	174721492	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:12,0:16,2:10,19,1,1
chr1	174948082	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.251:17:5,2:8,2:0,13,0,4
chr1	174959086	.	C	CT	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,2:0.056:51:29,0:17,1:29,20,1,1
chr1	174969271	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,24:0.448:54:10,17:18,7:22,8,21,3
chr1	174983818	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=154,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:13,2:5,1:13,5,1,2
chr1	174984064	.	ATTTTC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,139;MMQ=46,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTC;STR;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr1	175046614	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:6,0:0|1:175046614_G_T:175046614:10,10,0,2
chr1	175046617	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,2:8,0:0|1:175046614_G_T:175046614:10,11,0,2
chr1	175046620	.	TTC	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,2:8,0:0|1:175046614_G_T:175046614:10,11,0,2
chr1	175046623	.	GGCCC	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,2:9,0:0|1:175046614_G_T:175046614:10,15,0,2
chr1	175087683	.	A	AT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:16,2:26,1:36,7,3,0
chr1	175092840	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.499:32:6,7:10,7:3,13,2,14
chr1	175097271	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=145,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:2,8,0,2
chr1	175097331	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=74,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.669:7:1,2:1,2:0|1:175097331_G_A:175097331:1,1,2,3
chr1	175097349	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=104,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:175097331_G_A:175097331:1,1,1,2
chr1	175105880	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=92,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:2,0,4,0
chr1	175105942	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,8:0,6:1,0,11,3
chr1	175116252	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:6,7:6,3:2,10,1,10
chr1	175292672	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=224,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	175293424	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=67,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,6:1,2:2,0,7,1
chr1	175306916	.	A	ACCTCACCTGGCTAATTTTTTTTGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr1	175323446	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	175336530	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	175360643	.	A	AGAG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=180,44;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:0|1:175360643_A_AGAG:175360643:0,10,1,1
chr1	175360644	.	T	TGAGAGAAC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=180,44;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:5,0:0|1:175360643_A_AGAG:175360643:0,10,1,1
chr1	175365663	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.655:24:3,8:5,8:6,2,12,4
chr1	175916267	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=120.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,16:0,0,25,8
chr1	176012807	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=85.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,6:0,18:0,0,24,1
chr1	176105710	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.256:22:4,2:8,3:1,15,0,6
chr1	176153658	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=150.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,24:0,16:0,0,42,0
chr1	176175610	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	176664842	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=106,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,6:4,3:6,3,7,2
chr1	176671937	.	G	GTATTAAAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=176,144;MMQ=50,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:176671937_G_GTATTAAAT:176671937:0,2,0,1
chr1	176671940	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,28;MFRL=176,144;MMQ=50,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:176671937_G_GTATTAAAT:176671937:0,2,0,1
chr1	176671962	.	C	CACGGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:176671962_C_CACGGA:176671962:0,0,0,1
chr1	176671963	.	T	TGGAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:176671962_C_CACGGA:176671962:0,0,0,1
chr1	176681165	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,32,33;MFRL=135,189,141;MMQ=60,60,60;MPOS=24,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=TG;STR;TLOD=3.70,6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,3:0.176,0.335:11:2,0,0:3,2,3:0,6,0,5
chr1	176734756	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=189,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr1	176769358	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:0,1:3,1:0,4,0,2
chr1	176826908	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	176857184	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:8,2:2,0:7,3,2,0
chr1	176857347	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr1	176992755	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=90,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:2,1:0,0:0|1:176992755_AC_A:176992755:2,1,0,1
chr1	176992757	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=13,32;MFRL=90,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.335:4:0,1:0,0:0|1:176992755_AC_A:176992755:2,1,0,1
chr1	177198998	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.472:49:7,14:18,9:15,11,13,10
chr1	177250670	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	177901971	.	G	GTTTATAAGTAGAACATTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=98,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:177901971_G_GTTTATAAGTAGAACATTA:177901971:0,3,0,1
chr1	177901973	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=98,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:177901971_G_GTTTATAAGTAGAACATTA:177901971:0,3,0,1
chr1	177902388	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,9,6
chr1	177909872	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:177909872_T_G:177909872:0,2,0,1
chr1	177909886	.	T	TCAGTGTTTGAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=10,33;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:0,0:0|1:177909872_T_G:177909872:0,1,0,1
chr1	177915474	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr1	177916865	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,64607875;MMQ=60,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.770:2:0,0:0,1:0|1:177916865_G_A:177916865:0,0,2,0
chr1	177916872	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,64607875;MMQ=60,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.785:2:0,1:0,1:0|1:177916865_G_A:177916865:0,0,2,0
chr1	177916889	.	AA	GG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,207;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.750:1:0,1:0,0:0|1:177916865_G_A:177916865:0,0,1,0
chr1	177929379	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,36,1
chr1	177930642	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	177930894	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr1	177933443	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,3,11
chr1	177933510	.	G	GGGCTGGAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=192,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177933510_G_GGGCTGGAGA:177933510:0,1,0,1
chr1	177933512	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=192,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177933510_G_GGGCTGGAGA:177933510:0,1,0,1
chr1	177935203	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	177937016	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,2:12,0:15,8,2,0
chr1	178389706	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:19,1:28,2:15,32,0,3
chr1	178408780	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr1	178408795	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	178433368	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,3:4,4:5,2,6,2
chr1	178434963	.	AAAAGAAAGAAAGAG	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.457:40:7,9:7,9:21,1,18,0
chr1	178439953	.	A	AGTTCCAAAATCCCTTCTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	178442190	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,24:0.611:39:5,10:10,14:11,4,19,5
chr1	178492477	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:178492477_CAA_C:178492477:2,1,0,1
chr1	178492480	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:178492477_CAA_C:178492477:2,1,0,1
chr1	178492484	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:178492477_CAA_C:178492477:2,1,0,1
chr1	178492508	.	A	AACC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=162,286;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:178492508_A_AACC:178492508:0,1,0,1
chr1	178492512	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=165,286;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:178492508_A_AACC:178492508:0,2,0,1
chr1	178492514	.	TCTC	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=165,286;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:178492508_A_AACC:178492508:0,2,0,1
chr1	178514203	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=185,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.684:14:1,4:3,4:1,3,4,6
chr1	178514560	.	A	AT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=54.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.584:34:8,12:6,8:2,12,3,17
chr1	178745798	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:178745798_CT_C:178745798:0,0,2,0
chr1	178745814	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:178745798_CT_C:178745798:2,0,2,0
chr1	178802682	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=136,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.136:49:22,5:21,1:23,20,1,5
chr1	178822770	.	CT	GG,GT	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=33,22,23;MFRL=157,130,120;MMQ=60,60,53;MPOS=32,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.74,5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,2,2:0.094,0.094:29:9,1,0:12,0,1:16,9,4,0
chr1	178822775	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=32,19;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:6,0:9,0:17,9,3,0
chr1	178822780	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=33,10;MFRL=144,120;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:9,0:14,0:0|1:178822780_C_A:178822780:21,12,2,0
chr1	178822788	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=151,120;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:12,0:17,0:0|1:178822780_C_A:178822780:21,14,2,0
chr1	178822790	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=32,16;MFRL=148,120;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,2:0.079:36:13,0:18,0:0|1:178822780_C_A:178822780:20,14,2,0
chr1	178846735	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:21,0:15,2:13,23,0,2
chr1	179019568	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:1,8,0,2
chr1	179035914	.	AA	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=126,156;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:9,0:12,9,2,0
chr1	179041011	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=176.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,29:0,22:0,0,37,14
chr1	179051300	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,315;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	179052006	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr1	179054692	.	T	G	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=240.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,72:0.987:72:0,31:0,37:0,0,37,35
chr1	179064035	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,0:0,0:0,0,7,0
chr1	179067071	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	179077450	.	T	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,11:0.177:54:18,3:16,4:33,10,0,11
chr1	179078169	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:6,0:4,0:0|1:179078169_A_C:179078169:0,10,5,0
chr1	179078173	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.332:16:6,2:4,1:0|1:179078169_A_C:179078169:0,11,5,0
chr1	179078178	.	CAGCAGTGCCACTG	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.299:18:5,3:4,2:0|1:179078169_A_C:179078169:0,13,5,0
chr1	179087934	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,2,14
chr1	179089239	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.261:19:7,2:4,2:12,2,4,1
chr1	179089475	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	179089491	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	179095895	.	TAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=205,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:0,1:3,1:1,4,0,2
chr1	179198308	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:179198308_A_C:179198308:0,0,2,0
chr1	179198312	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:179198308_A_C:179198308:0,0,2,0
chr1	179198317	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:179198308_A_C:179198308:0,0,2,0
chr1	179304892	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=16,28;MFRL=118,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.451:5:1,2:0,0:1,2,0,2
chr1	179312102	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,6:4,0:2,6,1,5
chr1	179316873	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.139:27:10,0:12,3:2,22,0,3
chr1	179319580	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:1,7:3,7:1,3,4,12
chr1	179320404	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=147,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:9,3:17,0:16,10,2,1
chr1	179320665	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=105,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.660:4:0,1:1,2:1,0,0,3
chr1	179338072	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:16,0:13,3:4,27,0,3
chr1	179348643	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=145,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.080:35:15,0:17,2:0|1:179348643_A_T:179348643:17,16,1,1
chr1	179348646	.	T	TG	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:8,5:9,8:7,10,7,6
chr1	179348649	.	C	CAGGT	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=147,54;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:13,2:0|1:179348643_A_T:179348643:13,16,1,1
chr1	179348650	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,0:14,2:0|1:179348643_A_T:179348643:13,15,1,1
chr1	179348710	.	TC	CT	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=147,170;MMQ=52,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:5,0:0,13,0,2
chr1	179354304	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr1	179364391	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,4:4,3:0,6,0,7
chr1	179380472	.	GT	G	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=159.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.984:56:0,25:0,31:0,0,0,56
chr1	179398563	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr1	179401379	.	CT	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=51.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,27:0.510:53:13,14:12,12:21,5,22,5
chr1	179401526	.	C	G	.	.	DP=86;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,41:0.482:84:21,22:18,13:14,29,11,30
chr1	179401559	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,27:0.506:53:15,17:10,7:1,25,0,27
chr1	179401564	.	CTT	C,CT	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=34,32,33;MFRL=174,164,177;MMQ=60,60,60;MPOS=16,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=7.51,56.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,24:0.164,0.772:31:1,2,17:0,2,7:0,2,1,28
chr1	179437827	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr1	179452194	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	179462149	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	179494612	.	CTACA	C	.	.	DP=97;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TACA;STR;TLOD=57.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.442:37:10,9:10,7:2,19,1,15
chr1	179494665	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=138.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,16:0,21:0,0,0,40
chr1	179503806	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=74.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,23:0.801:28:2,14:3,9:4,1,22,1
chr1	179504025	.	AAAG	A	.	.	DP=90;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=116,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAG;STR;TLOD=154.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,41:0.513:80:18,17:14,23:0|1:179504025_AAAG_A:179504025:25,14,28,13
chr1	179504043	.	C	G	.	.	DP=125;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=116,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=210.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,59:0.518:114:27,22:27,37:0|1:179504025_AAAG_A:179504025:27,28,41,18
chr1	179504130	.	G	A	.	.	DP=128;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=237.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,78:0.642:121:21,28:22,48:5,38,3,75
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chr1	179528917	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.554:23:2,5:8,6:0,10,0,13
chr1	179528942	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:0,7,0,7
chr1	179545050	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	179605058	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=123,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr1	179620253	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	179632727	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	179876900	.	A	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=185.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,36:0,17:0,0,37,16
chr1	179972347	.	G	GA	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.057:50:25,0:21,2:26,22,0,2
chr1	179983665	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=63.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,9:0,0,1,19
chr1	179992076	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	179993793	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	180010702	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr1	180022343	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,2,6
chr1	180059811	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	180063063	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:18,1:10,1:24,4,2,0
chr1	180065137	.	ATTTTG	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTTTG;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.055:53:25,0:16,3:41,9,3,0
chr1	180080115	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=179.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,28:0,20:0,0,41,7
chr1	180145088	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=80,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.883:23:0,13:2,8:1,1,12,9
chr1	180155376	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:1,2,1,3
chr1	180155382	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	180158668	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,2:5,4:9,0,6,0
chr1	180159797	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=271,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	180217656	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=404,253;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	180243625	.	GA	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:180243625_GA_TC:180243625:1,3,0,1
chr1	180243631	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:180243625_GA_TC:180243625:1,3,0,1
chr1	180243646	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=267,116;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	180257692	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0,0,3,19
chr1	180757056	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:3,13:10,4:1,12,1,16
chr1	180803922	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=265,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,3,2
chr1	180849494	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr1	180853268	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=157,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,0:6,2:0,9,0,2
chr1	180885875	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:4,7,1,1
chr1	180897521	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,15,3
chr1	180897569	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.633:20:3,7:4,5:4,3,5,8
chr1	180905448	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,8:4,4:3,6,8,4
chr1	180910133	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=154,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.548:5:0,0:1,0:0|1:180910133_A_C:180910133:1,1,3,0
chr1	180910137	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,13;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.702:5:0,0:1,0:0|1:180910133_A_C:180910133:0,1,4,0
chr1	180910140	.	C	CCCG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:180910133_A_C:180910133:0,1,2,0
chr1	180962612	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=200,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:180962612_T_G:180962612:0,1,0,1
chr1	180962614	.	A	AAATGTTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=200,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:180962612_T_G:180962612:0,1,0,1
chr1	181058017	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:7,1:12,1:19,0,2,0
chr1	181058618	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=182,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:181058618_C_G:181058618:1,0,1,1
chr1	181058643	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:181058618_C_G:181058618:0,0,2,0
chr1	181059988	.	T	TAATTGTTAAACAAACACTGTATCCACATGAAGTCCAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=284,173;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.487:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	181479669	.	TG	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:22,3:17,0:27,14,3,0
chr1	181480712	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=112,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:181480712_G_T:181480712:1,3,0,1
chr1	181480715	.	GC	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=112,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:181480712_G_T:181480712:1,2,0,1
chr1	181684605	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr1	181684634	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=207,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	181686216	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=62,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,5:1,1:0,3,5,1
chr1	181687379	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=221,239;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	181688868	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=142,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.342:32:11,7:10,2:15,6,7,4
chr1	181706685	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:5,0,4,0
chr1	181719679	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,4:3,4:0,6,3,6
chr1	181724432	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:0,12:3,3:2,1,8,7
chr1	181725110	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=103,131;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:6,2:4,2:6,4,3,1
chr1	181727030	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr1	181727100	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=168,110;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:7,7,2,0
chr1	181731667	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.339:18:8,5:3,1:10,2,6,0
chr1	181732695	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,44934909;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	181752769	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.215:20:5,1:10,2:14,2,4,0
chr1	181752783	.	T	G,TG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,37,32;MFRL=122,200,117;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.93,10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,6:0.105,0.253:24:5,2,2:10,0,4:11,5,7,1
chr1	181752923	.	AAGCTT	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGCTT;STR;TLOD=162.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.977:38:0,20:0,15:0,0,11,27
chr1	181754803	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.443:23:6,4:6,6:13,0,10,0
chr1	182354850	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=65.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.571:35:8,12:6,8:15,0,19,1
chr1	182355046	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,28:0.675:41:6,15:7,13:1,12,1,27
chr1	182356517	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=218,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:182356517_T_A:182356517:0,3,0,1
chr1	182356519	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=218,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:182356517_T_A:182356517:0,3,0,1
chr1	182356525	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=218,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:0,0:0|1:182356517_T_A:182356517:0,3,0,1
chr1	182462326	.	C	CACAAGCGTCCTTAAAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=135,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	182491107	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,3:2,5:9,0,9,0
chr1	182501933	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=97,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,2:6,6:4,7,0,8
chr1	182509292	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=129,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:182509292_A_G:182509292:1,0,1,0
chr1	182509302	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,10;MFRL=241,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:182509292_A_G:182509292:3,0,1,0
chr1	182509308	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=241,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:182509292_A_G:182509292:3,0,1,0
chr1	182509580	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=193,111;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:7,0:4,2:0,11,0,2
chr1	182509598	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr1	182517357	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=220,230;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr1	182554783	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,2:10,0:15,7,0,2
chr1	182556036	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	182571003	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=189,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr1	182571277	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:10,9:7,8:4,13,2,15
chr1	182573227	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr1	182638763	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.079:61:18,3:38,1:27,30,0,4
chr1	182784022	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:0,6,0,4
chr1	182812410	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.247:16:9,2:2,1:12,0,3,1
chr1	182812528	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:5,10,2,0
chr1	182812666	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.269:6:2,0:3,1:1,4,0,1
chr1	182848431	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:20,2:18,1:18,20,3,0
chr1	182854017	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:0,4,0,6
chr1	183176994	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.268:17:4,0:5,0:10,3,4,0
chr1	183205523	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=136,127;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.240:15:5,2:4,1:10,2,3,0
chr1	183205576	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,6:0.087:61:26,0:26,0:5,50,6,0
chr1	183205581	.	A	C	.	.	DP=68;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,6:0.091:65:23,1:31,1:6,53,6,0
chr1	183209468	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=151,242;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:21,1:21,2:24,20,0,3
chr1	183230516	.	ATCCGC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	183253959	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.404:28:10,6:5,5:4,13,1,10
chr1	183273751	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:5,1,4,2
chr1	183481943	.	C	CT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.683:10:1,3:1,2:2,1,4,3
chr1	183516440	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	183525452	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	183534935	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,15:0,0,7,23
chr1	183538449	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	183556180	.	C	CAATATAGTAAAACCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=185,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	183617485	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,2:11,0:11,10,2,0
chr1	183711483	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr1	183775638	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=152,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:0,2:5,4:1,4,1,5
chr1	183775704	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr1	183816683	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,5:5,1:13,2,4,2
chr1	183852914	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=93.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,15:0,10:0,0,16,9
chr1	183866849	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	183871637	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,7:0,15:0,0,20,2
chr1	183895178	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	183913540	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	183938304	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:183938304_C_A:183938304:2,0,2,0
chr1	183938313	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:0|1:183938304_C_A:183938304:2,0,2,0
chr1	183942950	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	183944444	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	184041946	.	C	CT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.095:53:25,0:19,5:35,13,5,0
chr1	184476621	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr1	184537506	.	ACTC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=91.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,9:0,0,17,4
chr1	184567463	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,9:0,0,24,2
chr1	184672179	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:0,3:3,3:0,4,0,6
chr1	184681081	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr1	184681802	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=199,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr1	184688237	.	CGT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GT;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:4,1:9,1:13,1,2,0
chr1	184695571	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr1	184706212	.	GT	G	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=297.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,84:0.989:84:0,43:0,41:0,0,26,58
chr1	184718744	.	G	C	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=26,19;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,9:0.118:82:27,0:13,0:27,46,0,9
chr1	184718750	.	GAAAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=34,18,17,17;MFRL=170,156,166,137;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,18,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=8.41,32.51,16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,8,19,8:0.173,0.450,0.212:41:2,2,3,0:1,1,0,0:1,5,3,32
chr1	184777177	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:5,6:3,3:8,1,7,2
chr1	185094277	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:0,6,0,7
chr1	185120927	.	GAA	G	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.064:57:16,0:23,3:45,9,3,0
chr1	185137454	.	T	TAAATGATAGAC	.	.	DP=150;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=161.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:94,45:0.325:139:40,17:51,16:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:53,41,26,19
chr1	185137461	.	A	T	.	.	DP=140;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=146.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,41:0.296:140:45,16:51,21:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:54,45,28,13
chr1	185137464	.	T	TAA	.	.	DP=148;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=63.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,42:0.299:141:45,16:49,20:54,45,28,14
chr1	185137628	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.468:49:17,9:9,13:0,26,0,23
chr1	185153545	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:7,12:6,3:0,14,0,15
chr1	185240474	.	A	G	.	.	DP=205;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=193.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:130,68:0.346:198:67,30:60,38:58,72,30,38
chr1	185245863	.	TTGG	T	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TGG;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.062:44:18,0:21,2:0,42,0,2
chr1	185267114	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=123,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,2:6,1:10,1,3,0
chr1	186007985	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:32,1:25,2:35,24,0,3
chr1	186050579	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=152,248;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr1	186050615	.	T	TCAGAAAGGCCATATTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186050615_T_TCAGAAAGGCCATATTG:186050615:0,1,0,1
chr1	186050618	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186050615_T_TCAGAAAGGCCATATTG:186050615:0,1,0,1
chr1	186050619	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186050615_T_TCAGAAAGGCCATATTG:186050615:0,1,0,1
chr1	186052024	.	G	A	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=106.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,39:0.430:91:28,23:24,16:33,19,18,21
chr1	186084611	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=104,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0|1:186084611_T_A:186084611:0,2,0,1
chr1	186084613	.	C	CCAGGAATAAAGTACAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=104,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:186084611_T_A:186084611:0,2,0,1
chr1	186135533	.	T	TTCTAAGTACTTATCCTGTTAAGGC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	186147517	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:12,2:5,0:0|1:186147517_T_G:186147517:18,0,2,0
chr1	186147521	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,93;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:9,2:4,0:0|1:186147517_T_G:186147517:17,0,3,0
chr1	186265948	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,4:2,0:8,0,4,0
chr1	186270894	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:0,5,1,6
chr1	186273994	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,32:0.528:61:14,16:12,15:20,9,23,9
chr1	186277088	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,51;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,19:0,19:0,0,17,21
chr1	186277989	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,29:0.522:55:13,13:11,10:15,11,16,13
chr1	186306247	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=139,95;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:22,0:15,3:14,23,0,3
chr1	186313249	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,1,13
chr1	186316656	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr1	186326703	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,2:12,0:13,13,1,1
chr1	186329869	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,25:0.667:37:2,13:10,12:10,2,19,6
chr1	186330695	.	TA	T,TAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30,28;MFRL=188,126,133;MMQ=60,60,60;MPOS=27,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.97,10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,5:0.241,0.248:21:6,3,3:5,2,2:11,0,9,1
chr1	186352347	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=210,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:0,8:3,5:0,3,0,14
chr1	186357523	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,15,2
chr1	186358588	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=216,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,3:0,2:2,0,5,0
chr1	186370598	.	T	TTCTG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCTG;STR;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.563:21:7,5:2,6:3,6,2,10
chr1	186413732	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:186413732_T_TG:186413732:0,0,0,1
chr1	186413733	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:186413732_T_TG:186413732:0,0,0,1
chr1	186413737	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:186413732_T_TG:186413732:0,0,0,1
chr1	186645352	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=191,114;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,0:8,3:1,14,0,3
chr1	186645679	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:25,2:16,1:22,19,3,0
chr1	186646068	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:7,0:12,2:1,18,0,2
chr1	186863385	.	TAA	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=51.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr1	186863422	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=210,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:186863422_TGG_T:186863422:0,3,0,1
chr1	186863427	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=210,141;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:186863422_TGG_T:186863422:0,3,0,1
chr1	186919732	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr1	186925168	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	186925194	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	186925552	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	186946638	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:186946638_C_T:186946638:0,0,4,0
chr1	186946641	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:186946638_C_T:186946638:0,0,4,0
chr1	190067748	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.191:19:10,3:6,0:0|1:190067748_T_C:190067748:7,9,3,0
chr1	190067753	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:9,3:6,0:0|1:190067748_T_C:190067748:6,9,3,0
chr1	190250762	.	T	G	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=134,152;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,4:0.053:91:35,4:46,0:60,27,4,0
chr1	192335271	.	C	CTAAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAT;STR;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	192545099	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,1,13
chr1	192547344	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=34,19;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.189:36:12,0:13,1:9,20,7,0
chr1	192547350	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=123,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.131:34:13,0:12,0:10,20,4,0
chr1	192547357	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=122,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.106:36:14,0:13,0:12,21,3,0
chr1	192778130	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=167,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.166:38:9,1:11,0:28,3,7,0
chr1	192778159	.	A	T	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=96.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,35:0.578:62:10,16:8,16:14,13,26,9
chr1	192780498	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,23:0.462:50:11,12:16,11:25,2,20,3
chr1	192997336	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=193,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,4:6,6:0,12,0,10
chr1	192998319	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,1:15,1:22,5,2,0
chr1	193051685	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:11,4:7,4:17,1,7,1
chr1	193051902	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr1	193051903	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:193051903_T_C:193051903:0,4,0,1
chr1	193051909	.	T	TCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:193051903_T_C:193051903:0,4,0,1
chr1	193051910	.	T	A,TTAGA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30,28;MFRL=157,161,157;MMQ=60,60,60;MPOS=2,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:2,0,0:1,1,1:0,3,0,2
chr1	193053675	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=123,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:2,8:1,7:2,1,14,1
chr1	193053762	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=118,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=62.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.668:31:6,10:4,11:6,4,11,10
chr1	193053996	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	193065956	.	T	TAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=185,186;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:193065956_T_TAGC:193065956:0,4,0,1
chr1	193065959	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=185,186;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:193065956_T_TAGC:193065956:0,4,0,1
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chr1	193181512	.	C	T	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,4:0.057:85:41,4:40,0:53,28,4,0
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chr1	196398974	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=75.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,0,22
chr1	196461513	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=198.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,29:0,29:0,0,8,51
chr1	196684650	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:196684650_C_A:196684650:1,0,1,0
chr1	196684654	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:196684650_C_A:196684650:1,0,1,0
chr1	196695678	.	A	T	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=144,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,3:0.059:65:21,0:38,3:0|1:196695678_A_T:196695678:39,23,1,2
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chr1	196706642	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:10,3:7,5:11,6,6,2
chr1	196763574	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,204;MMQ=52,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:14,2:27,0:41,0,2,0
chr1	197008597	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,13:0,6:0,0,6,13
chr1	197020085	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=72,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:197020085_A_T:197020085:0,2,0,1
chr1	197020093	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=72,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:197020085_A_T:197020085:0,2,0,1
chr1	197020095	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=72,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:197020085_A_T:197020085:0,2,0,1
chr1	197026672	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr1	197030201	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,3,11
chr1	197030237	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	197031021	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,13:0,0,9,15
chr1	197053373	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	197055925	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,15:0,0,12,10
chr1	197059221	.	GA	G,GAA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=164,198,151;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=5.35,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,4,4:0.109,0.093:41:4,1,1:14,3,2:6,27,3,5
chr1	197059878	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	197059892	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	197059928	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,12,2
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chr1	197070980	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:11,7,0,2
chr1	197072189	.	T	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:18,3:16,0:17,18,3,0
chr1	197098326	.	G	A	.	.	DP=115;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=188.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,64:0.589:109:21,33:21,31:31,14,44,20
chr1	197102745	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:2,2,1,3
chr1	197104149	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=65.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,12:0,7:0,0,18,1
chr1	197109042	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr1	197113073	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=156.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,19:0,26:0,0,40,6
chr1	197141235	.	CTA	C	.	.	DP=93;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TA;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,3:0.056:67:32,2:25,1:0|1:197141235_CTA_C:197141235:60,4,3,0
chr1	197141243	.	A	C	.	.	DP=104;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=233.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,70:0.948:74:2,39:2,31:4,0,62,8
chr1	197141253	.	A	C	.	.	DP=135;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:111,6:0.050:117:55,3:55,3:0|1:197141235_CTA_C:197141235:97,14,4,2
chr1	197237654	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,1:10,1:3,22,0,2
chr1	197297540	.	A	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=84.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,32:0.403:80:26,14:21,18:35,13,23,9
chr1	197316435	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,2:0,6:0,0,9,0
chr1	197325908	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr1	197397169	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,0:5,3:0,5,0,3
chr1	197482167	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	197510025	.	G	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=201.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,25:0,36:0,0,57,5
chr1	197515777	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr1	197515981	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:1,7,0,7
chr1	197576307	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=63.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,3,15
chr1	197741951	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=78,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,48:0.944:50:1,19:1,28:0,2,38,10
chr1	197742171	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr1	197871802	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	197890422	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr1	198225658	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,7:4,7:0,8,0,14
chr1	198288709	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=194,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	198492490	.	C	CT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:22,1:19,2:25,17,1,2
chr1	198498325	.	AATAT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=AT;STR;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.605:8:1,2:2,3:0,3,1,4
chr1	198505830	.	C	T	.	.	DP=138;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=174.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,63:0.491:128:30,28:35,34:38,27,36,27
chr1	198691478	.	AAT	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.089:61:25,5:25,0:55,1,5,0
chr1	198711170	.	CA	C,CAA	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=20,33,24;MFRL=167,143,138;MMQ=60,60,60;MPOS=23,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.76,3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,4,4:0.113,0.125:32:7,4,2:5,0,1:2,22,0,8
chr1	198717218	.	GTT	G,GTTT	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=35,35,34;MFRL=143,120,130;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=T;STR;TLOD=4.47,19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,18:0.087,0.474:35:9,2,3:1,1,10:10,4,16,5
chr1	200008941	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=112,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,3:2,4:2,2,3,4
chr1	200014560	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.551:40:10,9:7,13:12,6,15,7
chr1	200014762	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:200014762_A_G:200014762:0,3,0,1
chr1	200014766	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:200014762_A_G:200014762:0,3,0,1
chr1	200080462	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=17,30;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.464:11:0,1:2,3:0|1:200080462_A_AT:200080462:2,4,2,3
chr1	200080464	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.468:11:1,2:4,2:0|1:200080462_A_AT:200080462:2,4,2,3
chr1	200089872	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=191,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr1	200143064	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.627:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr1	200182654	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr1	200311910	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,2,22
chr1	200312546	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=98,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.929:13:1,3:0,6:0,1,1,11
chr1	200378731	.	TGCC	T	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCC;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,2:0.053:52:20,1:23,1:15,35,0,2
chr1	200523514	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=165,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:3,2:9,9:12,0,11,0
chr1	200523518	.	CA	C,CAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,33,35;MFRL=159,242,200;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.28,6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,4:0.171,0.186:24:5,0,2:11,4,2:16,0,8,0
chr1	200549590	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=175,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:5,4:1,2:0,7,0,6
chr1	200550243	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,141;MMQ=40,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.736:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	200567596	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:0,2:5,1:0,6,0,3
chr1	200569392	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,6,1
chr1	200575794	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,3,1
chr1	200578093	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,3,20
chr1	200583380	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:3,3:6,7:7,2,10,0
chr1	200587936	.	T	TTTAAAAGTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	200594005	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:5,2:7,3:8,4,4,2
chr1	200594240	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	200613388	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.184:23:10,1:9,1:17,2,4,0
chr1	200613472	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=128,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.097:54:27,1:22,3:29,20,3,2
chr1	200617465	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=133,218;MMQ=60,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:200617465_G_GC:200617465:1,0,1,0
chr1	200617466	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=133,218;MMQ=60,41;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:200617465_G_GC:200617465:1,0,1,0
chr1	200617533	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:3,2,5,2
chr1	200619478	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	200619530	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr1	200619883	.	A	ACC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=107,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:200619883_A_ACC:200619883:0,1,0,1
chr1	200619885	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=107,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:200619883_A_ACC:200619883:0,1,0,1
chr1	200619888	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:200619883_A_ACC:200619883:0,0,0,1
chr1	200619897	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:200619883_A_ACC:200619883:0,0,0,1
chr1	200635964	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=235,194;MMQ=24,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	200816519	.	TTGTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=256,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=TG;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr1	200816658	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr1	200818301	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,1:11,1:13,5,2,0
chr1	200843305	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr1	200868607	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.070:47:8,0:22,2:22,22,2,1
chr1	200877786	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,15,1
chr1	200880978	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	200943793	.	CAGGA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGA;STR;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	200944840	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	200960307	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=125,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:5,8:8,7:5,8,5,10
chr1	200967490	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=199,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:3,2,3,0
chr1	200968954	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	201009556	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr1	201009897	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	201016271	.	C	CAAT	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,2:13,0:0|1:201016271_C_CAAT:201016271:7,20,1,1
chr1	201016274	.	T	TGG	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=126,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,2:14,0:0|1:201016271_C_CAAT:201016271:7,23,1,1
chr1	201016277	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=132,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:13,1:13,0:0|1:201016271_C_CAAT:201016271:6,22,1,1
chr1	201016296	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,3:6,5:1,10,2,6
chr1	201020105	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.446:32:9,6:7,8:12,6,9,5
chr1	201020360	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=330,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr1	201021668	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=128,94;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,10:0.222:46:18,3:17,2:36,0,0,10
chr1	201031307	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=274,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	201042618	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=116,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.503:6:1,0:2,2:2,1,3,0
chr1	201043845	.	ACT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=179,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,5:0,0:0,2,0,5
chr1	201044748	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:1,4:7,4:4,4,3,5
chr1	201052199	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	201079235	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:4,7:0,3:4,0,8,2
chr1	201079458	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:1,3,0,3
chr1	201081324	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:2,4,1,1
chr1	201113118	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr1	201115822	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:5,1,4,1
chr1	201116018	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr1	201163191	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=204,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr1	201164930	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:3,6:3,3:5,2,9,0
chr1	201169554	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=101,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,2:1,3,2,3
chr1	201169601	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=281,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,1,2
chr1	201170772	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	201170824	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr1	201171007	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=94,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	201182779	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=225,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr1	201195119	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:1,3:4,2:1,4,3,3
chr1	201285663	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,14;MFRL=121,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.208:19:7,1:5,0:8,7,4,0
chr1	201285909	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=200,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:1,5:0,2:0,1,0,7
chr1	201286614	.	GA	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=213,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=95.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,35:0.926:37:1,18:1,17:2,0,35,0
chr1	201286628	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=190.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,23:0,28:0,0,48,3
chr1	201288007	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr1	201288898	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,10,2
chr1	201289305	.	G	GCCTAGAAAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201289305_G_GCCTAGAAAC:201289305:0,1,0,1
chr1	201289310	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201289305_G_GCCTAGAAAC:201289305:0,1,0,1
chr1	201289312	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201289305_G_GCCTAGAAAC:201289305:0,1,0,1
chr1	201291066	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	201292110	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.850:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr1	201293512	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr1	201293970	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	201293985	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	201335899	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr1	201336984	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,3,12
chr1	201336994	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=174,162;MMQ=60,57;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:1,9,0,2
chr1	201337050	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=178,132;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	201338553	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr1	201338586	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	201338896	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.905:8:0,5:0,1:0,0,6,2
chr1	201339043	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	201341175	.	CAGAAG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAG;STR;TLOD=96.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,16,6
chr1	201341341	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr1	201353827	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	201368463	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=197,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	201383616	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,2,1
chr1	201383643	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr1	201386916	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=136,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,28:0.460:61:21,15:11,13:18,15,14,14
chr1	201437477	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=227,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,4:2,5:3,0,9,0
chr1	201749520	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:6,9:5,6:7,4,13,3
chr1	201754410	.	CTTTT	C,CTTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32,34;MFRL=0,188,168;MMQ=60,60,60;MPOS=30,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,16;RU=T;STR;TLOD=3.20,6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.399,0.490:6:0,0,2:0,3,1:0,0,5,1
chr1	201757850	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:1,1:2,0:0|1:201757850_A_C:201757850:0,4,0,1
chr1	201757852	.	CA	TT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=37,32;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:1,1:2,0:0|1:201757850_A_C:201757850:0,4,0,1
chr1	201757856	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr1	201763499	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,182;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,6:1,3:1,0,9,0
chr1	201772863	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=18,14;MFRL=127,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.742:10:0,0:1,1:0,2,0,8
chr1	201772891	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=283,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	201773566	.	CTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.170:15:7,1:6,1:13,0,2,0
chr1	201816639	.	ATCTTTT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.455:31:7,3:7,10:17,0,12,2
chr1	201823750	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:13,0:17,2:22,9,2,0
chr1	201824357	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:3,0:16,2:1,18,0,2
chr1	201824390	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:1,1:5,5:0,6,0,7
chr1	201826340	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=2379480,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,4:1,0:0,2,0,4
chr1	201828209	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=218,99;MMQ=60,55;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0,10,0,2
chr1	201837934	.	CGTGT	C,CGT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,27,30;MFRL=126,208,141;MMQ=60,60,60;MPOS=21,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=GT;STR;TLOD=4.68,7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,3:0.129,0.266:13:2,1,1:5,1,2:2,6,1,4
chr1	201837957	.	G	GTGCGTGCATGTGTTTCAATAAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=165,57;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.164:15:5,0:8,2:1,12,1,1
chr1	201838919	.	TG	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=141,77;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:201838919_TG_CT:201838919:0,4,0,1
chr1	201838923	.	A	ATCTGGAT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=135,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201838919_TG_CT:201838919:0,1,0,1
chr1	201838927	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=135,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201838919_TG_CT:201838919:0,1,0,1
chr1	201838930	.	TA	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=135,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:201838919_TG_CT:201838919:0,1,0,1
chr1	201840059	.	GTTATT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTATT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	201840464	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=99.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,10:0,17:0,0,18,10
chr1	201840504	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=17,13;MFRL=110,175;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.512:11:2,1:0,0:4,1,0,6
chr1	201844128	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr1	201861016	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:0,7,0,4
chr1	201869093	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:2,0:5,2:2,6,0,2
chr1	201915550	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	201924749	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=177,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:1,3:1,3:1,2,2,4
chr1	201926386	.	C	CT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.527:38:12,4:6,15:15,3,15,5
chr1	201952294	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	201952755	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	201969082	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.620:32:5,10:5,9:8,4,8,12
chr1	201970748	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:5,4:9,3,6,2
chr1	201970986	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	201973565	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:2,3:6,5:3,5,2,6
chr1	201973630	.	T	TCTCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=227,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:201973630_T_TCTCA:201973630:0,2,1,1
chr1	201973631	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=227,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,0:0|1:201973630_T_TCTCA:201973630:0,2,1,1
chr1	201973633	.	C	CTAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=227,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:201973630_T_TCTCA:201973630:0,2,0,1
chr1	201973692	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	201981005	.	CAAA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	201981335	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.493:10:4,3:1,2:0|1:201981335_G_A:201981335:0,5,0,5
chr1	201981354	.	TG	CC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:0|1:201981335_G_A:201981335:0,4,0,5
chr1	201983211	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,0:11,2:3,22,0,2
chr1	201983242	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,4:4,2:0,10,0,6
chr1	202092046	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	202092810	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=246,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202092810_T_TC:202092810:0,1,0,1
chr1	202092811	.	T	TAGGTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=246,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202092810_T_TC:202092810:0,1,0,1
chr1	202096815	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:6,0,6,0
chr1	202104905	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=146,49;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:11,0:19,4:15,17,0,4
chr1	202107234	.	A	ACTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=182,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:202107234_A_ACTCT:202107234:1,2,0,1
chr1	202107237	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=182,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:202107234_A_ACTCT:202107234:1,2,0,1
chr1	202121643	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=204,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	202122840	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,6:5,6:8,0,8,4
chr1	202129895	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=199,197;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:3,3:1,4:1,3,0,8
chr1	202129930	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=199,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr1	202194441	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	202197011	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,7:4,6:7,1,12,1
chr1	202266547	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr1	202266607	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.610:16:5,7:1,3:3,3,8,2
chr1	202273837	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,103;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,0:3,3:1,11,0,3
chr1	202274936	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=82,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,3:2,4:0,2,2,5
chr1	202288383	.	C	CTATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=131,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:202288383_C_CTATT:202288383:0,4,0,1
chr1	202288385	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=131,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:202288383_C_CTATT:202288383:0,4,0,1
chr1	202318316	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=113,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr1	202386075	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=109,171;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.917:21:1,10:0,10:0,1,4,16
chr1	202396267	.	C	CAG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=156,75;MMQ=52,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,0:12,2:0|1:202396267_C_CAG:202396267:12,15,1,1
chr1	202396269	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=156,75;MMQ=52,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:15,0:12,2:0|1:202396267_C_CAG:202396267:12,15,1,1
chr1	202457784	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,154;MMQ=50,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,6:0,3,3,6
chr1	202536848	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=129,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:6,9:6,6:11,1,14,1
chr1	202572105	.	GCC	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=C;STR;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,1,3
chr1	202572106	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.438:5:2,0:2,1:1,3,1,0
chr1	202703053	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=191,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:0,5,0,6
chr1	202710733	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.648:18:4,7:2,4:3,3,7,5
chr1	202711778	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:2,9:4,5:4,2,10,4
chr1	202715537	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=13,34;MFRL=188,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.410:3:0,1:0,0:0|1:202715537_GAA_G:202715537:0,2,0,1
chr1	202715550	.	A	AGCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=188,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:202715537_GAA_G:202715537:0,2,0,1
chr1	202731986	.	C	CCTCAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:3,2:4,3:1,7,0,5
chr1	202861566	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	202861853	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=236,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202861853_C_T:202861853:0,1,0,1
chr1	202861855	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=236,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202861853_C_T:202861853:0,1,0,1
chr1	202863272	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,416;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:18,1,0,3
chr1	202863469	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=190,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:0,10,0,2
chr1	202887295	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:9,9:9,7:14,4,12,4
chr1	202914356	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,6:1,9:0,1,0,15
chr1	202931839	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=225,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,3:0,4:1,1,0,7
chr1	202931958	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=166,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr1	202931998	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr1	202933657	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,8:7,0,9,2
chr1	202978032	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=179,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	202985013	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=119,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,2:6,2:9,1,4,0
chr1	202987770	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:4,6:12,7:0,16,0,13
chr1	202987796	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=237,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:1,5:6,2:1,7,0,7
chr1	202990110	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,30,25;MFRL=135,186,168;MMQ=60,60,60;MPOS=26,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,16;RU=T;STR;TLOD=9.88,3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,8,2:0.513,0.077:16:3,4,1:2,4,0:2,4,3,7
chr1	202992217	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,274;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	203012705	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:3,2:0,6,0,4
chr1	203018745	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=207,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:203018745_TC_AA:203018745:1,0,1,0
chr1	203018749	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=207,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:203018745_TC_AA:203018745:1,0,1,0
chr1	203018751	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=207,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:203018745_TC_AA:203018745:1,0,1,0
chr1	203029541	.	GGA	TTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=77,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:203029541_GGA_TTC:203029541:1,3,0,1
chr1	203029545	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=77,92;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:203029541_GGA_TTC:203029541:1,3,0,1
chr1	203029547	.	TGAGTGG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=77,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:203029541_GGA_TTC:203029541:1,3,0,1
chr1	203045633	.	GGT	ACC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:203045633_GGT_ACC:203045633:0,2,0,2
chr1	203045639	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:203045633_GGT_ACC:203045633:0,2,0,2
chr1	203045641	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:203045633_GGT_ACC:203045633:0,2,0,2
chr1	203045643	.	GA	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:203045633_GGT_ACC:203045633:0,2,0,2
chr1	203054520	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:203054520_T_G:203054520:0,0,1,0
chr1	203054523	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:203054520_T_G:203054520:0,0,1,0
chr1	203055101	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.632:28:6,6:4,11:3,7,3,15
chr1	203137784	.	A	ACT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=77.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,5:0,9:0,0,14,5
chr1	203144359	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=210,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	203144573	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.073:53:24,3:22,0:26,24,3,0
chr1	203144896	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:203144896_T_A:203144896:1,2,0,1
chr1	203144900	.	G	GTCTCACTAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:203144896_T_A:203144896:1,2,0,1
chr1	203144901	.	G	GTTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:203144896_T_A:203144896:1,2,0,1
chr1	203144902	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=178,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:203144896_T_A:203144896:0,2,0,1
chr1	203149775	.	A	AATAGAGGCCATAGTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.318:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr1	203152801	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=130,163;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:3,1,4,3
chr1	203153634	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:3,9:0,2:3,0,9,2
chr1	203154267	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=185,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:2,0:3,2,2,0
chr1	203154532	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,3:5,6:0,7,1,8
chr1	203317394	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,2:1,5:0,3,0,8
chr1	203468990	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=203,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:203468990_G_T:203468990:0,1,0,1
chr1	203468991	.	C	CATT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=203,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:203468990_G_T:203468990:0,1,0,1
chr1	203468992	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=203,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:203468990_G_T:203468990:0,1,0,1
chr1	203469060	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:203469060_C_T:203469060:0,0,0,1
chr1	203469062	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=45,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:203469060_C_T:203469060:1,0,0,1
chr1	203469064	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,25;MFRL=0,182;MMQ=45,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:203469060_C_T:203469060:1,0,0,1
chr1	203679934	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,6:4,7:9,1,10,3
chr1	203709034	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr1	203709068	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	203740615	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:7,8:8,1:5,10,1,8
chr1	203741110	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,4:3,0:3,0,4,0
chr1	203803016	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr1	203809332	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,120;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.117:24:6,1:14,1:22,0,2,0
chr1	203819177	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.500:46:10,11:13,12:5,18,2,21
chr1	203821200	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=100.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,17:0,11:0,0,28,0
chr1	204082002	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:2,8:2,4:4,0,11,2
chr1	204083546	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,1:10,1:14,5,2,0
chr1	204085609	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.420:53:12,7:18,15:21,10,14,8
chr1	204094071	.	C	CTCACGGGATCACGTAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=216,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:0,2,1,1
chr1	204095280	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:7,2:8,2:2,14,1,3
chr1	204101421	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.418:34:6,7:13,7:9,11,4,10
chr1	204103618	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=159,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:3,2:1,6:3,1,8,1
chr1	204115934	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=236,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:3,3,1,2
chr1	204125093	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=253,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,0,2
chr1	204129671	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=111,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:2,3:11,5:11,2,6,2
chr1	204130376	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:8,2:2,4:7,3,5,1
chr1	204159611	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:5,7:1,0:6,0,6,1
chr1	204159781	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=199,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,0:3,0:0|1:204159781_T_G:204159781:5,10,0,2
chr1	204159784	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=199,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:4,0:0|1:204159781_T_G:204159781:6,11,0,2
chr1	204159787	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=198,194;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,8:1,4:2,4,4,8
chr1	204159791	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=29,17;MFRL=199,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.182:18:7,0:4,0:0|1:204159781_T_G:204159781:6,9,0,3
chr1	204159800	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,18;MFRL=199,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:7,0:3,0:0|1:204159781_T_G:204159781:6,11,0,3
chr1	204216410	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	204216468	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	204216601	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,5:0,0:0,0,3,2
chr1	204219559	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	204219850	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	204227046	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:204227046_T_C:204227046:0,4,1,0
chr1	204227049	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,0:0|1:204227046_T_C:204227046:0,4,1,0
chr1	204227053	.	A	C,T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,26,29;MFRL=178,128,109;MMQ=60,60,60;MPOS=3,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:3,1,1:0,0,0:0,3,1,1
chr1	204227055	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:1,3,0,1
chr1	204227056	.	C	CTACTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTAGAGA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=119,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.457:5:3,1:0,0:1,3,0,1
chr1	204230581	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,7:0,18:0,0,10,15
chr1	204234196	.	GGT	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=83.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,20:0.922:21:0,10:1,9:0|1:204234196_GGT_G:204234196:0,1,4,16
chr1	204234222	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=95.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.961:24:0,11:0,10:0|1:204234196_GGT_G:204234196:0,0,3,21
chr1	204237518	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:204237518_T_TCC:204237518:0,1,0,1
chr1	204237522	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:204237518_T_TCC:204237518:0,1,0,1
chr1	204237524	.	TG	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:204237518_T_TCC:204237518:0,1,0,1
chr1	204242731	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,11:0,1:0,0,8,4
chr1	204380404	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=100.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,33:0.596:55:12,15:10,17:6,16,9,24
chr1	204401519	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.191:15:5,1:5,2:0|1:204401519_A_T:204401519:1,11,0,3
chr1	204401524	.	A	AACTTCTGCC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.181:16:5,0:7,2:0|1:204401519_A_T:204401519:1,12,0,3
chr1	204403686	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:19,0:10,2:10,20,1,1
chr1	204409281	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,21:0,1:0,0,17,5
chr1	204413297	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=345.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,79:0.988:79:0,38:0,40:0|1:204413297_C_T:204413297:0,0,25,54
chr1	204413299	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=345.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,79:0.988:79:0,37:0,37:0|1:204413297_C_T:204413297:0,0,25,54
chr1	204415330	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=219,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.691:8:1,1:1,3:0,2,0,6
chr1	204418889	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr1	204418939	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,6:0,0,11,5
chr1	204429838	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	204429865	.	G	GCGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=207,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0,4,0,1
chr1	204433093	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,11,4
chr1	204433511	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr1	204434277	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0,0,19,3
chr1	204438018	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=150,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:17,0:20,3:26,11,2,1
chr1	204494703	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=117,97;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:17,0:9,2:15,11,2,0
chr1	204494756	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=116,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.324:12:2,0:6,1:2,6,1,3
chr1	204495595	.	G	T,GT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=14,32,14;MFRL=150,168,143;MMQ=60,40,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.03,8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,11,9:0.217,0.349:31:2,6,1:0,1,2:0,11,1,19
chr1	204512100	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,4:4,6:0,6,0,10
chr1	204515863	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:4,0,5,1
chr1	204516025	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=174,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,5:6,3:2,8,3,5
chr1	204518842	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=205,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:0,4,1,4
chr1	204913627	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=17800032,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:204913627_C_A:204913627:1,0,0,1
chr1	204913633	.	G	GTTTTGCCCTCCAGGGAACAATTGCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=17800032,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:204913627_C_A:204913627:1,0,0,1
chr1	204921054	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	204923887	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:8,1,2,0
chr1	204926980	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,0:2,2:0,4,1,2
chr1	204943285	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr1	204943991	.	CA	TG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:4,5:9,5:0,13,0,10
chr1	204943992	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.959:23:0,9:0,14:0,0,0,23
chr1	204960533	.	A	ATTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:204960533_A_ATTC:204960533:0,1,0,1
chr1	204960535	.	G	GGAGGAGGAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:204960533_A_ATTC:204960533:0,1,0,1
chr1	204960537	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=167,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:204960533_A_ATTC:204960533:0,1,0,1
chr1	204978914	.	A	ATGTGTGTGTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	205028883	.	CAG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:1,2:5,4:0,6,1,5
chr1	205031508	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=172,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:8,1,0,2
chr1	205031672	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=131,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:5,9,1,1
chr1	205031744	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=113,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr1	205031769	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	205033374	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:3,3:4,4:7,0,8,0
chr1	205034488	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=265,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	205038731	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	205039288	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=226,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	205041015	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr1	205041262	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr1	205041542	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=193,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr1	205041789	.	A	ATTACTTCTAACTCTTGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=194,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	205042115	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,3:3,6:4,0,9,0
chr1	205042939	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	205057880	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=166,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:8,3:18,0:24,2,2,1
chr1	205063949	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:7,1,2,0
chr1	205065733	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,4:3,3:6,0,7,0
chr1	205070758	.	AT	CA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:23,0:10,2:14,19,0,2
chr1	205083865	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,17:0.305:57:22,10:18,7:36,4,14,3
chr1	205084120	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,17:0.387:45:15,9:10,8:7,21,2,15
chr1	205090885	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=47835577,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr1	205129466	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	205130413	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,7:0,0,16,4
chr1	205138321	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:5,7:12,9:9,8,12,4
chr1	205240913	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	205274512	.	T	TGAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,880;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,1,0
chr1	205312280	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=169,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	205312767	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	205385498	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr1	205417563	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr1	205417586	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,1:1,2:0,1,0,4
chr1	205561511	.	T	TTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=317,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.785:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr1	205568213	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:5,10:10,6:14,1,14,2
chr1	205568390	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:4,6:6,9:0,10,2,13
chr1	205568438	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:1,2:1,2:0,3,0,5
chr1	205568442	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=152,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	205585640	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,106;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,1:11,1:17,2,2,0
chr1	205630893	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	205632726	.	G	GCCCTGGGTCCATGCTAATGGCTAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=118,195;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	205718991	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,5:0.071:73:36,3:27,1:47,21,3,2
chr1	205739396	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=174,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr1	205740829	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr1	205743903	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,0:1,0:0,1,3,0
chr1	205743912	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=192,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:0|1:205743912_T_G:205743912:2,1,1,0
chr1	205743913	.	C	CGGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,11;MFRL=192,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=G;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:0|1:205743912_T_G:205743912:2,1,1,0
chr1	205764433	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,4:6,5:9,1,6,3
chr1	205764640	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:2,9:2,8:0,4,4,13
chr1	205766159	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=183,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.717:16:2,5:2,6:0,4,2,10
chr1	205767187	.	G	GT	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,2:0.043:67:28,2:36,0:0|1:205767187_G_GT:205767187:28,37,1,1
chr1	205767188	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,2:0.043:67:29,2:36,0:0|1:205767187_G_GT:205767187:28,37,1,1
chr1	205767189	.	CAGAGG	C	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,2:0.041:70:29,2:36,0:0|1:205767187_G_GT:205767187:28,40,1,1
chr1	205810947	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,18:0.372:49:14,10:17,8:16,15,9,9
chr1	205811865	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,7:0,2:0,2,4,6
chr1	205813007	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=277,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:205813007_G_T:205813007:1,0,0,1
chr1	205813008	.	GCA	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=277,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:205813007_G_T:205813007:1,0,0,1
chr1	205813014	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=277,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:205813007_G_T:205813007:1,0,0,1
chr1	205814695	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,5:2,1:0,3,0,6
chr1	205816923	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,242;MMQ=27,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,1:8,2:15,0,3,0
chr1	205886381	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr1	205888143	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=315,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	205890679	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr1	205892411	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.555:25:7,7:4,3:0|1:205892411_T_C:205892411:10,1,10,4
chr1	205892415	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=52.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,15:0.571:26:6,9:4,4:0|1:205892411_T_C:205892411:10,1,11,4
chr1	205893699	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	205896235	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr1	205896293	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:7,6:5,7:10,2,11,2
chr1	205896431	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,9:6,2:4,7,2,9
chr1	205896475	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr1	205897876	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:1,3:3,1,8,0
chr1	205901788	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,12,3
chr1	205902242	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,4:7,6:1,12,1,9
chr1	206239317	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	206328647	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=67.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,19,0
chr1	206328803	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=54,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.868:20:2,9:0,9:1,1,5,13
chr1	206516159	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=298,280;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	206557403	.	T	TACC	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=151,124;MMQ=25,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,4:0.076:63:31,4:26,0:0|1:206557403_T_TACC:206557403:0,59,0,4
chr1	206557405	.	A	AGTAGAGCTCGT	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=151,124;MMQ=25,25;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,4:0.077:63:30,4:28,0:0|1:206557403_T_TACC:206557403:0,59,0,4
chr1	206566293	.	G	C	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=160,173;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,8:0.124:70:27,4:35,4:10,52,0,8
chr1	206567100	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=173,170;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,3:8,3:0,14,0,6
chr1	206579936	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=154,179;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.512:39:10,5:9,15:19,0,20,0
chr1	206623685	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,10,6
chr1	206623866	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	206626779	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	206648378	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr1	206665896	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=162.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,15:0,31:0,0,20,26
chr1	206666366	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:5,1:5,1:3,8,0,2
chr1	206670827	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	206757850	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:21,1:24,2:18,29,0,3
chr1	206758077	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	206758091	.	C	CATCAGAGGCCAGGTCCTTTAGGGGTAGGCCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=148,130;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr1	206760474	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr1	206769047	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=59.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.686:26:5,10:2,8:5,3,15,3
chr1	206772753	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	206775897	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=264,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:206775897_C_A:206775897:0,1,0,1
chr1	206775899	.	CA	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=264,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:206775897_C_A:206775897:0,1,0,1
chr1	206776203	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,3:0,0,12,0
chr1	206858861	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.156:21:7,1:5,1:4,14,0,3
chr1	206904137	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,86;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	206904464	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:11,8:5,8:12,5,11,6
chr1	206943297	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.435:16:5,3:3,2:2,7,0,7
chr1	206943351	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	206944233	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.491:41:12,12:8,8:13,8,13,7
chr1	206944645	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.736:17:3,9:1,3:2,2,13,0
chr1	206944861	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:1,3,0,6
chr1	207014472	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,0,13
chr1	207039098	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:207039098_A_C:207039098:0,0,1,0
chr1	207039103	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:207039098_A_C:207039098:0,0,1,0
chr1	207039110	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:207039098_A_C:207039098:1,0,1,0
chr1	207040659	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	207071236	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,1:6,1:0,10,1,1
chr1	207083746	.	G	GAAAATTGAGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=210,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:207083746_G_GAAAATTGAGT:207083746:0,3,0,1
chr1	207083747	.	C	CTCAGTTTCACACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=210,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:207083746_G_GAAAATTGAGT:207083746:0,3,0,1
chr1	207135516	.	AC	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:1,0:6,0,3,0
chr1	207235954	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=63.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.535:41:8,16:11,6:9,10,13,9
chr1	207237096	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,21:0.482:44:11,10:10,11:10,13,16,5
chr1	207237228	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.423:12:6,1:1,0:0|1:207237228_T_G:207237228:2,5,0,5
chr1	207237235	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.378:11:3,2:1,0:0|1:207237228_T_G:207237228:2,5,0,4
chr1	207241440	.	AGT	A,AGTGTGTGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31,33;MFRL=161,123,110;MMQ=60,60,54;MPOS=10,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,14;RU=GT;STR;TLOD=5.76,3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.391,0.354:5:1,2,0:0,0,2:1,0,4,0
chr1	207243851	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	207269858	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,11,8
chr1	207300259	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,6,19
chr1	207497811	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	207500032	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=216,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,2:2,2:3,0,5,0
chr1	207504669	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,2,15
chr1	207510596	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr1	207640345	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=212,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	207641840	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,2:4,3:9,2,4,1
chr1	207642295	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=226,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,2,1
chr1	207653444	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=106,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:3,3:2,2:2,3,0,5
chr1	207700348	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=204,210;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:207700348_G_A:207700348:0,1,0,2
chr1	207700353	.	T	TCTATAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=204,210;MMQ=25,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:207700348_G_A:207700348:0,1,0,2
chr1	207737670	.	GAC	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=194,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.283:19:9,3:4,2:0,14,1,4
chr1	207739127	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=134,154;MMQ=52,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.385:50:16,8:15,11:27,4,17,2
chr1	207753831	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=140,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.279:15:7,1:2,2:7,4,1,3
chr1	207760897	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,2:12,0:0|1:207760897_A_T:207760897:9,16,0,2
chr1	207760899	.	A	AATGATG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,1:13,0:0|1:207760897_A_T:207760897:9,16,0,2
chr1	207784968	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr1	207812791	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=191,148;MMQ=52,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,4:4,4:0,5,1,7
chr1	207850717	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.549:25:2,6:9,6:9,2,11,3
chr1	207851487	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:4,6:1,8:5,0,13,1
chr1	207872507	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=142,150;MMQ=52,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=116.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,45:0.527:85:19,22:21,21:32,8,39,6
chr1	207881485	.	TA	T	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=146,137;MMQ=56,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,22:0.382:58:14,7:18,13:0|1:207881485_TA_T:207881485:24,12,16,6
chr1	207881489	.	T	G	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=146,137;MMQ=56,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=75.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,22:0.382:58:15,8:20,12:0|1:207881485_TA_T:207881485:24,12,16,6
chr1	207881491	.	C	A	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=146,146;MMQ=56,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,20:0.362:56:14,8:20,12:0|1:207881485_TA_T:207881485:24,12,14,6
chr1	207891027	.	GT	G	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,91;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.050:77:32,3:37,0:11,63,3,0
chr1	207940853	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=197,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:3,3:0,2:4,0,5,0
chr1	207956559	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.658:36:7,15:5,9:11,1,22,2
chr1	207959122	.	CTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=71,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:2,0:0,1:0|1:207959122_CTTTT_C:207959122:0,2,0,1
chr1	207959136	.	T	TAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=71,225;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,11;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:207959122_CTTTT_C:207959122:0,2,0,1
chr1	208062471	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.426:24:6,6:7,4:8,6,5,5
chr1	208063100	.	G	A,GA,GAA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=35,32,34,34;MFRL=105,141,152,159;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,26,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=28.03,10.61,9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,16,7,4:0.372,0.299,0.180:31:1,8,4,1:3,8,2,3:3,1,10,17
chr1	208204919	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,4:2,3:9,0,6,1
chr1	208206946	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	208211850	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:0,6,1,3
chr1	208211887	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	208212129	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,4:1,5:4,0,6,3
chr1	208213125	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr1	208213241	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,3,1
chr1	208213308	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.719:22:3,7:2,9:4,2,13,3
chr1	208216304	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr1	208219164	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr1	208224579	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.542:40:9,10:9,9:13,5,17,5
chr1	208234228	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	208255877	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr1	208255899	.	CA	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=178,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:208255899_CA_TT:208255899:0,3,0,1
chr1	208255904	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=178,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:208255899_CA_TT:208255899:0,3,0,1
chr1	208276399	.	C	CCTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=CT;STR;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	208383713	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:17,1:15,1:21,13,2,0
chr1	209605636	.	TAGCAGCAGCAGC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=141,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=AGC;STR;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.459:9:2,4:1,0:0,5,0,4
chr1	209779805	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr1	209792015	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr1	209796267	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=222,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	209804095	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,2,11
chr1	209811829	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.567:19:3,5:5,5:6,2,9,2
chr1	209812063	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	209849002	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=106.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,17:0,15:0,0,26,6
chr1	209849399	.	AG	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=119.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.968:28:0,12:0,14:0|1:209849399_AG_A:209849399:0,0,10,18
chr1	209849406	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,12:0,14:0|1:209849399_AG_A:209849399:0,0,10,18
chr1	209849714	.	TA	T	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=182.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,33:0,32:0,0,43,25
chr1	209905763	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=173,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.496:26:6,6:7,6:12,1,12,1
chr1	209905988	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=160,216;MMQ=50,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:13,1:6,2:0,19,0,3
chr1	209906015	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=181,160;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,4:3,1:0,9,0,5
chr1	209950681	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,12,6
chr1	209952865	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:2,6:6,3:3,6,3,6
chr1	209965587	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=134,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:13,2:4,4:15,2,4,2
chr1	209969902	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=115,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:6,9:11,6:10,8,8,8
chr1	209974554	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,14;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:4,0:1,0:2,4,2,0
chr1	210001543	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,0:2,5:1,5,1,4
chr1	210001586	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=189,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	210003388	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:5,4:11,1,8,0
chr1	210003402	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=91.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,13:0,12:0,0,25,0
chr1	210004199	.	C	G	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=270.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,44:0,30:0,0,31,43
chr1	210004319	.	G	C	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=132,44;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,3:0.049:79:40,3:33,0:37,39,3,0
chr1	210006437	.	GC	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	210008367	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=76.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0|1:210008367_C_G:210008367:0,0,14,6
chr1	210008374	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.499:22:6,5:5,6:0|1:210008367_C_G:210008367:8,3,7,4
chr1	210012102	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	210015568	.	GCT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=47.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr1	210016896	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:20,2:9,0:9,21,2,0
chr1	210407338	.	T	TAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:8,0:5,2:0,13,0,2
chr1	210407339	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.550:17:5,4:3,5:0,8,0,9
chr1	210411266	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=104,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.315:14:3,2:2,2:0|1:210411266_GT_G:210411266:7,3,4,0
chr1	210411281	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,9;MFRL=110,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.297:20:4,0:6,0:0|1:210411266_GT_G:210411266:8,6,6,0
chr1	210414879	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.313:28:7,0:5,4:13,6,3,6
chr1	210577873	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,7:5,1:3,6,3,5
chr1	210577884	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:4,6:4,2:2,7,3,5
chr1	210591742	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	210686570	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=139,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,5:3,6:1,5,1,10
chr1	210686614	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=152,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	210856585	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	210856604	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=228,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr1	210970823	.	T	TG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.413:20:6,3:5,5:9,3,7,1
chr1	211276828	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=73.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,14:0,8:0,0,17,5
chr1	211280724	.	TAA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.939:12:0,3:0,7:0,0,3,9
chr1	211444464	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=191,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,0:8,4:13,0,4,0
chr1	211447435	.	CTT	C,CT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,219,184;MMQ=60,60,60;MPOS=20,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=T;STR;TLOD=6.03,83.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,31:0.131,0.844:35:0,1,15:0,3,15:0,0,35,0
chr1	211451393	.	TATC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:3,4:5,2:8,1,7,0
chr1	211452529	.	TAA	T,TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33,31;MFRL=82,175,156;MMQ=60,58,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.17,27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,15:0.182,0.676:22:1,1,7:1,3,6:2,1,15,4
chr1	211452678	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,28:0.509:55:14,13:10,14:6,21,8,20
chr1	211452728	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=167,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:7,5:7,4:0,14,0,9
chr1	211545442	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=191,172;MMQ=60,55;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.525:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr1	211545459	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=18,14;MFRL=191,103;MMQ=60,55;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:0,0:0,0:4,0,2,0
chr1	211652755	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	211837028	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,0:11,3:0,23,0,3
chr1	212118366	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	212118391	.	G	GATCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=207,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	212139896	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,0:1,5:0,5,1,4
chr1	212142055	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=195,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.409:24:5,3:6,3:2,12,4,6
chr1	212194560	.	GA	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.114:41:14,4:17,0:2,35,0,4
chr1	212217944	.	GA	G,GAA	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=36,35,35;MFRL=161,160,115;MMQ=60,60,57;MPOS=22,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=9.60,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,8,4:0.273,0.124:29:10,1,2:7,7,1:17,0,11,1
chr1	212217963	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=20,16;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.110:43:8,0:12,0:33,4,6,0
chr1	212217971	.	C	CTT	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=109.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,31:0.637:49:5,7:5,7:16,2,25,6
chr1	212217976	.	T	A	.	.	DP=67;ECNT=4;MBQ=29,14;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.053:59:24,0:22,0:42,14,3,0
chr1	212220847	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	212236157	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=94,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.621:19:1,5:6,7:4,3,12,0
chr1	212240063	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:3,0,8,0
chr1	212241714	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.529:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	212241739	.	C	CAGAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:212241739_C_CAGAT:212241739:0,3,0,1
chr1	212241740	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:212241739_C_CAGAT:212241739:0,3,0,1
chr1	212241743	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:212241739_C_CAGAT:212241739:1,3,0,1
chr1	212519369	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=195,178;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:212519369_G_A:212519369:0,2,0,1
chr1	212519375	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=195,178;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:212519369_G_A:212519369:0,2,0,1
chr1	212521639	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	212530192	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,4:2,3:4,0,5,2
chr1	212530659	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.222:20:6,3:8,1:0,16,0,4
chr1	212538786	.	TT	CC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	212587978	.	G	GCCC	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=31,10;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.784:17:3,0:0,0:0,3,14,0
chr1	212587979	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=26,13;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.788:17:3,1:0,2:0,3,14,0
chr1	212587981	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=27,13;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,14:0.756:18:3,2:0,4:0|1:212587981_A_C:212587981:0,4,14,0
chr1	212587988	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.545:18:6,4:0,5:0|1:212587981_A_C:212587981:1,7,10,0
chr1	212587994	.	CAT	C	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=32,17;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:11,2:1,1:0|1:212587981_A_C:212587981:5,11,7,0
chr1	212587999	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=31,13;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:13,2:3,0:0|1:212587981_A_C:212587981:5,12,6,0
chr1	212588003	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=31,32;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:14,3:2,1:0|1:212587981_A_C:212587981:7,14,5,0
chr1	212588005	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=32,11;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:15,1:5,0:0|1:212587981_A_C:212587981:9,15,5,0
chr1	212588021	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=9;MBQ=31,10;MFRL=141,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.102:45:19,0:17,0:16,22,5,2
chr1	212615875	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=206,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:1,2:1,1:2,0,4,0
chr1	212619339	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:4,5:7,10:5,6,7,8
chr1	212900434	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr1	212912108	.	ATT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr1	212969842	.	C	CT,CTT	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=34,34,34;MFRL=167,154,177;MMQ=60,60,60;MPOS=17,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=49.86,13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,24,11:0.598,0.274:41:1,13,6:5,7,3:6,0,30,5
chr1	212969856	.	C	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=19,10;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,17:0.228:61:10,0:10,2:30,14,16,1
chr1	212970375	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr1	213009157	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=184,156;MMQ=40,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr1	213009178	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=169,168;MMQ=40,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.397:11:2,2:4,2:6,1,4,0
chr1	213032568	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,0,13
chr1	213056819	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr1	213056892	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	213062017	.	T	TTTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TTG;STR;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.878:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	213068233	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,15:0,7:0,0,22,0
chr1	213139748	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:0,6,0,6
chr1	213140398	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:2,3:4,6:1,5,9,1
chr1	213168513	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.422:43:13,10:12,8:6,19,8,10
chr1	213180441	.	GAA	G,GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34,33;MFRL=0,161,113;MMQ=60,60,60;MPOS=15,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=6.04,8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,5:0.385,0.537:8:0,1,2:0,2,2:0,0,7,1
chr1	213181452	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=161,161;MMQ=58,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:213181452_T_C:213181452:3,0,1,0
chr1	213181458	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=161,158;MMQ=58,35;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0|1:213181452_T_C:213181452:3,0,2,0
chr1	213181486	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=194,167;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,1:8,1:14,0,2,0
chr1	213303245	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:213303245_GT_G:213303245:0,1,0,1
chr1	213303247	.	ATATTATGTTTTGG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:213303245_GT_G:213303245:0,1,0,1
chr1	213303261	.	CATG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:213303245_GT_G:213303245:0,1,0,1
chr1	213303272	.	GT	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=199,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	213349664	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	213403990	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=173,168;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,1:0,1:0,7,0,2
chr1	213404014	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=190,222;MMQ=57,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr1	214454774	.	GGGC	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGC;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:5,0:8,3:4,10,1,2
chr1	214478459	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,5:0,0,8,0
chr1	214492162	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,2:1,0:3,1,0,2
chr1	214503489	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,16,7
chr1	214531239	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,25:0.520:48:13,13:10,12:16,7,21,4
chr1	214551276	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,10:0,15:0,0,20,6
chr1	214557048	.	GCCT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCT;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,2:0,0:4,2,1,1
chr1	214558228	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,14;MFRL=0,219;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr1	214564442	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=135,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.492:24:8,7:4,3:1,11,1,11
chr1	214566952	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,14:0,4:0,0,18,0
chr1	214567013	.	CG	C	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=199.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.987:71:0,45:0,26:0,0,53,18
chr1	214637882	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	214638172	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr1	214794191	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:18,0:7,2:12,13,1,1
chr1	214804063	.	TTA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:0|1:214804063_TTA_T:214804063:0,8,0,2
chr1	214804067	.	T	TCTCTCTGTCCATCTCTCTC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:214804063_TTA_T:214804063:0,8,0,2
chr1	214815033	.	C	G	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,9:0.127:76:35,7:31,2:29,38,2,7
chr1	214824974	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=177,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:6,2:17,1,2,0
chr1	214825289	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:5,4:9,6:0,17,0,10
chr1	214826364	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:10,3:7,3:5,13,0,6
chr1	214828812	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:8,3:3,6:0,11,1,9
chr1	214830205	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=189,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr1	214832344	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,108;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:3,0:15,3:4,16,0,3
chr1	215345263	.	GTCTCTC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,8;RU=TC;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	215368514	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	215753355	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=58.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,3,14
chr1	215754380	.	G	GGATCACCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=201,154;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:215754380_G_GGATCACCT:215754380:0,3,0,2
chr1	215754384	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=201,162;MMQ=60,36;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:215754380_G_GGATCACCT:215754380:0,3,0,1
chr1	215754388	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=201,162;MMQ=60,36;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0|1:215754380_G_GGATCACCT:215754380:0,3,0,1
chr1	215781574	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr1	215814142	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:2,1:6,2:0,10,0,3
chr1	215853748	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.872:5:0,2:0,3:0|1:215853748_GT_G:215853748:0,0,0,5
chr1	215853770	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=170,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:215853748_GT_G:215853748:0,2,0,1
chr1	215853771	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=170,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:215853748_GT_G:215853748:0,2,0,1
chr1	215853774	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=170,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:215853748_GT_G:215853748:0,2,0,1
chr1	215914646	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:5,1,3,0
chr1	215914826	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,102;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:11,3:9,2:4,16,2,3
chr1	215916728	.	ATGTGTGTGTG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=164,192;MMQ=40,40;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=15,10;RU=TG;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:215916728_ATGTGTGTGTG_A:215916728:0,3,0,1
chr1	215916740	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=164,192;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:215916728_ATGTGTGTGTG_A:215916728:0,3,0,1
chr1	215931928	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:6,4:4,3:10,0,7,0
chr1	215956304	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,3,6
chr1	215963374	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=121,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr1	215972180	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:1,0,9,1
chr1	215990410	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=172,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:13,3:12,0:0|1:215990410_G_T:215990410:13,13,2,1
chr1	215990414	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=172,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:11,3:12,0:0|1:215990410_G_T:215990410:14,12,2,1
chr1	216051157	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,7:5,5:2,7,6,6
chr1	216107915	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	216222071	.	G	GTGTGGTA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0,12,0,2
chr1	216246675	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	216270618	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=154.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,26:0,18:0,0,1,44
chr1	216497469	.	CCAAT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr1	216500830	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	216538507	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	216595306	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:7,5:8,6:10,6,5,6
chr1	216680376	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:15,0:18,2:14,19,1,1
chr1	216850409	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,1:5,6:8,2,7,0
chr1	217604777	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,1:4,7:0,5,0,8
chr1	217784431	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.444:12:2,4:5,1:0,7,0,5
chr1	217793938	.	T	TTAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAA;STR;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr1	217822135	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr1	217856803	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.373:33:13,8:7,4:2,19,0,12
chr1	217947911	.	T	TCTTGGCAACATGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=203,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	218458557	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	218578737	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=231,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0|1:218578737_C_A:218578737:0,1,0,1
chr1	218578740	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=231,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:218578737_C_A:218578737:0,1,0,1
chr1	218578742	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=231,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:218578737_C_A:218578737:0,1,0,1
chr1	218578743	.	C	CAGGT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=231,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:218578737_C_A:218578737:0,1,0,1
chr1	218610662	.	CTT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=108,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,2:4,0:11,2,2,0
chr1	218610682	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.323:19:2,0:6,1:8,5,6,0
chr1	218683417	.	CT	C,CTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,34,31;MFRL=145,161,173;MMQ=60,60,60;MPOS=19,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=10.83,4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,9,4:0.262,0.161:29:7,5,3:8,3,1:15,1,12,1
chr1	219366400	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	219383848	.	A	ACTTTTT	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=202.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,19:0,19:0,0,43,4
chr1	219383867	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=176.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,23:0,26:0,0,39,11
chr1	220145371	.	T	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=101.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,33:0.586:56:11,20:12,13:22,1,28,5
chr1	220153332	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=200,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	220154246	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.446:15:6,5:2,1:0,8,0,7
chr1	220154659	.	TAAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=189,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.568:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr1	220156090	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=82.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,28:0.527:53:14,17:11,11:16,9,20,8
chr1	220156704	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,28:0.516:54:15,9:9,18:0|1:220156704_T_C:220156704:8,18,7,21
chr1	220156729	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,17:0.500:34:9,4:8,11:0|1:220156704_T_C:220156704:4,13,4,13
chr1	220160433	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:8,11:5,3:13,0,13,1
chr1	220162195	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr1	220178717	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr1	220191932	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=13,17;MFRL=75,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.547:5:0,1:0,0:0,2,0,3
chr1	220192495	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=211,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,3:0,4:0,3,0,7
chr1	220197545	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=228,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	220205693	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,0:1,2:2,0,2,0
chr1	220205943	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	220207017	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=92.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,34:0.473:72:21,18:17,16:6,32,9,25
chr1	220208154	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,7:2,3:8,0,10,0
chr1	220231248	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=133,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,4:0.063:77:44,1:29,3:19,54,0,4
chr1	220231253	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=9;MBQ=34,27;MFRL=135,111;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,2:0.042:69:44,0:22,2:14,53,1,1
chr1	220231258	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.049:64:37,0:21,3:13,48,0,3
chr1	220231268	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=144,157;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,2:0.056:51:29,0:19,2:3,46,0,2
chr1	220231293	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=164,152;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.096:28:10,2:15,0:0|1:220231293_A_G:220231293:0,26,0,2
chr1	220231295	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=32,21;MFRL=164,152;MMQ=60,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.096:28:10,1:16,0:0|1:220231293_A_G:220231293:0,26,0,2
chr1	220231299	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=36,17;MFRL=164,152;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.096:28:10,0:16,0:0|1:220231293_A_G:220231293:0,26,0,2
chr1	220231343	.	CA	C	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=35,34;MFRL=188,152;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.187:13:4,0:7,2:0|1:220231343_CA_C:220231343:0,11,0,2
chr1	220231347	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=182,152;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.201:12:4,0:6,2:0|1:220231343_CA_C:220231343:0,10,0,2
chr1	220232091	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=191,195;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr1	220232151	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=155,158;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:3,2:12,0:16,0,2,0
chr1	220233219	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:3,1:0,7,0,2
chr1	220269439	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.459:36:10,9:9,6:18,1,15,2
chr1	220275378	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:0,6:7,3:7,0,9,0
chr1	220284258	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:10,2:6,13,1,1
chr1	220300035	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,3:5,4:7,3,7,0
chr1	220310347	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:1,4,0,5
chr1	220313680	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=163,188;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0,5,0,2
chr1	220313722	.	TG	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=155,184;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0,4,0,1
chr1	220319007	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:15,2:13,7:6,22,3,6
chr1	220327203	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=164,158;MMQ=60,34;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:220327203_C_T:220327203:4,0,2,0
chr1	220327207	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=164,158;MMQ=60,34;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0|1:220327203_C_T:220327203:4,0,2,0
chr1	220331298	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	220345878	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,6:4,1:6,0,6,1
chr1	220368534	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:20,4:14,0:17,17,4,0
chr1	220373857	.	C	A	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,31:0.364:86:30,16:22,15:38,17,23,8
chr1	220374047	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.447:29:8,6:8,6:0,16,0,13
chr1	220379361	.	TA	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.114:50:18,3:20,1:8,37,1,4
chr1	220406291	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,6:4,2:0,10,0,8
chr1	220771740	.	TTA	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TA;STR;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.127:52:24,3:17,3:0,46,0,6
chr1	220771832	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr1	220789236	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr1	220789362	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.853:18:2,5:0,10:2,0,1,15
chr1	220808666	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:3,4:1,0:4,0,4,0
chr1	220808921	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	220824115	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:6,3:4,5:2,9,0,8
chr1	220825523	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=112.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,18:0,12:0,0,3,29
chr1	220835392	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:11,0:9,3:10,13,0,3
chr1	220978645	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:6,9:7,9:3,10,3,15
chr1	220982320	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.597:8:0,2:3,1:0,3,0,5
chr1	221055463	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:3,7:10,5:10,3,12,0
chr1	221875661	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=143,176;MMQ=46,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:1,3:9,0:8,2,4,0
chr1	221876029	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr1	222713395	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=83,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:10,12:7,6:8,9,11,7
chr1	222732027	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.460:26:8,5:6,6:11,3,10,2
chr1	222737568	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=58.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,1,16
chr1	222751034	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr1	222802006	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,10:0,9:0,0,10,9
chr1	222805698	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,0:1,2:1,8,0,2
chr1	222823529	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=204,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.682:14:2,6:2,2:4,0,10,0
chr1	222823738	.	GTT	G,GT	.	.	DP=124;ECNT=3;MBQ=33,34,30;MFRL=146,149,131;MMQ=60,60,60;MPOS=31,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=10.29,14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:74,8,15:0.082,0.142:97:34,0,2:30,7,9:21,53,5,18
chr1	222823742	.	T	TG	.	.	DP=116;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,4:0.055:86:29,2:52,2:17,65,1,3
chr1	222823743	.	T	G	.	.	DP=111;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,47:0.542:86:10,22:29,25:11,28,7,40
chr1	222825525	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,52;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:25,3:32,0:50,9,0,3
chr1	222825717	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=141,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,32:0.541:59:9,13:18,19:3,24,5,27
chr1	222825761	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=72.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,4:0,17:0,0,0,21
chr1	222826481	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.543:39:6,8:10,13:7,11,4,17
chr1	222832010	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,22:0.500:44:7,12:15,10:21,1,20,2
chr1	222838216	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=253.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,42:0,32:0,0,27,47
chr1	222846847	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:14,2:0,25,0,2
chr1	222846868	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=177,178;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0,19,0,2
chr1	222867568	.	C	T	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,3:0.037:106:47,2:54,1:64,39,3,0
chr1	222889091	.	C	T	.	.	DP=160;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:133,12:0.088:145:66,6:63,6:73,60,8,4
chr1	223116472	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:7,7:4,6:0|1:223116472_G_A:223116472:6,5,4,10
chr1	223116474	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:7,6:4,7:0|1:223116472_G_A:223116472:6,5,4,10
chr1	223152868	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,7:0,1:0,0,8,1
chr1	223156382	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=168.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,29:0,19:0,0,22,27
chr1	223156406	.	CT	C,CTT	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=21,24,34;MFRL=144,161,0;MMQ=60,60,60;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.83,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,6,3:0.207,0.092:30:9,2,2:9,3,0:4,17,6,3
chr1	223175830	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:18,2:17,2:20,15,2,2
chr1	223283851	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:4,7:8,11:5,7,12,6
chr1	223285057	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=143,81;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:12,4:18,0:14,16,4,0
chr1	223400943	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,1:13,1:12,16,2,0
chr1	223532570	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,5:2,5:0,5,0,10
chr1	223533601	.	T	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,17:0.322:48:16,1:10,3:26,5,0,17
chr1	223533607	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,15:0.300:49:14,0:11,1:27,7,0,15
chr1	223712834	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,619;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,0:9,2:1,15,1,1
chr1	223715248	.	GT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=62.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,22:0.696:31:3,7:6,15:1,8,8,14
chr1	223716349	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr1	223718275	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:223718275_C_G:223718275:0,1,0,1
chr1	223718277	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:223718275_C_G:223718275:0,1,0,1
chr1	223718281	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:223718275_C_G:223718275:0,1,0,1
chr1	223718518	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=233,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.773:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr1	223722646	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	223722780	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=106,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:1,2,1,4
chr1	223807207	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:223807207_A_AG:223807207:0,3,0,1
chr1	223807209	.	A	ACAGGAGGCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:1,0:0|1:223807207_A_AG:223807207:0,3,0,1
chr1	223814671	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	223816322	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,13,2
chr1	223816347	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=73.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,13:0,11:0,0,15,9
chr1	223816577	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	223853440	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	223936923	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.244:19:5,2:5,2:0,15,0,4
chr1	223938565	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.441:41:11,11:11,6:16,7,11,7
chr1	223944932	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	223947106	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:12,1:12,1:5,19,1,1
chr1	223951985	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr1	223959796	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr1	223984296	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=183,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,0:2,2:1,6,0,2
chr1	223984306	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=122,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.681:4:1,2:0,0:0,1,0,3
chr1	223998177	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:18,0:18,2:0|1:223998177_T_C:223998177:15,23,1,1
chr1	223998180	.	T	TCA	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:19,0:16,2:0|1:223998177_T_C:223998177:14,22,1,1
chr1	224008913	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,16,4
chr1	224302154	.	T	TGAG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=112.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,10:0,12:0,0,2,24
chr1	224318151	.	T	TTTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTG;STR;TLOD=68.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,6:0,0,13,4
chr1	224321906	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=162,908;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,1:13,1:5,13,1,1
chr1	224321984	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	224345012	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,8:0,8:0,0,14,2
chr1	224418834	.	CAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=182,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	224424379	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=183,183;MMQ=60,55;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,2:7,0:0,17,0,2
chr1	224444628	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=146.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,21:0,20:0,0,41,0
chr1	224444901	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=101.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,14:0,0,0,27
chr1	224468992	.	T	TACTGAATAAAGACAGAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,210;MMQ=33,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	224477229	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.122:31:14,0:11,3:17,11,0,3
chr1	224492381	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=105.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,13:0,0,25,4
chr1	224495852	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=189.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,22:0,33:0,0,26,29
chr1	224505570	.	T	TAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=154.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,15:0,0,14,23
chr1	224505719	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.830:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	224517907	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.915:10:0,4:0,3:0,0,0,10
chr1	224588825	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr1	224619366	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:11,1:19,1:15,16,1,1
chr1	224868596	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:7,1,4,0
chr1	224872443	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:11,5:9,4:12,8,6,3
chr1	224872473	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.462:33:7,8:9,7:11,7,7,8
chr1	225156457	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=109.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,38:0.591:64:13,18:13,20:18,8,28,10
chr1	225226445	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,11:0.161:72:23,7:38,4:36,25,5,6
chr1	225237850	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,16,1
chr1	225311160	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	225346975	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,1:4,1,4,0
chr1	225394645	.	A	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,28:0.527:53:14,12:11,16:20,5,23,5
chr1	225439988	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,9:5,4:6,5,10,3
chr1	225445589	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.439:7:1,1:2,2:3,1,3,0
chr1	225445652	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,3:6,4:9,8,5,2
chr1	225460626	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=209,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.748:6:0,1:1,4:1,0,4,1
chr1	225460897	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=190,190;MMQ=54,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:225460897_G_A:225460897:0,4,0,1
chr1	225460900	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,16;MFRL=191,190;MMQ=48,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:225460897_G_A:225460897:0,3,0,1
chr1	225460901	.	GA	G,AA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,28,29;MFRL=190,190,210;MMQ=44,40,59;MPOS=5,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:1,0,1:1,1,0:0,2,0,2
chr1	225460903	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=190,210;MMQ=40,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	225460905	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=190,200;MMQ=44,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	225506262	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,19,0
chr1	225512402	.	GT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=53.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,7:0,12:0,0,17,3
chr1	225521282	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr1	225539665	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	225546172	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,10,3
chr1	225546419	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=177,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr1	225546446	.	C	CTATAAACTG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=191,180;MMQ=51,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:225546446_C_CTATAAACTG:225546446:0,4,0,1
chr1	225546450	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=191,180;MMQ=51,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:225546446_C_CTATAAACTG:225546446:0,4,0,1
chr1	225546453	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=191,180;MMQ=51,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:225546446_C_CTATAAACTG:225546446:0,4,0,1
chr1	225546454	.	C	CATTGG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=192,154;MMQ=51,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	225552624	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=175.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,22:0,30:0,0,5,47
chr1	225552650	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=118.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,14:0,21:0,0,1,34
chr1	225555602	.	TC	GC,GT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33,34;MFRL=0,147,156;MMQ=60,60,60;MPOS=22,11;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=93.19,3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,26,2:0.876,0.093:28:0,12,0:0,14,2:0,0,16,12
chr1	225562385	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=109.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,18:0,13:0,0,16,15
chr1	225565217	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=173,136;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:10,1:7,1:0,17,0,2
chr1	225565231	.	GTGGA	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=183,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:9,3:6,0:0|1:225565231_GTGGA_G:225565231:0,15,0,3
chr1	225565235	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=189,141;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:7,1:5,1:0,12,0,2
chr1	225565239	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=187,212;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,1:6,0:0|1:225565231_GTGGA_G:225565231:0,13,0,2
chr1	225576058	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr1	225577648	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:0,4:1,3:0,1,0,8
chr1	225577663	.	T	TCCCCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.281:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	225600351	.	TA	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.189:38:8,3:14,2:6,24,2,6
chr1	225603103	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,10:0,14:0,0,1,24
chr1	225606997	.	C	T	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,98;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,3:0.044:87:36,1:47,2:37,47,3,0
chr1	225607144	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=195.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,36:0,21:0,0,18,41
chr1	225607375	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:8,3:3,0:11,2,3,1
chr1	225611845	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr1	225685621	.	TAAG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	225702410	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.236:32:13,5:7,1:19,6,0,7
chr1	226016614	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:14,1:12,1:6,23,1,1
chr1	226016633	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:9,7:3,7:2,10,2,12
chr1	226027096	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:226027096_G_GA:226027096:0,1,0,1
chr1	226027098	.	G	GATGGTGATGGTGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:226027096_G_GA:226027096:0,1,0,1
chr1	226027101	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:226027096_G_GA:226027096:0,1,0,1
chr1	226027129	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	226027548	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.501:34:10,6:7,11:13,4,13,4
chr1	226044489	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=53.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr1	226048744	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,37;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	226050609	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=101,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,7:2,2:0,4,0,9
chr1	226058862	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,89;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:17,0:27,3:6,39,0,3
chr1	226059643	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=140,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.149:25:5,1:9,1:12,10,3,0
chr1	226075410	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,197;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	226108200	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.478:37:7,8:12,7:12,7,10,8
chr1	226125543	.	G	GA	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=198.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.985:61:0,21:0,40:0,0,12,49
chr1	226127443	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=188,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,0,2
chr1	226252232	.	C	T	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=297.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,88:0.989:88:0,35:0,49:0,0,5,83
chr1	226253316	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=140.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,24:0,17:0,0,38,4
chr1	226334578	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr1	226340365	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=243,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:226340365_C_G:226340365:0,3,0,1
chr1	226340369	.	G	GTCTGTTGAAAAATTCTTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=243,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:226340365_C_G:226340365:0,3,0,1
chr1	226438449	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	226550924	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr1	226556094	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	226578099	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=188,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:0,1,4,4
chr1	226595423	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:2,0,1,0
chr1	226595430	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:3,0,1,0
chr1	226825341	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,3:2,0:2,0,2,1
chr1	226827379	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.180:15:6,1:6,1:0|1:226827379_A_AG:226827379:2,11,0,2
chr1	226827382	.	C	CG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.180:15:4,1:5,1:0|1:226827379_A_AG:226827379:2,11,0,2
chr1	226827384	.	G	GTTCGTAGGGCTCTGTAGA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.238:11:3,1:5,1:0|1:226827379_A_AG:226827379:1,8,0,2
chr1	227170297	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	227170543	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=193,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,5:6,3:6,3,6,2
chr1	227171584	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	227171736	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=36,35;MFRL=181,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:0|1:227171736_G_GT:227171736:4,0,3,0
chr1	227171737	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=224,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.557:7:2,2:0,2:0|1:227171737_G_T:227171737:3,0,4,0
chr1	227171738	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=181,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:2,3:0,0:0|1:227171736_G_GT:227171736:4,0,3,0
chr1	227171739	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=224,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.557:7:3,2:0,1:0|1:227171737_G_T:227171737:3,0,4,0
chr1	227171933	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:0,9,0,2
chr1	227171958	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:0,5,0,5
chr1	227172518	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=106,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,1:4,5:3,2,3,3
chr1	227172903	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr1	227172935	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	227174122	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,36;MFRL=90,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,0:2,3:2,1,3,0
chr1	227174145	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,7,2
chr1	227181923	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0,0,11,0
chr1	227182033	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,15:0,0,16,16
chr1	227182179	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,0:2,5:0,3,0,5
chr1	227192579	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,5:0,0,15,0
chr1	227198775	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=118,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:7,6:6,8:5,8,5,9
chr1	227204557	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:4,4:8,2:12,0,6,0
chr1	227210888	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	227218069	.	C	CAT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=124.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,12:0,0,28,1
chr1	227222515	.	G	GACAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=66.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,9:0,5:0,0,1,14
chr1	227222581	.	A	AAAGGGTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=179,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:227222581_A_AAAGGGTGG:227222581:0,3,0,1
chr1	227222582	.	C	CAGAGAGCACTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=179,82;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:227222581_A_AAAGGGTGG:227222581:0,3,0,1
chr1	227239562	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.313:26:13,2:5,5:13,5,7,1
chr1	227239746	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,4:2,6:0,2,0,10
chr1	227288655	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=141.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,18:0,21:0,0,35,6
chr1	227299978	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=124,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.531:28:6,9:7,5:11,2,15,0
chr1	227300277	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.727:20:3,10:2,5:5,0,14,1
chr1	227327502	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=256,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:227327502_G_A:227327502:0,1,0,2
chr1	227327527	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:227327502_G_A:227327502:0,0,0,2
chr1	227330759	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:9,2:6,4:3,12,2,5
chr1	227387361	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,2:6,5:4,8,0,7
chr1	227400792	.	A	T	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=142.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,50:0.532:94:19,31:25,19:36,8,46,4
chr1	227504613	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=150,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	227834233	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.497:20:6,6:3,4:7,3,6,4
chr1	227834400	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=116,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:4,4:5,7:2,7,5,6
chr1	227841981	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,3:2,6:6,0,9,0
chr1	227920061	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:9,7:13,3:16,6,6,4
chr1	227921175	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,2:14,0:14,10,2,0
chr1	227935355	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.341:10:2,2:3,1:7,0,3,0
chr1	228003967	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:3,7,0,4
chr1	228112121	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=144.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,21:0,17:0,0,7,32
chr1	228284991	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,5:5,1:6,0,6,0
chr1	228289976	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:1,1,1,2
chr1	228345634	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:3,8,2,0
chr1	228400155	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:228400155_A_C:228400155:0,0,1,0
chr1	228400175	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:228400155_A_C:228400155:0,0,1,0
chr1	228404368	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,2:0,6,0,5
chr1	228404668	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	228412106	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=94.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,19,9
chr1	228412227	.	TG	CA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,12:0,0,10,14
chr1	228431235	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	228431930	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	228434602	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	228437603	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,17,2
chr1	228444297	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,105;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr1	228444318	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,15,4
chr1	228444565	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,22:0,23:0,0,15,32
chr1	228456147	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr1	228461408	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0,0,11,0
chr1	228461757	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:5,1:2,4:0,8,1,4
chr1	228464248	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=151.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,16:0,25:0,0,31,11
chr1	228464276	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=172.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,22:0,26:0,0,36,12
chr1	228464842	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	228465370	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=80.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,11:0,9:0,0,21,0
chr1	228466750	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr1	228468547	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=202,93;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:228468547_T_A:228468547:0,3,0,1
chr1	228468549	.	GGCATGGA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=202,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:228468547_T_A:228468547:0,3,0,1
chr1	228468560	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=207,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:228468547_T_A:228468547:0,2,0,1
chr1	228468566	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	228471046	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,1,4
chr1	228476321	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=194,233;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:4,3:1,0:5,1,3,0
chr1	228476532	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.250:41:14,5:17,4:10,21,2,8
chr1	228480964	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	228482010	.	C	T	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=111,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,55:0.624:87:10,20:21,27:0|1:228482010_C_T:228482010:13,19,22,33
chr1	228482028	.	G	C	.	.	DP=82;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=126,122;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:56,23:0.296:79:21,6:33,17:1|0:228482010_C_T:228482010:17,39,8,15
chr1	228495060	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,79;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:16,2:10,0:9,17,0,2
chr1	228497053	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr1	228505204	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:7,11:8,0:5,10,6,5
chr1	228506661	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,4:7,4:5,4,5,3
chr1	228520880	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=116,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,7:3,3:1,3,9,1
chr1	228523442	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,4:2,7:4,0,11,1
chr1	228523447	.	TG	CA,CG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32,31;MFRL=0,146,142;MMQ=60,60,60;MPOS=18,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=35.85,14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,12,5:0.653,0.300:17:0,5,2:0,7,3:0,0,14,3
chr1	228523618	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,2:3,7:0,5,1,8
chr1	228524919	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:2,1,5,2
chr1	228524961	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.680:26:6,5:2,13:6,2,12,6
chr1	228525627	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=118,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.561:14:2,4:4,2:4,2,7,1
chr1	228525898	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	228526486	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:1,3:2,0,5,0
chr1	228526742	.	C	CCACACA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=CA;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	228528232	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:7,0:18,2:14,11,2,0
chr1	228528412	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,7:4,3:6,3,7,3
chr1	228547494	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:7,5:9,8:15,1,10,3
chr1	228548175	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	228554187	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,107;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:7,8,3,0
chr1	228558522	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=205,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:0,2:1,4:0,1,1,6
chr1	228559654	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,4:3,2:4,6,4,2
chr1	228562206	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	228564773	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=136,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr1	228564966	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=139,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr1	228601638	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=282,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	228601671	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=282,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:228601671_A_C:228601671:0,1,0,1
chr1	228601673	.	A	ACCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=282,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:0,1:0|1:228601671_A_C:228601671:0,1,0,1
chr1	228612838	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,16:0,10:0,0,14,12
chr1	228612869	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:18,2:7,0:10,15,0,2
chr1	228613052	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,1,18
chr1	228645063	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=145.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,22:0,16:0,0,37,1
chr1	228646356	.	C	CGT,CGTGT	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=189,125,133;MMQ=60,60,60;MPOS=13,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,16;RU=GT;STR;TLOD=28.46,17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,13,8:0.497,0.326:26:1,5,5:3,5,2:4,1,19,2
chr1	228646846	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:6,2:12,0:15,5,1,1
chr1	228647697	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=76;ECNT=4;MBQ=31,30,32,31;MFRL=152,152,138,155;MMQ=60,50,60,46;MPOS=12,17,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=7.17,34.71,8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:21,6,19,7:0.116,0.357,0.137:53:10,3,10,4:9,2,7,3:2,19,9,23
chr1	228647776	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=185,160;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:11,3:8,0:0|1:228647776_A_C:228647776:0,19,0,3
chr1	228647779	.	GG	CA	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=186,167;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,1:8,0:0|1:228647776_A_C:228647776:0,20,0,2
chr1	228647855	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	228676646	.	TT	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=112,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,0:2,3,1,3
chr1	229385650	.	C	CTTTTT	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=187,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:4,1:1,0:0,5,0,1
chr1	229385669	.	TTC	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=185,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TC;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	229385689	.	TTCC	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,34;MFRL=203,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:229385689_TTCC_T:229385689:0,3,0,1
chr1	229385698	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=203,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:229385689_TTCC_T:229385689:0,3,0,1
chr1	229385699	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:229385689_TTCC_T:229385689:0,2,0,1
chr1	229385703	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:229385703_C_T:229385703:0,2,0,1
chr1	229385706	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=25,31;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:229385689_TTCC_T:229385689:0,2,0,1
chr1	229385707	.	CT	TC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=174,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:229385703_C_T:229385703:0,1,0,1
chr1	229387286	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=116,87;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:3,7,1,1
chr1	229387328	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=176,180;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:229387328_CA_TG:229387328:0,3,0,1
chr1	229387337	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=179,180;MMQ=59,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:229387328_CA_TG:229387328:0,2,0,1
chr1	229387345	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=179,180;MMQ=59,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:229387328_CA_TG:229387328:0,2,0,1
chr1	229422193	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:9,3:7,4:10,6,6,2
chr1	229438530	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=234,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	229461024	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=131,158;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,30:0.526:57:13,15:14,15:12,15,22,8
chr1	229461057	.	G	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:25,0:28,3:35,19,0,3
chr1	229462716	.	T	TATATGTG	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=129,29;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,2:0.031:94:36,2:50,0:31,61,0,2
chr1	229568231	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr1	229580570	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=189,155;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0|1:229580570_A_G:229580570:10,0,2,0
chr1	229580572	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=189,155;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0|1:229580570_A_G:229580570:10,0,2,0
chr1	229625612	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=191,186;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr1	229662901	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.288:21:3,2:10,4:14,1,6,0
chr1	229663064	.	GAGGAA	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGGAA;STR;TLOD=170.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.980:41:0,26:0,14:0,0,6,35
chr1	229738236	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,9,8
chr1	229746019	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,9:0,0,1,11
chr1	229773172	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,2:1,0:0,9,0,2
chr1	229781532	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,15,4
chr1	229781744	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr1	229783236	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0|1:229783236_T_C:229783236:0,0,11,2
chr1	229783240	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,2:0|1:229783236_T_C:229783236:0,0,10,2
chr1	229795070	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,2,9
chr1	230371883	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	230386341	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr1	230410162	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:16,5:12,7:15,13,10,2
chr1	230410374	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr1	230415025	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,6:2,4:6,2,5,5
chr1	230492809	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:7,13,1,1
chr1	230497940	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	230503684	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr1	230778243	.	AC	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=180,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.527:32:3,3:8,8:14,1,17,0
chr1	230778491	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,17:0,17:0,0,0,34
chr1	230795177	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,18,2
chr1	230798864	.	CT	C,CTT	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=143,146,169;MMQ=60,60,60;MPOS=11,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=17.55,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:51,11,4:0.173,0.071:66:22,7,1:27,4,3:42,9,13,2
chr1	230819295	.	ATTC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:6,1:8,3:8,6,2,2
chr1	230819479	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.824:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	230820780	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr1	230822607	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:1,3:3,3:4,0,7,0
chr1	230829139	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,2:8,5:6,9,4,3
chr1	230883466	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=120,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.551:16:4,2:2,5:0|1:230883466_C_T:230883466:1,6,3,6
chr1	230883484	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=120,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:5,1:0,5:0|1:230883466_C_T:230883466:1,4,2,4
chr1	230883499	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=22,25;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.429:10:3,1:0,3:0|1:230883466_C_T:230883466:0,6,1,3
chr1	230891248	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr1	230910481	.	CTTTCTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=168546389,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	230914706	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=102,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.479:17:6,2:2,6:0|1:230914706_C_A:230914706:6,3,4,4
chr1	230914729	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,11:0,6:0|1:230914706_C_A:230914706:0,0,8,11
chr1	230915827	.	CGTGTGTGT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=GT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	230923187	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,16,3
chr1	230928512	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	231042705	.	C	T	.	.	DP=105;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,3:0.038:103:48,2:52,1:55,45,3,0
chr1	231042732	.	T	A	.	.	DP=98;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=315.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,91:0.990:91:0,41:0,49:0,0,36,55
chr1	231047310	.	TAC	T	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=18,31;MFRL=95,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=287.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,81:0.980:82:0,37:0,43:0,1,27,54
chr1	231047392	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,17:0,0,1,30
chr1	231057310	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=107.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,19:0,13:0,0,1,31
chr1	231060736	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr1	231064611	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr1	231066951	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr1	231067236	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr1	231067318	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	231069652	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	231081269	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,5:1,8:0,1,0,13
chr1	231081304	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr1	231124055	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.409:42:15,12:10,5:24,1,16,1
chr1	231298699	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=87,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:2,3:2,2:3,1,5,1
chr1	231299470	.	AGCC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=198,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCC;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:0,1:3,1:3,2,1,1
chr1	231337031	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	231359931	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,0:2,4:3,0,4,0
chr1	231361110	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,3:5,1:7,0,4,0
chr1	231377081	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,14:0,0,21,11
chr1	231386612	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	231401081	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.084:56:26,4:25,0:27,25,3,1
chr1	231401596	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=119.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,15:0,17:0,0,1,31
chr1	231403339	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=198,218;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	231408024	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.717:29:4,6:3,15:6,2,16,5
chr1	231486976	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=103,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.428:7:0,1:3,0:0|1:231486976_G_A:231486976:2,2,3,0
chr1	231486978	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.382:8:1,0:3,0:0|1:231486976_G_A:231486976:3,2,3,0
chr1	231502230	.	TA	T,TAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31,32;MFRL=142,164,166;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=10.56,5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,4:0.286,0.252:17:5,3,2:3,2,1:1,7,1,8
chr1	231509825	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,2:0.046:63:28,1:33,1:22,39,1,1
chr1	231697030	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.503:30:9,8:5,7:1,14,1,14
chr1	231936016	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	232094729	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr1	232098999	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:0,0:2,3:0,2,1,2
chr1	232144842	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=165,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,0:3,2:1,4,1,1
chr1	232172374	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:10,8:11,7:20,1,14,1
chr1	232172623	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,22;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:1,1:2,6,0,4
chr1	232534776	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=96276278,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr1	232535030	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,3:0,0,1,11
chr1	232551416	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	232568293	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	232650663	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:7,6,0,2
chr1	232940853	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=143,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:24,2:19,0:29,14,2,0
chr1	232941153	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,37:0.717:51:9,22:5,15:5,9,13,24
chr1	232943329	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:2,1:11,2:4,9,2,1
chr1	232943694	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=94.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,35:0.493:71:23,16:13,19:20,16,19,16
chr1	232944569	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=111,136;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:6,7:1,7:3,4,3,11
chr1	233091295	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=63,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.188:23:8,1:5,2:8,11,4,0
chr1	233113827	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	233119951	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr1	233134900	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.463:28:8,2:7,10:6,9,8,5
chr1	233135198	.	CTT	C,CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,19,17;MFRL=151,157,168;MMQ=40,40,40;MPOS=5,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=5.03,8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,6:0.308,0.401:16:2,1,0:1,1,2:0,5,0,11
chr1	233137192	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=184,167;MMQ=53,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:2,1:17,4:19,0,5,0
chr1	233137225	.	CATAA	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=231,151;MMQ=53,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=ATAA;STR;TLOD=67.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.869:19:0,6:1,10:2,0,17,0
chr1	233152910	.	A	AAAAGCAAGATTTTGAGTCCTCACAGCTATTCT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=60.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,4:0,5:0,0,1,13
chr1	233225957	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,4:3,0:1,9,0,4
chr1	233225971	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:8,3:5,0:0|1:233225971_A_C:233225971:1,13,0,3
chr1	233225973	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=157,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:8,3:4,0:0|1:233225971_A_C:233225971:1,12,0,3
chr1	233225976	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:7,3:4,0:0|1:233225971_A_C:233225971:1,11,0,3
chr1	233353882	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,265;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:22,0:20,3:20,24,3,0
chr1	233362941	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:9,0,2,0
chr1	233372603	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,1:9,1:11,10,2,0
chr1	233431154	.	T	G	.	.	DP=108;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:101,5:0.034:106:51,1:41,0:0|1:233431154_T_G:233431154:54,47,1,4
chr1	233431158	.	G	GTGGGCCGCGCTCACC	.	.	DP=109;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=150,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:105,2:0.027:107:54,2:46,0:0|1:233431154_T_G:233431154:53,52,1,1
chr1	233464441	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=27,15;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.416:6:1,0:1,0:0|1:233464441_G_C:233464441:4,0,2,0
chr1	233464443	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=22,11;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:1,0:0|1:233464441_G_C:233464441:3,1,2,0
chr1	233464446	.	CGG	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:2,2:0|1:233464441_G_C:233464441:3,1,2,0
chr1	233464454	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=11,31;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:1,0:0,2:0|1:233464441_G_C:233464441:2,1,2,0
chr1	233464457	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=11,21;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,0:0,1:0|1:233464441_G_C:233464441:3,2,2,0
chr1	233464459	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=24,28;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:2,0:1,2:0|1:233464441_G_C:233464441:3,2,2,0
chr1	233464461	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=24,28;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:1,1:0|1:233464441_G_C:233464441:3,2,2,0
chr1	233464469	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=30,17;MFRL=139,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.275:9:2,1:3,0:0|1:233464441_G_C:233464441:3,4,1,1
chr1	233489499	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=113,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,4:6,2:5,1,6,0
chr1	233489529	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=147,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,6:7,2:8,1,8,0
chr1	233489707	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:8,11:16,7:5,19,6,12
chr1	233490536	.	A	AATGTCTTGGGGATAATCTG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:6,1:2,3:0|1:233490536_A_AATGTCTTGGGGATAATCTG:233490536:7,1,4,0
chr1	233490543	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.409:15:7,1:2,4:0|1:233490536_A_AATGTCTTGGGGATAATCTG:233490536:7,2,5,1
chr1	233490764	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.418:24:5,3:9,6:1,13,1,9
chr1	233490776	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:5,3:9,4:1,14,0,7
chr1	233512313	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=98,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.594:25:1,8:9,7:3,7,2,13
chr1	233749855	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=252,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	233767068	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,51;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:10,12,2,0
chr1	233802824	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=224,190;MMQ=60,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:233802824_C_T:233802824:0,3,0,1
chr1	233802828	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,37;MFRL=224,190;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:233802824_C_T:233802824:0,3,0,1
chr1	233802832	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=224,190;MMQ=60,30;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:233802824_C_T:233802824:0,3,0,1
chr1	234040742	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=210,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	234454405	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	234519385	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=199,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,2:3,6:6,0,8,0
chr1	234519452	.	C	CT	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=106.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,45:0.904:50:4,22:1,21:4,1,39,6
chr1	234527575	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,10:0,12:0,0,0,23
chr1	234528373	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	234541622	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=163,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.450:13:3,3:4,1:6,1,4,2
chr1	234556362	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=81,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,0:4,0,3,0
chr1	234556630	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:0,1,0,8
chr1	234556646	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	234561394	.	ATAATT	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,26:0.398:66:17,6:21,20:26,14,22,4
chr1	234561590	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.497:34:7,7:10,9:1,16,0,17
chr1	234563556	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0,10,0,2
chr1	234564864	.	GAA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:6,8:5,1:12,1,9,0
chr1	234565078	.	GA	G,GAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=149,95,156;MMQ=60,60,60;MPOS=23,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.39,17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,9:0.215,0.456:19:5,1,5:0,3,2:1,5,8,5
chr1	234565176	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:6,6:7,9:11,2,8,8
chr1	234565787	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,4:3,0:4,1,4,0
chr1	234582457	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr1	234584176	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:9,1,2,0
chr1	234584288	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=127,116;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:7,6:8,5:6,9,5,6
chr1	234607055	.	TG	T	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=117.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,36:0.606:59:9,19:14,17:3,20,3,33
chr1	234607086	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:6,9:9,7:0,15,0,16
chr1	234607104	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=40.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.590:25:6,9:4,5:0,10,1,14
chr1	234613860	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:5,0,6,0
chr1	234742799	.	GAT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,1:8,1:14,0,2,0
chr1	234745009	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=200,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.710:11:0,5:2,3:3,0,8,0
chr1	235275430	.	G	GA	.	.	DP=134;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=133,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:108,5:0.045:113:46,1:42,2:24,84,1,4
chr1	235299492	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=196,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.596:28:3,8:7,7:0,11,0,17
chr1	235301496	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=34,34,34,28;MFRL=140,158,120,74;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,26,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.72,16.98,8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:38,7,11,7:0.098,0.187,0.118:63:20,2,7,4:15,3,4,2:11,27,6,19
chr1	235316088	.	TA	T	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,6:0.113:59:22,2:23,3:2,51,0,6
chr1	235345782	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.384:50:16,4:15,15:9,22,1,18
chr1	235377266	.	CTCT	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCT;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.086:37:19,2:12,1:11,23,0,3
chr1	235383715	.	TGA	T	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,2:0.026:113:55,2:44,0:51,60,0,2
chr1	235384838	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:4,3:7,0,5,0
chr1	235507245	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,1:6,1:6,10,0,2
chr1	235582898	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,0:6,2:1,14,1,1
chr1	235594182	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0,0,0,25
chr1	235598973	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr1	235628908	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=132.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,47:0.584:80:15,23:17,23:29,4,42,5
chr1	235647631	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,4:3,11:5,1,10,5
chr1	235652642	.	C	CCACATCCAGTTTTTCCTCTTATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152616244,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr1	235715523	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=96,205;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:1,4,0,4
chr1	235715556	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=118,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	235747005	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,3:7,2:11,1,5,0
chr1	235747154	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:6,3:4,1:2,9,1,3
chr1	235826307	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=141,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:19,2:17,2:18,19,3,1
chr1	235918688	.	C	CAAAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AAAAG;STR;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.817:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr1	235971725	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.159:30:10,0:11,0:4,21,5,0
chr1	235971731	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.113:42:16,0:14,0:10,27,5,0
chr1	235971734	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.094:49:19,0:17,1:12,32,5,0
chr1	235971737	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.104:49:20,0:19,0:11,33,5,0
chr1	235972092	.	CTTG	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,73;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:13,0:14,3:15,13,1,2
chr1	236142253	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.511:18:4,3:3,6:7,2,7,2
chr1	236143117	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,2:9,0:18,6,2,0
chr1	236143302	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.819:14:1,6:1,6:0,2,0,12
chr1	236154365	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,1,2
chr1	236175339	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=118,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.287:26:10,4:8,3:6,13,0,7
chr1	236192781	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,50;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,1,1
chr1	236193121	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=180,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:236193121_G_C:236193121:0,4,0,1
chr1	236193124	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=180,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:236193121_G_C:236193121:0,4,0,1
chr1	236193145	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	236195653	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=174,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:3,4:1,2:4,0,7,0
chr1	236205588	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr1	236342024	.	T	TTGTGGGTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=115,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:236342024_T_TTGTGGGTAC:236342024:0,1,0,1
chr1	236342026	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=115,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:236342024_T_TTGTGGGTAC:236342024:0,1,0,1
chr1	236368391	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.432:21:8,3:4,6:9,3,7,2
chr1	236381897	.	T	A	.	.	DP=85;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=135.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,49:0.594:82:19,22:14,26:11,22,15,34
chr1	236381917	.	T	A	.	.	DP=70;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,33:0.525:63:13,15:16,18:7,23,3,30
chr1	236381987	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.546:20:3,7:4,4:0|1:236381987_A_G:236381987:0,9,1,10
chr1	236381989	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.546:20:5,6:3,4:0|1:236381987_A_G:236381987:0,9,1,10
chr1	236384278	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:3,3:4,4:2,5,0,8
chr1	236385116	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.539:25:6,7:5,6:12,0,12,1
chr1	236385165	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,24:0.622:38:9,11:5,11:13,1,23,1
chr1	236385360	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=170,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:7,1:0,8:0,7,2,7
chr1	236385379	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:4,1:0,5:0,4,1,6
chr1	236393654	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,0,21
chr1	236399254	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:13,0:5,2:0|1:236399254_T_TG:236399254:0,19,0,3
chr1	236399256	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=165,127;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:6,1:0|1:236399254_T_TG:236399254:0,19,0,2
chr1	236413147	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,7:3,4:7,3,10,1
chr1	236413282	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.486:27:9,9:4,4:3,11,2,11
chr1	236413362	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=225,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	236415347	.	T	C	.	.	DP=103;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=144.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,47:0.472:100:26,23:26,24:22,31,32,15
chr1	236415433	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=90.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,25:0.634:39:6,12:8,13:0|1:236415433_T_G:236415433:0,14,1,24
chr1	236415444	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=76.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,19:0.645:29:4,9:6,10:0|1:236415433_T_G:236415433:0,10,0,19
chr1	236433135	.	AT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=132.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,17:0,17:0,0,33,1
chr1	236590675	.	CT	C,CTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,35,34;MFRL=132,168,178;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.01,3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,2:0.187,0.187:13:4,1,1:4,1,1:8,1,4,0
chr1	236631671	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=191,117;MMQ=58,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:2,1:0,10,0,2
chr1	236702117	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr1	236702153	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=175,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:7,2:3,4:9,2,5,1
chr1	236702447	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,7:0.276:27:7,2:10,5:0|1:236702447_T_G:236702447:1,19,0,7
chr1	236702450	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.301:28:7,2:12,5:0|1:236702447_T_G:236702447:1,19,0,8
chr1	236702475	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:4,1:10,6:0,14,0,7
chr1	236703767	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	236703832	.	CG	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:9,1:2,3:9,2,3,1
chr1	236704857	.	TTAGTACCATTTATAATTTTTTTATATGTCAATATAAAATATTTAGAAAATATTTTCTAC	T	.	.	DP=136;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:128,8:0.024:136:18,2:15,0:104,24,6,2
chr1	236704888	.	A	AACAGGT	.	.	DP=73;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=108.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,29:0.428:68:20,15:16,8:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:38,1,25,4
chr1	236704891	.	TAAA	T	.	.	DP=83;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=106.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,30:0.378:80:23,16:19,11:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:47,3,24,6
chr1	236704897	.	ATT	A	.	.	DP=86;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=106.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,30:0.369:82:26,17:19,13:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:49,3,24,6
chr1	236706352	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=115,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,2:9,2:8,11,0,4
chr1	236706371	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:6,1:6,1:3,10,0,2
chr1	236706780	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	236707007	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=144,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:0,8,0,4
chr1	236707036	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=271,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.557:7:0,0:3,4:0|1:236707036_A_T:236707036:0,3,0,4
chr1	236707045	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=271,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:2,3:0|1:236707036_A_T:236707036:0,3,0,3
chr1	236708022	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,3:1,2:7,0,5,0
chr1	236708224	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.506:34:8,10:7,7:5,12,7,10
chr1	236708316	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr1	236711297	.	A	T	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,28:0.454:62:24,19:9,9:25,9,23,5
chr1	236711323	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,36:0.469:77:24,22:17,14:26,15,23,13
chr1	236714292	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=9,9;MFRL=127,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.607:5:0,0:0,0:0,2,0,3
chr1	236714335	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0,9,0,2
chr1	236714378	.	C	CAGTGCAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=243,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	236717104	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=205,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.529:9:1,1:3,2:0,4,0,5
chr1	236718524	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	236718561	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=189,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:6,1,4,0
chr1	236719259	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.504:20:2,5:7,5:4,6,2,8
chr1	236721452	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	236722489	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	236722511	.	GCT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:236722511_GCT_G:236722511:0,4,0,1
chr1	236722514	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:236722511_GCT_G:236722511:0,4,0,1
chr1	236723177	.	GC	AA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,7:0,7,2,9
chr1	236724504	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=271.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,47:0,29:0,0,57,21
chr1	236724605	.	G	T	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=269.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,36:0,41:0,0,16,62
chr1	236727865	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,1:9,1:11,13,2,0
chr1	236729867	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:5,0,4,0
chr1	236729965	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,8:5,6:6,3,12,2
chr1	236735064	.	AGAACTCATTCAATAAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAACTCATTCAATAAG;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.426:10:2,3:3,1:0,6,1,3
chr1	236735939	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.505:22:5,4:5,7:6,5,11,0
chr1	236737657	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=137,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:0,6,0,8
chr1	236738237	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:0,5,0,6
chr1	236740039	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,9,2
chr1	236744720	.	TAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	236746275	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:5,3,5,3
chr1	236748397	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,25:0.672:37:3,14:8,11:9,3,10,15
chr1	236748505	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.346:33:10,0:10,11:8,14,3,8
chr1	236749022	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=183,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr1	236749026	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=190,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:8,0,4,0
chr1	236749451	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=104.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,13:0,0,26,0
chr1	236749649	.	T	C	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,42:0.472:89:27,17:20,25:16,31,17,25
chr1	236749817	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,0:8,5:0,13,0,5
chr1	236750616	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.291:21:10,5:5,1:14,1,6,0
chr1	236750709	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,39:0.482:81:17,17:23,20:14,28,20,19
chr1	236750799	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.606:36:9,14:5,8:4,10,1,21
chr1	236751195	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=64.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.647:32:4,14:7,7:11,0,20,1
chr1	236755427	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=101.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,12:0,15:0,0,3,24
chr1	236755814	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=274.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,66:0.985:66:0,39:0,27:0|1:236755814_G_A:236755814:0,0,50,16
chr1	236755837	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=281.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,69:0.986:69:0,40:0,24:0|1:236755814_G_A:236755814:0,0,38,31
chr1	236755937	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=123,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=47.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.943:19:0,9:1,9:0,1,1,17
chr1	236757229	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	236757468	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:8,3:2,4:0,10,0,8
chr1	236757507	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr1	236759060	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.468:26:7,6:6,6:7,7,4,8
chr1	236760368	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=224,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	236761110	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=189,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,4:2,4:2,0,7,1
chr1	236766355	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	236766745	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=189,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr1	236767176	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	236767178	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=179,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0|1:236767178_AG_A:236767178:3,0,4,0
chr1	236767182	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,3:0.362:9:4,1:2,2:1|0:236767178_AG_A:236767178:6,0,3,0
chr1	236767288	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:12,5:9,10:12,9,7,8
chr1	236882110	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr1	236882303	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,15:0,0,7,23
chr1	236883564	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	236900589	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:236900589_C_CA:236900589:0,2,0,1
chr1	236900590	.	C	CCTTGGCTTCAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:236900589_C_CA:236900589:0,2,0,1
chr1	236902560	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	236902594	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr1	236902865	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	236907847	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=189,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:1,3:1,1:3,0,4,0
chr1	236910889	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=183,126;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,3:5,0:8,0,3,0
chr1	236911137	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:0,7,0,5
chr1	236912597	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:2,3,0,4
chr1	236923197	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=274,251;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	236924506	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	236926013	.	T	TGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=226,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GA;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	236971998	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:15,0:5,2:12,9,1,1
chr1	236972186	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:1,3,0,5
chr1	236978992	.	T	TTCTG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.354:15:8,1:1,4:4,6,0,5
chr1	236988593	.	A	AT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,20:0.358:55:16,11:19,9:26,9,13,7
chr1	237001926	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=175,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.465:15:3,2:5,4:0,8,0,7
chr1	237013550	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:3,1:8,3:0|1:237013550_AT_A:237013550:12,0,4,0
chr1	237013553	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:4,1:8,3:0|1:237013550_AT_A:237013550:12,0,4,0
chr1	237013914	.	CTGA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=182,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGA;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr1	237037998	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr1	237038161	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,8:2,4:2,3,2,10
chr1	237048562	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:1,8,0,4
chr1	237057608	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:3,1:3,5:6,0,6,1
chr1	237060433	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:10,2:5,7:2,14,0,9
chr1	237060945	.	CTT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,4:6,2:4,10,0,6
chr1	237540615	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=132,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:2,7:5,6:5,2,9,4
chr1	237551376	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr1	237619875	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=103,91;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.641:6:0,3:1,1:1,1,3,1
chr1	237620049	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,5,6
chr1	237632345	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,80;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:10,2:10,0:19,2,2,0
chr1	237632458	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=130,15324;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,1:14,1:10,14,2,0
chr1	237666734	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:15,0:7,3:13,9,0,3
chr1	237670140	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,7:0,0,2,16
chr1	237675150	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.595:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr1	237711644	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	237729774	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=92,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr1	237730124	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,1:0,9:0,0,0,10
chr1	237730169	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	237732395	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:9,3:4,5:13,0,8,0
chr1	237755200	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr1	237759032	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:0,0:2,1:0|1:237759032_T_C:237759032:0,2,0,1
chr1	237759036	.	A	ATATACCTGCTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:237759032_T_C:237759032:0,2,0,1
chr1	237788862	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	237791424	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=127,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.761:19:2,6:2,8:1,3,1,14
chr1	237796837	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:5,0,5,1
chr1	237797082	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr1	237797103	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	237802559	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	237804242	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:7,7,1,1
chr1	237813126	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	237813177	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=140,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:11,0:3,3:14,0,2,1
chr1	237814898	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	237817514	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,4:6,0,8,1
chr1	237817784	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=223,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,3:4,3:0,4,0,6
chr1	237824286	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,140;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:19,0:17,3:2,34,0,3
chr1	237824332	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr1	237831103	.	C	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=219.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,22:0,38:0,0,59,2
chr1	237838065	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:16,3:20,0:18,18,3,0
chr1	237850666	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.883:5:0,1:0,2:0,0,2,3
chr1	237862164	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:7,0,4,0
chr1	237863439	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,4:2,5:4,0,9,0
chr1	237863790	.	GT	G,GTT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=22,18,27;MFRL=157,104,156;MMQ=60,60,60;MPOS=19,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.23,7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,4:0.155,0.189:24:7,2,2:4,0,1:3,13,1,7
chr1	237865203	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=92.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,22,5
chr1	237872435	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,57;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:1,8,0,2
chr1	237872714	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr1	237880443	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.387:24:5,6:9,3:12,3,7,2
chr1	237893674	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,2:0,0,3,12
chr1	237896961	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,140;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,3:4,0:8,7,3,0
chr1	237905568	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=88,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr1	237921027	.	T	TTCATCTTGGG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=169,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:237921027_T_TTCATCTTGGG:237921027:6,7,1,1
chr1	237921029	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=169,53;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:237921027_T_TTCATCTTGGG:237921027:6,7,1,1
chr1	237923053	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:4,4:7,5:9,2,8,1
chr1	237946964	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:11,7:10,7:16,5,7,7
chr1	237947660	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,1:4,1:3,11,1,1
chr1	237951451	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=294.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,81:0.988:81:0,32:0,48:0,0,4,77
chr1	237951482	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=179,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:10,9:12,10:0,22,0,19
chr1	237957146	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.621:27:5,11:5,6:8,2,15,2
chr1	237957161	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:7,10:8,8:10,5,14,4
chr1	237957309	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,3:3,6:0,5,0,9
chr1	237965131	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:237965131_G_A:237965131:1,0,2,0
chr1	237965133	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=13,31;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0|1:237965131_G_A:237965131:1,0,2,0
chr1	238045995	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=5185118,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	238053118	.	A	ACGCCCCCCCCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.659:4:0,0:1,0:0|1:238053118_A_ACGCCCCCCCCCC:238053118:0,1,3,0
chr1	238053123	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:0,0:1,2:0|1:238053118_A_ACGCCCCCCCCCC:238053118:0,1,3,0
chr1	238053524	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,2:0,2:0,2,2,2
chr1	240071318	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:18,3:19,0:25,12,3,0
chr1	240072721	.	G	A,GAA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=24,31,18;MFRL=158,0,119;MMQ=60,60,60;MPOS=7,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.67,6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,7,6:0.196,0.243:28:2,2,1:6,5,1:3,12,2,11
chr1	240073619	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,5:2,4:2,1,6,4
chr1	240073884	.	GA	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=144,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.100:47:22,2:17,2:39,4,3,1
chr1	240074554	.	GA	G,GAA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=138,116,136;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=5.88,8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,6,7:0.134,0.152:45:15,2,1:5,4,4:15,17,5,8
chr1	240074847	.	TA	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.125:34:14,1:12,3:5,25,0,4
chr1	240076975	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:3,4:4,6:2,6,0,10
chr1	240255203	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	240255568	.	GGGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	240351628	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.632:6:1,2:1,1:0,2,0,4
chr1	240370744	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=107,162;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.201:13:6,0:2,0:0|1:240370744_C_G:240370744:5,6,2,0
chr1	240370749	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=107,162;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.202:13:5,0:1,0:0|1:240370744_C_G:240370744:5,6,2,0
chr1	240370913	.	TGCCCCCTCTACCCGGAGCGGGAATACCTCCTCC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=21,30;MFRL=105,0;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.256:18:3,2:3,1:3,11,0,4
chr1	240408789	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=123,61;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:6,2,4,2
chr1	240421383	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,0:5,2:0,7,0,2
chr1	240492543	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,7,6
chr1	240497265	.	A	C	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=254.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.986:71:0,41:0,30:0,0,28,43
chr1	240601269	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	240656797	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:4,6:1,5:0,6,4,7
chr1	240656824	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	240975213	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,3:8,4:14,3,4,3
chr1	240975435	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr1	240979803	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:0,5,0,6
chr1	241519031	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=143,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:15,3:5,0:13,7,2,1
chr1	241519098	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,12:0,0,12,12
chr1	241712134	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	241713007	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:6,7,0,2
chr1	241728198	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	241761217	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=150,74;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.091:41:17,3:19,0:20,18,2,1
chr1	241837845	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.193:19:6,3:9,0:16,0,3,0
chr1	241838057	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=97.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,28:0.426:66:20,15:18,13:0|1:241838057_C_T:241838057:4,34,8,20
chr1	241838065	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,26:0.435:60:19,10:15,11:0|1:241838057_C_T:241838057:3,31,7,19
chr1	241847018	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.580:41:5,10:12,13:3,14,3,21
chr1	241886754	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.385:24:8,3:6,6:0|1:241886754_T_C:241886754:2,13,1,8
chr1	241886764	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:5,2:4,4:0|1:241886754_T_C:241886754:2,9,0,6
chr1	241907691	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=102,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:1,6:8,9:6,3,9,6
chr1	241912834	.	TCTCTGTATGCTCAGGAACAGTCAGAATCTGGGACTTTGGCAGTGGGCAGGAGATGAAGGTGTTGCCGGAGGGGAAAGACTGGAAGGAGGACGAGCACTGCCTACGACGCCTCATTTTC	T	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,203;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,8:0.052:102:9,0:7,6:53,41,6,2
chr1	241913062	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.427:19:5,6:6,2:1,10,4,4
chr1	241920499	.	TGTAG	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=140,268;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:1,1:3,0,4,0
chr1	241920562	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:6,3:4,6:7,4,7,2
chr1	241933876	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.462:35:7,12:11,4:15,4,15,1
chr1	241936055	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:3,4:2,4:6,0,6,2
chr1	241951106	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,27:0.596:45:12,17:5,8:14,4,23,4
chr1	241958592	.	GA	TT	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=141,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:15,0:19,2:14,20,0,3
chr1	241958665	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=138,221;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr1	241964559	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=138,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,2:4,5:0,5,2,5
chr1	242030151	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,3:0,13:0,0,11,5
chr1	242042690	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	242045383	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:7,0:0,19,0,2
chr1	242048514	.	G	GTAAATATA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=192,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.412:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr1	242052685	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,1:2,3:5,0,5,0
chr1	242383201	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=142,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	242383510	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	242511556	.	AACAAAG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAAAG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	243327520	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,9:0,0,21,0
chr1	243332884	.	AAG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=81.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,5:0,14:0,0,18,1
chr1	243335902	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	243362331	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	243433654	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	243468093	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,23:0.421:55:16,16:16,7:7,25,2,21
chr1	243480230	.	C	CT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.148:35:13,1:14,3:6,24,2,3
chr1	243493907	.	A	T	.	.	DP=120;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=389.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,116:0.992:116:0,53:0,60:0,0,62,54
chr1	243507680	.	C	CA	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=217.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,24:0,38:0,0,2,60
chr1	243581303	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=147,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,0:11,3:14,7,0,3
chr1	244220229	.	CT	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:20,2:19,1:30,11,1,3
chr1	244528127	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:0,8,1,3
chr1	244541859	.	TC	GA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=126,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:21,3:15,0:22,15,1,2
chr1	244595962	.	C	CTTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=13,19;MFRL=170,173;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=21,24;RU=T;STR;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.718:12:0,3:0,0:0,3,0,9
chr1	244601152	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	244624887	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr1	244653781	.	AT	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=52.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,24:0.467:51:16,8:9,16:0,27,3,21
chr1	244662263	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:22,2:18,1:32,9,2,1
chr1	244735547	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,16:0.486:33:9,8:8,8:0|1:244735547_A_G:244735547:17,0,16,0
chr1	244735556	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=165.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.977:42:0,19:0,21:0|1:244735547_A_G:244735547:0,0,40,2
chr1	244773514	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:5,3,2,0
chr1	244803205	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	245020833	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:2,2:11,0:11,3,2,0
chr1	245020845	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:5,2:16,0:17,7,2,0
chr1	245021291	.	TA	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,8:0.147:56:26,5:19,3:38,10,8,0
chr1	245025697	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.735:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr1	245133539	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,0,15
chr1	245133549	.	GGC	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GC;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,0:2,2:0,8,0,2
chr1	245133623	.	T	TCCTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCTCC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	245180471	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.366:39:13,7:12,7:24,1,13,1
chr1	245180639	.	ATT	A,AT	.	.	DP=137;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=144,126,144;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=5.40,121.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:37,5,59:0.055,0.591:101:18,2,28:17,3,26:11,26,14,50
chr1	245222634	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	245222839	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	245703990	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,6:2,6:5,1,12,0
chr1	245847719	.	G	GCCACACGGACACAGGCTATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=63,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr1	245850233	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=160,60;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,0:13,3:13,10,1,2
chr1	245861566	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=273,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:245861566_G_A:245861566:0,1,0,1
chr1	245861571	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:245861566_G_A:245861566:0,0,0,2
chr1	245913033	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=200,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:245913033_T_A:245913033:0,2,0,1
chr1	245913037	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=200,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:245913033_T_A:245913033:0,2,0,1
chr1	245913043	.	TGC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=200,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:245913033_T_A:245913033:0,2,0,1
chr1	246021941	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,6,9
chr1	246022071	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	246027024	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,9,0
chr1	246027029	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,9,0
chr1	246027034	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.934:12:0,5:0,7:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,11,1
chr1	246091432	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=217,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:246091432_G_C:246091432:0,1,0,1
chr1	246091436	.	CA	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=217,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:246091432_G_C:246091432:0,1,0,1
chr1	246489706	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,35;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,0:0,3:0,1,0,3
chr1	246490438	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0|1:246490438_T_C:246490438:0,0,9,1
chr1	246490442	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0|1:246490438_T_C:246490438:0,0,9,1
chr1	246490452	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:0|1:246490438_T_C:246490438:3,1,6,0
chr1	246498866	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:1,2,0,2
chr1	246670281	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.761:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr1	246670284	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,13;MFRL=224,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr1	246670287	.	CGA	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=186,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.480:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr1	246670300	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=133,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	246670308	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,23;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,1:3,0,3,0
chr1	246670333	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	246670587	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	246704563	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.670:4:1,1:0,2:0|1:246704563_C_T:246704563:0,1,0,3
chr1	246704572	.	A	AACTGTGAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:246704563_C_T:246704563:0,1,0,2
chr1	246707816	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:5,7:8,10:10,3,13,4
chr1	246711789	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.289:15:5,3:6,1:11,0,4,0
chr1	246711816	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.654:15:3,5:1,5:5,0,10,0
chr1	246714426	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=144,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr1	246714446	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=148,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:9,0,3,0
chr1	246714587	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=122,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,17:0.391:44:16,10:11,7:9,18,9,8
chr1	246714631	.	TG	AA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,11:0.459:24:8,5:4,4:0|1:246714631_TG_AA:246714631:3,10,1,10
chr1	246714636	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.476:23:8,5:4,5:0|1:246714631_TG_AA:246714631:3,9,1,10
chr1	246720798	.	G	A	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,57;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=292.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,85:0.989:85:0,41:0,44:0,0,31,54
chr1	246727558	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	246754778	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	246754956	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.540:44:10,11:10,11:10,10,17,7
chr1	246797710	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:0|1:246797710_G_T:246797710:6,0,4,0
chr1	246797714	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,2:1,2:0|1:246797710_G_T:246797710:6,0,4,0
chr1	246797974	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	246940790	.	TAAAGA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	247007013	.	TAAATA	T	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATA;STR;TLOD=62.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,17:0.369:47:13,7:14,10:30,0,17,0
chr1	247007042	.	TA	T	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=157.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,59:0.970:60:0,28:1,31:1,0,55,4
chr1	247025531	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.313:23:10,2:5,4:0,16,0,7
chr1	247109014	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.444:45:14,14:11,5:20,5,19,1
chr1	247109168	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:8,4:3,5:0,11,0,10
chr1	247109233	.	C	CCACAGAATCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=199,263;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr1	247150450	.	CT	AC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=164,196;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,2:5,0:0|1:247150450_CT_AC:247150450:6,9,0,2
chr1	247150454	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=167,196;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,1:5,0:0|1:247150450_CT_AC:247150450:6,8,0,2
chr1	247163187	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,11:0,2:1,0,13,0
chr1	247202032	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=157,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:5,0,1,1
chr1	247241795	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.478:41:9,7:12,9:18,3,19,1
chr1	247275192	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=259,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:247275192_AG_A:247275192:1,0,1,0
chr1	247275196	.	TGCGGCTCCCGGAGCGCGAGGCCGCAGC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=259,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:247275192_AG_A:247275192:1,0,1,0
chr1	247321252	.	TAA	T,TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,22,32;MFRL=174,279,160;MMQ=60,49,60;MPOS=27,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.83,3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.323,0.344:6:2,0,1:0,1,1:0,2,0,4
chr1	247322967	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,6:3,3:3,3,8,1
chr1	247420135	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,101;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,0:4,2:7,7,0,2
chr1	247464630	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=335,359;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:247464630_C_A:247464630:0,1,0,1
chr1	247464632	.	CCTA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=335,359;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:247464630_C_A:247464630:0,1,0,1
chr1	247486421	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.736:17:2,5:2,7:4,0,9,4
chr1	247597629	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=140,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:3,2:5,5:1,7,4,5
chr1	247597656	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr1	247599232	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=140,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:2,0,4,1
chr1	247608066	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:13,0:8,2:11,11,2,0
chr1	247611659	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:4,1,3,0
chr1	247615252	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=196,114;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:3,5,2,4
chr1	247615261	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,9:0,0,4,9
chr1	247655275	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:1,4:12,4:9,5,5,3
chr1	247726822	.	CTTTT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=T;STR;TLOD=63.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:9,7:8,8:16,1,14,3
chr1	247729206	.	CT	C,CTT	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=34,33,34;MFRL=148,116,158;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=11.35,4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,12,6:0.308,0.169:36:10,5,3:5,5,2:16,2,14,4
chr1	247729227	.	C	A	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=28,9;MFRL=123,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,10:0.162:50:13,0:13,0:24,16,10,0
chr1	247737493	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,8:3,6:6,3,6,8
chr1	247752019	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,19:0,16:0,0,11,24
chr1	247752161	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:5,2:3,2:5,3,4,1
chr1	247835352	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	247836008	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,12:0,0,12,14
chr1	247921717	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,3,16
chr1	247921789	.	AGTGTGTGT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=GT;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.321:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr1	247978087	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr1	247978541	.	AAGG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr1	248004687	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,5,7
chr1	248004775	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,10,3
chr1	248005213	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	248023966	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,15:0,0,19,12
chr1	248024073	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,0,13
chr1	248039294	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,3:7,6:9,3,7,2
chr1	248058797	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	248058845	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr1	248058879	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,12,3
chr1	248059043	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=125,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.258:24:6,1:12,0:2,16,6,0
chr1	248059049	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:8,1:13,1:0|1:248059049_A_C:248059049:3,18,5,0
chr1	248059055	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=128,118;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:7,2:13,0:0|1:248059049_A_C:248059049:3,20,4,0
chr1	248059057	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=128,118;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:6,2:14,0:0|1:248059049_A_C:248059049:2,19,4,0
chr1	248059712	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:3,6:5,11:3,5,6,12
chr1	248059856	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	248084434	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=165,143;MMQ=40,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,31:0.943:32:0,16:1,13:0,1,4,27
chr1	248084464	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=122,158;MMQ=24,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,23:0.800:28:1,8:4,13:4,1,3,20
chr1	248084471	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=158,159;MMQ=25,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:2,6:12,2:0|1:248084471_A_G:248084471:7,10,0,8
chr1	248084473	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=158,159;MMQ=25,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:2,6:11,2:0|1:248084471_A_G:248084471:7,10,0,8
chr1	248084511	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=123,134;MMQ=25,24;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:2,3:12,5:7,7,0,8
chr1	248084604	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:248084604_T_TTA:248084604:0,0,0,2
chr1	248084605	.	G	GGGAAGTTTTAATGCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:248084604_T_TTA:248084604:0,0,0,2
chr1	248084909	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=139,186;MMQ=24,25;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,1:3,3:0,9,0,4
chr1	248085341	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	248112745	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,30;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr1	248112762	.	TG	CA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,39;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,3:0,8:0,0,9,3
chr1	248112771	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,41;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,5:0,8:0,0,11,3
chr1	248262644	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:6,1,8,0
chr1	248343639	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:24,1:19,1:0|1:248343639_A_C:248343639:20,26,1,1
chr1	248343640	.	TGG	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,2:0.058:50:25,1:20,1:0|1:248343639_A_C:248343639:22,26,1,1
chr1	248367150	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:22,3:14,0:16,20,2,1
chr1	248457979	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,53;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,20:0,24:0,0,22,22
chr1	248458689	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	248458717	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,45;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,10:0,0:0,0,8,2
chr1	248458974	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,3:0,0,0,14
chr1	248486895	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,19,1
chr1	248486913	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,21,4
chr1	248512064	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,8,8
chr1	248512094	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,17:0,0,13,15
chr1	248513023	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr1	248513088	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	248525638	.	CA	C	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=300.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,75:0.988:75:0,35:0,37:0,0,44,31
chr1	248551419	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,0:7,2:8,13,2,0
chr1	248569282	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	248570440	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,10:0,0,7,14
chr1	248636641	.	C	CTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	248652104	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=201,185;MMQ=27,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	248738133	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,136;MMQ=44,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:10,3:21,3:0,32,0,6
chr1	248789454	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,13,4
chr1	248790495	.	C	CGGGGTACAGAGAGTGTTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	248790498	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	248801944	.	TCAGCACG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=87.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.960:20:0,10:0,10:0,0,6,14
chr1	248813135	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr1	248813271	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=140,97;MMQ=60,52;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,5:0.098:58:30,2:22,3:0|1:248813271_C_A:248813271:35,18,2,3
chr1	248813280	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:32,20:0.389:52:17,13:15,7:1|0:248813271_C_A:248813271:17,15,12,8
chr1	248813650	.	CAGA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=231,178;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:1,6:2,0:2,2,3,4
chr1	248814126	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,151;MMQ=45,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.213:31:7,5:16,1:2,23,0,6
chr1	248845097	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,8:0,0,9,10
chr1	248845673	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=206,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248845673_TG_T:248845673:0,1,0,1
chr1	248845676	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,33;MFRL=206,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248845673_TG_T:248845673:0,1,0,1
chr1	248845677	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=206,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248845673_TG_T:248845673:0,1,0,1
chr1	248845681	.	G	GGCA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=206,136;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248845673_TG_T:248845673:0,1,0,1
chr1	248845682	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,16;MFRL=206,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:248845673_TG_T:248845673:0,1,0,1
chr1	248845688	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=312,136;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248845673_TG_T:248845673:0,1,0,1
chr1	249145072	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,3:1,2:0,1,1,4
chr1	249149486	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=255,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr1	249151921	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.414:14:4,0:1,0:8,0,6,0
chr1	249211350	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.578:24:5,8:5,6:2,8,8,6
chr1	249212725	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.499:24:6,7:5,4:8,4,9,3
chr1	249212878	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,30:0.582:51:6,11:15,17:9,12,12,18
chr2	45895	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr2	224970	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=139,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.540:46:4,13:17,11:5,16,7,18
chr2	234130	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:5,1,4,2
chr2	234350	.	C	CAATCAATTACAGGTGGCTGAAAGACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	242732	.	T	TAAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAC;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr2	243567	.	T	TA	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.460:41:7,7:13,9:3,19,2,17
chr2	262553	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:6,5:5,4:10,1,9,0
chr2	264895	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,10:0,0,19,0
chr2	265121	.	ACT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:9,0:14,3:0,24,0,3
chr2	271998	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.391:11:4,1:1,2:4,3,1,3
chr2	275148	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:10,0:7,11,2,0
chr2	276908	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:12,1,5,0
chr2	276942	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:17,3:10,3:24,3,6,0
chr2	287666	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	672976	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=193,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr2	676177	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=119,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,7:3,2:3,4,6,3
chr2	677213	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr2	906044	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,5,15
chr2	1079130	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:1079130_G_A:1079130:0,0,2,1
chr2	1079132	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:1079130_G_A:1079130:0,0,2,1
chr2	1079143	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,2,1
chr2	1079442	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	1093965	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:10,6:5,4:7,8,8,2
chr2	1099065	.	C	CT	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=33,23;MFRL=137,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:5,4:2,3:4,5,4,6
chr2	1099109	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=123,132;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr2	1099175	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1099175_G_A:1099175:0,4,0,1
chr2	1099176	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=190,180;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:1099176_T_C:1099176:0,4,0,1
chr2	1099179	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=190,180;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:1099176_T_C:1099176:0,4,0,1
chr2	1099183	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,28;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1099175_G_A:1099175:0,4,0,1
chr2	1099184	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=190,180;MMQ=60,58;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:1099176_T_C:1099176:0,4,0,1
chr2	1133188	.	G	GCACA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=168,90;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=CA;STR;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:8,0,7,0
chr2	1168756	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:3,0,4,1
chr2	1241592	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr2	1263235	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:5,2:2,3:2,6,0,6
chr2	1426787	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:8,1:8,3,2,0
chr2	1437163	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:8,0,7,1
chr2	1437410	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.727:13:2,3:1,4:1,2,1,9
chr2	1457364	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	1459806	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	1460140	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	1481231	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	1488668	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	1491497	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	1491842	.	C	CAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=68306278,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1491842_C_CAG:1491842:0,2,0,1
chr2	1491843	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=68306278,237;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1491842_C_CAG:1491842:0,2,0,1
chr2	1491850	.	GA	TC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=68306278,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,0:1,1:0|1:1491842_C_CAG:1491842:0,2,0,1
chr2	1491864	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=190,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	1642537	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:1642537_T_C:1642537:0,0,5,0
chr2	1642539	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:1642537_T_C:1642537:0,0,5,0
chr2	1642545	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:1642537_T_C:1642537:0,0,5,0
chr2	1652305	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	1667310	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	1677683	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	1688001	.	CTAGTCATTTCAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.691:1:0,1:0,0:0|1:1688001_CTAGTCATTTCAAA_C:1688001:0,0,0,1
chr2	1688018	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1688001_CTAGTCATTTCAAA_C:1688001:0,0,0,1
chr2	1688020	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1688001_CTAGTCATTTCAAA_C:1688001:0,0,0,1
chr2	1696194	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	1842968	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.564:21:4,10:5,2:8,1,11,1
chr2	1844458	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=171,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:2,4:0,2:2,0,7,0
chr2	1844652	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=197,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr2	1946914	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.537:28:7,9:5,5:4,9,8,7
chr2	1947077	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,1:11,1:0|1:1947077_C_T:1947077:6,14,0,2
chr2	1947082	.	T	TCTCC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:9,1:0|1:1947077_C_T:1947077:4,15,0,2
chr2	1982915	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,1:7,3:5,5,1,3
chr2	1983374	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr2	1983619	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	3196305	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=132,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:5,2:7,4,0,2
chr2	3200888	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	3212247	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	3212559	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:9,5:4,4:4,10,3,6
chr2	3217869	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=152,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:2,2:11,0:12,3,1,1
chr2	3217908	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0,0,11,12
chr2	3341867	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:6,12,0,3
chr2	3342009	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=216,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr2	3356953	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,15:0,18:0,0,25,8
chr2	3358458	.	ATTATGAAGTTAGAT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=152.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,14:0,21:0,0,3,32
chr2	3428508	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	3460870	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,0:0,0,2,3
chr2	3460946	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=62,141;MMQ=45,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3460946_T_C:3460946:0,2,0,1
chr2	3460949	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=62,141;MMQ=45,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3460946_T_C:3460946:0,2,0,1
chr2	3460952	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=62,141;MMQ=45,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3460946_T_C:3460946:0,2,0,1
chr2	3460978	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3460978_C_T:3460978:0,0,0,1
chr2	3460984	.	AGTGAATGTTT	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3460978_C_T:3460978:0,0,0,1
chr2	3469278	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	3470186	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,7:0,0,4,19
chr2	3470254	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	3481637	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=80.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,0,25
chr2	3481659	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,0,17
chr2	3482796	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	3482912	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr2	3502709	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=90.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,11:0,17:0,0,24,4
chr2	3502909	.	A	ACTT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=55.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.877:14:0,4:1,8:0|1:3502909_A_ACTT:3502909:0,1,0,13
chr2	3502910	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.877:14:0,4:1,8:0|1:3502909_A_ACTT:3502909:0,1,0,13
chr2	3502932	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	3599700	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,6:1,5:3,0,11,0
chr2	3605528	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.349:18:5,1:3,5:0|1:3605528_T_G:3605528:1,11,0,6
chr2	3605538	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:7,1:6,2:0|1:3605528_T_G:3605528:1,13,0,5
chr2	3623540	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.606:31:6,10:6,9:1,11,2,17
chr2	3660856	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:8,4:3,7:9,2,9,2
chr2	3673493	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=201,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	3718646	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:3718646_G_A:3718646:0,0,2,0
chr2	3718655	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:3718646_G_A:3718646:0,0,2,0
chr2	3718692	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,4,1
chr2	3721632	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=86.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,9:0,11:0|1:3721632_G_A:3721632:0,0,21,0
chr2	3721637	.	ATCTT	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=113,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCTT;STR;TLOD=52.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.558:25:2,6:5,8:0|1:3721632_G_A:3721632:9,2,13,1
chr2	3721821	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr2	3725964	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=202,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr2	3726163	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr2	3749084	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=74,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:4,0,3,1
chr2	3749151	.	GGAA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=41.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,4:0,0,4,6
chr2	3749267	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=138,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,4:2,0:1,1,2,2
chr2	3756073	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	3774519	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr2	3800496	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:3,4,3,4
chr2	3815250	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,1:2,3:4,0,4,0
chr2	3815477	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=114,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:6,5:0,5:5,2,3,7
chr2	3826324	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=128,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:0,3:2,0:3,0,3,0
chr2	5834249	.	G	GTGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TGA;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	5834751	.	A	AT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=126,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.619:27:6,6:3,10:2,8,8,9
chr2	5834833	.	A	AATCTCGCTTTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=219,159;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr2	5835227	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:11,5:4,2:7,8,4,3
chr2	5835335	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,13:0.733:17:4,7:0,5:0|1:5835335_TA_T:5835335:2,2,4,9
chr2	5835352	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=226,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=59.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,18:0.832:21:3,10:0,8:0|1:5835335_TA_T:5835335:2,1,6,12
chr2	5835564	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.641:9:1,4:1,2:1,2,3,3
chr2	5835697	.	GTTT	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=60,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.460:7:2,1:0,1:2,2,0,3
chr2	5837583	.	C	CACTCTCCCACCCTTCAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=158,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.486:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	5838496	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,11:0.242:46:15,0:20,2:33,2,0,11
chr2	5838683	.	TAAA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:3,2:1,2:1,3,0,4
chr2	5839811	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:4,3:3,1:1,7,0,4
chr2	5839850	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=202,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:5839850_T_C:5839850:0,2,0,1
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chr2	5839861	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=166,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:5839850_T_C:5839850:2,2,0,1
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chr2	7001249	.	ACACACACACC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=196,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.691:4:1,2:0,1:0|1:7001233_ACG_A:7001233:1,0,3,0
chr2	7005069	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr2	7005992	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	7017903	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr2	7027323	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,2,14
chr2	7137067	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr2	7154707	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:3,4,5,1
chr2	7154826	.	A	AT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.401:31:6,6:12,7:8,10,6,7
chr2	7164746	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=268,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	7208477	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=227,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr2	8822892	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,33,34;MFRL=0,177,129;MMQ=60,60,60;MPOS=26,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=25,22,24;RU=A;STR;TLOD=33.43,5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,10,3:0.608,0.322:13:0,5,1:0,2,2:0,0,12,1
chr2	8822906	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=129,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.664:16:1,5:4,4:5,0,10,1
chr2	8822912	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.776:22:0,8:3,7:5,0,13,4
chr2	8823086	.	TGC	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.074:37:16,1:18,1:5,30,0,2
chr2	8870814	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,238;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	8873845	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=205,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr2	8910736	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.654:7:2,3:0,1:2,0,4,1
chr2	8910987	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	8911010	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=176,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr2	8916847	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,10,1
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chr2	8943295	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr2	9008512	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,2:8,2:16,0,4,0
chr2	9028160	.	C	CAGTGTGACAATTTTTGTCATTT	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,2:0.038:75:27,2:40,0:0|1:9028160_C_CAGTGTGACAATTTTTGTCATTT:9028160:40,33,0,2
chr2	9028162	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,2:0.039:75:27,1:44,0:0|1:9028160_C_CAGTGTGACAATTTTTGTCATTT:9028160:40,33,0,2
chr2	9419411	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=63.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,6:0,6:0|1:9419411_G_A:9419411:0,0,13,2
chr2	9419415	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=65.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0|1:9419411_G_A:9419411:0,0,14,2
chr2	9460376	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.172:19:5,1:11,1:11,5,3,0
chr2	9463454	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	9496291	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=104,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,14:0.295:49:18,6:15,8:9,26,6,8
chr2	9554255	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,4:3,6:8,1,8,2
chr2	9554458	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	9554461	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	9569972	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,3:5,0:7,0,3,0
chr2	9570054	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=135,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:16,1:14,1:20,10,2,0
chr2	9571054	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:1,6,0,7
chr2	9572887	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.341:7:3,1:2,0:0,5,0,2
chr2	9576553	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr2	9583822	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.592:13:0,5:5,3:2,3,1,7
chr2	9593064	.	A	G	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,36:0.469:77:14,19:26,17:20,21,19,17
chr2	9616035	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:5,7:10,4:12,4,9,2
chr2	9621663	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.616:3:0,2:1,0:0|1:9621663_CTT_C:9621663:0,1,0,2
chr2	9621666	.	CTGTTTCT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:9621663_CTT_C:9621663:0,1,0,2
chr2	9630231	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=99,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,4,1
chr2	9630244	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=99,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:2,2:3,1,5,1
chr2	9630722	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	9631270	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,99;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:3,11,0,2
chr2	9633137	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:15,6:13,6:4,24,3,9
chr2	9637403	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=97,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:2,5,0,4
chr2	9650350	.	C	CATAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr2	9983591	.	A	AG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=94.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,17:0,0,19,9
chr2	9983716	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.167:38:15,3:14,2:13,19,0,6
chr2	9986076	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=163,158;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,1:4,8:5,0,9,0
chr2	9986162	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:11,1:15,4:10,16,2,3
chr2	9989570	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:8,1:1,2:1,9,0,3
chr2	9991867	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=227,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:2,2,1,3
chr2	10023016	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,5:7,2:0,11,0,8
chr2	10044941	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:7,4:4,1:0|1:10044941_G_T:10044941:12,1,4,1
chr2	10044946	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.299:18:8,4:5,0:0|1:10044941_G_T:10044941:12,1,4,1
chr2	10045147	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.307:20:11,1:3,4:1,13,2,4
chr2	10051053	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:8,1:14,4:7,15,1,4
chr2	10051792	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,1:5,6:0,7,0,7
chr2	10053412	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,0,4
chr2	10094992	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr2	10105535	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=183,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:0,4,1,5
chr2	10105584	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.821:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr2	10126416	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,5,15
chr2	10132126	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=122,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,2:3,0:8,2,2,0
chr2	10133284	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:15,4:8,2:21,2,4,2
chr2	10136459	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=124,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:13,1:14,1:13,15,1,1
chr2	10140651	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.248:21:9,1:7,3:14,2,5,0
chr2	10192711	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=196,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:10192711_A_T:10192711:0,2,0,1
chr2	10192714	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=196,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:10192711_A_T:10192711:0,2,0,1
chr2	10225241	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,8,8
chr2	10226306	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:1,7,0,2
chr2	10264057	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=195,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	10281903	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,2:0,6:0,0,9,0
chr2	10282147	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,7:3,8:0,6,0,15
chr2	10350757	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr2	10563231	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=152,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.104:28:13,0:11,1:15,11,1,1
chr2	10563236	.	G	A,GTGGAATAATATGGTTTGGCT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,29,20;MFRL=166,179,53;MMQ=60,60,60;MPOS=16,1;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=47.40,5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,15,2:0.680,0.111:21:2,10,0:2,5,2:2,2,10,7
chr2	10566792	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:5,1,3,2
chr2	10566804	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,6:3,5:4,2,8,3
chr2	10595534	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,12:0,4:0,0,9,7
chr2	10762302	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=95.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,16:0,10:0,0,3,23
chr2	10784356	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:22,0,2,0
chr2	10808776	.	C	CAA	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=280.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.985:65:0,25:0,37:0,0,36,29
chr2	10813782	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr2	10912153	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	10915020	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:7,3:5,2:5,7,0,6
chr2	10915090	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,4:5,2:4,1,1,5
chr2	10924524	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	10927345	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=159,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,2:4,1:5,1,4,0
chr2	10927660	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=208,261;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	10928710	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr2	10928777	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:10,1:8,5:11,7,3,3
chr2	10928962	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,3:6,2:9,3,5,0
chr2	10929133	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:5,6:3,6:1,7,1,12
chr2	10929867	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.464:35:6,7:11,9:13,6,9,7
chr2	10930050	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=231,178;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,3:6,0:1,6,0,3
chr2	10931001	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,3:3,0:0,8,0,3
chr2	10932082	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=102,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,2:7,1:2,8,0,3
chr2	10933421	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	10942567	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,1:4,3:6,1,4,0
chr2	10987818	.	G	GGGAATGTGTGAAGACT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.253:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chr2	10994418	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	11280792	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	11300732	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.224:25:13,3:5,2:9,11,4,1
chr2	11300854	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,9:0.345:27:11,4:7,4:0|1:11300854_C_T:11300854:4,14,2,7
chr2	11300869	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:6,5:5,2:0|1:11300854_C_T:11300854:0,11,1,7
chr2	11304471	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.570:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr2	11312181	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=85,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,4:4,4:1,6,2,6
chr2	11312224	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=214,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	11312888	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=54186108,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:11312888_C_T:11312888:0,2,0,1
chr2	11312911	.	AT	GC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=306,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11312888_C_T:11312888:0,1,0,1
chr2	11312915	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=306,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11312888_C_T:11312888:0,1,0,1
chr2	11352043	.	T	TATTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=234,251;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr2	11357139	.	CA	TG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=183,138;MMQ=59,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:10,2:6,0:16,0,1,1
chr2	11359031	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:12,6:10,7:21,1,11,2
chr2	11375823	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=158,229;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.175:26:9,4:13,0:20,2,2,2
chr2	11716433	.	C	CA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=130,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.367:24:3,4:10,3:10,5,8,1
chr2	11718591	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr2	11738765	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,5:0,0,14,2
chr2	11742458	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=223,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr2	11755315	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,159;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,0:6,2:12,9,0,2
chr2	11755443	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr2	11774324	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,7,10
chr2	11777757	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	11905636	.	GT	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=74.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,11:0,21:0,0,22,10
chr2	11905876	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=186,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:2,7,1,8
chr2	11907842	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:1,2:10,4:11,0,5,1
chr2	11924950	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr2	11928594	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=111,59;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,1:11,0:0|1:11928594_C_G:11928594:6,9,1,1
chr2	11928614	.	G	GTGGTGAAACATGAA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=110,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:3,2:11,0:0|1:11928594_C_G:11928594:4,12,1,1
chr2	11931773	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=125,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,25:0.424:59:19,16:15,9:32,2,19,6
chr2	11932173	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr2	11936798	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	11943082	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,2:3,5:6,4,5,2
chr2	12858444	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:6,4:14,3:11,9,6,1
chr2	12864696	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.074:51:25,3:23,0:45,3,3,0
chr2	12865048	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=201,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr2	14774094	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=173,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=52.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:7,6:1,13:5,3,12,7
chr2	14779227	.	TAC	T,TACACAC	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31,0;MFRL=145,158,75;MMQ=60,60,60;MPOS=7,50;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,14;RU=AC;STR;TLOD=3.89,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,2,3:0.122,0.196:17:3,0,0:7,2,0:11,1,2,3
chr2	15319070	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:8,3:10,2:16,3,4,1
chr2	15359004	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:24,2:18,1:22,21,3,0
chr2	15378717	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=126,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.127:45:18,3:22,2:18,22,2,3
chr2	15378822	.	G	GAATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,7:0,0,0,15
chr2	15417280	.	ATT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:15417280_ATT_A:15417280:0,3,0,4
chr2	15417285	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:15417280_ATT_A:15417280:0,3,0,4
chr2	15427173	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,2:4,4:7,2,3,3
chr2	15448311	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:11,4:11,3:17,5,7,0
chr2	15493881	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,3:2,4:0,6,1,6
chr2	15519992	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,5:3,5:0,6,1,9
chr2	15523266	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,24,0
chr2	15523307	.	TA	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=53.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,23:0.544:43:9,13:11,10:13,7,18,5
chr2	15533689	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:5,2:6,1:11,0,4,0
chr2	15533734	.	G	GAAATGAAAGCGTATGTCTACAC	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAATGAAAGCGTATGTCTACAC;STR;TLOD=55.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.596:23:4,3:5,1:7,2,13,1
chr2	15533779	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=144,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,41:0.618:66:9,26:16,15:17,8,31,10
chr2	15533884	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=64.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,18:0.487:37:10,10:7,7:0|1:15533884_C_A:15533884:4,15,0,18
chr2	15533895	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=59.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,16:0.472:34:7,7:9,7:0|1:15533884_C_A:15533884:4,14,0,16
chr2	15533899	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,15:0.485:31:5,7:9,8:0|1:15533884_C_A:15533884:3,13,0,15
chr2	15601287	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,5:2,5:5,0,9,2
chr2	15608013	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr2	15613411	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,36;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:7,11,1,1
chr2	15616012	.	G	GA	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=147,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.059:48:21,2:22,0:13,33,1,1
chr2	15616013	.	C	G,CAGGGTGGGAGGGAGGTAATGAAAAAGA	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=28,33,20;MFRL=143,154,58;MMQ=60,60,60;MPOS=17,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=74.13,4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,25,2:0.521,0.059:47:12,10,2:8,15,0:4,16,9,18
chr2	15616030	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.554:36:8,7:8,13:3,13,5,15
chr2	15623608	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	15644401	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=221,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr2	15676686	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,2,3
chr2	15676715	.	AACT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=177,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	15694164	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=129,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:4,5:7,6:10,1,10,3
chr2	15731998	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr2	15735419	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.616:29:4,7:6,10:0,11,0,18
chr2	15742570	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,7:4,2:10,0,9,0
chr2	15744484	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr2	15746220	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,7:4,8:4,3,6,9
chr2	15753279	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:10,6:2,12:12,1,17,1
chr2	15753307	.	AT	ATT,A	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=33,32,32;MFRL=142,152,142;MMQ=60,60,60;MPOS=5,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,12;RU=T;STR;TLOD=4.17,4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,4,5:0.103,0.112:45:21,3,0:14,1,5:34,2,9,0
chr2	15768876	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,13:0.241:56:25,4:18,9:33,10,7,6
chr2	15840505	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=211,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,24:0.926:25:1,14:0,10:1,0,19,5
chr2	15840522	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=211,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:1,15:0,11:1,0,18,8
chr2	15841288	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr2	16743453	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr2	16746897	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.432:30:8,4:9,8:10,7,7,6
chr2	17696664	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=136,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,2:5,1:2,12,1,2
chr2	17773524	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,10:0,15:0,0,6,19
chr2	17897279	.	CTTCA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCA;STR;TLOD=57.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:3,10:4,5:8,0,15,0
chr2	17919678	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:17919678_A_C:17919678:0,2,0,1
chr2	17919680	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:17919678_A_C:17919678:0,2,0,1
chr2	17941423	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr2	17954140	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr2	17954647	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=100.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,0,27
chr2	17962993	.	CAAGTT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:4,7:6,6:5,6,7,6
chr2	18113776	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=154,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:18113776_C_CTT:18113776:1,2,0,1
chr2	18113779	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=154,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:18113776_C_CTT:18113776:1,2,0,1
chr2	18113784	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:18113776_C_CTT:18113776:2,2,0,1
chr2	18745235	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=206,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:4,8,0,2
chr2	18745466	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	20130970	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.386:8:2,2:2,1:5,0,3,0
chr2	20130984	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.469:10:1,0:2,0:5,0,5,0
chr2	20131184	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=58.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,2,16
chr2	20173255	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	20174175	.	GA	G,GAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=35,34,34;MFRL=151,233,141;MMQ=60,60,60;MPOS=7,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.89,6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,4,6:0.133,0.169:33:8,2,0:15,2,5:23,0,9,1
chr2	20189089	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:2,6:2,8:0,4,3,11
chr2	20194036	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:14,6:3,2:8,9,6,2
chr2	20202865	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr2	20206167	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	20251075	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20251075_G_C:20251075:0,0,1,0
chr2	20251080	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:20251075_G_C:20251075:0,0,1,0
chr2	20251282	.	C	A	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,6:0.077:89:46,3:35,3:33,50,1,5
chr2	20402782	.	G	GAGTATTTGGGTTT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=37,34;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:3,1,0,1
chr2	20402786	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=13,12;MFRL=148,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.337:4:1,0:0,0:0|1:20402786_A_C:20402786:2,1,1,0
chr2	20402792	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.548:5:1,1:1,0:1,1,3,0
chr2	20402796	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=74,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:2,1:1,0:0|1:20402786_A_C:20402786:3,1,1,0
chr2	20402798	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,17;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:20402786_A_C:20402786:2,1,1,0
chr2	20402803	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,13;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:20402786_A_C:20402786:2,1,1,0
chr2	20405050	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	20455179	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=183,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr2	20455190	.	T	A,TAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31,26;MFRL=195,234,171;MMQ=60,60,60;MPOS=1,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.222,0.255:5:2,0,0:1,1,1:1,2,0,2
chr2	20526078	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=126,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.108:25:10,2:13,0:13,10,2,0
chr2	20648933	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.352:18:7,3:4,3:5,7,4,2
chr2	20699667	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,6:0,13:0,0,19,2
chr2	20700900	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	20700905	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr2	20701170	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=282,218;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	20792173	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,15,10
chr2	20822192	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20822192_G_T:20822192:0,1,0,1
chr2	20822194	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20822192_G_T:20822192:0,1,0,1
chr2	20823612	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,1:2,4:5,2,5,0
chr2	20823816	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=150,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:1,0:0,2:0,2,0,3
chr2	20823850	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	20824658	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:1,7,0,4
chr2	20845273	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	20871190	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,6:0,0,4,11
chr2	20884546	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	20884586	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=170,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:2,5:2,6:4,0,9,2
chr2	20939706	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=280,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0|1:20939706_T_C:20939706:1,0,4,2
chr2	20939708	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=280,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0|1:20939706_T_C:20939706:1,0,4,2
chr2	21000982	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=144,285;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr2	21001025	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:7,0:13,2,1,2
chr2	21232803	.	TG	CA,CG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33,33;MFRL=0,164,101;MMQ=60,60,60;MPOS=14,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=37.09,12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,12,5:0.654,0.299:17:0,6,4:0,6,1:0,0,8,9
chr2	21235475	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr2	21236482	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr2	21246306	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=226,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	21246577	.	C	CTCAG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=121,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:7,2:8,0:4,13,1,1
chr2	21363332	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:8,5,1,1
chr2	23608319	.	A	AGCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=117,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GCC;STR;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.651:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr2	23698353	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr2	23746851	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,62;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.231:14:8,0:3,2:8,3,2,1
chr2	23907211	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26,32;MFRL=95,118,155;MMQ=60,60,60;MPOS=15,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=A;STR;TLOD=3.87,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.217,0.289:7:2,2,0:1,0,2:3,0,3,1
chr2	23919169	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr2	23925980	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=222,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	23977653	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:16,3:12,0:6,22,0,3
chr2	24009163	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=212,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr2	24021079	.	C	T	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,3:0.043:90:40,2:46,1:50,37,1,2
chr2	24021231	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=89.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,27:0.651:41:6,13:8,14:0,14,1,26
chr2	24042550	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	24055110	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:5,0:11,3:0|1:24055110_G_C:24055110:8,10,0,3
chr2	24055114	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:5,0:13,3:0|1:24055110_G_C:24055110:8,11,0,3
chr2	24057029	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24057029_T_TA:24057029:1,0,0,1
chr2	24057033	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24057029_T_TA:24057029:1,0,0,1
chr2	24057037	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24057029_T_TA:24057029:1,0,0,1
chr2	24057043	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24057029_T_TA:24057029:0,0,0,1
chr2	24087621	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.390:36:12,3:10,10:19,3,13,1
chr2	24087857	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:2,2:9,6:1,10,0,8
chr2	24103432	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,164;MMQ=52,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.615:8:2,3:1,1:3,0,5,0
chr2	24108557	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:4,0,4,0
chr2	24110611	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:8,0,7,0
chr2	24110911	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:5,0:2,2:0,11,0,3
chr2	24111311	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=83.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,28:0.536:52:15,15:9,12:7,17,6,22
chr2	24149625	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.067:43:21,1:19,1:27,14,1,1
chr2	24194314	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,5:1,3:0,3,1,7
chr2	24200029	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:24200029_T_A:24200029:0,2,0,1
chr2	24200032	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:24200029_T_A:24200029:0,3,0,1
chr2	24200035	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=210,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:24200029_T_A:24200029:0,2,0,2
chr2	24200042	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=210,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:24200029_T_A:24200029:0,2,0,1
chr2	24200046	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=210,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:24200029_T_A:24200029:0,2,0,1
chr2	24238928	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	24239189	.	T	TCCTGGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCTGGC;STR;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,3:0,3,0,5
chr2	24245659	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=228,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr2	24245799	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=110,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:0|1:24245799_G_A:24245799:6,7,1,1
chr2	24245805	.	G	GTTGAAGTGTCTGCTCACTGGGCT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=20,20;MFRL=119,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:3,0:0|1:24245799_G_A:24245799:6,7,1,1
chr2	24245816	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:0|1:24245816_G_A:24245816:3,6,1,1
chr2	24245818	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:4,0:0|1:24245816_G_A:24245816:3,6,1,1
chr2	24246175	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:24246175_C_T:24246175:0,0,0,4
chr2	24246179	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:0,1:2,0:0|1:24246175_C_T:24246175:0,2,0,1
chr2	24246180	.	C	CTTGACTCTTGCTGAGGTAGGTAAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:0,1:2,0:0|1:24246175_C_T:24246175:0,2,0,1
chr2	24246679	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	24255862	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr2	24255991	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=134,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:6,2,6,2
chr2	24272645	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	24302246	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:5,7:2,3:6,1,11,0
chr2	24345196	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:1,0:1,0,1,1
chr2	24387178	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	24390657	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	24395506	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=203.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,63:0.985:63:0,31:0,31:0,0,10,53
chr2	24398281	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	24400769	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:1,0,2,6
chr2	24402127	.	C	CAA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=185.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,22:0,21:0,0,4,40
chr2	24413298	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=136,118;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.503:36:2,12:15,6:14,4,16,2
chr2	24413326	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=119,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.083:53:22,0:20,0:34,15,0,4
chr2	24413595	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=189,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:2,4:0,1:0,2,1,5
chr2	24423662	.	CT	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	24432138	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr2	24432667	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,13,5
chr2	24432721	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:4,8,0,2
chr2	24432937	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,1:2,2:0,5,0,3
chr2	24475205	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=116.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.946:34:0,19:0,14:1,0,22,11
chr2	24484150	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	24493517	.	TA	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:10,3:23,0:27,7,3,0
chr2	24521493	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr2	24521686	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=18,34;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:0,1:0,5,0,2
chr2	24521766	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	24550867	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=14,34;MFRL=83,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr2	24896389	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=73.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,0,20
chr2	24952730	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24952730_C_T:24952730:0,0,0,1
chr2	24952732	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24952730_C_T:24952730:0,0,0,1
chr2	24952738	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24952730_C_T:24952730:0,0,0,1
chr2	24952740	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:24952730_C_T:24952730:0,0,0,1
chr2	25013523	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	25038268	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	25047408	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr2	25048847	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr2	25061880	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=175,172;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	25095338	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=225,208177314;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	25100738	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:2,2:6,1,3,0
chr2	25100902	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=134,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,1,2
chr2	25351100	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,107;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,0:11,4:15,7,4,0
chr2	25353360	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:18,2,1,1
chr2	25354769	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=229,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:25354769_T_A:25354769:0,4,0,1
chr2	25354773	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=229,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:25354769_T_A:25354769:0,4,0,1
chr2	25360186	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=95,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:2,1,3,1
chr2	25376681	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=135,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:2,4:4,1:1,5,2,3
chr2	25376711	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=153,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.384:6:2,2:2,0:0|1:25376711_G_T:25376711:1,3,1,1
chr2	25376724	.	TCCTCCCCACCTCC	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=137,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:25376711_G_T:25376711:1,2,0,1
chr2	25377176	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,4,15
chr2	25383887	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr2	25458546	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:3,1,5,0
chr2	25463483	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,11:0,7:0,0,12,6
chr2	25466888	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr2	25469913	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,13:0,0,15,3
chr2	25551463	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,19;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,1:5,1:5,4,4,0
chr2	25610287	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:5,4:3,1:1,8,1,4
chr2	25656880	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=108.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,15:0,14:0,0,6,25
chr2	25875401	.	TAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=124,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:5,3:1,0:6,2,3,0
chr2	25967327	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=198,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:25967327_A_T:25967327:1,3,0,1
chr2	25967329	.	A	AGCGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=198,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:25967327_A_T:25967327:1,3,0,1
chr2	25967331	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=198,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:25967327_A_T:25967327:1,3,0,1
chr2	25967332	.	C	CGACGTCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=198,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:25967327_A_T:25967327:1,3,0,1
chr2	25973174	.	G	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.087:55:22,0:28,4:30,21,4,0
chr2	25990500	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,99;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:18,3:18,0:15,21,3,0
chr2	26022446	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=142,230;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr2	26022473	.	T	TGCTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=127,251;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	26350136	.	G	T	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=142.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,46:0.553:83:12,22:25,24:3,34,4,42
chr2	26357748	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:5,1,6,1
chr2	26405985	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.932:17:0,7:0,9:0,1,1,15
chr2	26417533	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr2	26420708	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr2	26454996	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,22,3
chr2	26477125	.	G	GACT	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACT;STR;TLOD=246.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.984:57:0,21:0,30:0,0,38,19
chr2	26532491	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=131,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr2	26532735	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,2,2
chr2	26533023	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:3,2,4,4
chr2	26534801	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=114,174;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:8,5:8,8:4,12,5,8
chr2	26536299	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.371:22:9,3:4,4:1,13,2,6
chr2	26536555	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr2	26536694	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=103,157;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:5,6:7,7:6,6,8,5
chr2	26537499	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,3,13
chr2	26539967	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=146,71;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0|1:26539967_C_T:26539967:0,3,1,1
chr2	26539971	.	A	AAGAGAGAGAGGTTGGACTGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,71;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.421:5:0,0:3,1:0|1:26539967_C_T:26539967:0,3,1,1
chr2	26568994	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:3,1:8,1:10,2,2,0
chr2	26587076	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=122,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	26590022	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,1:9,2:14,6,2,1
chr2	26590084	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,7:0,0,5,12
chr2	26590118	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr2	26609469	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	26652671	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr2	26663187	.	T	TTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=18,31;MFRL=220,180;MMQ=40,41;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=TG;STR;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.840:10:0,3:0,4:1,0,9,0
chr2	26671544	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.584:34:6,11:8,8:9,5,13,7
chr2	26676322	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=166.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,18:0,28:0,0,20,27
chr2	26679394	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=118,164;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:6,4:10,6:3,13,2,8
chr2	26689893	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=274,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr2	26693654	.	C	CTTCTTCCTCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	26695338	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=119,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:0|1:26695338_C_T:26695338:7,3,4,4
chr2	26695354	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=111,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,10:0.550:18:5,5:3,4:0|1:26695338_C_T:26695338:3,5,4,6
chr2	26697422	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:7,3:1,3:7,1,5,2
chr2	26697480	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:8,3:8,8:10,6,7,4
chr2	26706486	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,1:12,1:8,10,0,2
chr2	26724725	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.635:20:4,4:3,8:3,4,1,12
chr2	26726752	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=135,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:4,4,1,5
chr2	26739247	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=115,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:1,2,4,1
chr2	26741900	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=115,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,2:10,0:4,11,2,0
chr2	26750645	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:7,5:2,2:8,1,5,2
chr2	26801586	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=158,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:6,1,3,0
chr2	26804143	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr2	26818006	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr2	26818021	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,6,5
chr2	26915669	.	GGCA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=276,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	26951449	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,4:0,1:0,0,2,6
chr2	26997280	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	27154658	.	C	CCAAAGTACAGGCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr2	27157400	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	27163044	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:0,1:0,4,0,2
chr2	27164806	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:1,9:6,6:4,3,12,3
chr2	27165317	.	TAAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr2	27246394	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=166,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:27246394_G_C:27246394:0,3,0,1
chr2	27246397	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=166,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27246394_G_C:27246394:0,3,0,1
chr2	27249245	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=193,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:0,6,1,4
chr2	27262073	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=169,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr2	27262763	.	GGGA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr2	27263122	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	27276202	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=165,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,5:1,0:2,0,5,0
chr2	27276835	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,2:15,0:15,13,2,0
chr2	27279416	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	27279744	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=169,163;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	27279756	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=173,160;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	27280092	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr2	27280127	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=166,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:4,4:1,5:6,0,9,0
chr2	27292651	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,7:3,2:0,6,0,9
chr2	27293150	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.648:35:6,14:6,8:1,11,4,19
chr2	27302165	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	27307769	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr2	27351279	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr2	27354173	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	27354542	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:8,2,1,1
chr2	27355344	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=236,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:1,3,2,0
chr2	27355453	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,210;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.197:16:7,3:6,0:13,0,2,1
chr2	27355454	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=65,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.947:19:1,10:1,7:0,2,17,0
chr2	27372274	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,27;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:27372274_A_AT:27372274:0,1,0,1
chr2	27372276	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27372274_A_AT:27372274:0,1,0,1
chr2	27372568	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,14;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:2,0:1,0:3,0,0,1
chr2	27423966	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,1:9,1:3,13,1,1
chr2	27424496	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	27426824	.	C	CGACGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=133,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27426824_C_CGACGCT:27426824:0,1,0,1
chr2	27426827	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=133,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27426824_C_CGACGCT:27426824:0,1,0,1
chr2	27428147	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	27428173	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,3:1,5:5,0,7,1
chr2	27428815	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=95,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.627:27:5,10:4,7:8,2,16,1
chr2	27435374	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.620:16:2,3:3,7:0,6,0,10
chr2	27439518	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=123,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=110.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,36:0.599:60:12,18:11,18:4,20,12,24
chr2	27440722	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=116,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.651:27:8,4:1,12:5,4,10,8
chr2	27445976	.	G	GTCACTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=192,277;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	27448145	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	27448171	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,155;MMQ=60,47;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.820:4:0,1:0,0:0,0,0,4
chr2	27449293	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,0:2,2,0,3
chr2	27455281	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=114,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:1,1:5,0,4,0
chr2	27460787	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:1,1,2,3
chr2	27461323	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:5,10,2,0
chr2	27463091	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=113,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.366:23:4,1:8,4:11,2,3,7
chr2	27463351	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:3,2,6,2
chr2	27465306	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:3,0:6,2:0|1:27465306_T_A:27465306:3,9,1,1
chr2	27465311	.	G	GACTGGGGTGGCTGGGACATAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=144,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:27465306_T_A:27465306:3,10,1,1
chr2	27465880	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	27479472	.	T	TCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=181,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	27499796	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=0,154;MMQ=60,47;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27499796_T_TG:27499796:1,0,0,1
chr2	27499801	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=0,154;MMQ=60,47;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:27499796_T_TG:27499796:1,0,0,1
chr2	27499806	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:27499796_T_TG:27499796:1,0,0,1
chr2	27521375	.	C	CACGTGCCCATGAAGGATACCTACA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=132,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:27521375_C_CACGTGCCCATGAAGGATACCTACA:27521375:2,1,0,1
chr2	27521377	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=132,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:27521375_C_CACGTGCCCATGAAGGATACCTACA:27521375:2,1,0,1
chr2	27521383	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:27521383_A_G:27521383:1,1,1,0
chr2	27521385	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:27521383_A_G:27521383:1,1,1,0
chr2	27522330	.	G	GCTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,0:2,1:0,5,0,1
chr2	27535311	.	T	TG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=66.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,11:0,0,7,13
chr2	27550250	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=164,192;MMQ=50,52;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	27550251	.	GC	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=181,137;MMQ=56,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	27552074	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=133,77;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.185:24:9,0:11,3:10,10,0,4
chr2	27556924	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=137,54;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.127:37:19,0:14,4:0|1:27556924_A_G:27556924:15,18,3,1
chr2	27556940	.	CC	TG	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=137,84;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:14,2:0|1:27556924_A_G:27556924:8,21,1,1
chr2	27558333	.	GGT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=143,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GT;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:7,1:14,1:4,18,0,2
chr2	27591804	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:5,0,5,1
chr2	27597190	.	AT	A,ATT	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,32,30;MFRL=143,160,100;MMQ=60,60,60;MPOS=20,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=11.39,5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,11,4:0.248,0.110:42:19,5,2:8,5,1:26,1,13,2
chr2	27598097	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	27659832	.	C	CT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:14,0:14,1:24,6,1,2
chr2	27664747	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:27664747_CT_C:27664747:0,2,0,1
chr2	27664756	.	AG	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=182,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27664747_CT_C:27664747:0,3,0,1
chr2	27666476	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,186;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0,15,0,2
chr2	27676923	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:8,3:12,1:10,12,2,2
chr2	27700586	.	T	TATTTTTATTCCATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	27712638	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr2	27731212	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	27803571	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:20,0:14,2:16,18,2,0
chr2	27805525	.	C	CG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:2,2:9,2:6,5,2,3
chr2	27823771	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	27824168	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr2	27839107	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,6:0,15:0,0,13,8
chr2	27850099	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,166;MMQ=57,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:12,7:9,3:12,9,7,3
chr2	27852113	.	A	AAGGTGGTCTTCCACTGGCTAAACGGCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=154,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr2	27852117	.	A	AGGTCTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	27852118	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	27852150	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr2	27852637	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr2	27855397	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=76.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,10:0,0,23,4
chr2	27857992	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=114.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,15:0,19:0,0,30,9
chr2	27858167	.	C	CTTTT,CTTTTTTTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,19,17;MFRL=128,153,189;MMQ=60,60,60;MPOS=8,-1073741815;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,20,25;RU=T;STR;TLOD=9.70,7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.415,0.406:7:0,0,0:1,0,1:0,1,0,6
chr2	27892013	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=231,124;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr2	27900569	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=179,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,24:0.500:48:10,12:13,11:19,5,21,3
chr2	27930837	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,12,12
chr2	28084253	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:28084253_T_C:28084253:1,0,0,1
chr2	28084256	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:28084253_T_C:28084253:1,0,0,1
chr2	28093758	.	CTGAAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=239,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28093758_CTGAAAA_C:28093758:0,1,0,1
chr2	28093767	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=239,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28093758_CTGAAAA_C:28093758:0,1,0,1
chr2	28211051	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=173,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28211051_C_CTT:28211051:0,1,0,1
chr2	28211053	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=173,244;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:28211051_C_CTT:28211051:0,1,0,1
chr2	28464373	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	28615803	.	CAGAA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:2,2:0,6,0,5
chr2	28615812	.	GGA	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=15,33;MFRL=182,191;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GA;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:1,1:0,8,0,3
chr2	28718897	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	28748857	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=70.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,10:0,9:0,0,9,11
chr2	28748916	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	28752348	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=226,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	28752498	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	28752555	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,6:0,12:0,0,15,3
chr2	28752727	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:28752727_C_G:28752727:0,0,0,8
chr2	28752741	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:28752727_C_G:28752727:0,0,0,5
chr2	28761257	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr2	28761282	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,1,13
chr2	28763374	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr2	28771452	.	CTA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	28771624	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	28771897	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr2	28795962	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	28802649	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,3:5,4:0,9,0,7
chr2	28804848	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=172,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.295:13:3,1:6,3:9,0,4,0
chr2	28808539	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=180,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:9,8:6,5:15,0,12,1
chr2	28812285	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,2:1,6:4,0,6,2
chr2	28812793	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,0:5,2:8,3,2,0
chr2	28812873	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=141,45;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:9,10,2,0
chr2	28812982	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,5:2,4:0,7,5,4
chr2	28816814	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.237:14:7,2:4,1:11,0,3,0
chr2	28821662	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,10:0,0,0,16
chr2	28824722	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,13;MFRL=170,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.373:8:4,0:0,1:3,2,3,0
chr2	28824793	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,9:0,0,8,11
chr2	28840691	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=91,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:2,3:7,4:2,7,2,6
chr2	28847806	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	28849461	.	CCCCGAGCTCCTTGCT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=139,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.543:11:2,4:3,1:0,5,1,5
chr2	28849473	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=161,139;MMQ=24,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.682:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	28851517	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,4:7,3:4,6,2,5
chr2	28854816	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=102770138,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr2	28855918	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	28863738	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=179,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,5:2,1:7,1,5,1
chr2	28865968	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:0,6,2,5
chr2	28866002	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=226,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:28866002_C_CCT:28866002:0,4,0,1
chr2	28866004	.	A	AGTTTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=246,221;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:28866002_C_CCT:28866002:0,3,0,1
chr2	28975107	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr2	29011498	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,2:6,0:15,2,2,0
chr2	29041877	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=168,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.519:23:6,6:5,6:9,2,8,4
chr2	29045323	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=153.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,28:0,16:0,0,0,45
chr2	29052256	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr2	29052275	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=178,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr2	29052282	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=213,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:29052282_G_T:29052282:0,2,0,1
chr2	29052286	.	T	TGGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=195,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:29052282_G_T:29052282:0,1,0,1
chr2	29075170	.	T	TGAGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=191,178;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr2	29087799	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	29145725	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=118,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.539:37:8,8:9,12:9,8,10,10
chr2	29152456	.	A	G	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,38:0.522:73:16,16:17,20:18,17,26,12
chr2	29169612	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:0,10,0,3
chr2	29217832	.	C	CAGAGAAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	29222388	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	29225496	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:12,4:1,2:7,7,3,3
chr2	29225691	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29225691_A_T:29225691:0,1,0,1
chr2	29225694	.	AA	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29225691_A_T:29225691:0,1,0,1
chr2	29225697	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29225691_A_T:29225691:0,1,0,1
chr2	29225700	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29225691_A_T:29225691:0,1,0,1
chr2	29226559	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=99.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.943:33:0,14:1,18:1,0,10,22
chr2	29239942	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.492:35:7,7:8,10:18,0,14,3
chr2	29240005	.	T	C	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=134.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,45:0.495:91:20,24:26,21:29,17,25,20
chr2	29240582	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=184,117;MMQ=60,31;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:3,4:9,1:11,1,5,0
chr2	29244932	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	29246119	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr2	29246922	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr2	29249903	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr2	29258289	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:6,0,5,0
chr2	29274898	.	A	ACAGAGGGGTGGC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGAGGGGTGGC;STR;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.395:18:3,2:7,2:9,2,5,2
chr2	29287926	.	C	CGCT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GCT;STR;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:4,5:2,1:2,4,2,5
chr2	29295389	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:9,3:5,4:4,11,1,6
chr2	29296373	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,4:4,3,2,4
chr2	29297091	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:5,3,0,2
chr2	29366875	.	C	CACAG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.535:11:1,2:4,3:1,4,0,6
chr2	29383374	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:1,5:5,5:1,5,0,10
chr2	29386646	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,4:5,8:8,3,9,3
chr2	29390301	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:7,11:5,7:10,3,16,2
chr2	29419591	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr2	29446202	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=75,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:4,1,4,0
chr2	29449819	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,106;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,2:3,6:5,1,5,3
chr2	29451783	.	AC	CG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=117,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.198:27:6,0:11,0:3,19,5,0
chr2	29498210	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr2	29541104	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr2	29551161	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr2	29551347	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=142,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,0:9,3:8,12,2,1
chr2	29917940	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	30682470	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.402:20:6,2:6,5:5,7,6,2
chr2	30828792	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=160.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,18:0,27:0,0,46,1
chr2	30829034	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=199,184;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:30829034_A_G:30829034:0,11,0,2
chr2	30829036	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=199,184;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:0|1:30829034_A_G:30829034:0,11,0,2
chr2	30863314	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=197,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,1:6,1:10,7,1,1
chr2	30959262	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	30961400	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,3:0,0,0,12
chr2	30973913	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr2	30977073	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	30980940	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=79,118;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,1:4,4:2,4,4,1
chr2	30986989	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,5,7
chr2	30993125	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:7,1:3,1:8,3,0,2
chr2	31009977	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,10,6
chr2	31133939	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=104,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:5,4:14,5:2,17,3,6
chr2	31155043	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.217:12:4,2:4,0:2,8,0,2
chr2	31189236	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr2	31401290	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr2	31410708	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,19:0,0,5,32
chr2	31414245	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=109,55;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,0:14,2:17,11,2,0
chr2	31414288	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=129,133;MMQ=60,56;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:4,0:4,1:3,6,0,4
chr2	31415957	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,13;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:31415957_A_C:31415957:2,0,1,0
chr2	31415967	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:31415957_A_C:31415957:2,0,1,0
chr2	31415971	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,11;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,0:0|1:31415957_A_C:31415957:2,0,1,0
chr2	31416245	.	A	ACAGCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31416245_A_ACAGCTG:31416245:0,0,0,1
chr2	31416250	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:31416245_A_ACAGCTG:31416245:0,0,0,1
chr2	31424885	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:2,5:2,4:1,3,5,5
chr2	31467079	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=223,233;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	31467351	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	31484334	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	31489613	.	A	AAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=249,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.384:3:1,1:1,0:0|1:31489613_A_AAG:31489613:0,2,0,1
chr2	31489614	.	T	TTGAAATCCTAGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=249,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:31489613_A_AAG:31489613:0,2,0,1
chr2	31558993	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:31558993_G_C:31558993:0,4,0,1
chr2	31558994	.	C	CCATTCTCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:31558993_G_C:31558993:0,4,0,1
chr2	31570376	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr2	31571040	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,2:5,0:18,0,2,0
chr2	31571064	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.539:22:7,10:3,1:9,1,12,0
chr2	31571241	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr2	31572732	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,6:2,1:0,3,0,7
chr2	31588288	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=140,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.492:26:7,5:6,6:11,2,10,3
chr2	31588294	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=133,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.126:29:12,1:13,2:18,8,2,1
chr2	31589654	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,4:0,4:2,0,8,0
chr2	31590759	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:4,1,3,0
chr2	31600146	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr2	31609448	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,3,11
chr2	31611029	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	31621511	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:12,2:14,0:14,12,2,0
chr2	31751295	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=118,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,0:5,2:8,10,0,2
chr2	31805880	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,3,5
chr2	32095023	.	TA	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=14,13;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.307:25:1,0:0,1:0,17,0,8
chr2	32117217	.	G	A,GA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=17,26,18;MFRL=157,158,151;MMQ=60,60,60;MPOS=23,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.23,4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,8,4:0.301,0.281:21:0,2,0:1,3,1:0,9,1,11
chr2	32254852	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=173,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,0:10,2:0|1:32254852_T_A:32254852:1,24,0,2
chr2	32254858	.	T	TAACCCCAGCAAAACCGGCAAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=175,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:13,0:7,2:0|1:32254852_T_A:32254852:1,20,0,2
chr2	32353659	.	T	TCATCTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	32366959	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,2:6,1:14,2,3,0
chr2	32368296	.	C	CA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.398:23:7,3:7,6:14,0,9,0
chr2	32368315	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:10,3:18,0:31,0,3,0
chr2	32368320	.	CA	AG	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=181,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.084:33:11,2:20,0:31,0,2,0
chr2	32369901	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=132,176;MMQ=45,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.852:11:0,3:1,7:1,0,10,0
chr2	32400294	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:7,1:0,5:7,0,4,2
chr2	32434701	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,3:0,13:0,0,0,17
chr2	32449871	.	ATTTT	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,4;RU=T;STR;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,3:0,11:0,0,0,15
chr2	32449879	.	T	TAAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=A;STR;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,2:0,11:0,0,0,14
chr2	32461493	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr2	32466029	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	32477809	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,168;MMQ=60,35;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr2	32481793	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=100.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0|1:32481793_AT_A:32481793:0,0,12,11
chr2	32481795	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0|1:32481793_AT_A:32481793:0,0,12,11
chr2	32605449	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32605449_G_A:32605449:0,0,0,1
chr2	32605452	.	C	CCCCA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32605449_G_A:32605449:0,0,0,1
chr2	32605455	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32605449_G_A:32605449:0,0,0,1
chr2	32605458	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32605449_G_A:32605449:0,0,0,1
chr2	32667058	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:32667058_C_A:32667058:0,0,2,0
chr2	32667061	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:32667058_C_A:32667058:0,0,2,0
chr2	32688470	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=148,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:12,2:8,1:2,18,1,2
chr2	32690109	.	AT	A	.	.	DP=114;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,12:0.129:93:48,8:28,4:67,14,11,1
chr2	32690253	.	AT	A,ATT	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=30,32,29;MFRL=122,168,151;MMQ=60,60,60;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,18,20;RU=T;STR;TLOD=5.78,3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,10,7:0.220,0.172:42:10,5,2:12,3,3:6,19,3,14
chr2	32690328	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=153,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,2:8,0:1,10,0,2
chr2	32706563	.	A	G	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=159,137;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:32,0:33,3:10,55,0,3
chr2	32706572	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=159,159;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:29,0:24,3:6,53,0,3
chr2	32706579	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=148.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,22:0,19:0,0,2,41
chr2	32712875	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=137.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,15:0,21:0,0,2,35
chr2	32726707	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:1,0:8,2:9,0,3,0
chr2	32730338	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32730338_A_AC:32730338:0,1,0,1
chr2	32730339	.	A	ACACTCTCATTCACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32730338_A_AC:32730338:0,1,0,1
chr2	32733343	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=27,28;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.848:3:0,0:0,0:0,0,1,2
chr2	32735648	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:10,13,0,2
chr2	32740777	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32740777_T_A:32740777:0,0,0,1
chr2	32740783	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32740777_T_A:32740777:0,0,0,1
chr2	32749880	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=109.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,16:0,9:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,25,0
chr2	32749890	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=129.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,16:0,10:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,28,1
chr2	32749893	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=151.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.973:35:0,18:0,13:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,33,2
chr2	32749903	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=169.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,22:0,17:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,39,2
chr2	32770823	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,370753;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:29,3:26,0:22,34,3,0
chr2	32820252	.	AT	A	.	.	DP=128;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,4:0.045:91:40,2:46,1:12,75,0,4
chr2	32822729	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr2	32865552	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=194,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32865552_G_C:32865552:0,1,0,1
chr2	32865554	.	T	TTGATTTGTTACTTTTTCTTCGAGCACCGAAGTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=203,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.483:3:0,1:1,0:0|1:32865552_G_C:32865552:0,2,0,1
chr2	32891730	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,2:16,0:14,14,1,1
chr2	32959024	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr2	32961691	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	32961745	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=77.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0,0,21,2
chr2	33011955	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	33174043	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.488:24:5,4:7,5:4,8,3,9
chr2	33245903	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:4,0,3,0
chr2	33246146	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,5:6,0:4,7,3,2
chr2	33413949	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,2:0,3:0,4,1,4
chr2	33414009	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	33442549	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	33477947	.	C	CCTTTTTTTTGTGAGTCCCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr2	33477964	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	33482673	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=208,143;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:33482673_G_A:33482673:0,4,0,1
chr2	33482676	.	TA	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=208,143;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:33482673_G_A:33482673:0,4,0,1
chr2	33500848	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:6,4:14,8:0|1:33500848_A_G:33500848:9,11,7,5
chr2	33500863	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,19:0.571:33:6,7:7,12:1|0:33500848_A_G:33500848:10,4,12,7
chr2	33540138	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	33540172	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=114,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.660:9:0,3:3,3:1,2,6,0
chr2	33585796	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,14:0,25:0,0,12,28
chr2	33586464	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.434:5:1,1:2,1:0|1:33586464_CT_C:33586464:2,1,2,0
chr2	33586481	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,18;MFRL=155,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,0:0|1:33586464_CT_C:33586464:4,1,2,0
chr2	33614187	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:2,2:3,5:4,1,7,1
chr2	33623387	.	AT	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=52.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,11:2,2:6,0,11,2
chr2	33744958	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0,0,13,7
chr2	33759403	.	T	TGTCC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=177,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:9,3:9,0:9,10,1,2
chr2	33764141	.	G	GT,GTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31,34;MFRL=146,143,173;MMQ=60,60,60;MPOS=3,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=5.17,4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,2:0.276,0.175:12:5,1,1:2,2,1:7,0,3,2
chr2	33784076	.	A	ACTGGAGGAGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr2	36583461	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=115,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,3:1,0,3,2
chr2	36605585	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=180,114;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:0,11,0,2
chr2	36668395	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,2:7,5:6,3,4,3
chr2	36669670	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=184,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:1,3:2,1:4,0,5,0
chr2	36739553	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr2	36740643	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.395:21:8,8:4,0:10,3,7,1
chr2	36756288	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:14,5:2,3:10,6,4,4
chr2	36779144	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,11,0
chr2	36783215	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=124.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,44:0.643:68:8,17:13,27:5,19,10,34
chr2	36785667	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr2	36943419	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,6:0,0:0,0,8,0
chr2	36970275	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,0:13,2:15,13,1,1
chr2	36994439	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.631:25:2,8:7,8:4,5,6,10
chr2	37000877	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.247:35:12,4:11,4:23,4,8,0
chr2	37010574	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,0,15
chr2	37041476	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=159,181;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,0,2
chr2	37077015	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	37078095	.	A	AT,ATT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34,32;MFRL=0,163,181;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=14.10,7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,6:0.475,0.461:12:0,4,3:0,2,3:0,0,12,0
chr2	37085261	.	G	GCCCTCATACGTTCATCGCAGCACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	37096970	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	37111045	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.584:34:11,6:3,14:11,3,14,6
chr2	37152160	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:12,1:26,2:39,0,3,0
chr2	37152166	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=162,152;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:12,2:25,2:39,0,4,0
chr2	37152186	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=152,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:20,2:33,0:0|1:37152186_C_T:37152186:48,8,1,1
chr2	37152194	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=151,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,2:0.044:65:27,2:34,0:0|1:37152186_C_T:37152186:54,9,1,1
chr2	37152195	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=149,166;MMQ=60,50;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,2:0.044:66:28,2:36,0:54,10,2,0
chr2	37152389	.	CA	C,CAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=35,34,35;MFRL=168,139,155;MMQ=60,60,60;MPOS=29,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.79,5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,3,4:0.122,0.154:29:9,1,1:13,2,2:1,21,0,7
chr2	37195608	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:6,0,5,0
chr2	37234519	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=167,161;MMQ=55,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,1:0,2,0,6
chr2	37248015	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:5,5:4,4:1,8,2,7
chr2	37255015	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,35:0.592:59:9,21:14,14:17,7,30,5
chr2	37264935	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr2	37280763	.	G	GA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=43.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.501:43:14,7:7,9:4,18,3,18
chr2	37292128	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:15,0:12,4:7,21,0,4
chr2	37292890	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:8,2,7,0
chr2	37297329	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,2:2,7:5,2,8,1
chr2	37302556	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	37306343	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,14,11
chr2	37316717	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=134,134;MMQ=60,58;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:4,0:7,3:11,3,3,1
chr2	37336486	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:14,0:13,3:0,28,0,3
chr2	37364220	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=144,109;MMQ=60,60;MPOS=-1073741808;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:24,2:20,0:11,34,1,1
chr2	37373982	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,16,5
chr2	37402270	.	C	G	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,20:0.291:70:26,9:24,11:27,23,11,9
chr2	37402373	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=131,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,15:0.334:46:8,4:22,11:10,21,3,12
chr2	37406761	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr2	37410537	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:8,3:2,1:7,3,4,0
chr2	37414431	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:5,6:11,2:16,0,8,0
chr2	37414613	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=179,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:5,15,0,2
chr2	37415496	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr2	37428743	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,28:0.462:61:19,18:13,10:30,3,27,1
chr2	37444266	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=153,113;MMQ=60,32;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0,11,0,2
chr2	37444278	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=172,140;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0,11,0,2
chr2	37444288	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=193,140;MMQ=60,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,0:3,4:0,8,0,4
chr2	37447465	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=154,123;MMQ=40,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.343:18:7,2:4,4:0|1:37447465_A_G:37447465:12,0,6,0
chr2	37447473	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=20,33;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.944:16:1,8:0,6:1,0,13,2
chr2	37447475	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=154,0;MMQ=40,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.475:19:4,3:2,6:0|1:37447465_A_G:37447465:10,0,7,2
chr2	37483719	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr2	37483772	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.299:12:6,2:2,1:8,1,3,0
chr2	37487341	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:6,2:6,1:9,4,1,2
chr2	37518088	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:9,1:4,14,0,2
chr2	37586681	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr2	37595696	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=108,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.481:23:7,7:5,4:9,3,7,4
chr2	37599688	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=239,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr2	37599963	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=144,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,4:6,1:1,11,0,5
chr2	37599988	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=114,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:1,6,0,4
chr2	38179414	.	CTG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=182,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:2,3,1,2
chr2	38179449	.	A	ATCCTTTTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	38201174	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=219,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr2	38202543	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=160,151;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38202543_C_T:38202543:0,1,0,1
chr2	38202548	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,151;MMQ=60,30;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:38202543_C_T:38202543:0,1,0,1
chr2	38208606	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr2	38218470	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:1,7:4,7:3,2,3,11
chr2	38244826	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:3,6:7,6:2,9,0,12
chr2	38298149	.	CA	TG	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,2:16,0:18,9,1,1
chr2	38298150	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,10:0,18:0,0,18,10
chr2	38302544	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,1,6
chr2	38526333	.	A	AT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,8:0.162:52:25,4:19,2:43,1,6,2
chr2	38800658	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38800658_A_ATC:38800658:0,1,0,1
chr2	38800659	.	A	ATTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:38800658_A_ATC:38800658:0,1,0,1
chr2	38809162	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:8,4:10,1:9,9,3,2
chr2	38818689	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:13,0:18,4:21,11,0,4
chr2	38829805	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=215,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.609:6:0,1:2,1:2,0,1,3
chr2	38975332	.	G	T,GT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,18,17;MFRL=150,174,145;MMQ=60,60,60;MPOS=20,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.72,9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,5:0.176,0.392:15:1,0,0:2,2,2:1,5,1,8
chr2	38975609	.	CG	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	38977287	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=146,70;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:25,0:15,3:16,25,1,2
chr2	38977371	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr2	38977402	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr2	39025632	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr2	39030074	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=184,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr2	39030155	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=200,265;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39030155_CT_C:39030155:0,1,0,1
chr2	39030158	.	CCCAAATTTAT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=200,265;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39030155_CT_C:39030155:0,1,0,1
chr2	39041092	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.061:49:31,1:15,2:10,36,0,3
chr2	39042639	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,12:0,3:0,0,14,1
chr2	39043388	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:5,1:1,3:0,6,0,4
chr2	39046373	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=188,137;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,1:3,1:0|1:39046373_G_A:39046373:0,9,0,2
chr2	39046375	.	GGT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=189,137;MMQ=60,58;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:3,1:0|1:39046373_G_A:39046373:0,11,0,2
chr2	39050061	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr2	39050141	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:5,2,0,3
chr2	39075356	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=93.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,31:0.696:44:5,16:8,15:13,0,25,6
chr2	39081369	.	AGG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=163,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:39081369_AGG_A:39081369:0,1,0,1
chr2	39081378	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=163,104;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:39081369_AGG_A:39081369:0,1,0,1
chr2	39083656	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=163,156;MMQ=46,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:39083656_T_C:39083656:1,3,0,1
chr2	39083665	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=163,156;MMQ=46,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:39083656_T_C:39083656:1,3,0,1
chr2	39083670	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=163,156;MMQ=44,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:39083656_T_C:39083656:0,3,0,1
chr2	39083672	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=163,156;MMQ=44,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:39083656_T_C:39083656:0,3,0,1
chr2	39090696	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr2	39095428	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:1,11,0,2
chr2	39117117	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,4:4,6:4,5,4,6
chr2	39156309	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0,13,0,2
chr2	39162832	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:5,2,4,0
chr2	39187519	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	39198966	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=200.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.982:54:0,29:0,25:0,0,39,15
chr2	39201073	.	CTA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr2	39213083	.	C	T	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,3:0.037:104:56,3:45,0:48,53,2,1
chr2	39214821	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	39224351	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,14,1
chr2	39224615	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	39233500	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,9:0,0,17,2
chr2	39239572	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	39240584	.	TA	T,TAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,26,30;MFRL=150,121,188;MMQ=60,60,60;MPOS=15,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.06,6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,5:0.157,0.207:25:8,0,3:8,4,1:14,2,6,3
chr2	39251375	.	T	TCAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAC;STR;TLOD=57.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr2	39262296	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,114;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:13,3:10,0:20,3,3,0
chr2	39281730	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,18,0
chr2	39405856	.	C	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,56;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,2:0.044:65:31,0:31,2:30,33,2,0
chr2	39411882	.	T	TACTTATATAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=226,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39411882_T_TACTTATATAC:39411882:0,1,0,1
chr2	39411887	.	G	GTGTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=226,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39411882_T_TACTTATATAC:39411882:0,1,0,1
chr2	39411891	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=226,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39411882_T_TACTTATATAC:39411882:0,1,0,1
chr2	39414956	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=125,217;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr2	39440727	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	39479122	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	39494469	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	39499366	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:8,5:4,2:11,1,7,0
chr2	39514136	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr2	39514204	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	39526842	.	A	C	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=315.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,86:0.989:86:0,40:0,44:0,0,73,13
chr2	39530136	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,8:0,16:0,0,24,0
chr2	39553271	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=151.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,21:0,22:0,0,30,15
chr2	39564620	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=112.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,21:0,10:0,0,28,5
chr2	39570427	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr2	39934378	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr2	39944055	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=193,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:3,0,5,0
chr2	39993167	.	T	C	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,23:0.264:89:33,13:33,10:46,20,20,3
chr2	40006430	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40006430_A_C:40006430:0,0,0,1
chr2	40006442	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40006430_A_C:40006430:0,0,0,1
chr2	40402275	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,17,0
chr2	40402319	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=118,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:18,4:16,0:27,8,4,0
chr2	40404839	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr2	40405727	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:40405727_T_C:40405727:0,3,0,1
chr2	40405734	.	C	CTGAACACCATTTTTGCATGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:40405727_T_C:40405727:0,2,0,1
chr2	40655563	.	CCACA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=199,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=CA;STR;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr2	42174733	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:4,2:5,1:2,7,1,2
chr2	42552711	.	TTA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:3,3:2,0:0|1:42552711_TTA_T:42552711:0,5,0,3
chr2	42552742	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:42552711_TTA_T:42552711:0,0,0,3
chr2	42719912	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr2	42836516	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr2	42922888	.	AT	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,9:0.164:55:23,4:19,4:40,6,9,0
chr2	42925079	.	TTTC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=64.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr2	42931529	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr2	42935961	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.952:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr2	42935979	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,9:0,0,15,4
chr2	42936174	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:16,0:12,2:15,13,1,1
chr2	42950185	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.587:20:3,4:5,7:0,8,2,10
chr2	42994505	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr2	42996759	.	AAGAG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AG;STR;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr2	43015612	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr2	43015719	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0,0,11,12
chr2	43015814	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,6:0,0,0,8
chr2	43019730	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	43452334	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=274,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	43452618	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:5,5:1,12:3,3,7,10
chr2	43458065	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.152:17:5,0:8,0:5,10,2,0
chr2	43514036	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.465:26:9,8:5,4:8,6,10,2
chr2	43625078	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.648:32:4,12:7,9:7,4,15,6
chr2	43657510	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	43735713	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=239,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	43768545	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr2	43778857	.	GAA	G,GA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32,35;MFRL=162,168,185;MMQ=60,60,60;MPOS=6,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=4.18,29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,14:0.132,0.521:26:5,2,9:4,1,4:9,0,17,0
chr2	43787576	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:0,5:4,5:0,4,0,10
chr2	43793963	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:2,1:3,2:0,7,0,3
chr2	43797710	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr2	43798792	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr2	43799070	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	43800174	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	43802261	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	43805608	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,8:4,7:6,1,12,3
chr2	43813764	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=156,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,18:0.659:27:1,12:7,4:0|1:43813764_A_G:43813764:7,2,14,4
chr2	43813767	.	C	CAATTTCTG	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=136,5336199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,2:0.095:29:13,0:11,2:1|0:43813764_A_G:43813764:22,5,0,2
chr2	43871983	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,4,17
chr2	43872032	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=215,184;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr2	43902511	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr2	43903066	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,16,15
chr2	43903483	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr2	43905898	.	G	GAGGTGGAGGTGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.902:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	43921489	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=104,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:5,0,4,0
chr2	43922421	.	CT	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.078:48:21,3:24,0:1,44,0,3
chr2	43927798	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,272;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43927798_C_CT:43927798:0,0,0,1
chr2	43927808	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43927798_C_CT:43927798:0,0,0,1
chr2	43927836	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,272;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43927836_A_G:43927836:0,0,0,1
chr2	43927837	.	G	GCT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43927836_A_G:43927836:0,0,0,1
chr2	43937500	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,4:4,3:0,12,2,6
chr2	43939525	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr2	43947944	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=133,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr2	43947961	.	T	TCCTGAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:43947961_T_TCCTGAAC:43947961:0,3,0,1
chr2	43947964	.	T	TTGACTGACTAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:43947961_T_TCCTGAAC:43947961:0,3,0,1
chr2	43980791	.	T	A	.	.	DP=98;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:88,3:0.043:91:41,3:47,0:0|1:43980791_T_A:43980791:48,40,3,0
chr2	43980794	.	T	G	.	.	DP=93;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:88,3:0.043:91:38,3:45,0:0|1:43980791_T_A:43980791:48,40,3,0
chr2	43991357	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=166.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,24:0,22:0,0,39,7
chr2	44010620	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,0:7,3:6,4,3,0
chr2	44036800	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:18,10:6,8:23,1,17,1
chr2	44051926	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,186;MMQ=48,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:4,0,3,0
chr2	44071625	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:3,2,2,1
chr2	44071639	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:2,2,1,2
chr2	44079004	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	44101214	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	44101538	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr2	44101649	.	G	GCC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=C;STR;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:5,2:3,4:0,8,0,6
chr2	44102235	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr2	44104610	.	ACT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr2	44115910	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=223,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44115910_AG_CA:44115910:0,1,0,1
chr2	44115914	.	GC	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=223,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44115910_AG_CA:44115910:0,1,0,1
chr2	44116836	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,0:8,4:16,3,3,1
chr2	44117578	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,17:0.358:46:19,8:9,4:2,27,0,17
chr2	44117640	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=199,178;MMQ=46,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:10,3:4,0:0,15,0,3
chr2	44123672	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=189,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,0:2,3:6,0,3,0
chr2	44123759	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:4,5:5,7:7,2,9,4
chr2	44145097	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,2:6,3:10,2,4,1
chr2	44145374	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:11,0:7,5:11,7,4,1
chr2	44152180	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=96,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,3:4,3:6,2,5,1
chr2	44161854	.	G	GA	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.094:51:25,2:21,2:34,13,3,1
chr2	44172444	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,6:8,2:7,5,6,2
chr2	44173422	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,5:5,1:0,5,0,6
chr2	44186431	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	44206924	.	T	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.137:46:23,5:14,0:33,7,6,0
chr2	44445604	.	GT	G,GTT	.	.	DP=155;ECNT=1;MBQ=35,34,34;MFRL=146,141,132;MMQ=60,60,60;MPOS=13,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=19.50,9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:82,18,14:0.135,0.106:114:29,13,9:49,4,2:73,9,25,7
chr2	44471313	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=153,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,2:6,1:16,1,3,0
chr2	44471326	.	CAT	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:12,3:4,0:24,1,2,1
chr2	44502788	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:12,1:3,5:6,11,2,4
chr2	44512954	.	A	AATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	44531484	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:2,7,3,4
chr2	44547705	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:11,0:7,3:0|1:44547705_T_C:44547705:7,11,0,3
chr2	44547710	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:11,0:6,3:0|1:44547705_T_C:44547705:8,11,0,3
chr2	44548613	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,24:0.439:55:17,11:13,12:0,31,1,23
chr2	44556298	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=120,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,3:5,3:1,8,2,4
chr2	44565447	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=208,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:5,0,5,0
chr2	44566521	.	ACAT	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:2,2:7,0:1,8,0,2
chr2	44566599	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=224,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44566599_A_G:44566599:0,1,0,1
chr2	44566602	.	T	TTGGTAGTTTGTGTCTTTCTAGGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=224,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:44566599_A_G:44566599:0,1,0,1
chr2	44569474	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr2	44569700	.	AAAT	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=48.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.455:31:11,7:5,7:2,15,1,13
chr2	44569739	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.449:9:0,0:4,2:0,5,0,4
chr2	44931520	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,8:7,2:1,11,3,7
chr2	44942319	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	44942384	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=120,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:3,6:6,3:7,2,9,0
chr2	44993542	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:11,5,2,0
chr2	45647043	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr2	45773816	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=61,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,3:2,2:2,0,4,1
chr2	45780962	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	45826526	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,6:0,4:1,1,9,1
chr2	45879217	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=29,14;MFRL=145,145;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:0,0:0|1:45879217_G_C:45879217:4,3,2,0
chr2	45879224	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:4,0:0,1:3,4,3,0
chr2	45879226	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,13;MFRL=150,145;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,0:0,0:0|1:45879217_G_C:45879217:2,4,2,0
chr2	45879231	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=150,145;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:0,1:0|1:45879217_G_C:45879217:2,4,2,0
chr2	45879236	.	GA	CC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,13;MFRL=145,145;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:0,0:0|1:45879217_G_C:45879217:1,4,2,0
chr2	45879610	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	46583266	.	T	TGGGGGGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=13,20;MFRL=142,227;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=1,12;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0,2,1,0
chr2	46583268	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,0:0,0,1,2
chr2	46603671	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.362:23:7,3:7,5:7,8,7,1
chr2	46605138	.	G	GAACACATGGGTCTTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:1,16,0,2
chr2	46605954	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=147,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:2,6,0,5
chr2	46739157	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=243,99;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,3:2,4:2,0,5,2
chr2	46808243	.	GGA	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,139;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,27:0.491:55:11,11:15,16:7,21,10,17
chr2	46818992	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=115,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,7:4,2:7,5,8,1
chr2	46819815	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,0,10
chr2	46839477	.	T	C	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=268.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,81:0.988:81:0,40:0,38:0,0,20,61
chr2	46839487	.	GA	G,GAA	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=17,17,19;MFRL=163,164,146;MMQ=60,60,60;MPOS=29,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.40,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:45,6,4:0.101,0.085:55:5,0,1:7,1,0:3,42,1,9
chr2	46845849	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=89.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,28,0
chr2	46851183	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=191,207;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,5:1,0:1,0,3,2
chr2	46988727	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,127;MMQ=56,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,2:6,6:6,4,4,4
chr2	47045267	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,2:7,3:8,4,3,2
chr2	47045309	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=128,159;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:9,4:6,2:0|1:47045309_C_T:47045309:9,7,2,4
chr2	47045321	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.278:23:9,3:5,3:0|1:47045309_C_T:47045309:7,10,1,5
chr2	47081092	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,145;MMQ=51,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	47081231	.	AA	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=84,142;MMQ=53,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47081231_AA_GG:47081231:0,2,0,1
chr2	47081239	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=84,142;MMQ=53,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47081231_AA_GG:47081231:0,2,0,1
chr2	47081248	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=84,142;MMQ=53,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47081231_AA_GG:47081231:0,2,0,1
chr2	47082988	.	T	TGATGAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=148,298;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr2	47083044	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:8,0,3,0
chr2	47085398	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:0,3,0,8
chr2	47133131	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,0:10,2:3,10,2,0
chr2	47221693	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:0,4,1,6
chr2	47233048	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:6,1,7,0
chr2	47233749	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=256,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=34.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,2:1,8:0,1,9,1
chr2	47238631	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=206,239;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	47314048	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=180,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr2	47314052	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	47357458	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.375:33:8,6:11,6:1,20,4,8
chr2	47380203	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:3,10,0,5
chr2	47382214	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	47387989	.	CAAAA	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=24,20;RU=A;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.418:15:1,1:1,4:1,7,1,6
chr2	47388765	.	CA	GG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:3,6:5,2:0|1:47388765_CA_GG:47388765:9,0,8,0
chr2	47388766	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,17:0.943:17:0,10:0,7:1|0:47388765_CA_GG:47388765:0,0,17,0
chr2	47389343	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.241:13:5,0:4,2:10,0,3,0
chr2	47600581	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:7,1:1,1:6,2,2,0
chr2	47612206	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,2:3,1:8,1,3,0
chr2	47694037	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:0,5,0,5
chr2	47710084	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:21,3:18,0:15,24,0,3
chr2	48018314	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.844:10:1,7:0,2:1,0,1,8
chr2	48026480	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:0|1:48026480_A_G:48026480:5,2,0,2
chr2	48026483	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:5,1:0|1:48026480_A_G:48026480:5,2,0,2
chr2	48030458	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	48030838	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=70.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,4,17
chr2	48032874	.	ACTAT	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTAT;STR;TLOD=106.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.967:24:0,10:0,14:0,0,3,21
chr2	48032937	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr2	48033551	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=135.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,13:0,22:0,0,22,14
chr2	48040904	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=50.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,7:0,0,15,3
chr2	48046012	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.460:13:4,3:1,3:3,4,1,5
chr2	48573895	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=225,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr2	48586376	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=174,124;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr2	48688258	.	ATTT	A,ATT,ATTTT	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=31,30,31,31;MFRL=159,173,170,146;MMQ=60,60,60,60;MPOS=9,21,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,11,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.70,14.38,12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:36,4,10,11:0.071,0.172,0.178:61:21,2,3,5:12,2,6,4:35,1,24,1
chr2	48722755	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=128,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	48725610	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:6,4:7,13:9,6,12,5
chr2	48734555	.	T	TCCTG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:48734555_T_TCCTG:48734555:0,4,0,1
chr2	48734561	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:48734555_T_TCCTG:48734555:0,4,0,1
chr2	48734562	.	TAACCCC	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:48734555_T_TCCTG:48734555:0,4,0,1
chr2	48734572	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:48734555_T_TCCTG:48734555:0,3,0,1
chr2	48734575	.	AGTTAGGACACTGTCCTGTTTTC	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:48734555_T_TCCTG:48734555:0,4,0,1
chr2	48734576	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	48737113	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:16,2,0,2
chr2	48738388	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,14,0
chr2	48738687	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,0,12
chr2	48844968	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr2	48873512	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.515:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	48906625	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,1,16
chr2	48925746	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr2	48925986	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr2	48936006	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr2	48941072	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:3,3,4,1
chr2	48952701	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	49003566	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	49216284	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr2	49244559	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,3:8,1:7,3,3,1
chr2	49381585	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:6,0:1,2:5,3,0,2
chr2	50149358	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:13,2:7,2:5,15,2,2
chr2	50280338	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,0:2,6:5,0,6,0
chr2	50280583	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,0:8,4:9,8,2,2
chr2	50434759	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:5,1,2,0
chr2	50574038	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:0,2,0,6
chr2	50693504	.	AAC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,12,1
chr2	50693725	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:50693725_T_A:50693725:0,3,0,1
chr2	50693726	.	GCT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:50693725_T_A:50693725:0,3,0,1
chr2	50693752	.	T	TGAACGTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	50758309	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,6:0,0,12,2
chr2	50758657	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	50780219	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	50858107	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,7:0,16:0,0,24,0
chr2	53990532	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:9,0,4,0
chr2	54014303	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	54024626	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,1:9,1:9,4,2,0
chr2	54042132	.	CTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=21,11;RU=T;STR;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.848:10:0,2:0,7:0,1,0,9
chr2	54081735	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:4,1:10,1:8,7,1,1
chr2	54093956	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.416:44:12,9:12,9:11,15,7,11
chr2	54115813	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:3,0,5,1
chr2	54117385	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr2	54125185	.	G	GA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:10,0:13,3:1,23,0,3
chr2	54131093	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,2:4,8:8,0,10,0
chr2	54133638	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,2:5,2:7,0,4,0
chr2	54159999	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=215,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr2	54163140	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:12,0,2,0
chr2	54482553	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:6,1:6,4:8,4,3,3
chr2	54482703	.	GGGGCCC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGCCC;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.701:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	54483443	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=93.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,15:0,12:0,0,6,21
chr2	54494370	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=192.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,15:0,38:0,0,40,13
chr2	54587302	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:2,4:5,5:7,0,8,2
chr2	54839276	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.632:36:6,12:7,11:10,3,12,11
chr2	54844911	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr2	54855137	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	54893237	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:7,6:2,8:0,9,2,12
chr2	55077061	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	55122589	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=70685401,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,4:1,5:0,2,0,9
chr2	55138272	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,3:5,7:0,10,0,10
chr2	55155672	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,5,1
chr2	55155957	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,5:3,5:0,4,0,10
chr2	55176112	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,9:0,0,5,14
chr2	55181079	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:4,2,5,0
chr2	55181351	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=104,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,7:0,5:0,1,3,11
chr2	55181382	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr2	55186229	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr2	55200938	.	C	CAGTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGTT;STR;TLOD=52.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,7:4,6:5,3,6,8
chr2	55201038	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr2	55214618	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,11:0,0,16,5
chr2	55214912	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0|1:55214912_C_G:55214912:0,0,0,7
chr2	55214921	.	A	ACTGGTATTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:55214912_C_G:55214912:0,4,0,1
chr2	55214926	.	GT	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:55214912_C_G:55214912:0,4,0,1
chr2	55404925	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=210,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:1,3,2,3
chr2	55407935	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr2	55433576	.	G	GTTCAACCATTGTGGAAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=164,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	55436488	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.674:25:4,6:2,10:6,2,15,2
chr2	55436934	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,0:3,5:1,4,3,2
chr2	55439916	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=134,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:8,1:10,2:11,7,1,2
chr2	55439963	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,2,15
chr2	55449318	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,5:3,1:7,0,6,0
chr2	55460605	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:4,5:8,2:2,10,1,6
chr2	55461369	.	TA	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,4:0.068:70:35,2:28,2:16,50,0,4
chr2	55463694	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:4,0,6,0
chr2	55471382	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.325:38:8,7:18,5:2,24,2,10
chr2	55471407	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,0,23
chr2	55473386	.	CAT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:0,7:5,4:5,0,10,1
chr2	55473681	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	55489629	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=180,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:1,3,0,3
chr2	55490687	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=203,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	55518742	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,2:0,0,7,0
chr2	55523309	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	55527108	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	55528257	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr2	55544670	.	T	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,3:0.052:75:41,3:28,0:49,23,3,0
chr2	55566531	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	55566538	.	CTATT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	55576634	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,16,6
chr2	55582684	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr2	55589364	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,22,0
chr2	55589434	.	T	A	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=173.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,24:0,26:0,0,29,22
chr2	55591017	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,255;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,0:0,4:3,1,4,0
chr2	55646286	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:0,9,0,2
chr2	55747471	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=117,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr2	55751005	.	CC	AA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,122;MMQ=60,55;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,0:9,3:0,16,0,3
chr2	55760940	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,15,3
chr2	55764754	.	AATATGAATAC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.371:25:4,2:9,7:2,14,0,9
chr2	55765882	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=151,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.228:29:9,2:9,1:19,3,4,3
chr2	55765906	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.122:47:11,1:20,1:15,25,7,0
chr2	55771050	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,32:0.484:66:22,14:12,17:26,8,27,5
chr2	55795557	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:3,3:1,4:0,4,1,7
chr2	55813754	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,44689518;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:15,0:18,2:26,9,2,0
chr2	55844433	.	T	TTGA	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=158,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:9,0:15,2:2,29,1,1
chr2	55844445	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:9,2:9,6:1,17,0,8
chr2	55863360	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr2	55867845	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,5:1,4:0,4,1,8
chr2	55873301	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,6:3,3:9,0,7,2
chr2	55883509	.	T	TA	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.187:33:12,2:13,4:1,26,0,6
chr2	55887176	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:2,8:5,6:7,0,14,0
chr2	55889062	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=200.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,36:0,23:0,0,44,15
chr2	55894247	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:2,5,1,3
chr2	55899228	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=112.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,11:0,22:0,0,4,29
chr2	55900231	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=16,18;MFRL=209,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:0,0:0,0:0,3,0,2
chr2	55914942	.	CAACCCACCCACT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=164,252;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	56102260	.	G	GAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=201,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AT;STR;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:4,1:4,2:0,8,0,4
chr2	56149475	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:6,1,5,3
chr2	56216052	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,5,3
chr2	56599673	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=154,76;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr2	56603118	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,5:3,5:1,7,2,8
chr2	58381785	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:4,9:3,4:7,0,13,0
chr2	58392789	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,7:2,0:3,0,7,0
chr2	58392797	.	TTTA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,7:2,0:3,0,7,0
chr2	58453843	.	GA	G,GAA,GAAA	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=33,33,34,33;MFRL=151,159,148,117;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,22,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,11,13,14;RU=A;STR;TLOD=8.00,34.35,6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:30,8,18,6:0.112,0.301,0.103:62:13,2,9,5:15,6,8,0:27,3,28,4
chr2	59482217	.	T	TGACTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=146,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GACTC;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	60768978	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=244.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,33:0,35:0,0,59,10
chr2	60773035	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=236,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:2,0,3,1
chr2	60997770	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	61007782	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:6,6:7,5:11,2,9,2
chr2	61009909	.	C	T	.	.	DP=149;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=138,110;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=200.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,73:0.521:142:26,32:32,40:21,48,25,48
chr2	61009938	.	AT	A,ATT	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=30,31,16;MFRL=147,168,90;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=9.81,3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:39,9,7:0.157,0.110:55:12,4,1:11,4,2:3,36,3,13
chr2	61010463	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	61020926	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:13,2:16,1:3,26,0,3
chr2	61021349	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:6,7:5,4:1,11,0,11
chr2	61118739	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:5,5:6,2:12,0,7,0
chr2	61121492	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=128.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,22:0,14:0,0,31,5
chr2	61128268	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:6,6:3,2:2,9,1,8
chr2	61128285	.	CTTTT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=17,21;MFRL=160,133;MMQ=55,42;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=23,19;RU=T;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:0,0:1,1:0,6,0,2
chr2	61145498	.	AT	A,ATT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,31,29;MFRL=175,167,219;MMQ=60,60,60;MPOS=27,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.67,7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,5,5:0.172,0.192:28:12,2,3:5,2,1:6,12,2,8
chr2	61147617	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:15,3:17,1:31,1,4,0
chr2	61182228	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=169,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,1:2,7,0,2
chr2	61187509	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,16;MFRL=202,0;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:3,1,1,0
chr2	61235855	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,6:3,2:5,1,5,3
chr2	61258832	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=127,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.495:16:3,6:5,1:5,3,5,3
chr2	61300556	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:14,3:8,1:23,1,3,1
chr2	61304002	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr2	61304377	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,2:3,0:0,6,0,2
chr2	61308517	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,24,0
chr2	61308569	.	ATT	A	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.150:36:15,4:12,1:28,3,4,1
chr2	61315638	.	GTA	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.142:39:17,0:17,5:3,31,0,5
chr2	61385100	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,23:0.923:24:1,13:0,7:0|1:61385100_G_A:61385100:0,1,3,20
chr2	61385105	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,20:0.913:21:1,11:0,7:0|1:61385100_G_A:61385100:0,1,3,17
chr2	61389799	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr2	61389811	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=176,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:61389811_T_A:61389811:1,3,0,1
chr2	61389812	.	G	GAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=176,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:61389811_T_A:61389811:1,3,0,1
chr2	61412559	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,7:0,0,12,0
chr2	61413723	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.880:23:1,9:1,11:1,1,7,14
chr2	61415073	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=145,124;MMQ=52,22;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:22,0:18,3:0|1:61415073_A_C:61415073:13,28,0,3
chr2	61415076	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=147,124;MMQ=52,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.083:46:24,0:16,3:0|1:61415073_A_C:61415073:14,29,0,3
chr2	61417617	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=148.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,21:0,19:0,0,34,7
chr2	61449881	.	GGATGC	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.109:34:19,3:12,0:0,31,0,3
chr2	61454318	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=117,141;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,8:0.113:56:23,1:21,6:0|1:61454318_T_C:61454318:17,31,2,6
chr2	61454321	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=117,141;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,8:0.111:57:25,0:21,5:0|1:61454318_T_C:61454318:18,31,2,6
chr2	61456592	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=119,166;MMQ=48,50;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	61462928	.	GA	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.110:52:11,3:31,1:40,7,4,1
chr2	61522123	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=220.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.986:66:0,33:0,33:0,0,40,26
chr2	61538602	.	G	GAAAAGAGAAAGAAAAAGAAAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,1:0,3:0,0,8,2
chr2	61552411	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:3,2:8,1,3,0
chr2	61566823	.	AG	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,15;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:7,0:7,0:0|1:61566823_AG_A:61566823:6,16,0,5
chr2	61566825	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:10,0:11,0:0|1:61566823_AG_A:61566823:6,16,0,5
chr2	61576517	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	61577667	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:7,1:4,2:11,1,2,1
chr2	61610566	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=165,180;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:17,0:12,2:0|1:61610566_A_G:61610566:0,33,0,2
chr2	61610571	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=166,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:18,0:9,3:0|1:61610566_A_G:61610566:0,28,0,3
chr2	61610577	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=170,180;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:20,0:11,2:0|1:61610566_A_G:61610566:0,31,0,2
chr2	61622251	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=236.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,34:0,34:0,0,62,6
chr2	61622374	.	TA	T,TAA	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=131,147,152;MMQ=60,60,60;MPOS=19,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=12.49,10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:49,11,10:0.149,0.139:70:20,3,5:25,8,4:7,42,5,16
chr2	61709477	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:6,2:12,0:17,6,2,0
chr2	61709747	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,4:1,0:0,1,0,5
chr2	61713154	.	AAAC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,0:1,4:0,4,0,4
chr2	61715958	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=169,152;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:4,2:0,16,0,2
chr2	61715975	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=195,152;MMQ=60,35;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0,12,0,2
chr2	61715993	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=214,173;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:5,1:2,1:0|1:61715993_C_T:61715993:0,7,0,2
chr2	61715996	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=214,173;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,1:0|1:61715993_C_T:61715993:0,7,0,2
chr2	61722519	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=107,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.734:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr2	61726050	.	TA	T,TAA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,31,30;MFRL=150,155,181;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.44,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,6,6:0.132,0.158:37:15,2,2:9,4,4:7,18,3,9
chr2	61729258	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=40,32;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=112.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,27:0.903:29:2,11:0,15:0|1:61729258_A_G:61729258:0,2,6,21
chr2	61729268	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=108.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,7:0,17:0|1:61729258_A_G:61729258:0,0,8,17
chr2	61749690	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,17,1
chr2	61749716	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=116.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,18:0,0,24,11
chr2	62053727	.	C	CCTTTTTTTTT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:8,0:12,2:0|1:62053727_C_CCTTTTTTTTT:62053727:2,18,0,2
chr2	62053728	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:8,0:12,2:0|1:62053727_C_CCTTTTTTTTT:62053727:2,18,0,2
chr2	62063093	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=29,28,29,30;MFRL=139,153,156,132;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,20,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,15,16,18;RU=A;STR;TLOD=9.67,49.24,5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:15,10,29,7:0.148,0.478,0.117:61:11,4,20,3:2,6,9,2:11,4,40,6
chr2	62063341	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,7:0,0,0,17
chr2	62065615	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:2,1:10,2:9,3,3,0
chr2	62066927	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr2	62081217	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr2	62104660	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,242;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:5,0:4,3:1,14,1,2
chr2	62107376	.	T	TC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=73.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,12:0,0,19,1
chr2	62110551	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=129,129;MMQ=40,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.727:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr2	62112221	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=27766226,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,5:0,1:0,1,1,7
chr2	62112222	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,2:0,0,1,9
chr2	62449597	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=150,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,0:12,3:11,16,3,0
chr2	62729747	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=208,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,1:2,4:5,2,3,2
chr2	63182611	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.522:25:3,8:7,5:12,0,12,1
chr2	63182633	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=168,84;MMQ=60,38;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:12,0:9,1:0|1:63182633_C_A:63182633:33,4,2,0
chr2	63182635	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=33,16;MFRL=167,84;MMQ=60,38;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:18,0:17,0:0|1:63182633_C_A:63182633:36,4,2,0
chr2	63182644	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=168,84;MMQ=60,38;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:14,0:14,1:0|1:63182633_C_A:63182633:36,5,2,0
chr2	63281340	.	ACT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=158,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:63281340_ACT_A:63281340:0,1,0,1
chr2	63281345	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=158,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:63281340_ACT_A:63281340:0,1,0,1
chr2	63281348	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=158,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:63281340_ACT_A:63281340:0,1,0,1
chr2	63380809	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	63401973	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:7,12:3,6:2,8,3,15
chr2	63486429	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=56,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.686:10:2,3:0,4:2,1,4,3
chr2	63540523	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:3,3:3,3:0,7,0,6
chr2	63609017	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,6:4,4:8,3,9,2
chr2	63609323	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:63609323_G_T:63609323:0,1,0,1
chr2	63609326	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:63609323_G_T:63609323:0,1,0,1
chr2	63665145	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,0:7,3:0,11,0,3
chr2	64085114	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,5:3,4:0,7,1,8
chr2	64113719	.	T	TGCCAATCAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	64139798	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=138,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,5:0.058:88:32,2:48,2:27,56,1,4
chr2	64139834	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.459:48:8,9:18,13:4,22,1,21
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chr2	64202251	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=171,148;MMQ=60,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:1,0:0,8,0,2
chr2	64331815	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.506:6:1,2:1,1:2,1,3,0
chr2	64682637	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,4:8,0:11,7,0,4
chr2	64683338	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=144,123;MMQ=60,21;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,3:6,0:0|1:64683338_G_A:64683338:9,2,3,0
chr2	64683344	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=133,123;MMQ=60,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.219:16:6,3:7,0:0|1:64683338_G_A:64683338:11,2,3,0
chr2	64796847	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.340:18:7,5:5,0:0,12,2,4
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chr2	65217391	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:8,4:3,5:0,11,0,9
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chr2	65298646	.	GAAC	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAC;STR;TLOD=57.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.568:28:7,5:5,11:5,7,10,6
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chr2	65481008	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:8,4:8,5:1,15,0,9
chr2	65488538	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.497:30:3,8:12,6:4,11,2,13
chr2	65495887	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,154;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.515:37:6,13:11,6:7,11,2,17
chr2	65559027	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	65561269	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:6,1,2,0
chr2	65604914	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	65659048	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=113,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr2	65659050	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,1:0,0,3,0
chr2	66662875	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=24,23;RU=T;STR;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.905:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	66665146	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	66667186	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,202;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.792:3:0,1:0,0:0,0,0,3
chr2	66739337	.	G	C	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,6:0.081:83:35,4:42,2:42,35,4,2
chr2	66798282	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	67637196	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=104.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,6,25
chr2	67637256	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=175,136;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:12,0:5,3:0,17,0,3
chr2	68269960	.	CGGGGGGG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=160,217;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=19,12;RU=G;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.285:5:3,1:1,0:0|1:68269960_CGGGGGGG_C:68269960:4,0,1,0
chr2	68269974	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.519:2:1,1:0,0:0|1:68269960_CGGGGGGG_C:68269960:1,0,1,0
chr2	68274510	.	CA	C,CAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,34,34;MFRL=198,237,203;MMQ=60,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.42,6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,3,5:0.152,0.243:21:3,2,3:10,1,2:0,13,1,7
chr2	68415563	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.270:12:1,2:6,1:9,0,2,1
chr2	68444143	.	TAC	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.225:38:12,7:16,1:30,0,8,0
chr2	68479204	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,0:12,2:16,7,2,0
chr2	68511527	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:4,0:6,1,2,0
chr2	68546304	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	68592584	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.492:23:3,5:6,5:2,10,3,8
chr2	68615438	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr2	68620463	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,5:7,2:0,10,0,7
chr2	68772281	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=187,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:3,3:1,4:5,0,5,2
chr2	69009304	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:2,1,4,0
chr2	69043539	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr2	69045158	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,12:0,0,4,15
chr2	69201894	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=42.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,7:0,0,2,12
chr2	69298817	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=51.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.442:41:14,7:9,11:15,8,15,3
chr2	69317925	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,2,2
chr2	69318129	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	69330118	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=71,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:1,2,0,5
chr2	69351621	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,1:6,1:7,0,2,0
chr2	69409029	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=108.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,10,22
chr2	69420546	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:14,0:8,4:7,15,2,2
chr2	69420591	.	T	TCA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=166,170;MMQ=50,51;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CA;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,1:0,2,0,4
chr2	69420596	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr2	69646584	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:8,0:22,2:28,2,1,1
chr2	69703181	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:69703181_C_A:69703181:0,3,0,1
chr2	69703184	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=182,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:69703181_C_A:69703181:0,3,0,1
chr2	69703188	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=215,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:69703181_C_A:69703181:0,2,0,1
chr2	69703194	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=260,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:69703181_C_A:69703181:0,1,0,2
chr2	69703196	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=215,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:69703181_C_A:69703181:0,2,0,1
chr2	69741753	.	CTGT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=71,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGT;STR;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.815:14:2,6:0,4:1,1,9,3
chr2	69771484	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	70031797	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:4,3:6,1:1,10,1,3
chr2	70033711	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr2	70066571	.	CT	C	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,6:0.101:62:22,4:27,2:44,12,5,1
chr2	70068258	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr2	70076954	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:6,4:12,3:0,18,0,7
chr2	70096862	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,6:3,0:3,2,5,1
chr2	70098808	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr2	70121197	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,17:0.282:62:21,8:22,9:15,30,3,14
chr2	70131320	.	G	GT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=186,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.421:22:7,6:5,3:12,1,8,1
chr2	70162638	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,1:7,1:1,18,0,2
chr2	70164034	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=256,302;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	70164551	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=148,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:70164551_TG_T:70164551:0,4,0,1
chr2	70164553	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=148,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:70164551_TG_T:70164551:0,4,0,1
chr2	70164556	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=148,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:70164551_TG_T:70164551:0,4,0,1
chr2	70164580	.	C	CAGGG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGGG;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.690:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	70188384	.	GCCTCTCCTCT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=163,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:70188384_GCCTCTCCTCT_G:70188384:2,3,1,1
chr2	70188398	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=165,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:70188384_GCCTCTCCTCT_G:70188384:2,4,1,1
chr2	70189331	.	GACAC	G,GAC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=17,32,35;MFRL=178,146,206;MMQ=40,60,60;MPOS=12,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=AC;STR;TLOD=9.64,4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.476,0.323:7:0,1,1:0,2,1:0,1,2,4
chr2	70316366	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	70377758	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70377758_C_T:70377758:0,0,0,1
chr2	70377760	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70377758_C_T:70377758:0,0,0,1
chr2	70377763	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70377758_C_T:70377758:0,0,0,1
chr2	70377765	.	AG	TT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:70377758_C_T:70377758:0,0,0,1
chr2	70486407	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:2,5:4,1:6,0,7,0
chr2	70486475	.	G	GT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.464:35:9,13:10,3:15,4,10,6
chr2	70502811	.	T	TTCTG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,2:4,6:0,10,0,8
chr2	70520846	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,4:4,2:1,10,0,6
chr2	70520875	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:0,10,0,4
chr2	70529242	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=209,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:0,5,0,4
chr2	70890787	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:14,1:11,1:7,19,1,1
chr2	70901785	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:9,4:3,1:0|1:70901785_A_G:70901785:9,4,3,2
chr2	70901788	.	GGT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:9,4:3,1:0|1:70901785_A_G:70901785:9,4,3,2
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chr2	71058811	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,1:6,4:7,3,2,3
chr2	71058835	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.863:20:0,8:2,9:0,2,13,5
chr2	71060733	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	71062833	.	G	GC	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=133.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,16:0,21:0,0,19,19
chr2	71148227	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.190:40:19,1:14,6:20,13,3,4
chr2	71160421	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,1:4,2:1,5,0,3
chr2	71162996	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	71163225	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.298:25:5,3:10,4:1,17,1,6
chr2	71170830	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=122,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:3,0,1,1
chr2	71185391	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr2	71185577	.	G	GTGTAGTGTGCTGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,72;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	71190102	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=219,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	71190384	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=115,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:2,5,0,2
chr2	71191777	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=230,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	71205976	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:8,10:7,3:0,15,0,13
chr2	71209852	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71209852_G_GT:71209852:0,0,0,1
chr2	71209853	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71209852_G_GT:71209852:0,0,0,1
chr2	71209856	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71209852_G_GT:71209852:0,0,0,1
chr2	71217048	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=225,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:71217048_T_C:71217048:0,1,0,1
chr2	71217055	.	GA	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71217048_T_C:71217048:0,0,0,1
chr2	71217059	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71217048_T_C:71217048:0,0,0,1
chr2	71219049	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=148,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,1:11,1:6,11,0,2
chr2	71221962	.	ACCG	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCG;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:19,0:9,2:0,29,0,2
chr2	71304821	.	G	GTAACTCATGAAGAGCTGGCTGTGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr2	71305359	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:0,1:3,3:3,0,4,1
chr2	71357417	.	C	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.379:41:6,8:14,7:6,20,6,9
chr2	71360723	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=152,174;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=110.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,31:0.552:56:11,17:14,14:0|1:71360723_A_G:71360723:0,25,0,31
chr2	71360735	.	T	TTCC	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,176;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCC;STR;TLOD=94.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,25:0.578:43:6,11:12,10:0|1:71360723_A_G:71360723:0,18,0,25
chr2	71368512	.	G	GAAACA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,1:17,0:0|1:71368512_G_GAAACA:71368512:1,27,0,2
chr2	71368514	.	A	AAAGTGCAGGTAG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,1:16,0:0|1:71368512_G_GAAACA:71368512:1,27,0,2
chr2	71415515	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=13,13;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.337:4:0,0:1,0:0|1:71415515_T_C:71415515:2,1,1,0
chr2	71415517	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=10,9;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:1,0:0|1:71415515_T_C:71415515:2,1,1,0
chr2	71415521	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:71415515_T_C:71415515:3,1,1,0
chr2	71415526	.	AT	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=21,34;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:71415515_T_C:71415515:2,0,1,0
chr2	71415533	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,0;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:71415515_T_C:71415515:2,1,1,0
chr2	71417065	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=97,144;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:0,2:7,2:3,4,1,4
chr2	71417087	.	TC	AA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=125,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:5,0:6,2:4,7,1,1
chr2	71417134	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=125,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:2,7:7,6:4,5,6,7
chr2	71429793	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:0,5,0,6
chr2	71607539	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.621:27:5,7:5,10:8,2,9,8
chr2	71620818	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=188,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:2,3:0,1:0,3,0,4
chr2	71627539	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=117.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,39:0.628:62:11,22:11,17:23,0,36,3
chr2	71631014	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=127,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:33,2:26,1:37,24,2,1
chr2	71633389	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.513:29:11,3:3,11:3,11,4,11
chr2	71633417	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:10,5:4,9:0,14,0,14
chr2	71635931	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.364:42:15,9:12,6:13,14,4,11
chr2	71645828	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=166,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,5:8,3:4,9,1,7
chr2	71645890	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=176,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr2	71651939	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:2,5:8,6:0,11,0,11
chr2	71658627	.	AG	CA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=168,170;MMQ=60,32;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:16,1:8,1:0,24,0,2
chr2	71661855	.	C	CA	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=86.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,34:0.433:79:26,12:18,22:35,10,26,8
chr2	71747235	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,4:6,4:9,5,7,1
chr2	71747432	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	71747851	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr2	71747899	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=137,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr2	71762310	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,1:1,4:1,5,4,1
chr2	71791169	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=17,12;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.391:11:2,0:1,0:5,2,4,0
chr2	71791172	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=22,13;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.317:14:3,1:1,0:8,2,4,0
chr2	71791175	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.368:14:4,2:2,0:7,2,5,0
chr2	71791181	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,10;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:10,0:5,0:13,2,3,0
chr2	71796865	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	71829821	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr2	71847843	.	G	GATGATGATTGAGGAGAGAGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71847843_G_GATGATGATTGAGGAGAGAGA:71847843:0,0,0,1
chr2	71847847	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=222,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:71847843_G_GATGATGATTGAGGAGAGAGA:71847843:0,1,0,1
chr2	71871039	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr2	71871236	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=87.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,5,22
chr2	71891361	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr2	71896950	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:71896950_C_T:71896950:0,4,0,1
chr2	71896952	.	T	TACTAAAAACACAAAATTAGCTGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:71896950_C_T:71896950:0,4,0,1
chr2	71896955	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:71896950_C_T:71896950:0,3,0,1
chr2	71901286	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,13,2
chr2	71906171	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr2	71909822	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.658:15:2,6:2,4:0,5,3,7
chr2	71913637	.	T	TTGAACATTGGACTCCAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:2,4,1,1
chr2	72692272	.	A	AAG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=96.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,16:0,8:0,0,20,4
chr2	72727071	.	C	G	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,8:0.096:91:36,6:46,2:35,48,4,4
chr2	72741728	.	TAA	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=157,173;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.389:17:5,1:6,5:11,0,6,0
chr2	72741734	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,29:0.871:34:2,13:3,16:5,0,27,2
chr2	72742083	.	GACACAC	G,GACAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,29,34;MFRL=148,210,192;MMQ=60,60,60;MPOS=14,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,12;RU=AC;STR;TLOD=6.50,18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,6:0.230,0.554:10:0,0,3:1,2,3:2,0,8,0
chr2	72742258	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,0:5,2:2,11,0,2
chr2	72742355	.	A	AATTAATAGCCTACCAACCAATAAAAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	72958022	.	T	TAAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	73114673	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	73118625	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,1:10,1:6,14,0,2
chr2	73195491	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=21,25;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.360:6:1,0:1,1:0|1:73195491_CAT_C:73195491:4,0,2,0
chr2	73195497	.	T	TAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,21;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:2,0:1,2:0|1:73195491_CAT_C:73195491:3,0,2,0
chr2	73195502	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,11;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:1,0:1,0:0|1:73195491_CAT_C:73195491:3,0,2,0
chr2	73195508	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=105,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:73195491_CAT_C:73195491:0,2,1,0
chr2	73228800	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=79,142;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,0:5,3:0|1:73228800_G_T:73228800:0,6,0,3
chr2	73228805	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=79,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,0:4,3:0|1:73228800_G_T:73228800:0,6,0,3
chr2	73339430	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr2	73435786	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=177,72;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr2	73447736	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=200,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:1,3:2,1:3,1,4,0
chr2	73447775	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,6:6,4:7,3,8,2
chr2	73448357	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,59;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:7,0:10,5,3,0
chr2	73450139	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.515:31:11,9:4,7:10,5,12,4
chr2	73455747	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,1:1,7:1,2,1,7
chr2	73460293	.	AGGGCC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGCC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	73461483	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:5,6:5,7:4,7,3,10
chr2	73467676	.	GAA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.455:31:9,10:7,4:8,9,4,10
chr2	73471653	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=120,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.669:19:4,5:2,8:5,1,12,1
chr2	73477351	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.648:9:1,2:1,3:1,2,6,0
chr2	73490392	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=174,92;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:2,2:1,3:3,0,1,4
chr2	73490412	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=132,68;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:1,2:0,3,1,2
chr2	73491618	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=146,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:1,10,0,2
chr2	73491683	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr2	73493624	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,1:9,1:4,13,0,2
chr2	73613031	.	TGGAGGA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=GGA;STR;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.881:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	73613341	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr2	73649928	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr2	73679487	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,1:13,1:17,3,2,0
chr2	73717769	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.557:25:5,9:6,5:3,8,6,8
chr2	73761881	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,17,1
chr2	73777400	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.459:35:9,4:10,12:9,10,10,6
chr2	73786304	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,4:0.081:59:22,2:32,2:0|1:73786304_C_G:73786304:19,36,2,2
chr2	73786305	.	T	TG	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,4:0.081:59:22,2:32,2:0|1:73786304_C_G:73786304:19,36,2,2
chr2	73786306	.	T	TGTGTGTGTC	.	.	DP=59;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,4:0.082:59:22,2:33,2:0|1:73786304_C_G:73786304:19,36,2,2
chr2	73868689	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:8,1:4,14,0,2
chr2	73957227	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:0,3,0,5
chr2	73994074	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr2	74087290	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,5:4,8:3,6,2,11
chr2	74089266	.	GA	G,GAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=134,146,120;MMQ=60,60,60;MPOS=25,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=10.16,5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,6,5:0.271,0.206:23:7,2,0:2,3,3:9,3,9,2
chr2	74128361	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:74128361_T_G:74128361:0,0,3,0
chr2	74128369	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0|1:74128361_T_G:74128361:0,0,3,0
chr2	74128391	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	74128433	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,9,1
chr2	74128678	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	74129474	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=84.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,11:0,0,19,4
chr2	74129664	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,6,9
chr2	74129712	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=70.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,7:0,0,16,4
chr2	74129895	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr2	74135380	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr2	74135732	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr2	74135797	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,5:0,0,11,7
chr2	74140581	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,12,1
chr2	74140789	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,2,15
chr2	74273383	.	T	TC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.574:17:3,3:4,7:5,2,8,2
chr2	74327453	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	74328500	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.194:18:4,0:9,0:0|1:74328500_A_C:74328500:8,7,3,0
chr2	74328504	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.205:17:6,0:8,0:0|1:74328500_A_C:74328500:7,7,3,0
chr2	74450155	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=177,217;MMQ=60,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:74450155_A_G:74450155:0,4,0,1
chr2	74450160	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=177,217;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:74450155_A_G:74450155:0,4,0,1
chr2	74450162	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=177,217;MMQ=60,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:74450155_A_G:74450155:0,4,0,1
chr2	74450168	.	ACT	GTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=188,217;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:74450155_A_G:74450155:0,4,0,1
chr2	74481884	.	G	GGCTACCAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=127,239;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr2	74481904	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,28;MFRL=246,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74481904_G_A:74481904:0,1,0,1
chr2	74481905	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=246,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74481904_G_A:74481904:0,1,0,1
chr2	74481907	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=246,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:74481904_G_A:74481904:0,1,0,1
chr2	74482892	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,5:5,4:6,1,7,2
chr2	74589931	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	74596708	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74596708_T_C:74596708:0,0,0,1
chr2	74596712	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74596708_T_C:74596708:0,0,0,1
chr2	74596718	.	C	CGGCTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,263;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:74596708_T_C:74596708:0,0,0,1
chr2	74597503	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:5,5,2,0
chr2	74601371	.	G	GCCCCCCCCCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,15;RU=C;STR;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,2:0|1:74601371_G_GCCCCCCCCCC:74601371:1,0,4,0
chr2	74601377	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.829:4:0,1:0,2:0|1:74601371_G_GCCCCCCCCCC:74601371:0,0,4,0
chr2	74601383	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:1,1:1,1:0|1:74601371_G_GCCCCCCCCCC:74601371:2,0,3,0
chr2	74604936	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.279:5:2,0:1,1:0|1:74604936_GC_G:74604936:0,4,0,1
chr2	74604939	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:74604936_GC_G:74604936:0,4,0,1
chr2	74604947	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:74604936_GC_G:74604936:0,4,0,1
chr2	74649920	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=166,149;MMQ=60,51;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.747:6:0,2:1,1:0|1:74649920_C_CA:74649920:0,1,3,2
chr2	74649921	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=166,149;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.747:6:0,3:1,2:0|1:74649920_C_CA:74649920:0,1,3,2
chr2	74683299	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,123;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.073:52:28,3:21,0:30,19,3,0
chr2	74686505	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:24,1:5,5:19,10,4,2
chr2	74687393	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=158,173;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.195:25:13,0:5,0:2,18,5,0
chr2	74720002	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,6,2
chr2	74747111	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,5:5,9:6,2,9,5
chr2	74752954	.	T	TAGTCAGGAACCTATGGAAAACAGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.485:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	74884611	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=151,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,2:6,2:6,1,4,0
chr2	74900495	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr2	74903065	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	75061873	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	75081606	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	75099381	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.295:21:10,1:5,4:13,2,6,0
chr2	75105798	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=212.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,30:0,30:0,0,44,17
chr2	75107367	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:4,1:4,1:7,1,4,0
chr2	75108744	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,5:2,4:2,0,9,0
chr2	75113572	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,12,10
chr2	75113657	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.653:32:7,13:3,8:7,4,14,7
chr2	75116627	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=255.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,79:0.988:79:0,38:0,38:0,0,31,48
chr2	75196679	.	C	CTCTCTGTGATGATTTAATCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=304,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	75425623	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr2	75881828	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=191,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:2,4:0,2:2,1,5,1
chr2	75882181	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.189:24:5,0:11,0:9,10,5,0
chr2	75919272	.	AATATAT	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=185,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=AT;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:1,0:0,1:0|1:75919272_AATATAT_A:75919272:0,2,0,1
chr2	75919294	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:75919272_AATATAT_A:75919272:0,3,0,1
chr2	75919296	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=166,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:75919272_AATATAT_A:75919272:0,3,0,1
chr2	75928300	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,6:3,4:7,1,8,2
chr2	75933830	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr2	75937888	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=143,69;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,3:5,0:2,4,2,1
chr2	79255426	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,5:3,3:2,2,0,8
chr2	79314081	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr2	79314094	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:0,3:3,2:0,3,0,6
chr2	79350448	.	C	CCGCATACCAACCTAACTCACTTGTCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	79385941	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=106,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:1,3,0,1
chr2	79385944	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:79385944_G_GA:79385944:0,2,0,1
chr2	79385945	.	G	A,GTC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,28,29;MFRL=77,134,185;MMQ=60,60,60;MPOS=5,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,1,0:0,0,1:0,1,0,2
chr2	79385947	.	G	GTCACGAAAGTCA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=160,77;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	79385949	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:79385944_G_GA:79385944:0,2,0,1
chr2	79878664	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=135,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,1:8,4:12,1,4,1
chr2	79971536	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=138,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.183:23:8,2:11,0:12,7,4,0
chr2	80809027	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	80816472	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,140;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:25,0:27,3:38,14,0,3
chr2	80831404	.	G	GAGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	80846147	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	84650856	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=114,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.441:9:1,4:4,0:0,5,0,4
chr2	84676163	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=130.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,20:0,17:0,0,4,33
chr2	84676886	.	TAAAAA	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=25,20;RU=A;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.670:15:1,6:2,3:1,4,2,8
chr2	84744877	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,3:9,0:13,2,3,0
chr2	84755996	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr2	84756049	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,12,2
chr2	84756341	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	84806553	.	GCC	AAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	84822715	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr2	84831767	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	84834063	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=80.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,20,4
chr2	84834237	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,10:0,0,0,14
chr2	84838891	.	A	C	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,4:0.055:89:42,0:43,4:45,40,0,4
chr2	84885398	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	84896628	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=118,149;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:1,9,0,5
chr2	84897361	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr2	84899360	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	84908554	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,1:14,1:14,7,0,2
chr2	84912420	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,2:6,1:15,0,3,0
chr2	84937518	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=125,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.168:39:19,6:14,0:12,21,3,3
chr2	84955116	.	A	AAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=181,170;MMQ=59,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	85066465	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=147,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.217:12:3,1:4,1:0,10,0,2
chr2	85108252	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr2	85255107	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:14,0:17,2:15,17,0,2
chr2	85273495	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=223,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:85273495_T_G:85273495:0,1,0,1
chr2	85273497	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=223,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:85273495_T_G:85273495:0,1,0,1
chr2	85273500	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85273495_T_G:85273495:0,0,0,1
chr2	85361101	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:7,7:3,2:6,4,4,5
chr2	85510777	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	85534950	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=192,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:1,6,0,7
chr2	85550192	.	C	CCG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=187,158;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:10,3:6,0:0|1:85550192_C_CCG:85550192:0,17,0,3
chr2	85550193	.	GAA	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=187,158;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:10,2:7,0:0|1:85550192_C_CCG:85550192:0,17,0,3
chr2	85552186	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=184,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr2	85554885	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=219,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:4,5:1,3:5,0,8,0
chr2	85570942	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=124,145;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:1,4:5,7:2,5,2,9
chr2	85571710	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,14,0
chr2	85573033	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	85576769	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.617:8:0,2:2,3:0,3,0,5
chr2	85617058	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,0:0,2:0,1,0,4
chr2	85618138	.	TCAGTGGAGC	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.540:11:1,2:2,4:0|1:85618138_TCAGTGGAGC_T:85618138:1,4,1,5
chr2	85618171	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:2,2:2,4:0|1:85618138_TCAGTGGAGC_T:85618138:0,4,1,6
chr2	85626454	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=252,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,1,2
chr2	85626469	.	A	AGTACCAGCATG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=252,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:85626469_A_AGTACCAGCATG:85626469:0,2,0,1
chr2	85626473	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=252,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:85626469_A_AGTACCAGCATG:85626469:0,2,0,1
chr2	85628492	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=190,213;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0,5,3,0
chr2	85628556	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	85661740	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,21;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	85662017	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:9,3:12,7:20,1,9,1
chr2	85662650	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:3,1,2,2
chr2	85769246	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr2	85778263	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=178,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	85779965	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=197,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:5,0,5,0
chr2	85783205	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=195,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,6,1
chr2	85788175	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	85806068	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,2:1,4:6,0,6,0
chr2	85806332	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=227,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,4:1,3:1,2,2,5
chr2	85807081	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=194,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.716:19:2,8:3,5:0,5,0,14
chr2	85807083	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.481:21:5,6:6,4:0,11,0,10
chr2	85808871	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:3,3:3,5:1,5,4,5
chr2	85818787	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,7:3,5:7,0,12,0
chr2	85824078	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:8,4:7,5:0|1:85824078_C_T:85824078:6,10,2,7
chr2	85824084	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:8,5:6,5:0|1:85824078_C_T:85824078:6,9,2,8
chr2	85826132	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr2	85826894	.	TCTC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.430:19:4,3:7,4:4,7,3,5
chr2	85828641	.	C	CCAAGCCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=135,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	85828648	.	C	CTGTGCACCTAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	85829102	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=22,13;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.140:31:6,0:9,1:4,23,0,4
chr2	85848747	.	CTT	C,CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20,33;MFRL=127,178,153;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=5.60,7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.370,0.490:8:0,2,2:1,1,2:0,1,0,7
chr2	85850755	.	A	AT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:23,0:12,3:30,6,0,3
chr2	85863344	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=131,124;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:85863344_T_G:85863344:0,1,0,1
chr2	85863350	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=131,124;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:85863344_T_G:85863344:0,1,0,1
chr2	85863365	.	TG	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	85866539	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr2	85866577	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=220,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.505:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	85890753	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,1:8,3:8,3,4,0
chr2	85890771	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=66.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,5:0,13:0,0,15,4
chr2	85893902	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:85893902_T_C:85893902:0,1,0,1
chr2	85893906	.	GTCTA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:85893902_T_C:85893902:0,2,0,1
chr2	85895263	.	GGCA	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCA;STR;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:17,2:24,2:18,24,1,3
chr2	85923191	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:1,1:0|1:85923191_G_T:85923191:1,1,0,1
chr2	85923197	.	C	CCAGATCATTTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=222,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:85923191_G_T:85923191:1,2,0,1
chr2	85981761	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=195,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr2	86075582	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:7,3:1,1:2,7,1,3
chr2	86258784	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.288:19:5,1:8,4:2,12,0,5
chr2	86259418	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=135,0;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:25,1:7,2:25,8,1,2
chr2	86259443	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.310:40:21,5:5,7:14,14,7,5
chr2	86266444	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:10,3,2,0
chr2	86275985	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=199,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr2	86292656	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr2	86302103	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr2	86305123	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=87.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,9,15
chr2	86307884	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr2	86310110	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr2	86310144	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=184,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:6,0,6,1
chr2	86315636	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=218,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,4:3,3:3,0,6,1
chr2	86316844	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	86332809	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.417:12:5,2:2,2:5,2,4,1
chr2	86334199	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:9,10:8,10:17,0,19,1
chr2	86335718	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=282.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,85:0.989:85:0,41:0,40:0,0,20,65
chr2	86344095	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,26:0.643:40:5,13:9,13:14,0,25,1
chr2	86344367	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=105.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,9:0,19:0,0,0,29
chr2	86345971	.	G	GCATA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=209,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr2	86348737	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,15;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.386:11:5,1:2,0:0,7,1,3
chr2	86352010	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	86352308	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	86353088	.	CAA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=183,173;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:7,1:2,0:0|1:86353088_CAA_C:86353088:0,10,0,2
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chr2	86355115	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=158,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.140:33:18,4:9,0:3,26,3,1
chr2	86357908	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:1,3:4,3:0,5,1,6
chr2	86359405	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,1:5,4:8,1,5,0
chr2	86362204	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:0,3,0,7
chr2	86364353	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=174,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:1,4,0,3
chr2	86364706	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr2	86385886	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	86389099	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=77.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,27:0.335:81:31,14:23,12:33,21,16,11
chr2	86398627	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86398627_C_G:86398627:0,0,0,1
chr2	86398628	.	T	TAGGGGGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:86398627_C_G:86398627:0,0,0,1
chr2	86400703	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,165;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.576:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr2	86422416	.	T	C	.	.	DP=124;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=129.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,45:0.393:115:34,20:33,24:48,22,18,27
chr2	86437551	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr2	86440873	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr2	86444252	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,10:0.238:44:19,4:15,6:15,19,6,4
chr2	86478980	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	86479035	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr2	86479287	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	86491245	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,73;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr2	86509267	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:6,4:4,1:8,3,4,1
chr2	86509388	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,12:0,0,9,21
chr2	86678124	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr2	86678348	.	AAACAGTAGT	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=158,53536908;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,2:5,0:0|1:86678348_AAACAGTAGT_A:86678348:2,13,0,2
chr2	86678362	.	A	ACT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=158,53536908;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,1:5,0:0|1:86678348_AAACAGTAGT_A:86678348:2,13,0,2
chr2	86678367	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=156,53536908;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,2:4,0:0|1:86678348_AAACAGTAGT_A:86678348:2,12,0,2
chr2	86683539	.	ATT	A,ATTT	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=152,153,141;MMQ=60,60,60;MPOS=27,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,20,23;RU=T;STR;TLOD=6.85,8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,8,10:0.231,0.335:29:5,4,7:4,4,2:9,2,17,1
chr2	86707504	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,2:6,5:1,11,2,5
chr2	86711086	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=176,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:3,2:5,1:7,2,3,0
chr2	86847534	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,66130155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:10,0:18,2:9,22,2,0
chr2	86850022	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:7,8:2,2:3,6,1,10
chr2	86947783	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,11,0
chr2	86992337	.	T	TAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=112.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,12:0,13:0,0,2,24
chr2	86998659	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	87015633	.	T	TGA	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=297.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.988:77:0,29:0,46:0,0,45,32
chr2	87073743	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,234;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.834:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	87080293	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=154,114;MMQ=39,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:16,1:17,1:0,37,0,2
chr2	87080309	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=160,112;MMQ=39,39;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.144:26:12,1:8,2:0,23,0,3
chr2	87085598	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	87085612	.	GTC	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=123,190;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:87085612_GTC_G:87085612:0,4,0,1
chr2	87085618	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=123,190;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:87085612_GTC_G:87085612:0,4,0,1
chr2	87085620	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=123,190;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:87085612_GTC_G:87085612:0,4,0,1
chr2	87205161	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=125,170;MMQ=40,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	87808726	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,12:0,13:0,0,24,2
chr2	88396080	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=142,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:9,3:8,4:16,1,6,2
chr2	88396120	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,14:0.455:31:9,7:8,6:0|1:88396120_G_A:88396120:13,4,9,5
chr2	88396123	.	CC	GT	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,14:0.455:31:9,8:7,6:0|1:88396120_G_A:88396120:13,4,9,5
chr2	88396348	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=245,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:88396348_G_A:88396348:0,2,0,2
chr2	88396358	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,30;MFRL=245,243;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:88396348_G_A:88396348:0,2,0,1
chr2	88402760	.	CGGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=G;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	88408013	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:10,5:6,0:5,11,3,2
chr2	88410102	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	88472925	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	88474370	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,9:0,16:0,0,4,21
chr2	88474390	.	CTG	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:7,1:9,1:2,14,0,2
chr2	88485392	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr2	88870632	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr2	88870648	.	A	AGAAACTCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	88882942	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:7,5:15,1:17,5,5,1
chr2	88913273	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,4:2,10:6,1,9,5
chr2	89161547	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	89196757	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:8,9:9,5:11,6,13,1
chr2	89196906	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:5,6:6,6:0,12,2,10
chr2	89246951	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,30:0.472:64:17,16:15,14:18,16,12,18
chr2	89265717	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=181,141;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:8,6:9,8:16,1,13,1
chr2	89292143	.	G	A	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,4:0.059:82:40,1:36,3:33,45,0,4
chr2	89292479	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,0:0|1:89292479_A_T:89292479:0,0,0,5
chr2	89292481	.	CAGGGGATGGGG	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=159,165;MMQ=59,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,3:0,1:0|1:89292479_A_T:89292479:0,2,0,5
chr2	89292493	.	CTGA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=159,190;MMQ=59,55;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0|1:89292479_A_T:89292479:0,2,0,3
chr2	89292502	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=37,30;MFRL=159,190;MMQ=59,55;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0|1:89292479_A_T:89292479:0,2,0,3
chr2	89309424	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:6,11:12,5:14,4,15,1
chr2	89326830	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,177;MMQ=49,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.542:39:9,9:7,12:7,11,9,12
chr2	89399858	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.824:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	89567950	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,208;MMQ=60,27;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89567950_G_A:89567950:0,0,1,0
chr2	89567960	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:89567950_G_A:89567950:0,0,1,0
chr2	89568139	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=130,102;MMQ=57,21;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,9:0.162:58:17,3:30,6:25,24,6,3
chr2	89987082	.	CA	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,22:0.433:51:17,10:10,11:10,19,5,17
chr2	90077659	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	90108416	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	90108778	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,9:0,0,12,9
chr2	95542271	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=205,73;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr2	95542416	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=135,147;MMQ=60,45;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:0|1:95542416_A_G:95542416:2,5,3,0
chr2	95542419	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=135,147;MMQ=60,45;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:0|1:95542416_A_G:95542416:2,5,3,0
chr2	95542476	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=125,151;MMQ=60,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	95542559	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	95847040	.	TGCG	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCG;STR;TLOD=139.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,15:0,17:0,0,17,18
chr2	95940678	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	95943666	.	C	CTTCAATCCCACTGCCACT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=113,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:9,5,1,1
chr2	95945568	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,1:0,0,5,3
chr2	95947085	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr2	95947846	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,13;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.248:14:4,0:5,1:0|1:95947846_G_C:95947846:2,9,3,0
chr2	95947849	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.233:15:5,1:6,1:0|1:95947846_G_C:95947846:2,10,3,0
chr2	95952177	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr2	95963242	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	96012907	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,9:0,4:0,0,2,11
chr2	96076409	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	96078465	.	AC	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,127;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:20,3:17,0:21,16,0,3
chr2	96260979	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,172;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.897:17:0,7:1,8:0,1,0,16
chr2	96692007	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=127,120;MMQ=57,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,0:5,3:4,9,1,2
chr2	96698129	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,240087;MMQ=60,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	96780986	.	C	CTCCTCCTCT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCCTCCTCT;STR;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,7:0,2:0,0,9,2
chr2	96781986	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	96798429	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,2:6,0:1,12,0,2
chr2	96943069	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=221,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:96943069_A_C:96943069:0,3,0,1
chr2	96943075	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=230,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:96943069_A_C:96943069:0,2,0,1
chr2	96943415	.	G	GCTATCATTCCTTCCTCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=140,65;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:0|1:96943415_G_GCTATCATTCCTTCCTCT:96943415:1,4,1,1
chr2	96943416	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=140,65;MMQ=60,35;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:3,1:2,0:0|1:96943415_G_GCTATCATTCCTTCCTCT:96943415:1,4,1,1
chr2	96947760	.	T	TTGTGGGATTGGGTGGAAAGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	96956315	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr2	96958933	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=195,141;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.285:5:4,0:0,1:1,3,0,1
chr2	96964762	.	G	GGTATTAGCTCTCCCTTACT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=117,236;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	96994050	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.195:18:2,1:10,2:1,14,0,3
chr2	97031876	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=178,158;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	97268023	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,0:13,2:8,16,2,0
chr2	97319534	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=226,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr2	97353725	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr2	97360079	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr2	97400324	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	97474318	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.140:31:11,1:10,1:12,15,4,0
chr2	97494379	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:16,0:7,2:9,14,1,1
chr2	97519314	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:8,9,1,1
chr2	97587023	.	G	GCATCGAAAGAGCGGGGGAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=219,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr2	97587049	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr2	97595109	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=83.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,18:0,11:0,0,6,23
chr2	97613658	.	CA	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=130,45;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.087:34:13,0:15,3:0|1:97613658_CA_C:97613658:4,27,2,1
chr2	97613669	.	A	AC	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=131,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.087:34:11,0:16,3:0|1:97613658_CA_C:97613658:2,29,2,1
chr2	97613671	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=33,22;MFRL=134,38;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.126:31:10,1:15,3:2,25,2,2
chr2	97613674	.	G	GAC	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=134,45;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,0:17,2:0|1:97613658_CA_C:97613658:1,26,1,1
chr2	97617212	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=123,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.127:47:19,0:16,1:17,23,0,7
chr2	97617227	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=99,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=92.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.938:29:1,14:0,14:0,1,6,22
chr2	97757509	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	97784295	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,5:0,15:0,0,0,20
chr2	98128150	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=12;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	98128172	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=151.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,34:0.972:34:0,13:0,12:0|1:98128172_C_A:98128172:0,0,34,0
chr2	98128183	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=12;MBQ=34,35;MFRL=161,163;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.315:36:12,7:12,4:25,0,11,0
chr2	98128194	.	GGT	CAC	.	.	DP=37;ECNT=12;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=164.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.974:37:0,19:0,16:0|1:98128172_C_A:98128172:0,0,36,1
chr2	98128228	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=34,31;MFRL=155,175;MMQ=25,26;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:17,2:11,2:24,4,4,0
chr2	98128234	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=30,20;MFRL=161,131;MMQ=25,23;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.223:29:13,5:10,0:20,3,3,3
chr2	98128256	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=12;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0|1:98128256_C_T:98128256:0,0,0,15
chr2	98128258	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=12;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,25;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0|1:98128256_C_T:98128256:0,0,0,15
chr2	98128285	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=148,159;MMQ=25,26;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,3:9,1:0,17,0,4
chr2	98128300	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=150,169;MMQ=26,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:6,3:6,6:0,12,0,10
chr2	98128313	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=12;MBQ=35,31;MFRL=215,169;MMQ=25,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:0,5:1,11:0,1,0,18
chr2	98128364	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=29,27;MFRL=252,212;MMQ=25,25;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,5:1,0,1,7
chr2	98128449	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=207,161;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	98128472	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=161,162;MMQ=25,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:3,1:7,0,2,0
chr2	98128515	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=151,151;MMQ=25,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:0|1:98128515_C_T:98128515:3,0,7,0
chr2	98128520	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=35,35;MFRL=151,151;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:0|1:98128515_C_T:98128515:4,0,6,0
chr2	98128531	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=151,150;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr2	98128574	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=158,160;MMQ=25,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,7:3,6:1,5,1,12
chr2	98129586	.	GG	AT	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=176,218;MMQ=27,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,5:0.118:49:24,2:20,3:0|1:98129586_GG_AT:98129586:44,0,5,0
chr2	98129589	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=177,218;MMQ=27,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,5:0.120:48:22,2:17,3:0|1:98129586_GG_AT:98129586:43,0,5,0
chr2	98129603	.	TAA	T	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=177,210;MMQ=27,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,9:0.217:44:20,6:14,3:31,4,9,0
chr2	98129631	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=173,194;MMQ=27,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,13:0.211:64:21,8:30,5:31,20,13,0
chr2	98129670	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=12;MBQ=34,31;MFRL=162,143;MMQ=25,25;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,7:0.109:71:30,2:33,5:36,28,7,0
chr2	98129682	.	TG	CA	.	.	DP=72;ECNT=12;MBQ=32,33;MFRL=153,155;MMQ=27,25;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,19:0.278:70:28,7:21,11:0|1:98129682_TG_CA:98129682:24,27,19,0
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chr2	98171807	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr2	98173368	.	CA	TG	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=391.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,89:0.989:89:0,34:0,50:0,0,71,18
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chr2	98353847	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	98354139	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr2	98355990	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
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chr2	98382886	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr2	98413781	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,11:0,0,21,6
chr2	98449796	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=189.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,27:0,29:0,0,45,11
chr2	98451036	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,33,32;MFRL=156,190,127;MMQ=60,60,60;MPOS=23,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=3.69,11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,2,8:0.080,0.297:27:11,1,5:5,1,3:9,8,9,1
chr2	98750492	.	A	AAAGGCAGAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	98795873	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr2	98797744	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:0,6,0,6
chr2	98844575	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	98872570	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.215:18:3,1:10,3:4,10,3,1
chr2	98872662	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr2	98887116	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=231,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:4,0,6,1
chr2	98907089	.	GT	G,GTT	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=33,29,20;MFRL=142,114,120;MMQ=60,60,60;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.46,5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:38,10,9:0.143,0.136:57:17,4,2:10,5,4:20,18,9,10
chr2	98994309	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:0,2:2,0:0,3,0,2
chr2	98994337	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=113,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:98994337_A_G:98994337:0,2,0,1
chr2	98994342	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=113,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:98994337_A_G:98994337:0,2,0,1
chr2	99008446	.	C	CGTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=165,35;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr2	99013338	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,1:3,2:1,4,0,4
chr2	99152615	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=116,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:11,6:6,3:16,1,5,4
chr2	99154227	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99154227_C_T:99154227:0,0,1,0
chr2	99154229	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99154227_C_T:99154227:0,0,1,0
chr2	99160508	.	GCA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=98,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr2	99220707	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:0,4:7,8:0,7,1,11
chr2	99232873	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:10,9:12,10:15,7,13,6
chr2	99234601	.	T	A,TTAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31,32;MFRL=192,104,163;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.05,4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,3:0.498,0.205:12:2,2,1:1,3,2:3,0,7,2
chr2	99242248	.	G	T	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,8:0.091:90:37,2:42,5:56,26,7,1
chr2	99272057	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=71.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,7:0,15:0,0,1,23
chr2	99295003	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=103,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr2	99443369	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	99449342	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:11,2,2,0
chr2	99449536	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=9635187,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	99614595	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33,24;MFRL=154,168,180;MMQ=60,60,60;MPOS=28,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=A;STR;TLOD=12.09,5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,8,3:0.266,0.120:30:8,5,1:11,3,1:18,1,10,1
chr2	99651963	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=222,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,3:3,8:0,6,0,11
chr2	99720380	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,2:7,3:11,4,4,1
chr2	99721804	.	CTT	C,CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33,35;MFRL=204,136,190;MMQ=60,60,60;MPOS=18,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=4.59,6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,4:0.243,0.351:12:4,1,3:1,2,1:5,0,7,0
chr2	99725223	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=196,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:7,0,3,0
chr2	99725479	.	A	AT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.537:24:6,7:5,6:1,10,2,11
chr2	99787120	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=165,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:6,6:5,1:3,9,3,4
chr2	99802820	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:8,9:3,1:0,11,0,10
chr2	99938942	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=219,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	99939031	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.429:28:5,3:11,8:16,0,11,1
chr2	99976802	.	GA	G	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,3:0.035:112:55,1:43,2:20,89,1,2
chr2	99992784	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=120,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,2:7,2:8,0,4,0
chr2	99993176	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr2	99995458	.	AT	A,ATT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=137,147,187;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=40.40,4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,21,5:0.611,0.139:34:2,10,4:6,10,1:8,0,24,2
chr2	99998561	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,10,1
chr2	100006620	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=383,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=103.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.946:35:0,20:1,12:0,1,32,2
chr2	100006904	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.408:15:4,4:3,1:1,8,2,4
chr2	100010685	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,3:4,7:8,2,9,1
chr2	100017906	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	100019496	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,17:0,9:0,0,10,16
chr2	100019612	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	100019646	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=212,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:100019646_TC_T:100019646:0,2,0,1
chr2	100019648	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=212,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:100019646_TC_T:100019646:0,2,0,1
chr2	100019652	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=212,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:100019646_TC_T:100019646:0,2,0,1
chr2	100021184	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,0:3,5:0,4,1,4
chr2	100022617	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr2	100022772	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.450:38:10,11:11,6:7,14,13,4
chr2	100029106	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	100050740	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.489:25:5,3:6,9:10,3,10,2
chr2	100055033	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:2,1,5,1
chr2	100068069	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=180,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr2	100081317	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=117.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,39:0.470:83:28,25:15,13:0|1:100081317_T_C:100081317:43,1,39,0
chr2	100081323	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=313.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,82:0.989:82:0,55:0,24:0|1:100081317_T_C:100081317:0,0,81,1
chr2	100081561	.	A	AAAGTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr2	100170706	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=211,163;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr2	100171121	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:5,7,2,0
chr2	100176775	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:7,2:4,4:7,4,6,0
chr2	100454072	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	100915629	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=212,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr2	100917109	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=127,165;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:2,2,4,1
chr2	100925509	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:6,0:10,1,3,0
chr2	101014363	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=101,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.462:28:7,8:8,4:7,8,8,5
chr2	101014622	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=19,32;MFRL=221,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:101014622_C_A:101014622:0,1,0,1
chr2	101014624	.	G	GCAACCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=17,33;MFRL=221,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:101014622_C_A:101014622:0,1,0,1
chr2	101031561	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=119,121;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:5,3:7,11:5,8,5,9
chr2	101521173	.	AT	A,ATT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,34,33;MFRL=147,110,151;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=T;STR;TLOD=5.95,4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,8,7:0.233,0.247:29:8,1,3:2,6,2:10,4,12,3
chr2	101541798	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=187,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=59.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:1,12:0,8:0,1,8,12
chr2	101564628	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=38,34;MFRL=97,70;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:1,0,10,0
chr2	101581246	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	101581294	.	C	CTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:101581294_C_CTT:101581294:0,0,1,0
chr2	101581308	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:101581294_C_CTT:101581294:0,0,1,0
chr2	101612047	.	C	CAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=117,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr2	101612051	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.860:5:0,2:0,1:0,0,2,3
chr2	101612362	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=200,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:101612362_C_T:101612362:0,2,0,1
chr2	101612363	.	G	GGACTGCCTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=200,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:101612362_C_T:101612362:0,2,0,1
chr2	101619283	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=160.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,22:0,23:0,0,6,39
chr2	101619321	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=127.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,17:0,15:0,0,0,33
chr2	101622696	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr2	101624471	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,12:0,8:0,0,7,13
chr2	101627343	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=203,195;MMQ=41,43;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.710:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	101627852	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,13,1
chr2	101640086	.	GT	G,GTT	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=143,166,148;MMQ=60,60,60;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=4.61,4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:44,4,5:0.085,0.097:53:24,3,2:17,1,3:31,13,7,2
chr2	101645856	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,187;MMQ=48,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	101650031	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:22,2:10,1:19,15,0,3
chr2	101675808	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	101767526	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=225,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:101767526_C_G:101767526:3,0,1,0
chr2	101767529	.	GCCC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=206,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:101767526_C_G:101767526:4,0,1,0
chr2	101767535	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,17;MFRL=186,219;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:2,0:1,0:0|1:101767526_C_G:101767526:3,0,1,0
chr2	101881539	.	C	CT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.134:27:12,0:11,3:6,18,1,2
chr2	101885656	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.193:22:7,2:11,2:8,10,2,2
chr2	101925026	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,0,22
chr2	101967346	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,9:0,0,18,5
chr2	102000210	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr2	102000228	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=150,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:102000228_A_G:102000228:0,4,0,1
chr2	102000230	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=150,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:102000228_A_G:102000228:0,4,0,1
chr2	102000232	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=150,95;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:102000228_A_G:102000228:0,4,0,1
chr2	102018878	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr2	102027050	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,1:9,2:13,1,3,0
chr2	102029548	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,4:0,0,2,7
chr2	102031488	.	A	AGTAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102031488_A_AGTAG:102031488:0,0,0,1
chr2	102031489	.	C	CTGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102031488_A_AGTAG:102031488:0,0,0,1
chr2	102031492	.	C	CGTGAGACAATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:102031488_A_AGTAG:102031488:0,0,0,1
chr2	102440583	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,15;MFRL=125,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:102440583_T_G:102440583:0,2,0,1
chr2	102440586	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=125,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:102440583_T_G:102440583:0,2,0,1
chr2	102440589	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=19,16;MFRL=125,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:102440583_T_G:102440583:0,2,0,1
chr2	102440592	.	G	GTGCCT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:102440583_T_G:102440583:0,1,0,1
chr2	102440594	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=17,30;MFRL=171,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:102440583_T_G:102440583:0,1,0,1
chr2	102440595	.	A	AGGCCC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:102440595_A_AGGCCC:102440595:0,1,0,1
chr2	102440596	.	A	AGGCCCCCAGGAG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:102440595_A_AGGCCC:102440595:0,1,0,1
chr2	102480188	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,0:1,2:9,0,2,0
chr2	102503507	.	T	TTTTGGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=153,178;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.275:8:1,1:3,1:5,1,2,0
chr2	102781164	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:8,2:4,0:0|1:102781164_C_T:102781164:11,1,2,0
chr2	102781166	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0|1:102781164_C_T:102781164:0,0,14,1
chr2	102785156	.	CG	C	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=21,26;MFRL=141,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,10:0.139:59:12,3:16,5:0|1:102785156_CG_C:102785156:8,41,1,9
chr2	102785157	.	G	GT	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,7:0.135:56:19,1:22,5:5,44,3,4
chr2	102785158	.	G	T	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=124,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=110.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,49:0.861:59:5,23:4,22:1|0:102785156_CG_C:102785156:1,9,8,41
chr2	102788409	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr2	102792760	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	102954653	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,18:0,10:0,0,24,5
chr2	102957348	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr2	102965571	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=135,92;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.192:19:4,0:7,3:0|1:102965571_C_T:102965571:11,5,0,3
chr2	102965575	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=132,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.223:16:3,0:8,3:0|1:102965571_C_T:102965571:8,5,0,3
chr2	102967928	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,16,2
chr2	102968007	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,16:0,0,16,14
chr2	102968075	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,21:0,15:0,0,24,12
chr2	102984624	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	102992408	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=130,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,4:0.070:68:31,1:29,3:45,19,2,2
chr2	103006448	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	103010912	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=143.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,22:0,22:0,0,32,13
chr2	103039873	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=128.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,14:0,21:0,0,1,34
chr2	103040177	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:103040177_A_T:103040177:0,0,9,0
chr2	103040182	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:103040177_A_T:103040177:0,0,12,0
chr2	103040247	.	T	TG	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=199.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,47:0.980:47:0,31:0,12:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,40,7
chr2	103040249	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=199.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,47:0.980:47:0,28:0,14:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,40,7
chr2	103057892	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	103059613	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,6:0,0,9,1
chr2	103063520	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,5,2
chr2	103120226	.	A	AATC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=187,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	103120232	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	103125457	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,0,6
chr2	103125466	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,0,2
chr2	103136309	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=125.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,17:0,19:0,0,28,10
chr2	103136446	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,1,16
chr2	103141447	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,1:0,0,5,2
chr2	103141651	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,11:0,6:0,0,3,14
chr2	103149162	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	103149182	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	103274010	.	T	TGTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,2:4,0:4,0,2,0
chr2	103281540	.	G	GT,GTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,35,36;MFRL=152,169,163;MMQ=60,60,60;MPOS=28,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=16.47,3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,8,2:0.509,0.165:15:2,4,2:3,4,0:5,0,10,0
chr2	103300506	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr2	103311674	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=220,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:1,2:2,2:0,3,0,5
chr2	103321113	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,3:7,0:7,11,1,2
chr2	103322496	.	C	CAATGAGAACACTTGGACACA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=199,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.355:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	103335512	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,4:7,3:3,6,3,4
chr2	103343234	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.764:15:2,7:1,4:3,0,12,0
chr2	103343275	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=90,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.423:14:1,5:4,0:4,4,5,1
chr2	103375056	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr2	103375071	.	GATCA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	103378581	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr2	103378599	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=14,18;MFRL=175,167;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.225:7:1,0:1,0:6,0,1,0
chr2	103378604	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=166,194;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:1,1:2,0:5,0,2,0
chr2	103378857	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:3,4:7,7:1,9,0,11
chr2	103431404	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr2	105665534	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=127,255;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	105705507	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:8,7:3,4:3,8,5,6
chr2	105705530	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=137,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:7,0:0|1:105705530_A_AT:105705530:3,15,1,1
chr2	105705532	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=136,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:7,0:0|1:105705530_A_AT:105705530:3,14,1,1
chr2	105705534	.	TCTTTTCTTG	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:7,0:0|1:105705530_A_AT:105705530:3,13,1,1
chr2	105710116	.	T	C	.	.	DP=134;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:121,4:0.039:125:59,0:62,4:42,79,0,4
chr2	105713868	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:105713868_A_G:105713868:0,0,0,3
chr2	105713877	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:105713868_A_G:105713868:0,0,0,3
chr2	105716266	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=179,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:0,3,2,4
chr2	105859940	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=93,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:11,0:6,2:5,12,1,1
chr2	105889900	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=123,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr2	105897261	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	105959592	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=156,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:1,5,0,5
chr2	105961703	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:9,0,7,0
chr2	105979730	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=182.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,25:0,28:0,0,28,26
chr2	106013216	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=87,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.433:12:3,2:3,3:1,6,0,5
chr2	106013248	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr2	106471825	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,19;MFRL=273,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.563:5:2,0:0,1:1,1,0,3
chr2	106715342	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	106717656	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr2	106780015	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,18,0
chr2	106780055	.	C	CTG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=118.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,9:0,14:0,0,24,3
chr2	106782398	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,10:0,0,15,0
chr2	107041680	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,174;MMQ=24,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,9:0.195:49:21,5:19,4:3,37,1,8
chr2	107423395	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.631:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	107446430	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	107460474	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	108443567	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.965:26:0,11:0,13:0|1:108443567_G_A:108443567:0,0,6,20
chr2	108443591	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0|1:108443567_G_A:108443567:0,0,2,18
chr2	108443598	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=84.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,8:0,9:0|1:108443567_G_A:108443567:0,0,2,17
chr2	108487097	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=206,222;MMQ=22,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr2	108507268	.	T	C	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=270.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,82:0.988:82:0,32:0,50:0,0,20,62
chr2	108608761	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=176,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,0:1,1:0|1:108608761_C_G:108608761:0,1,0,1
chr2	108608764	.	T	TTAAATCTAAGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=176,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:108608761_C_G:108608761:0,1,0,1
chr2	108863650	.	A	C	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,31:0.561:55:16,16:8,14:20,4,21,10
chr2	108868736	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=169,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr2	108910598	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=213,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	108917214	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,4,1
chr2	108921218	.	A	AGAGCAACTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=213,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	108921228	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=218,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:2,1:0,0:0|1:108921228_T_TG:108921228:0,2,0,1
chr2	108921230	.	T	TTACAATTATGTCTCTGTCAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=218,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:108921228_T_TG:108921228:0,2,0,1
chr2	108921795	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:2,4,5,1
chr2	108994808	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,4:5,2:5,2,3,3
chr2	109003761	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,6:2,1:2,3,5,2
chr2	109003977	.	G	GTCATTTTCTTCTTGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=128,75862646;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	109066234	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:109066234_AT_A:109066234:0,0,0,1
chr2	109066250	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109066234_AT_A:109066234:0,0,0,1
chr2	109088535	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:8,5:12,0:2,18,0,5
chr2	109092247	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,6:0.086:77:32,3:39,3:42,29,3,3
chr2	109113642	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=172,175;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.060:47:33,0:12,2:7,38,0,2
chr2	109113654	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,6:0.155:43:30,2:7,4:3,34,0,6
chr2	109113658	.	CA	TG	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=181,165;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.067:42:30,1:10,1:3,37,0,2
chr2	109123988	.	CT	C	.	.	DP=157;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,149;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,10:0.074:121:49,5:48,4:91,20,9,1
chr2	109292280	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr2	109393522	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	109404474	.	CT	C,CTT	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=149,162,165;MMQ=60,60,60;MPOS=12,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=9.25,6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:54,7,6:0.106,0.099:67:26,4,3:23,2,3:49,5,12,1
chr2	109407894	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	109411248	.	GAATAT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATAT;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	109429146	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,12:0,12:0,0,12,12
chr2	109429434	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,136;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:7,1:4,1:2,11,0,2
chr2	109492544	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:17,1:9,1:25,2,2,0
chr2	109513321	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.902:8:0,4:0,2:0,0,8,0
chr2	109513786	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	109522720	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr2	109527087	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0|1:109527087_G_A:109527087:0,0,0,5
chr2	109527094	.	G	GAGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=133,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:109527087_G_A:109527087:0,4,0,1
chr2	109964431	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr2	109988215	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	110303633	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,2:12,0:17,8,1,1
chr2	110373568	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,9;MFRL=211,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.384:13:3,0:4,0:7,1,0,5
chr2	110373574	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=211,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.385:13:4,0:3,0:7,1,0,5
chr2	110375592	.	CA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=130,61;MMQ=60,56;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.484:17:4,2:2,4:6,3,7,1
chr2	110886686	.	A	AGACCAGAT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=122,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,4:1,5:2,0,13,0
chr2	110905664	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:3,8:1,8:0,4,2,14
chr2	110919321	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr2	110925982	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.315:11:6,2:2,1:8,0,3,0
chr2	111397237	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr2	111399374	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=248,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111399374_T_A:111399374:0,1,0,1
chr2	111399375	.	T	TGGCCCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=14,32;MFRL=248,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:111399374_T_A:111399374:0,1,0,1
chr2	111417709	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=183,164;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:111417709_G_A:111417709:0,3,0,1
chr2	111417719	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=183,164;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:111417709_G_A:111417709:0,3,0,1
chr2	111417723	.	A	T,C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,29,28;MFRL=183,164,222;MMQ=40,40,40;MPOS=11,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,0,1:0,1,0:0,1,0,2
chr2	111417728	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,26;MFRL=203,164;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:111417709_G_A:111417709:0,2,0,1
chr2	111417729	.	ACC	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,25;MFRL=203,164;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:111417709_G_A:111417709:0,2,0,1
chr2	111417730	.	CCT	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=183,222;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	111417733	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=203,164;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:111417709_G_A:111417709:0,2,0,1
chr2	111556743	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:2,2:8,0:1,9,0,2
chr2	111559246	.	A	ATGGGGATGTTGTCTGTTGTTTCCTTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.205:12:2,0:8,2:3,7,0,2
chr2	111644475	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr2	111644491	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	111721142	.	ATGTGTG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=TG;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.777:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	111806978	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=197,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:111806978_C_A:111806978:0,1,0,1
chr2	111806980	.	C	CTTTGTCTTTCTGAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=197,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:111806978_C_A:111806978:0,1,0,1
chr2	111851198	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr2	112545736	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=198,203;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,3:13,0:28,1,3,0
chr2	112550170	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=170,97;MMQ=45,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:5,0:20,3:1,24,0,3
chr2	112580212	.	T	TAAAAACAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=167,161;MMQ=24,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:112580212_T_TAAAAACAA:112580212:0,1,0,1
chr2	112580214	.	G	GATCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=167,161;MMQ=24,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:112580212_T_TAAAAACAA:112580212:0,1,0,1
chr2	112582523	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,142;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=83.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,32:0.550:58:10,21:15,10:16,10,24,8
chr2	112592109	.	ACAAGGT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=163,167;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,2:5,1:0|1:112592109_ACAAGGT_A:112592109:12,3,3,1
chr2	112592117	.	CCTAT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=157,167;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.209:22:7,2:8,2:0|1:112592109_ACAAGGT_A:112592109:14,4,3,1
chr2	112605465	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,5,19
chr2	112616059	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=185,200;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:7,7:1,5:0,8,0,13
chr2	112621498	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=13,25;MFRL=176,173;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.721:8:0,1:0,2:0,2,1,5
chr2	112625575	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=125.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,39:0.592:66:12,21:13,17:17,10,28,11
chr2	112687157	.	A	ATATTTATTTATTTATT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,8;RU=TATT;STR;TLOD=51.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.672:20:4,4:2,7:0,6,0,14
chr2	112702647	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:2,4,1,3
chr2	112705157	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=189,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,1:4,5:0,4,0,6
chr2	112705185	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=189,182;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	112725674	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=172,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.203:16:5,0:7,3:12,1,3,0
chr2	112725684	.	A	ATGTG,ATGTGTG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31,31;MFRL=131,148,172;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,9,10;RU=TG;STR;TLOD=7.65,20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,7:0.234,0.471:14:1,0,3:3,3,2:3,1,9,1
chr2	112740373	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=107,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:3,2:8,8:8,3,7,3
chr2	112751928	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.737:25:4,7:2,8:2,4,8,11
chr2	112754880	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,9:5,6:9,1,10,5
chr2	112754943	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=82,118;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.734:29:1,11:4,10:2,6,9,12
chr2	112755001	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=120,146;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:0,6,0,7
chr2	112761653	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=205,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr2	112779928	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:8,0:14,2:10,13,0,2
chr2	112813163	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=204,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:2,7:2,1:4,0,8,2
chr2	112813391	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=153.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,20:0,22:0,0,5,38
chr2	112817706	.	C	CTT	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=180,144;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:8,3:6,0:0|1:112817706_C_CTT:112817706:0,14,0,3
chr2	112817707	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=183,144;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:8,3:6,0:0|1:112817706_C_CTT:112817706:0,15,0,3
chr2	112817713	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=202,155;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:5,0:0|1:112817706_C_CTT:112817706:0,16,0,2
chr2	112821880	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:0,9,0,5
chr2	112832535	.	CAAT	C	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=199.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,52:0.559:93:16,23:24,28:22,19,18,34
chr2	112847164	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:8,6:2,6:9,1,10,2
chr2	112854563	.	GT	G,GTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,33,35;MFRL=163,138,178;MMQ=60,60,60;MPOS=21,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.87,5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,6,4:0.216,0.165:27:8,4,1:9,2,2:16,1,9,1
chr2	112856165	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=112,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=95.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,34:0.671:50:7,19:9,13:9,7,18,16
chr2	112858122	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.544:26:4,7:6,7:12,0,14,0
chr2	112865517	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	112873840	.	A	AGGTATAAGTGGCTTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	112945188	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	112990804	.	T	TATAAAGA	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=164.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,44:0.554:79:18,17:17,19:31,4,38,6
chr2	112991609	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=199,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:2,1:0,3:2,0,3,1
chr2	113060848	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,6:0.142:47:15,2:26,4:20,21,5,1
chr2	113074775	.	CT	C,CTT	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=32,33,32;MFRL=146,142,140;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=16.30,19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,13,15:0.258,0.360:43:8,7,4:4,2,5:13,2,20,8
chr2	113074790	.	G	T	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,14:0.164:71:31,0:12,1:30,27,14,0
chr2	113082318	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=207,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,1:10,1:0,14,0,2
chr2	113088520	.	TAA	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=87.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,22:0.719:30:3,11:4,10:0|1:113088520_TAA_T:113088520:8,0,17,5
chr2	113088524	.	TTTATTA	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=86.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,22:0.678:32:4,12:4,10:0|1:113088520_TAA_T:113088520:10,0,17,5
chr2	113090047	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:3,1:3,5:0,6,0,7
chr2	113127809	.	GA	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=19,27;MFRL=138,108;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.211:19:2,3:4,1:3,12,1,3
chr2	113146885	.	T	TACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,277;MMQ=37,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	113300330	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=206,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr2	113305150	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,4:1,6:0,3,2,8
chr2	113308622	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=66.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,2,16
chr2	113309653	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=147,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	113310175	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=177,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	113310197	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.502:8:2,2:1,2:4,0,4,0
chr2	113315735	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.586:10:4,2:0,4:0,4,0,6
chr2	113321900	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=104,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,8:6,3:7,2,8,3
chr2	113326281	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr2	113326502	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=78.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,14:0,0,6,18
chr2	113331445	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:113331445_A_T:113331445:0,2,0,1
chr2	113331447	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:113331445_A_T:113331445:0,2,0,1
chr2	113331449	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:113331445_A_T:113331445:0,2,0,1
chr2	113343488	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,13,2
chr2	113346512	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	113416827	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=164,99;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:8,1:13,4,2,0
chr2	113479745	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	113480556	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,311;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	113480938	.	G	GCACACA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=198,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=CA;STR;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.685:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr2	113481547	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	113484319	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=145.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,25:0,21:0,0,22,25
chr2	113484353	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=95.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,12:0,15:0,0,3,28
chr2	113504204	.	C	CACCAGGAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=202,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:113504204_C_CACCAGGAAA:113504204:0,4,0,1
chr2	113504205	.	T	TGCAAATAAAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=202,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:113504204_C_CACCAGGAAA:113504204:0,4,0,1
chr2	113513504	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=126,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,5:6,3:12,0,8,0
chr2	113514884	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	113532885	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,5:2,7:0,4,2,10
chr2	113540205	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr2	113590467	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,1:3,1:0,3,0,3
chr2	113671303	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=267,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=134.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.952:39:1,17:0,21:1,0,34,4
chr2	113671518	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=267,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:1,8:0,8:0,1,0,16
chr2	113765644	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=139,51;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,2:8,0:0|1:113765644_G_T:113765644:3,16,1,1
chr2	113765649	.	C	CTTCAGAGCTGACAGCG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=139,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:113765644_G_T:113765644:2,15,1,1
chr2	113765651	.	T	TGAACCA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:113765644_G_T:113765644:2,15,1,1
chr2	113783909	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	113785727	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=38,33;MFRL=150,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.569:5:0,0:2,3:0|1:113785727_A_G:113785727:0,2,1,2
chr2	113785734	.	G	GAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=193,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:113785727_A_G:113785727:0,2,0,1
chr2	113785737	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=199,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:3,1:1|0:113785727_A_G:113785727:0,3,0,1
chr2	113875509	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=97,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:2,2,3,0
chr2	113875631	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,113;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:2,7:1,2:1,2,1,9
chr2	113877538	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,7:3,1:6,0,8,0
chr2	113887262	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:3,4:4,6:1,6,6,4
chr2	113887273	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=192,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:1,2,3,3
chr2	113887294	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr2	113887334	.	G	GGAAGTTCTCTGGGGATTTTGAGAGCTTTGAGTTTGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=190,222;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	113887338	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	113888793	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=114,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,1,4
chr2	113953336	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=127,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:8,0:11,8,1,2
chr2	113953401	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr2	113953657	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:7,6:2,5:8,1,10,1
chr2	113953952	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=142,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:1,2:1,1:0,2,0,4
chr2	113953973	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=124,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0|1:113953973_A_AT:113953973:0,1,1,4
chr2	113953974	.	GACA	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=124,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0|1:113953973_A_AT:113953973:0,1,1,4
chr2	113955074	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,6:2,2:6,2,7,1
chr2	113977862	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	113993253	.	G	GTGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=253,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr2	113999736	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:4,0:0,4:1,3,0,5
chr2	114000458	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	114004237	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	114257462	.	C	CAAGGTCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=332,151;MMQ=24,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	114258779	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,165;MMQ=25,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.381:50:14,9:17,9:24,7,12,7
chr2	114340450	.	AGAG	A	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=157,145;MMQ=22,22;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.131:49:14,2:24,4:43,0,6,0
chr2	114340469	.	G	A	.	.	DP=88;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=145,146;MMQ=22,22;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,17:0.208:84:30,5:37,12:67,0,17,0
chr2	114340494	.	G	A	.	.	DP=146;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=134,151;MMQ=22,22;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,43:0.311:139:38,21:57,22:90,6,41,2
chr2	114340511	.	G	A	.	.	DP=203;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=141,126;MMQ=22,22;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:159,29:0.155:188:57,10:98,18:125,34,22,7
chr2	114340663	.	G	A	.	.	DP=183;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=144,147;MMQ=47,23;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,64:0.364:176:52,30:59,33:44,68,23,41
chr2	114340677	.	C	A	.	.	DP=161;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=141,143;MMQ=40,22;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,39:0.264:148:44,14:63,24:36,73,4,35
chr2	114340706	.	A	G	.	.	DP=116;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=146,170;MMQ=52,22;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,24:0.232:104:39,8:41,14:13,67,1,23
chr2	114398940	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=122,158;MMQ=40,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:8,2:16,0:7,17,1,1
chr2	114480812	.	A	AAAC	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=154.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,20:0,14:0,0,0,35
chr2	114486880	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=209,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:5,2:7,0,2,0
chr2	114486907	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,3:0,13:0,0,16,0
chr2	114492135	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,15,3
chr2	114493315	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,31:0.562:55:13,16:10,14:21,3,27,4
chr2	114493524	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,0,13
chr2	114500473	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:1,5,0,5
chr2	114503773	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	114513386	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=185.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,28:0,25:0,0,45,8
chr2	114689047	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:1,1:3,1:0,7,0,3
chr2	114691809	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:5,1,2,0
chr2	114713169	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,17:0.650:26:1,6:6,9:0|1:114713169_A_G:114713169:9,0,16,1
chr2	114713188	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,23:0.706:32:3,7:5,15:0|1:114713169_A_G:114713169:8,1,21,2
chr2	115919677	.	CT	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	116066984	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	116497479	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=74.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,7,15
chr2	116497528	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr2	116520249	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:116520249_T_TC:116520249:0,1,0,1
chr2	116520250	.	G	GTTCTACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:116520249_T_TC:116520249:0,1,0,1
chr2	116525794	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	116525831	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,61;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr2	116534922	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,2,12
chr2	116535536	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	116539846	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,11:0,4:0,0,15,1
chr2	116548820	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,23,6
chr2	116593675	.	ATG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=152,180;MMQ=52,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,5:0,4:1,0,9,0
chr2	116593695	.	GAT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=192,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AT;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,3:1,2:3,0,5,0
chr2	116599927	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	118575215	.	C	G	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=264.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,80:0.988:80:0,32:0,46:0,0,32,48
chr2	118578691	.	TA	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=9,31;MFRL=189,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=101.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,40:0.977:41:0,23:0,15:0,1,31,9
chr2	118582580	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,128;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:23,0:9,2:17,15,0,2
chr2	118582741	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:4,1:0,6:1,3,0,7
chr2	118582936	.	A	ATAAAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.809:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	118688754	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr2	118694393	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	118704478	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,2,17
chr2	118705570	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	118706879	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr2	118709122	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr2	118753148	.	A	ATC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	118753916	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,493;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:7,3:8,0:6,10,0,3
chr2	118766024	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	118771663	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr2	118771682	.	TGCC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GCC;STR;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.874:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	119732042	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,11,10
chr2	119735163	.	C	CTG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=202,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:4,1:1,0:0|1:119735163_C_CTG:119735163:0,5,0,1
chr2	119735165	.	C	CTGCCAGAGAACA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=202,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:4,1:1,0:0|1:119735163_C_CTG:119735163:0,5,0,1
chr2	119739142	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,0:4,0:7,4,3,0
chr2	119739150	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:3,0:7,1:10,6,3,0
chr2	119739269	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=58.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr2	119748135	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.947:14:0,8:0,5:0,0,0,14
chr2	119749477	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.647:32:5,8:6,13:2,9,4,17
chr2	119915060	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	119915074	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	119915132	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr2	120003642	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	120014985	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	120059988	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=120.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,15:0,18:0,0,29,4
chr2	120078689	.	T	C	.	.	DP=111;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=183.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,59:0.573:103:28,32:15,27:42,2,54,5
chr2	120125053	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=198,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:7,0,3,1
chr2	120125058	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=198,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,2:7,0,3,1
chr2	120125363	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,1:7,1:7,3,0,2
chr2	120125910	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=126,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,1,2
chr2	120125936	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	120128482	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,1:2,3:0,4,0,4
chr2	120194651	.	A	AGTGTGC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,8:0,7:0,0,4,12
chr2	120197670	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr2	120199252	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:1,1:0|1:120199252_T_C:120199252:0,2,0,1
chr2	120199258	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:120199252_T_C:120199252:0,2,0,1
chr2	120199262	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:120199252_T_C:120199252:0,2,0,1
chr2	120199263	.	CTTA	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=36,28;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:120199252_T_C:120199252:0,2,0,1
chr2	120199267	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:120199252_T_C:120199252:0,2,0,1
chr2	120209689	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr2	120209766	.	G	GAGGTTGGTGAGCAGCGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=182,265;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	120230998	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr2	120231165	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,2,14
chr2	120362407	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,11:1,12:1,0,10,15
chr2	120362897	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=98.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,3,28
chr2	120366057	.	G	GTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,15;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.691:1:0,0:0,1:0|1:120366057_G_GTTT:120366057:0,0,1,0
chr2	120366070	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.691:1:0,0:0,0:0|1:120366057_G_GTTT:120366057:0,0,1,0
chr2	120383138	.	CATT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=95,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,4:1,5:1,1,8,2
chr2	120404629	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,0:0,2:0,0,1,4
chr2	120406160	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	120414083	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.927:10:0,8:0,2:0,0,2,8
chr2	120635205	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.362:17:7,3:3,2:0,11,0,6
chr2	120643280	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:6,0,7,0
chr2	120689905	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=202,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:3,3:5,3:9,0,6,0
chr2	120703842	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr2	120704164	.	A	AT	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=124.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,36:0.622:58:9,11:13,23:0|1:120704164_A_AT:120704164:5,17,12,24
chr2	120704166	.	G	T	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,36:0.616:58:9,11:13,22:0|1:120704164_A_AT:120704164:5,17,12,24
chr2	120714401	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr2	120718322	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:1,0,8,0
chr2	120734737	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:3,2:1,1:0,6,0,5
chr2	120776884	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0,15,0,2
chr2	120776914	.	T	TACA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0|1:120776914_T_TACA:120776914:0,3,0,1
chr2	120776916	.	G	GTCTCTACCCTTTTTGAAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:120776914_T_TACA:120776914:0,3,0,1
chr2	120776918	.	T	TTGAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0|1:120776914_T_TACA:120776914:0,3,0,1
chr2	120830627	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.448:25:6,7:7,4:14,0,11,0
chr2	120830815	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=167.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,21:0,23:0,0,14,31
chr2	120834549	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:9,1,4,0
chr2	120889173	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,15,1
chr2	120918585	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	120922536	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,2:4,5:1,7,0,8
chr2	121036385	.	TT	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,1,8
chr2	121043403	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,9,4
chr2	121709091	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	121712729	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	121713022	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:121713022_C_G:121713022:0,0,1,1
chr2	121713030	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:121713022_C_G:121713022:0,0,1,1
chr2	121713041	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	121726217	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=10,18;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:121726217_A_G:121726217:1,0,1,0
chr2	121726218	.	T	TGGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,30;MFRL=240,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1|0:121726217_A_G:121726217:1,0,1,0
chr2	121726219	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=13,18;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:121726217_A_G:121726217:1,0,1,0
chr2	121726221	.	CC	GG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=13,10;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:121726217_A_G:121726217:1,0,1,0
chr2	121729490	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,9:0,0,17,7
chr2	121729686	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	121740190	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,6,0
chr2	121740194	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,8,0
chr2	121740505	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	121744225	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr2	121989633	.	TT	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:121989633_TT_AG:121989633:0,1,0,1
chr2	121989635	.	G	GAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:121989633_TT_AG:121989633:0,1,0,1
chr2	121995400	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=127,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:8,0:0|1:121995400_T_C:121995400:12,10,2,0
chr2	121995408	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,2:11,0:0|1:121995400_T_C:121995400:14,11,2,0
chr2	121995511	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=85,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,6:1,3:1,4,1,8
chr2	122004596	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=162,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	122006700	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,1:7,3:3,12,1,3
chr2	122042750	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	122104703	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=140,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:6,0:9,3:5,10,1,2
chr2	122139915	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:3,15,0,2
chr2	122161850	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr2	122273187	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:8,3:4,4:12,0,7,0
chr2	122283313	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	122484966	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,16:0.347:47:11,9:20,7:26,5,14,2
chr2	122484990	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,34:0.625:54:12,13:7,21:14,6,24,10
chr2	122485106	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=177,146;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,4:8,6:1,11,0,10
chr2	122489374	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=114,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,5:0,1:2,1,6,0
chr2	122489831	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr2	122514235	.	T	C	.	.	DP=84;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,3:0.048:81:46,1:28,2:0|1:122514235_T_C:122514235:24,54,0,3
chr2	122514247	.	G	A	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=145,131;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,2:0.038:76:37,0:31,2:0|1:122514235_T_C:122514235:10,64,0,2
chr2	122514249	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=146,131;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,2:0.040:73:36,0:31,1:0|1:122514235_T_C:122514235:9,62,0,2
chr2	125204333	.	A	AC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=137,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,1:6,0:0|1:125204333_A_AC:125204333:10,4,1,1
chr2	125204336	.	G	GCCCCAGCTGA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=137,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:8,0:0|1:125204333_A_AC:125204333:10,4,1,1
chr2	125285113	.	A	AAGTCAAAAAAGATTAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	125521453	.	CC	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:0|1:125521453_CC_AT:125521453:7,4,0,2
chr2	125521455	.	T	TTTAATGTAAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:0|1:125521453_CC_AT:125521453:7,4,0,2
chr2	125521602	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,2:8,0:12,3,1,1
chr2	125672772	.	TAC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.141:20:8,1:6,1:18,0,2,0
chr2	125672940	.	G	GA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=142,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.104:35:12,0:18,3:1,31,0,3
chr2	127447763	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr2	127453479	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.882:6:0,1:0,3:0,0,6,0
chr2	127453818	.	A	AGGAAAACATG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	127808532	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:6,9:3,4:1,8,6,7
chr2	127810006	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:127810006_G_GA:127810006:0,4,0,1
chr2	127810008	.	A	ACGTTAAGTAATTGCCCCAAGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:127810006_G_GA:127810006:0,4,0,1
chr2	127811679	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=226,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	127815193	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=187,19444415;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:0,13,1,1
chr2	127821085	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.370:16:5,3:5,1:10,0,4,2
chr2	127821453	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:2,1,6,0
chr2	127821499	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,4:6,1:12,0,5,0
chr2	127828296	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,20;MFRL=168,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:0,0:1,1:4,0,2,0
chr2	127834136	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,4:2,0:7,0,4,0
chr2	127834369	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=208,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:127834369_C_T:127834369:0,2,0,2
chr2	127834384	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=235,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:127834369_C_T:127834369:0,3,0,2
chr2	127944781	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	127950904	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:3,2:1,1:1,3,1,3
chr2	127951458	.	GC	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,5:5,7:3,5,2,10
chr2	128015367	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr2	128046961	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,2:5,0:0|1:128046961_A_T:128046961:6,14,0,2
chr2	128046963	.	C	CTTCTTCTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,2:6,0:0|1:128046961_A_T:128046961:6,15,0,2
chr2	128050134	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=195,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr2	128081682	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.591:35:6,5:8,14:13,1,18,3
chr2	128087651	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,0,4
chr2	128180404	.	TG	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,14;MFRL=237,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr2	128181028	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	128184875	.	GGAC	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128184875_GGAC_G:128184875:0,0,0,1
chr2	128184881	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128184875_GGAC_G:128184875:0,0,0,1
chr2	128184883	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:128184875_GGAC_G:128184875:0,0,0,1
chr2	128253571	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,21:0.759:27:2,10:4,11:6,0,16,5
chr2	128324125	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	128324391	.	C	CAGTGGCTCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,36;MFRL=245,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128324391_C_CAGTGGCTCA:128324391:0,1,0,1
chr2	128324394	.	C	CCTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=37,31;MFRL=245,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:128324391_C_CAGTGGCTCA:128324391:0,1,0,1
chr2	128327569	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,5:2,6:0,4,0,11
chr2	128339780	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	128340093	.	C	CGAAGGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=194,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	128342547	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:7,2:1,2:0,8,1,3
chr2	128350551	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:1,1:8,1:0,10,0,2
chr2	128350578	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr2	128351229	.	C	CTCGGCGGCTCTCTGGGGGT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=169,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:7,0:4,8,0,2
chr2	128351294	.	GGGTCCAT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTCCAT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	128354024	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=164,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.446:25:8,5:5,6:10,4,6,5
chr2	128363530	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,1:0,6:0,0,2,7
chr2	128364684	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr2	128366272	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:3,2:3,3:6,0,6,0
chr2	128367359	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:1,5:9,2:4,6,4,3
chr2	128377833	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	128377842	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr2	128378136	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	128382859	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	128389343	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	128389360	.	C	CTGAGTG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:128389360_C_CTGAGTG:128389360:0,3,0,1
chr2	128389362	.	C	CAGGGAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:128389360_C_CTGAGTG:128389360:0,3,0,1
chr2	128389422	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	128392300	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,13;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:0,1:2,0:1,3,0,3
chr2	128392688	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=80,78;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	128393261	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	128393289	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:6,1,3,0
chr2	128394843	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=22,13;MFRL=233,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.545:7:1,1:1,0:2,1,4,0
chr2	128394875	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:8,1,0,2
chr2	128394877	.	C	T,CT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,33,33;MFRL=0,154,122;MMQ=60,60,60;MPOS=23,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.28,31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,9:0.214,0.720:11:0,1,5:0,1,4:0,0,8,3
chr2	128396807	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr2	128407499	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	128411898	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=219,252;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr2	128411934	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,2:0,6:0,0,9,1
chr2	128411950	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr2	128412341	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,9;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.478:8:2,0:2,0:1,3,4,0
chr2	128431188	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=161,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.736:16:2,4:1,8:3,1,10,2
chr2	128460824	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:3,1,3,3
chr2	128461446	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,150;MMQ=47,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:7,7,0,2
chr2	128467473	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr2	128522637	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=103,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	128528266	.	AAAATAAATAAAT	A,AAAAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,165,157;MMQ=60,60,41;MPOS=12,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,8,9;RU=AAAT;STR;TLOD=3.74,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.411,0.406:2:0,0,1:0,1,0:0,0,2,0
chr2	128608271	.	GAA	G,GA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,34,34;MFRL=166,171,164;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.36,77.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,32:0.097,0.807:38:1,1,14:1,2,17:1,2,10,25
chr2	128608290	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=157,171;MMQ=55,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=143.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,36:0.925:38:1,14:0,18:1,1,10,26
chr2	128610747	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	128622693	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=104,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,0:11,2:17,7,2,0
chr2	128628600	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:128628600_A_AGT:128628600:0,1,0,1
chr2	128628603	.	G	GCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:128628600_A_AGT:128628600:0,1,0,1
chr2	128699750	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=84,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:4,6:3,3:2,5,1,8
chr2	128708063	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	128744580	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	128753854	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	128757804	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr2	128877837	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	128880899	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,0,22
chr2	128890878	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,5:0,0,2,7
chr2	128915006	.	T	TATGATATTA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=207,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	128944424	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:8,5:1,3:1,8,0,8
chr2	129075919	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=173,90;MMQ=52,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:3,2:12,2:10,5,2,2
chr2	130739444	.	TGAAGACG	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAGACG;STR;TLOD=190.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.981:44:0,18:0,25:0,0,26,18
chr2	130739646	.	TTAAC	T	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=288.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.985:65:0,33:0,28:0,0,20,45
chr2	130739712	.	CT	C,CTT	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=31,33,33;MFRL=161,146,157;MMQ=60,60,60;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.99,5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,8,6:0.213,0.158:35:8,6,3:11,1,2:9,12,8,6
chr2	130832873	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,137;MMQ=24,24;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,17:0.282:60:16,10:27,5:23,20,13,4
chr2	130872569	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=37,32;MFRL=236,216;MMQ=27,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:130872569_G_T:130872569:3,0,1,0
chr2	130872576	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=236,216;MMQ=27,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:130872569_G_T:130872569:3,0,1,0
chr2	130872658	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr2	130897559	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr2	130901926	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,153;MMQ=49,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr2	130902067	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,152;MMQ=52,40;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:11,1:23,4:12,22,2,3
chr2	130910847	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=216,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	130910967	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=193,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,1:4,1:2,7,0,2
chr2	130914797	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=271,193;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr2	130930819	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,149;MMQ=39,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:9,7:15,4:18,6,9,2
chr2	130939288	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:14,5:7,5:8,13,5,5
chr2	130940090	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=191,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,3:5,4:9,1,7,0
chr2	130941318	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,174;MMQ=52,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:12,5:3,4:10,5,6,3
chr2	130941409	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=167,132;MMQ=56,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.412:44:16,8:9,10:12,14,13,5
chr2	130949303	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,270;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	130949553	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=150,179;MMQ=52,27;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:15,1:8,2:14,10,0,3
chr2	130949582	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=158,184;MMQ=52,34;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:15,1:11,1:15,11,0,2
chr2	130949589	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=161,213;MMQ=52,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:15,1:12,1:15,13,1,1
chr2	130951581	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=141,151;MMQ=51,43;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:8,0:9,4:0|1:130951581_A_G:130951581:14,3,2,2
chr2	130951584	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=137,151;MMQ=51,43;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.237:19:8,0:7,3:0|1:130951581_A_G:130951581:13,2,2,2
chr2	130951599	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=134,151;MMQ=52,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,3:11,0:17,3,3,0
chr2	130951754	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=161,166;MMQ=27,27;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:2,5:15,3:8,10,1,7
chr2	130952053	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,209;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	130952111	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=217,232;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	131099137	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=150,124;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,2:11,0:0|1:131099137_G_A:131099137:21,0,2,0
chr2	131099139	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=150,124;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,2:11,0:0|1:131099137_G_A:131099137:21,0,2,0
chr2	131099246	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.145:46:16,4:24,2:18,22,3,3
chr2	131116404	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=235,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr2	131117120	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:1,0:1,0:0|1:131117120_G_C:131117120:1,1,1,0
chr2	131117123	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:131117120_G_C:131117120:1,1,1,0
chr2	131117126	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,19;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:131117120_G_C:131117120:1,1,1,0
chr2	131117128	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:131117120_G_C:131117120:1,1,1,0
chr2	131119835	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=181,125;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131119835_A_G:131119835:0,1,0,1
chr2	131119838	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=10,35;MFRL=181,125;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:131119835_A_G:131119835:0,1,0,1
chr2	131119842	.	C	CTTGTTATGAAT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=181,125;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131119835_A_G:131119835:0,1,0,1
chr2	131119854	.	T	TCCAAA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131119854_T_TCCAAA:131119854:0,0,0,1
chr2	131119855	.	T	TGACTTC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:131119854_T_TCCAAA:131119854:0,0,0,1
chr2	131119858	.	A	ATTCCT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=210,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131119854_T_TCCAAA:131119854:0,1,0,1
chr2	131130678	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=107,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr2	131232617	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=130,131;MMQ=24,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.669:16:3,3:2,8:2,3,7,4
chr2	131332167	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=215,194;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,0,3
chr2	131334627	.	GTC	ACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=141,149;MMQ=40,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	131403183	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=175,103;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,3:4,2:8,1,3,2
chr2	131414061	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=179,167;MMQ=60,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:7,8:6,4:13,0,12,0
chr2	131414073	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=179,162;MMQ=60,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:8,6:8,4:16,0,10,0
chr2	131414176	.	C	T	.	.	DP=125;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=145,141;MMQ=49,45;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=244.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,88:0.721:122:16,54:16,32:14,20,50,38
chr2	131523671	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.311:27:11,3:7,5:10,9,5,3
chr2	131673316	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,4:0,0,6,6
chr2	131673950	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	131675133	.	A	AAGT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131675133_A_AAGT:131675133:0,2,0,1
chr2	131675136	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131675133_A_AAGT:131675133:0,2,0,1
chr2	131675137	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=148,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131675137_G_A:131675137:0,2,0,1
chr2	131675138	.	G	GAACTTGA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131675133_A_AAGT:131675133:0,2,0,1
chr2	131675139	.	G	GTCACTTGAGTCC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=148,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:131675137_G_A:131675137:0,2,0,1
chr2	131688916	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131688916_C_CA:131688916:0,0,0,1
chr2	131688918	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131688916_C_CA:131688916:0,0,0,1
chr2	131688919	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131688916_C_CA:131688916:0,0,0,1
chr2	131805979	.	CG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:4,2:7,2:3,8,2,2
chr2	131810546	.	T	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=134,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,11:0.151:59:19,1:19,0:32,16,0,11
chr2	131829606	.	GAA	CCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=232,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131829606_GAA_CCC:131829606:0,1,0,1
chr2	131829610	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=232,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131829606_GAA_CCC:131829606:0,1,0,1
chr2	131883519	.	TC	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=85,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:1,2,0,1
chr2	131995700	.	C	T	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,173;MMQ=24,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,7:0.075:102:50,3:43,3:76,19,5,2
chr2	132010270	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,312;MMQ=60,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	132021475	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,141;MMQ=34,22;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.249:21:9,3:7,1:9,7,1,4
chr2	132120501	.	C	CT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=118.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.979:41:0,22:0,19:0,0,28,13
chr2	132121686	.	T	TTCGGCTTCCCCAGCCGCCGCCGCC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCGGCTTCCCCAGCCGCCGCCGCC;STR;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.866:5:0,0:0,3:0,0,0,5
chr2	132240509	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr2	132248379	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,25:0.672:37:3,11:7,14:5,7,13,12
chr2	132249372	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	132249600	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=159,179;MMQ=40,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:3,3:7,0:0|1:132249600_G_A:132249600:10,0,3,0
chr2	132249605	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=166,179;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,3:6,0:0|1:132249600_G_A:132249600:9,2,3,0
chr2	132249663	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=154,188;MMQ=53,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:5,5:0,2:0,8,0,7
chr2	132250067	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	132250093	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:132250093_T_G:132250093:0,0,0,1
chr2	132250104	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:132250093_T_G:132250093:0,0,0,1
chr2	132285511	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	132285999	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=164,170;MMQ=57,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:6,9:8,5:12,2,10,4
chr2	132286046	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=152,159;MMQ=33,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.257:37:15,6:12,3:17,11,6,3
chr2	132286061	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=157,156;MMQ=33,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.201:33:14,4:11,2:16,11,4,2
chr2	132290399	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=175,175;MMQ=49,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.585:25:5,8:5,4:2,8,6,9
chr2	132290621	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,167;MMQ=27,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.311:23:7,2:9,4:3,13,3,4
chr2	132905660	.	G	A	.	.	DP=101;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=139,144;MMQ=37,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:94,7:0.078:101:35,2:54,5:0|1:132905660_G_A:132905660:70,24,7,0
chr2	132905664	.	G	T	.	.	DP=105;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=139,144;MMQ=37,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,7:0.075:105:37,2:59,5:0|1:132905660_G_A:132905660:71,27,7,0
chr2	132905682	.	T	C	.	.	DP=109;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=137,144;MMQ=37,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:102,7:0.072:109:41,2:57,5:0|1:132905660_G_A:132905660:66,36,7,0
chr2	132905693	.	T	C	.	.	DP=115;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=137,144;MMQ=37,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:108,7:0.068:115:43,2:57,5:0|1:132905660_G_A:132905660:63,45,7,0
chr2	132905703	.	C	G	.	.	DP=114;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=136,143;MMQ=37,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:107,7:0.068:114:44,2:58,4:0|1:132905660_G_A:132905660:55,52,6,1
chr2	132905706	.	A	G	.	.	DP=107;ECNT=7;MBQ=30,25;MFRL=136,143;MMQ=40,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,7:0.073:106:42,0:54,5:0|1:132905660_G_A:132905660:52,47,6,1
chr2	132905741	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=141,146;MMQ=40,24;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,8:0.106:82:39,2:34,6:21,53,0,8
chr2	132912296	.	C	G	.	.	DP=154;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=133,133;MMQ=50,23;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:140,5:0.039:145:76,1:58,4:76,64,4,1
chr2	132912316	.	G	A	.	.	DP=142;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,133;MMQ=50,23;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:128,7:0.058:135:66,2:57,5:61,67,1,6
chr2	132912398	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,182;MMQ=40,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.151:44:19,2:19,4:0,38,0,6
chr2	133014510	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,23;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133014510_TG_CA:133014510:0,0,0,1
chr2	133014518	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,23;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133014510_TG_CA:133014510:0,0,0,1
chr2	133014602	.	GG	CT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,56;MMQ=60,58;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:133014602_GG_CT:133014602:0,0,1,1
chr2	133014607	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,56;MMQ=60,58;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:133014602_GG_CT:133014602:0,0,1,1
chr2	133014612	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,56;MMQ=60,58;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:133014602_GG_CT:133014602:0,0,1,1
chr2	133014614	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,56;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:133014602_GG_CT:133014602:0,0,1,1
chr2	133014616	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,56;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:133014602_GG_CT:133014602:0,0,1,1
chr2	133014721	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,37;MFRL=0,0;MMQ=60,38;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	133014751	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,38;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	133402607	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=204,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:3,6:0,6:3,0,11,1
chr2	133403600	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=106,102;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:11,4,2,0
chr2	133425912	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=68,211;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr2	133539460	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.550:9:3,4:1,1:3,1,5,0
chr2	133541092	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:8,3:19,0:17,11,3,0
chr2	133543305	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=140,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,0:3,2:0,4,0,3
chr2	133636367	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=151,68;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:4,1,2,2
chr2	135099425	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	135102453	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=64,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:0,1:4,0,5,0
chr2	135160755	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	135199506	.	GGT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.724:5:0,2:1,2:0|1:135199506_GGT_G:135199506:1,0,0,4
chr2	135199512	.	G	GCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,11;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.712:5:0,0:1,0:0|1:135199506_GGT_G:135199506:1,0,0,4
chr2	135308248	.	A	AAGGGTTTTTCTGAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=131,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr2	135470735	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:2,2,4,0
chr2	135677471	.	A	AGTTT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.373:30:9,6:10,5:7,12,5,6
chr2	135694354	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:5,3:1,4:0|1:135694354_G_C:135694354:6,0,7,0
chr2	135694379	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0|1:135694354_G_C:135694354:0,0,19,2
chr2	135700151	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:7,3:8,4:8,7,5,2
chr2	135703650	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:6,1:2,2:4,4,2,1
chr2	135705558	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	135710322	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=186.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,30:0,21:0,0,8,44
chr2	135745861	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135745861_A_C:135745861:0,0,0,1
chr2	135745866	.	T	TTCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135745861_A_C:135745861:0,0,0,1
chr2	135745867	.	A	ACTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135745861_A_C:135745861:0,0,0,1
chr2	135762980	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,6:4,3:5,1,8,1
chr2	135848503	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:15,0,2,0
chr2	135848786	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=207,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	135881656	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.342:10:4,1:1,2:7,0,3,0
chr2	135887514	.	AT	A,ATT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,32,31;MFRL=149,164,174;MMQ=60,60,60;MPOS=14,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=12.87,9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,10,6:0.198,0.148:46:17,5,3:9,3,1:23,7,12,4
chr2	135887667	.	A	AT	.	.	DP=134;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,4:0.044:107:49,3:53,1:15,88,0,4
chr2	135920394	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:12,5:4,6:8,9,3,8
chr2	135922290	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:2,4,0,2
chr2	135985544	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:18,2:12,0:11,21,0,2
chr2	135988088	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=171,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.238:23:7,4:11,1:13,5,3,2
chr2	136148392	.	TG	AA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=18,30;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:136148392_TG_AA:136148392:2,2,0,1
chr2	136148396	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:136148392_TG_AA:136148392:2,2,0,1
chr2	136148399	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:136148392_TG_AA:136148392:1,2,0,1
chr2	136360062	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,3:1,0:4,0,3,0
chr2	136373848	.	CAGTTT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,3:6,0:1,11,0,3
chr2	136407445	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=108.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,19:0,0,32,2
chr2	136407479	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=159.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,21:0,29:0,0,36,15
chr2	136418868	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=99,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:7,10:8,3:8,7,11,2
chr2	136467119	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=212.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.986:65:0,41:0,24:0,0,18,47
chr2	136467164	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,13:0,10:0,0,0,24
chr2	136479426	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:15,0,2,0
chr2	136499632	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.175:26:10,0:12,4:0,22,2,2
chr2	136511874	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,3:6,4:4,7,3,4
chr2	136511898	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.357:9:3,0:2,1:0,6,0,3
chr2	136528385	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,136;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:23,0:17,3:2,39,3,0
chr2	136545844	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	136548169	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	136548192	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	136552188	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:7,3:1,2:7,1,5,0
chr2	136555525	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	136561735	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	136567633	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,14:0,3:0,0,0,17
chr2	136574968	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:3,1,2,2
chr2	136587238	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=90,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:3,3,3,3
chr2	136622543	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,6:3,3:6,0,9,1
chr2	136622825	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	136630239	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=126,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:3,5:5,1:8,1,5,1
chr2	136633771	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	136633962	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,5:3,2:0,4,0,7
chr2	136664812	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	136664833	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=17,18;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:4,0,1,0
chr2	136674028	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,2
chr2	136674031	.	T	TAC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,1
chr2	136674032	.	T	TCACC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,1
chr2	136674034	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,1
chr2	136674038	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,1
chr2	136674040	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,1
chr2	136674043	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:136674028_A_G:136674028:0,0,0,1
chr2	136690414	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=11,31;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.585:12:1,5:1,2:0|1:136690414_TA_T:136690414:2,3,3,4
chr2	136690425	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.584:12:2,5:3,2:0|1:136690414_TA_T:136690414:2,3,3,4
chr2	136740900	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr2	136743143	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:5,3:1,3:1,5,0,6
chr2	136743172	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:2,2:3,0:0,5,0,3
chr2	136873880	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,14;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,0:2,0:1,2,0,1
chr2	137814804	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:2,7:1,8:1,2,5,10
chr2	137872961	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	137990463	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,1:9,2:10,4,2,1
chr2	137999979	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	138030124	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:9,7,2,0
chr2	138030271	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,4:0,3:0,2,0,7
chr2	138033412	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=185,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr2	138033428	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:4,0,5,0
chr2	138033556	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.169:27:10,0:13,4:13,10,1,3
chr2	138163391	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr2	138169158	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr2	138208631	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	138208662	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=238,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:138208662_G_A:138208662:0,2,0,1
chr2	138208663	.	A	AAAATAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=238,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:138208662_G_A:138208662:0,2,0,1
chr2	138413310	.	T	TGCAGGGATACAGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	138417180	.	ATTAGAAATATC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=131,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:8,2:13,4,1,1
chr2	138434130	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=146,79;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,2:2,3:2,6,2,3
chr2	138434220	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	138771760	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	139308397	.	TTC	T,TTCTCTCTC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25,32;MFRL=212,197,153;MMQ=60,60,57;MPOS=26,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,14;RU=TC;STR;TLOD=5.03,20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,6:0.198,0.510:11:3,1,4:0,0,1:3,0,8,0
chr2	139318332	.	CT	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.164:36:14,4:15,2:29,1,5,1
chr2	139429023	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,1:6,1:9,12,0,2
chr2	139429277	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:139429277_C_CA:139429277:0,2,0,1
chr2	139429278	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:139429277_C_CA:139429277:0,2,0,1
chr2	140992337	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=84.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,9:0,17:0,0,21,6
chr2	140997197	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	141027926	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,15:0.326:47:20,4:12,11:11,21,5,10
chr2	141032220	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	141092225	.	GAA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141092225_GAA_G:141092225:0,1,0,1
chr2	141092228	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141092225_GAA_G:141092225:0,1,0,1
chr2	141245333	.	T	TAAAGAAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:141245333_T_TAAAGAAG:141245333:0,3,0,1
chr2	141245334	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:141245333_T_TAAAGAAG:141245333:0,3,0,1
chr2	141245337	.	T	TAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:141245333_T_TAAAGAAG:141245333:0,3,0,1
chr2	141245342	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:141245333_T_TAAAGAAG:141245333:0,2,0,1
chr2	141253408	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	141259528	.	TA	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=220,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:141259528_TA_CC:141259528:0,1,0,1
chr2	141259531	.	C	CCACAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=220,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:141259528_TA_CC:141259528:0,1,0,1
chr2	141259532	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=220,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:141259528_TA_CC:141259528:0,1,0,1
chr2	141283603	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr2	141294285	.	GAAAA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=141,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:1,2:1,0:1,14,1,1
chr2	141298635	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=152,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.792:17:1,9:2,5:0,3,5,9
chr2	141298674	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:3,1:8,3:0|1:141298674_T_C:141298674:4,7,0,4
chr2	141298682	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:2,1:7,2:0|1:141298674_T_C:141298674:4,7,0,4
chr2	141298728	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=143,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141298728_A_T:141298728:0,1,0,1
chr2	141298733	.	T	TATAAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=143,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141298728_A_T:141298728:0,1,0,1
chr2	141299317	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,2:3,4:2,1,6,0
chr2	141356372	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,64;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:2,4:8,0:4,6,3,1
chr2	141359287	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	141473505	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=80.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,7:0,16:0,0,17,6
chr2	141474402	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	141474456	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	141527013	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	141528592	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr2	141533662	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,8:0,0,15,4
chr2	141571440	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	141571456	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.795:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	141598473	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,11,0
chr2	141625630	.	TA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,7:0.198:36:16,2:11,5:27,2,7,0
chr2	141739813	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=113,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.217:12:6,2:4,0:6,4,1,1
chr2	141773533	.	G	GATGTATGCGTTTGCAGTGAGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	141806500	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,127;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:10,2:2,0:10,2,2,0
chr2	141945949	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr2	141987087	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,5:1,4:1,2,0,9
chr2	142012027	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr2	142237868	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	142238112	.	T	TGGGTATGACGAAGGA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=144,54;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:14,1:4,2:2,17,1,2
chr2	142888376	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=176,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	143676141	.	AT	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.398:29:10,6:6,4:16,1,10,2
chr2	143713700	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,0:3,6:5,1,5,1
chr2	143787152	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=170,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:11,1,1,1
chr2	143787161	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,6:0,0,16,2
chr2	143787274	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,14:0,0,6,24
chr2	143913004	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	143973860	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=109.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,16:0,0,31,1
chr2	144193151	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.815:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr2	144244968	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=123,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,0:8,2:9,8,1,1
chr2	144276944	.	G	GGGAGCCAC	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.093:28:13,2:13,0:0|1:144276944_G_GGGAGCCAC:144276944:9,17,0,2
chr2	144276946	.	A	ACATACTGGGCCTAG	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.096:28:12,1:13,0:0|1:144276944_G_GGGAGCCAC:144276944:9,17,0,2
chr2	144903385	.	T	TTC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=189,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr2	144903389	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=156,217;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:0,5,0,1
chr2	144903397	.	A	ACCCGATGCTGCCTCGCCTCTGTTCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=221,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0,3,0,1
chr2	144936654	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=220,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	145146503	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,26;MFRL=178,87;MMQ=60,34;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:0,0:2,1:0,5,0,2
chr2	145255431	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=228,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.632:2:1,0:0,1:0|1:145255431_TA_T:145255431:0,1,0,1
chr2	145255438	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=228,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.623:2:1,0:0,1:0|1:145255431_TA_T:145255431:0,1,0,1
chr2	145255440	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=228,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.623:2:1,0:0,1:0|1:145255431_TA_T:145255431:0,1,0,1
chr2	148674797	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:6,9:5,11:10,1,17,3
chr2	148716428	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,38:0.557:68:18,20:12,18:10,20,7,31
chr2	148733548	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.817:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	149240657	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	149247563	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=140,69;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:0|1:149247563_T_C:149247563:5,7,1,1
chr2	149247567	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=140,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:0|1:149247563_T_C:149247563:5,7,1,1
chr2	149247576	.	C	CTCCCCTTATT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=145,69;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:3,0:5,2:0|1:149247563_T_C:149247563:6,3,1,1
chr2	149520214	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.428:33:9,7:9,6:12,7,13,1
chr2	149633133	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,0:0|1:149633133_T_TG:149633133:0,0,1,0
chr2	149633138	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,0:0|1:149633133_T_TG:149633133:0,0,1,0
chr2	149633142	.	C	CGGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,6;RU=G;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.681:1:0,0:0,0:0|1:149633133_T_TG:149633133:0,0,1,0
chr2	149639294	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=106.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,37:0.875:42:2,15:3,22:5,0,31,6
chr2	149639328	.	T	C	.	.	DP=253;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=158,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=764.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,242:0.976:247:3,100:2,132:5,0,170,72
chr2	149798213	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:1,8,0,6
chr2	149803357	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=211,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,3:3,0,8,0
chr2	149838132	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:4,0:0,2:0,5,0,2
chr2	149853960	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	150069645	.	CGT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=112,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:8,1:10,1:2,16,0,2
chr2	150320627	.	TAA	T,TA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=25,31,32;MFRL=131,169,124;MMQ=60,60,60;MPOS=3,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=14.49,48.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,11,24:0.257,0.613:40:2,3,13:3,6,11:3,2,33,2
chr2	150426399	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	150427516	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,18,0
chr2	150432377	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,3,22
chr2	150433128	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	150435889	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,0:0,0,5,1
chr2	150443689	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=56.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,9:0,0,6,11
chr2	151326521	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=143,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:10,2:0|1:151326521_T_C:151326521:20,6,1,1
chr2	151326529	.	T	TGG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=142,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:11,0:13,2:0|1:151326521_T_C:151326521:19,6,1,1
chr2	151328284	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=16,18;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.815:8:0,1:0,2:0,1,1,6
chr2	151900223	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr2	151900390	.	TAAAAACAAAAAC	T,TAAAAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30,31;MFRL=0,168,209;MMQ=60,60,60;MPOS=18,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,4,5;RU=AAAAAC;STR;TLOD=11.73,7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.524,0.373:5:0,3,1:0,0,1:0,0,1,4
chr2	152108261	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	152117780	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=114,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:3,5:8,6:8,3,9,2
chr2	152118338	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:3,1:1,5,0,5
chr2	152139271	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=199,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:1,2:5,0,2,0
chr2	152139493	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,20:0.396:51:13,4:18,16:6,25,3,17
chr2	152267072	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.516:18:2,3:4,6:2,7,2,7
chr2	152267672	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,18:0,9:0,0,27,0
chr2	152267721	.	AT	A,ATT	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=30,30,31;MFRL=152,155,146;MMQ=60,60,60;MPOS=16,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=66.63,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,35,4:0.472,0.064:72:19,20,0:13,14,4:27,6,29,10
chr2	152267897	.	G	GT	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,30:0.492:61:22,13:6,12:1,30,0,30
chr2	152273503	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=200,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr2	152289767	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=177,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,4:3,1:1,6,0,5
chr2	152292179	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	152293320	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:4,2:2,1:6,0,2,1
chr2	152295141	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,9:4,5:8,0,9,5
chr2	152298562	.	T	TTTTTA,TTTTTATTTTATTTTA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,175,153;MMQ=60,40,40;MPOS=10,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,8,10;RU=TTTTA;STR;TLOD=23.48,7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,3:0.656,0.288:9:0,3,2:0,3,0:0,0,0,9
chr2	152300286	.	G	GAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=206,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	152303171	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	152308309	.	T	TTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:152308309_T_TTC:152308309:0,1,0,1
chr2	152308311	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:152308309_T_TTC:152308309:0,1,0,1
chr2	152308312	.	T	TTTACCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:152308309_T_TTC:152308309:0,1,0,1
chr2	152311768	.	T	TTTTGCCTTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:152311768_T_TTTTGCCTTC:152311768:1,1,0,1
chr2	152311769	.	A	ATGGCCTTTATT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:152311768_T_TTTTGCCTTC:152311768:1,1,0,1
chr2	152311771	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:152311768_T_TTTTGCCTTC:152311768:1,1,0,1
chr2	152314547	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	152318667	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,153;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr2	152318713	.	TATC	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:11,7:4,4:11,4,10,1
chr2	152322095	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,13,7
chr2	152342481	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:152342481_A_G:152342481:0,0,0,5
chr2	152342487	.	G	GGGAGTGTGAAGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=250,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:2,1:0,0:0|1:152342481_A_G:152342481:0,2,0,1
chr2	152348842	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,5:6,1:8,3,4,2
chr2	152349026	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr2	152350462	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	152353395	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,7:3,3:8,0,10,0
chr2	152354239	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=121,135;MMQ=54,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.488:31:5,9:10,6:6,10,2,13
chr2	152370233	.	A	AAAAATATTGGGACAAACCCAAAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=137,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0|1:152370233_A_AAAAATATTGGGACAAACCCAAAT:152370233:0,1,0,1
chr2	152370238	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:152370233_A_AAAAATATTGGGACAAACCCAAAT:152370233:0,2,0,1
chr2	152374800	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,17:0,12:0,0,22,7
chr2	152381859	.	G	GTGTGGTCACTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	152382454	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,11:0,11:0,0,15,9
chr2	152383913	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	152388228	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr2	152388415	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=47.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,5,9
chr2	152394534	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,0,15
chr2	152402999	.	G	GAATGACTTTATTGAATATGAACTTAATAAATAAATGAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=155,90;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr2	152403014	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=197,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr2	152404294	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:6,2:9,4:1,14,0,7
chr2	152406241	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,36321096;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:8,0:3,19,0,2
chr2	152411476	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,1:11,1:8,12,1,1
chr2	152421937	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.505:16:5,4:2,3:8,0,8,0
chr2	152475938	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:6,0,2,1
chr2	152483577	.	GTAA	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=141,8903;MMQ=52,21;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,2:8,0:0|1:152483577_GTAA_G:152483577:8,7,2,0
chr2	152483582	.	TTTCAG	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=141,8903;MMQ=53,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,2:9,0:0|1:152483577_GTAA_G:152483577:8,9,2,0
chr2	152483592	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,36;MFRL=145,8903;MMQ=53,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,2:9,0:0|1:152483577_GTAA_G:152483577:8,8,2,0
chr2	152483595	.	GG	AC	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=141,8903;MMQ=52,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:8,0:0|1:152483577_GTAA_G:152483577:7,8,2,0
chr2	152483598	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=141,8903;MMQ=52,21;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:8,0:0|1:152483577_GTAA_G:152483577:7,8,2,0
chr2	152499580	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,243;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:3,0,2,3
chr2	152511778	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr2	152520027	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,3:0,7:1,0,8,2
chr2	152522556	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=226,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr2	152522986	.	A	ATACCGCTCAAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	152525471	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=190,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	152531781	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,3:6,6:5,5,6,3
chr2	152536180	.	AAG	CCC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,1:0,2:0|1:152536180_AAG_CCC:152536180:3,2,3,0
chr2	152536186	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:1,2:0|1:152536180_AAG_CCC:152536180:4,2,2,0
chr2	152536190	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:2,1:0|1:152536180_AAG_CCC:152536180:5,4,2,0
chr2	152536194	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:152536180_AAG_CCC:152536180:5,4,2,0
chr2	152536427	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=57,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.710:29:3,12:5,9:7,1,14,7
chr2	152539370	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:3,0:0,1:0|1:152539370_T_C:152539370:0,3,0,1
chr2	152539376	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:152539370_T_C:152539370:0,1,0,1
chr2	152539379	.	C	CTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:152539370_T_C:152539370:0,1,0,1
chr2	152551210	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr2	152552029	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,1:3,6:3,0,7,0
chr2	152563346	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,2:2,0:3,0,3,0
chr2	152563588	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	152573902	.	A	AGGC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGC;STR;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,4:5,1:6,6,3,2
chr2	152580766	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:5,10:2,3:4,3,5,8
chr2	152581866	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:5,3:2,2:8,0,5,0
chr2	152584153	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	152671754	.	G	GA	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=116.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,51:0.622:82:18,31:12,14:2,29,3,48
chr2	152684704	.	A	AC	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.664:33:7,7:3,4:7,4,6,16
chr2	152725790	.	CAG	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.114:23:8,1:13,1:4,17,0,2
chr2	152955071	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,13;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:3,0:3,7,2,0
chr2	152988610	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:3,4:4,3:7,0,2,5
chr2	153000337	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:6,5:0,2:5,1,5,2
chr2	153001330	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:7,2:6,0:15,0,2,0
chr2	153001340	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=139,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.200:19:8,4:7,0:13,2,2,2
chr2	153001343	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=138,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.127:22:12,2:7,0:15,5,1,1
chr2	153001359	.	GAT	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=149,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=73.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.710:29:6,9:1,12:4,4,12,9
chr2	153004816	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.282:21:6,0:6,4:0,15,0,6
chr2	153192324	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:0,8,0,8
chr2	153415170	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	153415234	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,3,1
chr2	153415244	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr2	153415376	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr2	153417325	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	153464021	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.732:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr2	153473521	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=197,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr2	153473794	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,5:3,3:0,3,0,8
chr2	153475263	.	GTA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:6,7:0,4:6,0,11,0
chr2	153476066	.	G	GCCA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr2	153481943	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,8,9
chr2	153483257	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,3:4,1:0,8,0,4
chr2	153492910	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=142,94;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,1:3,3:5,2,2,2
chr2	153514583	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,4:2,2:0,7,0,6
chr2	153519524	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.436:19:5,6:4,2:9,2,8,0
chr2	153519768	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	153520782	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,18:0.361:51:20,8:11,9:9,24,1,17
chr2	153520819	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:9,4:7,6:1,15,0,10
chr2	153535670	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=179.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,20:0,32:0,0,11,42
chr2	153572438	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,18,0
chr2	153576580	.	A	ATTTC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:7,2:1,4:0,8,0,6
chr2	153577013	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,4:6,4:11,2,6,2
chr2	154334687	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr2	155265623	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr2	155306885	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr2	157183211	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr2	157352734	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:6,1:8,2:3,12,0,4
chr2	157370018	.	G	GTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=197,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.389:8:2,2:1,1:0,5,2,1
chr2	157370066	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	157406296	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,14:0,0,8,19
chr2	157425549	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:157425549_C_T:157425549:0,2,0,1
chr2	157425552	.	GAGGGT	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:157425549_C_T:157425549:0,2,0,1
chr2	157425561	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:157425549_C_T:157425549:0,2,0,1
chr2	157425801	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr2	157426114	.	ACTGGCAGCAAT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=206,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:2,1:1,5,1,3
chr2	157427593	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	157427837	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr2	157427850	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	158140717	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	158165004	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr2	158275111	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31,30,18;MFRL=174,139,149,145;MMQ=60,60,60,60;MPOS=30,33,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,15,16,18;RU=A;STR;TLOD=3.09,4.82,5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,3,4:0.199,0.271,0.331:11:2,2,2,1:0,0,1,1:1,1,1,8
chr2	158291107	.	TAG	T,TAGAG	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=29,28,29;MFRL=140,125,142;MMQ=60,60,60;MPOS=29,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=AG;STR;TLOD=12.00,25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,7,19:0.180,0.594:33:2,3,3:3,3,11:5,2,25,1
chr2	158395079	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=88.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,23,2
chr2	158400908	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr2	158401137	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,12:0,18:0,0,6,24
chr2	158485001	.	C	CGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=20,12;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:158485001_C_CGG:158485001:0,1,1,0
chr2	158485002	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,17;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:158485001_C_CGG:158485001:0,1,1,0
chr2	158485004	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:158485001_C_CGG:158485001:0,1,1,0
chr2	158637137	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.799:8:1,2:0,2:0,1,0,7
chr2	158655883	.	C	CA,CAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,156,178;MMQ=60,60,60;MPOS=14,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=4.84,17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,8:0.285,0.651:11:0,2,4:0,1,4:0,0,11,0
chr2	158962668	.	C	G	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=137,91;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,7:0.105:73:29,6:36,1:29,37,5,2
chr2	158978178	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:9,8:11,5:0,20,0,13
chr2	159028664	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=143,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,17:0.380:45:9,8:18,8:16,12,9,8
chr2	159028721	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:4,6:10,6:4,10,1,12
chr2	159028800	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	159077019	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr2	159201633	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr2	159214901	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr2	159459606	.	G	C	.	.	DP=116;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,4:0.043:115:56,2:54,2:55,56,3,1
chr2	159478028	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,179;MMQ=42,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:0,19,0,2
chr2	159498940	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr2	159522879	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr2	159526188	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,1:4,9:6,1,10,0
chr2	159530546	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=186,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,6:0,5:2,0,1,10
chr2	159672168	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr2	159683021	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.882:13:0,8:1,3:1,0,2,10
chr2	160019826	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.127:45:28,4:12,1:35,5,5,0
chr2	160019863	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=191.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,35:0,21:0,0,38,18
chr2	160019934	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.065:58:28,3:21,0:12,43,2,1
chr2	160042430	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:5,10:7,3:4,8,4,9
chr2	160055448	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:4,2,4,0
chr2	160074150	.	G	GAGAGTTGATATGTAGTTCCAGTCT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=150,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.148:24:9,2:12,1:5,16,1,2
chr2	160075886	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.605:16:0,5:6,5:1,5,2,8
chr2	160082354	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr2	160082364	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=182,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr2	160082384	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr2	160084263	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	160084534	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	160087535	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,9:0,12:0,0,2,20
chr2	160116281	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,22:0.311:72:27,10:22,12:29,21,15,7
chr2	160132196	.	A	AC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=64.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,12:0,8:0,0,0,22
chr2	160136337	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=149.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,44:0.979:44:0,23:0,21:0|1:160136337_G_A:160136337:0,0,25,19
chr2	160136345	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,5:0.122:47:23,2:19,3:0|1:160136337_G_A:160136337:24,18,2,3
chr2	160176943	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=179.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,22:0,25:0,0,12,35
chr2	160182074	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr2	160188955	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=198,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,1:8,2:11,0,3,0
chr2	160193370	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:1,0,8,0
chr2	160203934	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr2	160229693	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:5,0:10,2:4,11,1,1
chr2	160231108	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	160241936	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr2	160243183	.	TA	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	160255367	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=117,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:9,2:0|1:160255367_T_G:160255367:13,9,0,2
chr2	160255368	.	TTG	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=117,101;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,0:9,1:0|1:160255367_T_G:160255367:12,10,0,2
chr2	160261729	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	160285660	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:13,8:7,7:20,0,15,0
chr2	160303581	.	AATATG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	160304741	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.411:42:11,9:13,8:12,13,10,7
chr2	160585740	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,0,20
chr2	160634564	.	ACC	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=70.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.954:16:0,11:0,5:0,0,0,16
chr2	160634582	.	TAATATC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr2	160637324	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr2	160640078	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=218,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	160663678	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,3,14
chr2	160676427	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,4,13
chr2	160676445	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr2	160688351	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0,3,0,4
chr2	160691978	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=195,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:5,0,4,0
chr2	160698700	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr2	160708645	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:1,2,4,0
chr2	160708933	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=145,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.791:12:0,5:0,2:0,2,0,10
chr2	160709922	.	T	C	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,5:0.077:76:34,0:36,5:11,60,0,5
chr2	160711556	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	160714990	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,0:3,4:1,6,0,4
chr2	160729134	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	160729186	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	160735008	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,5:2,6:0,2,4,7
chr2	160737495	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	160737560	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	160746800	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=137,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,2:4,6:4,2,2,6
chr2	160840370	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,8:0,0,7,1
chr2	160862094	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr2	160873270	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	160873294	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	160876827	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	160889673	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,0,17
chr2	160918755	.	CGA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.328:12:2,2:2,1:3,5,4,0
chr2	160958349	.	GAA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=54.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr2	160968743	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.922:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	161349727	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.787:2:0,0:0,0:0|1:161349727_T_A:161349727:0,0,2,0
chr2	161349732	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=103,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.606:3:0,1:0,0:0|1:161349727_T_A:161349727:1,0,2,0
chr2	162059969	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=177.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,29:0,20:0,0,44,7
chr2	162060022	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=136,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,3:0.051:76:41,2:32,1:36,37,3,0
chr2	162080591	.	CA	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.095:39:17,2:19,1:0,36,0,3
chr2	162081128	.	AT	A,ATT	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=31,31,34;MFRL=167,148,187;MMQ=60,60,60;MPOS=17,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.19,3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:42,5,4:0.105,0.092:51:19,3,2:21,1,1:38,4,8,1
chr2	162091836	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=110.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.943:33:0,16:1,16:1,0,28,4
chr2	162175290	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,18,5
chr2	162224193	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr2	162247772	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr2	162273201	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=153,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,1:6,3:3,5,1,3
chr2	162280117	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=140,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	162280748	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,8:0,0,2,17
chr2	162728996	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=202,268;MMQ=60,55;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr2	162821515	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=209,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,5:3,3:7,0,8,0
chr2	162873188	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=214,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr2	162877041	.	C	CA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,0:11,2:16,3,2,1
chr2	162881299	.	C	CCATG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,17;MFRL=138,37;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0|1:162881299_C_CCATG:162881299:3,0,1,1
chr2	162881302	.	A	AACCCACCACC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=138,37;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:162881299_C_CCATG:162881299:3,0,1,1
chr2	162881304	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=136,37;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:162881299_C_CCATG:162881299:4,0,1,1
chr2	162881307	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=136,37;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.366:6:1,0:3,2:0|1:162881299_C_CCATG:162881299:4,0,1,1
chr2	162881474	.	A	AATGGCTAGAGCTGTTGTTGTCTATG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=152,84;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr2	162891848	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:1,5,1,7
chr2	162894996	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	162901978	.	TC	AT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:23,4:15,0:37,5,4,0
chr2	163030336	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=139,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:6,4:14,3:8,12,1,6
chr2	163039858	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:26,3:35,0:46,15,2,1
chr2	163059420	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,3:8,0:12,7,2,1
chr2	163099691	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=202,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:3,1,0,1
chr2	163292149	.	A	ACACAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=168,209;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr2	163292181	.	ACAAAAAC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:163292181_ACAAAAAC_A:163292181:0,0,0,1
chr2	163292191	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:163292181_ACAAAAAC_A:163292181:0,0,0,1
chr2	163361126	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:26,0:18,3:20,24,0,3
chr2	163694878	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	163694886	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	164468414	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=232,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr2	165358655	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:6,0,4,0
chr2	165358672	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,17,0
chr2	165364887	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=226,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr2	165378427	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:9,4:10,1:17,2,5,0
chr2	165381542	.	C	A	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=119,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,38:0.432:88:28,20:22,17:25,25,23,15
chr2	165557318	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	165578581	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:4,3:8,1:9,4,3,1
chr2	165586346	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr2	165630100	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	165694012	.	C	CA	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,11:0.172:63:27,4:22,5:18,34,1,10
chr2	165811641	.	TAGGTGACCTGACCTGTTGCA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,140;MMQ=60,51;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:6,2:7,0:12,9,0,2
chr2	166012203	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr2	166018764	.	C	CT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:24,3:13,1:33,6,4,0
chr2	166153499	.	A	G	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=302.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,84:0.989:84:0,49:0,32:0,0,67,17
chr2	166170073	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=181,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr2	166170127	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,16,3
chr2	166172317	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=51.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr2	166179650	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr2	166221569	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	166229922	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr2	166231571	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=241,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:166231571_T_TG:166231571:0,1,0,1
chr2	166231572	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=241,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:166231571_T_TG:166231571:0,1,0,1
chr2	166234076	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,4:6,4:8,1,6,2
chr2	166246310	.	A	ACTCTACAGATCAAAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.408:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr2	166514594	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	166535621	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=68,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:1,5,0,3
chr2	166611086	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=92,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,4:3,3:2,1,7,0
chr2	166621354	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:0,7:1,4:1,0,11,2
chr2	166740578	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=232,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:0,6,1,3
chr2	166758447	.	T	TA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=17,16;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.259:19:5,1:2,1:1,13,1,4
chr2	166764327	.	ATT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=160,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:166764327_ATT_A:166764327:0,4,0,1
chr2	166764331	.	ATCT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=191,89;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:166764327_ATT_A:166764327:0,3,0,1
chr2	166764336	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=191,89;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:166764327_ATT_A:166764327:0,3,0,1
chr2	166764346	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=191,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	166785895	.	TTTA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:166785895_TTTA_T:166785895:0,1,0,1
chr2	166785903	.	CA	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:166785895_TTTA_T:166785895:0,1,0,1
chr2	166797450	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	166797646	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,8:0,0,11,10
chr2	166799893	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,5:0,0,0,13
chr2	166894209	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=193,195;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:6,3:4,3:11,0,6,0
chr2	166896114	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,6:0.131:51:21,0:24,6:6,39,1,5
chr2	166896178	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	166897982	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:166897982_A_T:166897982:1,3,0,1
chr2	166897983	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=17,31;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:1,0:0|1:166897982_A_T:166897982:1,3,0,1
chr2	166897984	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=15,20;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:0,1:1,2,0,1
chr2	166903188	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=14,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr2	166930214	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	167060449	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,17,3
chr2	167060980	.	GAAAC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=93.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,14:0,0,1,20
chr2	167082978	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,11:0,0,18,0
chr2	167085124	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	167085141	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr2	167090042	.	G	A,GGCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32,33;MFRL=0,154,163;MMQ=60,60,60;MPOS=22,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.38,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,1:0.673,0.220:6:0,0,1:0,5,0:0,0,0,6
chr2	167137119	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=127,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:1,3,1,4
chr2	167149693	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,6:1,0:5,1,5,1
chr2	167162277	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.420:15:6,2:1,4:9,0,6,0
chr2	167163372	.	TC	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=211,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:3,3:8,0,6,0
chr2	167163663	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,3:7,4:0,11,0,7
chr2	167168280	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,75;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:7,2:4,0:0|1:167168280_AT_A:167168280:1,12,1,1
chr2	167168287	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=150,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:7,1:5,0:0|1:167168280_AT_A:167168280:1,13,1,1
chr2	167261996	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	167262088	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:9,3:2,5:11,0,8,0
chr2	167262353	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,102;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,4:7,10:8,5,6,8
chr2	167263204	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,3:6,7:0,14,0,10
chr2	167284531	.	C	CTGATCATCCTCCAAGGGGTCAAGATTGACACACCCTGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=177,202;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr2	167285862	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=203,114;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	167285867	.	G	GGCTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=225,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	167300262	.	GAC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=86,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AC;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	167321931	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.441:41:13,8:10,10:20,3,14,4
chr2	167328750	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.950:17:0,5:0,10:0|1:167328750_C_T:167328750:0,0,16,1
chr2	167328754	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.350:21:4,3:9,4:0|1:167328750_C_T:167328750:12,2,6,1
chr2	167334234	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:7,6:1,10:2,6,2,14
chr2	168041152	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=103.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,9,19
chr2	168102730	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:3,0:11,2:5,11,0,2
chr2	168103623	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=162,126;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:11,0:12,3:12,11,0,3
chr2	168920072	.	G	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,5:0.083:70:32,0:31,5:27,38,0,5
chr2	168986154	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=127.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,18:0,18:0,0,17,19
chr2	168986376	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	168986391	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=197,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:168986391_G_A:168986391:0,4,0,1
chr2	168986393	.	A	AATTGGCACTATTTTATTCGGTGCCAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=197,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:168986391_G_A:168986391:0,4,0,1
chr2	169487610	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.808:19:2,10:1,6:0,3,1,15
chr2	169487668	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	169668030	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,0:1,2:7,2,2,0
chr2	169681278	.	T	TTTTGTTTG	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=142,145;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=TTTG;STR;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.423:15:5,3:2,4:0,8,0,7
chr2	169681301	.	T	TG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=145,92;MMQ=60,41;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:14,2:7,0:0,21,0,2
chr2	169681302	.	T	TTTGTTTTCCTTTTC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=145,92;MMQ=60,41;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,2:7,0:0,21,0,2
chr2	169713384	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=150,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169713384_C_T:169713384:0,1,0,1
chr2	169713391	.	A	AGGGTCTCACTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,227;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169713384_C_T:169713384:0,1,0,1
chr2	169721377	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:6,2:3,5:0|1:169721377_G_A:169721377:5,4,6,2
chr2	169721381	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=146,110;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:6,1:3,4:0|1:169721377_G_A:169721377:5,4,6,1
chr2	169727849	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=193,181;MMQ=51,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:16,0,2,0
chr2	169727876	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=170,191;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,2:13,0:24,0,2,0
chr2	169727879	.	G	GA	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=142,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.415:22:4,6:9,3:13,0,9,0
chr2	169728069	.	GAAA	G,GA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=36,18,16;MFRL=166,137,142;MMQ=60,60,60;MPOS=21,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=A;STR;TLOD=24.15,3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,16,3:0.715,0.165:21:1,3,0:0,2,0:1,1,3,16
chr2	169763148	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:3,4:8,0:10,1,4,0
chr2	169764176	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,184;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:18,1:7,4:14,12,4,1
chr2	169780366	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr2	169788789	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=193,224;MMQ=40,32;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr2	169788825	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=172,228;MMQ=40,29;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:2,1:8,1:10,0,2,0
chr2	169801488	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=46.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,17:0.368:47:13,8:16,9:7,23,7,10
chr2	169814647	.	G	GTGAAGGTGACGGCCTAAGGTCCCACGGCCAATCACAGACAGAGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=177,136;MMQ=60,46;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	169814655	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,35;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr2	169820618	.	AT	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:6,0,6,0
chr2	169826465	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,14;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:169826465_A_AC:169826465:1,0,1,0
chr2	169826466	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,13;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:169826465_A_AC:169826465:1,0,1,0
chr2	169826469	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:169826465_A_AC:169826465:1,0,1,0
chr2	169826479	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:169826465_A_AC:169826465:1,0,1,0
chr2	169836326	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr2	169836333	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=126,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:0,0:1,1:2,1,2,0
chr2	169836441	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:1,1:3,6,0,2
chr2	169842809	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:1,2,0,3
chr2	170012744	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,251;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:10,5,2,0
chr2	170033152	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0|1:170033152_A_AG:170033152:0,3,0,1
chr2	170033160	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=92,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:170033152_A_AG:170033152:0,2,0,1
chr2	170050472	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=176,80;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	170055255	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:4,0,4,0
chr2	170059190	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr2	170077170	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	170129636	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	170131833	.	C	CCACATAGTAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr2	170134191	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	170139346	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,14,1
chr2	170145733	.	A	ACATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=197,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	170147266	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	170148745	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,2:3,8:5,1,5,5
chr2	170218816	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr2	170218847	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr2	170336024	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr2	170338681	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:8,4:8,2:17,0,6,0
chr2	170344193	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.538:22:4,3:6,8:10,0,11,1
chr2	170344686	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=157,68601659;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:18,0:11,2:0,33,0,2
chr2	170344691	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=157,68601659;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:17,0:12,2:0,31,0,2
chr2	170344706	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=177,68601659;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:0,21,0,2
chr2	170349560	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=215,239;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:170349560_T_G:170349560:0,3,0,1
chr2	170349566	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=215,239;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:170349560_T_G:170349560:0,3,0,1
chr2	170360765	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.598:18:5,3:2,7:3,4,6,5
chr2	170371060	.	ATCTC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=167,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=TC;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,2:1,0:2,0,2,0
chr2	170371545	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.408:13:5,4:1,1:0,8,0,5
chr2	170374607	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	170393919	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:170393919_GT_G:170393919:0,0,0,2
chr2	170393922	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=172,217;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170393919_GT_G:170393919:0,1,0,1
chr2	170393925	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=217,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170393919_GT_G:170393919:0,1,0,1
chr2	170393933	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=217,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:170393919_GT_G:170393919:0,1,0,1
chr2	170396718	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.347:33:9,10:10,1:1,21,1,10
chr2	170417031	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:8,4:9,11:7,10,8,7
chr2	170419652	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=217,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr2	170465107	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:7,0,4,0
chr2	170471270	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:7,6:14,16:0,21,1,21
chr2	170488454	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	170489566	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=201,170;MMQ=40,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:12,1,2,0
chr2	170492567	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,16:0,8:0,0,21,4
chr2	170492584	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=152.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,23:0,18:0,0,29,13
chr2	170493103	.	T	A	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=295.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,86:0.989:86:0,47:0,39:0,0,49,37
chr2	170505684	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=127.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,20:0,16:0,0,31,6
chr2	170510651	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=112,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.404:30:7,7:11,5:4,14,5,7
chr2	170531135	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,13;MFRL=167,77;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:5,0:0|1:170531135_C_A:170531135:16,2,2,0
chr2	170531144	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=22,14;MFRL=151,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:7,0:0|1:170531135_C_A:170531135:16,6,2,0
chr2	170531572	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=253.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,35:0,34:0,0,8,61
chr2	170531614	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:0,16:1,12:0,1,0,28
chr2	170550727	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=128,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.497:26:6,9:6,3:10,3,11,2
chr2	170632896	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,18:0.439:41:17,10:6,7:18,5,15,3
chr2	170632960	.	C	CA,CAA	.	.	DP=56;ECNT=6;MBQ=32,33,34;MFRL=128,142,170;MMQ=60,60,60;MPOS=28,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=A;STR;TLOD=47.77,3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,19,3:0.430,0.083:45:10,11,1:11,7,2:12,11,12,10
chr2	170632969	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,24:0.484:50:12,14:13,10:14,12,13,11
chr2	170633023	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:7,8:7,7:3,11,3,12
chr2	170633067	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,5:2,4:0,7,0,9
chr2	170633103	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	170657374	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=188,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr2	170662416	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:1,6,0,3
chr2	170664983	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.354:37:9,4:15,8:12,12,7,6
chr2	170665108	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr2	170665418	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,16:0.293:56:19,9:21,7:10,30,3,13
chr2	170665435	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,15:0.320:48:21,6:12,8:8,25,3,12
chr2	170667911	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:0,5,1,4
chr2	170668106	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=141.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,22:0,18:0,0,38,2
chr2	170668813	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,176;MMQ=48,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr2	170676227	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,0,18
chr2	170678476	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.572:24:6,9:4,3:3,7,5,9
chr2	170678591	.	T	TGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=203,308;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:170678591_T_TGA:170678591:0,3,0,1
chr2	170678595	.	TA	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=203,308;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:170678591_T_TGA:170678591:0,3,0,1
chr2	170684224	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	170728897	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.358:37:13,8:11,5:7,17,4,9
chr2	170751886	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.379:19:7,2:5,5:1,11,0,7
chr2	170762487	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,9:0,5:0,0,9,6
chr2	170780532	.	CT	C	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,4:0.068:69:26,3:31,1:33,32,4,0
chr2	170780657	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,23:0.387:60:16,7:21,16:9,28,5,18
chr2	170782037	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr2	170782338	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	170783092	.	CAAAAACA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAAACA;STR;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.934:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr2	170783812	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.341:45:13,10:16,5:22,8,11,4
chr2	170789504	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,14:0.288:50:12,6:24,8:18,18,7,7
chr2	170802707	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:9,14:3,4:12,0,18,0
chr2	170802741	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,21:0.431:49:18,16:10,5:24,4,19,2
chr2	170850738	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	170863471	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.537:15:5,1:1,7:5,2,5,3
chr2	170871976	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr2	170917983	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr2	171055942	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr2	171055969	.	T	TAGAGCAC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	171056569	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr2	171070810	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr2	171071369	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=198,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr2	171071379	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=132,124;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	171071391	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=132,124;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:171071391_G_GA:171071391:0,1,0,1
chr2	171071393	.	C	CAAAAGCCA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=132,124;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:171071391_G_GA:171071391:0,1,0,1
chr2	171071397	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:171071391_G_GA:171071391:0,0,0,1
chr2	171092445	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:5,0,3,0
chr2	171225841	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,24:0.568:42:7,14:11,10:11,7,14,10
chr2	171225855	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=132,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:19,3:21,0:22,20,3,0
chr2	171239560	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr2	171242865	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr2	171242878	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=190,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr2	171249093	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr2	171256597	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	171257945	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.745:14:2,2:1,7:3,0,8,3
chr2	171260708	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	171319997	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,6:0,0,2,10
chr2	171323280	.	CTGTGTCCTAAGAT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	171356382	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=187,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:171356382_T_G:171356382:0,1,0,1
chr2	171356385	.	T	TATAGAGGTTTCTGAGACAGGTGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=187,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:171356382_T_G:171356382:0,1,0,1
chr2	171358211	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	171358474	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	171508490	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr2	171570488	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	171572940	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	171654663	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	171786169	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=113.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,18:0,19:0,0,36,1
chr2	171786265	.	A	G	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,3:0.048:80:29,1:42,2:27,50,1,2
chr2	171813155	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:171813155_T_C:171813155:0,4,0,1
chr2	171813158	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:171813155_T_C:171813155:0,4,0,1
chr2	171818289	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,4,9
chr2	171850201	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=21,27;MFRL=198,220;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:1,0:1,2:0|1:171850201_G_A:171850201:3,0,3,0
chr2	171850207	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=170,233;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0|1:171850201_G_A:171850201:3,0,2,0
chr2	171850212	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=198,208;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.397:5:1,0:1,1:3,0,2,0
chr2	171850216	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=170,222;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:6,0,2,0
chr2	171862896	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=177,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:4,2:2,0:2,4,2,0
chr2	171902604	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	171906775	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,4:1,0:1,3,0,4
chr2	171911712	.	G	C	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=135,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,13:0.174:73:13,0:17,1:17,43,0,13
chr2	171911713	.	CAA	C	.	.	DP=85;ECNT=2;MBQ=19,19;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.139:40:6,0:7,2:3,32,0,5
chr2	171912911	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=72.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,21,0
chr2	171916371	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	172187261	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,1:2,1:0,11,0,3
chr2	172300076	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:17,8,0,2
chr2	172305175	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.521:15:3,5:4,2:0|1:172305175_C_CT:172305175:7,0,8,0
chr2	172305177	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.521:15:3,5:4,3:0|1:172305175_C_CT:172305175:7,0,8,0
chr2	172329458	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:7,8:5,5:6,7,3,10
chr2	172333295	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.645:20:4,6:2,7:7,0,13,0
chr2	172336541	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.651:21:3,6:4,7:3,4,10,4
chr2	172378889	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=227,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr2	172379686	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=176,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:5,0,2,1
chr2	172398311	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=198,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,4:0,0:1,0,2,2
chr2	172409790	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,3:4,5:6,1,8,0
chr2	172549248	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=173.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,25:0,22:0,0,39,9
chr2	172582281	.	A	ATTAC	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,7:0,10:0,0,3,16
chr2	172582344	.	AAC	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,15,3
chr2	172644168	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,0:12,3:4,18,0,3
chr2	172644229	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr2	172683461	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=177,208;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.217:16:4,1:7,1:0,13,0,3
chr2	172691464	.	AGGAGTCTTCAC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.520:2:0,1:0,0:1,0,0,1
chr2	172700852	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:2,0:8,2,2,0
chr2	172712480	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr2	172865009	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,2:0,0,0,9
chr2	172930575	.	A	ACTTTATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	172935562	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=153,288;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,2:7,0:12,1,2,0
chr2	172944079	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:172944079_A_AG:172944079:1,0,0,1
chr2	172944080	.	A	ATGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:172944079_A_AG:172944079:1,0,0,1
chr2	172944083	.	A	AAAG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:172944079_A_AG:172944079:1,0,0,1
chr2	172944086	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:172944079_A_AG:172944079:1,0,0,1
chr2	172944091	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:172944079_A_AG:172944079:0,0,0,1
chr2	172944748	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr2	172950804	.	GAGAGAGAAAGAGAAGA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=306,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	173292725	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=193,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:6,3:9,4:1,15,0,7
chr2	173340344	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=134,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,6:0.070:97:40,4:48,2:38,53,1,5
chr2	173356340	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=172,291;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:173356340_G_T:173356340:0,3,0,1
chr2	173356341	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=172,291;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:173356340_G_T:173356340:0,3,0,1
chr2	173368989	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.380:20:4,2:6,4:1,12,2,5
chr2	173429496	.	TTAGG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=283,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAGG;STR;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:1,2,0,6
chr2	173435578	.	C	CT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=22,19;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.218:23:3,1:10,1:4,14,0,5
chr2	173600783	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr2	173659913	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	173825889	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,72;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,1:15,1:6,18,1,1
chr2	173832116	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=141,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:6,4:8,0:7,7,2,2
chr2	173848200	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:2,3:2,0:5,1,3,0
chr2	173853488	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=127,76;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,2:5,1:3,10,2,1
chr2	173865976	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.647:18:5,7:1,4:5,1,8,4
chr2	173881182	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:1,6,0,4
chr2	173891769	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	174074407	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=67,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr2	174094345	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	174094500	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr2	174104037	.	GAA	G,GA,GAAA,GAAAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,33,33,35,34;MFRL=164,193,195,184,208;MMQ=60,60,60,60,51;MPOS=12,14,18,15;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15,16;RU=A;STR;TLOD=3.49,4.77,4.91,3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:5,3,3,3,2:0.140,0.184,0.215,0.131:16:5,2,2,1,0:0,0,0,2,1:5,0,10,1
chr2	174104067	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.206:28:12,0:4,0:20,2,6,0
chr2	174123399	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=72,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:2,0,7,0
chr2	174131511	.	TA	T,TAAAAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32,15;MFRL=129,137,123;MMQ=60,60,60;MPOS=24,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,21;RU=A;STR;TLOD=3.34,9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,7:0.194,0.583:12:2,0,0:1,2,2:1,2,1,8
chr2	174230153	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=131,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,4:0,5:3,2,7,2
chr2	174230394	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=27,34;MFRL=179,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,3,0,1
chr2	174230399	.	GTT	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230402	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,35;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230405	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=20,35;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230407	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230411	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=27,32;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230413	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=26,28;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230416	.	A	ACC	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,2,0,1
chr2	174230419	.	TGA	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=31,25;MFRL=179,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:174230394_C_G:174230394:0,1,0,1
chr2	174230974	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.467:9:3,0:2,4:4,1,4,0
chr2	174230983	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=130,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.566:7:0,2:3,2:2,1,4,0
chr2	174829848	.	G	A	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,6:0.067:101:42,3:53,3:77,18,5,1
chr2	174943685	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,31:0.603:51:12,20:8,10:17,3,27,4
chr2	174943876	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=196,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:1,10,0,3
chr2	175093978	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.457:44:10,10:14,10:19,5,18,2
chr2	175199895	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=200.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,32:0,26:0,0,10,49
chr2	175202199	.	AGCG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCG;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr2	175213722	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=153,249;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:4,1:9,1:0|1:175213722_C_CT:175213722:7,7,0,2
chr2	175213726	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=153,249;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:4,0:10,1:0|1:175213722_C_CT:175213722:7,7,0,2
chr2	175215287	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	175246386	.	GA	G,GAA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=150,136,151;MMQ=60,60,60;MPOS=25,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=6.82,5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,5,7:0.123,0.158:43:11,2,2:15,2,5:25,6,11,1
chr2	175246545	.	CA	C,CAA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,35,25;MFRL=178,214,155;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.18,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,6,4:0.157,0.115:36:10,4,1:10,2,1:1,25,0,10
chr2	175262970	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	175264627	.	CTTTTT	C,CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32,33;MFRL=0,160,196;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,13,14;RU=T;STR;TLOD=5.43,10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,6:0.337,0.587:9:0,2,4:0,1,1:0,0,8,1
chr2	175264674	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,3:12,0:18,5,3,0
chr2	175265666	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=93.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.935:28:1,14:0,13:1,0,23,4
chr2	175268763	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr2	175287778	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=86.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,15:0,0,6,20
chr2	175289144	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=84.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,23,0
chr2	175292364	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	175292580	.	TTCAAATTTATCAG	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCAAATTTATCAG;STR;TLOD=248.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.985:57:0,23:0,34:0,0,20,37
chr2	175309792	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr2	175318396	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	175324886	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175324886_T_A:175324886:0,1,0,1
chr2	175324891	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175324886_T_A:175324886:0,0,0,1
chr2	175324894	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175324886_T_A:175324886:0,0,0,1
chr2	175324896	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175324886_T_A:175324886:0,0,0,1
chr2	175324902	.	T	TAACTCAAGAAAG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175324886_T_A:175324886:0,0,0,1
chr2	175333632	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:7,3:10,9:12,5,7,5
chr2	175335076	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	175346726	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,32;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175346726_A_AT:175346726:0,1,0,1
chr2	175346728	.	G	GCCCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,33;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:175346726_A_AT:175346726:0,1,0,1
chr2	175346729	.	A	AAAACAAAACC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175346726_A_AT:175346726:0,1,0,1
chr2	175346735	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,30;MFRL=176,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:175346726_A_AT:175346726:0,1,0,1
chr2	175431707	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:8,0,5,0
chr2	175431990	.	AAGAG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=AG;STR;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.620:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	175436940	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,8:0,13:0,0,15,7
chr2	175439512	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,17,0
chr2	175439536	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,6:3,5:9,0,11,0
chr2	175439681	.	TA	T,TAA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,30,30;MFRL=127,141,129;MMQ=60,60,60;MPOS=14,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.05,12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,11:0.125,0.347:29:8,0,6:5,3,2:2,13,2,12
chr2	175613600	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	175622788	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=212.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,26:0,36:0,0,23,39
chr2	175624107	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.536:11:2,4:0,2:0,5,3,3
chr2	175629021	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:4,6:7,7:10,1,10,3
chr2	175673870	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	175677022	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,6:5,6:11,1,10,2
chr2	175686502	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175686502_C_T:175686502:0,0,1,0
chr2	175686510	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:175686502_C_T:175686502:0,0,1,0
chr2	175711162	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=176,70;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:10,0:6,3:2,14,1,2
chr2	175711942	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=222,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	175982957	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:6,2,4,1
chr2	176032334	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.451:25:6,6:6,5:12,2,9,2
chr2	176044008	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:5,2:2,4:1,6,1,5
chr2	176046007	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.489:14:3,1:4,4:5,2,7,0
chr2	176959113	.	G	GCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=248,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=CA;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr2	176988290	.	C	CGCA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCA;STR;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.549:9:1,4:3,0:3,1,2,3
chr2	176988675	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:12,12,2,0
chr2	176994623	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=12,34;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr2	176995960	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,18;MFRL=219,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr2	176996023	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=109,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,4:0,5:1,0,8,1
chr2	177014970	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	177034208	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=149,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:1,0:4,1:5,4,2,0
chr2	177034215	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=143,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:1,0:6,0:6,5,3,0
chr2	177036211	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr2	178098087	.	CA	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=52.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.426:45:8,6:17,12:4,22,1,18
chr2	178301428	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr2	178326838	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:178326838_C_G:178326838:0,0,0,5
chr2	178326847	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0|1:178326838_C_G:178326838:0,0,0,5
chr2	178362572	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,1,14
chr2	178378452	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=40.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr2	178417835	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	178494173	.	G	GGGA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGA;STR;TLOD=68.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:9,11:11,6:15,5,8,10
chr2	178528703	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,2:4,6:3,7,2,6
chr2	178534324	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0,3,0,4
chr2	178540293	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=136,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,7:6,1:4,9,6,2
chr2	178545680	.	G	GCTCACCAAAGTATTAGAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=172,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	178545713	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	178545736	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=244,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	178565775	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:0,0:3,3:2,1,4,0
chr2	178565815	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,11,3
chr2	178592332	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr2	178633945	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=201,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr2	178681534	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:1,1:6,2:6,1,2,1
chr2	178681716	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr2	178682558	.	A	ATATAAAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:1,0:1,3,2,0
chr2	178684878	.	A	AAG	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.500:28:5,7:9,5:0|1:178684878_A_AAG:178684878:12,2,14,0
chr2	178684879	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.500:28:5,7:9,6:0|1:178684878_A_AAG:178684878:12,2,14,0
chr2	178684921	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=141,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=67.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,24:0.454:53:15,15:14,9:17,12,18,6
chr2	178685129	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,3:6,3:0,10,0,6
chr2	178764364	.	A	AAT,AATATATAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,16,32;MFRL=0,196,183;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,13;RU=AT;STR;TLOD=8.60,11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.407,0.398:7:1,1,2:0,0,1:0,1,0,6
chr2	178769992	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	178879287	.	C	CTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	178936434	.	TCCACCAGG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=78,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:178936434_TCCACCAGG_T:178936434:1,1,1,0
chr2	178936445	.	A	ACAATCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:178936434_TCCACCAGG_T:178936434:1,0,1,0
chr2	178990941	.	CAT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,1:6,3:2,10,0,5
chr2	179193118	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=135,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr2	179193150	.	A	AGGCCTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=185,83;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:179193150_A_AGGCCTT:179193150:0,3,0,1
chr2	179193152	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=185,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:179193150_A_AGGCCTT:179193150:0,3,0,1
chr2	179208974	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:5,9:12,4:9,8,8,5
chr2	179213872	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,3:3,5:4,0,8,0
chr2	179260382	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	179296821	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=131,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:11,6:9,7:12,8,8,5
chr2	179300971	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=61.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,17:0.462:37:12,11:6,6:0|1:179300971_G_A:179300971:7,13,9,8
chr2	179300979	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=75.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,22:0.561:39:11,12:5,9:0|1:179300971_G_A:179300971:5,12,13,9
chr2	179301046	.	T	TTAAAGAAATGTGGTTCTCTGGAGAAATATTA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=35.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.497:20:5,4:5,5:2,8,5,5
chr2	179309165	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,1204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:10,2:16,2:14,13,1,3
chr2	179326004	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,0:9,3:1,10,0,3
chr2	179330468	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=132,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr2	179363909	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.322:33:15,5:5,5:19,4,6,4
chr2	179407152	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,4:3,9:3,5,1,12
chr2	179407763	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:2,1:3,2:2,3,2,1
chr2	179422238	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,1:12,1:7,11,0,2
chr2	179434120	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:17,0:11,3:17,12,2,1
chr2	179437598	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=143,1562;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,3:7,0:12,8,0,3
chr2	179442915	.	A	AAATTTGGTTCGTTATAACCTCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	179473247	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=211,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:6,1,0,3
chr2	179476501	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=128,163;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,3:7,0:8,10,3,0
chr2	179494084	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:9,1:11,9,1,1
chr2	179510831	.	TTATATA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=TA;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.733:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	179511767	.	GTATA	G,GTA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,33,35;MFRL=152,108,124;MMQ=60,60,60;MPOS=5,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=TA;STR;TLOD=5.26,19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,8:0.109,0.270:31:11,0,3:8,3,4:19,1,10,1
chr2	179515655	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=201,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:179515655_G_T:179515655:1,2,0,1
chr2	179515657	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=242,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:179515655_G_T:179515655:1,3,0,1
chr2	179515660	.	G	GCGCCTGCTAAGTAGGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=242,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:179515655_G_T:179515655:1,3,0,1
chr2	179528821	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=162,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.119:31:15,3:12,0:7,21,1,2
chr2	179546054	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=126,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,0:6,1:9,1,2,0
chr2	179548695	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.239:15:2,2:5,1:6,6,2,1
chr2	179549822	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=197,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:5,1:2,1:6,2,2,0
chr2	179554305	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=105,89;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:6,6:4,2:1,9,3,5
chr2	179557198	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,9:3,1:4,2,6,4
chr2	179563643	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=16,10;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.265:12:1,0:1,0:1,8,0,3
chr2	179565881	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:16,0:17,2:15,18,0,2
chr2	179566038	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=124,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr2	179566146	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr2	179572600	.	AA	TG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:179572600_AA_TG:179572600:0,2,0,1
chr2	179572605	.	A	ATC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179572600_AA_TG:179572600:0,2,0,1
chr2	179572606	.	AAC	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179572600_AA_TG:179572600:0,2,0,1
chr2	179572613	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:179572600_AA_TG:179572600:0,2,0,1
chr2	179572629	.	C	CCCAAA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179572629_C_CCCAAA:179572629:0,0,0,1
chr2	179572630	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:179572629_C_CCCAAA:179572629:0,0,0,1
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chr2	179583182	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=133,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:11,0:2,2:0|1:179583182_G_C:179583182:5,9,1,1
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chr2	179714675	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=200,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:7,0,4,0
chr2	179732980	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=199,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr2	179753245	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=104,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:12,2:3,3:11,4,4,1
chr2	179826241	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,6:5,5:1,5,0,11
chr2	179981276	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,89;MMQ=60,32;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:5,0,2,0
chr2	179988395	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.828:19:2,10:1,5:3,0,14,2
chr2	179989039	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr2	179997177	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr2	180039068	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=118.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,20:0,15:0,0,33,2
chr2	180047746	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,10:0,2:0,0,11,1
chr2	180309648	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=170,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:10,12,0,2
chr2	180311207	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:4,0,6,0
chr2	180725481	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	180725655	.	TACAAGTGGGACCTTGAG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=202,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:6,1,1,1
chr2	180815528	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr2	180819843	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:0,2,0,6
chr2	180835321	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:8,0:13,2:4,19,1,1
chr2	180835589	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=75.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,9:0,11:0,0,6,15
chr2	180835859	.	TATTTTTATA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	180837806	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr2	180838584	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,1:4,6:0,10,0,7
chr2	180843126	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr2	180846743	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr2	182322639	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:3,2:0,8,0,5
chr2	182343385	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:8,3:5,1:12,1,4,0
chr2	182344846	.	G	GT,GTT	.	.	DP=126;ECNT=1;MBQ=34,33,34;MFRL=149,145,168;MMQ=60,60,60;MPOS=15,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=179.46,4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,76,6:0.847,0.069:90:3,35,4:5,36,2:7,1,68,14
chr2	182346220	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr2	182350743	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=92.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,5,21
chr2	182359613	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	182374328	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.616:21:2,10:5,3:7,1,11,2
chr2	182374534	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=175,226;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:0|1:182374534_A_G:182374534:0,6,1,5
chr2	182374553	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=236,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,3:0.400:8:2,2:2,1:1|0:182374534_A_G:182374534:1,4,0,3
chr2	182374567	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=250,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,3:0.500:6:2,2:0,1:1|0:182374534_A_G:182374534:0,3,0,3
chr2	182376546	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=63.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,9:0,0,2,17
chr2	182387133	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:0,8,0,3
chr2	182392143	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=209,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:1,3,1,6
chr2	182399497	.	A	ATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:4,3:0,1:4,0,5,0
chr2	182399685	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=165,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:3,3:3,4:1,5,0,8
chr2	182402790	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,4:5,3:6,0,7,0
chr2	182403792	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr2	182412697	.	T	TGATGATCTTGTTTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	182413602	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	182778704	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=241,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:1,6:1,2:0,2,0,8
chr2	182786920	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,7750265;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,0:10,2:10,9,0,2
chr2	182852729	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr2	182928555	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=82.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,17:0,6:0,0,5,18
chr2	183066377	.	C	CA,CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,153,142;MMQ=60,60,60;MPOS=26,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.53,5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.377,0.506:5:0,1,0:0,1,2:0,0,4,1
chr2	183088584	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=108.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,20:0,9:0,0,23,7
chr2	183129148	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.465:24:5,6:8,5:3,10,0,11
chr2	183593451	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.936:11:0,4:0,7:0,0,2,9
chr2	183597318	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=90,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.874:14:0,4:1,6:0,1,0,13
chr2	183616592	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	183616748	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr2	183622319	.	AATAAT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAAT;STR;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	183627619	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,0,19
chr2	183707223	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=135,98;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:12,1:16,1:19,10,2,0
chr2	183790559	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,143;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.103:46:24,0:18,4:7,35,0,4
chr2	183827018	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr2	183832100	.	CA	C,CAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,32,19;MFRL=140,136,123;MMQ=60,60,60;MPOS=21,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.38,6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,6,5:0.222,0.217:24:6,2,1:2,4,0:1,12,2,9
chr2	183841691	.	GAAA	G,GA,GAA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=17,33,34,19;MFRL=133,193,163,144;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,17,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,9,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.23,3.99,43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,2,3,19:0.076,0.110,0.574:32:1,2,1,2:0,0,2,7:1,7,2,22
chr2	183851058	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,0,12
chr2	183859473	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:5,0,3,1
chr2	183998382	.	TTAA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:183998382_TTAA_T:183998382:0,3,0,2
chr2	183998393	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,1:0|1:183998382_TTAA_T:183998382:0,3,0,2
chr2	184024143	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr2	185463815	.	C	CCT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=40.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.875:13:0,4:1,5:0,1,0,12
chr2	185798504	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,14:0,8:0,0,0,22
chr2	185802211	.	C	CACA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=49.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,3:0,8:0,0,7,5
chr2	185802243	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chr2	185803582	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=111,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.378:24:7,5:7,3:6,9,7,2
chr2	186670104	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=152.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,18:0,26:0,0,25,20
chr2	186671766	.	ATT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:3,0:5,4,1,1
chr2	186678241	.	A	AT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.335:28:8,3:10,5:18,1,7,2
chr2	186680041	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,1:5,2:5,2,2,1
chr2	186680282	.	A	AAGGGCCAGATAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=187,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:186680282_A_AAGGGCCAGATAT:186680282:0,2,0,1
chr2	186680285	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=187,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:186680282_A_AAGGGCCAGATAT:186680282:0,2,0,1
chr2	186680296	.	T	TTA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=203,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186680296_T_TTA:186680296:0,1,0,1
chr2	186680298	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=203,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:186680296_T_TTA:186680296:0,1,0,1
chr2	186692859	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:10,0:12,3:22,1,3,0
chr2	186697876	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,9:0,0,17,7
chr2	187364811	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr2	187364878	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,28:0.569:49:14,16:7,12:16,5,19,9
chr2	187369013	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	187455278	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,1,17
chr2	187465030	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=101,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.211:29:7,1:14,1:0|1:187465030_A_C:187465030:1,22,6,0
chr2	187465037	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=100,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.155:33:8,1:17,1:0|1:187465030_A_C:187465030:1,27,5,0
chr2	187465039	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=32,11;MFRL=99,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.145:31:8,0:16,0:0|1:187465030_A_C:187465030:1,26,4,0
chr2	187490405	.	T	TGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GA;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	187501682	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,16,0
chr2	187503226	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:4,4:1,7:1,4,1,10
chr2	187532010	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.415:29:11,9:6,2:1,16,0,12
chr2	187533741	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=224,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	187540732	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:0,5,0,7
chr2	187559029	.	A	ACAGCAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=CAG;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.690:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	187559222	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,0:0,2:0,5,0,2
chr2	187559235	.	TCG	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=205,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	187611748	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	187627620	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr2	187692746	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=124,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,0:4,2:12,6,2,0
chr2	187693564	.	TA	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	187698037	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	187701993	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:10,1,2,0
chr2	187702299	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=193,216;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,0:4,2:0,6,0,2
chr2	187702339	.	GTA	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.788:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr2	187709405	.	TA	T,TAA	.	.	DP=132;ECNT=1;MBQ=30,32,32;MFRL=134,142,134;MMQ=60,60,60;MPOS=24,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=4.91,7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:94,5,11:0.051,0.085:110:39,2,5:47,3,4:70,24,12,4
chr2	188216807	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=202,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:1,10:3,3:0,4,4,9
chr2	188224057	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=194,238;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	188225262	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,259;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:3,1:2,3:6,0,4,0
chr2	188243633	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:4,0,6,0
chr2	188245281	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,1:12,1:7,14,1,1
chr2	189162265	.	C	CTTTGT	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=133,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.115:50:16,2:28,2:0|1:189162265_C_CTTTGT:189162265:4,41,2,3
chr2	189162268	.	AG	CT	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=133,88;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.115:50:14,3:27,1:0|1:189162265_C_CTTTGT:189162265:4,41,2,3
chr2	189162271	.	TACAAA	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=135,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:15,1:23,1:0|1:189162265_C_CTTTGT:189162265:3,39,1,2
chr2	189434711	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:6,1:9,1:13,2,2,0
chr2	189448896	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	189454360	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.552:29:9,7:3,9:11,2,16,0
chr2	189454481	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.128:53:20,0:23,6:8,39,0,6
chr2	189849773	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=157,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:4,0,5,1
chr2	189855674	.	T	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=137.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,44:0.625:70:14,17:12,27:20,6,34,10
chr2	189857993	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	189859434	.	C	CT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.145:30:9,2:16,2:24,2,4,0
chr2	189860975	.	AGT	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GT;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.235:20:5,1:10,3:2,14,1,3
chr2	189861031	.	T	TACACACACAC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=200,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,16;RU=AC;STR;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.401:11:1,0:4,1:3,4,2,2
chr2	189862203	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	189867684	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=130,85;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:13,3:15,0:20,9,3,0
chr2	189870217	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:1,20,0,2
chr2	189870902	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=133,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:8,2,2,0
chr2	189874873	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,1:3,1:7,0,1,1
chr2	189899541	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	189899572	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	189901295	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=138,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr2	189910066	.	ATGTG	A,ATG,ATGTGTG	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,32,31,32;MFRL=176,170,151,193;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,24,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,10,11,13;RU=TG;STR;TLOD=3.48,14.93,4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,2,7,2:0.118,0.353,0.142:18:4,1,2,1:1,1,3,1:0,7,0,11
chr2	189918060	.	TACGAC	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,172;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:9,0:23,0,2,0
chr2	189918787	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr2	189923104	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr2	189923327	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.605:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr2	189923630	.	ATT	A,AT	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=33,32,31;MFRL=149,140,138;MMQ=60,60,60;MPOS=27,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=9.54,116.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,8,56:0.113,0.819:68:1,5,25:3,3,25:0,4,24,40
chr2	189925548	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=158.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,23:0,24:0,0,13,34
chr2	189925629	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=206,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,4:3,5:0,4,0,9
chr2	189926229	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.487:15:3,5:1,2:7,1,5,2
chr2	189927506	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	189933686	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr2	189936687	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:19,9:3,3:20,2,9,3
chr2	189943121	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,4:1,4:3,0,8,0
chr2	189945654	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,2,1
chr2	189948651	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:7,0,3,0
chr2	189949786	.	TG	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:5,0,7,0
chr2	189950556	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=107,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:1,4,0,4
chr2	189953551	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.429:33:7,9:12,5:1,18,1,13
chr2	189964747	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:6,9:8,5:12,2,13,1
chr2	189964891	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,20:0.412:49:12,12:17,8:10,19,6,14
chr2	189964970	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:0,6,0,6
chr2	190313396	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr2	190313890	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=204,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:0,0:1,0,2,0
chr2	190319990	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	190321967	.	C	CA	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=168,126;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.162:22:12,1:6,2:19,0,3,0
chr2	190321977	.	AG	GA	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:15,2:10,1:23,3,3,0
chr2	190321978	.	GA	G	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=150,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.126:29:14,2:5,1:21,5,3,0
chr2	190322196	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=200,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:3,1:3,2:0,7,0,3
chr2	190323530	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.513:37:11,8:7,11:11,7,15,4
chr2	190327126	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	190327400	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:0,7,0,5
chr2	190339974	.	A	G	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,100;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,6:0.080:85:36,6:40,0:55,24,6,0
chr2	190444630	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:9,8:8,5:5,12,3,11
chr2	190445076	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:3,0,4,1
chr2	190535538	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	190541892	.	G	GAGTGCAGGGACGTGATCATGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=227,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	190554688	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=180,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,2:8,1:1,14,0,3
chr2	190570001	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.924:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr2	190585604	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=216,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	190593311	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,6,3
chr2	190603201	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	190611084	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=141.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.978:40:0,16:0,24:0,0,31,9
chr2	190611414	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,0,21
chr2	190636411	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	190640475	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,1,12
chr2	190647108	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr2	190722245	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=75,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,29:0.548:53:13,21:10,8:19,5,20,9
chr2	190925223	.	T	TCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=196,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	190926859	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:0,1:4,0,3,0
chr2	191065236	.	TTTTG	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTG;STR;TLOD=80.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,21:0.614:34:8,11:5,10:6,7,13,8
chr2	191065595	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,9:3,6:2,4,7,8
chr2	191065782	.	A	AGAT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=61.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:4,7:0,7:2,2,7,9
chr2	191067766	.	T	TTC	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.550:38:11,8:6,11:12,5,13,8
chr2	191068260	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=257,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	191073721	.	A	AGCTTCTCACCCCCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:1,1:1,0:0|1:191073721_A_AGCTTCTCACCCCCCT:191073721:0,2,0,1
chr2	191073726	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:191073721_A_AGCTTCTCACCCCCCT:191073721:0,2,0,1
chr2	191159232	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,6:0,0,14,2
chr2	191175639	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	191184524	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=150.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,27:0,17:0,0,10,34
chr2	191301368	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,11,8
chr2	191334424	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr2	191334459	.	A	ATTTTTAT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTTTAT;STR;TLOD=60.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,4:0,0,14,1
chr2	191354491	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:12,6:1,7:8,5,10,3
chr2	191354658	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	191374043	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=81,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr2	191383989	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	191390126	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr2	191552121	.	CAAAA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=24,20;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.408:3:1,0:0,1:1,1,0,1
chr2	191765206	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	191789227	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=132,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:3,2:6,7:8,1,10,0
chr2	191789238	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=132,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,4:6,7:8,1,10,1
chr2	191789377	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=160,85;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:5,2:0|1:191789377_T_G:191789377:7,16,1,1
chr2	191789380	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=160,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:16,0:7,2:0|1:191789377_T_G:191789377:7,16,1,1
chr2	191789381	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,2:0.115:24:15,1:7,1:1|0:191789377_T_G:191789377:7,15,0,2
chr2	191795063	.	AG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=174,138;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:3,1,1,0
chr2	191818243	.	ATG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=121,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,4:4,7:6,3,10,1
chr2	191839539	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,3:5,4:10,2,7,0
chr2	191840695	.	GTTC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=189,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,0:2,4:0,3,1,3
chr2	191848312	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr2	191862786	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:2,6,1,2
chr2	191875035	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=109,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:12,4:11,2:14,9,6,0
chr2	191899346	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:3,4:6,5:3,7,1,9
chr2	191923026	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr2	191923064	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,0,10
chr2	191941054	.	G	GA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.249:20:3,0:4,2:1,14,1,4
chr2	192160970	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,2:2,4:1,6,1,5
chr2	192214833	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr2	192225294	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	192225477	.	G	GTGTTGT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=153,158;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=TGT;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.655:4:1,0:0,1:0,1,0,3
chr2	192226908	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	192250543	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr2	192250568	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,6:0,10:0,0,13,3
chr2	192283457	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	192711162	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr2	192820898	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=203,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr2	193056737	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,2,4
chr2	196578313	.	CT	C,CTT	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=31,31,22;MFRL=145,138,123;MMQ=60,60,60;MPOS=23,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=12.48,7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,9,4:0.178,0.107:44:10,4,0:17,5,4:6,25,1,12
chr2	196578326	.	C	CTAAGAG	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=143,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,2:0.053:54:21,0:24,2:7,45,0,2
chr2	196581295	.	T	TGTCTAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,2:0,0,6,0
chr2	196602582	.	A	AAAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAT;STR;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	196636662	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	196663997	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,16,5
chr2	196664047	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,73;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:9,0:12,3:12,10,1,2
chr2	196681284	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,16,0
chr2	196689261	.	A	ATTTCATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	196718071	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,262;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:25,0:12,3:16,21,3,0
chr2	196756535	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:1,7:0,7:0,1,0,14
chr2	196825238	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:3,11:3,5:2,5,9,8
chr2	196891449	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	196912067	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=103.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,12:0,16:0,0,26,2
chr2	196916088	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	197010823	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	197021086	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr2	197021141	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=148.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,21:0,22:0,0,34,11
chr2	197065964	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=117.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,15:0,19:0,0,27,8
chr2	197066175	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=201,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,4:0,6:0,1,0,11
chr2	197092767	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:9,8:11,2:20,0,10,0
chr2	197106759	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=110.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,18:0,14:0,0,27,7
chr2	197122493	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:6,0,8,0
chr2	197122662	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:5,0:9,7:3,11,1,6
chr2	197143469	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=189,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr2	197157277	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:9,3:10,0:15,6,3,0
chr2	197171175	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0|1:197171175_C_T:197171175:0,0,11,3
chr2	197171183	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,14:0.750:18:1,4:3,10:0|1:197171175_C_T:197171175:2,2,10,4
chr2	197172816	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	197298222	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:197298222_T_C:197298222:0,0,0,8
chr2	197298232	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0|1:197298222_T_C:197298222:0,0,0,7
chr2	197531493	.	CGCTCAAGAACTACTGGCCCAGGAACAAAAAAAAAAAGAAGAGTTGGAGATTGCTACTTCACA	C	.	.	DP=145;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:130,15:0.031:145:30,5:30,5:54,76,7,8
chr2	197531518	.	CA	C,CAA	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=32,33,30;MFRL=150,163,147;MMQ=60,60,60;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.38,6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:39,4,7:0.081,0.124:50:15,2,3:14,2,4:20,19,2,9
chr2	197534692	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,0,17
chr2	197594203	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr2	197595762	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=215,170;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:0,6,0,4
chr2	197643863	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:197643863_T_TC:197643863:0,4,0,1
chr2	197643866	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:197643863_T_TC:197643863:0,4,0,1
chr2	197643869	.	T	TTCCCAAGTCCCTTTCCCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:197643863_T_TC:197643863:0,4,0,1
chr2	197645397	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,0:5,5:2,7,1,4
chr2	197664521	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	197709173	.	T	TA	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,6:0.116:54:24,6:22,0:42,6,5,1
chr2	197738280	.	G	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.057:68:34,0:31,3:21,44,0,3
chr2	197762941	.	CA	C,CAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,33,33;MFRL=158,139,159;MMQ=60,60,50;MPOS=9,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.44,6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,4:0.172,0.186:24:8,1,1:8,3,2:16,0,7,1
chr2	197777589	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=87.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,16:0,10:0,0,22,4
chr2	197786800	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,54;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr2	197791356	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.147:29:13,0:12,3:1,24,1,3
chr2	197791434	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=147,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr2	197854433	.	C	CCCTACAAGAG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=147,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,3:9,0:1,13,0,3
chr2	197863214	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=180.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,30:0,23:0,0,2,51
chr2	197863851	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr2	197870536	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:5,7:4,9:2,7,4,12
chr2	197872727	.	T	TTCTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TC;STR;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.822:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr2	197873563	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	197953372	.	TAAGTC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGTC;STR;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr2	197954780	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,5,9
chr2	197986048	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,15,2
chr2	197990509	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	198001443	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr2	198011904	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,9:0,0,0,25
chr2	198257652	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,31;MFRL=128,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr2	198263146	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=129,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:12,3:6,2:16,2,4,1
chr2	198264903	.	AAAT	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=70.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,20:0.314:65:21,10:22,9:13,32,4,16
chr2	198265173	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.965:24:0,11:0,12:0,0,1,23
chr2	198266943	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,8:0,0,0,18
chr2	198267243	.	GAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,176;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,1:3,1:6,1,2,0
chr2	198267484	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:4,0:12,2:6,10,0,2
chr2	198267770	.	G	GAA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=149.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.978:40:0,17:0,14:0,0,15,25
chr2	198272719	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=109,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:12,3:10,0:16,6,3,0
chr2	198283305	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,11,18
chr2	198359027	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=204,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:4,1:5,3:0,10,0,4
chr2	198359315	.	CAGATAACTCAAACTTTTGATCATA	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,17:0.349:50:8,7:6,10:28,5,13,4
chr2	198365043	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=101.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,10:0,22:0,0,32,0
chr2	198365248	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.287:11:3,0:1,0:0|1:198365248_T_G:198365248:0,8,0,3
chr2	198365252	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=11,13;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.285:11:2,1:1,0:0|1:198365248_T_G:198365248:0,8,0,3
chr2	198365788	.	C	T	.	.	DP=147;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=118.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,46:0.330:140:50,23:44,23:61,33,26,20
chr2	198413208	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:198413208_G_A:198413208:0,1,0,1
chr2	198413225	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:198413208_G_A:198413208:0,0,0,1
chr2	198498521	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:16,0:8,4:8,16,0,4
chr2	198509058	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=206,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr2	198563642	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=67,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr2	198572076	.	A	ATTC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTC;STR;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:5,2:8,6:7,6,4,5
chr2	198643631	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=69,65;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:1,1,2,2
chr2	198950968	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr2	198953816	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=148,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr2	198953832	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:198953832_A_ATG:198953832:0,4,0,1
chr2	198953834	.	T	TAAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=219,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:198953832_A_ATG:198953832:0,3,0,1
chr2	200173684	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr2	200233371	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:3,19,0,2
chr2	200298313	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr2	200813293	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	200820505	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	201171014	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:8,4:10,8:15,3,9,3
chr2	201194279	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,1,3
chr2	201254049	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,8:0,0,8,16
chr2	201277181	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,4:7,3:1,9,0,7
chr2	201303791	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,1336;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:4,2:10,1,2,0
chr2	201331923	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,142;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,0:14,2:18,0,2,0
chr2	201334663	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.122:31:10,0:15,3:16,12,3,0
chr2	201371768	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=86.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,14:0,0,2,24
chr2	201397647	.	A	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,15:0.326:47:14,10:17,5:32,0,15,0
chr2	201399917	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.359:37:14,10:9,3:9,15,2,11
chr2	201400685	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr2	201438766	.	T	TCATTGAACCTAATGGAGATTAAAGGTCAAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,16;MFRL=239,251;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr2	201445152	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr2	201457954	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,243;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,0:10,3:2,14,0,3
chr2	201460104	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,4:2,4:1,7,1,7
chr2	201464295	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	201466954	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,5:0,0,12,2
chr2	201470233	.	ATTTT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=T;STR;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	201473674	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,9,5
chr2	201474179	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=121.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,15:0,18:0,0,6,27
chr2	201478720	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=110,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr2	201485398	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:20,3:18,0:30,10,3,0
chr2	201502898	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr2	201502954	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:11,12,2,0
chr2	201505953	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	201515939	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:2,12,1,1
chr2	201521731	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.818:20:1,12:2,4:0,3,1,16
chr2	201534423	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=109,13930330;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,0:9,2:6,12,0,2
chr2	201677317	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	201677454	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=92.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,15:0,0,16,12
chr2	201683695	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=128.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,14:0,21:0,0,1,34
chr2	201719258	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31,33;MFRL=213,0,124;MMQ=54,60,60;MPOS=8,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.17,12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,5:0.272,0.549:8:0,2,2:1,0,2:1,0,5,2
chr2	201719412	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,3:10,0:2,17,0,3
chr2	201724746	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:2,7:1,2:3,0,9,0
chr2	201736235	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:201736235_A_T:201736235:2,17,0,2
chr2	201736242	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:6,2:0|1:201736235_A_T:201736235:2,13,0,2
chr2	201778717	.	TA	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=16,9;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.245:27:5,1:1,2:3,17,3,4
chr2	201785925	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0|1:201785925_T_C:201785925:0,2,0,1
chr2	201785929	.	C	CTGGTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:201785925_T_C:201785925:0,2,0,1
chr2	201785942	.	G	GCGTGATC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	201857133	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,249;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:15,0:9,3:1,24,0,3
chr2	202000629	.	TA	CG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:12,2:16,0:24,5,2,0
chr2	202025131	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	202025764	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	202028714	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=165,92;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:0|1:202028714_C_T:202028714:4,9,1,1
chr2	202028717	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=144,92;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:5,2:0|1:202028714_C_T:202028714:4,9,1,1
chr2	202070735	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr2	202073781	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=75,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.427:22:3,5:8,2:1,11,10,0
chr2	202134418	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,3:0,2:0,4,0,5
chr2	202139722	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=137,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,7:0.124:53:20,0:18,0:17,29,0,7
chr2	202139739	.	CT	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=175,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.218:19:7,3:3,1:0,15,0,4
chr2	202151163	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	202211443	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	202211481	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=214,238;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202211481_CAT_C:202211481:0,1,0,1
chr2	202211485	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=214,238;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202211481_CAT_C:202211481:0,1,0,1
chr2	202211487	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=214,238;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:202211481_CAT_C:202211481:0,1,0,1
chr2	202211490	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202211481_CAT_C:202211481:0,0,0,1
chr2	202211492	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:202211481_CAT_C:202211481:0,0,0,1
chr2	202215409	.	C	CAAAACAAAACAAAACAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAACAAAACAAAACAA;STR;TLOD=67.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,1:0,4:0,0,11,7
chr2	202245244	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,14:0,11:0,0,23,2
chr2	202245944	.	TAA	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.674:7:1,1:1,4:0|1:202245944_TAA_T:202245944:0,2,0,5
chr2	202245953	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr2	202245955	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.672:7:1,0:1,2:0|1:202245944_TAA_T:202245944:0,2,0,5
chr2	202246034	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	202248788	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=94.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,12:0,13:0,0,22,5
chr2	202248979	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,1,25
chr2	202254288	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr2	202262401	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202262401_A_C:202262401:0,1,0,1
chr2	202262402	.	C	CTTTATTTTAAGTGTATGTATGCCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,24;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:202262401_A_C:202262401:0,1,0,1
chr2	202264316	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	202272032	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr2	202285100	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr2	202323636	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:26,2:14,1:6,36,0,3
chr2	202323641	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=145,166;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:26,0:11,1:5,35,0,2
chr2	202323696	.	GC	CT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:0,13,0,2
chr2	202337730	.	A	G	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=327.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,102:0.991:102:0,53:0,46:0,0,47,55
chr2	202342610	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:10,0:6,5:6,10,0,5
chr2	202342737	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,22,0
chr2	202344179	.	GT	G	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=168.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,69:0.960:71:1,33:1,36:1,1,47,22
chr2	202402250	.	AAC	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=202.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,51:0.964:52:1,28:0,23:0,1,12,39
chr2	202410395	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:6,2:5,5:0,11,0,7
chr2	202430428	.	ATTT	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=76,215;MMQ=54,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=T;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.308:8:3,0:2,2:0|1:202430428_ATTT_A:202430428:5,1,2,0
chr2	202430450	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,16;MFRL=106,159;MMQ=60,35;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,2:0.212:12:4,0:2,0:1|0:202430428_ATTT_A:202430428:8,2,2,0
chr2	202430452	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=19,13;MFRL=111,159;MMQ=60,35;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,2:0.199:13:3,0:2,0:1|0:202430428_ATTT_A:202430428:9,2,2,0
chr2	202430458	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,11;MFRL=119,159;MMQ=60,35;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,2:0.157:17:6,0:4,0:1|0:202430428_ATTT_A:202430428:13,2,2,0
chr2	202447009	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr2	202469472	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	202491995	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,3:5,3:11,1,6,0
chr2	202499683	.	C	G	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=153.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,49:0.588:83:14,20:20,29:8,26,12,37
chr2	202501448	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=117,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,4:1,3:5,1,6,1
chr2	202505545	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.340:45:12,6:18,9:25,5,11,4
chr2	202505719	.	AT	A,ATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,14,30;MFRL=192,109,198;MMQ=60,60,60;MPOS=30,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.26,5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,3:0.285,0.283:11:0,0,2:3,1,1:0,5,0,6
chr2	202507982	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.606:6:0,0:2,2:2,0,3,1
chr2	202528830	.	A	AT	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=46.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,26:0.370:70:29,16:15,10:19,25,14,12
chr2	202531136	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:1,5,1,1
chr2	202546113	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	202547528	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,2:4,6:5,0,7,1
chr2	202566741	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr2	202569992	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,8,11
chr2	202570232	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,11:0,0,1,15
chr2	202571562	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,5:2,2:5,1,6,1
chr2	202572806	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=230,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	202574825	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	202574862	.	A	ATAAAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=174,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	202575907	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	202580370	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=78.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,20,3
chr2	202587653	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=76,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr2	202589148	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=121,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:18,1:9,1:13,14,0,2
chr2	202589257	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=166,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	202626188	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,2:12,0:12,11,0,2
chr2	202626561	.	A	AAAGAAAAG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=154,54;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:8,0:7,3:0|1:202626561_A_AAAGAAAAG:202626561:3,13,2,1
chr2	202626571	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=154,54;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:6,0:8,1:0|1:202626561_A_AAAGAAAAG:202626561:2,12,2,1
chr2	202626625	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr2	202630368	.	A	ATACTT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TACTT;STR;TLOD=59.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:5,4:5,11:10,1,4,11
chr2	202630424	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.405:23:6,5:6,4:9,5,6,3
chr2	202632104	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=116,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:5,0:11,2:6,11,1,1
chr2	202688293	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	202700444	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,239;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:19,0:6,3:5,21,0,3
chr2	202712095	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=81.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,18,6
chr2	202899358	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	202901235	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=155,88;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,4:2,3:4,4,5,2
chr2	202902385	.	TA	T,TAA	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=31,32,31;MFRL=143,133,138;MMQ=60,60,60;MPOS=26,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.43,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:76,4,6:0.055,0.072:86:24,4,2:50,0,3:44,32,6,4
chr2	202902870	.	ATTAAAG	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.565:30:7,11:4,6:10,3,11,6
chr2	202955454	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr2	202962310	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=194,186;MMQ=50,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.612:6:0,2:1,2:0,2,0,4
chr2	202962358	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=218,202;MMQ=40,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	202962361	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=202,218;MMQ=60,40;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	202964528	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr2	202964986	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,11,2
chr2	202965222	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	202970726	.	G	GACTTACTGGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	202979369	.	G	GACA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr2	203003066	.	G	GGTGT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=GT;STR;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,4:2,4:2,3,8,2
chr2	203029951	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:5,1,4,0
chr2	203054932	.	G	GA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=80,80;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.135:26:8,1:9,2:14,9,3,0
chr2	203079025	.	TA	T,TAA	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=31,30,30;MFRL=130,146,124;MMQ=60,60,60;MPOS=17,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.71,10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,7,10:0.126,0.189:51:15,2,3:15,5,5:30,4,14,3
chr2	203096479	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,0;MMQ=60,23;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,1,0
chr2	203103035	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:203103035_A_C:203103035:0,0,2,0
chr2	203103038	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:203103035_A_C:203103035:0,0,2,0
chr2	203139738	.	A	AC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=53.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.932:17:0,6:1,10:1,0,16,0
chr2	203152355	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=151,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,8:3,4:6,1,9,3
chr2	203154953	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	203155015	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.622:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr2	203168235	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,26:0.517:50:14,14:10,11:0,24,2,24
chr2	203383843	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	203384712	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	203384776	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.875:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr2	203395642	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,1:5,1:4,12,0,2
chr2	203421199	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=92,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:4,3:0,1:1,3,0,4
chr2	203620174	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=172,94;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:7,0,3,0
chr2	203630102	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.535:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr2	203650558	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	203650825	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=54711750,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	203661779	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	203676382	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=165,175,121;MMQ=48,60,48;MPOS=21,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,18,21;RU=A;STR;TLOD=3.12,7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,6:0.205,0.492:12:0,2,2:2,1,2:2,1,7,2
chr2	203682304	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	203690387	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,8,3
chr2	203693559	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,22,2
chr2	203747522	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:5,3:9,2:2,12,0,5
chr2	203748544	.	A	AT,ATT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31,30;MFRL=0,167,137;MMQ=60,60,60;MPOS=15,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.91,6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.376,0.503:5:0,1,1:0,1,2:0,0,0,5
chr2	203759178	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:5,2:13,0:17,1,2,0
chr2	203759227	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:28,3:16,0:30,14,1,2
chr2	203806724	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=57.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,21:0.386:55:12,9:21,12:11,23,3,18
chr2	203836507	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=138,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	203880992	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,210;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr2	203921270	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=170.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,28:0,20:0,0,13,35
chr2	203921317	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=162,155;MMQ=58,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:16,2:5,1:0|1:203921317_T_C:203921317:0,21,0,3
chr2	203921319	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=163,155;MMQ=59,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:16,1:5,1:0|1:203921317_T_C:203921317:0,22,0,3
chr2	203921336	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=177,165;MMQ=58,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:16,2:3,0:0|1:203921336_C_T:203921336:0,19,0,2
chr2	203921338	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=177,165;MMQ=58,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,1:3,0:0|1:203921336_C_T:203921336:0,19,0,2
chr2	203947911	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	203964456	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=143,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.206:21:9,3:5,1:6,11,1,3
chr2	203964516	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=201,152;MMQ=60,46;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:4,1:2,1:0|1:203964516_T_C:203964516:0,6,0,2
chr2	203964530	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=168,105;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:203964516_T_C:203964516:0,4,0,1
chr2	203964532	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=168,105;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:203964516_T_C:203964516:0,4,0,1
chr2	203996870	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,14:0,0,3,16
chr2	204002809	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=124.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,13:0,20:0,0,33,0
chr2	204111394	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0|1:204111394_T_C:204111394:0,0,5,0
chr2	204111398	.	GTTAA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:204111394_T_C:204111394:0,0,4,0
chr2	204111443	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	204111705	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,3:0,0,0,9
chr2	204116660	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,5:1,3:3,0,9,0
chr2	204116690	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,9:0,0,16,4
chr2	204116887	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=86.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,0,24
chr2	204144935	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=205,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:204144935_T_C:204144935:0,2,0,1
chr2	204144936	.	G	GGGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=205,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:204144935_T_C:204144935:0,2,0,1
chr2	204154677	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=182,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:5,4:5,3:0|1:204154677_A_T:204154677:0,10,0,7
chr2	204154686	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0|1:204154677_A_T:204154677:0,0,0,17
chr2	204305093	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=90,57;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.372:28:7,6:8,4:11,7,5,5
chr2	204305635	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	204305982	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	204732850	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,0,16
chr2	204735423	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=146,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.122:37:15,2:18,2:16,17,1,3
chr2	204822670	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr2	204824178	.	AGT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GT;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:1,1:7,3:7,1,4,0
chr2	205912210	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	205978113	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr2	205978118	.	GTGTGT	G,GGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34,34;MFRL=0,184,153;MMQ=60,60,60;MPOS=24,29;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.25,7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.385,0.515:5:0,1,2:0,1,1:0,0,5,0
chr2	205978347	.	T	TGATTTGA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GATTTGA;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:6,1:3,2:0,9,0,3
chr2	206036918	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,4:4,6:5,2,4,6
chr2	206041366	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=15,10;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:0,0:0,1,0,4
chr2	206165549	.	A	AGACTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	206305171	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=127,14606535;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,0:12,2:8,12,0,2
chr2	206364791	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr2	206418032	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chr2	206480351	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=20,13;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,12:0.240:45:13,3:6,1:16,17,11,1
chr2	206480369	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=130,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.058:50:23,1:16,0:26,22,0,2
chr2	206562250	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,9:0,11:0,0,17,3
chr2	206592525	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	206605180	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr2	206614646	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=304,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	206631623	.	TTGTCAAATCTCGCAAGAG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	206882503	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.571:33:8,10:6,9:6,8,5,14
chr2	206884595	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	206911191	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=15,33;MFRL=102,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.873:9:0,1:0,7:0,1,7,1
chr2	206911417	.	C	CCGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=101,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	206921763	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	207006825	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:1,3:1,6,0,4
chr2	207008675	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=229,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr2	207024857	.	T	G	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=18,11;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,17:0.218:71:13,0:13,1:0,54,0,17
chr2	207024886	.	G	GC	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=169.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.983:52:0,22:0,30:0,0,0,52
chr2	207025444	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:10,5:14,6:3,21,4,7
chr2	207027407	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:5,1:7,3:11,2,2,2
chr2	207172957	.	AAA	CTG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,401;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,2:10,0:11,9,1,1
chr2	207452151	.	GT	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=107,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=89.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,33:0.927:36:0,13:1,19:1,2,2,31
chr2	207457265	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=161,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,4:2,4:2,0,8,0
chr2	207459467	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=135,119;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.499:32:10,2:6,14:8,8,11,5
chr2	207516721	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:0,7,0,5
chr2	207527608	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=107,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr2	207559640	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:207559640_A_G:207559640:2,2,0,1
chr2	207559641	.	G	T,GAATGGAATGGAATCAAAACGA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,10,35;MFRL=123,183,147;MMQ=60,60,60;MPOS=30,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.10,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,0:1,0,1:2,1,0,2
chr2	207559647	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,10;MFRL=170,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,0:1|0:207559640_A_G:207559640:0,2,0,1
chr2	207582852	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=196,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr2	207610454	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=186,163;MMQ=40,58;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:0,2:1,3,0,2
chr2	207625567	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:7,3:3,3:9,1,5,1
chr2	207629846	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,6:6,2:9,1,8,0
chr2	207629904	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.404:45:15,9:12,9:21,6,15,3
chr2	207631382	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:8,1:19,1,2,0
chr2	207651410	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,6:0,2:4,0,7,1
chr2	207653653	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=194,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr2	207824548	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	207833848	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr2	207953406	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	208134190	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0|1:208134190_C_CT:208134190:0,1,0,1
chr2	208134192	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:208134190_C_CT:208134190:0,1,0,1
chr2	208134196	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:208134190_C_CT:208134190:0,1,0,1
chr2	208488974	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=106,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:17,1:10,1:12,15,1,1
chr2	208606875	.	CA	C,CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32,0;MFRL=145,175,115;MMQ=60,54,40;MPOS=14,50;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=3.21,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.217:6:1,0,0:1,2,0:2,1,3,0
chr2	208615919	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=206,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:208615919_T_TC:208615919:0,1,0,1
chr2	208615921	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=206,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:208615919_T_TC:208615919:0,1,0,1
chr2	208693261	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	208693307	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	208811097	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,11:0,5:0,0,13,3
chr2	208841461	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=118,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,2:7,0:12,8,1,1
chr2	208865712	.	GAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=121,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:3,1:5,1,2,0
chr2	208986385	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,15:0,7:0,0,19,4
chr2	209010891	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=105,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.611:13:2,4:2,4:1,4,0,8
chr2	209028191	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.557:32:7,5:7,12:12,2,12,6
chr2	209035658	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,16,1
chr2	209035849	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,0,11
chr2	209036605	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	209036712	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,8:0,20:0,0,21,7
chr2	209046100	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr2	209049840	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	209051586	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.684:10:1,5:1,2:3,0,6,1
chr2	209101905	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,141;MMQ=49,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,3:1,4:0,1,2,7
chr2	209106969	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	209110006	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:1,3:8,0:7,3,3,0
chr2	209113189	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.086:55:28,2:20,2:30,21,3,1
chr2	209113192	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,17:0.301:57:26,8:14,8:23,17,11,6
chr2	209163556	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,3,7
chr2	209168853	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	209168945	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,2:12,0:12,12,0,2
chr2	209182548	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=118,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:8,3,5,0
chr2	209182677	.	CAGTTCAGCAGTGA	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.423:17:6,1:2,6:2,8,1,6
chr2	209189912	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr2	209194696	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	209195491	.	G	GAGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:209195491_G_GAGA:209195491:0,0,0,2
chr2	209195503	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:209195491_G_GAGA:209195491:0,1,0,1
chr2	209195506	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=221,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:209195491_G_GAGA:209195491:0,3,0,1
chr2	209195507	.	T	TTTAATAAATA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=221,158;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:209195491_G_GAGA:209195491:0,3,0,1
chr2	209199945	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	209201739	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,0,17
chr2	209203122	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr2	209204319	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,3:6,1:0,11,0,4
chr2	209209997	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=109.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,20:0,11:0,0,1,33
chr2	209215448	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr2	209219190	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	209315573	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.652:24:5,10:3,5:2,6,3,13
chr2	209345944	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=148,177;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:1,0:2,3:0,7,0,4
chr2	210560808	.	GG	TT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=158,255;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:210560808_GG_TT:210560808:0,3,0,1
chr2	210560811	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=158,255;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:210560808_GG_TT:210560808:0,3,0,1
chr2	210560815	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=158,255;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:210560808_GG_TT:210560808:0,3,0,1
chr2	210594540	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,13:0,0,14,6
chr2	210594717	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr2	210594768	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	210682485	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.479:17:5,3:3,5:7,2,7,1
chr2	210704200	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,2,3
chr2	210704227	.	A	AAAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:210704227_A_AAAC:210704227:0,4,0,1
chr2	210704228	.	T	TGAAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:210704227_A_AAAC:210704227:0,4,0,1
chr2	210704230	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:210704227_A_AAAC:210704227:0,4,0,1
chr2	210714162	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:4,2,7,1
chr2	210745681	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,15:0,7:0,0,14,9
chr2	210745855	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr2	210786137	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	210802336	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,2:14,0:11,14,0,2
chr2	210802391	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=126,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:3,9,0,2
chr2	210804439	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,172;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	210808045	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	210809729	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=153,231;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:3,0:1,2:1,3,2,0
chr2	210810468	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	210810528	.	AA	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=126,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,2:3,5:4,0,5,2
chr2	210823765	.	G	GAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=A;STR;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,5:2,3:0|1:210823765_G_GAA:210823765:3,2,8,1
chr2	210823772	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:4,6:2,5:0|1:210823765_G_GAA:210823765:4,2,9,2
chr2	210834410	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=193,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	210838063	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	210846867	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,6,2
chr2	210860264	.	TTA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,51;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:17,0:9,3:15,12,0,3
chr2	210882171	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,6:0,0,10,3
chr2	210890032	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=185,195;MMQ=60,41;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:210890032_A_G:210890032:0,3,0,1
chr2	210890035	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=185,195;MMQ=60,41;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:210890032_A_G:210890032:0,3,0,1
chr2	210890041	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=185,195;MMQ=60,41;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:210890032_A_G:210890032:0,3,0,1
chr2	211069438	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr2	211163063	.	T	TACAC,TACACAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32,33;MFRL=0,131,213;MMQ=60,60,52;MPOS=12,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,16,17;RU=AC;STR;TLOD=3.79,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,1:0,0,2,0
chr2	211167132	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr2	211168181	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr2	211168346	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,3,13
chr2	211179864	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	211302627	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,4:2,4:0,8,2,6
chr2	211319824	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:4,0,8,0
chr2	211319943	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:7,5:2,6:4,5,7,4
chr2	211320041	.	G	GAA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=17,16;MFRL=169,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,1:0,0:0,1,1,2
chr2	211320052	.	A	AAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=122,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:211320052_A_AAT:211320052:1,2,0,1
chr2	211320055	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=122,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:211320052_A_AAT:211320052:1,2,0,1
chr2	211340937	.	A	AT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:10,6:9,4:19,0,10,0
chr2	211341156	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=76.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,27:0.620:43:10,14:5,11:1,15,5,22
chr2	211341204	.	G	GC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=58.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,1,15
chr2	211421452	.	A	ATCT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.355:43:15,8:11,6:22,6,12,3
chr2	211456637	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=110,152;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,12:0.866:13:1,5:0,6:0|1:211456637_A_G:211456637:1,0,2,10
chr2	211456639	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0|1:211456637_A_G:211456637:0,0,3,10
chr2	211467110	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:211467110_CTTT_C:211467110:0,2,0,1
chr2	211467114	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:211467110_CTTT_C:211467110:0,2,0,1
chr2	211467117	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:211467110_CTTT_C:211467110:0,1,0,1
chr2	211467119	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:211467110_CTTT_C:211467110:0,1,0,1
chr2	211467144	.	T	TGGGATAATGGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	211481257	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=66,161;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.952:20:0,10:0,9:1,0,6,13
chr2	211502439	.	G	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.085:56:20,3:32,0:26,26,3,1
chr2	211513118	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	211514995	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr2	211515263	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=231,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:211515263_C_T:211515263:0,1,0,1
chr2	211515268	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=231,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:211515263_C_T:211515263:0,1,0,1
chr2	211515269	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=231,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:211515263_C_T:211515263:0,1,0,1
chr2	211515271	.	GTA	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=201,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:211515263_C_T:211515263:0,2,0,1
chr2	211521227	.	CTT	C,CT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,32,31;MFRL=129,145,188;MMQ=60,60,60;MPOS=10,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=4.14,8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.282,0.524:8:0,0,3:1,3,1:0,1,5,2
chr2	211521254	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=129,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.151:28:13,0:8,0:11,13,4,0
chr2	211523457	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=97,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,3:1,2:1,3,2,3
chr2	211525420	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr2	211527827	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=181,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.756:18:1,3:1,9:4,0,8,6
chr2	211533070	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	212252824	.	AGGG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=226,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:212252824_AGGG_A:212252824:0,1,0,1
chr2	212252830	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=226,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:212252824_AGGG_A:212252824:0,1,0,1
chr2	212252834	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=226,122;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:212252824_AGGG_A:212252824:0,1,0,1
chr2	212295590	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,5:0,0,8,0
chr2	212488870	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	212530218	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:1,1:7,1:2,7,0,3
chr2	212543691	.	C	CAAAAAAAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=25,34;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.689:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	212543924	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,6:3,6:4,6,3,9
chr2	212569953	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:4,2:15,0:19,0,2,0
chr2	212569983	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=211,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:4,11:3,5:7,0,16,0
chr2	212576743	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:11,4:9,0:0|1:212576743_T_G:212576743:18,3,4,0
chr2	212576751	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:10,4:13,0:0|1:212576743_T_G:212576743:21,3,4,0
chr2	212578379	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr2	212587321	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,0,10
chr2	212589986	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=175,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	212615516	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	213872133	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=157,39;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.110:34:16,3:15,0:0|1:213872133_C_T:213872133:15,16,2,1
chr2	213872136	.	T	TGATTCAAGAGG	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=30,17;MFRL=163,39;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:13,1:16,0:0|1:213872133_C_T:213872133:17,18,1,1
chr2	213872138	.	CT	AG	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=157,39;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:14,2:17,0:0|1:213872133_C_T:213872133:19,17,1,1
chr2	213872143	.	TT	AC	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=157,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:17,2:17,0:0|1:213872133_C_T:213872133:18,18,1,1
chr2	213872836	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.581:10:1,3:3,2:2,2,1,5
chr2	213886647	.	A	ATTTTATCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTTATCT;STR;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.840:4:0,2:0,0:0,0,4,0
chr2	213914343	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	214012405	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,16,1
chr2	214174767	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,14,4
chr2	214182100	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr2	214182191	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=209,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	214228959	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr2	214972825	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	215013801	.	G	GTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=163,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TA;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.823:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr2	215632164	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,5:1,4:2,0,8,1
chr2	215657182	.	TAA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.587:10:1,2:1,3:0,4,0,6
chr2	215661716	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.574:26:3,9:6,6:10,1,14,1
chr2	215661911	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,3:3,4:0,5,0,7
chr2	215674090	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,4:0,0,7,1
chr2	215674323	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	215797542	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=160,136;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:0,5,0,2
chr2	215818604	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:11,2,2,0
chr2	215819853	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=197,142;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:6,0,5,0
chr2	215821549	.	CA	C,CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,18,19;MFRL=165,193,88;MMQ=60,60,60;MPOS=17,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.21,3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.402,0.299:7:0,1,0:2,0,0:1,1,0,5
chr2	215831743	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=200,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr2	215833415	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:7,3:4,4:11,1,6,1
chr2	215833622	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	215851246	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=96.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,18,10
chr2	215862383	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,14:0.254:57:15,6:28,8:28,15,12,2
chr2	215862633	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	215869066	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	215874965	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=196,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr2	215875251	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	215883988	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	215890299	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:215890299_G_T:215890299:0,0,1,0
chr2	215890312	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:215890299_G_T:215890299:0,0,2,0
chr2	215890324	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,0:1,0,4,0
chr2	215890352	.	GTT	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:1,7:0,1:2,0,8,0
chr2	215928972	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:1,1:7,5:1,7,0,6
chr2	215976231	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,16:0,16:0,0,33,0
chr2	216182769	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	216189951	.	CT	GG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:5,0:6,0:11,7,3,0
chr2	216190691	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr2	216197971	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	216200907	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=108.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,15:0,0,3,29
chr2	216209472	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr2	216211712	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=223,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr2	216235089	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,9,12
chr2	216243832	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,13:0,2:0,0,9,6
chr2	216248305	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	216253039	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr2	216253063	.	A	ATGACG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=119,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:0,1:4,0:0,5,0,1
chr2	216256344	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr2	216259479	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	216269046	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	216269095	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,6:0,0,12,6
chr2	216271763	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,12,0
chr2	216271812	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,21,5
chr2	216272138	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=239,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr2	216272900	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,6,8
chr2	216274853	.	A	AAC,AACAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30,23;MFRL=0,111,217;MMQ=60,60,60;MPOS=27,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=AC;STR;TLOD=4.97,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.520,0.376:5:0,1,1:0,2,0:0,0,2,3
chr2	216288777	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	216292868	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=98,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:5,0:10,2:12,4,1,1
chr2	216292881	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=98,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,0:12,2:11,6,1,1
chr2	216292903	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=107,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:3,2:8,1:6,7,2,1
chr2	216811707	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr2	216861273	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	216903894	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=230,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr2	216977644	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	216977701	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,6:5,2:10,2,8,0
chr2	216995591	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.415:29:8,7:9,4:14,3,8,4
chr2	217069151	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:4,5:7,12:0,11,2,15
chr2	217280261	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=159,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,0:2,1:0,3,0,2
chr2	217342000	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=177,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:1,3,0,3
chr2	217363935	.	CTCCAGGGCCTGCCTGGGT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:5,0:6,2:16,5,1,1
chr2	217364639	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,5:3,1:6,1,6,0
chr2	218673225	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=207,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr2	218675144	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	218679599	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=215,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:3,0,5,1
chr2	218694510	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:1,6:5,3:0|1:218694510_CT_C:218694510:5,2,9,0
chr2	218694512	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:2,6:4,2:0|1:218694510_CT_C:218694510:5,2,9,0
chr2	218694551	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.539:37:6,10:11,10:7,10,12,8
chr2	218713577	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:9,1:15,3,2,0
chr2	218747016	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=110,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,2:13,0:16,5,2,0
chr2	218750453	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=42.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr2	218750731	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,3:2,1:0|1:218750731_G_C:218750731:4,1,2,2
chr2	218750734	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=155,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:1,3:4,1:0|1:218750731_G_C:218750731:5,1,2,2
chr2	218750817	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=104,48;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.305:34:13,6:11,4:15,9,9,1
chr2	218757735	.	C	CAGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=130,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:4,4,1,1
chr2	218758070	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=205,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr2	218759674	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr2	218941095	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:4,5:4,2:8,0,5,2
chr2	219000079	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,4:8,0:12,8,4,0
chr2	219000992	.	CAAAAAAAAAA	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=19,35;MFRL=143,152;MMQ=57,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;RPA=15,5;RU=A;STR;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.230:20:4,3:3,1:0,16,0,4
chr2	219001014	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,139;MMQ=51,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,1:6,1:0,11,0,3
chr2	219082119	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=9,32;MFRL=209,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=119.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,35:0.966:37:0,24:0,11:2,0,33,2
chr2	219082330	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr2	219093435	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:13,6,2,0
chr2	219103313	.	CTTTTTT	C,CTTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34,34;MFRL=0,67,208;MMQ=60,53,60;MPOS=27,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,16,19;RU=T;STR;TLOD=3.01,7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,6:0.175,0.747:8:0,1,3:0,1,3:0,0,8,0
chr2	219103580	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=119.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,11:0,25:0,0,7,29
chr2	219128543	.	T	TTTTCCTGCCTCTC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=136,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.307:4:3,1:0,0:0|1:219128543_T_TTTTCCTGCCTCTC:219128543:0,3,0,1
chr2	219128550	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=137,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:219128543_T_TTTTCCTGCCTCTC:219128543:0,4,0,1
chr2	219128669	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	219129188	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:3,1,1,0
chr2	219136044	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.197:21:3,2:5,0:17,0,4,0
chr2	219142023	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	219142492	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr2	219142773	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr2	219142786	.	T	TGGTGAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=206,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:219142786_T_TGGTGAC:219142786:0,2,0,1
chr2	219142789	.	C	CCAATGTCTCA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=206,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:219142786_T_TGGTGAC:219142786:0,2,0,1
chr2	219188211	.	G	GTTCCTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,102;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	219206435	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr2	219209393	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr2	219222012	.	C	CTCTCTCTGTCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=191,141;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	219222491	.	C	CTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=170,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	219222506	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:219222506_C_CCA:219222506:0,0,0,1
chr2	219222507	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:219222506_C_CCA:219222506:0,0,0,1
chr2	219222733	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=124,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:2,7:3,12:3,2,15,4
chr2	219232354	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	219232427	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=221,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr2	219252437	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr2	219254668	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,0:12,2:12,13,1,1
chr2	219257688	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr2	219258920	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:19,2:6,0:12,14,1,1
chr2	219259844	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	219266204	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	219267913	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,5:4,3:4,5,4,4
chr2	219293113	.	CTG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=49,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:219293113_CTG_C:219293113:1,2,0,1
chr2	219293116	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=49,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:219293113_CTG_C:219293113:1,2,0,1
chr2	219293119	.	C	CCTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=138,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.499:4:0,2:2,0:1|0:219293113_CTG_C:219293113:0,2,1,1
chr2	219293124	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:219293113_CTG_C:219293113:0,1,0,1
chr2	219294080	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,1:13,1:13,10,0,2
chr2	219305404	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr2	219320207	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	219320233	.	GAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,0:1,0,2,2
chr2	219339283	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr2	219350358	.	CAAAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33,33,33;MFRL=0,132,157,130;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,27,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=24,19,20,21;RU=A;STR;TLOD=5.05,4.53,6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,5,4,5:0.307,0.300,0.339:14:0,3,2,4:0,2,2,1:0,0,14,0
chr2	219353195	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	219360754	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:219360754_T_C:219360754:0,2,0,1
chr2	219360764	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:219360754_T_C:219360754:0,2,0,1
chr2	219362927	.	A	ATTCCTGTTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=270,250;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	219410896	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	219414434	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=191,177;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:4,1:8,1:12,0,2,0
chr2	219414466	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=176,249;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,1:12,1:24,0,2,0
chr2	219418539	.	T	TTATTAATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=287,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	219433597	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=106.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,16:0,15:0,0,32,2
chr2	219452361	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:15,0:13,3:7,21,0,3
chr2	219480804	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	219498759	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	219501133	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,8:0,0,9,9
chr2	219501328	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0,0,5,8
chr2	219525668	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr2	219529199	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:3,6,0,2
chr2	219529228	.	C	CCACCCGAGGGCTTTCTGTAATATGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0,4,0,1
chr2	219538412	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:16,0:11,2:8,20,2,0
chr2	219557313	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr2	219603954	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=189,276;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:219603954_C_T:219603954:0,2,0,1
chr2	219603970	.	A	AAGTGAAAACCAAAAATTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=189,276;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:219603954_C_T:219603954:0,2,0,1
chr2	219614202	.	TTTTCTTTG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.690:1:0,1:0,0:0|1:219614202_TTTTCTTTG_T:219614202:0,0,0,1
chr2	219614211	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:219614202_TTTTCTTTG_T:219614202:0,0,0,1
chr2	219619202	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr2	219691566	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	219692527	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,4,9
chr2	219692790	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,2:0,7:0,0,4,5
chr2	219695598	.	TG	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=128,126;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,0:8,2:7,8,0,2
chr2	219696014	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=100.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,11:0,18:0,0,19,11
chr2	219825918	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,19;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.169:28:6,0:8,0:13,11,4,0
chr2	219826523	.	AGACCACCC	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=142,102;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.207:17:2,1:9,2:0|1:219826523_AGACCACCC_A:219826523:13,1,1,2
chr2	219826533	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=142,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:3,1:10,2:0|1:219826523_AGACCACCC_A:219826523:13,1,1,2
chr2	219826536	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=141,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:4,1:11,2:0|1:219826523_AGACCACCC_A:219826523:14,1,1,2
chr2	219826537	.	G	GTTT	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=141,102;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:4,1:10,2:0|1:219826523_AGACCACCC_A:219826523:14,1,1,2
chr2	219826538	.	C	CTCCT	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=141,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:4,1:11,2:0|1:219826523_AGACCACCC_A:219826523:14,1,1,2
chr2	219826542	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:4,1:11,1:0|1:219826523_AGACCACCC_A:219826523:15,1,0,2
chr2	219875748	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	219883930	.	G	GGCTGAAGGAGAACAAGAGCTGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=209,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.484:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	219893180	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr2	219903258	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr2	219903787	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr2	219922073	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	220012576	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	220022176	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr2	220022435	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,7:0,0,1,15
chr2	220028047	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,0:4,2:12,0,2,0
chr2	220028900	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:5,2,4,0
chr2	220033337	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.111:29:9,0:16,0:6,20,3,0
chr2	220033956	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:1,0,8,2
chr2	220034497	.	C	CCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CA;STR;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,3:1,2:1,1,4,1
chr2	220034816	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,21;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,1:0,0:1,0,0,2
chr2	220040216	.	CA	C,CAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,33,35;MFRL=173,177,139;MMQ=60,60,40;MPOS=12,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=14.22,5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,8,3:0.375,0.189:19:5,5,0:3,3,2:8,0,11,0
chr2	220040235	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=24,10;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:15,0:11,0:32,1,1,2
chr2	220041091	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=120,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr2	220041433	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=196,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	220041455	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,2:0,0,10,1
chr2	220043302	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	220045035	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,3:5,6:0,6,2,7
chr2	220046349	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,13,4
chr2	220047393	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	220071803	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr2	220071879	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	220072766	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=186.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.984:57:0,34:0,21:0,0,14,43
chr2	220072852	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,3:0,0,1,10
chr2	220078496	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,8:0,0,11,3
chr2	220081285	.	A	AATCCCTTATTTCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:220081285_A_AATCCCTTATTTCC:220081285:1,2,0,1
chr2	220081286	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:3,0:0,0:1|0:220081285_A_AATCCCTTATTTCC:220081285:1,2,0,1
chr2	220081290	.	T	TTGAAGGTAGGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1|0:220081285_A_AATCCCTTATTTCC:220081285:2,1,0,1
chr2	220082365	.	CAA	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,97;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.067:42:15,1:19,1:27,13,2,0
chr2	220083453	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chr2	220088248	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr2	220088899	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,0:5,2:11,6,0,2
chr2	220101974	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,23:0.600:38:5,14:10,8:8,7,14,9
chr2	220107149	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
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chr2	220107355	.	G	GTAATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:220107349_T_TCATGGGAAAAACCC:220107349:0,3,0,1
chr2	220107730	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	220159675	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:1,1:5,0:9,0,3,0
chr2	220166493	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:220166493_G_T:220166493:0,3,0,1
chr2	220166495	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:220166493_G_T:220166493:0,3,0,1
chr2	220166497	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:220166493_G_T:220166493:0,3,0,1
chr2	220166506	.	TG	AT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:220166493_G_T:220166493:0,3,0,1
chr2	220166511	.	G	GCAAAC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	220192359	.	C	CTTG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,24;MFRL=240,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220192359_C_CTTG:220192359:0,1,0,1
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chr2	220192363	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=240,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220192359_C_CTTG:220192359:0,1,0,1
chr2	220192364	.	A	AGGGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=240,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220192359_C_CTTG:220192359:0,1,0,1
chr2	220192366	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=240,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220192359_C_CTTG:220192359:0,1,0,1
chr2	220197456	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:1,5,0,3
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chr2	220239534	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr2	220239561	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,3:0,0,11,6
chr2	220246218	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,15,5
chr2	220250322	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,10,4
chr2	220250826	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr2	220250897	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr2	220251178	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	220251208	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	220264543	.	C	CAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr2	220284717	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	220284779	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,22:0,9:0,0,26,6
chr2	220285545	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220285545_CT_C:220285545:1,0,1,0
chr2	220285551	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220285545_CT_C:220285545:1,0,1,0
chr2	220313730	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220313730_AT_A:220313730:0,0,1,0
chr2	220313732	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220313730_AT_A:220313730:0,0,1,0
chr2	220313742	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=154,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:220313730_AT_A:220313730:1,0,1,0
chr2	220316579	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	220330724	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=86,68;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:3,3,0,2
chr2	220341727	.	G	GGAAGTAT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=34,34;MFRL=111,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,1:1,0:0|1:220341727_G_GGAAGTAT:220341727:1,2,0,1
chr2	220341734	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=36,32;MFRL=195,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1|0:220341727_G_GGAAGTAT:220341727:1,0,0,1
chr2	220341737	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=36,31;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,1:1|0:220341727_G_GGAAGTAT:220341727:1,1,0,1
chr2	220341741	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,30;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:220341727_G_GGAAGTAT:220341727:1,1,0,1
chr2	220341744	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,29;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:220341727_G_GGAAGTAT:220341727:1,1,0,1
chr2	220341747	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=22,26;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:220341747_G_T:220341747:1,1,0,1
chr2	220341751	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=36,31;MFRL=174,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:220341747_G_T:220341747:1,1,0,1
chr2	220343940	.	G	GTAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=166,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr2	220344004	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:220344004_G_C:220344004:0,1,0,1
chr2	220344008	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:220344004_G_C:220344004:0,0,0,1
chr2	220350163	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.099:48:18,2:26,2:18,26,2,2
chr2	220353650	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=137,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:220353650_G_GA:220353650:0,2,0,1
chr2	220353654	.	GC	CT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,33;MFRL=137,209;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:220353650_G_GA:220353650:0,2,0,1
chr2	220353659	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=137,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:220353650_G_GA:220353650:0,2,0,1
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chr2	220353665	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220353664_G_T:220353664:0,0,0,1
chr2	220353668	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220353664_G_T:220353664:0,0,0,1
chr2	220354745	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:220354745_T_G:220354745:2,2,0,1
chr2	220354747	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,11;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:220354745_T_G:220354745:2,2,0,1
chr2	220354750	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:220354745_T_G:220354745:2,2,0,1
chr2	220354754	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,35;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:220354745_T_G:220354745:1,2,0,1
chr2	220354759	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=14,13;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:220354745_T_G:220354745:0,2,0,1
chr2	220356806	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,2:0,0,7,3
chr2	220361265	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr2	220364750	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:9,8:7,6:7,9,6,8
chr2	220370317	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:7,0:13,3:5,16,0,3
chr2	220379839	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,1:9,1:12,10,1,1
chr2	220400103	.	GG	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220400103_GG_AT:220400103:0,0,0,1
chr2	220400106	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220400103_GG_AT:220400103:0,0,0,1
chr2	220401751	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr2	220402624	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	220406239	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=188,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr2	220409701	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	220415595	.	GGA	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=169,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GA;STR;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:1,5,2,3
chr2	220415646	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=109,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	220416164	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	220416535	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220416535_C_A:220416535:0,0,0,1
chr2	220416537	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220416535_C_A:220416535:0,0,0,1
chr2	220416540	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220416535_C_A:220416535:0,0,0,1
chr2	220416803	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=147.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,31:0,14:0,0,33,12
chr2	220416942	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.549:27:8,5:4,9:3,9,2,13
chr2	220416967	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.555:21:4,7:5,2:0,9,2,10
chr2	220419553	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	220421417	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:7,11:5,4:6,6,13,2
chr2	220421479	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.648:23:6,10:1,5:2,6,3,12
chr2	220427996	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	220428381	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:0,6:2,2:0,2,2,7
chr2	220431919	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr2	220432709	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=111,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.413:20:10,4:1,4:7,5,3,5
chr2	220432994	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:4,6,0,2
chr2	220435375	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	220437081	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.352:33:8,1:13,7:11,10,4,8
chr2	220466344	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.565:12:2,5:0,2:0|1:220466344_G_GT:220466344:2,3,7,0
chr2	220466360	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=115,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.353:20:6,1:4,0:0|1:220466344_G_GT:220466344:2,11,7,0
chr2	220471116	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,5,5
chr2	220473134	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=318,99;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:220473134_G_A:220473134:1,0,0,1
chr2	220473136	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=318,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:220473134_G_A:220473134:1,0,0,1
chr2	220474081	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:6,0:6,5,2,0
chr2	220476645	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	220479153	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:220479153_C_A:220479153:3,1,0,1
chr2	220479155	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:220479153_C_A:220479153:3,1,0,1
chr2	220479156	.	ACCCGC	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,1:2,0:0|1:220479153_C_A:220479153:4,1,0,1
chr2	220479182	.	G	GATT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,34;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:220479182_G_GATT:220479182:3,0,0,1
chr2	220479183	.	C	CATTTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:220479182_G_GATT:220479182:3,0,0,1
chr2	220479184	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:1,1:2,0:0|1:220479182_G_GATT:220479182:3,0,0,1
chr2	220480693	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	220492614	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,9;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:220492614_T_G:220492614:0,0,1,0
chr2	220492620	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220492614_T_G:220492614:0,0,1,0
chr2	220492624	.	CT	GG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,0;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:220492614_T_G:220492614:0,0,1,0
chr2	220499336	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr2	220501510	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:6,10,1,1
chr2	220505348	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr2	222290902	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:3,2:4,3:1,6,0,5
chr2	222301357	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	222301713	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,2,1
chr2	222301892	.	A	ATTTATTATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	222301912	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	222307534	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:3,2,5,1
chr2	222320427	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,1,18
chr2	223065870	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.966:25:0,13:0,10:0,0,17,8
chr2	223158601	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:223158601_C_CAG:223158601:0,1,0,1
chr2	223158602	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:223158601_C_CAG:223158601:0,1,0,1
chr2	223161606	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	223162024	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	223169231	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,17:0.391:44:10,10:17,7:8,19,7,10
chr2	223169325	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.429:40:17,10:6,7:18,5,7,10
chr2	223169658	.	G	GGCCAAGA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:3,1:9,7:3,9,4,4
chr2	223339533	.	CTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=T;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	223493435	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=185,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	223505479	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:5,1:6,2:12,1,3,0
chr2	223520905	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr2	223574708	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=202,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr2	223781017	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.327:17:5,2:6,3:7,5,5,0
chr2	223785846	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=195,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,3:1,4:1,3,0,7
chr2	223787496	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:13,2:10,15,0,2
chr2	223787559	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,5:5,6:1,8,1,10
chr2	223787691	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,5:4,5:9,0,10,0
chr2	223789080	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=241,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,3:1,5:2,0,9,0
chr2	223793471	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=192,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:0|1:223793471_C_T:223793471:5,0,6,0
chr2	223793480	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=53.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0|1:223793471_C_T:223793471:0,0,14,0
chr2	223797797	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	223799207	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr2	223806189	.	C	CTT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=137,162;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.283:5:1,0:2,1:3,1,1,0
chr2	223806194	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=144,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:2,1,2,2
chr2	223806207	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,11;MFRL=129,124;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:2,0:5,0:3,6,2,0
chr2	223918680	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,5:8,1:6,8,1,5
chr2	223919558	.	A	T	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=143,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=74.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,29:0.480:60:14,11:17,14:7,24,13,16
chr2	223919674	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr2	224462249	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:7,1:5,8,1,1
chr2	224629876	.	C	CCATCAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=CAT;STR;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.525:17:5,5:3,4:7,1,8,1
chr2	224743524	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=149,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,0:5,1:2,10,0,3
chr2	224758906	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=85.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,14:0,11:0,0,25,0
chr2	224763816	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	224765894	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr2	224770780	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr2	224777094	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=207.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,51:0.981:51:0,25:0,22:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,9,42
chr2	224777105	.	G	GTGAT	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=197.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,47:0.980:47:0,21:0,23:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,6,41
chr2	224862820	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,2:5,2:9,1,3,1
chr2	225244235	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=210,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:3,0,4,0
chr2	225365056	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,2:3,5:8,0,7,0
chr2	225367669	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=92,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.711:29:6,10:2,11:5,3,13,8
chr2	225368321	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=130,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,4:5,4:4,3,6,2
chr2	225376034	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:2,9:4,6:4,2,12,3
chr2	225400185	.	CCTTCAA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=210,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTCAA;STR;TLOD=54.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.792:17:3,7:0,7:3,0,11,3
chr2	225431679	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=145,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.499:28:5,8:9,6:3,11,4,10
chr2	225630435	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=156,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.552:36:6,8:10,12:13,3,15,5
chr2	225665074	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	225671007	.	T	TATTAGGTATTATAAG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225671007_T_TATTAGGTATTATAAG:225671007:0,1,0,1
chr2	225671011	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225671007_T_TATTAGGTATTATAAG:225671007:0,1,0,1
chr2	225671013	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225671007_T_TATTAGGTATTATAAG:225671007:0,1,0,1
chr2	225671015	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225671007_T_TATTAGGTATTATAAG:225671007:0,1,0,1
chr2	225671017	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=162,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225671007_T_TATTAGGTATTATAAG:225671007:0,1,0,1
chr2	225729757	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=130,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:4,0:7,5:5,6,1,4
chr2	225729849	.	A	AGGGCCTATG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	225750359	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=151,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,4:10,0:19,0,3,1
chr2	225761160	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=164,139;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:225761160_G_T:225761160:0,4,0,1
chr2	225761162	.	TT	AC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=164,139;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:225761160_G_T:225761160:0,4,0,1
chr2	225848390	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:8,1,4,0
chr2	225848579	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:7,8:8,2:4,11,2,8
chr2	225907150	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	226446639	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:11,0:16,8,2,0
chr2	227771389	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=189,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:8,0,5,1
chr2	227773466	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:6,9:9,3:13,2,10,2
chr2	227872995	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.449:36:10,8:9,8:12,8,6,10
chr2	227873028	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.480:21:5,6:6,4:3,8,0,10
chr2	227874957	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,4:6,3:11,1,7,0
chr2	227877037	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,2:1,0:1,3,1,1
chr2	227886925	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:7,4:5,5:2,10,3,6
chr2	227890394	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:9,0,2,0
chr2	227892720	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:3,6,1,2
chr2	227895125	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr2	227896652	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=114,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.403:23:10,2:3,7:9,5,7,2
chr2	227912331	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:0,6,0,6
chr2	227927189	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=12,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:0,2:0,1,5,0
chr2	227954599	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,2:6,1:7,5,2,1
chr2	227966148	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=103.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,19:0,10:0,0,28,3
chr2	227966298	.	T	TA,TAA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=157,137,168;MMQ=60,60,60;MPOS=16,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=33.50,3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,18,3:0.663,0.137:26:3,9,1:2,7,2:1,4,3,18
chr2	227967601	.	ACAATATTTCAGCAATAGGGAAAG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.934:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr2	227967830	.	GA	G	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=37,35;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=128.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,54:0.967:55:1,25:0,24:1,0,38,16
chr2	227973410	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr2	227973623	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,2:0,13:0,0,1,15
chr2	227974090	.	A	AATTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	227974113	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	228004932	.	G	GACATTTCATATT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=160,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:5,2:4,0:1,8,1,1
chr2	228104760	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0,0,14,1
chr2	228104774	.	AC	GG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=154,126;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:13,4:3,0:13,3,4,0
chr2	228109626	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr2	228109784	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	228112186	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=134.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,15:0,21:0,0,30,6
chr2	228118403	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,6:0,0,4,8
chr2	228119461	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,1:3,8:5,3,1,8
chr2	228122239	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=97,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:4,2:2,5:4,2,6,1
chr2	228131752	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:6,5:3,2:4,5,4,4
chr2	228144706	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=135,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	228145543	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:8,3:9,7:17,0,10,0
chr2	228149100	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=121,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:3,1:1,7,1,1
chr2	228149107	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,4:3,0:1,3,1,3
chr2	228158418	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.396:36:12,6:9,8:15,7,11,3
chr2	228159660	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=133,163;MMQ=53,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.615:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	228159677	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=45,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.395:6:1,0:1,0:1,3,2,0
chr2	228169632	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:8,4:3,5:11,0,9,0
chr2	228172623	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,0:12,2:6,17,0,2
chr2	228194480	.	AG	TT	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,28:0.420:67:14,12:25,16:16,23,10,18
chr2	228194570	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=108.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,2,30
chr2	228197368	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr2	228204929	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	228204982	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr2	228207625	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	228211074	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,6:0,0,0,16
chr2	228356182	.	GAAATATTT	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=75.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.480:42:9,12:7,8:22,0,20,0
chr2	228356364	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=182;ECNT=1;MBQ=33,32,33,33;MFRL=124,135,136,90;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,23,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=42.50,105.36,4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:15,34,70,7:0.256,0.578,0.049:126:6,18,33,5:6,9,35,2:3,12,38,73
chr2	228373404	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,23;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:1,1:0,4,0,2
chr2	228399480	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr2	228477819	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	228493338	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=189,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:3,1:0,5,0,3
chr2	228560728	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:5,10:8,8:6,7,11,7
chr2	228560800	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr2	228563815	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=113,169;MMQ=60,29;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:7,8,0,3
chr2	228563995	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,190;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:13,4,2,0
chr2	228567046	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=132,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:1,1:2,4:0,3,0,6
chr2	228736313	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,2:7,4:12,2,5,1
chr2	228736341	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:3,11:5,8:5,3,13,6
chr2	228736527	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:5,2:0,11,0,4
chr2	228741250	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,7:3,4:2,2,1,10
chr2	228750239	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,1,3
chr2	228758456	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=101,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr2	228767618	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr2	228767631	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr2	228777067	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=129,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:11,0:12,8,1,1
chr2	228777070	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=124,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,3:11,0:11,8,2,1
chr2	228783479	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:3,9:9,2:8,4,9,2
chr2	228788680	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=118,97;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:20,1:26,2:14,32,0,3
chr2	228855958	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.330:28:11,5:8,4:8,11,4,5
chr2	228858349	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,75071110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:2,7,0,2
chr2	228860461	.	C	CAGGT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=220,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:228860461_C_CAGGT:228860461:0,2,0,1
chr2	228860463	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=220,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:228860461_C_CAGGT:228860461:0,2,0,1
chr2	228860467	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=220,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:228860461_C_CAGGT:228860461:0,2,0,1
chr2	228881072	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	228882970	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,5:8,2:2,10,3,4
chr2	228884686	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=90,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.595:35:8,13:6,8:9,5,13,8
chr2	228973660	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=131,81;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:2,2,1,2
chr2	228996650	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=138,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:3,2,2,1
chr2	228996672	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=138,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:2,3,3,1
chr2	230135711	.	G	GC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=65.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.958:20:0,10:0,9:0,0,12,8
chr2	230411826	.	A	AGCGATAATAACAAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,109;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr2	230453224	.	A	AAGAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=87,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:230453224_A_AAGAT:230453224:2,1,0,1
chr2	230453225	.	C	CAGGGTACAGCTGCAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,35;MFRL=87,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:230453224_A_AAGAT:230453224:2,1,0,1
chr2	230456352	.	TAGGCAGTGTCACCGTTGCCTGAGAGCG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,2:8,0:9,15,1,1
chr2	230656987	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,2:4,1:0,13,0,3
chr2	230661483	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.098:49:24,1:20,3:10,35,0,4
chr2	230668953	.	T	TA	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:7,1:16,1:6,19,0,3
chr2	230668968	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:3,7:6,10:2,7,2,15
chr2	230668982	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:4,7:4,7:0,8,1,13
chr2	230705516	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,2:13,0:20,4,2,0
chr2	230705521	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=160,195;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:9,3:17,0:20,6,3,0
chr2	230841074	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,5:5,4:1,10,1,9
chr2	231034036	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=102,141;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:231034036_T_TC:231034036:0,2,0,1
chr2	231034037	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=204,141;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:231034036_T_TC:231034036:0,3,0,1
chr2	231034046	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=204,141;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:231034036_T_TC:231034036:0,3,0,1
chr2	231077393	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,3:8,0:11,0,3,0
chr2	231077636	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=149,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.167:21:7,0:6,2:13,5,0,3
chr2	231077643	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,10;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.266:20:6,1:6,0:11,4,0,5
chr2	231081405	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=134,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	231101855	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,4:4,1:4,7,2,3
chr2	231103185	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	231106244	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=135,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:1,2,3,5
chr2	231106306	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=207,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	231118186	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,7:3,2:0,7,0,10
chr2	231120255	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	231149108	.	G	A	.	.	DP=100;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=318.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,96:0.990:96:0,37:0,56:0,0,48,48
chr2	231157512	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=63.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.608:31:5,9:7,10:3,9,6,13
chr2	231157527	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,23:0.705:32:2,11:7,11:1,8,6,17
chr2	231174591	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:10,2:13,0:23,0,2,0
chr2	231175592	.	T	TGCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,296;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	231175763	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=191,177;MMQ=57,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.768:15:1,4:2,8:3,0,12,0
chr2	231177200	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.298:15:6,1:5,3:11,0,4,0
chr2	231193641	.	C	T,CAAAAACTTAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,32,35;MFRL=101,243,218;MMQ=60,60,60;MPOS=2,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,1,1:2,0,0:1,2,0,2
chr2	231193642	.	T	TGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=124,243;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:1,3,0,1
chr2	231193653	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	231226364	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,2:10,0:11,14,1,1
chr2	231226488	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=172,250;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	231258302	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=148,247;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	231330919	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=125,137;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.321:30:6,3:10,1:13,8,9,0
chr2	231330923	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=115,141;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.219:29:9,0:9,0:14,8,7,0
chr2	231334495	.	TA	T,TAA	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=31,31,30;MFRL=150,117,64;MMQ=60,60,60;MPOS=13,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=7.14,4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:48,9,7:0.125,0.095:64:16,4,3:27,5,4:27,21,7,9
chr2	231363231	.	G	C	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.090:63:21,0:24,0:17,41,0,5
chr2	231363252	.	TA	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.158:29:7,2:10,2:3,22,2,2
chr2	231405930	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=163,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:3,0,1,0
chr2	231683487	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=205,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr2	231738263	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0|1:231738263_C_T:231738263:0,0,3,8
chr2	231738269	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:231738263_C_T:231738263:0,0,3,7
chr2	231738318	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	231740276	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	231860848	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:231860848_A_G:231860848:0,0,1,0
chr2	231860856	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:231860848_A_G:231860848:0,0,1,0
chr2	231861032	.	TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=116.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.974:31:0,18:0,13:0,0,26,5
chr2	231864490	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:3,2,2,3
chr2	231864600	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	231865018	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=193,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr2	231865047	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,3:2,1:7,1,3,1
chr2	231865269	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.655:7:0,2:2,1:0,2,1,4
chr2	231940295	.	CT	C,CTT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=23,34,25;MFRL=146,159,119;MMQ=60,60,60;MPOS=11,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.15,8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,5,9:0.116,0.189:44:15,3,6:12,2,1:9,21,3,11
chr2	231944373	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.356:43:12,4:16,11:5,23,1,14
chr2	231988403	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.118:36:23,2:9,1:15,17,2,2
chr2	232026275	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=130,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:1,6:6,10:0,7,2,14
chr2	232030510	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	232030555	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=252,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr2	232035429	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,2:7,5:4,7,3,4
chr2	232072796	.	ATTTG	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTG;STR;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,5:6,3:13,1,8,0
chr2	232087385	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,3:6,6:11,0,9,0
chr2	232087474	.	AT	GA	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=210.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,26:0,22:0,0,20,28
chr2	232104566	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=121,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	232156257	.	AC	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=212,166;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr2	232196472	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.362:17:2,4:8,1:6,5,5,1
chr2	232317263	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=207,203;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr2	232324780	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=190,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr2	232326793	.	C	CTTCTTTAGATGGCTATTTAAAAATACTAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=234,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1,2,0,1
chr2	232326801	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr2	232574807	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr2	232645701	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=18,13;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.165:28:8,1:3,0:21,2,5,0
chr2	232653481	.	A	ACT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.942:13:0,6:0,6:0,0,2,11
chr2	233028070	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr2	233243660	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,6:0,0,5,8
chr2	233245090	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,145;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:4,2,5,0
chr2	233272162	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=154,219;MMQ=52,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:1,1:1,1,1,1
chr2	233272528	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:7,4:10,5:2,15,4,5
chr2	233272925	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,113;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr2	233274391	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,198;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,1:16,1:4,26,0,2
chr2	233323177	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	233345390	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=18,13;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.374:19:3,0:3,0:6,6,7,0
chr2	233346398	.	C	CACTGTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	233346662	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	233347919	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,1,15
chr2	233350000	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr2	233350041	.	A	AGGGCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=186,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:233350041_A_AGGGCC:233350041:0,1,0,1
chr2	233350042	.	T	TGGGAGCAGAGGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,16;MFRL=186,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:233350041_A_AGGGCC:233350041:0,1,0,1
chr2	233350045	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=186,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:233350041_A_AGGGCC:233350041:0,1,0,1
chr2	233390937	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=91,135;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,3:2,4:2,1,5,2
chr2	233392020	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=215,90;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AG;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:2,1,2,0
chr2	233398875	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,224;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:4,2,0,2
chr2	233405445	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:1,2,0,1
chr2	233406204	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=129,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:2,5,0,4
chr2	233408220	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr2	233413098	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233413098_C_G:233413098:0,0,0,1
chr2	233413101	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233413098_C_G:233413098:0,0,0,1
chr2	233413393	.	T	TCCATTTGTTTTCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,1746;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	233415978	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=119,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,24:0.663:36:4,15:7,9:3,9,9,15
chr2	233421284	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr2	233428927	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=92.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,29:0.566:51:12,14:9,15:17,5,22,7
chr2	233429144	.	GTATTTTATTT	G,GTATTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,215,244;MMQ=60,40,60;MPOS=10,33;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,5,6;RU=TATTT;STR;TLOD=7.29,11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.382,0.509:5:0,1,3:0,1,0:0,0,0,5
chr2	233445925	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=195,267;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:233445925_G_T:233445925:0,1,0,1
chr2	233445934	.	T	TTAGTTCAGTGCCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:233445925_G_T:233445925:0,0,0,1
chr2	233445937	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:233445925_G_T:233445925:0,0,0,1
chr2	233470900	.	TC	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=53.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.543:35:4,8:12,11:8,8,9,10
chr2	233470931	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.534:28:3,4:10,11:3,10,5,10
chr2	233536926	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	233620927	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:2,0:2,0:3,1,1,0
chr2	233641083	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,12,5
chr2	233652137	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr2	233660704	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:0,1:6,1:6,0,2,0
chr2	233708806	.	A	G	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,112;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,29:0.395:74:18,12:26,17:24,21,14,15
chr2	233711987	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:4,1,4,0
chr2	233712049	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:17,4:10,8:21,7,8,4
chr2	233712226	.	CACA	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,10:0.440:23:8,6:3,2:0|1:233712226_CACA_C:233712226:1,12,1,9
chr2	233712248	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=169,201;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.480:23:8,5:4,6:0|1:233712226_CACA_C:233712226:0,12,0,11
chr2	233712296	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=215,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,2:7,4:0,10,0,6
chr2	233721455	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.467:32:7,7:9,7:12,5,12,3
chr2	233740055	.	AAGAG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=AG;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:2,1:4,0,2,0
chr2	233740227	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=113,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,1:8,5:6,7,2,4
chr2	233740908	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	233744428	.	G	GGCAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	233746015	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233746015_C_G:233746015:0,0,0,1
chr2	233746017	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233746015_C_G:233746015:0,0,0,1
chr2	233746020	.	A	AATCCTGGCTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233746015_C_G:233746015:0,0,0,1
chr2	233748768	.	C	CCTACTTATCCAGTGTCTTCTCAGAAATCACTAAGGCCAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=157,152;MMQ=60,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr2	233750118	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,1,2
chr2	233877986	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,0:9,3:1,18,0,3
chr2	233925166	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.459:19:4,4:6,2:10,0,8,1
chr2	233925406	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:2,10,0,3
chr2	234072626	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.845:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr2	234079301	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:19,2:14,1:6,28,0,3
chr2	234091158	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,1,9
chr2	234091232	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	234093035	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:5,1,7,1
chr2	234104243	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	234107070	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,1:0,2,0,7
chr2	234113301	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=218,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,6:2,0:0,2,0,6
chr2	234178624	.	CTT	C,CT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=161,136,174;MMQ=60,60,60;MPOS=19,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=11.06,10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,7,8:0.212,0.258:32:9,2,6:8,5,2:16,1,13,2
chr2	234178781	.	AT	A	.	.	DP=100;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,6:0.099:66:27,5:18,1:6,54,1,5
chr2	234178811	.	CA	TG	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,2:0.037:79:54,1:20,1:0|1:234178811_CA_TG:234178811:0,77,0,2
chr2	234178814	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,2:0.037:79:54,1:18,1:0|1:234178811_CA_TG:234178811:0,77,0,2
chr2	234294561	.	T	TTC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,6:2,5:2,3,9,2
chr2	234350678	.	AG	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=200,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:234350678_AG_CT:234350678:0,2,0,1
chr2	234350681	.	G	GCCGCACCTCATTTA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=200,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:234350678_AG_CT:234350678:0,2,0,1
chr2	234356711	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=117,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,0:1,2:2,1,1,1
chr2	234371225	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=189,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.641:3:0,0:0,0:1,0,2,0
chr2	234372767	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:1,2:2,5:3,1,5,2
chr2	234372985	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=114,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:1,1,0,5
chr2	234377246	.	C	CTTGACCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=247,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	234386018	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=86,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,2:0,5:2,1,6,1
chr2	234394329	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,30:0.727:41:5,15:5,15:10,1,29,1
chr2	234396542	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,5:2,6:4,0,9,2
chr2	234397006	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.498:14:3,6:4,1:0,7,0,7
chr2	234398195	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:1,0:2,0:0,4,0,4
chr2	234405374	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=132,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:2,2,2,1
chr2	234407160	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=76.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,25:0.635:39:9,10:5,15:10,4,21,4
chr2	234418725	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:6,9,1,1
chr2	234421283	.	A	AATATTATTTTTCTTAGT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=58.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.550:26:5,6:5,8:1,10,1,14
chr2	234429739	.	T	TTTC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTC;STR;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,2:5,5:2,10,1,6
chr2	234438246	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	234442437	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=18,35;MFRL=163,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr2	234442492	.	A	AAGGTTTACTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:1,0:0,1:0|1:234442492_A_AAGGTTTACTCT:234442492:0,1,0,1
chr2	234442494	.	G	GGAACAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:234442492_A_AAGGTTTACTCT:234442492:0,1,0,1
chr2	234449462	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=220,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,0,4
chr2	234450843	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	234451094	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	234457900	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.384:32:7,8:12,4:1,19,0,12
chr2	234469945	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=194,183;MMQ=30,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:14,3:6,0:0,20,0,3
chr2	234469974	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=192,216;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,3:1,0:0,6,0,3
chr2	234590527	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:10,1,4,0
chr2	234637707	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:7,0,4,0
chr2	234638690	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,156;MMQ=57,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:0,8,0,9
chr2	234652717	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,281;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	234668879	.	C	CAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AT;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	234676411	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=224,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	234688036	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.351:35:11,6:12,6:12,11,6,6
chr2	234698579	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=119,90;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:7,8,2,1
chr2	234701602	.	G	GGGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=176,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:234701602_G_GGGA:234701602:0,3,0,1
chr2	234701605	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=176,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:234701602_G_GGGA:234701602:0,3,0,1
chr2	234701606	.	A	ACCATCACGTGTCT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=176,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:234701602_G_GGGA:234701602:0,3,0,1
chr2	234701611	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=176,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:234701602_G_GGGA:234701602:0,3,0,1
chr2	234701619	.	GG	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=100,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	234702449	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:6,1:5,7:0|1:234702449_G_A:234702449:3,9,3,5
chr2	234702459	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,0:7,6:0|1:234702449_G_A:234702449:5,7,1,5
chr2	234703136	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:5,1:4,2:2,9,1,2
chr2	234704495	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:4,1:4,1:4,4,1,2
chr2	234704690	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.550:20:1,6:7,5:6,3,5,6
chr2	234704746	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=288,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr2	234704974	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=78,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:234704974_G_GAA:234704974:1,1,0,1
chr2	234704975	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=78,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:234704974_G_GAA:234704974:1,1,0,1
chr2	234704981	.	G	GCTCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:234704974_G_GAA:234704974:0,0,0,1
chr2	234707341	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	234708570	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr2	234708629	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr2	234708824	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,4:5,3:7,2,6,2
chr2	234709000	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:1,7,0,7
chr2	234711008	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=79,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	234712652	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr2	234712921	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	234713588	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=249,118;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:234713588_C_G:234713588:2,0,1,0
chr2	234713591	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=214,118;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:234713588_C_G:234713588:3,0,1,0
chr2	234713812	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	234716272	.	TTG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:2,1:4,2,2,0
chr2	234717988	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:234717988_G_T:234717988:0,0,0,1
chr2	234717997	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0|1:234717988_G_T:234717988:0,0,0,1
chr2	234725502	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,10:0,0,8,13
chr2	234727250	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,9:0,0,10,4
chr2	234753008	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	234754506	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,2,12
chr2	234758393	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,2:3,4:3,5,3,3
chr2	234761225	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,15:0,10:0,0,12,13
chr2	234761355	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	234763137	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.417:24:8,7:6,2:4,10,7,3
chr2	234763226	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	234846198	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	234890391	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,8:2,4:6,0,12,0
chr2	234891850	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:9,5:3,9:10,2,4,10
chr2	234916831	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	234967539	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,11:0,0,10,19
chr2	234969184	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,104;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr2	235962513	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	236433161	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,24:0.407:59:22,11:13,12:15,20,10,14
chr2	236433331	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,0,12
chr2	236617736	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr2	236682914	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=102,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr2	236685731	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,0:6,4:2,8,0,4
chr2	236685762	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=167,166;MMQ=53,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr2	236691858	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=177,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	236817336	.	CT	C,CTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,34,34;MFRL=178,72,162;MMQ=60,60,60;MPOS=23,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.83,4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,2:0.420,0.246:9:2,1,1:1,2,1:3,0,5,1
chr2	236817357	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=154,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.152:18:7,0:4,0:14,2,2,0
chr2	236817629	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	236877066	.	AT	A,ATT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32,33;MFRL=155,124,105;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=T;STR;TLOD=14.51,7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,8,8:0.393,0.416:19:2,5,4:1,2,2:3,0,10,6
chr2	236923361	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,7:5,5:12,0,12,0
chr2	236923570	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,95;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:18,0:16,3:7,32,1,3
chr2	236949534	.	C	CCCAGTGTATCCTG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,20;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:1,2:1,0:0|1:236949534_C_CCCAGTGTATCCTG:236949534:0,2,1,1
chr2	236949539	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:236949534_C_CCCAGTGTATCCTG:236949534:0,2,0,1
chr2	236949541	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:236949534_C_CCCAGTGTATCCTG:236949534:0,2,0,1
chr2	236957675	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,4,1
chr2	237029104	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=167,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,1:6,6:4,6,3,4
chr2	237105050	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=152,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:3,4:3,4:1,5,3,6
chr2	237105095	.	G	GATGATGATGAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:237105095_G_GATGATGATGAT:237105095:0,0,0,1
chr2	237105097	.	GG	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:237105095_G_GATGATGATGAT:237105095:0,0,0,1
chr2	237247072	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:0,8,0,2
chr2	237276823	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=124,495;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,2:8,0:15,6,2,0
chr2	237308229	.	G	GGTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:237308229_G_GGTGT:237308229:0,1,0,1
chr2	237308230	.	C	CACCTGGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:237308229_G_GGTGT:237308229:0,1,0,1
chr2	237308233	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:237308229_G_GGTGT:237308229:0,1,0,1
chr2	237995735	.	G	GTTGTT	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TTGTT;STR;TLOD=79.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,21:0.499:42:7,10:13,10:0|1:237995735_G_GTTGTT:237995735:18,3,21,0
chr2	237995744	.	T	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=136,147;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:53,3:0.068:56:22,3:31,0:1|0:237995735_G_GTTGTT:237995735:47,6,3,0
chr2	238005370	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.354:15:3,4:6,1:9,1,5,0
chr2	238243579	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.222:19:8,0:6,3:0,15,0,4
chr2	238244863	.	TGCA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCA;STR;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr2	238253930	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:0,4:2,5:0,2,1,8
chr2	238255120	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=117,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,4:5,5:5,3,7,2
chr2	238257127	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:3,2,3,2
chr2	238257213	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=116,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:8,7:5,9:10,3,12,4
chr2	238257353	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=75,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,6:0,1:0,4,1,6
chr2	238257396	.	G	GGTGTGTGTGGCCTCCAGGTGTGTCATGTACCCCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=202,200;MMQ=60,43;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.322:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr2	238261112	.	GC	AA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:3,2,5,1
chr2	238261194	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=150,206;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:7,0:7,5,3,0
chr2	238267058	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr2	238269871	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.681:20:4,9:2,4:1,5,4,10
chr2	238341661	.	A	AC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=193,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.244:18:7,1:6,2:12,2,3,1
chr2	238419543	.	C	CGTGT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=GT;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,2:1,1:0,1,2,1
chr2	238419611	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:3,2,2,4
chr2	238427142	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:8,5:6,8:9,5,10,3
chr2	238427251	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=120,151;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.483:35:10,8:8,8:7,11,3,14
chr2	238428454	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:238428454_T_C:238428454:0,0,2,0
chr2	238428459	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:238428454_T_C:238428454:0,0,2,0
chr2	238435897	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	238460991	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.212:20:6,3:9,0:9,7,2,2
chr2	238475619	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	238536255	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	238632132	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:9,3:6,0:0|1:238632132_T_A:238632132:17,0,4,0
chr2	238632135	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:9,4:8,0:0|1:238632132_T_A:238632132:17,0,4,0
chr2	238662209	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,36;MFRL=235,181;MMQ=45,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238662209_TG_CA:238662209:0,1,0,1
chr2	238662213	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=235,181;MMQ=45,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238662209_TG_CA:238662209:0,1,0,1
chr2	238662217	.	TT	CC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=235,181;MMQ=45,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238662209_TG_CA:238662209:0,1,0,1
chr2	238662218	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,36;MFRL=0,235;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,1:0,0:1|0:238662209_TG_CA:238662209:0,0,0,1
chr2	238662221	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=233,181;MMQ=53,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:238662209_TG_CA:238662209:0,2,0,1
chr2	238688244	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	238726339	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=158,64;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:18,1:16,1:19,15,0,2
chr2	238896494	.	C	CA,CAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34,33;MFRL=75,154,127;MMQ=60,60,60;MPOS=26,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.42,7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,8,5:0.553,0.348:14:0,3,1:1,5,3:1,0,13,0
chr2	238903310	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr2	238912120	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=144,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr2	238939370	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.558:11:2,4:1,2:1,4,0,6
chr2	238940752	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:9,4:3,1:13,0,5,0
chr2	238944441	.	ACT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=121,315;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:3,0,1,0
chr2	238978064	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,19;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.119:32:9,1:8,0:12,17,0,3
chr2	238982516	.	TTC	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=216,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:238982516_TTC_T:238982516:0,1,0,1
chr2	238982522	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=216,179;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:238982516_TTC_T:238982516:0,1,0,1
chr2	238991557	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:4,1:0,2:0|1:238991557_CT_C:238991557:4,0,3,0
chr2	238991560	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,3:2,0:3,0,4,0
chr2	238991562	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:4,1:0,0:0|1:238991557_CT_C:238991557:4,0,3,0
chr2	239002480	.	CTTG	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=71.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,9:0,8:0,0,14,4
chr2	239007806	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	239007850	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr2	239010577	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr2	239025523	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,9,4
chr2	239025755	.	G	GTCCTTGTCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	239036416	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0|1:239036416_T_C:239036416:0,0,1,8
chr2	239036423	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,1:0,5:0|1:239036416_T_C:239036416:0,0,0,7
chr2	239037273	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	239049540	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=204,192;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,2:5,4:6,4,3,3
chr2	239049751	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=189,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:2,15,1,1
chr2	239054504	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,4:0,11:0,0,3,12
chr2	239059610	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.782:21:2,9:2,6:3,1,7,10
chr2	239082166	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:3,1,5,0
chr2	239092485	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	239093788	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,4:7,4:16,0,8,0
chr2	239102856	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,5:6,4:12,0,9,0
chr2	239103574	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=114,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,2:3,5:1,5,0,7
chr2	239103614	.	TA	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=187,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:239103614_TA_CT:239103614:0,4,0,1
chr2	239103617	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=187,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:239103614_TA_CT:239103614:0,4,0,1
chr2	239134138	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=121,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:1,2:4,2:1,4,0,4
chr2	239139920	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,5:5,4:1,6,2,7
chr2	239148996	.	CCCGT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCGT;STR;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:3,6:1,3:2,3,7,2
chr2	239155105	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=149,152;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:4,10,0,2
chr2	239168596	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.228:24:10,1:9,4:18,1,5,0
chr2	239184581	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:2,2:8,2:1,10,0,4
chr2	239234629	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,0:14,2:0|1:239234629_G_A:239234629:4,21,1,1
chr2	239234638	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=142,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:9,2:0|1:239234629_G_A:239234629:4,16,1,1
chr2	239237953	.	G	T	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,42:0.599:70:6,17:21,25:1,27,1,41
chr2	239241445	.	AT	A,ATT	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=155,163,141;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=11.65,6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:41,10,9:0.163,0.148:60:21,9,5:17,1,4:30,11,17,2
chr2	239242719	.	G	GT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.457:16:0,0:2,2:0,9,1,6
chr2	239247174	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=192,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr2	239264713	.	G	GTTGAAAAATCA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=144,54;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,2:12,0:0|1:239264713_G_GTTGAAAAATCA:239264713:2,15,1,1
chr2	239264715	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=144,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,2:11,0:0|1:239264713_G_GTTGAAAAATCA:239264713:2,15,1,1
chr2	239264717	.	A	ATTTTAT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,2:11,0:0|1:239264713_G_GTTGAAAAATCA:239264713:2,14,1,1
chr2	239264718	.	G	GTTA	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=148,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:3,1:10,0:0|1:239264713_G_GTTGAAAAATCA:239264713:2,14,1,1
chr2	240016824	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:5,6:3,9:0,8,0,15
chr2	240029736	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,8:0,0,12,0
chr2	240048437	.	A	ATTGGGTCAGAAAGGTGACAAGGTCTTATAGACCAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=134,170;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.383:4:3,1:0,0:0|1:240048437_A_ATTGGGTCAGAAAGGTGACAAGGTCTTATAGACCAT:240048437:0,3,0,1
chr2	240048441	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=145,170;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:240048437_A_ATTGGGTCAGAAAGGTGACAAGGTCTTATAGACCAT:240048437:0,2,0,1
chr2	240048452	.	GGCT	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:240048452_GGCT_G:240048452:0,1,0,1
chr2	240048457	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:240048452_GGCT_G:240048452:0,1,0,1
chr2	240055901	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr2	240061394	.	TG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.130:27:11,3:11,0:15,9,2,1
chr2	240066417	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.922:23:0,10:1,12:0,1,6,16
chr2	240085403	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	240085702	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:1,0:0,0:0|1:240085702_A_C:240085702:0,2,0,1
chr2	240085705	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:240085702_A_C:240085702:0,1,0,1
chr2	240085707	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,10;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:240085702_A_C:240085702:0,1,0,1
chr2	240323905	.	T	TG	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=123.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,42:0.566:74:19,20:13,21:17,15,25,17
chr2	240500413	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,5:2,3:4,5,3,6
chr2	240500437	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:5,4:2,1:5,2,2,4
chr2	240504878	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,2:2,5:0,5,0,7
chr2	240702216	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:0,7,0,3
chr2	240721598	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=121,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.673:22:5,8:1,6:2,5,5,10
chr2	240834669	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=134,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.812:19:1,8:2,8:2,1,9,7
chr2	240900607	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.361:21:6,3:6,4:6,8,5,2
chr2	240923146	.	TC	CT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.410:32:8,6:10,7:7,12,6,7
chr2	240946766	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:4,6:11,4:7,8,4,7
chr2	240954110	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:4,2:7,1:12,0,3,0
chr2	240958129	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=150,234;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:5,2:0,6,0,3
chr2	240985511	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=200,192;MMQ=24,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	241078784	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,1:5,5:0,7,1,5
chr2	241079382	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=217,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:3,1,3,1
chr2	241375527	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	241390827	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr2	241394518	.	GAA	TCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,18;MFRL=106,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:241394518_GAA_TCT:241394518:1,2,0,1
chr2	241394523	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=106,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:241394518_GAA_TCT:241394518:1,2,0,1
chr2	241394527	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=106,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:241394518_GAA_TCT:241394518:1,2,0,1
chr2	241395353	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:241395353_A_G:241395353:0,0,1,0
chr2	241395367	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:241395353_A_G:241395353:0,0,1,0
chr2	241395960	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,5:1,2:1,1,5,2
chr2	241397333	.	CT	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:241397333_CT_AG:241397333:1,0,1,0
chr2	241397338	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,13;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:241397333_CT_AG:241397333:1,0,1,0
chr2	241397342	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:241397333_CT_AG:241397333:1,0,1,0
chr2	241420522	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=101,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:7,2:0|1:241420522_A_T:241420522:5,6,1,1
chr2	241420525	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=101,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:2,0:9,2:0|1:241420522_A_T:241420522:5,6,1,1
chr2	241420533	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=81,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,3:2,5:1,1,2,6
chr2	241439326	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:241439326_G_C:241439326:0,0,5,1
chr2	241439329	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:241439326_G_C:241439326:0,0,5,1
chr2	241439337	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:241439326_G_C:241439326:0,0,6,1
chr2	241440020	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	241451326	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=159,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,1,1
chr2	241452198	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr2	241452212	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr2	241492255	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	241512470	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,6:1,3:2,0,9,0
chr2	241531978	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:20,1:9,2:2,28,0,3
chr2	241534381	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr2	241535830	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:9,0:12,2:6,15,0,2
chr2	241538229	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:0,5,0,6
chr2	241555784	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:2,0,3,2
chr2	241631267	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	241657662	.	G	GGAAATGGAGCGGCTCCGGGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=216,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:241657662_G_GGAAATGGAGCGGCTCCGGGA:241657662:0,1,0,1
chr2	241657665	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=216,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:241657662_G_GGAAATGGAGCGGCTCCGGGA:241657662:0,1,0,1
chr2	241659368	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=176,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,3:1,1:0,2,0,4
chr2	241662141	.	C	CCATTTTTAGTTCTACTTTGACACGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	241663019	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:1,3,1,1
chr2	241674222	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,8:0,0,2,13
chr2	241680644	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	241696840	.	ATCC	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TCC;STR;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.901:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr2	241702561	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	241702840	.	AGGAGAAAGGGGAAC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:241702840_AGGAGAAAGGGGAAC_A:241702840:0,0,0,1
chr2	241702859	.	G	GTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:241702840_AGGAGAAAGGGGAAC_A:241702840:0,0,0,1
chr2	241702861	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:241702840_AGGAGAAAGGGGAAC_A:241702840:0,0,0,1
chr2	241712094	.	C	CCCCACGGCGACTGAAGTCATCCTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=184,33;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr2	241712707	.	GGACA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=148,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:1,4,1,1
chr2	241722613	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	241727429	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=13,14;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.424:5:0,0:1,0:0|1:241727429_A_C:241727429:2,1,2,0
chr2	241727435	.	C	CCGGGGGG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,1:2,1:0|1:241727429_A_C:241727429:2,1,2,0
chr2	241727436	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=19,25;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,1:1,0:0|1:241727429_A_C:241727429:2,1,2,0
chr2	241808685	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:3,2,2,1
chr2	241808792	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=127,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,1,1
chr2	241813496	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:1,2,3,1
chr2	241814432	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=275,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	241815307	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=88,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,3:1,3:1,1,9,0
chr2	241815473	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,0:5,6:1,7,1,5
chr2	241818261	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	241827676	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:0,0:2,1:2,0,1,1
chr2	241827696	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,1,3
chr2	241834875	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:3,2,3,0
chr2	241871847	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,4:6,6:5,3,2,8
chr2	241874559	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=197,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:0|1:241874559_T_C:241874559:0,2,0,3
chr2	241874577	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=191,187;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:241874559_T_C:241874559:0,2,0,1
chr2	241889171	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:1,4,1,3
chr2	241889937	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=139,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:2,4:9,5:4,7,1,8
chr2	241898824	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=94,114;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:4,8:8,4:10,3,4,8
chr2	241898947	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:2,0:7,2:2,7,0,4
chr2	241903108	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:11,2:11,7,2,0
chr2	241973385	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr2	241973972	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=138,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.374:13:5,1:1,0:6,2,5,0
chr2	241974228	.	G	GAGATACTGAGCACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.304:4:0,1:2,0:1,2,0,1
chr2	241976615	.	CG	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,7:5,3:7,3,7,4
chr2	242003558	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr2	242004199	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr2	242004219	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=34.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,9,5
chr2	242011081	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:242011081_A_C:242011081:0,0,1,0
chr2	242011104	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:242011081_A_C:242011081:0,0,1,0
chr2	242011112	.	CGAGA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=185,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:242011081_A_C:242011081:0,1,1,0
chr2	242011122	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=185,255;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:242011081_A_C:242011081:0,1,1,0
chr2	242011151	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr2	242011314	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=173,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.303:13:6,0:2,0:1,8,4,0
chr2	242021129	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,1:8,5:6,7,2,4
chr2	242026957	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:4,4:5,1:1,8,1,4
chr2	242029359	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.350:35:13,6:10,6:22,1,10,2
chr2	242036871	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,2:3,5:1,7,1,6
chr2	242046737	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:5,4:7,3:8,5,5,2
chr2	242046993	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=225,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	242047750	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=118,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,1:4,1:3,6,0,2
chr2	242063350	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=73,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:1,1,4,0
chr2	242072280	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:1,1,2,2
chr2	242077298	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	242079233	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	242082480	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr2	242099961	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,11:0,0,1,19
chr2	242142737	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr2	242149073	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	242157735	.	C	CAGAATTAGCCTTGGCCTATGATCCCACAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	242162503	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr2	242163461	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:6,2:1,1:7,1,4,0
chr2	242168967	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:2,2:6,0:4,5,1,1
chr2	242182145	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=133,110;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:1,6,0,2
chr2	242186391	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:6,1,5,0
chr2	242194583	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=183,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,4:4,3:1,7,2,5
chr2	242194597	.	TG	AA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=201,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:242194597_TG_AA:242194597:2,8,1,1
chr2	242194601	.	T	TAAGGACACGTTTTTCACC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=201,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:242194597_TG_AA:242194597:2,6,1,1
chr2	242259614	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=128,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.262:39:16,2:13,7:20,9,6,4
chr2	242263615	.	G	GT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.209:25:9,2:11,3:19,1,5,0
chr2	242265313	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=195,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	242276333	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=205,188;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:242276333_A_AC:242276333:0,4,0,1
chr2	242276336	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=205,191;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:242276336_CT_AA:242276336:0,4,0,1
chr2	242276337	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=206,188;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:0|1:242276333_A_AC:242276333:0,3,0,1
chr2	242276342	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,33;MFRL=203,191;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:242276336_CT_AA:242276336:0,3,0,1
chr2	242283094	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=187,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr2	242285545	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:13,4:7,7:13,7,9,2
chr2	242289663	.	C	CATT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATT;STR;TLOD=68.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,19:0.391:49:15,8:14,11:1,29,0,19
chr2	242371254	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=132,145;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:242371254_A_T:242371254:0,3,0,1
chr2	242371256	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=132,145;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:242371254_A_T:242371254:0,3,0,1
chr2	242402087	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,5:3,0:0,7,0,5
chr2	242423044	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=187,228;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	242433348	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.485:19:7,4:1,5:10,0,8,1
chr2	242594622	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:4,3,4,1
chr2	242605962	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=132,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:5,0,4,0
chr2	242607483	.	GC	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=169,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	242608183	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr2	242610253	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=86,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,3:1,2:0,4,0,5
chr2	242610773	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,12:0,0,11,14
chr2	242611547	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=77,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:5,2,2,0
chr2	242615462	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr2	242615472	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=94,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,2,0
chr2	242615528	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,1,2
chr2	242617792	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	242617851	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,3:2,0:7,1,2,1
chr2	242641566	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	242643983	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:5,0:0,2:5,0,2,0
chr2	242643998	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=130,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:3,2,5,0
chr2	242644173	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=97,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,2:1,3:2,3,0,5
chr2	242648545	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:1,5:1,2:0|1:242648545_C_T:242648545:2,0,8,0
chr2	242648549	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=176,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:0|1:242648545_C_T:242648545:1,0,8,0
chr2	242650832	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=104,54;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:5,0:19,2:17,7,2,0
chr2	242651331	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=53.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:6,6:5,11:8,3,16,1
chr2	242662761	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.352:12:5,1:1,2:0,8,0,4
chr2	242664463	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:5,0:5,6,2,1
chr2	242674959	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	242684115	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=179,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,6:3,2:5,1,5,3
chr2	242688203	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=166,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:3,2,2,1
chr2	242688366	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=161,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr2	242694697	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=147,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:242694697_G_C:242694697:2,1,1,0
chr2	242694707	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=142,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:242694697_G_C:242694697:3,1,1,0
chr2	242694711	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=171,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:242694697_G_C:242694697:3,1,1,0
chr2	242707101	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.378:41:9,8:13,7:16,10,13,2
chr2	242755599	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:7,0,4,0
chr2	242758475	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,365;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	242801062	.	C	CTCAGCTTTTAGCCCCCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	242813241	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,2:0,0,4,7
chr2	242813276	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,0,9
chr2	242815267	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:13,9,0,2
chr2	242836365	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,2:7,3:8,4,3,2
chr2	242839581	.	A	ATGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=211,86;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:242839581_A_ATGT:242839581:0,1,0,1
chr2	242839583	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,21;MFRL=211,86;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:242839581_A_ATGT:242839581:0,1,0,1
chr2	242842568	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.331:31:8,5:13,5:6,15,5,5
chr3	367757	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=70.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,25:0.500:50:13,16:12,9:7,18,6,19
chr3	386247	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr3	391001	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr3	402069	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=136,143;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:11,3:18,0:18,12,3,0
chr3	403345	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr3	423904	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=108,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.407:32:7,3:12,9:14,5,8,5
chr3	440088	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr3	1269680	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:5,4:8,4:4,9,3,5
chr3	1320271	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	1337203	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr3	1337259	.	G	GTT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=164,54;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=T;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:1337259_G_GTT:1337259:12,3,1,1
chr3	1337269	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=162,54;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:7,2:0|1:1337259_G_GTT:1337259:14,4,1,1
chr3	1337275	.	TG	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=161,54;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:1337259_G_GTT:1337259:15,3,1,1
chr3	1337279	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=158,54;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:10,2:0|1:1337259_G_GTT:1337259:16,5,1,1
chr3	1339680	.	GGTTTTT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GTTTTT;STR;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.426:17:6,1:3,6:1,9,1,6
chr3	1369105	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,5,1
chr3	1369278	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:4,5:5,2:0,9,2,5
chr3	1413903	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr3	1415195	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	1415811	.	TAAAAC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=11071958,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAC;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr3	1427566	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:1,1,0,4
chr3	1444243	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,105;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr3	2908335	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr3	3030223	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr3	3078840	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,4:0,0,10,5
chr3	3080527	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	3081750	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:4,5,1,3
chr3	3081959	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=210,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.711:11:1,4:1,4:0,3,2,6
chr3	3082003	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=182,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr3	3084147	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr3	3095404	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=266,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	3097942	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=107,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr3	3118142	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,2:1,5:6,0,7,0
chr3	3137155	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=14,30;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,5:0,3:0,1,0,11
chr3	3170910	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,4,15
chr3	3170947	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	3171502	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	3171713	.	G	GCCTGACT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	3188362	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr3	3189059	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=87.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,22,2
chr3	3189398	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:7,9:6,8:0,13,3,15
chr3	3192524	.	A	ATAAC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAC;STR;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,4:4,4:10,2,9,1
chr3	3194107	.	G	GA	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=111,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,34:0.453:75:18,13:17,10:33,8,24,10
chr3	3194301	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.126:37:16,0:17,4:5,28,0,4
chr3	3197871	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=299.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,86:0.989:86:0,39:0,43:0,0,59,27
chr3	3215901	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=120,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.403:23:8,5:5,4:8,6,3,6
chr3	3215954	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr3	3221430	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,9:0,0,1,19
chr3	3886721	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=130,201;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:7,1:4,6:6,5,6,3
chr3	3886847	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=129,128;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:4,3:7,11:3,8,3,11
chr3	3889067	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=180,151,154;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.24,12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,6:0.339,0.535:11:0,0,1:1,4,5:1,0,9,1
chr3	4345849	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=200,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr3	4358782	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.121:22:7,2:12,0:0|1:4358782_G_GA:4358782:1,19,0,2
chr3	4358788	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:7,1:12,0:0|1:4358782_G_GA:4358782:1,21,0,2
chr3	4403767	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.851:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr3	4403817	.	TT	AC,AT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,31,31;MFRL=0,193,132;MMQ=60,60,60;MPOS=22,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=33.42,42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,11,15:0.414,0.552:26:0,6,8:0,4,7:0,0,20,6
chr3	4403837	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,20,8
chr3	4452737	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	4461698	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	4687470	.	G	GCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	4693937	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,3:0,3:0,5,2,4
chr3	4693943	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0|1:4693943_G_A:4693943:0,4,0,4
chr3	4693953	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:0|1:4693943_G_A:4693943:0,6,0,3
chr3	4693959	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:0|1:4693943_G_A:4693943:0,6,0,3
chr3	4695680	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	4700012	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=199,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:4700012_G_T:4700012:1,3,0,1
chr3	4700018	.	AC	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=199,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:4700012_G_T:4700012:1,3,0,1
chr3	4704986	.	C	T,A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31,32;MFRL=222,129,167;MMQ=60,60,60;MPOS=13,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,1:2,1,0:0,3,0,2
chr3	4704991	.	TG	AG,CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29,32;MFRL=222,129,167;MMQ=60,60,60;MPOS=8,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,0,1:1,1,0:0,3,0,2
chr3	4709007	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,6:1,1:1,1,6,1
chr3	4716708	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr3	4738774	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,52;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr3	4776784	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr3	4819151	.	A	AATGCTTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=216,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	4821374	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr3	4829732	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,27:0.431:62:15,10:20,14:8,27,11,16
chr3	4856180	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,16:0,21:0,0,24,13
chr3	4856234	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=126,124;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.495:40:11,9:9,9:9,11,7,13
chr3	4856650	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,2:1,4:6,0,6,0
chr3	4856993	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr3	4859725	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=113.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,14:0,19:0,0,30,8
chr3	5023221	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=122,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,4:4,2:4,5,1,5
chr3	5241223	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	6903260	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:5,3:4,5:4,5,3,6
chr3	6903297	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=170,188;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,1:5,7:2,4,1,7
chr3	6903601	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr3	7348129	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:6,2:0,2:6,0,4,0
chr3	7456675	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr3	7494245	.	TTG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=78,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TG;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.559:5:1,1:1,1:1,1,3,0
chr3	7620168	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,19:0.401:48:13,12:15,7:0|1:7620168_A_G:7620168:10,19,7,12
chr3	7620170	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=135,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:45,3:0.080:48:22,0:19,3:1|0:7620168_A_G:7620168:16,29,1,2
chr3	7621093	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,4:4,3:0,5,0,7
chr3	7722083	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=221,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	8543713	.	G	GT	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=153.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.981:46:0,25:0,21:0,0,3,43
chr3	8579093	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,7:5,2:3,4,4,5
chr3	8609071	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=130,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:5,1,3,1
chr3	8665360	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=151,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:2,0:2,5:0,4,1,5
chr3	8667896	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:3,0:0,1:2,1,1,1
chr3	8669361	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.534:28:5,6:6,8:0|1:8669361_C_A:8669361:9,4,5,10
chr3	8669367	.	TG	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=55.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.517:29:6,4:7,9:0|1:8669361_C_A:8669361:9,5,6,9
chr3	8671319	.	C	CTGACTCACCAGTGGTTCACAGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGACTCACCAGTGGTTCACAGA;STR;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.493:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	8775379	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,4:5,4:8,0,8,0
chr3	8931984	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr3	8932189	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,6:2,6:2,3,5,7
chr3	8955240	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	8983367	.	TC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,1:7,0:4,13,0,2
chr3	8988809	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	9000759	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,1:10,1:0,13,0,2
chr3	9005078	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,22:0.467:47:11,8:13,13:5,20,3,19
chr3	9005085	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,25:0.518:48:11,9:10,15:2,21,5,20
chr3	9032159	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=201,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.763:15:1,4:2,7:3,0,12,0
chr3	9036010	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr3	9069747	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.469:41:10,12:10,7:14,8,12,7
chr3	9088974	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	9089254	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	9102103	.	T	TTTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=173,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:9102103_T_TTTA:9102103:0,2,0,1
chr3	9102106	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=173,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:9102103_T_TTTA:9102103:0,2,0,1
chr3	9102137	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	9406661	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:4,1,7,1
chr3	9406704	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:11,4:9,8:17,3,10,2
chr3	9407022	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,6:7,2:2,10,1,7
chr3	9416380	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,5:7,5:1,8,1,9
chr3	9489767	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	9495385	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=141.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,22:0,18:0,0,35,5
chr3	9593942	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=19,18;MFRL=128,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.367:9:1,0:2,0:0|1:9593942_C_G:9593942:3,3,3,0
chr3	9593950	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,9;MFRL=134,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:1,0:4,0:0|1:9593942_C_G:9593942:2,3,3,0
chr3	9593955	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,15;MFRL=128,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.361:9:2,0:4,0:0|1:9593942_C_G:9593942:3,3,3,0
chr3	9691526	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=210,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr3	9730529	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.434:5:0,0:2,1:0,3,0,2
chr3	9743398	.	TGGAG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGAG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	9746154	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	9747441	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=202,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:9747441_G_A:9747441:1,1,0,1
chr3	9747443	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=202,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:9747441_G_A:9747441:1,1,0,1
chr3	9757287	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	9758664	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=172,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr3	9759884	.	AG	TT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=90,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:0,0:0|1:9759884_AG_TT:9759884:0,2,0,1
chr3	9759892	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=90,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:0,0:0|1:9759884_AG_TT:9759884:0,2,0,1
chr3	9768461	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr3	9780806	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=175,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:8,9,1,1
chr3	9799113	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr3	9803126	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.268:28:7,2:13,5:12,9,5,2
chr3	9831112	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	9831680	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=220,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr3	9841989	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:1,4,3,6
chr3	9854865	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:3,3,3,0
chr3	9854913	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:5,3:5,4,2,2
chr3	9857974	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,11;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:9857974_G_T:9857974:0,1,0,1
chr3	9857983	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9857974_G_T:9857974:0,0,0,1
chr3	9857985	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:9857974_G_T:9857974:0,0,0,1
chr3	9859456	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=130,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:2,2,1,4
chr3	9876301	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	9880697	.	GGCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,3,1
chr3	9918776	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:11,7:4,3:11,4,6,4
chr3	9944636	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=101,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:8,4:10,3:10,8,6,1
chr3	9944832	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=255,91;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr3	9945933	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=201,222;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	9962157	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=115,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:3,3:3,1:6,0,5,0
chr3	9969932	.	TGG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:0,3:2,2:1,1,2,3
chr3	9972484	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=147,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.602:8:1,3:2,2:0|1:9972484_T_C:9972484:3,0,5,0
chr3	9972493	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:9972484_T_C:9972484:0,0,12,0
chr3	9974460	.	G	GCA	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,56;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:19,2:17,0:16,22,0,2
chr3	9975353	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	9988095	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.521:27:3,7:8,6:5,8,5,9
chr3	10028286	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:16,2:16,1:17,17,2,1
chr3	10049334	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.684:11:1,0:2,0:3,0,0,8
chr3	10081106	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr3	10088223	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=162,166;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:20,4:14,2:30,4,6,0
chr3	10088239	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=159,166;MMQ=60,47;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,17:0.273:64:24,6:21,8:0|1:10088239_G_A:10088239:37,10,17,0
chr3	10088242	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=159,166;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,17:0.272:64:24,7:22,9:0|1:10088239_G_A:10088239:37,10,17,0
chr3	10088266	.	G	T	.	.	DP=107;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=150,150;MMQ=60,50;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,36:0.354:102:31,19:35,16:45,21,31,5
chr3	10088404	.	C	T	.	.	DP=82;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=169,139;MMQ=39,27;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,36:0.457:79:21,17:21,18:0|1:10088404_C_T:10088404:8,35,1,35
chr3	10088407	.	AG	A	.	.	DP=78;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=166,143;MMQ=33,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=129.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,35:0.450:78:23,17:18,14:0|1:10088404_C_T:10088404:8,35,1,34
chr3	10088409	.	TAAG	T	.	.	DP=75;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=166,148;MMQ=33,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=120.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,32:0.429:75:23,17:18,15:0|1:10088404_C_T:10088404:7,36,1,31
chr3	10088422	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=164,149;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=93.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,25:0.406:62:17,13:20,10:0|1:10088404_C_T:10088404:4,33,1,24
chr3	10088443	.	CA	AG	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=169,183;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=49.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.395:36:8,8:13,6:3,19,0,14
chr3	10088461	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=179,184;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:5,4:11,3:2,14,0,7
chr3	10089499	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=204,232;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:10089499_A_G:10089499:3,0,1,0
chr3	10089509	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=180,217;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:10089499_A_G:10089499:4,0,2,0
chr3	10089549	.	TACTA	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=142,180;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,1:5,2:10,0,3,0
chr3	10089723	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=29,31;MFRL=112,149;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:10,2:5,5:5,10,1,6
chr3	10089738	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=30,33;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,1:5,2:3,12,1,2
chr3	10089749	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:8,0:3,2:1,10,0,2
chr3	10089772	.	CA	GG	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=35,35;MFRL=125,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:0|1:10089772_CA_GG:10089772:0,8,0,3
chr3	10089775	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=10;MBQ=32,36;MFRL=125,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:0|1:10089772_CA_GG:10089772:0,8,0,3
chr3	10089805	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=34,29;MFRL=181,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:10089805_G_T:10089805:0,4,0,1
chr3	10089808	.	GG	TA	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=34,31;MFRL=181,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:10089805_G_T:10089805:0,4,0,1
chr3	10089811	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=181,232;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:10089805_G_T:10089805:0,4,0,1
chr3	10089815	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=29,33;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0|1:10089815_A_C:10089815:0,1,0,2
chr3	10089818	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=35,28;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:10089815_A_C:10089815:0,1,0,2
chr3	10091252	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=168,183;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:0|1:10091252_A_C:10091252:0,9,0,2
chr3	10091261	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=168,183;MMQ=27,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:4,1:0|1:10091252_A_C:10091252:0,9,0,2
chr3	10091289	.	G	GAGTTGAAATTTTCATTTGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=183,189;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	10103759	.	A	T	.	.	DP=109;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=164,174;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,4:0.047:103:32,2:66,2:99,0,4,0
chr3	10103768	.	C	T	.	.	DP=134;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=159,138;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:121,3:0.031:124:38,2:82,1:121,0,3,0
chr3	10103769	.	G	A	.	.	DP=135;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=159,136;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:118,10:0.084:128:33,7:84,3:118,0,10,0
chr3	10103931	.	CT	C,CTT	.	.	DP=113;ECNT=4;MBQ=20,21,20;MFRL=161,138,153;MMQ=60,60,60;MPOS=20,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=9.01,10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,9,9:0.202,0.205:41:7,4,3:9,3,2:0,23,1,17
chr3	10103964	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=169,146;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.085:57:39,3:12,1:0,53,0,4
chr3	10103983	.	G	GGT	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.053:55:41,0:10,1:0|1:10103983_G_GGT:10103983:0,53,0,2
chr3	10103985	.	CAA	C	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,2:0.052:56:42,1:10,1:0|1:10103983_G_GGT:10103983:0,54,0,2
chr3	10106144	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,136;MMQ=57,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,3:16,1:10,19,3,1
chr3	10106459	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=151,145;MMQ=52,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.163:35:14,2:15,3:18,12,5,0
chr3	10109060	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr3	10109070	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.268:5:2,0:2,1:0|1:10109070_C_CA:10109070:0,4,0,1
chr3	10109071	.	C	CACAAAACCAGCT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.274:5:2,0:2,1:0|1:10109070_C_CA:10109070:0,4,0,1
chr3	10188141	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,137;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:8,2:17,0:22,4,2,0
chr3	10219510	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr3	10219729	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	10241987	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	10251196	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,9:0,1:0,0,10,0
chr3	10258762	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,5,10
chr3	10261284	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=193,131;MMQ=51,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:4,0,1,0
chr3	10261294	.	AC	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,3:0,0,7,0
chr3	10280474	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:15,2:11,0:14,12,1,1
chr3	10319976	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:9,2:11,9,1,1
chr3	10345926	.	A	ATGACATTAACCTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,15;MFRL=193,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr3	10353550	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=161,227;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr3	10353626	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=135,156;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:1,5:5,7:3,3,8,4
chr3	10355241	.	T	TCCTTC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=187,42;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:10355241_T_TCCTTC:10355241:0,4,1,1
chr3	10355244	.	C	CTGAAAGG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=187,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:10355241_T_TCCTTC:10355241:0,4,1,1
chr3	10355245	.	C	CCCCAGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=187,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:10355241_T_TCCTTC:10355241:0,4,1,1
chr3	10355268	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	10370486	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=95,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:3,3:1,6:2,2,8,1
chr3	10382148	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,29;MFRL=81,164;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.643:6:1,1:0,2:1,1,4,0
chr3	10382234	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,1:15,1:16,9,2,0
chr3	10400636	.	G	GGATGGTGCATCCATTTCCTAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=190,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0,4,1,1
chr3	10420875	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,5:3,2:5,3,7,0
chr3	10429902	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:8,2:3,2:11,1,4,0
chr3	10452231	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,3:1,1:7,0,4,0
chr3	10858227	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=134,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.131:32:15,2:13,0:14,14,0,4
chr3	10858252	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=18,13;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.284:22:6,1:2,0:5,11,0,6
chr3	10858258	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=20,13;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.189:23:3,1:6,0:4,14,0,5
chr3	10967712	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,5:6,3:8,4,2,6
chr3	10967828	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:10967828_C_CA:10967828:1,3,0,1
chr3	10967829	.	C	CTCCTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:10967828_C_CA:10967828:1,3,0,1
chr3	10967851	.	CAGGAGGCCAGACGCCACCCTTAGGAG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=198,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:10967851_CAGGAGGCCAGACGCCACCCTTAGGAG_C:10967851:0,3,0,1
chr3	10967880	.	GCTCCCCA	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=198,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:10967851_CAGGAGGCCAGACGCCACCCTTAGGAG_C:10967851:0,2,0,1
chr3	10975745	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=120,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:9,2:1,3:5,5,4,1
chr3	11059752	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	11300707	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr3	11304202	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:9,3:8,6:7,10,1,8
chr3	11348623	.	GAAACT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.247:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr3	11744544	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=115,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,1:0,2:0,1,0,4
chr3	11744573	.	A	AAAGATGAGGG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.494:2:0,1:1,0:0|1:11744573_A_AAAGATGAGGG:11744573:0,1,0,1
chr3	11744574	.	C	CAGATA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11744573_A_AAAGATGAGGG:11744573:0,1,0,1
chr3	11744576	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11744573_A_AAAGATGAGGG:11744573:0,1,0,1
chr3	11744580	.	GA	AT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=180,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11744573_A_AAAGATGAGGG:11744573:0,1,0,1
chr3	11744584	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	11831953	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:5,2:4,1:5,4,3,0
chr3	11880816	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=123,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,4:3,6:1,6,1,9
chr3	12045986	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,8,4
chr3	12046013	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,7:0,0,7,9
chr3	12046124	.	AG	GC	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,1:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,8
chr3	12046131	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,9
chr3	12046148	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=0,21;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,0:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,5
chr3	12046168	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=0,20;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,1:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,4
chr3	12046196	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:12046196_A_C:12046196:0,0,0,2
chr3	12046207	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12046196_A_C:12046196:0,0,0,1
chr3	12046215	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12046196_A_C:12046196:0,0,0,1
chr3	12046222	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,22;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12046196_A_C:12046196:0,0,0,1
chr3	12198868	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:10,2:18,0:19,9,0,2
chr3	12208652	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	12208671	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:4,0,7,0
chr3	12232208	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr3	12458703	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=248,211;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,0:1,2:0,2,0,3
chr3	12458732	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	12537955	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=115,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:7,2:0,1:7,0,3,0
chr3	12560763	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:4,1:1,5:0,6,1,5
chr3	12571420	.	G	GT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.220:24:7,2:7,1:2,17,0,5
chr3	12616533	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,1:5,4:0,6,0,5
chr3	12618262	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:7,6:3,10:2,8,3,13
chr3	12626516	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,31;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:1,0,1,4
chr3	12650482	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,5:0,0,2,8
chr3	12660291	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	12776410	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=218,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12776410_A_ATC:12776410:0,1,0,1
chr3	12776411	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=218,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:12776410_A_ATC:12776410:0,1,0,1
chr3	12791172	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:4,3:0,3:4,0,7,0
chr3	12845166	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=119,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,1:2,1:2,2,0,3
chr3	12849011	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,1:0,6,0,6
chr3	12854626	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:0,7,1,2
chr3	12859456	.	G	GTCAAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12859456_G_GTCAAA:12859456:0,0,0,1
chr3	12859458	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:12859456_G_GTCAAA:12859456:0,0,0,1
chr3	12869077	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:8,10,1,1
chr3	12875443	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=161,123;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,6:2,2:1,3,3,5
chr3	12944158	.	CA	C,CAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29,14;MFRL=189,167,136;MMQ=60,52,60;MPOS=21,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=14.26,4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,2:0.586,0.249:9:1,3,0:0,1,0:1,0,8,0
chr3	12954868	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,4:2,7:2,0,11,0
chr3	12956531	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:4,0,7,0
chr3	12962101	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,4:1,3:1,7,0,7
chr3	12963827	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr3	12966054	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=148,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:7,1:3,0:6,9,4,0
chr3	13361238	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,7:4,4:7,1,9,2
chr3	13377103	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,0:13,2:12,15,1,1
chr3	13383510	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,1:11,1:10,8,2,0
chr3	13383540	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=128,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.336:22:3,4:11,3:10,5,2,5
chr3	13395055	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=131,99;MMQ=60,37;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:9,4,2,0
chr3	13395198	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=131,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:13395198_G_A:13395198:1,2,0,1
chr3	13395202	.	ATCAC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=131,83;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:13395198_G_A:13395198:1,2,0,1
chr3	13395211	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=131,83;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13395198_G_A:13395198:0,1,0,1
chr3	13413371	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=83.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,29:0.563:51:8,11:14,16:14,8,20,9
chr3	13413537	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,0:4,2:2,12,0,2
chr3	13421150	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=98,151;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:9,7:4,4:7,6,6,5
chr3	13427778	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,68;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:15,4:12,0:14,14,3,1
chr3	13438830	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:9,0,3,1
chr3	13461478	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	13538326	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=138,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:2,14,0,2
chr3	13538370	.	GCAT	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=180,187;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:13538370_GCAT_G:13538370:2,2,0,2
chr3	13538371	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:2,1,0,1
chr3	13538376	.	CT	GG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=177,187;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0|1:13538370_GCAT_G:13538370:2,0,0,2
chr3	13538381	.	C	CGAGGGGGGGGGG	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=33,14;MFRL=177,187;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:1,0:1,0:0|1:13538370_GCAT_G:13538370:2,0,0,2
chr3	13538382	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=31,22;MFRL=177,187;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:1,0:1,1:0|1:13538370_GCAT_G:13538370:2,0,0,2
chr3	13669537	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr3	13670837	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	13678121	.	C	CATTGATAAAACCAGACTCTAAACCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=144,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr3	13916407	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,5:4,3:6,1,8,0
chr3	14174077	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.450:31:5,5:12,8:9,8,7,7
chr3	14183311	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,1,5
chr3	14187345	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	14187699	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=95,88;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr3	14190237	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:5,6:13,1:8,10,4,3
chr3	14201352	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,8:1,4:0,5,2,10
chr3	14206468	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:2,2,0,1
chr3	14513704	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=133,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:6,0:12,0:17,5,4,0
chr3	14537867	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=193,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,5:2,5:5,1,9,1
chr3	14538072	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:0,7,1,1
chr3	14548494	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.295:38:12,2:15,8:7,20,4,7
chr3	14555367	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	14555739	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:5,2,4,0
chr3	14555758	.	C	CAGTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=36,24;MFRL=119,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:3,3:3,3:3,3,4,3
chr3	14561627	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr3	14562039	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,3:7,0:0,17,0,3
chr3	14563121	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=108,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.108:29:6,0:13,0:11,15,3,0
chr3	14563126	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=108,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.169:29:3,0:14,0:9,15,5,0
chr3	14565017	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=230,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	14566916	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=178,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	14702982	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr3	14708918	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=119.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.952:39:0,18:1,19:1,0,29,9
chr3	14709058	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,4:6,6:0,9,0,10
chr3	14724724	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14724724_G_C:14724724:0,1,0,1
chr3	14724727	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14724724_G_C:14724724:0,1,0,1
chr3	14724728	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14724724_G_C:14724724:0,1,0,1
chr3	14724734	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14724724_G_C:14724724:0,1,0,1
chr3	14724739	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14724724_G_C:14724724:0,1,0,1
chr3	14725668	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	14755572	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,8,10
chr3	14756726	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=162,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:14756726_C_T:14756726:2,0,1,0
chr3	14756730	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:14756726_C_T:14756726:0,0,2,0
chr3	14756734	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=145,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:14756726_C_T:14756726:1,0,1,0
chr3	14763381	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	14768553	.	C	CAGACTGCTTGAACCTAGGAGTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=153,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	14768554	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=82,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	14801550	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr3	14862119	.	G	GGGTGCCGCTCACCCTGTCC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=178,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:11,4,1,1
chr3	14922388	.	C	CAAATTGGTCAATACCCAACAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	14939198	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr3	14942024	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:0,9,1,8
chr3	14942675	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	14949102	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=99,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:10,5:8,6:14,4,10,1
chr3	14949268	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.407:15:3,3:5,2:0,9,0,6
chr3	14960170	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	14963337	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr3	14965466	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=190,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,4:3,2:3,0,6,0
chr3	14965507	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr3	14967731	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=136,41;MMQ=60,58;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:2,6,1,1
chr3	14967749	.	A	ACTTAGAGCGTGAGCTCACTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=82,125;MMQ=55,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	15071871	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,0:6,3:6,8,0,3
chr3	15076143	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=109,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:3,1,3,0
chr3	15084262	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.406:23:5,6:7,3:12,2,9,0
chr3	15115270	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:3,1,2,1
chr3	15115606	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=127,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,7:5,5:4,4,4,8
chr3	15116473	.	ACTATGCTGGC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=242,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	15127522	.	CTAG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=137,191;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chr3	15132102	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:15132102_T_TG:15132102:0,3,0,1
chr3	15132105	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:15132102_T_TG:15132102:0,3,0,1
chr3	15259865	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	15269257	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.260:13:3,0:6,3:10,0,3,0
chr3	15288742	.	CTT	C,CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31,33;MFRL=160,217,162;MMQ=60,60,60;MPOS=29,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.88,4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,3:0.143,0.231:15:5,1,2:3,1,1:10,0,5,0
chr3	15300452	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:8,2:20,0:19,9,1,1
chr3	15300504	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:16,0:12,2:14,14,1,1
chr3	15311464	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr3	15345815	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=194,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:15345815_A_T:15345815:0,2,0,1
chr3	15345817	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=194,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:15345815_A_T:15345815:0,2,0,1
chr3	15345821	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=194,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:15345815_A_T:15345815:0,2,0,1
chr3	15455717	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	15466373	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:7,3:0,2:7,0,5,0
chr3	15507761	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr3	15515695	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,12,5
chr3	15515875	.	A	ACCCCTTGCTACTTGTCCCTCCAGTGATCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=164,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.667:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	15516910	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr3	15517025	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr3	15518731	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,3,12
chr3	15539976	.	C	CCACACA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=CA;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.434:7:2,0:2,1:3,1,3,0
chr3	15643043	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	15718652	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	15720781	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=131,59;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:9,0:14,5,1,1
chr3	15736385	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,0,12
chr3	15737610	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,14,5
chr3	15749371	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:7,0,2,1
chr3	15752830	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=149.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,19:0,20:0,0,3,37
chr3	15756039	.	G	GAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=195,131;MMQ=40,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.794:12:2,6:0,2:2,0,8,2
chr3	15756215	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=153.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,21:0,24:0,0,5,40
chr3	15807725	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,16,0
chr3	16242101	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,5:4,2:4,0,7,0
chr3	16249998	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:4,5:3,5:5,2,9,1
chr3	16343092	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=130.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,21:0,14:0,0,29,6
chr3	16368180	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=185,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr3	16399558	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=187,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,0:0,0:0|1:16399558_T_G:16399558:0,1,0,1
chr3	16399575	.	GGGGGT	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16399558_T_G:16399558:0,0,0,1
chr3	16399587	.	G	GCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16399558_T_G:16399558:0,0,0,1
chr3	16399589	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16399558_T_G:16399558:0,0,0,1
chr3	16450872	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.626:27:5,7:4,10:6,4,9,8
chr3	16633688	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,121;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,2:0.044:65:36,1:26,1:20,43,0,2
chr3	16636093	.	TA	T,TAA	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=31,30,30;MFRL=142,136,116;MMQ=60,60,60;MPOS=26,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=19.24,5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,13,9:0.213,0.147:57:10,6,2:20,6,5:5,30,1,21
chr3	16639754	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,7:4,2:0,6,0,9
chr3	17209153	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,4:6,1:9,0,5,0
chr3	17209195	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=155,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.398:22:3,4:10,2:10,3,6,3
chr3	17209361	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:17209361_G_C:17209361:1,17,0,2
chr3	17209363	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:17209361_G_C:17209361:1,17,0,2
chr3	17299980	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:17,1:16,1:26,7,2,0
chr3	17300133	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=168,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,1:3,5:0,10,0,6
chr3	17413531	.	A	AAAACAAAC,AAAACAAACAAACAAAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34,29;MFRL=0,89,156;MMQ=60,40,60;MPOS=18,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=4,6,8;RU=AAAC;STR;TLOD=3.53,7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.343,0.519:3:0,0,0:0,1,1:0,0,3,0
chr3	17418001	.	T	TA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:21,2:19,1:31,11,2,1
chr3	17469887	.	ATG	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.286:25:7,3:6,4:18,0,6,1
chr3	17469901	.	GTGTATA	G,GTA	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=34,35,36;MFRL=163,163,172;MMQ=60,60,60;MPOS=28,31;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.62,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:37,4,2:0.100,0.063:43:15,1,2:17,3,0:30,7,6,0
chr3	17469903	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.459:36:10,11:10,5:16,4,15,1
chr3	17470081	.	A	AAG	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.088:31:10,1:19,1:0|1:17470081_A_AAG:17470081:0,29,0,2
chr3	17470086	.	CT	GA	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:9,0:19,1:0|1:17470081_A_AAG:17470081:0,29,0,2
chr3	17470114	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=201,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:3,2:4,3:0,7,0,6
chr3	19190358	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:0,9,0,2
chr3	19436587	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=60.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,4:0,0,16,1
chr3	19925807	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	19940877	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr3	19941074	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	19947105	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:7,6:8,4:10,5,8,2
chr3	19947296	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:0,2,0,5
chr3	19956995	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=181,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr3	19961966	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,3:9,0:10,5,3,0
chr3	19974932	.	GTCC	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=147,67;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,2:10,0:10,17,1,1
chr3	20017489	.	GG	CC	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,22:0.426:52:17,13:13,9:23,7,20,2
chr3	20113989	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	20114044	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=150,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:20114044_T_C:20114044:0,1,0,2
chr3	20114048	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:20114044_T_C:20114044:0,0,0,2
chr3	20141301	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:8,9:8,11:15,1,19,1
chr3	20141356	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,24:0.377:64:21,13:18,10:24,16,14,10
chr3	20143020	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	20153178	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:8,12,1,1
chr3	20156302	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,10,2
chr3	20168875	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,3:6,7:13,1,10,0
chr3	20189528	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=134,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.265:21:2,1:9,4:1,15,0,5
chr3	20212189	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:9,10:11,4:12,8,11,3
chr3	20212754	.	TA	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.126:29:12,0:14,3:0,26,0,3
chr3	20212796	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:4,7:7,8:0,11,0,15
chr3	20216049	.	A	AT	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=131,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.104:56:24,5:24,1:28,22,4,2
chr3	20219885	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,0:3,5:0,7,0,5
chr3	21462754	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=67,114;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.924:20:0,8:1,10:0,1,10,9
chr3	21462787	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,4,11
chr3	21606027	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	23631338	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:9,2:17,0:3,23,1,1
chr3	23986930	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=219,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr3	24001078	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	24164347	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,77;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:13,5,2,0
chr3	24270500	.	G	GA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=86.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.972:31:0,13:0,16:0,0,5,26
chr3	25639973	.	A	AT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.485:27:6,8:8,5:0,14,2,11
chr3	25660094	.	G	GT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,5:5,3:7,3,5,3
chr3	25661557	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr3	25666156	.	C	T	.	.	DP=89;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,30:0.352:86:29,19:27,11:46,10,26,4
chr3	25668397	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=257,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25668397_A_AGT:25668397:0,1,0,1
chr3	25668399	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=257,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:25668397_A_AGT:25668397:0,1,0,1
chr3	25671778	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:5,3:1,5:6,0,8,0
chr3	25673835	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.462:35:13,11:5,5:19,0,15,1
chr3	25674091	.	C	A	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,38:0.507:75:20,17:17,21:8,29,4,34
chr3	25775356	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,15,4
chr3	25805879	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr3	25824706	.	G	GC	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.213:27:5,3:9,3:8,12,7,0
chr3	25824710	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=28,28;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.378:32:7,2:7,6:0|1:25824710_A_C:25824710:5,15,12,0
chr3	25824714	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,10:0.315:33:9,4:11,3:0|1:25824710_A_C:25824710:6,17,10,0
chr3	25824722	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=29,16;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,7:0.172:40:12,0:13,1:0|1:25824722_A_C:25824722:10,23,7,0
chr3	25824726	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,7:0.171:40:14,1:17,3:0|1:25824722_A_C:25824722:10,23,7,0
chr3	25824734	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=170,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,6:0.123:47:17,0:17,1:16,25,6,0
chr3	25833387	.	T	TTTGGTTACTGTAGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=196,352;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	25836023	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	27203864	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=254,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr3	27215923	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:8,0:10,4,2,0
chr3	27233498	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:1,2:5,2:6,0,3,1
chr3	27233716	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=136,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:6,1:4,4:3,8,0,5
chr3	27243119	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:6,2:2,3:1,8,1,4
chr3	27243871	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:5,2,5,0
chr3	27297684	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr3	27297944	.	A	AATACACAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	27326398	.	T	TATGCAGGCCTATGTACTATA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=232,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:2,7,1,1
chr3	27332282	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=111,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,3:4,0:0,4,0,3
chr3	27332297	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=184,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:27332297_G_T:27332297:0,3,0,1
chr3	27332300	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=184,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:27332297_G_T:27332297:0,3,0,1
chr3	27332308	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=184,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:27332297_G_T:27332297:0,3,0,1
chr3	27338552	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=187,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr3	27350384	.	G	T	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=116.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,45:0.522:86:21,23:20,22:26,15,29,16
chr3	27353716	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr3	27363637	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.627:22:4,8:4,6:8,0,13,1
chr3	27394419	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:0,7,0,6
chr3	27424799	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=131,301;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr3	27427521	.	A	G	.	.	DP=109;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=123,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=143.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,49:0.464:106:28,26:28,23:19,38,11,38
chr3	27427601	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=188,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=53.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:4,8:9,7:0,15,0,15
chr3	27446285	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.546:33:9,8:5,10:15,0,13,5
chr3	27463207	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,0:8,3:5,13,1,2
chr3	27475351	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,4:5,3:8,1,7,0
chr3	27478796	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=179,191;MMQ=44,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr3	27478834	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,1:4,4:8,2,5,0
chr3	27490194	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=136,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,18:0.382:48:13,6:16,12:17,13,9,9
chr3	27763427	.	G	GCGGCGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr3	28304768	.	CT	C	.	.	DP=118;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,6:0.059:104:54,3:40,3:81,17,5,1
chr3	28373462	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr3	28381887	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.524:40:11,9:8,12:13,6,14,7
chr3	28520513	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,114;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,0:11,2:1,15,0,2
chr3	28557206	.	CTGTG	C,CTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,24,25;MFRL=123,84,195;MMQ=60,58,60;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=TG;STR;TLOD=4.81,8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.303,0.511:6:0,0,2:1,1,0:0,1,1,4
chr3	29476428	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:2,9:5,8:2,5,0,17
chr3	29804300	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,17,0
chr3	29804487	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,22:0.523:42:11,13:9,9:5,15,5,17
chr3	29804509	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,24:0,11:0,0,5,30
chr3	29977739	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=120.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,3,29
chr3	30032495	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr3	30045457	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=150,101;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,4,0,1
chr3	30045461	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=29,32;MFRL=150,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,4,0,1
chr3	30045463	.	TGTTGTTG	T	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=174,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.331:4:2,1:1,0:1|0:30045457_T_A:30045457:0,3,0,1
chr3	30045464	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=32,34;MFRL=186,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30045467	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=186,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30045471	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=33,24;MFRL=174,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,1,0,2
chr3	30045473	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=134,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30045475	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=134,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30045477	.	TT	GG	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30045481	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=30,32;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30045483	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=27,29;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:1,0:1|0:30045457_T_A:30045457:0,2,0,1
chr3	30713126	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=98,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.357:15:6,4:3,1:8,2,5,0
chr3	30842597	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr3	30885594	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:30885594_G_A:30885594:3,0,1,0
chr3	30885601	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:30885594_G_A:30885594:3,0,1,0
chr3	31621228	.	T	TAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,3:0,0,9,2
chr3	31638362	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=139,113;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:8,8:8,6:4,12,4,10
chr3	31642037	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,0:2,5:0,3,0,5
chr3	31661402	.	T	TAGAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=185,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31661402_T_TAGAGC:31661402:0,1,0,1
chr3	31661403	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=185,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:31661402_T_TAGAGC:31661402:0,1,0,1
chr3	31663515	.	A	AGTGTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,2:0,3:0,0,8,0
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chr3	32571823	.	GA	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=19,9;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:2,1:1,0:3,8,1,6
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chr3	32746288	.	GT	G,GTT	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=123,129,153;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=16.79,8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:38,17,7:0.237,0.120:62:19,10,3:15,6,4:24,14,21,3
chr3	32758761	.	TTG	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=109.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.969:27:0,16:0,10:0,0,4,23
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chr3	32776232	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr3	32779082	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:0,6,0,3
chr3	32804188	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:18,1:9,1:19,9,1,1
chr3	32805843	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	32811547	.	G	GTCTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	32811552	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32811552_C_T:32811552:0,1,0,1
chr3	32811556	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=180,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32811552_C_T:32811552:0,1,0,1
chr3	32915214	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	32933360	.	C	CTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=262,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	32933370	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.789:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	32996841	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=186,169;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:32996841_C_T:32996841:0,8,0,2
chr3	32996844	.	CA	TT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=186,169;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:4,0:0|1:32996841_C_T:32996841:0,8,0,2
chr3	32996935	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:3,0:9,3:12,0,3,0
chr3	32996970	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=153,136;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.210:25:4,0:16,4:20,0,5,0
chr3	32997029	.	C	CA	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=18,27;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.504:35:3,2:4,5:4,14,1,16
chr3	32997096	.	GT	G,GTTTTTTTTTTTTT	.	.	DP=126;ECNT=3;MBQ=36,36,36;MFRL=158,159,105;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,22,35;RU=T;STR;TLOD=3.34,4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,11:0.143,0.510:21:5,5,5:0,0,2:5,0,12,4
chr3	32997278	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=273,241;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32997278_T_C:32997278:0,1,0,1
chr3	32997282	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=273,241;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32997278_T_C:32997278:0,1,0,1
chr3	33038928	.	ATG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33038928_ATG_A:33038928:0,0,0,1
chr3	33038933	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33038928_ATG_A:33038928:0,0,0,1
chr3	33060076	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0,20,0,2
chr3	33060081	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:8,0:11,3:0,19,0,3
chr3	33093190	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,7:0,0,15,5
chr3	33114306	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	33171659	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	33175793	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,12:0,3:0,0,3,12
chr3	33175854	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr3	33194138	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	33194150	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr3	33194990	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.445:40:12,9:9,6:11,11,9,9
chr3	33216357	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr3	33249493	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=252,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,0:0,1:0|1:33249493_G_A:33249493:0,1,0,1
chr3	33249495	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=252,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33249493_G_A:33249493:0,1,0,1
chr3	33249497	.	G	GCTTCTCCTTCACAACACCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=252,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33249493_G_A:33249493:0,1,0,1
chr3	33255592	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,7,16
chr3	33406293	.	CT	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=169,185;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,2:0,6,0,3
chr3	33444286	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=68.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,8:0,0,14,7
chr3	33600984	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	33612364	.	TAA	T,TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20,20;MFRL=178,177,180;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=10.69,10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,6,6:0.334,0.386:17:2,2,1:1,1,2:1,4,0,12
chr3	33626186	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=165,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr3	33634085	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	33645812	.	CTTTT	C,CTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,36,20;MFRL=172,159,202;MMQ=60,60,50;MPOS=27,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,11,14;RU=T;STR;TLOD=3.12,3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.219,0.341:6:0,0,1:1,1,0:0,3,0,3
chr3	33653622	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,2:0,2:0,1,0,4
chr3	33668662	.	ATTAAGT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.469:13:4,2:3,4:0,7,0,6
chr3	33725814	.	G	GA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=157,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.181:27:10,3:9,0:17,5,3,2
chr3	33731377	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,70444099;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:12,1:9,1:4,18,1,1
chr3	33840170	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,6:0.115:59:21,4:31,2:46,7,6,0
chr3	33877500	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=205,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:5,1:2,1:8,0,1,1
chr3	33877513	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=139,244;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,1:5,0:10,3,3,0
chr3	33877516	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=160,95;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,1:5,0:11,3,2,0
chr3	33893929	.	CT	C,CTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32,32;MFRL=184,182,156;MMQ=60,60,60;MPOS=15,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,18,20;RU=T;STR;TLOD=6.23,7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,7:0.301,0.504:13:2,2,3:0,1,3:2,0,10,1
chr3	35724256	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	35724493	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	35731725	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr3	36422111	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:9,1:10,5,2,0
chr3	36524405	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr3	36534540	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=193,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr3	36875406	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:36875406_C_T:36875406:0,3,0,1
chr3	36875413	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=195,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:36875406_C_T:36875406:0,2,0,1
chr3	36875415	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=195,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:36875406_C_T:36875406:0,2,0,1
chr3	36875424	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36875406_C_T:36875406:0,0,0,1
chr3	36875426	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36875406_C_T:36875406:0,0,0,1
chr3	36875427	.	CACAA	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36875406_C_T:36875406:0,0,0,1
chr3	36887973	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=172,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr3	36896653	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr3	37048633	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	37053568	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,3:1,5:2,3,1,7
chr3	37062040	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	37067050	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr3	37067075	.	CTATATA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=TA;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	37089263	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=187,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37089263_T_G:37089263:0,1,0,1
chr3	37089269	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=187,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37089263_T_G:37089263:0,1,0,1
chr3	37107470	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr3	37107835	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:17,0:21,2:11,28,0,2
chr3	37133124	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr3	37144535	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=93.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,5,21
chr3	37150988	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=139.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,17:0,21:0,0,26,12
chr3	37162944	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:11,2:14,0:24,2,2,0
chr3	37163039	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=135.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,24:0,16:0,0,15,25
chr3	37170717	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr3	37285152	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.661:25:3,10:4,4:0,8,2,15
chr3	37327629	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=119,183;MMQ=60,36;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.577:22:3,8:6,3:2,7,2,11
chr3	37343701	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,0:11,2:10,10,2,0
chr3	37360696	.	AT	A,ATT	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=31,24,31;MFRL=150,120,150;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=8.68,6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:46,8,6:0.128,0.108:60:16,4,4:22,2,0:3,43,2,12
chr3	37366459	.	C	A	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,50:0.573:87:17,26:19,24:13,24,20,30
chr3	37370594	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=119,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:7,12,0,2
chr3	37376500	.	C	CT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.603:36:6,9:8,12:12,2,21,1
chr3	37396534	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=170,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:6,0,2,1
chr3	37459347	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37459347_A_G:37459347:0,1,0,1
chr3	37459349	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37459347_A_G:37459347:0,1,0,1
chr3	37459351	.	A	ACCCCGCTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:37459347_A_G:37459347:0,1,0,1
chr3	37476427	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.317:39:18,4:9,8:12,15,2,10
chr3	37514974	.	G	GCAGTGTCTGTACGCCTTCT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.318:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	37515037	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=16,32;MFRL=269,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:37515037_A_AG:37515037:0,1,0,1
chr3	37515039	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=269,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37515037_A_AG:37515037:0,1,0,1
chr3	37515042	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=269,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37515037_A_AG:37515037:0,1,0,1
chr3	37550027	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:1,2:3,0:5,0,2,0
chr3	37560676	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr3	37575039	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0|1:37575039_G_A:37575039:0,0,0,3
chr3	37575050	.	C	CATGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=186,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:37575039_G_A:37575039:0,2,0,1
chr3	37583851	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=208,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr3	37670876	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=191,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:37670876_G_C:37670876:0,2,0,2
chr3	37670878	.	G	GGGCGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=228,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:37670876_G_C:37670876:0,3,0,1
chr3	37670880	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=228,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:37670876_G_C:37670876:0,3,0,1
chr3	37725269	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:37725269_T_A:37725269:0,0,1,0
chr3	37725270	.	GCCCC	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=6,2;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:37725269_T_A:37725269:0,0,1,0
chr3	37774304	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=96,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:6,1:1,3:3,4,4,1
chr3	37818805	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=134,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,4,0
chr3	37998566	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,4:2,5:4,4,5,4
chr3	38038533	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=207,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr3	38044143	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	38044592	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	38045975	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=217,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	38047607	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr3	38050852	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=133,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,3:14,0:12,15,2,1
chr3	38061846	.	G	GTGGTTTGCTGAGATTGTTTA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:4,1,1,1
chr3	38087024	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=114,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:2,5:4,7:5,1,8,4
chr3	38087123	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:7,3:5,7:5,7,2,9
chr3	38087239	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=121,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:11,0:1,3:2,11,0,3
chr3	38104353	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=217,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,0,2
chr3	38105487	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=209,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.646:9:2,5:1,1:0|1:38105487_CT_C:38105487:0,3,0,6
chr3	38105497	.	T	TTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=138,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.235:10:6,2:1,0:1|0:38105487_CT_C:38105487:0,8,0,2
chr3	38125591	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,2:4,0:7,0,1,1
chr3	38134438	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	38135225	.	CGG	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=118,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:7,2:11,0:0|1:38135225_CGG_C:38135225:3,16,0,2
chr3	38135229	.	T	TCTTGACC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=118,109;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,2:12,0:0|1:38135225_CGG_C:38135225:3,16,0,2
chr3	38137982	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	38164070	.	CATG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=199,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr3	38164561	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=153,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr3	38167232	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=131,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,3:2,3:1,2,4,2
chr3	38224663	.	ATGGGAAATAACTTGAAG	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=222,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.336:4:1,1:0,0:0|1:38224663_ATGGGAAATAACTTGAAG_A:38224663:0,3,0,1
chr3	38224686	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=222,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.355:4:3,1:0,0:0|1:38224663_ATGGGAAATAACTTGAAG_A:38224663:0,3,0,1
chr3	38224688	.	TT	AA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=222,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:38224663_ATGGGAAATAACTTGAAG_A:38224663:0,3,0,1
chr3	38224691	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=222,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:38224663_ATGGGAAATAACTTGAAG_A:38224663:0,3,0,1
chr3	38257567	.	CT	C,CTT	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,32,32;MFRL=133,131,158;MMQ=60,60,60;MPOS=15,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=12.23,6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,9,8:0.225,0.213:39:14,3,4:7,5,4:21,1,16,1
chr3	38291485	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:17,2:22,0:18,21,2,0
chr3	38316511	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,57;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,1:12,1:12,10,1,1
chr3	38348949	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr3	38350543	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,6:0,0,9,8
chr3	38350630	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr3	38354390	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	38355176	.	T	TGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0,0,2,1
chr3	38355509	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	38390020	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,7:0,0,16,3
chr3	38401918	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr3	38402007	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	38406648	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	38406773	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr3	38406793	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr3	38408248	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	38408459	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	38409600	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr3	38411756	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.359:4:3,0:0,1:0|1:38411756_C_T:38411756:0,3,0,1
chr3	38411757	.	ACTCTGC	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:38411756_C_T:38411756:0,3,0,1
chr3	38411758	.	C	CACACACACAGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=191,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	38414100	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:8,3,1,1
chr3	38416079	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=191,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr3	38524564	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,3:3,4:8,2,7,0
chr3	38524592	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:7,5:3,5:7,3,9,1
chr3	38539095	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,0:1,6:3,1,3,3
chr3	38543024	.	G	GCAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	38592108	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,1:7,1:13,4,1,1
chr3	38597893	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:1,0:0|1:38597893_A_C:38597893:2,1,3,0
chr3	38597897	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=26,13;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,0:2,0:0|1:38597893_A_C:38597893:3,1,3,0
chr3	38597903	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,14;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,0:2,0:3,1,2,0
chr3	38597908	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,14;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,0:2,1,3,0
chr3	38598106	.	C	CAG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,36;MFRL=156,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.318:4:0,0:3,1:0|1:38598106_C_CAG:38598106:0,3,0,1
chr3	38598108	.	G	GTT,GTGGGGTGTGATGGGTGATGCCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33,33;MFRL=169,109,73;MMQ=60,60,60;MPOS=11,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,0:2,1,1:0,2,0,2
chr3	38598110	.	G	GAGGGGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=156,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:38598106_C_CAG:38598106:0,3,0,1
chr3	38598113	.	C	CAGTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:38598106_C_CAG:38598106:0,2,0,1
chr3	38627153	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,14;RU=GT;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,1:0,0,8,6
chr3	38646423	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:0,3:2,3:0,3,0,6
chr3	38647642	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=116,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr3	38648062	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	38648385	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=260,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38648385_TG_AA:38648385:0,1,0,1
chr3	38648390	.	AA	TT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=260,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38648385_TG_AA:38648385:0,1,0,1
chr3	38648394	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=260,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38648385_TG_AA:38648385:0,1,0,1
chr3	38648396	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=260,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38648385_TG_AA:38648385:0,1,0,1
chr3	38648398	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=260,106;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38648385_TG_AA:38648385:0,1,0,1
chr3	38755394	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=168,84;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0|1:38755394_C_T:38755394:3,0,1,1
chr3	38755399	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=168,84;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:38755394_C_T:38755394:3,0,1,1
chr3	38802750	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=141,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:8,6,1,1
chr3	38926912	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=194,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,6:1,0:2,2,0,6
chr3	38926930	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=224,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,5:1,0:1,2,0,5
chr3	38926977	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=224,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	38938299	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=220,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.859:9:0,4:1,4:0,1,8,0
chr3	38945560	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=119,112;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,6:3,8:0,9,4,10
chr3	38946872	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr3	38949363	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:7,0,4,1
chr3	38950760	.	C	CACATTTCACTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=195,252;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	38951753	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	38967100	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=132,164;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:38967100_G_T:38967100:0,2,0,1
chr3	38967103	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=132,164;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:38967100_G_T:38967100:0,2,0,1
chr3	38988407	.	C	CA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:16,1:10,1:2,24,0,2
chr3	38991882	.	AGA	TAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=166,234;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:38991882_AGA_TAT:38991882:0,3,0,1
chr3	38991888	.	T	TCTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=166,234;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:38991882_AGA_TAT:38991882:0,3,0,1
chr3	39108453	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=211,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr3	39110376	.	TA	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.127:46:21,4:15,2:3,37,1,5
chr3	39116127	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,15;MFRL=224,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.412:7:0,0:2,0:4,0,3,0
chr3	39121184	.	G	GT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:15,0:23,4:27,11,3,1
chr3	39121306	.	AT	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.095:39:19,2:16,1:13,23,2,1
chr3	39142155	.	CT	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=100,0;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,0,1
chr3	39166484	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	39166509	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	39166743	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	39167905	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	39174462	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr3	39175917	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39175917_A_T:39175917:0,1,0,1
chr3	39175918	.	T	TTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:39175917_A_T:39175917:0,1,0,1
chr3	39176502	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39176502_A_AC:39176502:0,0,1,0
chr3	39176509	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39176502_A_AC:39176502:0,0,1,0
chr3	39176516	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:39176502_A_AC:39176502:1,0,1,0
chr3	39176520	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=76681810,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:39176502_A_AC:39176502:1,1,1,0
chr3	39176526	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=76681810,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:39176502_A_AC:39176502:1,1,1,0
chr3	39176528	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,13;MFRL=76681810,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:39176502_A_AC:39176502:1,1,1,0
chr3	39178899	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	39178945	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=171,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:4,0:2,2:6,1,2,0
chr3	39179909	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr3	39180162	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,21:0,16:0,0,25,13
chr3	39185968	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	39229333	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,1:12,1:12,10,2,0
chr3	39433147	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,1,13
chr3	39437800	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	39453057	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	39453610	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr3	40085817	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,0:1,2:0,5,2,0
chr3	40208247	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	40208450	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr3	40291982	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:7,1:8,9,1,1
chr3	40352355	.	ATT	A,AT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=120,163,148;MMQ=60,60,60;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=16.35,60.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,11,29:0.229,0.669:45:0,5,12:4,5,14:4,1,36,4
chr3	40352640	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=102.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,14:0,9:0|1:40352640_A_G:40352640:0,0,0,24
chr3	40352647	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=105.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,16:0,7:0|1:40352640_A_G:40352640:0,0,0,25
chr3	40352884	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr3	40353425	.	CAG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=61.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr3	40442574	.	AGAGGTCC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=159,312;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr3	40498720	.	TACGC	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=ACGC;STR;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:10,5:10,3:20,0,8,1
chr3	40498904	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.399:38:13,7:9,8:5,18,5,10
chr3	40498933	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,9:0,0,4,22
chr3	40503520	.	A	ACTGCTG,ACTGCTGCTG,ACTGCTGCTGCTGCTG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30,30,29;MFRL=0,175,167,154;MMQ=60,34,45,27;MPOS=13,4,11;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,12,13,15;RU=CTG;STR;TLOD=5.49,28.63,17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,9,5:0.141,0.520,0.300:16:0,1,5,1:0,1,4,3:0,0,15,1
chr3	40503809	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:4,2:3,3:0,8,0,5
chr3	40519532	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=98,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:7,8:3,7:2,8,5,10
chr3	40553179	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=180,222;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:3,0:0,0:0,3,0,2
chr3	40557271	.	TTG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=TG;STR;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	41274764	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=67.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,17,2
chr3	41439790	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr3	41497115	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	41607701	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	41877473	.	CA	C,AA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=19,36,31;MFRL=136,207,149;MMQ=60,60,60;MPOS=25,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.75,6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,5,3:0.299,0.152:17:1,0,2:3,3,1:0,9,0,8
chr3	41925260	.	CAGAGAAAAAACAAGTGA	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,16,1
chr3	41925301	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=91.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,23,2
chr3	41937122	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.067:57:26,0:27,3:1,53,0,3
chr3	41938500	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,3,9
chr3	41939993	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=90,121;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,38:0.968:40:0,13:2,24:1,1,9,29
chr3	41942199	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	41952781	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=146.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,13:0,30:0,0,35,10
chr3	41961168	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr3	41977214	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	41977488	.	CCT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	41996275	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr3	42167160	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=182,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,1,1
chr3	42167189	.	G	GAGTCATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	42226151	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,3:4,4:8,0,7,0
chr3	42234740	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:2,6,1,3
chr3	42243895	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:7,10:11,8:15,4,10,8
chr3	42244321	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	42251577	.	C	CGGA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=196,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=GGA;STR;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,2:2,0:2,0,4,0
chr3	42264393	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,3:2,3:5,1,6,0
chr3	42264422	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:8,4:1,2:8,1,5,1
chr3	42265270	.	TCTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=125,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:3,1:0,8,0,4
chr3	42305131	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=77.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,10:0,0,6,16
chr3	42568903	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=104,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:6,0:8,2:6,8,0,2
chr3	42573717	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:7,1:10,1:11,7,0,2
chr3	42597410	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,23:0.386:60:19,13:17,9:18,19,11,12
chr3	42599049	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.256:17:8,3:5,1:13,0,2,2
chr3	42599252	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:5,0:18,2:1,22,0,2
chr3	42610297	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,6:5,2:9,0,8,0
chr3	42633106	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=135,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.247:9:1,1:5,0:0,7,2,0
chr3	42660489	.	CTT	C,CT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,34,33;MFRL=163,155,153;MMQ=60,60,60;MPOS=18,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=4.22,10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,6:0.242,0.323:21:5,3,4:2,2,2:8,2,11,0
chr3	42687278	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=64.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0,0,20,0
chr3	42701190	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,0:13,2:7,11,1,1
chr3	42705274	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=120,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.383:6:2,1:1,0:0|1:42705274_A_C:42705274:2,2,2,0
chr3	42705281	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=149,241;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:2,1:4,0:0|1:42705274_A_C:42705274:5,3,2,0
chr3	42705714	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.251:27:11,0:5,0:8,12,7,0
chr3	42799858	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	42907409	.	TCTC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:42907409_TCTC_T:42907409:0,4,0,1
chr3	42907415	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:42907409_TCTC_T:42907409:0,3,0,1
chr3	42907416	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:42907409_TCTC_T:42907409:0,3,0,1
chr3	42907422	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:42907409_TCTC_T:42907409:0,3,0,1
chr3	42915878	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,6,5
chr3	42917047	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr3	42947776	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	43021088	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	43122594	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:6,2:14,0:9,12,0,2
chr3	43373696	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=128,59;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,1:8,1:13,7,0,2
chr3	43384947	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,0:17,2:6,21,2,0
chr3	43389552	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,77629;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:6,13,1,1
chr3	43591142	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,2:0,0,9,1
chr3	43607224	.	CAA	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.282:19:3,3:5,1:5,9,3,2
chr3	43618373	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,1:11,1:7,10,1,1
chr3	43642126	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,2,20
chr3	43740960	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,101;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0,5,0,2
chr3	43756577	.	C	CTG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=189,125;MMQ=55,46;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=TG;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.769:6:0,2:1,3:0,1,2,3
chr3	44283525	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,10;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,0:0,0,3,0
chr3	44296403	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,1,1
chr3	44329394	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr3	44332176	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr3	44345646	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:0,7,0,6
chr3	44373517	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.341:17:2,1:7,3:0,11,0,6
chr3	44399668	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	44408864	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	44437870	.	A	C	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=200.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,27:0,33:0,0,33,28
chr3	44442136	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44442136_T_TG:44442136:0,3,0,1
chr3	44442139	.	A	ATCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:44442136_T_TG:44442136:0,3,0,1
chr3	44442140	.	A	ATCACCTTTACCAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:44442136_T_TG:44442136:0,3,0,1
chr3	44490318	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=14,34;MFRL=215,275;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.532:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr3	44761729	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:5,6:4,6:5,4,8,5
chr3	44763027	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:8,7,0,2
chr3	44763037	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:4,2:3,4:3,4,5,2
chr3	44778144	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=153,142;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:9,9,2,0
chr3	44803108	.	AAAGACAG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGACAG;STR;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,8:0,1:0,0,4,5
chr3	44803130	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=174,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,6:1,0:1,3,4,2
chr3	44815871	.	CT	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.156:35:13,1:16,3:29,1,3,2
chr3	44816952	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	44819565	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=147,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.430:19:6,3:5,5:10,1,8,0
chr3	44826315	.	G	GT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=194,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=56.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.934:27:0,12:1,13:1,0,24,2
chr3	44827793	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr3	44846477	.	GA	G,GAAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33,27;MFRL=147,166,0;MMQ=60,60,60;MPOS=23,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,17;RU=A;STR;TLOD=11.07,6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,7,5:0.296,0.226:23:3,1,2:6,4,0:9,2,6,6
chr3	44846722	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,5:4,7:0,9,1,11
chr3	44854563	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=117,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,6:2,1:2,1,3,4
chr3	44869851	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:1,6,0,6
chr3	44879843	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:20,1:13,1:22,12,1,1
chr3	44880014	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr3	44882784	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=207,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,5:0,1:0,3,0,6
chr3	44903434	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:4,0,4,1
chr3	44906746	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	44943104	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=126,128;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.565:37:11,11:5,9:7,9,11,10
chr3	44943503	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44943503_G_A:44943503:0,1,0,1
chr3	44943507	.	GT	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=81,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44943503_G_A:44943503:0,2,0,1
chr3	44952407	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:3,1:3,4:6,1,4,2
chr3	44952942	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=194,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	45017904	.	AG	TT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:2,7:15,3:0,17,0,11
chr3	45127255	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:11,2:13,9,1,1
chr3	45132637	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:2,3:1,3:3,0,7,0
chr3	45134822	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,11,7
chr3	45134844	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:5,0:14,2:14,6,1,1
chr3	45137087	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,4:2,7:0,6,4,7
chr3	45267058	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	45461102	.	G	GT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=127.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,24:0,14:0,0,25,15
chr3	45500174	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=203,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,5:1,4:1,0,9,0
chr3	45515648	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	45527099	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,9,0
chr3	45530395	.	T	TCCCCCTTTTATTTTTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=205,234;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr3	45530401	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=187,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr3	45533380	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45533380_A_T:45533380:0,1,0,1
chr3	45533382	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45533380_A_T:45533380:0,1,0,1
chr3	45533385	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45533380_A_T:45533380:0,1,0,1
chr3	45533387	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45533380_A_T:45533380:0,1,0,1
chr3	45533391	.	T	TCCCCCTGACATTTTA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:45533380_A_T:45533380:0,1,0,1
chr3	45542083	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=135,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:1,4,0,5
chr3	45557632	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:14,0:17,2:17,16,1,1
chr3	45559621	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=109,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr3	45583297	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:3,1,3,0
chr3	45637830	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:1,8,1,6
chr3	45677635	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=121.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,14:0,11:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,18,10
chr3	45677638	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=121.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,14:0,12:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,18,10
chr3	45715750	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:45715750_T_G:45715750:0,1,1,0
chr3	45715753	.	C	CCGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:45715750_T_G:45715750:0,3,1,0
chr3	45715755	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:45715750_T_G:45715750:0,4,1,0
chr3	45715767	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=102,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,5:0.500:10:2,4:3,1:1|0:45715750_T_G:45715750:0,5,1,4
chr3	45718327	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,5:5,0:5,0,5,0
chr3	45748429	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:4,2:5,6:0|1:45748429_G_A:45748429:2,10,1,9
chr3	45748435	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:5,4:7,7:0|1:45748429_G_A:45748429:2,10,1,11
chr3	45761115	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.484:27:5,6:9,7:4,10,0,13
chr3	45763635	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,6:6,5:0,10,1,10
chr3	45764544	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	45772742	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=119,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:10,5:10,5:14,6,10,0
chr3	45772772	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.380:40:11,9:14,6:15,10,13,2
chr3	45773732	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:2,0:0,2,0,3
chr3	45776875	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.396:13:5,3:3,1:0,8,1,4
chr3	45776900	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr3	45779277	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.091:41:14,3:23,0:21,17,2,1
chr3	45784963	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:2,1:4,3:0|1:45784963_T_C:45784963:8,0,5,0
chr3	45784972	.	GGT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=159,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:0|1:45784963_T_C:45784963:9,0,4,0
chr3	45804391	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:5,6:5,3:7,3,6,3
chr3	45813025	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	45814027	.	GGTGGCTCC	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=131,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:45814027_GGTGGCTCC_G:45814027:4,3,1,1
chr3	45814042	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=131,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0|1:45814027_GGTGGCTCC_G:45814027:4,3,1,1
chr3	45817418	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.949:18:0,4:0,11:0,0,13,5
chr3	45821624	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr3	45821687	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	45875716	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:8,3:7,0:8,8,3,0
chr3	45977899	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr3	46021328	.	TAGGGAA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=162,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGGAA;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:12,2:7,0:1,19,1,1
chr3	46063517	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=124,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:0|1:46063517_A_G:46063517:1,12,0,2
chr3	46063526	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=124,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,1:0|1:46063517_A_G:46063517:0,11,0,2
chr3	46244924	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:9,1:13,1:8,14,0,2
chr3	46245843	.	T	TAGAAAGAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr3	46307871	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:7,2:14,0:13,8,2,0
chr3	46400550	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:21,3:23,0:22,23,3,0
chr3	46416216	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=121,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,20:0.437:46:8,5:18,15:11,15,5,15
chr3	46449581	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=159,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	46450297	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.425:35:12,7:8,6:8,12,9,6
chr3	46484898	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,7:3,4:9,0,8,3
chr3	46487003	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=220,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	46491608	.	G	GGGCTATAAAATTTTATACCAGTTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=188,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.485:3:0,1:1,0:0|1:46491608_G_GGGCTATAAAATTTTATACCAGTTTT:46491608:0,2,0,1
chr3	46491611	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=213,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:46491608_G_GGGCTATAAAATTTTATACCAGTTTT:46491608:0,1,0,1
chr3	46491948	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:3,0,3,1
chr3	46501213	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.426:24:7,5:6,5:6,8,6,4
chr3	46501284	.	C	CCTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr3	46542488	.	T	TAGACAGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:46542488_T_TAGACAGAC:46542488:0,0,0,1
chr3	46542490	.	T	TGAAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46542488_T_TAGACAGAC:46542488:0,0,0,1
chr3	46574256	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,7:6,2:9,3,8,1
chr3	46574418	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,3:6,1:1,12,0,4
chr3	46586622	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.477:38:9,10:9,7:16,4,6,12
chr3	46592895	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=69,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr3	46592987	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=112,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.628:24:4,7:3,8:6,3,4,11
chr3	46593147	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	46620614	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=124,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.448:25:5,6:8,5:10,4,9,2
chr3	46726948	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.720:9:1,3:1,2:2,0,7,0
chr3	46904811	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=94,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:3,8,1,1
chr3	46940703	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=196,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	46963502	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:7,1,4,1
chr3	46964920	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=139,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:7,5:4,2:2,10,3,4
chr3	46965118	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=125,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:11,0:10,14,0,2
chr3	46965197	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr3	46967040	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,2:5,3:2,8,0,5
chr3	47021509	.	CGCGCGCGCGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	47033937	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,4:2,1:5,0,5,0
chr3	47035900	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=117,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr3	47037670	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=403,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:47037670_G_C:47037670:0,1,0,1
chr3	47037674	.	C	CTTTGTTCCGTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:47037670_G_C:47037670:0,0,0,1
chr3	47038135	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,5:0,0,4,5
chr3	47041506	.	C	CTCATGCTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	47043386	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=190,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr3	47044122	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr3	47047176	.	A	AG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=111,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.320:26:3,4:15,4:6,12,4,4
chr3	47050908	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=191,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	47059323	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,0,2
chr3	47061183	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:12,4:6,2:13,5,6,0
chr3	47079112	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:8,2,3,1
chr3	47103861	.	GTT	G,GT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=18,33,23;MFRL=122,123,176;MMQ=60,60,60;MPOS=21,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=13.64,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,8,4:0.240,0.144:33:2,1,1:8,7,1:3,18,3,9
chr3	47125916	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=115,122;MMQ=42,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.728:4:0,2:0,0:0,1,0,3
chr3	47129784	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:1,11,0,2
chr3	47142907	.	TCC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:8,10:10,0:17,2,9,1
chr3	47147393	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,130;MMQ=40,44;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	47147691	.	A	AGTTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=210,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47147691_A_AGTTC:47147691:0,1,0,1
chr3	47147695	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=210,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47147691_A_AGTTC:47147691:0,1,0,1
chr3	47205502	.	CGCGGCGGCG	C,CGCG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30,30;MFRL=0,227,215;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,7,8;RU=GCG;STR;TLOD=20.26,6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,2:0.609,0.298:7:0,1,2:0,3,0:0,0,1,6
chr3	47276968	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,6:3,1:4,0,5,2
chr3	47277458	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	47277885	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:4,0,2,1
chr3	47282303	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,3:4,6:4,4,5,4
chr3	47286227	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	47305928	.	TTTTTA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr3	47312635	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAAAG;STR;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.457:9:1,0:4,4:5,0,4,0
chr3	47316725	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr3	47318747	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=92.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,12:0,0,17,12
chr3	47318763	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=135,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,1:9,1:13,12,2,0
chr3	47361074	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=132,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr3	47361082	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=114,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.530:13:2,6:4,1:5,1,6,1
chr3	47363971	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=220,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr3	47376095	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr3	47378313	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:0,18,0,2
chr3	47448214	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=116,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.586:32:9,12:4,6:4,9,10,9
chr3	47449529	.	G	GTGATTAAGCTGACACTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	47451411	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,7:2,3:3,1,6,4
chr3	47451519	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,11;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:2,0:7,0:6,6,4,0
chr3	47451666	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:9,1:3,1:1,11,0,2
chr3	47452118	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.521:27:5,7:6,6:4,9,6,8
chr3	47452786	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,230;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,1,1
chr3	47453216	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr3	47454399	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,0,12
chr3	47456225	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,5,5
chr3	47459564	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,4:2,1:4,0,6,0
chr3	47462587	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr3	47539751	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr3	47539969	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	47543389	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:3,0:2,4:0,6,1,3
chr3	47555142	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=133,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.682:17:2,7:3,4:0,5,0,12
chr3	47614413	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr3	47618885	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=176,264;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,1:4,1:4,8,1,1
chr3	47676902	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr3	47680119	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr3	47717178	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=288,237;MMQ=40,56;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	47752375	.	A	ACAGCCCTGCAATTTAAGTTGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=211,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	47755816	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=167,64;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:3,2:28,0:31,0,1,1
chr3	47755822	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=171,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:5,1:25,3:30,1,4,0
chr3	47755827	.	TG	T	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=165,180;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:8,2:33,0:0|1:47755827_TG_T:47755827:41,1,2,0
chr3	47755832	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=156,180;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,2:0.062:46:7,2:33,0:0|1:47755827_TG_T:47755827:42,2,2,0
chr3	47755845	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.113:50:9,4:35,0:35,10,3,2
chr3	47787531	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,0:12,3:1,19,0,3
chr3	47823059	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=23,17;MFRL=182,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.204:20:5,0:3,0:0|1:47823059_T_G:47823059:13,3,4,0
chr3	47823063	.	CT	GG	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,19;MFRL=177,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.195:21:8,0:3,0:0|1:47823059_T_G:47823059:14,3,4,0
chr3	47823068	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=182,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:5,0:4,1:12,4,4,0
chr3	47823075	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=23,13;MFRL=182,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.396:20:4,1:3,0:6,6,8,0
chr3	47823091	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.148:32:8,1:15,0:13,14,5,0
chr3	47860864	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,4:0,3,0,7
chr3	47868810	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:9,2:16,0:25,2,2,0
chr3	47963443	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=136,156;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr3	48019258	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,13:0,12:0,0,25,1
chr3	48209486	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr3	48219320	.	AAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.870:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr3	48265966	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.249:20:5,1:7,1:8,7,0,5
chr3	48265978	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.322:20:5,1:6,2:6,8,0,6
chr3	48342700	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.507:26:7,6:4,7:8,5,12,1
chr3	48361128	.	A	ACAC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,2:6,0:2,11,0,2
chr3	48414197	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr3	48415007	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr3	48416756	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr3	48419897	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,8,12
chr3	48419915	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=140,103;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,3:4,0:8,8,3,0
chr3	48422360	.	G	GGGGTCCAGCAGGCGCTGGCACATA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=167,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.242:10:5,2:3,0:2,6,1,1
chr3	48448364	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=122,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,0:2,0:0|1:48448364_A_C:48448364:0,2,2,0
chr3	48448370	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,11;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.516:4:0,0:1,0:0|1:48448364_A_C:48448364:1,1,2,0
chr3	48451307	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,13:0.240:57:26,6:10,7:26,18,9,4
chr3	48451656	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,1:5,1:4,4,1,1
chr3	48491350	.	GAA	G,GAAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34,34;MFRL=174,134,218;MMQ=60,60,60;MPOS=29,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,17;RU=A;STR;TLOD=3.97,3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.216,0.235:9:3,1,0:1,1,2:4,1,4,0
chr3	48510900	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=120,0;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:18,2:11,0:10,19,0,2
chr3	48511223	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,83;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:25,0:33,3:23,36,1,2
chr3	48594057	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:48594057_G_C:48594057:1,0,1,0
chr3	48594061	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=22,13;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:48594057_G_C:48594057:1,0,1,0
chr3	48594062	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=11,13;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:48594057_G_C:48594057:1,0,1,0
chr3	48594066	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=146,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:48594057_G_C:48594057:4,0,1,0
chr3	48602523	.	G	GGGC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.950:16:0,11:0,4:0,0,9,7
chr3	48603794	.	A	ATAAAT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:48603794_A_ATAAAT:48603794:0,3,0,1
chr3	48603795	.	G	GAGT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:48603794_A_ATAAAT:48603794:0,3,0,1
chr3	48603798	.	A	ATAT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:48603794_A_ATAAAT:48603794:0,3,0,1
chr3	48603799	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:48603794_A_ATAAAT:48603794:0,3,0,1
chr3	48603800	.	G	GTTTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:48603794_A_ATAAAT:48603794:0,3,0,1
chr3	48603803	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=92,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48603794_A_ATAAAT:48603794:0,1,0,1
chr3	48613266	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=23,13;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.230:16:0,0:6,0:10,2,4,0
chr3	48613275	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.233:18:5,0:9,0:11,3,4,0
chr3	48620474	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:3,11,1,1
chr3	48623124	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:2,4:2,3:4,1,6,1
chr3	48624611	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=131,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.325:41:18,5:10,8:9,19,8,5
chr3	48624631	.	T	TG	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.090:30:14,2:14,0:0|1:48624631_T_TG:48624631:11,17,0,2
chr3	48624635	.	T	TTGGCACTTGGGCCTCTTGG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,2:14,0:0|1:48624631_T_TG:48624631:11,17,0,2
chr3	48627789	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.512:37:6,8:12,11:5,13,7,12
chr3	48630456	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=182,118;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:5,1,3,0
chr3	48631945	.	A	ACGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=149,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	48631998	.	A	AATGGCGTAAACCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	48664300	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:9,3,2,0
chr3	48678026	.	T	TCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48678026_T_TCA:48678026:0,1,0,1
chr3	48678027	.	G	GATGCTTTTTCTGCATCTAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48678026_T_TCA:48678026:0,1,0,1
chr3	48678030	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:48678026_T_TCA:48678026:0,1,0,1
chr3	48681765	.	CAG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=170,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:0,1:5,3:1,5,1,3
chr3	48683071	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=139,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:17,2:7,1:10,14,1,2
chr3	48689769	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:48689769_A_C:48689769:1,0,1,0
chr3	48689772	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48689769_A_C:48689769:1,0,1,0
chr3	48691753	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,2:16,0:19,6,2,0
chr3	48691963	.	G	GTCTGCTTGGTGGTCTGTCTGTCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=198,218;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	48693517	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,10;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:48693517_C_A:48693517:0,0,1,0
chr3	48693523	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=0,179;MMQ=54,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48693517_C_A:48693517:0,2,1,0
chr3	48697393	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,1:11,1:4,17,2,0
chr3	48719638	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	48719951	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,1:9,1:11,6,1,1
chr3	48731487	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:2,1:6,6:6,2,7,1
chr3	48731961	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,28:0.528:53:11,14:13,13:4,21,2,26
chr3	48897078	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr3	48897150	.	AT	GC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=156,171;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:48897150_AT_GC:48897150:0,3,0,1
chr3	48897161	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=156,171;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:48897150_AT_GC:48897150:0,3,0,1
chr3	48897166	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=156,171;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:48897150_AT_GC:48897150:0,3,0,1
chr3	48897173	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=156,171;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:48897150_AT_GC:48897150:0,3,0,1
chr3	48956862	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr3	49004723	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,3,13
chr3	49011287	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=157,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.138:26:9,3:14,0:4,19,1,2
chr3	49044767	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,14,2
chr3	49052785	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	49053219	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,7,7
chr3	49060271	.	AA	CC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:14,2:9,1:0|1:49060271_AA_CC:49060271:6,20,0,3
chr3	49060274	.	A	ATCTCCATCCACTGCAG	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:16,1:8,1:0|1:49060271_AA_CC:49060271:6,19,0,3
chr3	49069790	.	GCCAGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr3	49070299	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	49070499	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,11,0
chr3	49081837	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=113,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:19,2:22,1:33,10,3,0
chr3	49114544	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	49135961	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr3	49137904	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,8:0,3:0,0,4,8
chr3	49139966	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr3	49148206	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:11,6,2,0
chr3	49148890	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	49154143	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=187,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:49154143_C_CT:49154143:0,1,0,1
chr3	49154144	.	C	CCATTTCTGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=187,240;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:49154143_C_CT:49154143:0,1,0,1
chr3	49156676	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	49161698	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,155;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.231:14:6,1:5,1:2,9,2,1
chr3	49162230	.	C	CATCT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=141,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:49162230_C_CATCT:49162230:4,8,1,1
chr3	49162232	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=141,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,1:3,0:0|1:49162230_C_CATCT:49162230:4,8,1,1
chr3	49166069	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr3	49169782	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.583:34:4,6:10,14:10,4,13,7
chr3	49227212	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr3	49249325	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=150,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:5,15,0,2
chr3	49249334	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,0:5,3:2,15,0,3
chr3	49249381	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr3	49294529	.	C	CTGATAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:49294529_C_CTGATAT:49294529:3,2,0,2
chr3	49294532	.	G	GGAATTGAATTTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:49294529_C_CTGATAT:49294529:3,2,0,2
chr3	49365269	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr3	49395422	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.402:12:2,1:2,0:6,1,5,0
chr3	49395673	.	GGCCGCC	G,GGCC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33,34;MFRL=0,170,177;MMQ=60,40,60;MPOS=16,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,4,5;RU=GCC;STR;TLOD=28.47,42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,11:0.411,0.547:19:0,3,7:0,5,3:0,0,4,15
chr3	49450449	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:10,9:9,2:12,7,11,0
chr3	49463287	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:1,1:2,1:3,0,2,1
chr3	49463926	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr3	49548294	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	49570636	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:49570636_G_A:49570636:0,2,1,1
chr3	49570640	.	GCGCC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=119,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0|1:49570636_G_A:49570636:0,1,1,1
chr3	49662864	.	A	AAACTGAATTTTCAGCAACATTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	49693438	.	GTAACCCC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=214,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:49693438_GTAACCCC_G:49693438:0,2,0,1
chr3	49693450	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:49693438_GTAACCCC_G:49693438:0,1,0,1
chr3	49700788	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:1,2,0,2
chr3	49701222	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,4:7,0:10,8,4,0
chr3	49702341	.	G	GAATGCATTTTCTGAGACAATTACCAGGAAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.355:8:4,2:1,0:1,5,1,1
chr3	49713753	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	49719729	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.390:16:7,4:3,2:9,1,5,1
chr3	49720393	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,8:0,4:1,0,5,7
chr3	49722356	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,167;MMQ=50,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.415:29:11,5:6,6:9,8,7,5
chr3	49723274	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=124,100;MMQ=52,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,2:1,1:1,2,2,1
chr3	49726178	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,156;MMQ=27,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:9,8:3,4:0,12,2,10
chr3	49728632	.	C	T	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=117,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,3:0.045:86:39,3:42,0:44,39,2,1
chr3	49736565	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,0:0,3:0,0,1,3
chr3	49739086	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,5:0,0,3,11
chr3	49740981	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=153,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:0|1:49740981_C_G:49740981:1,16,1,1
chr3	49740986	.	AGC	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=160,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:0|1:49740981_C_G:49740981:1,16,1,1
chr3	49740989	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=160,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:49740981_C_G:49740981:1,16,1,1
chr3	49744392	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	49750188	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	49753003	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr3	49753788	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=63.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,15:0,7:0,0,15,7
chr3	49753820	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=132,83;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:21,3:10,0:15,16,2,1
chr3	49758342	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:3,15,0,2
chr3	49759836	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=148,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.412:10:1,0:4,0:0|1:49759836_A_C:49759836:3,3,4,0
chr3	49759842	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=144,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.379:11:1,0:3,0:0|1:49759836_A_C:49759836:3,4,4,0
chr3	49765449	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=170,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:49765449_C_A:49765449:1,0,1,0
chr3	49765457	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=170,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:49765449_C_A:49765449:3,0,1,0
chr3	49765462	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=170,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:49765449_C_A:49765449:3,0,1,0
chr3	49765470	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,17;MFRL=172,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:49765449_C_A:49765449:4,0,1,0
chr3	49828911	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=136,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.200:27:5,3:14,2:4,17,1,5
chr3	49829476	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=195,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49829476_A_C:49829476:0,1,0,1
chr3	49829478	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=195,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49829476_A_C:49829476:0,1,0,1
chr3	49829480	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=195,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49829476_A_C:49829476:0,1,0,1
chr3	49830016	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=130,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:10,0:11,13,1,1
chr3	49830727	.	G	GTATCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=106,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr3	49836212	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,18;MFRL=68,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:1,0:1,1,2,0
chr3	49836218	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=81,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,0:0,2,3,0
chr3	49928162	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=175,169;MMQ=40,57;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr3	49933203	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	49934780	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,1:2,0:0|1:49934780_CTT_C:49934780:3,3,1,1
chr3	49934784	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:1,0:0|1:49934780_CTT_C:49934780:3,4,1,1
chr3	49934785	.	A	ATCT	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:49934780_CTT_C:49934780:3,4,1,1
chr3	49934787	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=184,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:49934780_CTT_C:49934780:3,4,1,1
chr3	49948260	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:4,13,0,2
chr3	50005475	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=141,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.194:18:7,2:8,1:6,9,2,1
chr3	50005960	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=131,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:19,2:20,2:8,31,2,2
chr3	50097216	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,3:4,4:1,3,2,6
chr3	50098985	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,13;MFRL=119,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,0:6,0:19,4,0,2
chr3	50112609	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.477:31:8,4:7,10:11,5,7,8
chr3	50112758	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:9,1:13,2:4,18,1,2
chr3	50129374	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	50129399	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr3	50148305	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	50155887	.	TGA	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=14,33;MFRL=83,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GA;STR;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.507:6:0,1:1,2:1,2,0,3
chr3	50155969	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=194,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:50155969_A_T:50155969:0,2,0,1
chr3	50155981	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=213,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:50155969_A_T:50155969:0,1,0,1
chr3	50222079	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:7,4:7,1:11,3,3,2
chr3	50223977	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=105.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,12:0,18:0,0,29,1
chr3	50224225	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,3,14
chr3	50230902	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.589:22:4,8:4,5:3,6,9,4
chr3	50251833	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr3	50255732	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=118,58;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:3,2:7,0:4,7,1,1
chr3	50289635	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:1,1,1,3
chr3	50290656	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.701:5:1,0:0,1:0,1,0,4
chr3	50293597	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=195,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:50293597_A_C:50293597:0,1,2,0
chr3	50293599	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=161,302;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,0:1,0:0|1:50293597_A_C:50293597:1,1,1,0
chr3	50293601	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=195,302;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:50293597_A_C:50293597:0,1,1,0
chr3	50306752	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr3	50308718	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	50326292	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=138,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,4:2,6:3,3,4,6
chr3	50327102	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.398:15:2,4:6,0:5,4,4,2
chr3	50329977	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	50337958	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:14,3:19,0:17,16,2,1
chr3	50339405	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:13,0:7,0:31,1,3,0
chr3	50368955	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:2,3,0,5
chr3	50379841	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:6,1:24,2:17,14,2,1
chr3	50386525	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=250,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50386525_GG_TT:50386525:0,1,0,1
chr3	50386527	.	G	GAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=250,233;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:50386525_GG_TT:50386525:0,1,0,1
chr3	50390622	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=141,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:4,0,2,0
chr3	50404553	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=178,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	50415095	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=168,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:7,0:10,2:0|1:50415095_A_G:50415095:13,5,1,1
chr3	50415101	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=168,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:6,0:12,2:0|1:50415095_A_G:50415095:15,7,1,1
chr3	50416501	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,2:2,7:2,2,5,4
chr3	50609123	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr3	50645635	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	50645793	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,5:0,0,11,3
chr3	50678001	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr3	50678022	.	T	TCTTCAGCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	50683227	.	T	TGC	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.147:25:8,3:13,0:0|1:50683227_T_TGC:50683227:8,14,3,0
chr3	50683232	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=140,120;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.218:23:7,0:9,1:0|1:50683227_T_TGC:50683227:4,14,5,0
chr3	50684489	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=92.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,11:0,0,22,4
chr3	50685574	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	51246338	.	T	TCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=83,93;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0|1:51246338_T_TCCC:51246338:0,2,0,1
chr3	51246339	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=83,93;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0|1:51246338_T_TCCC:51246338:0,2,0,1
chr3	51265348	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:6,1,2,0
chr3	51273711	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr3	51274902	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=50.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,3:0,0,11,4
chr3	51393706	.	C	CAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,4,4
chr3	51395571	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	51417610	.	CAG	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.296:10:3,2:4,0:0|1:51417610_CAG_C:51417610:0,7,3,0
chr3	51417616	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.249:9:3,2:4,0:0|1:51417610_CAG_C:51417610:0,7,2,0
chr3	51417617	.	C	CCA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.249:9:3,2:4,0:0|1:51417610_CAG_C:51417610:0,7,2,0
chr3	51426506	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:16,1:9,1:9,17,1,1
chr3	51431679	.	AT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:12,2:9,2:12,11,0,4
chr3	51458301	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,92;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:10,3:15,0:14,11,2,1
chr3	51474900	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=145,135;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,2:12,0:24,0,2,0
chr3	51474901	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=144,179;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:10,3:12,0:24,0,3,0
chr3	51474908	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=144,179;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.122:26:8,3:13,0:23,0,3,0
chr3	51474917	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=143,151;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:13,2:17,0:26,5,2,0
chr3	51475985	.	TTTCC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51475985_TTTCC_T:51475985:0,0,0,1
chr3	51475991	.	CATAAT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51475985_TTTCC_T:51475985:0,0,0,1
chr3	51476001	.	GG	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:51475985_TTTCC_T:51475985:0,0,0,1
chr3	51668102	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,3:3,3:0,3,1,5
chr3	51677960	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,55;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:7,12,2,0
chr3	51697493	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=47.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,1,12
chr3	51747231	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:5,2,1,1
chr3	51895850	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,14:0,0,20,4
chr3	51908226	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	51929360	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr3	51930729	.	G	GCACA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=201,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=CA;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.473:6:0,1:3,0:3,0,3,0
chr3	51936949	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,5:1,1:5,0,6,0
chr3	51968838	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=171,256;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr3	51969138	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=101,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.469:11:3,2:2,3:4,2,5,0
chr3	51972052	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=111,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	51994530	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,351;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.173:19:9,2:7,0:12,4,0,3
chr3	52003514	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.157:38:12,3:14,1:15,17,6,0
chr3	52004149	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:11,13,1,1
chr3	52019503	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=13,13;MFRL=204,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.701:4:0,0:0,0:0,1,0,3
chr3	52019544	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=204,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:52019544_A_T:52019544:0,3,0,1
chr3	52019546	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,12;MFRL=204,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.342:4:2,0:1,0:0|1:52019544_A_T:52019544:0,3,0,1
chr3	52019553	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=204,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:52019544_A_T:52019544:0,3,0,1
chr3	52019554	.	C	CGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=204,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:52019544_A_T:52019544:0,3,0,1
chr3	52097642	.	T	TAGACTTCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	52185032	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,56;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,0:10,2:13,7,0,3
chr3	52236762	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=238.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.986:71:0,36:0,33:0,0,28,43
chr3	52237970	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,11:0,0,8,11
chr3	52238656	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52238677	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr3	52242021	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52242021_C_T:52242021:2,0,1,0
chr3	52242026	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52242021_C_T:52242021:2,0,1,0
chr3	52255230	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=140,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.059:64:32,3:27,0:44,17,2,1
chr3	52258372	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	52263277	.	G	GTACCTT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52263277_G_GTACCTT:52263277:0,2,0,1
chr3	52263279	.	T	TCCCTGCA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52263277_G_GTACCTT:52263277:0,2,0,1
chr3	52263281	.	G	GGCTTAC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52263277_G_GTACCTT:52263277:0,2,0,1
chr3	52263301	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,29;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52263301_C_A:52263301:0,1,0,1
chr3	52263302	.	C	CGGCAA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52263301_C_A:52263301:0,1,0,1
chr3	52263304	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52263301_C_A:52263301:0,1,0,1
chr3	52272945	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	52281840	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=85,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52281840_G_A:52281840:2,1,0,1
chr3	52281843	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=85,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52281840_G_A:52281840:2,1,0,1
chr3	52293312	.	C	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=215,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=159.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,48:0.961:49:1,28:0,20:0,1,13,35
chr3	52325759	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,9,3
chr3	52379420	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	52382822	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	52383096	.	AA	CG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=237,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:52383096_AA_CG:52383096:2,2,0,1
chr3	52383100	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=237,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:52383096_AA_CG:52383096:2,2,0,1
chr3	52383110	.	G	GCAAGGGAC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=199,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:0|1:52383110_G_GCAAGGGAC:52383110:1,1,0,1
chr3	52383116	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=37,25;MFRL=199,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:52383110_G_GCAAGGGAC:52383110:1,1,0,1
chr3	52383120	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52386064	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=97,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:13,1:4,1:10,7,0,2
chr3	52387078	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	52390555	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	52392772	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:7,2:3,10,0,2
chr3	52396944	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	52400509	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:8,2:13,0:7,14,1,1
chr3	52400740	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr3	52404111	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr3	52415865	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	52420414	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	52420901	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,3,15
chr3	52423028	.	C	CACT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	52429251	.	C	CCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCA;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:52429251_C_CCCA:52429251:0,0,2,0
chr3	52429255	.	GAT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:52429251_C_CCCA:52429251:0,0,2,0
chr3	52429607	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,2:11,0:16,5,0,2
chr3	52431671	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	52432214	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:52432214_G_A:52432214:0,0,0,3
chr3	52432223	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:52432214_G_A:52432214:0,0,0,3
chr3	52436927	.	C	CTCAAGGAGGAGGTAGAGAAGAGGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=187,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:0,5,1,1
chr3	52454262	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr3	52487983	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.242:19:5,2:4,1:7,7,5,0
chr3	52489564	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	52489627	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr3	52489677	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,3:2,8:6,0,11,0
chr3	52505758	.	G	GAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,9:0,0,16,1
chr3	52506282	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,15,4
chr3	52506426	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,2:0,0,1,6
chr3	52510697	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	52512318	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr3	52513940	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,0,11
chr3	52518476	.	T	TGAGGGGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=209,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,1:1,0:0|1:52518476_T_TGAGGGGGGGGG:52518476:2,0,1,0
chr3	52518478	.	T	TGGG,C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,15,28;MFRL=0,209,195;MMQ=60,60,60;MPOS=14,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.95,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,0,1:0,1,0:0,0,3,0
chr3	52518483	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=195,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:0,0:0,0:1|0:52518476_T_TGAGGGGGGGGG:52518476:1,0,2,0
chr3	52518488	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,2:0.750:2:0,1:0,1:1|0:52518476_T_TGAGGGGGGGGG:52518476:0,0,2,0
chr3	52518492	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=15,27;MFRL=223,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.528:2:0,0:0,1:1|0:52518476_T_TGAGGGGGGGGG:52518476:1,0,1,0
chr3	52519677	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=171,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr3	52519854	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,17:0,21:0,0,11,27
chr3	52522659	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr3	52535264	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:3,12,1,1
chr3	52537969	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	52539850	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.249:17:7,1:6,2:5,8,3,1
chr3	52544470	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr3	52546487	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,4,8
chr3	52546820	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr3	52549983	.	GA	CC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,14;MFRL=0,186;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:52549983_GA_CC:52549983:0,0,1,0
chr3	52549993	.	CGTT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=0,186;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52549983_GA_CC:52549983:0,1,1,0
chr3	52549997	.	C	CGGG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,13;MFRL=0,186;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:52549983_GA_CC:52549983:0,1,1,0
chr3	52550001	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,10;MFRL=58,186;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:52549983_GA_CC:52549983:0,2,1,0
chr3	52550008	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=87,186;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:52549983_GA_CC:52549983:1,2,1,0
chr3	52550010	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,11;MFRL=87,186;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:52549983_GA_CC:52549983:1,2,1,0
chr3	52551265	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,3:0|1:52551265_T_C:52551265:0,0,7,0
chr3	52551284	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:52551265_T_C:52551265:0,0,9,0
chr3	52553625	.	TGTAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr3	52554481	.	CCTGGCCTATGGCA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=186,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:52554481_CCTGGCCTATGGCA_C:52554481:1,1,0,1
chr3	52554497	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=234,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52554481_CCTGGCCTATGGCA_C:52554481:1,0,0,1
chr3	52554499	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=234,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:52554481_CCTGGCCTATGGCA_C:52554481:1,0,0,1
chr3	52555054	.	C	CCGTGGCCTAGGACTTATCCTATAAGGTTCAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	52555316	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	52557038	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr3	52557760	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,13;MFRL=98,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.276:11:4,0:2,0:0|1:52557760_A_C:52557760:3,5,3,0
chr3	52557766	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,13;MFRL=93,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.402:10:2,1:1,0:0|1:52557760_A_C:52557760:1,5,4,0
chr3	52558133	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,14:0,5:0,0,17,2
chr3	52559167	.	CGGGG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=G;STR;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr3	52561779	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	52567617	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	52597566	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	52620764	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52677427	.	A	AGAATAAGGCAGAAGTGATGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	52685677	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,2:7,3:10,2,5,0
chr3	52804641	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,13;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:1,0:1,1,1,0
chr3	52814217	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:13,2,2,0
chr3	52817430	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=35,34;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52817430_C_G:52817430:0,3,0,1
chr3	52817432	.	CA	AG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=35,33;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52817430_C_G:52817430:0,3,0,1
chr3	52817438	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52817430_C_G:52817430:0,2,0,1
chr3	52817440	.	GGA	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,33;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52817430_C_G:52817430:0,2,0,1
chr3	52817443	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52817430_C_G:52817430:0,2,0,1
chr3	52817449	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=189,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:52817430_C_G:52817430:0,2,0,1
chr3	52817456	.	GG	CT	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	52831935	.	T	TTGATTTCTCAGTTAATGTTAACTGAATGAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.326:8:5,2:0,0:2,4,1,1
chr3	52833899	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=113,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.178:15:5,0:6,2:0|1:52833899_A_G:52833899:5,8,1,1
chr3	52833909	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=119,51;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:4,0:7,2:0|1:52833899_A_G:52833899:4,8,1,1
chr3	52835112	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,1:10,1:4,11,0,2
chr3	52847473	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=115,154;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,9:5,2:7,4,4,7
chr3	52853340	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr3	52853401	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:6,8:11,7:13,4,7,8
chr3	52858578	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	52867288	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr3	52867595	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr3	52874446	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr3	52874709	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=213,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:52874709_G_T:52874709:0,2,0,1
chr3	52874714	.	ATGTTT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,15;MFRL=213,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:52874709_G_T:52874709:0,2,0,1
chr3	52876942	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:24,0:11,3:20,17,0,3
chr3	52877647	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,5,0
chr3	52877649	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,5,0
chr3	52877720	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,6,5
chr3	52878746	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	52878825	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,4:0,0,13,3
chr3	52889326	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,0:2,0:1,2,3,0
chr3	52889331	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:0,0:2,0:1,2,3,0
chr3	52889339	.	A	ACCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,18;RU=C;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.418:5:1,1:2,0:0,3,2,0
chr3	52960013	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr3	52966320	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:1,13,0,2
chr3	52968801	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	53003020	.	AG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,11;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr3	53003021	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	53126672	.	TTGCCCTGGACAAGGC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:3,2:0,5,1,1
chr3	53133526	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=201,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:2,3:0,0:1,2,0,3
chr3	53139813	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,127;MMQ=60,44;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:2,15,0,2
chr3	53154132	.	ATTAACT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	53212574	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr3	53213538	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr3	53213624	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=159,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.159:35:12,3:18,2:22,8,3,2
chr3	53213815	.	C	CGTGT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=GT;STR;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.930:9:0,4:0,3:0,0,2,7
chr3	53215799	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,1,1
chr3	53217413	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=269,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr3	53219680	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=21,32;MFRL=68,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:53219680_G_A:53219680:1,1,0,1
chr3	53219686	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=68,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:53219680_G_A:53219680:1,1,0,1
chr3	53219688	.	GACC	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,15;MFRL=68,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:53219680_G_A:53219680:1,1,0,1
chr3	53219693	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=17,28;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:53219680_G_A:53219680:0,1,0,1
chr3	53219699	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:53219680_G_A:53219680:0,1,0,1
chr3	53219706	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,14;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr3	53220444	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	53220569	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=116,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.543:9:4,1:0,4:4,0,4,1
chr3	53220763	.	GCTCAGAGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	53223291	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	53259989	.	G	GTA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:53259989_G_GTA:53259989:0,2,0,1
chr3	53259992	.	AGC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:53259989_G_GTA:53259989:0,2,0,1
chr3	53259996	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	53259997	.	T	TGTGGGGCGGG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:53259989_G_GTA:53259989:0,2,0,1
chr3	53260025	.	G	GCACAGCTTTCTCTTC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	53260716	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	53263200	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=181,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	53263279	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr3	53265581	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=194,236;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:4,3:3,1:1,6,0,5
chr3	53267133	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr3	53267155	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,13,2
chr3	53324819	.	ATGGCAC	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGCAC;STR;TLOD=235.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,23:0,29:0,0,17,36
chr3	53324915	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=97.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,11:0,15:0,0,2,26
chr3	53326072	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:53326072_T_G:53326072:0,0,1,0
chr3	53326073	.	G	GGGC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,18;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:53326072_T_G:53326072:0,0,1,0
chr3	53326077	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53326072_T_G:53326072:0,0,1,0
chr3	53326083	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:53326072_T_G:53326072:0,0,1,0
chr3	53338368	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=175,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,1:4,4:0,4,0,5
chr3	53381327	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	53529126	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,13;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:53529126_A_C:53529126:0,0,1,0
chr3	53529128	.	T	TAC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53529126_A_C:53529126:0,0,1,0
chr3	53529131	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53529126_A_C:53529126:0,0,1,0
chr3	53529137	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53529126_A_C:53529126:0,0,1,0
chr3	53529140	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:53529126_A_C:53529126:0,0,1,0
chr3	53529141	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=158,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:53529126_A_C:53529126:1,0,1,0
chr3	53529145	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=24,12;MFRL=139,235;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:53529126_A_C:53529126:3,0,1,0
chr3	53700622	.	G	GTGGTCTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:53700622_G_GTGGTCTA:53700622:0,3,0,1
chr3	53700624	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:53700622_G_GTGGTCTA:53700622:0,3,0,1
chr3	53752807	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:53752807_T_A:53752807:0,1,0,1
chr3	53752809	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53752807_T_A:53752807:0,1,0,1
chr3	53752810	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53752807_T_A:53752807:0,1,0,1
chr3	53752812	.	C	CTCTTATTA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,21;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:53752807_T_A:53752807:0,1,0,1
chr3	53758049	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,2:6,3:1,8,3,2
chr3	53766212	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,1:2,1:0,4,0,3
chr3	53774411	.	G	GTGCAGTGGCGTGATCCTAGCTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	53776995	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:4,5:6,5:10,1,9,1
chr3	53779580	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=159,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr3	53806803	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:5,1,3,0
chr3	53814197	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	53844021	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=179,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,2:7,0:6,6,1,1
chr3	53845080	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:1,0:1,0:5,1,3,0
chr3	53880684	.	C	CTCCACCATCCCACTCTCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=149,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:53880684_C_CTCCACCATCCCACTCTCA:53880684:0,2,1,1
chr3	53880686	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:53880684_C_CTCCACCATCCCACTCTCA:53880684:0,2,1,1
chr3	53880789	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	53882663	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:11,3:5,7:8,8,7,3
chr3	53882673	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.425:26:11,4:4,7:9,6,7,4
chr3	53886254	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:6,3:2,0:0,8,0,3
chr3	53889368	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=124,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.382:35:12,6:8,7:5,17,4,9
chr3	53890787	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	53891097	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=232,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	53892720	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,2:1,1:2,1,4,0
chr3	53899409	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53899409_C_T:53899409:0,0,0,1
chr3	53899410	.	T	TTGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:53899409_C_T:53899409:0,0,0,1
chr3	53903988	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:0,4:2,1:2,0,6,0
chr3	53906334	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr3	53910109	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,0:1,4,2,5
chr3	53910122	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,3,9
chr3	53912341	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,17,1
chr3	53921028	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,0,17
chr3	54420721	.	G	GTT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=156,132;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=18,20;RU=T;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:54420721_G_GTT:54420721:1,0,1,0
chr3	54420742	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=14,18;MFRL=156,132;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:54420721_G_GTT:54420721:3,0,1,0
chr3	54420749	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,18;MFRL=154,132;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:54420721_G_GTT:54420721:4,0,1,0
chr3	54420752	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=21,18;MFRL=154,132;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTT:54420721:4,0,1,0
chr3	54420755	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=12,17;MFRL=154,132;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:54420721_G_GTT:54420721:4,0,1,0
chr3	54420758	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=22,17;MFRL=154,132;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTT:54420721:4,0,1,0
chr3	54596815	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr3	54604188	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=172,100;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:0,4,1,3
chr3	54919272	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:6,3:8,3:10,5,5,1
chr3	54962013	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,3:4,0:2,3,1,2
chr3	55003733	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	55003992	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,2:0,1:0,0,0,5
chr3	55018619	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,142;MMQ=55,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:4,3:0,6:4,0,8,1
chr3	55038898	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,6,9
chr3	55041696	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr3	55107512	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:16,0:9,5:18,9,0,5
chr3	55107671	.	A	AGAAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=216,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAG;STR;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:2,3,1,4
chr3	55107944	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:0,6,0,3
chr3	55108055	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:55108055_G_A:55108055:0,0,3,0
chr3	55108064	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:55108055_G_A:55108055:0,0,3,0
chr3	55108188	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=128,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.444:27:8,8:7,3:7,8,6,6
chr3	55108234	.	CACTGACTGAGATGTTCTCTT	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTGACTGAGATGTTCTCTT;STR;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.940:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr3	55520969	.	G	GCC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=166,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:4,0:8,6,0,3
chr3	55733390	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.498:40:6,12:14,7:15,5,14,6
chr3	56052839	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=212,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr3	56173775	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=69,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:56173775_G_A:56173775:0,2,0,1
chr3	56173782	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=138,247;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:56173775_G_A:56173775:0,1,0,1
chr3	56173787	.	T	TGAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56173775_G_A:56173775:0,0,0,1
chr3	56173788	.	T	TTCTTCCAC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:56173775_G_A:56173775:0,0,0,1
chr3	56591178	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr3	56591278	.	T	TGGGGTAAGCA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGTAAGCA;STR;TLOD=114.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.971:30:0,14:0,9:0,0,18,12
chr3	56593543	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=219.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,33:0,29:0,0,52,12
chr3	56593680	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=175.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,24:0,23:0,0,6,41
chr3	56597688	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr3	56600531	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	56601175	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=179,244;MMQ=60,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	56605404	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=15,31;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=57.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,21:0.922:22:0,12:0,7:0|1:56605404_TA_T:56605404:0,1,1,20
chr3	56605416	.	GT	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.157:23:14,1:3,2:0|1:56605404_TA_T:56605404:1,19,0,3
chr3	56647537	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.343:33:14,6:8,5:22,0,11,0
chr3	56647855	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,116;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,0:4,3:0,13,0,3
chr3	56674190	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,1,14
chr3	56789122	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=118,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,0:3,1:0|1:56789122_A_C:56789122:7,3,0,3
chr3	56789129	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=132,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.366:14:3,1:3,0:0|1:56789122_A_C:56789122:6,3,0,5
chr3	56807854	.	TA	T,TAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,31,32;MFRL=125,162,164;MMQ=60,60,60;MPOS=7,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=10.36,6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,6,6:0.274,0.258:23:6,2,3:4,4,3:2,9,3,9
chr3	56808956	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=0,185;MMQ=50,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.815:7:0,2:0,4:1,0,6,0
chr3	57131529	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	57137090	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,7:0,14:0,0,13,8
chr3	57139833	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,4:6,4:8,0,7,1
chr3	57140108	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.351:21:4,4:9,3:7,7,4,3
chr3	57232525	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=150,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.325:7:3,1:1,0:0,5,1,1
chr3	57264803	.	T	C	.	.	DP=122;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=122,75;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,2:0.024:122:65,0:52,2:49,71,1,1
chr3	57264807	.	G	T	.	.	DP=119;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=122,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:108,8:0.069:116:58,0:47,7:39,69,6,2
chr3	57264872	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.383:24:4,2:9,6:0,15,1,8
chr3	57276258	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.365:20:4,3:9,4:0,13,0,7
chr3	57276259	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,171;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.303:22:7,0:9,6:1,15,0,6
chr3	57294085	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.523:21:7,5:3,6:3,7,3,8
chr3	57294295	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=103,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr3	57294884	.	CAAATT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATT;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	57330832	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=120,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,1:2,6:2,1,6,1
chr3	57335876	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=103,160;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:6,5:1,7:1,6,3,9
chr3	57335885	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=145,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,1:7,1:5,13,0,2
chr3	57394339	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=36,34;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:57394339_G_GC:57394339:0,3,0,2
chr3	57394341	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=-10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:57394339_G_GC:57394339:0,3,0,2
chr3	57394345	.	T	TTG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=-12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:1,2:0|1:57394339_G_GC:57394339:0,3,0,2
chr3	57394348	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=-14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:57394339_G_GC:57394339:0,3,0,2
chr3	57394353	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=-16;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.424:5:1,0:2,2:0|1:57394339_G_GC:57394339:0,3,0,2
chr3	57407522	.	A	AGTTAGCTCTTCTTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	57414330	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,3,6
chr3	57422824	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:9,8:3,4:0,12,1,12
chr3	57431721	.	AAAATAAAT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=AAAT;STR;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.382:11:4,1:2,3:0|1:57431721_AAAATAAAT_A:57431721:6,1,4,0
chr3	57431740	.	ATAAATAAATAAT	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,9:0.500:18:1,6:3,3:1|0:57431721_AAAATAAAT_A:57431721:8,1,7,2
chr3	57443817	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=116.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,20:0,10:0,0,29,3
chr3	57456093	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr3	57456371	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr3	57457123	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,11:0,4:0,0,16,0
chr3	57469053	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr3	57469097	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,15,5
chr3	57469272	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr3	57484323	.	G	GATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=132,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr3	57484333	.	T	TTAACAACCCAATTTTCACCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	57488279	.	T	TTTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	57493637	.	CG	TA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=193,137;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	57493642	.	TC	AT,GT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=17,31,34;MFRL=204,182,137;MMQ=60,60,40;MPOS=22,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:0,0,0:1,1,1:0,3,0,2
chr3	57493649	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=204,160;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	57493651	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:57493651_C_T:57493651:0,4,0,1
chr3	57493653	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:57493651_C_T:57493651:0,4,0,1
chr3	57545154	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:5,8:5,8:3,7,0,16
chr3	57545169	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=119,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,5:3,6:0,6,0,11
chr3	57563120	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:0,6,0,6
chr3	57627500	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,2,17
chr3	57632004	.	C	CA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:14,4:13,0:27,1,3,1
chr3	57646399	.	T	C	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,9:0.131:74:10,0:54,9:64,1,9,0
chr3	57658248	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,147;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:17,0:18,2:0,36,0,2
chr3	57846577	.	CA	C	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,8:0.133:65:23,3:33,5:4,53,1,7
chr3	57850505	.	CT	C	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,9:0.169:57:28,8:17,1:33,15,8,1
chr3	58080505	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=144,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,0:3,4:7,0,3,1
chr3	58089585	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=183,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,2:1,1:4,0,4,0
chr3	58089594	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,1:6,0,5,0
chr3	58089851	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=128,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:2,1:3,6:2,3,1,7
chr3	58089877	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr3	58090893	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:21,0:21,2:18,25,1,1
chr3	58092346	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,2,2
chr3	58094157	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=122,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,3:2,4:4,2,5,2
chr3	58094852	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,6:2,7:4,0,11,2
chr3	58095466	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr3	58095500	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=178,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr3	58104676	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=123,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:15,1:19,2:13,21,1,2
chr3	58111285	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=149,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,6:0,1:5,1,5,2
chr3	58112251	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:6,4:3,6:9,1,10,0
chr3	58112556	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,1,2
chr3	58116369	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:0,3:6,7:6,0,10,0
chr3	58118700	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,6:8,2:3,9,1,7
chr3	58120318	.	GGT	G,GGTGT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,29,30;MFRL=145,155,101;MMQ=60,60,60;MPOS=1,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=GT;STR;TLOD=3.33,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,3,3:0.102,0.127:28:7,1,1:14,2,1:21,1,5,1
chr3	58121626	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	58132808	.	GC	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,3:5,1:0,6,0,4
chr3	58145263	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr3	58155230	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=233,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr3	58179028	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=237,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr3	58183636	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.516:37:7,11:10,8:5,13,9,10
chr3	58186911	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	58194051	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:12,2:11,3:5,18,1,4
chr3	58196639	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=119,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:6,7:2,3:2,6,2,8
chr3	58270943	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=156,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:58270943_T_A:58270943:1,3,0,1
chr3	58270945	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=156,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:58270943_T_A:58270943:1,3,0,1
chr3	58270963	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr3	58279530	.	G	GCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58279530_G_GCC:58279530:0,1,0,1
chr3	58279534	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58279530_G_GCC:58279530:0,1,0,1
chr3	58279535	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58279530_G_GCC:58279530:0,1,0,1
chr3	58296209	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.659:15:2,6:1,3:2,3,7,3
chr3	58296398	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr3	58302404	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=135,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr3	58303069	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr3	58303307	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	58351656	.	G	C	.	.	DP=82;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=142,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,4:0.057:81:24,0:25,1:29,48,0,4
chr3	58351660	.	CT	C,CTTT,CTTTT	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=20,26,19,21;MFRL=160,161,125,147;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,18,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,14,17,18;RU=T;STR;TLOD=6.67,8.73,5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:22,5,7,3:0.121,0.235,0.111:37:9,3,2,0:7,1,1,2:2,20,3,12
chr3	58351672	.	T	G	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=147,126;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:26,3:29,0:14,41,0,3
chr3	58385194	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=122,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr3	58413662	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=235,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr3	58414382	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=73,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	58415590	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=151,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	58417190	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=182,254;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr3	58516383	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:3,1:7,6:3,8,0,7
chr3	58520306	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr3	58520859	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	58552834	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	58555386	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=85,88;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr3	58620193	.	G	GTGTGTGTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:58620193_G_GTGTGTGTGT:58620193:0,0,0,1
chr3	58620194	.	GGA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,0:0,1:0|1:58620193_G_GTGTGTGTGT:58620193:0,0,0,1
chr3	58621935	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	58629529	.	GAGGA	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.510:2:1,1:0,0:0|1:58629529_GAGGA_G:58629529:0,1,0,1
chr3	58629536	.	CACA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58629529_GAGGA_G:58629529:0,1,0,1
chr3	58629540	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:58629529_GAGGA_G:58629529:0,1,0,1
chr3	58631184	.	G	GAAATA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=189,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AAATA;STR;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:1,3:2,0:3,0,3,1
chr3	58641352	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=117,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,7:4,5:1,6,2,10
chr3	59738115	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:59738115_G_A:59738115:0,2,0,1
chr3	59738120	.	G	GAGAC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:59738115_G_A:59738115:0,1,0,1
chr3	59738124	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=17,32;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:59738115_G_A:59738115:0,1,0,1
chr3	59738134	.	AAAATTT	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:59738134_AAAATTT_A:59738134:0,0,0,1
chr3	59738142	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:59738134_AAAATTT_A:59738134:0,0,0,1
chr3	59738146	.	TT	GG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:59738134_AAAATTT_A:59738134:0,0,0,1
chr3	59999690	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:4,3:4,3:8,0,6,1
chr3	61734539	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=107,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.618:32:4,4:8,16:8,4,13,7
chr3	62257150	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=135,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,2:5,0:9,6,1,1
chr3	62261684	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=113,84;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:2,6,0,2
chr3	62357238	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,1:9,1:8,4,1,1
chr3	62423881	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.104:26:9,2:15,0:9,15,1,1
chr3	62431387	.	G	GAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=129,182;MMQ=35,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=A;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:0,1:2,3:4,0,4,0
chr3	62431394	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=157,101;MMQ=60,31;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:10,1,2,0
chr3	62431415	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=111,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.454:16:5,3:1,3:8,1,7,0
chr3	62484799	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,145;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:8,3,3,0
chr3	62498378	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=208.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,31:0,30:0,0,45,17
chr3	62631553	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr3	62636588	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:23,0:10,3:22,11,2,1
chr3	62636826	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	62647904	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr3	62647928	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr3	62739092	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	63821914	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=67.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,7:0,0,15,4
chr3	63898360	.	G	GGCA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=GCA;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr3	63981635	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=121,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:13,5:5,5:6,12,1,9
chr3	63999322	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:2,1:0,7,1,3
chr3	64004409	.	C	CA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=182,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:7,1:7,10:7,7,8,5
chr3	64142994	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.581:34:9,12:5,7:2,12,7,13
chr3	64518994	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0,0,1,11
chr3	64526717	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	64526942	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,4,12
chr3	64527299	.	AGAAAAC	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=20,33;MFRL=131,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,2:6,0:0|1:64527299_AGAAAAC_A:64527299:2,9,0,2
chr3	64527306	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:64527299_AGAAAAC_A:64527299:0,8,0,2
chr3	64527308	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=37,34;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:64527299_AGAAAAC_A:64527299:0,8,0,2
chr3	64527321	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr3	64527336	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	64527378	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr3	64527465	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr3	64532509	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=111,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:6,1:18,1:12,13,1,1
chr3	64592834	.	G	GGAACTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=184,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64592834_G_GGAACTA:64592834:0,1,0,1
chr3	64592837	.	A	AACTATATAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=184,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64592834_G_GGAACTA:64592834:0,1,0,1
chr3	64592838	.	G	GGGAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=184,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:64592834_G_GGAACTA:64592834:0,1,0,1
chr3	64608351	.	TCGCTGTGC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64608351_TCGCTGTGC_T:64608351:0,1,0,1
chr3	64608360	.	ACG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:64608351_TCGCTGTGC_T:64608351:0,1,0,1
chr3	64617699	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=197,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	64640206	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=135.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.971:31:0,14:0,16:0|1:64640206_TA_T:64640206:0,0,23,8
chr3	64640212	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=138.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0|1:64640206_TA_T:64640206:0,0,24,8
chr3	65350557	.	G	GGTGT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=115,160;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=GT;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.072:39:17,0:17,1:22,15,2,0
chr3	65350694	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.593:18:3,7:4,2:0,7,0,11
chr3	65361716	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=303,330;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:65361716_G_A:65361716:0,1,0,1
chr3	65361717	.	T	TACCTATTATCTCTCTCTCTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=303,330;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:65361716_G_A:65361716:0,1,0,1
chr3	65416648	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,838;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	65425560	.	T	TCTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=133,181;MMQ=60,58;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=CTG;STR;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,1:2,0,4,0
chr3	65464344	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:12,0:14,3:15,11,2,1
chr3	66023592	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	66413203	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr3	66463251	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr3	66465259	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	66465504	.	AAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:2,3:1,5,0,3
chr3	67053677	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.084:33:17,1:14,0:18,13,1,1
chr3	67058514	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=157,64902538;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:8,10,1,1
chr3	67426125	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,183;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,3:3,5:7,1,8,0
chr3	67659817	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr3	67660040	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:67660040_G_A:67660040:0,0,1,6
chr3	67660049	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:67660040_G_A:67660040:0,0,1,5
chr3	68587884	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,7:6,4:9,0,8,3
chr3	68782213	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.414:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr3	68788363	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:6,5:0,5:0,6,2,8
chr3	69036524	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	69036678	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=118,170;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:8,5:3,5:0|1:69036678_G_C:69036678:6,5,2,8
chr3	69036683	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:9,5:3,5:0|1:69036678_G_C:69036678:6,6,2,8
chr3	69047141	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:9,4:4,5:7,6,5,4
chr3	69058783	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:6,0,7,1
chr3	69059081	.	CAACAA	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=19,36;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:0,0:0,3,0,1
chr3	69059086	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	69059095	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=170,159;MMQ=50,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:69059095_A_T:69059095:0,2,0,1
chr3	69059097	.	A	AGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=170,159;MMQ=50,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:69059095_A_T:69059095:0,2,0,1
chr3	69073410	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.609:8:0,3:2,1:0,3,1,4
chr3	69073419	.	GTTT	G,GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32,33;MFRL=0,188,165;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.46,7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.336,0.552:5:0,2,1:0,0,2:0,0,1,4
chr3	69074930	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,2:2,7:0,6,0,9
chr3	69082657	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	69082873	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,5:3,2:0,5,0,7
chr3	69084161	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.406:40:10,7:12,9:15,9,10,6
chr3	69088027	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=97,119;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:5,1:20,1:13,12,2,0
chr3	69088918	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	69088944	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	69093598	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:7,11:6,4:11,2,13,2
chr3	69104695	.	T	A	.	.	DP=176;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=533.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,162:0.994:162:0,76:0,83:0,0,51,111
chr3	69104752	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=177.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,26:0,25:0,0,0,51
chr3	69106304	.	CC	TG	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:8,9:9,6:17,0,14,1
chr3	69112049	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=84.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,12:0,0,25,1
chr3	69112658	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.144:32:8,1:13,1:10,17,0,5
chr3	69112673	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=156,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:13,0:13,2:1,27,0,2
chr3	69113153	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:4,7:7,9:9,2,16,1
chr3	69127133	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:0,7,0,9
chr3	69129386	.	GGGGGTGT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,12;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.266:9:1,0:3,0:0|1:69129386_GGGGGTGT_G:69129386:7,0,0,2
chr3	69129397	.	G	GCC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:3,2:3,0:0|1:69129386_GGGGGTGT_G:69129386:6,3,0,3
chr3	69153852	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:69153852_A_C:69153852:0,4,0,1
chr3	69153854	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:69153852_A_C:69153852:0,1,0,4
chr3	69153861	.	TTGCG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:0|1:69153852_A_C:69153852:0,3,0,1
chr3	69153869	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:69153852_A_C:69153852:0,3,0,1
chr3	69225588	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr3	69225875	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr3	69229976	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr3	69230026	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,6:0,0,17,3
chr3	69230061	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,12:0,0,16,13
chr3	69242770	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.843:11:1,7:0,2:1,0,9,1
chr3	69244162	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,8,3
chr3	69245949	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	69246274	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,1114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	69265371	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0,0,8,4
chr3	69267578	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=78.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,10:0,0,0,25
chr3	69273656	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	69362722	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr3	70005712	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,8:4,4:2,7,3,9
chr3	71015021	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.396:31:5,7:13,5:13,6,12,0
chr3	71027251	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=143,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr3	71161788	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,36;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,2:9,0:3,8,1,1
chr3	71745633	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:19,1:13,1:16,17,1,1
chr3	72495593	.	T	TAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=201,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=A;STR;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,1:0,1:1,1,2,2
chr3	72495777	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=194,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.934:28:0,15:1,12:0,1,9,18
chr3	72873591	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:15,2:13,0:20,8,2,0
chr3	72897583	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=274,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	73004157	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	73016635	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	73024350	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=125.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,21:0,18:0,0,8,33
chr3	73096591	.	A	ATAAT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,25:0.577:43:8,7:10,18:0,18,0,25
chr3	73110076	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr3	73112489	.	A	AAAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.604:9:1,3:1,3:0,3,0,6
chr3	73112919	.	T	TA	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=76.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,26:0.583:45:9,10:9,14:4,15,4,22
chr3	73112974	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=159,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,4:1,3:0,8,1,6
chr3	73437112	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,1,2
chr3	73440108	.	G	GA,GAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33,35;MFRL=117,142,62;MMQ=60,60,60;MPOS=9,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.41,3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.273,0.273:8:1,1,1:2,1,1:4,0,4,0
chr3	73651469	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,6:3,2:2,5,6,2
chr3	73651621	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr3	74315580	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,9:1,5:3,0,14,0
chr3	74344356	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.456:20:5,4:6,5:3,8,3,6
chr3	74350997	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr3	74474166	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,6:0,14:0,0,0,20
chr3	75679820	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=12;MBQ=20,29;MFRL=113,188;MMQ=37,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:3,1:0,1:2,1,2,0
chr3	75679836	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=12;MBQ=34,32;MFRL=191,128;MMQ=25,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr3	75679863	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=12;MBQ=34,34;MFRL=194,134;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:8,0,4,1
chr3	75679872	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=166,196;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,2:7,1:10,1,3,0
chr3	75679876	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=166,158;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,3:6,2:10,1,5,0
chr3	75679891	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=191,137;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:5,4:7,3:0|1:75679891_G_A:75679891:11,1,6,1
chr3	75679893	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=191,137;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,4:7,3:11,1,6,1
chr3	75679899	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=188,137;MMQ=25,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:4,4:8,3:0|1:75679891_G_A:75679891:11,1,6,1
chr3	75679930	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=144,131;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.413:27:7,6:9,5:0|1:75679930_A_C:75679930:12,4,6,5
chr3	75679937	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=127,171;MMQ=25,48;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.267:28:10,2:11,4:14,7,5,2
chr3	75679938	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=29,33;MFRL=139,131;MMQ=25,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:7,5:12,4:0|1:75679930_A_C:75679930:14,5,5,4
chr3	75679944	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=138,138;MMQ=25,25;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:11,2:14,3:14,12,5,0
chr3	75679958	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=126,147;MMQ=27,48;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,7:0.205:37:13,2:16,5:0|1:75679958_C_T:75679958:19,11,5,2
chr3	75679965	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=131,137;MMQ=29,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,11:0.285:40:8,5:18,4:0|1:75679965_C_A:75679965:19,10,5,6
chr3	75679973	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=28,34;MFRL=127,143;MMQ=27,48;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:12,3:17,5:0|1:75679958_C_T:75679958:19,14,4,4
chr3	75679975	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=33,31;MFRL=125,136;MMQ=48,26;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,14:0.357:40:9,7:16,7:0|1:75679975_C_T:75679975:15,11,7,7
chr3	75679988	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=11;MBQ=27,33;MFRL=125,136;MMQ=48,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,12:0.317:39:11,6:16,6:0|1:75679975_C_T:75679975:16,11,5,7
chr3	75679990	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=11;MBQ=29,30;MFRL=133,131;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,3:0.091:42:15,0:16,3:0|1:75679990_G_A:75679990:19,20,2,1
chr3	75679997	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=32,31;MFRL=128,145;MMQ=27,29;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,6:0.189:35:10,4:17,1:0|1:75679965_C_A:75679965:13,16,2,4
chr3	75680006	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=30,33;MFRL=138,128;MMQ=27,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:9,3:16,0:8,18,1,2
chr3	75680010	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=31,28;MFRL=137,139;MMQ=27,48;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:9,2:13,3:8,15,1,4
chr3	75680011	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=32,28;MFRL=139,131;MMQ=25,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:11,0:14,2:0|1:75679990_G_A:75679990:7,21,2,1
chr3	75680081	.	TGTG	T	.	.	DP=7;ECNT=11;MBQ=31,32;MFRL=156,179;MMQ=25,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr3	75713442	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=28,31;MFRL=148,274;MMQ=40,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,1:0|1:75713442_G_A:75713442:7,0,2,0
chr3	75713449	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=145,274;MMQ=40,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:75713442_G_A:75713442:11,0,2,0
chr3	75713457	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=140,299;MMQ=43,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:9,0:6,3:0|1:75713442_G_A:75713442:15,0,3,0
chr3	75713472	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=136,244;MMQ=58,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:16,1:10,4:22,4,5,0
chr3	75713496	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=124,226;MMQ=55,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.107:49:24,1:20,4:33,11,4,1
chr3	75713507	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=120,208;MMQ=55,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,7:0.138:52:24,3:20,4:32,13,5,2
chr3	75713566	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=141,192;MMQ=52,26;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,8:0.173:50:26,4:16,4:16,26,7,1
chr3	75713618	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=157,152;MMQ=47,37;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.104:50:19,2:25,3:28,17,5,0
chr3	75713654	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=146,140;MMQ=50,49;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,16:0.176:92:30,5:44,10:47,29,12,4
chr3	75713658	.	AAG	A	.	.	DP=108;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=143,147;MMQ=50,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,9:0.085:106:37,3:53,6:58,39,7,2
chr3	75713669	.	G	A	.	.	DP=116;ECNT=12;MBQ=28,30;MFRL=137,137;MMQ=50,49;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,23:0.221:106:33,9:45,14:50,33,14,9
chr3	75713725	.	C	T	.	.	DP=107;ECNT=12;MBQ=34,28;MFRL=134,143;MMQ=51,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,38:0.371:103:29,17:35,21:23,42,18,20
chr3	75713738	.	T	G	.	.	DP=85;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=138,145;MMQ=52,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,29:0.370:79:19,12:28,16:12,38,10,19
chr3	75713748	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=139,139;MMQ=51,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,8:0.127:69:21,3:31,5:18,43,0,8
chr3	75713751	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=140,150;MMQ=48,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,14:0.250:58:16,7:27,7:11,33,4,10
chr3	75713757	.	AGG	A	.	.	DP=52;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=141,137;MMQ=49,41;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,16:0.354:46:12,5:16,11:0|1:75713757_AGG_A:75713757:5,25,2,14
chr3	75713762	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=12;MBQ=30,35;MFRL=139,142;MMQ=49,41;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=61.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,17:0.375:46:13,5:13,12:0|1:75713757_AGG_A:75713757:5,24,2,15
chr3	75713782	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=140,166;MMQ=56,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.571:33:6,11:8,8:0,14,1,18
chr3	75713794	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=33,34;MFRL=160,168;MMQ=56,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:10,6:7,4:0,17,0,10
chr3	75713858	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=232,212;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:2,2:3,1:6,0,0,3
chr3	75713879	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=186,242;MMQ=60,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:12,1,0,2
chr3	75713897	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=186,215;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:14,1,1,1
chr3	75713948	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=154,203;MMQ=60,37;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,1:15,1:0|1:75713948_C_T:75713948:21,4,2,0
chr3	75713958	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=152,203;MMQ=60,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:11,1:16,1:0|1:75713948_C_T:75713948:22,6,2,0
chr3	75713963	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=150,203;MMQ=60,37;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,1:15,1:0|1:75713948_C_T:75713948:20,6,2,0
chr3	75714095	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=135,140;MMQ=37,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,11:0.255:45:12,7:22,4:0|1:75714095_G_A:75714095:9,25,0,11
chr3	75714102	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=135,140;MMQ=31,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,9:0.222:43:13,4:19,3:0|1:75714095_G_A:75714095:7,27,0,9
chr3	75714118	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=145,0;MMQ=28,36;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.162:35:7,2:22,3:0|1:75714118_G_A:75714118:4,26,0,5
chr3	75714127	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=158,0;MMQ=28,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:8,2:16,1:0|1:75714118_G_A:75714118:2,22,0,3
chr3	75714139	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=179,140;MMQ=56,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:3,4:10,4:2,11,1,7
chr3	75714185	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=30,29;MFRL=180,204;MMQ=36,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:5,1:0|1:75714185_C_T:75714185:6,2,2,0
chr3	75714202	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=170,206;MMQ=40,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.221:25:10,2:7,3:0|1:75714185_C_T:75714185:18,2,3,2
chr3	75714240	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=161,171;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,12:0.245:51:17,5:21,7:37,2,10,2
chr3	75714242	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=8;MBQ=35,32;MFRL=164,164;MMQ=40,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,12:0.236:53:19,3:21,9:0|1:75714242_G_T:75714242:37,4,12,0
chr3	75714251	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=161,163;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,14:0.238:61:25,3:21,11:0|1:75714242_G_T:75714242:43,4,14,0
chr3	75714263	.	CA	TT	.	.	DP=71;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=156,148;MMQ=40,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,14:0.211:69:21,8:31,6:49,6,14,0
chr3	75714298	.	A	G	.	.	DP=133;ECNT=8;MBQ=31,27;MFRL=127,129;MMQ=60,37;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,50:0.421:118:30,29:37,21:51,17,49,1
chr3	75714337	.	T	G	.	.	DP=335;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=110,112;MMQ=60,48;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=633.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,206:0.649:318:64,105:44,93:60,52,131,75
chr3	75714345	.	G	T	.	.	DP=366;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=108,122;MMQ=60,52;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=166.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:275,80:0.224:355:150,30:118,47:168,107,47,33
chr3	75714379	.	T	G	.	.	DP=273;ECNT=12;MBQ=29,30;MFRL=116,120;MMQ=60,37;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:242,24:0.092:266:116,13:117,11:108,134,10,14
chr3	75714382	.	G	C,T	.	.	DP=268;ECNT=12;MBQ=31,33,31;MFRL=120,120,118;MMQ=60,60,43;MPOS=20,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=154.86,102.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:149,65,37:0.260,0.149:251:86,23,20:59,42,16:63,86,44,58
chr3	75714388	.	G	T	.	.	DP=229;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=120,117;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=90.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:198,30:0.134:228:94,14:81,12:82,116,9,21
chr3	75714391	.	G	T	.	.	DP=205;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=120,128;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=254.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:129,71:0.357:200:63,38:62,31:0|1:75714391_G_T:75714391:52,77,20,51
chr3	75714394	.	G	T	.	.	DP=200;ECNT=12;MBQ=32,32;MFRL=121,130;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=250.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:130,70:0.352:200:56,35:60,31:0|1:75714391_G_T:75714391:51,79,19,51
chr3	75714396	.	T	TG	.	.	DP=187;ECNT=12;MBQ=31,32;MFRL=123,130;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=244.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:118,67:0.364:185:48,33:54,31:0|1:75714391_G_T:75714391:44,74,17,50
chr3	75714422	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=141,123;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,21:0.271:79:25,4:31,17:5,53,7,14
chr3	75714423	.	G	T	.	.	DP=83;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=129,141;MMQ=48,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=94.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,30:0.387:78:19,10:28,20:10,38,1,29
chr3	75714447	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=12;MBQ=28,31;MFRL=129,155;MMQ=44,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=162.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,40:0.661:60:10,13:7,25:2,18,1,39
chr3	75714459	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=159,166;MMQ=44,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,13:0.275:49:17,2:15,10:3,33,0,13
chr3	75714465	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=12;MBQ=32,31;MFRL=164,171;MMQ=46,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=84.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,22:0.479:46:8,12:14,9:2,22,1,21
chr3	75714648	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=162,126;MMQ=50,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.212:26:5,2:16,3:17,4,4,1
chr3	75714663	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=163,126;MMQ=55,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.262:36:8,6:19,3:20,7,7,2
chr3	75714674	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=166,140;MMQ=50,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.340:45:14,4:15,11:20,10,11,4
chr3	75714702	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=167,137;MMQ=60,53;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,36:0.563:64:11,12:16,24:17,11,23,13
chr3	75714709	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=161,130;MMQ=60,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.056:69:25,1:37,2:39,27,2,1
chr3	75714788	.	A	C	.	.	DP=86;ECNT=12;MBQ=31,29;MFRL=141,137;MMQ=52,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,3:0.038:84:28,1:50,1:0|1:75714788_A_C:75714788:49,32,0,3
chr3	75714805	.	TG	T	.	.	DP=95;ECNT=12;MBQ=32,33;MFRL=137,142;MMQ=53,41;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=87.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,25:0.280:91:18,12:38,11:0|1:75714805_TG_T:75714805:37,29,15,10
chr3	75714807	.	G	A	.	.	DP=91;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=137,142;MMQ=53,41;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,25:0.283:90:21,14:40,11:0|1:75714805_TG_T:75714805:37,28,15,10
chr3	75714809	.	C	T	.	.	DP=96;ECNT=12;MBQ=30,29;MFRL=138,157;MMQ=52,25;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,14:0.153:96:31,5:44,6:0|1:75714788_A_C:75714788:45,37,11,3
chr3	75714819	.	G	A	.	.	DP=103;ECNT=12;MBQ=29,31;MFRL=140,168;MMQ=55,25;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,18:0.181:103:34,7:47,9:0|1:75714788_A_C:75714788:43,42,14,4
chr3	75714824	.	AG	A	.	.	DP=104;ECNT=12;MBQ=31,31;MFRL=139,165;MMQ=55,25;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,15:0.152:103:32,7:49,8:46,42,12,3
chr3	75714825	.	G	A	.	.	DP=102;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=140,153;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,27:0.278:102:30,10:43,15:0|1:75714805_TG_T:75714805:41,34,17,10
chr3	75714831	.	G	A	.	.	DP=109;ECNT=12;MBQ=28,32;MFRL=137,168;MMQ=60,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:91,18:0.171:109:32,9:54,9:0|1:75714788_A_C:75714788:44,47,15,3
chr3	75714835	.	C	T	.	.	DP=111;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=138,168;MMQ=60,25;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:93,18:0.168:111:35,9:53,9:0|1:75714788_A_C:75714788:44,49,15,3
chr3	75714840	.	A	G	.	.	DP=122;ECNT=12;MBQ=31,34;MFRL=131,156;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=205.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,54:0.466:116:26,24:35,29:27,35,34,20
chr3	75714843	.	T	A	.	.	DP=128;ECNT=12;MBQ=29,29;MFRL=134,153;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=123.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:93,35:0.277:128:39,14:46,15:0|1:75714805_TG_T:75714805:49,44,18,17
chr3	75714853	.	G	A	.	.	DP=147;ECNT=12;MBQ=28,30;MFRL=133,153;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,39:0.286:138:41,16:50,22:0|1:75714805_TG_T:75714805:52,47,20,19
chr3	75714895	.	G	A	.	.	DP=117;ECNT=11;MBQ=30,31;MFRL=136,197;MMQ=52,31;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:109,7:0.067:116:57,3:47,4:45,64,5,2
chr3	75714898	.	G	A	.	.	DP=114;ECNT=11;MBQ=33,32;MFRL=142,133;MMQ=53,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,34:0.310:110:44,16:31,17:30,46,20,14
chr3	75714917	.	G	A	.	.	DP=106;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=137,157;MMQ=50,45;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,26:0.262:101:34,14:37,9:0|1:75714917_G_A:75714917:40,35,8,18
chr3	75714929	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=11;MBQ=33,29;MFRL=137,165;MMQ=50,31;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,24:0.245:99:35,13:34,9:0|1:75714917_G_A:75714917:41,34,9,15
chr3	75714935	.	C	A	.	.	DP=101;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=150,147;MMQ=49,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:89,12:0.126:101:42,7:40,5:0|1:75714935_C_A:75714935:46,43,4,8
chr3	75714937	.	G	A	.	.	DP=106;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=148,147;MMQ=49,31;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:92,12:0.123:104:45,6:43,5:0|1:75714935_C_A:75714935:47,45,4,8
chr3	75714950	.	C	A	.	.	DP=102;ECNT=11;MBQ=33,32;MFRL=137,172;MMQ=49,43;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,23:0.232:99:39,12:36,8:0|1:75714917_G_A:75714917:42,34,10,13
chr3	75714976	.	C	T	.	.	DP=110;ECNT=11;MBQ=34,29;MFRL=155,118;MMQ=43,48;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,50:0.485:103:27,24:25,26:32,21,25,25
chr3	75714980	.	C	A	.	.	DP=107;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=133,175;MMQ=49,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,17:0.168:105:46,5:36,12:45,43,11,6
chr3	75715033	.	T	C	.	.	DP=115;ECNT=11;MBQ=31,33;MFRL=131,129;MMQ=50,28;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:101,10:0.097:111:41,6:55,4:43,58,8,2
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chr3	75715205	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=33,35;MFRL=192,133;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.258:29:8,2:12,4:0|1:75715173_CT_TG:75715173:3,19,1,6
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chr3	75715261	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=27,32;MFRL=197,160;MMQ=60,35;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:3,3:2,3:0|1:75715261_C_T:75715261:0,6,2,6
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chr3	75785942	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=18;MBQ=34,31;MFRL=231,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,2:1,1:0|1:75785942_G_A:75785942:4,0,3,0
chr3	75785954	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=18;MBQ=33,32;MFRL=231,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:2,0:0|1:75785942_G_A:75785942:4,0,4,0
chr3	75785959	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=18;MBQ=35,31;MFRL=219,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.528:10:3,5:2,0:0|1:75785942_G_A:75785942:5,0,5,0
chr3	75785962	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=18;MBQ=29,34;MFRL=213,242;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,2:1,1:7,0,3,0
chr3	75785970	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=18;MBQ=34,30;MFRL=203,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.484:11:3,5:3,0:0|1:75785942_G_A:75785942:6,0,5,0
chr3	75785996	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=18;MBQ=35,31;MFRL=158,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,9:2,4:8,0,14,0
chr3	75786019	.	GG	CA,CG	.	.	DP=38;ECNT=18;MBQ=34,33,33;MFRL=157,187,235;MMQ=60,60,60;MPOS=15,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=46.12,8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,13,3:0.341,0.098:38:12,6,2:10,5,1:21,1,16,0
chr3	75786029	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=18;MBQ=32,31;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.167:40:16,3:18,2:0|1:75786029_T_A:75786029:33,1,6,0
chr3	75786035	.	G	GA	.	.	DP=49;ECNT=18;MBQ=34,34;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,8:0.176:49:18,4:18,4:0|1:75786029_T_A:75786029:38,3,8,0
chr3	75786036	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=18;MBQ=32,34;MFRL=151,217;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.134:49:19,4:19,2:41,2,6,0
chr3	75786041	.	AG	A	.	.	DP=62;ECNT=18;MBQ=32,34;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.103:56:27,0:20,5:49,2,5,0
chr3	75786042	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=18;MBQ=33,33;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,29:0.490:59:18,14:10,13:28,2,27,2
chr3	75786059	.	CA	TG,TA	.	.	DP=88;ECNT=18;MBQ=33,31,31;MFRL=152,123,149;MMQ=60,60,60;MPOS=14,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=140.71,49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,38,15:0.429,0.176:88:17,19,5:15,14,7:31,4,47,6
chr3	75786071	.	C	A	.	.	DP=105;ECNT=18;MBQ=32,32;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:86,19:0.187:105:39,5:38,13:0|1:75786071_C_A:75786071:71,15,16,3
chr3	75786073	.	C	G	.	.	DP=108;ECNT=18;MBQ=34,34;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,5:0.055:105:47,0:48,5:82,18,3,2
chr3	75786079	.	CG	TA	.	.	DP=131;ECNT=18;MBQ=32,30;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:92,26:0.222:118:46,7:42,16:0|1:75786071_C_A:75786071:75,17,20,6
chr3	75786080	.	G	A	.	.	DP=130;ECNT=18;MBQ=28,31;MFRL=133,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,48:0.496:100:23,27:28,21:40,12,40,8
chr3	75786132	.	T	C	.	.	DP=184;ECNT=18;MBQ=31,29;MFRL=126,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:154,23:0.134:177:72,11:73,12:71,83,10,13
chr3	75786202	.	TG	CA	.	.	DP=126;ECNT=21;MBQ=31,35;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:118,7:0.063:125:53,4:57,3:0|1:75786202_TG_CA:75786202:43,75,2,5
chr3	75786211	.	A	G	.	.	DP=120;ECNT=21;MBQ=29,33;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,25:0.222:114:41,9:43,15:27,62,10,15
chr3	75786221	.	G	A	.	.	DP=104;ECNT=21;MBQ=33,32;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:98,6:0.066:104:50,3:45,3:0|1:75786202_TG_CA:75786202:33,65,2,4
chr3	75786225	.	G	A	.	.	DP=108;ECNT=21;MBQ=32,31;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,36:0.357:101:32,18:30,17:23,42,13,23
chr3	75786243	.	C	T	.	.	DP=87;ECNT=21;MBQ=33,30;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,21:0.250:86:32,9:29,11:0|1:75786243_C_T:75786243:18,47,6,15
chr3	75786245	.	T	A	.	.	DP=85;ECNT=21;MBQ=31,28;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,21:0.253:85:33,9:29,12:0|1:75786243_C_T:75786243:18,46,6,15
chr3	75786251	.	GG	AT	.	.	DP=84;ECNT=21;MBQ=31,33;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,3:0.046:84:40,1:38,1:25,56,1,2
chr3	75786252	.	G	T	.	.	DP=84;ECNT=21;MBQ=32,30;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,19:0.238:83:31,8:28,10:0|1:75786243_C_T:75786243:20,44,6,13
chr3	75786256	.	T	A	.	.	DP=76;ECNT=21;MBQ=32,30;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,17:0.231:76:28,7:27,9:0|1:75786243_C_T:75786243:17,42,4,13
chr3	75786261	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,20:0.318:64:19,12:22,6:12,32,4,16
chr3	75786278	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=21;MBQ=31,34;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,23:0.453:51:11,10:15,11:0|1:75786278_A_C:75786278:8,20,1,22
chr3	75786288	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=21;MBQ=32,33;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,16:0.354:46:13,7:16,8:0|1:75786288_A_G:75786288:7,23,1,15
chr3	75786298	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=21;MBQ=31,34;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,12:0.310:40:11,5:13,7:0|1:75786288_A_G:75786288:4,24,0,12
chr3	75786302	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=21;MBQ=33,32;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:15,1:18,1:3,31,0,2
chr3	75786314	.	CCTACATTCT	C	.	.	DP=31;ECNT=21;MBQ=34,34;MFRL=137,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,12:0.394:31:7,3:8,9:0|1:75786278_A_C:75786278:2,17,2,10
chr3	75786337	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.347:21:6,1:8,5:0|1:75786337_G_A:75786337:0,14,2,5
chr3	75786354	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=21;MBQ=32,32;MFRL=156,149;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:4,1:6,4:0|1:75786337_G_A:75786337:0,11,2,3
chr3	75786355	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:3,1:8,2:2,11,0,3
chr3	75786379	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=21;MBQ=31,31;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,2:4,4:1,7,3,3
chr3	75786381	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=21;MBQ=32,33;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:2,4:3,4,1,6
chr3	75786385	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=21;MBQ=28,34;MFRL=186,93;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,3:1,4,1,5
chr3	75786417	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=25;MBQ=30,32;MFRL=129,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:7,8:2,1:0|1:75786417_T_C:75786417:6,5,8,1
chr3	75786430	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=25;MBQ=33,33;MFRL=133,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:11,4:5,0:11,5,4,0
chr3	75786438	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=25;MBQ=34,33;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.480:23:8,8:4,3:0|1:75786417_T_C:75786417:8,4,10,1
chr3	75786440	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=25;MBQ=34,33;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:8,7:4,3:0|1:75786417_T_C:75786417:8,4,11,1
chr3	75786450	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=25;MBQ=27,33;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,18:0.575:31:9,12:4,4:0|1:75786417_T_C:75786417:9,4,14,4
chr3	75786453	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=25;MBQ=32,32;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=63.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,17:0.529:32:9,13:5,4:0|1:75786417_T_C:75786417:11,4,14,3
chr3	75786469	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=25;MBQ=34,30;MFRL=129,165;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,6:0.152:44:22,6:14,0:0|1:75786469_G_A:75786469:28,10,6,0
chr3	75786476	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=25;MBQ=33,33;MFRL=137,143;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,6:0.143:47:22,6:15,0:0|1:75786469_G_A:75786469:31,10,6,0
chr3	75786490	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=25;MBQ=34,35;MFRL=136,122;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,6:0.130:52:24,5:18,1:0|1:75786469_G_A:75786469:31,15,6,0
chr3	75786499	.	CA	TG	.	.	DP=54;ECNT=25;MBQ=34,32;MFRL=125,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,5:0.107:54:28,3:18,2:34,15,4,1
chr3	75786500	.	AT	GA,GT	.	.	DP=58;ECNT=25;MBQ=32,29,29;MFRL=135,126,124;MMQ=60,60,60;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=21.66,76.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,7,21:0.142,0.401:52:13,5,11:9,2,8:16,8,18,10
chr3	75786506	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=25;MBQ=30,33;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,22:0.365:61:20,13:15,8:0|1:75786506_T_C:75786506:28,11,11,11
chr3	75786515	.	GG	AG,AT	.	.	DP=63;ECNT=25;MBQ=30,32,33;MFRL=136,121,160;MMQ=60,60,60;MPOS=15,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=101.70,14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:29,28,5:0.439,0.093:62:13,14,3:15,11,2:20,9,20,13
chr3	75786518	.	A	C	.	.	DP=64;ECNT=25;MBQ=30,36;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,6:0.106:64:26,4:24,2:0|1:75786469_G_A:75786469:34,24,6,0
chr3	75786521	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=25;MBQ=33,34;MFRL=137,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,6:0.104:65:27,3:31,2:0|1:75786469_G_A:75786469:34,25,6,0
chr3	75786533	.	T	G	.	.	DP=70;ECNT=25;MBQ=29,34;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=72.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,23:0.332:70:20,11:25,11:0|1:75786506_T_C:75786506:28,19,13,10
chr3	75786555	.	C	CTG	.	.	DP=70;ECNT=25;MBQ=33,33;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=144.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,38:0.573:66:13,17:14,18:15,13,18,20
chr3	75786572	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=25;MBQ=32,30;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,27:0.406:67:17,11:20,15:0|1:75786572_T_C:75786572:17,23,15,12
chr3	75786597	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=25;MBQ=30,32;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,21:0.367:58:17,9:16,9:0|1:75786572_T_C:75786572:19,18,11,10
chr3	75786607	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=25;MBQ=33,32;MFRL=134,146;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=81.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,22:0.371:60:21,10:15,11:0|1:75786572_T_C:75786572:20,18,8,14
chr3	75786610	.	T	A,G	.	.	DP=63;ECNT=25;MBQ=32,33,32;MFRL=132,165,133;MMQ=60,60,57;MPOS=8,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.09,50.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:39,7,16:0.126,0.268:62:19,3,9:18,4,6:22,17,9,14
chr3	75786618	.	CT	AC	.	.	DP=63;ECNT=25;MBQ=34,28;MFRL=132,143;MMQ=60,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,8:0.142:61:26,4:22,4:27,26,2,6
chr3	75786619	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=25;MBQ=32,29;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,23:0.359:63:19,12:18,10:22,18,9,14
chr3	75786623	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=25;MBQ=33,32;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,13:0.222:61:26,6:20,7:20,28,10,3
chr3	75786628	.	G	C	.	.	DP=66;ECNT=25;MBQ=33,32;MFRL=131,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,25:0.397:63:19,14:19,10:20,18,12,13
chr3	75786662	.	A	T	.	.	DP=86;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=131,171;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,4:0.057:85:38,2:42,2:0|1:75786662_A_T:75786662:35,46,2,2
chr3	75786670	.	G	A	.	.	DP=90;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,21:0.245:87:42,1:24,20:27,39,9,12
chr3	75786672	.	C	T	.	.	DP=88;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=131,166;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,5:0.067:88:38,3:36,2:0|1:75786662_A_T:75786662:34,49,3,2
chr3	75786681	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=174.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,49:0.652:75:15,23:10,26:11,15,18,31
chr3	75786684	.	G	T	.	.	DP=82;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=132,171;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,6:0.084:81:36,3:34,3:0|1:75786662_A_T:75786662:29,46,3,3
chr3	75786687	.	A	T	.	.	DP=79;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,9:0.125:78:33,6:35,3:27,42,3,6
chr3	75786737	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=27;MBQ=31,33;MFRL=118,175;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,21:0.439:48:13,8:12,11:8,19,8,13
chr3	75786740	.	CA	GG	.	.	DP=52;ECNT=27;MBQ=33,32;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,9:0.182:51:15,5:22,3:0|1:75786740_CA_GG:75786740:16,26,2,7
chr3	75786741	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=27;MBQ=31,32;MFRL=118,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,13:0.317:42:12,4:16,8:0|1:75786741_A_G:75786741:9,20,6,7
chr3	75786748	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=27;MBQ=33,32;MFRL=137,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,7:0.143:54:17,5:25,2:0|1:75786748_C_T:75786748:19,28,1,6
chr3	75786753	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=27;MBQ=30,30;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.441:50:14,7:12,14:11,17,9,13
chr3	75786754	.	G	T	.	.	DP=53;ECNT=27;MBQ=32,32;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,10:0.194:53:17,5:23,3:0|1:75786740_CA_GG:75786740:18,25,4,6
chr3	75786759	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=27;MBQ=32,34;MFRL=118,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,20:0.382:53:15,9:17,11:11,22,10,10
chr3	75786760	.	TC	T	.	.	DP=53;ECNT=27;MBQ=31,32;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,8:0.164:53:19,5:24,3:0|1:75786748_C_T:75786748:19,26,2,6
chr3	75786764	.	C	CT	.	.	DP=53;ECNT=27;MBQ=29,35;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,8:0.164:53:18,5:23,3:0|1:75786740_CA_GG:75786740:18,27,4,4
chr3	75786773	.	T	A	.	.	DP=51;ECNT=27;MBQ=31,30;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,11:0.226:51:21,4:18,6:0|1:75786741_A_G:75786741:17,23,6,5
chr3	75786784	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=27;MBQ=31,29;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,7:0.154:50:21,2:20,5:0|1:75786740_CA_GG:75786740:17,26,4,3
chr3	75786802	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=27;MBQ=29,33;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,11:0.217:51:15,3:20,4:0|1:75786741_A_G:75786741:18,22,7,4
chr3	75786817	.	CACATTCATT	C	.	.	DP=54;ECNT=27;MBQ=33,35;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,14:0.295:49:13,4:16,9:0|1:75786817_CACATTCATT_C:75786817:24,11,3,11
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chr3	75786832	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=27;MBQ=30,31;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,14:0.275:51:15,5:20,7:0|1:75786741_A_G:75786741:20,17,9,5
chr3	75786833	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=27;MBQ=31,31;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,11:0.214:54:16,4:19,7:22,21,8,3
chr3	75786845	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=27;MBQ=32,33;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=165.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,41:0.711:57:6,19:10,20:1|0:75786817_CACATTCATT_C:75786817:5,11,27,14
chr3	75786854	.	A	T	.	.	DP=67;ECNT=27;MBQ=32,29;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,15:0.237:64:20,5:26,9:27,22,9,6
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chr3	75786888	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=27;MBQ=30,30;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,9:0.115:85:24,4:46,5:0|1:75786888_C_T:75786888:40,36,8,1
chr3	75786892	.	A	C	.	.	DP=93;ECNT=27;MBQ=32,30;MFRL=133,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,26:0.284:93:21,10:38,13:0|1:75786866_G_T:75786866:38,29,15,11
chr3	75786894	.	GT	G	.	.	DP=95;ECNT=27;MBQ=33,34;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,9:0.106:92:28,4:51,5:0|1:75786888_C_T:75786888:44,39,8,1
chr3	75786899	.	T	C	.	.	DP=96;ECNT=27;MBQ=31,34;MFRL=132,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=108.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,30:0.316:96:20,13:44,15:0|1:75786866_G_T:75786866:36,30,15,15
chr3	75786916	.	C	A	.	.	DP=102;ECNT=27;MBQ=34,31;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=103.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,29:0.288:102:24,13:44,15:0|1:75786866_G_T:75786866:39,34,16,13
chr3	75786919	.	A	T	.	.	DP=105;ECNT=27;MBQ=31,32;MFRL=124,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=105.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,30:0.292:104:25,14:44,13:0|1:75786866_G_T:75786866:39,35,16,14
chr3	75786921	.	G	A	.	.	DP=107;ECNT=27;MBQ=33,32;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,11:0.115:102:35,6:49,5:48,43,4,7
chr3	75786942	.	C	A	.	.	DP=117;ECNT=27;MBQ=33,30;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=85.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,36:0.314:115:38,17:39,18:38,41,14,22
chr3	75786965	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=19;MBQ=33,32;MFRL=133,146;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,22:0.225:100:43,10:34,12:0|1:75786965_C_T:75786965:31,47,7,15
chr3	75786991	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,17:0.231:76:29,6:27,7:0|1:75786965_C_T:75786965:22,37,7,10
chr3	75786993	.	T	A	.	.	DP=69;ECNT=19;MBQ=32,33;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,7:0.111:65:31,2:27,4:20,38,4,3
chr3	75787015	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,18:0.311:59:23,7:18,11:0|1:75787015_C_T:75787015:14,27,6,12
chr3	75787032	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=19;MBQ=31,30;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,15:0.258:60:20,6:21,8:0|1:75787032_T_C:75787032:15,30,6,9
chr3	75787042	.	G	GAAAT	.	.	DP=63;ECNT=19;MBQ=33,35;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,18:0.292:63:25,6:18,9:0|1:75787032_T_C:75787032:15,30,8,10
chr3	75787043	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=19;MBQ=34,32;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,15:0.246:63:21,7:22,7:0|1:75787015_C_T:75787015:20,28,3,12
chr3	75787044	.	A	ACTT	.	.	DP=64;ECNT=19;MBQ=32,30;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,19:0.303:64:26,5:17,11:0|1:75787032_T_C:75787032:16,29,9,10
chr3	75787047	.	G	GACTTATA	.	.	DP=64;ECNT=19;MBQ=34,34;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,16:0.253:64:21,7:22,6:0|1:75787015_C_T:75787015:21,27,4,12
chr3	75787049	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=19;MBQ=33,31;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,9:0.150:64:28,4:22,4:22,33,3,6
chr3	75787057	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,43:0.677:63:14,16:6,24:8,12,17,26
chr3	75787081	.	A	T	.	.	DP=58;ECNT=19;MBQ=32,32;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,13:0.228:58:17,7:20,5:0|1:75787015_C_T:75787015:21,24,3,10
chr3	75787098	.	CCT	C	.	.	DP=53;ECNT=19;MBQ=34,29;MFRL=146,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,10:0.211:50:18,3:17,7:16,24,4,6
chr3	75787116	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=19;MBQ=32,32;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,11:0.228:49:17,4:18,7:0|1:75787015_C_T:75787015:15,23,3,8
chr3	75787127	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=19;MBQ=33,32;MFRL=159,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,7:0.167:46:17,3:17,3:0|1:75787015_C_T:75787015:13,26,2,5
chr3	75787145	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=19;MBQ=31,28;MFRL=166,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,9:0.249:38:13,6:16,3:0|1:75787145_T_C:75787145:13,16,3,6
chr3	75787159	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=19;MBQ=33,31;MFRL=166,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.200:38:14,4:14,1:0|1:75787145_T_C:75787145:15,16,4,3
chr3	75787169	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=19;MBQ=27,31;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.386:42:14,9:11,6:16,10,10,6
chr3	75787174	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=19;MBQ=32,27;MFRL=160,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:20,1:15,2:22,17,3,0
chr3	75787186	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=11;MBQ=32,30;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,12:0.289:43:13,8:16,3:18,13,8,4
chr3	75787218	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.114:42:21,2:14,1:0|1:75787218_T_A:75787218:19,19,3,1
chr3	75787221	.	CA	TG	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=33,33;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:22,2:12,2:0|1:75787218_T_A:75787218:20,17,3,1
chr3	75787224	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=29,30;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:20,2:11,2:0|1:75787218_T_A:75787218:21,16,3,1
chr3	75787240	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=11;MBQ=31,29;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.089:43:25,1:13,1:0|1:75787218_T_A:75787218:20,20,2,1
chr3	75787244	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=11;MBQ=31,32;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:23,0:15,1:0|1:75787218_T_A:75787218:20,22,1,1
chr3	75787347	.	TCCC	T	.	.	DP=45;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=C;STR;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:21,3:12,5:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:11,22,5,3
chr3	75787352	.	T	TA	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=31,31;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:19,3:11,5:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:10,23,5,3
chr3	75787353	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:17,3:11,5:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:10,23,5,3
chr3	75787372	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,17:0.353:49:16,8:8,7:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:8,24,12,5
chr3	75787382	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=11;MBQ=31,28;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=85.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,32:0.588:54:13,21:8,10:16,6,10,22
chr3	75787405	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,24:0.438:55:17,14:10,9:0|1:75787405_C_T:75787405:16,15,18,6
chr3	75787416	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,10:0.200:53:25,6:15,4:26,17,7,3
chr3	75787424	.	C	G	.	.	DP=60;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,28:0.468:60:15,16:11,10:0|1:75787405_C_T:75787405:21,11,18,10
chr3	75787427	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,26:0.474:55:14,13:11,12:0|1:75787405_C_T:75787405:18,11,17,9
chr3	75787458	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,11:0.203:57:19,3:22,8:25,21,5,6
chr3	75787464	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=105.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,28:0.469:60:13,11:16,16:0|1:75787464_C_T:75787464:19,13,10,18
chr3	75787476	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,10:0.166:64:20,6:33,4:27,27,4,6
chr3	75787486	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=114.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,30:0.456:66:13,12:22,17:0|1:75787464_C_T:75787464:22,14,12,18
chr3	75787516	.	C	G	.	.	DP=60;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=102.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,27:0.452:60:11,12:21,15:0|1:75787464_C_T:75787464:12,21,8,19
chr3	75787519	.	CT	AG	.	.	DP=62;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,28:0.475:59:9,11:21,13:12,19,8,20
chr3	75787620	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=31,34;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:21,3:29,0:27,25,3,0
chr3	75787637	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=10;MBQ=34,30;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=81.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,23:0.414:56:13,12:19,10:0|1:75787637_C_T:75787637:18,15,15,8
chr3	75787645	.	GAA	G	.	.	DP=63;ECNT=10;MBQ=35,32;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=100.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,28:0.453:62:12,15:20,12:0|1:75787637_C_T:75787637:18,16,19,9
chr3	75787679	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=30,33;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=109.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,28:0.537:52:9,18:9,10:0|1:75787679_T_C:75787679:15,9,17,11
chr3	75787688	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=10;MBQ=31,31;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=117.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,31:0.571:54:12,19:9,12:0|1:75787679_T_C:75787679:14,9,19,12
chr3	75787702	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=10;MBQ=35,34;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,32:0.635:50:12,21:6,10:10,8,16,16
chr3	75787726	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=10;MBQ=30,31;MFRL=135,139;MMQ=41,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=170.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,41:0.914:44:2,27:1,11:2,1,22,19
chr3	75787728	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=10;MBQ=29,31;MFRL=139,135;MMQ=60,41;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:28,2:12,1:22,19,2,1
chr3	75787732	.	A	C	.	.	DP=50;ECNT=10;MBQ=33,27;MFRL=134,138;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.305:43:20,8:10,4:17,13,6,7
chr3	75787739	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=10;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=210.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,33:0,17:0,0,26,24
chr3	75787770	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=15;MBQ=34,31;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,11:0.204:57:24,8:19,3:22,24,4,7
chr3	75787794	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=15;MBQ=31,32;MFRL=137,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,35:0.632:55:12,19:8,15:6,14,10,25
chr3	75787801	.	TG	CA	.	.	DP=58;ECNT=15;MBQ=31,33;MFRL=139,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,11:0.200:58:26,4:16,7:15,32,1,10
chr3	75787809	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=15;MBQ=30,34;MFRL=138,115;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,9:0.178:54:27,3:18,5:11,34,1,8
chr3	75787869	.	CA	TG	.	.	DP=39;ECNT=15;MBQ=32,31;MFRL=149,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,27:0.718:37:6,8:4,16:7,3,6,21
chr3	75787876	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=107.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,26:0.711:36:6,8:4,17:8,2,5,21
chr3	75787880	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=27,33;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.429:33:10,3:8,10:9,10,3,11
chr3	75787897	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=15;MBQ=31,29;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:13,2:8,4:8,13,0,7
chr3	75787927	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=15;MBQ=31,33;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:8,4:3,8:5,7,5,8
chr3	75787949	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,2:6,6:5,7,4,5
chr3	75787962	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:2,2:7,6:6,4,5,5
chr3	75787996	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=32,32;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.150:22:7,1:10,3:14,4,1,3
chr3	75788010	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=15;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,13:0,0,17,6
chr3	75788023	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=30,30;MFRL=149,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.427:26:8,4:8,6:11,5,7,3
chr3	75788028	.	G	C,A	.	.	DP=29;ECNT=15;MBQ=34,34,31;MFRL=151,148,86;MMQ=60,60,60;MPOS=24,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.12,3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,5,2:0.197,0.096:28:13,2,0:7,3,2:15,6,5,2
chr3	75788068	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=21;MBQ=32,27;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,2:13,1:15,14,0,3
chr3	75788076	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=21;MBQ=30,33;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.408:31:9,8:9,5:8,10,6,7
chr3	75788088	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=21;MBQ=33,33;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.243:32:11,4:14,3:13,12,5,2
chr3	75788115	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=21;MBQ=30,32;MFRL=151,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:4,4:7,7:5,7,8,3
chr3	75788130	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=21;MBQ=32,31;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:12,0:13,4:19,10,4,0
chr3	75788150	.	A	AG	.	.	DP=48;ECNT=21;MBQ=32,32;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.163:47:23,1:15,6:24,16,6,1
chr3	75788152	.	T	G,C	.	.	DP=47;ECNT=21;MBQ=29,33,32;MFRL=158,186,186;MMQ=60,60,60;MPOS=18,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=51.39,20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,16,7:0.348,0.160:46:13,8,1:9,8,5:11,12,18,5
chr3	75788156	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=21;MBQ=33,28;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,6:0.143:46:22,0:16,5:0|1:75788156_C_T:75788156:24,16,3,3
chr3	75788158	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=21;MBQ=33,33;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.489:45:9,14:14,8:16,7,10,12
chr3	75788165	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=21;MBQ=33,34;MFRL=158,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,6:0.125:53:27,1:18,5:0|1:75788156_C_T:75788156:27,20,3,3
chr3	75788199	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=21;MBQ=31,32;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,11:0.203:57:22,3:22,8:25,21,7,4
chr3	75788217	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.087:55:19,4:30,0:30,21,1,3
chr3	75788226	.	CA	AG,GG	.	.	DP=57;ECNT=21;MBQ=33,33,33;MFRL=136,156,141;MMQ=60,60,60;MPOS=24,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=35.82,35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,11,11:0.219,0.214:52:13,2,8:17,9,3:21,9,10,12
chr3	75788245	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,6:0.137:49:12,4:29,2:26,17,1,5
chr3	75788258	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=21;MBQ=32,29;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,11:0.218:53:14,5:28,6:23,19,4,7
chr3	75788281	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=21;MBQ=31,30;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,19:0.389:52:14,6:19,12:13,20,9,10
chr3	75788291	.	AT	GA	.	.	DP=65;ECNT=21;MBQ=31,33;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,16:0.273:63:18,6:25,10:18,29,6,10
chr3	75788292	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=21;MBQ=31,30;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.251:43:16,3:17,6:11,22,5,5
chr3	75788294	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=21;MBQ=31,28;MFRL=139,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,7:0.119:64:23,2:31,5:19,38,5,2
chr3	75788314	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=21;MBQ=32,34;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,10:0.102:66:24,2:29,8:21,35,2,8
chr3	75788316	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=21;MBQ=34,32;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,13:0.215:63:16,6:33,7:16,34,6,7
chr3	75788366	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=118,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,15:0.291:53:12,5:26,10:12,26,3,12
chr3	75788376	.	G	C,GTT	.	.	DP=52;ECNT=6;MBQ=33,31,33;MFRL=115,121,110;MMQ=60,60,60;MPOS=12,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.55,18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,5,6:0.108,0.154:43:12,2,1:20,3,4:8,24,3,8
chr3	75788382	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=122,111;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,7:0.170:45:13,1:23,6:0|1:75788382_C_T:75788382:9,29,1,6
chr3	75788390	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=31,37;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,6:0.163:41:13,1:21,5:0|1:75788382_C_T:75788382:8,27,0,6
chr3	75788394	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.179:37:9,1:21,5:0|1:75788382_C_T:75788382:7,24,0,6
chr3	75788411	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.162:29:7,2:18,2:5,20,0,4
chr3	75788506	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75788506_GA_G:75788506:0,0,0,1
chr3	75788513	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75788506_GA_G:75788506:0,0,0,1
chr3	75790370	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:5,1:1,4:0|1:75790370_A_C:75790370:5,1,5,1
chr3	75790376	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=33,35;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:5,1:1,5:0|1:75790370_A_C:75790370:5,1,5,1
chr3	75790405	.	TG	AA,AC	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=32,32,31;MFRL=131,156,112;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.92,4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,3:0.192,0.154:21:9,2,1:5,2,1:10,4,6,1
chr3	75790406	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=131,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.465:19:8,4:2,5:7,3,5,4
chr3	75790409	.	TG	CT,CA	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=31,34,33;MFRL=131,156,112;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.91,33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,9:0.192,0.385:23:8,2,4:1,2,5:7,3,9,4
chr3	75790444	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=121,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:9,4:9,3:10,9,4,3
chr3	75790446	.	GG	TA	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=34,30;MFRL=129,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.414:27:7,5:7,5:0|1:75790446_GG_TA:75790446:10,6,4,7
chr3	75790466	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,11:0.444:25:7,6:7,5:0|1:75790446_GG_TA:75790446:7,7,3,8
chr3	75790479	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=9;MBQ=33,27;MFRL=124,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:11,3:15,3:9,17,3,3
chr3	75790513	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,16:0,15:0|1:75790513_T_C:75790513:0,0,11,20
chr3	75790527	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=120,85;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,12:0.416:29:9,2:8,10:0|1:75790513_T_C:75790513:7,10,4,8
chr3	75790537	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=112,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.127:29:11,1:14,2:0|1:75790513_T_C:75790513:9,17,1,2
chr3	75790542	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=7;MBQ=20,20;MFRL=108,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,14:0.522:27:8,2:4,12:0|1:75790513_T_C:75790513:6,7,5,9
chr3	75790583	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=123,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:0|1:75790513_T_C:75790513:2,3,1,4
chr3	75790585	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=26,34;MFRL=123,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,0:2,4:0|1:75790513_T_C:75790513:2,3,1,4
chr3	75790607	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=103,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:2,2:0,4:0|1:75790513_T_C:75790513:2,0,2,5
chr3	75790704	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=174,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,16:0.567:28:5,9:7,7:0|1:75790704_C_T:75790704:12,0,15,1
chr3	75790717	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,23:0.511:45:10,14:11,9:0|1:75790704_C_T:75790704:20,2,19,4
chr3	75790724	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=152,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,19:0.400:48:17,10:12,9:27,2,15,4
chr3	75790726	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=31,33;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,26:0.519:50:12,15:10,11:0|1:75790704_C_T:75790704:22,2,22,4
chr3	75790730	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=148,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,26:0.500:52:14,15:9,11:0|1:75790704_C_T:75790704:24,2,22,4
chr3	75790747	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=139,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=82.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,22:0.426:52:16,13:13,9:0|1:75790704_C_T:75790704:24,6,19,3
chr3	75790822	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=115,143;MMQ=40,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,33:0.752:43:3,15:5,10:7,3,17,16
chr3	77147112	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	77526805	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=167,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:0,13,0,2
chr3	77607070	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,2:2,1,4,1
chr3	77629232	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,0:13,2:11,11,1,1
chr3	77645946	.	CTT	C,CT	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=23,35,29;MFRL=115,151,166;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=13.20,14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,6,8:0.289,0.415:20:4,4,5:2,2,3:1,5,0,14
chr3	77645954	.	T	TTTTTTC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=156,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.144:18:10,2:6,0:0|1:77645954_T_TTTTTTC:77645954:0,16,1,1
chr3	77645960	.	G	GGC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=152,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.138:19:11,2:6,0:0|1:77645954_T_TTTTTTC:77645954:0,17,1,1
chr3	77645962	.	CCTTCCT	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:9,2:5,0:0|1:77645962_CCTTCCT_C:77645962:1,16,0,2
chr3	77645969	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:8,2:3,0:0|1:77645962_CCTTCCT_C:77645962:0,11,0,2
chr3	77651695	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,1:7,1:0,7,0,2
chr3	77666936	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr3	77684222	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:0,6,1,6
chr3	78656219	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=182,161;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:8,2:2,15,0,2
chr3	78666765	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,9,1
chr3	78676405	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr3	78676467	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,10:0,0,10,8
chr3	78706491	.	C	CGTTCCTTTCTAAAGACGGGG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=36,29;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.387:4:2,1:1,0:0|1:78706491_C_CGTTCCTTTCTAAAGACGGGG:78706491:0,3,0,1
chr3	78706494	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=184,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:78706491_C_CGTTCCTTTCTAAAGACGGGG:78706491:0,2,0,1
chr3	78706505	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=206,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:78706505_GA_G:78706505:0,2,0,1
chr3	78706509	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=206,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:78706505_GA_G:78706505:0,2,0,1
chr3	78706511	.	GT	AC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=206,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:78706505_GA_G:78706505:0,2,0,1
chr3	78706519	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	78708810	.	A	AATAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=AT;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:4,0,2,0
chr3	78709044	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	78717508	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.423:22:6,2:5,7:6,7,4,5
chr3	78737962	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=121,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,1:3,6:3,5,1,6
chr3	78796078	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.502:12:3,5:3,1:2,4,2,4
chr3	81548209	.	T	TAAG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.144:18:10,1:6,1:16,0,1,1
chr3	81699036	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,3:0.061:63:31,2:29,1:23,37,2,1
chr3	81810516	.	C	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,22:0.346:64:23,10:19,11:27,15,12,10
chr3	81810702	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=44.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr3	86010875	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:86010875_G_A:86010875:0,3,0,1
chr3	86010891	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:86010875_G_A:86010875:0,1,0,1
chr3	87303058	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	87313353	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=188,242;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr3	88042501	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:2,5:1,3:2,1,5,3
chr3	88042990	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.644:9:2,1:1,5:0,3,0,6
chr3	88188420	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=144.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,23:0,17:0,0,28,14
chr3	88199179	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,17,9
chr3	88199185	.	T	TC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=62.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,11:0,12:0,0,13,10
chr3	89157047	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=130,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	89157082	.	C	CCAGCTCTGACCATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.676:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	89176419	.	A	AGGATTGAATCATAGTTTTGTGCAATT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:4,2:6,0:2,9,0,2
chr3	89456555	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.395:18:6,2:4,4:2,9,3,4
chr3	89480265	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr3	89498619	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr3	89521602	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:3,2:7,3:7,3,2,3
chr3	89528461	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr3	89528477	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr3	93605126	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=103.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,20:0,8:0,0,27,2
chr3	93692435	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=141,122;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:22,3:14,0:33,3,3,0
chr3	93754080	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	93754277	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.171:25:6,0:8,0:9,12,0,4
chr3	93754281	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=22,23;MFRL=143,94;MMQ=60,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:5,1:6,0:9,15,0,2
chr3	93754286	.	GT	G,GTTT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,33,23;MFRL=130,200,94;MMQ=60,60,49;MPOS=26,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,18;RU=T;STR;TLOD=9.16,4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,5,2:0.342,0.120:16:3,4,1:5,1,0:3,6,1,6
chr3	93768420	.	GA	G,CA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=17,17,19;MFRL=156,145,154;MMQ=60,60,60;MPOS=23,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.37,4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,5,4:0.167,0.130:28:0,0,0:0,1,1:0,19,0,9
chr3	93813171	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,5,22
chr3	97367230	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:4,7:0,2:0,4,0,9
chr3	97467361	.	ATCTC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=130,31255322;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TC;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,0:3,2:3,1,2,0
chr3	97605460	.	AT	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,7:0.151:48:18,4:16,3:33,8,7,0
chr3	97605677	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,7:6,4:0,10,0,11
chr3	97611916	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=55.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.487:35:6,9:12,8:0,18,0,17
chr3	97619250	.	C	CAACTA	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=154.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,40:0.512:78:18,13:19,21:32,6,31,9
chr3	97660198	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,4:3,4:0,4,1,7
chr3	97666183	.	TCTC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=125,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTC;STR;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:6,5:7,2:10,3,7,0
chr3	97669543	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	97686127	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:9,2:9,0:13,6,0,2
chr3	97727727	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,4:1,0:2,0,3,1
chr3	97727753	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:1,3:2,3:3,1,4,2
chr3	97744611	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:0,3,0,5
chr3	97805929	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	97851475	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	97852229	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.407:39:16,6:7,8:6,17,9,7
chr3	97887495	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	97983487	.	TTGTAACCAC	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTAACCAC;STR;TLOD=106.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.968:24:0,10:0,14:0,0,9,15
chr3	98073591	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	98110406	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=56.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,11:0,9:0,0,13,9
chr3	98250862	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,5:5,5:9,5,5,5
chr3	98299707	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr3	98489670	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:12,2,2,0
chr3	98489686	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,8:4,1:7,2,7,2
chr3	98491619	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,4:3,6:8,2,9,1
chr3	98503941	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,2:7,2:0,9,0,4
chr3	98512610	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=124,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:2,4:4,1:1,6,2,3
chr3	98518160	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=271,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.710:5:1,3:0,0:1,0,4,0
chr3	98518217	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.340:7:3,2:0,0:5,0,2,0
chr3	98518339	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:8,9:4,8:6,6,8,9
chr3	98536571	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:5,0,5,1
chr3	98541012	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	98541422	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,5:7,5:11,0,10,0
chr3	98541633	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:5,7:8,4:1,12,0,11
chr3	98544123	.	CAA	C,CA	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=150,137,122;MMQ=60,60,60;MPOS=15,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=25.52,29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,17,17:0.372,0.436:42:3,7,8:3,7,9:7,1,32,2
chr3	99513418	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=130,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.160:35:13,5:17,0:15,15,4,1
chr3	99515002	.	A	ATTGTAGAGACCAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1,2,0,1
chr3	99567161	.	A	G	.	.	DP=114;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=121,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,3:0.036:106:54,2:47,1:63,40,3,0
chr3	99648965	.	CTCT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=255,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99648965_CTCT_C:99648965:0,1,0,1
chr3	99648973	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=255,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99648965_CTCT_C:99648965:0,1,0,1
chr3	99886662	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:8,5:8,7:5,11,5,7
chr3	100015146	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.457:44:16,9:8,11:3,21,2,18
chr3	100016726	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,1:5,2:13,3,3,0
chr3	100029381	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=131,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:17,0:20,2:17,20,0,2
chr3	100034849	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr3	100053684	.	C	CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	100086861	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,14:0,0,17,5
chr3	100092526	.	A	AG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=75.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.952:17:0,8:0,9:0|1:100092526_A_AG:100092526:0,0,0,17
chr3	100092528	.	T	TGCA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.950:17:0,8:0,9:0|1:100092526_A_AG:100092526:0,0,0,17
chr3	100174722	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=110.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,41:0.513:80:22,19:16,22:16,23,26,15
chr3	100238573	.	A	ATTT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100238573_A_ATTT:100238573:0,1,0,1
chr3	100238574	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100238573_A_ATTT:100238573:0,1,0,1
chr3	100238576	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:100238573_A_ATTT:100238573:0,2,0,1
chr3	100238579	.	T	TTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:100238573_A_ATTT:100238573:0,2,0,1
chr3	100354683	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr3	100354698	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr3	100368692	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr3	100387709	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	100432752	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=145,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,2:1,3:0,1,0,6
chr3	100432791	.	C	CACACATTTCTTCTAGACCTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	100438797	.	CT	C,CTT	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=143,157,176;MMQ=60,60,60;MPOS=16,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=15.59,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:65,12,5:0.146,0.061:82:32,6,3:31,6,2:61,4,16,1
chr3	100463651	.	TTG	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,6:0.122:53:19,4:18,2:35,12,5,1
chr3	100467018	.	T	C	.	.	DP=111;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=338.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,102:0.991:102:0,47:0,51:0,0,56,46
chr3	100471567	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=19,36;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr3	100511428	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:2,1:0|1:100511428_G_A:100511428:5,0,2,0
chr3	100511446	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:1,1:5,2:0|1:100511428_G_A:100511428:6,0,3,0
chr3	100515197	.	AT	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=49.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.550:44:11,13:9,11:16,4,20,4
chr3	100523771	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=185,82;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr3	100567592	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=128,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:3,6:6,9:9,0,14,1
chr3	100567799	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr3	100570787	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	100570801	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:100570801_A_AT:100570801:0,4,0,1
chr3	100570802	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:100570801_A_AT:100570801:0,4,0,1
chr3	100570809	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	100581261	.	ATT	A,AT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=16,31,31;MFRL=124,165,151;MMQ=60,60,60;MPOS=25,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=8.08,22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,5,11:0.240,0.509:21:0,3,1:2,2,9:1,4,3,13
chr3	100593659	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,1:5,10:8,0,11,0
chr3	100594326	.	CGGCATA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,3:5,4:7,5,7,0
chr3	100605206	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr3	100621426	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0,0,11,4
chr3	100949842	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,13:0,3:0,0,14,2
chr3	101039107	.	A	C	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=90.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,32:0.540:59:13,13:14,19:22,5,22,10
chr3	101046671	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,4:4,7:0,7,2,9
chr3	101051794	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.585:29:3,8:8,9:2,10,1,16
chr3	101060716	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=219,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	101066992	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	101070555	.	A	AT	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,4:0.069:67:28,2:33,2:13,50,0,4
chr3	101085208	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=109,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,3:4,4:4,0,7,0
chr3	101085683	.	TAAAAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=193,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,3;RU=A;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr3	101177901	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,2:3,3:0,4,1,6
chr3	101212889	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	101219818	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,7:4,4:7,0,11,0
chr3	101231829	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	101232093	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	101304414	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,7:5,4:0,13,0,11
chr3	101370505	.	TAAGCACTCAAATGGCTTAACTCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCATGTGTAGTGAGGTGC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=200,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	101373480	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,3:2,5:2,1,7,1
chr3	101383853	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,115;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:26,3:19,0:27,21,3,0
chr3	101399910	.	GA	G,GAA	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=33,34,35;MFRL=145,154,214;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=64.32,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,32,3:0.544,0.071:55:11,17,0:9,13,3:19,1,32,3
chr3	101404813	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=172,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:6,11:8,3:0,14,0,14
chr3	101443461	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr3	101504624	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	101573361	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,10;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.575:12:2,0:0,1:5,0,7,0
chr3	101574503	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr3	101575882	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:1,5:1,3:2,0,8,0
chr3	101576029	.	T	TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=159.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,14:0,13:0,0,16,20
chr3	101576373	.	T	TTAACGTTGCTCAGAAGTTGCTTCTATGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	101576404	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	105238890	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,14:0.684:20:0,7:6,5:0|1:105238890_CT_C:105238890:6,0,14,0
chr3	105238901	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.536:28:3,8:7,5:0|1:105238890_CT_C:105238890:11,2,14,1
chr3	105252377	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr3	105412286	.	C	CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=65.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr3	105421344	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=195,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,1,0
chr3	105423088	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,3:0,10:0,0,0,13
chr3	105438806	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	105452751	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	105453034	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr3	105455955	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,9:0,0,16,1
chr3	105470204	.	A	ATGTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TG;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:2,0:8,2:10,0,2,0
chr3	105470455	.	C	T	.	.	DP=118;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,3:0.034:114:39,3:68,0:29,82,1,2
chr3	105495432	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,3:0,14:0,0,1,16
chr3	105588069	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr3	107435472	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.163:41:19,2:16,4:15,20,2,4
chr3	107447857	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.575:12:3,6:2,1:0,5,1,6
chr3	107451907	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr3	107463456	.	TG	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=93.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,30:0.544:55:17,15:8,15:22,3,23,7
chr3	107491758	.	TAGA	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGA;STR;TLOD=104.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,28:0.518:54:12,14:12,14:13,13,7,21
chr3	107519843	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	107770938	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=78.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,0,22
chr3	107776511	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,1,16
chr3	107779796	.	T	TGCTAGACATAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=190,238;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	107882643	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=133.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,19:0,19:0,0,0,38
chr3	107884211	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,12:0,1:0,0,13,0
chr3	107885825	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=156,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,0:13,2:6,17,0,2
chr3	107885875	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,4:3,3:0,5,0,7
chr3	107910327	.	C	CT,CTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34,26;MFRL=0,140,95;MMQ=60,60,60;MPOS=22,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,17;RU=T;STR;TLOD=4.61,5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.449,0.449:4:0,2,1:0,0,0:0,0,3,1
chr3	107937286	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	107937360	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:9,2:1,8:10,0,10,0
chr3	107937571	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,5:4,1:1,9,0,6
chr3	107938240	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,3:7,7:9,2,9,1
chr3	108070556	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	108072243	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	108072704	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	108081217	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=106,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.675:22:2,7:4,7:4,3,10,5
chr3	108081247	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=115,113;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.297:31:11,5:10,3:7,15,1,8
chr3	108096227	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,4:0,12:0,0,0,16
chr3	108103433	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	108135606	.	TAA	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=59.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.962:23:0,9:0,13:0|1:108135606_TAA_T:108135606:0,0,21,2
chr3	108135609	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,22:0.921:23:0,9:1,13:0|1:108135606_TAA_T:108135606:1,0,20,2
chr3	108140148	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	108147295	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,5:0,0,12,2
chr3	108156633	.	A	AAAAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAG;STR;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr3	108158574	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr3	108172817	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,9,0
chr3	108174537	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=86.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,10:0,0,18,6
chr3	108179219	.	CAA	C,CA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,37,34;MFRL=166,122,139;MMQ=60,60,60;MPOS=15,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=6.72,33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,15:0.230,0.718:21:0,1,7:1,4,7:0,1,0,20
chr3	108189750	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr3	108211869	.	A	AAAGG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAGG;STR;TLOD=46.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,1:0,6:0,0,11,1
chr3	108211895	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=149,138;MMQ=60,55;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:7,3:21,0:26,3,3,0
chr3	108214537	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	108216807	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,7,0
chr3	108216956	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=135,29;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,2:12,0:9,15,1,1
chr3	108218413	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:11,0:11,8:2,20,0,8
chr3	108224685	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32,34;MFRL=164,65,151;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=A;STR;TLOD=3.05,7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,5:0.165,0.338:14:1,1,1:4,1,1:0,7,0,7
chr3	108272681	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=192,166;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108272681_C_CCT:108272681:0,2,0,1
chr3	108272682	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=192,166;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108272681_C_CCT:108272681:0,2,0,1
chr3	108272686	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=192,166;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:108272681_C_CCT:108272681:0,2,0,1
chr3	108276166	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.068:57:33,3:21,0:35,19,1,2
chr3	108285518	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=203,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,4:6,3:0,11,0,7
chr3	108295067	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,6:5,7:12,1,12,1
chr3	108308306	.	C	CATGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=193,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	108324362	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=222,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:108324362_G_C:108324362:0,2,0,1
chr3	108324365	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=222,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:108324362_G_C:108324362:0,2,0,1
chr3	108327050	.	T	TAAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=89.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,7:0,12:0,0,1,20
chr3	108344636	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:5,2:3,2:7,1,4,0
chr3	108347811	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=77,180;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	108355423	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=69.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,23,0
chr3	108355575	.	CTT	C,CT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=20,35,34;MFRL=99,157,147;MMQ=60,60,60;MPOS=27,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=7.70,47.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,21:0.166,0.710:30:1,4,6:2,1,14:1,3,2,24
chr3	108356501	.	T	TTTAAGGTAGTA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,8:0,1:0,0,0,11
chr3	108366978	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:6,9:5,3:1,11,0,12
chr3	108394771	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,1:4,5:0,6,0,7
chr3	108403019	.	TG	T,TGG,TGGG	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,28,30,30;MFRL=144,195,157,194;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,20,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=9,8,10,11;RU=G;STR;TLOD=5.26,11.21,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:13,3,6,2:0.137,0.251,0.105:24:4,2,3,1:8,0,2,1:12,1,9,2
chr3	108474524	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:5,0,3,1
chr3	108475974	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=124,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,2:6,6:8,5,7,1
chr3	108475993	.	G	GGGGGATTA	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=129,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGATTA;STR;TLOD=48.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.536:24:4,5:7,6:8,3,5,8
chr3	108565815	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr3	108635099	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=127,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,3:6,1:1,10,0,4
chr3	108639270	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=85.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,33:0.512:64:15,15:16,16:23,8,20,13
chr3	108705702	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,22:0.483:46:8,8:14,13:0|1:108705702_T_C:108705702:23,1,20,2
chr3	108705715	.	A	AT	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=161.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,49:0.911:53:1,21:3,25:0|1:108705702_T_C:108705702:4,0,46,3
chr3	108754320	.	T	TAA	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:2,3:0,0:0,3,0,3
chr3	108754336	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:5,1:0,0:0,5,0,1
chr3	108754340	.	G	GCTGTGAA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:4,1:0,0:0,5,0,1
chr3	108754346	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.664:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr3	108776343	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,12:0,0,7,17
chr3	108782158	.	T	TAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	108782160	.	T	C,TGTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29,31;MFRL=0,156,155;MMQ=60,60,60;MPOS=27,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.04,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr3	108788461	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,3:3,9:2,4,9,3
chr3	108833147	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,116;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr3	109027157	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr3	109027820	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr3	109056417	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=117,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.360:22:9,3:5,3:4,10,2,6
chr3	109129115	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=157,182;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.340:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr3	109129147	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=207,143;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109129147_T_C:109129147:0,1,0,1
chr3	109129149	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=207,143;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109129147_T_C:109129147:0,1,0,1
chr3	109129154	.	TCCAA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=207,143;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109129147_T_C:109129147:0,1,0,1
chr3	109129159	.	T	TCGGC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=207,143;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109129147_T_C:109129147:0,1,0,1
chr3	110791113	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	110837406	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=82,301;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:110837406_G_GAA:110837406:2,0,1,0
chr3	110837407	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=82,301;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:110837406_G_GAA:110837406:2,0,1,0
chr3	111260975	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr3	111261242	.	G	GCTGCTGAAATTGATCACCA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTGCTGAAATTGATCACCA;STR;TLOD=64.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.948:15:0,6:0,8:0,0,0,15
chr3	111312552	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=118,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.068:56:20,2:30,1:23,30,0,3
chr3	111632132	.	ACCCACTGACCT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,3:4,5:7,2,4,4
chr3	111637904	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=100.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,13:0,16:0,0,26,4
chr3	111638132	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0,0,0,15
chr3	111639353	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	111658290	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:2,1:1,2:3,0,2,2
chr3	111658486	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,2,11
chr3	111658514	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=147,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:2,2:1,5,1,5
chr3	111659377	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=142.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.957:44:1,24:0,17:1,0,31,12
chr3	111664064	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:8,9:7,6:10,5,13,2
chr3	111667883	.	TGCCACAGCTGTGCTGGCGAGCCA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,0:9,2:6,14,1,1
chr3	111685371	.	T	TGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=160,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=G;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr3	111685397	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:4,6:4,3:6,3,9,0
chr3	111685572	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,28:0.674:41:7,13:6,14:6,7,4,24
chr3	111685607	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,5:4,6:1,8,3,8
chr3	111686738	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr3	111705275	.	G	GTTTGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTGT;STR;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.491:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	111710201	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,5:1,3:5,0,8,0
chr3	111719605	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,6:3,3:7,3,7,2
chr3	111730546	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=71,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,2,0
chr3	111730591	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,5:6,3:7,1,6,2
chr3	111730766	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr3	111760771	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=175,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,2:2,1:7,0,3,0
chr3	111763278	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	111766559	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr3	111785208	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	111793316	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,4:1,5:0,6,0,9
chr3	111794365	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.675:22:2,4:4,11:1,6,1,14
chr3	111795976	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,29:0.556:52:13,20:9,8:11,12,13,16
chr3	111799809	.	T	A	.	.	DP=95;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,3:0.043:90:37,3:50,0:42,45,3,0
chr3	111799845	.	A	T	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=116,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=275.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,84:0.988:85:1,34:0,48:0,1,34,50
chr3	111805438	.	G	GT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=146.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,18:0,22:0,0,1,39
chr3	111831753	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:8,0:12,10,2,0
chr3	111851817	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr3	111851890	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.377:30:10,6:8,5:13,6,8,3
chr3	111860116	.	G	T	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=147.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,49:0.618:79:9,22:20,26:9,21,10,39
chr3	111860222	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=217,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:0,8,0,4
chr3	111873881	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=145,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:9,0:2,2:0|1:111873881_A_T:111873881:8,4,1,1
chr3	111873887	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=154,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:1,2:0|1:111873881_A_T:111873881:6,3,1,1
chr3	111873889	.	A	ATGTGGTCTTT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=161,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:0|1:111873881_A_T:111873881:6,2,1,1
chr3	111873890	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=161,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,0:1,1:0|1:111873881_A_T:111873881:6,2,1,1
chr3	111898613	.	T	TGACCACTCTAGGTACCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	111901099	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,14:0.277:52:25,10:13,4:15,23,3,11
chr3	111921010	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,7:2,3:7,0,10,0
chr3	111923047	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr3	111936200	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	111981696	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=215,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:0|1:111981696_CA_C:111981696:4,0,7,0
chr3	111981704	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=215,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:1,3:2,5:0|1:111981696_CA_C:111981696:4,0,8,0
chr3	111983197	.	C	T	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=98.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,35:0.461:76:15,18:26,17:4,37,6,29
chr3	111993691	.	TC	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:2,8:4,6:6,0,14,0
chr3	111993716	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=115.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,16:0,17:0,0,32,3
chr3	111996694	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=136,95;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.061:62:26,2:33,1:17,42,1,2
chr3	111996726	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=164,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:9,8:7,9:1,16,5,12
chr3	111996730	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:7,9:8,6:5,11,1,14
chr3	111997791	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=163,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr3	112052173	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	112068503	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:5,5:3,2:9,0,6,1
chr3	112184927	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,16:0,9:0,0,22,3
chr3	112253058	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.814:12:1,6:1,3:2,0,9,1
chr3	112253193	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.731:8:2,2:0,2:0,2,1,5
chr3	112253233	.	AAAG	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=131,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,1:2,2:0,7,0,3
chr3	112255525	.	GT	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,266;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr3	112267523	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,1,16
chr3	112280218	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	112289320	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr3	112289372	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,13:0,8:0,0,17,4
chr3	112301458	.	C	CCTTAGTAAT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,4:0,0,17,3
chr3	112324534	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:17,2:12,0:14,17,2,0
chr3	112338027	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr3	112538571	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=55.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,20,0
chr3	112647613	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr3	112666859	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=69,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:3,2,0,2
chr3	112709828	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,6,1
chr3	112719791	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=18,28;MFRL=107,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.446:9:1,1:0,3:1,4,2,2
chr3	112732286	.	T	TA	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=152,54;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.075:63:14,1:25,1:2,57,0,4
chr3	112732309	.	GTT	G,GT	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=15,30,15;MFRL=161,150,172;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=10.36,20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,18:0.237,0.640:28:0,0,2:1,4,5:0,3,0,25
chr3	112738307	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=259,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:112738307_C_G:112738307:3,0,1,0
chr3	112738309	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=259,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:1,0:0|1:112738307_C_G:112738307:3,0,1,0
chr3	112738318	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.900:7:0,4:0,3:0|1:112738307_C_G:112738307:0,0,6,1
chr3	112991196	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,0:0,0,6,0
chr3	112996932	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:8,0,3,0
chr3	112997141	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,4:8,2:0,12,1,5
chr3	112998090	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:4,5,6,2
chr3	112999611	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	113002184	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=170,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,0:10,0,2,0
chr3	113003273	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:2,6,4,4
chr3	113003595	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.506:18:4,4:4,5:8,1,8,1
chr3	113004421	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.682:13:1,4:2,5:3,1,4,5
chr3	113005753	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:0|1:113005753_T_A:113005753:1,5,1,4
chr3	113005754	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,5:0.452:11:2,2:4,2:1|0:113005753_T_A:113005753:1,5,1,4
chr3	113084964	.	AT	TC	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.074:52:21,0:26,3:19,30,0,3
chr3	113098296	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.090:53:26,4:21,0:24,25,4,0
chr3	113119301	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	113125966	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr3	113152596	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	113169372	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,0:1,0:1,7,0,2
chr3	113207968	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.440:5:1,1:2,1:0|1:113207968_CT_C:113207968:0,3,0,2
chr3	113207988	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=171,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1|0:113207968_CT_C:113207968:0,4,0,1
chr3	113207991	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,19;MFRL=171,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:1,0:1|0:113207968_CT_C:113207968:0,4,0,1
chr3	113222099	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=137,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.262:20:4,3:9,1:3,12,0,5
chr3	113323787	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=182,124;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,1:0,2,1,3
chr3	113323793	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=130,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr3	113325945	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,1:6,1:7,7,0,2
chr3	113327017	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=130,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:18,1:23,2:16,25,0,3
chr3	113376110	.	TTGC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TGC;STR;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.874:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr3	113377505	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=98,151;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.461:22:6,6:4,2:5,7,4,6
chr3	113442198	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,2,1
chr3	113464859	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=123,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:3,6,3,3
chr3	113497507	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.377:17:4,2:4,4:11,0,6,0
chr3	113508499	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.420:12:4,3:2,2:7,0,5,0
chr3	113522544	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=52.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.404:52:22,12:9,8:13,18,6,15
chr3	113557787	.	AGCC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	113595156	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=170.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,19:0,27:0,0,0,46
chr3	113619872	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,10:0,0,15,4
chr3	113628031	.	T	TCACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr3	113655096	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	113720624	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	113785085	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=130,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.114:50:17,2:27,2:31,14,4,1
chr3	113858350	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,15,7
chr3	113955725	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:15,2:16,0:17,15,1,1
chr3	114070427	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=181,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:4,8,2,0
chr3	118621294	.	T	TGGG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118621294_T_TGGG:118621294:0,0,1,0
chr3	118621299	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118621294_T_TGGG:118621294:0,0,1,0
chr3	118621304	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118621294_T_TGGG:118621294:0,0,1,0
chr3	118621308	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:118621294_T_TGGG:118621294:0,0,1,0
chr3	118624369	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=215,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:6,0,3,2
chr3	118865011	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr3	118866515	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	118870025	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=101,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,5:1,4:3,0,7,2
chr3	118870222	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=183,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	118906560	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,12;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr3	118906564	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=21,30;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:118906564_T_C:118906564:1,0,1,0
chr3	118906567	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=14,26;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:118906564_T_C:118906564:1,0,1,0
chr3	118906616	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=105,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.598:15:1,3:4,6:4,2,4,5
chr3	118906644	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:4,2:17,0:10,11,1,1
chr3	118909962	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,0,17
chr3	118909987	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr3	118922654	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:2,0,6,0
chr3	118931389	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0,0,16,5
chr3	118935278	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=166,74;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.401:6:2,0:2,2:0|1:118935278_C_T:118935278:0,4,1,1
chr3	118935286	.	CGCACAT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,74;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.466:5:0,0:2,2:0|1:118935278_C_T:118935278:0,3,1,1
chr3	118945614	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,4,1
chr3	119013928	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr3	119084331	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr3	119084334	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:119084334_G_A:119084334:0,3,0,1
chr3	119084338	.	T	TGAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:119084334_G_A:119084334:0,2,0,1
chr3	119120577	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=137,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:8,0,5,0
chr3	119128628	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=136.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,13:0,17:0|1:119128628_A_G:119128628:0,0,7,25
chr3	119128634	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=133.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,13:0,16:0|1:119128628_A_G:119128628:0,0,7,24
chr3	119128712	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.880:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	119133635	.	T	TGCTGGGCAATG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr3	119155605	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:11,3:3,5:11,3,4,5
chr3	119157000	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=249,86;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	119171280	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=128.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,24:0,16:0,0,29,13
chr3	119196334	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,0,3
chr3	119196366	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:1,1:0|1:119196366_C_A:119196366:0,2,0,1
chr3	119196368	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:119196366_C_A:119196366:0,2,0,1
chr3	119196370	.	G	GAGTAGGTTGCGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:119196366_C_A:119196366:0,2,0,1
chr3	119198873	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=121.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,15:0,19:0,0,26,10
chr3	119199099	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:1,0:0,4,0,2
chr3	119204063	.	CA	C,CAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34,34;MFRL=0,206,199;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=16.39,19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,8:0.446,0.502:15:0,1,4:0,6,4:0,0,15,0
chr3	119204311	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.313:26:10,5:8,2:0,18,0,8
chr3	119210328	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,2:14,0:24,2,2,0
chr3	119211230	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:10,1:13,1:15,9,2,0
chr3	119211384	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr3	119236017	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,4,0
chr3	119263770	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:9,2:3,4:1,11,0,6
chr3	119325907	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=129,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr3	119327604	.	GC	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:7,8:8,6:10,6,9,5
chr3	119328449	.	CAGGCTTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,3:3,3:1,5,0,6
chr3	119334986	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr3	119348345	.	A	ATT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.845:3:0,1:0,0:0,0,0,3
chr3	119361250	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:4,2:3,4:7,0,5,2
chr3	119373301	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=136,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:0,5:1,4:2,0,9,0
chr3	119373315	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,7:0,4:2,3,10,2
chr3	119394168	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=199,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:2,1:4,3:0,6,0,5
chr3	119459342	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=150,88;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:13,0,0,2
chr3	119501580	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr3	119501780	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:119501780_G_A:119501780:0,0,0,7
chr3	119501798	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:119501780_G_A:119501780:0,0,0,3
chr3	119529113	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr3	119531853	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119531853_G_C:119531853:0,0,0,1
chr3	119531856	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119531853_G_C:119531853:0,0,0,1
chr3	119531858	.	C	CAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119531853_G_C:119531853:0,0,0,1
chr3	119531860	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:119531853_G_C:119531853:0,0,0,1
chr3	119533733	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	119533773	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	119533910	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,3:0,11:0,0,4,10
chr3	119534153	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:3,1,2,0
chr3	119721171	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr3	119886548	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	119892121	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,4:1,3:6,0,6,1
chr3	119892413	.	A	AAGGTCAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=75,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:0,1:2,0:0|1:119892413_A_AAGGTCAAC:119892413:1,1,0,1
chr3	119892415	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=75,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:119892413_A_AAGGTCAAC:119892413:1,1,0,1
chr3	119900260	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	119904125	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr3	119904315	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	119905641	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,4:0,1:0,0,0,7
chr3	120067797	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr3	120130874	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,5:3,5:0,7,4,6
chr3	120130883	.	GACACACACACACACATACATGC	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:6,3:1,1:1,7,0,4
chr3	120130899	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr3	120134720	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,8:0,8:0,0,13,3
chr3	120134883	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr3	120169437	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	120169641	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=188,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	120369575	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:6,0,5,0
chr3	120371414	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,13,8
chr3	120389454	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,36;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.316:4:1,0:2,1:0|1:120389454_T_C:120389454:0,3,0,1
chr3	120389462	.	G	GCCCA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:120389454_T_C:120389454:0,3,0,1
chr3	120389463	.	G	GCCTGTGTTCTCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:120389454_T_C:120389454:0,3,0,1
chr3	120389466	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:120389454_T_C:120389454:0,2,0,1
chr3	120413158	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=145.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,21:0,21:0,0,1,41
chr3	120428621	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:5,7:10,5:12,3,10,2
chr3	120833993	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,14:0.577:24:6,8:4,6:0|1:120833993_C_T:120833993:0,10,0,14
chr3	120833994	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,9:0.387:23:8,4:6,3:1|0:120833993_C_T:120833993:0,14,0,9
chr3	120924764	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.355:41:15,5:10,9:22,4,12,3
chr3	120952606	.	T	TGTTTCCCTTTTTACTGCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.243:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chr3	120959427	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=173,147;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:0,10,0,2
chr3	121100116	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	121132268	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	121137304	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=127,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,2:0.042:69:27,1:36,0:38,29,1,1
chr3	121137976	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=64.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,9:0,0,10,12
chr3	121138015	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr3	121155198	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	121186543	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	121195302	.	TAC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=AC;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	121202131	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr3	121202433	.	TA	T,TAA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,29,31;MFRL=164,118,103;MMQ=60,60,60;MPOS=23,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=8.85,10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,9,9:0.336,0.399:23:2,6,4:2,3,4:1,4,4,14
chr3	121206883	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,230;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,2:11,0:10,13,0,2
chr3	121207637	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.508:47:12,14:11,9:12,11,14,10
chr3	121212277	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr3	121228833	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr3	121239027	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	121241058	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr3	121263720	.	C	A	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=272.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,83:0.988:83:0,43:0,39:0,0,36,47
chr3	121339354	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,8:0,0,12,3
chr3	121339520	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr3	121351338	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:2,1:4,4:3,3,3,3
chr3	121351498	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121351498_C_A:121351498:0,0,1,0
chr3	121351502	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:121351498_C_A:121351498:0,0,1,0
chr3	121353254	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr3	121353291	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr3	121377298	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=203,98;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,1:4,1:0,6,0,2
chr3	121448675	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,2:2,3:10,0,4,1
chr3	121507371	.	CTTTTTA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=168,230;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr3	121508830	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr3	121514458	.	TAA	T,TA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,31,31;MFRL=0,197,150;MMQ=60,60,60;MPOS=16,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=7.06,31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,15:0.251,0.712:21:0,3,8:0,3,6:0,0,2,19
chr3	121526099	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=48.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr3	121526381	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:0,7,0,4
chr3	121527903	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=161,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.260:13:2,0:4,2:0,10,0,3
chr3	121545030	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:8,1:1,11,0,2
chr3	121547527	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.470:34:6,9:12,6:2,16,2,14
chr3	121563271	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,2:3,4:10,0,6,0
chr3	121563285	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.481:23:7,6:5,5:12,0,9,2
chr3	121576063	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,0:9,2:0,24,0,2
chr3	121630328	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr3	121634171	.	A	AT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=115,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:5,6:4,4:2,7,3,7
chr3	121634410	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.491:22:6,4:5,5:9,2,8,3
chr3	121641821	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:5,1,2,2
chr3	121643143	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=115,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.460:13:5,3:2,3:7,0,6,0
chr3	121643170	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=115,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:3,4:7,5:10,1,9,0
chr3	121643303	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:2,4:6,7:1,8,2,9
chr3	121643337	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=175,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr3	121643699	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=1623,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,3:1,3:0,1,6,0
chr3	121643893	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:3,5:7,12:2,9,3,14
chr3	121646495	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=167,165;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:121646495_C_T:121646495:1,0,3,0
chr3	121646500	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=165,138;MMQ=60,30;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:121646495_C_T:121646495:3,0,1,0
chr3	121646503	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=139,138;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:121646495_C_T:121646495:4,0,1,0
chr3	121646506	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=139,138;MMQ=60,30;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:121646495_C_T:121646495:4,0,1,0
chr3	121647467	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=116,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr3	121647782	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,4:5,2:5,0,5,1
chr3	121659197	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=175,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:0,3:1,3:2,0,5,1
chr3	121720514	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	121810427	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=65.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,15:0,8:0,0,18,6
chr3	121836966	.	TGA	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GA;STR;TLOD=139.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.976:35:0,9:0,25:0,0,8,27
chr3	121976253	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr3	121981345	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	122000871	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	122086960	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,4:8,5:10,2,9,0
chr3	122087178	.	A	AGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:122087178_A_AGG:122087178:1,1,0,1
chr3	122087179	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:122087178_A_AGG:122087178:1,1,0,1
chr3	122128519	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,2:1,3:5,0,6,0
chr3	122134889	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,7:7,2:1,10,0,9
chr3	122145810	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,9:0,0,17,0
chr3	122146299	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	122168341	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,8:6,2:10,1,10,0
chr3	122247606	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.661:19:3,4:3,7:1,5,3,10
chr3	122259782	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,159;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:6,5:0,1:0,6,0,7
chr3	122259797	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,188;MMQ=59,35;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:8,2:0,0:0,8,0,2
chr3	122269380	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,0:3,4:4,0,4,1
chr3	122437834	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=105.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,13:0,0,3,27
chr3	122471407	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.695:25:6,11:1,4:7,1,14,3
chr3	122474284	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.287:15:3,1:4,2:0|1:122474284_TA_T:122474284:4,7,0,4
chr3	122474305	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0|1:122474284_TA_T:122474284:0,0,4,15
chr3	122478032	.	C	CCACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=0,51;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=CA;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.506:4:1,0:1,1:2,0,1,1
chr3	122512624	.	C	CTTTGAATTCACGTTCATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=225,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	122512631	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	122629589	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=170,192;MMQ=50,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,2:1,8:1,0,10,0
chr3	122631270	.	C	CCATTAGGCCAAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr3	122632063	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,389;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	122642401	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	122642415	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=198,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr3	122642590	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,2:0,16:0,0,5,13
chr3	122680171	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0,8,1,2
chr3	122807995	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:4,1,6,0
chr3	122811187	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:6,1:7,3:13,0,4,0
chr3	122821385	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr3	122821478	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	122821671	.	AT	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,13:0,11:0,0,6,19
chr3	122829929	.	CGGG	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122829929_CGGG_C:122829929:0,0,0,1
chr3	122829940	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122829929_CGGG_C:122829929:0,0,0,1
chr3	122829942	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:122829929_CGGG_C:122829929:0,0,0,1
chr3	122843212	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:3,3:3,4:3,3,3,5
chr3	122864396	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=111,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:5,2:6,0:6,6,1,1
chr3	122865136	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=73,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:1,2:1,2,0,2
chr3	122873923	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr3	122880118	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=196,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:4,0,3,1
chr3	123010276	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,9:4,2:3,9,1,10
chr3	123014877	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	123015094	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	123018963	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,5:0,2:0,0,8,0
chr3	123021838	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	123021870	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=211,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:5,2,2,2
chr3	123021975	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,0:11,2:16,9,1,1
chr3	123037047	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	123039685	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=166,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	123046554	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=124,120;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:11,2:17,0:18,10,2,0
chr3	123047478	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,8:0,0:0,0,8,1
chr3	123047594	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,2:7,0:7,11,1,1
chr3	123047666	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr3	123049707	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,12:0,5:0,0,14,6
chr3	123049938	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chr3	123066555	.	A	AAAGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGG;STR;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr3	123301242	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:8,8:8,5:0,16,0,13
chr3	123303821	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,6:6,5:0,11,0,11
chr3	123337414	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:4,0,5,1
chr3	123338955	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=227,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123338955_AT_A:123338955:1,0,1,0
chr3	123338967	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:2,0:0|1:123338955_AT_A:123338955:3,0,1,0
chr3	123440967	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=86.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,10:0,15:0,0,19,10
chr3	123441179	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr3	123451773	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,8:0,15:0,0,14,9
chr3	123456432	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	123457711	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,7:0,0,12,1
chr3	123458705	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:4,1,1,1
chr3	123458913	.	A	AAATAAAACTCAACATATAAGCATGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:123458913_A_AAATAAAACTCAACATATAAGCATGT:123458913:0,4,0,1
chr3	123458916	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=161,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:123458913_A_AAATAAAACTCAACATATAAGCATGT:123458913:0,4,0,1
chr3	123471459	.	T	TTGTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	123633612	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,13,3
chr3	123650432	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:1,3:0,7,0,7
chr3	123650447	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=231,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,6:1,3:0,1,0,10
chr3	123650452	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr3	123652476	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr3	123665823	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=145,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.083:45:25,3:17,0:26,16,2,1
chr3	123666192	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=173,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr3	123674879	.	TA	T,TAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31,33;MFRL=154,171,181;MMQ=60,60,60;MPOS=24,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.65,7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,3,6:0.113,0.192:31:11,2,4:11,1,1:16,6,5,4
chr3	124044949	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:4,2:7,10:6,6,9,3
chr3	124113929	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,6:0,10:0,0,14,2
chr3	124132263	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr3	124132568	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	124195987	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr3	124209748	.	G	GCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=233,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr3	124209795	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	124281604	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=192,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr3	124281980	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,0:3,2:0,5,0,3
chr3	124303786	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,2,9
chr3	124351542	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,1:5,1:2,13,0,2
chr3	124352868	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,0,4
chr3	124369640	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=248,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,6:1,8:1,0,11,5
chr3	124378386	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	124380793	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,7,15
chr3	124390796	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:7,8:3,5:1,10,2,11
chr3	124393490	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.412:17:4,3:6,3:2,8,3,4
chr3	124397249	.	A	ATTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=227,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,16;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	124416592	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=136,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:9,2:5,16,0,2
chr3	124418846	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=129,140;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.700:14:1,7:2,2:1,3,3,7
chr3	124458816	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr3	124492734	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,6:8,6:5,9,5,7
chr3	124629222	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=224,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.711:8:1,3:1,3:2,0,3,3
chr3	124646705	.	A	AAAG	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=174.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,17:0,20:0,0,5,36
chr3	124692785	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr3	124696807	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=150,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:1,2:3,3:0,4,1,4
chr3	124709728	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=155,119;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:14,2:13,2:11,17,1,3
chr3	124721245	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,3:1,1:0,2,0,5
chr3	124728472	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:4,0,6,0
chr3	124728626	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,180;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,6:6,2:5,5,3,5
chr3	124729193	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr3	124732842	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=193,225;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	124746049	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,148;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr3	124802677	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr3	124854425	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr3	124896861	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,5:0,3:0,0,2,7
chr3	124951171	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.861:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr3	124998098	.	C	CA,CAAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,37,21;MFRL=0,184,137;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.83,49.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,17:0.132,0.832:19:0,0,6:0,2,7:0,0,4,15
chr3	125179732	.	C	CATAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr3	125188265	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,3:12,0:16,6,3,0
chr3	125223456	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=107.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,19,12
chr3	125238792	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.694:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	125250610	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	125270985	.	GTATA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TA;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	125297715	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr3	125301711	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=162.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,14:0,31:0,0,40,6
chr3	125651602	.	CT	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,147;MMQ=60,45;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.114:37:13,2:14,2:3,30,0,4
chr3	125695953	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=239,195;MMQ=27,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr3	125769757	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=172,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,1:2,4:2,3,4,1
chr3	125775428	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,2:0,5,0,5
chr3	125786695	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=104,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:3,2:0,4:4,0,6,0
chr3	125786760	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=167,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:6,0,3,0
chr3	125825978	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=105,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,5:3,4:3,2,5,4
chr3	125831572	.	GGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,2:0,1,3,0
chr3	125843400	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,1:1,3,0,3
chr3	125849031	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=154,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.596:15:0,4:5,5:5,1,7,2
chr3	125849224	.	G	GCCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	125849238	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	125850169	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=271,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr3	125850193	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,5,0
chr3	125850381	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:0,6,0,4
chr3	125850434	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=199,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr3	125850454	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=220,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:125850454_A_C:125850454:0,4,0,1
chr3	125850457	.	GA	TT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=220,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:125850454_A_C:125850454:0,4,0,1
chr3	125872384	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=94,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,3:0,3:3,0,4,2
chr3	125874388	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	126070619	.	A	AGCCAGGGAAAGTACATTTGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=213,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:2,2:0,0:2,0,1,1
chr3	126126168	.	C	CCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=186,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:126126168_C_CCAA:126126168:0,1,0,1
chr3	126126169	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=186,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:126126168_C_CCAA:126126168:0,1,0,1
chr3	126126172	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=186,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:126126168_C_CCAA:126126168:0,1,0,1
chr3	126137556	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,3:5,0:4,6,1,2
chr3	126137881	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,9;MFRL=21433,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.551:5:1,0:0,0:0,2,3,0
chr3	126138778	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr3	126139084	.	CG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:0,4,0,3
chr3	126142496	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:0,4,0,8
chr3	126178390	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr3	126184941	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:6,0,5,1
chr3	126185238	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=36,32;MFRL=91,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:126185238_C_T:126185238:0,1,0,2
chr3	126185245	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,35;MFRL=174,91;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:126185238_C_T:126185238:0,2,0,1
chr3	126185250	.	AA	TT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,34;MFRL=174,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:126185238_C_T:126185238:0,2,0,1
chr3	126185255	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,33;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:126185238_C_T:126185238:0,1,0,1
chr3	126185258	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:126185238_C_T:126185238:0,1,0,1
chr3	126185265	.	A	AGGATCAC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,31;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:126185238_C_T:126185238:0,1,0,1
chr3	126185268	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1|0:126185238_C_T:126185238:0,1,0,1
chr3	126189919	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=124,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1,3,1,3
chr3	126207222	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	126218159	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.454:29:5,2:9,10:14,2,10,3
chr3	126219030	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr3	126219086	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr3	126219750	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=208,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:126219750_A_C:126219750:0,4,0,1
chr3	126219752	.	ACACAGCCTGGGC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=208,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:126219750_A_C:126219750:0,4,0,1
chr3	126219973	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr3	126224480	.	A	AAGGG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AGGG;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,1:2,0,3,0
chr3	126226518	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr3	126227185	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr3	126228410	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,9,4
chr3	126236348	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr3	126260888	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=207,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr3	126268953	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,1,17
chr3	126270757	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	126271038	.	A	AGCACC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=169,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	126449533	.	A	ATCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,16;MFRL=122,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:1,3,0,1
chr3	126571646	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=156,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:126571646_T_A:126571646:0,3,0,1
chr3	126571649	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=156,109;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:126571646_T_A:126571646:0,3,0,1
chr3	126633419	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,7,0
chr3	126723588	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:126723588_G_C:126723588:1,3,0,1
chr3	126723591	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:126723588_G_C:126723588:1,3,0,1
chr3	126724881	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	126739012	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	126741478	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	126746973	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=176,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,1:0|1:126746973_A_C:126746973:0,9,2,0
chr3	126746980	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=176,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:8,0:0|1:126746973_A_C:126746973:0,13,2,0
chr3	126749229	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:1,18,0,2
chr3	126749334	.	T	TGGGCAAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=214,254;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	126751689	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr3	127298770	.	CT	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,19;MFRL=104,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:127298770_CT_GG:127298770:0,2,1,0
chr3	127298779	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:127298770_CT_GG:127298770:0,1,1,0
chr3	127298781	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:127298770_CT_GG:127298770:0,1,1,0
chr3	127335861	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:6,6,1,1
chr3	127336934	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,15:0,5:0,0,7,13
chr3	127339646	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,0:15,2:12,18,0,2
chr3	127390189	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:127390189_A_C:127390189:0,0,1,0
chr3	127390191	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=94,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.529:2:0,0:0,0:0|1:127390189_A_C:127390189:1,0,1,0
chr3	127390195	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=16,12;MFRL=94,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.533:2:0,0:0,0:0|1:127390189_A_C:127390189:1,0,1,0
chr3	127396220	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	127682211	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,85;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:8,0:13,2:10,11,0,2
chr3	127800297	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:4,0:9,2:2,12,0,2
chr3	127983495	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,13,10
chr3	128182997	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	128204919	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:6,1:12,0,0,2
chr3	128292060	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0|1:128292060_G_A:128292060:0,0,6,1
chr3	128292082	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=103,141;MMQ=60,55;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:4,0:0|1:128292060_G_A:128292060:5,7,2,0
chr3	128292318	.	ATC	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:7,2:12,1:9,12,2,1
chr3	128348735	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,17,0
chr3	128351054	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	128351078	.	ACAACCTATATATCAG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=202,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr3	128598469	.	CGT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=176,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GT;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	128614133	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:2,3:6,2:6,3,4,2
chr3	128614185	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:10,6:5,0:9,6,2,4
chr3	128618366	.	GGTGTGTGTGTGTGT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=13,23;MFRL=306,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=20,13;RU=GT;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.512:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr3	128624880	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr3	128627753	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,0:3,2:3,2,2,0
chr3	128628877	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,107;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:23,3:23,0:34,14,3,0
chr3	128720466	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	128721050	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	128753132	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:0|1:128753132_A_G:128753132:5,12,1,1
chr3	128753139	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=142,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:10,0:0|1:128753132_A_G:128753132:5,13,1,1
chr3	128755814	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr3	128755953	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr3	128755971	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	128757560	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr3	128758786	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.470:4:0,1:2,0:0|1:128758786_C_CCA:128758786:0,3,0,1
chr3	128758788	.	G	GCCCTATCCCTGCAGCCCCTCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=230,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.485:3:0,0:1,0:0|1:128758786_C_CCA:128758786:0,2,0,1
chr3	128780492	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:3,1,2,0
chr3	128781258	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.858:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr3	128840034	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,10:0,0,19,0
chr3	128853622	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr3	128859202	.	C	CTTAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=68.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,12,4
chr3	128864520	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:128864520_C_G:128864520:0,0,8,0
chr3	128864540	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:128864520_C_G:128864520:0,0,10,0
chr3	128877521	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	128974022	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=221,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:1,1:0,3,0,3
chr3	128979692	.	GAGCTCTGTCCCTGCTCT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0,4,0,1
chr3	128984587	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=168,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:4,3:10,0:8,9,1,2
chr3	129020778	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:1,4:4,2:5,1,6,0
chr3	129120743	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr3	129123335	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:129123335_T_TC:129123335:0,3,0,1
chr3	129123337	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:129123335_T_TC:129123335:0,3,0,1
chr3	129123340	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:129123335_T_TC:129123335:0,3,0,1
chr3	129137025	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	129151927	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,19,5
chr3	129152144	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr3	129153036	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,1,17
chr3	129156536	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,12:0,7:0,0,17,3
chr3	129168854	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=120,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.795:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr3	129177346	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	129179623	.	C	CTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	129185641	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	129185661	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr3	129185924	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr3	129188325	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr3	129197108	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.904:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr3	129202316	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=93,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=154.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,46:0.924:49:3,23:0,23:2,1,33,13
chr3	129207309	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,12:0,0,0,19
chr3	129210977	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,9,6
chr3	129214511	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	129218944	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=71.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,4,17
chr3	129234259	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	129247551	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	129251263	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,0:0,0,0,4
chr3	129251268	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=122,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.661:4:1,1:0,0:0,1,0,3
chr3	129251273	.	G	GAGCTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=184,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr3	129251275	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=13,12;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:0,1:0,0:0,2,0,3
chr3	129252604	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr3	129266162	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr3	129275403	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,18,1
chr3	129275619	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	129275644	.	GAA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=275,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	129277458	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=78,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:129277458_G_T:129277458:0,4,0,1
chr3	129277460	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,16;MFRL=78,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:129277458_G_T:129277458:0,4,0,1
chr3	129277481	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	129278446	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	129279570	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,19:0,21:0,0,23,18
chr3	129279597	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,19:0,16:0,0,15,20
chr3	129281866	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr3	129282137	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	129284415	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr3	129284637	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr3	129286531	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,12:0,0,10,14
chr3	129289831	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,10:0,0,9,13
chr3	129290187	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,3,6
chr3	129290322	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=21,10;MFRL=192,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.286:11:3,0:3,0:0|1:129290322_T_G:129290322:5,3,3,0
chr3	129290326	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=200,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.632:14:1,1:2,1:0|1:129290322_T_G:129290322:3,2,8,1
chr3	129291621	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:6,2:9,0:7,11,0,2
chr3	129294456	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,5,11
chr3	129294503	.	G	GACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0|1:129294503_G_GACA:129294503:1,1,0,1
chr3	129294506	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:129294503_G_GACA:129294503:1,1,0,1
chr3	129303090	.	G	GGAATGGATCGGAATGGAATCCAATGGAATCCACT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=170,101;MMQ=60,30;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,0:3,1:1,4,0,1
chr3	129303197	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr3	129303436	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,3:1,3:0,4,0,6
chr3	129308096	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=215,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr3	129308149	.	A	AGCCG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,0:0,1:0|1:129308149_A_AGCCG:129308149:0,0,3,0
chr3	129308153	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:129308149_A_AGCCG:129308149:0,1,1,0
chr3	129308157	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=110,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,1:0|1:129308149_A_AGCCG:129308149:0,4,1,0
chr3	129308163	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=110,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:129308149_A_AGCCG:129308149:0,4,1,0
chr3	129308383	.	C	CCCAATCCCTTAGGGAGGAAGCAGCCTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=193,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.289:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr3	129694934	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,4:0,11:0,0,1,15
chr3	129800783	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=122,156;MMQ=53,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:12,6:6,5:16,2,8,3
chr3	129800888	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=145,160;MMQ=52,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,10:0.324:32:11,3:11,7:0|1:129800888_G_A:129800888:8,14,8,2
chr3	129800895	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=131,160;MMQ=50,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,12:0.406:30:8,3:8,8:0|1:129800888_G_A:129800888:8,10,8,4
chr3	129800934	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=154,160;MMQ=49,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:5,3:6,4:0|1:129800934_C_G:129800934:2,9,0,8
chr3	129800938	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=156,160;MMQ=51,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:3,3:6,5:0|1:129800934_C_G:129800934:2,8,0,8
chr3	129801012	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=170,205;MMQ=51,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr3	129811073	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.426:31:7,5:10,8:0,18,0,13
chr3	129811872	.	GAAAAAA	G,GAA	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=34,34,35;MFRL=145,107,145;MMQ=52,57,55;MPOS=18,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=25,19,21;RU=A;STR;TLOD=3.65,4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,3,5:0.116,0.209:28:8,3,4:11,0,1:19,1,8,0
chr3	129811897	.	ATT	A	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=134,155;MMQ=50,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,13:0.221:54:20,3:10,5:0|1:129811897_ATT_A:129811897:33,8,13,0
chr3	129811902	.	ATC	A	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=134,155;MMQ=47,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,13:0.190:62:23,1:16,5:0|1:129811897_ATT_A:129811897:35,14,13,0
chr3	129811906	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=134,155;MMQ=47,53;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,13:0.190:62:23,1:19,3:0|1:129811897_ATT_A:129811897:35,14,13,0
chr3	129814847	.	CG	C	.	.	DP=42;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=138,146;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.398:33:10,6:9,7:13,7,11,2
chr3	129814862	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=146,138;MMQ=50,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,26:0.600:43:7,13:8,13:10,7,15,11
chr3	129814863	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=135,146;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,18:0.404:45:13,7:13,9:0|1:129814863_G_A:129814863:15,12,11,7
chr3	129814869	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=135,150;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=70.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,20:0.437:46:13,9:13,9:0|1:129814863_G_A:129814863:14,12,13,7
chr3	129814934	.	GC	G	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=52.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.488:41:11,11:10,8:8,13,7,13
chr3	129814960	.	G	GCCTTGATGCCTCT	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=146,148;MMQ=43,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.097:28:8,2:18,0:6,20,0,2
chr3	129815930	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=177,144;MMQ=60,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,6:4,2:9,0,8,0
chr3	129815971	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:8,5:3,5:7,4,6,4
chr3	129816169	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	130098687	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,0:16,2:8,18,1,1
chr3	130110650	.	A	ACAGG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=239,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130110650_A_ACAGG:130110650:0,1,0,1
chr3	130110652	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=239,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130110650_A_ACAGG:130110650:0,1,0,1
chr3	130110655	.	T	TATA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=239,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130110650_A_ACAGG:130110650:0,1,0,1
chr3	130110659	.	T	TGTGGGA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=239,197;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130110650_A_ACAGG:130110650:0,1,0,1
chr3	130114408	.	AC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=64.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,0,18
chr3	130117052	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=230,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:130117052_G_A:130117052:0,2,0,1
chr3	130117054	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=230,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:130117052_G_A:130117052:0,2,0,1
chr3	130117056	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=230,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:130117052_G_A:130117052:0,2,0,1
chr3	130122409	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,14,2
chr3	130122572	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:7,1:0,17,0,2
chr3	130132302	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:130132302_T_A:130132302:0,0,4,0
chr3	130132304	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:130132302_T_A:130132302:0,0,4,0
chr3	130132509	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr3	130132851	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr3	130134492	.	T	C	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=266.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,76:0.987:76:0,33:0,41:0,0,41,35
chr3	130135575	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=132.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,19:0,19:0,0,31,7
chr3	130135588	.	AT	A	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:21,2:20,1:26,15,2,1
chr3	130137866	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=36.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr3	130142587	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	130144984	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=108.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,19:0,11:0,0,25,5
chr3	130150874	.	G	GAAAATTATGGATTTGAGAAACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130150874_G_GAAAATTATGGATTTGAGAAACAC:130150874:0,1,0,1
chr3	130150877	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:130150874_G_GAAAATTATGGATTTGAGAAACAC:130150874:0,1,0,1
chr3	130158343	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,9,5
chr3	130203024	.	A	AAAACGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0|1:130203024_A_AAAACGC:130203024:0,0,0,1
chr3	130203027	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:130203024_A_AAAACGC:130203024:0,0,0,1
chr3	130286886	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,14:0,0,18,4
chr3	130289617	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	130313017	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	130313219	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.509:43:9,10:12,11:5,16,4,18
chr3	130317341	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,3,10
chr3	130327712	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:12,3:12,0:17,8,3,0
chr3	130360600	.	TA	T,TAA	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=31,30,30;MFRL=161,125,133;MMQ=60,60,60;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=10.05,10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,9,8:0.192,0.185:43:8,4,7:13,2,1:2,24,5,12
chr3	130399509	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=125,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.102:57:27,1:24,4:31,21,4,1
chr3	130447530	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,10;MFRL=152,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,0:3,0:0,15,0,3
chr3	130463445	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:10,0:15,6,2,0
chr3	130660392	.	AT	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:20,2:10,1:28,4,3,0
chr3	130674022	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,1:0,7:0,0,0,9
chr3	130733046	.	CT	C,CTT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30,33;MFRL=118,184,144;MMQ=60,60,60;MPOS=7,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=8.45,4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,7,3:0.263,0.152:24:5,4,1:8,3,1:6,8,7,3
chr3	130737632	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	130748733	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,5:1,0:0,3,0,5
chr3	130828790	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=112.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,36:0.949:37:1,16:0,19:0,1,6,30
chr3	130881409	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=105.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,15:0,0,3,26
chr3	131186893	.	CA	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:11,6:14,1:26,0,7,0
chr3	131186907	.	GA	G	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,14:0.358:40:11,4:6,3:24,2,14,0
chr3	131217208	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr3	131261662	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,1:0,2:0,0,0,8
chr3	131404826	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:1,6:6,9:0,7,0,15
chr3	131415307	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=119,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:9,1,2,0
chr3	131418719	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:4,6:1,5:4,1,9,2
chr3	131624097	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=119,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.436:19:8,4:1,4:6,5,7,1
chr3	132063914	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr3	132063977	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	132068876	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	132068925	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	132075472	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr3	132075707	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr3	132075743	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,3:1,2:0,2,1,4
chr3	132075746	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr3	132075759	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr3	132086625	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=123,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:8,8,2,0
chr3	132166148	.	AT	A	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,10:0.154:66:33,5:22,5:49,7,10,0
chr3	132169705	.	T	TA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.544:20:3,4:6,7:0,9,0,11
chr3	132173004	.	AT	A	.	.	DP=107;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,13:0.165:72:17,2:23,8:15,44,4,9
chr3	132176310	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr3	132179072	.	GT	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,24:0.470:51:14,8:9,15:23,4,20,4
chr3	132179280	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=18,30,17,15;MFRL=188,209,165,163;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,20,10;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.50,13.61,4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,3,8,3:0.138,0.343,0.162:22:1,1,0,0:3,1,2,0:1,7,0,14
chr3	132186187	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,10:5,4:1,7,1,13
chr3	132196816	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,8:0,8:0,0,12,7
chr3	132197995	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=179,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr3	132198097	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=111,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,5:7,3:7,7,4,4
chr3	132198156	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=120,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,4:5,6:2,7,2,8
chr3	132202449	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,3:5,4:1,10,1,6
chr3	132217957	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:1,5:5,5:5,1,7,3
chr3	132219554	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,8:3,4:8,0,12,0
chr3	132221076	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=169,155,147;MMQ=60,60,60;MPOS=10,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=T;STR;TLOD=11.41,6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,4:0.335,0.370:11:2,3,3:1,1,1:3,0,8,0
chr3	132224128	.	G	A	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=122.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,42:0.458:92:26,19:24,23:31,19,29,13
chr3	132244406	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr3	132247160	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:2,5,4,5
chr3	132250027	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=224,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr3	132320802	.	T	TA	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=106,141;MMQ=39,27;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=196.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,82:0.956:87:4,36:1,45:3,2,45,37
chr3	132322262	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=122,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr3	132345482	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	132345723	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=198,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr3	132345739	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr3	132345762	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,1307;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	132347311	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr3	132363786	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr3	132394556	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=175.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,32:0,16:0,0,21,28
chr3	132394784	.	A	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=105.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,38:0.470:81:19,17:24,21:8,35,10,28
chr3	132401600	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,29:0.411:71:16,17:26,12:22,20,15,14
chr3	132402424	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=182,24;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,0:8,3:0,12,1,2
chr3	132407481	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:8,3:4,2:10,2,5,0
chr3	132413887	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=196,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr3	132423164	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:12,2:20,1:15,18,2,1
chr3	132434156	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr3	132438747	.	CAT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.578:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr3	133108978	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr3	133114858	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:14,2:9,0:9,15,0,2
chr3	133114893	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0,0,3,15
chr3	133185834	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:6,4:8,4:0,14,0,8
chr3	133191453	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=113.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,18:0,0,1,30
chr3	133331163	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=199,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr3	133335787	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:1,5,0,3
chr3	133335960	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,3:4,5:8,1,8,0
chr3	133335977	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:8,1,9,0
chr3	133343047	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=136,174;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:6,2:1,4:0|1:133343047_T_C:133343047:0,7,0,6
chr3	133343050	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=136,174;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:6,2:1,4:0|1:133343047_T_C:133343047:0,7,0,6
chr3	133347604	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.389:34:10,2:8,10:1,20,4,9
chr3	133356790	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.702:18:2,5:3,8:0,5,6,7
chr3	133368199	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=210,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr3	133371522	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=176,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:133371522_A_T:133371522:0,2,0,1
chr3	133371531	.	T	TATCACTTCAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=176,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:133371522_A_T:133371522:0,2,0,1
chr3	133375785	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr3	133380026	.	A	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,34:0.556:61:7,19:20,15:1,26,0,34
chr3	133467271	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=134,61;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:16,0:9,2:11,16,2,0
chr3	133524591	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=220,269;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	133524717	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,17:0.364:47:13,6:17,10:28,2,17,0
chr3	133553527	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=126,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr3	133583374	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=129,106;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:0|1:133583374_A_C:133583374:6,1,2,0
chr3	133583382	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=129,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.314:10:4,2:2,0:0|1:133583374_A_C:133583374:7,0,2,1
chr3	133661684	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=127,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:2,2:0,5,0,4
chr3	133667767	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=115,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:7,0:3,2:5,6,1,1
chr3	133673711	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	133692497	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,2:1,5:4,2,7,0
chr3	133894390	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.628:25:5,8:4,7:9,0,15,1
chr3	133901733	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,4:4,1:11,1,5,0
chr3	133941470	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:133941470_A_AT:133941470:0,1,0,1
chr3	133941471	.	GATAA	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=156,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,1:0,0:0|1:133941470_A_AT:133941470:0,1,0,1
chr3	133941477	.	A	AC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133941470_A_AT:133941470:0,0,0,1
chr3	133941483	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133941470_A_AT:133941470:0,0,0,1
chr3	133941484	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:133941470_A_AT:133941470:0,0,0,1
chr3	133969380	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	133969437	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	134080661	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,1:4,1:2,6,0,2
chr3	134085070	.	GAAGT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=103,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGT;STR;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,4:3,1:5,0,4,1
chr3	134085205	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,2:6,4:1,9,4,2
chr3	134214042	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,16,0
chr3	134226159	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=116.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,22:0,15:0,0,11,27
chr3	134256159	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,0,19
chr3	134266148	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,7,2
chr3	134280395	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,11:0,16:0,0,3,24
chr3	134362333	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	134514579	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,12:0,9:0,0,9,12
chr3	134644636	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=123,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.374:17:7,4:2,2:10,1,3,3
chr3	134670363	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=161,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:0|1:134670363_A_T:134670363:4,15,0,2
chr3	134670365	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=161,212;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:9,2:0|1:134670363_A_T:134670363:4,15,0,2
chr3	134825375	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:3,0:12,2:9,7,2,0
chr3	134911715	.	T	TGATAG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=147,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:2,1:1,0:0|1:134911715_T_TGATAG:134911715:0,3,0,1
chr3	134911716	.	G	GTTAGGATGGTCGAACTGGCCCAT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=147,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.314:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	134911720	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=170,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:134911715_T_TGATAG:134911715:0,3,0,1
chr3	134911721	.	G	GTGTATGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=170,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:134911715_T_TGATAG:134911715:0,3,0,1
chr3	134967368	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,2:4,6:1,7,1,7
chr3	135721309	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:5,3:14,0:8,11,3,0
chr3	135797251	.	G	A	.	.	DP=128;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,72;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,5:0.049:117:54,5:56,0:43,69,4,1
chr3	135821000	.	G	GGTCTCACCATCAACAGCTGGCTTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=156,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr3	136002809	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=205,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr3	136048935	.	TTTGC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=191,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:136048935_TTTGC_T:136048935:0,3,0,1
chr3	136048941	.	A	AGCCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=191,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:136048935_TTTGC_T:136048935:0,3,0,1
chr3	136048955	.	G	GCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	136068226	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,0:7,4:1,13,0,4
chr3	136082410	.	A	AGGAAGGAGACAGCTTTAAACT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr3	136162109	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:10,1,2,0
chr3	136196071	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,3:0,4:1,0,5,2
chr3	136287710	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,22:0.470:47:16,7:8,15:5,20,4,18
chr3	136646968	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,3:0.064:60:34,1:21,2:27,30,0,3
chr3	136677064	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:5,2:3,2:2,6,0,5
chr3	137749933	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=151,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,2:6,0:5,4,1,1
chr3	137783512	.	A	AAGTGTCATCCTTTGCCCTAG	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.112:33:12,3:17,0:15,15,1,2
chr3	137783700	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr3	137787282	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	137799291	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	137799498	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,3,8
chr3	137800656	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,3,6
chr3	137803188	.	GGCA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137803188_GGCA_G:137803188:0,0,0,1
chr3	137803193	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137803188_GGCA_G:137803188:0,0,0,1
chr3	137807203	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,33;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:9,2:2,0:8,3,1,1
chr3	137850003	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,3:0,26:0,0,16,16
chr3	137880695	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=164.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,20:0,26:0,0,39,7
chr3	137880740	.	ATCG	A	.	.	DP=123;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=120,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:93,5:0.059:98:40,4:51,1:45,48,4,1
chr3	137880743	.	G	A	.	.	DP=121;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=328.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,114:0.992:114:0,49:0,64:0,0,61,53
chr3	137882377	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr3	137882752	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr3	137886238	.	T	TGCGAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:137886238_T_TGCGAA:137886238:0,1,0,1
chr3	137886240	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,22;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:137886238_T_TGCGAA:137886238:0,1,0,1
chr3	137958438	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,7:0,0,0,10
chr3	137982718	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=57.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,4:0,0,1,16
chr3	138009528	.	T	TGGCTTTCC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,101;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:5,8,0,2
chr3	138025136	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=204,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,2:1,6:6,0,8,0
chr3	138025396	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,2:2,1:0,3,0,4
chr3	138037127	.	G	GGGAGTCTCAGGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	138091701	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,1:7,3:8,2,4,0
chr3	138116392	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:138116392_T_C:138116392:0,0,0,1
chr3	138116399	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:138116392_T_C:138116392:0,0,0,1
chr3	138116401	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:138116392_T_C:138116392:0,0,0,1
chr3	138117422	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=161,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:11,0:12,4:4,19,1,3
chr3	138170788	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr3	138176456	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=127,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:138176456_G_T:138176456:7,15,1,1
chr3	138176461	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,2:9,0:0|1:138176456_G_T:138176456:6,14,1,1
chr3	138176482	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,2:9,0:0|1:138176482_A_G:138176482:5,9,1,1
chr3	138176485	.	T	TGCGCTCACCTTCTCA	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=116,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,2:8,0:0|1:138176482_A_G:138176482:5,9,1,1
chr3	138176533	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr3	138189031	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=131,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:1,3,1,2
chr3	138213849	.	ATTTGT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:6,5:4,6:7,3,5,6
chr3	138244400	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,9:0,0,5,7
chr3	138248009	.	GA	G,GAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,17,32;MFRL=132,56,140;MMQ=60,60,50;MPOS=13,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=6.77,7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,3:0.317,0.278:12:1,0,1:3,2,1:4,1,3,4
chr3	138251302	.	G	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=178.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,22:0,32:0,0,41,13
chr3	138251447	.	CGGTAT	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTAT;STR;TLOD=162.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.977:38:0,17:0,21:0,0,8,30
chr3	138256252	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	138409992	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:17,0:19,3:2,34,2,1
chr3	138724370	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=29,17;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.156:34:12,2:14,0:16,13,4,1
chr3	138724372	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=31,22;MFRL=152,144;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:13,1:16,0:0|1:138724372_C_G:138724372:18,13,1,2
chr3	138724373	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=29,13;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.127:34:12,0:15,0:15,15,4,0
chr3	138724374	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=29,22;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:12,1:15,1:17,13,2,2
chr3	138724379	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=28,12;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.216:31:7,1:9,0:12,12,5,2
chr3	138724387	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=31,17;MFRL=152,144;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:12,0:10,1:0|1:138724372_C_G:138724372:16,12,1,2
chr3	138724392	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=29,17;MFRL=150,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:9,1:6,1:13,11,4,2
chr3	138763308	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=213,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr3	138763343	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=217,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:1,2:2,0:0,4,0,3
chr3	138763627	.	GTGC	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGC;STR;TLOD=98.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,12:0,10:0,0,16,8
chr3	139066902	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	139074638	.	G	GT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.136:37:18,2:13,1:15,17,0,5
chr3	139075938	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:0,9,0,6
chr3	139080056	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,1:11,1:8,13,1,1
chr3	139081275	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=179,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:2,0:5,4,2,0
chr3	139085686	.	C	CACA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=196,208;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr3	139085696	.	C	CCAATTCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=194,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	139085705	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=202,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139085705_T_C:139085705:1,0,0,1
chr3	139085708	.	C	CAATACTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=202,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:139085705_T_C:139085705:1,0,0,1
chr3	139088481	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=165,227;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	139090736	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,4:2,6:0,4,0,10
chr3	139098357	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:12,8:10,7:0,22,0,15
chr3	139102120	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,13:0,15:0,0,24,4
chr3	139108250	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	139180977	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:19,2:8,0:12,17,1,1
chr3	139181144	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:6,13,0,2
chr3	139195177	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.738:21:1,9:4,6:5,0,12,4
chr3	139236404	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:7,1:13,5,2,0
chr3	139257545	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=158,278;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr3	139280064	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:16,1:14,3:19,11,2,2
chr3	140139907	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	140178279	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	140178638	.	CCCT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,7:0,4:0,0,3,9
chr3	140282084	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr3	140285115	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=94.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,11:0,18:0,0,1,29
chr3	140397409	.	C	CACACACTCACAGCATGTATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=211,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr3	140419715	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,17,6
chr3	140678384	.	TA	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,11:0.271:40:7,3:14,6:1,28,2,9
chr3	140692486	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	140998214	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,16,7
chr3	141006396	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	141277651	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=98.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,32:0.506:63:17,13:14,18:31,0,31,1
chr3	141299334	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.484:35:4,10:14,6:3,15,1,16
chr3	141305037	.	TG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=211,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:141305037_TG_AA:141305037:0,2,0,1
chr3	141305040	.	G	GCCCTTACCAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=211,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:141305037_TG_AA:141305037:0,2,0,1
chr3	141327593	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:0,3:3,6:0,3,0,9
chr3	141331222	.	G	A	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=132.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,51:0.458:111:24,26:36,23:15,45,15,36
chr3	141457106	.	C	CGGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=231,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,6;RU=G;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.528:2:1,0:0,1:0|1:141457106_C_CGGG:141457106:1,0,1,0
chr3	141457110	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=11,31;MFRL=207,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.413:3:0,0:0,1:0|1:141457106_C_CGGG:141457106:2,0,1,0
chr3	141535558	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,13,6
chr3	141622630	.	G	GT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,199;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.218:20:10,2:4,0:1,15,0,4
chr3	141622680	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=176,123;MMQ=59,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:6,2:0,0:0,6,0,2
chr3	141625999	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=73.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,16,4
chr3	141626189	.	C	CGGTA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=109,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGTA;STR;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,3:0,1,0,7
chr3	141626200	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=196,161;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr3	141644274	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr3	141724160	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=189,68;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:9,0,1,1
chr3	141904977	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,15:0,12:0,0,22,6
chr3	141905253	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=158.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,13:0,19:0|1:141905253_C_A:141905253:0,0,35,1
chr3	141905259	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=171.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.976:39:0,15:0,22:0|1:141905253_C_A:141905253:0,0,38,1
chr3	141905261	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=171.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.977:39:0,15:0,23:0|1:141905253_C_A:141905253:0,0,38,1
chr3	141917810	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=69.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,0,19
chr3	141923491	.	G	GA	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,5:0.130:44:25,2:11,3:0|1:141923491_G_GA:141923491:30,9,5,0
chr3	141923506	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=202.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,61:0.985:61:0,37:0,19:0|1:141923491_G_GA:141923491:0,0,48,13
chr3	141932531	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr3	141934393	.	CA	C,CAA	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,34,32;MFRL=170,232,141;MMQ=60,60,60;MPOS=20,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.02,8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:43,3,7:0.068,0.135:53:27,2,5:15,1,2:43,0,9,1
chr3	142051147	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:2,3:0,6:2,0,9,0
chr3	142094816	.	GCACA	G,GCA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,35,32;MFRL=130,172,155;MMQ=60,60,60;MPOS=31,34;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=CA;STR;TLOD=5.19,4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,2:0.196,0.213:11:6,0,1:0,2,1:3,4,0,4
chr3	142119303	.	T	A	.	.	DP=110;ECNT=1;MBQ=30,15;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,10:0.098:100:43,0:33,0:75,15,0,10
chr3	142122451	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.525:32:9,8:5,6:15,0,17,0
chr3	142215178	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=106,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,6:1,2:1,0,6,2
chr3	142232555	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,118;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,0:14,2:0,27,2,0
chr3	142241691	.	A	AC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=176,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,0:9,2:1,19,0,3
chr3	142241692	.	GAA	G,CAA,AAA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=17,34,19,34;MFRL=172,188,196,134;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,16,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=4.25,5.94,5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,2,4,3:0.146,0.229,0.157:16:0,2,0,0:1,0,1,3:1,6,0,9
chr3	142259706	.	CA	C,CAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=145,116,137;MMQ=60,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.05,6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,6:0.179,0.338:17:7,1,3:1,2,3:7,1,8,1
chr3	142272275	.	AAC	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AC;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:7,2:1,0:0,8,0,3
chr3	142272314	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=228,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr3	142277365	.	AAAAT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,152;MMQ=55,52;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AAAT;STR;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.709:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr3	142402827	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.157:23:10,0:9,3:20,0,3,0
chr3	142413407	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:9,6:3,7:1,11,5,8
chr3	142443372	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,23;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:142443372_T_G:142443372:0,0,1,0
chr3	142443377	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=217,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:142443372_T_G:142443372:1,0,1,0
chr3	142443382	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,10;MFRL=217,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:142443372_T_G:142443372:1,0,1,0
chr3	142443384	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=217,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:142443372_T_G:142443372:1,0,1,0
chr3	142521224	.	CT	C,CTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,34,20;MFRL=162,148,150;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.74,24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,14:0.131,0.497:27:7,0,6:3,3,4:0,10,2,15
chr3	142537283	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:4,10,0,2
chr3	142567327	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=130,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,2:6,5:2,7,0,7
chr3	142720348	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	142740061	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=177,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr3	142740255	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:26,0:30,3:23,33,0,3
chr3	142752293	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	142773738	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=158.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,27:0,21:0,0,34,14
chr3	142774062	.	TTAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=245,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	142841379	.	T	TCACACACACACACAAACA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=136,99;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.150:39:18,2:15,0:20,13,4,2
chr3	142985622	.	GT	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,144;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:14,3:13,0:12,15,0,3
chr3	143214114	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,6:6,3:10,0,9,0
chr3	143214290	.	A	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=149,93;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:23,0:32,3:13,43,0,3
chr3	143371003	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	143567207	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=151.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,18:0,23:0,0,6,40
chr3	145788467	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.515:33:11,10:5,7:11,5,14,3
chr3	145788803	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=202,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,2:3,1:6,3,3,0
chr3	145790519	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	145803138	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,13:0.424:31:5,7:13,4:0|1:145803138_T_C:145803138:0,18,0,13
chr3	145803142	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=184,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,11:0.400:28:5,8:12,3:0|1:145803138_T_C:145803138:0,17,0,11
chr3	145804524	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:11,14:6,11:17,0,25,0
chr3	145809750	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,3:3,3:0,5,0,6
chr3	145820684	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:6,5:0,3:1,5,3,5
chr3	145820726	.	G	GTGCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.414:5:1,1:1,1:0|1:145820726_G_GTGCC:145820726:0,3,0,2
chr3	145820729	.	T	TCCAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:145820726_G_GTGCC:145820726:0,3,0,1
chr3	145824478	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,4:3,2:0,11,0,6
chr3	145824504	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=181,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr3	145828256	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr3	145838895	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,5:5,3:5,1,5,3
chr3	145841854	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	145924632	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr3	145938528	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=201,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr3	145938782	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,4:6,2:2,8,0,6
chr3	145939755	.	C	CA	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=134,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.344:43:18,8:8,4:21,7,11,4
chr3	145939776	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=117,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=72.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,23:0.387:60:23,14:14,6:25,12,15,8
chr3	146176075	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=113.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,16:0,0,32,0
chr3	146233935	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:1,1:0,7,0,2
chr3	146251430	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:1,3:3,5:0|1:146251430_A_G:146251430:0,4,0,8
chr3	146251433	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:1,3:3,5:0|1:146251430_A_G:146251430:0,4,0,8
chr3	146303750	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:7,6:3,2:10,0,8,0
chr3	146307635	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr3	146311937	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=159,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:4,2:4,3:0,9,2,3
chr3	146312917	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,30:0.535:56:9,12:17,18:4,22,8,22
chr3	146312941	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=174,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.527:34:6,8:10,10:1,15,4,14
chr3	146318000	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=199,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr3	147108756	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.576:12:2,2:2,4:2,3,3,4
chr3	147113667	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,3:5,6:7,3,6,3
chr3	148545857	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=100,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.666:22:1,7:6,7:3,4,10,5
chr3	148562425	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:9,10:5,6:4,10,8,8
chr3	148562620	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=123,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr3	148563493	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr3	148575156	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	148597482	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr3	148597612	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=210.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,32:0,30:0,0,24,38
chr3	148711906	.	G	GT	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.115:55:25,3:24,3:45,4,6,0
chr3	148714025	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,1:8,3:11,1,4,0
chr3	148752761	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=128,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,5:0.088:65:33,2:27,3:30,30,1,4
chr3	148756825	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr3	148757290	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=184,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:2,1:9,1:12,0,2,0
chr3	148764090	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=191,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:4,3:6,8:0,10,1,11
chr3	148788941	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr3	148804090	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,7:0.196:33:11,0:15,0:0|1:148804090_T_A:148804090:4,22,7,0
chr3	148804093	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.164:31:11,0:14,0:0|1:148804090_T_A:148804090:4,22,5,0
chr3	148858353	.	A	AAGGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGGT;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr3	148858987	.	CTT	C,CT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=24,33,33;MFRL=150,149,140;MMQ=60,60,60;MPOS=15,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=5.03,9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,4,6:0.111,0.199:33:11,2,5:9,2,0:9,14,6,4
chr3	148876404	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,1:10,1:18,5,1,1
chr3	148879878	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:7,2:2,6:0|1:148879878_A_G:148879878:10,0,8,0
chr3	148879883	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,2:3,6:0|1:148879878_A_G:148879878:10,0,8,0
chr3	148885779	.	AT	A,ATT	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=31,31,31;MFRL=158,144,125;MMQ=60,60,60;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=3.30,57.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,3,38:0.052,0.544:68:14,2,16:13,1,20:3,24,10,31
chr3	148885851	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=174,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.691:24:1,7:6,9:0,7,0,17
chr3	148896430	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,2:7,3:0,9,0,5
chr3	148901406	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.634:14:2,6:3,3:0,5,0,9
chr3	148925418	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,4:5,2:0,6,3,3
chr3	149087714	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=78.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,28:0.784:35:4,12:3,15:0,7,5,23
chr3	149192564	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:2,1,7,0
chr3	149238595	.	C	CTTAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.369:25:9,3:7,5:11,5,7,2
chr3	149243715	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:7,0,5,0
chr3	149245675	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,18:0.402:46:10,9:12,8:15,13,6,12
chr3	149260145	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:9,2:20,1:18,12,3,0
chr3	149290605	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=119,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:5,0,7,0
chr3	149613232	.	ATTTT	A,AT,ATT,ATTT	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=34,34,33,33,32;MFRL=162,157,173,176,139;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=19,22,22,10;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=18,14,15,16,17;RU=T;STR;TLOD=4.73,7.76,34.44,12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:1,4,6,18,8:0.096,0.152,0.460,0.243:37:0,1,3,11,6:1,3,3,7,2:1,0,36,0
chr3	149613252	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=13,18;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,9:0.136:61:8,0:7,0:43,9,9,0
chr3	149619799	.	A	AAGTT	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=110.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,29:0.454:64:24,8:11,18:25,10,24,5
chr3	149619941	.	T	C	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=136.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,52:0.546:95:15,20:27,30:14,29,20,32
chr3	149686367	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=119,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,6:1,4:0,1,0,10
chr3	150128154	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.474:21:7,4:4,5:9,2,10,0
chr3	150128392	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=199,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr3	150128484	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=233,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr3	150129171	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:150129171_A_AT:150129171:0,1,0,4
chr3	150129173	.	T	TCATTTGTTCTGCAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=213,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:150129171_A_AT:150129171:0,4,0,1
chr3	150270077	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	150276151	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.815:14:2,6:0,5:0|1:150276151_A_AT:150276151:1,1,11,1
chr3	150276153	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.815:14:2,7:0,5:0|1:150276151_A_AT:150276151:1,1,11,1
chr3	150282061	.	CT	C,CTT	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=161,136,116;MMQ=60,60,60;MPOS=16,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.64,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,7,4:0.152,0.109:41:13,3,3:14,3,1:22,8,9,2
chr3	150285664	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=139.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,15:0,0,10,27
chr3	150290393	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=155,159;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150290393_G_A:150290393:0,1,0,1
chr3	150290398	.	TC	CT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=155,159;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150290393_G_A:150290393:0,1,0,1
chr3	150290407	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=155,159;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:150290393_G_A:150290393:0,1,0,1
chr3	150290413	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150290393_G_A:150290393:0,0,0,1
chr3	150290417	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150290393_G_A:150290393:0,0,0,1
chr3	150340114	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=143.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,16:0,21:0,0,37,0
chr3	150384807	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr3	150391638	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150391638_C_G:150391638:0,0,1,0
chr3	150391647	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150391638_C_G:150391638:0,0,1,0
chr3	150398810	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr3	150420057	.	C	CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=245,161;MMQ=55,32;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=24,26;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.544:4:0,0:1,0:0,2,0,2
chr3	150460572	.	T	TCTCTCAACCGCCACTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,33;MFRL=218,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr3	150480448	.	CCCG	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCG;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.070:40:14,0:20,2:5,33,0,2
chr3	150661472	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr3	150661495	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,15,3
chr3	150690566	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	150804908	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	150876464	.	TG	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=96.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,23:0,3:0,0,22,4
chr3	150883777	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,9:0,4:0,0,4,10
chr3	150903165	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=149,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.100:37:15,1:19,2:21,13,1,2
chr3	150903178	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=146,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:14,0:16,2:18,13,0,2
chr3	150916131	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=96,141;MMQ=58,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:0,1:2,10:1,1,10,1
chr3	151046604	.	G	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=188.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,59:0.969:60:0,23:1,36:1,0,28,31
chr3	151073033	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=216.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,29:0,28:0,0,20,38
chr3	151073818	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=98,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:17,2:19,0:17,19,2,0
chr3	151074925	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr3	151074941	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=64.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,6:0,0,17,2
chr3	151083630	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:18,0:3,3:17,4,3,0
chr3	151085578	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=76.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,9,15
chr3	151102790	.	ACT	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.088:31:13,2:13,0:24,5,2,0
chr3	151103070	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr3	151128973	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	151128975	.	CA	GC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,19;MFRL=202,175;MMQ=54,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:151128975_CA_GC:151128975:2,0,1,0
chr3	151128977	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,14;MFRL=175,242;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr3	151128981	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,18;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:151128975_CA_GC:151128975:3,0,1,0
chr3	151128990	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:151128975_CA_GC:151128975:3,0,1,0
chr3	151129173	.	C	CACTCGGCTGCTGCTGAATCTGTCTGAG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,44;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,0:14,3:12,17,1,2
chr3	151131183	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr3	151134104	.	AGCAGCCCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCAGCCTCCCCAGCCCCAGCAGTCCTCGCAGTCCCAGAGTCAGACCCTTGGTCTCCAAGCAAT	A	.	.	DP=160;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=126,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:124,36:0.044:160:16,16:14,13:49,75,25,11
chr3	151134121	.	CAG	C	.	.	DP=75;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=141,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,4:0.104:44:18,0:14,2:0|1:151134121_CAG_C:151134121:6,34,4,0
chr3	151134127	.	CAGCAG	C	.	.	DP=82;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,4:0.088:52:18,1:18,1:0|1:151134121_CAG_C:151134121:10,38,4,0
chr3	151134134	.	CT	C	.	.	DP=83;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=136,170;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.093:49:20,1:21,2:0|1:151134121_CAG_C:151134121:10,35,4,0
chr3	151154923	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,5:5,2:5,5,6,1
chr3	151162965	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=127,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,23:0.534:43:8,15:12,8:7,13,11,12
chr3	151531894	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=126,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.588:32:5,9:8,10:12,1,12,7
chr3	151535422	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	151542408	.	AAAAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr3	151545318	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,11,1
chr3	151545321	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,2:0,8:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,12,1
chr3	151545323	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,2:0,9:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,11,1
chr3	151546041	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	152017897	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr3	152554282	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:13,2:10,0:10,15,2,0
chr3	152881442	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=175,166;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.740:6:1,3:0,0:0,1,2,3
chr3	152881444	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=175,166;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.740:6:1,2:0,1:0|1:152881444_A_T:152881444:0,1,2,3
chr3	152881449	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=200,162;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.611:6:1,3:0,0:0|1:152881444_A_T:152881444:0,2,1,3
chr3	152881453	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=175,166;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.792:8:1,4:0,0:0|1:152881444_A_T:152881444:0,1,1,6
chr3	152881852	.	AT	A,ATT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32,32;MFRL=186,162,225;MMQ=60,60,60;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.67,5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,5,3:0.191,0.150:24:9,2,2:7,3,1:9,7,4,4
chr3	152883395	.	CT	C,CTT	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=126,149,135;MMQ=60,60,60;MPOS=17,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=16.83,5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:50,14,6:0.183,0.090:70:25,6,1:21,7,3:41,9,13,7
chr3	153839959	.	CT	TC	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=200.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,30:0,17:0,0,21,27
chr3	153847555	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=183,131;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:153847555_T_C:153847555:1,14,0,2
chr3	153847558	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=183,131;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:0|1:153847555_T_C:153847555:1,14,0,2
chr3	153847582	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr3	153870511	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=137.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,16:0,22:0,0,34,4
chr3	153970796	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,25,1
chr3	153972500	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr3	153994502	.	TG	CA,CG	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32,33;MFRL=0,174,166;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=46.48,49.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,16,19:0.450,0.524:35:0,10,12:0,6,7:0,0,34,1
chr3	153995307	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=209,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:6,0,8,0
chr3	154002357	.	A	AT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.507:24:5,6:7,4:11,1,10,2
chr3	154007618	.	T	TA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.119:34:12,2:16,2:1,29,0,4
chr3	154007682	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	154010515	.	AACACAC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=AC;STR;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.604:5:1,3:0,0:0,2,0,3
chr3	154010560	.	C	CCGCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=180,199;MMQ=60,50;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr3	154018690	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,5:4,5:11,0,10,0
chr3	154021063	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=256.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.988:77:0,30:0,43:0,0,64,13
chr3	154024165	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=229,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr3	154802742	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.492:37:7,12:10,6:17,2,18,0
chr3	154834379	.	G	GTA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,78;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TA;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.137:19:9,1:8,1:6,11,2,0
chr3	154858158	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,4:3,3:0,6,0,7
chr3	154866453	.	T	C	.	.	DP=111;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=135.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,47:0.479:98:25,18:26,26:11,40,11,36
chr3	154878158	.	GA	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.321:29:9,6:11,3:14,6,2,7
chr3	155200133	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:3,5,1,2
chr3	155205993	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.797:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr3	155212325	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,7:0,0,2,13
chr3	155241593	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr3	155241740	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,16:0,14:0,0,12,18
chr3	155267621	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=132,97;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,3:5,0:6,8,1,2
chr3	155271825	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,11,5
chr3	155282974	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=223,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155282974_G_A:155282974:0,1,0,1
chr3	155282977	.	AAA	CTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=223,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:155282974_G_A:155282974:0,1,0,1
chr3	155481609	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,5,17
chr3	155611557	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	155621834	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:14,3:20,0:0,35,0,3
chr3	155633708	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr3	155649472	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:1,0:2,0,2,0
chr3	155838302	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155838302_T_A:155838302:1,0,1,0
chr3	155838311	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155838302_T_A:155838302:1,0,1,0
chr3	156175167	.	GG	AA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=57.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr3	156181651	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.439:16:2,4:7,3:0,9,0,7
chr3	156183307	.	GCCTC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTC;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	156183382	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr3	156260908	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=99,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:156260908_T_G:156260908:3,0,1,0
chr3	156260911	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=108,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:156260908_T_G:156260908:4,0,1,0
chr3	156260913	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=108,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:156260908_T_G:156260908:4,0,1,0
chr3	156261110	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.413:20:6,5:5,3:2,10,0,8
chr3	156262232	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=102.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,32:0.524:61:17,12:10,20:5,24,6,26
chr3	156266642	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,15,1
chr3	156266774	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,3:5,1:6,8,0,4
chr3	156266880	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	156271595	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.489:35:8,7:9,10:4,14,3,14
chr3	156271608	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=159,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.484:35:9,7:9,9:3,15,1,16
chr3	156271627	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:5,7:5,8:0,11,0,15
chr3	156413633	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=124,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.428:10:3,3:1,1:2,4,0,4
chr3	156421525	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr3	156421568	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=23,32;MFRL=195,184;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156421568_C_A:156421568:0,1,0,1
chr3	156421574	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=195,184;MMQ=60,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156421568_C_A:156421568:0,1,0,1
chr3	156421576	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=195,184;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:156421568_C_A:156421568:0,1,0,1
chr3	156421578	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,43;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:156421568_C_A:156421568:0,0,0,1
chr3	156742775	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,7:0,0,0,21
chr3	156867776	.	G	GAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=A;STR;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:10,6:6,7:0,16,4,10
chr3	156868266	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=227,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:156868266_CTT_C:156868266:0,4,0,1
chr3	156868270	.	T	TTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=227,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:156868266_CTT_C:156868266:0,4,0,1
chr3	156870059	.	C	T	.	.	DP=116;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=147.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,54:0.486:111:35,20:21,32:19,38,8,46
chr3	156870816	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,21:0.468:45:8,8:16,13:19,5,14,7
chr3	156876574	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:6,0,4,0
chr3	156876803	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,3:1,5:2,3,0,8
chr3	156877276	.	CAA	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,19:0.385:50:14,11:17,8:10,21,4,15
chr3	156877357	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=200,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr3	156877530	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=248,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr3	156978919	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=114,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:3,1:8,9:8,3,8,2
chr3	156983273	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.790:12:0,3:2,7:2,0,9,1
chr3	157004323	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=72.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,15,5
chr3	157034810	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,2:7,0:15,1,2,0
chr3	157081604	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr3	157082082	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	157146307	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr3	157146336	.	A	AGGAATATGACCCTTAGAAGTCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=165,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr3	157154768	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=139,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.512:39:11,17:8,3:12,7,12,8
chr3	157154861	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=95.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,15:0,0,14,16
chr3	157188045	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,7:0,0:0,0,7,0
chr3	157318257	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr3	157820400	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr3	157820423	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr3	158072623	.	AT	A,ATT	.	.	DP=154;ECNT=2;MBQ=31,33,33;MFRL=128,118,131;MMQ=60,60,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=11.91,9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:72,20,10:0.149,0.097:102:47,13,4:20,7,6:28,44,19,11
chr3	158072637	.	C	G	.	.	DP=142;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=128,93;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:111,7:0.065:118:47,1:32,1:38,73,6,1
chr3	158072776	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,4:0,10:0,1,0,15
chr3	158310391	.	CAGTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=114,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:0,4:1,2:0,2,1,5
chr3	158314810	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:0,4:9,9:0,9,0,13
chr3	158318015	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,12:0,0,0,25
chr3	158320597	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=186,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:7,4:8,5:9,6,6,3
chr3	158362391	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.381:40:11,6:14,9:24,1,14,1
chr3	158362526	.	A	G	.	.	DP=109;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=116.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,40:0.384:105:26,18:38,22:23,42,15,25
chr3	158362588	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:5,9:14,8:0,19,0,18
chr3	158372477	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:0,5,0,6
chr3	158372502	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=154,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr3	158384068	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=84.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,26:0.519:50:15,12:9,14:23,1,24,2
chr3	158384920	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,13:0.350:38:12,4:13,9:1,24,0,13
chr3	158386737	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.537:39:9,12:9,9:18,0,20,1
chr3	158387487	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr3	158388721	.	C	CAAAGAAA	.	.	DP=184;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAGAAA;STR;TLOD=273.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,73:0.464:157:34,18:49,34:52,32,44,29
chr3	158399757	.	A	AT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:13,7:9,8:21,1,15,0
chr3	158407930	.	CTT	C,CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,34,32;MFRL=158,161,190;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.08,5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,4:0.148,0.258:16:5,2,1:5,0,3:9,1,6,0
chr3	158409093	.	C	CA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=46.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.498:40:9,12:11,8:19,1,13,7
chr3	158409262	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.550:38:6,10:11,11:5,12,1,20
chr3	158415840	.	T	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:5,5:11,9:1,15,2,12
chr3	158428809	.	A	AAGGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,249;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AGGC;STR;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr3	158449965	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	158450080	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	158522190	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:12,3:3,6:4,12,2,7
chr3	158524777	.	AT	A	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,5:0.099:58:25,2:25,3:51,2,5,0
chr3	158537415	.	CTTTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=T;STR;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,4:0,2:1,0,5,1
chr3	158537443	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,4:0,0,7,3
chr3	158539294	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=159.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,23:0,22:0,0,47,3
chr3	158539486	.	A	G	.	.	DP=101;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=338.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,92:0.990:92:0,40:0,51:0,0,25,67
chr3	158539961	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=116.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,19:0,0,6,28
chr3	158545195	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	158787219	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=89,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:2,5:7,4:4,5,8,1
chr3	158991724	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,6:0,1:0,5,0,7
chr3	160000174	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.083:58:27,0:26,4:53,1,4,0
chr3	160083957	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:2,0:1,1:3,7,0,2
chr3	160130139	.	A	AT	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,4:0.057:85:38,4:41,0:64,17,4,0
chr3	160131236	.	CT	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.167:42:16,3:12,4:30,5,7,0
chr3	160134121	.	A	T	.	.	DP=121;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,6:0.062:110:51,4:51,2:48,56,0,6
chr3	160134208	.	G	GT	.	.	DP=97;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,11:0.182:58:13,1:16,4:10,37,0,11
chr3	160134241	.	CT	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.195:23:7,3:7,1:0,19,0,4
chr3	160137362	.	A	T	.	.	DP=120;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:110,4:0.041:114:49,2:49,2:37,73,2,2
chr3	160137363	.	CT	C,CTT	.	.	DP=119;ECNT=2;MBQ=33,33,26;MFRL=136,162,162;MMQ=60,60,60;MPOS=23,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.20,6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:64,6,8:0.068,0.095:78:34,1,5:24,4,1:12,52,7,7
chr3	160138723	.	AT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,139;MMQ=60,52;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:5,2:7,2:1,13,0,4
chr3	160141147	.	G	GT,GTT	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=35,35,29;MFRL=162,157,208;MMQ=60,60,60;MPOS=18,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=6.08,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:37,5,3:0.123,0.082:45:20,4,2:17,0,1:36,1,8,0
chr3	160141166	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=17,19;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,5:0.115:51:9,0:7,1:44,2,5,0
chr3	160142810	.	ATG	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=TG;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:1,2:3,1:0,13,0,5
chr3	160144019	.	G	GA	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,7:0.113:69:17,2:36,1:6,56,1,6
chr3	160149360	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:8,2:6,1:14,0,3,0
chr3	160151385	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,94;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:18,3:23,0:40,3,3,0
chr3	160156367	.	C	CT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.140:33:14,3:13,1:16,13,2,2
chr3	160233406	.	CT	C,CTT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=167,168,194;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=10.04,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,7,3:0.262,0.134:26:7,1,3:6,6,0:0,16,2,8
chr3	160249220	.	TA	T,TAA	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=31,31,30;MFRL=146,145,123;MMQ=60,60,60;MPOS=17,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=20.69,4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:42,16,5:0.233,0.082:63:23,9,4:17,6,1:39,3,19,2
chr3	160249234	.	T	A	.	.	DP=93;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,3:0.042:92:36,2:24,1:77,12,3,0
chr3	160249242	.	G	T	.	.	DP=109;ECNT=3;MBQ=32,16;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:102,5:0.039:107:41,0:33,1:78,24,5,0
chr3	160395089	.	GA	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:14,1:16,2:31,6,3,0
chr3	160395095	.	A	G,T	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,30,27;MFRL=151,77,87;MMQ=60,60,60;MPOS=17,33;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.47,6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:37,5,4:0.118,0.101:46:10,5,4:27,0,0:32,5,8,1
chr3	160679744	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr3	160955879	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,2:1,6:1,0,8,0
chr3	160955882	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,32,29;MFRL=143,202,168;MMQ=60,60,60;MPOS=26,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=T;STR;TLOD=8.28,5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,4:0.309,0.252:16:2,1,3:2,4,1:6,1,9,0
chr3	160964271	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:4,4:4,1:0,9,0,5
chr3	160967354	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,28:0.439:64:16,14:20,14:9,27,7,21
chr3	161064193	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,6:4,3:0,9,0,9
chr3	161216860	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.540:26:3,5:8,9:12,0,14,0
chr3	161216912	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,14:0.360:40:12,7:12,7:16,10,11,3
chr3	163889384	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.443:25:6,3:7,7:2,12,3,8
chr3	164733721	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,8:0,4:1,0,8,4
chr3	164748663	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=114,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.185:35:13,0:8,1:16,13,0,6
chr3	164748665	.	C	CA	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.794:20:1,3:2,4:2,2,3,13
chr3	164751319	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=138,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:1,2,0,7
chr3	164758630	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	164760771	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,3:5,5:6,0,7,1
chr3	164766816	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr3	164766835	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr3	164772957	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,12,2
chr3	164776913	.	C	CAT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=118.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,12:0,14:0,0,15,13
chr3	164777677	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,8,6
chr3	164777722	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,1:3,2:5,5,1,2
chr3	164781368	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=170.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.982:50:0,26:0,24:0,0,6,44
chr3	164785338	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr3	164786413	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr3	164786629	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr3	164787004	.	G	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=145,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.099:47:21,0:21,4:6,37,1,3
chr3	164908265	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=127,55;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:4,3,1,1
chr3	164908283	.	TG	CA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:3,2:0|1:164908283_TG_CA:164908283:5,3,1,1
chr3	164908287	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:164908283_TG_CA:164908283:5,3,1,1
chr3	164908290	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0|1:164908283_TG_CA:164908283:5,3,1,1
chr3	164908549	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:14,3:20,0:13,23,3,0
chr3	164908642	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=122,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:9,0:6,5:2,14,0,5
chr3	167000006	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:12,2:14,1:22,6,1,2
chr3	167006612	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=117,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,7:6,1:5,4,8,0
chr3	167045701	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	167068169	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:13,0:17,2:26,4,0,2
chr3	167078544	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=226.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,61:0.969:62:0,31:1,30:0,1,12,49
chr3	167167286	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=222,172;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:167167286_A_G:167167286:0,1,0,1
chr3	167167290	.	ATTTATTTT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=222,172;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:167167286_A_G:167167286:0,1,0,1
chr3	167170829	.	T	TA	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,6:0.101:66:30,4:26,2:1,59,0,6
chr3	167223281	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	167524941	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=214,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:9,1,5,0
chr3	167745703	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,1:2,3:0,5,0,5
chr3	167754573	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:2,6:8,4:9,2,7,3
chr3	167762678	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=183,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.492:18:4,2:4,5:0,9,3,6
chr3	168808094	.	T	TGAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:168808094_T_TGAC:168808094:0,1,0,1
chr3	168808097	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:168808094_T_TGAC:168808094:0,1,0,1
chr3	168810980	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	168818560	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	168819788	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr3	168833559	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=149,46;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:13,2:0|1:168833559_G_A:168833559:13,10,1,1
chr3	168833563	.	A	ATACTTTGGTTC	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=142,46;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:10,0:13,2:0|1:168833559_G_A:168833559:15,13,1,1
chr3	168833565	.	A	ACAGGAC	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=141,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:13,0:12,2:0|1:168833559_G_A:168833559:15,12,1,1
chr3	168840571	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,2,9
chr3	168840607	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.827:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr3	168861536	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:7,7,2,0
chr3	169381254	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=154,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.107:35:18,3:12,0:0|1:169381254_T_C:169381254:0,32,0,3
chr3	169381257	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=154,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:18,1:12,0:0|1:169381254_T_C:169381254:0,32,0,2
chr3	169486144	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=193,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,6:0,5:0,1,0,11
chr3	169487397	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,10;MFRL=191,205;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,0:0|1:169487397_A_C:169487397:0,6,0,2
chr3	169487399	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=191,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.363:9:3,0:1,1:0|1:169487397_A_C:169487397:0,6,0,3
chr3	169492016	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.610:16:3,3:3,6:6,0,9,1
chr3	169500487	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr3	169525523	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=163,234;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:0|1:169525523_A_C:169525523:0,8,0,2
chr3	169525525	.	A	ACCACACACAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=163,234;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:6,1:0|1:169525523_A_C:169525523:0,8,0,2
chr3	169539649	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=98.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,26,1
chr3	169550759	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=89.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,16:0,0,23,3
chr3	169566090	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr3	169654252	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,26:0.502:52:9,10:16,16:5,21,4,22
chr3	169684687	.	G	C	.	.	DP=124;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=198.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,76:0.614:123:25,32:22,39:15,32,23,53
chr3	169684706	.	G	C	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,6:0.098:70:16,0:18,1:13,51,0,6
chr3	169710363	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr3	169710807	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,2:0.046:62:32,1:28,1:22,38,0,2
chr3	169803231	.	GGAA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.542:11:2,3:3,2:0,5,0,6
chr3	169863241	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=126,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,4:0.059:70:30,2:35,1:37,29,3,1
chr3	169896634	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.078:61:21,2:36,2:37,20,3,1
chr3	169896684	.	C	T	.	.	DP=100;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=129,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=157.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,58:0.621:93:24,22:11,34:16,19,22,36
chr3	169981327	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=147,179;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:0|1:169981327_T_C:169981327:0,3,0,1
chr3	169981333	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=183,179;MMQ=60,36;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:169981327_T_C:169981327:0,2,0,1
chr3	169998240	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:7,1:3,2:2,10,0,4
chr3	170078232	.	C	T	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=285.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,88:0.989:88:0,43:0,42:0,0,36,52
chr3	170099218	.	ATTAT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTAT;STR;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr3	170108337	.	C	CGA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=167,157;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,1:3,1:0,12,0,2
chr3	170109112	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:5,1:8,2:0,16,0,3
chr3	170720299	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,3:1,0:2,0,5,0
chr3	170723135	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.084:33:15,2:16,0:16,15,1,1
chr3	170744452	.	TCTGTCATTGTACTAGTTGGGAGTC	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.055:53:21,2:18,0:14,37,2,0
chr3	170784061	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=109,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:16,3:8,0:18,7,2,1
chr3	170801912	.	TAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=A;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.316:7:4,1:0,1:3,2,1,1
chr3	170841568	.	A	ATGTGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=215,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	170846671	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=102,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.231:19:6,0:4,0:11,3,0,5
chr3	170846676	.	CA	C,CAA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=19,19,25;MFRL=151,141,107;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,19,21;RU=A;STR;TLOD=3.62,5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,5:0.407,0.330:14:1,2,3:0,1,0:1,2,1,10
chr3	170857167	.	GCA	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=21,29;MFRL=167,196;MMQ=60,52;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=CA;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr3	170857171	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=23,29;MFRL=167,196;MMQ=60,52;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,0:1,1:2,0,1,0
chr3	170857240	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=138,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.410:52:14,13:12,7:16,15,8,13
chr3	170879189	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:2,1,0,2
chr3	170885097	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=189,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,2:4,4:0,9,0,6
chr3	170912469	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,1:3,4:1,7,1,4
chr3	171087469	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,7,15
chr3	171406653	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=125,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,0:14,2:14,14,0,2
chr3	171455451	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:4,2:8,3:0,13,0,5
chr3	172003764	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=134,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:13,9,1,1
chr3	172046695	.	G	GTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,6:2,4:6,0,10,0
chr3	172046933	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.501:24:7,9:5,3:1,11,1,11
chr3	172059121	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:1,3:3,2:0,4,0,6
chr3	172224769	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:172224769_GC_G:172224769:0,0,0,2
chr3	172224771	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:172224769_GC_G:172224769:0,0,0,2
chr3	172227199	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr3	172351917	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:1,3,0,3
chr3	172365619	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:4,4:1,1:3,3,5,1
chr3	172480173	.	A	ATT	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=95.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,25:0.464:54:15,10:12,15:0|1:172480173_A_ATT:172480173:22,7,15,10
chr3	172480174	.	AC	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=95.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,25:0.464:54:16,10:13,15:0|1:172480173_A_ATT:172480173:22,7,15,10
chr3	172520818	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr3	172534428	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:12,3:7,8:17,2,10,1
chr3	172537850	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,3:5,3:10,0,6,0
chr3	172634025	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:172634025_T_TTG:172634025:0,0,2,0
chr3	172634039	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:172634025_T_TTG:172634025:0,0,2,0
chr3	172634054	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:172634025_T_TTG:172634025:1,0,1,0
chr3	172634206	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=134,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,2:13,0:0|1:172634206_C_T:172634206:5,16,1,1
chr3	172634208	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=134,58;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,2:12,0:0|1:172634206_C_T:172634206:5,16,1,1
chr3	174815037	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:15,1:10,3:9,19,1,3
chr3	175165201	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	175189406	.	CT	C	.	.	DP=96;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=245.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.988:77:0,31:0,44:0,0,59,18
chr3	175189417	.	G	A	.	.	DP=95;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,33:0.370:89:28,10:28,21:37,19,28,5
chr3	175189447	.	G	A	.	.	DP=116;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,39:0.377:104:31,14:33,25:37,28,23,16
chr3	175521082	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=215,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	176765253	.	G	A	.	.	DP=118;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=430.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,115:0.992:115:0,52:0,58:0|1:176765253_G_A:176765253:0,0,83,32
chr3	176765269	.	T	C	.	.	DP=133;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=155.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,56:0.440:128:30,36:40,20:0|1:176765253_G_A:176765253:51,21,39,17
chr3	176769608	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,5:7,2:0,13,0,7
chr3	178545952	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=123,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:6,11:4,4:4,6,9,6
chr3	178785549	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=137.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,24:0,18:0,0,14,28
chr3	178917005	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr3	178919397	.	A	ATTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=15,14;MFRL=170,199;MMQ=60,43;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.552:5:0,0:0,0:0,2,0,3
chr3	178921253	.	G	GTAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr3	178921564	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=150,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0,8,0,2
chr3	178922222	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,3:4,7:6,0,10,0
chr3	178922274	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=74.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,27:0.549:49:8,12:14,15:20,2,19,8
chr3	178922430	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:6,8:11,7:0,17,0,15
chr3	178935943	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,170;MMQ=43,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:7,11:5,6:12,0,17,0
chr3	178936082	.	G	A	.	.	DP=196;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,137;MMQ=54,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=68.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:151,34:0.184:185:67,17:79,16:82,69,18,16
chr3	178938747	.	A	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=143,144;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=104.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,38:0.534:71:15,17:17,21:27,6,36,2
chr3	178942431	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=62.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:1,10:7,7:6,2,18,0
chr3	178960607	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=190,167;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.597:20:3,7:4,4:8,0,12,0
chr3	178960766	.	CT	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,145;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=67.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.549:46:12,13:8,12:9,12,5,20
chr3	178962491	.	G	GA	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=23,19;MFRL=147,142;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.310:32:3,2:9,2:3,19,3,7
chr3	178962517	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=129,146;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:5,3:11,4:0,16,1,6
chr3	178984575	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	179083024	.	AT	A	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=143,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,9:0.127:60:21,5:22,4:9,42,5,4
chr3	179083079	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:5,9:5,7:0,10,0,16
chr3	179085716	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=185,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.530:30:6,8:8,8:14,0,16,0
chr3	179085722	.	G	GTA	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=147,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TA;STR;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.655:24:3,7:5,8:8,0,16,0
chr3	179085775	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=98.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,36:0.483:75:20,23:15,12:28,11,27,9
chr3	179092989	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:6,8:11,8:14,4,14,3
chr3	179096508	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,154;MMQ=36,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.956:42:1,21:0,19:1,0,32,9
chr3	179103342	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=207,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,4:1,1:3,0,5,1
chr3	179109735	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:6,3:9,10:14,1,13,0
chr3	179119177	.	T	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=159,203;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,6:0.111:61:30,0:23,6:0,55,0,6
chr3	179122918	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=206,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr3	179291308	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.492:26:5,8:7,5:2,11,0,13
chr3	179298584	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=176,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,2:8,2:11,5,1,3
chr3	179301051	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,2:5,6:8,0,8,0
chr3	179305654	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=62,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:5,1,5,0
chr3	179399570	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr3	179448066	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=41.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.948:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr3	179448383	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:2,1:5,4:3,4,4,1
chr3	179463057	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.484:2:0,0:1,0:0|1:179463057_T_G:179463057:1,0,0,1
chr3	179463063	.	C	CCTGGATTGGGTGGCAGCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:179463057_T_G:179463057:1,0,0,1
chr3	179481738	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.411:8:1,1:2,2:5,0,3,0
chr3	179481971	.	CTG	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=TG;STR;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.858:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr3	179482030	.	T	TCTTAATGAATGTGGGGTGCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,89601616;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chr3	180319981	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr3	180320897	.	ATT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:8,0:8,2:12,6,1,1
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chr3	180360046	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr3	180365043	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.898:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr3	180630565	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,31:0.543:57:17,14:9,17:8,18,8,23
chr3	180693215	.	GT	G,GTT,GTTT	.	.	DP=195;ECNT=1;MBQ=33,33,33,33;MFRL=134,129,136,106;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,18,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=26.12,30.69,9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:58,27,26,12:0.181,0.241,0.098:123:29,18,11,5:26,8,14,7:20,38,24,41
chr3	181431226	.	GA	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:10,4:12,1:17,9,2,3
chr3	182546017	.	C	A	.	.	DP=138;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=176.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,64:0.502:127:25,35:38,27:12,51,8,56
chr3	182559786	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=123,185;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.398:18:3,3:8,4:3,8,6,1
chr3	182559795	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=125,192;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:8,0:0|1:182559795_GT_G:182559795:5,13,2,0
chr3	182559798	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,16;MFRL=125,192;MMQ=60,40;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,0:0|1:182559795_GT_G:182559795:5,13,2,0
chr3	182575631	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.384:32:12,4:7,8:15,5,10,2
chr3	182576923	.	T	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=113.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,40:0.507:79:15,19:24,21:27,12,33,7
chr3	182583990	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,7:5,7:9,0,14,0
chr3	182587126	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,5:4,3:0,7,0,8
chr3	182590096	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=163,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,2:6,0:17,0,2,0
chr3	182590354	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.442:50:14,12:14,10:1,27,2,20
chr3	182598863	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.604:31:6,7:6,11:0,12,0,19
chr3	182603666	.	A	AT	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=60.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,28:0.534:52:11,14:13,13:24,0,28,0
chr3	182603693	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=86.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,31:0.498:62:15,17:16,13:30,1,29,2
chr3	182631792	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.360:34:9,8:13,4:7,15,2,10
chr3	182665109	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,2:15,0:7,18,0,2
chr3	182735182	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr3	182804385	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
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chr3	182853414	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=166,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:3,0,3,0
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chr3	182858287	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=88.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,14:0,0,15,14
chr3	182858461	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr3	182870082	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr3	182913092	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.663:33:4,9:6,13:0,11,0,22
chr3	182946002	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr3	182987515	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr3	183013137	.	C	G	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=139,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,5:0.065:88:49,0:34,5:44,39,3,2
chr3	183368891	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.480:42:6,11:15,9:7,15,10,10
chr3	183493624	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:9,1:2,1:11,0,2,0
chr3	183493743	.	CGGA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=97,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GGA;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:5,0:3,2:4,5,0,2
chr3	183493991	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	183516808	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,66038149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,1:9,1:4,13,0,2
chr3	183521942	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:21,4:13,2:10,24,1,5
chr3	183526969	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:10,2:7,5:2,15,3,4
chr3	183535763	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=123,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.533:17:6,4:1,5:7,1,9,0
chr3	183558497	.	CT	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.225:22:5,3:6,1:0,17,0,5
chr3	183665062	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,5:2,1:4,1,6,0
chr3	183677501	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=164,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:12,8:10,6:19,3,10,4
chr3	183679392	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=139,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:12,4:7,0:9,10,2,2
chr3	183679532	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	183682897	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,6:3,0:5,0,6,0
chr3	183689339	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:8,1,2,0
chr3	183689610	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=124,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.540:46:11,14:10,10:5,16,12,13
chr3	183750942	.	C	CTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=174,139;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr3	183756426	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=138,144;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.284:37:13,6:12,4:14,13,3,7
chr3	183756780	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.347:18:8,4:4,2:1,11,3,3
chr3	183773250	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr3	183776469	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=215,269;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr3	183822504	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=22,21;RU=A;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.822:3:0,0:0,3:0|1:183822504_CA_C:183822504:0,0,3,0
chr3	183822528	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,13;MFRL=130,137;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.489:6:0,0:1,0:0|1:183822504_CA_C:183822504:1,2,3,0
chr3	183822533	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=34,13;MFRL=136,137;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.432:7:1,0:2,0:0|1:183822504_CA_C:183822504:2,2,3,0
chr3	183822535	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=145,137;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.350:9:2,0:2,0:0|1:183822504_CA_C:183822504:4,2,3,0
chr3	183822539	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=143,137;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.319:10:4,0:3,1:0|1:183822504_CA_C:183822504:4,3,3,0
chr3	183857820	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,3:6,0:6,3,3,0
chr3	183882461	.	T	TG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=162,337;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:10,2:0|1:183882461_T_TG:183882461:6,12,0,2
chr3	183882462	.	T	TACC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=162,337;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:8,0:10,2:0|1:183882461_T_TG:183882461:6,12,0,2
chr3	183896641	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=91.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,13:0,0,16,10
chr3	183900095	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,3:7,0:0,12,0,3
chr3	183900680	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=119.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,25:0,8:0,0,8,27
chr3	183900729	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr3	183903935	.	C	CG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr3	183904232	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,6,10
chr3	183905103	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr3	183906448	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,37;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	183906515	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,7,7
chr3	183907792	.	TG	CC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=208,90;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr3	183957112	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	183958945	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,0:10,3:11,10,3,0
chr3	183994449	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=149,51;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:1,7,1,1
chr3	183995854	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,2,3
chr3	183996213	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,2,1
chr3	184010048	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.465:26:7,7:7,5:4,10,2,10
chr3	184020100	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,1:5,6:11,0,7,0
chr3	184022272	.	GCA	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:184022272_GCA_G:184022272:0,5,0,2
chr3	184022280	.	G	GTGTGTGTAA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:184022272_GCA_G:184022272:0,4,0,2
chr3	184022282	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:184022272_GCA_G:184022272:0,4,0,2
chr3	184022285	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:3,2:0|1:184022272_GCA_G:184022272:0,4,0,2
chr3	184026703	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=190,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr3	184038874	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:4,5:11,5:0,15,0,10
chr3	184040128	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,21:0.423:50:17,14:12,6:29,0,19,2
chr3	184046355	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr3	184060122	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,234;MMQ=60,47;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:184060122_G_C:184060122:0,0,0,1
chr3	184060127	.	AC	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:184060122_G_C:184060122:0,0,0,1
chr3	184062644	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=129,81;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.275:8:3,0:3,1:0|1:184062644_G_A:184062644:4,2,1,1
chr3	184062647	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=129,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.275:8:3,0:2,1:0|1:184062644_G_A:184062644:4,2,1,1
chr3	184070675	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=250,82;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,1,1
chr3	184071017	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,18:0.613:29:6,9:3,8:0|1:184071017_G_A:184071017:7,4,8,10
chr3	184071019	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,18:0.613:29:7,10:4,8:0|1:184071017_G_A:184071017:7,4,8,10
chr3	184072459	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,98;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,4:1,4:0,1,3,6
chr3	184075958	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,2:4,5:7,4,7,0
chr3	184090266	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=116,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.476:40:12,10:9,9:21,0,16,3
chr3	184090609	.	C	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.083:58:22,3:30,1:18,36,1,3
chr3	184091149	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=77,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,3:5,1:4,1,3,1
chr3	184094183	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	184100961	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	184280169	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.748:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr3	184293564	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=182,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:2,1:1,2:3,0,4,0
chr3	184295008	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=141,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,1,1
chr3	184295316	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.760:22:1,9:3,7:0,5,3,14
chr3	184295828	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=110,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr3	184299308	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=190,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:9,7:0,6:6,3,10,3
chr3	184429133	.	A	ATCC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TCC;STR;TLOD=46.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,4:0,2:0,0,10,1
chr3	184587434	.	A	AAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr3	184616504	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,1,17
chr3	184642587	.	A	ATT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=198,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,1:1,0,5,0
chr3	184654166	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,1,12
chr3	184658058	.	T	TTA,TTATA,TTATATA	.	.	DP=131;ECNT=1;MBQ=34,33,31,23;MFRL=0,138,154,112;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,21,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=9,10,11,12;RU=TA;STR;TLOD=29.60,155.67,14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,13,51,9:0.165,0.688,0.126:74:0,6,16,1:1,5,23,5:0,1,5,68
chr3	184675359	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=121.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,13:0,20:0,0,1,33
chr3	184682214	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr3	184700356	.	A	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=216.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,29:0,34:0,0,35,29
chr3	184717703	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	185155430	.	C	CT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.717:13:1,3:3,5:1,3,1,8
chr3	185167941	.	A	AAAGTTTGTTGCAAAGTGTTTATAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	185169030	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,6:1,1:2,0,7,0
chr3	185212593	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=204,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,3:0,4:0,2,0,7
chr3	185226492	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr3	185232169	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=121,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:4,1,7,0
chr3	185307879	.	A	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=202.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,31:0,29:0,0,53,9
chr3	185308069	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,0,8
chr3	185316123	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.489:18:5,3:4,4:8,1,9,0
chr3	185327217	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:185327217_G_T:185327217:0,4,0,1
chr3	185327218	.	C	CCAATTTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:185327217_G_T:185327217:0,4,0,1
chr3	185330304	.	TTGA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=102.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,24,0
chr3	185339575	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:5,0,4,1
chr3	185341970	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	185347459	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	185393286	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=197,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:9,0:2,3:1,10,0,3
chr3	185541057	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=22,12;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.136:38:9,0:8,0:8,24,0,6
chr3	185635634	.	AC	CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.176:21:8,2:7,1:0,18,0,3
chr3	185766711	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=194,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr3	185879296	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	185960414	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=89,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.503:10:2,2:3,3:2,3,0,5
chr3	186015283	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:6,5,0,2
chr3	186015303	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:3,4,0,2
chr3	186276393	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:8,4:6,3:0,14,0,7
chr3	186288814	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.672:1:0,0:0,1:0|1:186288814_G_GA:186288814:0,0,0,1
chr3	186288818	.	G	GAACATCACATACCGGGGCCTTTCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:186288814_G_GA:186288814:0,0,0,1
chr3	186295417	.	A	AT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=21,26;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.458:28:3,7:5,2:15,0,11,2
chr3	186302391	.	A	AGTGTGTGTGTGT,ATTGTGTGTGTGT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,31,30;MFRL=199,175,106;MMQ=60,40,60;MPOS=18,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.33,12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,12:0.340,0.488:16:0,1,3:1,2,4:0,1,4,11
chr3	186302458	.	ATAGAAGAACTCTC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=193,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186302458_ATAGAAGAACTCTC_A:186302458:0,1,0,1
chr3	186302477	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=193,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:186302458_ATAGAAGAACTCTC_A:186302458:0,1,0,1
chr3	186338692	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=130,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:6,9,0,2
chr3	186358768	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=161,14701770;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:11,1,2,0
chr3	186360409	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:4,1:2,3:1,6,0,4
chr3	186386664	.	T	TA,TAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33,23;MFRL=0,171,144;MMQ=60,60,60;MPOS=18,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=A;STR;TLOD=10.12,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,2:0.595,0.305:7:0,3,0:0,2,1:0,0,7,0
chr3	186393073	.	GGTGTGTGTGTGT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=13,35;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,6;RU=GT;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.535:2:0,1:0,0:0,1,1,0
chr3	186435583	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr3	186435591	.	T	TCA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=136,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CA;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0,4,1,1
chr3	186435608	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=181,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr3	186438037	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,5:2,9:2,3,5,9
chr3	186442940	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=145,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,0:6,2:12,3,1,1
chr3	186445186	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=158,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr3	186501502	.	C	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,32:0.465:69:17,9:20,23:5,32,3,29
chr3	186504148	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,4:2,5:1,8,3,6
chr3	186507117	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:13,1:15,1:0,29,0,2
chr3	186507922	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,36:0.587:61:17,24:7,12:10,15,19,17
chr3	186508247	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:9,3:2,5:0,11,0,8
chr3	186509517	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.426:40:12,9:11,7:12,11,9,8
chr3	186515356	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,17:0.439:39:12,9:10,8:11,11,9,8
chr3	186518806	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:1,1:3,4:4,0,6,0
chr3	186522293	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:8,1:4,4:12,0,5,0
chr3	186571123	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,7:0,0,0,20
chr3	186793647	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,1:1,4,1,4
chr3	186938956	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=57.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,4:0,0,2,16
chr3	186961478	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	186965268	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,1:9,3:0,13,0,4
chr3	186967942	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr3	186969624	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=124,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.386:4:2,0:0,1:0|1:186969624_A_C:186969624:0,3,0,1
chr3	186969631	.	T	TGCAGAGCCTTGCCTGGGAAAGGGGA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.486:3:1,0:0,1:0|1:186969624_A_C:186969624:0,2,0,1
chr3	186980285	.	GGA	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GA;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:15,3:13,1:23,8,4,0
chr3	187088903	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=139,139;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.528:34:5,6:11,12:3,13,6,12
chr3	187088923	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.386:29:6,2:11,9:7,11,3,8
chr3	187088926	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,9:0,19:0,0,9,19
chr3	187387896	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.401:21:5,3:7,4:7,6,6,2
chr3	187416253	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:3,1,4,1
chr3	187419661	.	G	GCCTGCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,2:0,0,3,1
chr3	187442662	.	G	GCTCCACCTCCTTCCCTGCC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=259,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTCCACCTCCTTCCCTGCC;STR;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.772:10:1,3:1,1:2,0,6,2
chr3	188123819	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr3	188202550	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0|1:188202550_A_T:188202550:0,0,0,8
chr3	188202582	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:188202550_A_T:188202550:0,0,0,4
chr3	188327612	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=162,66;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,2:7,0:0|1:188327612_G_T:188327612:0,11,1,1
chr3	188327628	.	C	CATTAAATCATAACTGTTATTGCCT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=175,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:6,0:0|1:188327612_G_T:188327612:0,12,1,1
chr3	188477999	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=152,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.117:40:17,4:19,0:20,16,3,1
chr3	188590358	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr3	189028117	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:4,3:2,3:6,0,6,1
chr3	189349247	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,5:4,6:8,0,10,1
chr3	189507518	.	C	CAGAG	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=64.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.465:39:12,6:9,10:21,0,17,1
chr3	189547652	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:5,7:4,7:9,0,13,1
chr3	189547697	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.404:40:10,7:13,8:14,10,11,5
chr3	189590824	.	GG	CA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=141.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,22:0,11:0,0,2,31
chr3	189604149	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr3	189604160	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,8,4
chr3	189607152	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.251:42:21,7:10,3:17,15,6,4
chr3	189688569	.	C	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=244.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.987:71:0,30:0,41:0,0,53,18
chr3	189690816	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=85,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.790:12:0,2:1,2:1,1,2,8
chr3	189690861	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,2,5
chr3	189692565	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	189702395	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.941:13:0,3:0,8:0,0,3,10
chr3	189705542	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,0:0,6:0,0,1,5
chr3	189706661	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:8,5:10,6:15,3,10,1
chr3	189712089	.	GG	AA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,4,10
chr3	189712094	.	A	AAAAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,45;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AAAC;STR;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.897:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	189837993	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:5,1,3,0
chr3	190147561	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,121;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:9,0:7,2:0,16,0,2
chr3	190282197	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,0,18
chr3	190322271	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=208,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.660:10:2,3:1,4:0|1:190322271_T_C:190322271:0,3,0,7
chr3	190322277	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=208,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:0|1:190322271_T_C:190322271:0,2,0,7
chr3	190338039	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr3	190341241	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr3	190341292	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	190345043	.	TTTTTG	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTTG;STR;TLOD=36.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.921:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr3	190345098	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,7:0,12:0,0,10,9
chr3	190347391	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,11:0,0,1,14
chr3	190578743	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	190936482	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,4,0
chr3	190967718	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr3	190986110	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,17:0.476:36:10,7:8,10:17,2,16,1
chr3	190995847	.	T	C	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=172.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,54:0.550:98:20,29:24,25:39,5,45,9
chr3	190999790	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:3,3:4,7:7,1,10,0
chr3	190999872	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=130,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,22:0.362:61:20,11:19,10:27,12,16,6
chr3	190999990	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.370:36:11,8:11,5:5,18,3,10
chr3	191074783	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr3	191074796	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=141,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.296:12:3,2:5,1:8,1,3,0
chr3	191075012	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,2,11
chr3	191093384	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:0,9:1,12:1,0,4,17
chr3	191093434	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=125,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,4:1,8:0,1,1,12
chr3	191093475	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=283,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:0,5:0,1,1,6
chr3	191097908	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=240,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=146.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,42:0.956:43:1,26:0,16:1,0,41,1
chr3	191097928	.	GT	G,GTT,GTTT	.	.	DP=66;ECNT=3;MBQ=33,29,34,30;MFRL=170,141,125,167;MMQ=60,60,60,60;MPOS=11,21,5;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,14,16,17;RU=T;STR;TLOD=4.85,21.32,3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:21,7,14,5:0.125,0.336,0.106:47:9,5,11,2:11,1,3,2:20,1,21,5
chr3	191097966	.	T	C	.	.	DP=103;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=248.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,98:0.980:99:1,44:0,38:0,1,64,34
chr3	191098121	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=177.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,22:0,27:0,0,2,47
chr3	191098731	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=257.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,34:0,43:0,0,11,67
chr3	191100448	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=98.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,19:0,9:0,0,28,0
chr3	191178925	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=123,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:6,1,1,4
chr3	191178962	.	CT	AG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:6,6:6,7:9,3,10,3
chr3	191179296	.	GGT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=208,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:0|1:191179296_GGT_G:191179296:0,3,0,1
chr3	191179302	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=208,163;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:191179296_GGT_G:191179296:0,3,0,1
chr3	191888452	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=128,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.435:5:0,0:1,0:0,3,0,2
chr3	192635348	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr3	192994543	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=225.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,64:0.985:64:0,30:0,30:0,0,40,24
chr3	193016895	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=127.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,31,6
chr3	193023255	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr3	193028548	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=34,20;MFRL=118,66;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0|1:193028548_G_C:193028548:0,5,1,1
chr3	193028554	.	T	TCC	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=131,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:2,2:0|1:193028548_G_C:193028548:0,4,1,1
chr3	193028556	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=108,66;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,1:0|1:193028548_G_C:193028548:0,3,1,1
chr3	193028562	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=66,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1|0:193028548_G_C:193028548:0,3,0,1
chr3	193028563	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=108,66;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:193028548_G_C:193028548:0,3,0,1
chr3	193028564	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=66,108;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,1:3,0:1|0:193028548_G_C:193028548:0,3,0,1
chr3	193028568	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,31;MFRL=77,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:193028548_G_C:193028548:0,2,0,1
chr3	193029535	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=181,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	193044923	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=86.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,1,22
chr3	193062906	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,2,15
chr3	193068800	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=185,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,5:3,6:7,0,10,1
chr3	193071888	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.690:7:1,3:1,1:2,0,4,1
chr3	193081206	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=142,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,4:3,0:1,4,2,2
chr3	193081235	.	A	AGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=168,94;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:193081235_A_AGT:193081235:0,4,0,1
chr3	193081237	.	ATAC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=168,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:193081235_A_AGT:193081235:0,4,0,1
chr3	193081830	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr3	193081864	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:7,5:6,6:13,0,11,0
chr3	193081866	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:5,6:6,6:11,0,13,0
chr3	193120359	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	193120726	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	193153562	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,2,9
chr3	193180510	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=135,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:7,3,4,0
chr3	193180661	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=149,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0,7,0,2
chr3	193180732	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=202,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr3	193188579	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:12,0,2,0
chr3	193210596	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:4,1:4,4:8,0,6,0
chr3	193220219	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:6,1,3,1
chr3	193272442	.	CGTGTGTGT	C,CGTGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=125,156,170;MMQ=60,60,60;MPOS=26,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,15;RU=GT;STR;TLOD=6.65,6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.396,0.391:5:0,2,0:0,0,2:1,0,3,1
chr3	193332420	.	C	CTGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TG;STR;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr3	193336639	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:6,6:6,6:11,2,9,3
chr3	193355074	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=270.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,84:0.977:85:0,48:1,36:0,1,27,57
chr3	193355102	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,25:0.491:51:14,15:12,10:4,22,5,20
chr3	193365057	.	C	CTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	193365974	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:5,6:4,3:1,9,0,9
chr3	193384203	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:12,2:5,8:2,15,1,9
chr3	193385275	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=198,240;MMQ=50,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:193385275_CA_TG:193385275:0,2,0,2
chr3	193385286	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=198,272;MMQ=50,47;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:193385275_CA_TG:193385275:0,2,0,1
chr3	193385289	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=198,272;MMQ=50,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:193385275_CA_TG:193385275:0,2,0,1
chr3	193386462	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=231,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr3	193854148	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=122;ECNT=1;MBQ=30,30,31,28;MFRL=129,147,118,118;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,19,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=15.87,23.12,6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:30,13,23,15:0.135,0.251,0.166:81:9,5,6,8:15,4,10,4:23,7,33,18
chr3	194080648	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:1,5:6,6:5,2,7,4
chr3	194080983	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,33:0.533:62:13,15:15,18:15,14,22,11
chr3	194149700	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,20:0.396:51:19,12:12,8:1,30,0,20
chr3	194165579	.	T	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,3:0.058:63:30,0:26,2:0|1:194165579_T_A:194165579:4,56,1,2
chr3	194165585	.	T	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,2:0.050:58:24,0:27,1:0|1:194165579_T_A:194165579:4,52,0,2
chr3	194168500	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,5:5,8:9,0,13,0
chr3	194168811	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=201,182;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:2,2:0,6,0,2
chr3	194176712	.	C	A	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=101.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,35:0.474:74:23,19:16,15:7,32,5,30
chr3	194180743	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:2,1:7,5:1,9,0,6
chr3	194324939	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=158,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:10,3:7,3:15,2,6,0
chr3	194324982	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,17:0.366:47:14,6:13,10:21,9,12,5
chr3	194325006	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,30:0.563:53:11,16:10,14:14,9,16,14
chr3	194325010	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,24:0.436:55:17,12:12,11:16,15,14,10
chr3	194346544	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:194346544_T_A:194346544:0,0,4,0
chr3	194346553	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0|1:194346544_T_A:194346544:0,0,7,0
chr3	194346803	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,0,14
chr3	194346822	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=183,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:2,2:1,1:0,4,0,3
chr3	194349027	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,5:0,0,15,0
chr3	194353772	.	C	CCCGCCCGACAG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCGCCCGACAG;STR;TLOD=62.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,7:0,0,15,0
chr3	194354032	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	194362721	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	194369579	.	CC	AA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,7:4,2:0,6,1,8
chr3	194373832	.	TG	CA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=197.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,22:0,22:0,0,15,30
chr3	194379596	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,23,2
chr3	194379646	.	T	TC	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=139.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,48:0.961:49:1,23:0,24:1,0,33,15
chr3	194379903	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,0:14,2:3,22,1,1
chr3	194379905	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=20,31;MFRL=61,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=59.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.882:23:0,9:2,12:1,1,0,21
chr3	194379959	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,0,11
chr3	194386881	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,12:0,0,20,2
chr3	194390713	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=90.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,14:0,0,21,6
chr3	194390869	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,7:0,6:0,0,7,7
chr3	194408704	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=204,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr3	194409257	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.304:16:3,3:5,2:5,6,3,2
chr3	194999996	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,24,0
chr3	195012343	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:19,0,2,0
chr3	195022428	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,3,20
chr3	195022931	.	TA	T,TAA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=145,168,174;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=5.18,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,4,5:0.112,0.139:37:14,3,2:13,1,3:0,28,1,8
chr3	195053916	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,2:0,8:0,0,0,11
chr3	195063453	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr3	195102610	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=149,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.055:53:32,1:14,0:46,5,0,2
chr3	195102787	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=127.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.975:35:0,21:0,12:0,0,1,34
chr3	195245805	.	G	A	.	.	DP=112;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=131.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,46:0.427:108:31,25:30,21:38,24,32,14
chr3	195295708	.	G	GGGGGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=101,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGT;STR;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.917:14:0,4:1,7:1,0,13,0
chr3	195300676	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:4,2,8,0
chr3	195447805	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,149;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,2:6,4:13,1,6,0
chr3	195451880	.	AG	GA	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=131,136;MMQ=27,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=164.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,42:0.599:70:12,20:12,21:19,9,27,15
chr3	195452908	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,155;MMQ=49,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:20,5:15,1:21,14,5,1
chr3	195453017	.	GC	G	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=72.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,29:0.410:71:21,21:20,8:13,29,11,18
chr3	195453064	.	T	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,32:0.577:55:6,22:16,8:11,12,8,24
chr3	195475989	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=226,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr3	195478169	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=157,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.297:18:3,0:5,1:4,9,0,5
chr3	195487810	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:15,1:9,1:17,7,0,2
chr3	195490284	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=207,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr3	195492027	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,3,9
chr3	195506753	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.968:27:0,10:0,17:0,0,7,20
chr3	195508348	.	G	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=126,154;MMQ=52,43;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.072:63:23,0:33,2:27,31,3,2
chr3	195508747	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,265;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:195508747_AC_A:195508747:0,0,0,1
chr3	195508751	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,265;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:195508747_AC_A:195508747:0,0,0,1
chr3	195508754	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,265;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:195508747_AC_A:195508747:0,0,0,1
chr3	195510060	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=107,162;MMQ=48,29;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,5:0.088:66:25,1:34,4:25,36,1,4
chr3	195510217	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,40;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr3	195510700	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=95,84;MMQ=30,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:5,3:12,0:12,5,2,1
chr3	195510749	.	C	CGGAAGTGTCGGTGACATGAAGAGGGGTGGCATGACCTGTGGATACTGA	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=149,128;MMQ=47,38;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,38:0.952:39:0,7:1,10:1,0,32,6
chr3	195510984	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=113,54;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.086:36:8,2:22,0:0|1:195510984_T_G:195510984:12,21,1,2
chr3	195510986	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=113,54;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.086:36:9,3:24,0:0|1:195510984_T_G:195510984:12,21,1,2
chr3	195512447	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=111,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,4:0.086:56:23,2:22,2:0|1:195512447_G_A:195512447:27,25,1,3
chr3	195512476	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=111,138;MMQ=52,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.102:42:18,2:14,1:0|1:195512447_G_A:195512447:21,17,2,2
chr3	195512930	.	G	C	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=120,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,9:0.120:80:37,3:32,5:33,38,5,4
chr3	195513868	.	G	GTGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=215,202;MMQ=21,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:195513868_G_GTGT:195513868:0,1,0,1
chr3	195513869	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=215,202;MMQ=21,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:195513868_G_GTGT:195513868:0,1,0,1
chr3	195513872	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=215,202;MMQ=21,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:195513868_G_GTGT:195513868:0,1,0,1
chr3	195515452	.	G	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=89,0;MMQ=56,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.103:56:14,5:34,0:30,21,3,2
chr3	195515566	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,5:0.093:62:21,2:32,3:0|1:195515566_G_A:195515566:33,24,4,1
chr3	195515572	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,5:0.090:65:23,2:33,3:0|1:195515566_G_A:195515566:37,23,4,1
chr3	195515582	.	G	T	.	.	DP=74;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,6:0.095:71:26,2:33,4:0|1:195515566_G_A:195515566:38,27,5,1
chr3	195515594	.	C	G	.	.	DP=77;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=147,125;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=131.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,42:0.562:75:17,18:16,22:17,16,26,16
chr3	195515617	.	G	C	.	.	DP=87;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=119,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,35:0.409:85:24,16:25,16:17,33,17,18
chr3	195516442	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,6:0.126:50:23,5:19,0:24,20,5,1
chr3	195517105	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=157,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:14,0:13,2:0|1:195517105_G_C:195517105:10,18,1,1
chr3	195517107	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=157,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:13,0:13,2:0|1:195517105_G_C:195517105:10,18,1,1
chr3	195517518	.	TG	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,7:0.143:54:25,2:18,5:0|1:195517518_TG_T:195517518:17,30,4,3
chr3	195517521	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,7:0.143:54:25,2:20,5:0|1:195517518_TG_T:195517518:17,30,4,3
chr3	195518036	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:9,5:12,9:15,6,8,6
chr3	195594151	.	CCT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:5,4:6,6:3,8,1,9
chr3	195596501	.	T	TAG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AG;STR;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,4:0,6:0,0,1,10
chr3	195596534	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=126,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:1,7,0,2
chr3	195596907	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=75.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,19,1
chr3	195599085	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,14:0,11:0,0,22,3
chr3	195779155	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:0,5:2,1:0,2,0,6
chr3	195780239	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=164,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:6,2:5,0:11,3,2,0
chr3	195782176	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:8,3:3,2:0|1:195782176_CA_TG:195782176:5,8,0,6
chr3	195782184	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:6,2:5,4:0|1:195782176_CA_TG:195782176:3,8,0,6
chr3	195789376	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=199,168;MMQ=44,41;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:4,5:10,7:14,0,12,0
chr3	195789383	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=173,210;MMQ=44,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:8,1:16,1:24,1,2,0
chr3	195789394	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=164,212;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:12,2:21,0:29,5,2,0
chr3	195789414	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=131,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.420:48:13,10:15,10:14,14,14,6
chr3	195789428	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=185.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,21:0,32:0,0,29,25
chr3	195789708	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,6:6,5:5,4,5,6
chr3	195798258	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=94.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,8:0,0,22,4
chr3	195800999	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,225;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.074:52:24,0:25,3:14,35,3,0
chr3	195804021	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=80.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,29:0.461:63:17,15:17,14:5,29,7,22
chr3	195925103	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr3	195935207	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=165,47;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,4:3,1:2,1,5,0
chr3	195936446	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=189,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:2,2:0,5,0,2
chr3	195937678	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	195943482	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.813:3:0,2:0,1:0|1:195943482_A_C:195943482:0,0,3,0
chr3	195943486	.	CGG	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:195943482_A_C:195943482:0,0,2,0
chr3	195943491	.	CAGG	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0|1:195943482_A_C:195943482:1,0,2,0
chr3	195943495	.	CAAG	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:0|1:195943482_A_C:195943482:1,0,2,0
chr3	195943501	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=26,23;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:195943482_A_C:195943482:1,0,2,0
chr3	195943504	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,21;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:195943482_A_C:195943482:1,0,2,0
chr3	195943511	.	CGG	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,12;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.507:2:1,0:0,0:0|1:195943482_A_C:195943482:1,0,1,0
chr3	195968818	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,1:9,1:11,10,1,1
chr3	195975284	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=285,233;MMQ=41,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	195984835	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	196051403	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:7,6:6,6:0,13,1,11
chr3	196054488	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:0,9,1,4
chr3	196096451	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	196118621	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,2:2,5:6,0,7,0
chr3	196159274	.	ACCG	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCG;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.058:48:22,2:19,0:6,40,1,1
chr3	196210590	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.356:15:6,3:3,2:9,1,5,0
chr3	196210808	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,6:4,3:0,5,1,8
chr3	196215451	.	CA	C,CAA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=149,162,117;MMQ=60,60,60;MPOS=14,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=51.04,3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,24,3:0.519,0.085:44:11,12,2:6,11,1:15,2,19,8
chr3	196215660	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=165,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:2,2:5,4:0,7,1,6
chr3	196229845	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:23,3:19,0:26,16,1,2
chr3	196434364	.	AGTCTG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=249,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr3	196435331	.	CAG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:3,4:7,1,8,0
chr3	196443803	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=123,144;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.395:36:12,4:10,10:10,12,5,9
chr3	196443826	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.355:20:7,1:6,5:4,9,2,5
chr3	196532148	.	CT	C,CTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=155,126,151;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.74,5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,4:0.173,0.200:22:10,1,2:2,3,2:13,1,8,0
chr3	196533587	.	TG	CA	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.058:49:22,0:22,2:11,36,0,2
chr3	196554020	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=184.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,33:0,21:0,0,48,6
chr3	196627335	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=167,55;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:6,4:1,3:2,6,1,7
chr3	196627361	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=129,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,4:0,0:1,4,0,4
chr3	196657670	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=70.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.959:28:0,8:1,18:1,0,19,8
chr3	196666059	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr3	196674259	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,2,1
chr3	196674916	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=139,193;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:1,2:8,2:5,4,2,2
chr3	196674919	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:4,6,2,0
chr3	196674972	.	CT	TC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,7:0,0,4,5
chr3	196675589	.	AGC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:196675589_AGC_A:196675589:0,0,0,1
chr3	196675593	.	C	CTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:196675589_AGC_A:196675589:0,0,0,1
chr3	196746421	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,1:11,0:0|1:196746421_C_G:196746421:17,0,2,0
chr3	196746427	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,2:12,0:0|1:196746421_C_G:196746421:20,1,2,0
chr3	196746433	.	AC	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:7,2:8,0:17,3,2,0
chr3	196749798	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,17,3
chr3	196750016	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	196754819	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=206,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	196778438	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:4,5:6,8:9,1,11,2
chr3	196793466	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=194,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,4:9,4:14,0,8,0
chr3	196817911	.	AAG	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=93.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,25:0.554:45:9,14:9,11:1,19,2,23
chr3	196846437	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:4,7:7,10:1,10,2,15
chr3	196869518	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,3:3,7:8,0,9,1
chr3	196869688	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,10:0,16:0,0,4,22
chr3	196876600	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=81.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,30:0.463:65:11,18:24,12:20,15,17,13
chr3	197023445	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr3	197402226	.	G	GAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=181,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:197402226_G_GAGT:197402226:1,0,0,1
chr3	197402229	.	G	GGCTGAAGGCAGGATTGCTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=181,260;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:197402226_G_GAGT:197402226:1,0,0,1
chr3	197426202	.	G	T,A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,30,32;MFRL=162,150,99;MMQ=60,60,60;MPOS=2,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,1,0:2,0,1:0,2,0,2
chr3	197426204	.	T	G,TC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,29,31;MFRL=162,150,99;MMQ=60,60,60;MPOS=0,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,1,0:2,0,1:0,2,0,2
chr3	197426206	.	G	GTCCTCC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=159,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:197426206_G_GTCCTCC:197426206:0,3,0,1
chr3	197426208	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=159,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:197426206_G_GTCCTCC:197426206:0,3,0,1
chr3	197427707	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,70587391;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:10,2:17,0:19,9,0,2
chr3	197483279	.	A	G	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=245.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.986:70:0,31:0,35:0,0,57,13
chr3	197496984	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=142.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.977:39:0,18:0,21:0,0,37,2
chr3	197500394	.	T	TTTTG	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTG;STR;TLOD=45.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.945:12:0,4:0,7:0,0,0,12
chr3	197508667	.	T	G	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,3:0.059:65:41,2:20,1:54,8,3,0
chr3	197508671	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=149,79;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,2:0.047:62:36,2:23,0:52,8,1,1
chr3	197544200	.	C	CGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=27,0;MFRL=112,133;MMQ=34,36;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.543:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr3	197544201	.	A	ATTTTGTGTGTGTGTGCG,G	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=0,25,32;MFRL=0,133,112;MMQ=60,36,34;MPOS=0,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.69,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.538,0.431:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr3	197544211	.	G	GTATTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=19,33;MFRL=133,112;MMQ=36,34;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:197544211_G_GTATTT:197544211:0,1,0,1
chr3	197544215	.	G	GTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTAACTGGTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=133,112;MMQ=36,34;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:197544211_G_GTATTT:197544211:0,1,0,1
chr3	197544231	.	G	GTATATATATATATATATA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=133,164;MMQ=36,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,18;RU=TA;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	197557635	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=141.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,20:0,19:0,0,36,5
chr3	197562505	.	G	GGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=180,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GT;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr3	197566084	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:5,3:4,2:9,0,6,0
chr3	197574248	.	T	G	.	.	DP=136;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=155.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,53:0.427:125:35,30:37,22:66,6,49,4
chr3	197574960	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:9,11:3,3:0,12,1,13
chr3	197579499	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:16,2:23,0:16,23,0,2
chr3	197597194	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr3	197597227	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=189,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:197597227_G_A:197597227:0,3,0,1
chr3	197597228	.	A	AAAACG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=189,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:197597227_G_A:197597227:0,3,0,1
chr3	197665599	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=227.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,68:0.986:68:0,29:0,36:0,0,26,42
chr3	197672589	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.689:17:3,5:2,7:0,5,1,11
chr3	197702875	.	CT	C,CTT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,35,33;MFRL=146,168,178;MMQ=60,60,60;MPOS=20,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=6.94,6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,5,6:0.125,0.141:44:13,4,2:18,1,4:29,4,11,0
chr3	197710959	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:1,6:7,6:0,8,3,9
chr3	197717568	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=139,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:7,0:8,2:2,13,1,1
chr3	197717643	.	A	ATATT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.875:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	197762958	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=215,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	197894800	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,31;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=36.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr4	53310	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:13,0:16,2:23,7,2,0
chr4	53498	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,12:0,3:0,0,0,15
chr4	59299	.	C	G	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:90,8:0.090:98:53,2:36,6:79,11,7,1
chr4	86101	.	G	GC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=64.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,15,6
chr4	86632	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=166,182;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:3,2,1,1
chr4	87277	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=99,144;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,32:0.944:33:1,10:0,22:0,1,18,14
chr4	87313	.	G	GA	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=134.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,18:0,26:0,0,16,28
chr4	265975	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:13,2:4,0:0|1:265975_G_T:265975:9,8,1,1
chr4	265978	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:13,2:4,0:0|1:265975_G_T:265975:9,8,1,1
chr4	331693	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=39.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,9:0,3:0,0,10,2
chr4	437909	.	T	C	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=134,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=121.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,42:0.544:77:16,13:19,29:13,22,15,27
chr4	521068	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:521068_A_T:521068:0,0,0,1
chr4	521090	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:521068_A_T:521068:0,1,0,1
chr4	527852	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=207,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:527852_G_T:527852:0,4,0,1
chr4	527854	.	G	GATGTAGAAAGGATGTGTTTGATGGACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=207,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:527852_G_T:527852:0,4,0,1
chr4	648715	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=159,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,1:3,3:3,4,1,3
chr4	650749	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=101,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:1,5:8,6:5,5,7,4
chr4	654363	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=94,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:8,9,0,2
chr4	658589	.	CA	TG	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=166,174;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:10,2:15,0:0|1:658589_CA_TG:658589:23,3,2,0
chr4	658590	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=170,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:23,3:0.140:26:8,2:15,1:1|0:658589_CA_TG:658589:21,2,2,1
chr4	666385	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,14;MFRL=116,133;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:0,0:1,0:1,2,0,3
chr4	755025	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.655:27:3,8:6,10:7,2,15,3
chr4	758959	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr4	759733	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	780286	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr4	780549	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=200,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr4	786401	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.616:19:5,6:2,4:2,5,3,9
chr4	843619	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,14;MFRL=162,262;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,0:0,10,2,0
chr4	843622	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=22,16;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=C;STR;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:0,0:1,1:1,3,0,5
chr4	844942	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:6,2:1,0:0|1:844942_A_G:844942:0,7,0,2
chr4	844948	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,12;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,0:0|1:844942_A_G:844942:0,7,0,2
chr4	845772	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr4	858874	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=142,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:1,0,2,0
chr4	860146	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:2,3:2,5:4,0,6,3
chr4	860192	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=105,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.572:31:5,7:8,9:9,4,10,8
chr4	871624	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=133,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:6,5:5,7:2,9,0,12
chr4	871675	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr4	875887	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=185,248;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	887878	.	A	AGGAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=235,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:887878_A_AGGAC:887878:0,1,0,1
chr4	887880	.	G	GAAAAATTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=235,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:887878_A_AGGAC:887878:0,1,0,1
chr4	887884	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	906647	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	942006	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:3,6:1,2:0,4,0,9
chr4	946974	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:8,0,1,3
chr4	954311	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	960713	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	980971	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	995708	.	C	CTCTAAAGCCATTCTCTCTCTGGAATTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:2,2,0,1
chr4	996325	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	1017537	.	G	GGGGGGGGGGCCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=189,235;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr4	1019054	.	CCA	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=95,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:14,1:5,2:12,11,3,0
chr4	1066674	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:7,3:6,4:12,1,5,2
chr4	1067542	.	AGAACCCC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=120,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1067542_AGAACCCC_A:1067542:0,1,0,1
chr4	1067553	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=120,118;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1067542_AGAACCCC_A:1067542:0,1,0,1
chr4	1084701	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	1102050	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,20:0,12:0,0,30,2
chr4	1164277	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,10,9
chr4	1165560	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	1165587	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr4	1326491	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,102;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,2:10,0:0|1:1326491_CT_C:1326491:8,4,1,1
chr4	1326495	.	AAGTT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=153,102;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,2:11,0:0|1:1326491_CT_C:1326491:12,6,1,1
chr4	1332175	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	1345647	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:9,3:5,5:3,11,1,7
chr4	1348806	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	1348888	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:10,5:2,5:11,1,10,1
chr4	1348900	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,1:9,1:17,4,2,0
chr4	1369069	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	1369093	.	CT	GG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	1374774	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,1,15
chr4	1374789	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,1,14
chr4	1388359	.	TGGAGTGCCCGCCTGCTCATGTGCCCATGTGGAGTGCCCGCCTGCTCACACATGTCGATGC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=80,128;MMQ=60,21;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.401:9:1,3:2,0:3,3,0,3
chr4	1389846	.	G	GTGATAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=118,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1389846_G_GTGATAT:1389846:0,1,0,1
chr4	1389848	.	G	GACAATGAAGTCCAGGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=40,35;MFRL=118,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1389846_G_GTGATAT:1389846:0,1,0,1
chr4	1720111	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,1:10,1:10,11,0,2
chr4	1720346	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:0,5,0,5
chr4	1725651	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.479:13:0,3:5,3:0,7,0,6
chr4	1729347	.	AT	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=173,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,1:8,0,3,0
chr4	1729425	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.432:37:9,7:12,6:14,7,8,8
chr4	1732573	.	GGGGT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.602:18:4,7:1,4:6,1,10,1
chr4	1732727	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=194,103;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.243:10:5,2:2,0:0|1:1732727_T_TG:1732727:0,8,0,2
chr4	1732731	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=193,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:0|1:1732727_T_TG:1732727:1,8,0,2
chr4	1732734	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=193,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,2:1,1:1,5,0,3
chr4	1732774	.	GG	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=170,275;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:3,0,0,1
chr4	1737109	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr4	1739252	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr4	1746844	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr4	1807583	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=151,94;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:4,1:7,2,1,2
chr4	1821178	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:3,5,0,2
chr4	1834536	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:17,1:7,1:19,5,2,0
chr4	1836809	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=175,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	1850821	.	ATTTTCAAACCCTG	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:11,0:19,4,1,1
chr4	1851022	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=185,128;MMQ=60,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:1851022_C_T:1851022:0,10,0,2
chr4	1851028	.	TGC	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=185,128;MMQ=60,44;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,1:0|1:1851022_C_T:1851022:0,10,0,2
chr4	1851052	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=192,200;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:1851052_C_T:1851052:0,3,0,2
chr4	1851054	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=192,200;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:1851052_C_T:1851052:0,3,0,2
chr4	1940139	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=17,10;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.335:12:1,0:1,0:0|1:1940139_C_A:1940139:7,1,3,1
chr4	1940141	.	T	TTA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.408:14:4,1:4,3:0|1:1940139_C_A:1940139:7,1,3,3
chr4	1940143	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=17,30;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.408:14:0,2:1,2:0|1:1940139_C_A:1940139:7,1,3,3
chr4	1940322	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	1957100	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=143,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1957100_CT_C:1957100:0,1,0,1
chr4	1957102	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=143,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1957100_CT_C:1957100:0,1,0,1
chr4	1957107	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=143,112;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1957100_CT_C:1957100:0,1,0,1
chr4	1957358	.	C	CGAGATTGGAGAATTCCCTGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,536;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr4	1961137	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,2:0,9:0,0,12,0
chr4	2065941	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2065941_G_A:2065941:0,0,0,1
chr4	2065946	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:2065941_G_A:2065941:0,0,0,1
chr4	2074839	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	2130804	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,21;MFRL=191,217;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,1:2,0,2,0
chr4	2158408	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr4	2176351	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,10:2,4:6,0,12,2
chr4	2176506	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,9:7,5:7,6,1,13
chr4	2176551	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=187,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.451:7:1,2:2,1:0,4,0,3
chr4	2176587	.	CT	TC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=184,208;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr4	2178108	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:0,1:2,4:0,2,0,6
chr4	2178127	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	2178149	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	2181016	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:7,6:6,6:10,3,8,4
chr4	2194901	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:13,4:6,5:17,2,7,2
chr4	2195089	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=228,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:0,4,1,5
chr4	2195128	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=206,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr4	2210239	.	A	AGATTTCAAGACTAATGTGTTCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	2252845	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=143,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,2:3,3:5,2,5,0
chr4	2252980	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=16,33;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.547:17:2,5:1,4:3,5,0,9
chr4	2254285	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=111,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:2254285_T_G:2254285:0,2,0,1
chr4	2254303	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=221,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:2254285_T_G:2254285:0,1,0,1
chr4	2275718	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr4	2275835	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=106,159;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,6:1,8:1,2,8,6
chr4	2322019	.	C	CAAGGAGATTGGGTG	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=158,42;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:2322019_C_CAAGGAGATTGGGTG:2322019:2,7,1,1
chr4	2322021	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=158,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:7,0:2,2:0|1:2322019_C_CAAGGAGATTGGGTG:2322019:2,7,1,1
chr4	2322039	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr4	2337357	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	2343150	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,1:1,4:2,0,6,0
chr4	2343349	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,5:4,5:2,5,1,9
chr4	2502299	.	A	ATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,6:2,0:4,1,6,0
chr4	2513620	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=115,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:6,4:4,2:9,2,6,0
chr4	2744266	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,13;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0,4,0,1
chr4	2822289	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,0:3,3:4,1,3,1
chr4	2829067	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=125,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,2:12,0:0|1:2829067_A_C:2829067:4,15,1,1
chr4	2829070	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=124,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:0|1:2829067_A_C:2829067:4,16,1,1
chr4	2829077	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=123,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:6,1:5,2:2,11,0,3
chr4	2829417	.	G	GACCCA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	2833200	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:2,0,7,0
chr4	2833226	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=163,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:6,0:14,0,2,0
chr4	2833500	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=222,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:1,1,0,3
chr4	2896235	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=178,179;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,2:2,0:3,0,2,0
chr4	2906799	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:13,2:10,0:7,16,0,2
chr4	2933271	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:2,2,6,1
chr4	2934308	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,10:0,0,11,8
chr4	2935013	.	C	CTAAGAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=236,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	2935251	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,7:0,18:0,0,17,10
chr4	2941418	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=215,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,0,5
chr4	2949288	.	G	GTCTC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=TC;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:2949288_G_GTCTC:2949288:3,4,1,1
chr4	2949291	.	A	ATGTATGAAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=129,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:0|1:2949288_G_GTCTC:2949288:3,4,1,1
chr4	2949398	.	GGC	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=12,33;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=-15;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0|1:2949398_GGC_G:2949398:0,1,0,2
chr4	2949402	.	C	CCGGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=-1073741843;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0|1:2949398_GGC_G:2949398:0,2,0,2
chr4	2949405	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=-19;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:2949398_GGC_G:2949398:0,2,0,2
chr4	2949407	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=-20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:0|1:2949398_GGC_G:2949398:0,2,0,2
chr4	2951804	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,23:0.420:55:21,16:11,7:15,17,13,10
chr4	2954211	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2954211_T_C:2954211:0,0,0,1
chr4	2954213	.	TA	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2954211_T_C:2954211:0,0,0,1
chr4	2955192	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.320:20:7,3:6,3:13,1,5,1
chr4	2956244	.	G	GCTTTTCCCATGGTGTGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=120,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr4	3024009	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,2:4,0:14,0,2,0
chr4	3024044	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.260:25:9,4:9,2:18,1,6,0
chr4	3029588	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr4	3039328	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0|1:3039328_C_G:3039328:0,0,0,1
chr4	3039336	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:3039328_C_G:3039328:0,0,0,1
chr4	3040279	.	G	GAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.348:7:1,0:0,1:0,5,0,2
chr4	3131823	.	T	TTTTCCAGATTTGGTCCATTAATG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr4	3144441	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=146,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.400:11:1,1:3,3:7,0,4,0
chr4	3149975	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:1,1:2,6:0,3,2,6
chr4	3180021	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.415:39:14,4:9,12:14,9,12,4
chr4	3180260	.	CA	AT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3180260_CA_AT:3180260:0,0,0,1
chr4	3180265	.	GC	AA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:3180260_CA_AT:3180260:0,0,0,1
chr4	3182189	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,98;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,4:6,0:11,0,4,0
chr4	3210403	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=173,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:3210403_T_A:3210403:3,1,1,0
chr4	3210410	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=173,208;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:3210403_T_A:3210403:3,1,1,0
chr4	3230804	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	3230825	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:3230825_A_T:3230825:0,3,0,1
chr4	3230827	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:3230825_A_T:3230825:0,3,0,1
chr4	3230832	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:3230825_A_T:3230825:0,3,0,1
chr4	3231804	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=102,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:1,2,0,2
chr4	3231813	.	GGGCCCATCT	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.284:5:2,1:2,0:0|1:3231813_GGGCCCATCT_G:3231813:0,4,0,1
chr4	3231827	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:3231813_GGGCCCATCT_G:3231813:0,4,0,1
chr4	3257699	.	AGGC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr4	3318782	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,13;MFRL=163,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.192:17:4,0:4,1:12,2,3,0
chr4	3318912	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,20398934;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:0,20,1,1
chr4	3416633	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=146,40;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:1,6,1,1
chr4	3416651	.	C	CTGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=113,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.307:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr4	3416652	.	A	AAGCAAGAGGAGGGAAGGTCTTCCTGGACC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=141,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.377:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr4	3444519	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=169,35;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:3444519_G_T:3444519:2,6,1,1
chr4	3444521	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=169,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:3444519_G_T:3444519:2,6,1,1
chr4	3445737	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=98,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:8,2:0,0:0|1:3445737_C_T:3445737:7,1,2,0
chr4	3445745	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=81,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.882:15:1,12:0,1:0|1:3445737_C_T:3445737:1,0,12,2
chr4	3446714	.	A	ATAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=151,247;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:3446714_A_ATAGG:3446714:0,2,0,1
chr4	3446715	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=151,247;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:3446714_A_ATAGG:3446714:0,2,0,1
chr4	3446883	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=168,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.576:12:2,4:2,2:5,0,7,0
chr4	3478323	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr4	3487237	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr4	3494404	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	3494419	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	3495283	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:0,10,0,4
chr4	3516588	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:6,1:10,8,0,2
chr4	3516689	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr4	3516742	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	3520734	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:4,3:0,9,1,4
chr4	3526642	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=127,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.467:26:5,7:8,5:6,8,5,7
chr4	3533846	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,10;MFRL=191,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:3533846_T_G:3533846:1,0,1,0
chr4	3533849	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0|1:3533846_T_G:3533846:2,0,1,0
chr4	3533852	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:3533846_T_G:3533846:3,0,1,0
chr4	3533855	.	GA	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:3533846_T_G:3533846:3,0,1,0
chr4	3768868	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=167,62;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr4	3768904	.	TAC	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=195,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0|1:3768904_TAC_T:3768904:2,1,1,1
chr4	3768907	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=195,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:3768904_TAC_T:3768904:2,1,1,1
chr4	3768911	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=195,62;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:3768904_TAC_T:3768904:2,1,1,1
chr4	3769789	.	G	GGGGGAGCTTTCCCAGAGACCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGAGCTTTCCCAGAGACCC;STR;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.808:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr4	4190507	.	C	CTTG	.	.	DP=71;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=147,117;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,26:0.375:70:22,18:21,7:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:31,13,22,4
chr4	4190508	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=147,121;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=100.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,27:0.384:71:22,18:22,7:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:31,13,23,4
chr4	4190511	.	G	GTCACTTGTTA	.	.	DP=77;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=147,134;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=123.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,33:0.430:77:22,21:21,7:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:31,13,29,4
chr4	4190525	.	CC	TT	.	.	DP=85;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=139,67;MMQ=57,22;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,2:0.035:84:48,2:30,0:56,26,1,1
chr4	4190683	.	G	A	.	.	DP=84;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=126,104;MMQ=60,27;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,13:0.179:73:22,7:36,5:20,40,4,9
chr4	4190723	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=139,167;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:9,1:21,4:3,28,0,5
chr4	4190792	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,0:0,9:0,0,0,9
chr4	4198948	.	GCGTTGC	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.396:41:15,10:9,5:17,8,11,5
chr4	4199823	.	A	ACAGATGCTTAATCAAAGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=124,152;MMQ=46,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr4	4228361	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	4239516	.	C	T	.	.	DP=106;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=148,147;MMQ=60,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=114.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,41:0.389:106:32,19:29,17:0|1:4239516_C_T:4239516:48,17,27,14
chr4	4239539	.	C	T	.	.	DP=118;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=145,143;MMQ=60,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:94,23:0.201:117:43,11:49,12:0|1:4239516_C_T:4239516:65,29,0,23
chr4	4241953	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	4249414	.	AT	GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr4	4249483	.	CA	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	4249974	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	4270428	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0,4,0,1
chr4	4281570	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	4283676	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	4285265	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	4285457	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,1,1
chr4	4285467	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=117,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:0,5,1,1
chr4	4285545	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=205,108372106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr4	4317659	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=156,76;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:16,0:14,4:0|1:4317659_G_A:4317659:15,16,1,3
chr4	4317661	.	CA	C	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=157,76;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.130:36:16,0:14,4:0|1:4317659_G_A:4317659:15,17,1,3
chr4	4317777	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.515:12:1,5:3,1:0,6,0,6
chr4	4322275	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr4	4322624	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=131,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,0:4,3:5,7,2,1
chr4	4411235	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=114,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,0:1,0,5,0
chr4	4411492	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4411492_C_CCT:4411492:0,1,0,1
chr4	4411493	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4411492_C_CCT:4411492:0,1,0,1
chr4	4411496	.	TCCC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=257,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:4411492_C_CCT:4411492:0,1,0,1
chr4	4411504	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=257,144;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:4411492_C_CCT:4411492:0,1,0,1
chr4	4425380	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=174,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr4	4425422	.	C	CAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	4436436	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=98,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr4	4861745	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=175,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	5016841	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,13,8
chr4	5018478	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=224,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:5018478_C_T:5018478:2,0,1,1
chr4	5018479	.	TCCTCCCAAC	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=186,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:1,0:0|1:5018478_C_T:5018478:4,0,1,1
chr4	5018491	.	TCC	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=186,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:5018478_C_T:5018478:4,0,1,1
chr4	5018497	.	T	TTA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=186,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:1,0:0|1:5018478_C_T:5018478:4,0,1,1
chr4	5018702	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	5399876	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=102,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:1,1,4,1
chr4	5418539	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:3,2,1,1
chr4	5527008	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.561:28:6,9:6,4:11,1,14,2
chr4	5527249	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=159,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,2:4,0:1,13,1,1
chr4	5528115	.	ATT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.826:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr4	5570104	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	5617295	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.359:15:3,3:5,2:0,10,0,5
chr4	5630470	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.362:17:2,3:8,3:1,10,1,5
chr4	5642141	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=195,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:5642141_C_T:5642141:1,0,3,0
chr4	5642161	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=143,124;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0|1:5642141_C_T:5642141:3,0,3,0
chr4	5642274	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,145;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.430:30:10,6:7,5:9,8,8,5
chr4	5664807	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr4	5687281	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	5693112	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,2:3,2:1,8,0,4
chr4	5696031	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.584:27:5,9:6,5:6,5,13,3
chr4	5731158	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0|1:5731158_C_T:5731158:1,3,1,3
chr4	5731174	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=191,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:5731158_C_T:5731158:0,4,0,1
chr4	5733068	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=154,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr4	5746916	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr4	5747078	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=106,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,5:1,7:0,1,3,9
chr4	5747131	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr4	5754544	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=114.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,20:0,0,24,13
chr4	5755756	.	T	TTTGGCATCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=251,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	5803669	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=186,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:5,1,3,1
chr4	5812195	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,6:5,6:1,9,2,10
chr4	5812778	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=140,54;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0,3,2,2
chr4	5812817	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,33;MFRL=204,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr4	5830414	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,6:0,8:0,0,4,10
chr4	5830434	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=168,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:10,1:4,11,0,2
chr4	5863032	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	5894776	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	5969113	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=161,83;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,2,2
chr4	5977566	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr4	5981849	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:6,7:1,5:7,0,11,1
chr4	5982108	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=153,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:4,2:1,6,2,5
chr4	5982135	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:1,1:1,2:1,1,0,4
chr4	5982158	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	5990162	.	T	TCAC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5990162_T_TCAC:5990162:0,0,0,1
chr4	5990165	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:5990162_T_TCAC:5990162:0,0,0,1
chr4	6062230	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=117,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	6080817	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=106,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,0,3
chr4	6083492	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr4	6087057	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	6107357	.	A	ATGAGGCCTCTGACTGCTTGAAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=178,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:1,6,1,1
chr4	6114508	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=85,64;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:7,4,2,0
chr4	6293595	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.185:19:8,0:8,3:14,2,2,1
chr4	6302452	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=42,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.582:38:8,12:6,10:15,1,19,3
chr4	6302680	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=173,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:3,7:3,2:3,3,8,2
chr4	6303327	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=93,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:2,1,2,3
chr4	6304242	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=179,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	6304286	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	6325018	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.748:22:1,6:4,9:2,3,12,5
chr4	6330938	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:6330938_C_G:6330938:2,0,2,1
chr4	6330947	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:6330938_C_G:6330938:2,1,2,1
chr4	6335203	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	6374189	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	6374230	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr4	6374468	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=190,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr4	6374493	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=134,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr4	6377530	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=119.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,16:0,9:0|1:6377530_C_G:6377530:0,0,19,9
chr4	6377534	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=120.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.967:28:0,19:0,8:0|1:6377530_C_G:6377530:0,0,19,9
chr4	6377713	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:0|1:6377713_G_C:6377713:0,1,0,4
chr4	6377717	.	AGAT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=174,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:6377713_G_C:6377713:0,4,0,1
chr4	6578487	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	6594827	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	6596515	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	6596552	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	6602516	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr4	6612964	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,5:4,2:2,6,2,5
chr4	6619052	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr4	6623032	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr4	6719092	.	TAGTC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,8:0,9:0,0,12,5
chr4	6925396	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:8,2:9,11,0,2
chr4	6956134	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=131,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,3:6,2:2,11,0,5
chr4	6968942	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr4	6996129	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr4	7002803	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,16,1
chr4	7012338	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,6:3,3:5,1,9,0
chr4	7027041	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr4	7032104	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=122,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.568:21:4,4:4,7:6,3,4,8
chr4	7032180	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr4	7064214	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=22,32;MFRL=180,173;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.806:8:1,4:0,2:0|1:7064214_T_G:7064214:0,1,1,6
chr4	7064218	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=180,164;MMQ=60,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0|1:7064214_T_G:7064214:0,1,1,5
chr4	7064220	.	TATATA	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=177,164;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,4:0,2:0|1:7064214_T_G:7064214:0,2,1,5
chr4	7064243	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=180,154;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0|1:7064214_T_G:7064214:0,3,0,5
chr4	7064277	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=192,180;MMQ=60,46;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	7064300	.	A	ACTG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	7069606	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=185,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.371:29:8,4:9,3:18,0,10,1
chr4	7069804	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=220,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,2:4,4:0,10,0,6
chr4	7434988	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	7435013	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=117,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,2,1
chr4	7639974	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:0,1:1,2,3,0
chr4	7663167	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:4,2:4,4:8,1,5,1
chr4	7666229	.	GGC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=178,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:0|1:7666229_GGC_G:7666229:0,4,1,1
chr4	7666232	.	AAC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=178,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:7666229_GGC_G:7666229:0,4,1,1
chr4	7684641	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=106,87;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,1:3,1:2,4,1,1
chr4	7684661	.	CT	AC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=92,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:2,3,1,1
chr4	7691193	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=114,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:3,2,1,1
chr4	7716932	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,16:0,9:0,0,15,10
chr4	7717066	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:4,0:2,2:0|1:7717066_C_T:7717066:0,6,1,1
chr4	7717069	.	A	AAACCTTTGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:7717066_C_T:7717066:0,6,1,1
chr4	7727100	.	T	TTGCCCCCGCCGCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7727100_T_TTGCCCCCGCCGCTG:7727100:0,1,0,1
chr4	7727102	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7727100_T_TTGCCCCCGCCGCTG:7727100:0,1,0,1
chr4	7728472	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:5,1,6,0
chr4	7731310	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr4	7735215	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=232,107;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr4	7738730	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=189,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr4	7738775	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr4	7742101	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7742101_C_G:7742101:0,1,0,1
chr4	7742104	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:7742101_C_G:7742101:0,1,0,1
chr4	7817698	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=82,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.765:5:0,1:1,3:0,1,4,0
chr4	7820727	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	7820795	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=99,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:3,1:3,6:4,2,5,3
chr4	7968888	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=68,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	8006928	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	8009759	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr4	8062638	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr4	8062689	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr4	8062871	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	8079298	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:2,2:5,0,6,0
chr4	8082607	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	8090028	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:5,3:3,3:0,9,2,4
chr4	8099086	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=206,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr4	8099105	.	A	ACG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=206,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr4	8207083	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:2,6:1,2:1,2,4,5
chr4	8207154	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=174,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:4,1:1,2:0,5,0,4
chr4	8211624	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	8214636	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,2:0,3:0,0,0,7
chr4	8217829	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:5,1,2,3
chr4	8217902	.	TGAG	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAG;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:14,1:15,1:19,14,2,0
chr4	8221058	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.568:40:8,11:9,10:11,6,13,10
chr4	8228627	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0|1:8228627_G_C:8228627:0,0,17,0
chr4	8228632	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,7:0,10:0|1:8228627_G_C:8228627:0,0,18,0
chr4	8228731	.	TG	CA,CG	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,35,30;MFRL=157,149,139;MMQ=60,60,60;MPOS=20,14;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.32,95.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,32:0.078,0.870:35:1,0,21:0,2,11:0,1,16,18
chr4	8228943	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,7:2,4:6,2,4,7
chr4	8230456	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	8237096	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,11,0
chr4	8288581	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr4	8288594	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=211,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:8288594_C_CA:8288594:0,3,0,1
chr4	8288595	.	T	TTCATCTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=211,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:8288594_C_CA:8288594:0,3,0,1
chr4	8293356	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=13,31;MFRL=210,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.620:5:0,1:0,2:0,2,0,3
chr4	8293379	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=210,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr4	8293974	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=101,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr4	8304137	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.547:11:3,6:1,0:3,2,5,1
chr4	8368731	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=138,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:14,0:7,3:0|1:8368731_G_A:8368731:8,13,0,3
chr4	8368735	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=135,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:13,0:7,3:0|1:8368731_G_A:8368731:8,14,0,3
chr4	8375448	.	A	AGTAGGTTGGAGAAATTATGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=176,268;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	8391467	.	A	ATCTGTGCTTCC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=157,43;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:2,8,1,1
chr4	8415982	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:7,6:9,4:9,7,8,2
chr4	8456572	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,9:2,4:1,4,5,8
chr4	8582679	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=14,34;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr4	8584448	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	8602793	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:8602793_T_C:8602793:0,0,5,0
chr4	8602798	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:8602793_T_C:8602793:0,0,6,0
chr4	8602816	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,1:0|1:8602793_T_C:8602793:0,0,7,1
chr4	8608979	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=146,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,1:0,1:1,0,2,1
chr4	8613908	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:8613908_G_A:8613908:0,2,1,0
chr4	8613913	.	TGGGCGG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=17,34;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:8613908_G_A:8613908:0,2,1,0
chr4	8620103	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr4	8620325	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	8621167	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,19:0.584:32:3,6:10,11:3,10,10,9
chr4	8621194	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,14:0,0,6,17
chr4	8621392	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	9446325	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr4	9485579	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=194,171;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,2:3,0:2,7,1,1
chr4	9486192	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=199,200;MMQ=60,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:9486192_G_C:9486192:0,3,0,1
chr4	9486194	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=205,200;MMQ=59,46;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:9486192_G_C:9486192:0,4,0,1
chr4	9486200	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=205,200;MMQ=59,46;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:9486192_G_C:9486192:0,4,0,1
chr4	9892304	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,61;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:8,3:7,0:6,10,2,1
chr4	9921931	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr4	9982191	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:5,7:2,5:6,1,11,1
chr4	9998605	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:0,4,0,4
chr4	10020564	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=157,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.496:24:6,6:6,5:12,0,11,1
chr4	10020757	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,3:5,5:0,7,1,7
chr4	10027509	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.482:19:8,6:2,2:9,1,7,2
chr4	10027542	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=139,133;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.641:31:10,10:0,10:8,3,13,7
chr4	10027643	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,5:1,3:0,4,1,7
chr4	10080462	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,2:5,0,3,2
chr4	10084866	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=158,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10084866_A_T:10084866:0,1,0,1
chr4	10084867	.	G	GCGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=158,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:10084866_A_T:10084866:0,1,0,1
chr4	10090178	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr4	10445719	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=134,52;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:11,0:8,3:8,12,0,4
chr4	10447985	.	AT	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:7,7:9,7:10,6,7,7
chr4	10509699	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr4	10542067	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,78;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:4,3,1,1
chr4	10586629	.	C	CTCCCG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,1:10,1:9,14,0,2
chr4	13370308	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:1,4,1,5
chr4	13462520	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.879:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	13578405	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,15,2
chr4	13589212	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr4	13589495	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,11:0,0,0,19
chr4	13605775	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=123,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:9,4:13,2:14,8,4,2
chr4	13615293	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=93.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,5,23
chr4	13616295	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.457:31:5,6:11,8:4,13,4,10
chr4	15005715	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:6,4:5,5:1,11,0,9
chr4	15059951	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	15480481	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=118,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,1:13,1:3,17,0,2
chr4	15482477	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:5,8:6,7:1,10,2,13
chr4	15504026	.	G	T	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,4:0.050:81:33,0:40,2:58,19,4,0
chr4	15513147	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr4	15538744	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.577:12:3,3:1,3:0,5,0,7
chr4	15539498	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.459:20:7,8:3,1:9,2,9,0
chr4	15568992	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=131,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,27:0.435:62:18,15:16,10:15,20,17,10
chr4	15569018	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,45:0.591:76:14,25:15,17:16,15,24,21
chr4	15569146	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.545:31:9,6:5,11:2,12,2,15
chr4	15575718	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:1,0,4,1
chr4	15587897	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,12:0,0,2,18
chr4	15589345	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr4	15603069	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:7,6:9,2:2,14,1,7
chr4	15642515	.	CA	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.261:32:9,5:14,3:1,23,1,7
chr4	15717321	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:4,2,1,4
chr4	15780358	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=118,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr4	15842255	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=211,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15842255_TG_AA:15842255:0,1,0,1
chr4	15842259	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=211,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15842255_TG_AA:15842255:0,1,0,1
chr4	15842262	.	TTC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=218,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:15842255_TG_AA:15842255:0,2,0,1
chr4	15842268	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=218,115;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:15842255_TG_AA:15842255:0,2,0,1
chr4	15937823	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,2:8,0:0|1:15937823_C_T:15937823:8,16,0,2
chr4	15937825	.	GG	CC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,2:8,0:0|1:15937823_C_T:15937823:7,16,0,2
chr4	15937828	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,2:7,0:0|1:15937823_C_T:15937823:7,16,0,2
chr4	15964040	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=145,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr4	15985984	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.400:15:4,4:5,1:1,8,2,4
chr4	15986041	.	C	CATGG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:15986041_C_CATGG:15986041:0,3,0,1
chr4	15986042	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	15986044	.	G	GATGCCTGCAAAGCACAGCAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:15986041_C_CATGG:15986041:0,3,0,1
chr4	15987348	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=104,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,4,1
chr4	15987509	.	T	TTTAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,0;MFRL=29342519,126;MMQ=60,57;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.638:3:0,0:0,0:0|1:15987509_T_TTTAAG:15987509:2,0,0,1
chr4	15987512	.	T	TGCTTATTTAATCTGTATTAAATATTTAATACAGATAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.921:11:0,1:0,1:0|1:15987509_T_TTTAAG:15987509:0,1,8,2
chr4	15987739	.	A	AGGATTTAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=196,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:15987739_A_AGGATTTAT:15987739:0,4,0,1
chr4	15987740	.	C	CCCTGAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=196,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:15987739_A_AGGATTTAT:15987739:0,4,0,1
chr4	15989191	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr4	15991275	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr4	16002050	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr4	16008231	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:14,8,0,2
chr4	16014998	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=138,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr4	16024885	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr4	16025837	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr4	16026983	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=123,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:3,3,1,2
chr4	16172181	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=194,69;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:7,0,2,0
chr4	16175930	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,108;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.105:45:24,0:17,4:9,32,0,4
chr4	16189991	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=158,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.277:29:10,3:10,5:6,15,1,7
chr4	16190073	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=155,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr4	16204226	.	GA	G,GAA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=18,25,18;MFRL=148,187,148;MMQ=60,60,60;MPOS=15,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.95,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,4,3:0.162,0.132:27:3,0,0:5,2,0:1,19,0,7
chr4	16215537	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,2:4,0:3,8,0,2
chr4	16510131	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,5:4,0:9,2,5,0
chr4	16597280	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr4	17494054	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	17503561	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	17506164	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:2,1:11,6:0,13,0,7
chr4	17511076	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=200,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.488:2:0,0:1,1:0|1:17511076_G_GA:17511076:0,1,0,1
chr4	17511077	.	T	TTCTCCTACCTCAGCTTCCCG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=200,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17511076_G_GA:17511076:0,1,0,1
chr4	17517242	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr4	17581617	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,4,14
chr4	17581643	.	CAG	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr4	17585014	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	17590671	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr4	17590694	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=204,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr4	17608620	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,2:1,3:0,3,1,4
chr4	17616214	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:6,0,3,1
chr4	17625209	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.374:30:10,5:9,6:10,9,6,5
chr4	17634213	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,10:0,0,10,13
chr4	17634255	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:3,6:9,1:0|1:17634255_G_A:17634255:4,8,1,6
chr4	17634256	.	C	CAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=130,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:3,6:9,1:0|1:17634255_G_A:17634255:4,8,1,6
chr4	17635556	.	CAAAAT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=194,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,1:3,1:0,7,0,2
chr4	17640858	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:3,2,2,0
chr4	17649233	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=178,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:3,1:1,6:3,2,4,3
chr4	17649494	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,35;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:17649494_T_C:17649494:0,1,1,0
chr4	17649499	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,36;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:17649494_T_C:17649494:0,1,1,0
chr4	17654648	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,2:5,4:0,5,1,5
chr4	17659936	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=163,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,3:0,2:3,1,3,2
chr4	17666297	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=124,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.426:7:1,0:1,1:0|1:17666297_G_A:17666297:0,4,1,2
chr4	17666303	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,16;MFRL=131,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.632:6:1,0:0,1:0|1:17666297_G_A:17666297:0,2,1,3
chr4	17706928	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	17805379	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=77.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,25:0.764:32:2,11:5,13:1,6,6,19
chr4	17812615	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=130.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,13:0,21:0,0,34,0
chr4	17812796	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.581:42:7,6:10,13:3,14,3,22
chr4	17814110	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,1:4,5:1,5,0,6
chr4	17836232	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=206,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr4	17841848	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.476:40:11,9:8,8:2,19,1,18
chr4	17842156	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.648:32:4,10:7,11:11,0,20,1
chr4	17844029	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.558:41:8,12:10,11:2,16,2,21
chr4	17885296	.	A	AAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AC;STR;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,6,1
chr4	17964528	.	TA	T	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,7:0.073:80:37,4:35,3:60,13,5,2
chr4	20255620	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	20259621	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.295:25:12,3:6,4:0|1:20259621_A_AT:20259621:1,17,0,7
chr4	20259622	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.295:25:12,3:6,4:0|1:20259621_A_AT:20259621:1,17,0,7
chr4	20270600	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	20482461	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=135,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr4	20482485	.	G	GGTTATTTTGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,97;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	20490667	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr4	20533700	.	A	AT	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=134.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,56:0.951:58:1,28:1,27:0,2,14,42
chr4	20541005	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=74.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,18:0.760:23:1,8:3,7:0|1:20541005_AG_A:20541005:5,0,16,2
chr4	20541008	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=74.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,18:0.760:23:2,10:3,8:0|1:20541005_AG_A:20541005:5,0,16,2
chr4	20547838	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	20597522	.	CAGT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=168,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr4	20618822	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=151,51;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:2,2:4,0:0|1:20618822_G_GA:20618822:3,4,1,1
chr4	20618823	.	T	TATTATG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=151,51;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:2,2:5,0:0|1:20618822_G_GA:20618822:3,4,1,1
chr4	20619369	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20619369_A_G:20619369:0,0,0,1
chr4	20619372	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20619369_A_G:20619369:0,0,0,1
chr4	20619373	.	C	CTATATGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20619369_A_G:20619369:0,0,0,1
chr4	20620683	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr4	20706067	.	CT	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,8:0.179:45:16,3:14,4:35,2,6,2
chr4	20714642	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	20715189	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=197,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr4	20715244	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	20733708	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,5:0,7:0,0,7,7
chr4	20736416	.	A	AAAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=210,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAC;STR;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr4	21699106	.	CAAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,36;MFRL=206,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AAT;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr4	22414708	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr4	22437978	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.380:11:5,1:2,3:7,0,4,0
chr4	22444251	.	CA	C,CAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,35,34;MFRL=163,165,143;MMQ=60,60,60;MPOS=26,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=7.05,5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,5,6:0.184,0.203:28:7,3,6:10,2,0:16,1,11,0
chr4	22449028	.	CA	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,9:0.181:47:11,4:25,4:34,4,6,3
chr4	22456621	.	CATT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0|1:22456621_CATT_C:22456621:0,2,0,1
chr4	22456626	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:22456621_CATT_C:22456621:0,2,0,1
chr4	22456630	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=161,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:22456621_CATT_C:22456621:0,2,0,1
chr4	22456631	.	TCAAGAACAGCA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=172,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:22456621_CATT_C:22456621:0,1,0,1
chr4	23815218	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=275,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	23815522	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=104,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:1,6:12,11:3,10,2,15
chr4	23815541	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=121,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:7,0:16,2:6,17,0,2
chr4	23815553	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:8,0:10,2:0|1:23815553_C_T:23815553:5,13,0,2
chr4	23815555	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:23815553_C_T:23815553:5,13,0,2
chr4	23815924	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	23816242	.	TAA	T,TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32,10;MFRL=0,157,150;MMQ=60,60,60;MPOS=22,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=6.08,16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,8:0.311,0.631:12:0,1,0:0,3,3:0,0,0,12
chr4	23830267	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:4,4:9,4:1,12,0,8
chr4	24550431	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=118,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,4,0
chr4	24824076	.	GAA	G,GA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,30,35;MFRL=146,122,135;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.37,3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:29,3,3:0.085,0.118:35:10,2,2:15,0,1:26,3,4,2
chr4	24914611	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	25005891	.	CTG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=220,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.385:3:1,0:1,1:0|1:25005891_CTG_C:25005891:0,2,0,1
chr4	25005898	.	C	CTCTGTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=220,175;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:25005891_CTG_C:25005891:0,2,0,1
chr4	25146307	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr4	25160732	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=167,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.240:20:9,1:3,4:0,15,1,4
chr4	25160828	.	A	AGCACATGCTCACCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	25262253	.	TATATATATATAC	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=148,160;MMQ=58,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.296:21:5,2:7,4:0,14,0,7
chr4	25370705	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=119,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:13,4,1,1
chr4	25392728	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=233,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr4	25393889	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,4:1,4:5,0,8,0
chr4	25394078	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,6:3,4:1,7,1,9
chr4	25395909	.	A	AT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.098:48:21,1:22,3:34,10,4,0
chr4	25404553	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=104,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:11,15:6,10:10,7,21,4
chr4	25408724	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr4	25417244	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:0,1:2,2:0,2,0,4
chr4	25419889	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=161,75;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:11,6,0,2
chr4	25673234	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=107,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,2:6,0:8,8,1,1
chr4	25674905	.	TCACA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.810:3:0,2:0,0:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,0,3
chr4	25674911	.	G	GAGGGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,0,3
chr4	25674913	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,0,3
chr4	25759298	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=130,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.411:32:6,5:12,8:9,10,5,8
chr4	25759452	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:5,4:0,8,0,7
chr4	25767064	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:6,4:9,5:2,13,2,7
chr4	25769041	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr4	25769135	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.464:48:14,15:10,7:15,11,14,8
chr4	25780599	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=184,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr4	25780675	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.533:26:5,8:7,5:7,5,9,5
chr4	25780891	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr4	25784092	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=191,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr4	25790067	.	C	CCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.673:1:0,0:0,0:0|1:25790067_C_CCTG:25790067:0,0,0,1
chr4	25790072	.	T	TCAGACCAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25790067_C_CCTG:25790067:0,0,0,1
chr4	25790073	.	T	TGCCTGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25790067_C_CCTG:25790067:0,0,0,1
chr4	25803830	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,3:4,6:6,0,9,0
chr4	25849270	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,1:10,1:13,6,1,1
chr4	25915858	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=193,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:8,0,5,0
chr4	26322645	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,71;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:9,1:15,2:14,12,2,1
chr4	26322759	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr4	26364300	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	26387959	.	ATT	AT,A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=31,31,29;MFRL=131,158,190;MMQ=60,60,60;MPOS=20,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,9;RU=T;STR;TLOD=135.67,5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,53,4:0.873,0.076:60:1,31,4:2,22,0:2,1,42,15
chr4	26417068	.	GT	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=131,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.117:49:17,3:24,1:30,14,2,3
chr4	26417136	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=277.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,84:0.988:84:0,43:0,37:0|1:26417136_T_C:26417136:0,0,47,37
chr4	26417158	.	C	T	.	.	DP=104;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=135,96;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:100,4:0.047:104:49,4:47,0:1|0:26417136_T_C:26417136:59,41,4,0
chr4	26487170	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	26615982	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr4	26685452	.	A	AGAATCTGGAACTTCTGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=203,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	26721578	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=188,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,6:1,2:4,1,8,0
chr4	26737063	.	C	CT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=66.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,33:0.730:45:5,16:6,13:6,6,23,10
chr4	27000995	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,3,19
chr4	27019666	.	G	GCCGAGAGTTTGAGACTAGTCAGGGCAAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=219,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr4	30725521	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=208,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:30725521_A_AG:30725521:1,1,1,0
chr4	30725523	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=208,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:30725521_A_AG:30725521:1,1,1,0
chr4	36069661	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=154,91;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,0:8,1:16,8,1,1
chr4	36109409	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr4	36122737	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.434:23:7,6:6,3:13,0,9,1
chr4	36126393	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr4	36130099	.	TAC	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AC;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.261:13:5,2:3,1:9,1,3,0
chr4	36130127	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,8:0.188:44:16,2:20,5:24,12,4,4
chr4	36130375	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:8,2:5,3:0|1:36130375_TA_T:36130375:0,14,1,5
chr4	36130393	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=151,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.335:22:7,5:7,2:0|1:36130375_TA_T:36130375:0,15,0,7
chr4	36148837	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,5:7,2:9,0,7,0
chr4	36149025	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:5,5:8,3:1,13,0,8
chr4	36149113	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:9,0,2,2
chr4	36160340	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=67.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,25:0.481:52:13,11:14,14:25,2,24,1
chr4	36162273	.	C	CA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:2,3:5,2:1,6,1,5
chr4	36168706	.	CAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=37,36;MFRL=203,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,5;RU=A;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	36211914	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	36216114	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,17:0.380:45:12,8:15,8:6,22,4,13
chr4	36340755	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.581:41:7,14:10,10:12,5,10,14
chr4	37432416	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=201,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0,3,0,2
chr4	37590570	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:1,6,0,3
chr4	37592659	.	T	TAAGTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=187,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	37592674	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	37636750	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:3,2:0,0:1,2,0,3
chr4	37831850	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	37841430	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,5:5,0:7,2,5,0
chr4	37841942	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	37848530	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr4	37850312	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr4	37857166	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	37863045	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,242;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr4	38119747	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=121,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.443:31:9,8:8,3:8,9,9,5
chr4	38134423	.	GTT	G,GT,GTTT,GTTTT	.	.	DP=146;ECNT=2;MBQ=34,34,34,34,34;MFRL=125,151,175,136,153;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=14,17,20,16;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17,18;RU=T;STR;TLOD=4.46,8.07,41.72,10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:35,6,7,32,12:0.052,0.079,0.373,0.133:92:15,2,3,15,7:20,4,4,13,2:22,13,41,16
chr4	38134442	.	C	G	.	.	DP=150;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,39:0.263:137:32,0:39,0:32,66,39,0
chr4	38696378	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,259;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,2:15,0:18,12,2,0
chr4	38698666	.	G	GA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:13,2:11,0:24,0,3,0
chr4	38798695	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,141;MMQ=52,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,0:16,3:18,9,2,1
chr4	38800346	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:13,3:11,0:10,14,3,0
chr4	38829280	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,2:13,0:11,12,1,1
chr4	38831150	.	G	GATTTCCCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	38916465	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=220,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.630:9:2,3:1,1:3,0,6,0
chr4	38937316	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.267:27:9,3:9,2:19,1,5,2
chr4	38937329	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=17,10;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.229:26:2,0:3,1:17,3,6,0
chr4	38942697	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.374:8:2,1:1,2:0,5,0,3
chr4	38944976	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=190,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:2,0,2,0
chr4	39064126	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,14,3
chr4	39064162	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,13:0,0,21,11
chr4	39077567	.	G	GT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.418:22:10,6:3,3:13,0,9,0
chr4	39082696	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:12,3:1,0:13,0,2,1
chr4	39104837	.	CTG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=182,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr4	39109399	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:7,4:3,6:0,10,0,11
chr4	39109428	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=141,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:0,5,0,6
chr4	39114559	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	39116775	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,1:4,7:6,2,3,5
chr4	39122577	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=148,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:1,2,6,0
chr4	39187522	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	39188125	.	GT	AA	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=111,161;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.320:31:4,0:15,6:0|1:39188125_GT_AA:39188125:5,16,10,0
chr4	39188130	.	TC	AA	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=124,145;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,7:0.202:35:6,1:17,1:0|1:39188125_GT_AA:39188125:10,18,7,0
chr4	39188133	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=124,164;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.090:34:7,1:20,0:0|1:39188125_GT_AA:39188125:10,21,3,0
chr4	39188136	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=34,13;MFRL=125,137;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:9,0:22,0:10,22,2,0
chr4	39205365	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr4	39216399	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:0|1:39216399_T_G:39216399:0,8,0,2
chr4	39216405	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=184,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:4,2:3,0:0|1:39216399_T_G:39216399:0,8,0,2
chr4	39226486	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.229:17:6,1:5,2:11,2,3,1
chr4	39226524	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=142,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.131:41:9,0:20,0:15,20,6,0
chr4	39233984	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=167,196;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39233984_C_T:39233984:0,1,0,1
chr4	39233987	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=167,196;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39233984_C_T:39233984:0,1,0,1
chr4	39233992	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=167,196;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39233984_C_T:39233984:0,1,0,1
chr4	39279671	.	CAA	C,CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33,34;MFRL=155,170,190;MMQ=60,60,60;MPOS=31,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=7.53,3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.334,0.248:9:2,0,1:2,3,1:4,0,5,0
chr4	39279907	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr4	39308187	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,8:3,4:3,1,7,5
chr4	39318706	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=206,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr4	39321969	.	CAA	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=121,125;MMQ=54,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.746:16:2,2:2,3:3,1,5,7
chr4	39329102	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:5,1:0,2:5,0,3,0
chr4	39329476	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	39343940	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,5:4,7:6,2,8,4
chr4	39353122	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr4	39449824	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr4	39456392	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=90.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.967:25:0,11:0,14:0,0,25,0
chr4	39459154	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:7,4:1,2:7,1,5,1
chr4	39459724	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr4	39473040	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	39501722	.	CAAAA	C,CA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=105,174,141;MMQ=60,60,60;MPOS=17,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,15;RU=A;STR;TLOD=8.74,13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,8:0.223,0.422:20:4,2,4:1,3,2:5,2,10,3
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chr4	39506997	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:0,3:6,3:1,5,0,6
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chr4	39510193	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=91,64;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:0|1:39510175_G_A:39510175:8,3,1,1
chr4	39511359	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=120,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:4,2:1,3:5,0,4,1
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chr4	39851058	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,176;MMQ=54,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.450:7:2,1:0,2:4,0,3,0
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chr4	39928382	.	T	G	.	.	DP=78;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,24:0.319:75:32,10:19,13:41,10,21,3
chr4	39928383	.	T	G	.	.	DP=82;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,4:0.063:76:40,2:31,2:60,12,3,1
chr4	39928486	.	TA	T,TAA	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=148,147,154;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=6.67,4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:38,5,5:0.113,0.106:48:13,2,4:22,2,1:1,37,0,10
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chr4	40123997	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:3,2:3,1:0,7,0,4
chr4	40246281	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr4	40337908	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,7,8
chr4	40339137	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=101,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr4	40778340	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	40810585	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=98,83;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:1,3:14,0:8,7,2,1
chr4	40947109	.	G	GATCAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=204,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.385:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr4	41015553	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=110,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr4	41016484	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=186,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:1,1:3,2:0,5,0,3
chr4	41615249	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.895:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr4	41615690	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,2,13
chr4	41615757	.	G	GAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr4	41615759	.	C	CACCACAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,36;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:41615759_C_CACCACAA:41615759:0,2,0,1
chr4	41615762	.	T	TCTCAAGAA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:41615759_C_CACCACAA:41615759:0,2,0,1
chr4	41621358	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=119,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:0|1:41621358_A_C:41621358:4,13,1,1
chr4	41621360	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:0|1:41621358_A_C:41621358:4,13,1,1
chr4	41691669	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:6,2:0,12,0,2
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chr4	41699276	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:41699274_A_G:41699274:2,12,0,2
chr4	41699278	.	C	CTCTTCCTGGGGACCAGA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,2:6,0:0|1:41699274_A_G:41699274:2,12,0,2
chr4	41985272	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=31.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.862:19:1,5:1,10:2,0,11,6
chr4	41985867	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:8,2:5,4:3,10,1,6
chr4	41986519	.	GC	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,195;MMQ=48,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:6,2,1,1
chr4	41988385	.	TAC	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=73.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.953:17:0,9:0,8:0,0,2,15
chr4	42003591	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=179,228;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,4:7,0:15,0,4,0
chr4	42003835	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=143.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,19:0,21:0,0,4,36
chr4	42022464	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,4,7
chr4	42024982	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr4	42025049	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr4	42037381	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=111,244;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,0:4,2:4,4,0,2
chr4	42040947	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=146.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,24:0,18:0,0,43,0
chr4	42069029	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr4	42119742	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,1:6,1:9,11,1,1
chr4	42402992	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr4	42403561	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	42448742	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr4	42466641	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr4	42526694	.	CTAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=201,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TAA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:3,0,1,0
chr4	42571074	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=165.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,23:0,26:0,0,45,4
chr4	42582047	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=122.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,9:0,23:0,0,1,31
chr4	42592935	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,35;MFRL=97,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.840:10:1,5:0,2:0,1,3,6
chr4	42593015	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	42602606	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=121.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.973:33:0,15:0,18:0,0,5,28
chr4	42626659	.	GAAA	G,GA,GAA	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=26,19,18,17;MFRL=182,0,136,148;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,23,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,11,12,13;RU=A;STR;TLOD=7.82,10.36,54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,4,7,28:0.090,0.158,0.608:45:3,0,0,7:0,2,2,3:3,3,5,34
chr4	42627805	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,1,19
chr4	42965159	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,2:6,4:1,11,0,6
chr4	43032612	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=57,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr4	44626846	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr4	44631514	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.530:32:9,15:5,1:10,5,6,11
chr4	44631587	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:0,8,1,5
chr4	44652187	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,6:5,2:0,6,0,8
chr4	44680727	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,19:0.429:44:11,9:14,8:23,2,16,3
chr4	44682661	.	CT	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=186,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.132:38:13,3:20,2:28,5,5,0
chr4	44684455	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=138.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,21:0,18:0,0,7,32
chr4	44684507	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr4	44685224	.	T	TA	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=178.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,20:0,17:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,39,2
chr4	44685225	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=180.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,42:0.977:42:0,20:0,18:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,40,2
chr4	44685236	.	AT	A	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=61.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,30:0.621:48:8,10:8,19:17,1,26,4
chr4	44691206	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	44691795	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:1,1,7,0
chr4	44693782	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:7,0:2,2:5,5,2,0
chr4	44696538	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=225.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,61:0.984:61:0,28:0,33:0,0,17,44
chr4	44699484	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,18:0.396:46:13,8:15,10:11,17,4,14
chr4	44699506	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.388:34:11,4:10,9:4,17,1,12
chr4	44709695	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	44712908	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr4	44713235	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:0,2,0,2
chr4	44720248	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=173,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.339:33:10,4:11,6:21,1,11,0
chr4	46967332	.	A	AATTAATTAAAATTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:46967332_A_AATTAATTAAAATTT:46967332:0,0,0,1
chr4	46967335	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:46967332_A_AATTAATTAAAATTT:46967332:0,0,0,1
chr4	46994972	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,0:0,0:0,1,0,5
chr4	46995366	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.415:15:5,4:3,2:3,6,3,3
chr4	47033770	.	TCG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,98;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.486:18:7,4:2,5:4,5,5,4
chr4	47034058	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0|1:47034058_CT_C:47034058:0,3,0,1
chr4	47034060	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:47034058_CT_C:47034058:0,3,0,1
chr4	47034064	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:47034058_CT_C:47034058:0,2,0,1
chr4	47034626	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,183;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,5:3,3:3,3,5,3
chr4	47163249	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=12,18;MFRL=189,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:0,0:1,0:3,0,2,0
chr4	47524961	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,2:2,2:1,1,5,0
chr4	47524997	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=148,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,1:6,2:9,0,2,1
chr4	47525009	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,12,1
chr4	47527537	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=129,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,8:5,5:6,3,12,1
chr4	47538360	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=206,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr4	47560859	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=110,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chr4	47582387	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=89,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.537:26:3,7:8,6:8,4,11,3
chr4	47592993	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.520:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr4	47666981	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=203,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	47685780	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,2:9,0:6,9,0,2
chr4	47695102	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:6,2:6,1:2,10,3,0
chr4	47746602	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=12,10;MFRL=205,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:0,0:0,0:0,4,0,2
chr4	47746658	.	A	AAGACTATTCTTTCTTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	47746661	.	A	ACG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=197,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	47853843	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,19,0
chr4	47857040	.	T	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=124,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=273.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,76:0.975:77:0,41:1,33:1,0,44,32
chr4	47886329	.	GT	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.157:40:12,3:19,2:28,6,5,1
chr4	47898491	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr4	47899964	.	T	TA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.091:53:33,1:15,2:40,9,4,0
chr4	47901169	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,0:0,1:0|1:47901169_A_AG:47901169:0,2,0,1
chr4	47901173	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47901169_A_AG:47901169:0,2,0,1
chr4	47901177	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47901169_A_AG:47901169:0,2,0,1
chr4	47905158	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=94.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,11:0,19:0,0,29,1
chr4	47912787	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,3:13,0:19,4,2,1
chr4	47944029	.	CAA	C,CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33,33;MFRL=59,192,167;MMQ=57,60,60;MPOS=16,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=A;STR;TLOD=5.21,4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.333,0.333:6:0,2,0:1,0,2:2,0,4,0
chr4	47944053	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,14;MFRL=132,94;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:2,0:7,1,2,0
chr4	47945455	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,0,19
chr4	47951945	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=101.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,14:0,15:0,0,3,26
chr4	47953515	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr4	48073501	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,5:1,1:1,3,6,0
chr4	48076091	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.349:41:18,5:9,9:6,21,4,10
chr4	48078593	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:2,1:0,6,0,4
chr4	48081896	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=78,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.540:9:1,4:2,1:4,0,5,0
chr4	48082095	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=130,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,3:6,4:6,5,3,4
chr4	48082208	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	48088419	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=107,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr4	48088446	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=228,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,5:0,9:1,0,11,3
chr4	48139565	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr4	48147612	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr4	48148435	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:0|1:48148435_G_A:48148435:0,6,0,4
chr4	48148442	.	TCA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:1,0:0|1:48148435_G_A:48148435:1,5,0,2
chr4	48165834	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=157,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:48165834_T_C:48165834:0,4,1,1
chr4	48165835	.	T	TGAAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=157,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GAAA;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:48165834_T_C:48165834:0,4,1,1
chr4	48165888	.	CTTA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	48169769	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=151.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,24:0,18:0,0,26,16
chr4	48170511	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=186,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,1:2,1:8,0,2,0
chr4	48172218	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:5,6:7,6:12,1,12,0
chr4	48173547	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=216,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,3:0,4,0,7
chr4	48178003	.	A	AAATCAGCC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AATCAGCC;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,1:1,0,4,0
chr4	48372085	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,2:2,5:0,2,0,7
chr4	48381690	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=193,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.280:17:5,3:4,2:9,3,4,1
chr4	48385026	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=96,196;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.433:4:0,1:2,1:0|1:48385026_ATT_A:48385026:0,2,0,2
chr4	48385030	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=96,196;MMQ=60,59;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:48385026_ATT_A:48385026:0,2,0,2
chr4	48385035	.	A	AAAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=96,196;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:48385026_ATT_A:48385026:0,2,0,2
chr4	48486193	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	48491010	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:3,5:7,9:0,10,3,12
chr4	48492434	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	48494708	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=152,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr4	48516970	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	48517352	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr4	48529683	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=17,31,31,32;MFRL=208,77,200,134;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,18,27;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.12,6.23,17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,4,8:0.135,0.227,0.529:15:0,1,3,3:0,1,1,4:0,1,0,14
chr4	48529733	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	48533148	.	C	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=125,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,23:0.437:53:13,12:16,11:19,11,16,7
chr4	48537603	.	T	TACAC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=AC;STR;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.901:7:0,2:0,3:0,0,7,0
chr4	48537633	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:5,2:5,5:9,1,14,1
chr4	48541973	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,1:6,5:8,2,4,2
chr4	48549796	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=143,128;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:15,0:7,2:0|1:48549796_A_C:48549796:6,18,0,2
chr4	48549800	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=144,128;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:0|1:48549796_A_C:48549796:3,18,0,2
chr4	48551719	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=668,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48551719_A_C:48551719:0,2,0,1
chr4	48551721	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=668,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:48551719_A_C:48551719:0,2,0,1
chr4	48565101	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	48577121	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=75.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,10:0,0,19,5
chr4	48582836	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr4	48583067	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=189,242;MMQ=52,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:48583067_T_A:48583067:0,1,0,1
chr4	48583073	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=189,242;MMQ=52,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48583067_T_A:48583067:0,1,0,1
chr4	48596036	.	TA	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,9:0.157:59:22,4:25,3:10,40,1,8
chr4	48604160	.	C	T	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=109.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,41:0.400:103:35,17:26,24:21,41,7,34
chr4	48607938	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,7:0,11:0,0,1,17
chr4	48611149	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:6,3:4,5:0|1:48611149_A_G:48611149:1,9,0,8
chr4	48611153	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0|1:48611149_A_G:48611149:0,0,1,15
chr4	48625204	.	T	TA	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,5:0.112:45:21,1:18,2:3,37,1,4
chr4	48625213	.	C	A	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,30:0,26:0,0,8,48
chr4	48851937	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:8,1:6,6:7,7,5,2
chr4	48894715	.	TATAA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:2,5:8,0,8,0
chr4	48894981	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:0,6,0,7
chr4	48990476	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=111,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.652:9:2,4:0,2:3,0,6,0
chr4	48994138	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr4	49005844	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,37;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:13,2:9,0:12,10,1,1
chr4	49019232	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=122,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:10,11:5,4:13,2,14,1
chr4	52896050	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=129,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:1,6,0,5
chr4	52926865	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=178,165;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:52926865_A_G:52926865:1,0,1,0
chr4	52926871	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=147,165;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:52926865_A_G:52926865:3,0,1,0
chr4	52927113	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=224,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.578:12:2,0:2,7:0,5,1,6
chr4	52928352	.	GTT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=142,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	52938243	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:5,7:8,6:7,6,7,6
chr4	52943045	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=165,58;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:16,3:15,0:0|1:52943045_T_G:52943045:17,15,3,0
chr4	52943047	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,58;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:17,3:15,0:0|1:52943045_T_G:52943045:17,15,3,0
chr4	52946161	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr4	52951213	.	CTT	C,CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28,30;MFRL=0,161,164;MMQ=60,60,60;MPOS=32,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.94,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.440,0.437:4:0,1,0:0,1,2:0,0,0,4
chr4	52960908	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=204,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,1,1
chr4	53494215	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.103:36:15,1:17,2:15,18,2,1
chr4	53728824	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	54011424	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:5,1,4,0
chr4	54218672	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=126,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr4	54243905	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr4	54245476	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=213.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,57:0.983:57:0,30:0,27:0|1:54245476_A_T:54245476:0,0,12,45
chr4	54245499	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,17:0.429:40:15,7:8,10:0|1:54245476_A_T:54245476:4,19,1,16
chr4	54255887	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=188,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr4	54256640	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,1:4,5:7,2,4,2
chr4	54280705	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.768:15:2,7:0,5:3,0,12,0
chr4	54310188	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=118,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:2,5:5,2:3,4,6,1
chr4	54310340	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr4	54319011	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr4	54324991	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.521:38:6,7:12,11:1,17,1,19
chr4	54327211	.	T	TA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:4,3:8,2:0|1:54327211_T_TA:54327211:2,13,0,6
chr4	54327235	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,10:0.490:20:4,2:6,7:1|0:54327211_T_TA:54327211:0,10,1,9
chr4	54327584	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=90.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,18:0,6:0,0,24,1
chr4	54327826	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:0,8,0,3
chr4	54362150	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr4	54373464	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.699:28:5,13:3,6:7,1,17,3
chr4	54852693	.	CTTTTA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TTTTA;STR;TLOD=54.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.950:13:0,6:0,5:0,0,13,0
chr4	54853201	.	C	CATTCTGTATTTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr4	54853232	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	54876144	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,14;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.111:41:13,0:15,1:35,0,6,0
chr4	54880387	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=217,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr4	54915527	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr4	54930269	.	CAG	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=211,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.901:18:0,8:1,9:1,0,17,0
chr4	54930310	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=22,13;MFRL=178,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.222:32:6,1:6,1:24,0,8,0
chr4	54967709	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,0:0,5:1,2,4,1
chr4	55125058	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:1,7,0,8
chr4	55139978	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,276;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	55143692	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.102:29:13,2:11,0:7,19,0,3
chr4	55146406	.	T	TTGTAGGTCCCCCAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.866:5:0,2:0,1:0,0,5,0
chr4	55151711	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	55151727	.	T	TAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:55151727_T_TAA:55151727:0,3,0,1
chr4	55151729	.	G	GTATGTAAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:55151727_T_TAA:55151727:0,3,0,1
chr4	55151958	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	55156380	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	55156400	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	55161254	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	55161379	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:8,7,2,0
chr4	55161391	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,9,7
chr4	55161517	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	55561697	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=134,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,3:8,0:12,8,1,2
chr4	55599436	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	55946081	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,12,4
chr4	55948108	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,8:0,0,19,5
chr4	55955232	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	55961159	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:5,1:2,2:0,8,0,3
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chr4	55967971	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55967966_C_T:55967966:0,0,1,0
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chr4	55976947	.	TA	T,AA,TAA	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=10,29,16,11;MFRL=142,148,144,137;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,4,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=5.98,3.04,36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:9,5,5,18:0.149,0.089,0.500:37:0,0,0,2:1,3,2,3:0,9,2,26
chr4	55980239	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:2,3:1,6:2,1,7,3
chr4	56235897	.	CAAA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=251,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.543:7:0,1:3,3:3,0,4,0
chr4	56235931	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=204,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,2:2,5:3,0,4,3
chr4	56236327	.	G	GTTTCTTTTCAGT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=176,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:56236327_G_GTTTCTTTTCAGT:56236327:0,2,0,1
chr4	56236329	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=176,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:56236327_G_GTTTCTTTTCAGT:56236327:0,2,0,1
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chr4	56236336	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=221,122;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:56236327_G_GTTTCTTTTCAGT:56236327:0,1,0,1
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chr4	56315601	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:22,0:20,3:29,14,2,1
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chr4	56329773	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:3,7:7,5:9,1,13,0
chr4	56337041	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=206,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:0,7,0,7
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chr4	56422737	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:19,2:5,0:18,6,2,0
chr4	56428820	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:8,7:3,10:1,10,0,17
chr4	56447146	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=227,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	56448235	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,6:3,1:5,2,6,1
chr4	56458400	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=308,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr4	56465418	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,16:0,17:0,0,2,31
chr4	56471404	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,6:5,5:11,2,10,1
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chr4	56471551	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.584:39:8,12:8,10:4,12,6,17
chr4	56473359	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.605:28:8,9:2,8:11,0,16,1
chr4	56475447	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr4	56502317	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	56730304	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=224,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr4	56734701	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=158.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,20:0,26:0,0,11,35
chr4	56736794	.	T	TTTTG	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TTTG;STR;TLOD=64.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.576:30:8,8:5,9:13,0,17,0
chr4	56763085	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=176,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,2:6,5:0,8,1,6
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chr4	56763167	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:56763157_TGTATATC_T:56763157:0,1,0,1
chr4	56770490	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:13,1:12,2:26,2,3,0
chr4	56835114	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=266,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,2:0,4:1,0,5,1
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chr4	56835398	.	GCCAC	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=178,182;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:13,2:9,0:0|1:56835397_A_T:56835397:0,26,0,2
chr4	56835403	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=181,182;MMQ=60,41;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:14,2:9,0:0|1:56835397_A_T:56835397:0,24,0,2
chr4	56835405	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=180,182;MMQ=60,41;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:15,2:10,0:0|1:56835397_A_T:56835397:0,25,0,2
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chr4	56858007	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:11,4:2,5:13,0,8,1
chr4	56883987	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=117,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:8,5:5,6:4,9,4,7
chr4	56885581	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.456:33:9,6:8,8:9,9,5,10
chr4	57176964	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:0|1:57176964_CT_C:57176964:0,3,0,5
chr4	57176966	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0|1:57176964_CT_C:57176964:0,4,0,4
chr4	57180473	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,8:3,3:0,7,5,6
chr4	57180616	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,0:3,2:2,3,0,2
chr4	57180701	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=53,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,2:0,3:1,1,1,4
chr4	57189498	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,12,1
chr4	57190303	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=148,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:17,4:15,0:0|1:57190303_G_C:57190303:13,19,2,2
chr4	57190305	.	C	CGGGCCTCTTCTCTTCT	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=148,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.131:36:15,4:15,0:0|1:57190303_G_C:57190303:13,19,2,2
chr4	57190306	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=150,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:16,3:15,0:0|1:57190303_G_C:57190303:13,18,2,2
chr4	57190356	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=145,166;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.392:41:11,7:13,7:17,8,12,4
chr4	57193762	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,2:0,9:0,0,12,0
chr4	57204476	.	C	CTTCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=196,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTCT;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr4	57208955	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.335:25:11,3:5,5:17,0,8,0
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chr4	57301496	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,1,0
chr4	57319694	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=166,207;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:3,1:4,1:7,0,2,0
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chr4	57319731	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=148,195;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:5,0:0|1:57319726_G_T:57319726:17,1,2,0
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chr4	62599289	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,5:0,0,4,11
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chr4	62861941	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,8:3,3:6,0,10,1
chr4	62861964	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.551:20:4,7:4,4:6,3,9,2
chr4	65145955	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=69.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,8:0,7:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,0,17
chr4	65145966	.	T	TAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=64.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,8:0,5:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,0,15
chr4	65146700	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=177.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.981:47:0,24:0,23:0,0,46,1
chr4	65146711	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=189.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,24:0,28:0,0,51,4
chr4	65165661	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,27:0.459:59:12,7:20,20:27,5,21,6
chr4	65165849	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,26:0.599:43:6,9:11,16:0,17,0,26
chr4	65180310	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=147,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,3:2,1:4,0,5,0
chr4	65240805	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:7,6:5,4:11,1,11,0
chr4	66189753	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,3:3,0,6,0
chr4	66217408	.	A	ATCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=196,95;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0|1:66217408_A_ATCT:66217408:0,1,0,1
chr4	66217411	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=196,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:66217408_A_ATCT:66217408:0,1,0,1
chr4	66218728	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,14:0.334:43:12,11:16,3:20,9,13,1
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chr4	66231686	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=141,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.298:25:7,4:10,3:14,4,5,2
chr4	66233029	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=111,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,2,1
chr4	66270241	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:0,5,0,6
chr4	66286088	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	66286100	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr4	66468046	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr4	66509194	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=146.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,10:0,28:0,0,2,36
chr4	68338441	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,186;MMQ=60,34;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,5:0.103:56:27,0:24,5:2,49,0,5
chr4	68357814	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr4	68360955	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:3,5:3,6:4,3,5,6
chr4	68384008	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=118,154;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.455:42:14,12:9,7:12,11,6,13
chr4	68384861	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.447:36:13,8:7,8:19,1,16,0
chr4	68396525	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:9,4:5,1:10,4,4,1
chr4	68406626	.	TATTA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,2:3,3:6,1,4,1
chr4	68442968	.	A	G	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=236.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,73:0.974:74:0,34:1,38:0,1,31,42
chr4	68447040	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,2:5,2:9,3,3,1
chr4	68458937	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,4:7,4:8,2,6,2
chr4	68490019	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.489:33:11,8:5,8:1,16,2,14
chr4	68490044	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=143,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,5:6,5:1,12,0,10
chr4	68490650	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,4,1
chr4	68492060	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:11,8:0,6:7,4,11,3
chr4	68496080	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	68497333	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:6,8:4,6:9,1,14,0
chr4	68499205	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.235:11:6,2:0,0:3,6,0,2
chr4	68500056	.	GA	G	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.091:52:16,2:17,1:5,43,0,4
chr4	68511775	.	C	CACCTAGCCATCCG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=197,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:68511775_C_CACCTAGCCATCCG:68511775:1,2,0,1
chr4	68511778	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=197,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:68511775_C_CACCTAGCCATCCG:68511775:1,2,0,1
chr4	68511780	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:1,0:0|1:68511775_C_CACCTAGCCATCCG:68511775:0,2,0,1
chr4	68514739	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:5,8:8,3:12,1,10,1
chr4	68528744	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=196,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr4	68530890	.	GA	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,54;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:19,3:26,1:32,13,3,1
chr4	68539539	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:4,2:4,3:0,8,0,5
chr4	68544318	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:8,7:8,4:2,14,0,11
chr4	68547165	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,6:4,2:12,0,8,0
chr4	68547809	.	A	ATAC	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=167.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,44:0.517:85:25,24:15,18:39,2,37,7
chr4	68547956	.	C	A	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=144,93;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,4:0.058:83:41,0:38,1:11,68,0,4
chr4	68700956	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0,4,0,5
chr4	68780253	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=198,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:2,5:2,3:4,0,9,0
chr4	68780512	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,3:2,3:0,8,0,6
chr4	68788694	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr4	68829207	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr4	68919617	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.476:23:5,4:7,6:9,3,8,3
chr4	68934306	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=126,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,1:2,7:5,0,6,2
chr4	68937948	.	A	AAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AT;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	68938002	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,2:1,0:1,0,3,0
chr4	68956422	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=130,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:0,5:1,2:0,1,0,8
chr4	68956433	.	CC	GA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr4	68956445	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=170,287;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68956445_G_C:68956445:0,1,0,1
chr4	68956447	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=170,287;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68956445_G_C:68956445:0,1,0,1
chr4	68964768	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=122,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,1,4
chr4	69057073	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,4:3,1:5,4,4,1
chr4	69083563	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:10,8:12,5:16,6,9,4
chr4	69094926	.	TTAAA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:3,9:9,2:8,7,7,4
chr4	69097150	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	69098006	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.298:31:12,4:9,4:22,0,9,0
chr4	69100396	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=182,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:3,1:0,7,1,3
chr4	69181942	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=204,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:4,3:7,0:12,0,3,0
chr4	69332537	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr4	69337105	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=173,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:1,1:2,0:3,1,2,0
chr4	69340500	.	A	G	.	.	DP=119;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=192.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,64:0.544:118:29,38:23,26:17,37,15,49
chr4	69342169	.	G	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,17:0.367:47:20,6:10,11:2,28,2,15
chr4	69343353	.	A	G	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=236.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.987:71:0,33:0,36:0,0,23,48
chr4	69344733	.	G	T	.	.	DP=138;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=430.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,130:0.993:130:0,62:0,67:0,0,49,81
chr4	69362301	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.493:43:8,11:12,10:21,1,21,0
chr4	69434217	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	69681675	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	69682471	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr4	69683953	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=117.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,0,31
chr4	69687964	.	G	A	.	.	DP=123;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=363.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,113:0.992:113:0,49:0,56:0,0,61,52
chr4	69687987	.	C	A	.	.	DP=138;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=457.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,136:0.993:136:0,62:0,73:0,0,52,84
chr4	69795871	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	69796548	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr4	69796838	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,18,3
chr4	69810923	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	69964180	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=180,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr4	69964209	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,2:4,0,6,0
chr4	69964234	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.716:16:3,5:1,5:4,0,11,1
chr4	69973044	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:4,7:11,7:0,15,0,14
chr4	69978554	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=180,243;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.264:9:0,0:4,1:2,5,0,2
chr4	70152685	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:0,3,0,4
chr4	70346680	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,6:7,2:1,11,0,8
chr4	70346711	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:0,5,0,7
chr4	70465153	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,2:2,3:1,4,0,5
chr4	70504823	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:11,7:4,6:4,11,5,8
chr4	70505254	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.100:47:20,3:23,0:30,13,4,0
chr4	70592790	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,11:0,7:0,0,15,3
chr4	70599073	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr4	70620708	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr4	70803380	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:4,5:3,5:8,0,10,0
chr4	70805829	.	TCACA	T,TCA	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=33,31,33;MFRL=183,163,162;MMQ=60,60,60;MPOS=14,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=CA;STR;TLOD=40.60,4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,12,3:0.647,0.093:21:3,4,1:3,6,2:0,6,0,15
chr4	70805833	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.354:42:10,3:11,8:2,24,0,16
chr4	70805835	.	A	T	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.112:38:12,0:11,3:2,32,0,4
chr4	70810524	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:7,0:15,1,2,0
chr4	70811806	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.530:32:5,10:10,7:13,2,15,2
chr4	70824865	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:0,4,0,8
chr4	70824887	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=178,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr4	70826810	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr4	70864065	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:2,1,3,0
chr4	70865621	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr4	70921164	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:4,1,8,1
chr4	70921337	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:1,4,0,5
chr4	71020205	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,1,11
chr4	71021888	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=135.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,26:0,11:0,0,1,36
chr4	71024010	.	T	TACAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	71027213	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=149.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,20:0,25:0,0,40,5
chr4	71062342	.	C	T	.	.	DP=120;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=129.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,49:0.431:114:37,28:28,21:29,36,24,25
chr4	71067317	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=80.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,0,23
chr4	71110488	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=177,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:4,0,5,0
chr4	71110505	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr4	71110639	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,9:0,5:0,0,1,13
chr4	71110680	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=151,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,1:2,2:0,4,1,3
chr4	71113633	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.382:40:11,5:13,10:1,24,0,15
chr4	71114676	.	TATA	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=141,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=ATA;STR;TLOD=53.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.399:41:18,9:5,7:17,8,12,4
chr4	71114702	.	A	AT	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=39.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.491:46:15,11:7,11:9,14,16,7
chr4	71115152	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,13:0,4:0,0,7,10
chr4	71227802	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=147,168;MMQ=27,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=115.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,34:0.899:37:2,20:1,14:3,0,29,5
chr4	71227998	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=66.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.943:15:0,6:0,8:0|1:71227998_A_T:71227998:0,0,1,14
chr4	71228001	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0|1:71227998_A_T:71227998:0,0,1,14
chr4	71232701	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:1,4:6,1:0,7,3,3
chr4	71232742	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=208,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr4	71232778	.	T	TCCCTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	71250308	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr4	71250399	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr4	71255370	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,174;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:4,8:5,4:7,2,12,1
chr4	71255593	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=90,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.560:30:5,10:7,6:9,4,9,8
chr4	71275012	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,19,0
chr4	71384579	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,3,14
chr4	71388379	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,15,1
chr4	71388394	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=70.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,19,1
chr4	71394346	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.128:35:15,4:14,0:29,2,4,0
chr4	71394353	.	CA	TG	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=157,145;MMQ=60,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:18,2:18,0:35,3,2,0
chr4	71394354	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.138:39:15,5:17,0:31,3,5,0
chr4	71394362	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.090:52:20,3:21,0:43,5,3,1
chr4	71394367	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.136:49:17,7:23,0:37,5,6,1
chr4	71398064	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=164.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,22:0,27:0,0,40,9
chr4	71459041	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:0|1:71459041_T_C:71459041:10,7,1,1
chr4	71459050	.	C	CCAAAAGAGTG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:10,2:0|1:71459041_T_C:71459041:12,9,1,1
chr4	71459055	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=139,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,1:0|1:71459041_T_C:71459041:11,10,1,1
chr4	71467346	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:8,0:1,15,0,2
chr4	71471985	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:5,4:8,3:7,6,4,3
chr4	71472426	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,110;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.541:35:7,10:9,9:9,7,8,11
chr4	71497661	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=152,129;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:10,0:15,3:3,23,0,3
chr4	71498303	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=100.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,33:0.531:62:17,20:12,13:29,0,31,2
chr4	71501674	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,6:5,2:0,9,0,9
chr4	71554619	.	CGAG	C	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GAG;STR;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,5:0.092:62:23,1:29,4:25,32,2,3
chr4	71588432	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=165,51;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:71588432_A_T:71588432:8,15,1,1
chr4	71588444	.	C	CCATCCCCAGCTGCACCACA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=119,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:5,0:11,2:0|1:71588432_A_T:71588432:7,13,1,1
chr4	71691743	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,5,1
chr4	71691975	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,6:4,5:2,5,2,9
chr4	71698183	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,4,11
chr4	71892513	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=139.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,23:0,17:0,0,2,40
chr4	72306239	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr4	72306560	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr4	72316023	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=233,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:72316023_G_A:72316023:1,0,1,0
chr4	72316032	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=197,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:72316023_G_A:72316023:3,0,1,0
chr4	72316822	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr4	72317018	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=113,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:17,1:24,1:12,29,0,3
chr4	72319431	.	G	GATTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=219,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:72319431_G_GATTTT:72319431:0,3,0,1
chr4	72319436	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=219,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:72319431_G_GATTTT:72319431:0,3,0,1
chr4	72397710	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	72397964	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,2:1,1:0,1,1,3
chr4	72411967	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	72412029	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=129,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:2,1,7,0
chr4	72413314	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=209,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,3:6,3:7,1,5,1
chr4	72423624	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr4	72429433	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	72429452	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	72618334	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:12,7:5,0:7,10,4,3
chr4	72620865	.	C	CTATTTATT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TATT;STR;TLOD=41.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.930:10:0,2:0,4:0,0,0,10
chr4	72622403	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,8,7
chr4	72634192	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,150;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:5,1:4,1:0,9,0,3
chr4	72634975	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr4	72934632	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=107.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,14:0,16:0,0,29,1
chr4	73012683	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=104,100;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr4	73156676	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=161,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:10,1:11,1:14,8,0,2
chr4	73175048	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=169,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:3,0:0,4:3,0,3,1
chr4	73175093	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr4	73205240	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,62;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,2:4,0:7,8,0,2
chr4	73414286	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:5,6:2,9:3,4,6,9
chr4	73433122	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:4,6:6,4:7,4,3,7
chr4	73434379	.	GT	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=104.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.976:40:0,29:0,11:0,0,34,6
chr4	73434535	.	CA	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.200:32:8,4:16,3:0,25,0,7
chr4	73927445	.	AAAG	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,14;MFRL=195,156;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,0:0|1:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73927448	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,15;MFRL=0,195;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.684:1:0,0:0,0:1|0:73927445_AAAG_A:73927445:0,0,1,0
chr4	73927452	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,12;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=-1073741810;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:73927445_AAAG_A:73927445:0,0,2,0
chr4	73927456	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=14,10;MFRL=195,156;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73927459	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=16,18;MFRL=195,156;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73927460	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=16,20;MFRL=156,195;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1|0:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73927464	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=9,12;MFRL=156,195;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1|0:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73927470	.	TCT	GAA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=0,17;MFRL=0,195;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1|0:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73927476	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,17;MFRL=0,195;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.498:2:1,0:0,0:1|0:73927445_AAAG_A:73927445:1,0,1,0
chr4	73931170	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr4	73933671	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=136,156,119;MMQ=60,60,60;MPOS=19,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=TG;STR;TLOD=20.08,3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,9,3:0.640,0.245:13:0,7,1:1,2,2:1,0,12,0
chr4	73933919	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=193,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:6,0:3,4:0,10,0,4
chr4	74005613	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:10,7:11,8:14,7,11,4
chr4	74008195	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=201,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:1,2:7,0:1,7,0,2
chr4	74010555	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=10,32;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,2:1,0:1,3,0,2
chr4	74014809	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:6,9:10,4:0,16,0,13
chr4	74285204	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:2,1:1,0:10,2,2,0
chr4	74286122	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,3:2,0:0,7,0,3
chr4	74302800	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,2:4,4:8,0,6,0
chr4	74304118	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	74307954	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=179,52;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,0,2
chr4	74309245	.	C	CACATGCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=188,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,2:4,0:0,12,0,2
chr4	74313169	.	T	C	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=312.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,87:0.989:87:0,45:0,38:0,0,36,51
chr4	74352916	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr4	74354469	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=190,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,2:3,6:3,6,2,6
chr4	74357851	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,1:4,7:1,7,0,8
chr4	74364992	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.651:15:2,5:1,4:0,5,0,10
chr4	74367706	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=160,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,3:2,3:0,4,0,6
chr4	74447452	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:6,2:4,6:8,2,6,2
chr4	74448078	.	ATCT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=209,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:5,2:5,5:0,10,0,7
chr4	74450830	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,8:2,2:8,0,10,0
chr4	74451073	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=152,100;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,16:0.708:22:3,10:2,5:0|1:74451073_A_G:74451073:2,4,5,11
chr4	74451092	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=160,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:4,6:3,3:0|1:74451073_A_G:74451073:1,6,1,8
chr4	74453656	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.561:41:7,10:10,13:6,12,9,14
chr4	74453691	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:5,6:6,11:0,11,4,13
chr4	74464285	.	T	TTG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=128,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TG;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr4	74464443	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr4	74486052	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr4	74486264	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	74607160	.	CATAGTCTCCAA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:11,0:7,1:25,0,2,0
chr4	74713799	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr4	74713950	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr4	74714003	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=144,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,5:4,4:10,0,9,0
chr4	74719259	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=195,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,2:2,4:0,4,0,7
chr4	74719925	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	74735244	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=209,202;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr4	74736144	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr4	74847292	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,7:0,0,2,17
chr4	74903137	.	T	TCCCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=223,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	75040944	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr4	75147041	.	C	CGT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=GT;STR;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:2,2:2,0:4,0,3,0
chr4	75245343	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr4	75248544	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,1,12
chr4	75673363	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr4	75673455	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	75675706	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,21,0
chr4	76442241	.	TTTTTTG	T,GTTTTTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,15,34;MFRL=193,108,121;MMQ=55,60,60;MPOS=13,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,0:1,0,1:0,4,0,2
chr4	76525648	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr4	76528916	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,10;MFRL=208,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0|1:76528916_C_A:76528916:2,0,2,0
chr4	76528919	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,24;MFRL=208,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:0,0:0|1:76528916_C_A:76528916:2,0,2,0
chr4	76532615	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:76532615_G_A:76532615:0,0,0,1
chr4	76532617	.	C	CTCCAGAACT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:76532615_G_A:76532615:0,0,0,1
chr4	76573938	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.200:20:6,0:7,4:2,14,0,4
chr4	76649924	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:6,3:13,5:18,1,8,0
chr4	76650026	.	TG	T	.	.	DP=118;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=125,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:88,5:0.052:93:45,3:37,1:48,40,3,2
chr4	76650176	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:8,7:4,9:0,12,0,16
chr4	76678576	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:4,5:9,10:12,1,15,0
chr4	76695810	.	TTCTC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,2:4,7:8,4,9,1
chr4	76721414	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:8,0,8,0
chr4	76721459	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=127,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.457:24:8,6:5,4:11,2,10,1
chr4	76721705	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=214,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,1:4,1:4,4,1,1
chr4	76722041	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr4	76722422	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,7:6,3:0,9,0,10
chr4	76725245	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,13:0,0,26,1
chr4	76726528	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,2:3,1:0,8,0,3
chr4	76726539	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=175,71;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:4,1:0,8,0,2
chr4	76727576	.	GT	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,19:0.607:31:3,9:7,10:12,0,19,0
chr4	76730004	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,18,0
chr4	76730061	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=161.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,29:0,18:0,0,37,10
chr4	76730195	.	A	G	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,38:0.379:100:33,25:28,11:19,43,10,28
chr4	76730258	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=164.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,21:0,22:0,0,0,43
chr4	76734266	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.156:23:7,2:13,1:20,0,3,0
chr4	76734343	.	C	T	.	.	DP=112;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=119.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,45:0.431:105:25,25:33,20:28,32,23,22
chr4	76785716	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,0,12
chr4	76785723	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,0,10
chr4	76785736	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=203,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr4	76788451	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,156;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.136:24:11,2:10,0:20,1,3,0
chr4	76804067	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,4,2
chr4	76805692	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	76805962	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	76805978	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=182,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr4	76809319	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr4	76811365	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	76813200	.	GAGGA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=205,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	76841962	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:13,4:14,0:12,16,0,4
chr4	76861137	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:8,2,7,1
chr4	76861859	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	76878956	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=86.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,29:0.556:52:16,18:7,11:23,0,28,1
chr4	76878982	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=113.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,37:0.584:63:16,23:10,13:25,1,33,4
chr4	76891385	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,40;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:6,0:2,2:9,0,2,0
chr4	76892452	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=130,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr4	76903036	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:4,3:5,4:8,1,6,1
chr4	76924933	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=220,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:0,1,0,4
chr4	76942943	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=235,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr4	76943235	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,4:5,6:0,9,0,11
chr4	76943677	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,2,2
chr4	76943764	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr4	76944491	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=125,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:8,6:3,5:7,4,10,1
chr4	76956289	.	C	CAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=65.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:5,5:11,13:7,10,9,9
chr4	76956528	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:4,4:12,7:3,13,3,8
chr4	76957171	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=89,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.764:17:1,6:2,8:0,3,6,8
chr4	76996957	.	CG	GA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=42.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,6:5,5:9,1,11,0
chr4	76996981	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=50.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:8,10:10,7:17,1,17,0
chr4	76997157	.	G	GT,GTT,GTTT	.	.	DP=84;ECNT=6;MBQ=29,25,30,14;MFRL=134,132,149,143;MMQ=60,60,60,50;MPOS=21,21,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,16,17,18;RU=T;STR;TLOD=4.92,10.25,8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:22,6,7,8:0.146,0.183,0.192:43:13,2,4,2:5,2,2,1:5,17,5,16
chr4	76997200	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=154,156;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,18:0.500:36:14,16:4,2:0|1:76997200_A_G:76997200:0,18,0,18
chr4	76997219	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=169,168;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,10:0.355:29:10,10:3,0:0|1:76997200_A_G:76997200:0,19,0,10
chr4	76997224	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=175,168;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:13,9:2,0:0|1:76997200_A_G:76997200:0,16,0,10
chr4	76997226	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=181,156;MMQ=55,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:15,6:2,0:0,17,0,6
chr4	76997227	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=169,203;MMQ=52,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:19,2:2,0:0,21,0,2
chr4	77020207	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=165,112;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.089:31:14,2:11,0:0|1:77020207_C_CT:77020207:0,29,0,2
chr4	77020208	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,8:0.288:29:12,5:9,2:0|1:77020207_C_CT:77020207:0,21,0,8
chr4	77021551	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=185,164;MMQ=40,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:0,9,0,4
chr4	77021811	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=169,185;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:77021811_C_G:77021811:4,0,1,0
chr4	77021815	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=169,185;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:77021811_C_G:77021811:4,0,1,0
chr4	77025840	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=118,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,2:4,6:0,6,2,6
chr4	77028783	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr4	77036593	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.103:37:20,3:12,0:16,18,2,1
chr4	77038757	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:7,6:2,5:9,0,7,4
chr4	77065476	.	TA	T,TAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=155,158,184;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=10.70,21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,12:0.228,0.476:25:3,6,5:4,0,4:6,1,11,7
chr4	77189928	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=137,70;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:7,0:8,4:0|1:77189928_A_T:77189928:4,11,1,3
chr4	77189931	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=137,70;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:5,0:8,4:0|1:77189928_A_T:77189928:3,11,1,3
chr4	77192688	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,3:2,5:1,1,6,2
chr4	77199414	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=172,233;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr4	77201332	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	77204500	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.571:35:8,11:6,9:11,4,13,7
chr4	77227856	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	77272926	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:5,8:4,6:5,4,4,11
chr4	77274242	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,20,0
chr4	77288683	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:7,12,1,1
chr4	77288973	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77288973_G_GA:77288973:0,1,0,1
chr4	77288974	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77288973_G_GA:77288973:0,1,0,1
chr4	77288977	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:77288973_G_GA:77288973:0,1,0,1
chr4	77303898	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr4	77476964	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:77476964_T_C:77476964:0,0,0,1
chr4	77476966	.	TC	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:77476964_T_C:77476964:0,0,0,1
chr4	77476971	.	CTA	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:77476964_T_C:77476964:0,0,0,1
chr4	77476975	.	C	CAAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:77476964_T_C:77476964:0,0,0,1
chr4	77662309	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=215,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr4	77677612	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=132,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.149:32:10,0:13,0:15,12,5,0
chr4	77680694	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,1:13,1:16,8,2,0
chr4	77817507	.	C	CAGAAAGCGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=179,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	77871016	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,2,1
chr4	77976617	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=187,255;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.411:8:2,1:0,0:0,5,0,3
chr4	77987351	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,5:1,0:1,0,5,0
chr4	78082563	.	TATTTAAAATC	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTTAAAATC;STR;TLOD=60.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.572:28:5,4:4,12:9,3,13,3
chr4	78694327	.	TA	T,TAA	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,32,31;MFRL=154,215,123;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=17.21,4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,10,6:0.335,0.203:29:2,2,4:10,7,1:0,13,1,15
chr4	78695723	.	C	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=128,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:34,3:20,0:35,20,3,0
chr4	78697552	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr4	78793016	.	AT	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.093:52:24,4:22,1:12,35,1,4
chr4	78806526	.	TAA	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=145,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,0:8,2:4,17,1,1
chr4	78806601	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=188,236;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	78815272	.	CT	C,CTT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,34,34;MFRL=147,154,137;MMQ=60,60,60;MPOS=25,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.06,4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,4,4:0.117,0.138:33:9,3,0:16,1,2:24,1,8,0
chr4	78873605	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,7:7,5:9,3,10,2
chr4	78873629	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.456:33:10,8:8,7:11,7,10,5
chr4	78979141	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=146,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,1,1
chr4	78979257	.	CGT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=137,70;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.299:11:4,2:3,1:3,5,1,2
chr4	78979301	.	A	AAGGGAAGAATGAAGAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=163,97;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	79173515	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,54545;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	79176325	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr4	79176361	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.942:13:0,10:0,3:0,0,12,1
chr4	79187900	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=200,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,0,2
chr4	79188160	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr4	79204164	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,2:2,0:2,4,0,2
chr4	79204209	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	79205699	.	T	A	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=128,120;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,39:0.563:69:12,24:18,15:11,19,20,19
chr4	79205747	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.531:34:5,12:10,6:1,15,2,16
chr4	79207784	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	79229435	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=94,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,1:2,5:1,3,0,6
chr4	79238448	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr4	79238496	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=153,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:5,1,1,1
chr4	79240196	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,4:6,0:0,7,2,2
chr4	79295418	.	C	CTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=196,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr4	79305148	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,18:0.452:40:13,11:9,7:20,2,18,0
chr4	79305177	.	T	G	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=136,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=92.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,33:0.522:63:13,17:17,15:21,9,23,10
chr4	79328729	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr4	79334264	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,4:8,3:4,8,3,4
chr4	79340016	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=256,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr4	79343111	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.592:13:0,4:4,2:2,3,3,5
chr4	79343213	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=236,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
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chr4	79366655	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=116,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:5,5:6,4:6,5,6,3
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chr4	79373254	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,16,0
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chr4	79387278	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
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chr4	79391327	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=110,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr4	79394836	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr4	79396695	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,0:10,2:3,13,0,2
chr4	79403146	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:3,3:4,5:0,8,1,7
chr4	79403682	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.481:31:8,6:8,8:1,15,4,11
chr4	79403781	.	TT	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=219,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr4	79409997	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr4	79421011	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.592:42:10,11:7,14:10,7,11,14
chr4	79434487	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,6:2,1:8,0,7,0
chr4	79434685	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=112,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:3,4:4,2:1,6,0,7
chr4	79436875	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=226,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr4	79436888	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr4	79437178	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.489:26:4,5:9,5:3,10,2,11
chr4	79440425	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr4	79442799	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.631:6:1,1:1,3:0,2,0,4
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chr4	79443837	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:4,3,4,2
chr4	79443850	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:2,3,4,0
chr4	79444029	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=125,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr4	79444043	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=176,242;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,1,1
chr4	79455858	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	79458112	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=136,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:2,1,3,1
chr4	79460660	.	A	ATGATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr4	79462311	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr4	79475494	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	79503230	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=18,32;MFRL=152,202;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr4	79512800	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.532:26:8,5:4,8:0,12,2,12
chr4	79516694	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=201,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr4	79531186	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:8,2:2,5:9,2,4,3
chr4	79531308	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:0,4,2,5
chr4	79697892	.	AGGCTC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=99,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:3,3,0,2
chr4	79768294	.	TTA	T,TTATA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=168,136,184;MMQ=60,60,60;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=TA;STR;TLOD=9.25,3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,4,2:0.130,0.081:33:15,2,2:12,2,0:24,3,4,2
chr4	79780667	.	TTATAATGTGCCCCTAAGTAG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=136,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:2,0:8,0,2,0
chr4	79786974	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr4	79792166	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr4	79847634	.	GA	G,GAA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=33,35,26;MFRL=149,84,151;MMQ=60,60,60;MPOS=18,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.29,5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,5,5:0.134,0.141:35:8,3,1:15,2,2:21,4,8,2
chr4	80828668	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,1,12
chr4	80828740	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	80905851	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,12,0
chr4	80905930	.	G	GA	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=110,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.203:35:15,5:12,1:18,10,4,3
chr4	80906131	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	80939979	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=86.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,18:0,7:0,0,25,0
chr4	80957195	.	GAA	G,GA,CAA,GAAA	.	.	DP=106;ECNT=1;MBQ=17,18,18,19,18;MFRL=144,145,117,116,145;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=21,26,20,20;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;TLOD=4.60,10.08,3.83,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:38,3,8,4,5:0.048,0.110,0.057,0.088:58:4,0,1,1,1:2,1,0,0,1:3,35,1,19
chr4	80975372	.	A	T	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=289.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,89:0.989:89:0,47:0,42:0,0,66,23
chr4	80976420	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=80.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,12:0,0,12,13
chr4	81123013	.	CGT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:8,1:4,2:11,1,2,1
chr4	81884610	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=60.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.919:22:0,7:1,12:1,0,20,1
chr4	82013619	.	A	AAAGGAAGG,AAAGGAAGGAAGG	.	.	DP=90;ECNT=1;MBQ=0,28,32;MFRL=0,158,162;MMQ=60,40,36;MPOS=1,8;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,14,15;RU=AAGG;STR;TLOD=4.65,6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.431,0.451:5:0,1,1:0,1,1:0,0,0,5
chr4	82056304	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:14,0:16,8,2,0
chr4	82065566	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=230,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr4	82088478	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=212,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,3:3,2:0,6,0,5
chr4	82092967	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=123,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,2:8,2:3,7,0,4
chr4	82366788	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=135,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.425:12:5,2:2,3:2,5,2,3
chr4	82368633	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=160,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.454:31:7,8:10,6:14,3,12,2
chr4	82368705	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,1:17,1:8,19,1,1
chr4	82369160	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr4	82369205	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr4	82369494	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr4	83294641	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=21,10;MFRL=128,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,4:0.074:46:23,1:16,0:0|1:83294641_T_G:83294641:21,21,4,0
chr4	83294645	.	A	C	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=20,34;MFRL=126,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.072:47:16,3:11,0:0|1:83294641_T_G:83294641:20,23,4,0
chr4	83294649	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=20,9;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,3:0.066:46:24,0:16,0:0|1:83294641_T_G:83294641:19,24,3,0
chr4	83347106	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=193,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,4:3,5:5,0,9,0
chr4	83347309	.	TAAGA	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=175.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,20:0,20:0,0,12,28
chr4	83347859	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,781;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr4	83378264	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=158,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0,4,0,1
chr4	83411197	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,253;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,1:2,0,3,1
chr4	83424089	.	TA	T,TAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30,26;MFRL=132,127,179;MMQ=60,60,60;MPOS=15,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=4.76,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,5,3:0.186,0.150:24:6,2,1:5,3,1:10,6,4,4
chr4	83558064	.	G	GAGTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.252:6:4,1:0,0:0,5,0,1
chr4	83602112	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	83626382	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.606:21:6,8:2,4:7,1,12,1
chr4	83742336	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:3,1:1,1:0,4,1,2
chr4	83778378	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	83785778	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,38;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:3,5,1,1
chr4	83788139	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=156.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,21:0,23:0,0,4,41
chr4	83788562	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	83791649	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	83793243	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=76.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,10:0,11:0,0,9,13
chr4	83800181	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,0,23
chr4	83827822	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=234,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,6:2,3:0,3,0,9
chr4	83852065	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,15,4
chr4	83857108	.	AT	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,6:2,3:5,0,8,1
chr4	83857402	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=163.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,23:0,23:0,0,42,6
chr4	83857613	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:1,11,0,3
chr4	83900260	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	83970297	.	CT	C,CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34,20;MFRL=146,180,174;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.13,4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.266,0.324:10:1,0,2:2,3,0:4,0,4,2
chr4	83989516	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	83989571	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=120,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,1:7,2:9,3,3,2
chr4	84015940	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:70,3:0.053:73:34,0:34,3:18,52,0,3
chr4	84185613	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=-1073741819;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0,10,0,2
chr4	84189012	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.826:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	84193366	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,1:0,10:0,0,1,10
chr4	84200317	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,3:5,4:0,6,0,7
chr4	84205618	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.461:35:9,8:6,7:15,4,12,4
chr4	84223461	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr4	84229897	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr4	84232104	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	84234190	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=203,180;MMQ=47,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr4	84234229	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	84240654	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	84240680	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.881:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	84243549	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	84352750	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,5:4,5:8,0,10,0
chr4	84362443	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:13,11:3,5:11,5,13,3
chr4	84364808	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=131,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr4	84367286	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:0,9,0,4
chr4	84368225	.	GCATTGTGGCCAATGCCTGTAATCC	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=212,157;MMQ=46,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.640:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr4	84368276	.	AG	GA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,35;MFRL=142,226;MMQ=60,32;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:84368276_AG_GA:84368276:0,1,0,1
chr4	84368280	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,32;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:84368276_AG_GA:84368276:0,0,0,1
chr4	84368285	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,32;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:84368276_AG_GA:84368276:0,0,0,1
chr4	84368287	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,32;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:84368276_AG_GA:84368276:0,0,0,1
chr4	84370091	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.580:41:4,11:13,12:3,14,6,18
chr4	84370124	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:0,4:3,3:0,3,0,8
chr4	84376725	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:14,0:8,2:0|1:84376725_T_C:84376725:2,20,1,1
chr4	84376730	.	C	CAAAAGGAACCGTCCAAGCT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:6,2:0|1:84376725_T_C:84376725:2,21,1,1
chr4	84376743	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,4:0,0,1,14
chr4	84381035	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,1:6,4:0,10,0,5
chr4	84382058	.	CA	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=101,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.496:41:10,9:11,10:17,4,17,3
chr4	84383810	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,28:0.482:58:15,13:15,14:15,15,10,18
chr4	84393475	.	C	T	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,32:0.506:63:13,12:18,19:6,25,4,28
chr4	84403491	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	84465613	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.772:20:2,11:2,4:4,0,16,0
chr4	84465855	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr4	84509465	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,1,9
chr4	84519775	.	AT	A,ATT,ATTT	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=33,32,33,33;MFRL=139,172,122,138;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,19,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=5.05,30.54,5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:33,5,22,8:0.071,0.344,0.106:68:17,3,9,5:15,2,13,2:29,4,27,8
chr4	84525973	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=154,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	85555196	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=182,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr4	85555199	.	G	GGCTGTTTGTATATA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	85556386	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=126,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr4	85556392	.	CTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=126,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.247:6:2,1:2,0:4,1,1,0
chr4	85560000	.	TTA	T,TTATA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34,30;MFRL=133,175,166;MMQ=60,60,60;MPOS=27,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=TA;STR;TLOD=10.73,7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,3:0.294,0.256:13:3,3,1:3,1,1:5,1,7,0
chr4	85612737	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:0,1:4,2:4,1,3,0
chr4	85634488	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	85639779	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,2:5,2:0,5,0,4
chr4	85647941	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,1:1,2:7,0,3,0
chr4	85648097	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=160,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.326:10:2,0:4,2:0,7,0,3
chr4	85656350	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr4	85699579	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=186,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:8,7:3,6:11,0,13,0
chr4	85710824	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=12,30;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,7:0,8:1,0,18,2
chr4	85716119	.	G	A	.	.	DP=107;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,4:0.049:99:40,0:52,4:26,69,0,4
chr4	85722718	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	85729647	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=197,190;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:1,12,0,3
chr4	85731549	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,18;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:85731549_A_G:85731549:0,0,0,1
chr4	85731551	.	A	ATACATTGAATGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:85731549_A_G:85731549:0,0,0,1
chr4	86863166	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=134,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,3:7,4:10,0,7,0
chr4	86863206	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=57.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.961:22:0,4:0,16:0,0,19,3
chr4	86863490	.	GTGA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=175,230;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:86863490_GTGA_G:86863490:0,2,0,1
chr4	86863497	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=175,230;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:86863490_GTGA_G:86863490:0,2,0,1
chr4	86915923	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=118,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.374:33:6,4:12,8:12,9,9,3
chr4	86921612	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,2:3,4:2,3,2,4
chr4	87610236	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.068:57:27,2:24,1:30,24,2,1
chr4	87674183	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:16,3:6,6:12,10,4,5
chr4	87690982	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.074:52:22,1:26,2:26,23,1,2
chr4	87690998	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,22:0.383:58:19,10:17,11:19,17,15,7
chr4	87695731	.	G	GTAAATTAAAAATCTTCTGGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	87728676	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=177,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr4	87754419	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:4,2,4,0
chr4	87809515	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	87812586	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=33,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.794:11:0,3:0,5:1,1,7,2
chr4	87928637	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=136,37;MMQ=60,53;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.261:11:3,0:6,2:0|1:87928637_C_CA:87928637:4,5,1,1
chr4	87928642	.	G	GTGCATGTATCCCGCTGTTGTTGTCACTGGTCTCTGAGTCGCA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=131,37;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.267:10:3,0:3,2:0|1:87928637_C_CA:87928637:2,6,1,1
chr4	87968798	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr4	88029482	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr4	88036460	.	G	GAACTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	88048163	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr4	88048315	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.898:6:0,0:0,2:0,0,0,6
chr4	88048328	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	88052219	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=77.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,13,11
chr4	88053085	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr4	88056719	.	GT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=71.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.937:30:0,12:0,16:0,1,15,14
chr4	88056925	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:0,6:1,11:0,1,0,17
chr4	88085076	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.302:27:7,3:12,4:9,10,5,3
chr4	88226480	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	88231338	.	GC	AA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=152,152;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.433:9:2,0:2,0:0|1:88231338_GC_AA:88231338:2,3,4,0
chr4	88231350	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=150,156;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.194:17:4,0:7,0:0|1:88231338_GC_AA:88231338:5,9,3,0
chr4	88231429	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.419:48:15,9:12,11:7,21,9,11
chr4	88234874	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	88238448	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	88293769	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:4,0,2,0
chr4	88293992	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,0:0,9:0,0,3,6
chr4	88295786	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=89.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,13:0,9:0,0,23,0
chr4	88312251	.	GTT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=216,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:0,0:2,1:0,3,0,2
chr4	88312293	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	88356111	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,3:3,4:4,2,6,1
chr4	88362904	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:9,5:9,3:18,0,8,0
chr4	88532182	.	AGT	A,AGTGTGT,AGTGTGTGT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,33,20,26;MFRL=109,126,202,155;MMQ=37,60,50,42;MPOS=22,12,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,15,18,19;RU=GT;STR;TLOD=8.92,4.23,3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,4,2,3:0.243,0.216,0.334:11:1,1,1,2:1,3,1,1:0,2,0,9
chr4	88533163	.	TTG	T,TTGTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29,33;MFRL=0,159,189;MMQ=60,60,60;MPOS=11,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=TG;STR;TLOD=5.87,10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.336,0.565:6:0,1,1:0,1,3:0,0,6,0
chr4	88535826	.	G	A	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=133,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=105.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,48:0.509:93:24,20:16,16:28,17,18,30
chr4	88536520	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,88;MMQ=60,57;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=201.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.986:66:0,27:0,27:0,0,41,25
chr4	88536868	.	TAGTGACAGCAGCAATAGC	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=120,134;MMQ=31,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=54.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.411:45:10,4:4,7:12,15,8,10
chr4	88537737	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:3,3:4,5:0,8,0,8
chr4	88577573	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=159,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	88577754	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr4	88578310	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,1:6,5:0,10,0,6
chr4	88732453	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=84.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,16:0,9:0,0,24,1
chr4	88732639	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=105,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,3:0.056:68:27,2:37,1:33,32,1,2
chr4	88732692	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=90,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,34:0.524:65:15,16:14,18:9,22,11,23
chr4	88755828	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr4	88759690	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,14,1
chr4	88901100	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=214,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr4	88959381	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,7:2,1:3,0,7,1
chr4	88959745	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=190,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr4	88977247	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:14,2:7,0:13,8,2,0
chr4	88986745	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:0,2:4,1:1,4,2,1
chr4	89015619	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	89015857	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:0,5:3,3:1,3,2,6
chr4	89016782	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:5,5:8,9:1,12,1,13
chr4	89018565	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.538:26:5,5:7,9:9,3,13,1
chr4	89022362	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:9,4:2,3:7,4,3,4
chr4	89326077	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:18,0:15,2:16,17,1,1
chr4	89349921	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:10,6:5,5:4,11,0,11
chr4	89352469	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:9,2:3,3:6,9,2,3
chr4	89359045	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=204,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:0,11,0,2
chr4	89360994	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=196,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.515:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr4	89389640	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	89400454	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,15;MFRL=143,116;MMQ=60,46;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.395:10:1,0:2,0:5,1,4,0
chr4	89400457	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=143,116;MMQ=60,46;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,0:3,0:5,1,4,0
chr4	89400460	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=131,158;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:3,1:7,1,2,0
chr4	89427070	.	CGTT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GTT;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.458:9:4,3:1,1:0,5,1,3
chr4	89575324	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,0:2,5:0,5,0,5
chr4	89583523	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr4	89585235	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,4:2,4:7,0,8,0
chr4	89588689	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:9,2:8,7:0,17,0,9
chr4	89599074	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr4	89599307	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:89599307_C_A:89599307:0,3,0,1
chr4	89599313	.	A	AATTCTCTTTTTTGGTTGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=141,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:89599307_C_A:89599307:0,4,0,1
chr4	89618498	.	C	CTCTTCTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,2:11,0:6,11,0,2
chr4	89649659	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,4:4,4:4,1,7,1
chr4	89670962	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,0:10,2:16,9,2,0
chr4	89671810	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=100,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	89708804	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=15,36;MFRL=240,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr4	89708850	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	89772341	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,17;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:1,0:0,0:0,1,0,2
chr4	89912345	.	GTAACAA	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=120,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.331:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr4	89912361	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=238,208;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:89912361_C_CA:89912361:0,4,0,1
chr4	89912362	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,23;MFRL=238,208;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:89912361_C_CA:89912361:0,4,0,1
chr4	89912366	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=238,208;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:89912361_C_CA:89912361:0,4,0,1
chr4	89941921	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=194,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:0,4,0,3
chr4	89950665	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:13,1:13,2:14,12,3,0
chr4	90036099	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=213,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:90036099_G_A:90036099:0,2,0,2
chr4	90036101	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=213,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:90036099_G_A:90036099:0,2,0,2
chr4	90168882	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=149,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:5,7:8,10:12,1,16,1
chr4	90743317	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.771:11:1,6:1,3:0|1:90743317_T_TC:90743317:2,0,8,1
chr4	90743331	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=181,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:0|1:90743317_T_TC:90743317:2,0,8,1
chr4	90816790	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.589:27:2,7:8,8:1,10,0,16
chr4	90855932	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:9,4:1,5:7,3,7,2
chr4	90874095	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr4	91234040	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=135,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,4:0.078:57:28,4:22,0:33,20,2,2
chr4	91234250	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	91549156	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.714:22:1,7:5,9:6,0,15,1
chr4	91760014	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,196;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.087:44:15,2:23,1:39,2,3,0
chr4	93511481	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.414:22:5,5:8,4:0,13,2,7
chr4	94032125	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.581:17:5,7:2,3:1,6,2,8
chr4	94547357	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr4	94750058	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:5,5:10,2:14,1,7,0
chr4	94751674	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=199,173;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:1,1:1,4,1,2
chr4	95155348	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr4	95170783	.	CT	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,97;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:14,1:11,2:26,0,4,0
chr4	95199986	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,2:14,0:10,12,1,1
chr4	95201723	.	GTGTTT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=174,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGTTT;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:10,1,1,1
chr4	95220771	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=144,66;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:11,2:18,1:16,13,1,2
chr4	95255637	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,19,6
chr4	95506214	.	G	A	.	.	DP=108;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=165.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,58:0.566:102:20,31:23,24:6,38,4,54
chr4	95506272	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=184,191;MMQ=60,40;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.061:47:29,0:14,2:1,44,0,2
chr4	95508128	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=99,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.440:33:6,6:9,1:9,9,15,0
chr4	95508130	.	A	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=97,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.335:39:10,3:10,1:11,14,14,0
chr4	95508281	.	CT	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.173:38:12,4:16,2:4,28,0,6
chr4	95575601	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=130,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:4,6,5,3
chr4	95578588	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,22:0,10:0,0,21,11
chr4	95585038	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:3,0,5,0
chr4	96127869	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=123,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.407:32:7,7:10,4:11,8,7,6
chr4	96256473	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=139,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:3,0,3,1
chr4	96256673	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,20:0,14:0,0,18,16
chr4	96256708	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:17,2:19,1:15,21,2,1
chr4	96470042	.	G	GACAGCGTTTAATGTGGGGCAGGTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,18;MFRL=98,73;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:1,0:0,0:1,1,0,1
chr4	96762629	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	98761900	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,20,5
chr4	98893334	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,2:0,0,13,0
chr4	98902278	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr4	99027184	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr4	99027218	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr4	99049513	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:8,2:8,0:16,0,2,0
chr4	99055406	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr4	99055480	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=154.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,18:0,25:0,0,38,5
chr4	99064379	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr4	99214537	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.245:33:13,5:9,3:22,3,8,0
chr4	99337881	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,5:0,0,14,4
chr4	99339708	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=54.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,16,1
chr4	99399748	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=124,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr4	99408106	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:99408106_T_C:99408106:0,0,0,2
chr4	99408125	.	C	CCCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99408106_T_C:99408106:0,0,0,1
chr4	99408128	.	A	AACAGACGATGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99408106_T_C:99408106:0,0,0,1
chr4	99802300	.	GA	G,TA	.	.	DP=100;ECNT=1;MBQ=18,26,10;MFRL=138,155,128;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.35,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:48,9,7:0.127,0.053:64:14,1,0:4,4,0:10,38,1,15
chr4	99808136	.	CTTAAA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:3,3:2,3:5,0,6,0
chr4	99964349	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr4	99997885	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,168;MMQ=60,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.343:36:10,5:13,7:16,8,6,6
chr4	100009738	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=159,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:3,6:11,3:13,1,8,1
chr4	100045500	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:11,6:7,10:18,0,14,2
chr4	100048327	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,19,2
chr4	100048414	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=114,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,34:0.564:60:15,19:11,14:12,14,13,21
chr4	100048506	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=74.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0|1:100048506_G_A:100048506:0,0,5,14
chr4	100048509	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:3,6:3,5:0|1:100048506_G_A:100048506:2,4,2,9
chr4	100052963	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=T;STR;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	100057858	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:4,2:2,2:1,5,0,4
chr4	100062675	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.522:38:6,14:12,5:16,2,16,4
chr4	100065509	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	100128530	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr4	100128753	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:9,4:1,3:0,10,1,7
chr4	100129746	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=204,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:11,0,2,0
chr4	100131746	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=220,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,0:1,4:0,5,0,4
chr4	100134713	.	A	AT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=79.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.961:21:0,8:0,12:0,0,17,4
chr4	100200509	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,4:3,3:4,0,7,0
chr4	100205819	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=133,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.483:27:9,4:5,9:0|1:100205819_C_A:100205819:13,1,11,2
chr4	100205829	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,19:0.513:37:13,6:5,13:0|1:100205819_C_A:100205819:16,2,13,6
chr4	100212173	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.619:19:6,5:1,7:0|1:100212173_A_T:100212173:0,7,0,12
chr4	100212197	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=81,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.643:12:3,3:0,5:0|1:100212173_A_T:100212173:0,4,0,8
chr4	100239112	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,11,0
chr4	100257929	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,166;MMQ=59,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:12,0:17,2:10,20,1,1
chr4	100258054	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr4	100260667	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=13,13;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.487:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr4	100265957	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0,0,11,1
chr4	100266159	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=160,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,3:12,0:6,17,1,2
chr4	100334243	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,1:8,2:10,4,1,2
chr4	100341643	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:3,4:6,7:8,1,10,2
chr4	100348850	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,10;MFRL=195,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:1,0:1,0:7,0,3,0
chr4	100350594	.	A	ATC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=190,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TC;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,0:3,0,2,0
chr4	100356337	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:4,9:9,7:13,0,14,2
chr4	100356466	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.564:28:6,8:6,7:3,9,3,13
chr4	100512350	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,0:5,4:6,2,4,0
chr4	100738035	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=96,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,2:3,2:4,2,1,3
chr4	100784142	.	TTG	T	.	.	DP=202;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=122,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:155,15:0.091:170:76,6:67,9:108,47,10,5
chr4	100787123	.	TTATA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=TA;STR;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:0,3:4,1,3,0
chr4	100827622	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,6:2,6:8,0,8,4
chr4	100846061	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=168,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr4	100870182	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.479:42:9,13:12,7:1,21,1,19
chr4	100870375	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:5,4:0,2:5,0,5,1
chr4	101338217	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,13,1
chr4	101953322	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	102267821	.	AA	CG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=138.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,14:0,0,32,0
chr4	102839362	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,2:0,7:0,0,1,10
chr4	102942761	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=127.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,46:0.572:80:13,17:18,28:0|1:102942761_C_T:102942761:8,26,15,31
chr4	102942765	.	T	TTA	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=69.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:45,25:0.361:70:18,9:27,16:1|0:102942761_C_T:102942761:15,30,4,21
chr4	102946347	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,2:3,2:5,4,3,1
chr4	102946392	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=154,101;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.359:26:8,5:8,4:11,6,5,4
chr4	102992517	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=75.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,25:0.553:45:9,12:11,12:2,18,5,20
chr4	103174491	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=93,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,2,0
chr4	103189036	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:4,3,5,1
chr4	103228545	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=118.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,15:0,19:0,0,30,4
chr4	103500260	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:103500260_TA_T:103500260:0,1,0,1
chr4	103500262	.	CTTGCTAG	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:103500260_TA_T:103500260:0,1,0,1
chr4	103500274	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103500260_TA_T:103500260:0,0,0,1
chr4	103500276	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103500260_TA_T:103500260:0,0,0,1
chr4	103500278	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103500260_TA_T:103500260:0,0,0,1
chr4	103500283	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:103500260_TA_T:103500260:0,0,0,1
chr4	103505784	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.828:15:1,7:1,4:2,0,10,3
chr4	103514658	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=244.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.988:77:0,36:0,38:0,0,42,35
chr4	103514741	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=209.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,21:0,38:0,0,10,50
chr4	103534560	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=112.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,18:0,0,33,4
chr4	103537503	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=87,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr4	103553447	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=10,18;MFRL=204,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.843:10:0,3:0,1:0,1,0,9
chr4	103557192	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr4	103557219	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	103557247	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:103557247_C_T:103557247:0,1,0,1
chr4	103557249	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:103557247_C_T:103557247:0,1,0,1
chr4	103557251	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	103585800	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:0,3:4,3:3,1,6,1
chr4	103647909	.	A	AAAACACAGAAAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=178,273;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:103647909_A_AAAACACAGAAAC:103647909:0,4,0,1
chr4	103647913	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=178,273;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:103647909_A_AAAACACAGAAAC:103647909:0,4,0,1
chr4	103722580	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,4:0.074:65:31,2:29,2:50,11,4,0
chr4	103723850	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,114;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0,14,0,2
chr4	103731067	.	CAAAT	C	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=133.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,35:0.462:76:18,22:20,13:2,39,6,29
chr4	103789810	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,22:0.511:43:5,15:16,7:17,4,15,7
chr4	103790186	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=195,256;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:6,0,3,0
chr4	103806308	.	CTA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:0,3:8,3:8,0,5,1
chr4	103822540	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=143,186;MMQ=49,22;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,5:0.067:85:42,2:38,3:13,67,0,5
chr4	103826635	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,124;MMQ=52,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,24:0.394:61:16,14:21,9:27,10,15,9
chr4	103826788	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=145,170;MMQ=49,23;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,3:0.078:49:16,2:27,1:0|1:103826788_T_G:103826788:21,25,0,3
chr4	103826813	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=153,170;MMQ=49,23;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,3:0.097:39:12,2:22,1:0|1:103826788_T_G:103826788:9,27,0,3
chr4	103866480	.	G	A	.	.	DP=115;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=145.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,53:0.470:113:28,33:31,20:28,32,30,23
chr4	103870402	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,164;MMQ=40,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.066:59:23,3:28,0:36,20,2,1
chr4	103911159	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=197,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:0,4,1,3
chr4	103911191	.	TT	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=202,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	104000973	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,4:5,6:2,10,3,7
chr4	104003148	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr4	104003993	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,0:7,3:7,3,3,0
chr4	104061266	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.587:20:3,5:5,6:1,7,1,11
chr4	104061351	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=199,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,4:2,1:2,3,5,0
chr4	104063071	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:6,4:3,1:3,6,1,4
chr4	104066176	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=137,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.310:17:9,2:1,3:12,0,5,0
chr4	104066206	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=129,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,2:0.065:44:20,0:8,0:0|1:104066206_C_A:104066206:31,11,2,0
chr4	104066215	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=136,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.053:54:26,0:17,0:0|1:104066206_C_A:104066206:35,17,2,0
chr4	104079424	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=139,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:5,1:2,3:4,3,5,0
chr4	104080013	.	TC	T	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,3:0.055:71:36,0:31,2:22,46,0,3
chr4	104080079	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:11,0:11,3:0|1:104080079_A_T:104080079:4,19,0,3
chr4	104080083	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:11,0:11,3:0|1:104080079_A_T:104080079:4,19,0,3
chr4	104081708	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,8:3,6:9,0,14,0
chr4	104084765	.	CAAAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=32,24,32,21;MFRL=134,148,0,151;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,28,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=12.36,4.14,8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,5,3,6:0.233,0.141,0.298:21:3,1,0,1:1,4,2,2:4,3,3,11
chr4	104084783	.	GAA	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.092:31:8,0:10,2:0|1:104084783_GAA_G:104084783:8,21,0,2
chr4	104084794	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=135,141;MMQ=60,60;MPOS=-1073741826;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:12,2:0|1:104084783_GAA_G:104084783:3,19,0,2
chr4	104097034	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:11,2:22,0:33,0,2,0
chr4	104577558	.	A	AACC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr4	104577578	.	A	ATTTTTTTTCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:104577578_A_ATTTTTTTTCTT:104577578:0,1,0,1
chr4	104577579	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:104577578_A_ATTTTTTTTCTT:104577578:0,1,0,1
chr4	104640712	.	AC	GT	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=150,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.159:29:9,4:12,0:0|1:104640712_AC_GT:104640712:13,12,2,2
chr4	104640716	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=149,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:11,4:11,0:0|1:104640712_AC_GT:104640712:13,10,2,2
chr4	104640717	.	G	GGCGCATCGCGC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=150,58;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.177:26:11,4:11,0:0|1:104640712_AC_GT:104640712:12,10,2,2
chr4	105393360	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.202:13:5,2:5,0:0|1:105393360_CA_TG:105393360:11,0,2,0
chr4	105393361	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,13:0.932:13:0,6:0,5:1|0:105393360_CA_TG:105393360:0,0,13,0
chr4	106155199	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,1:8,2:8,4,0,3
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chr4	106158999	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,4:5,1:6,3,5,0
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chr4	106160238	.	T	TGTTTTTTTTTG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,145;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.589:27:5,5:6,10:8,3,13,3
chr4	106163224	.	GTTC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:2,4:4,3:6,1,5,2
chr4	106197000	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,3:2,3:6,1,6,0
chr4	106197750	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=196,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:1,2,0,3
chr4	106290829	.	A	ACTTGGGGAAAAAGAGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:1,2:2,1,5,1
chr4	106292121	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=179.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,30:0,18:0,0,3,45
chr4	106307874	.	A	AACC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.274:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr4	106317370	.	T	TATAAA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=85.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.571:40:11,9:6,9:16,1,20,3
chr4	106317498	.	CCAAA	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAAA;STR;TLOD=83.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.537:41:9,14:9,6:5,14,0,22
chr4	106359209	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr4	106367535	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,2:4,5:3,5,5,2
chr4	106367645	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,0:6,3:0|1:106367645_C_A:106367645:5,10,1,2
chr4	106367649	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=146,76;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.201:18:6,0:6,3:0|1:106367645_C_A:106367645:5,10,1,2
chr4	106370395	.	A	ATTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	106370624	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:13,0:13,2:0,26,0,2
chr4	106378002	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,5:3,4:0,6,1,8
chr4	106394985	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=14,33;MFRL=179,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr4	106395144	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.550:31:7,11:5,6:3,11,5,12
chr4	106395181	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,6:4,3:0,11,0,9
chr4	106552291	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=244,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	106613390	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=287,225;MMQ=40,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	106620983	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,2:7,4:13,0,5,1
chr4	106638697	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,5:5,6:11,0,11,0
chr4	106640543	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:19,3:12,0:29,5,3,0
chr4	106647679	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,4,0
chr4	106759098	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:22,0:19,3:8,33,0,3
chr4	106766496	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr4	106819053	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.407:52:15,11:15,10:22,9,12,9
chr4	106863590	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,2:0.039:73:44,2:27,0:50,21,2,0
chr4	106888263	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,2:0,5:0,0,9,0
chr4	107133861	.	CTT	C,CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,35,33;MFRL=169,189,175;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.45,5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,2,3:0.107,0.148:24:9,2,0:10,0,3:19,0,5,0
chr4	107154904	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=214,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=36.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:3,4:5,8:0,9,0,12
chr4	107156365	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=171,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:7,1,4,1
chr4	107165685	.	TAA	T,TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32,25;MFRL=220,204,86;MMQ=60,60,60;MPOS=11,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.67,8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.248,0.419:9:2,2,2:1,0,2:3,0,6,0
chr4	107169335	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.053:55:22,2:29,0:0|1:107169335_A_C:107169335:46,7,2,0
chr4	107169339	.	A	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.053:54:22,2:29,0:0|1:107169335_A_C:107169335:45,7,2,0
chr4	108574816	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=148,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,3:7,0:0,14,0,3
chr4	108608100	.	CTCTAACACT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr4	108622454	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=149,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,0:4,1:0|1:108622454_G_C:108622454:0,9,0,2
chr4	108622475	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=157,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,3:0.500:6:0,1:3,2:1|0:108622454_G_C:108622454:0,3,0,3
chr4	108641169	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	108829850	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=134,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:8,9,0,2
chr4	108852871	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	108868515	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:6,4:3,1:9,0,5,0
chr4	108870764	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr4	108911244	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr4	108935768	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.915:10:1,3:0,5:0|1:108935768_CT_C:108935768:0,1,5,4
chr4	108935771	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=144,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.909:10:1,4:0,5:0|1:108935768_CT_C:108935768:0,1,5,4
chr4	108944579	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,9,2
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chr4	109734959	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:4,4:3,3:7,0,8,0
chr4	109735133	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,23:0.574:40:4,9:12,12:0|1:109735133_T_C:109735133:3,14,5,18
chr4	109735146	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,17:0.500:34:4,8:13,9:0|1:109735133_T_C:109735133:2,15,2,15
chr4	109735209	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=188,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:0,7:4,3:0,4,0,10
chr4	109740573	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109740573_G_A:109740573:0,1,0,1
chr4	109740575	.	C	CCTAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109740573_G_A:109740573:0,1,0,1
chr4	109740587	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109740587_C_G:109740587:0,1,0,1
chr4	109740590	.	CT	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:109740587_C_G:109740587:0,1,0,1
chr4	109745336	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,121;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.418:41:12,12:12,5:7,17,8,9
chr4	109766290	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,0:5,8:6,2,4,4
chr4	109767453	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	109769832	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	109769899	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,204;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:11,2:6,2:13,4,4,0
chr4	109782249	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	109790346	.	C	CAATAAATA	.	.	DP=90;ECNT=2;MBQ=34,37;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=AATA;STR;TLOD=86.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,23:0.593:37:7,7:6,13:0|1:109790346_C_CAATAAATA:109790346:0,14,1,22
chr4	109790373	.	TAAATA	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:31,18:0.373:49:12,10:17,7:1|0:109790346_C_CAATAAATA:109790346:1,30,0,18
chr4	109811003	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=201,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:1,1,0,6
chr4	109817962	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=209,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr4	109820446	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,634;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	109862665	.	C	CAGATGGTTTCT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.279:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr4	109862677	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109862677_T_C:109862677:0,1,0,1
chr4	109862683	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:109862677_T_C:109862677:0,1,0,1
chr4	109931455	.	AC	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=133.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,14:0,15:0|1:109931455_AC_A:109931455:0,0,21,10
chr4	109931457	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=133.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.971:31:0,14:0,17:0|1:109931455_AC_A:109931455:0,0,21,10
chr4	109969183	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.418:24:6,5:8,4:14,0,10,0
chr4	109969337	.	G	T	.	.	DP=114;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=114,121;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,45:0.422:105:30,19:28,18:22,38,20,25
chr4	109969456	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=201,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:0,6,1,4
chr4	109971378	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,17:0.339:51:23,11:11,6:6,28,2,15
chr4	110384047	.	G	GCTTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTTT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	110446454	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr4	110454881	.	AT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.153:26:10,1:12,3:1,21,1,3
chr4	110580084	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	110581324	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:2,3:7,2:9,0,6,0
chr4	110581363	.	T	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=127,116;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,15:0.333:45:14,6:15,7:24,6,9,6
chr4	110619534	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,8:4,3:2,6,2,9
chr4	110635488	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=162,140;MMQ=60,41;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,0:7,1,4,0
chr4	110670807	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr4	110678819	.	CA	C	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=138.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,41:0.576:71:10,27:18,14:26,4,32,9
chr4	110678979	.	T	TTTTAA	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,28:0.970:28:0,9:0,18:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,1,27
chr4	110679002	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,8:0,11:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,1,19
chr4	110681618	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0,0,17,8
chr4	110688053	.	A	ATAAGTTCCCTGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=40,30;MFRL=186,186;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.668:2:1,1:0,0:0|1:110688053_A_ATAAGTTCCCTGG:110688053:0,1,0,1
chr4	110688058	.	A	ACTTCTTGGTGAAAGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:110688053_A_ATAAGTTCCCTGG:110688053:0,0,0,1
chr4	110688060	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,186;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:110688053_A_ATAAGTTCCCTGG:110688053:0,0,0,1
chr4	110737549	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr4	110737594	.	T	TGTGGTGTGTGTCTAACAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=139,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:0,0:3,0:0,3,0,1
chr4	110739025	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=117,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr4	110743628	.	AG	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=241,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr4	110765361	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,5:0,0,3,12
chr4	110765372	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr4	110786290	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,17,0
chr4	110786517	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,0,24
chr4	110791087	.	ATCT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.417:34:12,6:8,8:12,8,11,3
chr4	111398252	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,16:0,11:0,0,1,26
chr4	111412391	.	GTTTT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=16,14;MFRL=160,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:0,0:1,0:0|1:111412391_GTTTT_G:111412391:0,3,0,1
chr4	111412408	.	T	TAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=213,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.334:4:1,0:2,1:1|0:111412391_GTTTT_G:111412391:0,3,0,1
chr4	111469321	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,17;MFRL=69,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.423:7:3,0:0,1:0|1:111469321_G_T:111469321:2,2,3,0
chr4	111469323	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.379:8:3,0:1,0:0|1:111469321_G_T:111469321:3,2,3,0
chr4	111469340	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:2,3,3,1
chr4	111469557	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111469557_G_GT:111469557:0,1,0,1
chr4	111469558	.	G	GATTAAA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111469557_G_GT:111469557:0,1,0,1
chr4	111469560	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:111469557_G_GT:111469557:0,1,0,1
chr4	111469562	.	T	TACCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=14,30;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:111469557_G_GT:111469557:0,1,0,1
chr4	111474659	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=183,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:0,5,0,7
chr4	111543323	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	111781650	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=89.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,9:0,17:0,0,21,6
chr4	111781852	.	T	TAACTTGTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=212,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	113107829	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,1:3,1:11,0,2,1
chr4	113178894	.	ATTTGT	A	.	.	DP=202;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=797.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,181:0.995:181:0,92:0,88:0,0,115,66
chr4	113178966	.	TA	T,TAA	.	.	DP=133;ECNT=2;MBQ=31,32,31;MFRL=148,150,157;MMQ=60,60,60;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=8.62,9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:77,10,10:0.086,0.105:97:34,3,6:34,6,4:23,54,6,14
chr4	113179077	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=112.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.966:26:0,15:0,11:0|1:113179077_C_T:113179077:0,0,3,23
chr4	113179080	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=106.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0|1:113179077_C_T:113179077:0,0,3,21
chr4	113199691	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr4	113346714	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr4	113346996	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,5:3,3:0,8,1,7
chr4	113347609	.	C	CT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.421:27:4,5:10,3:11,5,6,5
chr4	113350415	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,2,3
chr4	113350441	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,0,0,1
chr4	113350443	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,0,0,1
chr4	113350444	.	GGA	G	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,0,0,1
chr4	113350447	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,0,0,1
chr4	113350453	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,0,0,1
chr4	113350458	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=30,31;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,1,0,1
chr4	113350461	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,1,0,1
chr4	113350462	.	TTTC	T	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=31,30;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113350441_A_AT:113350441:0,1,0,1
chr4	113350498	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=10;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	113352397	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,12,2
chr4	113356259	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:4,0,9,0
chr4	113356495	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:9,7:3,7:0,13,0,14
chr4	113359883	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=170,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0,4,0,3
chr4	113362463	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,0,4
chr4	113539196	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:6,2:9,3:14,1,5,0
chr4	113568126	.	TA	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,7:0.183:40:14,4:10,3:23,10,5,2
chr4	113569135	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:9,9:11,9:10,10,11,7
chr4	113569218	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=157,157;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:15,2:15,0:18,17,3,0
chr4	113570639	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=126.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,16:0,19:0,0,31,5
chr4	113578326	.	TTG	T,TTGTG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31,23;MFRL=151,84,95;MMQ=60,58,60;MPOS=14,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=TG;STR;TLOD=3.78,3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.165,0.215:14:5,1,0:4,1,1:9,0,4,1
chr4	114028168	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	114267023	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,16,2
chr4	114277676	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,21:0.438:48:14,5:13,15:10,17,7,14
chr4	114280556	.	T	TATTCCTA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	114286357	.	ATGTG	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=15,15;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=TG;STR;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.589:5:0,1:0,0:0,2,0,3
chr4	114286437	.	T	TATATAATG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114286437_T_TATATAATG:114286437:0,0,0,1
chr4	114286439	.	T	TTCTTTATGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114286437_T_TATATAATG:114286437:0,0,0,1
chr4	114582933	.	T	TA	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,6:0.130:48:24,4:17,2:7,35,0,6
chr4	114899667	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:5,0:8,3:7,6,2,1
chr4	115586972	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.451:15:1,3:6,3:0,8,2,5
chr4	115589159	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	115748918	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr4	115749005	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=119,102;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:4,5:5,7:4,5,4,8
chr4	115792133	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=160,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.178:26:9,0:11,4:0|1:115792133_A_T:115792133:1,21,0,4
chr4	115792139	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=171,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:8,0:11,1:0|1:115792133_A_T:115792133:1,18,0,4
chr4	119035948	.	T	TC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,9:0,6:0,0,11,4
chr4	119064666	.	TG	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:16,0:9,3:24,1,3,0
chr4	119064668	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,23:0.830:28:2,13:3,9:4,1,23,0
chr4	119147975	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=207,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr4	119161619	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,1:0,10:0,0,9,2
chr4	119174640	.	CT	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=225,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=105.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.956:42:1,22:0,18:1,0,38,3
chr4	119176703	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=106.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,12:0,16:0,0,24,4
chr4	119216054	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:6,3,3,0
chr4	119217114	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=55.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr4	119239788	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr4	119256617	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,7:2,5:7,1,11,1
chr4	119609039	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=108.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,19:0,12:0,0,26,5
chr4	119609182	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=125,150;MMQ=58,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.358:9:2,0:3,3:0,6,0,3
chr4	119615544	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,11:0,0,21,0
chr4	119661791	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:8,0:15,2:16,7,1,1
chr4	119665338	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,1:5,3:0|1:119665338_G_A:119665338:0,10,0,4
chr4	119665345	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=168,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:3,0:6,3:0|1:119665338_G_A:119665338:0,10,0,3
chr4	119666217	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=10,22;MFRL=148,76;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.711:5:0,1:0,0:0,1,1,3
chr4	119736598	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,5:4,7:6,2,9,3
chr4	119947961	.	AAAG	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=111,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:5,5:6,6:2,11,3,8
chr4	119947985	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,6:5,5:6,5,6,5
chr4	119952179	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:18,3:15,0:25,9,2,1
chr4	120071926	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr4	120072275	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	120079159	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:5,6:0,4:5,1,3,7
chr4	120079387	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=237,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,4:4,4:0,5,1,7
chr4	120085380	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:11,2:18,6,2,0
chr4	120177522	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:9,11:9,4:12,6,12,3
chr4	120177708	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,5:6,3:1,9,4,4
chr4	120189328	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=195,176;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=A;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.382:12:3,2:5,2:0|1:120189328_C_CA:120189328:8,0,4,0
chr4	120189350	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=30,11;MFRL=172,184;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.224:30:9,0:4,0:0|1:120189328_C_CA:120189328:16,8,6,0
chr4	120189365	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=34,10;MFRL=133,185;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,5:0.122:47:16,0:21,0:0|1:120189328_C_CA:120189328:21,21,5,0
chr4	120189369	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=135,185;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,5:0.112:51:21,0:23,0:0|1:120189328_C_CA:120189328:24,22,5,0
chr4	120194718	.	G	GT,GTT	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=34,35,30;MFRL=160,140,155;MMQ=60,60,60;MPOS=14,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=T;STR;TLOD=116.27,6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,45,5:0.815,0.104:54:1,24,3:3,20,2:4,0,43,7
chr4	120212425	.	AT	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=131,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.445:23:8,5:4,5:2,11,1,9
chr4	120212514	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=194,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr4	120221425	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.697:8:2,3:0,2:2,0,6,0
chr4	120243336	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr4	120446868	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr4	120463856	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	120486559	.	C	G	.	.	DP=82;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=143,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,3:0.047:82:51,0:27,3:0|1:120486559_C_G:120486559:35,44,0,3
chr4	120486567	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=144,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,3:0.052:74:43,0:26,1:0|1:120486559_C_G:120486559:32,39,0,3
chr4	120486568	.	A	AGTGGCTCAAGCTGGAGCCG	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=144,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,3:0.053:73:42,0:26,1:0|1:120486559_C_G:120486559:32,38,0,3
chr4	120548222	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr4	120549760	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=160,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,0:6,1:0|1:120549760_G_C:120549760:5,11,1,1
chr4	120549767	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=170,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,2:0|1:120549760_G_C:120549760:3,10,1,1
chr4	120549769	.	G	GCCATGTGACTTGA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=170,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0|1:120549760_G_C:120549760:1,10,1,1
chr4	120981214	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr4	120983086	.	GA	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=175.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,32:0,27:0,0,59,0
chr4	120983259	.	T	C	.	.	DP=122;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=418.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,113:0.992:113:0,61:0,51:0,0,24,89
chr4	121631375	.	G	GAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr4	121702270	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chr4	121719575	.	T	TG	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,1:13,1:0|1:121719575_T_TG:121719575:6,18,2,0
chr4	121719580	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:9,0:14,0:0|1:121719575_T_TG:121719575:6,18,2,0
chr4	121719582	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:10,0:0|1:121719575_T_TG:121719575:6,18,2,0
chr4	121719584	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.379:19:7,3:4,4:3,9,1,6
chr4	121720771	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:5,6:8,11:12,1,14,3
chr4	121720941	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,2:3,9:0,6,0,11
chr4	121720960	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:0,5,0,7
chr4	121737750	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.219:21:10,3:6,1:2,15,1,3
chr4	121738182	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,0,5
chr4	121828519	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr4	121958691	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr4	121961031	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	121961279	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	122059877	.	A	ATTCAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:8,2:11,0:2,18,0,2
chr4	122258063	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.641:26:2,8:7,8:3,6,1,16
chr4	122261785	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,77;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:2,3,0,2
chr4	122590883	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:2,3:1,1,0,5
chr4	122590913	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr4	122599755	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	122681373	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	122723106	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,22:0.452:49:14,9:12,13:5,22,3,19
chr4	122732899	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=80.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,26:0.549:47:14,13:7,12:1,20,0,26
chr4	122735225	.	C	CTTA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,7:2,0:0,5,2,5
chr4	122735257	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr4	122737487	.	CT	C,CTT	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=32,33,33;MFRL=137,164,174;MMQ=60,60,60;MPOS=13,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=4.80,21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,15:0.122,0.430:35:6,2,8:9,2,7:14,2,19,0
chr4	122737506	.	A	T	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=21,15;MFRL=145,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.102:52:19,1:12,0:37,9,6,0
chr4	122739121	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=217,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr4	122740454	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	122749436	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:8,2:2,7:7,3,4,5
chr4	122749541	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.467:26:6,7:7,5:11,3,6,6
chr4	122769967	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.537:22:7,7:3,4:8,2,11,1
chr4	122782879	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:0,4,2,4
chr4	122825380	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	123108762	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,0,17
chr4	123140739	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=77.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,3,18
chr4	123175900	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr4	123178320	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=211,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	123185682	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	123192830	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,2:10,0:3,19,0,2
chr4	123239472	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:1,13,0,2
chr4	123246971	.	GT	G,GTT	.	.	DP=127;ECNT=4;MBQ=34,34,33;MFRL=156,147,189;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=7.02,11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:59,8,11:0.098,0.142:78:34,1,2:17,6,4:48,11,16,3
chr4	123246987	.	C	A	.	.	DP=114;ECNT=4;MBQ=16,14;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,12:0.091:107:16,1:25,0:67,28,12,0
chr4	123246992	.	C	A	.	.	DP=127;ECNT=4;MBQ=20,10;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,6:0.034:110:22,0:30,0:71,33,6,0
chr4	123246994	.	C	A	.	.	DP=129;ECNT=4;MBQ=29,10;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,6:0.040:123:33,0:33,0:77,40,6,0
chr4	123277226	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=168,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr4	123280966	.	A	AGAGAG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123280966_A_AGAGAG:123280966:0,1,0,1
chr4	123280969	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123280966_A_AGAGAG:123280966:0,1,0,1
chr4	123280971	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123280966_A_AGAGAG:123280966:0,1,0,1
chr4	123280975	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:123280966_A_AGAGAG:123280966:0,1,0,1
chr4	123663575	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=119,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:12,3:10,1:15,7,4,0
chr4	123666198	.	AC	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=193,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	123748479	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=137,73;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.130:28:12,0:12,3:12,13,1,2
chr4	123854495	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr4	123949556	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=86.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,9,16
chr4	124323738	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=299.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,88:0.989:88:0,46:0,42:0,0,37,51
chr4	124324242	.	CCTT	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=193.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,23:0,23:0,0,25,22
chr4	125592001	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.124:30:13,0:13,3:0|1:125592001_C_A:125592001:11,16,0,3
chr4	125592009	.	T	TTCGATTTTCTATCCCTATAGGTTTG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,38;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:13,0:11,3:0|1:125592001_C_A:125592001:9,16,0,3
chr4	125592024	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=139,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:11,0:9,14,0,2
chr4	125593754	.	AAA	TTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=168,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0,4,0,1
chr4	125593775	.	T	TGTATTTTATACGCAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=261,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	125593777	.	A	ATTGTGGGATCTTTTTTTAAAAAAATG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.660:2:0,1:0,0:1,0,0,1
chr4	125631648	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	126315034	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,19,2
chr4	126315211	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,231;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0,10,0,2
chr4	126335978	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	126336105	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:10,5:6,7:9,7,13,0
chr4	126336990	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,1,13
chr4	126337042	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr4	126337555	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=132,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,1:1,0,2,0
chr4	126337867	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=159,176;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:126337867_A_G:126337867:0,4,0,2
chr4	126337871	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=159,153;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:126337867_A_G:126337867:0,4,0,1
chr4	126337874	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=159,153;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:126337867_A_G:126337867:0,4,0,1
chr4	126355609	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,3,11
chr4	126367606	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=109,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.513:29:4,7:10,7:8,6,9,6
chr4	126367720	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=166,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:126367720_CCA_C:126367720:0,4,0,1
chr4	126367726	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,1:3,0:0|1:126367720_CCA_C:126367720:0,3,0,1
chr4	126369554	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=153,275;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr4	126370100	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:6,0,4,1
chr4	126373570	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,1:3,5:0,3,2,4
chr4	126389627	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr4	126400825	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	126400922	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=115,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,1:7,4:10,3,4,1
chr4	126402921	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr4	128554404	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	128565000	.	A	G	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=273.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,82:0.988:82:0,38:0,42:0,0,50,32
chr4	128590234	.	A	ACCATGC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:7,2:15,0:11,11,0,2
chr4	128590404	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr4	128595254	.	T	TTATTTTGAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATTTTGAA;STR;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:0,4:4,4:3,1,8,1
chr4	128621144	.	CT	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.183:38:15,4:12,3:26,4,5,3
chr4	128621272	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=106.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,14:0,0,0,29
chr4	128627050	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr4	128632023	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr4	128665981	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr4	128715306	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=141,67;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,3:0.060:63:25,0:33,3:0|1:128715306_G_A:128715306:22,38,1,2
chr4	128715315	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=146,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,3:0.062:61:23,0:30,1:0|1:128715306_G_A:128715306:20,38,1,2
chr4	128719648	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	128751804	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:3,7:3,3:5,1,11,0
chr4	128803159	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr4	128807914	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=177,241;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr4	128812230	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.340:21:6,5:7,2:12,2,6,1
chr4	128814425	.	AT	A,ATT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=125,140,169;MMQ=60,60,60;MPOS=18,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=11.32,9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,7,7:0.180,0.183:40:14,5,1:11,2,6:25,1,13,1
chr4	128817907	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.139:20:9,1:9,1:17,1,2,0
chr4	128842077	.	CAAACTTACAAG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=214,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	128843044	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.091:42:17,3:21,0:35,4,3,0
chr4	128923001	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.359:9:2,2:4,1:0|1:128923001_GT_G:128923001:0,6,0,3
chr4	128923006	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,6:0.639:9:2,2:1,4:1|0:128923001_GT_G:128923001:0,3,0,6
chr4	128996166	.	G	GT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=118,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.179:28:11,0:12,4:10,13,1,4
chr4	129012267	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,89;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:6,0:12,2:4,14,0,2
chr4	129019575	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=184,235;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr4	129028656	.	G	GTGTTCTCATTGTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	129083340	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.515:39:11,9:7,11:13,6,15,5
chr4	129752955	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:9,11,1,1
chr4	129767588	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:5,0:7,7,0,2
chr4	129805520	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=122,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	129805716	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:5,1:2,6,2,1
chr4	129878342	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,7:7,0:0,11,0,7
chr4	129920969	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,6:4,5:1,10,3,8
chr4	129924932	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,2:12,2:16,7,4,0
chr4	130023759	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=146,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:3,1:7,3,3,0
chr4	138442525	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:5,3:12,5:0|1:138442525_G_A:138442525:12,5,6,2
chr4	138442527	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:5,2:11,5:0|1:138442525_G_A:138442525:12,5,6,2
chr4	138449683	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=118,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,35:0.556:63:14,21:13,14:17,11,21,14
chr4	138449812	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=151,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.491:22:6,3:5,4:2,9,0,11
chr4	139103366	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	139140388	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr4	139980254	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,121;MMQ=52,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:22,0:14,4:13,23,0,4
chr4	139981918	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:0,2,0,4
chr4	140217010	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr4	140263984	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:22,1:27,2:40,11,3,0
chr4	140270589	.	AT	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.103:41:20,4:16,0:33,4,4,0
chr4	140281584	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=166,7204852;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:5,2:12,0:18,0,2,0
chr4	140308984	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr4	140375296	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,10,0
chr4	140433072	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:140433072_T_A:140433072:0,2,0,1
chr4	140433077	.	G	GGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:140433072_T_A:140433072:0,1,0,1
chr4	140450455	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	140616462	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,3:7,1:1,8,1,3
chr4	140625323	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,3,12
chr4	140651584	.	TCTG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CTG;STR;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.912:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr4	140810637	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.477:32:7,2:8,8:10,6,10,6
chr4	140810638	.	GGCT	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCT;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:7,0:13,2:13,9,1,1
chr4	141317068	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:10,9:7,6:7,10,6,9
chr4	141320130	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.438:37:8,7:10,9:3,18,6,10
chr4	141321425	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	141446510	.	C	CTAAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,3:7,2:13,0,6,0
chr4	141446767	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr4	141448595	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=154;ECNT=1;MBQ=23,21,29,25;MFRL=140,108,141,144;MMQ=60,60,60,60;MPOS=21,20,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=T;STR;TLOD=7.88,26.49,14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:53,9,19,14:0.084,0.198,0.144:95:21,6,11,3:23,3,4,8:24,29,22,20
chr4	141448705	.	TA	T,TAA	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=146,137,204;MMQ=60,60,60;MPOS=19,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=10.21,5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:43,8,6:0.139,0.110:57:20,2,5:20,5,1:4,39,3,11
chr4	141458485	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	141483471	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=136,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:5,8:8,6:10,3,7,7
chr4	141549393	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr4	141555062	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr4	141578155	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr4	141677006	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	141868736	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=101.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,17:0,12:0,0,25,4
chr4	142054017	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=194,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:2,1:0|1:142054017_T_A:142054017:0,2,0,1
chr4	142054020	.	TCC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=194,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:142054017_T_A:142054017:0,2,0,1
chr4	142054025	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=194,192;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:142054017_T_A:142054017:0,2,0,1
chr4	142155207	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:142155207_T_G:142155207:0,3,0,1
chr4	142155208	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:142155207_T_G:142155207:0,3,0,1
chr4	142155210	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:142155207_T_G:142155207:0,3,0,1
chr4	142155213	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:142155207_T_G:142155207:0,3,0,1
chr4	142155217	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:142155207_T_G:142155207:0,3,0,1
chr4	142640538	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,9,4
chr4	142651159	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=198,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr4	143003155	.	G	GA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=100.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,10:0,22:0,0,29,6
chr4	143007197	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	143007419	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr4	143007460	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	143044635	.	T	TGTAGGTGTATCTTTGTGGGCTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr4	143044666	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	143130034	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr4	143130219	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,1,18
chr4	143181730	.	G	T	.	.	DP=79;ECNT=3;MBQ=27,14;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,13:0.131:75:24,2:12,0:23,39,0,13
chr4	143181747	.	AT	A	.	.	DP=67;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,19:0.401:46:17,7:10,12:3,24,3,16
chr4	143181748	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=20,32;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,53:0.946:56:1,25:2,26:2,1,5,48
chr4	143191952	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=189,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:0|1:143191952_G_A:143191952:1,9,1,1
chr4	143191959	.	A	AAATCAGTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=189,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0|1:143191952_G_A:143191952:1,9,1,1
chr4	143226768	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr4	143226784	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr4	143324036	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr4	143326312	.	AAGAGAG	A,AAG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,150,144;MMQ=60,60,60;MPOS=20,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,7,8;RU=AG;STR;TLOD=7.12,51.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,15:0.167,0.788:18:0,0,5:0,3,10:0,0,12,6
chr4	144124492	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:8,0,6,0
chr4	144378770	.	CA	AC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=16,14;MFRL=193,225;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:1,0:0|1:144378770_CA_AC:144378770:4,0,1,0
chr4	144378775	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,20;MFRL=193,225;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:144378770_CA_AC:144378770:4,0,1,0
chr4	144378778	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,21;MFRL=193,225;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:144378770_CA_AC:144378770:4,0,1,0
chr4	144447630	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,3,14
chr4	144456124	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=98.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,8:0,19:0,0,3,25
chr4	144466050	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	144466100	.	CTT	C,CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,22,20;MFRL=0,191,204;MMQ=60,60,40;MPOS=26,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=3.34,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.496,0.383:5:0,0,1:0,3,0:0,0,0,5
chr4	144469383	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	144801662	.	C	G,T	.	.	DP=121;ECNT=3;MBQ=33,32,31;MFRL=126,117,135;MMQ=60,51,55;MPOS=16,12;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=173.44,73.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:37,50,27:0.432,0.241:114:19,28,13:18,22,13:15,22,19,58
chr4	144801671	.	A	C	.	.	DP=102;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=146,117;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=160.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,46:0.452:102:29,22:25,16:16,40,12,34
chr4	144801728	.	CA	TG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=167,160;MMQ=52,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:14,5:8,3:0,22,0,8
chr4	144917514	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=149.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,22:0,22:0,0,20,24
chr4	144918867	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=200,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,3:5,6:0,10,0,9
chr4	144920480	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,156;MMQ=55,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,21:0.458:46:18,13:7,8:22,3,18,3
chr4	144920638	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=141,146;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=93.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,35:0.599:58:16,22:7,11:6,17,5,30
chr4	145037980	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=151.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,28:0,14:0,0,33,9
chr4	145040784	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr4	145040962	.	CA	GT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr4	145040999	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	145041011	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	145041577	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,127;MMQ=51,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:2,4:3,7:5,0,11,0
chr4	145041686	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,5,5
chr4	145041707	.	CT	AC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,31;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	145041720	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,39;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr4	145041741	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=0,36;MFRL=0,147;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:145041741_T_G:145041741:0,0,5,3
chr4	145041750	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:145041741_T_G:145041741:0,0,5,4
chr4	145041821	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=170,240210;MMQ=30,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr4	145579907	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr4	146031236	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.254:25:11,3:6,2:16,2,5,2
chr4	146031657	.	C	T	.	.	DP=131;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:115,3:0.033:118:74,1:41,2:2,113,0,3
chr4	146040996	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:15,2:13,0:30,1,2,0
chr4	146044698	.	C	T	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,142;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:94,3:0.040:97:47,3:47,0:44,50,1,2
chr4	146046123	.	AT	A	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,6:0.102:66:29,4:30,2:0|1:146046123_AT_A:146046123:53,7,5,1
chr4	146046138	.	T	C	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=266.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,87:0.989:87:0,37:0,32:0|1:146046123_AT_A:146046123:0,0,65,22
chr4	146048554	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr4	146048583	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,14:0,7:0,0,21,0
chr4	146059878	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=215,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:146059878_T_C:146059878:0,2,0,1
chr4	146059880	.	C	CTTATGTGT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=215,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:146059878_T_C:146059878:0,2,0,1
chr4	146059884	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=254,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:146059884_GG_AA:146059884:0,1,0,1
chr4	146059887	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,28;MFRL=254,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:146059884_GG_AA:146059884:0,1,0,1
chr4	146059894	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=254,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:146059884_GG_AA:146059884:0,1,0,1
chr4	146061066	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:20,2:24,1:38,6,2,1
chr4	146065006	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,5:0,0,14,0
chr4	146076632	.	TA	T,TAA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,29,32;MFRL=160,192,164;MMQ=60,60,60;MPOS=12,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.46,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,3,3:0.103,0.105:34:17,0,2:10,2,1:6,22,2,4
chr4	146080577	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=76.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,22,0
chr4	146086269	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=189,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=137.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,39:0.953:40:1,25:0,14:1,0,36,3
chr4	146092710	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,1:11,1:23,0,2,0
chr4	146475243	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,16;MFRL=134,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.655:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr4	146560558	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:15,2:9,0:10,15,0,2
chr4	146744687	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:2,1:0,0:0|1:146744687_G_A:146744687:1,2,0,1
chr4	146744692	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=12,32;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:146744687_G_A:146744687:1,1,0,1
chr4	146744693	.	G	GAGACA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=12,34;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:146744687_G_A:146744687:1,1,0,1
chr4	146744697	.	GT	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:146744687_G_A:146744687:0,1,0,1
chr4	146744701	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=120,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:146744687_G_A:146744687:0,1,0,1
chr4	146813642	.	A	AGTTGCATTCCATTGGATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=201,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	147104263	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr4	147110652	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:5,0,7,1
chr4	147110891	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,7:5,5:0,11,0,12
chr4	147214029	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:3,1,6,1
chr4	147425114	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=76.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,0,21
chr4	147431302	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	147442802	.	G	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=138,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,2:0.054:53:31,1:20,0:37,14,1,1
chr4	147560457	.	T	TGGC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=GGC;STR;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.497:14:1,2:4,3:5,2,5,2
chr4	147561264	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=141,105;MMQ=53,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:147561264_C_T:147561264:0,2,0,1
chr4	147561267	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,21;MFRL=141,105;MMQ=53,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:147561264_C_T:147561264:0,2,0,1
chr4	147561269	.	A	ATTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=141,105;MMQ=53,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:147561264_C_T:147561264:0,2,0,1
chr4	147562010	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=164,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:147562010_T_C:147562010:0,1,1,1
chr4	147562016	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=164,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:147562010_T_C:147562010:0,1,1,1
chr4	147562019	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=164,76;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:147562010_T_C:147562010:0,1,1,1
chr4	147795903	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=106,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,19:0.379:51:13,10:18,9:14,18,9,10
chr4	148463840	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr4	148578917	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.310:17:7,3:4,2:9,3,5,0
chr4	148589677	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	148591769	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr4	148604871	.	C	CG	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,15:0.505:30:3,8:6,4:0|1:148604871_C_CG:148604871:14,1,14,1
chr4	148604884	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=16,15;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,22:0.543:42:0,7:1,0:0|1:148604871_C_CG:148604871:13,7,11,11
chr4	148604886	.	G	A,T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=0,16,26;MFRL=0,126,147;MMQ=60,60,60;MPOS=13,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=15.31,53.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,12,22:0.413,0.561:34:0,1,10:0,3,5:0,0,17,17
chr4	148743956	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=114.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,37:0.594:62:12,14:13,23:12,13,23,14
chr4	148778685	.	G	GT	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=202,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=95.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,38:0.869:43:3,21:2,15:5,0,35,3
chr4	148800299	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr4	148827697	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,3:0,6:1,0,9,0
chr4	148827747	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,12,5
chr4	148827973	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	148886159	.	AT	A	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,4:0.059:82:37,2:28,2:64,14,3,1
chr4	148985720	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr4	149002637	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=137,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:149002637_A_T:149002637:6,12,1,1
chr4	149002641	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=137,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:9,2:0|1:149002637_A_T:149002637:4,12,1,1
chr4	149035449	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr4	149073555	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:0,3:4,4:4,0,7,1
chr4	149116035	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr4	149357168	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:5,3:13,0:8,10,3,0
chr4	151119353	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	151153948	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,1:13,1:8,10,1,1
chr4	151161470	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr4	151161490	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,11,1
chr4	151161502	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,14,2
chr4	151177340	.	CC	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,0,13
chr4	151177432	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	151231337	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:151231337_C_A:151231337:2,0,1,0
chr4	151231339	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,0:0,1:0|1:151231337_C_A:151231337:2,0,1,0
chr4	151231371	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr4	151408800	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr4	151412049	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=132,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:8,6:10,5:15,3,6,5
chr4	151505624	.	TC	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=74.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.937:28:0,11:1,9:0,1,0,27
chr4	151656589	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	151683003	.	TA	T	.	.	DP=137;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:103,5:0.054:108:31,3:50,1:18,85,0,5
chr4	151765243	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=181.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,28:0,26:0,0,45,12
chr4	151792401	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=201,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,0:5,5:8,0,5,0
chr4	151814316	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:20,1:18,1:7,31,0,2
chr4	151829659	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,10:0,0,1,13
chr4	151850226	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=122,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.596:8:0,3:1,0:0,3,0,5
chr4	152024167	.	A	AGCAAAGAATAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=195,189;MMQ=40,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	152025273	.	G	GCTTAT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTAT;STR;TLOD=233.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,11:0,34:0,0,46,7
chr4	152048936	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	152053408	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,15,2
chr4	152069406	.	TACACACACACACACAC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=17,9;RU=AC;STR;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr4	152201204	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	152487552	.	G	GCCATTTCTTTACCT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:7,0:5,2:1,13,0,2
chr4	152507998	.	G	GCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CA;STR;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:2,3:3,2:0|1:152507998_G_GCA:152507998:0,5,1,5
chr4	152508014	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0|1:152507998_G_GCA:152507998:0,6,1,4
chr4	152510130	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.410:22:5,4:8,4:3,10,1,8
chr4	152559717	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:152559717_TA_T:152559717:2,0,1,0
chr4	152559734	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,14;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:152559717_TA_T:152559717:4,0,1,0
chr4	152583907	.	C	CTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.337:9:1,1:4,2:2,4,1,2
chr4	152592469	.	A	ATTAC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTAC;STR;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.351:12:2,3:6,0:0,8,0,4
chr4	152601112	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr4	152609920	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,3:3,2:1,4,0,5
chr4	152609998	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=186,231;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr4	152681952	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.631:28:5,7:5,10:9,1,17,1
chr4	153249566	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,1,4
chr4	153268227	.	CA	C,AA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=24,21,16;MFRL=164,134,172;MMQ=60,60,60;MPOS=25,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.17,5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,9,7:0.294,0.134:31:6,1,2:6,4,0:5,10,2,14
chr4	153549731	.	A	ATGAAGTCTTGGGCCTGGGGC	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=126,108;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.100:30:16,2:11,0:12,15,1,2
chr4	153549745	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,3,14
chr4	153549852	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,43;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	153565641	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:4,7:10,11:1,13,2,16
chr4	153750918	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,3,19
chr4	153793528	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr4	153831387	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=154,189;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:7,0:15,4:0|1:153831387_T_C:153831387:6,16,0,4
chr4	153831393	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=153,189;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.173:27:7,0:13,4:0|1:153831387_T_C:153831387:6,17,0,4
chr4	153882057	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	153884092	.	GGT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=GT;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.825:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr4	153889204	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=135,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:12,0:6,2:8,10,1,2
chr4	153889237	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=161,64;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:0|1:153889237_A_AT:153889237:3,11,1,2
chr4	153889246	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=161,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:6,0:8,1:0|1:153889237_A_AT:153889237:3,11,1,2
chr4	153889265	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.703:18:3,6:2,7:2,3,2,11
chr4	153896358	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr4	154125681	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=141,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.070:41:20,2:18,0:17,22,2,0
chr4	154256178	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:0,14,0,2
chr4	154315340	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,4:3,2:3,0,5,1
chr4	154330064	.	GTA	G,GTATATA,GTATATATA	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=34,35,35,35;MFRL=183,175,185,172;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,16,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,13,14;RU=TA;STR;TLOD=3.71,9.86,8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:17,2,7,8:0.063,0.202,0.235:34:7,1,2,4:9,1,5,3:17,0,17,0
chr4	154388277	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:2,0,6,0
chr4	154471113	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=217,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:3,5:2,3:5,0,9,0
chr4	154476924	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:6,13:11,7:10,7,15,5
chr4	154478300	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,4:4,5:0,8,0,9
chr4	154502520	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=106,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.285:9:3,1:3,1:6,1,1,1
chr4	154502741	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr4	154508948	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=120,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.080:59:24,3:30,1:20,35,3,1
chr4	154524952	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,227;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:9,0,2,0
chr4	154542814	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:4,3:8,1,5,0
chr4	154544267	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	154556798	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr4	154557383	.	ATG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=43.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr4	154557405	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr4	154624698	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=145,64;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.162:22:10,3:8,0:13,6,2,1
chr4	154625682	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=115,166;MMQ=52,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.479:19:3,3:7,6:4,6,8,1
chr4	154633734	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=61,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,24:0.896:26:0,7:2,17:1,1,6,18
chr4	154641489	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.911:20:0,11:1,8:0,1,3,16
chr4	154644454	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	154669733	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	154669993	.	C	CAAAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,19;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,12;RU=A;STR;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:0,1:1,1:0,1,0,7
chr4	154709480	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=221,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,2:1,2,3,0
chr4	154709854	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=120,163;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.489:16:6,3:2,3:0|1:154709854_G_A:154709854:4,4,2,6
chr4	154709856	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,6:0|1:154709854_G_A:154709854:0,0,6,10
chr4	155156207	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr4	155161666	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=128.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,19:0,17:0,0,28,11
chr4	155219318	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.420:48:13,11:15,9:16,12,11,9
chr4	155225784	.	AAAACAAAC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AAAC;STR;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.912:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr4	155244401	.	TTTTG	T	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=20,31;MFRL=59,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTG;STR;TLOD=82.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.855:23:0,7:2,12:1,2,11,9
chr4	155244475	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,3:0,13:0,0,4,14
chr4	155244566	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155244566_G_T:155244566:0,1,0,1
chr4	155244569	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155244566_G_T:155244566:0,1,0,1
chr4	155244571	.	T	TCC	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155244566_G_T:155244566:0,1,0,1
chr4	155244573	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155244566_G_T:155244566:0,1,0,1
chr4	155244576	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155244566_G_T:155244566:0,1,0,1
chr4	155249431	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr4	155252934	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,4:0,5:0,2,0,9
chr4	155254502	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=171,79;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,2:6,0:9,9,0,2
chr4	155256177	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.289:26:9,5:8,2:10,9,2,5
chr4	155256187	.	TGA	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,2:6,0:8,10,0,2
chr4	155256205	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,8,11
chr4	155305491	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,7:3,3:9,0,8,2
chr4	155312411	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=85,150;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:0,6:7,2:2,5,2,6
chr4	155407569	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,10:0,14:0,0,16,8
chr4	155407680	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr4	155410407	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr4	155458728	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	155461687	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr4	155462148	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr4	155465535	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,12:0,0,30,1
chr4	155466935	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=122.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,23:0,12:0,0,31,4
chr4	155467187	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=104.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,17:0,0,26,6
chr4	155469959	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,1:0,0,10,3
chr4	155487888	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=213,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr4	155489643	.	G	GTAATTTTAAATT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=113,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:2,2:11,0:5,8,1,1
chr4	155505241	.	A	AGAAGACAGAGTGCTCCCATTCCCACTTC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=117,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAAGACAGAGTGCTCCCATTCCCACTTC;STR;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.624:24:7,1:6,4:11,3,6,4
chr4	155505999	.	T	TAATTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:155505999_T_TAATTC:155505999:0,0,0,1
chr4	155506003	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:155505999_T_TAATTC:155505999:0,0,0,1
chr4	155507590	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=103,113;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.521:46:13,14:8,7:13,9,12,12
chr4	155508627	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr4	155510224	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	155511897	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	155525970	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=80,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,7:1,1:1,0,8,0
chr4	155533739	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,3:0.052:74:36,2:33,1:36,35,0,3
chr4	155719919	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=79,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:0,2:1,0,3,0
chr4	156136079	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=144,199;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:5,1,0,2
chr4	156274584	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=201,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	156276788	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr4	156276841	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr4	156281666	.	ACT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	156283302	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=141.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,19:0,24:0,0,7,37
chr4	156290032	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr4	156294624	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:0,1:4,4:1,3,0,6
chr4	156297060	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,4:3,3:1,4,0,7
chr4	156617994	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,16,4
chr4	156629269	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=185,190;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:14,0,2,0
chr4	156643176	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,14,9
chr4	156725681	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr4	156757789	.	G	GA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:5,8:4,8:7,2,15,2
chr4	156757818	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.587:42:7,12:10,11:13,4,21,4
chr4	156787214	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr4	156787340	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:8,5:7,7:12,3,8,4
chr4	156787390	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=132,118;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.105:26:12,2:11,0:0|1:156787390_G_T:156787390:17,7,2,0
chr4	156787396	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=132,118;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:12,2:11,0:0|1:156787390_G_T:156787390:15,8,2,0
chr4	156826166	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.486:35:9,8:9,9:12,6,11,6
chr4	156830242	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156830242_G_A:156830242:0,0,0,1
chr4	156830245	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:156830242_G_A:156830242:0,0,0,1
chr4	156832841	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr4	156847230	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=146,112;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,16:0.410:39:11,8:11,6:0|1:156847230_A_G:156847230:9,14,6,10
chr4	156847237	.	AG	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,18:0.432:42:10,8:13,9:0|1:156847230_A_G:156847230:9,15,6,12
chr4	157999375	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=183,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:157999375_G_T:157999375:0,2,0,1
chr4	157999385	.	AACAAAAC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=184,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:157999375_G_T:157999375:0,3,0,1
chr4	158242540	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,9,1
chr4	158283954	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:20,1:13,1:24,10,2,0
chr4	159076679	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	159165619	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.270:11:6,3:2,0:0|1:159165619_CA_TG:159165619:0,8,0,3
chr4	159165624	.	CC	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.248:12:7,1:2,0:0|1:159165619_CA_TG:159165619:0,9,0,3
chr4	159568383	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr4	159590922	.	TA	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:12,1:8,3:4,31,0,5
chr4	159605732	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.063:45:19,2:24,0:36,7,2,0
chr4	159618695	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,2:3,1,6,1
chr4	159630817	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	159638069	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,168;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:7,1:11,0,2,0
chr4	159644494	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:159644494_G_C:159644494:0,0,0,9
chr4	159644501	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:159644494_G_C:159644494:0,0,0,8
chr4	159789387	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:11,4,2,0
chr4	159836236	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,6:3,2:5,1,8,0
chr4	159894187	.	T	TTATATTTTGCTGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=157,290;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	159894199	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr4	160189200	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,0:4,2:5,0,1,1
chr4	160225430	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,4:1,1:5,0,5,0
chr4	160251447	.	GTATA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=TA;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.699:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	160260209	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr4	160271268	.	GT	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=84.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,35:0.951:36:1,19:0,15:1,0,28,7
chr4	162307312	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=117,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.463:28:10,7:5,5:10,5,9,4
chr4	162431624	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.502:40:8,9:10,11:0,20,2,18
chr4	162431695	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr4	162459299	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,15,0
chr4	162697014	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,25:0.493:51:9,13:16,12:22,4,21,4
chr4	162841814	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=14,31;MFRL=181,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:0,6:0,5:0,2,1,11
chr4	162954926	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=198,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:0,1:2,4:0,2,0,6
chr4	164048335	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:164048335_G_A:164048335:0,12,0,2
chr4	164048337	.	AA	GG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,1:3,0:0|1:164048335_G_A:164048335:0,12,0,2
chr4	164085514	.	G	A	.	.	DP=106;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,4:0.048:99:43,0:51,4:41,54,3,1
chr4	164087453	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=14,13;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.238:33:3,1:4,0:17,7,9,0
chr4	164087457	.	A	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=14,13;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.216:36:6,1:4,0:20,7,9,0
chr4	164087954	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr4	164438523	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	164440461	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:4,2:7,6:12,2,5,4
chr4	164440743	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,10:0,11:0,0,1,20
chr4	164450255	.	A	AT,ATT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31,30;MFRL=0,182,142;MMQ=60,60,60;MPOS=17,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=23.47,6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,10,4:0.662,0.292:14:0,6,3:0,4,1:0,0,0,14
chr4	164466970	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	165891229	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,255;MMQ=60,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:165891229_C_T:165891229:0,0,0,1
chr4	165891236	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,255;MMQ=60,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:165891229_C_T:165891229:0,0,0,1
chr4	165962745	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.153:36:14,1:7,1:13,18,5,0
chr4	165962750	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.198:33:12,0:7,0:10,17,6,0
chr4	165981764	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=219,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:165981764_T_G:165981764:0,4,0,1
chr4	165981766	.	T	TATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=219,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:165981764_T_G:165981764:0,4,0,1
chr4	166150095	.	A	T	.	.	DP=139;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=158.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,59:0.449:132:40,29:31,29:12,61,3,56
chr4	166215662	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=133,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.245:17:9,2:4,2:2,11,0,4
chr4	166218661	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=193,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr4	166243051	.	TAAGA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=217,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGA;STR;TLOD=23.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,3:1,3:1,0,5,1
chr4	166243082	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,14,1
chr4	166307302	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,28:0.629:44:9,13:7,14:15,1,28,0
chr4	166307373	.	T	A	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,5:0.092:63:27,5:30,0:36,22,5,0
chr4	166307407	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,3:0.052:75:32,0:36,3:20,52,1,2
chr4	166403574	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:3,7:3,2:0,6,0,10
chr4	166408782	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146710732,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	166978539	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=187,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:1,3:2,0:1,2,1,2
chr4	166981408	.	T	TA,TAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30,31;MFRL=87,163,178;MMQ=60,60,60;MPOS=10,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=5.29,4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.373,0.355:8:0,1,1:2,2,1:0,2,0,6
chr4	167012241	.	GTTT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,6;RU=T;STR;TLOD=52.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0|1:167012241_GTTT_G:167012241:0,0,11,1
chr4	167012250	.	T	TAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=56.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0|1:167012241_GTTT_G:167012241:0,0,11,2
chr4	167012381	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,16:0,12:0,0,19,9
chr4	167012480	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,13:0,6:0,0,2,18
chr4	167012506	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,0,18
chr4	167012543	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr4	167020494	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.092:51:24,0:23,4:29,18,3,1
chr4	167656073	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,24:0.431:56:18,15:14,9:31,1,24,0
chr4	168155063	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr4	169086441	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=150.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,20:0,26:0,0,31,17
chr4	169086540	.	CAA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.886:5:0,4:0,0:0,0,0,5
chr4	169183789	.	A	G	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=277.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,44:0,28:0,0,64,10
chr4	169188927	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=116.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,19:0,14:0,0,13,23
chr4	169190129	.	CAA	C,CA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,32,26;MFRL=157,138,148;MMQ=60,60,60;MPOS=23,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=4.68,35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,17:0.155,0.668:25:1,2,5:2,2,7:1,3,0,21
chr4	169197081	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,19;MFRL=200,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.274:5:0,0:2,0:4,0,1,0
chr4	169213139	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	169232226	.	TA	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.077:62:26,1:25,1:11,47,0,4
chr4	169282232	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.468:30:8,3:8,11:12,4,13,1
chr4	169292759	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,27:0.457:59:15,16:17,10:23,9,17,10
chr4	169299676	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.484:23:6,6:5,5:0,12,0,11
chr4	169301059	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr4	169315571	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr4	169317081	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.346:24:6,4:10,4:0|1:169317081_C_A:169317081:15,1,7,1
chr4	169317082	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,16:0.654:24:4,6:4,10:1|0:169317081_C_A:169317081:7,1,15,1
chr4	169317279	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.502:26:2,3:8,9:4,9,4,9
chr4	169317284	.	T	TA	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.352:30:5,3:13,4:4,15,2,9
chr4	169317343	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:6,0:12,3:0,19,0,3
chr4	169325282	.	TA	T,TAA	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,31,30;MFRL=144,166,167;MMQ=60,60,60;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=8.22,22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,7,16:0.142,0.312:51:10,3,6:13,4,6:4,24,1,22
chr4	169327755	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,5:0.089:65:37,4:23,1:39,21,3,2
chr4	169337741	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr4	169351683	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=147,70;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.067:42:20,0:20,2:0|1:169351683_A_T:169351683:16,24,1,1
chr4	169351686	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=147,70;MMQ=60,56;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:20,0:20,2:0|1:169351683_A_T:169351683:16,24,1,1
chr4	169351692	.	G	GACACCCAGTAGAGTA	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=147,70;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:19,0:17,2:0|1:169351683_A_T:169351683:13,25,1,1
chr4	169351717	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=139,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,1:10,1:10,15,0,2
chr4	169374487	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=193,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,5:6,5:0,8,0,10
chr4	169392803	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=223,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:2,1,3,0
chr4	169433326	.	TG	CA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.411:22:5,5:7,2:0|1:169433326_TG_CA:169433326:6,7,4,5
chr4	169433333	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.429:21:5,4:7,2:0|1:169433326_TG_CA:169433326:5,7,4,5
chr4	169612461	.	GT	G,GTT	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=33,34,33;MFRL=137,137,137;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.79,7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,5,10:0.117,0.216:41:13,2,4:13,3,6:0,26,2,13
chr4	169612528	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:0,5,0,7
chr4	169630333	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr4	169835048	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,6:0,0,16,2
chr4	169842976	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr4	169846255	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=209,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,11:1,14:1,0,9,16
chr4	169846359	.	GCT	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=130.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.976:35:0,15:0,20:0,0,28,7
chr4	169923363	.	CAAAAAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=114,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=25,19;RU=A;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:1,0:0,1:1,1,0,3
chr4	169931268	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=135.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.972:32:0,13:0,19:0|1:169931268_G_A:169931268:0,0,6,26
chr4	169931274	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=119.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,10:0,16:0|1:169931268_G_A:169931268:0,0,5,22
chr4	169931288	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,8:0,9:0|1:169931268_G_A:169931268:0,0,5,13
chr4	169931326	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=168,193;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.544:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr4	170017860	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:3,4,0,3
chr4	170354836	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,2,8
chr4	170354873	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr4	170483153	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	170510679	.	GA	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,10:0.231:46:14,4:18,5:2,34,0,10
chr4	170616918	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	170628474	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	170663321	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	170669824	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,10:0,0,19,1
chr4	170913543	.	TGAACATCTATGAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,116;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAACATCTATGAA;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:1,0:2,1:0,3,1,0
chr4	170927112	.	C	CGTTGCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	170927113	.	A	AAAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	170989708	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,2:8,1:12,1,2,1
chr4	172735897	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	173232679	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr4	173232944	.	G	T	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=244.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,38:0,36:0,0,20,54
chr4	173873170	.	TG	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.940:30:1,18:0,11:1,0,20,9
chr4	173930309	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,6:3,3:4,1,6,3
chr4	173930479	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr4	174238918	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,1:8,1:6,16,0,2
chr4	174294990	.	A	AT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=112.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,14:0,21:0,0,35,1
chr4	174537063	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,29;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=91.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,25,3
chr4	175225386	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:17,3:14,0:29,3,3,0
chr4	175229927	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:14,2:15,3:17,12,1,4
chr4	175414202	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	175414246	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	175443156	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:1,3,3,5
chr4	175443424	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	175580119	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr4	175649861	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=10,33;MFRL=169,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.899:12:0,6:0,4:0,1,2,9
chr4	175649873	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=18,35;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,1:0,3:0,2,0,6
chr4	175688274	.	TACAC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=235,176;MMQ=53,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=AC;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.605:3:0,0:1,2:0|1:175688274_TACAC_T:175688274:0,1,0,2
chr4	175688298	.	C	CACACAGAG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=176,235;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:175688274_TACAC_T:175688274:0,2,0,1
chr4	176562080	.	TTT	CAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=309,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176562080_TTT_CAA:176562080:0,1,0,1
chr4	176562087	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=309,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176562080_TTT_CAA:176562080:0,1,0,1
chr4	176562088	.	T	TCAGAAAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=309,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:176562080_TTT_CAA:176562080:0,1,0,1
chr4	176733450	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.862:5:0,1:0,2:0|1:176733450_G_T:176733450:0,0,1,4
chr4	176733452	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.866:5:0,1:0,4:0|1:176733450_G_T:176733450:0,0,1,4
chr4	177032932	.	G	GTAAGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177032932_G_GTAAGC:177032932:0,1,0,1
chr4	177032935	.	A	AGAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:177032932_G_GTAAGC:177032932:0,1,0,1
chr4	177049854	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,28:0.460:61:18,14:15,14:28,5,25,3
chr4	177049880	.	T	C	.	.	DP=88;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=138,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=115.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,38:0.470:81:23,19:20,19:33,10,27,11
chr4	177050057	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=164,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,21:0.479:44:7,8:11,13:0|1:177050057_G_A:177050057:3,20,0,21
chr4	177050062	.	CTATCAAATAAAA	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=58.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,16:0.416:39:11,5:11,10:0|1:177050057_G_A:177050057:2,21,0,16
chr4	177052925	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:8,5:6,5:0,14,0,10
chr4	177058580	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=255,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr4	177058741	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:5,7:3,11:4,4,5,14
chr4	177061218	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	177063096	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=82.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,30:0.542:55:9,13:16,16:20,5,24,6
chr4	177071187	.	T	TAGTTTTTCTATTTC	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,231;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.079:34:12,2:19,0:14,18,0,2
chr4	177071841	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	177082032	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,35;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:4,2:0,0:2,2,2,0
chr4	177082069	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=128,167;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:3,3:4,3:6,2,4,2
chr4	177083166	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=95.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,14:0,0,26,0
chr4	177084327	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,0:8,2:14,7,2,0
chr4	177093505	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,19:0.408:47:16,7:12,12:23,5,18,1
chr4	177100754	.	AT	A,ATT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30,30;MFRL=145,0,150;MMQ=60,60,60;MPOS=11,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.75,4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,3:0.220,0.235:14:2,1,1:4,2,1:1,7,2,4
chr4	177113764	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,4:5,2:11,2,6,0
chr4	177113779	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:11,4:3,4:11,3,7,1
chr4	177116463	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,1:5,4:5,1,5,0
chr4	177142488	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:12,9:8,10:3,17,6,13
chr4	177142776	.	CA	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,1,9
chr4	177143417	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr4	177143664	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	177241136	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr4	177605081	.	CTCA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCA;STR;TLOD=111.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,13:0,0,20,7
chr4	177608875	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	177650593	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177650593_C_T:177650593:0,0,1,0
chr4	177650614	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177650593_C_T:177650593:0,0,1,0
chr4	177713511	.	G	GACAGTAAAGAGCCGTCCATTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.672:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	178256759	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:3,1:0,9:3,0,10,0
chr4	178257516	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,4:5,4:0,9,2,6
chr4	178262613	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.465:9:3,3:2,1:5,0,3,1
chr4	178262811	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:1,9,0,2
chr4	178272748	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:0,6,0,4
chr4	178274919	.	C	CT	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=159,140;MMQ=56,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.653:6:0,2:1,0:0,2,2,2
chr4	178274968	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.578:22:8,7:1,4:0,9,0,13
chr4	178353046	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:1,3,0,4
chr4	178355668	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,8:0,17:0,0,5,20
chr4	178357514	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	178361414	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.362:23:8,5:6,3:11,4,6,2
chr4	178361621	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	178363378	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,13:0,0,25,0
chr4	178882120	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr4	178897192	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=224,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr4	183267728	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.674:7:2,2:0,3:2,0,4,1
chr4	183268174	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	183522021	.	C	CAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AT;STR;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr4	183594117	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	183600752	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr4	183601593	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=179,154;MMQ=54,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:2,0,1,2
chr4	183601594	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=154,179;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,2,0
chr4	183601666	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=98,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,2:4,4:5,5,4,2
chr4	183650026	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,36;MFRL=223,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr4	183659722	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=151,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,6:6,3:3,9,0,10
chr4	183664593	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:1,4:5,8:1,5,0,12
chr4	183673226	.	T	TA,TAA	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=31,16,17;MFRL=118,162,123;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=27.32,7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,16,7:0.514,0.213:33:3,2,3:5,6,0:1,9,3,20
chr4	183673247	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=156.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,16:0,22:0,0,1,38
chr4	183674577	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr4	183694858	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=230,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:183694858_A_G:183694858:0,2,0,1
chr4	183694864	.	CA	AT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=219,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:183694858_A_G:183694858:0,4,0,1
chr4	183694868	.	T	TCTGCTAAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=219,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:183694858_A_G:183694858:0,4,0,1
chr4	183715020	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,0:8,2:12,9,0,2
chr4	183721143	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:7,8,1,1
chr4	183814169	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.631:14:2,3:2,5:2,3,4,5
chr4	184170025	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr4	184171187	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:7,5:5,9:4,8,2,12
chr4	184180920	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=99.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,4,25
chr4	184182001	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,5:0,0,8,4
chr4	184190355	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,1:0,3,1,3
chr4	184190535	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=98,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,17:0.400:43:13,5:12,12:18,8,7,10
chr4	184202148	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr4	184236951	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:0,4,0,6
chr4	184366629	.	T	TGCACA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCACA;STR;TLOD=69.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,7:0,7:0,0,16,0
chr4	184367558	.	TCTG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,3:0,16:0,0,14,5
chr4	184426526	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=197.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,24:0,34:0,0,16,43
chr4	184427580	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr4	184567431	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,64;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.319:25:6,4:8,4:15,2,6,2
chr4	184570723	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.378:22:5,5:8,1:1,13,0,8
chr4	184577177	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	184585015	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=103,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:9,1:15,5:12,13,5,1
chr4	184585134	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:13,1:16,1:12,17,0,2
chr4	184612656	.	TAATAATAAAAGTATGTTTATATCAATATTTTA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,241;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.171:26:7,3:10,0:0,22,0,4
chr4	184614376	.	T	TTG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,139;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0,14,0,2
chr4	184930308	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,9;MFRL=77,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:5,0:6,0:4,12,1,1
chr4	184932609	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,11:0,0,2,18
chr4	185312027	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr4	185552135	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=164,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr4	185553098	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.450:38:15,7:6,10:5,16,5,12
chr4	185556618	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.440:32:9,5:8,8:0,18,1,13
chr4	185559487	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=150,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,2:2,5:3,1,5,2
chr4	185578485	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=171,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:6,5:7,3:0,13,3,5
chr4	185583092	.	C	CTATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,0,15
chr4	185593699	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:0,8,1,3
chr4	185603582	.	A	AAGCTCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,222;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:5,2:0,0:0,5,0,2
chr4	185612627	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:5,8:4,4:8,3,12,1
chr4	185612953	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=195,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:0,4,0,3
chr4	185615888	.	G	GGA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,128;MMQ=60,22;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GA;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:19,0:12,2:10,23,0,2
chr4	185631338	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:7,7:4,5:0,11,1,12
chr4	185634144	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:3,3,1,3
chr4	185634171	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:0,0:2,0:0,2,0,2
chr4	185637523	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,8:4,4:9,0,11,1
chr4	185638231	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=114,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr4	185650276	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,3:4,1:0,4,0,5
chr4	185652201	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:2,8:9,4:0,15,0,14
chr4	185652223	.	AAC	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.202:21:8,3:9,1:0,17,0,4
chr4	185652224	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.559:23:4,9:5,4:0,10,0,13
chr4	185681475	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr4	185687233	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr4	185687687	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr4	185691716	.	AGGGGGAG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,42;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGGGAG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	185691738	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	185694697	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:4,3:6,3:10,0,7,0
chr4	185694877	.	T	TA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.257:24:9,1:8,4:13,5,3,3
chr4	185701620	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:185701620_T_C:185701620:0,1,0,3
chr4	185701627	.	C	CATGATATT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,36;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:185701620_T_C:185701620:0,3,0,1
chr4	185701628	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:185701620_T_C:185701620:0,3,0,1
chr4	185701633	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:185701620_T_C:185701620:0,3,0,1
chr4	185701637	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:185701620_T_C:185701620:0,3,0,1
chr4	185724445	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=157,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:1,1:11,1:11,1,1,1
chr4	185940461	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	186097219	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=196,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,0:2,2:0,5,0,4
chr4	186168387	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=168,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:9,3:5,8:14,0,11,0
chr4	186272773	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=81,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,1:2,1:2,4,1,1
chr4	186274541	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=205,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:0,3:1,1:2,0,4,0
chr4	186288457	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=157,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:3,1:2,1:1,5,0,2
chr4	186294198	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:5,2:6,5,1,3
chr4	186320666	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.945:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr4	186321067	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr4	186321447	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	186324841	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	186336583	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr4	186347055	.	G	A	.	.	DP=94;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=279.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,88:0.989:88:0,43:0,41:0,0,21,67
chr4	186347073	.	G	C	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=230.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,41:0,31:0,0,4,70
chr4	186347092	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=212.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.985:65:0,33:0,32:0,0,1,64
chr4	186350559	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.387:26:8,2:8,7:11,5,5,5
chr4	186361876	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.912:7:0,6:0,0:0,0,0,7
chr4	186366315	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,3,10
chr4	186366382	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	186370676	.	TA	T,TAA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,31,31;MFRL=160,144,157;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=8.56,15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,5,11:0.145,0.298:36:5,2,3:15,3,8:20,0,14,2
chr4	186384243	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr4	186423637	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr4	186423655	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,5:3,2:1,5,1,6
chr4	186423661	.	A	AGCGCC	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=197,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:8,0:2,2:0|1:186423661_A_AGCGCC:186423661:1,9,1,1
chr4	186423663	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=188,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:7,0:2,1:0|1:186423661_A_AGCGCC:186423661:1,10,1,1
chr4	186423677	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.878:6:0,2:0,2:0,0,0,6
chr4	186423734	.	TCA	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	186427735	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:2,3:0,1:0,3,2,2
chr4	186427841	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	186444698	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	186444704	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	186456617	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr4	186544675	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=116,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:3,1:14,1:11,6,2,0
chr4	186551624	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,9:0,5:0,0,15,0
chr4	186578529	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr4	186997767	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:2,0,2,2
chr4	187000256	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:1,4:1,0:0,2,0,5
chr4	187003636	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:23,0:16,4:18,22,0,4
chr4	187005376	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,4:0,0,1,11
chr4	187005379	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=20,20;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.387:8:2,1:2,1:0,5,0,3
chr4	187073030	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr4	187075886	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,0:1,1:0|1:187075886_T_TA:187075886:0,1,0,1
chr4	187075888	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:187075886_T_TA:187075886:0,1,0,1
chr4	187075889	.	T	TGTCTCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:187075886_T_TA:187075886:0,1,0,1
chr4	187077393	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=204,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr4	187078922	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.457:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr4	187084602	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:7,0:11,2:16,5,0,2
chr4	187115632	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:5,4:2,1:4,3,2,4
chr4	187115841	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr4	187118040	.	TTC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=187,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:3,2:7,0,4,0
chr4	187118662	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.485:33:7,8:10,8:10,7,13,3
chr4	187122304	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,15:0.410:37:11,7:11,8:14,8,7,8
chr4	187122319	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.428:40:11,8:12,9:15,8,8,9
chr4	187130198	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=177,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:3,3:3,6:3,4,3,6
chr4	187130490	.	A	AGGGAAAAAAGAAACCACC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,137479142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr4	187171355	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	187172280	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=187,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:6,0,4,0
chr4	187172353	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.536:13:3,3:3,3:6,0,7,0
chr4	187175722	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=179,93;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,4:5,5:6,2,7,2
chr4	187178300	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,4:3,7:5,1,11,0
chr4	187178599	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,11:0,0,2,20
chr4	187178613	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.576:17:2,6:5,3:1,6,1,9
chr4	187195452	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,0:8,2:2,9,0,2
chr4	187201834	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.285:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr4	187208795	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,3:7,1:10,0,0,4
chr4	187454848	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,88;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:14,2:9,0:17,6,0,2
chr4	187510226	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=144,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:14,1:23,2:7,30,0,3
chr4	187510280	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:5,3:10,4:5,10,0,7
chr4	187517758	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,25:0.702:35:5,7:5,16:4,6,12,13
chr4	187518196	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,2:10,0:8,11,1,1
chr4	187518976	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,15:0.593:25:6,9:4,6:0|1:187518976_C_T:187518976:2,8,2,13
chr4	187518980	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=99.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,14:0,10:0|1:187518976_C_T:187518976:0,0,4,21
chr4	187522528	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:2,10:4,6:2,4,8,8
chr4	187525153	.	A	AGACGGGAAGAAAGGGTATGAAATACGT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=117,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.312:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	187530313	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr4	187534542	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr4	187534559	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr4	187538133	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:5,1,8,0
chr4	187539003	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:7,1,1,1
chr4	187539217	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=139,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:3,11:1,3:4,0,9,5
chr4	187540635	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:4,5:4,5:5,3,5,5
chr4	187540654	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.678:16:3,7:1,4:0,5,4,7
chr4	187540918	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:5,5:0,6:5,0,6,5
chr4	187541761	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.552:22:6,4:2,8:5,5,6,6
chr4	187542316	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=182,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:4,3,2,0
chr4	187542736	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:7,10:4,5:8,3,8,7
chr4	187542940	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=187,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr4	187542970	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=228,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:187542970_A_T:187542970:0,2,0,1
chr4	187542976	.	A	AT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=228,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:187542970_A_T:187542970:0,2,0,1
chr4	187542980	.	GT	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=228,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:187542970_A_T:187542970:0,2,0,1
chr4	187549428	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.540:26:4,5:7,9:7,5,10,4
chr4	187549582	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,1:3,3:3,2,1,4
chr4	187554770	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:9,0,2,0
chr4	187557148	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:3,4:3,2:7,0,6,0
chr4	187560812	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:6,0,6,0
chr4	187584771	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	188925815	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,63;MMQ=55,46;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,2:4,1,4,2
chr4	189012456	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,2:0,3:0|1:189012456_C_T:189012456:1,0,6,0
chr4	189012458	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0|1:189012456_C_T:189012456:1,0,6,0
chr4	189018281	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:17,3:17,0:19,18,3,0
chr4	189018486	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=97,110;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,5:4,5:5,2,7,3
chr4	189018597	.	CCATG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=117,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:0,0:3,1:0|1:189018597_CCATG_C:189018597:0,3,0,1
chr4	189018604	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=117,238;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:189018597_CCATG_C:189018597:0,3,0,1
chr4	189018606	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=117,238;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:189018597_CCATG_C:189018597:0,3,0,1
chr4	189018613	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr4	189022420	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=228,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr4	189026171	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=205,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:2,3,4,3
chr4	189060633	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	189061169	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=129,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:2,3:3,4:1,4,1,7
chr4	189061604	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=144,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:4,2,3,0
chr4	189061675	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.396:18:3,3:8,4:5,6,5,2
chr4	189061855	.	GAAAAAAAAAAGACAAATTTTTCC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.505:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr4	189063361	.	CGTGTGTGTGTGTGTGT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,10;RU=GT;STR;TLOD=53.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,13:0.825:15:0,8:1,4:0|1:189063361_CGTGTGTGTGTGTGTGT_C:189063361:2,0,10,3
chr4	189063392	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=120,141;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,15:0.696:21:4,9:2,6:0|1:189063361_CGTGTGTGTGTGTGTGT_C:189063361:4,2,10,5
chr4	189065055	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:8,0:1,4:4,5,1,4
chr4	189065096	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=212,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:189065096_T_TA:189065096:4,0,0,1
chr4	189065097	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=212,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:189065096_T_TA:189065096:4,0,0,1
chr4	189065099	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=212,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:189065096_T_TA:189065096:4,0,0,1
chr4	189065104	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,4,3
chr4	189065128	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=197,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:4,1,1,3
chr4	190862319	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:13,1:22,1:0|1:190862319_G_A:190862319:2,33,0,2
chr4	190862341	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=193,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.197:37:11,1:19,5:1,29,0,7
chr4	190862342	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=189,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.102:37:12,1:21,2:0|1:190862319_G_A:190862319:1,33,0,3
chr4	190873335	.	C	T	.	.	DP=100;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=146,149;MMQ=60,23;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,4:0.051:93:44,0:45,4:44,45,3,1
chr4	190873347	.	A	G	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=144,145;MMQ=55,23;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,5:0.061:94:42,1:45,4:46,43,3,2
chr4	190873442	.	G	A	.	.	DP=95;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=141,145;MMQ=58,23;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:86,4:0.054:90:40,1:43,3:0|1:190873442_G_A:190873442:29,57,0,4
chr4	190873451	.	C	T	.	.	DP=87;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=147,145;MMQ=60,23;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,4:0.057:85:39,1:40,2:0|1:190873442_G_A:190873442:26,55,0,4
chr4	190874147	.	AT	A	.	.	DP=154;ECNT=13;MBQ=31,32;MFRL=144,143;MMQ=48,23;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:107,23:0.181:130:51,14:47,9:92,15,23,0
chr4	190874157	.	A	G	.	.	DP=164;ECNT=13;MBQ=32,34;MFRL=142,139;MMQ=48,23;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=127.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,43:0.281:155:59,20:47,11:90,22,41,2
chr4	190874160	.	A	T	.	.	DP=192;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=143,122;MMQ=42,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:180,11:0.062:191:83,6:71,5:141,39,10,1
chr4	190874167	.	G	A	.	.	DP=274;ECNT=13;MBQ=34,29;MFRL=145,133;MMQ=43,45;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=205.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:184,72:0.284:256:92,31:85,35:155,29,40,32
chr4	190874175	.	A	G	.	.	DP=339;ECNT=13;MBQ=30,34;MFRL=145,139;MMQ=43,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=129.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:251,59:0.192:310:126,32:113,27:170,81,53,6
chr4	190874183	.	C	A	.	.	DP=383;ECNT=13;MBQ=33,31;MFRL=149,126;MMQ=43,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=98.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:319,55:0.145:374:163,31:146,22:232,87,29,26
chr4	190874199	.	T	A	.	.	DP=485;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=140,151;MMQ=42,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=150.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:430,50:0.106:480:209,25:190,22:0|1:190874199_T_A:190874199:282,148,42,8
chr4	190874206	.	T	A	.	.	DP=522;ECNT=13;MBQ=30,32;MFRL=139,151;MMQ=42,42;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:449,57:0.114:506:237,30:207,27:0|1:190874199_T_A:190874199:287,162,45,12
chr4	190874234	.	C	T	.	.	DP=595;ECNT=13;MBQ=33,31;MFRL=135,137;MMQ=44,43;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:470,65:0.117:535:237,30:221,34:258,212,39,26
chr4	190874240	.	C	G	.	.	DP=566;ECNT=13;MBQ=33,37;MFRL=133,157;MMQ=48,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:547,10:0.020:557:251,7:255,3:0|1:190874240_C_G:190874240:300,247,8,2
chr4	190874242	.	TC	AA	.	.	DP=560;ECNT=13;MBQ=31,34;MFRL=133,157;MMQ=48,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:550,10:0.020:560:249,7:264,3:0|1:190874240_C_G:190874240:305,245,8,2
chr4	190874255	.	A	T	.	.	DP=538;ECNT=13;MBQ=29,31;MFRL=130,126;MMQ=50,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:463,47:0.088:510:228,20:218,26:228,235,27,20
chr4	190874256	.	C	T	.	.	DP=534;ECNT=13;MBQ=28,30;MFRL=129,141;MMQ=50,27;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:492,20:0.040:512:242,11:241,6:251,241,7,13
chr4	190874281	.	G	T	.	.	DP=513;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=130,148;MMQ=40,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:498,6:0.012:504:222,3:251,2:187,311,1,5
chr4	190874290	.	T	A	.	.	DP=480;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=132,140;MMQ=40,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=146.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:371,68:0.155:439:173,31:193,36:126,245,12,56
chr4	190874315	.	TA	GA,GT	.	.	DP=382;ECNT=8;MBQ=31,34,32;MFRL=151,141,134;MMQ=40,40,40;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=85.96,289.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:213,41,101:0.119,0.289:355:99,13,43:110,27,57:44,169,8,134
chr4	190874352	.	G	C	.	.	DP=183;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=157,143;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:156,19:0.112:175:69,6:85,13:6,150,0,19
chr4	190874367	.	CCA	C	.	.	DP=131;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=165,134;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:104,11:0.102:115:43,7:57,3:0|1:190874367_CCA_C:190874367:8,96,0,11
chr4	190874370	.	CAG	C	.	.	DP=123;ECNT=8;MBQ=34,27;MFRL=155,162;MMQ=60,36;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=85.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,30:0.269:113:39,13:42,16:0|1:190874370_CAG_C:190874370:8,75,0,30
chr4	190874372	.	G	T	.	.	DP=115;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=167,134;MMQ=60,35;MPOS=-1073741824;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,22:0.223:94:30,12:38,9:0|1:190874367_CCA_C:190874367:8,64,0,22
chr4	190874385	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=175,173;MMQ=60,36;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,13:0.206:66:21,7:30,5:0|1:190874370_CAG_C:190874370:5,48,0,13
chr4	190876242	.	G	A	.	.	DP=248;ECNT=20;MBQ=33,31;MFRL=142,127;MMQ=60,41;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=545.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,176:0.755:233:27,88:30,86:33,24,145,31
chr4	190876247	.	G	C	.	.	DP=261;ECNT=20;MBQ=34,35;MFRL=129,134;MMQ=43,37;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:258,3:0.015:261:124,2:125,1:0|1:190876247_G_C:190876247:192,66,3,0
chr4	190876250	.	G	A	.	.	DP=266;ECNT=20;MBQ=34,30;MFRL=127,134;MMQ=43,37;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:263,3:0.015:266:125,2:126,1:0|1:190876247_G_C:190876247:191,72,3,0
chr4	190876256	.	C	T	.	.	DP=275;ECNT=20;MBQ=32,28;MFRL=127,121;MMQ=43,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:245,25:0.089:270:121,9:112,16:172,73,19,6
chr4	190876263	.	A	T	.	.	DP=288;ECNT=20;MBQ=31,27;MFRL=128,111;MMQ=43,33;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:251,25:0.088:276:117,14:122,9:172,79,18,7
chr4	190876268	.	A	G	.	.	DP=294;ECNT=20;MBQ=31,33;MFRL=127,134;MMQ=42,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:270,21:0.075:291:125,10:134,9:0|1:190876268_A_G:190876268:173,97,16,5
chr4	190876269	.	T	C	.	.	DP=295;ECNT=20;MBQ=30,33;MFRL=125,139;MMQ=42,30;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:269,16:0.058:285:123,11:139,5:170,99,13,3
chr4	190876272	.	G	A	.	.	DP=290;ECNT=20;MBQ=33,31;MFRL=126,131;MMQ=42,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:268,22:0.079:290:117,12:135,7:0|1:190876268_A_G:190876268:168,100,16,6
chr4	190876278	.	G	A	.	.	DP=266;ECNT=20;MBQ=33,33;MFRL=125,131;MMQ=41,36;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:248,18:0.071:266:107,7:128,11:0|1:190876278_G_A:190876278:139,109,11,7
chr4	190876287	.	G	A	.	.	DP=248;ECNT=20;MBQ=32,30;MFRL=125,126;MMQ=40,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:231,16:0.068:247:95,9:115,5:0|1:190876268_A_G:190876268:109,122,9,7
chr4	190876293	.	C	A	.	.	DP=235;ECNT=20;MBQ=32,32;MFRL=125,126;MMQ=40,37;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:208,16:0.075:224:93,7:111,8:0|1:190876278_G_A:190876278:80,128,8,8
chr4	190876301	.	C	A	.	.	DP=207;ECNT=20;MBQ=34,30;MFRL=128,124;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:182,21:0.104:203:88,9:86,11:0|1:190876301_C_A:190876301:58,124,6,15
chr4	190876305	.	A	T	.	.	DP=208;ECNT=20;MBQ=30,32;MFRL=128,124;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:186,19:0.094:205:84,9:78,9:0|1:190876301_C_A:190876301:56,130,5,14
chr4	190876307	.	G	A	.	.	DP=189;ECNT=20;MBQ=32,30;MFRL=129,124;MMQ=40,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:179,9:0.053:188:83,6:83,3:0|1:190876268_A_G:190876268:44,135,1,8
chr4	190876319	.	A	T	.	.	DP=148;ECNT=20;MBQ=30,33;MFRL=143,125;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=175.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,60:0.419:144:38,27:41,33:16,68,1,59
chr4	190876322	.	G	C	.	.	DP=144;ECNT=20;MBQ=33,33;MFRL=135,132;MMQ=40,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:129,12:0.091:141:56,6:64,5:0|1:190876268_A_G:190876268:16,113,1,11
chr4	190876335	.	T	C	.	.	DP=128;ECNT=20;MBQ=32,34;MFRL=142,141;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:116,11:0.093:127:53,4:59,5:0|1:190876335_T_C:190876335:9,107,1,10
chr4	190876343	.	G	A	.	.	DP=114;ECNT=20;MBQ=33,32;MFRL=144,146;MMQ=40,35;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,8:0.077:114:52,3:49,5:0|1:190876335_T_C:190876335:5,101,0,8
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chr4	190878452	.	TG	CA	.	.	DP=67;ECNT=10;MBQ=29,33;MFRL=182,187;MMQ=43,42;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,6:0.103:66:28,4:29,1:55,5,6,0
chr4	190878463	.	T	G	.	.	DP=75;ECNT=10;MBQ=31,34;MFRL=179,201;MMQ=46,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,16:0.221:75:25,11:30,5:0|1:190878463_T_G:190878463:52,7,15,1
chr4	190878479	.	A	C	.	.	DP=73;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=179,199;MMQ=49,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,3:0.055:70:28,1:36,2:0|1:190878479_A_C:190878479:60,7,3,0
chr4	190878485	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=10;MBQ=34,34;MFRL=180,191;MMQ=51,38;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,12:0.191:66:22,5:30,6:0|1:190878463_T_G:190878463:47,7,11,1
chr4	190878487	.	C	G	.	.	DP=65;ECNT=10;MBQ=34,36;MFRL=179,209;MMQ=49,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,8:0.134:65:22,5:33,3:0|1:190878487_C_G:190878487:49,8,8,0
chr4	190878500	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=10;MBQ=34,29;MFRL=167,191;MMQ=52,29;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,2:0.042:69:26,1:36,1:0|1:190878479_A_C:190878479:56,11,2,0
chr4	190878504	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=165,225;MMQ=58,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,8:0.126:70:25,2:35,6:0|1:190878504_C_T:190878504:50,12,7,1
chr4	190878506	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=10;MBQ=33,31;MFRL=154,207;MMQ=60,35;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=91.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,26:0.385:69:15,10:24,15:34,9,23,3
chr4	190878508	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=164,211;MMQ=56,31;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,3:0.055:70:21,1:31,1:0|1:190878487_C_G:190878487:55,12,3,0
chr4	190878512	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=159,196;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,5:0.103:56:22,0:28,4:0|1:190878504_C_T:190878504:43,8,4,1
chr4	190878541	.	T	TC	.	.	DP=79;ECNT=24;MBQ=31,32;MFRL=145,164;MMQ=57,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.050:77:34,2:34,1:44,30,3,0
chr4	190878563	.	C	A	.	.	DP=144;ECNT=24;MBQ=32,32;MFRL=150,154;MMQ=40,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:116,22:0.161:138:62,10:50,12:73,43,20,2
chr4	190878567	.	G	C	.	.	DP=146;ECNT=24;MBQ=33,33;MFRL=149,133;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:137,6:0.048:143:71,5:64,1:0|1:190878567_G_C:190878567:93,44,4,2
chr4	190878569	.	T	C	.	.	DP=148;ECNT=24;MBQ=32,32;MFRL=151,135;MMQ=40,37;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:135,13:0.093:148:68,7:61,5:91,44,9,4
chr4	190878571	.	G	A	.	.	DP=155;ECNT=24;MBQ=33,31;MFRL=151,134;MMQ=40,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:149,6:0.045:155:71,2:65,4:0|1:190878571_G_A:190878571:100,49,5,1
chr4	190878580	.	A	G	.	.	DP=174;ECNT=24;MBQ=31,35;MFRL=144,167;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:159,7:0.047:166:75,7:83,0:110,49,6,1
chr4	190878583	.	T	C	.	.	DP=178;ECNT=24;MBQ=32,30;MFRL=144,170;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:167,10:0.058:177:78,5:81,3:0|1:190878567_G_C:190878567:119,48,5,5
chr4	190878596	.	G	A	.	.	DP=187;ECNT=24;MBQ=34,30;MFRL=144,134;MMQ=40,26;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:179,8:0.048:187:87,4:87,4:0|1:190878571_G_A:190878571:126,53,6,2
chr4	190878597	.	C	T	.	.	DP=185;ECNT=24;MBQ=34,30;MFRL=144,141;MMQ=40,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=166.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:120,65:0.354:185:58,30:57,34:78,42,53,12
chr4	190878599	.	A	G	.	.	DP=189;ECNT=24;MBQ=33,33;MFRL=144,135;MMQ=40,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:163,21:0.118:184:78,11:77,10:118,45,13,8
chr4	190878600	.	TGAAGCAGGGGACATAGAA	T	.	.	DP=268;ECNT=24;MBQ=31,30;MFRL=140,163;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:245,13:0.054:258:83,7:83,6:145,100,7,6
chr4	190878604	.	G	A	.	.	DP=197;ECNT=24;MBQ=33,32;MFRL=143,135;MMQ=40,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:179,5:0.032:184:85,1:82,4:0|1:190878604_G_A:190878604:126,53,4,1
chr4	190878608	.	G	A	.	.	DP=214;ECNT=24;MBQ=33,32;MFRL=142,134;MMQ=40,26;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:186,8:0.046:194:85,4:88,4:0|1:190878571_G_A:190878571:124,62,6,2
chr4	190878625	.	A	G	.	.	DP=256;ECNT=24;MBQ=31,20;MFRL=134,123;MMQ=40,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:250,3:0.016:253:105,1:122,2:0|1:190878604_G_A:190878604:130,120,3,0
chr4	190878626	.	G	A	.	.	DP=249;ECNT=24;MBQ=32,32;MFRL=133,135;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:230,7:0.033:237:102,2:121,5:118,112,5,2
chr4	190878654	.	C	G	.	.	DP=278;ECNT=24;MBQ=34,33;MFRL=138,132;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:211,59:0.220:270:87,31:118,28:61,150,16,43
chr4	190878658	.	G	A	.	.	DP=275;ECNT=24;MBQ=33,31;MFRL=137,135;MMQ=40,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:261,9:0.036:270:112,2:135,7:68,193,2,7
chr4	190878661	.	A	T	.	.	DP=270;ECNT=24;MBQ=30,33;MFRL=139,134;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=170.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:195,73:0.273:268:88,29:105,43:56,139,11,62
chr4	190878662	.	T	C	.	.	DP=275;ECNT=24;MBQ=32,27;MFRL=139,135;MMQ=40,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:249,23:0.086:272:105,8:131,15:59,190,8,15
chr4	190878700	.	G	A	.	.	DP=144;ECNT=24;MBQ=33,30;MFRL=151,134;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:117,11:0.091:128:52,4:62,7:0|1:190878700_G_A:190878700:19,98,0,11
chr4	190878703	.	G	A	.	.	DP=128;ECNT=24;MBQ=33,28;MFRL=150,134;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:116,11:0.093:127:48,4:59,6:0|1:190878700_G_A:190878700:19,97,0,11
chr4	190878729	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=24;MBQ=31,31;MFRL=152,170;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,14:0.347:41:11,4:14,6:0|1:190878729_A_G:190878729:1,26,0,14
chr4	190878731	.	GG	CA	.	.	DP=43;ECNT=24;MBQ=32,32;MFRL=152,172;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,15:0.363:42:10,6:14,5:0|1:190878729_A_G:190878729:1,26,0,15
chr4	190878750	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=24;MBQ=31,33;MFRL=169,189;MMQ=52,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:14,5:15,1:0,31,0,6
chr4	190881826	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=188,225;MMQ=40,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:7,5:11,5:6,12,9,1
chr4	190881871	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=182,176;MMQ=27,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,14:0.255:57:17,5:24,9:25,18,14,0
chr4	190881933	.	A	G	.	.	DP=102;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=162,131;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,34:0.350:98:35,16:28,17:59,5,34,0
chr4	190881969	.	G	A	.	.	DP=173;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=141,131;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=224.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:107,66:0.383:173:50,34:50,30:0|1:190881969_G_A:190881969:64,43,20,46
chr4	190881992	.	T	C	.	.	DP=193;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=146,142;MMQ=27,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=272.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:118,75:0.390:193:54,30:60,41:0|1:190881969_G_A:190881969:53,65,11,64
chr4	190881997	.	A	G	.	.	DP=194;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=141,144;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=264.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:113,72:0.390:185:50,30:58,40:0|1:190881969_G_A:190881969:45,68,8,64
chr4	190882909	.	T	C	.	.	DP=131;ECNT=24;MBQ=31,32;MFRL=166,161;MMQ=40,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:114,15:0.112:129:54,8:60,7:111,3,9,6
chr4	190882911	.	A	T	.	.	DP=139;ECNT=24;MBQ=33,31;MFRL=162,166;MMQ=40,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:121,15:0.116:136:52,9:60,6:0|1:190882911_A_T:190882911:110,11,15,0
chr4	190882917	.	A	G	.	.	DP=152;ECNT=24;MBQ=33,34;MFRL=161,164;MMQ=40,35;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=46.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:133,16:0.112:149:60,9:70,7:0|1:190882911_A_T:190882911:116,17,16,0
chr4	190882925	.	T	C	.	.	DP=174;ECNT=24;MBQ=31,33;MFRL=161,161;MMQ=40,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:143,26:0.155:169:67,9:75,16:117,26,25,1
chr4	190882928	.	G	A	.	.	DP=178;ECNT=24;MBQ=35,31;MFRL=159,162;MMQ=40,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:153,18:0.109:171:66,9:82,9:125,28,17,1
chr4	190882949	.	T	C	.	.	DP=205;ECNT=24;MBQ=30,32;MFRL=156,158;MMQ=40,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:195,10:0.052:205:93,3:96,7:141,54,10,0
chr4	190882971	.	T	C	.	.	DP=171;ECNT=24;MBQ=32,34;MFRL=147,135;MMQ=52,31;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:164,5:0.035:169:46,2:82,3:0|1:190882971_T_C:190882971:101,63,1,4
chr4	190882973	.	A	G	.	.	DP=148;ECNT=24;MBQ=30,33;MFRL=145,136;MMQ=52,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=83.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:107,36:0.255:143:40,11:61,23:57,50,18,18
chr4	190882977	.	AAAG	A	.	.	DP=176;ECNT=24;MBQ=31,32;MFRL=138,135;MMQ=52,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:166,5:0.035:171:58,2:88,3:0|1:190882971_T_C:190882971:77,89,1,4
chr4	190883026	.	G	T	.	.	DP=218;ECNT=24;MBQ=34,31;MFRL=148,162;MMQ=52,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:195,21:0.100:216:82,9:106,12:69,126,2,19
chr4	190883030	.	G	T	.	.	DP=219;ECNT=24;MBQ=33,33;MFRL=150,168;MMQ=52,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:195,19:0.092:214:87,6:96,13:68,127,1,18
chr4	190883038	.	C	A	.	.	DP=214;ECNT=24;MBQ=33,31;MFRL=152,159;MMQ=51,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:207,6:0.032:213:92,2:109,4:0|1:190883038_C_A:190883038:65,142,1,5
chr4	190883039	.	T	C	.	.	DP=214;ECNT=24;MBQ=32,34;MFRL=153,166;MMQ=52,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:197,12:0.058:209:82,8:107,4:64,133,1,11
chr4	190883046	.	G	A	.	.	DP=201;ECNT=24;MBQ=32,32;MFRL=155,162;MMQ=52,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:187,10:0.054:197:81,5:95,5:60,127,3,7
chr4	190883051	.	G	A	.	.	DP=179;ECNT=24;MBQ=29,32;MFRL=137,169;MMQ=60,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=224.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:98,71:0.421:169:44,29:48,36:40,58,10,61
chr4	190883060	.	G	T	.	.	DP=160;ECNT=24;MBQ=33,31;MFRL=156,177;MMQ=52,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:157,3:0.024:160:67,1:78,1:0|1:190883038_C_A:190883038:47,110,0,3
chr4	190883073	.	G	A	.	.	DP=149;ECNT=24;MBQ=33,31;MFRL=144,172;MMQ=52,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:128,15:0.110:143:58,6:66,8:38,90,1,14
chr4	190883075	.	C	T	.	.	DP=143;ECNT=24;MBQ=28,31;MFRL=145,173;MMQ=52,27;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:129,10:0.072:139:56,6:67,4:37,92,1,9
chr4	190883080	.	CT	AG	.	.	DP=129;ECNT=24;MBQ=34,31;MFRL=148,171;MMQ=52,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,12:0.099:129:50,6:55,5:30,87,0,12
chr4	190883092	.	CTATT	C	.	.	DP=106;ECNT=24;MBQ=33,35;MFRL=148,165;MMQ=52,27;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,12:0.135:94:38,5:38,7:22,60,0,12
chr4	190883100	.	T	G	.	.	DP=93;ECNT=24;MBQ=32,34;MFRL=153,165;MMQ=52,33;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,7:0.086:90:39,5:43,2:18,65,2,5
chr4	190883110	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=24;MBQ=33,32;MFRL=144,168;MMQ=52,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=51.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,17:0.231:76:26,7:32,10:14,45,0,17
chr4	190883117	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=24;MBQ=33,34;MFRL=159,162;MMQ=51,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,5:0.077:76:31,1:35,4:12,59,0,5
chr4	190883125	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=24;MBQ=32,30;MFRL=161,161;MMQ=52,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,5:0.088:66:27,3:32,2:8,53,0,5
chr4	190883174	.	GT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=170,166;MMQ=60,25;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:13,1:11,4:2,23,0,5
chr4	190884118	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=158,139;MMQ=59,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr4	190884127	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=173,136;MMQ=60,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr4	190884177	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=165,131;MMQ=40,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:19,3:13,0:22,11,0,3
chr4	190905897	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,182;MMQ=40,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,3:3,0:0|1:190905897_C_T:190905897:7,0,3,0
chr4	190905922	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=170,157;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,3:0.222:16:8,2:5,1:1|0:190905897_C_T:190905897:13,0,3,0
chr4	190906025	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=153,142;MMQ=60,27;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,11:0.263:44:13,7:17,4:21,12,2,9
chr4	190906052	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=148,160;MMQ=52,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:14,3:14,1:10,19,1,3
chr4	190906057	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=153,136;MMQ=52,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:12,3:13,1:0|1:190906057_G_A:190906057:10,17,0,4
chr4	190906060	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=153,136;MMQ=52,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:12,3:10,1:0|1:190906057_G_A:190906057:8,16,0,4
chr4	190906142	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=140,165;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr4	190947451	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,140;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,28:0.708:39:4,12:7,16:11,0,28,0
chr5	163720	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:163720_A_C:163720:0,0,0,1
chr5	163722	.	A	ACCGAGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:163720_A_C:163720:0,0,0,1
chr5	169361	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	169763	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	172971	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr5	173200	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,3,15
chr5	173258	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	174026	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:9,1,2,0
chr5	174240	.	GC	AA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr5	182077	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,8,6
chr5	182462	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	194843	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=103,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:9,1:9,11,1,1
chr5	225768	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr5	230980	.	A	G	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=273.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.988:77:0,39:0,37:0,0,47,30
chr5	235531	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:5,1:14,1:1,18,0,2
chr5	254442	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=90.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,16:0,0,29,0
chr5	354051	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,4:0,13:0,0,3,15
chr5	413428	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.876:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr5	413591	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=92.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,12:0,8:0|1:413591_G_A:413591:0,0,3,18
chr5	413594	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=92.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0|1:413591_G_A:413591:0,0,3,18
chr5	413639	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
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chr5	423029	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:0,4,0,6
chr5	423906	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	428166	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:0,6:1,6:0,1,1,12
chr5	432905	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.772:19:2,7:1,5:1,3,8,7
chr5	434981	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	434998	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	435001	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	442571	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	443236	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	458151	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.573:19:3,6:5,4:3,5,6,5
chr5	465164	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=237,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr5	466811	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr5	473580	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	475621	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:475621_T_TG:475621:0,0,7,0
chr5	475626	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:475621_T_TG:475621:0,0,7,0
chr5	476530	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,3,5
chr5	477634	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	479879	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	479905	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	481610	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	481780	.	C	CCTTAAAGCCACTTGCCA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr5	482131	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,13;MFRL=243,174;MMQ=40,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:1,0:0,0:0|1:482131_A_C:482131:1,0,2,0
chr5	482138	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=16,12;MFRL=243,174;MMQ=40,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,0:0,0:0|1:482131_A_C:482131:1,0,2,0
chr5	482141	.	AA	GC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=16,16;MFRL=243,174;MMQ=40,36;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,0:0,0:0|1:482131_A_C:482131:1,0,2,0
chr5	482145	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=13,15;MFRL=174,243;MMQ=36,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:0,0:0,0:2,0,1,0
chr5	482146	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=36,11;MFRL=243,174;MMQ=40,36;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:1,0:0,0:0|1:482131_A_C:482131:1,0,2,0
chr5	482148	.	A	AGGGGGGGGGGGGGG,AGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,13,14;MFRL=0,174,243;MMQ=60,36,40;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=1,15,17;RU=G;STR;TLOD=5.46,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.499,0.335:3:0,0,0:0,0,0:0,0,3,0
chr5	482653	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,9:0,12:0,0,14,7
chr5	491826	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	619022	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr5	619333	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr5	634130	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=153,306;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	635709	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=123,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:1,6:5,9:2,4,5,10
chr5	644552	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=116,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.384:32:6,4:13,8:9,11,3,9
chr5	666244	.	G	GGGGCACAGGCGACTTA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=174,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGCACAGGCGACTTA;STR;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,4:0,0:0,1,2,2
chr5	666270	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=173,91;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	666323	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	801362	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	843702	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=138,140;MMQ=27,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:5,6:13,4:15,3,9,1
chr5	843723	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=128,121;MMQ=27,45;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.355:42:10,10:17,3:17,10,10,5
chr5	1034818	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,40;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,0:15,2:21,0,1,1
chr5	1035399	.	T	TAATG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AATG;STR;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	1035482	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=136.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,17:0,21:0,0,23,16
chr5	1036521	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr5	1038526	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	1053396	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr5	1057782	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	1060379	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	1060400	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	1060634	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	1060637	.	T	TTTTCAGTTCCATCTGTGTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1060637_T_TTTTCAGTTCCATCTGTGTG:1060637:0,2,0,1
chr5	1060641	.	CA	TT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:1060637_T_TTTTCAGTTCCATCTGTGTG:1060637:0,2,0,1
chr5	1060654	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	1065297	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,2:0|1:1065297_C_T:1065297:0,0,6,0
chr5	1065301	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0|1:1065297_C_T:1065297:0,0,7,0
chr5	1065306	.	ACT	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0|1:1065297_C_T:1065297:0,0,9,0
chr5	1065310	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,5:0|1:1065297_C_T:1065297:0,0,9,0
chr5	1065311	.	GGAGACACAC	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0|1:1065297_C_T:1065297:0,0,9,0
chr5	1065689	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	1073689	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	1076245	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr5	1076996	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1076996_T_A:1076996:0,0,0,1
chr5	1076997	.	C	CCAGGCATACTGCA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1076996_T_A:1076996:0,0,0,1
chr5	1078898	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=56.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,2,14
chr5	1081668	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.907:19:0,7:1,11:1,0,13,5
chr5	1081702	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,15:0,0,17,13
chr5	1085314	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:0,0:2,0:2,0,6,0
chr5	1085318	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,0:3,0:5,0,5,0
chr5	1085653	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1085653_G_A:1085653:0,1,0,1
chr5	1085655	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1085653_G_A:1085653:0,1,0,1
chr5	1085658	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:1085653_G_A:1085653:0,1,0,1
chr5	1085660	.	CC	TT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1085653_G_A:1085653:0,0,0,1
chr5	1093609	.	G	GGGGCGGGGACT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGCGGGGACT;STR;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.845:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	1094389	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr5	1201696	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	1201925	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=177,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr5	1212357	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	1214264	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr5	1219821	.	G	GGCAGCACAAATCCCCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	1221199	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr5	1225687	.	CT	TC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,6:0,0,7,6
chr5	1225703	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr5	1232255	.	AG	CC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=283,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:1232255_AG_CC:1232255:1,0,1,0
chr5	1232261	.	CT	GG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,17;MFRL=283,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:1232255_AG_CC:1232255:1,0,1,0
chr5	1232491	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr5	1232551	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr5	1232774	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1232774_T_TA:1232774:3,0,1,0
chr5	1232776	.	A	AAG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1232774_T_TA:1232774:3,0,1,0
chr5	1232779	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:1232774_T_TA:1232774:3,0,1,0
chr5	1232781	.	GTTATTTTGT	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.353:4:2,1:1,0:0|1:1232774_T_TA:1232774:3,0,1,0
chr5	1240848	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	1243009	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr5	1280477	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	1318665	.	T	TAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=185,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1318665_T_TAA:1318665:0,1,0,1
chr5	1318666	.	G	GGTTCCTGAGAAAGTCAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=185,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1318665_T_TAA:1318665:0,1,0,1
chr5	1320722	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,5,1
chr5	1324818	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,1:4,6:5,3,5,2
chr5	1325767	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,2:1,4:6,0,6,0
chr5	1325803	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:3,2:3,5:6,1,5,2
chr5	1334507	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=115,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.431:12:3,3:4,2:1,6,2,3
chr5	1334594	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	1334597	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	1335385	.	CTG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=173,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr5	1344458	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=118,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.410:53:12,12:19,7:18,13,12,10
chr5	1409127	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr5	1411256	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	1416142	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr5	1421907	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	1432825	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,4:5,1:2,5,1,4
chr5	1432876	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0|1:1432876_G_A:1432876:0,2,0,6
chr5	1432881	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,1:1,4:0|1:1432876_G_A:1432876:0,2,0,5
chr5	1466813	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr5	1470900	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.363:26:10,6:4,3:10,7,5,4
chr5	1471109	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	1473977	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	1479678	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=216,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.824:9:0,5:1,3:1,0,7,1
chr5	1481148	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr5	1483541	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,50;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.120:49:19,5:16,0:29,15,5,0
chr5	1490019	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,6:3,5:0,9,0,11
chr5	1494764	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr5	1501542	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:4,4:9,2:12,1,6,0
chr5	1501790	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr5	1814369	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=177,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr5	1814395	.	TTGTA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTA;STR;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,6:2,1:5,1,6,1
chr5	1815992	.	G	A	.	.	DP=138;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:122,5:0.046:127:67,1:53,4:57,65,1,4
chr5	1881828	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,2:2,0,7,1
chr5	1882655	.	T	TGCCCCCCCCCCC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.355:12:1,2:6,2:0|1:1882655_T_TGCCCCCCCCCCC:1882655:7,1,4,0
chr5	1882660	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=12,32;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:2,0:2,2:0|1:1882655_T_TGCCCCCCCCCCC:1882655:8,1,3,0
chr5	1882664	.	CAT	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,1:7,2:0|1:1882655_T_TGCCCCCCCCCCC:1882655:11,1,3,0
chr5	1882669	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,1:4,1:0|1:1882655_T_TGCCCCCCCCCCC:1882655:11,1,3,0
chr5	1882788	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.614:25:1,3:8,5:1,8,4,12
chr5	2749057	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	2755031	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr5	5146200	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	5146223	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:3,2,4,1
chr5	5186415	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.593:8:3,2:0,3:0|1:5186415_GT_G:5186415:0,3,0,5
chr5	5186417	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.593:8:2,2:0,2:0|1:5186415_GT_G:5186415:0,3,0,5
chr5	5187776	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.405:10:3,0:3,3:6,0,4,0
chr5	5200220	.	A	ATCTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,0;MMQ=60,57;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=TC;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.316:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr5	5232398	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	5236983	.	TA	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=173,212;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	5240137	.	A	ATCTCCCAGTGGAAAATGGAGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	5303349	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:6,3:7,1:10,5,3,1
chr5	5303614	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,4,0
chr5	5464225	.	A	AGACC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:5464225_A_AGACC:5464225:2,2,0,1
chr5	5464227	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:5464225_A_AGACC:5464225:1,2,0,1
chr5	5476250	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,14;MFRL=218,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,0:0,2,0,2
chr5	6372585	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=171,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.306:17:7,2:4,2:8,4,4,1
chr5	6372710	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=158,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:11,0:6,4:5,12,1,3
chr5	6378614	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,4,13
chr5	6602668	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.533:17:4,4:3,5:1,7,0,9
chr5	6604205	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=110,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:3,1,2,1
chr5	6605532	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,9:0,0,7,14
chr5	6607125	.	GAAC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr5	6610039	.	AAT	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AT;STR;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:14,2:17,1:3,29,0,3
chr5	6611757	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	6611983	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,1,8
chr5	6617011	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr5	6618186	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr5	6620459	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr5	6623432	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0,2,0,2
chr5	6632875	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,8:4,4:6,5,5,7
chr5	6632909	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,3:2,2:0,9,1,4
chr5	6632942	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:5,2:3,1:0,8,0,4
chr5	7690707	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	7690754	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr5	7743787	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=143.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,20:0,22:0,0,20,22
chr5	7782231	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr5	7804883	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7804883_T_G:7804883:0,1,0,1
chr5	7804885	.	AA	CC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7804883_T_G:7804883:0,1,0,1
chr5	7804888	.	T	TCCA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:7804883_T_G:7804883:0,1,0,1
chr5	7804892	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:7804883_T_G:7804883:0,0,0,1
chr5	7835685	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	7859523	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.497:32:7,11:9,4:9,7,10,6
chr5	7861638	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:6,0,3,0
chr5	7861840	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7861840_C_T:7861840:0,0,0,1
chr5	7861852	.	T	TTCATAACTGCCTGATA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:7861840_C_T:7861840:0,0,0,1
chr5	7862926	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=196,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:6,3:9,7:12,4,8,2
chr5	7878035	.	TTCGTTTG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:0,1:2,0:2,3,0,1
chr5	7885782	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:5,4:3,2:8,0,6,0
chr5	7893121	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=129,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	7896957	.	CT	C	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,7:0.113:69:30,2:22,5:48,14,6,1
chr5	9043142	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr5	9050410	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	9066464	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr5	9066802	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	9201973	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=208,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,1:2,3:4,0,4,0
chr5	9225088	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	9227108	.	AAT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.085:32:15,2:15,0:2,28,0,2
chr5	9629251	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,0:0|1:9629251_A_C:9629251:5,0,1,1
chr5	9629254	.	GCACTT	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=184,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:9629251_A_C:9629251:4,0,1,1
chr5	9629260	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=184,61;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:9629251_A_C:9629251:4,0,1,1
chr5	9629262	.	T	TGGA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=184,61;MMQ=60,60;MPOS=-1073741812;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:1,1:3,0:0|1:9629251_A_C:9629251:4,0,1,1
chr5	10227548	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr5	10227823	.	C	CCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=162,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	10235490	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	10236693	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,9:4,5:5,3,5,9
chr5	10250047	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=105.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.977:36:0,11:0,24:0,0,3,33
chr5	10250430	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=167.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,21:0,28:0,0,39,10
chr5	10250443	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=192.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,25:0,30:0,0,40,15
chr5	10254817	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=151.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,21:0,21:0,0,30,13
chr5	10255021	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr5	10256365	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	10258125	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr5	10262740	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,7:0,15:0,0,4,18
chr5	10263453	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,1:0,5:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,0,0,8
chr5	10263457	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,0,0,8
chr5	10263461	.	GGGA	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,2:0,6:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,0,0,9
chr5	10264962	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr5	10282238	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,189;MMQ=50,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:3,1:12,1:16,0,2,0
chr5	10282479	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=198,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr5	10381840	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:7,1,2,0
chr5	10394911	.	ATT	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=35,25;MFRL=167,155;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.322:7:5,1:0,0:4,1,1,1
chr5	10394930	.	GA	TG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=174,84;MMQ=53,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:4,2:1,0:1,5,2,0
chr5	10394997	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=191,162;MMQ=56,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:0|1:10394997_C_T:10394997:0,7,0,2
chr5	10394999	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=191,162;MMQ=56,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:5,1:2,0:0|1:10394997_C_T:10394997:0,7,0,2
chr5	10397473	.	CT	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.151:39:14,3:17,2:6,27,3,3
chr5	10405809	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.306:16:3,3:6,1:1,10,1,4
chr5	10415850	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr5	10417589	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	10442496	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	10748231	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,19,0
chr5	10748462	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	10748469	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=187,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr5	10988172	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr5	11082762	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=117,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,1:3,1:2,1,2,1
chr5	11082866	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:13,9,0,2
chr5	11117693	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:7,3:2,5:2,8,1,7
chr5	11159657	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:12,4:11,5:14,9,7,2
chr5	11159945	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0,4,1,4
chr5	11412302	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr5	11564995	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,2:0,8:0,0,9,1
chr5	13714740	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,3:4,0:3,4,0,3
chr5	13729714	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:4,3:3,2:1,7,0,5
chr5	13735892	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=182,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:3,3:7,10:6,4,11,2
chr5	13737700	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=204,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:13737700_A_G:13737700:0,1,1,2
chr5	13737705	.	G	GCCTGGCTCTCTAGAGGAGGAGGAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=102,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:13737700_A_G:13737700:1,1,0,1
chr5	13752462	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=207,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:13752462_C_G:13752462:0,1,0,1
chr5	13752465	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=188,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:13752462_C_G:13752462:0,2,0,1
chr5	13763039	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr5	13769257	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=200,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,4:0,5,4,5
chr5	13770757	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	13776487	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,2:4,3:4,0,5,0
chr5	13810149	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=83.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,12:0,0,19,9
chr5	13810441	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	13810451	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:13810451_CAT_C:13810451:0,3,0,1
chr5	13810462	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:13810451_CAT_C:13810451:0,3,0,1
chr5	13817881	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=221,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr5	13820656	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=33,21;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:13820656_G_A:13820656:0,4,0,1
chr5	13820658	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:13820656_G_A:13820656:0,4,0,1
chr5	13820662	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=167,174;MMQ=55,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:13820656_G_A:13820656:0,2,0,1
chr5	13820668	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=23,30;MFRL=159,190;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr5	13820671	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,31;MFRL=143,182;MMQ=60,55;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr5	13820683	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=35,31;MFRL=143,190;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13820683_C_T:13820683:0,1,0,1
chr5	13820687	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=143,190;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13820683_C_T:13820683:0,1,0,1
chr5	13820696	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=31,32;MFRL=143,190;MMQ=60,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13820683_C_T:13820683:0,1,0,1
chr5	13820699	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=24,31;MFRL=143,190;MMQ=60,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:13820683_C_T:13820683:0,1,0,1
chr5	13829608	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:7,2:1,3:6,2,5,0
chr5	13839695	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr5	13842027	.	CAAAAA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=226,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=19,14;RU=A;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.393:6:2,0:1,2:0|1:13842027_CAAAAA_C:13842027:0,4,1,1
chr5	13842052	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=224,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.757:4:1,1:0,2:0|1:13842027_CAAAAA_C:13842027:0,1,1,2
chr5	13845107	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	13845151	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	13850739	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:3,2:10,9:10,3,8,3
chr5	13850750	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.553:25:2,4:9,9:7,4,11,3
chr5	13859743	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=128,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:1,7:7,5:0,8,0,12
chr5	13859807	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	13862616	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:3,2,4,0
chr5	13865717	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=229,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:1,2,7,0
chr5	13866450	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=196,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:7,1:1,4:0,8,0,6
chr5	13867819	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr5	13868103	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.542:16:4,4:3,5:2,5,3,6
chr5	13871163	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,1:15,1:1,22,0,2
chr5	13871925	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=214,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:1,3:5,6:1,5,0,9
chr5	13882958	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=132,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.547:20:7,6:2,5:4,5,6,5
chr5	13885023	.	GCA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:0,1:0,1,3,1
chr5	13911700	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=A;STR;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	13914120	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr5	13914556	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	13914775	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,2,9
chr5	13914796	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	13914819	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr5	13923650	.	TT	CC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	13931205	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,4:3,5:8,1,6,3
chr5	13931340	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:3,2,1,4
chr5	14369690	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr5	14378068	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=252,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,4,1
chr5	14381174	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=143,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr5	14387489	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,1:2,4:9,1,5,0
chr5	14388793	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=113,130;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.166:25:11,0:7,0:11,10,0,4
chr5	14388797	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=111,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.192:25:9,1:6,1:11,9,0,5
chr5	14390989	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.148:36:15,2:13,3:28,3,5,0
chr5	14394283	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:0,8,1,4
chr5	14405895	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	14420027	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,10:0,0,11,5
chr5	14462816	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,11:0,16:0,0,25,4
chr5	14465620	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=12,21;MFRL=149,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.350:22:3,3:3,1:10,5,7,0
chr5	14472626	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,5:0,0,15,0
chr5	14476915	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=58,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAAG;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.506:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr5	14476968	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,6:6,4:7,5,5,5
chr5	14479938	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,10,0
chr5	14481270	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr5	14481455	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	14485161	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=149,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:6,1:5,2:9,3,3,0
chr5	14497070	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=109,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:12,1:15,1:10,19,1,1
chr5	14601058	.	TTTG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=107,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0|1:14601058_TTTG_T:14601058:1,1,2,0
chr5	14601064	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=186,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:1,0:0|1:14601058_TTTG_T:14601058:2,1,2,0
chr5	14601071	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,13;MFRL=174,152;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:14601058_TTTG_T:14601058:3,1,1,0
chr5	14607339	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=125,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr5	14610184	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr5	14678762	.	CT	C,CTT	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=149,128,173;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=11.39,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,10,4:0.193,0.089:50:16,3,2:19,6,1:34,2,11,3
chr5	14713075	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=170,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,0:13,3:6,15,1,2
chr5	14751399	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=217,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr5	14871620	.	AGGGGCGAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGGCGAC;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.861:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	15928155	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=121,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:15928155_G_A:15928155:0,3,0,1
chr5	15928157	.	C	CAAGACTGAGGATATA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=121,202;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:15928155_G_A:15928155:0,3,0,1
chr5	15937296	.	AGGG	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=201,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:15937296_AGGG_A:15937296:0,3,0,1
chr5	15937300	.	A	AGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=201,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:15937296_AGGG_A:15937296:0,3,0,1
chr5	15937302	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=201,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:15937296_AGGG_A:15937296:0,3,0,1
chr5	15937309	.	A	AACTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=191,109;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:15937296_AGGG_A:15937296:0,2,0,1
chr5	16067596	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:5,9,2,0
chr5	16067919	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:16067919_T_C:16067919:0,1,0,1
chr5	16067927	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=220,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:16067919_T_C:16067919:0,2,0,1
chr5	16091210	.	A	AGCAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=88,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:16091210_A_AGCAT:16091210:0,2,0,1
chr5	16091213	.	T	TGGATGTGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=88,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:16091210_A_AGCAT:16091210:0,2,0,1
chr5	16091242	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	16477751	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=84.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,10:0,15:0,0,22,4
chr5	16478120	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=134.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,21:0,17:0,0,29,9
chr5	16479151	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,0,19
chr5	16508674	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=182.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,38:0,16:0,0,27,27
chr5	16670618	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr5	16676103	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.470:28:8,9:6,4:14,1,13,0
chr5	16679966	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=218,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:6,0,6,0
chr5	16681553	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:9,0:20,2:12,17,1,1
chr5	16681966	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,28;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.469:13:1,2:6,4:3,4,5,1
chr5	16684109	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=112,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:0|1:16684109_T_C:16684109:1,4,0,2
chr5	16684131	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=182,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,0:3,1:1|0:16684109_T_C:16684109:0,4,0,1
chr5	16690033	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=109,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:5,6:0,3:3,2,2,7
chr5	16699512	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=216,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,6:2,1:2,1,6,1
chr5	16699721	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=124,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:16699721_CCA_C:16699721:1,3,0,1
chr5	16699729	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=124,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:16699721_CCA_C:16699721:0,3,0,1
chr5	16699733	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=124,216;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:16699721_CCA_C:16699721:0,3,0,1
chr5	16711365	.	CA	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=57.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.931:24:1,8:0,13:0,1,8,15
chr5	16711451	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr5	16762646	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,13,6
chr5	16763908	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:4,9:6,5:2,8,2,12
chr5	16764334	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr5	16766093	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,9,0
chr5	16781940	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:6,0:9,2:0|1:16781940_T_A:16781940:3,12,1,1
chr5	16781944	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=141,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:4,2:0|1:16781940_T_A:16781940:2,10,1,1
chr5	16783437	.	T	TAAAC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,4:5,6:7,4,6,4
chr5	16818363	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	16877671	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0|1:16877671_AC_A:16877671:6,1,2,0
chr5	16877673	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0|1:16877671_AC_A:16877671:6,1,2,0
chr5	16877853	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.233:6:2,1:3,0:0|1:16877853_A_AT:16877853:0,5,0,1
chr5	16877856	.	G	GTGTCCCCGCTTAAATCT	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:3,0:0|1:16877853_A_AT:16877853:0,5,0,1
chr5	16877860	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,1:3,0:0|1:16877853_A_AT:16877853:0,5,0,1
chr5	16877870	.	A	AACTC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:16877870_A_AACTC:16877870:0,2,0,1
chr5	16877875	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:16877870_A_AACTC:16877870:0,2,0,1
chr5	17276053	.	CCT	C	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=118,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=CT;STR;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,13:0.747:17:1,7:2,6:0|1:17276053_CCT_C:17276053:1,3,3,10
chr5	17276080	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=111,118;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,4:0.239:19:8,1:5,3:1|0:17276053_CCT_C:17276053:3,12,1,3
chr5	17276848	.	C	CA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=40.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.802:21:1,7:2,6:4,0,13,4
chr5	17276986	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=85.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,13:0,10:0,0,1,22
chr5	19571589	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=227,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr5	21760602	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	21783690	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21783690_T_TA:21783690:0,1,0,1
chr5	21783691	.	T	TAGTTTACATTTTCCTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:21783690_T_TA:21783690:0,1,0,1
chr5	21783703	.	G	GATCCATGTTTTGATCTGGGAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	23510203	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=68,160;MMQ=42,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=70.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.876:22:1,14:1,6:0,2,0,20
chr5	23510220	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=161,169;MMQ=49,42;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:5,0:0|1:23510220_A_G:23510220:0,18,0,2
chr5	23510222	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=161,169;MMQ=49,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,1:5,0:0|1:23510220_A_G:23510220:0,18,0,2
chr5	23523348	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr5	23527840	.	A	ACC	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=139,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.101:27:11,0:14,2:0|1:23527840_A_ACC:23527840:8,17,0,2
chr5	23527842	.	A	AC	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=139,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.101:27:9,0:13,2:0|1:23527840_A_ACC:23527840:8,17,0,2
chr5	23527919	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,0,11
chr5	24511674	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	26886200	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,23:0.436:53:20,10:10,13:4,26,7,16
chr5	26886261	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:0,13,0,6
chr5	26889902	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,1:3,2:5,2,3,0
chr5	26890727	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26890727_A_C:26890727:0,2,0,1
chr5	26890729	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=147,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26890727_A_C:26890727:0,2,0,1
chr5	31297497	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:12,2:17,0:6,23,0,2
chr5	31317812	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=166,126;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:8,5,2,0
chr5	31322851	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr5	31401447	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,5:3,1:8,0,6,0
chr5	31405880	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:0,0:2,2:0|1:31405880_T_C:31405880:0,3,0,2
chr5	31405887	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:31405880_T_C:31405880:0,3,0,2
chr5	31407139	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr5	31409115	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:7,0,3,0
chr5	31451752	.	GA	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:18,2:22,1:6,35,0,3
chr5	31472087	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=195,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:0,4:5,4:5,0,7,1
chr5	31472117	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.655:27:4,11:5,7:7,2,11,7
chr5	31483596	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=168.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,24:0,28:0,0,43,9
chr5	31483751	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=33,9;MFRL=109,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,8:0.120:50:11,0:17,0:0|1:31483751_G_T:31483751:18,24,0,8
chr5	31483752	.	AG	A	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=26,15;MFRL=109,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,8:0.121:50:12,0:21,0:0|1:31483751_G_T:31483751:18,24,0,8
chr5	31483753	.	GAA	G,GA	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=26,17,15;MFRL=125,109,161;MMQ=60,60,60;MPOS=18,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.95,7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,7,11:0.211,0.547:24:1,0,1:2,0,1:2,4,1,17
chr5	31483754	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=105,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,11:0.239:44:11,1:18,3:0|1:31483751_G_T:31483751:18,15,0,11
chr5	31486540	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr5	31508933	.	G	GT,GTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,23,33;MFRL=170,120,220;MMQ=60,50,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.87,3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.377,0.376:5:1,1,1:0,0,1:0,1,0,4
chr5	31508945	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=152,172;MMQ=50,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr5	31511106	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=182,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:6,5:5,6:10,1,9,2
chr5	31521324	.	T	TCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=134,215;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:10,0:5,13,0,2
chr5	31529299	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:31529299_A_G:31529299:0,0,0,4
chr5	31529306	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0|1:31529299_A_G:31529299:0,0,0,4
chr5	31532429	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,13:0,0,23,2
chr5	31532685	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=189,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr5	31541007	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,21:0.440:48:16,10:10,10:27,0,20,1
chr5	31541013	.	C	CT	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.102:41:20,1:16,2:36,1,4,0
chr5	31541034	.	G	T	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=144,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,5:0.082:70:33,5:24,0:56,9,5,0
chr5	31541212	.	AGTGTGTGT	A,AGT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32,31;MFRL=0,278,219;MMQ=60,60,55;MPOS=9,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,18,19;RU=GT;STR;TLOD=4.49,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.464,0.438:4:0,0,1:0,2,1:0,0,0,4
chr5	31799522	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=109,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:1,4:6,9:4,3,7,6
chr5	32057651	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	32057910	.	GT	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.235:19:5,1:9,2:5,10,1,3
chr5	32072509	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	32077795	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=184,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:32077795_G_T:32077795:0,2,0,1
chr5	32077798	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=184,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:32077795_G_T:32077795:0,2,0,1
chr5	32087228	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=57.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,13,5
chr5	32087253	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,9:0,0,12,10
chr5	32101400	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=119,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr5	32248077	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:3,1:5,3:8,0,3,1
chr5	32379210	.	G	A	.	.	DP=108;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=350.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,103:0.991:103:0,47:0,54:0,0,55,48
chr5	32385852	.	C	CCTAACCCTAACCCTAACCCTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=180,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.242:7:1,1:3,0:0,6,0,1
chr5	32388485	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,3:6,2:7,0,5,0
chr5	32395502	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	32415360	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=51.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr5	32444286	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=199,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:1,4:2,0:4,0,5,0
chr5	32591804	.	AT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:1,0:0,2:0,8,1,2
chr5	32789852	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,0:1,3:1,3,3,1
chr5	32790625	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:32790625_G_C:32790625:0,1,0,1
chr5	32790630	.	C	CTACCTCATCAGTATCTACCGGGAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:32790625_G_C:32790625:0,2,0,1
chr5	33441124	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:4,5:2,6:6,0,8,3
chr5	33455616	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr5	33455815	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,21:0.424:50:12,7:16,13:8,21,7,14
chr5	33456210	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,27:0.502:54:15,10:11,16:18,9,15,12
chr5	33457535	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,4:4,4:5,6,3,5
chr5	33458636	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:5,0,5,0
chr5	33458833	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:0,5,0,6
chr5	33460949	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:1,4:4,4:6,0,8,0
chr5	33461226	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:6,5:9,9:11,4,9,5
chr5	33467914	.	G	GGTTCGCTTTTGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	33535138	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=200,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33535138_C_G:33535138:0,1,0,1
chr5	33535139	.	GAC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=200,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33535138_C_G:33535138:0,1,0,1
chr5	33535142	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=200,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:33535138_C_G:33535138:0,1,0,1
chr5	33546062	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=195,174;MMQ=49,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:2,0:10,4:12,0,4,0
chr5	33546113	.	TA	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.554:27:7,7:5,8:11,1,11,4
chr5	33576848	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,0:5,4:4,7,0,4
chr5	33577339	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	33588684	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:7,8:2,2:5,4,5,5
chr5	33589003	.	G	GCACGCCCCCTAGTGGGTTGGAGTGTCTCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=38,33;MFRL=209,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.664:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	33615904	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr5	33630839	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,6:5,3:8,0,7,2
chr5	33637596	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,9,0
chr5	33637891	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=36,32;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:0,2:1,6:0|1:33637891_C_A:33637891:0,1,0,9
chr5	33637899	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:0,3:1,5:0|1:33637891_C_A:33637891:0,1,0,9
chr5	33637922	.	G	GTCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=210,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:33637922_G_GTCT:33637922:0,3,0,1
chr5	33637925	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=210,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:33637922_G_GTCT:33637922:0,3,0,1
chr5	33642112	.	AGCT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=212,246;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33642112_AGCT_A:33642112:0,1,0,1
chr5	33642118	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=212,246;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33642112_AGCT_A:33642112:0,1,0,1
chr5	33643617	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=49.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,3,12
chr5	33648842	.	GTT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	33648906	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	33649637	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr5	33649807	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr5	33649835	.	A	AAGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=115,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	33751454	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,11:0,4:0,0,13,2
chr5	33963731	.	AAAC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAC;STR;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	33964210	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,4:0,1:0,0,0,7
chr5	34043319	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34043319_G_GT:34043319:0,1,0,1
chr5	34043321	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:34043319_G_GT:34043319:0,1,0,1
chr5	34124422	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=176,192;MMQ=40,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:11,1,2,0
chr5	34124441	.	ATACCTG	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=168,145;MMQ=52,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:11,0:10,2:0|1:34124441_ATACCTG_A:34124441:26,1,2,0
chr5	34124449	.	GACT	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=168,145;MMQ=52,49;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:15,0:12,2:0|1:34124441_ATACCTG_A:34124441:26,1,4,0
chr5	34124455	.	GTAACTTATAAGAAGAGATA	G	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=160,158;MMQ=52,49;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:15,0:12,3:0|1:34124441_ATACCTG_A:34124441:44,1,3,0
chr5	34687911	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:5,1:9,10:0,14,1,10
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chr5	35068354	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:9,2:0|1:35068341_C_T:35068341:7,13,1,1
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chr5	35641591	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=219,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=85.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,26:0.932:27:0,13:1,13:0|1:35641582_A_C:35641582:1,0,13,13
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chr5	35659355	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
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chr5	35739960	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr5	35740186	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:7,3:7,5:9,5,3,6
chr5	35740449	.	T	TATAGGGTCTCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=210,273;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	35763895	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	35774185	.	C	CTTCTAGGATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	35792356	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	35799994	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr5	35800310	.	AA	GG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=260,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	35807070	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:8,9:9,5:2,15,1,14
chr5	35807132	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,8:1,1:1,2,4,5
chr5	35807455	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	35857177	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,6:7,4:3,7,1,9
chr5	35857235	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr5	35857262	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=163,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr5	35861068	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,26:0.530:49:11,15:12,11:10,13,11,15
chr5	35875593	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:4,6:6,0:10,1,6,0
chr5	35876024	.	AA	CC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,376;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:35876024_AA_CC:35876024:0,0,1,0
chr5	35876029	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=308,376;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35876024_AA_CC:35876024:1,0,1,0
chr5	35876033	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=308,376;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35876024_AA_CC:35876024:1,0,1,0
chr5	35876035	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=308,376;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35876024_AA_CC:35876024:1,0,1,0
chr5	35876038	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=308,376;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35876024_AA_CC:35876024:1,0,1,0
chr5	35876449	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=169,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:2,5:6,0:3,5,3,3
chr5	35904614	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,5:2,7:6,0,11,1
chr5	35910419	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,4:6,2:13,0,6,0
chr5	35921069	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr5	35921266	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=207,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr5	35954614	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=137,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:3,3:4,4:1,6,2,5
chr5	36035727	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr5	36111167	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	36116787	.	TTG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	36123065	.	TAA	T,TAAAA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=16,21,15;MFRL=141,148,144;MMQ=60,60,60;MPOS=22,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,16;RU=A;STR;TLOD=6.95,3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,4,3:0.124,0.086:29:4,2,1:5,0,0:5,17,2,5
chr5	36124428	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,2:11,1:0,24,0,3
chr5	36136349	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=97.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,24,2
chr5	36136675	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	36137620	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr5	36141386	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=200,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:2,5:5,3:0,8,0,8
chr5	36142589	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.537:13:3,4:2,2:4,3,5,1
chr5	36142648	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,7:7,2:5,6,6,4
chr5	36168582	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,1,11
chr5	36170455	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:5,7:4,7:3,6,11,3
chr5	36184135	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,194;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:22,2:7,0:1,28,0,2
chr5	36195448	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.485:25:7,6:5,6:0,13,0,12
chr5	36201336	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr5	36207424	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	36217764	.	G	GTTAATCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr5	36217997	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:8,7:5,4:2,11,3,8
chr5	36253937	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr5	36260976	.	T	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=162.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,31:0,19:0,0,19,31
chr5	36268218	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,13,0
chr5	36271491	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=45.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,8:0,9:0,0,1,16
chr5	36301362	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=134,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0|1:36301362_T_A:36301362:3,0,4,0
chr5	36301369	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=134,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0|1:36301362_T_A:36301362:3,0,4,0
chr5	36301420	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:4,4:3,2,7,2
chr5	36629549	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=136,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.225:28:13,0:5,0:12,9,7,0
chr5	36683903	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	36686472	.	T	TAGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=164,219;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	36985303	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,30:0.425:71:25,18:16,12:20,21,16,14
chr5	37000642	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=125,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.117:40:17,2:19,2:18,18,2,2
chr5	37000852	.	G	C	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,6:0.091:75:31,5:38,1:48,21,4,2
chr5	37001074	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:8,7:13,4:16,5,6,5
chr5	37007629	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:2,2:7,7:0,9,0,9
chr5	37019354	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,4:0,3:2,2,6,1
chr5	37027560	.	G	T	.	.	DP=124;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=118,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:100,12:0.082:112:46,3:42,1:47,53,0,12
chr5	37027576	.	GT	G,GTT	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=30,20,17;MFRL=126,76,138;MMQ=60,60,60;MPOS=15,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=19.05,4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,12,6:0.232,0.114:50:6,8,0:15,1,2:1,31,4,14
chr5	37027598	.	T	TTTCTG	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=141,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:20,2:19,0:2,38,0,2
chr5	37036449	.	GTATA	G,GTA,GTATATA	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=34,35,34,34;MFRL=156,152,139,99;MMQ=60,60,60,60;MPOS=30,21,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,8,9,11;RU=TA;STR;TLOD=7.50,69.70,6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:16,4,27,4:0.080,0.509,0.090:51:4,2,16,2:10,2,10,1:13,3,28,7
chr5	37036492	.	C	T	.	.	DP=139;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:131,3:0.029:134:56,3:67,0:76,55,1,2
chr5	37051861	.	A	AT	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,6:0.112:60:38,2:15,4:43,11,4,2
chr5	37064677	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:10,0,1,1
chr5	37108621	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr5	37115000	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=189,152;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.798:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr5	37139474	.	TA	T	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=41.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,25:0.363:68:16,13:21,11:7,36,3,22
chr5	37173930	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.624:11:3,2:0,4:2,2,5,2
chr5	37176091	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=140,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,2:5,8:3,8,2,8
chr5	37180362	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=180,153;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:9,0:0,1:0,11,0,2
chr5	37182902	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,7:3,1:7,2,7,1
chr5	37187489	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=137,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,25:0.404:62:18,18:19,6:28,9,22,3
chr5	37196023	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,4:0.074:65:25,4:33,0:34,27,4,0
chr5	37199052	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	37224485	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:0,0:2,4:0,3,1,3
chr5	37247700	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=77.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,17,6
chr5	37247899	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,34;MFRL=166,223;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr5	37292239	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=216,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:0,3,0,7
chr5	37307299	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.649:9:1,0:2,6:3,0,6,0
chr5	37331973	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=174,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37331973_G_T:37331973:0,1,1,0
chr5	37331976	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=174,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:37331973_G_T:37331973:0,1,1,0
chr5	37349160	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:3,4:3,2:7,0,6,0
chr5	37350390	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,11:5,0:2,7,0,11
chr5	37358310	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=250,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	37364095	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=147,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:11,2:3,2:4,10,2,2
chr5	37364103	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=147,52;MMQ=60,52;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,0:4,2:0|1:37364103_G_T:37364103:5,11,1,1
chr5	37364105	.	A	AGATACAACATATAAATT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=147,52;MMQ=60,52;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:11,0:4,2:0|1:37364103_G_T:37364103:5,11,1,1
chr5	37392277	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,10;MFRL=156,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.194:18:4,0:5,0:1,14,0,3
chr5	37605122	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=17,21;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.599:13:0,3:0,1:5,0,8,0
chr5	37724990	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=44.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,9:0,4:0,0,10,3
chr5	37752497	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	38352476	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:6,3:3,1:0,9,0,5
chr5	38407256	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=84,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,2:3,0:2,3,1,1
chr5	38408075	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=154,275;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:38408075_A_C:38408075:1,1,0,1
chr5	38408079	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,14;MFRL=154,275;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:38408075_A_C:38408075:1,1,0,1
chr5	38408093	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38408075_A_C:38408075:0,0,0,1
chr5	38490271	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,31:0.499:62:16,11:15,19:18,13,19,12
chr5	38502993	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,37;MFRL=255,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	38504303	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:7,1:2,5:1,8,0,7
chr5	38510481	.	AC	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:38510481_AC_A:38510481:0,0,1,0
chr5	38510486	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:38510481_AC_A:38510481:0,0,1,0
chr5	38512154	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,4:4,4:0,6,0,9
chr5	38528969	.	CACACACACACAG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:2,3:5,1:1,6,0,4
chr5	38869035	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	38876573	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	38881628	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,7,4
chr5	38886040	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	38886044	.	A	ACACTTCTCTTCCTTAAGTAATTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=240,124;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.385:4:2,0:1,1:3,0,0,1
chr5	38903923	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr5	38904363	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:38904363_C_T:38904363:0,0,3,1
chr5	38904373	.	C	CATCATTTTTCCTTCACCATGGAGTTCAATCTGACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=148,121;MMQ=60,37;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:38904363_C_T:38904363:2,0,0,1
chr5	38917574	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr5	38923152	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=179,172;MMQ=56,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr5	38923171	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=230,156;MMQ=40,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr5	38931919	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:1,5:5,7:6,0,11,1
chr5	38932466	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:6,9:2,5:8,0,14,0
chr5	38933645	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	38942329	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=177,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,1:11,1:22,1,2,0
chr5	38942554	.	AT	A,ATT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,31,30;MFRL=145,170,182;MMQ=60,60,60;MPOS=16,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=6.22,9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,5:0.225,0.271:19:4,3,3:5,1,1:0,10,0,9
chr5	38942560	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=180,135;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.164:22:11,0:7,3:0|1:38942560_T_A:38942560:0,19,0,3
chr5	38942562	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=180,135;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:12,0:6,3:0|1:38942560_T_A:38942560:0,19,0,3
chr5	38945919	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=188,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	38953665	.	G	GA	.	.	DP=98;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=147.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,61:0.930:66:4,17:1,14:2,3,10,51
chr5	38954994	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,0,23
chr5	38958750	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:11,9:6,8:12,5,12,5
chr5	38958968	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=196,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.911:21:1,10:0,9:0,1,0,20
chr5	38959794	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	38960058	.	TC	CT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,83;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:19,0:11,2:11,21,0,2
chr5	38962543	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=166.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,23:0,22:0,0,17,28
chr5	38966903	.	A	ATTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=178,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,19;RU=T;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr5	38971912	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,5:0,0:0,0,6,0
chr5	38990957	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	39074296	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,23:0.436:53:18,10:12,12:11,19,10,13
chr5	39119222	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	39119236	.	GAT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=238,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr5	39119561	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=248.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,71:0.986:71:0,38:0,29:0,0,67,4
chr5	39124508	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:3,4:2,4:0,5,0,9
chr5	39127960	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:0,3,1,5
chr5	39134295	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,5:4,5:7,3,5,5
chr5	39139351	.	G	C	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,3:0.054:71:37,0:31,3:23,45,1,2
chr5	39341371	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:17,2:9,0:5,21,0,2
chr5	39342294	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,1:14,1:5,14,1,1
chr5	39342308	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=141,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:0,3:4,5:1,3,0,8
chr5	39377132	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=101,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,32:0.590:54:10,23:12,9:12,10,25,7
chr5	39390061	.	C	A	.	.	DP=90;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=296.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,86:0.989:86:0,41:0,45:0,0,16,70
chr5	39390121	.	AT	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=155,75;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.136:19:10,1:5,1:0,17,0,2
chr5	40681254	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=101.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,34:0.549:62:10,15:16,19:11,17,11,23
chr5	40716153	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr5	40746885	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=113,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.546:29:9,10:3,6:12,1,13,3
chr5	40777531	.	T	TTA	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.428:40:13,8:9,8:18,5,13,4
chr5	40949997	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr5	40950211	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=2573,161;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr5	40962083	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=169,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr5	40964816	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.676:26:5,11:3,5:5,3,12,6
chr5	40972646	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=112,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,0:8,2:8,13,0,2
chr5	40979790	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=107,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.539:9:2,2:2,2:2,2,4,1
chr5	40980102	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr5	40981768	.	CCTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=209,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	40998814	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=127,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:2,3:5,2:2,5,1,5
chr5	40998851	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr5	40999900	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,4:7,6:4,6,2,8
chr5	41000243	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:5,0,6,0
chr5	41001023	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	41004396	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr5	41004406	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr5	41004807	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr5	41005791	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr5	41008650	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,3:3,2:7,1,5,0
chr5	41008780	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:5,3:3,6:4,4,6,4
chr5	41009546	.	A	ATCAGAGACCTTCATGGAGCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=168,270;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	41009576	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=196,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41009576_A_C:41009576:0,1,0,1
chr5	41009577	.	C	CCTTGAAATTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=196,168;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41009576_A_C:41009576:0,1,0,1
chr5	41010258	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	41032998	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr5	41033883	.	T	TTATC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=162,113;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=TATC;STR;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.284:15:8,2:2,0:11,0,4,0
chr5	41033909	.	ATCTATCTATCTATC	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=128,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.467:26:5,9:4,3:10,4,11,1
chr5	41034058	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=153,88;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr5	41039000	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	41042284	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:8,5:1,5:4,5,5,5
chr5	41042321	.	AAAGAT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,7:0,1:2,1,3,5
chr5	41045768	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	41045835	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr5	41050999	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	41061715	.	CA	TG	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,20:0.685:29:3,11:5,9:0|1:41061715_CA_TG:41061715:8,1,15,5
chr5	41061716	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,28:0.966:29:0,13:1,14:1|0:41061715_CA_TG:41061715:1,0,22,6
chr5	41061871	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.490:19:5,1:1,7:0,10,0,9
chr5	41069973	.	TGAC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr5	41070840	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,2:1,5:3,0,7,0
chr5	41142967	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=155,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:9,0:4,2:0|1:41142967_C_T:41142967:6,7,1,1
chr5	41142969	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=155,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:41142967_C_T:41142967:6,7,1,1
chr5	41142973	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=155,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:0|1:41142967_C_T:41142967:6,7,1,1
chr5	41149284	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:7,0,6,0
chr5	41154150	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,2,12
chr5	41158863	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr5	41381901	.	T	TC	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=92.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,37:0.944:39:1,25:1,12:2,0,27,10
chr5	41807543	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,4:1,2:0,3,1,5
chr5	41909830	.	CT	C,CTT	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=34,33,26;MFRL=132,141,131;MMQ=60,60,60;MPOS=14,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.40,4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:40,5,5:0.104,0.114:50:21,3,0:12,2,2:34,6,9,1
chr5	42713472	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:2,1:4,2:5,2,3,0
chr5	42718335	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr5	42769632	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.687:30:2,10:7,11:9,0,21,0
chr5	42769647	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.572:40:4,12:13,11:16,1,23,0
chr5	42769844	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=98.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.970:28:0,9:0,18:0,0,0,28
chr5	42779686	.	G	GA,GAA	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=34,33,34;MFRL=168,154,178;MMQ=60,60,60;MPOS=18,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=A;STR;TLOD=85.79,3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,36,4:0.799,0.104:44:1,13,4:3,15,0:0,4,4,36
chr5	42779736	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.418:32:11,6:5,7:1,18,0,13
chr5	42783581	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=88.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,28:0.539:52:12,18:11,10:21,3,21,7
chr5	42799719	.	T	TTTA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=52.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,6:7,6:11,2,14,0
chr5	42799876	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:17,1:15,1:5,27,0,2
chr5	42800808	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.701:14:1,5:2,5:2,2,8,2
chr5	43122348	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr5	43292483	.	C	CTTACTATGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	43292908	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=111.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,16:0,14:0,0,30,5
chr5	43294357	.	TAAGTAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	43295958	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:24,0:17,3:17,25,0,3
chr5	43297032	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr5	43298557	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr5	43412532	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	43488180	.	T	TTGATTAAGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=236,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	43492265	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=109.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,11:0,0,31,0
chr5	43493592	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=131.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.976:36:0,23:0,13:0,0,36,0
chr5	43509198	.	AC	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,141;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:11,2,2,0
chr5	43509462	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,5:0,0,1,6
chr5	43527673	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	43530035	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr5	43533992	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr5	43535754	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,6,17
chr5	43536855	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=85.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,16:0,7:0,0,23,0
chr5	43536904	.	TA	T	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,7:0.102:62:34,5:14,1:45,10,6,1
chr5	43543219	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,151;MMQ=60,30;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:26,3:20,0:12,34,0,3
chr5	43609272	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=158,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,2:5,6:11,2,6,2
chr5	43609343	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=205.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,20:0,39:0,0,37,22
chr5	43612984	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr5	43613137	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=134,80;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,3:0.062:62:22,0:37,3:23,36,3,0
chr5	45353366	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,75;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:2,9,0,2
chr5	50046139	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr5	50055456	.	C	CT,CTT,CTTT	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=33,34,32,33;MFRL=203,158,157,137;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,10,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,17,18,19;RU=T;STR;TLOD=11.03,11.04,16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,8,11,13:0.199,0.301,0.360:38:4,6,7,3:1,2,1,4:4,2,24,8
chr5	50122645	.	GTT	G,GT,GTTT,GTTTT	.	.	DP=120;ECNT=1;MBQ=30,17,33,33,14;MFRL=144,136,136,140,113;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=18,29,20,16;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=3.67,8.51,5.79,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:45,4,10,8,6:0.053,0.118,0.107,0.067:73:13,0,3,4,1:13,1,5,4,0:9,36,9,19
chr5	50679459	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:2,4:3,3:6,0,6,1
chr5	52084365	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	52097183	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr5	52097663	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=188,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr5	52193414	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=52.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,2,14
chr5	52204943	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,7:0,4:0,0,1,11
chr5	52223350	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,5:3,3:4,1,8,1
chr5	52235582	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:2,1:6,4:5,3,3,2
chr5	52235802	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,3,15
chr5	52235853	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:0,8,0,4
chr5	52235854	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:0,4,0,8
chr5	52243361	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr5	52322721	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.415:19:6,4:5,2:0,11,0,8
chr5	52344610	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:10,2:7,5:2,15,0,7
chr5	52351377	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:8,7:5,4:10,3,7,4
chr5	52351746	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:5,9:11,8:16,0,15,2
chr5	52351876	.	A	G	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=105.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,37:0.487:76:17,19:21,17:19,20,17,20
chr5	52353959	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=115,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:4,6:6,3:0,10,2,8
chr5	52354001	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,22;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr5	52354004	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:52354004_T_A:52354004:0,4,0,1
chr5	52354012	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	52354014	.	A	ATAACAACACCTCCAAG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr5	52354019	.	GC	TT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=202,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:52354004_T_A:52354004:0,1,0,1
chr5	52356701	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:8,2:2,8:11,0,6,4
chr5	52358757	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.511:19:1,1:1,8:1,9,4,5
chr5	52363046	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=140,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:5,4,0,2
chr5	52365923	.	A	ATT	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=T;STR;TLOD=84.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,29:0.508:57:18,12:8,14:19,9,23,6
chr5	52366138	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.636:25:2,8:5,8:0,9,0,16
chr5	52367666	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr5	52367706	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,2:1,3:0|1:52367706_T_C:52367706:5,0,5,0
chr5	52367715	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0|1:52367706_T_C:52367706:6,0,4,0
chr5	52368366	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=178,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,3:5,1:7,0,4,0
chr5	52368472	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=123,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:7,3:13,4:10,10,3,4
chr5	52368546	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.398:18:7,5:4,2:3,8,3,4
chr5	52368565	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=128,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:0,7,0,3
chr5	52368594	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr5	52369002	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:8,9:8,6:10,7,9,6
chr5	52369086	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=137,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.432:35:12,11:8,4:6,14,4,11
chr5	52370174	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:9,8:8,5:14,4,11,2
chr5	52382748	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:4,0,3,3
chr5	52404277	.	T	TTAC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,3:3,3:7,0,8,0
chr5	52404287	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,4:4,5:8,0,10,0
chr5	52404312	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.546:29:5,6:8,9:13,0,15,1
chr5	52781376	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.815:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	52781597	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,4:6,4:1,9,1,7
chr5	52781646	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:6,3:2,0:3,6,0,3
chr5	52781902	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=18,23,32;MFRL=113,159,148;MMQ=60,60,60;MPOS=8,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,20,23;RU=A;STR;TLOD=3.62,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,4:0.361,0.255:11:1,2,2:0,0,1:1,2,4,4
chr5	52954280	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,4:4,6:11,0,10,0
chr5	52954514	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,3:6,6:0,11,0,9
chr5	52979097	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,1:5,5:0,7,1,5
chr5	53815219	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,1:5,6:3,3,3,4
chr5	53815240	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,7:3,5:3,1,10,2
chr5	54275119	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:5,3:3,12:6,2,9,6
chr5	54320700	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,1,2
chr5	54459961	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,10:0,0,10,9
chr5	54468921	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr5	54552380	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:4,1:2,1:1,6,0,2
chr5	54558674	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,6:3,6:5,3,7,5
chr5	54563473	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=131,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,3:4,4:7,1,5,2
chr5	54565183	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,5:1,0:3,0,5,0
chr5	54573188	.	CA	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=133,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:1,1,0,1
chr5	54594591	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,175;MMQ=59,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:6,8:4,4:0,10,0,12
chr5	54641111	.	C	CACTTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:0,17,0,2
chr5	54683850	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:13,1:11,1:16,9,1,1
chr5	54693374	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr5	54693402	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr5	54706325	.	T	TTTTAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=85.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,6:0,10:0,0,18,2
chr5	54709943	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=69.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,13:0,7:0,0,17,3
chr5	54710072	.	GT	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=17,23;MFRL=161,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.569:16:1,4:2,3:1,6,3,6
chr5	54718605	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=180,162;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:0|1:54718605_A_T:54718605:8,0,2,0
chr5	54718611	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=185,162;MMQ=60,50;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:0|1:54718605_A_T:54718605:9,0,2,0
chr5	54718618	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.927:11:0,10:0,1:0|1:54718605_A_T:54718605:0,0,11,0
chr5	54721619	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr5	54721642	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=10,33;MFRL=225,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.953:24:0,10:0,9:1,0,20,3
chr5	54737791	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr5	54830295	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr5	54944945	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=148,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:4,5:8,0,7,0
chr5	54944976	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:9,7:5,8:13,1,15,0
chr5	54948586	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:2,1:4,3:0|1:54948586_C_CA:54948586:0,6,0,4
chr5	54948598	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:1,2:3,3:0|1:54948586_C_CA:54948586:0,5,0,6
chr5	54952688	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	54960609	.	A	G	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=118.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,43:0.494:87:27,19:16,22:31,13,25,18
chr5	54960687	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,25:0.408:62:16,14:18,11:7,30,3,22
chr5	54964974	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	54965513	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:4,2:5,5:3,6,3,5
chr5	54993829	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:3,1:4,6:1,6,1,7
chr5	55041943	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,4:3,3:9,0,7,0
chr5	55042163	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:0,5,0,6
chr5	55080998	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=178,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr5	55081043	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=164,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:12,3:11,0:21,2,3,0
chr5	55081476	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,6:2,1:8,0,5,2
chr5	55081745	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,2:0|1:55081745_C_T:55081745:0,10,0,2
chr5	55081753	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=190,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:55081745_C_T:55081745:0,7,0,2
chr5	55088589	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:9,2:2,0:3,10,1,1
chr5	55112262	.	C	CT,CTT	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=34,34,34;MFRL=151,137,158;MMQ=60,60,60;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=T;STR;TLOD=10.56,21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,8,16:0.268,0.502:32:5,4,7:1,3,5:8,0,20,4
chr5	55112289	.	A	C	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=126,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,6:0.079:68:23,0:21,0:36,26,6,0
chr5	55164650	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=133,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:6,1:6,1:5,7,0,2
chr5	55179052	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr5	55179070	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr5	55203138	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=213,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr5	55212379	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	55218112	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr5	55243420	.	TAA	T	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=31,9;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=25,23;RU=A;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.281:20:3,0:6,1:6,8,0,6
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chr5	55243461	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=139,131;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:14,0:13,2:0|1:55243434_A_G:55243434:0,28,0,2
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chr5	55272085	.	G	C	.	.	DP=125;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=189.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,64:0.537:119:25,33:29,29:26,29,28,36
chr5	55398269	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=109.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,11:0,0,26,4
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chr5	55466693	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0|1:55466689_C_A:55466689:0,3,0,6
chr5	55479293	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr5	55528572	.	A	AACAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=AC;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.821:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr5	55528815	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=200,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,1,6
chr5	55828998	.	G	GTTCA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=116,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.314:4:3,1:0,0:2,1,0,1
chr5	55828999	.	G	GCTC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=120,70;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.315:4:3,1:0,0:0|1:55828999_G_GCTC:55828999:2,1,0,1
chr5	55829001	.	G	GCAGGTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=17,32;MFRL=120,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:0,0:0|1:55828999_G_GCTC:55828999:2,1,0,1
chr5	55830865	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	56152416	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,4:4,7:9,3,8,3
chr5	56168907	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=183,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr5	56177848	.	TCAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CAA;STR;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:2,0:3,3:3,4,1,2
chr5	56205643	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=199.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,49:0.980:49:0,22:0,25:0|1:56205643_A_G:56205643:0,0,0,49
chr5	56205662	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,21:0.565:37:6,10:9,10:0|1:56205643_A_G:56205643:0,16,0,21
chr5	56206073	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr5	56212595	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:8,4:4,3:11,1,7,1
chr5	56219698	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=80.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.650:38:6,15:7,9:10,3,12,13
chr5	56226410	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:6,0,4,0
chr5	56229288	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,3:4,4:0,8,0,7
chr5	56233541	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.516:29:6,7:8,7:0|1:56233541_G_A:56233541:2,12,1,14
chr5	56233551	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,16:0.567:28:4,8:7,8:0|1:56233541_G_A:56233541:2,10,1,15
chr5	56234876	.	G	GCCTGATTTTTCAGAGGCACAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=164,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr5	56234906	.	A	ATTAAATTTGTGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56234906_A_ATTAAATTTGTGT:56234906:0,0,0,1
chr5	56234908	.	T	TAGGGGCCCAGGGCAATGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56234906_A_ATTAAATTTGTGT:56234906:0,0,0,1
chr5	56246610	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=186,77;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr5	56526783	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=158.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,28:0,21:0,0,16,34
chr5	56526819	.	GT	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.422:29:7,12:10,0:3,14,2,10
chr5	56527224	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	56527247	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	56531761	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,2:4,6:7,0,8,0
chr5	56546749	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=137,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,2:1,0,3,1
chr5	56547059	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr5	57750350	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:7,1,4,1
chr5	57753456	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,5:6,5:0,8,0,10
chr5	57754004	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=117,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:2,6,0,7
chr5	57754005	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=144,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,5:4,3:0,7,2,6
chr5	57754071	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=466,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57754071_T_TG:57754071:1,1,0,1
chr5	57754074	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=466,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57754071_T_TG:57754071:1,1,0,1
chr5	57754132	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	57754808	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.381:27:8,5:8,5:11,6,7,3
chr5	57755843	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr5	57790337	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.496:22:7,4:4,6:11,0,11,0
chr5	57913379	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=197,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr5	58021809	.	AT	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.095:50:28,3:16,1:38,8,3,1
chr5	58271713	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=11,23;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:0,5:0,4:0,1,2,10
chr5	58284283	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr5	58285813	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr5	58286625	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,12:0,2:0,0,10,4
chr5	58286749	.	A	AGAAAGTACCTTACCTGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr5	58289334	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=88.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,8:0,16:0,0,0,24
chr5	58334645	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.955:18:0,7:0,10:0,0,14,4
chr5	58489218	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	59899413	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=109,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:1,1:1,4,0,2
chr5	59940502	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,12:0,6:0,0,17,1
chr5	59995820	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=211,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr5	60062332	.	AAAGATCAAACATTT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAGATCAAACATTT;STR;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.282:23:4,5:7,1:14,3,4,2
chr5	60063576	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:4,4:6,11:10,0,15,0
chr5	60083275	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr5	60170337	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,2:5,3:7,0,5,0
chr5	60170512	.	TA	T	.	.	DP=71;ECNT=3;MBQ=19,30;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,12:0.253:48:8,3:9,7:8,28,4,8
chr5	60170558	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.490:37:9,6:9,12:0,19,0,18
chr5	60170605	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,5:6,5:0,8,0,10
chr5	60186618	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	60186975	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr5	60199363	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=216,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr5	60240986	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=17,30;MFRL=195,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.389:6:1,1:0,1:4,0,2,0
chr5	60241050	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=142,90;MMQ=60,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:18,4:10,1:23,5,5,0
chr5	60241274	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=113,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:60241274_A_T:60241274:1,2,0,1
chr5	60241276	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=113,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:60241274_A_T:60241274:1,2,0,1
chr5	60241278	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=113,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:60241274_A_T:60241274:1,2,0,1
chr5	60241281	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=113,217;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:60241274_A_T:60241274:1,2,0,1
chr5	60241306	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	60369083	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=143,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:2,7:6,7:3,5,2,12
chr5	60394706	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,24:0.528:45:15,7:6,15:21,0,24,0
chr5	60827631	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=198,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:60827631_C_G:60827631:0,2,0,1
chr5	60827637	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60827631_C_G:60827631:0,1,0,1
chr5	60827638	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60827631_C_G:60827631:0,1,0,1
chr5	60827643	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:60827631_C_G:60827631:0,1,0,1
chr5	60839907	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,4:3,7:4,3,7,4
chr5	60982694	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=114,213;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:11,7,2,0
chr5	61602209	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=20,21;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.680:4:1,0:0,2:0|1:61602209_T_TC:61602209:1,0,3,0
chr5	61602215	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.863:5:0,0:0,1:0|1:61602209_T_TC:61602209:0,0,5,0
chr5	61602219	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=27,32;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:0,0:1,4:0|1:61602209_T_TC:61602209:0,4,4,0
chr5	61602221	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=24,32;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,0:1,3:0|1:61602209_T_TC:61602209:0,4,4,0
chr5	61602224	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=166,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:4,0:1,1:0|1:61602209_T_TC:61602209:0,5,4,0
chr5	61602230	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,13;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,0:2,1:0|1:61602209_T_TC:61602209:1,7,3,0
chr5	61669737	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=248,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	61690246	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:10,2:18,1:28,0,3,0
chr5	61715024	.	A	AAAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=211,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:61715024_A_AAAAG:61715024:0,4,0,1
chr5	61715027	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=211,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:61715024_A_AAAAG:61715024:0,4,0,1
chr5	61745737	.	CTT	C,CT	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=136,138,154;MMQ=60,60,60;MPOS=11,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=8.80,101.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,7,43:0.126,0.778:55:1,2,19:2,4,23:2,3,41,9
chr5	61745937	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:0,13,0,2
chr5	61747534	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=116,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:2,4:0,0:2,0,4,0
chr5	61762880	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	61781127	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,23,0
chr5	61785936	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=170.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,19:0,27:0,0,38,10
chr5	61826663	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,2,13
chr5	63513099	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=114,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr5	63513258	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=159,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:63513258_A_T:63513258:0,3,0,1
chr5	63513260	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=159,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:63513258_A_T:63513258:0,3,0,1
chr5	63513265	.	T	TGAAGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:63513265_T_TGAAGA:63513265:0,2,0,1
chr5	63513266	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:63513265_T_TGAAGA:63513265:0,2,0,1
chr5	63621166	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,98;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,0:8,3:13,8,0,3
chr5	63802636	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=64,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.737:7:0,2:2,2:1,1,5,0
chr5	64023924	.	C	A	.	.	DP=158;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=124,121;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=184.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,73:0.482:151:41,39:33,32:38,40,36,37
chr5	64023940	.	CT	C,CTT	.	.	DP=131;ECNT=3;MBQ=33,34,34;MFRL=139,125,134;MMQ=60,60,60;MPOS=21,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=7.23,8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:79,8,8:0.078,0.090:95:38,4,3:37,3,4:19,60,7,9
chr5	64023981	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,34:0.451:76:26,20:14,14:6,36,4,30
chr5	64070617	.	A	AAATTATGAC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.516:27:8,11:5,3:7,6,7,7
chr5	64077647	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=197,272;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	64084746	.	CT	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=171,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:10,9:13,8:24,0,16,2
chr5	64084762	.	C	G	.	.	DP=70;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,4:0.073:65:18,0:20,1:51,10,4,0
chr5	64096046	.	CT	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,20:0.512:39:9,10:9,9:11,8,14,6
chr5	64096170	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,17:0.474:36:8,8:11,9:0|1:64096170_G_T:64096170:7,12,3,14
chr5	64096172	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=157,56;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:33,2:0.080:35:16,0:17,2:1|0:64096170_G_T:64096170:9,24,1,1
chr5	64267431	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:3,0,6,0
chr5	64447777	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=113,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,3:7,4:3,9,3,4
chr5	64466688	.	C	CAAAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,7;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:64466688_C_CAAAAA:64466688:0,0,0,1
chr5	64466691	.	T	TTCTTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:64466688_C_CAAAAA:64466688:0,0,0,1
chr5	64466694	.	G	GATATTTTAGCAAGTC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:64466688_C_CAAAAA:64466688:0,0,0,1
chr5	64483759	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	64520684	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr5	64522124	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=215,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr5	64747918	.	T	TG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=122.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,14:0,17:0,0,29,3
chr5	64755987	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,6:7,4:10,2,10,0
chr5	64766519	.	ATT	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0|1:64766519_ATT_A:64766519:2,0,4,0
chr5	64766523	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0|1:64766519_ATT_A:64766519:2,0,4,0
chr5	64766558	.	AATT	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:1,4:2,1,4,3
chr5	64825102	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:1,3:0,4,0,4
chr5	64838584	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:2,11:6,3:7,1,13,1
chr5	64838758	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=175,241;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	64847543	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:5,4:8,2:0,14,0,6
chr5	64863320	.	C	T	.	.	DP=92;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,46:0.533:86:15,29:25,17:30,10,38,8
chr5	64863484	.	T	TA	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.316:35:8,5:12,4:1,23,0,11
chr5	64865405	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=206,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:1,5:6,10:7,0,14,1
chr5	64890479	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=181,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,2:3,3:0,6,0,6
chr5	64892966	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,1:16,1:12,11,0,2
chr5	64906617	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=264,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr5	64914025	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=146,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,0:10,3:8,16,1,2
chr5	64919991	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=133,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:2,3:8,3:5,5,4,2
chr5	64920803	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,2:4,7:7,0,9,0
chr5	64933457	.	CA	C,CAA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,34,34;MFRL=158,147,143;MMQ=47,45,60;MPOS=24,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=7.36,10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,6,9:0.175,0.285:32:4,4,5:13,2,3:17,0,13,2
chr5	64942799	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=225,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,3:2,6:2,1,9,1
chr5	64942852	.	CT	C,CTT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,32,25;MFRL=160,109,0;MMQ=60,60,60;MPOS=21,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=12.74,7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,9,5:0.326,0.199:25:6,4,3:2,2,0:10,1,8,6
chr5	64954159	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.345:15:7,4:2,0:10,0,5,0
chr5	64956428	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=216,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr5	64960311	.	A	ATC,ATCTC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=207,158,194;MMQ=60,60,60;MPOS=7,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,8,9;RU=TC;STR;TLOD=7.64,21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,7:0.253,0.513:13:1,1,3:2,2,4:2,1,7,3
chr5	64968170	.	AT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.303:17:6,2:5,3:2,10,0,5
chr5	65008946	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=209,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr5	65018321	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr5	65073224	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,10:0,0,18,5
chr5	65288791	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	65308055	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,2:2,5:0,8,1,6
chr5	65309438	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:16,2:25,1:15,26,1,2
chr5	65310477	.	AT	A	.	.	DP=113;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,8:0.082:103:43,2:47,6:81,14,8,0
chr5	65317332	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,0,14
chr5	65372793	.	CT	C,CTT	.	.	DP=171;ECNT=1;MBQ=33,27,23;MFRL=143,117,129;MMQ=60,60,60;MPOS=19,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.73,6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:100,10,7:0.060,0.065:117:45,6,5:49,4,2:26,74,3,14
chr5	65458490	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:0,9,0,2
chr5	65466045	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=61.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,24:0.454:53:14,10:15,14:1,28,0,24
chr5	65466348	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=280,205;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,2:1,0:3,0,0,3
chr5	65892539	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,13;MFRL=204,279;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:65892539_A_C:65892539:1,0,1,0
chr5	65892544	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,13;MFRL=204,279;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:65892539_A_C:65892539:1,0,1,0
chr5	66084676	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=189,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,1:3,3:0,9,0,4
chr5	66124759	.	AT	TG	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,53;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,0:10,2:4,18,1,1
chr5	66282444	.	A	ATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=25.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,7:2,3:0,4,0,10
chr5	66416969	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=171,35516610;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:2,13,1,1
chr5	66429329	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,18,5
chr5	66462069	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.492:21:3,5:8,5:6,5,4,6
chr5	66478626	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	66478729	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=185,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:3,5:4,5:6,1,7,3
chr5	66480374	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.552:14:3,4:3,2:2,4,4,4
chr5	67569746	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=169,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.728:24:2,9:4,7:4,2,14,4
chr5	67575333	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,4:1,0:4,0,4,0
chr5	67575358	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=178,163;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:6,0:13,0,2,0
chr5	67576330	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.305:17:1,4:9,0:11,1,4,1
chr5	68409094	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:8,5:5,1:2,11,0,6
chr5	68412048	.	A	AT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.462:26:3,7:11,5:6,8,3,9
chr5	68463014	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.598:13:1,2:4,4:3,2,4,4
chr5	68464234	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.622:14:2,5:3,3:0,5,0,9
chr5	68471305	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,179;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:14,0:17,3:16,15,0,3
chr5	68485366	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=179,239;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	68490622	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,128;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:16,0:6,2:0,24,0,2
chr5	68491714	.	T	TAGTCAAG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGTCAAG;STR;TLOD=36.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,6:1,3:0,4,1,8
chr5	68492948	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:23,0:17,4:8,33,0,4
chr5	68498675	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:5,10:10,2:13,2,10,2
chr5	68504225	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=143,81;MMQ=60,48;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:20,0:14,6:7,28,2,4
chr5	68513572	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=154,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr5	68513599	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.665:19:0,7:6,5:6,0,13,0
chr5	68524006	.	CT	C,CTT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,34,33;MFRL=164,137,147;MMQ=60,60,60;MPOS=28,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.76,29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,5,17:0.151,0.464:35:7,1,3:5,4,11:13,0,16,6
chr5	68548351	.	T	TA	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=169,161;MMQ=60,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,34:0.744:46:6,23:3,10:0,12,0,34
chr5	68550348	.	CA	C,CAAA,CAAAAAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,19,35,27;MFRL=162,116,157,83;MMQ=60,60,40,60;MPOS=7,27,0;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=18,17,20,23;RU=A;STR;TLOD=5.63,4.14,5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,6,2,4:0.255,0.140,0.266:17:1,1,1,0:3,2,1,1:4,1,4,8
chr5	68564985	.	TA	T,TAA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,30,32;MFRL=157,145,66;MMQ=60,60,60;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=14.10,5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,10,5:0.231,0.124:42:13,7,4:13,2,0:27,0,11,4
chr5	68572902	.	C	CT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.114:32:17,0:10,2:26,3,2,1
chr5	68581383	.	A	AACTCTTCAAGCACTAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:68581383_A_AACTCTTCAAGCACTAAC:68581383:0,3,0,1
chr5	68581387	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=170,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:68581383_A_AACTCTTCAAGCACTAAC:68581383:0,3,0,1
chr5	68581389	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	68596054	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	68602746	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.544:44:10,14:10,10:6,14,5,19
chr5	68616456	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=251,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68616456_A_C:68616456:0,1,0,1
chr5	68616458	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,27;MFRL=251,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68616456_A_C:68616456:0,1,0,1
chr5	68616465	.	C	CTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=251,175;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68616456_A_C:68616456:0,1,0,1
chr5	68667263	.	TCCC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=C;STR;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.853:11:0,5:0,3:0,1,0,10
chr5	68682267	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,3:0.048:81:40,0:33,3:34,44,1,2
chr5	68685037	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0,7,1,1
chr5	68695852	.	CT	C	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=124,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,4:0.071:68:34,1:26,3:50,14,3,1
chr5	68696035	.	G	GTTTATTTA	.	.	DP=84;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=140,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=TTTA;STR;TLOD=105.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,28:0.877:31:2,14:1,10:0|1:68696035_G_GTTTATTTA:68696035:0,3,1,27
chr5	68696056	.	T	TTTATTTA	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:31,3:0.107:34:17,2:14,1:1|0:68696035_G_GTTTATTTA:68696035:1,30,0,3
chr5	68696064	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,2:0.094:30:11,0:13,1:1|0:68696035_G_GTTTATTTA:68696035:0,28,0,2
chr5	68706252	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=101.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,15:0,0,27,2
chr5	68706438	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=129.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,15:0,23:0,0,6,32
chr5	68715741	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,8:0.220:39:19,4:11,4:26,5,8,0
chr5	68728482	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=132,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,4:0.055:76:34,3:36,0:42,30,0,4
chr5	68728544	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:7,9:5,8:0,12,0,17
chr5	68737570	.	CA	TG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:17,2:6,0:0,23,0,2
chr5	68862362	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=151,129;MMQ=33,44;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.377:27:7,4:9,5:16,1,8,2
chr5	68862363	.	TGG	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=144,122;MMQ=35,21;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=G;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.222:26:10,1:9,5:18,2,5,1
chr5	68862365	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=157,132;MMQ=41,29;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.821:26:2,7:1,9:4,0,13,9
chr5	68868255	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,90;MMQ=60,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.898:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	70398831	.	A	C	.	.	DP=93;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,4:0.060:81:51,0:24,4:14,63,0,4
chr5	70398844	.	T	A	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=157,139;MMQ=57,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,3:0.062:61:34,2:21,1:5,53,0,3
chr5	70422915	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,99;MMQ=60,35;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70422915_T_G:70422915:0,0,0,1
chr5	70422922	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,99;MMQ=60,35;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:70422915_T_G:70422915:0,0,0,1
chr5	70757785	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=19,21;MFRL=178,185;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,14;RU=T;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.204:12:2,0:1,1:0,10,0,2
chr5	70763088	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=186,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	70779729	.	T	C	.	.	DP=147;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=137,60;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:131,6:0.050:137:59,6:67,0:63,68,0,6
chr5	70786726	.	G	GAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	70797500	.	TAA	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=131,84;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.292:18:4,4:1,1:5,8,3,2
chr5	70798653	.	A	ATT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:70798653_A_ATT:70798653:0,4,0,1
chr5	70798654	.	G	GCTGCCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:70798653_A_ATT:70798653:0,4,0,1
chr5	70798658	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:70798653_A_ATT:70798653:0,3,0,1
chr5	70800538	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,38:0.402:95:25,17:29,20:21,36,10,28
chr5	70805272	.	GC	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.353:35:12,5:11,7:16,7,8,4
chr5	70807991	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,9:3,4:8,0,13,0
chr5	70811821	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:8,2:4,2:11,1,4,0
chr5	70818305	.	G	C	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=132,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.087:60:16,0:24,0:15,40,0,5
chr5	70818329	.	CAAAA	C,CA,CAAA,CAAAAA	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=28,36,35,26,30;MFRL=140,147,146,163,130;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=18,21,26,18;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,12,13,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.08,5.60,4.03,10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:14,2,3,4,7:0.069,0.095,0.137,0.242:30:6,1,3,1,1:7,1,0,1,3:1,13,1,15
chr5	70818877	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=193,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,0:1,3:0,1,0,4
chr5	70820235	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70820235_G_T:70820235:0,1,0,1
chr5	70820239	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70820235_G_T:70820235:0,1,0,1
chr5	70820241	.	ATT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:70820235_G_T:70820235:0,1,0,1
chr5	70834833	.	G	A	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,34:0.388:87:20,11:33,20:29,24,23,11
chr5	70837295	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.393:23:7,4:7,3:6,8,4,5
chr5	70840433	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=208,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr5	70852611	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=205,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,2:3,6:5,0,8,0
chr5	70860493	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=48.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.497:32:9,8:6,7:16,0,16,0
chr5	70888665	.	GT	G,GTT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=35,36,36;MFRL=161,197,194;MMQ=60,60,60;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=6.18,5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,4,4:0.193,0.204:20:6,2,2:4,2,2:11,1,8,0
chr5	70888713	.	C	G	.	.	DP=61;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=137,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,7:0.142:53:30,2:14,1:34,12,6,1
chr5	70888798	.	C	T	.	.	DP=111;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=150,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,3:0.036:109:52,3:54,0:46,60,2,1
chr5	70888913	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=19,11;MFRL=199,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.292:14:4,0:1,1:0,10,0,4
chr5	70888916	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=176,210;MMQ=57,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:0,1:3,2:0,6,0,5
chr5	70922616	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,3:9,3:4,12,1,5
chr5	70927856	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:5,1,4,0
chr5	70928083	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.613:23:1,4:6,10:0,9,1,13
chr5	70948654	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr5	70952506	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.313:10:4,2:3,0:7,0,3,0
chr5	71403273	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	71403306	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr5	71411718	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	71494055	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,0:8,3:10,9,0,3
chr5	71522125	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	71739546	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr5	71743024	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	71743322	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	71757382	.	AA	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71757382_AA_TG:71757382:0,0,0,1
chr5	71757385	.	A	AGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:71757382_AA_TG:71757382:0,0,0,1
chr5	72112421	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:0|1:72112421_T_C:72112421:0,1,6,1
chr5	72112430	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0|1:72112421_T_C:72112421:0,1,4,1
chr5	72144209	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:8,7:12,6:12,8,5,8
chr5	72168584	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=138,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:7,2:8,1:1,14,0,3
chr5	72183055	.	CCT	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:6,2:10,1:0|1:72183055_CCT_C:72183055:5,12,1,2
chr5	72183059	.	AGTCCAG	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:6,2:10,1:0|1:72183055_CCT_C:72183055:5,13,1,2
chr5	72183069	.	GA	CT	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,1:9,1:0|1:72183055_CCT_C:72183055:2,12,1,2
chr5	72183074	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=127,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,1:0|1:72183055_CCT_C:72183055:1,11,1,1
chr5	72185591	.	CT	C,CTT	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,34,35;MFRL=145,160,140;MMQ=60,60,60;MPOS=25,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=11.91,8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,8,6:0.196,0.172:38:6,6,3:11,2,3:17,7,14,0
chr5	72192419	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=138,133;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,2:0.059:48:27,0:17,2:7,39,0,2
chr5	72192423	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=137,147;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:27,0:16,3:7,36,0,3
chr5	72192425	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=137,151;MMQ=60,35;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,2:0.064:45:25,0:15,2:7,36,0,2
chr5	72192431	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=144,128;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:18,0:14,2:0,36,0,2
chr5	72192434	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=140,138;MMQ=60,29;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:18,0:13,4:0,34,0,4
chr5	72192454	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=153,174;MMQ=58,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:8,1:5,1:0,13,0,2
chr5	72201058	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=214,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:2,4:0,2:2,0,7,0
chr5	72252034	.	G	GGGC	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GGC;STR;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.590:20:3,5:5,7:1,7,0,12
chr5	72347090	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=115,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:5,3:1,2:3,4,4,1
chr5	72350042	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,4:0.067:71:35,3:32,1:9,58,2,2
chr5	72350290	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,3:5,4:10,0,6,1
chr5	72364673	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:0,9,0,3
chr5	72370745	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,2:5,4:0,5,0,6
chr5	72378703	.	AT	A,ATT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=17,24,15;MFRL=152,151,137;MMQ=60,60,60;MPOS=26,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=13.29,3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,10,4:0.419,0.104:25:2,4,0:1,1,0:3,8,2,12
chr5	72742882	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,9:0,0,4,18
chr5	72742891	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=141,36;MMQ=60,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:10,0:5,2:0|1:72742891_G_A:72742891:1,14,1,1
chr5	72742896	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=141,36;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:0|1:72742891_G_A:72742891:1,12,1,1
chr5	72795055	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:14,2:6,1:1,22,0,3
chr5	72798502	.	GTT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr5	72798724	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr5	72800125	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,16;MFRL=123,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.196:45:18,0:12,2:14,22,8,1
chr5	72850282	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,1,5
chr5	72850858	.	A	AAAGGGCAGACATTTTCTGAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=159,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:5,0:2,2:0,7,1,1
chr5	72865584	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=258,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72865584_G_T:72865584:0,1,0,1
chr5	72865586	.	GGTTTAAATTT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=258,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72865584_G_T:72865584:0,1,0,1
chr5	72865598	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=258,203;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:72865584_G_T:72865584:0,1,0,1
chr5	72872766	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=68.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,16,4
chr5	72872966	.	C	CTTTTGATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=198,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:72872966_C_CTTTTGATG:72872966:0,4,0,1
chr5	72872968	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=198,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:72872966_C_CTTTTGATG:72872966:0,4,0,1
chr5	72873925	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr5	72874801	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr5	72875635	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	72980669	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:10,0:9,7,2,1
chr5	72980710	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:10,9,1,1
chr5	73069581	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	73076457	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	73076474	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=24,34;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr5	73076511	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr5	73090165	.	A	AGTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GTT;STR;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:4,0,6,1
chr5	73091126	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=166,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,6:2,1:5,1,7,0
chr5	73142380	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr5	73144845	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,11,7
chr5	73153389	.	TAC	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.248:18:8,4:3,0:0|1:73153389_TAC_T:73153389:14,0,4,0
chr5	73153407	.	CACACAT	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,14:0.470:30:8,5:6,9:1|0:73153389_TAC_T:73153389:16,0,13,1
chr5	73160730	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=120,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:4,7:5,2:3,6,4,5
chr5	73163861	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr5	73189145	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:1,8,0,7
chr5	73205463	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=190,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr5	73930442	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	73932315	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,5,11
chr5	73985107	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,3,1
chr5	73992406	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr5	73992609	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,10:0,0,2,18
chr5	74009327	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:4,6:3,4:6,2,6,4
chr5	74011541	.	TA	T,AA	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=29,26,20;MFRL=141,152,124;MMQ=60,60,60;MPOS=28,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.44,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,6,5:0.216,0.130:28:9,0,1:4,4,2:3,14,3,8
chr5	74011584	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:16,2:5,0:0,21,0,2
chr5	74021846	.	TACTCAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTCAA;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:2,2:4,3,1,2
chr5	74034245	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,26:0.472:55:11,11:18,14:9,20,9,17
chr5	74054595	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=175,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:8,1,8,0
chr5	74054792	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:6,7:7,5:2,11,0,12
chr5	74059623	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:2,2,0,1
chr5	74063154	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=156,121;MMQ=60,57;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,6:4,3:6,1,4,5
chr5	74063250	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=21,35;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:0,1:2,2:0,4,0,4
chr5	74063268	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.428:7:2,0:2,2:0,4,0,3
chr5	74072339	.	G	GA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=52.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.500:46:13,10:10,12:22,1,22,1
chr5	74097381	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.381:24:8,4:6,4:9,6,5,4
chr5	74130504	.	C	CTCTCTGTTTTCATCCCTGCCTTTGCAAAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	74130512	.	A	ACC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:74130512_A_ACC:74130512:0,0,0,1
chr5	74130513	.	T	TGGTTTGGGTCTCTATTCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:74130512_A_ACC:74130512:0,0,0,1
chr5	74134742	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:4,2,3,0
chr5	74326038	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:12,2:18,0:21,9,0,2
chr5	74639576	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr5	74651084	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,5,10
chr5	74655726	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.439:14:1,4:5,1:8,0,6,0
chr5	74675076	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=196,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:3,1,3,1
chr5	74685520	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:1,7:4,7:1,4,5,9
chr5	74695939	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr5	74842760	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=167,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:15,1:12,2:28,0,3,0
chr5	74842768	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.191:30:14,2:11,3:25,0,5,0
chr5	74842772	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:13,2:13,2:27,0,4,0
chr5	74848385	.	C	G	.	.	DP=117;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=133,50;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:112,4:0.042:116:53,0:57,4:0|1:74848385_C_G:74848385:46,66,0,4
chr5	74848387	.	A	C	.	.	DP=120;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=133,50;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:112,4:0.042:116:52,0:56,3:0|1:74848385_C_G:74848385:46,66,0,4
chr5	74876961	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=236,243;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	74877252	.	AC	A	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=144,117;MMQ=60,52;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.081:47:14,0:28,3:0|1:74877252_AC_A:74877252:11,33,0,3
chr5	74877256	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=143,117;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:15,0:29,2:0|1:74877252_AC_A:74877252:11,34,0,3
chr5	74877266	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,21:0.470:45:3,9:20,12:4,20,4,17
chr5	74879035	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr5	74880496	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35,32;MFRL=183,207,229;MMQ=52,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=A;STR;TLOD=3.46,3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.250,0.277:8:2,1,2:2,1,0:4,0,4,0
chr5	74889615	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,2:6,0:6,0,2,0
chr5	74986481	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr5	74988369	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,5:0,3:0,1,2,6
chr5	75427518	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr5	75505664	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:3,11,0,2
chr5	75886168	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=221,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	75888788	.	G	A	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=89.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,32:0.491:65:15,13:18,18:3,30,6,26
chr5	75907065	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr5	75913305	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=252,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr5	75923141	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:8,0,4,0
chr5	75923393	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:10,8:11,10:4,18,0,19
chr5	75927595	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,3:4,3:9,0,6,0
chr5	75927606	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:4,7:2,7:6,0,14,0
chr5	75927938	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr5	75932768	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr5	75948474	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	75948650	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr5	75948685	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr5	75950193	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	75950707	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr5	75954537	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.562:21:5,4:4,7:0,9,2,10
chr5	75960818	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=77.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.951:18:0,8:0,7:0|1:75960818_T_TA:75960818:0,0,16,2
chr5	75960825	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0|1:75960818_T_TA:75960818:0,0,18,3
chr5	75960865	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,10:0,17:0,0,20,8
chr5	75964462	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:5,4:2,6:8,0,10,0
chr5	75964683	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=154,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:16,0:17,3:1,33,0,3
chr5	75964702	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:7,8:8,7:0,15,1,14
chr5	75979832	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=270,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75979832_T_A:75979832:0,1,0,1
chr5	75979833	.	A	ACCTCAGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=270,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:75979832_T_A:75979832:0,1,0,1
chr5	75996837	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,4:5,2:9,0,6,0
chr5	75997063	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=50.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,14:0.536:26:6,7:5,7:0|1:75997063_A_G:75997063:2,10,2,12
chr5	75997069	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:5,4:5,6:0|1:75997063_A_G:75997063:1,10,2,9
chr5	75998488	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr5	76249536	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr5	76259350	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,4:0,0,0,14
chr5	76332631	.	CAG	TGA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=173,187;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0,12,0,2
chr5	76332644	.	CT	AC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=166,189;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:0,9,0,2
chr5	76607841	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=151,102;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.382:42:14,12:12,3:18,8,12,4
chr5	76607930	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=17,28;MFRL=153,173;MMQ=57,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.481:8:1,2:0,2:0,4,0,4
chr5	76621612	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr5	76707435	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20,29;MFRL=174,140,118;MMQ=60,60,60;MPOS=21,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.44,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.230,0.253:9:1,0,1:4,1,1:5,0,3,1
chr5	76722443	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,1:1,2:0,3,0,3
chr5	76729193	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr5	76736907	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=230,229;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	76747087	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=117.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,40:0.597:67:11,25:15,15:24,3,29,11
chr5	76760495	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=118,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,22:0.426:52:16,12:14,10:28,2,21,1
chr5	76760657	.	G	GA	.	.	DP=102;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=118.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,53:0.583:91:19,22:17,20:4,34,5,48
chr5	76785405	.	T	TG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:7,1:10,5:5,13,2,6
chr5	76787919	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,4,1
chr5	77004031	.	A	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,29:0.420:70:21,10:16,19:40,1,28,1
chr5	77004229	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.389:34:11,6:10,7:0,21,0,13
chr5	77004268	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=187,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,1:4,4:0,10,0,5
chr5	77298685	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=114,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.398:28:8,8:9,3:13,4,8,3
chr5	77424062	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	77425028	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,16:0,20:0,0,17,19
chr5	77461615	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:0,11,0,2
chr5	77745853	.	C	CA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=139.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.977:39:0,17:0,19:0|1:77745853_C_CA:77745853:0,0,9,30
chr5	77745862	.	GT	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.177:20:9,2:5,1:0|1:77745853_C_CA:77745853:4,13,1,2
chr5	77755035	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=187.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,31:0,23:0,0,38,16
chr5	77784642	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	77784671	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	78251347	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=128,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,2:5,5:1,6,3,4
chr5	78265092	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:2,2:3,5:0|1:78265092_C_T:78265092:0,5,0,7
chr5	78265096	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:0|1:78265092_C_T:78265092:0,4,0,5
chr5	78340062	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr5	78373251	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.339:13:5,3:3,1:9,0,4,0
chr5	78411763	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,7:2,3:0,5,0,10
chr5	78411817	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78411817_G_A:78411817:0,1,0,1
chr5	78411819	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:78411817_G_A:78411817:0,1,0,1
chr5	78416416	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,0:3,6:0,4,0,6
chr5	78416973	.	CA	C,CAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,34,34;MFRL=158,146,153;MMQ=60,49,50;MPOS=28,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=8.02,7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,6:0.286,0.326:18:3,2,3:4,3,2:7,0,10,1
chr5	78416992	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,15;MFRL=159,162;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.420:22:4,0:3,0:10,2,10,0
chr5	78421780	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,1:6,3:8,0,4,0
chr5	78533584	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=186,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr5	78586123	.	GG	CA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=114,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:12,2:6,19,0,2
chr5	78586914	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=126,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,3:2,2:5,3,4,1
chr5	78608354	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=20,20,23,20;MFRL=137,156,144,143;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,23,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15;RU=T;STR;TLOD=4.68,7.17,23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,3,5,13:0.095,0.153,0.403:33:3,1,0,4:6,2,3,6:3,9,2,19
chr5	78610480	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:78610480_C_A:78610480:1,6,0,2
chr5	78610484	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,0:0|1:78610480_C_A:78610480:3,7,0,2
chr5	78742858	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,1:1,3:8,0,3,1
chr5	78742980	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,0:5,4:1,9,0,4
chr5	78936847	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.393:21:7,4:4,3:10,3,2,6
chr5	78952691	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,5:2,2:5,0,7,0
chr5	79024734	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr5	79026371	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=125,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,2:6,0:10,3,1,1
chr5	79029008	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,16159291;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,0:9,2:8,10,1,1
chr5	79058981	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr5	79084949	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,5:3,1:1,3,1,5
chr5	79084973	.	T	TTCATC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:79084973_T_TTCATC:79084973:1,3,0,1
chr5	79084977	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:79084973_T_TTCATC:79084973:1,3,0,1
chr5	79086903	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=109,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,0:2,7:2,4,1,6
chr5	79283016	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.687:1:0,0:0,0:0|1:79283016_A_T:79283016:0,0,0,1
chr5	79283025	.	GATCAA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79283016_A_T:79283016:0,0,0,1
chr5	79284464	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=140,73;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:15,0:9,3:0|1:79284464_G_C:79284464:10,15,1,2
chr5	79284469	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=146,73;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:15,0:8,3:0|1:79284464_G_C:79284464:10,16,1,2
chr5	79285898	.	C	CA	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=138,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,5:0.074:78:34,2:38,3:67,6,5,0
chr5	79351544	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=171,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
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chr5	79351859	.	GG	AA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=108,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,15:0.500:30:9,12:6,3:0|1:79351852_A_T:79351852:7,8,4,11
chr5	79354147	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:1,2,0,4
chr5	79354184	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,0,3
chr5	79354647	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=210,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,1:3,4:0,4,2,4
chr5	79354682	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=184,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr5	79354702	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	79355192	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	79366249	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.573:23:3,7:3,5:2,8,3,10
chr5	79368016	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	79368048	.	TAGA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr5	79375144	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=183,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79375144_T_A:79375144:0,1,0,1
chr5	79375145	.	TGTGTTTTCC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=183,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79375144_T_A:79375144:0,1,0,1
chr5	79375724	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=190,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:8,4:6,6:11,3,8,2
chr5	79443169	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=234,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,3:1,2:1,1,1,5
chr5	79473059	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=62.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,18,0
chr5	79551867	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	79616859	.	G	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=139,206;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:27,0:23,3:30,20,0,3
chr5	79735858	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,6:0,5:0,0,0,12
chr5	79741018	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr5	79741304	.	CTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,0:2,1:0,3,1,0
chr5	79743821	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,13,2
chr5	79747291	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,15:0,0,19,6
chr5	79773028	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	79855876	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,8,9
chr5	79950163	.	C	CTGGCGCGTCCCGCCCAGGT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=101.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,23:0,13:0,0,47,0
chr5	79950512	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr5	79950724	.	G	C,GCCGCAGCGGCCGCAGCGC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32,35;MFRL=134,156,176;MMQ=60,60,60;MPOS=5,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.44,7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,6:0.211,0.629:11:3,1,3:0,1,2:0,3,3,5
chr5	79974646	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	80088461	.	CAG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=84.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,20,0
chr5	80388554	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr5	80390225	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,7:0,2:0,0,3,7
chr5	80390290	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	80404983	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=284,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:80404983_T_C:80404983:0,2,0,1
chr5	80404989	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=284,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:80404983_T_C:80404983:0,2,0,1
chr5	80409729	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr5	80504282	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr5	80513157	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=168,66;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,3:3,0:6,4,3,0
chr5	80521485	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=67.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,7:0,0,5,15
chr5	80562120	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr5	80600752	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:18,3:27,0:28,17,3,0
chr5	80608266	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	80608545	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr5	80631511	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:7,1:3,5:9,1,6,0
chr5	80640940	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	80716219	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,2:8,0:13,0,2,0
chr5	80744758	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	80756848	.	TAA	T	.	.	DP=96;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=147,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=A;STR;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,9:0.121:75:30,5:24,3:54,12,7,2
chr5	80756854	.	A	AT	.	.	DP=97;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=147,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,4:0.061:78:38,2:35,0:58,16,4,0
chr5	80756855	.	A	T,AT	.	.	DP=97;ECNT=3;MBQ=32,30,29;MFRL=144,147,133;MMQ=60,60,60;MPOS=16,7;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=187.52,5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,63,4:0.808,0.061:78:7,31,3:3,30,1:8,3,54,13
chr5	80770337	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,62;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,1:12,1:7,15,1,1
chr5	80785011	.	G	A	.	.	DP=96;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=310.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,91:0.989:91:0,49:0,40:0,0,80,11
chr5	81474225	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr5	81549280	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:1,6,0,4
chr5	81571846	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,30:0.537:56:11,12:14,18:26,0,30,0
chr5	81571896	.	A	G	.	.	DP=112;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=130,137;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=92.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,34:0.323:106:37,17:34,16:43,29,22,12
chr5	81572184	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:6,8:5,8:7,4,14,3
chr5	81573992	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.931:13:0,5:0,0:0,0,13,0
chr5	82360944	.	GA	G,AA,CA,TA	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=17,18,30,20,10;MFRL=166,160,126,166,154;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=18,10,17,19;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;TLOD=8.35,4.17,5.96,5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:37,7,5,7,10:0.107,0.056,0.096,0.076:66:5,1,2,3,0:3,0,3,1,0:5,32,2,27
chr5	82554559	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,149;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,0:8,3:0,15,0,3
chr5	82835724	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.674:25:3,8:4,9:4,4,11,6
chr5	82837631	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,4:4,5:1,4,3,6
chr5	82837896	.	CGAT	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.099:28:13,2:11,0:0|1:82837896_CGAT_C:82837896:18,8,0,2
chr5	82837901	.	G	GTAAGA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=172,137;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,1:12,0:0|1:82837896_CGAT_C:82837896:16,8,0,2
chr5	82843711	.	T	TATC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATC;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,5:1,1:3,0,6,0
chr5	82844004	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	82849120	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	82876284	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=124,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,23:0.511:45:12,10:10,13:5,17,3,20
chr5	82940510	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr5	82940548	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,1:0,8:0,0,0,9
chr5	82969399	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=185,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:82969399_TG_T:82969399:0,1,0,1
chr5	82969404	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=185,124;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:82969399_TG_T:82969399:0,1,0,1
chr5	83476194	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,5:1,4:5,0,8,1
chr5	86629061	.	C	CT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.131:43:19,0:17,3:35,3,4,1
chr5	86644983	.	CT	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.085:44:22,2:18,1:39,2,3,0
chr5	86667856	.	G	GA,GAAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,35,36;MFRL=0,172,137;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,13;RU=A;STR;TLOD=23.64,5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,9,2:0.683,0.197:12:0,5,1:1,4,1:1,0,11,0
chr5	86669964	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:3,0:4,2:8,0,3,0
chr5	86679495	.	TAA	T,TA	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=31,32,33;MFRL=152,146,171;MMQ=60,60,60;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=A;STR;TLOD=3.65,11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,4,10:0.121,0.336:31:8,4,5:6,0,4:14,3,10,4
chr5	86679676	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=192,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.432:12:5,2:2,3:0,7,0,5
chr5	86704042	.	GT	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	87494728	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33,32,30;MFRL=179,180,155,129;MMQ=60,60,60,60;MPOS=10,16,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=8.65,16.08,4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,5,9,3:0.211,0.362,0.144:24:4,4,5,2:1,1,4,1:7,0,15,2
chr5	87502325	.	G	A,GAAAA	.	.	DP=84;ECNT=1;MBQ=20,31,35;MFRL=130,142,89;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.41,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,18,4:0.299,0.072:42:5,7,2:5,7,1:6,14,3,19
chr5	87503087	.	GACT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=182,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.502:12:3,1:2,5:0,6,0,6
chr5	87516544	.	G	GAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=64,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=24,26;RU=A;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.666:12:3,1:1,1:3,1,0,8
chr5	87564602	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:14,0:15,4:11,20,0,4
chr5	88027559	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=129,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,1:9,1:15,6,1,1
chr5	89705413	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,5:2,2:5,2,5,2
chr5	89757099	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,2:9,0:10,10,1,1
chr5	89757452	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=167,55;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,4:5,0:1,9,0,4
chr5	89781594	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr5	89814604	.	G	GTGACC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=213,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGACC;STR;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,3:3,2:5,0,7,0
chr5	89815312	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.486:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr5	89914925	.	T	G	.	.	DP=93;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,41:0.495:83:21,16:20,25:22,20,24,17
chr5	89918596	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,198;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,1:2,1:0,11,0,2
chr5	89923477	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,0:8,2:10,5,0,2
chr5	89938587	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.366:25:5,5:10,3:8,8,1,8
chr5	89954184	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr5	89979380	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr5	89981879	.	G	GTTGTAGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=114,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:89981879_G_GTTGTAGGC:89981879:0,1,0,1
chr5	89981881	.	T	TTTAGAGTTATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=114,102;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:89981879_G_GTTGTAGGC:89981879:0,1,0,1
chr5	89988412	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.408:30:10,9:6,3:12,6,10,2
chr5	89990545	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr5	89993045	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,1:5,2:0,5,0,3
chr5	90001988	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,3:1,4:3,0,7,0
chr5	90002220	.	CT	C,CTT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,33,23;MFRL=162,148,132;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=8.50,8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,5,6:0.205,0.255:24:7,2,2:6,2,4:4,9,0,11
chr5	90007196	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,0:6,4:0,11,0,4
chr5	90012614	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	90015792	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr5	90020868	.	A	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=90.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,29:0.484:60:14,11:15,18:7,24,11,18
chr5	90021499	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.466:49:11,11:14,11:2,24,1,22
chr5	90052263	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,1:2,6:4,1,7,0
chr5	90052289	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.478:23:6,2:5,9:11,1,9,2
chr5	90053056	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	90086683	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=118,99;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:0,1,2,0
chr5	90111593	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	90149446	.	A	AAAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90149446_A_AAAG:90149446:0,0,0,1
chr5	90149448	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90149446_A_AAAG:90149446:0,0,0,1
chr5	90149450	.	C	CTGTTTTCATGTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90149446_A_AAAG:90149446:0,0,0,1
chr5	90445829	.	T	TTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.502:8:1,2:3,1:4,0,4,0
chr5	90449031	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr5	90669400	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0|1:90669400_A_T:90669400:0,0,8,0
chr5	90669408	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=134,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0|1:90669400_A_T:90669400:4,0,4,0
chr5	92956623	.	T	TCGA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CGA;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,1:4,0,2,0
chr5	92956865	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,1:8,8:2,12,3,6
chr5	93120058	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:13,0:20,3:25,9,1,2
chr5	93294451	.	CA	C,CAA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,33,32;MFRL=132,182,121;MMQ=60,60,60;MPOS=28,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.51,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,3,5:0.108,0.154:33:14,1,2:11,2,3:19,6,7,1
chr5	93388777	.	T	TATAG,TATAGATAG,TATAGATAGATAG	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32,31,30;MFRL=136,150,139,105;MMQ=60,60,40,40;MPOS=8,3,1;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,11,12,13;RU=ATAG;STR;TLOD=21.99,9.93,5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,6,3,2:0.356,0.318,0.220:13:2,4,1,1:0,2,2,0:2,0,11,0
chr5	93732142	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:8,7:11,9:10,9,11,5
chr5	93739455	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,2:4,1:4,8,1,2
chr5	93788579	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:5,1:8,3:13,0,4,0
chr5	93905243	.	T	C	.	.	DP=78;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=124,87;MMQ=60,30;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,19:0.257:76:22,10:33,9:29,28,3,16
chr5	93905255	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=126,96;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,9:0.139:70:25,7:33,2:0|1:93905255_C_T:93905255:30,31,1,8
chr5	93905264	.	CC	TT	.	.	DP=68;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=126,96;MMQ=60,31;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,7:0.114:68:24,5:33,2:0|1:93905255_C_T:93905255:29,32,1,6
chr5	93905269	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=131,96;MMQ=60,31;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,5:0.090:65:26,4:29,1:0|1:93905255_C_T:93905255:28,32,1,4
chr5	93905271	.	GT	CC	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=131,96;MMQ=60,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,5:0.094:62:27,3:26,1:0|1:93905255_C_T:93905255:27,30,1,4
chr5	93905352	.	T	TGGCCTGTCTTACTAGGTG	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=148,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,1:4,0:1,4,0,1
chr5	93998112	.	G	GTTA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=140,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTA;STR;TLOD=47.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.415:34:8,7:12,6:3,17,2,12
chr5	94006023	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=129.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.979:42:0,24:0,17:0,0,5,37
chr5	94022491	.	TTTAG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=183,265;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	94022495	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=194,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:94022495_G_T:94022495:0,2,0,2
chr5	94022515	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=215,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:94022495_G_T:94022495:0,3,0,1
chr5	94043353	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr5	94206019	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:11,0,2,0
chr5	94206957	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,19;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,2:3,1:3,1,5,1
chr5	94267796	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0|1:94267796_G_C:94267796:0,3,0,1
chr5	94267797	.	C	CCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:94267796_G_C:94267796:0,3,0,1
chr5	94267799	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0|1:94267796_G_C:94267796:0,3,0,1
chr5	94275689	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=189,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr5	94278129	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=197,149;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,5:1,7:0,5,2,10
chr5	94278154	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=196,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,5:2,4:0,6,1,8
chr5	94728631	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr5	94749903	.	C	CT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:7,5:7,5:2,12,1,9
chr5	94749969	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=139,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr5	94842718	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr5	94848178	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,1:12,1:23,4,1,1
chr5	94903575	.	CT	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.194:28:12,2:8,2:18,5,4,1
chr5	94918992	.	AAGAAAAATTTGAAAATTGTAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	95018382	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,5:8,2:9,4,3,4
chr5	95128742	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=143,249;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:6,1:7,3:9,4,3,1
chr5	95152313	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=155,154;MMQ=60,53;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.478:37:14,5:4,9:8,11,6,12
chr5	95152339	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.171:22:6,0:4,1:6,13,0,3
chr5	95732986	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,5:3,4:5,0,8,1
chr5	95735761	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:25,5:18,0:20,23,5,0
chr5	95747963	.	TCTC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=38.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.564:21:4,6:4,6:8,1,9,3
chr5	95757696	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=64427851,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:95757696_T_TC:95757696:1,0,0,1
chr5	95757698	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=18,33;MFRL=64427851,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:95757696_T_TC:95757696:1,0,0,1
chr5	95757704	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=64427851,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:95757696_T_TC:95757696:1,0,0,1
chr5	96062617	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,5:5,3:0,7,1,7
chr5	96066576	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.651:21:5,6:1,7:4,3,6,8
chr5	96066652	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,0,12
chr5	96071780	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=208,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	96078309	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=116.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,18:0,18:0,0,27,9
chr5	96078337	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=70.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,24:0.490:49:8,13:17,9:14,11,19,5
chr5	96093386	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=115,168;MMQ=60,44;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.199:24:12,0:7,0:9,10,0,5
chr5	96093391	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=139,169;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.292:27:9,6:6,2:9,10,0,8
chr5	96101066	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr5	96112005	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:1,2:0,2:1,0,5,0
chr5	96112083	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.474:21:6,3:5,6:8,3,8,2
chr5	96112284	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0|1:96112284_A_T:96112284:0,6,0,5
chr5	96112295	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:0|1:96112284_A_T:96112284:0,6,0,5
chr5	96116112	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:3,2:1,0:3,1,3,0
chr5	96116286	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:0,2,0,8
chr5	96116660	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,7:3,1:9,0,8,0
chr5	96116808	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,22:0.470:47:13,11:10,10:11,14,11,11
chr5	96117300	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr5	96117579	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=112,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,2:3,0:2,2,0,2
chr5	96119579	.	A	ACT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=46.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,5:0,0,11,1
chr5	96121715	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=170,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,1,3
chr5	96122260	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.429:33:12,7:7,7:6,13,3,11
chr5	96122281	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:9,5:6,8:3,12,3,10
chr5	96124447	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=196,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:96124447_G_C:96124447:0,1,0,4
chr5	96124453	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=191,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:0|1:96124447_G_C:96124447:0,2,0,3
chr5	96127905	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,4,18
chr5	96136525	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=132,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:6,6:3,3:8,2,8,1
chr5	96139066	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,5:6,2:8,1,6,1
chr5	96228256	.	C	CACACTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:96228256_C_CACACTG:96228256:0,4,0,1
chr5	96228258	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.297:5:2,1:2,0:0|1:96228256_C_CACACTG:96228256:0,4,0,1
chr5	96230858	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.494:12:3,5:3,1:5,1,6,0
chr5	96230883	.	A	ATT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=T;STR;TLOD=87.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,8:0,0,21,1
chr5	96231069	.	TTCACAATTCTGTGTATCATACTATATGGTGTAAAGAA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=168,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.093:31:12,1:9,0:7,22,0,2
chr5	96232222	.	G	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=139.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.979:46:0,18:0,25:0,0,0,46
chr5	96232250	.	G	GAAA	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=126.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,15:0,13:0,0,0,29
chr5	96232286	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr5	96232345	.	CAT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr5	96232402	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=119.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,17:0,16:0,0,32,1
chr5	96237413	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,0,13
chr5	96239294	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=54.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,4,12
chr5	96244585	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr5	96244638	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,10:0,0,14,5
chr5	96245518	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=80.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,3,19
chr5	96253349	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,161;MMQ=58,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:16,0:14,2:1,31,0,2
chr5	96332085	.	TC	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=89.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,16:0,15:0,0,22,9
chr5	96339102	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr5	96339273	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,6:0,0,2,13
chr5	96339297	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=187,28716627;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:1,8,0,2
chr5	96341750	.	TTATA	T,TTATATA,TTATATATA	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=28,31,30,31;MFRL=122,181,145,185;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,7,7;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=9,7,10,11;RU=TA;STR;TLOD=4.17,45.06,6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,2,17,3:0.079,0.477,0.102:32:1,0,9,2:9,2,8,1:7,3,19,3
chr5	96342077	.	TAA	T,TA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,26,32;MFRL=161,126,163;MMQ=60,60,60;MPOS=5,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=8.20,27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,8,14:0.279,0.577:25:2,2,6:1,5,7:3,0,15,7
chr5	96360459	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=173,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:96360459_C_A:96360459:0,2,0,1
chr5	96360462	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=173,240;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:96360459_C_A:96360459:0,2,0,1
chr5	96363407	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	96363459	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.581:27:5,6:6,8:5,6,9,7
chr5	96364063	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	96364151	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=148,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:15,0:13,11,2,0
chr5	96514982	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	98199048	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	98204372	.	AACCCCAATAGC	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.284:5:3,0:1,1:0|1:98204372_AACCCCAATAGC_A:98204372:0,4,0,1
chr5	98204375	.	C	CAGAGA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,36;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.323:4:2,1:1,0:1|0:98204372_AACCCCAATAGC_A:98204372:0,3,0,1
chr5	98204376	.	C	CAGGGTCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:2,1:1,0:1|0:98204372_AACCCCAATAGC_A:98204372:0,3,0,1
chr5	98204379	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:2,1:0,0:1|0:98204372_AACCCCAATAGC_A:98204372:0,3,0,1
chr5	98216956	.	CTTTTTT	C,CTTT,CTTTT,CTTTTTTT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,32,34,33,33;MFRL=124,129,126,126,76;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=14,24,29,30;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=24,18,21,22,25;RU=T;STR;TLOD=4.98,3.92,5.11,3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:2,4,4,5,4:0.126,0.203,0.244,0.283:19:0,1,2,3,2:0,2,2,1,0:2,0,14,3
chr5	98218734	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,1:3,2:15,0,3,0
chr5	98229376	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0,12,0,2
chr5	101592809	.	T	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.445:50:12,8:14,14:21,7,18,4
chr5	101595885	.	T	TGA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GA;STR;TLOD=82.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.962:22:0,9:0,11:0,0,21,1
chr5	101596025	.	TAA	T	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=163,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=A;STR;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.475:28:7,8:8,4:0,16,2,10
chr5	101596032	.	AAAAT	A	.	.	DP=58;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,16:0.467:57:22,8:13,8:15,26,0,16
chr5	101596072	.	ATATAT	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=149,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATAT;STR;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.483:25:5,6:8,6:0,13,0,12
chr5	101606518	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,0:3,2:0,8,1,2
chr5	101631592	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=21,27;MFRL=199,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:0,2:1,2:2,0,4,0
chr5	101631890	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=101,56;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:14,0:14,2:12,18,1,1
chr5	101724307	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=227,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr5	101724356	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,5:3,6:7,0,10,1
chr5	101726648	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=197.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,30:0,27:0,0,48,10
chr5	101726851	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr5	101755430	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr5	101794167	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=128,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:11,6:10,5:10,11,8,3
chr5	101795296	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,6:6,3:10,0,9,0
chr5	101795490	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,5:0,10:0,0,3,19
chr5	101811346	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr5	102262210	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:2,6:2,2:4,0,9,0
chr5	102282472	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,3:4,6:7,1,8,1
chr5	102282589	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:8,8:6,6:6,8,7,7
chr5	102295723	.	C	T	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=101.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,39:0.445:88:28,19:20,20:27,22,15,24
chr5	102310130	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=177,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,4:1,5:1,2,2,7
chr5	102310160	.	T	TTCTGTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=124,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr5	102310166	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	102363858	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:4,6:12,11:11,5,12,5
chr5	102364542	.	A	AAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,6:0,0,13,4
chr5	102423576	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=200,705375;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:102423576_A_G:102423576:5,0,2,0
chr5	102423579	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=200,705375;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:2,1:0|1:102423576_A_G:102423576:5,0,2,0
chr5	102440588	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=226,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:102440588_G_A:102440588:0,2,0,1
chr5	102440591	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=226,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:102440588_G_A:102440588:0,2,0,1
chr5	102440593	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=36,33;MFRL=226,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	102440599	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=225,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:1,0:0,1:0|1:102440599_A_T:102440599:0,1,0,1
chr5	102440601	.	A	ACGTT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,29;MFRL=225,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102440599_A_T:102440599:0,1,0,1
chr5	102440604	.	A	ACTTT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,27;MFRL=225,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102440599_A_T:102440599:0,1,0,1
chr5	102440606	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=225,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102440599_A_T:102440599:0,1,0,1
chr5	102472560	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=183,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:0,3:3,2:0,3,1,4
chr5	102483600	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.418:41:5,9:17,8:21,3,15,2
chr5	102484797	.	TAC	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.168:29:9,2:10,3:24,0,5,0
chr5	102487110	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:5,2:8,7:1,12,0,9
chr5	102490521	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:6,10:5,3:3,8,8,5
chr5	102491539	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,1:0,6:3,0,7,0
chr5	102494751	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr5	102513343	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:5,1,1,2
chr5	102537193	.	GT	G,GTT	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=34,33,34;MFRL=165,140,165;MMQ=60,60,60;MPOS=12,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.67,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:47,8,4:0.119,0.079:59:26,4,3:21,4,0:40,7,10,2
chr5	102612166	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:8,7:4,7:9,3,6,8
chr5	102613156	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,4:6,8:8,3,8,4
chr5	102614106	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=65.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,23:0.599:38:12,11:3,11:11,4,16,7
chr5	102614323	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=161,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,23:0.521:44:10,14:11,9:0|1:102614323_C_T:102614323:13,8,7,16
chr5	102614327	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=179.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,46:0.980:46:0,22:0,21:0|1:102614323_C_T:102614323:0,0,19,27
chr5	102886512	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr5	106723326	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=208,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,4:3,6:3,2,9,1
chr5	107197432	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=123,73;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:5,8,2,0
chr5	107684324	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	107703446	.	CAAG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=90.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,20,1
chr5	108203451	.	G	GT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.218:25:11,2:8,2:19,1,3,2
chr5	108203465	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=18,11;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.174:33:5,1:4,0:19,7,7,0
chr5	108281779	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr5	108281959	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=163,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.292:8:3,2:3,0:0|1:108281959_G_GA:108281959:3,3,1,1
chr5	108281960	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=163,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:0|1:108281959_G_GA:108281959:3,3,1,1
chr5	108281962	.	A	AAAATTCTTGACTAATAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=163,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:3,1:2,0:0|1:108281959_G_GA:108281959:3,3,1,1
chr5	108294979	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=149,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.353:29:11,3:8,7:8,11,4,6
chr5	108373106	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0,0,12,10
chr5	108382742	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:8,8:3,6:11,0,14,0
chr5	108436014	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=236,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	108516629	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:0,8:1,14:0,1,7,16
chr5	108673063	.	GA	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:10,1:18,2:9,25,0,4
chr5	108673125	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=200,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.680:20:2,10:4,4:1,5,2,12
chr5	108679870	.	T	TTTAA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTAA;STR;TLOD=209.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,18:0,21:0,0,40,8
chr5	108691730	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,16;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.312:17:4,0:5,0:0|1:108691730_GA_G:108691730:0,12,0,5
chr5	108691738	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,11:0.622:17:4,5:2,3:1|0:108691730_GA_G:108691730:0,6,0,11
chr5	108717157	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:5,1,6,0
chr5	109049507	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=51,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.687:6:0,3:1,1:1,1,1,3
chr5	109155662	.	A	AAATGATGACT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,409;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109155662_A_AAATGATGACT:109155662:0,0,1,0
chr5	109155666	.	G	GAAGAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,409;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109155662_A_AAATGATGACT:109155662:0,0,1,0
chr5	109155669	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,409;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:109155662_A_AAATGATGACT:109155662:0,0,1,0
chr5	109202725	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,21:0.449:47:14,8:12,13:7,19,6,15
chr5	109960960	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=108,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:9,13:5,2:8,6,10,5
chr5	109960989	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=107,134;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:5,10:6,4:4,7,6,8
chr5	109963430	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:8,12:7,6:14,1,17,1
chr5	110092480	.	AT	A,ATT	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=31,31,31;MFRL=138,121,151;MMQ=60,60,60;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=4.72,8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:40,4,6:0.087,0.131:50:20,4,2:19,0,4:10,30,2,8
chr5	110092545	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:5,4:10,9:0,16,0,13
chr5	110407507	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	110408705	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:3,3:2,9:0,5,2,10
chr5	110436301	.	G	A	.	.	DP=107;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=140.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,50:0.495:101:27,25:22,25:40,11,35,15
chr5	110436450	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=220.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,32:0,32:0,0,11,56
chr5	110438000	.	C	CA,CAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31,33;MFRL=143,175,129;MMQ=60,60,60;MPOS=11,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=7.21,6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,3:0.316,0.210:16:3,2,2:5,3,1:7,1,7,1
chr5	110443228	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	110446091	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.874:14:1,4:0,8:0,1,0,13
chr5	110446741	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:2,6,1,5
chr5	110448734	.	A	AATATATATATATATAT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=154,189;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=9,17;RU=AT;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.221:11:5,1:4,0:9,0,2,0
chr5	110448753	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=153,130;MMQ=40,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.763:15:2,7:0,5:3,0,10,2
chr5	110448755	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=189,130;MMQ=40,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.815:14:2,6:0,5:2,0,10,2
chr5	110448791	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=130,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:10,0:14,6,0,2
chr5	110454681	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:3,2,5,1
chr5	110461283	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:1,1,5,0
chr5	110679657	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:5,0,6,0
chr5	110712491	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=118,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr5	110730557	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	111500822	.	T	TAAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=108.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,16:0,8:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:0,0,3,22
chr5	111500824	.	T	TAC	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=112.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,15:0,8:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:0,0,3,23
chr5	111504403	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:1,6:5,6:5,1,12,0
chr5	111505885	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr5	111506751	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:3,2:0,3:0,4,0,5
chr5	111519740	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=128,124;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,45:0.548:82:21,28:16,17:18,19,24,21
chr5	111545670	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,106;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.628:25:5,7:4,8:5,4,7,9
chr5	111545730	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=140,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:2,12,0,2
chr5	111601969	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=147,59;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,5:0.087:67:35,5:25,0:0|1:111601969_C_T:111601969:27,35,2,3
chr5	111601977	.	G	T	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,3:0.051:69:37,2:22,0:0|1:111601969_C_T:111601969:27,39,2,1
chr5	111601981	.	G	GGAAATATACAAGATGAGCTTAGAGCATCTT	.	.	DP=76;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=138,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,3:0.047:76:42,3:26,0:0|1:111601969_C_T:111601969:26,47,2,1
chr5	112111309	.	TA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.196:31:15,4:8,3:22,2,6,1
chr5	112116632	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=120.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,17:0,17:0,0,4,33
chr5	112163630	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:13,2:17,0:23,8,1,1
chr5	112163815	.	C	CTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=188,189;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	112178492	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,5:3,6:2,2,1,10
chr5	112197132	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.500:28:5,9:9,5:0|1:112197132_G_A:112197132:9,5,8,6
chr5	112197140	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,15:0.533:28:5,7:8,7:0|1:112197132_G_A:112197132:8,5,7,8
chr5	112198128	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:4,0,7,2
chr5	112200098	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=118.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,31,0
chr5	112222694	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,3:5,5:7,5,5,3
chr5	112222787	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:3,5:10,11:4,9,8,8
chr5	112237982	.	GAC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr5	112238300	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	112256814	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,6:0,0,11,7
chr5	112257366	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	112257908	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=96.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,13:0,14:0,0,5,23
chr5	112312528	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=185,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:1,4:3,4:4,0,9,1
chr5	112312736	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,20:0.424:48:11,7:12,12:3,25,1,19
chr5	112321488	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:4,5:6,8:11,0,12,1
chr5	112343544	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr5	112346416	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr5	112346434	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,69;MMQ=60,38;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:13,1,1,1
chr5	112384725	.	GGTCACTGGGCA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTCACTGGGCA;STR;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.393:16:1,1:3,5:4,6,3,3
chr5	112385004	.	CA	GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:3,4:0,5,1,6
chr5	112385035	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr5	112389633	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=117,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,1:4,2:5,10,2,1
chr5	112389688	.	C	CTTAGCAGACCCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=205,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	112389738	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=177,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:112389738_C_T:112389738:0,1,0,1
chr5	112389743	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=177,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:112389738_C_T:112389738:0,1,0,1
chr5	112389747	.	C	A,G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,27,32;MFRL=0,205,177;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr5	112399760	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,1:13,1:10,18,1,1
chr5	112399791	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.467:26:4,10:9,2:3,11,6,6
chr5	112399934	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=132,45;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	112403678	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr5	112406718	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr5	112487137	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,12:0,11:0,0,5,19
chr5	112676191	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,12,0
chr5	112770027	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,117;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.513:14:3,5:2,2:4,3,3,4
chr5	112824039	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:0,8,1,6
chr5	112824048	.	T	TGCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GCC;STR;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr5	112851088	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=144,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:7,6:5,2:4,8,1,7
chr5	112851121	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,5:2,5:0,7,0,10
chr5	112876889	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=180,192;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.620:6:2,1:0,2:0,2,0,4
chr5	112884197	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:4,0,7,0
chr5	112898969	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	112901494	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,2:2,1:3,1,3,0
chr5	112915473	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=222,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr5	112926982	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,5:5,4:0,8,0,9
chr5	112927686	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=119,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr5	113698631	.	TGCC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr5	114462589	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr5	114611356	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	114611390	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=192,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:114611390_A_C:114611390:1,3,0,1
chr5	114611393	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=192,253;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:114611390_A_C:114611390:1,3,0,1
chr5	115167595	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=83,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr5	115168264	.	CTTTCT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=178,168;MMQ=53,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,4:4,2:6,0,7,0
chr5	115177668	.	G	GAGGC,GAGATTACGAGGC	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=28,28,29;MFRL=177,144,129;MMQ=60,60,60;MPOS=20,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.53,28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,5,8:0.208,0.302:28:5,3,4:10,2,4:15,0,13,0
chr5	115177706	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=143,0;MMQ=60,36;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.140:33:5,2:11,1:0|1:115177706_A_C:115177706:20,9,4,0
chr5	115177708	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=28,17;MFRL=143,0;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.120:39:7,0:16,0:0|1:115177706_A_C:115177706:24,11,4,0
chr5	115177713	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=144,53;MMQ=52,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.219:43:7,1:19,1:18,15,10,0
chr5	115230688	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,6:5,5:7,0,11,0
chr5	115249078	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,152;MMQ=60,51;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,12:0.220:57:30,8:13,4:24,21,11,1
chr5	115249271	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,179;MMQ=27,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.395:26:7,8:8,2:0,16,0,10
chr5	115298232	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	115323691	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr5	115329539	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,3:0.056:69:28,0:38,3:16,50,0,3
chr5	115338704	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr5	115339086	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=78.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,2,21
chr5	115351150	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	115351224	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=202,289;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr5	115351498	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,7:0,0,0,11
chr5	115426746	.	T	C	.	.	DP=94;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=323.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,90:0.989:90:0,42:0,46:0,0,70,20
chr5	115428439	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,0,16
chr5	115783553	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:1,0:2,2:0,4,0,3
chr5	115814496	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=119,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,3:2,1:0,2,0,5
chr5	115827356	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	115827407	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=94.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,19,7
chr5	115831092	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:6,4:10,2:14,3,4,2
chr5	115831305	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr5	115838117	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr5	115840528	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:4,1:3,3:8,0,3,1
chr5	118176842	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=198,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	118465215	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	118470061	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,0:9,2:7,13,0,2
chr5	118485908	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,69;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,4:7,0:10,6,3,1
chr5	118500981	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=10,16,30;MFRL=156,133,146;MMQ=60,60,60;MPOS=23,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,17;RU=A;STR;TLOD=5.21,5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,5,4:0.267,0.273:17:0,0,1:1,2,2:1,7,1,8
chr5	118556350	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,0,16
chr5	118574877	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	118691693	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=223,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr5	118691737	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.219:15:3,1:8,1:11,1,3,0
chr5	118691888	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:3,4:13,5:1,15,2,7
chr5	118691929	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr5	118728495	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=204,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.552:7:2,3:1,1:2,1,4,0
chr5	118788196	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:6,8:9,5:13,2,12,1
chr5	118809533	.	CCA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,2:2,8:6,2,9,1
chr5	118811313	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,5:3,1:4,0,5,1
chr5	118813240	.	T	C	.	.	DP=113;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=132.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,47:0.469:102:25,16:21,31:9,46,11,36
chr5	118837658	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:2,0,5,1
chr5	118837788	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=140,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,0:6,3:7,11,2,1
chr5	118837796	.	T	TGACGGGGCTGGGCCAGTCC	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:7,0:10,14,1,1
chr5	118837833	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,6:5,2:2,10,2,6
chr5	118862971	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=90.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,29:0.612:47:10,14:8,15:0,18,1,28
chr5	118867173	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,4:0,2:1,4,0,6
chr5	118965609	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=200,0;MMQ=50,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,1:0,2,2,1
chr5	118965615	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=84,232;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:118965615_C_T:118965615:1,1,0,1
chr5	118965617	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=84,232;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:118965615_C_T:118965615:1,1,0,1
chr5	118965621	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=84,232;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:118965615_C_T:118965615:1,1,0,1
chr5	118965623	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=167,116;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr5	118968423	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=157,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:2,1:0,3:2,1,3,1
chr5	118969594	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr5	120021819	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,9,12
chr5	121330223	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=117.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,18:0,17:0,0,28,8
chr5	121726714	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=206,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr5	121759310	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:121759310_A_T:121759310:0,3,0,1
chr5	121759312	.	C	CACAGACCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=165,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:121759310_A_T:121759310:0,3,0,1
chr5	121761323	.	G	GAGAGATTCTAGCCCAACTACTGGCTGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=237,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.484:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr5	122131082	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:2,5:5,1:2,6,0,6
chr5	122137708	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.429:47:18,12:9,8:3,24,4,16
chr5	122151706	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=133,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:7,2:17,0:9,15,1,1
chr5	122152520	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr5	122161961	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr5	122165207	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:9,1,2,0
chr5	122165209	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:8,1,4,1
chr5	122281709	.	G	GT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.423:27:9,6:7,4:16,0,11,0
chr5	122281721	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=19,10;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.172:38:6,0:6,0:24,6,8,0
chr5	122343366	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=145,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.159:22:8,0:5,0:11,8,3,0
chr5	122359502	.	A	AAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=AC;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,2:0,0,7,0
chr5	122425971	.	A	ACCTCCGCCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CCTCCGCCT;STR;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,0:0,2:0,0,1,2
chr5	122682154	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,17,0
chr5	122685801	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,2,18
chr5	122713989	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=140.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,27:0,16:0,0,34,9
chr5	122718341	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	122726783	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,14,1
chr5	122729230	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr5	122735032	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:0,8,0,3
chr5	122888781	.	A	AT	.	.	DP=213;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:158,7:0.042:165:80,3:77,2:108,50,5,2
chr5	122911666	.	AC	TT	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=141,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:25,3:17,0:10,33,2,1
chr5	122941000	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,76;MMQ=60,51;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr5	123984763	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=102,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,5:4,4:0,8,2,7
chr5	123985484	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=129,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr5	124079728	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=144,82;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,3:3,0:8,0,3,0
chr5	125802122	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.386:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr5	125805316	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,2:16,0:23,2,2,0
chr5	125809072	.	T	TA	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.153:30:16,3:10,1:1,25,0,4
chr5	125809145	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:0,7,0,5
chr5	125820276	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.434:5:2,1:1,1:1,2,0,2
chr5	125880589	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:4,1:4,1,2,0
chr5	125886071	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	125887685	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr5	125896918	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,4:3,1:0,8,0,5
chr5	125898834	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr5	125900371	.	T	TAAAATACAAAAATTAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=142,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:125900371_T_TAAAATACAAAAATTAG:125900371:0,1,0,1
chr5	125900374	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=142,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:125900371_T_TAAAATACAAAAATTAG:125900371:0,1,0,1
chr5	125919529	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=203,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:1,1:9,2:10,0,3,0
chr5	125936839	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=170,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:1,1:1,0:1,6,0,3
chr5	125944219	.	G	GTGTTTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TGTTTT;STR;TLOD=51.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.940:12:0,4:0,6:0,0,0,12
chr5	126145771	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	126156538	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr5	126168563	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=66.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,6:0,12:0,0,0,18
chr5	126171999	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=129.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,15:0,21:0,0,6,30
chr5	126753585	.	G	GAGGTCAGGGGTTAAAGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	126869270	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=169,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,3:7,4:9,2,6,1
chr5	126994381	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=225,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:0,1,0,5
chr5	127485599	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	127493679	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,4:6,4:10,0,7,1
chr5	127507316	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:7,2:4,2:10,1,5,0
chr5	127512873	.	A	C	.	.	DP=105;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=146.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,48:0.513:94:26,21:18,27:7,39,10,38
chr5	127514436	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,4:4,7:0,6,0,11
chr5	127522153	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=131,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.317:11:2,2:4,1:5,3,3,0
chr5	127613791	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	127640783	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.429:33:12,3:6,11:2,17,0,14
chr5	127674749	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=132,90;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:4,11,0,2
chr5	127680264	.	T	TACGTCCTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:127680264_T_TACGTCCTG:127680264:0,0,0,1
chr5	127680266	.	A	ATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:127680264_T_TACGTCCTG:127680264:0,0,0,1
chr5	127727761	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=120,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:7,3:13,0:5,15,3,0
chr5	127730721	.	CA	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	127855152	.	GTTAAA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.688:17:3,3:2,8:0,5,0,12
chr5	128321068	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:1,1:0,4,0,3
chr5	128359247	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	128359297	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr5	128430384	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	128796210	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=160,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,0:4,2:0|1:128796210_A_T:128796210:1,8,1,1
chr5	128796215	.	T	TGAAGATCTTCA	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=160,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:128796210_A_T:128796210:1,8,1,1
chr5	128796217	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=160,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:128796210_A_T:128796210:1,8,1,1
chr5	128796220	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=172,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,2:0|1:128796210_A_T:128796210:1,10,1,1
chr5	128863423	.	A	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=141,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.081:59:25,4:29,0:49,6,3,1
chr5	128932316	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,91;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:9,3:12,0:8,13,3,0
chr5	129015668	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chr5	129072943	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,1,17
chr5	129244122	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:0,7,0,7
chr5	129244133	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr5	129519874	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr5	130515745	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=149,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:5,2:3,0:8,0,3,0
chr5	130726599	.	TAAAATTCTGGG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=183,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:3,3:9,0,6,0
chr5	130788698	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:3,0,8,0
chr5	130808198	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=211,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,5,0
chr5	130808373	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=126,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.088:42:18,3:21,0:19,20,2,1
chr5	130831365	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=65.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,22:0.411:54:16,13:16,9:10,22,6,16
chr5	130939025	.	T	TA	.	.	DP=83;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,8:0.156:55:12,2:28,4:5,42,1,7
chr5	130982768	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=87,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.547:31:6,8:6,8:10,4,12,5
chr5	131006082	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=190,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:4,4:2,8:6,0,12,0
chr5	131006356	.	T	A	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=81.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,30:0.519:58:11,10:13,20:3,25,6,24
chr5	131006381	.	TA	T,TAA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,31,32;MFRL=187,184,184;MMQ=60,60,60;MPOS=18,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=8.36,5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,6,4:0.251,0.191:23:2,3,1:5,2,2:0,13,0,10
chr5	131014845	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.050:77:35,0:38,3:18,56,0,3
chr5	131066577	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.574:24:4,6:6,7:9,1,12,2
chr5	131322666	.	CCACACACTCACA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=215,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr5	131323807	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.112:25:9,2:11,0:9,14,0,2
chr5	131324250	.	C	CTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TG;STR;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,3:1,3:3,2,5,2
chr5	131325888	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=194,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,1,2
chr5	131326522	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.779:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	131347520	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr5	131396478	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:0,3,4,2
chr5	131534499	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,2,1
chr5	131546280	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr5	131553428	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=122,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:2,4:8,4:7,5,8,2
chr5	131607402	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.372:30:12,7:6,3:18,1,9,2
chr5	131630852	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,4:4,5:8,1,9,0
chr5	131658085	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,0,16
chr5	131671769	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr5	131719999	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=96.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,11:0,17:0,0,6,23
chr5	131720070	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=130,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr5	131721174	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.595:40:8,11:8,13:2,14,4,20
chr5	131721204	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,7:6,1:1,8,0,8
chr5	131728198	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,106;MMQ=60,33;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:15,0:23,4:18,21,0,4
chr5	131730052	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr5	131755477	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	131792639	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr5	131796163	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=202,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:3,2:3,1:6,0,2,2
chr5	131796573	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr5	131796609	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=126,237;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	131821520	.	GAC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=191,75;MMQ=54,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.543:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr5	131892979	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=72.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,8:0,0,21,1
chr5	131915213	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:7,4:4,6:3,8,4,6
chr5	131915848	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=184,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,0:0,8,0,2
chr5	131928692	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=216,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.430:3:2,1:0,0:0|1:131928692_A_T:131928692:0,2,0,1
chr5	131928694	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=216,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.430:3:1,1:0,0:0|1:131928692_A_T:131928692:0,2,0,1
chr5	131928699	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:131928692_A_T:131928692:0,1,0,1
chr5	131931550	.	A	ATTTAAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	131995843	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr5	132009710	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr5	132018132	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr5	132018169	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0,0,13,2
chr5	132036252	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=126.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,15:0,21:0,0,33,5
chr5	132042007	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,15:0,7:0,0,21,1
chr5	132042041	.	T	TA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:12,7:8,11:19,1,17,1
chr5	132044738	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr5	132046590	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=103.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,21:0,11:0,0,30,2
chr5	132069847	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,12:0,0,22,1
chr5	132070242	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr5	132099633	.	TTGG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	132161123	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	132198287	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	132224667	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=185,162;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:19,0,2,0
chr5	132232531	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:11,2:22,0:13,20,1,1
chr5	132234152	.	C	CG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	132234182	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	132334614	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:5,2:1,6,0,2
chr5	132342361	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:6,0,5,0
chr5	132388068	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:1,1,0,5
chr5	132403057	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,1:2,3:8,1,4,0
chr5	132403341	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=179,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,2:1,5:0,6,0,7
chr5	132409074	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,2:3,5:0,11,1,6
chr5	132409650	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=201,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,3:0,3:6,0,6,0
chr5	132409867	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,1:4,6:0,7,0,7
chr5	132412299	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,199;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,1:3,0,4,0
chr5	132428503	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.663:16:3,5:2,4:3,2,7,4
chr5	132437613	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=173,174;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=T;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:0,0:0,0:0,1,0,5
chr5	132561277	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr5	132569260	.	GCCT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=200,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,3:2,5:1,4,2,7
chr5	132652422	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:132652422_A_C:132652422:0,2,0,1
chr5	132652427	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:132652422_A_C:132652422:0,2,0,1
chr5	132652429	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:132652422_A_C:132652422:0,2,0,1
chr5	132652431	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=160,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:132652422_A_C:132652422:0,2,0,1
chr5	132652435	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:132652422_A_C:132652422:0,1,0,1
chr5	133316707	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:3,1:2,6,0,4
chr5	133326914	.	A	ACTC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=206,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,0:1,1:0|1:133326914_A_ACTC:133326914:0,1,0,1
chr5	133326917	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=206,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:133326914_A_ACTC:133326914:0,1,0,1
chr5	133450964	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,12;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.415:14:2,0:4,0:7,1,6,0
chr5	133478063	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	133481475	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=155,105;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:8,3:4,0:3,9,2,1
chr5	133481510	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:4,7,0,2
chr5	133536849	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,189;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,1:2,1:0,10,0,2
chr5	133537438	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	133537479	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	133561589	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr5	133655048	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,13;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,0:8,0:3,8,2,0
chr5	133657610	.	G	GA	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.322:34:13,0:9,11:2,21,4,7
chr5	133685845	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=196,178;MMQ=48,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,2:7,1:9,0,3,0
chr5	133685857	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=181,212;MMQ=55,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:12,0,2,0
chr5	133685868	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=178,187;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,3:8,0:13,0,3,0
chr5	133685871	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=178,212;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:7,0:13,0,2,0
chr5	133707164	.	T	TCGG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=206,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=CGG;STR;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:1,3:3,2:4,0,5,0
chr5	133707247	.	C	CT	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.143:37:14,1:14,3:29,3,5,0
chr5	133738481	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=183,219;MMQ=40,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:133738481_C_T:133738481:2,0,1,0
chr5	133738488	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=183,219;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:133738481_C_T:133738481:2,0,1,0
chr5	133745699	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=139,122;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:7,0:14,3:6,15,0,3
chr5	133896744	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=244,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr5	133898136	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=134,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.798:13:1,4:1,6:0,2,1,10
chr5	133900111	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:2,1:4,7:6,1,6,2
chr5	133902288	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=59,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,1,2
chr5	133902355	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	133909475	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,4:0,0,1,13
chr5	133944043	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=202,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr5	133996983	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=134,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:16,1:11,1:18,11,3,0
chr5	134010770	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,9:0.129:75:32,7:33,2:39,27,8,1
chr5	134011834	.	C	CT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=156,163;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.292:24:6,1:4,2:1,16,1,6
chr5	134033777	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,0,10
chr5	134099734	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,31963125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,1:8,1:4,16,0,2
chr5	134164284	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=230,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr5	134192096	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=174,150;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:18,0:14,2:0,34,0,2
chr5	134192112	.	CTT	C	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=184,140;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:17,0:11,2:0,28,0,2
chr5	134192113	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=188,181;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.171:27:14,2:9,2:0|1:134192113_T_C:134192113:0,23,0,4
chr5	134192117	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=177,181;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.166:28:12,1:10,2:0|1:134192113_T_C:134192113:0,24,0,4
chr5	134192123	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=188,161;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,1:7,1:0,19,0,4
chr5	134192215	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=226,217;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:2,1,3,1
chr5	134192330	.	CAAAT	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=125,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AAAT;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:3,2:6,1:9,0,3,0
chr5	134193595	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,2501;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:14,0:14,3:7,22,0,3
chr5	134194789	.	G	GA	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.147:45:12,1:12,2:10,29,2,4
chr5	134331921	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=146,67;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:2,1:6,3,1,1
chr5	134344497	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr5	134345062	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=115,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:2,3:4,0,4,3
chr5	134364406	.	TCCGCGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=148,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCGCGC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr5	134365091	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=163,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,0:7,3:0,10,0,3
chr5	134781992	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:3,2,5,0
chr5	134782013	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:3,2,5,1
chr5	134782450	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,4,13
chr5	134782472	.	G	GAT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=153,163;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,0:7,2:3,9,0,2
chr5	134914350	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,3,3
chr5	135170671	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,4:5,5:1,10,1,8
chr5	135178124	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr5	135186075	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	135188214	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,7:0,0,12,1
chr5	135207322	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,49;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:14,8,2,0
chr5	135272670	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=239,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	135276201	.	AGTT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=71.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.501:38:12,5:7,14:14,5,9,10
chr5	135276701	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=125,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=78.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,26:0.474:55:15,18:14,8:18,11,16,10
chr5	135277394	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr5	135383136	.	C	CGG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:2,2:1,0:0|1:135383136_C_CGG:135383136:0,3,1,1
chr5	135383137	.	A	AGCCAAGACTCGAGGTAG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:2,2:1,0:0|1:135383136_C_CGG:135383136:0,3,1,1
chr5	135496820	.	CA	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.344:21:6,5:7,1:0,14,1,6
chr5	135513085	.	T	TC	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=182.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,21:0,24:0,0,22,26
chr5	135567316	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=215,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:135567316_A_G:135567316:0,1,0,1
chr5	135567318	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=215,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:135567316_A_G:135567316:0,1,0,1
chr5	135567331	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:135567316_A_G:135567316:0,0,0,1
chr5	135610530	.	AAAAAC	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAC;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,1:9,1:0,13,0,2
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chr5	136315200	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	136320758	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr5	136476451	.	T	TGCTGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=165,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr5	136994047	.	T	TAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr5	136997776	.	AC	A	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=29,22;MFRL=200,161;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,0:0,3,0,4
chr5	136997805	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=36,34;MFRL=257,167;MMQ=60,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:0,1:2,0:0|1:136997805_GA_G:136997805:0,2,0,1
chr5	136997808	.	A	ATTATT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=257,167;MMQ=60,36;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:136997805_GA_G:136997805:0,2,0,1
chr5	136997809	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=257,167;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:136997805_GA_G:136997805:0,2,0,1
chr5	136997811	.	G	GTAAC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=257,167;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	136997816	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=247,167;MMQ=60,36;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr5	137027953	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr5	137034169	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=186,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.592:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr5	137241856	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,14,2
chr5	137243696	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	137257288	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,13,3
chr5	137259251	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr5	137259281	.	A	AAATGGACAAAAACTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=184,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr5	137281708	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr5	137282031	.	C	A,CA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=22,17,24;MFRL=186,155,183;MMQ=60,60,60;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.80,12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,6,7:0.170,0.345:23:4,0,4:1,1,0:0,10,0,13
chr5	137292052	.	AA	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=168,228;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,1,0
chr5	137292133	.	C	CA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=92.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,16:0,16:0,0,28,6
chr5	137295823	.	T	C	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=273.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,76:0.987:76:0,28:0,47:0,0,50,26
chr5	137323117	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=112.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,23:0,8:0,0,28,3
chr5	137342589	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	137347403	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=251,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.899:18:1,8:0,6:1,0,17,0
chr5	137354554	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.182:14:5,0:7,2:12,0,2,0
chr5	137354851	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,2,16
chr5	137420376	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	137464887	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=103,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr5	137485292	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,15,1
chr5	137493037	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=253,85;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	137498740	.	A	AGGAAGAAAGAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.811:8:0,4:1,2:1,0,6,1
chr5	137500665	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,26:0.438:60:15,15:17,11:14,20,6,20
chr5	137500734	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:6,2:17,0:8,15,0,2
chr5	137501415	.	CAAA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=118,222;MMQ=40,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	137501433	.	AGC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=97,118;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:137501433_AGC_A:137501433:3,1,1,0
chr5	137501436	.	A	ACCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=0,118;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:0|1:137501433_AGC_A:137501433:3,2,1,0
chr5	137506434	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	137507104	.	TAA	T,TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=131,137,65;MMQ=60,60,60;MPOS=24,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=7.29,8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,4:0.336,0.434:9:1,0,1:1,3,2:0,2,2,5
chr5	137513368	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=104,66;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.422:5:3,0:0,1:0|1:137513368_A_AT:137513368:2,1,0,2
chr5	137513369	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=52,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.603:5:2,1:0,2:0|1:137513368_A_AT:137513368:2,0,0,3
chr5	137514374	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=164,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,2:3,8:2,6,1,10
chr5	137524834	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.070:40:19,0:18,2:6,32,1,1
chr5	137589876	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=97,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.318:10:3,0:1,3:4,3,0,3
chr5	137593489	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:15,5,2,0
chr5	137626513	.	GCA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=162,152;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:137626513_GCA_G:137626513:0,2,0,1
chr5	137626518	.	T	TGC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,152;MMQ=60,59;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:137626513_GCA_G:137626513:0,2,0,1
chr5	137626528	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,33;MFRL=162,152;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:137626513_GCA_G:137626513:0,2,0,1
chr5	137665405	.	T	TGG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,26;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:137665405_T_TGG:137665405:0,2,0,1
chr5	137665406	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:137665405_T_TGG:137665405:0,2,0,1
chr5	137665418	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137665418_T_TG:137665418:0,0,0,1
chr5	137665420	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:137665418_T_TG:137665418:0,0,0,1
chr5	137665424	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=208,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:137665418_T_TG:137665418:0,1,0,1
chr5	137665427	.	TT	AG	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=24,30;MFRL=208,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137665418_T_TG:137665418:0,1,0,1
chr5	137665433	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=204,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:137665418_T_TG:137665418:0,2,0,1
chr5	137682714	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr5	137708434	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,22:0.546:40:8,10:10,11:11,7,17,5
chr5	137728774	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr5	137729134	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,6:1,3:0,4,0,10
chr5	137735754	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,0,13
chr5	137760083	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,0:4,3:0,6,0,4
chr5	137780347	.	G	GCAGGCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=226,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr5	137780368	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,3,2
chr5	137780631	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	137802404	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.608:24:4,7:5,5:7,2,14,1
chr5	137844274	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=122,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:2,0,4,0
chr5	137846155	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr5	137847082	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,31;MFRL=201,235;MMQ=40,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:0,6:1,4:1,0,9,1
chr5	137847084	.	CACACACAT	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=187,190;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.219:12:3,1:2,1:10,0,2,0
chr5	137847086	.	CACACAT	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=150,230;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:3,2:1,2:7,0,4,0
chr5	137847092	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=88,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:2,6:1,3:3,0,8,1
chr5	137848707	.	AAAAAT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAAT;STR;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.731:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr5	137893017	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.444:34:9,7:10,8:18,1,15,0
chr5	137897174	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr5	137902868	.	GA	G,GAA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33,34;MFRL=159,171,148;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=19.29,6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,9,5:0.360,0.205:25:3,7,2:6,2,3:0,11,3,11
chr5	137903084	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=132,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:5,7:1,8:6,0,14,1
chr5	137906816	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,4:7,5:4,8,5,4
chr5	137909674	.	GAGA	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=50.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.429:33:8,7:8,7:17,2,12,2
chr5	138208839	.	T	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,6:0.105:51:19,1:18,2:0|1:138208839_T_G:138208839:9,36,6,0
chr5	138208842	.	G	T	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,5:0.084:51:20,0:19,0:0|1:138208839_T_G:138208839:9,37,5,0
chr5	138643062	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr5	138658539	.	C	T	.	.	DP=122;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,77;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:112,5:0.049:117:59,5:52,0:58,54,4,1
chr5	138704323	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=151,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,2:5,0:9,1,2,0
chr5	138718825	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=176,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr5	138724126	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=30.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr5	138725611	.	G	GTAGCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138725611_G_GTAGCC:138725611:0,0,0,1
chr5	138725613	.	T	TCAATCTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138725611_G_GTAGCC:138725611:0,0,0,1
chr5	138725614	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138725611_G_GTAGCC:138725611:0,0,0,1
chr5	138725619	.	GA	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:138725611_G_GTAGCC:138725611:0,0,0,1
chr5	138755989	.	TATC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=ATC;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	138775166	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,11;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.111:29:13,0:12,1:0,26,0,3
chr5	138775173	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.459:24:6,4:6,5:0,13,1,10
chr5	138837504	.	TTC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:138837504_TTC_T:138837504:0,4,0,1
chr5	138837508	.	C	CTTACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:138837504_TTC_T:138837504:0,4,0,1
chr5	138858192	.	CCAG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=189,238;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	138861370	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	139201548	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=115,57;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:8,0:6,2:7,8,2,0
chr5	139213452	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr5	139215386	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=197,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:3,1,3,2
chr5	139216901	.	A	AG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=71.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,1,20
chr5	139227629	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:1,1,0,3
chr5	139231494	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=293,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	139251469	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,5:3,1:0,4,0,6
chr5	139260428	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:7,8:2,5:7,2,11,2
chr5	139494846	.	TA	T,TAA	.	.	DP=141;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=134,109,119;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=23.69,6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:71,23,12:0.193,0.094:106:31,13,7:37,10,4:47,24,26,9
chr5	139494992	.	CA	C	.	.	DP=130;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,4:0.045:108:50,2:51,1:23,81,1,3
chr5	139740109	.	C	CACGGTGAAGTGCTCCACTT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	139745732	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=121,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,1:5,1:7,8,1,1
chr5	139745804	.	CC	GG	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=134,86;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:12,2:2,0:0|1:139745804_CC_GG:139745804:4,11,0,2
chr5	139745808	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=137,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:12,2:1,0:0|1:139745804_CC_GG:139745804:4,10,0,2
chr5	139745810	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=137,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:13,2:1,0:0|1:139745804_CC_GG:139745804:4,10,0,2
chr5	139745815	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=121,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:12,2:1,0:4,9,0,3
chr5	139747547	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=209,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:139747547_G_T:139747547:0,4,0,1
chr5	139747549	.	CA	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=209,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:139747547_G_T:139747547:0,4,0,1
chr5	139817996	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=136,145,186;MMQ=60,60,60;MPOS=15,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=5.02,4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,3,2:0.190,0.142:18:7,3,2:5,0,0:10,3,5,0
chr5	139907748	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.404:7:2,0:2,0:2,2,2,1
chr5	139921961	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=137,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr5	139930262	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:20,2:20,1:28,12,3,0
chr5	139931628	.	A	AGT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,16:0.586:27:7,8:4,7:0|1:139931628_A_AGT:139931628:6,5,5,11
chr5	139931629	.	C	CG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,16:0.586:27:6,9:4,7:0|1:139931628_A_AGT:139931628:6,5,5,11
chr5	139931776	.	AGG	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=152,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,1:6,1:0|1:139931776_AGG_A:139931776:3,7,0,2
chr5	139931779	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=152,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0|1:139931776_AGG_A:139931776:3,7,0,2
chr5	139936980	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,7:0,0:0,0,4,3
chr5	139940026	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=133,97;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:20,3:19,0:0|1:139940026_C_A:139940026:20,21,3,0
chr5	139940033	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=133,97;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.081:47:23,3:19,0:0|1:139940026_C_A:139940026:22,22,3,0
chr5	139941318	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=89.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,10:0,0,17,9
chr5	139943422	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,52;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,0:11,2:6,9,0,2
chr5	140021858	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=90,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:2,3:4,4:4,2,6,2
chr5	140022436	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:6,4:1,0:6,1,5,0
chr5	140023818	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.527:21:5,7:4,4:0,10,1,10
chr5	140024491	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,1:1,1,3,0
chr5	140027216	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=83,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:0,2:2,0:1,1,1,2
chr5	140033991	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:2,4:8,1:9,1,4,1
chr5	140035656	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:140035656_T_TC:140035656:0,0,0,1
chr5	140035658	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:140035656_T_TC:140035656:0,0,0,1
chr5	140037272	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.464:13:4,1:3,5:0,7,2,4
chr5	140048209	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.516:29:6,4:8,11:8,6,12,3
chr5	140050907	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=140,114;MMQ=50,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,2:0.038:77:38,1:26,1:0|1:140050907_C_T:140050907:40,35,2,0
chr5	140050926	.	G	A	.	.	DP=91;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=149,125;MMQ=49,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,8:0.100:87:42,4:31,4:0|1:140050907_C_T:140050907:42,37,7,1
chr5	140050940	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=148,139;MMQ=44,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:93,5:0.058:98:53,2:39,3:1|0:140050907_C_T:140050907:51,42,3,2
chr5	140051240	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,121;MMQ=57,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:12,2:8,15,1,1
chr5	140051983	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=253,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr5	140054257	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=54.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.760:23:3,14:2,4:1,4,13,5
chr5	140059565	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:140059565_T_TTG:140059565:0,0,0,1
chr5	140059567	.	TCC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:140059565_T_TTG:140059565:0,0,0,1
chr5	140073883	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.344:30:12,5:8,5:8,12,3,7
chr5	140075011	.	C	CAGTTGATAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=192,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,2:4,6:7,0,8,0
chr5	140077699	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=87.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,17:0,0,2,22
chr5	140081791	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:0,5,1,6
chr5	140175932	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,34:0.573:59:8,17:17,16:16,9,17,17
chr5	140180737	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr5	140181094	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,134;MMQ=54,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.317:23:10,2:6,5:9,7,5,2
chr5	140181645	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:7,3:8,8,0,3
chr5	140183296	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=293,225;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	140183325	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	140201264	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=204,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr5	140201420	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=198,199;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:8,1:3,6:7,5,6,1
chr5	140220910	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=111,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:9,4:10,6:14,5,5,5
chr5	140232167	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.443:18:3,3:6,4:7,3,8,0
chr5	140232470	.	AT	A	.	.	DP=66;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.131:51:22,3:16,3:12,32,1,6
chr5	140232485	.	T	A	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=166,166;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.059:48:27,0:16,2:0|1:140232485_T_A:140232485:9,37,0,2
chr5	140232487	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=166,166;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,2:0.060:48:29,0:16,1:0|1:140232485_T_A:140232485:9,37,0,2
chr5	140232524	.	TG	CA	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=160,121;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:11,2:5,0:0|1:140232524_TG_CA:140232524:0,17,0,2
chr5	140232526	.	CC	TG	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,3:6,0:0,15,0,3
chr5	140232527	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=162,121;MMQ=60,42;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:7,2:6,0:0|1:140232524_TG_CA:140232524:0,16,0,2
chr5	140235663	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=79.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,31:0.473:65:13,18:21,10:15,19,13,18
chr5	140264010	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:5,10:10,8:10,5,14,4
chr5	140306793	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,3:8,0:10,8,3,0
chr5	140475803	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,186;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:6,3,1,1
chr5	140480708	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=154,108;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:0|1:140480708_G_T:140480708:3,5,0,2
chr5	140480711	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=168,108;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:6,0:2,2:0|1:140480708_G_T:140480708:3,6,0,2
chr5	140480716	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=154,108;MMQ=60,55;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.253:10:6,0:1,2:0|1:140480708_G_T:140480708:3,5,0,2
chr5	140532478	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=110,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.275:12:4,0:3,2:7,2,0,3
chr5	140532488	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=134,144;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.243:19:6,1:5,3:10,5,2,2
chr5	140532641	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=126,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=87.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,30:0.608:49:5,14:14,16:8,11,13,17
chr5	140532871	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=201,227;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr5	140554189	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=106,177;MMQ=36,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:3,3,2,0
chr5	140559035	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=175,165;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:18,1:14,3:16,17,4,0
chr5	140559319	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=183,172;MMQ=40,32;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.265:17:6,3:5,1:0,13,0,4
chr5	140559320	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=178,188;MMQ=40,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,2:6,1:0,13,0,3
chr5	140559532	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=202,205;MMQ=22,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,1,0
chr5	140565046	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=159,90;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr5	140567191	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,201;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:2,3:2,3:5,0,6,0
chr5	140568026	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:3,2:5,4:0|1:140568026_T_C:140568026:6,2,6,0
chr5	140568034	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=55.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0|1:140568026_T_C:140568026:0,0,13,1
chr5	140569353	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	140573439	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=142,149;MMQ=45,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:9,4:8,1:0|1:140573439_G_C:140573439:3,15,1,5
chr5	140573442	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=142,149;MMQ=45,40;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:9,4:8,2:0|1:140573439_G_C:140573439:3,15,1,5
chr5	140573844	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=217,184;MMQ=26,37;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr5	140590445	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	140591702	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.462:37:13,7:7,9:4,16,5,12
chr5	140597483	.	G	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=119,3628;MMQ=60,27;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.152:44:18,0:20,6:25,13,6,0
chr5	140627129	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=167,206;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	140682757	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,116;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:6,11:8,6:7,7,11,6
chr5	140699679	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:6,8:4,10:7,3,9,9
chr5	140710705	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,4,3
chr5	140720954	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.456:44:16,13:8,7:10,14,4,16
chr5	140737183	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:7,3:13,3:4,16,0,6
chr5	140742226	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=236,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	140745166	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	140745340	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=100,102;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:5,9,0,2
chr5	140750044	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,16,5
chr5	140754749	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=175,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,1:11,1:7,13,1,1
chr5	140765000	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=216,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,2,3
chr5	140772898	.	GC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=123,183;MMQ=56,56;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.411:20:6,6:6,2:7,5,2,6
chr5	140773738	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=112,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.516:31:8,4:6,11:9,6,7,9
chr5	140774363	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=165,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:11,0:9,15,0,2
chr5	140774940	.	G	GGAACCCACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:140774940_G_GGAACCCACA:140774940:0,3,0,1
chr5	140774941	.	T	TAGATGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:140774940_G_GGAACCCACA:140774940:0,3,0,1
chr5	140774980	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	140778530	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,0:2,4:5,4,0,4
chr5	140782755	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,2:7,1:6,7,2,1
chr5	140784427	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.402:18:6,6:4,1:6,5,5,2
chr5	140785080	.	AAA	GGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:140785080_AAA_GGG:140785080:0,0,0,1
chr5	140785089	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:140785080_AAA_GGG:140785080:0,0,0,1
chr5	140789281	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,2:13,0:11,13,2,0
chr5	140797339	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	140803317	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=G;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.511:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr5	140811464	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=105,231;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:5,1:8,2:8,6,1,2
chr5	140812775	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.257:13:6,2:4,1:2,8,1,2
chr5	140812885	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=220,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140812885_G_C:140812885:0,1,0,1
chr5	140812887	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=220,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140812885_G_C:140812885:0,1,0,1
chr5	140857395	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=161,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:3,2:0|1:140857395_G_A:140857395:7,1,1,1
chr5	140857402	.	T	TGGAGTCC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=159,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:140857395_G_A:140857395:8,1,1,1
chr5	140857974	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:3,3,2,0
chr5	140858245	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:5,3:5,8:3,8,2,9
chr5	140890770	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:9,2:4,5:1,12,1,6
chr5	140907266	.	T	TAAAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=15,0;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=23,28;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr5	140915744	.	C	CATGCTCAGCTAATTTTTTATTATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=0,215;MMQ=56,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	140955777	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=138,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,23:0.411:56:18,11:15,11:24,9,17,6
chr5	140957189	.	A	AAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AT;STR;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:1,3:3,2:0,6,0,5
chr5	141005943	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=273,271;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141005943_T_TA:141005943:0,1,0,1
chr5	141005945	.	T	TACACTATTGTGAACCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=273,271;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141005943_T_TA:141005943:0,1,0,1
chr5	141016276	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=149.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,41:0.955:42:0,16:1,24:0|1:141016276_T_C:141016276:1,0,26,15
chr5	141016288	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,14:0.358:40:7,8:18,6:0|1:141016276_T_C:141016276:17,9,9,5
chr5	141018454	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,27:0.528:51:13,16:11,11:8,16,10,17
chr5	141019569	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.590:25:4,7:6,7:1,9,3,12
chr5	141033555	.	A	AGTGGTGAACTAC	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=119,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:5,2:14,0:10,19,1,1
chr5	141033567	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=117,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.200:22:4,0:6,3:9,9,0,4
chr5	141034001	.	G	GTTTTTTATTAAAAT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=230,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:141034001_G_GTTTTTTATTAAAAT:141034001:0,4,0,1
chr5	141034002	.	G	GTTGTGTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=230,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:141034001_G_GTTTTTTATTAAAAT:141034001:0,4,0,1
chr5	141049509	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,18;MFRL=128,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.146:38:14,2:11,1:21,11,0,6
chr5	141304314	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=180,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.658:8:1,2:2,1:0,3,1,4
chr5	141304345	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=180,170;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	141313727	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:12,3:6,0:18,1,3,0
chr5	141324955	.	C	CCTGCTGCTG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,9;RU=CTG;STR;TLOD=30.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.531:15:3,3:3,5:6,1,6,2
chr5	141329183	.	C	CCCCCTGGAGTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:6,2:10,0:0,16,0,2
chr5	141335674	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:3,1,7,2
chr5	141336264	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,3:5,4:5,4,4,3
chr5	141363166	.	TATG	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.420:29:7,4:9,8:1,16,1,11
chr5	141364511	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=128.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,14:0,24:0,0,10,28
chr5	141367202	.	GA	TT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,6:1,4:4,0,10,0
chr5	141382584	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr5	141387336	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,4,1
chr5	141387520	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	141511525	.	TA	T	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.215:42:11,4:22,5:1,32,2,7
chr5	141511561	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.575:40:7,10:9,13:0,17,1,22
chr5	141694649	.	C	CAGTTAATAAGGTATCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=226,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	142259083	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,3:4,6:1,8,0,9
chr5	142288318	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:8,0,4,0
chr5	142288527	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=143,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:0,8,0,6
chr5	142311509	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr5	142393562	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr5	142435748	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr5	142586694	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:4,7:6,6:7,3,11,2
chr5	142680344	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,8:0,0,2,17
chr5	143853684	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=22,16;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:0,0:0|1:143853684_G_T:143853684:0,2,0,1
chr5	143853687	.	G	GTAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,14;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:1,0:0|1:143853684_G_T:143853684:0,2,0,1
chr5	143853688	.	G	GACATTATCCTCAGCAAACTA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0|1:143853684_G_T:143853684:0,2,0,1
chr5	143853690	.	GG	CA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,1:1,0:0|1:143853684_G_T:143853684:0,2,0,1
chr5	143853693	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:0,1:1,0:0|1:143853684_G_T:143853684:0,2,0,1
chr5	143853698	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=218,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.489:2:0,1:1,0:0|1:143853684_G_T:143853684:0,1,0,1
chr5	145144419	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,11,2
chr5	145197411	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr5	145199430	.	AG	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=95.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,22,3
chr5	145199686	.	GTTTTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=114,208;MMQ=47,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,7;RU=T;STR;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.801:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr5	145239406	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,2:14,0:0|1:145239406_C_T:145239406:15,14,2,0
chr5	145239414	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,2:15,0:0|1:145239406_C_T:145239406:14,13,2,0
chr5	145252574	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:2,4:1,4:1,3,0,8
chr5	145427527	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	145439880	.	A	ATGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	145465225	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:145465225_A_T:145465225:0,1,0,1
chr5	145465227	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:145465225_A_T:145465225:0,1,0,1
chr5	145483679	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=209,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr5	145483713	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=188,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr5	145502161	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:9,2:7,5:4,12,1,6
chr5	145508340	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.549:27:3,6:9,8:1,11,4,11
chr5	145508457	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:145508457_T_C:145508457:1,0,3,0
chr5	145508471	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0|1:145508457_T_C:145508457:1,0,3,0
chr5	145508688	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,2:5,5:2,10,0,7
chr5	145509573	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,23:0.535:43:10,14:9,9:13,7,19,4
chr5	145512367	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=273,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr5	145512378	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=128,273;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0|1:145512378_AAG_A:145512378:3,0,1,0
chr5	145512390	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,1:0,2:0|1:145512378_AAG_A:145512378:4,0,3,0
chr5	145522912	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr5	145532859	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=243,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:0|1:145532859_T_C:145532859:0,1,0,8
chr5	145532876	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=243,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0|1:145532859_T_C:145532859:0,1,0,6
chr5	145533214	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,46;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:15,1,2,0
chr5	145533418	.	T	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,22:0.451:49:10,9:17,13:15,12,11,11
chr5	145538924	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=126,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=51.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:10,9:6,8:14,2,16,1
chr5	145539123	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=200,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,5:2,3:0,4,0,8
chr5	145562143	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:4,6:3,9:0,7,1,14
chr5	145637995	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.461:22:5,3:7,6:10,2,10,0
chr5	145640215	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=137,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:4,0,6,0
chr5	145643048	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=113,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:1,7:10,3:8,3,6,4
chr5	145647199	.	C	A,G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=18,10,19;MFRL=159,155,154;MMQ=60,60,60;MPOS=19,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.63,9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:33,17,7:0.264,0.142:57:8,0,1:5,0,2:26,7,24,0
chr5	145650704	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=166,177;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:0|1:145650704_C_T:145650704:0,19,0,2
chr5	145650712	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=166,172;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.219:21:9,1:7,3:0|1:145650704_C_T:145650704:0,17,0,4
chr5	145838440	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,22:0.403:55:18,12:15,10:20,13,15,7
chr5	145848074	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=164,146;MMQ=60,28;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.209:17:5,0:8,3:0|1:145848074_A_T:145848074:0,14,0,3
chr5	145848082	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=164,146;MMQ=60,28;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:4,0:7,1:0|1:145848074_A_T:145848074:0,14,0,3
chr5	145848083	.	T	TTTATTTTTTTATTTTTTTTA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=170,146;MMQ=60,28;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:4,0:8,1:0|1:145848074_A_T:145848074:0,13,0,3
chr5	145851157	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=123,136;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.314:38:12,0:8,1:14,12,0,12
chr5	145851160	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=129,126;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.223:37:13,2:7,0:14,15,0,8
chr5	145851163	.	A	AT	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=130,130;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.177:39:18,4:9,0:13,19,0,7
chr5	145888687	.	CT	C,CTT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,34,34;MFRL=159,167,163;MMQ=60,60,60;MPOS=21,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.25,5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,3,4:0.154,0.180:23:6,2,2:9,1,1:15,1,5,2
chr5	145888700	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.149:30:10,1:9,0:21,5,3,1
chr5	145890167	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=151,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.277:23:10,3:6,3:5,12,2,4
chr5	145972646	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=120,46;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:145972646_GA_G:145972646:2,9,1,1
chr5	145972649	.	GGTC	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=120,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:7,2:0|1:145972646_GA_G:145972646:2,9,1,1
chr5	145972656	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=120,46;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0|1:145972646_GA_G:145972646:1,8,1,1
chr5	145972660	.	AT	TG	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=120,46;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:6,2:0|1:145972646_GA_G:145972646:1,8,1,1
chr5	146030055	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr5	146435163	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr5	146659014	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=10,36;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr5	146728149	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=123,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,0:4,4:5,1,3,1
chr5	146793337	.	GT	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=13,29;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr5	146991976	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:146991976_T_C:146991976:0,2,0,1
chr5	146991981	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:146991976_T_C:146991976:0,2,0,1
chr5	147012186	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=114,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.606:13:4,2:0,5:5,0,8,0
chr5	147012291	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,35:0.734:47:5,21:7,13:0|1:147012291_G_A:147012291:6,6,14,21
chr5	147012297	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=131,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:35,11:0.245:46:20,3:14,7:1|0:147012291_G_A:147012291:12,23,6,5
chr5	147016712	.	AAGAATTTTCTATG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=255,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr5	147019114	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=68,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,2,1
chr5	147019335	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=216,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.655:9:1,1:2,5:0,3,0,6
chr5	147020419	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:0,4,1,4
chr5	147020443	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr5	147444785	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=179,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:147444785_A_G:147444785:1,0,1,0
chr5	147444792	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=179,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:147444785_A_G:147444785:1,0,1,0
chr5	147444989	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=164,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,19:0.644:29:7,8:3,11:0|1:147444989_G_A:147444989:3,7,8,11
chr5	147445023	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0|1:147444989_G_A:147444989:0,5,0,5
chr5	147449855	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=85.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,30:0.431:70:22,15:17,15:32,8,26,4
chr5	147450085	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=208,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,1:2,6:1,4,0,7
chr5	147468234	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:0,5,0,4
chr5	147468971	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:4,5:4,4:8,0,11,0
chr5	147475488	.	A	G	.	.	DP=96;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=74.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,31:0.373:83:26,9:24,19:23,29,4,27
chr5	147475513	.	G	GT	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:10,7:4,11:2,12,1,17
chr5	147478785	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.525:36:9,8:8,11:12,5,10,9
chr5	147478981	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	147479991	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=131,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr5	147480007	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.373:9:2,1:2,2:6,0,2,1
chr5	147480027	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,1:4,2:8,0,2,1
chr5	147480868	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=102,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,22:0.561:39:6,9:11,13:14,3,13,9
chr5	147480955	.	A	G	.	.	DP=62;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,28:0.476:59:10,12:21,16:16,15,13,15
chr5	147481018	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=115,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=72.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,29:0.428:68:19,16:19,12:16,23,7,22
chr5	147484465	.	GAA	G,GA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,33,34;MFRL=180,147,172;MMQ=60,60,60;MPOS=12,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=4.20,30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,3,14:0.110,0.464:30:6,3,4:6,0,10:13,0,17,0
chr5	147491532	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr5	147493871	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	147497932	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:0,1,4,1
chr5	147498523	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=107,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:5,6:1,4:5,1,9,1
chr5	147498652	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.522:25:6,9:5,4:6,6,4,9
chr5	147498669	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:8,6:6,4:0|1:147498669_G_A:147498669:5,9,0,10
chr5	147498672	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:7,6:6,4:0|1:147498669_G_A:147498669:5,9,0,10
chr5	147504305	.	C	CT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.492:28:10,6:3,5:0|1:147504305_C_CT:147504305:14,0,14,0
chr5	147504315	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,14:0.476:29:11,9:4,5:0|1:147504305_C_CT:147504305:15,0,14,0
chr5	147505227	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:6,7:9,6:11,5,6,7
chr5	147510776	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=121,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,7:1,1:3,0,6,2
chr5	147511018	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:147511018_TA_T:147511018:0,0,0,1
chr5	147511020	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:147511018_TA_T:147511018:0,0,0,1
chr5	147511021	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:147511018_TA_T:147511018:0,0,0,1
chr5	147516470	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:1,7:9,7:9,1,14,0
chr5	147554997	.	TTTTTTCC	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=217.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,27:0,24:0,0,21,30
chr5	147555029	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=100.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,15:0,0,2,27
chr5	147693829	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=130,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,3:5,6:0,7,3,6
chr5	147781995	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=150,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:15,2:16,0:9,23,1,1
chr5	147785802	.	AT	A,ATT	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=139,164,127;MMQ=60,60,60;MPOS=18,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=13.32,5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,12,8:0.188,0.134:56:19,9,5:13,3,1:29,7,19,1
chr5	147795594	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=155,219;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:17,0:16,4:12,23,0,4
chr5	147795697	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=139,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,0:0,0:0,1,0,4
chr5	147818144	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=330,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:147818144_G_T:147818144:0,1,0,1
chr5	147818146	.	T	TGTTTTCTCTTTGTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=330,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:147818144_G_T:147818144:0,1,0,1
chr5	147902972	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=68,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.404:10:4,1:2,2:0|1:147902972_G_A:147902972:3,3,2,2
chr5	147902980	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=121,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:147902972_G_A:147902972:2,2,0,1
chr5	147902982	.	G	GCGGATATCTGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=121,228;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1|0:147902972_G_A:147902972:2,2,0,1
chr5	147928130	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr5	148206348	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	148206375	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,2:0,0,13,0
chr5	148207264	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:17,2:12,1:16,14,1,2
chr5	148207633	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,23:0.670:34:6,15:4,6:2,9,7,16
chr5	148207667	.	C	CCG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.663:21:1,6:6,7:0,7,0,14
chr5	148386525	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,29:0.651:44:6,11:9,18:10,5,11,18
chr5	148386561	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=148,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:17,0:18,3:15,20,0,3
chr5	148389763	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:4,1:7,3:9,2,3,1
chr5	148406386	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=206,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:3,2,4,2
chr5	148521717	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=113,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.280:14:4,2:6,0:0|1:148521717_C_G:148521717:7,3,0,4
chr5	148521720	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=117,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.304:11:1,0:6,0:0|1:148521717_C_G:148521717:7,1,0,3
chr5	148521799	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr5	148580025	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,9:0,5:0,0,1,13
chr5	148682188	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	148689735	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr5	148725199	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=201.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,24:0,32:0,0,23,37
chr5	148725225	.	G	GC	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=57.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.467:41:8,9:10,8:2,20,7,12
chr5	148745674	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,1:7,1:0,8,1,1
chr5	148748249	.	C	CTGTCCAAGGGAGTGGTCACAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	148758695	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.487:35:8,7:9,10:13,5,14,3
chr5	148876440	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:0|1:148876440_AC_A:148876440:1,9,0,2
chr5	148876447	.	AAAAGTT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=158,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:148876440_AC_A:148876440:1,8,0,2
chr5	148889428	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:13,2:16,0:20,10,2,0
chr5	148897467	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,3:10,0:2,17,0,3
chr5	148977613	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:0,6,0,4
chr5	148989312	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0|1:148989312_A_G:148989312:0,2,0,3
chr5	148989320	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0|1:148989312_A_G:148989312:0,2,0,4
chr5	148997686	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=127.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,18:0,23:0,0,34,8
chr5	148997880	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:9,0:9,2:2,17,0,2
chr5	149006837	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr5	149112300	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=150,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,18:0.413:44:9,8:17,10:18,8,13,5
chr5	149112312	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.055:52:23,0:24,1:0|1:149112312_T_G:149112312:32,18,2,0
chr5	149112317	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,2:0.054:53:26,0:25,2:0|1:149112312_T_G:149112312:31,20,2,0
chr5	149200205	.	C	CTCCCTGCTTCTGAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=82,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	149206219	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.162:30:11,4:13,0:20,6,4,0
chr5	149212469	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:12,10,1,1
chr5	149221892	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,19:0.540:35:11,8:5,11:12,4,11,8
chr5	149247403	.	C	CCTTTGACTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=144,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	149247419	.	C	CTTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	149263091	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:11,0:7,2:6,13,1,1
chr5	149264028	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=132,114;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.237:40:16,7:15,2:19,12,4,5
chr5	149276373	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr5	149283378	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:149283378_A_AT:149283378:0,3,0,1
chr5	149283381	.	A	ATTCG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:149283378_A_AT:149283378:0,3,0,1
chr5	149294670	.	TCACTGCAA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,32;MFRL=275,245;MMQ=57,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0|1:149294670_TCACTGCAA_T:149294670:0,1,0,1
chr5	149294684	.	AT	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=275,245;MMQ=57,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:149294670_TCACTGCAA_T:149294670:0,1,0,1
chr5	149313685	.	A	ATGGAAATGGGGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=224,210;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	149384610	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=200,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,5:1,1:0,6,0,6
chr5	149427387	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	149439466	.	GCTCCCCT	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149439466_GCTCCCCT_G:149439466:0,0,0,1
chr5	149439475	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:149439466_GCTCCCCT_G:149439466:0,0,0,1
chr5	149440995	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=195,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0|1:149440995_A_AC:149440995:1,0,1,0
chr5	149440996	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,12;MFRL=195,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:1,0:0,0:0|1:149440995_A_AC:149440995:1,0,1,0
chr5	149495253	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	149495274	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=234,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:149495274_T_G:149495274:1,1,0,1
chr5	149495278	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=21,12;MFRL=234,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:149495274_T_G:149495274:1,1,0,1
chr5	149495287	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=176,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr5	149497099	.	GCGCGCGCGCACACACACA	G,GCACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28,28;MFRL=191,141,207;MMQ=60,40,51;MPOS=24,33;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.34,5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,3:0.266,0.521:5:1,1,2:0,0,1:1,0,4,0
chr5	149497177	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=60,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:4,2,5,1
chr5	149513072	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr5	149546426	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr5	149574512	.	G	GACAGGCTGCCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=149,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.244:10:3,1:5,1:0|1:149574512_G_GACAGGCTGCCA:149574512:0,8,1,1
chr5	149574516	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=149,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,1:4,1:0|1:149574512_G_GACAGGCTGCCA:149574512:0,8,1,1
chr5	149576233	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr5	149576273	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr5	149576528	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=197,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:1,1:4,0:0|1:149576528_C_T:149576528:1,4,0,2
chr5	149576538	.	A	AAAGAAGGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=197,258;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:149576528_C_T:149576528:1,2,0,1
chr5	149576553	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=143,253;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:149576553_CG_C:149576553:2,1,0,1
chr5	149576555	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=143,253;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:149576553_CG_C:149576553:2,1,0,1
chr5	149576559	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=143,253;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:149576553_CG_C:149576553:2,1,0,1
chr5	149578999	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr5	149580819	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr5	149582103	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,6:0,0,5,9
chr5	149584341	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,10,1
chr5	149584969	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	149584981	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	149602222	.	GAC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr5	149602425	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	149602824	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=68,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr5	149610967	.	AAAT	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=183,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AAT;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr5	149624901	.	G	GCCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=CCT;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.710:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	149627423	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=157,88;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0,3,2,2
chr5	149627472	.	C	CCACCGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=175,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	149627492	.	G	GGACCACACCGATCAAACCTTATGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	149629683	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	149631413	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=63.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,7,11
chr5	149632955	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,8:3,0:5,1,7,1
chr5	149636073	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	149636109	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr5	149676889	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=126,142;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:17,1:12,1:19,11,0,2
chr5	149737221	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	149759356	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=141,177;MMQ=60,46;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:7,2:1,17,0,2
chr5	149759384	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=158,160;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:8,1:5,3:0,13,0,4
chr5	149772207	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	149776232	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.409:42:9,9:14,8:15,10,10,7
chr5	149784565	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.587:3:0,1:1,0:0|1:149784565_AG_CC:149784565:1,0,2,0
chr5	149784570	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,0:1,0:0|1:149784570_A_C:149784570:1,0,2,0
chr5	149784574	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,0:1,0:0|1:149784565_AG_CC:149784565:1,0,2,0
chr5	149784576	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,14;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.792:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr5	149784581	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=21,12;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,0:0,0:0|1:149784570_A_C:149784570:2,0,2,0
chr5	149823785	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	149826572	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	149827098	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=180,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=205.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,68:0.972:69:1,35:0,29:1,0,51,17
chr5	149907742	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,2:8,0:13,3,2,0
chr5	149914401	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=179,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:5,1:3,5:6,2,6,1
chr5	149914631	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	149918777	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=123,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.339:12:2,1:4,0:2,6,4,0
chr5	149932683	.	AT	GG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=152,165;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:149932683_AT_GG:149932683:3,0,1,0
chr5	149932693	.	GTG	ACA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=174,165;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:149932683_AT_GG:149932683:4,0,1,0
chr5	149932698	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=174,165;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:149932683_AT_GG:149932683:4,0,1,0
chr5	150027538	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:10,8,1,1
chr5	150028109	.	C	CGA	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=110,128;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:24,3:18,0:0|1:150028109_C_CGA:150028109:22,20,2,1
chr5	150028111	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=110,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:24,1:18,0:0|1:150028109_C_CGA:150028109:22,20,2,1
chr5	150031682	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:11,1:3,1:5,9,1,1
chr5	150051246	.	CT	GG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,13;MFRL=137,192;MMQ=60,58;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:5,0:3,8,0,2
chr5	150072693	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=202,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,5:1,4:3,1,5,4
chr5	150080118	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=188,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.234:11:3,2:3,0:0,9,1,1
chr5	150090866	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:10,5:7,12:5,12,3,14
chr5	150110397	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	150110756	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,2:6,0:0|1:150110756_G_C:150110756:0,17,0,2
chr5	150110758	.	GT	AA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:150110756_G_C:150110756:0,17,0,2
chr5	150135952	.	GA	G,GAA	.	.	DP=88;ECNT=1;MBQ=33,33,35;MFRL=142,172,78;MMQ=60,60,60;MPOS=12,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=5.39,5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:72,5,4:0.071,0.059:81:29,3,0:37,2,3:55,17,5,4
chr5	150174892	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr5	150227615	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=185,203;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,2:2,1:3,0,4,0
chr5	150227643	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:0,0:6,0,2,1
chr5	150227652	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.339:9:4,3:2,0:6,0,2,1
chr5	150227654	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=162,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,2:3,0:8,1,2,0
chr5	150228318	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:0,4:4,3:0,4,0,8
chr5	150277909	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,0:6,5:11,0,5,0
chr5	150282674	.	A	AT	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=40.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,24:0.512:47:9,9:10,12:7,16,17,7
chr5	150407456	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,1:2,0:3,5,0,2
chr5	150413406	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,1:1,6:0,4,0,7
chr5	150415169	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=136,85;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:20,2:12,1:19,13,3,0
chr5	150483095	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:2,6:5,4:7,1,8,2
chr5	150484787	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,33:0.493:67:16,16:17,17:17,17,18,15
chr5	150484889	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.598:35:8,10:5,11:2,12,3,18
chr5	150498981	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:4,1:4,2:0,8,0,4
chr5	150503784	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.368:22:6,5:8,2:10,4,7,1
chr5	150506104	.	A	AACACAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=129,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=AC;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	150510757	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=110,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,3:1,2:4,1,5,0
chr5	150515735	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	150516702	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=174,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:150516702_GT_G:150516702:2,0,1,0
chr5	150516713	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,14;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:150516702_GT_G:150516702:4,0,1,0
chr5	150518358	.	AG	GA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:1,3:7,5:1,7,1,9
chr5	150518392	.	G	GGAA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAA;STR;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:1,4:1,3,0,6
chr5	150518435	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=260,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	150518892	.	GC	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.376:22:9,7:4,1:11,3,6,2
chr5	150519063	.	C	CGTGGCATGTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=151,227;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr5	150519096	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr5	150519108	.	A	AGCTGTGTGACCTTAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=68,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	150519670	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,4:6,7:9,1,10,1
chr5	150565770	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr5	150567049	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr5	150578721	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	150639409	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=151,92;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:8,9:5,6:6,7,6,9
chr5	150639439	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,8:7,4:7,7,5,7
chr5	150660769	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:6,5:5,3:0|1:150660769_A_G:150660769:2,9,3,5
chr5	150660794	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:3,3:2,2:0|1:150660769_A_G:150660769:1,5,1,4
chr5	150660830	.	T	TACTCTGTCATCTGGTATACTCTCTGTGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=160,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	150663565	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=124,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:3,8:2,2:4,1,10,0
chr5	150682975	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=113,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:2,7,0,3
chr5	150683005	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=113,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,0:4,2:1,4,0,2
chr5	150704758	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	150712767	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,4:1,5:3,0,6,3
chr5	150723806	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=124,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:7,5:3,4:4,6,6,3
chr5	150723913	.	TGATAGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=212,246;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150723913_TGATAGG_T:150723913:0,1,0,1
chr5	150723920	.	CGGG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=212,246;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:150723913_TGATAGG_T:150723913:0,1,0,1
chr5	150726759	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	150838528	.	T	TTCAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	150886616	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr5	150887184	.	G	GAGA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr5	150887200	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:0,3,0,6
chr5	150891663	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,12:0,2:0,0,12,2
chr5	150905249	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:150905249_T_G:150905249:2,0,1,0
chr5	150905253	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:150905249_T_G:150905249:2,0,1,0
chr5	150917545	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:1,3,0,3
chr5	150921805	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr5	150934137	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:8,0:15,3:11,12,0,3
chr5	150934284	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	150942969	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,10,9
chr5	150948537	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr5	151049404	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,2,10
chr5	151052659	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr5	151169791	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=204,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr5	151169805	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=183,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:7,2:18,0,2,0
chr5	151180451	.	AT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,15;MFRL=126,112;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.649:13:2,1:1,1:2,3,0,8
chr5	151208651	.	AC	GT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:151208651_AC_GT:151208651:0,2,0,1
chr5	151208655	.	G	GACTGCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:151208651_AC_GT:151208651:0,2,0,1
chr5	151231233	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,0,0,1
chr5	151231239	.	CGGCT	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,35;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151231246	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=26,31;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151231249	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151231250	.	CTG	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151231254	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=13,30;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151231255	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,29;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151231263	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:151231233_C_A:151231233:0,1,0,1
chr5	151771817	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=170.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,53:0.982:53:0,25:0,26:0,0,30,23
chr5	152870636	.	C	CGAAAAAGAAGCCCAGGTCCAATCATAGATTTGGTGTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=198,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr5	153085668	.	T	TTTTGTTTG,TTTTGTTTGTTTG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=24,32,25;MFRL=159,155,149;MMQ=40,42,50;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,8,9;RU=TTTG;STR;TLOD=10.37,3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.482,0.319:6:1,1,0:0,2,1:0,1,0,5
chr5	153085699	.	A	ACTGTCATCTGCTGG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=155,164;MMQ=42,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.240:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr5	153144216	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=181,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,1,1
chr5	153174310	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,19;MFRL=134,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.224:19:3,1:6,0:0,15,0,4
chr5	153372525	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,15:0.349:44:14,7:14,8:15,14,9,6
chr5	153372743	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	153406644	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,3,1
chr5	153413390	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,30:0.484:62:13,17:19,13:16,16,14,16
chr5	153414545	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=158,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr5	153432450	.	A	AT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:5,10:12,8:17,0,17,1
chr5	153434018	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,7:7,1:9,6,6,2
chr5	153435294	.	CA	AC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153435294_CA_AC:153435294:0,0,0,1
chr5	153435299	.	AG	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153435294_CA_AC:153435294:0,0,0,1
chr5	153435304	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:153435294_CA_AC:153435294:0,0,0,1
chr5	153709043	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	153760270	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr5	153765787	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=125,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr5	153783587	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.437:30:10,8:7,5:13,4,8,5
chr5	153789078	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=155,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:5,2:4,2:8,1,4,1
chr5	153795274	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:3,5:6,6:9,0,11,0
chr5	154172384	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=138,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.185:24:5,0:15,4:3,17,2,2
chr5	154190823	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=128,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,2:14,1:15,12,3,0
chr5	154190863	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=122,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:12,1:15,1:15,12,0,2
chr5	154193409	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=169,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:6,5:8,11:11,3,12,4
chr5	154193735	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr5	154203121	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.462:28:9,2:6,10:3,12,3,10
chr5	154243004	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=140,88;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:21,0:12,4:6,30,2,2
chr5	154243016	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=136,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:21,0:12,2:4,29,1,1
chr5	154243038	.	GCTATTCACAGA	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=161,131;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:10,4:5,0:1,17,0,4
chr5	154243039	.	CTATTCACAGAT	C	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=168,127;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.225:19:7,3:5,1:1,14,0,4
chr5	154243052	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=174,131;MMQ=60,42;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,2:5,0:1,15,0,2
chr5	154270739	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=134,137;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:16,4,2,0
chr5	154271391	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	154278888	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,2,17
chr5	154282551	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	154287115	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,17,0
chr5	154291219	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr5	154291496	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr5	154296795	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,4:0,8:0,0,2,11
chr5	154301082	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0|1:154301082_A_C:154301082:0,0,0,1
chr5	154301087	.	T	TCCCAGTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154301082_A_C:154301082:0,0,0,1
chr5	154301089	.	C	CTTTTTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,7;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:154301082_A_C:154301082:0,0,0,1
chr5	154308282	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	154308307	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	154311235	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	154311576	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	154311661	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:5,1:17,1:19,3,2,0
chr5	154339595	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=132,113;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:14,4:10,0:15,9,4,0
chr5	154346325	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.453:31:9,5:8,9:5,12,6,8
chr5	154393753	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:17,2:16,0:13,20,2,0
chr5	154395057	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:6,8:7,7:5,8,5,10
chr5	155771421	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=218,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.515:9:1,1:3,3:4,0,5,0
chr5	156074654	.	TAAATTGA	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=116,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr5	156074656	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.771:2:0,1:0,1:0|1:156074656_A_AG:156074656:0,0,0,2
chr5	156074657	.	A	AGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.771:2:0,1:0,1:0|1:156074656_A_AG:156074656:0,0,0,2
chr5	156074660	.	GAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.771:2:0,1:0,1:0|1:156074656_A_AG:156074656:0,0,0,2
chr5	156381370	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr5	156390297	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:1,5,0,2
chr5	156390317	.	T	TTCTCTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:156390317_T_TTCTCTA:156390317:1,2,0,1
chr5	156390318	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=150,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:156390317_T_TTCTCTA:156390317:1,2,0,1
chr5	156456900	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=172,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr5	156464212	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr5	156464242	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=129,74;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,2:1,5:7,1,5,2
chr5	156479323	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,4:3,7:8,1,11,0
chr5	156479424	.	A	C	.	.	DP=77;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=330.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,77:0.987:77:0,23:0,49:0,0,54,23
chr5	156479426	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,47:0.607:77:12,13:16,31:21,9,33,14
chr5	156479443	.	CTTG	C	.	.	DP=85;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTG;STR;TLOD=134.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,37:0.437:85:18,19:25,18:32,16,27,10
chr5	156479509	.	A	G	.	.	DP=125;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=283.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,110:0.991:110:0,34:0,64:0,0,54,56
chr5	156479557	.	GTTGGAACAGTCGTCA	G,ATTGGAACAGTCGTCA	.	.	DP=163;ECNT=6;MBQ=29,31,25;MFRL=119,149,108;MMQ=60,60,60;MPOS=20,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=155.60,4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:47,46,4:0.419,0.041:97:18,18,0:25,27,4:20,27,20,30
chr5	156479568	.	C	CGTT	.	.	DP=138;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=222.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,84:0.990:84:0,30:0,46:0,0,34,50
chr5	156531865	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	156644775	.	T	TC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=79.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,8:0,0,23,0
chr5	156679576	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,14:0,3:0,0,10,7
chr5	156721863	.	T	TC	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=120.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.978:41:0,19:0,20:0,0,16,25
chr5	156742172	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:156742172_T_A:156742172:0,2,0,1
chr5	156742175	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:156742172_T_A:156742172:0,2,0,1
chr5	156742177	.	A	AGCTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,22;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:156742172_T_A:156742172:0,2,0,1
chr5	156742179	.	G	GGAGGGGACTAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=127,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:156742172_T_A:156742172:0,2,0,1
chr5	156747584	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr5	156747614	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr5	156747632	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr5	156747669	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,14,6
chr5	156765981	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	156766037	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr5	156766273	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr5	156817468	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=71,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.481:4:1,0:0,1:0|1:156817468_C_CG:156817468:0,2,2,0
chr5	156817469	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=71,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.481:4:1,0:0,0:0|1:156817468_C_CG:156817468:0,2,2,0
chr5	156817473	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=71,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:1,0:1,0:0|1:156817468_C_CG:156817468:0,2,2,0
chr5	156817477	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,10;MFRL=71,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0,2,1,0
chr5	156887185	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,24:0.567:42:8,13:10,10:11,7,8,16
chr5	156898899	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	156899651	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,1:10,1:4,11,1,1
chr5	156899869	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	156916022	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=147,232;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:6,1:14,1:19,1,2,0
chr5	156916037	.	C	CAAAAAGAA	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=136,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAAGAA;STR;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.447:29:6,5:8,4:11,5,12,1
chr5	156917340	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,5:6,4:9,3,7,3
chr5	156918850	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=75,147;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.406:17:6,3:4,2:6,4,3,4
chr5	156936549	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr5	156940458	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=104,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=75.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,27:0.684:39:6,18:6,9:5,7,15,12
chr5	156957741	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr5	156991508	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:0,4,1,3
chr5	157053271	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	157065829	.	C	CTCTGTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=266,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	157075943	.	TAC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.857:8:1,1:0,6:0,1,0,7
chr5	157102063	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=108,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:8,3:3,3:6,5,4,2
chr5	157106785	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,19,1
chr5	157106968	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=123,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,21:0.316:67:16,9:30,11:15,31,8,13
chr5	157164889	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr5	157166430	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:15,0:6,17,0,2
chr5	157178592	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=47.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr5	157180930	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr5	157180959	.	AAAT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAT;STR;TLOD=56.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,11:0,3:0,0,12,2
chr5	157214823	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=152,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:10,1:15,1:13,14,0,2
chr5	157241367	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=180,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,1,2
chr5	158140222	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr5	158526525	.	G	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=30,9;MFRL=108,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.173:42:11,1:12,1:17,16,0,9
chr5	158526534	.	T	TA,TAA	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=11,10,20;MFRL=138,145,63;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=14.02,4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,10,5:0.415,0.197:25:2,0,1:2,2,2:0,10,2,13
chr5	158588633	.	GAAAAA	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=14,33;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,10;RU=A;STR;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.724:23:0,8:1,7:0,6,1,16
chr5	158589898	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,25:0.500:50:7,10:18,15:24,1,18,7
chr5	158608880	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:3,5:8,6:11,0,11,0
chr5	158630629	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:3,1:4,1:0,8,0,2
chr5	158697481	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=84.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,26:0.659:39:8,12:5,14:2,11,10,16
chr5	158697716	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,0:3,1:0,6,0,2
chr5	158710419	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,29:0.536:54:8,11:16,18:0,25,0,29
chr5	158753845	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=133,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:1,12,0,2
chr5	159398792	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=208,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:159398792_T_G:159398792:2,0,1,0
chr5	159398797	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:159398792_T_G:159398792:1,0,1,0
chr5	159437466	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,8:7,0,11,0
chr5	159640652	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr5	159665523	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,17,0
chr5	159665527	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,17,0
chr5	159665534	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=84.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,10:0,9:0|1:159665523_C_T:159665523:0,0,20,0
chr5	159665726	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=104.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.963:24:0,11:0,12:0|1:159665726_C_T:159665726:0,0,2,22
chr5	159665733	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=97.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0|1:159665726_C_T:159665726:0,0,2,20
chr5	159738878	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:13,1:15,1:8,20,0,2
chr5	159831664	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr5	159835173	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr5	159840688	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr5	159841492	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,4:6,0:1,9,1,3
chr5	159842251	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:15,1:16,1:8,23,1,1
chr5	159851211	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,6:0,13:0,0,16,3
chr5	160026025	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr5	160043071	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	160044855	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr5	160047265	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr5	160047346	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=147,142;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,0:11,2:17,6,2,0
chr5	160049355	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr5	160097429	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr5	160097453	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,12,0
chr5	160097632	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr5	160114730	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:3,2:14,0:17,0,2,0
chr5	160761786	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:8,0:12,7,1,1
chr5	160763822	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=105,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.534:9:3,3:1,1:1,3,1,4
chr5	160763836	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=130,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr5	160763850	.	A	AGCATATTTGAATAAATTGAGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=172,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr5	161302728	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr5	161318132	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=132,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr5	161318152	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0,3,0,1
chr5	161322889	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:5,3:5,4:1,9,0,7
chr5	161322953	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=192,298;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:161322953_G_C:161322953:0,2,0,1
chr5	161322955	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=192,298;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:161322953_G_C:161322953:0,2,0,1
chr5	161322956	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=192,298;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:161322953_G_C:161322953:0,2,0,1
chr5	161322959	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=192,298;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:161322953_G_C:161322953:0,2,0,1
chr5	161495162	.	A	ATC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	162866548	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=194,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,2:0,4:0,3,0,6
chr5	162891894	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:0,4,0,6
chr5	162896856	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:4,3,1,6
chr5	162896918	.	GT	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	162902707	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=118,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.481:23:6,7:5,4:1,11,1,10
chr5	162909687	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=153,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=105.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,38:0.448:85:17,23:30,15:30,17,30,8
chr5	162909716	.	C	T	.	.	DP=124;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=141,134;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,52:0.467:111:21,30:38,20:30,29,30,22
chr5	162909955	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr5	162910199	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:7,4:9,8:4,12,3,9
chr5	162910438	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,20:0.486:41:14,9:7,10:1,20,2,18
chr5	162910462	.	T	TTGATATA	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:17,1:15,1:0|1:162910462_T_TTGATATA:162910462:0,32,0,2
chr5	162910463	.	GCAA	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:17,0:15,1:0|1:162910462_T_TTGATATA:162910462:0,32,0,2
chr5	162939177	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=131,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:16,1:17,1:16,17,1,1
chr5	162940739	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=95.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,7,20
chr5	162944709	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=139,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,3:6,6:2,12,1,8
chr5	162945387	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,34,34;MFRL=121,195,125;MMQ=60,60,60;MPOS=16,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.53,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,3:0.177,0.244:13:3,1,0:5,1,3:1,7,0,5
chr5	167420255	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	167489049	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=147,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=T;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.344:7:4,1:1,1:0|1:167489049_C_CTT:167489049:5,0,2,0
chr5	167489062	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,10;MFRL=141,195;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.308:8:1,0:2,0:0|1:167489049_C_CTT:167489049:5,1,2,0
chr5	167553672	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:9,0,10,0
chr5	167622107	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	167625771	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr5	167631460	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:6,3,0,2
chr5	167638834	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:7,0:0|1:167638834_TG_T:167638834:3,12,0,2
chr5	167638836	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:7,0:0|1:167638834_TG_T:167638834:3,12,0,2
chr5	167638839	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:0|1:167638834_TG_T:167638834:3,13,0,2
chr5	167638842	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=142,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:7,0:0|1:167638834_TG_T:167638834:3,13,0,2
chr5	167645315	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:9,6,0,2
chr5	167653364	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,3:0,3:0,6,0,6
chr5	167798585	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,4:2,6:0,4,2,8
chr5	167812452	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=222,270;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:167812452_A_C:167812452:0,2,0,1
chr5	167812454	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=222,270;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:167812452_A_C:167812452:0,2,0,1
chr5	167824840	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=229,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,5:2,2:1,2,2,5
chr5	167833397	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,2:1,5:0,5,0,7
chr5	167837016	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=185,51;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:2,1:2,0:0|1:167837016_CT_C:167837016:2,2,0,2
chr5	167837018	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=185,51;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,0:2,1:0|1:167837016_CT_C:167837016:2,2,0,2
chr5	167848958	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:18,0:23,3:36,5,3,0
chr5	167851168	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,0,14
chr5	167857225	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,3:4,4:2,6,3,4
chr5	167858462	.	TCTGGCTGG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=CTGG;STR;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.821:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	167868809	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,14:0,0,10,17
chr5	167868844	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=157,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:10,0:9,2:4,15,0,3
chr5	167868930	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	167891774	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:17,0:8,2:9,16,0,2
chr5	167891862	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:8,1:8,8,1,1
chr5	167913603	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	167919623	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	167921047	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=56.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,0,16
chr5	167924189	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=206,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,5:2,4:4,0,8,1
chr5	167984721	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr5	168111122	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,2:4,6:1,7,0,8
chr5	168175205	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,36;MFRL=161,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,2:0,0:1,0,2,0
chr5	168187760	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=245,227;MMQ=60,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	168188048	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	168189501	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.481:31:6,8:9,5:13,3,11,4
chr5	168189526	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=146,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:17,2:18,2:20,15,2,2
chr5	168216489	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,4:0,2:3,0,6,0
chr5	168233413	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.342:15:4,3:6,1:7,3,4,1
chr5	168244256	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:1,1:6,2:5,2,3,1
chr5	168244471	.	G	GT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,2:14,0:0|1:168244471_G_GT:168244471:5,16,0,2
chr5	168244473	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:6,2:14,0:0|1:168244471_G_GT:168244471:5,16,0,2
chr5	168244506	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=158,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,4:4,5:0,5,2,7
chr5	168244543	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:0,3,1,4
chr5	168250429	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	168690612	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.460:35:13,6:6,10:3,16,2,14
chr5	169031218	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,8:0,14:0,0,4,19
chr5	169097505	.	T	TTTTTA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTTA;STR;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.554:7:2,2:1,0:3,0,4,0
chr5	169126349	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:4,3,3,1
chr5	169129284	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,6:2,4:5,0,10,0
chr5	169129495	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:4,5:1,6:0,6,0,11
chr5	169445897	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,103;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr5	169454831	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:0,2:6,2:0|1:169454831_G_A:169454831:5,1,4,0
chr5	169454833	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:0,2:5,2:0|1:169454831_G_A:169454831:5,1,4,0
chr5	169461399	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=119,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:0,1:6,1:4,2,1,2
chr5	169461547	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.535:24:5,5:6,7:5,6,6,7
chr5	169468243	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=100,232;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	169472765	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:7,0,7,0
chr5	169496051	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=192,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:3,1,3,0
chr5	169503133	.	T	TTAGGGTTAGGGTTA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:0,0:1,2,0,1
chr5	169508763	.	CAG	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169508763_CAG_C:169508763:0,0,1,0
chr5	169508769	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:169508763_CAG_C:169508763:0,0,1,0
chr5	169508774	.	C	CCCCGGG	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:169508774_C_CCCCGGG:169508774:0,0,1,0
chr5	169508775	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,18;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:169508774_C_CCCCGGG:169508774:0,0,1,0
chr5	169508776	.	GTCTA	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,17;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:169508774_C_CCCCGGG:169508774:0,0,1,0
chr5	169508783	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,12;MFRL=180,289;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:169508774_C_CCCCGGG:169508774:1,0,1,0
chr5	169508788	.	CAAGGCACTG	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=130,289;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:0|1:169508774_C_CCCCGGG:169508774:2,1,1,0
chr5	169508802	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,26;MFRL=130,289;MMQ=60,60;MPOS=-13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:169508774_C_CCCCGGG:169508774:2,1,1,0
chr5	169533591	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:169533591_C_T:169533591:0,3,0,1
chr5	169533592	.	C	CTCTTTA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:169533591_C_T:169533591:0,3,0,1
chr5	169533614	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=153,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	169675693	.	AT	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=135,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=83.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,28:0.433:65:13,14:22,13:20,17,17,11
chr5	169679354	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr5	169680139	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,27:0.491:55:11,12:15,15:20,8,17,10
chr5	169685163	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:5,8:6,7:3,8,6,9
chr5	169689604	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr5	169695423	.	GCGGCCATCGGTC	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=17,34;MFRL=90,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:2,0,1,0
chr5	169695438	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169695438_T_A:169695438:1,0,1,0
chr5	169695440	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:169695438_T_A:169695438:1,0,1,0
chr5	169695441	.	GGGGGC	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:169695438_T_A:169695438:3,0,1,0
chr5	169695446	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	169695447	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=126,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:169695438_T_A:169695438:3,0,1,0
chr5	169697707	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.455:29:7,7:8,6:12,4,9,4
chr5	169698002	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:8,1:5,1:0|1:169698002_C_CT:169698002:0,13,0,2
chr5	169698003	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:7,1:5,1:0|1:169698002_C_CT:169698002:0,13,0,2
chr5	170149674	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,9:0,0,15,3
chr5	170159997	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr5	170160749	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	170162666	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr5	170215790	.	TTC	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170215790_TTC_T:170215790:0,0,0,1
chr5	170215795	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170215790_TTC_T:170215790:0,0,0,1
chr5	170221185	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,3,1
chr5	170221379	.	CAAAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=113,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr5	170336614	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:1,2:3,2:6,0,4,0
chr5	170338163	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:4,7:6,8:2,8,2,13
chr5	170341326	.	TTA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TA;STR;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:2,1:1,4:0,4,0,5
chr5	170380523	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=232,136;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr5	170610273	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,33:0.502:66:14,17:17,15:16,17,13,20
chr5	170640827	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr5	170736824	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=189,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr5	170815082	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,18;MFRL=101,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,0:1,0,0,3
chr5	170837513	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=145,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.471:6:1,3:2,0:2,1,2,1
chr5	170847555	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	171480055	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr5	171488367	.	G	GTACATC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171488367_G_GTACATC:171488367:0,0,0,1
chr5	171488369	.	A	ACTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171488367_G_GTACATC:171488367:0,0,0,1
chr5	171488373	.	AA	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:171488367_G_GTACATC:171488367:0,0,0,1
chr5	171491650	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,2:1,0,7,0
chr5	171491682	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,4:4,3:9,1,5,2
chr5	171491697	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.473:21:6,3:5,6:10,1,6,4
chr5	171510180	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	171520394	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=127,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,1:6,4:6,1,4,1
chr5	171532799	.	C	CTCGTGTTTCCTTCCAGCCTCTCCCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=162,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,1,1
chr5	171534682	.	T	TGCCCACAGGCTGACCGGGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.497:12:3,1:3,1:5,1,6,0
chr5	171554473	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	171554516	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr5	171583809	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,1,1
chr5	171710717	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr5	171785892	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,4:8,6:2,10,2,8
chr5	171809074	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=111,103;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,4:0.077:62:29,4:26,0:38,20,3,1
chr5	172096768	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=134,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.527:36:5,15:11,3:8,9,14,5
chr5	172097353	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	172113074	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=161,249;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	172197522	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=348,0;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	172336616	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,5,1
chr5	172336838	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=151,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr5	172336858	.	G	GACCAAGACCATGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	172347440	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:7,7:8,5:8,7,3,9
chr5	172395408	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,5:4,7:5,1,10,2
chr5	172395552	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=130,101;MMQ=52,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:6,9,1,1
chr5	172396394	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=285.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,85:0.989:85:0,36:0,48:0,0,67,18
chr5	172421760	.	ATT	A,AT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,31,31;MFRL=168,194,136;MMQ=60,60,60;MPOS=15,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=6.29,14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,9:0.212,0.461:19:3,2,2:1,1,6:3,3,3,10
chr5	172535553	.	AGG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=160,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr5	172560793	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:2,1:9,2:2,9,1,2
chr5	172573767	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	172578549	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:1,3:2,1:3,1,4,0
chr5	172585927	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr5	172745283	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	173316729	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=247.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,73:0.987:73:0,40:0,32:0,0,49,24
chr5	173380346	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr5	173383194	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=228,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:1,2:0,3,1,2
chr5	174152100	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,0:0,1,0,5
chr5	174152106	.	G	GCGGTGGCTCACGCCTGTAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:174152106_G_GCGGTGGCTCACGCCTGTAA:174152106:0,4,0,1
chr5	174152108	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:0,0:0|1:174152106_G_GCGGTGGCTCACGCCTGTAA:174152106:0,4,0,1
chr5	174156168	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=103,148;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:3,4:9,5:8,5,4,5
chr5	174156530	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,224;MMQ=56,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr5	174868700	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	174870633	.	A	AAAATCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:174870633_A_AAAATCT:174870633:0,0,0,1
chr5	174870635	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:174870633_A_AAAATCT:174870633:0,0,0,1
chr5	174870639	.	CA	TT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:174870633_A_AAAATCT:174870633:0,0,0,1
chr5	174936038	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,5:3,2:6,2,3,4
chr5	174943551	.	GA	G	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=48.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,21:0.483:44:9,9:14,12:20,3,18,3
chr5	175387139	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,115;MMQ=60,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	175394887	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,238;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	175517236	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,147;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.142:29:12,1:13,3:25,0,4,0
chr5	175520358	.	C	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,166;MMQ=36,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,7:0.095:81:37,2:37,5:6,68,0,7
chr5	175530166	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,160;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.404:45:12,9:15,9:25,2,17,1
chr5	175721962	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=202,180;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:1,1:8,8:9,0,9,0
chr5	175774865	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,6:1,5:2,1,5,6
chr5	175786437	.	CATT	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=128.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,36:0.529:68:20,17:9,19:11,21,20,16
chr5	175843461	.	CG	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=86.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,13:0,12:0,0,0,27
chr5	175916083	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,7:5,3:0,9,0,10
chr5	175933691	.	TGTGTGTGC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTGTGTGC;STR;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,3:1,1:4,0,4,1
chr5	175956177	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,6,8
chr5	175956271	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=146.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,28:0,14:0,0,33,12
chr5	175992258	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=38,29;MFRL=132,132;MMQ=25,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,3:0,6:2,0,7,2
chr5	175992266	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,10,3
chr5	175998129	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	176002144	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,6,9
chr5	176002873	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	176002926	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr5	176004312	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	176004846	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr5	176004866	.	A	AGT,T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32,32;MFRL=210,149,169;MMQ=60,60,57;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.06,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,1:0.447,0.222:6:2,3,0:0,0,1:1,1,0,4
chr5	176005175	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0|1:176005175_A_C:176005175:0,0,0,9
chr5	176005184	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0|1:176005175_A_C:176005175:0,0,0,7
chr5	176005559	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=96,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:3,0:0,2:1,2,1,1
chr5	176012067	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,303;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	176026121	.	TCAAAGACCCAGGA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.931:12:0,6:0,6:0|1:176026121_TCAAAGACCCAGGA_T:176026121:0,0,2,10
chr5	176026135	.	TCCTCCTTCCTC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.931:12:0,6:0,6:0|1:176026121_TCAAAGACCCAGGA_T:176026121:0,0,2,10
chr5	176053645	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr5	176056529	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,7:0,0,13,9
chr5	176069831	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,5,6
chr5	176069859	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=187,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,3:1,0,0,6
chr5	176069866	.	C	CCCG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr5	176071462	.	C	CCCG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.270:9:2,1:5,1:0|1:176071462_C_CCCG:176071462:1,6,0,2
chr5	176071466	.	C	CTTAAGGT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,1:5,1:0|1:176071462_C_CCCG:176071462:1,6,0,2
chr5	176074643	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:2,2,6,1
chr5	176078982	.	GGGT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=208,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	176081856	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	176082998	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=134,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.411:20:4,4:7,4:9,3,4,4
chr5	176083175	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=132.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,13:0,23:0,0,14,24
chr5	176083997	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr5	176295978	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=185,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr5	176304710	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=172,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,0:0,4:1,3,0,4
chr5	176305466	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=204,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:6,1:3,4:8,1,4,2
chr5	176305678	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:1,8,0,2
chr5	176306676	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.493:8:2,1:2,2:2,2,4,0
chr5	176308870	.	C	CAG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:6,1:4,3:4,6,1,3
chr5	176308956	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr5	176310790	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:2,5,2,1
chr5	176317743	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:6,7:3,6:7,2,6,7
chr5	176332553	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=189,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	176333126	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	176338496	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=231,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	176370402	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=52.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.477:42:12,15:10,5:12,10,9,11
chr5	176378433	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:7,6:12,4:13,6,9,1
chr5	176396334	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=203,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,0:1,4:0,2,0,5
chr5	176471591	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,4:0,0,0,11
chr5	176491483	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,2:7,1,7,0
chr5	176516796	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	176517885	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:0|1:176517885_G_A:176517885:4,1,3,1
chr5	176517893	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,2:2,1:0|1:176517885_G_A:176517885:4,1,3,1
chr5	176519287	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr5	176520277	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.406:18:4,0:5,0:0|1:176520277_A_C:176520277:2,9,7,0
chr5	176520283	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.403:18:4,3:4,3:0|1:176520277_A_C:176520277:2,9,7,0
chr5	176520287	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=172,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:6,1:5,2:0|1:176520277_A_C:176520277:1,11,6,0
chr5	176520291	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:7,1:5,2:0|1:176520277_A_C:176520277:1,12,5,0
chr5	176520294	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,13;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:6,0:6,1:0|1:176520277_A_C:176520277:1,12,5,0
chr5	176522728	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=120,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,4:5,5:5,5,4,5
chr5	176523562	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	176523597	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr5	176523777	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=95,255;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:0|1:176523777_A_T:176523777:0,2,0,1
chr5	176523785	.	TCC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=95,255;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:176523777_A_T:176523777:0,2,0,1
chr5	176523789	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=95,255;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:176523777_A_T:176523777:0,2,0,1
chr5	176639270	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:176639270_G_T:176639270:1,0,0,1
chr5	176639277	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:176639270_G_T:176639270:1,0,0,1
chr5	176639280	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:176639270_G_T:176639270:1,0,0,1
chr5	176675205	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:9,0:4,3:10,3,2,1
chr5	176707544	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.371:25:9,2:7,7:9,7,6,3
chr5	176720766	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=198,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr5	176729736	.	ACC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=C;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.484:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	176733341	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=130,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:6,5:2,4:8,0,9,0
chr5	176733616	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr5	176738936	.	CCGCCCCGCCCCCGGGA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=171,246;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.527:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	176764730	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=130,42;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,3:12,0:18,8,3,0
chr5	176765395	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr5	176798070	.	CGGGCCGGGGCCGGGGCCGGGGCCGGGGCCG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,4;RU=GGGCCG;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.422:3:1,1:0,0:2,0,1,0
chr5	176813404	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:6,0,2,3
chr5	176824137	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=216,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr5	176830627	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr5	176831119	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	176831177	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr5	176831980	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	176836644	.	C	CAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,36;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:176836644_C_CAA:176836644:0,1,0,1
chr5	176836646	.	GTT	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:176836644_C_CAA:176836644:0,1,0,1
chr5	176836649	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:176836644_C_CAA:176836644:0,1,0,1
chr5	176857769	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,7:0,17:0,0,25,0
chr5	176858049	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:6,5:5,5:0,11,0,10
chr5	176868780	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,14;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.232:14:5,0:4,1:0|1:176868780_A_C:176868780:1,10,3,0
chr5	176868784	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.233:14:5,0:5,1:0|1:176868780_A_C:176868780:1,10,3,0
chr5	176868787	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=162,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.193:17:5,0:5,0:0|1:176868780_A_C:176868780:3,11,3,0
chr5	176885111	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=132,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:2,2:5,1:3,4,1,3
chr5	176886539	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:0,3:6,2:6,0,5,0
chr5	176894681	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,13;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.403:10:2,1:1,0:3,3,4,0
chr5	176895817	.	GC	AA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=95.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,10:0,0,15,7
chr5	176917764	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=221,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.648:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr5	176929974	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,4:4,0:6,0,4,0
chr5	176930135	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,11:0,0,8,7
chr5	176930171	.	AGAG	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,3:5,8:3,6,4,7
chr5	176931594	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=217,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr5	176931706	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr5	176935215	.	GC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	176939051	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	176939688	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr5	176939735	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr5	176940274	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr5	176940871	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,7:0,0,5,15
chr5	176943680	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,11;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.698:4:0,0:0,0:1,0,3,0
chr5	176950879	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,12:0,2:0,0,15,0
chr5	176963349	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr5	177019540	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.500:31:9,6:6,5:10,5,12,4
chr5	177019688	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=107.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,26:0,21:0,0,13,37
chr5	177020677	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=141,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.089:32:14,0:14,2:16,14,2,0
chr5	177031602	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	177036043	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	177158602	.	T	TCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=77,79;MMQ=33,21;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:1,3,0,1
chr5	177158612	.	G	A,GTCAACAAAAATAAGC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,28,33;MFRL=69,79,84;MMQ=39,21,27;MPOS=5,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.22,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.248,0.248:5:0,0,0:2,1,1:2,1,0,2
chr5	177158617	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=69,84;MMQ=39,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0|1:177158617_C_T:177158617:2,1,0,1
chr5	177158619	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=69,84;MMQ=39,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0|1:177158617_C_T:177158617:2,1,0,1
chr5	177161998	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,287;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	177164143	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	177166053	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=128.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,24:0,17:0,0,32,9
chr5	177171823	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,101;MMQ=60,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.799:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	177422823	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=146,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,2:3,5:3,1,7,0
chr5	177465999	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=152,150;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	177466284	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,199;MMQ=39,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,1:6,3:16,0,4,0
chr5	177466530	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=187,182;MMQ=24,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.465:41:14,3:8,15:1,21,0,19
chr5	177570759	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr5	177574901	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.389:29:10,7:7,3:13,5,8,3
chr5	177580593	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=160,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:30,2:22,1:26,26,2,1
chr5	177580874	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:0,8,1,4
chr5	177639921	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=219,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr5	177642177	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr5	177642214	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:12,0,2,0
chr5	177656900	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr5	177658625	.	CG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=153,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:1,1:0,0:1,0,1,1
chr5	177658883	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr5	177658896	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,0,3
chr5	177665554	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=179,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:3,2:4,1,3,0
chr5	177666091	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,13;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:3,1:0,0:0|1:177666091_A_C:177666091:0,3,3,0
chr5	177666100	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.226:11:4,0:5,0:0|1:177666091_A_C:177666091:3,6,2,0
chr5	177666112	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=142,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,5:3,4:2,3,5,5
chr5	177669475	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,26;MFRL=218,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:177669475_T_TG:177669475:0,1,0,1
chr5	177669476	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=218,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:177669475_T_TG:177669475:0,1,0,1
chr5	177673153	.	AGTGCAGGGACCCAGTGAG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=222,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,0:1,3:6,0,3,0
chr5	177674431	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:4,0,5,0
chr5	177675217	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.592:30:6,9:5,8:8,4,9,9
chr5	177675315	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,134;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,0:5,3:0,10,0,3
chr5	177679506	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,130;MMQ=60,29;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:5,3,3,0
chr5	177679654	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,4:3,4:1,3,4,4
chr5	177679680	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=135,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr5	177684022	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=222,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	177684682	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=115,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	177686815	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=74,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr5	177697417	.	C	CATAGAG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=110,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:3,2:1,0:0|1:177697417_C_CATAGAG:177697417:2,2,1,1
chr5	177697418	.	C	CTATTTCGAGCATTAAATGAATTTAT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=110,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:3,2:1,0:0|1:177697417_C_CATAGAG:177697417:2,2,1,1
chr5	177715291	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=181.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,26:0,31:0,0,35,22
chr5	177715302	.	CA	C	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=137.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,24:0,31:0,0,30,28
chr5	177715477	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=122.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,10:0,25:0,0,19,21
chr5	177717431	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:11,5:13,2:8,18,3,4
chr5	177987770	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.137:32:7,1:11,4:0|1:177987770_G_A:177987770:10,17,3,2
chr5	177987778	.	ACG	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.108:28:10,0:12,2:0|1:177987770_G_A:177987770:7,18,2,1
chr5	178030941	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,10;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:1,0:0,0:1,3,0,2
chr5	178040919	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr5	178140090	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:4,8:9,1:5,8,2,7
chr5	178140598	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:178140598_G_A:178140598:0,4,0,1
chr5	178140604	.	T	TTCATCAGTTTAACTATTAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:178140598_G_A:178140598:0,3,0,1
chr5	178154174	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=167,137;MMQ=60,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,1:1,8,0,3
chr5	178293175	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=169,0;MMQ=60,37;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,2:10,2:18,0,4,0
chr5	178293406	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,126;MMQ=52,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.447:34:8,6:10,9:1,18,3,12
chr5	178293873	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=204,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,2,1
chr5	178293937	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:4,7:6,4:0|1:178293937_G_A:178293937:10,1,11,0
chr5	178293943	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,12:0.464:26:7,7:7,5:0|1:178293937_G_A:178293937:12,2,11,1
chr5	178369673	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	178408906	.	C	CTCAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=133,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:178408906_C_CTCAG:178408906:0,3,0,1
chr5	178408908	.	C	CTCTCAAGTA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=133,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:178408906_C_CTCAG:178408906:0,3,0,1
chr5	178409856	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=99,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr5	178410265	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	178413681	.	C	CAAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	178413816	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=115,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,4,0
chr5	178414050	.	C	CAAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:178414050_C_CAAA:178414050:0,1,0,1
chr5	178414051	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:178414050_C_CAAA:178414050:0,1,0,1
chr5	178414055	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:178414050_C_CAAA:178414050:0,1,0,1
chr5	178419104	.	G	GGCCAGGGAGGTTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.264:9:3,2:4,0:0|1:178419104_G_GGCCAGGGAGGTTT:178419104:2,5,1,1
chr5	178419106	.	T	TGCAGAGCA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,0:0|1:178419104_G_GGCCAGGGAGGTTT:178419104:2,5,1,1
chr5	178455198	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,1,10
chr5	178504199	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.539:24:8,7:3,6:0|1:178504199_G_A:178504199:3,8,2,11
chr5	178504201	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.539:24:7,7:3,3:0|1:178504199_G_A:178504199:3,8,2,11
chr5	178564971	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	178581977	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:1,4,0,5
chr5	178608265	.	CCAGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	178634469	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=16,32;MFRL=208,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.410:3:0,1:0,0:0|1:178634469_T_G:178634469:2,0,1,0
chr5	178634472	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=16,17;MFRL=208,236;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.415:3:0,0:0,0:0|1:178634469_T_G:178634469:2,0,1,0
chr5	178770759	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=213,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr5	178986978	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:0,3:4,0,4,0
chr5	178986987	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr5	178996435	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=121,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:8,7:1,7:1,8,1,13
chr5	179012968	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	179016518	.	TAAG	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.515:33:10,10:5,7:11,5,15,2
chr5	179016664	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,22:0.490:45:7,11:16,11:7,16,6,16
chr5	179021982	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	179036357	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=194,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:2,3,2,0
chr5	179043041	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:0|1:179043041_C_G:179043041:10,1,2,0
chr5	179043075	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=74.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.962:23:0,10:0,12:0|1:179043041_C_G:179043041:0,0,18,5
chr5	179045142	.	G	A	.	.	DP=79;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=132,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,33:0.459:72:24,22:15,11:19,20,12,21
chr5	179048449	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,5:7,5:1,11,1,9
chr5	179050188	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:8,6:9,9:0,17,0,15
chr5	179069309	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,16,4
chr5	179069369	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=149,140;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:15,3:11,0:14,12,3,0
chr5	179070528	.	GGAACTGGGACTTAC	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,18;MFRL=139,172;MMQ=56,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:179070528_GGAACTGGGACTTAC_G:179070528:0,4,0,1
chr5	179070546	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=124,172;MMQ=52,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:179070528_GGAACTGGGACTTAC_G:179070528:0,3,0,1
chr5	179070548	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=124,172;MMQ=52,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:179070528_GGAACTGGGACTTAC_G:179070528:0,3,0,1
chr5	179071724	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=210,205;MMQ=52,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr5	179071947	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=110,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,14:0.231:63:26,6:22,8:18,31,5,9
chr5	179071958	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=128,101;MMQ=60,27;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,7:0.131:58:23,3:27,4:18,33,4,3
chr5	179072006	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=120,145;MMQ=54,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:18,1:7,4:10,16,0,5
chr5	179072040	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=125,125;MMQ=52,39;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:11,1:5,2:4,14,0,3
chr5	179072100	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=226,197;MMQ=45,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.281:5:1,1:1,0:0|1:179072100_T_TA:179072100:0,4,0,1
chr5	179072103	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=226,197;MMQ=45,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:179072100_T_TA:179072100:0,4,0,1
chr5	179136138	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=104,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,4:1,9:0,1,0,13
chr5	179143173	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,1:10,1:14,8,2,0
chr5	179147641	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr5	179150788	.	G	GT	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,8:0.191:42:9,4:14,3:4,30,2,6
chr5	179200803	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	179233663	.	A	AGGC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GGC;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	179260009	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,3:3,6:4,2,6,3
chr5	179260494	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	179264886	.	C	CAGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179264886_C_CAGG:179264886:0,1,0,1
chr5	179264888	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179264886_C_CAGG:179264886:0,1,0,1
chr5	179264890	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:179264886_C_CAGG:179264886:0,1,0,1
chr5	179267783	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr5	179269075	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=141,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr5	179290575	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:13,1:10,1:15,9,1,1
chr5	179305249	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,16;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.471:6:2,1:1,0:3,0,2,1
chr5	179334857	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	179405144	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=183,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,2:5,0:6,1,2,0
chr5	179407229	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=64.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,0,18
chr5	179554522	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=202,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr5	179555407	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr5	179563368	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.468:39:10,8:9,10:18,3,17,1
chr5	179563532	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,20:0.583:34:7,13:7,7:0,14,0,20
chr5	179565000	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=126,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:179565000_G_A:179565000:2,2,0,1
chr5	179565002	.	G	GTGTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=126,108;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:179565000_G_A:179565000:2,2,0,1
chr5	179565071	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr5	179663606	.	T	TTACAAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=154,270;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0,4,0,1
chr5	179663614	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	179663631	.	C	CTTCTGGTTATTGTCATGGTGATTGTCTACTGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	179728707	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chr5	179731695	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=201,239;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	179763054	.	C	CTGTAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr5	179763398	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr5	179765467	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr5	179765510	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:13,4,0,2
chr5	179780292	.	CCTCCGTGGG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTCCGTGGG;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.789:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	179780340	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	179980302	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,0:0,4:0,0,5,0
chr5	179980527	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,9:0,0,0,17
chr5	179991841	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	179994815	.	CTG	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,1:12,1:24,4,2,0
chr5	179996111	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,8,7
chr5	179998366	.	T	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.117:41:11,4:23,0:21,16,4,0
chr5	179998454	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,6:0,11:0,0,1,16
chr5	180037100	.	TG	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:180037100_TG_AA:180037100:0,3,0,1
chr5	180037107	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=199,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:180037100_TG_AA:180037100:0,4,0,1
chr5	180041001	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,2,0
chr5	180041008	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,3,0
chr5	180041208	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,1:0,7:0,0,3,6
chr5	180043864	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:8,0,1,1
chr5	180045700	.	G	GGGTTACCCTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,0:0,0,5,0
chr5	180046209	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	180046426	.	C	CTGGCCGCTTAGCTAAGGCACAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr5	180047629	.	TGAG	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=116,69;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GAG;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:8,0:10,1:12,7,1,1
chr5	180047863	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr5	180048316	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr5	180049923	.	GCAC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAC;STR;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr5	180053307	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	180055862	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,3,0
chr5	180055864	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,3,0
chr5	180056044	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr5	180056620	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	180057214	.	T	TGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,13;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,10;RU=G;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr5	180057300	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=84,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr5	180057504	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.815:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr5	180278159	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:18,2:6,0:20,5,2,0
chr5	180329458	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=139,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.474:21:6,8:4,1:7,4,5,5
chr5	180329536	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=195,171;MMQ=56,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr5	180338300	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.470:19:5,4:5,4:7,3,6,3
chr5	180374484	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=117,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.424:26:7,5:8,5:11,4,9,2
chr5	180377102	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=112,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:12,1:21,2:13,20,1,2
chr5	180377594	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	180430797	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,146;MMQ=40,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,6:3,2:3,2,6,2
chr5	180432540	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:14,2:17,0:15,17,1,1
chr5	180482303	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=131,261;MMQ=48,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr5	180482390	.	C	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=51.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.555:34:8,14:7,5:12,3,13,6
chr5	180482541	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=192,146;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:0,9,0,2
chr5	180486224	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	180582980	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=134,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	180622615	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.538:30:5,6:7,10:9,5,12,4
chr5	180625254	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.498:12:1,5:5,1:1,5,3,3
chr5	180627250	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=267,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	180650945	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,273;MMQ=60,32;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr5	180650951	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=139,273;MMQ=60,32;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:180650951_G_C:180650951:1,0,1,0
chr5	180650956	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,14;MFRL=139,273;MMQ=60,32;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:180650951_G_C:180650951:1,0,1,0
chr5	180650958	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,32;MFRL=139,273;MMQ=60,32;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:180650958_G_C:180650958:1,0,1,0
chr5	180650966	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=22,13;MFRL=133,273;MMQ=60,32;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:180650958_G_C:180650958:2,0,1,0
chr5	180650968	.	C	CCCCCCACAAAAAAGGATG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=133,273;MMQ=60,32;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:180650951_G_C:180650951:2,0,1,0
chr5	180660515	.	C	CCA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:8,0:7,5:0,15,0,5
chr5	180663941	.	GT	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:24,0:14,3:36,4,3,0
chr5	180666276	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=224,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:1,2,0,4
chr5	180669136	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=206,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.497:8:1,2:3,2:4,0,2,2
chr5	180669370	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:3,4:7,4:1,9,3,5
chr5	180686958	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:9,10:6,8:13,2,15,3
chr5	180687428	.	CTCT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCT;STR;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,4:7,4:7,5,4,4
chr6	292452	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=18,23;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:0,1:0|1:292452_G_C:292452:2,2,2,0
chr6	292456	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:0,1:0|1:292452_G_C:292452:2,2,2,0
chr6	292461	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:0,0:2,2,2,0
chr6	292464	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:0,0:0|1:292464_G_C:292464:3,2,2,0
chr6	292466	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,9;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:4,0:0,0:0|1:292464_G_C:292464:3,2,1,0
chr6	292694	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=209,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr6	311798	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=237,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr6	312029	.	TAATG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:9,1:8,9:1,16,3,7
chr6	335069	.	T	A	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,24:0.382:63:18,9:21,14:35,4,23,1
chr6	335251	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,15:0.471:32:9,8:8,6:0|1:335251_T_C:335251:1,16,1,14
chr6	335253	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=57.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,15:0.471:32:8,8:8,7:0|1:335251_T_C:335251:1,16,1,14
chr6	335268	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=73.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,25:0.866:28:1,13:2,9:0,3,1,24
chr6	348051	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.429:10:2,2:2,2:6,0,3,1
chr6	348080	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,5:0,12:0,0,15,2
chr6	350940	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.456:22:8,7:4,3:3,9,2,8
chr6	407496	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=130,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,22:0.339:66:18,13:24,9:25,19,14,8
chr6	407629	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,19;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,1:0,0:2,1,0,3
chr6	407656	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=231,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:2,2:0,1:0,3,0,3
chr6	497520	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,9,14
chr6	564515	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	572480	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr6	572543	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,4:3,6:5,1,5,5
chr6	572714	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	599042	.	T	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=160.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.981:48:0,22:0,23:0,0,35,13
chr6	619358	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,0:2,2:10,0,2,0
chr6	619582	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=166,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:619582_A_AG:619582:1,3,0,1
chr6	619583	.	T	TATTCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=166,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:619582_A_AG:619582:1,3,0,1
chr6	1313157	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=196,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr6	1612419	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=115,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.345:9:2,1:1,2:1,5,2,1
chr6	1726623	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:8,9:3,8:8,3,11,6
chr6	2624374	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr6	2675271	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:13,2:6,1:12,8,3,0
chr6	2683439	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=154,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0,5,0,2
chr6	2683472	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2683472_G_T:2683472:0,1,0,1
chr6	2683473	.	TGCAAG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2683472_G_T:2683472:0,1,0,1
chr6	2683483	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2683472_G_T:2683472:0,0,0,1
chr6	2683486	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2683472_G_T:2683472:0,0,0,1
chr6	2685677	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr6	2689217	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:3,7,1,3
chr6	2766465	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:7,0,5,0
chr6	2769205	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr6	2834265	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	2838046	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=237,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr6	2838248	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,3:4,2:0,7,0,5
chr6	2890614	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:9,2:14,8,2,0
chr6	2948965	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,4:0,0,1,8
chr6	2949387	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,5:0,0:0,0,0,7
chr6	2953252	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr6	2953445	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,4,13
chr6	3006807	.	A	G	.	.	DP=86;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=169.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,55:0.679:81:17,32:7,20:14,12,30,25
chr6	3006821	.	CT	C,CTT	.	.	DP=64;ECNT=4;MBQ=32,32,32;MFRL=141,147,163;MMQ=60,60,60;MPOS=13,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.11,8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,5,5:0.159,0.174:32:9,3,1:11,2,3:5,17,2,8
chr6	3006889	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.212:15:9,3:3,0:0|1:3006889_A_AT:3006889:0,12,0,3
chr6	3006890	.	C	CTGCCTG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.216:15:9,2:3,0:0|1:3006889_A_AT:3006889:0,12,0,3
chr6	3012725	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=55,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.889:11:2,5:0,4:1,1,7,2
chr6	3017310	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	3078266	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	3118947	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr6	3157798	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	3224927	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=126,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chr6	3225115	.	ATG	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=175,147;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:3225115_ATG_A:3225115:0,4,0,1
chr6	3225119	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,27;MFRL=175,147;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:3225115_ATG_A:3225115:0,4,0,1
chr6	3225120	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,21;MFRL=175,147;MMQ=40,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:3225115_ATG_A:3225115:0,4,0,1
chr6	3225123	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=175,147;MMQ=40,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:3225115_ATG_A:3225115:0,4,0,1
chr6	3225232	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,288;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	3226973	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,15;MFRL=176,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.472:10:3,0:2,2:0,5,0,5
chr6	3264101	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:2,1,1,5
chr6	3264582	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=220,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:1,2,0,4
chr6	3284163	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,2:7,5:8,4,4,3
chr6	3287118	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,5,1
chr6	3289983	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=145,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:3,1,4,2
chr6	3723764	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	3983531	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.082:34:18,0:14,2:8,24,0,2
chr6	3984080	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=185,213;MMQ=30,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3984080_T_G:3984080:0,1,0,1
chr6	3984082	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=185,213;MMQ=30,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:3984080_T_G:3984080:0,1,0,1
chr6	4021554	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,7,0
chr6	4033065	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	4037582	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=63.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,9:0,9:0,0,16,3
chr6	4040922	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:1,0,5,0
chr6	4044297	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=96.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:0,10:1,18:0,1,2,26
chr6	4044344	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr6	4049920	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:14,1:13,1:20,7,2,0
chr6	4052167	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr6	4052383	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=173.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,25:0,25:0,0,7,44
chr6	4057200	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr6	4057233	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,2:0,13:0,0,13,3
chr6	4057429	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,2,13
chr6	4074612	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=99.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,13:0,0,26,1
chr6	4119553	.	ATTT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=15,14;MFRL=97,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.249:9:0,0:2,0:2,5,0,2
chr6	4892330	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:3,4,1,1
chr6	4936074	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr6	4937728	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=37,34;MFRL=209,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:0|1:4937728_C_CA:4937728:0,1,4,0
chr6	4937742	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,11;MFRL=129,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:1,0:0|1:4937728_C_CA:4937728:2,2,3,0
chr6	4937747	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=129,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:2,0:2,2:0|1:4937728_C_CA:4937728:2,2,3,0
chr6	4944004	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.598:10:1,1:2,3:0,4,1,5
chr6	4952413	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	4996682	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:4996682_TG_T:4996682:1,3,0,1
chr6	4996684	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:4996682_TG_T:4996682:1,3,0,1
chr6	4996689	.	AT	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=127,105;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:4996682_TG_T:4996682:1,3,0,1
chr6	4996694	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:4996682_TG_T:4996682:0,3,0,1
chr6	5000721	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr6	5000724	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,33,32;MFRL=144,178,164;MMQ=60,60,58;MPOS=19,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,20;RU=T;STR;TLOD=3.37,3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.262,0.418:7:1,1,0:0,0,3:2,0,5,0
chr6	5086070	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	5109592	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr6	5217010	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=195,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr6	5404958	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=27,32;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.680:13:3,4:0,5:0,4,1,8
chr6	5404986	.	GA	TT	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=28,14;MFRL=163,151;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:5404986_GA_TT:5404986:0,4,0,1
chr6	5404989	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,14;MFRL=160,151;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,0:0|1:5404986_GA_TT:5404986:0,3,0,1
chr6	5404996	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=28,14;MFRL=155,151;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:5404986_GA_TT:5404986:0,2,0,1
chr6	5404998	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=23,14;MFRL=155,151;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:5404986_GA_TT:5404986:0,2,0,1
chr6	5405016	.	TTTTTC	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=28,15;MFRL=217,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0,3,0,1
chr6	5405017	.	TTTTC	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=32,31;MFRL=238,151;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:0,0:0|1:5404986_GA_TT:5404986:0,2,0,1
chr6	5405026	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=23,29;MFRL=238,151;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:0|1:5405026_T_A:5405026:0,2,0,2
chr6	5405028	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=14,28;MFRL=238,151;MMQ=60,50;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:0,0:0|1:5405026_T_A:5405026:0,2,0,2
chr6	5545654	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	5831924	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,145;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,3:0,3:3,0,6,0
chr6	5832125	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,3:2,3:0,4,1,5
chr6	5999464	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	6145998	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,1:10,1:4,13,0,2
chr6	6167621	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr6	6174786	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=90.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,8:0,17:0,0,21,5
chr6	6250967	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.753:5:0,1:0,2:1,0,4,0
chr6	6318945	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=134,120;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6318945_A_AG:6318945:0,3,0,1
chr6	6318948	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=134,120;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6318945_A_AG:6318945:0,3,0,1
chr6	6318949	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=134,120;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6318945_A_AG:6318945:0,3,0,1
chr6	6318951	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=134,120;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6318945_A_AG:6318945:0,3,0,1
chr6	6318953	.	C	CTG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=134,120;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6318945_A_AG:6318945:0,3,0,1
chr6	6318954	.	A	AATTCG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=134,120;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:6318945_A_AG:6318945:0,3,0,1
chr6	6321128	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,9:0,5:0,0,0,14
chr6	6589193	.	G	GGTGGATGGAATGTTGGCCCAA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6589193_G_GGTGGATGGAATGTTGGCCCAA:6589193:0,0,0,1
chr6	6589196	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6589193_G_GGTGGATGGAATGTTGGCCCAA:6589193:0,0,0,1
chr6	6625333	.	G	GTTCTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:6625333_G_GTTCTGA:6625333:0,0,0,1
chr6	6625335	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6625333_G_GTTCTGA:6625333:0,0,0,1
chr6	6650003	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:6650003_G_C:6650003:0,3,0,1
chr6	6650011	.	G	GCAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:6650003_G_C:6650003:0,3,0,1
chr6	6650014	.	AAG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:6650003_G_C:6650003:0,3,0,1
chr6	6650020	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:6650003_G_C:6650003:0,3,0,1
chr6	6650022	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=238,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:6650003_G_C:6650003:0,3,0,1
chr6	7246729	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr6	7330194	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	7368917	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.550:38:7,11:10,10:13,4,17,4
chr6	7373249	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,1:0,7:2,0,8,0
chr6	7387236	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.637:17:2,4:3,6:4,2,7,4
chr6	7387433	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=112,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.436:12:1,1:6,4:2,5,1,4
chr6	7387462	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=106,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr6	7390369	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,10:0,0,1,14
chr6	7396836	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr6	7396887	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,3:8,3:10,6,5,1
chr6	7398832	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:8,0,4,0
chr6	7401382	.	AAAAC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:0,5,0,4
chr6	7413094	.	AT	A,ATT	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=31,31,30;MFRL=147,165,154;MMQ=60,60,60;MPOS=15,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.48,9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:44,8,9:0.119,0.146:61:25,3,2:16,4,6:38,6,15,2
chr6	7414382	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:8,0,6,0
chr6	7414657	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,15:0,6:0,0,1,21
chr6	7555854	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:4,0,3,0
chr6	7567970	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=200,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr6	7568203	.	GGA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:7568203_GGA_G:7568203:0,0,0,1
chr6	7568207	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:7568203_GGA_G:7568203:0,0,0,1
chr6	7574805	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr6	7575497	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,169;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr6	7578819	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:6,2:4,3:0|1:7578819_T_G:7578819:1,9,1,4
chr6	7578823	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:4,2:4,3:0|1:7578819_T_G:7578819:1,9,1,5
chr6	7590624	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.414:26:7,7:7,1:1,14,3,8
chr6	7590653	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.522:19:3,7:6,3:0,9,1,9
chr6	7595241	.	AT	A,ATT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,31,27;MFRL=154,186,140;MMQ=60,60,60;MPOS=22,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.27,4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,5,5:0.111,0.139:38:14,1,2:13,4,2:28,0,9,1
chr6	7606255	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=106,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,29:0.517:56:12,17:15,12:18,9,24,5
chr6	7883507	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=160,114;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,0:7,3:0,12,0,3
chr6	8015821	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr6	8016089	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr6	8026577	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,7:0,0,12,5
chr6	8097494	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:7,2:16,0:18,6,1,1
chr6	8428071	.	CAT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=119,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr6	8428137	.	A	AAGT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=101,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,8:3,5:7,1,13,2
chr6	8430049	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=189,120;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:4,0,5,0
chr6	9900599	.	T	TGAG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.391:26:6,6:10,4:11,5,6,4
chr6	9908920	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:2,4:6,0:0,9,0,4
chr6	9939564	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=171,74;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,0:3,4:2,6,1,3
chr6	10529087	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,3,1
chr6	10529126	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=104,67;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:7,0:5,3:6,6,2,1
chr6	10626841	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr6	10695136	.	GTTTTTTT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=225,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=19,12;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr6	10724943	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=120,167;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,1:7,2:2,15,1,2
chr6	10729011	.	C	CACAGTTTGCCACTCTGGAAAAAATGTGGAAACGGGG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=193,172;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr6	10775530	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:8,2:7,0:12,5,1,1
chr6	10802045	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr6	10802101	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=115,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.664:19:4,3:2,9:5,1,10,3
chr6	10874318	.	A	AAGCAGTTTCTGAGAATGATTCC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,1:8,1:8,11,0,2
chr6	10874905	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,10:3,4:3,3,5,9
chr6	10882100	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	10887251	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0|1:10887251_T_C:10887251:0,0,11,0
chr6	10887253	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,6:0,4:0|1:10887251_T_C:10887251:0,0,11,0
chr6	10887276	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,12,4
chr6	10891651	.	ATT	A,AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32,33;MFRL=0,191,188;MMQ=60,60,60;MPOS=29,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,18,19;RU=T;STR;TLOD=8.11,4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,4:0.517,0.403:9:0,3,2:0,2,2:0,0,9,0
chr6	10891673	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=14,18;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:2,1:2,0:12,0,10,0
chr6	10927692	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	10931587	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr6	10955408	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=109.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,18:0,0,12,19
chr6	10961649	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.598:20:4,6:3,5:2,6,2,10
chr6	10983971	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:3,5:3,2:5,1,8,0
chr6	10984101	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=100,72;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.443:22:7,4:4,4:8,4,5,5
chr6	10990493	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,1:1,4:3,0,4,1
chr6	10995489	.	C	CTGA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.388:3:1,1:1,0:0|1:10995489_C_CTGA:10995489:0,2,0,1
chr6	10995490	.	C	CAGAAGATTGTATAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:10995489_C_CTGA:10995489:0,2,0,1
chr6	11005842	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=202,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr6	11011074	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=83,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr6	11103888	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:2,1:1,2:3,0,3,1
chr6	11105057	.	G	GTGTATTT	.	.	DP=106;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=128,57;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:102,2:0.028:104:48,2:49,0:0|1:11105057_G_GTGTATTT:11105057:51,51,1,1
chr6	11105060	.	T	TTTGGGGCTTAAGAGTAGA	.	.	DP=107;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=128,57;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:102,2:0.028:104:49,2:44,0:0|1:11105057_G_GTGTATTT:11105057:51,51,1,1
chr6	11185967	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	11192575	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=87,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:2,7:12,5:5,10,8,5
chr6	11538455	.	AGCC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=190,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr6	11538534	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:3,2,2,0
chr6	11538564	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=161,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:3,3,2,0
chr6	11714639	.	GA	G,GAA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,32,33;MFRL=186,149,144;MMQ=60,60,60;MPOS=20,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.28,10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,8:0.156,0.585:13:2,2,3:0,0,4:2,1,8,2
chr6	11714668	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=143,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.106:42:16,0:15,0:26,12,4,0
chr6	11714681	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=33,18;MFRL=138,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.091:49:18,0:19,0:29,16,4,0
chr6	11714806	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,16:0.386:42:13,9:13,7:8,18,1,15
chr6	11723538	.	AC	GC,GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33,34;MFRL=0,152,127;MMQ=60,60,60;MPOS=12,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.58,25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,9:0.421,0.528:16:0,2,5:0,5,2:0,0,13,3
chr6	11770334	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=120,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.546:13:1,3:3,4:1,5,0,7
chr6	11770398	.	AC	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11770398_AC_TG:11770398:0,1,0,1
chr6	11770401	.	A	AAGCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:11770398_AC_TG:11770398:0,1,0,1
chr6	12016009	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	12020672	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=157,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,3:9,0:1,19,1,2
chr6	12120090	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.574:26:2,8:8,6:10,1,13,2
chr6	12120445	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=132,245;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,2:5,0:10,6,1,1
chr6	12123232	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:2,5:2,7:2,2,6,6
chr6	12292772	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,7:0,5:0,0,2,11
chr6	12749758	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:12749758_C_A:12749758:0,3,0,1
chr6	12749762	.	C	CCAACACACACCCACA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:12749758_C_A:12749758:0,3,0,1
chr6	12749786	.	C	CAAGACAAGGCCTCACACTGTCGCCAGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	12933994	.	CT	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=148,63;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:15,0:27,3:19,23,0,3
chr6	13182685	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	13182995	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr6	13230558	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=172,122;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.243:6:4,1:1,0:0|1:13230558_T_A:13230558:1,4,0,1
chr6	13230561	.	A	ACTGC	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=172,122;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.243:6:3,1:1,0:0|1:13230558_T_A:13230558:1,4,0,1
chr6	13230566	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=172,149;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr6	13230581	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=203,149;MMQ=40,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.243:6:4,1:1,0:0,5,0,1
chr6	13278648	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=87.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,0,24
chr6	13316909	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=109,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,7:2,3:3,2,3,7
chr6	13592135	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:6,7:15,4:5,16,1,10
chr6	13601112	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=123,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.377:19:5,1:6,5:8,4,2,5
chr6	13604852	.	C	CCACATCCTGCTGATTGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=173,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	13620877	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr6	13638243	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	13639700	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=212,175;MMQ=50,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,6:1,2:2,0,8,0
chr6	13790955	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=155,99;MMQ=58,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.215:15:1,2:11,0:11,1,2,1
chr6	13800626	.	TAA	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=A;STR;TLOD=88.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,27:0.550:49:12,12:10,15:3,19,1,26
chr6	13814163	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	13814340	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	13814529	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	13978614	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr6	13979526	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr6	14134083	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	15374508	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr6	15374544	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr6	15468722	.	AGGGTGAG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	15497422	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,3,16
chr6	15511429	.	C	CCCAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr6	15513399	.	CGT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GT;STR;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	15513744	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr6	15593240	.	T	C	.	.	DP=131;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=430.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,122:0.992:122:0,60:0,59:0,0,92,30
chr6	15593319	.	GA	G,GAA	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=17,18,32;MFRL=152,140,153;MMQ=60,60,60;MPOS=21,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=18.53,3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,13,5:0.354,0.168:32:0,3,0:4,3,3:2,12,3,15
chr6	15615712	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=232,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:15615712_A_T:15615712:0,1,0,1
chr6	15615714	.	TTCACATTG	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,33;MFRL=241,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:15615712_A_T:15615712:0,2,0,1
chr6	15651642	.	GA	G,TA	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=19,18,10;MFRL=158,170,145;MMQ=60,60,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.72,4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,12,11:0.354,0.199:36:4,4,1:1,1,0:5,8,3,20
chr6	16326788	.	C	CTCATT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=127,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:8,10,1,1
chr6	16326790	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=129,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:11,1:6,2:8,9,1,2
chr6	17282949	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	17426720	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=176,113;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:2,2:9,0:12,0,2,0
chr6	17426734	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.191:16:3,1:8,2:13,0,3,0
chr6	17426756	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=146,108;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.112:24:9,2:12,0:20,2,1,1
chr6	17539418	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	17541406	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=166,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:2,8,0,2
chr6	17541463	.	GATTT	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=110,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr6	17541469	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=110,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:17541469_T_TAA:17541469:0,2,0,1
chr6	17541475	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=110,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:17541469_T_TAA:17541469:0,2,0,1
chr6	17541478	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=110,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:17541469_T_TAA:17541469:0,2,0,1
chr6	17543036	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:1,3:5,6:6,1,8,1
chr6	17602797	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=203,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr6	17605179	.	AG	GA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,2401;MMQ=60,23;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,2:12,0:13,15,0,2
chr6	17606158	.	GC	CA	.	.	DP=55;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=139,128;MMQ=60,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,2:0.055:52:20,1:26,1:0|1:17606158_GC_CA:17606158:31,19,2,0
chr6	17606162	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=139,128;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,2:0.061:47:16,1:27,1:0|1:17606158_GC_CA:17606158:27,18,2,0
chr6	17606169	.	T	A	.	.	DP=56;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=140,128;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,3:0.072:53:20,2:29,1:0|1:17606158_GC_CA:17606158:26,24,2,1
chr6	17606184	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=142,128;MMQ=60,41;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.084:56:21,3:31,1:24,28,2,2
chr6	17608624	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=159,182;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:8,2:0|1:17608624_C_T:17608624:1,16,0,2
chr6	17608634	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=157,182;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:17608624_C_T:17608624:0,10,0,2
chr6	17608637	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=157,182;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:17608624_C_T:17608624:0,10,0,2
chr6	17617026	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=227,166;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	17633061	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,4,10
chr6	17669256	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=121,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.328:10:4,0:3,0:0|1:17669256_G_T:17669256:3,4,0,3
chr6	17669262	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=107,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.623:6:0,2:2,0:0|1:17669256_G_T:17669256:1,1,0,4
chr6	17675328	.	G	GCCAGGA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:3,8,0,2
chr6	17675386	.	GA	G,GAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33,34;MFRL=181,154,163;MMQ=60,60,60;MPOS=11,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.79,6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.297,0.307:10:1,1,2:3,2,1:4,0,6,0
chr6	17764279	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:8,0,4,0
chr6	17777614	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=99,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.904:16:0,4:1,8:1,1,3,11
chr6	17777654	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=166,167;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,1:4,4:0,11,0,5
chr6	17779922	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=18,17;MFRL=165,63;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.195:24:3,0:1,0:2,18,1,3
chr6	17781216	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:17781216_A_T:17781216:0,2,0,1
chr6	17781221	.	A	AGTTCCCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=179,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:17781216_A_T:17781216:0,2,0,1
chr6	17785948	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	17790191	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.262:36:11,6:16,3:5,22,2,7
chr6	17794774	.	T	TA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:2,5:2,3:3,1,4,5
chr6	17799766	.	TG	CA,CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35,28;MFRL=0,177,170;MMQ=60,60,60;MPOS=18,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.82,17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,6:0.385,0.538:10:0,2,4:0,2,2:0,0,0,10
chr6	17805649	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,15;MFRL=131,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:1,0:0|1:17805649_G_T:17805649:5,1,2,0
chr6	17805651	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=131,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:0|1:17805649_G_T:17805649:5,1,2,0
chr6	17809165	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,31;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:17809165_C_A:17809165:0,2,0,1
chr6	17809170	.	TC	GG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:17809165_C_A:17809165:0,2,0,1
chr6	17809199	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	17817235	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	17817519	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=174,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:5,6:2,7:0,7,1,12
chr6	17834316	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	17834328	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	17834331	.	G	GATTTGGCTA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=136,172;MMQ=54,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	17834347	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=214,163;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:17834347_C_A:17834347:0,1,0,1
chr6	17834348	.	C	CAGACTATTGATAACTGCTTAAGAGGG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,36;MFRL=214,163;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:17834347_C_A:17834347:0,1,0,1
chr6	17855864	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,0,2
chr6	17987661	.	C	G	.	.	DP=123;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=87.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,33:0.286:117:42,21:41,12:44,40,17,16
chr6	18122506	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=226,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,0:0,4:0,2,0,4
chr6	18122639	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	18133977	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=170,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:10,0,2,0
chr6	18134008	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=174,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.658:13:0,2:4,5:4,0,6,3
chr6	18134021	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,5:0,15:0,0,11,10
chr6	18139964	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=50.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.962:19:0,9:0,7:0,0,1,18
chr6	18143769	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.632:14:1,2:3,6:4,1,9,0
chr6	18148019	.	G	A	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=130.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,43:0.738:58:8,22:6,21:11,4,35,8
chr6	18148155	.	GA	G,GAA	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=20,34,19;MFRL=141,150,113;MMQ=60,60,60;MPOS=19,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=11.79,3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,8,6:0.182,0.118:45:9,3,2:8,3,1:1,30,1,13
chr6	18148247	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=201,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:1,5,0,6
chr6	18149318	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:18,1:15,1:10,23,0,2
chr6	18161563	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,3:7,3:6,5,6,0
chr6	18161646	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:6,3:10,0:3,13,1,2
chr6	18201961	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr6	18208319	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=177,52490574;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:5,3,1,1
chr6	18215166	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:2,3,3,0
chr6	18222102	.	C	CTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,3:3,2:10,2,5,0
chr6	18226340	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.337:33:12,6:10,4:22,0,11,0
chr6	18236932	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=203,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	18256497	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:16,2:24,1:42,0,3,0
chr6	18256507	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.076:50:19,3:28,0:47,0,3,0
chr6	18256513	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:21,3:27,0:48,0,3,0
chr6	18258516	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,7:5,4:9,1,9,2
chr6	18399750	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:3,0,3,1
chr6	20110043	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	20128852	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr6	20144637	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr6	20212469	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=207,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:3,5,2,4
chr6	20481678	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr6	20546826	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=191,193;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr6	20546845	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=236,137;MMQ=51,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr6	20548795	.	CT	C,CTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32,33;MFRL=156,81,171;MMQ=60,60,60;MPOS=8,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.32,8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,6:0.150,0.265:23:6,3,3:4,0,2:13,1,9,0
chr6	20739907	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr6	20758704	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr6	20758943	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr6	20781282	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	21065449	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:8,3:7,2:3,12,2,3
chr6	21230987	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,31;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21230987_G_A:21230987:1,0,1,0
chr6	21230992	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:21230987_G_A:21230987:1,0,1,0
chr6	21231002	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:21230987_G_A:21230987:2,0,1,0
chr6	21596241	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=169,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	21596247	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:21596247_GA_G:21596247:0,2,0,1
chr6	21596256	.	A	T,G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,30,31;MFRL=181,169,143;MMQ=60,60,60;MPOS=6,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,0:1,0,1:0,1,0,2
chr6	21596257	.	AACG	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=162,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:21596247_GA_G:21596247:0,2,0,1
chr6	21596258	.	A	ACAAGC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,24;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	21597753	.	CTTTTTTTT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=102,155;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;RPA=19,11;RU=T;STR;TLOD=83.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,25:0.847:30:0,5:1,4:2,3,14,11
chr6	22570064	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=213,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:2,3:2,2:3,1,5,1
chr6	22571662	.	TG	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=132,34;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:11,2:15,0:18,8,1,1
chr6	24174955	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,6:5,1:14,3,7,0
chr6	24302087	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,17:0,18:0,0,14,21
chr6	24353742	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr6	24358356	.	GCACA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=120,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=CA;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.182:14:4,1:3,1:9,3,2,0
chr6	24403196	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=177,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr6	24412431	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,35,33,33;MFRL=168,100,121,171;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,13,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.18,4.64,4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:14,2,4,4:0.097,0.149,0.173:24:7,2,2,3:7,0,1,1:14,0,8,2
chr6	24429424	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	24445718	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.499:12:1,6:5,0:0|1:24445718_A_G:24445718:5,1,4,2
chr6	24445723	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=118,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,7:0.533:13:6,2:0,5:1|0:24445718_A_G:24445718:3,3,6,1
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chr6	24554672	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr6	24556759	.	GGC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=183,246;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr6	24559433	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr6	24578272	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=182,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr6	24580185	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.460:20:5,4:5,5:1,10,0,9
chr6	24583804	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.668:22:3,9:4,6:4,3,12,3
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chr6	24596930	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=193,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24596930_CT_C:24596930:0,1,0,1
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chr6	24654553	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=175,244;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr6	24657964	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=86.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,23,0
chr6	24667662	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,1,9
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chr6	24687999	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=163,175;MMQ=53,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=136.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,37:0.927:39:2,24:0,12:0,2,0,37
chr6	24688064	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=226,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	24698215	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,12,10
chr6	24714681	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.841:14:2,6:0,6:0,2,0,12
chr6	24718676	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=175,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:2,4:6,1,7,0
chr6	24806594	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=115,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:5,3,2,1
chr6	24806752	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=200,95;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	24806777	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=267,95;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	24809853	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr6	24809881	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,0:1,3:5,0,3,0
chr6	24828318	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:2,3:7,1:9,1,3,1
chr6	24828560	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=158,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:0,8,1,1
chr6	24832387	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr6	24836161	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:0,8,0,5
chr6	24839746	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=124,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,14:0.304:47:17,6:16,8:23,10,10,4
chr6	24875830	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:1,0,4,0
chr6	25084691	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.291:29:9,4:10,4:16,5,7,1
chr6	25084718	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.263:35:13,3:13,5:17,9,7,2
chr6	25084839	.	G	GTTCT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=161,53;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:8,0:17,2:2,23,1,1
chr6	25086958	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0|1:25086958_T_C:25086958:4,0,4,0
chr6	25086968	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,6:0.539:11:3,1:1,5:1|0:25086958_T_C:25086958:5,0,5,1
chr6	25097450	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,37;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:12,1:10,4:5,17,0,5
chr6	25106745	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:9,8:10,4:6,13,2,10
chr6	25106783	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:5,4:6,1:0,11,0,5
chr6	25110097	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr6	25115176	.	CGTTTTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTTTTT;STR;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.590:15:2,6:2,3:6,0,8,1
chr6	25115397	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=229,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr6	25280119	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=126,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,8:3,4:1,5,1,11
chr6	25285026	.	C	CT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,13:0.343:39:12,6:12,6:26,0,12,1
chr6	25420400	.	TTGA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGA;STR;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:6,4:4,6:5,7,4,6
chr6	25426640	.	ATTT	A,AT,ATT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31,29,32;MFRL=0,127,145,168;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,5,12;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,14,15,16;RU=T;STR;TLOD=7.31,3.04,21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,4,3,9:0.217,0.202,0.535:16:0,2,0,5:0,2,3,4:0,0,15,1
chr6	25435654	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	25450026	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr6	25450970	.	TCCTCCCTCCCTTCCTCCCTCCCTTCCTCCCTCC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTCCCTCCCTTCCTCCCTCCCTTCCTCCCTCC;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.412:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr6	25471559	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,14;MFRL=188,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.448:5:2,0:0,0:0,3,0,2
chr6	25472787	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=134,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:1,6,0,6
chr6	25492296	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,7:0,0,3,14
chr6	25509976	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,4:2,5:0,4,1,8
chr6	25510051	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=219,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:25510051_A_G:25510051:0,1,0,2
chr6	25510058	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=219,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:25510051_A_G:25510051:0,1,0,2
chr6	25510648	.	TA	CA,CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30,31;MFRL=0,163,174;MMQ=60,60,60;MPOS=6,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=12.07,6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,3:0.536,0.363:7:0,3,3:0,1,0:0,0,7,0
chr6	25511008	.	C	CAT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=140,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:6,10:10,5:3,13,5,10
chr6	25516126	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=142,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr6	25516158	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	25554180	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	25557132	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.298:15:1,0:6,1:1,10,0,4
chr6	25557148	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.374:11:4,0:3,3:0|1:25557148_T_TA:25557148:0,7,0,4
chr6	25557149	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.653:13:2,4:1,4:0|1:25557148_T_TA:25557148:0,4,0,9
chr6	25605091	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,3:0,11:0,0,8,7
chr6	25606520	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:7,0:5,3:1,11,0,3
chr6	25610203	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:3,1,5,0
chr6	25652568	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr6	25653566	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	25661887	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=70.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,23:0.687:33:8,13:2,10:2,8,7,16
chr6	25682262	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,3,12
chr6	25689383	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=189,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr6	25689487	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:2,3,0,3
chr6	25726666	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=202,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,4:6,1:5,5,1,4
chr6	25727013	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727013_A_T:25727013:0,0,0,1
chr6	25727017	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727013_A_T:25727013:0,0,0,1
chr6	25727018	.	G	GTCTCGTCCTTTTCACCTCTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727013_A_T:25727013:0,0,0,1
chr6	25727656	.	C	CTGTA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727656_C_CTGTA:25727656:0,0,0,1
chr6	25727665	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727656_C_CTGTA:25727656:0,0,0,1
chr6	25727668	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:25727656_C_CTGTA:25727656:0,0,0,1
chr6	25770239	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=268,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr6	25770707	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=80,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,5:2,5:2,4,2,8
chr6	25778055	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	25798932	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr6	25801057	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr6	25813150	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.957:19:0,10:0,9:0,0,9,10
chr6	25849620	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=120,139;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.629:17:5,4:1,6:5,1,8,3
chr6	25862208	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:25862208_G_C:25862208:0,2,0,1
chr6	25862220	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:25862208_G_C:25862208:2,2,0,1
chr6	25914901	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,101;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,2:0,4:0,2,1,5
chr6	25916979	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=105,148;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:8,2:4,6:4,8,5,3
chr6	25918688	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:12,12:3,9:11,4,15,6
chr6	25924134	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:0,2,1,4
chr6	25924158	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr6	25972411	.	AGT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:1,1:2,0:0|1:25972411_AGT_A:25972411:0,3,0,1
chr6	25972414	.	AATGTT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:25972411_AGT_A:25972411:0,3,0,1
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chr6	26597384	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.534:37:6,9:11,9:5,12,7,13
chr6	27114892	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,25:0.620:40:3,14:12,11:13,2,19,6
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chr6	27218668	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,13;MFRL=262,230;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27218664_T_A:27218664:0,1,1,0
chr6	27218671	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,13;MFRL=262,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27218664_T_A:27218664:0,1,1,0
chr6	27218678	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,10;MFRL=262,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27218664_T_A:27218664:0,1,1,0
chr6	27218682	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,13;MFRL=262,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27218664_T_A:27218664:0,1,1,0
chr6	27218684	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,18;MFRL=262,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27218664_T_A:27218664:0,1,1,0
chr6	27220519	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr6	27279774	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,120;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:1,5:3,2:2,2,3,5
chr6	27293049	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	27293697	.	AC	GT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr6	27293719	.	G	GCACCATTGAGCACTGAGTGA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=112,119;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	27293723	.	C	CAG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:27293723_C_CAG:27293723:0,0,0,1
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chr6	28359307	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.317:39:16,5:11,7:15,12,7,5
chr6	28366262	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=239,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
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chr6	28554543	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=11,33;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,0:0,3:0,1,0,3
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chr6	28876961	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,30;MFRL=228,161;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:28876957_C_T:28876957:0,2,0,1
chr6	28891458	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,5:2,3:0,5,0,8
chr6	28911802	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.655:27:5,8:4,10:1,8,4,14
chr6	28963248	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:1,6:4,4:4,1,7,3
chr6	29011960	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,4,1
chr6	29068622	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	29068759	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=151.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,16:0,20:0|1:29068759_C_A:29068759:0,0,33,8
chr6	29068766	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,21:0.498:42:12,9:9,11:0|1:29068759_C_A:29068759:18,3,15,6
chr6	29069016	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,15:0.382:40:12,8:12,7:12,13,6,9
chr6	29069264	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=129,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:7,6:8,6:9,6,5,7
chr6	29069299	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=134,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:9,3:9,5:11,7,3,5
chr6	29069337	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=111.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,23:0,9:0,0,19,14
chr6	29079992	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=151,89;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.069:55:26,3:25,0:30,22,2,1
chr6	29080344	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,22:0.594:37:9,11:5,11:0|1:29080344_G_A:29080344:11,4,14,8
chr6	29080349	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=153.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0|1:29080344_G_A:29080344:0,0,25,12
chr6	29080450	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=101.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.972:32:0,15:0,17:0,0,13,19
chr6	29141632	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=144,166;MMQ=40,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,4:3,2:2,7,1,5
chr6	29141742	.	CA	TG	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=149,95;MMQ=50,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,2:10,0:16,3,1,1
chr6	29141743	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,50;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,18,4
chr6	29141772	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=99.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,19:0,13:0,0,23,9
chr6	29142054	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=126.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,18:0,13:0|1:29142054_C_G:29142054:0,0,18,14
chr6	29142064	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=158,132;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,9:0.304:31:9,7:10,2:0|1:29142054_C_G:29142054:10,12,6,3
chr6	29230577	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:14,2:2,1:8,8,1,2
chr6	29230683	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr6	29230806	.	CCCTTAT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0|1:29230806_CCCTTAT_C:29230806:0,0,0,1
chr6	29230815	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29230806_CCCTTAT_C:29230806:0,0,0,1
chr6	29231172	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	29231831	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=119,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:9,7:6,5:9,6,5,7
chr6	29274486	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,5:2,1:7,2,4,2
chr6	29323076	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.641:23:4,9:4,6:4,4,7,8
chr6	29323259	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr6	29323838	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:2,1,3,4
chr6	29342775	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,4:3,6:3,4,5,5
chr6	29342825	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,5:5,2:3,6,3,4
chr6	29364615	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=80.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,4,18
chr6	29364643	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr6	29364787	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=65.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,11:0,0,11,8
chr6	29364815	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr6	29364835	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,9:0,0,10,9
chr6	29364838	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=130,129;MMQ=56,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:6,0:3,9:4,5,5,4
chr6	29364951	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,10,7
chr6	29365241	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=124.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,19:0,15:0,0,13,21
chr6	29365423	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr6	29394427	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	29394474	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=153,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,2:1,7:2,0,8,1
chr6	29395057	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,4:2,5:5,3,2,7
chr6	29395104	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=104,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,2:1,8:2,1,2,8
chr6	29395499	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=130,165;MMQ=41,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,3:0,1:1,1,0,4
chr6	29408090	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=210,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:4,2,2,3
chr6	29408270	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:0|1:29408270_C_T:29408270:0,5,3,3
chr6	29408275	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,1:1,3:0|1:29408270_C_T:29408270:0,4,3,2
chr6	29408278	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0|1:29408270_C_T:29408270:0,4,3,2
chr6	29408397	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,7:4,1:7,4,7,1
chr6	29408476	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.721:23:3,10:3,7:1,5,7,10
chr6	29408528	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:2,7:2,5:1,3,6,6
chr6	29408554	.	AC	CA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=106,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:4,4:2,3,6,3
chr6	29430170	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=96,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:0,6:7,4:4,3,5,5
chr6	29431628	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=154,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,1:2,6:2,2,2,5
chr6	29431698	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=205,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:1,3:1,2:0,2,1,5
chr6	29454489	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:2,1,4,1
chr6	29455098	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=86,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:6,2:7,4:9,4,2,4
chr6	29455599	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr6	29523646	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:4,1,6,2
chr6	29523670	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=128,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,15:0.762:19:2,5:2,9:0|1:29523670_C_A:29523670:2,2,12,3
chr6	29523676	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,16:0.774:20:1,5:2,10:0|1:29523670_C_A:29523670:2,2,13,3
chr6	29527599	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,35;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.799:6:0,2:0,3:0,1,0,5
chr6	29555681	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,7:0,0,19,0
chr6	29555809	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=166.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,25:0,21:0,0,26,20
chr6	29555864	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=131.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,21:0,19:0,0,17,25
chr6	29556759	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=84.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,32:0.546:58:14,12:12,17:9,17,15,17
chr6	29571553	.	G	GAGTTCTTGATGTTGAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=170,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	29574257	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,2:12,0:8,17,0,2
chr6	29574595	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=15,32;MFRL=148,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:0,3:1,0,8,0
chr6	29574631	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=182,121;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:5,3:2,0:6,1,1,2
chr6	29575003	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr6	29575089	.	G	GGT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29575089_G_GGT:29575089:0,0,0,1
chr6	29575091	.	G	GGATCGGAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29575089_G_GGT:29575089:0,0,0,1
chr6	29576393	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,11:0,0,10,12
chr6	29576590	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=212,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:29576590_G_A:29576590:0,1,1,1
chr6	29576592	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=212,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:29576590_G_A:29576590:0,1,1,1
chr6	29577200	.	G	A,GCAACGTTGGA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,32,33;MFRL=179,126,124;MMQ=60,60,60;MPOS=9,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.34,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.285,0.353:3:1,1,1:0,0,0:0,1,0,2
chr6	29577201	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:29577201_A_AC:29577201:1,2,0,1
chr6	29577204	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:29577201_A_AC:29577201:0,2,0,1
chr6	29577206	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=179,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:29577201_A_AC:29577201:0,1,0,1
chr6	29577218	.	G	GCACAGA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	29578871	.	GTTGTA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=189,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,1:1,0:0|1:29578871_GTTGTA_G:29578871:0,2,0,1
chr6	29578880	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=189,212;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,1:1,0:0|1:29578871_GTTGTA_G:29578871:0,2,0,1
chr6	29580265	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,1:2,0,2,1
chr6	29580285	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=-1073741820;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:1,0:0|1:29580285_AG_CC:29580285:1,3,2,0
chr6	29580289	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:2,0:0|1:29580285_AG_CC:29580285:0,3,2,0
chr6	29580291	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,13;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,0:0|1:29580285_AG_CC:29580285:0,3,2,0
chr6	29580436	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=145,82;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:0,3,2,1
chr6	29581011	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=145,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:5,4:10,6:9,6,8,2
chr6	29581041	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=144,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.398:28:6,2:11,9:11,6,6,5
chr6	29581110	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,8:0.243:35:11,4:13,4:0|1:29581110_A_G:29581110:6,21,3,5
chr6	29581113	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,8:0.265:32:12,4:11,4:0|1:29581110_A_G:29581110:6,18,3,5
chr6	29590000	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr6	29591864	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:2,3,0,2
chr6	29600054	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=116,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,21:0.430:49:9,11:18,9:15,13,12,9
chr6	29600104	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.499:26:6,10:6,2:5,8,5,8
chr6	29625001	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=123,89;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:8,3:6,3:7,8,4,2
chr6	29627313	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:7,5:1,8:4,4,5,8
chr6	29627473	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,5:6,1:2,8,1,5
chr6	29634012	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,8,9
chr6	29635531	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=156,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:2,2,1,3
chr6	29638245	.	A	AAGGGAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,1:0,0:0|1:29638245_A_AAGGGAC:29638245:0,0,0,1
chr6	29638249	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:29638245_A_AAGGGAC:29638245:0,0,0,1
chr6	29639047	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,7:4,6:2,7,0,13
chr6	29641613	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,165;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:0,5,0,5
chr6	29691140	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,7:4,5:6,0,11,1
chr6	29691303	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,26:0.467:56:18,15:11,11:15,15,9,17
chr6	29691390	.	CT	GC	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,13:0,11:0,0,4,20
chr6	29691713	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=66.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.663:32:4,8:4,13:7,4,11,10
chr6	29691744	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,23:0.728:31:5,12:3,11:7,1,14,9
chr6	29691772	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.322:23:9,4:6,3:12,4,6,1
chr6	29691800	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.452:38:11,8:9,9:15,6,9,8
chr6	29691857	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,10:0.203:52:24,4:16,6:17,25,2,8
chr6	29692305	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	29692729	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.589:22:4,11:4,2:4,5,4,9
chr6	29693011	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=244.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,72:0.987:72:0,38:0,32:0,0,30,42
chr6	29693113	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,25:0.620:40:9,13:5,10:4,11,10,15
chr6	29694044	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:3,2:4,2:3,5,4,0
chr6	29694680	.	AA	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	29794860	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=20,31;MFRL=113,121;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,1:6,7:4,7,3,5
chr6	29794897	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr6	29794906	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr6	29794933	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr6	29795636	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=30,30;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:10,1:5,5:0|1:29795636_G_A:29795636:6,9,2,4
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chr6	29795720	.	A	G,C	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=0,32,32;MFRL=0,169,162;MMQ=60,60,21;MPOS=15,32;POPAF=7.30,7.30;TLOD=45.12,5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,14,2:0.798,0.150:16:0,7,0:0,5,2:0,0,5,11
chr6	29795724	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=169,162;MMQ=60,21;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:6,2:0|1:29795709_A_G:29795709:4,12,2,0
chr6	29795730	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=28,31;MFRL=169,162;MMQ=60,21;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:4,2:0|1:29795709_A_G:29795709:4,11,2,0
chr6	29795738	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=159,162;MMQ=60,21;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:29795709_A_G:29795709:3,7,2,0
chr6	29795740	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=159,162;MMQ=60,21;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:3,2:0|1:29795709_A_G:29795709:3,7,2,0
chr6	29795742	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=149,162;MMQ=60,21;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:0|1:29795709_A_G:29795709:3,6,2,0
chr6	29795747	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=149,162;MMQ=60,21;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:29795709_A_G:29795709:2,5,2,0
chr6	29795768	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=132,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:3,2,1,1
chr6	29795809	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=166,212;MMQ=52,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,1:6,2:5,5,2,1
chr6	29795993	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:12,5:10,2:12,10,5,2
chr6	29796103	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:9,2:7,3:0|1:29796103_T_C:29796103:6,10,0,5
chr6	29796115	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:8,1:3,3:0|1:29796103_T_C:29796103:5,6,0,4
chr6	29796126	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:3,1:3,3:0|1:29796103_T_C:29796103:3,5,1,3
chr6	29796152	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=175,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:2,4,3,1
chr6	29796257	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:6,1:0,2:3,3,2,1
chr6	29796306	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,21;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.296:14:8,0:2,3:4,6,1,3
chr6	29796311	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,13;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.367:13:3,1:3,1:4,4,0,5
chr6	29796327	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=140,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,0:3,5:4,6,1,4
chr6	29796640	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,1:2,1:0,3,0,2
chr6	29796685	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=217,240;MMQ=56,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr6	29797173	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=106,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.232:41:19,6:13,3:19,13,5,4
chr6	29797436	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,85;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.144:39:19,0:13,5:17,17,2,3
chr6	29797459	.	TG	CC	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,71;MMQ=60,54;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.149:30:14,0:10,3:6,20,2,2
chr6	29797553	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:15,8:3,6:8,10,12,2
chr6	29797639	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,15:0.279:54:18,8:18,5:21,18,5,10
chr6	29797696	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.203:32:8,2:16,4:6,20,1,5
chr6	29797782	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.235:11:3,0:4,2:0,9,0,2
chr6	29798140	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=123,142;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.417:36:7,8:14,6:11,10,8,7
chr6	29910225	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=14;MBQ=33,36;MFRL=161,202;MMQ=60,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,3:1,2:6,2,6,0
chr6	29910237	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=32,33;MFRL=136,202;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:8,3:2,3:0|1:29910237_C_T:29910237:10,2,6,0
chr6	29910245	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=14;MBQ=34,34;MFRL=129,202;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:10,3:3,3:0|1:29910237_C_T:29910237:11,2,6,0
chr6	29910265	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=14;MBQ=27,31;MFRL=129,198;MMQ=60,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.249:22:13,2:4,3:0|1:29910265_G_A:29910265:12,5,5,0
chr6	29910274	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=14;MBQ=28,33;MFRL=129,198;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.161:23:14,1:5,1:0|1:29910265_G_A:29910265:12,8,3,0
chr6	29910276	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=14;MBQ=32,28;MFRL=134,143;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:7,9:2,3:7,3,7,6
chr6	29910286	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=107.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,15:0,10:0,0,20,10
chr6	29910289	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=22,33;MFRL=126,162;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,4:0.147:32:16,3:8,1:0|1:29910289_G_C:29910289:17,11,3,1
chr6	29910294	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=14;MBQ=28,32;MFRL=126,154;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:16,3:10,1:0|1:29910289_G_C:29910289:21,11,5,1
chr6	29910302	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=14;MBQ=26,30;MFRL=136,154;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,6:0.166:40:19,5:14,1:0|1:29910289_G_C:29910289:23,11,5,1
chr6	29910336	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=14;MBQ=32,26;MFRL=144,148;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,9:0.208:46:15,8:21,1:0|1:29910336_C_G:29910336:25,12,4,5
chr6	29910340	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=14;MBQ=31,27;MFRL=140,154;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,10:0.220:48:16,9:19,1:0|1:29910336_C_G:29910336:25,13,5,5
chr6	29910358	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=14;MBQ=33,28;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,11:0.244:46:19,7:16,3:19,16,7,4
chr6	29910371	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=14;MBQ=29,31;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.476:38:11,9:7,9:7,13,10,8
chr6	29910402	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=25;MBQ=32,31;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.232:41:17,5:15,4:10,22,3,6
chr6	29910419	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=25;MBQ=32,30;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:8,8:10,7:4,14,7,11
chr6	29910420	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=25;MBQ=33,34;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=69.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.488:37:8,10:6,8:5,14,7,11
chr6	29910429	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=25;MBQ=29,33;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.296:31:9,4:12,4:8,14,2,7
chr6	29910439	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=25;MBQ=33,32;MFRL=159,160;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.200:33:13,2:12,4:9,18,2,4
chr6	29910444	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=25;MBQ=32,33;MFRL=170,160;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.184:36:14,1:11,4:10,20,2,4
chr6	29910447	.	CAA	C	.	.	DP=34;ECNT=25;MBQ=33,30;MFRL=171,160;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.139:34:14,1:13,3:10,20,2,2
chr6	29910451	.	G	GGC	.	.	DP=34;ECNT=25;MBQ=31,33;MFRL=170,160;MMQ=60,47;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:12,1:13,3:9,20,2,2
chr6	29910457	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=25;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=137.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,9:0,16:0,0,12,19
chr6	29910460	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=25;MBQ=30,28;MFRL=169,168;MMQ=48,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,20:0.677:29:2,7:4,12:4,5,8,12
chr6	29910468	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=25;MBQ=34,29;MFRL=169,166;MMQ=45,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.571:26:4,5:6,7:6,5,5,10
chr6	29910473	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=25;MBQ=34,33;MFRL=168,165;MMQ=42,44;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:6,2:8,6:7,7,4,4
chr6	29910478	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=25;MBQ=28,30;MFRL=190,170;MMQ=44,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=81.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.870:21:1,6:1,11:2,0,8,11
chr6	29910482	.	G	T,A	.	.	DP=21;ECNT=25;MBQ=32,30,33;MFRL=190,168,170;MMQ=44,39,40;MPOS=26,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=45.88,25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,12,7:0.542,0.333:21:1,4,2:1,5,5:2,0,8,11
chr6	29910496	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=25;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,11:0,0,8,12
chr6	29910507	.	CA	TG	.	.	DP=24;ECNT=25;MBQ=31,28;MFRL=171,186;MMQ=40,37;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:1,8:6,7:5,2,9,6
chr6	29910508	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=25;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.961:24:0,9:0,13:0,0,15,9
chr6	29910522	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=25;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,10:0,0,15,3
chr6	29910527	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=25;MBQ=34,28;MFRL=181,171;MMQ=40,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.322:20:8,0:6,5:11,3,4,2
chr6	29910557	.	TT	AC	.	.	DP=50;ECNT=25;MBQ=32,31;MFRL=171,168;MMQ=51,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=64.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.500:46:10,11:13,12:18,5,16,7
chr6	29910558	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=25;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,22:0,25:0,0,35,13
chr6	29910581	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=25;MBQ=31,34;MFRL=170,164;MMQ=52,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,14:0.208:70:26,7:28,6:38,18,13,1
chr6	29910583	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=25;MBQ=32,31;MFRL=170,164;MMQ=52,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,14:0.205:71:25,7:29,7:38,19,13,1
chr6	29910586	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=25;MBQ=33,34;MFRL=170,164;MMQ=52,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,14:0.205:71:27,7:30,7:38,19,13,1
chr6	29910604	.	C	A	.	.	DP=75;ECNT=25;MBQ=31,31;MFRL=162,158;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,14:0.197:74:30,5:30,8:43,17,10,4
chr6	29910640	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=19;MBQ=32,32;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=105.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,37:0.500:74:17,21:19,14:25,12,29,8
chr6	29910679	.	G	A	.	.	DP=99;ECNT=19;MBQ=28,30;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=158.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,60:0.626:95:18,31:17,24:20,15,39,21
chr6	29910716	.	C	G	.	.	DP=89;ECNT=19;MBQ=33,32;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,23:0.292:80:30,13:27,9:29,28,9,14
chr6	29910717	.	A	T	.	.	DP=89;ECNT=19;MBQ=32,31;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=241.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,59:0.715:82:13,29:10,26:9,14,30,29
chr6	29910719	.	G	C	.	.	DP=81;ECNT=19;MBQ=34,34;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=239.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,58:0.711:81:13,29:10,27:9,14,30,28
chr6	29910725	.	C	G	.	.	DP=85;ECNT=19;MBQ=29,33;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,22:0.264:85:28,11:30,10:31,32,9,13
chr6	29910730	.	T	A	.	.	DP=78;ECNT=19;MBQ=31,32;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,21:0.275:78:27,11:29,10:28,29,8,13
chr6	29910742	.	G	C	.	.	DP=69;ECNT=19;MBQ=33,33;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,17:0.254:69:23,8:26,8:21,31,6,11
chr6	29910759	.	T	C,A	.	.	DP=59;ECNT=19;MBQ=29,29,31;MFRL=0,160,163;MMQ=60,60,60;MPOS=13,7;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=218.11,21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,51,7:0.839,0.129:59:1,16,5:0,30,1:1,0,19,39
chr6	29910761	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=19;MBQ=35,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=252.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,57:0.967:58:1,22:0,29:1,0,19,38
chr6	29910767	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=19;MBQ=33,28;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,6:0.123:55:16,2:31,1:15,34,2,4
chr6	29910770	.	ACCC	A	.	.	DP=53;ECNT=19;MBQ=30,30;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.073:53:16,2:27,1:15,35,1,2
chr6	29910774	.	TG	T	.	.	DP=51;ECNT=19;MBQ=31,30;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,3:0.075:51:15,2:28,1:14,34,1,2
chr6	29910779	.	G	GCTCC	.	.	DP=52;ECNT=19;MBQ=32,28;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:17,2:29,1:13,34,1,2
chr6	29910820	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=19;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=184.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,20:0,16:0,0,6,36
chr6	29910834	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=19;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=130.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,19:0,8:0,0,4,26
chr6	29910839	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=194,184;MMQ=46,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.564:28:7,10:5,5:4,8,0,16
chr6	29910852	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=19;MBQ=32,35;MFRL=209,191;MMQ=48,47;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,3:9,0:1,21,3,0
chr6	29910861	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=19;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=105.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,14:0,9:0,0,6,19
chr6	29910947	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=14;MBQ=30,31;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.236:35:14,3:12,4:17,10,6,2
chr6	29910970	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=14;MBQ=33,32;MFRL=182,631;MMQ=60,28;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.285:35:15,5:10,3:19,6,7,3
chr6	29910984	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=32,30;MFRL=179,631;MMQ=60,28;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.311:32:14,6:7,2:16,6,6,4
chr6	29911000	.	T	G,C	.	.	DP=24;ECNT=14;MBQ=0,24,29;MFRL=0,163,179;MMQ=60,34,60;MPOS=4,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.57,70.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,20:0.173,0.789:24:0,2,11:0,0,6:0,0,15,9
chr6	29911003	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=14;MBQ=33,31;MFRL=190,179;MMQ=51,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.595:21:4,8:3,4:6,3,7,5
chr6	29911030	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=14;MBQ=20,26;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.640:26:1,8:5,4:6,3,9,8
chr6	29911056	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=31,33;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.280:31:10,4:8,5:12,10,4,5
chr6	29911064	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=14;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=141.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,16:0,14:0,0,19,14
chr6	29911069	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=14;MBQ=31,20;MFRL=171,97;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:13,2:9,6:16,7,4,5
chr6	29911077	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=14;MBQ=20,33;MFRL=96,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,25:0.703:35:3,14:7,10:4,6,18,7
chr6	29911114	.	GG	AC	.	.	DP=35;ECNT=14;MBQ=29,28;MFRL=171,101;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:15,3:8,6:12,11,4,6
chr6	29911119	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=14;MBQ=33,30;MFRL=171,118;MMQ=60,51;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.333:34:15,6:8,5:12,11,5,6
chr6	29911149	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=14;MBQ=33,33;MFRL=141,165;MMQ=52,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,31:0.680:45:7,17:6,13:9,5,17,14
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chr6	29911228	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=14;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=187.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,43:0.978:43:0,17:0,20:0|1:29911203_A_C:29911203:0,0,22,21
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chr6	29911326	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=14;MBQ=32,32;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,16:0.380:42:15,8:9,6:0|1:29911203_A_C:29911203:6,20,2,14
chr6	29911344	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=14;MBQ=34,29;MFRL=150,146;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.142:33:19,3:8,1:0|1:29911203_A_C:29911203:5,24,0,4
chr6	29911360	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=14;MBQ=31,32;MFRL=152,138;MMQ=60,42;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:13,2:8,1:0|1:29911203_A_C:29911203:1,21,0,3
chr6	29911367	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=33,31;MFRL=209,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:6,4:4,3:0|1:29911203_A_C:29911203:0,11,1,6
chr6	29911388	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=14;MBQ=34,30;MFRL=213,173;MMQ=60,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:4,1:0|1:29911203_A_C:29911203:0,8,0,2
chr6	29911395	.	AATTGG	A	.	.	DP=9;ECNT=14;MBQ=33,31;MFRL=209,173;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,1:0|1:29911203_A_C:29911203:0,7,0,2
chr6	29911419	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=14;MBQ=26,32;MFRL=178,268;MMQ=40,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:29911203_A_C:29911203:0,1,0,3
chr6	29911803	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=14;MBQ=30,32;MFRL=168,166;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:11,4:4,4:10,5,4,4
chr6	29911837	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=14;MBQ=28,32;MFRL=148,153;MMQ=33,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.586:39:8,13:8,10:16,0,19,4
chr6	29911879	.	T	G	.	.	DP=79;ECNT=14;MBQ=31,34;MFRL=124,174;MMQ=39,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,7:0.104:75:38,5:28,2:49,19,5,2
chr6	29911893	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=14;MBQ=29,31;MFRL=118,174;MMQ=51,42;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,7:0.101:77:40,5:26,2:0|1:29911893_C_T:29911893:39,31,5,2
chr6	29911895	.	T	A	.	.	DP=78;ECNT=14;MBQ=29,31;MFRL=119,174;MMQ=51,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,7:0.100:78:44,5:24,2:0|1:29911893_C_T:29911893:39,32,5,2
chr6	29911901	.	C	G	.	.	DP=84;ECNT=14;MBQ=31,27;MFRL=122,174;MMQ=39,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,7:0.093:84:44,5:25,2:0|1:29911893_C_T:29911893:39,38,5,2
chr6	29911912	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=14;MBQ=27,27;MFRL=126,174;MMQ=39,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,7:0.091:79:31,5:20,2:27,45,5,2
chr6	29911921	.	C	T	.	.	DP=76;ECNT=14;MBQ=33,29;MFRL=128,173;MMQ=39,46;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,6:0.090:76:38,4:23,2:0|1:29911921_C_T:29911921:22,48,4,2
chr6	29911925	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=14;MBQ=34,29;MFRL=150,126;MMQ=40,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=78.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,32:0.507:63:17,20:12,12:9,22,11,21
chr6	29911928	.	C	G	.	.	DP=59;ECNT=14;MBQ=33,30;MFRL=128,175;MMQ=39,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,3:0.066:59:29,2:21,1:0|1:29911921_C_T:29911921:15,41,2,1
chr6	29911930	.	CA	TG	.	.	DP=59;ECNT=14;MBQ=34,32;MFRL=130,175;MMQ=39,42;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,3:0.067:58:29,2:23,1:0|1:29911921_C_T:29911921:15,40,2,1
chr6	29911951	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=14;MBQ=34,32;MFRL=148,166;MMQ=33,39;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,16:0.395:41:11,7:13,8:0|1:29911951_C_T:29911951:2,23,1,15
chr6	29911957	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=14;MBQ=33,31;MFRL=148,166;MMQ=33,39;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,14:0.366:39:11,6:13,7:0|1:29911951_C_T:29911951:2,23,1,13
chr6	29911970	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=14;MBQ=33,31;MFRL=156,248;MMQ=39,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:15,0:13,5:0,28,3,2
chr6	29912028	.	AG	A	.	.	DP=41;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=194,189;MMQ=27,39;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:15,3:19,1:0|1:29912028_AG_A:29912028:26,9,0,4
chr6	29912030	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=7;MBQ=34,34;MFRL=192,189;MMQ=27,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,4:0.119:40:15,3:19,1:0|1:29912028_AG_A:29912028:27,9,0,4
chr6	29912041	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=203,182;MMQ=33,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,29:0.750:38:5,14:4,15:6,3,22,7
chr6	29912086	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=181,151;MMQ=33,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,15:0.296:52:19,8:18,7:36,1,12,3
chr6	29912087	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=7;MBQ=34,28;MFRL=155,178;MMQ=27,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=130.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,35:0.680:51:8,19:8,15:12,4,35,0
chr6	29912098	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=7;MBQ=35,30;MFRL=169,129;MMQ=39,27;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,13:0.241:56:20,6:21,6:35,8,10,3
chr6	29912108	.	G	C	.	.	DP=69;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=129,173;MMQ=27,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=166.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,46:0.724:63:10,22:7,22:11,6,38,8
chr6	29912204	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=187,169;MMQ=52,52;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=193.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,55:0.728:75:9,22:11,33:10,10,26,29
chr6	29912227	.	TGGA	T	.	.	DP=95;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=138.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,37:0.427:87:22,25:24,12:32,18,22,15
chr6	29912234	.	C	G	.	.	DP=96;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,29:0.325:90:39,11:21,18:37,24,17,12
chr6	29912280	.	TG	CA,CG	.	.	DP=116;ECNT=4;MBQ=0,33,28;MFRL=0,166,141;MMQ=60,43,59;MPOS=16,13;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=62.30,256.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,22,84:0.200,0.791:106:0,11,47:0,10,36:0,0,55,51
chr6	29912297	.	A	G	.	.	DP=112;ECNT=21;MBQ=30,28;MFRL=144,165;MMQ=51,45;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:84,23:0.220:107:35,11:35,11:27,57,17,6
chr6	29912315	.	A	C	.	.	DP=114;ECNT=21;MBQ=31,34;MFRL=153,139;MMQ=49,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=118.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,35:0.321:110:39,16:30,19:31,44,12,23
chr6	29912326	.	G	A	.	.	DP=112;ECNT=21;MBQ=32,31;MFRL=145,141;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=144.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,41:0.382:108:36,21:30,19:27,40,11,30
chr6	29912333	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=21;MBQ=33,32;MFRL=147,146;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=274.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,70:0.689:101:17,32:12,34:15,16,21,49
chr6	29912345	.	A	T	.	.	DP=92;ECNT=21;MBQ=31,30;MFRL=144,145;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=111.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,32:0.354:91:30,15:25,12:20,39,10,22
chr6	29912348	.	A	G	.	.	DP=91;ECNT=21;MBQ=29,31;MFRL=146,142;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=238.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,61:0.666:91:19,30:10,26:10,20,18,43
chr6	29912368	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=21;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=320.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,74:0.987:74:0,30:0,30:0,0,20,54
chr6	29912373	.	T	G	.	.	DP=63;ECNT=21;MBQ=32,32;MFRL=152,142;MMQ=60,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,17:0.287:61:18,8:19,9:12,32,3,14
chr6	29912386	.	G	C	.	.	DP=54;ECNT=21;MBQ=33,34;MFRL=151,144;MMQ=55,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,21:0.393:54:14,10:16,11:7,26,7,14
chr6	29912395	.	T	TGG	.	.	DP=56;ECNT=21;MBQ=29,30;MFRL=152,160;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=43.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,13:0.254:53:11,7:15,5:11,29,3,10
chr6	29912398	.	A	G,T	.	.	DP=56;ECNT=21;MBQ=32,33,31;MFRL=158,151,160;MMQ=60,54,56;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=53.40,44.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,15,13:0.289,0.253:54:9,8,8:15,7,4:8,18,6,22
chr6	29912405	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=153,160;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,15:0.262:59:20,8:22,5:12,32,4,11
chr6	29912413	.	TG	T	.	.	DP=54;ECNT=21;MBQ=28,28;MFRL=159,153;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=111.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,30:0.553:54:8,14:10,7:8,16,8,22
chr6	29912451	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=21;MBQ=33,29;MFRL=165,158;MMQ=60,41;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,16:0.486:33:9,8:7,7:3,14,3,13
chr6	29912457	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=21;MBQ=33,33;MFRL=171,154;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:10,7:7,8:3,15,3,12
chr6	29912463	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=21;MBQ=31,30;MFRL=167,122;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:12,3:6,4:2,18,1,6
chr6	29912473	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=21;MBQ=32,34;MFRL=157,134;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,4:3,5:1,8,2,11
chr6	29912477	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=21;MBQ=31,33;MFRL=157,134;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,4:3,4:1,8,0,9
chr6	29912493	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=21;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=71.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,8:0,0,1,16
chr6	29912502	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=21;MBQ=34,30;MFRL=158,168;MMQ=54,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,3:1,7,0,6
chr6	29912510	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=21;MBQ=31,35;MFRL=164,158;MMQ=40,44;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:0,4,1,5
chr6	29912713	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=142,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:9,4:1,2:8,2,5,1
chr6	29912754	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:8,6:4,6:10,2,9,3
chr6	29912766	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:10,7:7,8:13,4,11,4
chr6	29912767	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=183,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.285:33:13,5:11,4:18,6,6,3
chr6	29912830	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=16;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=102.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.968:27:0,13:0,10:0|1:29912830_T_C:29912830:0,0,12,15
chr6	29912852	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=16;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=105.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,9:0,10:0|1:29912830_T_C:29912830:0,0,15,11
chr6	29912856	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=16;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=106.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.967:27:0,13:0,11:0|1:29912830_T_C:29912830:0,0,15,12
chr6	29912885	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=157,167;MMQ=48,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,6:0.152:44:22,5:15,1:0|1:29912885_C_A:29912885:16,22,4,2
chr6	29912890	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=16;MBQ=32,34;MFRL=160,167;MMQ=47,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,6:0.146:46:23,5:16,1:0|1:29912885_C_A:29912885:16,24,4,2
chr6	29912892	.	CT	AA	.	.	DP=47;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=160,167;MMQ=46,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,6:0.143:47:24,5:16,1:0|1:29912885_C_A:29912885:17,24,4,2
chr6	29912896	.	GG	AA	.	.	DP=48;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=160,167;MMQ=46,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,6:0.140:48:24,5:17,1:0|1:29912885_C_A:29912885:18,24,4,2
chr6	29912900	.	CT	AC	.	.	DP=51;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=160,167;MMQ=46,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,6:0.142:47:22,5:17,1:0|1:29912885_C_A:29912885:18,23,4,2
chr6	29912918	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=161,177;MMQ=44,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,10:0.211:50:21,8:19,2:0|1:29912918_G_A:29912918:20,20,7,3
chr6	29912923	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=16;MBQ=33,31;MFRL=162,182;MMQ=43,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,11:0.222:52:19,8:17,3:0|1:29912918_G_A:29912918:20,21,8,3
chr6	29912925	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=16;MBQ=32,31;MFRL=176,146;MMQ=40,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,22:0.479:46:15,12:8,10:17,7,8,14
chr6	29912927	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=16;MBQ=34,32;MFRL=164,183;MMQ=42,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,10:0.229:46:19,5:16,2:0|1:29912918_G_A:29912918:18,18,7,3
chr6	29912935	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=16;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=205.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,46:0.979:46:0,23:0,21:0|1:29912935_C_T:29912935:0,0,29,17
chr6	29912938	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=16;MBQ=33,31;MFRL=166,174;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,14:0.322:44:14,6:15,7:17,13,10,4
chr6	29912944	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=16;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=202.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,46:0.979:46:0,20:0,23:0|1:29912935_C_T:29912935:0,0,29,17
chr6	29912961	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=16;MBQ=32,32;MFRL=166,189;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,17:0.360:48:16,6:14,11:22,9,13,4
chr6	29913001	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,18:0.267:69:30,6:20,12:26,25,8,10
chr6	29913037	.	G	A	.	.	DP=65;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=142,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,14:0.237:61:29,5:18,9:20,27,7,7
chr6	29913042	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=236.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,58:0.984:58:0,33:0,25:0,0,26,32
chr6	29913067	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,32:0.646:49:11,15:6,14:7,10,13,19
chr6	29913074	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=248.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,25:0,24:0,0,24,33
chr6	29913078	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=8;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=247.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,25:0,28:0,0,23,34
chr6	29913098	.	C	A	.	.	DP=62;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,16:0.293:56:18,5:21,10:17,23,7,9
chr6	29913111	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,22:0.371:60:15,11:23,11:11,27,10,12
chr6	29913171	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=17;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=148.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,17:0,18:0,0,12,23
chr6	29913179	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=17;MBQ=33,32;MFRL=169,145;MMQ=40,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.352:32:11,6:9,5:8,13,3,8
chr6	29913191	.	TG	CG,CA	.	.	DP=31;ECNT=17;MBQ=20,27,34;MFRL=122,195,144;MMQ=60,40,40;MPOS=11,14;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=26.33,77.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,10,20:0.289,0.653:31:0,6,12:1,4,8:1,0,10,20
chr6	29913197	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=17;MBQ=31,27;MFRL=160,142;MMQ=40,47;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:10,6:6,5:6,10,4,7
chr6	29913201	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=17;MBQ=30,34;MFRL=158,157;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:12,3:8,3:8,15,3,5
chr6	29913204	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=17;MBQ=33,35;MFRL=156,171;MMQ=40,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:10,6:9,2:9,11,2,6
chr6	29913213	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=17;MBQ=31,31;MFRL=163,161;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:12,4:6,2:7,12,3,3
chr6	29913214	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=17;MBQ=30,31;MFRL=96,170;MMQ=47,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.433:19:6,6:5,2:5,6,2,6
chr6	29913266	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=17;MBQ=33,32;MFRL=169,180;MMQ=40,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:9,8:4,4:2,11,3,9
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chr6	29913275	.	GC	G	.	.	DP=20;ECNT=17;MBQ=32,32;MFRL=151,169;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:11,2:6,1:0|1:29913274_T_C:29913274:3,14,0,3
chr6	29913282	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=17;MBQ=34,32;MFRL=148,164;MMQ=60,26;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:5,0:0|1:29913274_T_C:29913274:2,14,0,2
chr6	29913306	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=17;MBQ=32,29;MFRL=151,189;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:29913274_T_C:29913274:0,9,0,2
chr6	29913310	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=17;MBQ=32,33;MFRL=153,189;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:29913274_T_C:29913274:0,8,0,2
chr6	29913344	.	G	A,C,T	.	.	DP=4;ECNT=17;MBQ=0,32,34,35;MFRL=0,31893,220,181;MMQ=60,60,46,60;MPOS=21,27,27;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=6.18,3.43,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,1,1:0.375,0.250,0.250:4:0,1,1,0:0,1,0,1:0,0,0,4
chr6	29913353	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=17;MBQ=31,36;MFRL=181,220;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:29913353_T_C:29913353:0,3,0,1
chr6	29913355	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=17;MBQ=31,33;MFRL=181,220;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:29913353_T_C:29913353:0,3,0,1
chr6	29942857	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	29942889	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,0:0,3:1,0,3,0
chr6	29942927	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=30,33;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,1:2,8:3,0,7,2
chr6	29942983	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.700:25:2,6:5,10:5,2,11,7
chr6	29943005	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:2,5:5,9:6,1,5,9
chr6	29943035	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:3,6:4,11:4,3,9,8
chr6	29943254	.	AGGGCT	A	.	.	DP=50;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=139,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=87.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,23:0.500:46:9,11:13,12:0|1:29943254_AGGGCT_A:29943254:14,9,10,13
chr6	29943269	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=85.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,22:0.500:44:9,10:12,12:0|1:29943254_AGGGCT_A:29943254:12,10,9,13
chr6	29943336	.	GGT	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=331,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:0|1:29943336_GGT_G:29943336:1,0,1,9
chr6	29943340	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=331,155;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:0|1:29943336_GGT_G:29943336:1,0,1,9
chr6	30029651	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=149,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.343:33:8,9:13,1:18,4,9,2
chr6	30030114	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr6	30032495	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=78.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:9,11:8,13:6,11,13,12
chr6	30035341	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.652:24:5,5:3,10:1,7,0,16
chr6	30036471	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.618:19:2,1:5,11:3,4,3,9
chr6	30038823	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,1:4,5:6,0,6,0
chr6	30038830	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=146,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:2,1:3,4:6,0,6,0
chr6	30039075	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=223,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,2:0,2,0,4
chr6	30039098	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=13,33;MFRL=241,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,1:0,2:0,1,0,3
chr6	30039240	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,2,2
chr6	30041009	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=85,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.616:19:3,9:4,2:5,2,5,7
chr6	30043557	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,1:7,1:1,11,0,2
chr6	30071330	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=194,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:4,0,4,1
chr6	30071586	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=139,92;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0,15,0,2
chr6	30075803	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=30,34;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,9:2,3:4,1,12,0
chr6	30075843	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=81.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,15,7
chr6	30075864	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:7,7:6,6:9,4,5,8
chr6	30075867	.	TC	GG	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=29,17;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:13,1:8,0:0|1:30075867_TC_GG:30075867:12,13,3,0
chr6	30075872	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=31,16;MFRL=142,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,0:10,0:0|1:30075867_TC_GG:30075867:12,13,2,0
chr6	30075877	.	GC	TG	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=142,212;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:15,0:10,2:0|1:30075867_TC_GG:30075867:13,14,2,0
chr6	30076016	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0|1:30076016_C_T:30076016:0,0,0,11
chr6	30076018	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0|1:30076016_C_T:30076016:0,0,0,11
chr6	30076755	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=79,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:3,2,3,1
chr6	30076828	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=97,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:4,3,1,1
chr6	30113878	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,8:5,5:4,4,1,12
chr6	30115379	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,239;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:2,2:10,0:6,6,2,0
chr6	30121581	.	T	TGGGA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,17;MFRL=193,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.295:8:3,1:3,0:0|1:30121581_T_TGGGA:30121581:1,5,1,1
chr6	30121583	.	G	GGGGCCGGGTGGTAAGGGATAGA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=193,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:3,0:0|1:30121581_T_TGGGA:30121581:1,5,1,1
chr6	30121854	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=168,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:7,0:10,2:4,14,1,1
chr6	30122154	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=77.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,5:0,17:0,0,8,14
chr6	30128678	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30128678_C_G:30128678:1,0,1,0
chr6	30128686	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:30128678_C_G:30128678:1,0,1,0
chr6	30131515	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:2,4,3,3
chr6	30131546	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=152,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,5:3,3:5,2,2,6
chr6	30138853	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:5,7:5,4:3,7,1,11
chr6	30154199	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,4,3
chr6	30157375	.	CT	TC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=208,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30157375_CT_TC:30157375:0,1,0,1
chr6	30157378	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=208,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:30157375_CT_TC:30157375:0,1,0,1
chr6	30157654	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	30166266	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=118,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.570:16:1,4:4,5:3,4,3,6
chr6	30228230	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,18,5
chr6	30228379	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=100.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,13:0,15:0,0,6,23
chr6	30228398	.	CG	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,44;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=82.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,13:0,0,3,23
chr6	30228416	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=82.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,8:0,14:0,0,2,20
chr6	30228879	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=36,31;MFRL=372036,163;MMQ=24,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=58.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.884:15:1,7:0,6:0|1:30228879_C_T:30228879:0,1,5,9
chr6	30228881	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=372036,163;MMQ=24,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,14:0.882:15:1,7:0,7:0|1:30228879_C_T:30228879:0,1,5,9
chr6	30228938	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,10,9
chr6	30229013	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=72,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=116.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,38:0.931:40:0,20:2,16:1,1,20,18
chr6	30229034	.	C	CT	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=20,33;MFRL=72,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=129.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,37:0.914:40:1,21:2,16:1,2,20,17
chr6	30229280	.	CC	AT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=132.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,9:0,19:0|1:30229280_CC_AT:30229280:0,0,13,17
chr6	30229306	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=118.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,13:0,14:0|1:30229280_CC_AT:30229280:0,0,21,9
chr6	30229457	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=204.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,51:0.981:51:0,20:0,25:0|1:30229457_C_T:30229457:0,0,22,29
chr6	30229463	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=188.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,44:0.979:44:0,15:0,25:0|1:30229457_C_T:30229457:0,0,15,29
chr6	30229504	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=81.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,4,21
chr6	30229990	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=52.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,14,2
chr6	30230085	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=165,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=84.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,26:0.932:27:0,9:1,17:1,0,8,18
chr6	30230128	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,4:1,4:1,0,4,4
chr6	30231071	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=112.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,20:0,13:0,0,19,15
chr6	30231108	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=96.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,15:0,14:0,0,15,16
chr6	30297529	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,18:0,8:0,0,4,22
chr6	30309105	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,2:10,1:15,7,3,0
chr6	30309508	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr6	30313227	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=159,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:4,8:9,3:5,8,5,6
chr6	30313245	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,2:11,0:9,15,2,0
chr6	30314566	.	TC	GA	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=163.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,16:0,17:0,0,8,29
chr6	30314598	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.545:31:2,9:12,8:0,14,3,14
chr6	30314607	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,1:7,11:3,11,0,12
chr6	30457732	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=140.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,43:0.562:77:14,24:17,19:13,21,19,24
chr6	30458064	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.526:36:6,10:11,9:12,5,12,7
chr6	30460394	.	T	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,15:0.297:50:14,0:12,3:24,11,0,15
chr6	30521137	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=80.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,29:0.703:41:6,13:6,12:6,6,18,11
chr6	30539438	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,21:0.647:32:7,10:4,11:0,11,0,21
chr6	30548137	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=193,194;MMQ=57,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:3,1:2,1:5,0,1,2
chr6	30550370	.	G	GAGATAAGT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	30551286	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=177,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr6	30552326	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=161,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:30552326_G_A:30552326:0,3,0,1
chr6	30552328	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=161,105;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:30552326_G_A:30552326:0,3,0,1
chr6	30552334	.	CCC	ATT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=161,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:30552326_G_A:30552326:0,3,0,1
chr6	30552937	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=189,126;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr6	30553871	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,5:2,4:3,0,7,2
chr6	30558477	.	G	GA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=103,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=90.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,26:0.855:30:1,15:3,11:1,3,4,22
chr6	30571471	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.742:25:2,10:4,9:5,1,7,12
chr6	30572945	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr6	30573637	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=97,180;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.549:7:2,1:0,3:3,0,4,0
chr6	30574194	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.367:33:11,4:9,7:19,2,11,1
chr6	30575603	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=143.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,14:0,27:0,0,24,18
chr6	30575760	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:0|1:30575760_CT_C:30575760:0,1,1,2
chr6	30575775	.	T	TACCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=128,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:30575760_CT_C:30575760:1,2,0,1
chr6	30575781	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=140,146;MMQ=57,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:30575760_CT_C:30575760:1,1,0,1
chr6	30576781	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:3,7:1,7:3,1,11,3
chr6	30587847	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,177;MMQ=40,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:0,15,0,2
chr6	30596200	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=30,18;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.098:28:13,0:12,1:0|1:30596200_T_A:30596200:9,17,1,1
chr6	30596208	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=134,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:12,2:0|1:30596200_T_A:30596200:8,16,1,1
chr6	30596209	.	T	TGCACACACACACCA	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,0:12,2:0|1:30596200_T_A:30596200:8,15,1,1
chr6	30596210	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,0:12,1:0|1:30596200_T_A:30596200:8,15,1,1
chr6	30619306	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30619306_C_T:30619306:0,0,0,1
chr6	30619310	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30619306_C_T:30619306:0,0,0,1
chr6	30619315	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30619306_C_T:30619306:0,0,0,1
chr6	30619317	.	T	TTGCC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:30619306_C_T:30619306:0,0,0,1
chr6	30627216	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:1,2:7,1:8,0,3,0
chr6	30627254	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=139,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,1:14,1:18,5,2,0
chr6	30628082	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.860:5:0,0:0,3:0,0,0,5
chr6	30640394	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=19,23;MFRL=118,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.195:19:4,1:2,1:12,4,3,0
chr6	30645123	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,13;MFRL=180,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,0:0,0:0|1:30645123_A_C:30645123:1,2,1,0
chr6	30645126	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:2,0:1,1:0|1:30645123_A_C:30645123:1,3,1,0
chr6	30645129	.	C	CGG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.287:5:3,0:0,1:0|1:30645123_A_C:30645123:1,3,1,0
chr6	30645136	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=197,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:30645123_A_C:30645123:0,3,1,0
chr6	30645138	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,12;MFRL=197,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:30645123_A_C:30645123:0,3,1,0
chr6	30657015	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr6	30670292	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=126,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,4:6,7:6,5,7,4
chr6	30672367	.	CACAACTGTTTCAGGGGTCTTGACAGAGGACCGATTTTTTCTTCCCCTAGTGGTCCGAGATGTGGGCTCAGAGGTGACAGGCTGGTCTGTGGAGGCGGAAGCCTGTAGCTCAGGGGCTGTGGGG	C	.	.	DP=223;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:172,51:0.034:223:22,14:36,32:73,99,25,26
chr6	30672694	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=137,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.103:56:14,1:22,1:28,22,3,3
chr6	30679628	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=89.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,11:0,14:0,0,13,13
chr6	30711805	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=91.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,10:0,17:0,0,14,14
chr6	30857072	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=58.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,17:0.720:23:2,8:4,9:1,5,3,14
chr6	30858857	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:0,6:3,4:0,3,3,8
chr6	30859333	.	TGAGA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.727:2:0,2:0,0:0|1:30859333_TGAGA_T:30859333:0,0,1,1
chr6	30859342	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30859333_TGAGA_T:30859333:0,0,0,1
chr6	30860386	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=180,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:30860386_A_T:30860386:0,1,0,1
chr6	30860388	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=180,224;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:30860386_A_T:30860386:0,1,0,1
chr6	30864700	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:3,1,2,3
chr6	30864829	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=149,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:2,9:5,7:3,4,9,7
chr6	30865115	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:2,1,2,0
chr6	30865820	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=69,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,2,0
chr6	30867106	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=29769222,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,1,2
chr6	30876737	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=187,273;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	30877202	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:7,5:2,5:7,2,6,4
chr6	30877760	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,25:0.632:39:7,13:7,10:6,8,17,8
chr6	30878360	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=208,167;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:2,4:1,1:3,0,6,0
chr6	30878579	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=164,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=57.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.731:28:4,9:3,9:1,6,8,13
chr6	30878769	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=234,179;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:0,1:1,2:1,1,0,3
chr6	30878919	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:0,6:4,0:2,2,5,2
chr6	30879988	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=182,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr6	30882634	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.291:29:9,4:11,4:8,13,5,3
chr6	30882781	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:1,4,1,2
chr6	30882856	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=194,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr6	30883878	.	AAAGCAACC	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGCAACC;STR;TLOD=112.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.967:26:0,16:0,9:0,0,14,12
chr6	30883920	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,15:0.355:43:15,10:13,5:17,11,10,5
chr6	30884806	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=159,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:8,8:15,2:12,11,4,6
chr6	30887780	.	C	CTGGGGCGGTGCAGGTGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGGGGCGGTGCAGGTGA;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	30887966	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:12,4:11,0:7,17,3,1
chr6	30887972	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,74;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:5,11:6,6:4,7,8,9
chr6	30887988	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:8,4:7,5:5,10,3,6
chr6	30888161	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=139.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,22:0,18:0|1:30888161_T_C:30888161:0,0,17,24
chr6	30888169	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=119,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,9:0.243:39:15,5:15,4:0|1:30888161_T_C:30888161:12,18,2,7
chr6	30889120	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.423:36:9,7:11,8:1,20,1,14
chr6	30890055	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:3,6:9,2:0,12,1,8
chr6	30890206	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.481:15:3,5:3,2:8,0,4,3
chr6	30890431	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr6	30890483	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,6:2,0:8,3,5,1
chr6	30890569	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:8,2:1,3:3,6,1,4
chr6	30890871	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr6	30892054	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr6	30892322	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=217,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr6	30892999	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=112,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,1:3,2:3,2,2,2
chr6	30893127	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=122,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:1,3,1,2
chr6	30893428	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=106,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,3:4,0:5,4,1,2
chr6	30893728	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,10:0,8:0,0,7,11
chr6	30893831	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=138,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:11,1:6,3:12,5,2,2
chr6	30899163	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr6	30899377	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=133,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:3,2,2,1
chr6	30899624	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:1,3,0,4
chr6	30916645	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=117,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=96.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,30:0.660:45:9,16:6,14:10,5,21,9
chr6	30917163	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=134,169;MMQ=51,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.253:16:7,0:5,0:0|1:30917163_A_T:30917163:6,6,0,4
chr6	30917212	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=134,134;MMQ=30,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,17:0.882:20:0,10:0,7:0|1:30917163_A_T:30917163:2,1,9,8
chr6	30918400	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=143,138;MMQ=50,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.459:35:5,7:10,3:13,6,9,7
chr6	30919057	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.663:30:4,12:5,8:6,4,15,5
chr6	30919701	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=77,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.259:28:11,5:9,1:11,10,2,5
chr6	30954245	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.789:25:2,14:2,6:1,4,12,8
chr6	30955681	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	30955963	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=118,66;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr6	31079339	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=146,152;MMQ=45,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:9,1:6,3:13,3,0,4
chr6	31083729	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=219,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,4:4,0:7,0,4,0
chr6	31083797	.	ACTT	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=69.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.949:16:0,8:0,7:0|1:31083797_ACTT_A:31083797:0,0,12,4
chr6	31083813	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,8:0,10:0|1:31083797_ACTT_A:31083797:0,0,14,5
chr6	31084075	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=81.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,15,8
chr6	31084163	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,0,15
chr6	31084170	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:1,4:1,6:1,2,0,10
chr6	31084288	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr6	31084435	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:1,3,0,6
chr6	31084639	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,6:3,1:1,3,6,2
chr6	31084684	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,11,7
chr6	31084787	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=126,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.300:28:10,3:9,5:0|1:31084787_A_G:31084787:7,13,5,3
chr6	31084792	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=96.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,28:0.935:29:1,12:0,14:0|1:31084787_A_G:31084787:1,0,8,20
chr6	31084964	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,6:0,8:0,0,7,7
chr6	31085200	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=108.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,15:0,0,20,13
chr6	31085269	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=115.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,14:0,19:0,0,6,28
chr6	31085382	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	31088037	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	31088202	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr6	31088232	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:31088232_A_G:31088232:0,0,1,8
chr6	31088241	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0|1:31088232_A_G:31088232:0,0,1,7
chr6	31097301	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr6	31097453	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,5,8
chr6	31105633	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr6	31105891	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,6,12
chr6	31106177	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.218:12:4,1:4,1:2,8,1,1
chr6	31106409	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr6	31106489	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=113,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,2:8,5:10,7,2,5
chr6	31106498	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=112,33;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:8,2:8,12,1,1
chr6	31106643	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=117,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:3,2,5,2
chr6	31107733	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,1,15
chr6	31110671	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr6	31111180	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,13:0,0:0,0,3,10
chr6	31112899	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	31112925	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	31113030	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,9,6
chr6	31113052	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,6,9
chr6	31113106	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,7:0,0,4,8
chr6	31113113	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,3:4,2:2,4,2,3
chr6	31113214	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,18,5
chr6	31113275	.	AG	GA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=106,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=62.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:4,9:9,7:8,5,12,5
chr6	31113476	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=110,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,1:8,1:10,8,0,2
chr6	31116526	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr6	31118511	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,8,10
chr6	31118565	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=65.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,3,16
chr6	31122315	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,13,13
chr6	31124849	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,13,6
chr6	31125067	.	C	CAACT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AACT;STR;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,3:0,0,7,1
chr6	31125158	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=86.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,16,10
chr6	31125407	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=194,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,2:1,5:0,3,1,6
chr6	31125471	.	C	CTCTTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr6	31129616	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr6	31129642	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr6	31130502	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	31132414	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,7,9
chr6	31132649	.	A	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=199.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,37:0,19:0,0,10,46
chr6	31132689	.	T	TGA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=84.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,12:0,7:0,0,0,20
chr6	31133509	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr6	31133577	.	A	AAAGCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr6	31133943	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,15:0,12:0,0,10,17
chr6	31138371	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=144,163;MMQ=51,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,2,1
chr6	31138377	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr6	31236853	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=160.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,19:0,26:0,0,38,11
chr6	31236998	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=137.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,15:0,23:0,0,17,21
chr6	31237002	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=7;MBQ=34,35;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:12,5:16,4:10,18,7,2
chr6	31237014	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=158.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,18:0,15:0|1:31237014_G_A:31237014:0,0,23,13
chr6	31237017	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=161.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.974:37:0,21:0,13:0|1:31237014_G_A:31237014:0,0,24,13
chr6	31237027	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=169.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.978:41:0,21:0,17:0|1:31237014_G_A:31237014:0,0,28,13
chr6	31237048	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=178.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,48:0.980:48:0,24:0,23:0,0,34,14
chr6	31237061	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=190.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,27:0,28:0,0,35,20
chr6	31237124	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=179.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,22:0,30:0,0,25,29
chr6	31237162	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=219.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,59:0.984:59:0,26:0,31:0,0,30,29
chr6	31237230	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=175,152;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=256.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,58:0.969:59:0,26:1,29:0|1:31237230_A_G:31237230:0,1,27,31
chr6	31237233	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=175,152;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=285.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,65:0.973:66:0,27:0,31:0|1:31237230_A_G:31237230:0,1,28,37
chr6	31237237	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=171,131;MMQ=50,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=101.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,36:0.599:60:9,18:13,18:9,15,17,19
chr6	31237255	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=254.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,62:0.984:62:0,27:0,27:0|1:31237230_A_G:31237230:0,0,26,36
chr6	31237323	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=145.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.974:35:0,13:0,20:0|1:31237323_A_G:31237323:0,0,5,30
chr6	31237333	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=134.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,13:0,16:0|1:31237323_A_G:31237323:0,0,1,30
chr6	31237342	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=34,31;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.448:29:7,4:9,8:1,15,0,13
chr6	31237353	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=79.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,0,25
chr6	31237405	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr6	31237437	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr6	31237660	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=15;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:31237660_A_G:31237660:0,0,9,1
chr6	31237664	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=15;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0|1:31237660_A_G:31237660:0,0,10,1
chr6	31237703	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=171,177;MMQ=50,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,0:6,4:10,3,3,1
chr6	31237723	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=15;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,45;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=52.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,2:0,7:0|1:31237723_G_A:31237723:0,0,8,4
chr6	31237727	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=15;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=54.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0|1:31237723_G_A:31237723:0,0,8,5
chr6	31237767	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=15;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=83.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,17,2
chr6	31237769	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=15;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=96.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,8:0,10:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,18,4
chr6	31237771	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=102.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,23:0.960:23:0,9:0,12:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,18,5
chr6	31237773	.	TG	CC	.	.	DP=25;ECNT=15;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=111.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,11:0,12:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,19,6
chr6	31237776	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=15;MBQ=32,30;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:1,10:8,6:7,2,12,4
chr6	31237786	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=142.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.971:33:0,16:0,15:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,26,7
chr6	31237802	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=15;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=181.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,46:0.979:46:0,25:0,19:0|1:31237767_T_C:31237767:0,0,35,11
chr6	31237833	.	T	C	.	.	DP=67;ECNT=15;MBQ=20,28;MFRL=35,130;MMQ=57,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=194.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,63:0.958:65:2,36:0,25:1,1,37,26
chr6	31237858	.	T	C	.	.	DP=77;ECNT=15;MBQ=30,28;MFRL=135,107;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,16:0.208:75:28,6:24,10:30,29,5,11
chr6	31237876	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=15;MBQ=28,32;MFRL=0,132;MMQ=22,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=216.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,60:0.977:61:1,26:0,33:1,0,21,39
chr6	31238126	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=150,210;MMQ=50,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:7,2:11,2:12,6,3,1
chr6	31238135	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=62.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,6:0,7:0|1:31238135_G_A:31238135:0,0,11,4
chr6	31238138	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=79.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,7:0,7:0|1:31238135_G_A:31238135:0,0,13,7
chr6	31238147	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=170,157;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,5:0,7:5,0,6,6
chr6	31238155	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=148,170;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.248:20:6,1:9,2:8,7,5,0
chr6	31238230	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,47;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=163.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,37:0.975:37:0,14:0,22:0|1:31238230_G_C:31238230:0,0,21,16
chr6	31238234	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=168.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.976:39:0,15:0,22:0|1:31238230_G_C:31238230:0,0,22,17
chr6	31238259	.	G	T	.	.	DP=47;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=141.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,17:0,26:0,0,16,29
chr6	31238297	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=115.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,15:0,20:0,0,13,24
chr6	31238308	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=143.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,35:0.974:35:0,14:0,19:0|1:31238308_G_C:31238308:0,0,17,18
chr6	31238318	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=9;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=154.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,38:0.976:38:0,16:0,18:0|1:31238308_G_C:31238308:0,0,23,15
chr6	31238345	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=145,170;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.386:39:14,8:10,6:21,3,10,5
chr6	31238372	.	C	G	.	.	DP=53;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=227.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,53:0.982:53:0,29:0,20:0|1:31238372_C_G:31238372:0,0,40,13
chr6	31238377	.	G	C	.	.	DP=61;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=236.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,56:0.983:56:0,31:0,19:0|1:31238372_C_G:31238372:0,0,42,14
chr6	31238490	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=208.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,66:0.971:67:1,41:0,24:0,1,22,44
chr6	31238492	.	C	A	.	.	DP=68;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=294.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,41:0,23:0,0,22,45
chr6	31238524	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=163.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,40:0.976:40:0,23:0,15:0|1:31238524_G_A:31238524:0,0,6,34
chr6	31238535	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=134.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,32:0.971:32:0,19:0,12:0|1:31238524_G_A:31238524:0,0,2,30
chr6	31238759	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:31238759_C_T:31238759:0,0,4,0
chr6	31238762	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:31238759_C_T:31238759:0,0,4,0
chr6	31238793	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=34,32;MFRL=197,178;MMQ=59,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr6	31238814	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=67.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,15,2
chr6	31238822	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=29,30;MFRL=200,158;MMQ=57,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.661:21:3,7:3,7:6,1,13,1
chr6	31238851	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=10;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=131.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,16:0,18:0,0,29,8
chr6	31238875	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=10;MBQ=28,26;MFRL=140,142;MMQ=49,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,8:0.177:49:21,1:14,5:0|1:31238875_G_A:31238875:29,12,5,3
chr6	31238880	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=150,142;MMQ=47,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,8:0.180:48:19,2:16,5:0|1:31238875_G_A:31238875:28,12,5,3
chr6	31238898	.	AC	CG	.	.	DP=52;ECNT=10;MBQ=28,20;MFRL=149,77;MMQ=45,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,2:0.058:49:15,1:22,1:26,21,2,0
chr6	31238909	.	GT	AG	.	.	DP=48;ECNT=10;MBQ=28,26;MFRL=149,106;MMQ=50,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.102:47:21,0:22,4:25,18,1,3
chr6	31238931	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=155,94;MMQ=48,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.135:27:10,1:14,2:11,13,1,2
chr6	31238942	.	G	T,A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=0,32,20;MFRL=0,157,94;MMQ=60,50,45;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=55.36,5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,17,4:0.753,0.206:21:0,6,2:0,11,2:0,0,7,14
chr6	31238957	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=68.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,3,16
chr6	31238983	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,1,14
chr6	31239010	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=32,30;MFRL=178,200;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:11,4:6,1:2,16,1,4
chr6	31239050	.	G	A,T	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=0,31,29;MFRL=0,205,160;MMQ=60,40,40;MPOS=7,29;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=50.73,8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,14,3:0.751,0.201:17:0,8,1:0,5,2:0,0,6,11
chr6	31239060	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=27,32;MFRL=160,214;MMQ=44,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,4:3,4:4,1,3,6
chr6	31239090	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=34,32;MFRL=207,172;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:4,2:3,7,2,1
chr6	31239101	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,4:0,7:0|1:31239101_G_T:31239101:0,0,5,7
chr6	31239114	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=34,31;MFRL=160,178;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.857:12:1,3:0,6:0|1:31239101_G_T:31239101:0,1,3,8
chr6	31239116	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=34,31;MFRL=160,172;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,1:0,6:0|1:31239101_G_T:31239101:0,1,3,6
chr6	31239141	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=28,25;MFRL=160,212;MMQ=53,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:1,2:0,2,1,1
chr6	31239151	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr6	31239205	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,58;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr6	31239279	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,59;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0|1:31239279_T_C:31239279:0,0,12,2
chr6	31239296	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=97.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.958:22:0,7:0,12:0|1:31239279_T_C:31239279:0,0,20,2
chr6	31239305	.	CT	TG	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=34,30;MFRL=184,177;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.401:22:4,4:8,2:12,1,8,1
chr6	31239306	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=10;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,12:0,0,20,2
chr6	31239335	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=172,177;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.420:31:6,6:11,6:17,1,11,2
chr6	31239378	.	T	G	.	.	DP=61;ECNT=10;MBQ=30,33;MFRL=136,160;MMQ=21,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=199.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,55:0.966:56:0,26:1,27:1,0,46,9
chr6	31239407	.	G	T	.	.	DP=102;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=146,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=187.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,53:0.533:99:24,20:20,25:0|1:31239407_G_T:31239407:34,12,35,18
chr6	31239417	.	C	T	.	.	DP=107;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=190.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,54:0.533:101:25,20:20,29:0|1:31239407_G_T:31239407:33,14,35,19
chr6	31239430	.	C	T	.	.	DP=118;ECNT=10;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=447.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,117:0.992:117:0,53:0,53:0,0,77,40
chr6	31239449	.	C	G	.	.	DP=124;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=189.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,64:0.550:116:27,32:25,31:28,24,36,28
chr6	31239577	.	A	C	.	.	DP=51;ECNT=7;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=215.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,51:0.981:51:0,25:0,26:0|1:31239577_A_C:31239577:0,0,16,35
chr6	31239585	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=214.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,50:0.981:50:0,24:0,18:0|1:31239577_A_C:31239577:0,0,17,33
chr6	31239593	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=186,180;MMQ=50,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.447:45:14,9:11,11:8,17,7,13
chr6	31239613	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=181,174;MMQ=49,29;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:17,0:12,2:9,23,1,1
chr6	31239614	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=174,185;MMQ=29,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=129.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,31:0.915:33:0,18:2,13:1,1,9,22
chr6	31239622	.	C	A,G	.	.	DP=33;ECNT=7;MBQ=0,32,35;MFRL=0,191,174;MMQ=60,48,29;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=130.78,4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,31,2:0.889,0.083:33:0,16,0:0,14,2:0,0,8,25
chr6	31239681	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=71.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,7:0,11:0,0,7,16
chr6	31239722	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=60.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,12,5
chr6	31239752	.	C	T,A	.	.	DP=16;ECNT=9;MBQ=11,28,23;MFRL=210,182,154;MMQ=60,60,60;MPOS=15,30;POPAF=7.30,7.30;TLOD=24.78,8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,9,5:0.598,0.330:15:0,3,2:0,5,1:1,0,12,2
chr6	31239776	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=31,34;MFRL=182,215;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,4:6,4:6,3,6,2
chr6	31239802	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=115.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,13:0,11:0|1:31239802_C_G:31239802:0,0,16,11
chr6	31239821	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=135,166;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.415:29:10,8:7,3:12,5,4,8
chr6	31239827	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=125.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,18:0,9:0|1:31239802_C_G:31239802:0,0,15,16
chr6	31239855	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=132.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,14:0,0,12,20
chr6	31239868	.	GT	CC,CT	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=0,33,33;MFRL=0,167,176;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=63.10,14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,21,6:0.734,0.233:27:0,9,4:0,12,2:0,0,9,18
chr6	31239896	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=31,35;MFRL=174,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,2:8,0:3,9,0,2
chr6	31322866	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=114,234;MMQ=60,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,1:9,1:6,4,2,0
chr6	31322888	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=101,234;MMQ=60,34;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:7,1:4,5,2,0
chr6	31322980	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=203,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,25:0.730:34:3,6:4,13:5,4,14,11
chr6	31323115	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=150,127;MMQ=60,45;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,14:0.250:58:22,7:22,6:0|1:31323115_T_C:31323115:27,17,7,7
chr6	31323128	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=147,139;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,16:0.270:61:21,7:21,5:0|1:31323115_T_C:31323115:27,18,8,8
chr6	31323134	.	T	C	.	.	DP=69;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=147,149;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=62.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,18:0.268:69:24,9:22,6:0|1:31323115_T_C:31323115:32,19,10,8
chr6	31323143	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=138,150;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,13:0.209:65:24,7:26,4:0|1:31323115_T_C:31323115:31,21,6,7
chr6	31323202	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=135,175;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,19:0.227:86:36,10:30,9:40,27,8,11
chr6	31323215	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=140,172;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,20:0.244:84:36,13:25,7:36,28,7,13
chr6	31323233	.	A	G	.	.	DP=105;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=149,151;MMQ=60,37;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,18:0.186:100:49,6:31,12:38,44,7,11
chr6	31323254	.	G	C	.	.	DP=99;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=146,164;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,14:0.151:97:39,9:42,5:0|1:31323254_G_C:31323254:36,47,2,12
chr6	31323262	.	G	A	.	.	DP=91;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=146,151;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=34.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,11:0.133:88:37,6:37,5:0|1:31323254_G_C:31323254:32,45,2,9
chr6	31323296	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=150,129;MMQ=49,32;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,10:0.179:59:28,4:18,6:25,24,3,7
chr6	31323337	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=8;MBQ=30,27;MFRL=150,128;MMQ=60,27;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,5:0.067:88:30,1:36,4:0|1:31323337_T_C:31323337:42,41,0,5
chr6	31323341	.	G	A	.	.	DP=92;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=150,128;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,5:0.067:87:34,1:44,4:0|1:31323337_T_C:31323337:42,40,0,5
chr6	31324024	.	C	A	.	.	DP=61;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=166,142;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,24:0.410:59:19,14:16,9:24,11,16,8
chr6	31324036	.	T	A	.	.	DP=66;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=142,159;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,16:0.253:65:27,10:19,4:0|1:31324036_T_A:31324036:32,17,8,8
chr6	31324051	.	C	A	.	.	DP=77;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=129,167;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,20:0.266:77:34,12:20,7:0|1:31324036_T_A:31324036:34,23,10,10
chr6	31324064	.	T	A	.	.	DP=83;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=132,171;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,18:0.233:80:29,8:21,8:0|1:31324036_T_A:31324036:31,31,8,10
chr6	31324104	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=7;MBQ=33,25;MFRL=145,146;MMQ=52,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,6:0.098:58:27,2:25,2:16,36,3,3
chr6	31324151	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=142,151;MMQ=44,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=108.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,33:0.875:37:2,22:2,11:0,4,11,22
chr6	31324200	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:9,6:4,3:2,11,2,7
chr6	31324373	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=199,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:6,3:3,0:0|1:31324373_A_G:31324373:8,1,2,1
chr6	31324375	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=199,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:6,3:3,0:0|1:31324373_A_G:31324373:8,1,2,1
chr6	31324516	.	C	A	.	.	DP=84;ECNT=10;MBQ=34,32;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,15:0.186:84:39,6:26,9:0|1:31324516_C_A:31324516:48,21,9,6
chr6	31324524	.	GCC	G	.	.	DP=89;ECNT=10;MBQ=34,34;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=50.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,16:0.187:89:40,6:27,9:0|1:31324516_C_A:31324516:50,23,9,7
chr6	31324528	.	G	GTT	.	.	DP=89;ECNT=10;MBQ=34,34;MFRL=146,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=45.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,14:0.165:89:35,6:32,8:0|1:31324516_C_A:31324516:52,23,9,5
chr6	31324531	.	C	T	.	.	DP=90;ECNT=10;MBQ=33,30;MFRL=146,169;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,12:0.141:90:38,4:33,4:0|1:31324516_C_A:31324516:51,27,7,5
chr6	31324536	.	T	G	.	.	DP=90;ECNT=10;MBQ=29,33;MFRL=147,165;MMQ=60,57;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,9:0.109:90:42,5:36,4:0|1:31324516_C_A:31324516:50,31,5,4
chr6	31324547	.	G	C	.	.	DP=94;ECNT=10;MBQ=33,33;MFRL=146,166;MMQ=60,46;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:86,8:0.094:94:43,3:38,4:0|1:31324516_C_A:31324516:51,35,5,3
chr6	31324549	.	T	C	.	.	DP=97;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=146,165;MMQ=60,40;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,7:0.085:92:44,3:37,4:0|1:31324516_C_A:31324516:50,35,4,3
chr6	31324586	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=10;MBQ=27,33;MFRL=147,173;MMQ=60,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:82,13:0.144:95:45,3:33,7:0|1:31324586_C_T:31324586:34,48,1,12
chr6	31324603	.	CT	TC	.	.	DP=93;ECNT=10;MBQ=34,32;MFRL=147,182;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,14:0.158:93:41,5:31,9:0|1:31324586_C_T:31324586:34,45,1,13
chr6	31324615	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=10;MBQ=29,31;MFRL=148,182;MMQ=60,46;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,13:0.165:83:35,4:31,6:0|1:31324586_C_T:31324586:28,42,1,12
chr6	31324641	.	T	A	.	.	DP=71;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=159,187;MMQ=60,46;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,9:0.145:67:28,4:28,5:0|1:31324641_T_A:31324641:23,35,1,8
chr6	31324643	.	G	C	.	.	DP=69;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=157,187;MMQ=60,46;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,9:0.141:69:25,4:28,4:0|1:31324641_T_A:31324641:25,35,1,8
chr6	31324664	.	T	G	.	.	DP=50;ECNT=13;MBQ=31,29;MFRL=148,224;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.115:50:23,1:18,2:0|1:31324641_T_A:31324641:16,29,3,2
chr6	31324666	.	A	T	.	.	DP=50;ECNT=13;MBQ=31,30;MFRL=148,227;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.098:49:23,1:20,3:0|1:31324641_T_A:31324641:16,29,3,1
chr6	31324702	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=13;MBQ=28,30;MFRL=160,224;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,5:0.122:47:18,2:23,3:0|1:31324702_C_T:31324702:10,32,4,1
chr6	31324705	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=13;MBQ=31,31;MFRL=162,224;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,5:0.118:49:19,2:22,3:0|1:31324702_C_T:31324702:10,34,4,1
chr6	31324711	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=13;MBQ=32,34;MFRL=163,207;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,4:0.106:45:18,1:22,3:0|1:31324702_C_T:31324702:9,32,3,1
chr6	31324742	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=13;MBQ=28,35;MFRL=176,148;MMQ=60,38;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,2:10,0:0|1:31324742_T_C:31324742:6,18,2,0
chr6	31324750	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=33,34;MFRL=172,148;MMQ=60,38;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:10,2:14,0:0|1:31324742_T_C:31324742:8,18,2,0
chr6	31324788	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=31,33;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:8,2:10,2:0|1:31324788_T_C:31324788:12,8,1,3
chr6	31324790	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=32,31;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:6,1:11,2:0|1:31324788_T_C:31324788:12,8,1,3
chr6	31324829	.	GG	CA	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=29,33;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,11:0.364:31:6,5:10,4:0|1:31324829_GG_CA:31324829:12,8,4,7
chr6	31324847	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=34,31;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,11:0.375:30:9,3:10,7:0|1:31324829_GG_CA:31324829:11,8,4,7
chr6	31324921	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=131,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,8:0.200:43:13,3:20,4:0|1:31324921_C_T:31324921:15,20,4,4
chr6	31324925	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,8:0.191:45:15,3:19,5:0|1:31324921_C_T:31324921:15,22,4,4
chr6	31324931	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,8:0.200:43:15,3:19,5:0|1:31324921_C_T:31324921:13,22,4,4
chr6	31324953	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.208:41:15,4:18,4:12,21,4,4
chr6	31324996	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=137,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,4:6,0:3,13,1,3
chr6	31379200	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31379920	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,162;MMQ=51,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.680:20:2,4:4,9:4,2,8,6
chr6	31380297	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=117,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:0,4:1,10:0,1,0,14
chr6	31431063	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=81.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,32:0.576:55:17,13:6,17:10,13,16,16
chr6	31431082	.	A	G	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=188.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,32:0,22:0,0,28,28
chr6	31431403	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.625:30:7,7:4,12:10,1,15,4
chr6	31465915	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=94,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.735:16:1,6:2,5:3,1,11,1
chr6	31473546	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=140,164;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=60.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:5,8:3,10:3,5,13,5
chr6	31473561	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=152,157;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=63.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:4,9:1,10:2,3,15,4
chr6	31473844	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr6	31473957	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,142;MMQ=44,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:5,12:10,6:7,8,8,10
chr6	31474000	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.649:35:5,15:7,8:2,10,13,10
chr6	31475127	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,187;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,4:7,4:12,4,3,5
chr6	31477461	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:3,2:3,1:6,0,4,0
chr6	31477681	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,6:3,8:2,4,6,8
chr6	31477767	.	CAG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,4:0,2:0,3,0,6
chr6	31497622	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.622:27:6,11:4,6:7,3,13,4
chr6	31509051	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=120,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.729:20:3,8:2,7:0,5,1,14
chr6	31525912	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr6	31555189	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:0,5,1,6
chr6	31556180	.	GGA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GA;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.236:23:5,3:4,0:18,0,5,0
chr6	31583166	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:9,4:11,4:11,9,5,3
chr6	31594628	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=134.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,40:0.977:40:0,20:0,20:0,0,17,23
chr6	31595772	.	GCCTGCTGCCCCA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=131,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.401:13:3,2:2,3:2,6,2,3
chr6	31595882	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,5,8
chr6	31597700	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr6	31598489	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.499:32:8,7:8,9:5,11,5,11
chr6	31601201	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,13;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.252:22:7,1:6,0:10,6,6,0
chr6	31601344	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=144.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,16:0,28:0,0,16,28
chr6	31601513	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:31601513_A_G:31601513:0,0,3,1
chr6	31601520	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=233,80;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:31601513_A_G:31601513:1,1,2,0
chr6	31601843	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=138,71;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.452:9:4,2:1,2:0|1:31601843_T_C:31601843:0,5,0,4
chr6	31601859	.	T	TTTCTAGTCATCTCCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=69,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1|0:31601843_T_C:31601843:0,4,0,1
chr6	31602489	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:6,0,2,2
chr6	31602967	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,7:0,0,8,12
chr6	31603770	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.563:32:11,9:2,9:6,8,10,8
chr6	31604044	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,6,10
chr6	31606901	.	C	CAAAG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAG;STR;TLOD=87.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,21:0.847:24:2,8:1,12:3,0,13,8
chr6	31607050	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr6	31609272	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:3,3,6,2
chr6	31611777	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,7,7
chr6	31612787	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:2,4,2,4
chr6	31614102	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	31616366	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	31619576	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:2,6:5,5:3,4,1,10
chr6	31627449	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,2:7,1:9,1,3,0
chr6	31627523	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=125.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,18:0,20:0,0,22,16
chr6	31629953	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr6	31630241	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=101.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,10:0,19:0,0,13,18
chr6	31631547	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,3:4,0:13,0,3,0
chr6	31632134	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,22:0.677:32:4,9:6,13:5,5,14,8
chr6	31633165	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.418:26:6,6:9,3:13,2,10,1
chr6	31634570	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,111;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.550:38:10,13:7,8:12,5,15,6
chr6	31634758	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	31637807	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31638747	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=111,142;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.115:33:16,0:13,3:21,9,0,3
chr6	31639129	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr6	31644640	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:3,0,8,0
chr6	31644978	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr6	31650809	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=217,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,5:2,5:4,0,6,4
chr6	31655438	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,7:2,2:3,3,5,4
chr6	31657413	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=97.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,13:0,0,12,16
chr6	31657754	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	31659731	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,3:0,11:0,0,1,13
chr6	31669149	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31,32;MFRL=70,108,122;MMQ=60,60,60;MPOS=22,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,7,8;RU=AC;STR;TLOD=7.80,27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,9:0.236,0.552:16:0,2,4:2,2,4:1,2,5,8
chr6	31671264	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,4:0,7:0,2,0,12
chr6	31675501	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:8,6:4,5:5,7,5,6
chr6	31675985	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr6	31678028	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	31678451	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:31678451_AG_A:31678451:0,0,0,1
chr6	31678474	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=116,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:31678451_AG_A:31678451:1,0,0,1
chr6	31680386	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:7,3:15,0:9,13,3,0
chr6	31687008	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.688:30:7,9:1,12:7,2,8,13
chr6	31691096	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,13;MFRL=94,131;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:31691096_G_C:31691096:1,2,1,0
chr6	31691098	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,18;MFRL=94,131;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:31691096_G_C:31691096:1,2,1,0
chr6	31691293	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=205,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:31691293_G_A:31691293:0,3,0,1
chr6	31691295	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=205,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.340:4:2,0:1,1:0|1:31691293_G_A:31691293:0,3,0,1
chr6	31691300	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=205,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:31691293_G_A:31691293:0,3,0,1
chr6	31691303	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=23,26;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:31691293_G_A:31691293:0,2,0,1
chr6	31691304	.	G	GA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:31691293_G_A:31691293:0,2,0,1
chr6	31691657	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:6,6:2,10:3,5,10,6
chr6	31692675	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=174,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.486:8:0,1:4,3:2,2,1,3
chr6	31702005	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=143,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:21,0:9,4:17,14,0,4
chr6	31708147	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.519:31:6,8:7,8:15,0,16,0
chr6	31709147	.	C	CTCTGATG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr6	31726688	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,2:2,5:2,5,4,3
chr6	31729359	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:3,3,2,1
chr6	31731014	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=277,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr6	31734102	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:11,1:17,1:16,13,0,2
chr6	31734385	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=249,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr6	31735632	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31744528	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.256:10:4,1:3,0:1,7,0,2
chr6	31745284	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,2:1,0,6,0
chr6	31749794	.	CC	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=139,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:31749794_CC_AG:31749794:1,2,0,1
chr6	31749797	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=139,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31749794_CC_AG:31749794:1,2,0,1
chr6	31750299	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,12;MFRL=142,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,8:0.163:42:10,0:16,1:11,23,8,0
chr6	31759602	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=21,9;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.384:12:2,0:4,0:7,0,5,0
chr6	31759608	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=14,13;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.405:15:2,0:2,1:8,1,6,0
chr6	31759613	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=15,12;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:3,0:2,0:0|1:31759613_A_C:31759613:11,1,3,0
chr6	31759617	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:3,0:4,2:0|1:31759613_A_C:31759613:11,1,3,0
chr6	31762587	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,10;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.345:9:4,0:2,1:6,0,3,0
chr6	31762843	.	GG	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=182,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr6	31773821	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:7,12:2,3:5,4,11,4
chr6	31773975	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:0,5,2,1
chr6	31777770	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,3:1,0:5,1,3,0
chr6	31777946	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=85.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,30:0.587:51:12,12:8,18:12,9,17,13
chr6	31778272	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=266.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,78:0.988:78:0,44:0,33:0,0,17,61
chr6	31783437	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=197,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,1:4,3:7,0,4,0
chr6	31783507	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,23:0.616:37:5,13:9,10:13,1,23,0
chr6	31785228	.	G	C	.	.	DP=103;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=172,146;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=274.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,93:0.967:101:2,41:0,52:2,6,36,57
chr6	31795949	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,316;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31797587	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=115.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,8:0,23:0,0,29,5
chr6	31797769	.	A	AAAGTT	.	.	DP=82;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGTT;STR;TLOD=167.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,43:0.571:75:15,26:17,16:11,21,13,30
chr6	31797923	.	GTTTTTT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=155,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=24,18;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,1:3,0:2,10,1,1
chr6	31831361	.	GA	G	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=126,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:17,0:12,1:27,5,0,2
chr6	31831366	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,3:0.100:38:15,0:11,3:0|1:31831366_T_G:31831366:30,5,0,3
chr6	31831372	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,3:0.087:44:18,0:15,2:0|1:31831366_T_G:31831366:35,6,0,3
chr6	31831376	.	G	GCC	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=33,11;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,3:0.088:43:19,0:15,1:0|1:31831366_T_G:31831366:34,6,0,3
chr6	31832374	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,18;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.218:15:3,1:2,0:9,3,3,0
chr6	31837250	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	31837277	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,16,1
chr6	31837491	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	31838490	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=79.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,11:0,0,8,17
chr6	31838545	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,9,6
chr6	31838713	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr6	31839309	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=157.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,41:0.977:41:0,16:0,23:0|1:31839309_C_T:31839309:0,0,7,34
chr6	31839331	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=17,20;MFRL=195,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=123.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,35:0.970:36:0,7:0,10:0|1:31839309_C_T:31839309:0,1,4,31
chr6	31843924	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:5,7,0,2
chr6	31843994	.	G	GAATGGAGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr6	31848492	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=119,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:5,3:4,8:8,1,9,2
chr6	31855865	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=147,84;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:5,0:13,3:18,3,0,3
chr6	31856070	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,5,6
chr6	31860337	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,3,11
chr6	31864304	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,7,14
chr6	31864547	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=136,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:4,2:5,8:2,7,5,6
chr6	31869178	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	31905209	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=64,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:3,8:5,7:5,3,8,7
chr6	31910640	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=146,75;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr6	31912591	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=127,119;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:21,1:17,3:15,23,1,3
chr6	31913217	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=205,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr6	31913226	.	TCCTC	CCCTC,T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33,32;MFRL=183,127,214;MMQ=60,60,60;MPOS=3,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,1:2,1,0:0,2,0,2
chr6	31913235	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=183,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr6	31914935	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,5,13
chr6	31919578	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	31919896	.	GGGAACAGGCACT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=208,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:1,1,0,1
chr6	31921475	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=115,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.476:23:9,4:3,6:9,3,9,2
chr6	31922254	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr6	31923081	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:10,1:21,1:8,24,2,0
chr6	31928330	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,1:10,1:6,11,2,0
chr6	31928799	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,12,3
chr6	31929014	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=87.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,14,10
chr6	31930441	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,11,1
chr6	31932177	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:5,1:1,1:0,6,0,3
chr6	31933764	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=184,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:31933764_A_C:31933764:2,5,0,2
chr6	31933765	.	T	TGG	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=184,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:31933764_A_C:31933764:2,5,0,2
chr6	31933768	.	CAGA	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=184,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:31933764_A_C:31933764:2,5,0,2
chr6	31933775	.	GCA	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=185,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:31933764_A_C:31933764:2,4,0,2
chr6	31933779	.	C	CGA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,24;MFRL=185,130;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:31933764_A_C:31933764:2,4,0,2
chr6	31935928	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr6	31936668	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,12,6
chr6	31936679	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=168,121;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.571:17:2,4:5,4:5,2,6,4
chr6	31938528	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=133,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:12,0:20,2:14,18,0,2
chr6	31948421	.	TCTC	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,178;MMQ=43,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:6,7:2,3:7,1,7,3
chr6	31962236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=199,206;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,0:5,4:5,3,4,0
chr6	31962582	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,228;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr6	31994742	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0|1:31994742_A_G:31994742:0,0,4,0
chr6	31994750	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=183,203;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:31994742_A_G:31994742:2,0,4,0
chr6	31994974	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,134;MMQ=27,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,2:5,2:1,10,0,4
chr6	31996363	.	G	GAAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,94;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr6	31997401	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=189,212;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.391:8:3,2:1,0:5,0,3,0
chr6	31997416	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=14,12;MFRL=188,205;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,0:0,0:4,0,2,0
chr6	32006214	.	CCTG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=198,203;MMQ=27,27;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTG;STR;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,2:2,1:8,1,3,0
chr6	32006317	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0|1:32006317_C_T:32006317:0,0,8,14
chr6	32006337	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=199,152;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.335:25:11,4:5,4:0|1:32006317_C_T:32006317:2,15,2,6
chr6	32006597	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr6	32006621	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=175,186;MMQ=53,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr6	32006804	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,3:7,3:9,1,6,0
chr6	32006858	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,15:0,18:0,0,27,10
chr6	32006886	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=150,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:6,9:8,8:9,5,11,6
chr6	32007063	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=177,181;MMQ=27,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:3,2,2,4
chr6	32007252	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,13;MFRL=157,131;MMQ=27,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.295:18:7,0:4,0:0|1:32007252_A_C:32007252:3,10,5,0
chr6	32007258	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=164,131;MMQ=44,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.280:19:6,2:3,0:0|1:32007252_A_C:32007252:5,9,5,0
chr6	32007264	.	AG	CC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=164,131;MMQ=51,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.252:21:5,2:5,1:0|1:32007252_A_C:32007252:6,10,5,0
chr6	32007624	.	AC	GT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=135,143;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.359:37:10,6:12,7:8,16,3,10
chr6	32008451	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=193,184;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:12,3:8,4:14,6,5,2
chr6	32010126	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,212;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,1:4,2:15,0,3,0
chr6	32010272	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=137,160;MMQ=57,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,17:0.371:46:16,9:10,6:15,14,6,11
chr6	32011644	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=208,47;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr6	32012755	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,147;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:8,0,3,0
chr6	32017441	.	T	TGCAATGATCTGTGATTGTGCC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	32026107	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,7:0,14:0,0,9,17
chr6	32026257	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	32029226	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,162;MMQ=57,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,4:1,11:1,0,15,1
chr6	32029415	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,6,13
chr6	32029849	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=156,129;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:2,2:0,1:2,0,4,0
chr6	32030284	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr6	32032743	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:4,3:4,3,2,5
chr6	32035427	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,4:2,4:5,0,8,0
chr6	32035652	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,191;MMQ=40,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:11,8,2,0
chr6	32047223	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	32050067	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,6,11
chr6	32064098	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=213,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,0:0,1:1,0,0,2
chr6	32088504	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=157,92;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,2:7,0:0|1:32088504_C_A:32088504:13,0,2,1
chr6	32088508	.	GT	AG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=149,92;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,2:5,0:0|1:32088504_C_A:32088504:14,0,1,1
chr6	32089142	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=126,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,2:5,9:3,5,2,9
chr6	32089217	.	CG	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=190,216;MMQ=53,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	32117282	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.212:19:7,0:5,0:3,12,4,0
chr6	32119898	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.913:9:0,4:0,3:0,0,3,6
chr6	32122386	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,16:0,0,17,7
chr6	32123361	.	CTGTGTG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=230,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=TG;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	32123639	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,4:4,8:3,6,10,2
chr6	32147291	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.280:21:9,1:6,5:7,8,2,4
chr6	32147761	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=159.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,30:0,20:0,0,29,22
chr6	32149219	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.373:19:4,4:8,2:5,7,6,1
chr6	32150296	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.571:30:4,12:6,5:5,8,11,6
chr6	32151893	.	T	G	.	.	DP=114;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=123,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:106,4:0.030:110:53,2:41,0:59,47,3,1
chr6	32151994	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=145.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.977:42:0,20:0,21:0,0,2,40
chr6	32155249	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=214,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.385:8:1,1:4,2:1,4,1,2
chr6	32157639	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=162,176;MMQ=56,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr6	32164799	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.513:21:5,7:5,2:2,8,2,9
chr6	32167009	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,6:7,5:0,11,0,11
chr6	32170433	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr6	32171683	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,4:0,3:2,1,0,7
chr6	32172065	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=115.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,14:0,0,21,10
chr6	32178773	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	32183175	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=113,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.580:14:1,3:3,5:2,4,2,6
chr6	32184705	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:8,8:1,3:6,3,9,2
chr6	32185922	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=197,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:1,5,1,2
chr6	32187836	.	G	GCC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=146,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=C;STR;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:9,2:6,3:14,1,5,0
chr6	32188099	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,2:5,5:1,8,4,3
chr6	32188383	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:2,2:1,1:2,3,2,1
chr6	32190620	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr6	32190871	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,6:6,5:3,8,4,7
chr6	32191620	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=151,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,3:2,4:4,4,3,4
chr6	32261771	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,7:0,0,0,17
chr6	32268501	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,9,9
chr6	32270500	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=159.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.978:44:0,29:0,15:0,0,1,43
chr6	32290927	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=108.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,16:0,0,10,22
chr6	32290954	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=69.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,8:0,11:0,0,2,18
chr6	32290967	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=153,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,1:12,1:1,19,0,2
chr6	32291270	.	CAG	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=70.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,15,1
chr6	32291359	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=232.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,66:0.985:66:0,38:0,27:0,0,28,38
chr6	32292392	.	C	CAACT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=70.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,5:0,10:0,0,14,2
chr6	32292560	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.921:9:0,4:0,4:0|1:32292560_AT_A:32292560:0,0,0,9
chr6	32292571	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:32292560_AT_A:32292560:0,0,0,9
chr6	32298372	.	A	G	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=181.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.982:49:0,22:0,27:0,0,14,35
chr6	32298449	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr6	32299715	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr6	32299873	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,7,11
chr6	32303672	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,2:2,1:0,5,3,0
chr6	32306657	.	GAAAGA	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.478:42:9,11:10,9:19,3,20,0
chr6	32307260	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=76.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,21,0
chr6	32307382	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=202.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,60:0.984:60:0,29:0,31:0,0,17,43
chr6	32307446	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=111.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,17:0,13:0,0,0,30
chr6	32310967	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,11:0,8:0,0,11,8
chr6	32310986	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=89.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,12:0,0,12,16
chr6	32311148	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:32311148_C_G:32311148:0,0,0,4
chr6	32311152	.	G	GCAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:32311148_C_G:32311148:0,3,0,1
chr6	32311154	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:32311148_C_G:32311148:0,3,0,1
chr6	32317471	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,7:0,0,8,2
chr6	32333837	.	T	TTTC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TTC;STR;TLOD=117.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,9:0,0,23,6
chr6	32333955	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=196.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,52:0.982:52:0,28:0,24:0,0,19,33
chr6	32335777	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=50.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,7:0,9:0,0,2,14
chr6	32336495	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=126.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,15:0,20:0,0,35,0
chr6	32336520	.	AG	A	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=166.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,45:0.958:46:1,19:0,26:1,0,37,8
chr6	32336586	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=216.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,59:0.969:60:1,20:0,39:0,1,23,36
chr6	32337630	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.912:20:1,8:0,10:1,0,13,6
chr6	32337686	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=125.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,22:0,16:0,0,22,16
chr6	32337854	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	32337864	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=196,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	32339348	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr6	32363816	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=186,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,3,2
chr6	32363844	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,3:4,4:8,2,5,2
chr6	32363955	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.375:30:10,7:9,4:11,8,7,4
chr6	32369488	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,3,1
chr6	32370616	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=218,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr6	32370684	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=124,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,3:3,7:4,1,9,1
chr6	32370835	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=147,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,21:0.629:33:9,9:3,12:6,6,11,10
chr6	32407709	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:5,7:7,8:10,2,13,2
chr6	32410137	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr6	32410159	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:2,3:5,0,7,0
chr6	32410941	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr6	32410987	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,12,10
chr6	32411035	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=90.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,14:0,0,16,12
chr6	32411523	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.292:29:10,3:9,5:18,3,6,2
chr6	32411726	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr6	32485524	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,40;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:32485524_C_A:32485524:0,0,1,2
chr6	32485539	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,23;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32485524_C_A:32485524:0,0,0,1
chr6	32485547	.	AGTG	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,23;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:32485524_C_A:32485524:0,0,0,1
chr6	32485641	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=196,159;MMQ=39,26;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32485641_C_T:32485641:0,1,1,0
chr6	32485651	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=20,28;MFRL=196,159;MMQ=39,26;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:32485641_C_T:32485641:0,1,1,0
chr6	32485655	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32485655_A_G:32485655:0,0,0,1
chr6	32485661	.	AC	GA	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32485655_A_G:32485655:0,0,0,1
chr6	32485667	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,19;MFRL=0,196;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:32485655_A_G:32485655:0,0,0,1
chr6	32485670	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32485655_A_G:32485655:0,0,0,1
chr6	32485853	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,17;MFRL=0,0;MMQ=60,37;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:32485853_C_T:32485853:0,0,1,0
chr6	32485856	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,37;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32485853_C_T:32485853:0,0,1,0
chr6	32485861	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,37;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32485853_C_T:32485853:0,0,1,0
chr6	32485881	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,0;MMQ=60,37;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:32485853_C_T:32485853:0,0,1,0
chr6	32485889	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,37;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32485853_C_T:32485853:0,0,1,0
chr6	32486238	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	32486278	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=11;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	32486291	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,36;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:32486291_TG_CA:32486291:0,0,4,0
chr6	32486295	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:32486291_TG_CA:32486291:0,0,4,0
chr6	32486315	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:32486315_C_A:32486315:0,0,4,0
chr6	32486319	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:32486315_C_A:32486315:0,0,4,0
chr6	32486324	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,37;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:32486315_C_A:32486315:0,0,4,1
chr6	32486332	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:32486315_C_A:32486315:0,0,4,2
chr6	32486344	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr6	32486358	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,212;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.864:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr6	32486391	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=29,30;MFRL=258,162;MMQ=40,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,5:0,5:1,0,5,5
chr6	32486484	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=13,32;MFRL=246,162;MMQ=25,53;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr6	32486491	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,47;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	32486493	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=32,35;MFRL=162,246;MMQ=53,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:32486493_T_G:32486493:0,2,0,1
chr6	32486501	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=35,34;MFRL=246,181;MMQ=25,58;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0|1:32486501_G_C:32486501:0,1,0,3
chr6	32486503	.	CC	TA	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=181,246;MMQ=58,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:32486493_T_G:32486493:0,3,0,1
chr6	32486505	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=35,34;MFRL=246,181;MMQ=25,58;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0|1:32486501_G_C:32486501:0,1,0,3
chr6	32486507	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:32486507_GCA_G:32486507:0,0,0,4
chr6	32486511	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:32486507_GCA_G:32486507:0,0,0,4
chr6	32486517	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:32486507_GCA_G:32486507:0,0,0,4
chr6	32486531	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=233,181;MMQ=43,58;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0|1:32486531_G_A:32486531:0,2,0,3
chr6	32486533	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=233,181;MMQ=43,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,2:2,0:0|1:32486531_G_A:32486531:0,2,0,3
chr6	32487054	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=27;MBQ=31,33;MFRL=166,226;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:32487054_T_C:32487054:11,0,2,0
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chr6	32487066	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=27;MBQ=35,32;MFRL=246,168;MMQ=25,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,13:0.778:16:1,6:1,5:0|1:32487066_G_T:32487066:3,0,13,0
chr6	32487068	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=27;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=59.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr6	32487074	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=27;MBQ=33,34;MFRL=31257,173;MMQ=25,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=59.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,14:0.833:16:1,7:1,7:0|1:32487066_G_T:32487066:2,0,14,0
chr6	32487080	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=27;MBQ=34,31;MFRL=31257,167;MMQ=25,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=68.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.850:18:1,7:1,7:0|1:32487066_G_T:32487066:2,0,16,0
chr6	32487101	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=27;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,10:0,7:0|1:32487066_G_T:32487066:0,0,15,3
chr6	32487104	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=27;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0|1:32487066_G_T:32487066:0,0,14,3
chr6	32487114	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=27;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,10:0,6:0|1:32487066_G_T:32487066:0,0,13,5
chr6	32487144	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=27;MBQ=34,31;MFRL=145,153;MMQ=40,26;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:14,4:7,2:12,9,6,0
chr6	32487158	.	G	GCA	.	.	DP=36;ECNT=27;MBQ=32,36;MFRL=151,137;MMQ=33,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:19,1:12,3:0|1:32487158_G_GCA:32487158:17,14,4,0
chr6	32487164	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=27;MBQ=32,32;MFRL=151,161;MMQ=33,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,5:0.146:39:21,1:12,4:0|1:32487158_G_GCA:32487158:17,17,4,1
chr6	32487170	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=27;MBQ=31,32;MFRL=151,155;MMQ=40,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=73.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,19:0.488:39:13,9:7,10:6,14,15,4
chr6	32487174	.	C	G,T	.	.	DP=41;ECNT=27;MBQ=32,32,31;MFRL=155,151,112;MMQ=27,40,25;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=62.87,22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,20,7:0.491,0.182:40:6,13,1:5,7,5:11,2,10,17
chr6	32487175	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=27;MBQ=33,31;MFRL=151,155;MMQ=31,27;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.325:41:14,8:12,5:10,18,11,2
chr6	32487189	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=27;MBQ=33,26;MFRL=161,137;MMQ=32,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,8:0.205:42:19,2:14,6:0|1:32487158_G_GCA:32487158:18,16,4,4
chr6	32487193	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=27;MBQ=33,24;MFRL=161,137;MMQ=33,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:19,2:13,6:0|1:32487158_G_GCA:32487158:17,16,4,4
chr6	32487209	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=27;MBQ=33,34;MFRL=156,159;MMQ=33,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:14,1:10,3:0|1:32487158_G_GCA:32487158:13,14,0,4
chr6	32487211	.	AC	A	.	.	DP=30;ECNT=27;MBQ=28,32;MFRL=156,159;MMQ=33,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:12,1:10,3:0|1:32487158_G_GCA:32487158:12,14,0,4
chr6	32487214	.	TC	CC,CT	.	.	DP=26;ECNT=27;MBQ=32,34,34;MFRL=159,164,161;MMQ=25,37,27;MPOS=17,16;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=29.06,20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,12,8:0.483,0.339:24:1,6,4:3,6,4:0,4,9,11
chr6	32487215	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=27;MBQ=29,34;MFRL=158,159;MMQ=30,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.197:24:10,1:8,3:0|1:32487158_G_GCA:32487158:8,12,0,4
chr6	32487237	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=27;MBQ=32,30;MFRL=159,154;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:12,1:10,2:0|1:32487237_C_T:32487237:9,17,2,1
chr6	32487241	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=27;MBQ=32,29;MFRL=161,154;MMQ=27,27;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.122:31:13,1:12,2:0|1:32487237_C_T:32487237:10,18,2,1
chr6	32487268	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=27;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=128.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.971:33:0,16:0,14:0,0,14,19
chr6	32487277	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=27;MBQ=32,31;MFRL=160,152;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.268:39:15,6:11,4:10,19,6,4
chr6	32487294	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=27;MBQ=33,30;MFRL=154,147;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=82.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,30:0.562:53:13,14:10,12:8,15,14,16
chr6	32487309	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=27;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=152.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,42:0.978:42:0,23:0,15:0,0,17,25
chr6	32487338	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=126,139;MMQ=30,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:21,0:14,2:9,27,0,2
chr6	32487361	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=121,152;MMQ=33,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,5:4,3:2,7,0,8
chr6	32487515	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,321;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	32489724	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=35,31;MFRL=160,144;MMQ=60,26;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:11,5,1,1
chr6	32489749	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.916:9:0,3:0,4:0|1:32489749_G_A:32489749:0,0,5,4
chr6	32489754	.	T	TCC	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,4:0,0,5,4
chr6	32489755	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0|1:32489749_G_A:32489749:0,0,2,4
chr6	32489757	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=184,147;MMQ=24,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:1,2:0,4:0|1:32489749_G_A:32489749:1,0,2,5
chr6	32489766	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,45;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,2:0|1:32489749_G_A:32489749:0,0,1,4
chr6	32489791	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=30;MBQ=31,31;MFRL=213,192;MMQ=53,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,9:0.833:10:1,3:0,6:0|1:32489791_A_G:32489791:0,1,4,5
chr6	32489794	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=30;MBQ=29,33;MFRL=208,192;MMQ=55,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.771:11:2,3:0,6:0|1:32489791_A_G:32489791:0,2,4,5
chr6	32489822	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=30;MBQ=27,33;MFRL=192,208;MMQ=42,55;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,2:10,0:6,13,0,2
chr6	32489835	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=30;MBQ=28,32;MFRL=192,184;MMQ=42,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:7,3:10,1:0|1:32489835_C_G:32489835:6,11,0,5
chr6	32489839	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=30;MBQ=32,28;MFRL=192,184;MMQ=40,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:7,4:10,1:0|1:32489835_C_G:32489835:5,12,0,5
chr6	32489844	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=30;MBQ=29,31;MFRL=192,184;MMQ=40,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:5,3:8,1:0|1:32489835_C_G:32489835:3,12,0,5
chr6	32489846	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=30;MBQ=32,31;MFRL=208,192;MMQ=35,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=67.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.852:18:0,8:2,7:0|1:32489846_A_T:32489846:1,1,1,15
chr6	32489852	.	AA	GC	.	.	DP=19;ECNT=30;MBQ=31,33;MFRL=208,191;MMQ=35,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,17:0.859:19:0,7:1,9:0|1:32489846_A_T:32489846:1,1,3,14
chr6	32489856	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=30;MBQ=9,29;MFRL=194,188;MMQ=48,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.897:17:0,7:0,7:0|1:32489846_A_T:32489846:1,0,3,13
chr6	32489868	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=30;MBQ=32,36;MFRL=184,132;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:7,2:3,10,2,0
chr6	32489871	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=30;MBQ=32,33;MFRL=118,193;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:0|1:32489871_A_G:32489871:2,3,1,7
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chr6	32489881	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=30;MBQ=34,32;MFRL=118,195;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:0|1:32489871_A_G:32489871:2,3,1,8
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chr6	32489887	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=30;MBQ=31,32;MFRL=118,191;MMQ=40,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:2,3:3,6:0|1:32489871_A_G:32489871:2,3,2,7
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chr6	32489927	.	T	A,G	.	.	DP=12;ECNT=30;MBQ=33,32,34;MFRL=154,205,215;MMQ=45,54,25;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=21.27,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,6,2:0.467,0.200:12:1,3,1:3,3,1:1,3,1,7
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chr6	32489933	.	T	A,G	.	.	DP=11;ECNT=30;MBQ=0,30,33;MFRL=0,187,215;MMQ=60,57,25;MPOS=23,27;POPAF=7.30,7.30;TLOD=37.61,6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,2:0.714,0.214:11:0,2,1:0,6,1:0,0,2,9
chr6	32489937	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=30;MBQ=34,34;MFRL=194,187;MMQ=33,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,2:5,2:2,5,0,5
chr6	32489940	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=30;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr6	32489955	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=30;MBQ=28,29;MFRL=198,150;MMQ=44,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:1,1:4,4:0|1:32489955_T_G:32489955:1,5,1,4
chr6	32489963	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=30;MBQ=28,32;MFRL=192,172;MMQ=33,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,1:3,2:0|1:32489955_T_G:32489955:1,3,0,4
chr6	32489967	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=30;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,1:0,4:0|1:32489967_G_C:32489967:0,0,1,5
chr6	32489976	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=30;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0|1:32489967_G_C:32489967:0,0,0,3
chr6	32489981	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=30;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:32489967_G_C:32489967:0,0,0,3
chr6	32497802	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=21;MBQ=33,35;MFRL=172,183;MMQ=60,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,4:0.143:33:15,3:14,1:0|1:32497802_A_G:32497802:27,2,4,0
chr6	32497815	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=21;MBQ=32,32;MFRL=175,175;MMQ=60,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.103:37:16,1:17,1:0|1:32497802_A_G:32497802:32,2,3,0
chr6	32497820	.	GC	AG	.	.	DP=39;ECNT=21;MBQ=34,24;MFRL=179,161;MMQ=60,38;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:16,1:17,0:0|1:32497802_A_G:32497802:35,2,2,0
chr6	32497824	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=21;MBQ=33,30;MFRL=171,161;MMQ=60,38;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:16,1:18,1:0|1:32497802_A_G:32497802:36,2,2,0
chr6	32497826	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=21;MBQ=34,32;MFRL=171,161;MMQ=60,38;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:17,1:18,0:0|1:32497802_A_G:32497802:36,2,2,0
chr6	32497847	.	A	C	.	.	DP=65;ECNT=21;MBQ=33,32;MFRL=148,158;MMQ=51,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,25:0.389:65:20,8:16,14:32,8,20,5
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chr6	32497856	.	A	T	.	.	DP=76;ECNT=21;MBQ=30,31;MFRL=156,118;MMQ=50,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,10:0.141:76:30,3:34,7:0|1:32497856_A_T:32497856:48,18,9,1
chr6	32497860	.	T	TTGC	.	.	DP=87;ECNT=21;MBQ=31,33;MFRL=147,132;MMQ=50,29;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,4:0.056:87:36,0:40,3:0|1:32497852_C_T:32497852:61,22,2,2
chr6	32497863	.	C	G	.	.	DP=93;ECNT=21;MBQ=32,28;MFRL=145,158;MMQ=50,47;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=63.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,21:0.239:90:29,10:34,11:47,22,16,5
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chr6	32497877	.	C	G	.	.	DP=136;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=147,160;MMQ=47,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:107,25:0.194:132:51,14:52,11:0|1:32497856_A_T:32497856:63,44,14,11
chr6	32497880	.	A	T	.	.	DP=139;ECNT=21;MBQ=31,31;MFRL=152,133;MMQ=47,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:126,13:0.099:139:62,5:56,7:0|1:32497852_C_T:32497852:75,51,6,7
chr6	32497884	.	CC	GT	.	.	DP=156;ECNT=21;MBQ=32,33;MFRL=145,140;MMQ=47,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:142,14:0.095:156:66,7:65,7:0|1:32497852_C_T:32497852:76,66,6,8
chr6	32497896	.	A	G	.	.	DP=175;ECNT=21;MBQ=29,30;MFRL=137,93;MMQ=48,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:170,3:0.023:173:77,1:84,2:88,82,0,3
chr6	32497900	.	A	G	.	.	DP=177;ECNT=21;MBQ=29,32;MFRL=141,118;MMQ=47,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:165,10:0.061:175:76,3:80,7:86,79,1,9
chr6	32497901	.	C	T	.	.	DP=179;ECNT=21;MBQ=28,31;MFRL=136,143;MMQ=45,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=127.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:135,38:0.223:173:61,19:68,17:63,72,22,16
chr6	32497904	.	C	T	.	.	DP=183;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=141,133;MMQ=47,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:163,18:0.103:181:77,8:79,10:0|1:32497852_C_T:32497852:78,85,8,10
chr6	32497905	.	G	T,A	.	.	DP=181;ECNT=21;MBQ=32,31,32;MFRL=130,144,152;MMQ=51,40,47;MPOS=21,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=221.42,117.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:69,74,35:0.416,0.196:178:29,38,18:35,34,15:26,43,58,51
chr6	32497914	.	C	T	.	.	DP=177;ECNT=21;MBQ=33,31;MFRL=135,151;MMQ=40,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=120.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:139,37:0.213:176:64,16:66,18:56,83,24,13
chr6	32497917	.	C	A	.	.	DP=172;ECNT=21;MBQ=33,29;MFRL=133,170;MMQ=49,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:137,31:0.182:168:61,12:67,16:59,78,15,16
chr6	32497943	.	A	G	.	.	DP=122;ECNT=8;MBQ=29,30;MFRL=121,147;MMQ=39,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=195.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,61:0.545:112:21,30:28,27:19,32,30,31
chr6	32497959	.	GCT	G	.	.	DP=92;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=135,145;MMQ=50,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=112.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,42:0.479:88:19,21:23,20:19,27,19,23
chr6	32497961	.	TT	GC	.	.	DP=89;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,49;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,84:0.988:84:0,38:0,41:0,0,37,47
chr6	32497962	.	T	TGC	.	.	DP=83;ECNT=8;MBQ=26,32;MFRL=77,146;MMQ=51,49;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,75:0.955:78:1,34:1,36:0,3,33,42
chr6	32498033	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=172,138;MMQ=49,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=144.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,42:0.782:53:3,16:8,26:3,8,8,34
chr6	32498041	.	CA	TG	.	.	DP=47;ECNT=8;MBQ=35,29;MFRL=147,172;MMQ=51,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,11:0.245:47:15,3:20,6:3,33,3,8
chr6	32498067	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=133.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,10:0,20:0,0,2,28
chr6	32498094	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr6	32546736	.	C	CAG	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=158,175;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:32546736_C_CAG:32546736:2,0,2,0
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chr6	32546743	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	32546765	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=32,26;MFRL=171,175;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr6	32546783	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=11;MBQ=25,34;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:0|1:32546783_T_C:32546783:1,0,5,0
chr6	32546795	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:32546783_T_C:32546783:0,0,5,1
chr6	32546800	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:32546783_T_C:32546783:0,0,6,1
chr6	32546805	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:32546783_T_C:32546783:0,0,8,1
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chr6	32546836	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=11;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:32546783_T_C:32546783:0,0,7,5
chr6	32546838	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0|1:32546783_T_C:32546783:0,0,7,5
chr6	32546863	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=145,102;MMQ=48,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:11,1:6,1:0|1:32546863_G_T:32546863:10,8,3,0
chr6	32546866	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,49;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,13:0,8:0,0,13,8
chr6	32546879	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=156,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.248:22:10,1:5,4:0|1:32546863_G_T:32546863:8,9,3,2
chr6	32546894	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=102,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:1,8:4,3:3,2,6,6
chr6	32546912	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=161,115;MMQ=60,55;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:7,1:2,3:0|1:32546912_A_AG:32546912:5,6,2,2
chr6	32546914	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=34,32;MFRL=159,115;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:7,1:2,3:0|1:32546912_A_AG:32546912:5,5,2,2
chr6	32546931	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=22,29;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,0:1,3:0|1:32546912_A_AG:32546912:2,2,1,2
chr6	32546935	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:32546912_A_AG:32546912:2,2,0,2
chr6	32547988	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=93.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0|1:32547988_T_C:32547988:0,0,14,7
chr6	32547991	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,53;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=93.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,7:0,13:0|1:32547988_T_C:32547988:0,0,14,7
chr6	32548006	.	AGG	A	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=118.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,9:0,16:0|1:32547988_T_C:32547988:0,0,16,11
chr6	32548031	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=28,22;MFRL=129,129;MMQ=40,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,1:12,0:0|1:32548031_C_T:32548031:8,13,1,1
chr6	32548032	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=26,30;MFRL=129,128;MMQ=34,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=81.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.877:22:1,9:1,11:1,1,8,12
chr6	32548049	.	TG	CA	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=152,129;MMQ=40,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,1:8,1:0|1:32548031_C_T:32548031:3,15,1,1
chr6	32548054	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=153,129;MMQ=40,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:8,1:0|1:32548031_C_T:32548031:1,14,1,1
chr6	32548058	.	GAGGAA	G	.	.	DP=17;ECNT=13;MBQ=35,35;MFRL=129,153;MMQ=34,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,15:0.842:17:1,6:1,9:0|1:32548058_GAGGAA_G:32548058:1,1,1,14
chr6	32548082	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,7:0,6:0|1:32548058_GAGGAA_G:32548058:0,0,0,15
chr6	32548086	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=13;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:32548058_GAGGAA_G:32548058:0,0,0,12
chr6	32548097	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:32548058_GAGGAA_G:32548058:0,0,0,10
chr6	32548118	.	A	ACAAC	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=31,30;MFRL=166,174;MMQ=37,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:32548118_A_ACAAC:32548118:1,3,0,1
chr6	32548119	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=33,34;MFRL=166,174;MMQ=37,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:32548118_A_ACAAC:32548118:1,3,0,1
chr6	32548143	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=173,181;MMQ=37,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,2:0|1:32548143_T_C:32548143:0,1,1,2
chr6	32548146	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=173,181;MMQ=37,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:32548143_T_C:32548143:0,1,1,2
chr6	32548167	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=173,99;MMQ=37,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,3:0,0:0,1,1,2
chr6	32548178	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,37;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	32548438	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=20;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,11:0,5:0|1:32548438_A_G:32548438:0,0,17,0
chr6	32548465	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=20;MBQ=32,28;MFRL=152,135;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,4:0.114:42:20,0:12,3:0|1:32548438_A_G:32548438:35,3,3,1
chr6	32548470	.	G	T	.	.	DP=56;ECNT=20;MBQ=34,30;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=157.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,39:0.714:54:8,26:5,10:0|1:32548438_A_G:32548438:12,3,37,2
chr6	32548484	.	A	T	.	.	DP=81;ECNT=20;MBQ=32,31;MFRL=142,166;MMQ=60,46;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,6:0.085:80:41,4:24,1:0|1:32548438_A_G:32548438:60,14,6,0
chr6	32548487	.	G	C	.	.	DP=90;ECNT=20;MBQ=33,33;MFRL=145,140;MMQ=50,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=113.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,31:0.348:90:31,16:22,11:0|1:32548438_A_G:32548438:50,9,26,5
chr6	32548488	.	C	T	.	.	DP=93;ECNT=20;MBQ=32,29;MFRL=138,149;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=104.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,29:0.316:93:38,13:22,11:0|1:32548438_A_G:32548438:53,11,26,3
chr6	32548489	.	C	G	.	.	DP=95;ECNT=20;MBQ=33,28;MFRL=145,131;MMQ=59,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,20:0.216:95:40,13:30,6:0|1:32548438_A_G:32548438:64,11,16,4
chr6	32548491	.	A	G	.	.	DP=95;ECNT=20;MBQ=30,34;MFRL=145,136;MMQ=50,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=116.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:61,33:0.354:94:34,22:26,10:0|1:32548438_A_G:32548438:52,9,27,6
chr6	32548497	.	AGAGC	A	.	.	DP=118;ECNT=20;MBQ=31,32;MFRL=143,146;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:106,12:0.108:118:53,7:30,5:0|1:32548438_A_G:32548438:89,17,10,2
chr6	32548498	.	G	C	.	.	DP=111;ECNT=20;MBQ=34,32;MFRL=149,132;MMQ=54,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=254.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,65:0.654:99:15,44:18,17:0|1:32548438_A_G:32548438:29,5,54,11
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chr6	32548662	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=20;MBQ=33,34;MFRL=159,165;MMQ=50,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=82.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,22:0.479:46:11,13:13,7:0|1:32548662_T_C:32548662:1,23,1,21
chr6	32548667	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=20;MBQ=32,33;MFRL=177,152;MMQ=50,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,17:0.429:40:12,7:10,8:0|1:32548661_G_T:32548661:1,22,1,16
chr6	32548669	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=20;MBQ=34,31;MFRL=165,152;MMQ=50,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.205:37:12,5:15,2:1,29,1,6
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chr6	32548674	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=20;MBQ=32,32;MFRL=165,153;MMQ=41,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.414:27:8,6:8,4:0|1:32548661_G_T:32548661:1,15,1,10
chr6	32548681	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=93.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,7:0,9:0|1:32548681_T_C:32548681:0,0,1,20
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chr6	32549284	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,47;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,2:0,0,3,1
chr6	32549296	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
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chr6	32549361	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:32549356_TG_CA:32549356:0,0,3,1
chr6	32549376	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:32549376_C_G:32549376:0,0,3,0
chr6	32549380	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=11;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:32549376_C_G:32549376:0,0,3,0
chr6	32549396	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=11;MBQ=29,35;MFRL=198,166;MMQ=33,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.662:8:0,1:1,3:0|1:32549396_C_G:32549396:3,0,5,0
chr6	32549398	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=24,31;MFRL=104,166;MMQ=33,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.553:10:1,2:1,3:0|1:32549396_C_G:32549396:5,0,5,0
chr6	32549401	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=152,104;MMQ=39,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.358:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr6	32549402	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=32,34;MFRL=104,152;MMQ=33,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.642:9:0,3:3,3:0|1:32549396_C_G:32549396:3,0,6,0
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chr6	32549475	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=30;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=184.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,46:0.980:46:0,23:0,19:0|1:32549464_T_C:32549464:0,0,33,13
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chr6	32557339	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=15;MBQ=32,29;MFRL=179,165;MMQ=34,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.849:18:2,8:0,8:0|1:32557319_A_T:32557319:2,0,15,1
chr6	32557365	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=32,34;MFRL=165,169;MMQ=27,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:6,2:11,3:0|1:32557365_A_C:32557365:13,5,5,0
chr6	32557370	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=15;MBQ=34,31;MFRL=159,172;MMQ=40,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,1:15,1:0|1:32557370_C_T:32557370:18,5,2,0
chr6	32557374	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=31,32;MFRL=169,157;MMQ=27,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:5,3:10,5:0|1:32557365_A_C:32557365:10,5,8,0
chr6	32557378	.	T	TTGC	.	.	DP=25;ECNT=15;MBQ=32,32;MFRL=155,172;MMQ=39,34;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:6,1:16,1:0|1:32557370_C_T:32557370:18,5,2,0
chr6	32557395	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=15;MBQ=33,34;MFRL=140,154;MMQ=27,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.335:31:8,5:11,5:0|1:32557365_A_C:32557365:16,5,10,0
chr6	32557398	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=31,30;MFRL=146,150;MMQ=27,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,5:0.187:30:8,3:15,2:0|1:32557370_C_T:32557370:21,4,5,0
chr6	32557402	.	CC	GT	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=32,33;MFRL=146,136;MMQ=27,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.219:30:8,3:15,2:0|1:32557370_C_T:32557370:20,4,6,0
chr6	32557405	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=15;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=129.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,12:0,17:0,0,26,5
chr6	32557414	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=15;MBQ=31,28;MFRL=148,161;MMQ=33,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:16,2:15,2:0|1:32557414_A_G:32557414:29,5,4,0
chr6	32557419	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=15;MBQ=32,31;MFRL=148,161;MMQ=33,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:16,2:15,1:0|1:32557414_A_G:32557414:29,5,4,0
chr6	32557422	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=146,122;MMQ=27,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.200:38:17,4:12,2:0|1:32557370_C_T:32557370:26,5,7,0
chr6	32557423	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=15;MBQ=29,31;MFRL=144,188;MMQ=33,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.379:35:13,8:7,5:20,2,12,1
chr6	32557435	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=15;MBQ=25,32;MFRL=118,142;MMQ=27,37;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=135.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,41:0.936:43:0,28:2,12:2,0,33,8
chr6	32557461	.	A	G	.	.	DP=105;ECNT=25;MBQ=32,27;MFRL=138,120;MMQ=40,47;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=74.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,22:0.219:103:38,11:39,10:0|1:32557461_A_G:32557461:47,34,12,10
chr6	32557465	.	G	A	.	.	DP=123;ECNT=25;MBQ=33,30;MFRL=140,119;MMQ=45,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:99,24:0.200:123:44,12:45,11:0|1:32557461_A_G:32557461:58,41,13,11
chr6	32557478	.	CG	AA,AG	.	.	DP=142;ECNT=25;MBQ=30,31,32;MFRL=120,132,147;MMQ=50,40,51;MPOS=16,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=70.53,80.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:72,30,34:0.219,0.251:136:35,16,14:34,10,18:38,34,39,25
chr6	32557483	.	T	C	.	.	DP=142;ECNT=25;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=628.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,142:0.993:142:0,68:0,67:0|1:32557461_A_G:32557461:0,0,80,62
chr6	32557487	.	G	A	.	.	DP=146;ECNT=25;MBQ=33,30;MFRL=129,118;MMQ=50,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=74.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:123,23:0.162:146:60,12:59,11:0|1:32557461_A_G:32557461:68,55,12,11
chr6	32557497	.	C	T	.	.	DP=143;ECNT=25;MBQ=33,32;MFRL=121,146;MMQ=51,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:130,13:0.097:143:63,8:66,5:0|1:32557461_A_G:32557461:70,60,5,8
chr6	32557504	.	G	A	.	.	DP=141;ECNT=25;MBQ=33,30;MFRL=118,147;MMQ=51,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:110,24:0.184:134:52,8:54,15:0|1:32557461_A_G:32557461:57,53,12,12
chr6	32557506	.	T	C	.	.	DP=137;ECNT=25;MBQ=32,33;MFRL=140,116;MMQ=51,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=269.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,74:0.552:133:27,33:28,38:0|1:32557461_A_G:32557461:28,31,40,34
chr6	32557544	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=25;MBQ=32,29;MFRL=130,110;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=60.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,18:0.389:47:15,7:12,9:0|1:32557461_A_G:32557461:11,18,5,13
chr6	32557549	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=25;MBQ=32,25;MFRL=124,111;MMQ=40,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.114:41:15,4:20,0:0|1:32557461_A_G:32557461:10,27,1,3
chr6	32557550	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=25;MBQ=31,31;MFRL=131,112;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,19:0.417:46:12,7:11,7:0|1:32557461_A_G:32557461:8,19,4,15
chr6	32557552	.	A	C,T	.	.	DP=43;ECNT=25;MBQ=0,34,30;MFRL=0,131,114;MMQ=60,40,40;MPOS=11,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=95.75,66.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,25,18:0.565,0.413:43:0,10,7:0,11,9:0,0,10,33
chr6	32557568	.	C	CAT	.	.	DP=26;ECNT=25;MBQ=34,37;MFRL=134,132;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,10:0.393:26:6,5:9,5:0|1:32557461_A_G:32557461:1,15,0,10
chr6	32557572	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=25;MBQ=33,29;MFRL=138,132;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:6,5:8,5:0|1:32557461_A_G:32557461:1,14,0,10
chr6	32557585	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=25;MBQ=29,35;MFRL=138,131;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.385:24:5,4:8,5:0|1:32557461_A_G:32557461:1,14,0,9
chr6	32557586	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=25;MBQ=34,35;MFRL=138,132;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,10:0.407:25:5,4:8,5:0|1:32557461_A_G:32557461:1,14,0,10
chr6	32557592	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=25;MBQ=34,31;MFRL=145,145;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,12:0.481:25:5,3:8,9:0|1:32557461_A_G:32557461:1,12,0,12
chr6	32557595	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=25;MBQ=32,32;MFRL=145,145;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,12:0.481:25:4,2:8,9:0|1:32557461_A_G:32557461:1,12,0,12
chr6	32557600	.	T	TC	.	.	DP=22;ECNT=25;MBQ=33,32;MFRL=150,148;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:3,2:7,9:0|1:32557461_A_G:32557461:1,10,0,11
chr6	32557601	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=25;MBQ=32,33;MFRL=169,148;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:3,2:7,9:0|1:32557461_A_G:32557461:1,9,0,11
chr6	32557605	.	AGT	A	.	.	DP=21;ECNT=25;MBQ=31,27;MFRL=169,148;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:3,1:6,7:0|1:32557461_A_G:32557461:1,9,0,11
chr6	32557608	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=25;MBQ=26,33;MFRL=150,158;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:2,1:4,8:0|1:32557461_A_G:32557461:1,8,0,9
chr6	32557610	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=25;MBQ=29,35;MFRL=150,158;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:2,1:4,7:0|1:32557461_A_G:32557461:1,6,0,9
chr6	32557611	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=25;MBQ=28,28;MFRL=163,150;MMQ=40,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:0,2:7,4:0|1:32557461_A_G:32557461:0,8,1,6
chr6	32557617	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=25;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=56.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0|1:32557461_A_G:32557461:0,0,1,12
chr6	32605132	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=159,168;MMQ=58,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr6	32605178	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=164,201;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:5,4:3,4:0|1:32605178_T_C:32605178:9,0,8,0
chr6	32605189	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=32,34;MFRL=162,167;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,6:4,7:10,0,13,0
chr6	32605207	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=31,34;MFRL=153,168;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,13:0.452:29:11,5:5,8:0|1:32605178_T_C:32605178:13,3,12,1
chr6	32605257	.	C	A	.	.	DP=60;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=147,145;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=89.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,26:0.464:56:16,17:14,8:21,9,19,7
chr6	32605274	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=8;MBQ=32,33;MFRL=147,139;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=111.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,30:0.463:65:16,19:18,8:21,14,20,10
chr6	32605284	.	G	A	.	.	DP=75;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=138,141;MMQ=50,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,37:0.512:72:23,19:11,16:24,11,21,16
chr6	32605295	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=125,132;MMQ=60,48;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,33:0.404:82:20,22:26,11:27,22,21,12
chr6	32605309	.	A	G	.	.	DP=82;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=138,121;MMQ=45,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,37:0.462:80:25,14:13,21:21,22,20,17
chr6	32605336	.	G	A	.	.	DP=69;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=140,138;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,31:0.487:64:12,21:19,10:14,19,9,22
chr6	32605380	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,14:0.431:33:9,5:9,8:1,18,0,14
chr6	32605400	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.470:28:6,6:8,7:0,15,0,13
chr6	32605418	.	GG	AC	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,5:7,5:0,11,0,10
chr6	32608998	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=165,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:3,4:1,0:4,0,4,1
chr6	32609042	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=34,31;MFRL=147,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.337:27:10,6:7,3:15,3,8,1
chr6	32609056	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=9;MBQ=31,32;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:11,8:9,3:15,5,8,3
chr6	32609094	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=9;MBQ=30,31;MFRL=137,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,14:0.358:40:16,8:9,6:15,11,6,8
chr6	32609105	.	GT	AC	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=33,28;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,14:0.311:46:20,8:12,5:15,17,5,9
chr6	32609126	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=9;MBQ=32,34;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.171:33:17,2:8,3:0|1:32609126_T_C:32609126:11,17,1,4
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chr6	32609142	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:15,1:8,1:9,14,0,3
chr6	32609173	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=9;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,5:0,0,4,12
chr6	32609371	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr6	32609647	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=30,34;MFRL=180,160;MMQ=50,35;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0|1:32609647_T_G:32609647:4,0,2,0
chr6	32609652	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=171,160;MMQ=60,35;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:0|1:32609647_T_G:32609647:8,0,2,0
chr6	32609654	.	GT	AG	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=33,33;MFRL=171,160;MMQ=60,35;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:0|1:32609647_T_G:32609647:8,0,2,0
chr6	32609671	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=34,32;MFRL=171,154;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:6,1:2,2:0|1:32609671_G_A:32609671:8,0,3,0
chr6	32609673	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=9;MBQ=35,32;MFRL=171,154;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:5,1:2,2:0|1:32609671_G_A:32609671:8,0,3,0
chr6	32609696	.	A	AGAAG	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=161,154;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.261:17:8,1:4,2:0|1:32609696_A_AGAAG:32609696:12,1,4,0
chr6	32609697	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=161,154;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.261:17:8,0:4,3:0|1:32609696_A_AGAAG:32609696:12,1,4,0
chr6	32609722	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=33,30;MFRL=124,126;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.194:27:11,2:11,2:19,3,4,1
chr6	32609746	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=9;MBQ=33,31;MFRL=133,136;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,14:0.313:46:15,8:15,6:26,6,11,3
chr6	32609855	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=154,173;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:11,1:16,4:16,12,2,3
chr6	32609873	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=158,175;MMQ=52,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.153:41:17,2:18,3:19,16,2,4
chr6	32610008	.	CC	TG	.	.	DP=104;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=129,156;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:77,24:0.243:101:45,11:30,12:38,39,21,3
chr6	32610047	.	T	C	.	.	DP=95;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,29:0.318:92:34,10:27,18:20,43,3,26
chr6	32610059	.	T	G	.	.	DP=82;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=123,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=81.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,28:0.373:76:27,7:19,21:10,38,3,25
chr6	32610099	.	TC	T	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=64.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,18:0.464:39:12,7:9,9:0|1:32610099_TC_T:32610099:0,21,0,18
chr6	32610109	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,16:0.486:33:9,8:8,7:0|1:32610099_TC_T:32610099:0,17,0,16
chr6	32610349	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=12;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=54.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,12:0,3:0,0,13,2
chr6	32610401	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=163,158;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,13:0.341:39:16,9:10,3:0|1:32610401_G_A:32610401:17,9,9,4
chr6	32610403	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=12;MBQ=33,30;MFRL=163,158;MMQ=60,52;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,13:0.341:39:16,9:9,4:0|1:32610401_G_A:32610401:17,9,9,4
chr6	32610436	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,19:0,13:0,0,22,12
chr6	32610461	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,15:0,10:0,0,14,11
chr6	32610478	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=12;MBQ=33,32;MFRL=155,155;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,8:0.255:33:10,5:12,2:0|1:32610478_C_G:32610478:13,12,1,7
chr6	32610481	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=12;MBQ=32,26;MFRL=155,151;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,9:0.276:34:11,5:13,1:0|1:32610478_C_G:32610478:13,12,1,8
chr6	32610487	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=12;MBQ=35,33;MFRL=154,165;MMQ=49,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,6:0.219:30:11,4:11,2:0|1:32610478_C_G:32610478:12,12,0,6
chr6	32610495	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=33,33;MFRL=152,175;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.242:31:12,5:11,2:0|1:32610478_C_G:32610478:9,15,1,6
chr6	32610535	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=152,184;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.225:38:18,4:11,4:6,24,1,7
chr6	32610553	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=33,31;MFRL=144,205;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:17,1:5,1:0|1:32610553_G_A:32610553:4,21,1,1
chr6	32610556	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=144,205;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:16,1:6,1:0|1:32610553_G_A:32610553:4,21,1,1
chr6	32627882	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=19;MBQ=34,28;MFRL=178,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	32627923	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=19;MBQ=32,27;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,0:2,2:3,0,3,0
chr6	32627956	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=19;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:32627956_C_G:32627956:0,0,8,0
chr6	32627958	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=19;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:32627956_C_G:32627956:0,0,9,0
chr6	32627967	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=19;MBQ=32,27;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:1,2:4,4:0|1:32627967_A_G:32627967:6,0,7,1
chr6	32627969	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:0|1:32627967_A_G:32627967:6,0,7,1
chr6	32627976	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=19;MBQ=34,33;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:2,4:5,4:0|1:32627967_A_G:32627967:7,1,7,1
chr6	32627988	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=19;MBQ=32,34;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,9:0.417:22:8,4:3,5:0|1:32627988_A_G:32627988:11,2,8,1
chr6	32627991	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=32,32;MFRL=119,0;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:8,4:3,5:0|1:32627988_A_G:32627988:10,2,8,1
chr6	32627992	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=31,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:4,8:5,3:8,1,10,2
chr6	32628001	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=19;MBQ=30,32;MFRL=106,0;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,11:0.480:23:7,4:5,7:0|1:32627988_A_G:32627988:9,3,8,3
chr6	32628022	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=19;MBQ=32,35;MFRL=111,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,12:0.371:33:9,6:12,5:0|1:32628022_A_G:32628022:12,9,7,5
chr6	32628030	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=19;MBQ=34,32;MFRL=121,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=63.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,17:0.462:37:9,10:10,6:0|1:32628022_A_G:32628022:10,10,6,11
chr6	32628045	.	CAT	GAT,GGA	.	.	DP=33;ECNT=19;MBQ=0,34,32;MFRL=0,127,110;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=65.92,52.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,19,14:0.556,0.417:33:0,10,8:0,8,6:0,0,13,20
chr6	32628064	.	TC	CG	.	.	DP=29;ECNT=19;MBQ=28,27;MFRL=127,121;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,10:0.355:29:8,5:10,5:0|1:32628022_A_G:32628022:6,13,0,10
chr6	32628079	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=35,32;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:3,5:8,3:0|1:32628022_A_G:32628022:2,10,0,8
chr6	32628093	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=19;MBQ=33,31;MFRL=158,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:4,5:6,2:0|1:32628022_A_G:32628022:1,9,0,7
chr6	32628127	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=19;MBQ=32,28;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:32628127_T_TG:32628127:0,3,0,1
chr6	32628129	.	G	GCTC	.	.	DP=5;ECNT=19;MBQ=35,33;MFRL=180,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:32628127_T_TG:32628127:0,3,0,1
chr6	32628505	.	TC	GA	.	.	DP=5;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr6	32628538	.	GG	TA	.	.	DP=15;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:5,3:2,3:0|1:32628538_GG_TA:32628538:7,2,6,0
chr6	32628543	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=31,31;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,6:4,3:7,0,7,2
chr6	32628549	.	TG	GA	.	.	DP=18;ECNT=15;MBQ=31,34;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:6,2:4,4:0|1:32628538_GG_TA:32628538:9,2,7,0
chr6	32628556	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=15;MBQ=33,31;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:6,3:5,6:0|1:32628538_GG_TA:32628538:10,2,9,0
chr6	32628568	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=31,35;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:8,3:6,6:0|1:32628568_A_G:32628568:11,3,9,0
chr6	32628571	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=15;MBQ=33,32;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.385:24:7,3:7,5:0|1:32628568_A_G:32628568:11,4,9,0
chr6	32628595	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=31,33;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.257:32:10,3:12,4:20,4,8,0
chr6	32628605	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=31,32;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.234:31:7,3:13,3:19,5,5,2
chr6	32628617	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=32,33;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.304:31:7,5:14,4:16,6,6,3
chr6	32628633	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=15;MBQ=30,33;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.351:35:9,6:14,4:13,10,7,5
chr6	32628712	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:7,8:7,6:4,10,2,12
chr6	32628736	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=163,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:4,6:5,3:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,8,1,8
chr6	32628741	.	C	CTTAA	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=34,31;MFRL=163,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:2,6:4,3:0|1:32628736_CA_TG:32628736:0,7,1,8
chr6	32628751	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=15;MBQ=33,30;MFRL=171,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:0,1:5,2:0|1:32628736_CA_TG:32628736:0,5,0,4
chr6	32629022	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=0,23;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.767:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr6	32629064	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=166,152;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:0|1:32629064_A_T:32629064:9,0,2,0
chr6	32629066	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=166,152;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,1:4,1:0|1:32629064_A_T:32629064:9,0,2,0
chr6	32629110	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=163,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,5:6,3:12,4,7,1
chr6	32629129	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=32,30;MFRL=132,156;MMQ=50,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.635:31:6,11:2,7:8,3,16,4
chr6	32629137	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=11;MBQ=32,33;MFRL=154,132;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,13:0.380:35:13,8:5,3:0|1:32629137_T_G:32629137:15,7,8,5
chr6	32629141	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=11;MBQ=31,29;MFRL=154,132;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,13:0.400:33:14,7:5,4:0|1:32629137_T_G:32629137:14,6,8,5
chr6	32629146	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=34,30;MFRL=154,130;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,11:0.375:30:12,7:5,3:0|1:32629137_T_G:32629137:14,5,6,5
chr6	32629155	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=133,154;MMQ=40,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,21:0.665:31:7,13:3,7:4,6,15,6
chr6	32629161	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=154,148;MMQ=60,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,9:0.312:30:12,7:8,2:0|1:32629137_T_G:32629137:14,7,4,5
chr6	32629193	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=11;MBQ=26,32;MFRL=158,155;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.297:35:15,6:10,4:7,18,6,4
chr6	32629239	.	AG	GA	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=31,33;MFRL=158,171;MMQ=55,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:14,0:4,2:0|1:32629239_AG_GA:32629239:1,18,2,0
chr6	32629240	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,5:0,0,3,17
chr6	32629246	.	A	AG	.	.	DP=21;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=170,171;MMQ=59,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:12,0:3,2:0|1:32629239_AG_GA:32629239:1,18,2,0
chr6	32629247	.	A	AC,C	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=0,29,30;MFRL=0,165,171;MMQ=60,58,40;MPOS=11,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=83.11,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,20,2:0.840,0.120:22:0,13,0:0,3,1:0,0,3,19
chr6	32629257	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=82.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,14:0,4:0,0,1,18
chr6	32629259	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=12;MBQ=31,27;MFRL=158,159;MMQ=55,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.292:15:8,3:3,1:0|1:32629259_T_C:32629259:1,10,0,4
chr6	32629269	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=12;MBQ=34,30;MFRL=164,159;MMQ=55,57;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:7,3:3,1:0|1:32629259_T_C:32629259:1,9,0,4
chr6	32629297	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=33,35;MFRL=197,184;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,5:0,2:0,3,0,7
chr6	32629314	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=30,30;MFRL=197,184;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:0,3,0,7
chr6	32629320	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=12;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr6	32629328	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=12;MBQ=34,32;MFRL=200,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:32629328_G_A:32629328:0,2,0,4
chr6	32629330	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=12;MBQ=36,32;MFRL=200,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:32629328_G_A:32629328:0,2,0,4
chr6	32629697	.	T	TCTGCC	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=183,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,0:4,5:5,0,5,0
chr6	32629708	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=30,28;MFRL=140,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,2:1,9:1,0,11,1
chr6	32629718	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:1,2:6,6:0|1:32629718_G_A:32629718:8,0,7,1
chr6	32629737	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.468:17:2,2:6,5:0|1:32629718_G_A:32629718:8,1,6,2
chr6	32629755	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=156,164;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,14:0.652:21:3,3:4,10:0|1:32629755_G_A:32629755:5,2,11,3
chr6	32629764	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=140,164;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,15:0.569:26:4,3:7,11:0|1:32629755_G_A:32629755:8,3,12,3
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chr6	32629868	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=21;MBQ=31,33;MFRL=160,134;MMQ=60,50;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,19:0.556:34:5,9:9,10:5,10,9,10
chr6	32629889	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=21;MBQ=29,32;MFRL=133,166;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,14:0.395:36:9,6:11,8:0|1:32629889_G_A:32629889:10,12,4,10
chr6	32629891	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=21;MBQ=34,32;MFRL=133,166;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,14:0.395:36:8,6:12,6:0|1:32629889_G_A:32629889:10,12,4,10
chr6	32629904	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=21;MBQ=31,33;MFRL=151,176;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.357:29:8,5:10,5:7,12,1,9
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chr6	32629936	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=21;MBQ=33,32;MFRL=160,133;MMQ=40,44;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.657:33:5,7:6,15:3,8,13,9
chr6	32629955	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=21;MBQ=31,32;MFRL=131,157;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:7,5:10,5:11,6,5,6
chr6	32629963	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=21;MBQ=33,30;MFRL=158,134;MMQ=40,40;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.580:29:6,7:6,10:6,6,12,5
chr6	32630028	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=21;MBQ=34,31;MFRL=160,162;MMQ=27,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,6:3,3:2,5,2,7
chr6	32630053	.	CAT	C	.	.	DP=16;ECNT=21;MBQ=35,34;MFRL=161,156;MMQ=45,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,3:2,6:0,7,1,8
chr6	32630055	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=21;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,45;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.919:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr6	32630066	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=21;MBQ=33,28;MFRL=155,162;MMQ=33,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:0,8,0,8
chr6	32630073	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=21;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0|1:32630073_A_C:32630073:0,0,0,13
chr6	32630080	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=21;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0|1:32630073_A_C:32630073:0,0,0,11
chr6	32630087	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=21;MBQ=30,29;MFRL=157,169;MMQ=42,52;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:2,1:0,6,0,4
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chr6	32630099	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=21;MBQ=33,30;MFRL=162,157;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0|1:32630093_GA_TG:32630093:0,3,0,4
chr6	32630101	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=21;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,45;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:32630073_A_C:32630073:0,0,0,7
chr6	32630112	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=21;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	32632587	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=19;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32632587_A_G:32632587:0,0,1,0
chr6	32632598	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=19;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:32632587_A_G:32632587:0,0,1,0
chr6	32632628	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=19;MBQ=32,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0|1:32632628_G_C:32632628:0,1,2,2
chr6	32632635	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=19;MBQ=28,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0|1:32632628_G_C:32632628:0,1,3,2
chr6	32632637	.	TC	GA	.	.	DP=6;ECNT=19;MBQ=31,29;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0|1:32632628_G_C:32632628:0,1,3,2
chr6	32632647	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=19;MBQ=29,33;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:0,3:0|1:32632628_G_C:32632628:1,2,2,2
chr6	32632650	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=19;MBQ=34,32;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:2,2,1,2
chr6	32632687	.	AT	GG	.	.	DP=10;ECNT=19;MBQ=32,28;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:0,2:2,4:0|1:32632687_AT_GG:32632687:3,0,6,1
chr6	32632688	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=19;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.840:3:0,0:0,2:0|1:32632688_T_A:32632688:0,0,3,0
chr6	32632694	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=19;MBQ=32,28;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:0|1:32632687_AT_GG:32632687:3,0,6,1
chr6	32632700	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=19;MBQ=31,31;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:0,1:3,5:0|1:32632687_AT_GG:32632687:4,1,8,1
chr6	32632711	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=32,32;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:4,1:10,4:0|1:32632688_T_A:32632688:13,1,5,1
chr6	32632714	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=19;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,14:0,0,18,1
chr6	32632717	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=19;MBQ=34,32;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,12:0.650:18:1,2:5,8:0|1:32632687_AT_GG:32632687:5,1,12,0
chr6	32632744	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=19;MBQ=33,28;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,4:5,9:8,2,11,2
chr6	32632745	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,11:0.429:26:4,4:10,4:0|1:32632745_G_A:32632745:12,3,9,2
chr6	32632770	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=19;MBQ=29,33;MFRL=120,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,15:0.372:41:11,7:12,6:0|1:32632745_G_A:32632745:20,6,12,3
chr6	32632781	.	AGA	CCC	.	.	DP=46;ECNT=19;MBQ=32,33;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,18:0.413:44:12,8:13,8:0|1:32632745_G_A:32632745:17,9,14,4
chr6	32632818	.	T	G	.	.	DP=55;ECNT=19;MBQ=30,34;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,17:0.318:54:20,7:17,9:21,16,9,8
chr6	32632832	.	A	T	.	.	DP=52;ECNT=9;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=172.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.981:50:0,22:0,24:0,0,23,27
chr6	32632859	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=9;MBQ=28,33;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,11:0.342:33:9,3:13,7:0|1:32632859_C_G:32632859:6,16,2,9
chr6	32632864	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=9;MBQ=31,31;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,11:0.364:31:6,3:12,8:0|1:32632859_C_G:32632859:4,16,2,9
chr6	32632872	.	A	AGGCCCCGGCCC	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=133,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:2,3:6,6:1,7,0,10
chr6	32632878	.	C	CAGCCTGGCCCT	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=34,36;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.394:21:5,2:7,5:0|1:32632878_C_CAGCCTGGCCCT:32632878:0,13,1,7
chr6	32632886	.	C	CTG	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=34,34;MFRL=155,139;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.317:17:4,2:6,3:0|1:32632878_C_CAGCCTGGCCCT:32632878:0,12,0,5
chr6	32632892	.	CCG	C	.	.	DP=22;ECNT=9;MBQ=34,34;MFRL=162,154;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.296:15:5,1:6,3:0|1:32632878_C_CAGCCTGGCCCT:32632878:0,11,0,4
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chr6	32709363	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.516:29:5,4:8,8:0|1:32709346_T_C:32709346:1,13,1,14
chr6	32709370	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,11:0.500:22:5,4:6,7:0|1:32709346_T_C:32709346:0,11,0,11
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chr6	32713188	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:0,7,1,6
chr6	32713487	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	32713521	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,34;MFRL=142,177;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:12,1,2,0
chr6	32713541	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=142,177;MMQ=60,33;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,2:9,0:0|1:32713541_C_T:32713541:20,5,2,0
chr6	32713545	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=141,177;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:14,2:10,0:0|1:32713541_C_T:32713541:19,5,2,0
chr6	32713565	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=155,177;MMQ=60,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:17,2:16,0:27,9,2,0
chr6	32713827	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=133,171;MMQ=54,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,14:0.178:80:32,7:33,6:29,37,1,13
chr6	32713888	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.502:42:6,6:14,15:6,15,7,14
chr6	32714108	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=16;MBQ=31,33;MFRL=137,140;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,3:0.074:52:23,1:25,2:0|1:32714108_C_G:32714108:25,24,3,0
chr6	32714111	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=16;MBQ=31,33;MFRL=140,140;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,3:0.075:51:20,1:22,2:0|1:32714108_C_G:32714108:25,23,3,0
chr6	32714117	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=16;MBQ=34,35;MFRL=143,140;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:22,0:19,2:0|1:32714108_C_G:32714108:22,23,3,0
chr6	32714125	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=16;MBQ=31,27;MFRL=142,104;MMQ=45,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,3:0.071:54:25,0:24,3:0|1:32714108_C_G:32714108:22,29,3,0
chr6	32714164	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=16;MBQ=31,34;MFRL=137,122;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.149:45:18,1:18,5:15,24,2,4
chr6	32714168	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=16;MBQ=31,35;MFRL=125,144;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,8:0.180:44:18,3:18,5:12,24,3,5
chr6	32714175	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,15:0.369:42:10,9:17,6:8,19,3,12
chr6	32714182	.	GA	G	.	.	DP=43;ECNT=16;MBQ=33,35;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.336:37:8,5:16,6:4,21,3,9
chr6	32714210	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:2,3:10,6:0|1:32714210_G_A:32714210:1,11,0,9
chr6	32714219	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=16;MBQ=29,33;MFRL=162,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:0,3:8,6:0|1:32714210_G_A:32714210:0,9,0,9
chr6	32714220	.	CCTCAGTA	C	.	.	DP=21;ECNT=16;MBQ=34,34;MFRL=190,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:1,3:8,6:0|1:32714210_G_A:32714210:0,12,0,9
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chr6	32724317	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=134,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,2:2,3:0|1:32724305_T_C:32724305:0,5,1,5
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chr6	32725062	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=117,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:7,5:12,7:7,12,3,9
chr6	32725153	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:0,1:7,2:0,7,0,3
chr6	32725517	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=32,34;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,4:3,5:6,0,7,2
chr6	32725523	.	T	TC	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=33,33;MFRL=118,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,3:3,5:6,0,6,2
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chr6	32725567	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=127,96;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:8,1:12,2:0|1:32725559_C_T:32725559:13,9,2,1
chr6	32725572	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=34,32;MFRL=127,96;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:10,1:9,2:0|1:32725559_C_T:32725559:12,8,2,1
chr6	32725619	.	TG	CA	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=114,164;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.347:21:9,4:5,2:0|1:32725619_TG_CA:32725619:7,7,3,4
chr6	32725625	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=111,153;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:10,5:5,3:0|1:32725619_TG_CA:32725619:7,8,3,5
chr6	32725666	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=33,32;MFRL=164,121;MMQ=60,45;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.261:20:9,2:5,2:4,11,0,5
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chr6	32725673	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=28,34;MFRL=170,133;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:7,7:4,3:0|1:32725672_A_AG:32725672:3,8,1,9
chr6	32725682	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=13;MBQ=33,35;MFRL=164,121;MMQ=60,44;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:10,2:5,1:0|1:32725682_G_C:32725682:4,11,0,3
chr6	32725685	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=13;MBQ=31,28;MFRL=167,121;MMQ=60,44;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:10,2:3,1:0|1:32725682_G_C:32725682:3,11,0,3
chr6	32725695	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=13;MBQ=35,30;MFRL=180,145;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:7,1:1,1:0|1:32725682_G_C:32725682:0,8,0,2
chr6	32726577	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr6	32726803	.	C	T	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=76.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,26:0.491:53:13,13:14,13:17,10,20,6
chr6	32726838	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=134,138;MMQ=51,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=82.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,30:0.646:46:6,13:10,17:8,8,16,14
chr6	32726967	.	GC	TT	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=32,25;MFRL=191,187;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:6,2:4,0:0|1:32726967_GC_TT:32726967:0,11,0,4
chr6	32726971	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=191,187;MMQ=60,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:6,3:4,1:0|1:32726967_GC_TT:32726967:0,11,0,4
chr6	32726972	.	C	CCAT	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=195,187;MMQ=60,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:0|1:32726967_GC_TT:32726967:0,10,0,4
chr6	32726974	.	GTGA	G	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=195,187;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:6,3:3,1:0|1:32726967_GC_TT:32726967:0,10,0,4
chr6	32726981	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=174,187;MMQ=60,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:0|1:32726967_GC_TT:32726967:0,6,0,4
chr6	32727002	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=222,187;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:0,6,0,4
chr6	32727004	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=221,188;MMQ=60,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,5:0,2:0,3,0,7
chr6	32729381	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=137,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:1,0,2,0
chr6	32729459	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:2,3,1,1
chr6	32729642	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.463:28:7,8:8,4:9,6,8,5
chr6	32729734	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,0:6,6:1,11,0,6
chr6	32781077	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=171,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:1,1:3,2,2,0
chr6	32782112	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=119,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:5,6:6,1:7,4,5,3
chr6	32782387	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=158,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:1,3:3,8:0,5,6,5
chr6	32784620	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.411:20:4,3:7,5:10,2,7,1
chr6	32784753	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:5,5:2,6:0,7,3,8
chr6	32784783	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:0,8,0,4
chr6	32790099	.	G	GA	.	.	DP=84;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,4:0.084:56:12,0:14,0:19,33,0,4
chr6	32790167	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=158,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:9,16:8,9:0,17,0,25
chr6	32796653	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=137,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr6	32796751	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=104,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:4,6:0,1:1,3,3,4
chr6	32796857	.	ACAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=224,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	32797115	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=125,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:2,1:8,0,2,0
chr6	32797168	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=127,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.248:17:10,1:3,2:8,5,2,2
chr6	32797297	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,4:3,5:1,8,1,8
chr6	32797684	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=127,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:7,4:10,5:11,6,7,2
chr6	32803408	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:5,7:7,5:10,2,9,3
chr6	32805470	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=113.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,16:0,17:0,0,18,16
chr6	32809223	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,2:0,3:1,0,6,0
chr6	32809848	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,19,4
chr6	32810443	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.947:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr6	32811629	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,10,4
chr6	32815080	.	C	CAGACACGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr6	32816958	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	32821447	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,0,8
chr6	32904949	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=150,110;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.139:38:17,4:16,0:25,8,0,5
chr6	32904981	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=128.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.976:37:0,21:0,15:0,0,26,11
chr6	32916540	.	A	ACTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	32916699	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,1:5,3:3,7,1,4
chr6	32916746	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32916746_G_C:32916746:0,2,0,1
chr6	32916748	.	A	AGGGGCTGCTCTCCAG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32916746_G_C:32916746:0,2,0,1
chr6	32917544	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,5:5,7:5,6,6,6
chr6	32942302	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:5,12:9,6:6,8,12,6
chr6	32943062	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=139,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.492:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr6	32943086	.	T	TGAGA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=GA;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:0,1:3,4:3,0,5,0
chr6	32943151	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,8:5,3:2,4,10,1
chr6	32943345	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:6,3:8,13:1,13,1,15
chr6	32943979	.	C	CT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=71.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,24:0.472:51:16,13:10,11:3,24,5,19
chr6	32944746	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=102,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:1,1,0,3
chr6	32945530	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=159.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,25:0,18:0,0,21,22
chr6	32945698	.	TGAG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:2,1:2,4,1,3
chr6	32946133	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,19:0.476:40:12,8:9,11:6,15,4,15
chr6	32974934	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.606:36:6,10:8,12:6,8,15,7
chr6	32975014	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=106,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.521:27:3,8:9,6:5,8,5,9
chr6	32975257	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.447:36:9,8:11,8:11,9,9,7
chr6	32975381	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0,8,0,3
chr6	32975720	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=64,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr6	32975869	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,3:4,3:7,4,3,3
chr6	32975896	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,5:3,6:2,4,5,6
chr6	32977315	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=146,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,1,2
chr6	33036977	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:11,0:18,2:15,14,1,1
chr6	33048380	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr6	33048457	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.948:17:0,8:0,7:0|1:33048457_C_G:33048457:0,0,9,8
chr6	33048459	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0|1:33048457_C_G:33048457:0,0,9,8
chr6	33048461	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,8:0,6:0|1:33048457_C_G:33048457:0,0,10,8
chr6	33048466	.	GG	TT	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=78.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0|1:33048457_C_G:33048457:0,0,10,8
chr6	33048542	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=11;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr6	33048599	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=11;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0|1:33048599_C_A:33048599:0,0,4,7
chr6	33048602	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0|1:33048599_C_A:33048599:0,0,4,7
chr6	33048606	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=11;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0|1:33048599_C_A:33048599:0,0,3,7
chr6	33048628	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=20,33;MFRL=76,124;MMQ=49,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,4:1,3:1,0,2,5
chr6	33048661	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=0,34;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0|1:33048661_A_G:33048661:0,0,4,1
chr6	33048663	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=11;MBQ=0,30;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:33048661_A_G:33048661:0,0,4,1
chr6	33048686	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=0,20;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0|1:33048686_G_A:33048686:0,0,3,3
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chr6	33053682	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=109.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,18:0,15:0,0,8,25
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chr6	33053728	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0|1:33053723_T_C:33053723:0,0,0,15
chr6	33053736	.	GGT	G	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0|1:33053723_T_C:33053723:0,0,0,13
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chr6	33053772	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0|1:33053772_G_A:33053772:0,0,0,7
chr6	33053780	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0|1:33053772_G_A:33053772:0,0,0,5
chr6	33053868	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=16;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:33053868_A_G:33053868:0,0,7,0
chr6	33053871	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=16;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0|1:33053868_A_G:33053868:0,0,8,0
chr6	33053877	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=16;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,4:0|1:33053868_A_G:33053868:0,0,10,0
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chr6	33053890	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=16;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0|1:33053868_A_G:33053868:0,0,11,0
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chr6	33053906	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=16;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0|1:33053868_A_G:33053868:0,0,14,0
chr6	33053942	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=16;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=86.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,9:0,15:0,0,22,2
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chr6	33053971	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=16;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=220.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,50:0.981:50:0,19:0,29:0|1:33053968_T_A:33053968:0,0,29,21
chr6	33053982	.	G	C	.	.	DP=57;ECNT=16;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=243.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,56:0.983:56:0,21:0,33:0|1:33053968_T_A:33053968:0,0,33,23
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chr6	33054071	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=16;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=128.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,16:0,9:0|1:33054046_T_G:33054046:0,0,10,19
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chr6	33054235	.	T	G	.	.	DP=64;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=266.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,61:0.984:61:0,34:0,26:0|1:33054227_G_A:33054227:0,0,45,16
chr6	33054268	.	C	A	.	.	DP=85;ECNT=16;MBQ=34,32;MFRL=129,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=255.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,80:0.976:81:1,44:0,32:1,0,47,33
chr6	33054280	.	TG	CA	.	.	DP=91;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=129,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=393.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,89:0.978:90:1,51:0,35:1,0,45,44
chr6	33054302	.	T	C	.	.	DP=90;ECNT=16;MBQ=34,33;MFRL=129,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=287.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,84:0.966:86:1,49:0,35:1,1,41,43
chr6	33054325	.	G	C	.	.	DP=72;ECNT=16;MBQ=32,34;MFRL=129,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=292.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,68:0.972:69:1,33:0,33:0|1:33054325_G_C:33054325:0,1,30,38
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chr6	33054342	.	T	A	.	.	DP=62;ECNT=16;MBQ=32,31;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=193.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,58:0.968:59:1,23:0,34:0,1,22,36
chr6	33054353	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=16;MBQ=35,31;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=224.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,54:0.965:55:1,19:0,32:0|1:33054353_G_A:33054353:0,1,14,40
chr6	33054355	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=16;MBQ=32,34;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=224.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,54:0.965:55:1,20:0,31:0|1:33054353_G_A:33054353:0,1,14,40
chr6	33054373	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=16;MBQ=0,31;MFRL=129,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=164.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,39:0.953:40:0,14:0,23:0|1:33054373_C_T:33054373:0,1,6,33
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chr6	33054400	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=16;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=108.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0|1:33054400_T_C:33054400:0,0,0,25
chr6	33054404	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=16;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=105.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,12:0,10:0|1:33054400_T_C:33054400:0,0,0,24
chr6	33054410	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=16;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,9:0,8:0|1:33054400_T_C:33054400:0,0,0,20
chr6	33054413	.	TT	GA	.	.	DP=21;ECNT=16;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=88.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,9:0,10:0|1:33054400_T_C:33054400:0,0,0,20
chr6	33054457	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=16;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr6	33132338	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	33134102	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	33134392	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,4:0,0,6,10
chr6	33135391	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=14,26;MFRL=150,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.642:6:0,1:0,2:0,2,1,3
chr6	33135722	.	GC	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=172,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	33136575	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,4,18
chr6	33136638	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	33136675	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=104,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.625:11:4,4:0,3:0,4,0,7
chr6	33137727	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:5,1:4,5:5,4,3,4
chr6	33138498	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr6	33138677	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=90,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:2,3,0,3
chr6	33138746	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	33138955	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,15,0
chr6	33139328	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,6:0,0,4,8
chr6	33139475	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=105.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,13:0,0,5,24
chr6	33139662	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr6	33140009	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	33140257	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:2,1:2,0:2,2,1,1
chr6	33140265	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=183,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:0,1:2,3,1,1
chr6	33140983	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	33141161	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	33141920	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	33142012	.	AG	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=96,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.506:27:7,5:6,9:5,8,7,7
chr6	33142253	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=192,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=70.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.926:24:0,12:1,9:0,1,15,8
chr6	33143756	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:3,9:4,7:7,0,12,4
chr6	33143948	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr6	33144243	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,7,9
chr6	33144373	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr6	33146053	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=132,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:1,3,2,4
chr6	33147589	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	33148087	.	A	ACTAACG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:3,0,0,1
chr6	33148878	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:6,6:4,6:6,4,9,4
chr6	33162540	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:4,1,1,6
chr6	33163451	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	33165780	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr6	33166034	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=153,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.521:23:7,6:3,4:8,3,7,5
chr6	33172905	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr6	33172932	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=75.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,8:0,0,19,5
chr6	33173748	.	CAGAGAGAGAG	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,8;RU=AG;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.434:5:1,1:2,1:1,2,1,1
chr6	33173842	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=173,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:7,4:9,11:16,0,13,2
chr6	33174459	.	A	AC	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=127,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.387:39:7,4:13,7:10,14,6,9
chr6	33176749	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:1,8,0,10
chr6	33180045	.	T	TC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=94,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.213:25:6,0:13,4:8,12,0,5
chr6	33218797	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,1:10,1:8,12,0,2
chr6	33239905	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.395:28:7,8:10,2:5,12,3,8
chr6	33240506	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=66.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.525:38:10,10:8,10:3,15,2,18
chr6	33246518	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:7,3:2,2:4,5,2,4
chr6	33254556	.	C	CG	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=131.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,25:0,12:0,0,27,11
chr6	33255067	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,5:5,3:6,1,8,1
chr6	33255103	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,16,5
chr6	33255577	.	C	CATCCTTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,19;MFRL=239,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:33255577_C_CATCCTTGT:33255577:0,1,0,1
chr6	33255579	.	A	AACCCTGCACG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=239,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33255577_C_CATCCTTGT:33255577:0,1,0,1
chr6	33256096	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,11:0,0,9,9
chr6	33256138	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,3:8,3:5,9,5,1
chr6	33256397	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.475:38:8,9:12,9:11,9,13,5
chr6	33256471	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr6	33256984	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0,0,1,10
chr6	33258443	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,5,12
chr6	33260186	.	CTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:4,2,3,1
chr6	33260215	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=190,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:8,1,5,0
chr6	33260398	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:33260398_A_G:33260398:0,3,0,1
chr6	33260400	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:33260398_A_G:33260398:0,3,0,1
chr6	33260410	.	T	TTGCCAACCCCAGCTCCCCTGGAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr6	33261871	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.388:13:5,2:3,2:4,4,2,3
chr6	33269689	.	C	CTG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	33272712	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,8:0,0,11,3
chr6	33272855	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=84.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,11:0,13:0,0,9,15
chr6	33281842	.	GA	TT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,1:6,1:5,4,0,2
chr6	33283766	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=68.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,10:0,0,12,10
chr6	33288075	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:4,3:2,2:3,3,6,0
chr6	33288244	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=141,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:7,2:12,0:5,14,1,1
chr6	33288271	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,4:1,5:0,4,1,9
chr6	33290547	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr6	33290611	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,10;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:2,1,1,0
chr6	33359716	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=96.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,12:0,0,20,9
chr6	33359820	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,0,20
chr6	33365981	.	GGT	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.120:22:6,2:9,0:10,10,0,2
chr6	33373433	.	T	TAGGGCACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33373433_T_TAGGGCACA:33373433:0,0,0,1
chr6	33373439	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33373433_T_TAGGGCACA:33373433:0,0,0,1
chr6	33379941	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,157;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.420:12:5,2:2,3:6,1,5,0
chr6	33382943	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=116.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,21:0,13:0,0,17,17
chr6	33385205	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=191,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.654:27:3,9:6,8:7,2,15,3
chr6	33400427	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,14;MFRL=215,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.613:3:0,0:1,0:0|1:33400427_T_A:33400427:0,1,2,0
chr6	33400432	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=37,24;MFRL=215,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:33400427_T_A:33400427:0,1,2,0
chr6	33400437	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=37,12;MFRL=6620087,219;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:0|1:33400427_T_A:33400427:0,2,2,0
chr6	33402881	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,14;MFRL=0,125;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:33402881_G_A:33402881:0,1,1,0
chr6	33402884	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=13,18;MFRL=0,125;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:33402881_G_A:33402881:0,1,1,0
chr6	33402888	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,15;MFRL=0,125;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:33402881_G_A:33402881:0,1,1,0
chr6	33406494	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,11;MFRL=36807972,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:2,0:0,0:0|1:33406494_A_G:33406494:0,2,2,0
chr6	33406500	.	TT	CG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.354:6:3,0:0,0:0|1:33406494_A_G:33406494:1,3,2,0
chr6	33406583	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=141,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,2:4,0:6,6,2,0
chr6	33406731	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,18;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.484:4:1,0:0,0:1,1,0,2
chr6	33411707	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,13;MFRL=176,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.549:5:2,0:0,1:0,2,0,3
chr6	33414626	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:33414626_T_C:33414626:0,0,0,3
chr6	33414637	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:33414626_T_C:33414626:0,0,0,2
chr6	33415795	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33415795_C_CT:33415795:0,1,0,1
chr6	33415798	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33415795_C_CT:33415795:0,1,0,1
chr6	33415801	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33415795_C_CT:33415795:0,0,0,1
chr6	33415803	.	A	AAGTATAAGATACC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33415795_C_CT:33415795:0,0,0,1
chr6	33419555	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=32,10;MFRL=139,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.304:13:7,1:2,0:2,7,4,0
chr6	33419614	.	AG	CC	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.482:8:3,3:0,0:0|1:33419614_AG_CC:33419614:0,4,4,0
chr6	33419620	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,1:0,0:0|1:33419614_AG_CC:33419614:1,4,3,0
chr6	33419623	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,1:0,1:0|1:33419623_A_C:33419623:3,4,4,0
chr6	33419629	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=114,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:7,2:1,0:0|1:33419623_A_C:33419623:4,4,3,0
chr6	33419634	.	GG	CC	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=27,24;MFRL=144,81;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:9,1:3,0:0|1:33419614_AG_CC:33419614:6,8,2,0
chr6	33422976	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=166.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,22:0,28:0,0,25,26
chr6	33541507	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,239;MMQ=57,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:12,0,2,0
chr6	33555348	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,1:1,0,3,1
chr6	33555654	.	AAAATAC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=261,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	33555682	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33555682_G_GA:33555682:0,0,0,1
chr6	33555683	.	C	CTCGGAAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33555682_G_GA:33555682:0,0,0,1
chr6	33608379	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr6	33623536	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=149,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:4,0:3,0:8,5,3,0
chr6	33623545	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:9,0:13,5,2,0
chr6	33630846	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,1,6
chr6	33631696	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=124,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr6	33633527	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	33636660	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	33639760	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=96,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,2:6,4:5,5,5,1
chr6	33641956	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:4,3:1,8:4,2,9,2
chr6	33644768	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=94.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.960:22:0,13:0,7:0|1:33644768_T_C:33644768:0,0,16,6
chr6	33644773	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,10:0,7:0|1:33644768_T_C:33644768:0,0,15,6
chr6	33646328	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,18:0,8:0,0,10,16
chr6	33646621	.	GGGCGGGGCTGAGGGGTGCTCAGGCATCTTGGGGTGGGGGACCGGAGCAGAGGCTT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.250:14:5,2:3,2:0|1:33646621_GGGCGGGGCTGAGGGGTGCTCAGGCATCTTGGGGTGGGGGACCGGAGCAGAGGCTT_G:33646621:2,7,2,3
chr6	33646656	.	G	GAAGTGAGCCGTAAGCCAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=13,35;MFRL=208,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.506:2:0,1:0,0:1|0:33646621_GGGCGGGGCTGAGGGGTGCTCAGGCATCTTGGGGTGGGGGACCGGAGCAGAGGCTT_G:33646621:0,1,0,1
chr6	33647651	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=118,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:6,1:2,1:5,4,1,1
chr6	33647936	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=171,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.377:11:4,0:2,2:1,6,1,3
chr6	33648228	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr6	33648515	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=155,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr6	33650430	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,0:5,3:0,10,0,3
chr6	33653107	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=191,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:6,1:3,3:0|1:33653107_G_A:33653107:6,3,1,3
chr6	33653111	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0|1:33653107_G_A:33653107:0,0,8,6
chr6	33654378	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr6	33659536	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=122,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,20:0.389:52:15,14:17,6:12,20,7,13
chr6	33659688	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,258;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:6,8,2,0
chr6	33660411	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	33662936	.	CTGACCCACCCTCTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,250;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	33663451	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,5:1,1:2,1,6,0
chr6	33679239	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=114,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.717:9:1,4:1,0:1,1,7,0
chr6	33748831	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=115,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,5:3,1:7,1,3,3
chr6	34008106	.	G	GAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr6	34008457	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:13,2:12,0:11,14,0,2
chr6	34026938	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,9:0,0:0,0,1,8
chr6	34101334	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:34101334_G_T:34101334:0,0,0,1
chr6	34101341	.	G	GCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:34101334_G_T:34101334:0,0,0,1
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chr6	34212743	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=107,168;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.881:15:1,6:0,6:0,1,0,14
chr6	34214994	.	G	GTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TC;STR;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,3:0,0,0,7
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chr6	34263328	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,10;MFRL=172,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,0:0|1:34263313_T_TA:34263313:4,1,2,0
chr6	34385517	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,4:1,4:3,0,7,1
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chr6	34386307	.	CT	AG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=226,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:34386300_AGTACCACTCCGTT_A:34386300:0,1,0,1
chr6	34386311	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=226,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:34386300_AGTACCACTCCGTT_A:34386300:0,1,0,1
chr6	34386314	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:34386300_AGTACCACTCCGTT_A:34386300:0,2,0,1
chr6	34386317	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=30,30;MFRL=207,191;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:34386300_AGTACCACTCCGTT_A:34386300:0,2,0,1
chr6	34386320	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=226,191;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34386300_AGTACCACTCCGTT_A:34386300:0,1,0,1
chr6	34498328	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=122,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.425:28:8,6:6,3:7,9,1,11
chr6	34574713	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:34574713_A_AG:34574713:0,1,0,1
chr6	34574716	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:34574713_A_AG:34574713:0,1,0,1
chr6	34622561	.	AG	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,6:6,2:2,8,3,6
chr6	34664207	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	34725655	.	G	GTCA	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=163.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,39:0.977:39:0,23:0,15:0|1:34725655_G_GTCA:34725655:0,0,13,26
chr6	34725658	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=154.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,36:0.974:36:0,21:0,13:0|1:34725655_G_GTCA:34725655:0,0,12,24
chr6	34730412	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:18,3:23,0:22,20,3,0
chr6	34735676	.	C	CCTCAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,41;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,3:0,0,3,5
chr6	34738203	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,3,11
chr6	34741174	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,1:4,2:4,0,2,1
chr6	34759903	.	T	TGGCGGCGGCGGCGGCGGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,11;RU=GGC;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	34759954	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	34760162	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	34791027	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=107.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,10:0,19:0,0,20,9
chr6	34802999	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:4,0,4,2
chr6	34804204	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr6	34831761	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=194,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0|1:34831761_G_T:34831761:4,0,3,0
chr6	34831781	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=107,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:7,0:1,0:0|1:34831761_G_T:34831761:8,3,3,0
chr6	34839262	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=202,263;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:34839262_T_A:34839262:2,0,1,0
chr6	34839266	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=202,263;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:34839262_T_A:34839262:2,0,1,0
chr6	34839272	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=202,263;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:34839262_T_A:34839262:2,0,1,0
chr6	34839339	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=206,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr6	34840275	.	T	TGTCCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:34840275_T_TGTCCC:34840275:0,3,0,1
chr6	34840277	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=163,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:34840275_T_TGTCCC:34840275:0,3,0,1
chr6	34850660	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=143,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.497:28:6,8:7,5:11,3,11,3
chr6	34855748	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=216,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:2,2:0,6:1,1,1,7
chr6	34949451	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,4:6,1:6,2,5,0
chr6	34962019	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr6	34962060	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=128,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.678:23:6,7:1,8:7,0,13,3
chr6	34985853	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=154,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,1:3,2:2,5,1,2
chr6	35027927	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,9:0,22:0,0,20,12
chr6	35047579	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,2:3,2:4,2,4,0
chr6	35047732	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:2,4:5,3:1,6,2,5
chr6	35054893	.	A	AGCTTCTTTTCTTCTTAC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	35056443	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,4,10
chr6	35088855	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.214:21:12,2:5,1:1,16,0,4
chr6	35104018	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:1,1:0,2,0,2
chr6	35210185	.	G	GCCCTTGCTTTAGTATAGCAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.665:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	35211016	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=197,131;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr6	35212003	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=80,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr6	35216296	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.481:10:2,0:3,3:3,2,4,1
chr6	35254213	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr6	35258539	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.472:13:0,3:6,3:0,7,2,4
chr6	35259261	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:4,3,2,1
chr6	35261768	.	A	ACTCTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=178,87;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.494:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	35277347	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	35280586	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=154,233;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.258:6:1,1:2,0:0|1:35280586_C_A:35280586:2,3,0,1
chr6	35280589	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=27,33;MFRL=156,233;MMQ=60,56;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.349:4:1,1:2,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,2,0,1
chr6	35280592	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=35,33;MFRL=115,233;MMQ=60,56;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.424:3:0,1:1,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,1,0,1
chr6	35280595	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=66,233;MMQ=60,56;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.539:2:0,1:1,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,0,0,1
chr6	35280598	.	TCAG	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=66,233;MMQ=60,56;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.539:2:0,1:1,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,0,0,1
chr6	35280603	.	G	GTT	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=66,233;MMQ=60,56;MPOS=-7;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.539:2:0,1:1,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,0,0,1
chr6	35280605	.	CATGAGAAGACAAGGGG	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=66,233;MMQ=60,56;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.539:2:0,1:1,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,0,0,1
chr6	35280623	.	TCAGGAGAGGGG	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=128,233;MMQ=60,56;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.424:3:0,1:1,0:0|1:35280586_C_A:35280586:1,1,0,1
chr6	35285720	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,4:4,5:4,4,5,4
chr6	35285731	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=20,34;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:8,1:8,1:7,10,1,1
chr6	35378778	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:3,0,4,0
chr6	35393544	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	35420628	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	35423489	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr6	35424188	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr6	35443573	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr6	35448189	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=77.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,10:0,0,6,16
chr6	35452447	.	G	GAGGTATGAAGTCTGGGAAAGGCTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=181,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,2:3,0:0,9,1,1
chr6	35477152	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr6	35477676	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=92,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:10,0:4,2:0|1:35477676_T_G:35477676:7,9,1,1
chr6	35477685	.	G	GTT	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=92,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:35477676_T_G:35477676:5,9,1,1
chr6	35477688	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,31;MFRL=92,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:4,2:0|1:35477676_T_G:35477676:5,9,1,1
chr6	35477690	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=92,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:4,2:0|1:35477676_T_G:35477676:5,9,1,1
chr6	35477692	.	GC	CT	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=93,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:4,1:0|1:35477676_T_G:35477676:4,9,1,1
chr6	35478612	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.898:8:0,2:0,3:0,0,6,2
chr6	35610681	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	35706063	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=141,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.515:4:2,0:0,1:2,0,2,0
chr6	35706097	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:2,2:1,1:3,0,5,0
chr6	35706123	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=150,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.674:14:2,5:2,1:4,0,7,3
chr6	35761202	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=199,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:1,3:0,2:1,0,5,1
chr6	35762978	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=119,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:20,3:15,0:17,18,3,0
chr6	35810383	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:4,2:6,1:4,10,0,3
chr6	35923325	.	G	GCTGCTGTGGGCTTCATATTCAATA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=138,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	35928910	.	TGA	CTC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,35;MFRL=153,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:35928910_TGA_CTC:35928910:0,2,0,1
chr6	35928917	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=153,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:35928910_TGA_CTC:35928910:0,2,0,1
chr6	35928918	.	A	AAAAAGGCAGG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=24,30;MFRL=122,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr6	35928921	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=153,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:35928910_TGA_CTC:35928910:0,2,0,1
chr6	35928923	.	A	ATAAAATTG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=17,31;MFRL=167,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:35928910_TGA_CTC:35928910:0,1,0,1
chr6	35928925	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,27;MFRL=167,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:35928910_TGA_CTC:35928910:0,1,0,1
chr6	35950075	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=237,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr6	35965754	.	G	GGGTTATATGGTTCTGTCTCTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0,3,0,1
chr6	35965762	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=18,34;MFRL=208,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:35965762_C_CA:35965762:0,1,0,1
chr6	35965767	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=202,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:35965762_C_CA:35965762:0,2,0,1
chr6	35987222	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr6	36040642	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=126,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=55.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.526:38:8,9:9,11:8,10,8,12
chr6	36075219	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=108,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:6,3:6,3,6,0
chr6	36098333	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,12,8
chr6	36104803	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr6	36107172	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,3:3,1:0,4,1,3
chr6	36189887	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,2:0,0,10,1
chr6	36261885	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr6	36287454	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	36290030	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=165,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:4,2:5,1,3,0
chr6	36293067	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:8,3,2,0
chr6	36294417	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=35,18;MFRL=125,50;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,0:5,0:0|1:36294417_C_G:36294417:4,8,6,0
chr6	36294424	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,17;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.298:18:3,0:6,0:0|1:36294417_C_G:36294417:4,9,5,0
chr6	36294429	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,18;MFRL=122,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,0:4,0:5,8,3,0
chr6	36294915	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	36359682	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=273,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.729:5:0,3:1,1:0,1,1,3
chr6	36446973	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:18,2:16,4:13,21,2,4
chr6	36449333	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=72,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:3,2,2,0
chr6	36452603	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=23,32,31,15;MFRL=158,163,141,166;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,18,24;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=3.37,7.37,5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,3,5,4:0.146,0.236,0.189:22:0,1,2,0:5,2,1,1:0,10,2,10
chr6	36467791	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,4:0,10:0,0,2,13
chr6	36493265	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,11,0
chr6	36569715	.	TTC	T	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.132:51:16,5:27,2:38,6,2,5
chr6	36569717	.	C	CT	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,24:0.918:26:0,11:1,13:1,1,17,7
chr6	36652339	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	36690478	.	A	AACT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,17;MFRL=111,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,0:9,1:6,9,1,1
chr6	36715921	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr6	36720900	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=109,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:7,0:2,4:0|1:36720900_T_A:36720900:5,7,0,4
chr6	36720902	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=109,108;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:7,0:5,3:0|1:36720900_T_A:36720900:5,7,0,4
chr6	36723916	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=152,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:4,0,3,1
chr6	36742751	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:14,3:4,0:15,3,2,1
chr6	36765877	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:2,2:9,0,0,2
chr6	36766264	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:2,8,1,1
chr6	36767920	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:36767920_T_TG:36767920:0,0,0,2
chr6	36767943	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36767920_T_TG:36767920:0,0,0,1
chr6	36853685	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	36853786	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,2,2
chr6	36853857	.	T	TCGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CGC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	36867430	.	G	GAGAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=155,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.262:6:4,1:1,0:0,5,0,1
chr6	36884252	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.073:53:24,2:25,1:28,22,2,1
chr6	36931326	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=123,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:24,0:13,4:0|1:36931326_A_T:36931326:14,23,0,4
chr6	36931331	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=138,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,4:0.108:44:25,0:13,4:0|1:36931326_A_T:36931326:14,26,0,4
chr6	36949527	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr6	36978879	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr6	36988364	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.558:16:5,4:1,4:5,2,5,4
chr6	36989391	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr6	37249913	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=125,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:2,3:1,2:4,0,4,1
chr6	37280844	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=89,247;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:3,3,0,3
chr6	37348920	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.463:35:10,9:7,7:12,7,11,5
chr6	37411846	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:16,0:10,2:10,18,0,2
chr6	37443220	.	G	GAGATTTCAGCCGCTTTGAGGTCAAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1,1,0,1
chr6	37446841	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	37447075	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr6	37605311	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr6	37606305	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr6	37611796	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	37614017	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:12,0:10,3:15,8,3,0
chr6	37614236	.	G	GAATTGATACTGACTTGTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	37614919	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.705:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr6	37614923	.	CAGG	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.292:5:0,0:0,1:3,1,1,0
chr6	37614932	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=115,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,0:5,1:4,2,2,0
chr6	37620129	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr6	38084569	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,2:1,3:0,6,0,5
chr6	38645223	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,35;MFRL=154,198;MMQ=60,30;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr6	38645227	.	CT	C,CTT	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,34,35;MFRL=154,189,198;MMQ=60,60,30;MPOS=18,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=3,2,4;RU=T;STR;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:1,0,0:0,1,1:0,1,0,2
chr6	38645237	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=239,194;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:0,2:0,3,0,2
chr6	38645249	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=239,198;MMQ=60,30;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38645249_GA_G:38645249:0,2,0,1
chr6	38645251	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=239,198;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38645249_GA_G:38645249:0,2,0,1
chr6	38645253	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=239,198;MMQ=60,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38645249_GA_G:38645249:0,2,0,1
chr6	38645255	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,28;MFRL=239,198;MMQ=60,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:38645249_GA_G:38645249:0,2,0,1
chr6	38670837	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=131,194;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:3,5:4,0:5,3,1,4
chr6	38691291	.	A	AGGTTGCGAAAATTTTCTCTGATTTTGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.259:9:3,2:4,0:0,7,1,1
chr6	38691328	.	GCAA	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=189,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAA;STR;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:0,4,0,3
chr6	38702212	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=165,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:5,2,2,0
chr6	38702468	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:0,5,0,6
chr6	38723670	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr6	38729458	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.454:44:11,9:13,10:15,9,15,5
chr6	38738383	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=134,143;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr6	38746090	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:3,4:2,0:0|1:38746090_A_G:38746090:6,0,6,0
chr6	38746098	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,6:2,0:0|1:38746090_A_G:38746090:5,0,6,0
chr6	38746263	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,26:0.475:55:13,12:15,14:7,22,5,21
chr6	38746294	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.487:35:9,7:9,10:1,17,1,16
chr6	38749200	.	ACAAATATATCATAT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:3,4:5,3:0,9,0,7
chr6	38754787	.	GTATA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=265,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=TA;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	38757511	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr6	38771106	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.500:32:9,8:6,8:3,13,1,15
chr6	38771168	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=140,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr6	38773172	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=148,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	38775336	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=148,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,2:6,5:7,3,4,3
chr6	38781749	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr6	38781866	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:5,3:13,8:9,9,8,3
chr6	38781931	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:7,2:7,11:5,9,1,12
chr6	38794183	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:2,2:5,8:1,6,0,10
chr6	38820451	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:10,6:8,7:12,6,8,5
chr6	38820599	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:1,7,0,6
chr6	38828424	.	G	GT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.499:26:8,6:5,7:3,10,4,9
chr6	38828453	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:5,2:1,5:1,5,0,7
chr6	38843350	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=170,42072688;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:38843350_A_T:38843350:12,0,1,1
chr6	38843356	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,42072688;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:0|1:38843350_A_T:38843350:13,1,1,1
chr6	38862736	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=221,144;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:38862736_C_T:38862736:0,3,0,1
chr6	38862741	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=221,144;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:38862736_C_T:38862736:0,3,0,1
chr6	38879386	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,1:6,2:1,15,0,3
chr6	38897534	.	C	CGAACAGACAGACAAGCTTGGCCG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	38899485	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=209,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,5:0,0:2,0,5,0
chr6	38905667	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=138,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr6	38913177	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	38979946	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=125,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,3,0
chr6	39041607	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=202,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:39041607_T_C:39041607:0,2,0,1
chr6	39041614	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=202,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:39041607_T_C:39041607:0,2,0,1
chr6	39046201	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr6	39077192	.	T	TTCC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCC;STR;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,2:5,5:0,6,0,7
chr6	39162206	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr6	39162599	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=152,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:3,1:2,3:0,6,0,4
chr6	39278848	.	GCACACACACACACACACACACACACACA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=24,10;RU=CA;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.393:6:3,1:0,1:0,4,0,2
chr6	39283226	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=136,41;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:0|1:39283226_G_A:39283226:0,8,1,1
chr6	39283228	.	C	CTGGGCAGAGACTTTGGAACA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=136,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:39283226_G_A:39283226:0,8,1,1
chr6	39313618	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:0,8,0,6
chr6	39325078	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,3:3,6:5,3,7,2
chr6	39325224	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=167,215;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.718:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr6	39330135	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:4,4:1,2:4,1,6,1
chr6	39563730	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr6	39682367	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	39828862	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=208,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	39832111	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=133,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,7,0
chr6	39832363	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr6	39839164	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr6	39846137	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=123,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,6:6,5:6,6,7,4
chr6	39851679	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,4:0,3:1,0,5,2
chr6	39851932	.	CTTTCCTTTCCT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=194,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr6	39855427	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr6	39866805	.	A	AACAATGGGC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr6	39869066	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=128,87;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:2,0,2,4
chr6	39869210	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=156,51;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.497:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr6	39876812	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:10,1:15,1:12,13,1,1
chr6	39895167	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=152,0;MMQ=60,44;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:4,0:3,2:0,8,1,1
chr6	40359674	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.764:9:0,0:0,0:2,0,7,0
chr6	40360724	.	G	GCAAAATCTCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=215,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	40399415	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:40399415_A_C:40399415:3,1,1,0
chr6	40399417	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,11;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:40399415_A_C:40399415:3,1,1,0
chr6	40399446	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr6	41010811	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=133,54;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:12,0:21,3:20,16,0,3
chr6	41036770	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr6	41037778	.	C	T	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=129,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,19:0.281:69:22,10:28,9:30,20,16,3
chr6	41037786	.	G	GA	.	.	DP=89;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=136,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:76,5:0.072:81:34,3:42,1:45,31,3,2
chr6	41038845	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.450:29:7,6:8,6:11,5,11,2
chr6	41052002	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	41118095	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,40;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,0:1,2:4,5,1,1
chr6	41122113	.	G	GGGTCAGTTGGTTTGTGTTGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=123,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.613:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	41166222	.	T	TCTTAGTCTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=139,142;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41166222_T_TCTTAGTCTG:41166222:0,1,0,1
chr6	41166225	.	T	TTTAGCAAGCGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=139,142;MMQ=60,39;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:41166222_T_TCTTAGTCTG:41166222:0,1,0,1
chr6	41196095	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,2:0|1:41196095_C_T:41196095:0,0,4,1
chr6	41196104	.	C	CCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:41196095_C_T:41196095:0,0,4,1
chr6	41196727	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,11:0,2:0|1:41196727_C_T:41196727:0,0,7,7
chr6	41196733	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:8,1:0,2:0|1:41196727_C_T:41196727:4,4,2,1
chr6	41204329	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,94;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,1:4,5:3,8,3,3
chr6	41250258	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=139,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,1:16,1:13,15,1,1
chr6	41309698	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,4,6
chr6	41486990	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,11,0
chr6	41554993	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=188,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr6	41620975	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41620975_A_G:41620975:0,0,1,0
chr6	41620983	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:41620975_A_G:41620975:0,0,1,0
chr6	41621022	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,10;MFRL=112,128;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:1,1,1,0
chr6	41655005	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	41659064	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=182,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:7,5,2,0
chr6	41659304	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=230,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr6	41704772	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,4:2,5:2,6,0,9
chr6	41705612	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:1,3:3,0:0,4,1,2
chr6	41705632	.	CTCAGCCCCTGGA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=137,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr6	41710195	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=129,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:11,7,0,2
chr6	41712586	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712586_TC_T:41712586:0,2,0,1
chr6	41712590	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=35,31;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712586_TC_T:41712586:0,2,0,1
chr6	41712596	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712586_TC_T:41712586:0,2,0,1
chr6	41712613	.	T	TCCCCAAC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712613_T_TCCCCAAC:41712613:0,2,0,1
chr6	41712617	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712613_T_TCCCCAAC:41712613:0,2,0,1
chr6	41712620	.	T	TGTTACA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712613_T_TCCCCAAC:41712613:0,2,0,1
chr6	41712622	.	C	CCCTG	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=34,29;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:41712613_T_TCCCCAAC:41712613:0,2,0,1
chr6	41721682	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=55.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,19:0.528:36:10,9:7,8:9,8,9,10
chr6	41748279	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	41754573	.	C	CCTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,4:5,7:4,4,5,6
chr6	41888827	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:8,8:6,5:2,12,2,11
chr6	41895150	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=121,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,2:10,1:5,9,1,2
chr6	41899117	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,6156142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:17,2:8,0:15,10,2,0
chr6	41900406	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:2,2,1,4
chr6	41905174	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=213,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,0:2,3:0,4,1,2
chr6	42018212	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:42018212_G_C:42018212:0,0,1,0
chr6	42018217	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=246,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:42018212_G_C:42018212:1,0,1,0
chr6	42023618	.	A	ATAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TAC;STR;TLOD=29.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,2:3,5:5,1,6,2
chr6	42025058	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,4:4,5:6,0,8,1
chr6	42025318	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=85,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:1,5,0,6
chr6	42036395	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	42045026	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr6	42045171	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=179,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,5:2,2:2,0,6,1
chr6	42054380	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,7,5
chr6	42075104	.	GGGTGGGGGTTCCAGCAGCAGGGGAGGT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=105,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.678:7:1,2:0,3:2,0,4,1
chr6	42077870	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	42110171	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=124,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:5,8:4,5:2,7,1,12
chr6	42146142	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,0:7,2:5,6,0,2
chr6	42152537	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,18;MFRL=110,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.242:11:2,0:3,0:6,3,2,0
chr6	42153609	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	42156550	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	42162575	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr6	42176120	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:1,5,0,3
chr6	42176544	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.710:11:2,4:0,4:3,0,8,0
chr6	42176743	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,5:0,0:0|1:42176743_TG_T:42176743:0,0,0,5
chr6	42176749	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0|1:42176743_TG_T:42176743:0,0,0,5
chr6	42176761	.	GG	TT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0,3,0,1
chr6	42176768	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=197,123;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42176768_CA_TG:42176768:0,1,0,1
chr6	42176775	.	TTG	CCA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=199,123;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42176768_CA_TG:42176768:0,2,0,1
chr6	42176780	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=199,123;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:42176768_CA_TG:42176768:0,2,0,1
chr6	42181773	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=45.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:4,7:5,8:9,0,15,0
chr6	42181960	.	A	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,23:0.450:51:12,9:16,13:11,17,6,17
chr6	42182183	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	42185631	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,6:2,2:0,4,2,6
chr6	42196127	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=147,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,4:3,4:5,3,5,4
chr6	42608123	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr6	42612312	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr6	42612344	.	TCTGGC	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:42612344_TCTGGC_T:42612344:0,2,0,1
chr6	42612354	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=194,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:42612344_TCTGGC_T:42612344:0,1,0,1
chr6	42615950	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,49;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,5,13
chr6	42626341	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=137.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,23:0,17:0,0,38,3
chr6	42626564	.	TAA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.491:6:2,3:0,0:2,1,1,2
chr6	42638564	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,5:0,0,0,18
chr6	42641704	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	42644623	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,7:0,16:0,0,5,18
chr6	42650766	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,6:0,11:0,0,11,6
chr6	42652667	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,1,7
chr6	42658752	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=87.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,11:0,13:0,0,20,4
chr6	42666020	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr6	42797142	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=147,88;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,0:3,3:3,5,0,3
chr6	42824756	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=280,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,5:1,0:1,0,5,0
chr6	42833204	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:12,1:5,1:0|1:42833204_A_C:42833204:2,17,0,2
chr6	42833209	.	GCCCCGAGACCCCA	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCCGAGACCCCA;STR;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,6:0.658:9:1,5:2,1:1|0:42833204_A_C:42833204:0,3,0,6
chr6	42853842	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr6	42883911	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=156,135;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,1:3,2:0,10,1,2
chr6	42891022	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:7,7:5,5:6,6,6,6
chr6	42905788	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,5:4,1:8,1,6,0
chr6	42906241	.	GCT	ATA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr6	42931224	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.574:19:3,4:4,6:5,3,6,5
chr6	42931261	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.502:26:6,6:7,7:9,4,4,9
chr6	42932715	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,3:2,1:1,1,4,1
chr6	42934500	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=79,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:3,4,1,6
chr6	42935173	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=137,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:9,1:11,5,2,0
chr6	42935998	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.673:28:2,12:5,7:3,6,10,9
chr6	42937649	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=138,72;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:18,2:13,0:11,20,2,0
chr6	42942779	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=106,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:6,2:0,3:3,3,2,3
chr6	42946340	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.281:5:1,1:3,0:0|1:42946340_G_GA:42946340:2,2,0,1
chr6	42946342	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=140,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:42946340_G_GA:42946340:2,2,0,1
chr6	42974698	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=166,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,0:8,3:6,6,0,3
chr6	42975636	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=114,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:9,2,2,0
chr6	42993135	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr6	42993166	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=194,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:42993166_G_A:42993166:0,4,0,1
chr6	42993168	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=194,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:42993166_G_A:42993166:0,4,0,1
chr6	43005345	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr6	43006214	.	A	ACCAGTC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=151,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:2,2:6,0:3,5,1,1
chr6	43013434	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=133,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,1:6,3:2,11,2,2
chr6	43014298	.	TT	CC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,15:0,7:0,0,6,17
chr6	43018744	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:16,2:11,0:22,6,2,0
chr6	43030926	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=159,76;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,2:7,0:0,12,1,1
chr6	43034839	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.293:15:3,1:7,1:0|1:43034839_T_TG:43034839:0,11,4,0
chr6	43034844	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:4,1:8,1:0|1:43034839_T_TG:43034839:0,12,4,0
chr6	43038938	.	TAAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=194,156;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr6	43038968	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,14;MFRL=131,156;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:43038968_T_A:43038968:2,1,1,0
chr6	43038972	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,14;MFRL=118,156;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:43038968_T_A:43038968:2,2,1,0
chr6	43038977	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,15;MFRL=118,156;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:43038968_T_A:43038968:2,2,1,0
chr6	43038982	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,15;MFRL=118,156;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:43038968_T_A:43038968:2,2,1,0
chr6	43111445	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	43112382	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=72,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1,3,1,2
chr6	43126766	.	G	GTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=225,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	43181357	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,14;MFRL=0,313;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43181357_C_A:43181357:0,0,1,0
chr6	43181366	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=158,313;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43181357_C_A:43181357:1,0,1,0
chr6	43188714	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:43188714_C_T:43188714:0,3,0,1
chr6	43188716	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=140,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.499:4:1,1:1,1:1|0:43188714_C_T:43188714:0,2,0,2
chr6	43188718	.	C	CTG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:43188714_C_T:43188714:0,3,0,1
chr6	43188719	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=168,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:43188714_C_T:43188714:0,3,0,1
chr6	43188720	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=171,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:43188714_C_T:43188714:0,2,0,1
chr6	43190186	.	TGG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=108,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:43190186_TGG_T:43190186:1,2,1,0
chr6	43190193	.	G	GTGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:43190186_TGG_T:43190186:1,0,1,0
chr6	43190200	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=182,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43190186_TGG_T:43190186:0,1,1,0
chr6	43225791	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	43250387	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	43250539	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=139,53;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:3,2:0|1:43250539_C_T:43250539:7,7,1,1
chr6	43250557	.	C	CTTGCGGCCGTCCCGCACGTGCTGCTTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=139,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:8,0:5,2:0|1:43250539_C_T:43250539:5,9,1,1
chr6	43251080	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,1:12,2:6,16,1,2
chr6	43251880	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	43267831	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=153,79;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr6	43269029	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=91,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,2,3
chr6	43269037	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=125,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,0,1
chr6	43270097	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,1,8
chr6	43270326	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr6	43273449	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,13;MFRL=221,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.530:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr6	43275706	.	A	ACCGACCTTACC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=135,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:43275706_A_ACCGACCTTACC:43275706:1,2,0,1
chr6	43275709	.	G	GCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=135,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43275706_A_ACCGACCTTACC:43275706:1,2,0,1
chr6	43275711	.	C	CTTCCT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=135,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43275706_A_ACCGACCTTACC:43275706:1,2,0,1
chr6	43306346	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,5,9
chr6	43320055	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,2:2,0,2,1
chr6	43322553	.	G	C	.	.	DP=69;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=125,61;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:36,0:25,3:41,20,0,3
chr6	43323917	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	43399837	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=139.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,17:0,23:0,0,24,17
chr6	43401105	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,3:4,4:0,5,0,7
chr6	43402666	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=264,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43402666_G_T:43402666:0,1,0,1
chr6	43402671	.	GAA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=264,199;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43402666_G_T:43402666:0,1,0,1
chr6	43406614	.	T	TACACTGCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	43411659	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=104,141;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:3,2:9,4:8,4,5,1
chr6	43413251	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,19;MFRL=205,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:2,0:0,0:0|1:43413251_C_G:43413251:2,1,1,0
chr6	43413255	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,10;MFRL=205,239;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:2,0:0,0:0|1:43413251_C_G:43413251:2,1,1,0
chr6	43413258	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=19,12;MFRL=128,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:43413251_C_G:43413251:1,1,1,0
chr6	43413263	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=18,12;MFRL=131,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:43413251_C_G:43413251:2,0,1,0
chr6	43413266	.	TC	AA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,13;MFRL=131,239;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:43413251_C_G:43413251:2,0,1,0
chr6	43414216	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	43414234	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	43416995	.	GGGA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=109,168;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,1:3,0:1,2,1,0
chr6	43469445	.	GACACACAC	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,118;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=26,22;RU=AC;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.813:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	43469519	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=195,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:1,3,0,2
chr6	43470149	.	A	ACAGTTAGAGAAGGGGTC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=113,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr6	43470181	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,34;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43470181_C_CT:43470181:1,0,0,1
chr6	43470187	.	G	GCCT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43470181_C_CT:43470181:1,0,0,1
chr6	43470188	.	GAGA	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43470181_C_CT:43470181:1,0,0,1
chr6	43470198	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,26;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43470181_C_CT:43470181:1,0,0,1
chr6	43470200	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43470181_C_CT:43470181:1,0,0,1
chr6	43471178	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=150,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,0:9,3:10,13,0,3
chr6	43473599	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	43480395	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=200,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,4:4,0:3,2,1,3
chr6	43494319	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr6	43497105	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=182,164;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43497105_C_T:43497105:0,1,0,1
chr6	43497107	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=182,164;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:43497105_C_T:43497105:0,1,0,1
chr6	43501580	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,8:0,0,10,2
chr6	43533305	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=9,30;MFRL=123,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.749:3:0,2:0,0:0,1,2,0
chr6	43538501	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=172,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,2,0
chr6	43593660	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=198,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:43593660_G_C:43593660:0,3,0,1
chr6	43593662	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=198,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:43593660_G_C:43593660:0,3,0,1
chr6	43593665	.	GG	CC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=198,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:43593660_G_C:43593660:0,3,0,1
chr6	43593999	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:17,3:6,0:12,11,2,1
chr6	43594243	.	T	TCCTCCCCTTTCTTCTTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	43640204	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,2:5,0:0,11,0,3
chr6	43745426	.	C	CCAGCTGCTTGCTCAGTTTCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=117,4659;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,0:1,1:1,2,1,0
chr6	43745433	.	GGG	ACA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43745433_GGG_ACA:43745433:0,0,0,1
chr6	43745440	.	G	GAGCAGATGCTTTCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43745433_GGG_ACA:43745433:0,0,0,1
chr6	43746169	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=165,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:3,3,6,1
chr6	43748643	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	43749887	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=170,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:43749887_G_C:43749887:0,2,0,1
chr6	43749897	.	GTG	CAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=170,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:43749887_G_C:43749887:0,2,0,1
chr6	44081987	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=204,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr6	44106360	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=233,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44106360_G_A:44106360:0,1,0,1
chr6	44106364	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=233,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44106360_G_A:44106360:0,1,0,1
chr6	44117798	.	G	GTAAGGATGGATTGAAATGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	44134581	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:2,4,2,5
chr6	44134610	.	TTCC	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=131,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCC;STR;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:0,2:0,2,0,3
chr6	44140818	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:0,10,1,7
chr6	44143974	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,13;MFRL=182,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.157:21:7,0:6,0:7,11,3,0
chr6	44143980	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,13;MFRL=182,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,1:5,0:7,9,3,0
chr6	44143984	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.319:19:3,0:6,1:4,9,6,0
chr6	44143988	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,13;MFRL=178,111;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.149:22:5,0:9,0:7,12,3,0
chr6	44145212	.	C	CCTTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CTTT;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.696:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr6	44147250	.	AAC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=139,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:3,1:8,2,1,1
chr6	44148582	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,14;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:5,0:7,0:0|1:44148582_T_A:44148582:3,11,2,0
chr6	44148588	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.184:14:3,0:7,0:0|1:44148582_T_A:44148582:3,9,2,0
chr6	44149113	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr6	44149153	.	CCA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CA;STR;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	44150586	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=154,153;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr6	44150591	.	A	C,G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31,28;MFRL=154,125,153;MMQ=60,60,40;MPOS=11,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:3,1,1:1,0,0:4,0,2,0
chr6	44150607	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,0:5,0,2,0
chr6	44151765	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	44151767	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=82,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:44151767_TC_T:44151767:0,2,0,1
chr6	44151770	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=82,229;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:44151767_TC_T:44151767:0,2,0,1
chr6	44151804	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	44216544	.	GT	G	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=61.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,17:0.567:30:5,9:7,8:0|1:44216544_GT_G:44216544:3,10,3,14
chr6	44216555	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,17:0.566:30:6,6:7,8:0|1:44216544_GT_G:44216544:3,10,3,14
chr6	44216557	.	A	AGACAGGGTC	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,2:0.090:31:13,2:15,0:1|0:44216544_GT_G:44216544:6,23,0,2
chr6	44216559	.	A	AG	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,2:0.092:30:12,1:15,0:1|0:44216544_GT_G:44216544:6,22,0,2
chr6	44218842	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,4:0.075:63:30,2:28,2:26,33,3,1
chr6	44227014	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=116,84;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:7,10,2,0
chr6	44228162	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:2,8:2,7:4,0,13,2
chr6	44233372	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:2,0:0|1:44233372_G_C:44233372:4,4,2,0
chr6	44233378	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=21,13;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:2,0:0|1:44233372_G_C:44233372:4,4,2,0
chr6	44233383	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:3,1:1,0:3,4,3,0
chr6	44233389	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.197:13:4,0:3,1:0|1:44233372_G_C:44233372:7,4,2,0
chr6	44241284	.	G	GTTGAACAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	44253617	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr6	44253749	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,8,8
chr6	44254344	.	C	CGCGGGGTAGCGCGCAGTCCCGG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	44268806	.	T	TTGTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	44269023	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr6	44270768	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr6	44270936	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,5:0,19:0,0,14,11
chr6	44273546	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=160.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,23:0,23:0,0,12,34
chr6	44274126	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=160,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:4,0:7,3:4,7,2,1
chr6	44274797	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr6	44280812	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr6	44311042	.	G	GTTATGTGGTATGTGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	44311050	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44311050_G_A:44311050:0,0,0,1
chr6	44311052	.	G	GATC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44311050_G_A:44311050:0,0,0,1
chr6	44355682	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr6	44355699	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr6	45165457	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=134,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,3:0.085:45:12,3:21,0:0|1:45165457_G_T:45165457:24,18,1,2
chr6	45165460	.	C	CAAT	.	.	DP=60;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,4:0.096:49:19,3:24,0:0|1:45165457_G_T:45165457:25,20,2,2
chr6	45165465	.	GTAT	G	.	.	DP=73;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=133,150;MMQ=60,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,2:0.041:71:23,2:36,0:0|1:45165457_G_T:45165457:50,19,2,0
chr6	45165473	.	A	C	.	.	DP=74;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=129,150;MMQ=60,55;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,2:0.040:72:28,2:35,0:0|1:45165457_G_T:45165457:52,18,2,0
chr6	45390445	.	ACAG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,187;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CAG;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:4,0:5,4,1,1
chr6	45513122	.	T	TGTTTTCTCCGTTTTTGGAATC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	45870999	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=178,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:0,4,0,5
chr6	45922849	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	46521602	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:2,3,3,7
chr6	46521606	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=143,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:3,9,0,2
chr6	46620985	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,2:10,1:7,10,2,1
chr6	46636556	.	GT	G,GTT	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=31,23,34;MFRL=111,157,165;MMQ=60,60,60;MPOS=23,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.71,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:27,4,3:0.119,0.106:34:6,1,1:15,1,1:7,20,1,6
chr6	46636568	.	TG	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.074:38:11,2:24,0:0|1:46636568_TG_T:46636568:7,29,1,1
chr6	46636571	.	A	AATTTGCATT	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:6,2:19,0:0|1:46636568_TG_T:46636568:7,29,1,1
chr6	46649231	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:1,4:4,1:3,2,2,3
chr6	46660929	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.243:6:2,0:3,1:4,1,0,1
chr6	46661932	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=196,94;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	46661937	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,20;MFRL=202,196;MMQ=51,50;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.520:4:0,1:1,0:0,2,0,2
chr6	46665778	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=113,25;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:9,5,1,1
chr6	46672207	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=176,218;MMQ=40,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr6	46672215	.	TCACACACA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=155,158;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=CA;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,2:2,1:5,0,3,0
chr6	46679303	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.489:35:11,7:6,10:7,11,5,12
chr6	46680043	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=132,83;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.172:19:11,2:5,0:10,6,2,1
chr6	46726441	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr6	46761363	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,1:10,1:11,10,1,1
chr6	46802901	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.340:21:8,2:6,4:14,0,7,0
chr6	46806948	.	G	GTTTGGGGCAGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=173,152;MMQ=60,47;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.496:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr6	46823695	.	G	A	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=366.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,113:0.991:113:0,62:0,50:0,0,71,42
chr6	46823805	.	A	AG	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=161.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.980:45:0,23:0,22:0,0,0,45
chr6	46826910	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,14:0,0,22,10
chr6	46828670	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr6	46832741	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr6	46834906	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,1:0,7:0,0,0,8
chr6	46856263	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:3,11:8,4:6,6,1,14
chr6	46867717	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=59.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,15,3
chr6	46995501	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:2,7,0,4
chr6	46995508	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:1,2:2,6:0,3,1,8
chr6	47254404	.	GGCCA	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=199,122;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47254404_GGCCA_G:47254404:0,2,0,1
chr6	47254409	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=199,122;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47254404_GGCCA_G:47254404:0,2,0,1
chr6	47254423	.	A	AAACCAACACATCCAGGACATAAG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	47445927	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=101.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,12:0,0,20,9
chr6	47522357	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,17:0,0,20,4
chr6	47547070	.	T	TAA,TAAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30,32;MFRL=0,186,183;MMQ=60,60,50;MPOS=17,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,16,17;RU=A;STR;TLOD=5.54,5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.444,0.442:4:0,2,1:0,0,1:0,0,4,0
chr6	47547090	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=154,163;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:7,0:9,6,2,0
chr6	47548672	.	C	A	.	.	DP=76;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=217.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.986:69:0,31:0,36:0,0,12,57
chr6	47549629	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,10:0,11:0,0,20,1
chr6	47549883	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=134.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,17:0,18:0,0,0,35
chr6	47577064	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr6	47591856	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,14,3
chr6	47624129	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	47626685	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr6	47626941	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=171,197;MMQ=60,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47626941_T_G:47626941:0,3,0,1
chr6	47626943	.	G	GATGAGATCCCGCAACTGCATTCAAGCCTGGGTGACAGAGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=171,197;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47626941_T_G:47626941:0,3,0,1
chr6	47626946	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=191,197;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:47626941_T_G:47626941:0,4,0,1
chr6	47626948	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=210,197;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47626941_T_G:47626941:0,3,0,1
chr6	47641307	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,1:0,0,0,6
chr6	47649573	.	CA	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,6:0,0,7,4
chr6	47649694	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=113,144;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,0:0,6:0,1,5,1
chr6	47653536	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=63.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,16,1
chr6	47653812	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	47653851	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	47654662	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=74.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,7:0,0,19,1
chr6	47654817	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,1,18
chr6	47654831	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,1,17
chr6	47654864	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	47661387	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=117.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,16:0,16:0,0,29,3
chr6	47678455	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=42.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr6	47678678	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,12:0,0,0,19
chr6	47681494	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=73.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,9:0,0,19,3
chr6	47682604	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,11:0,0,19,4
chr6	47749728	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr6	47791772	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:12,1:14,1:8,20,0,2
chr6	47847683	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=92,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr6	47869805	.	A	ATCCATCCCTCCATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	49403433	.	A	AGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=176,200;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:49403433_A_AGG:49403433:0,2,0,1
chr6	49403434	.	CTA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=176,200;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:49403433_A_AGG:49403433:0,2,0,1
chr6	49409487	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr6	49409737	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,1,12
chr6	49415351	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=163,137;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.780:25:4,13:1,7:4,1,19,1
chr6	49415383	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=33,14;MFRL=140,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.121:42:18,0:11,0:23,14,5,0
chr6	49421241	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,12,0
chr6	49437853	.	ATT	A,AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34,32;MFRL=165,175,171;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=6.39,31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,14:0.208,0.702:19:0,3,9:1,1,5:1,0,18,0
chr6	49440614	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=137.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,46:0.980:46:0,22:0,23:0,0,12,34
chr6	49483298	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,5:3,6:6,0,11,0
chr6	49494126	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:4,2:14,0:13,5,0,2
chr6	49494359	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,0:15,2:8,19,2,0
chr6	49494459	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:9,10,0,2
chr6	49578876	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=160,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,5:4,1:2,8,0,6
chr6	49578958	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=176,298;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr6	49580033	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,2:3,0:8,0,2,0
chr6	49582617	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=141,208;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:1,4,1,2
chr6	49660418	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr6	49660694	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:49660694_G_T:49660694:0,4,0,1
chr6	49660697	.	G	GTGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:49660694_G_T:49660694:0,3,0,1
chr6	49663465	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:4,8:8,4:11,1,12,0
chr6	49705182	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=15524273,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr6	49937257	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,11,4
chr6	50712784	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,1:3,5:3,0,6,0
chr6	50789944	.	CTG	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,2:6,0:3,15,0,2
chr6	51484348	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	51497344	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28,32;MFRL=173,168,86;MMQ=60,60,60;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.26,3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.248,0.248:9:4,1,2:1,1,0:5,0,4,0
chr6	51524359	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=136,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,1:10,1:10,6,2,0
chr6	51611588	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:12,0:17,2:0|1:51611588_G_T:51611588:13,17,0,2
chr6	51611594	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=132,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:15,2:0|1:51611588_G_T:51611588:11,14,0,2
chr6	51613270	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=53,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:51613270_G_C:51613270:0,2,1,0
chr6	51613273	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=53,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:51613270_G_C:51613270:0,2,1,0
chr6	51618170	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,9,11
chr6	51619808	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	51640751	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr6	51656236	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	51732986	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=182,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:51732986_T_C:51732986:0,2,0,1
chr6	51732987	.	TTAA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=182,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:1,0:1,1:0|1:51732986_T_C:51732986:0,2,0,1
chr6	51750640	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,3:9,0:18,3,1,2
chr6	51892737	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:4,0:8,2:3,10,0,2
chr6	51900434	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,1:10,2:10,8,2,1
chr6	51914898	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr6	51930886	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.908:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr6	51938242	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,12,10
chr6	51944893	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=237,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	52129493	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=134,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:9,8,2,0
chr6	52129667	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	52137313	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:0,5,1,6
chr6	52138441	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=177,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr6	52138765	.	GAAC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=151,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,0:0,3,0,2
chr6	52141850	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=123,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,3:5,0:8,3,1,2
chr6	52142582	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=199,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr6	52147363	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,6:5,1:7,0,6,1
chr6	52147692	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr6	52270544	.	TTTG	T	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,25:0.510:49:17,16:7,9:13,11,13,12
chr6	52270992	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:6,4,4,4
chr6	52271417	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=167,219;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:0|1:52271417_G_A:52271417:0,12,0,2
chr6	52271419	.	GAT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=167,219;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,1:4,0:0|1:52271417_G_A:52271417:0,12,0,2
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chr6	52662263	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr6	52697576	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=178,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,5:1,2:3,0,7,0
chr6	52697601	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,3:8,1:16,0,4,0
chr6	52697825	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0|1:52697825_A_C:52697825:0,0,2,8
chr6	52697834	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:52697825_A_C:52697825:0,0,1,8
chr6	52702324	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,6:0,11:0,0,10,8
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chr6	52762600	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:12,1:15,2:17,10,1,2
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chr6	52843477	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
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chr6	52958667	.	GT	G,GTT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=34,34,35;MFRL=163,168,150;MMQ=60,60,60;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.88,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:31,7,6:0.150,0.142:44:12,3,1:18,4,4:29,2,11,2
chr6	52962715	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
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chr6	52998834	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr6	52998856	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,5,4
chr6	53134104	.	C	CACAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=52.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,0,12
chr6	53134164	.	C	CCTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	53138203	.	TAA	T,TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31,32;MFRL=0,163,144;MMQ=60,60,60;MPOS=22,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.49,10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,5:0.364,0.548:8:0,2,3:0,1,2:0,0,0,8
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chr6	53160383	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr6	53365019	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=13,30;MFRL=109,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=138.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,43:0.957:44:0,20:0,21:0,1,27,16
chr6	53365404	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=215,199;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	53370628	.	TC	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.114:42:12,0:24,4:17,21,0,4
chr6	53520088	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,37;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	53520124	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	53707098	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,137;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.576:17:4,4:3,5:0,7,0,10
chr6	53883868	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=139,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:8,1:18,3:13,13,2,2
chr6	53986286	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.483:29:10,6:5,8:5,10,8,6
chr6	54013765	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,37;MFRL=170,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr6	54054837	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=153,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr6	54067088	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:0,7,0,5
chr6	54130829	.	CT	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=110,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.284:29:7,3:10,3:6,15,0,8
chr6	54186024	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	54245215	.	GACA	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=213,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	54254580	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:7,1:5,5:0|1:54254580_T_G:54254580:9,3,6,0
chr6	54254589	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=132,171;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.391:21:8,2:5,6:0|1:54254580_T_G:54254580:10,3,7,1
chr6	54804482	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=125,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:7,0,5,0
chr6	54805279	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=139,186;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:2,3,3,0
chr6	55113347	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:1,0,10,0
chr6	55113350	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=165,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,7:1,3:1,0,11,0
chr6	55113411	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=119.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,20:0,15:0,0,25,11
chr6	55113664	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,0:1,3:0,3,0,4
chr6	55113692	.	CTA	GGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=202,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	55113713	.	T	TTTTAGTATTG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=265,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:0,1:1,0:0|1:55113713_T_TTTTAGTATTG:55113713:1,0,0,1
chr6	55113715	.	GCC	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=265,229;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55113713_T_TTTTAGTATTG:55113713:1,0,0,1
chr6	55120128	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:17,2:14,0:14,17,0,2
chr6	55198826	.	T	TCCTCC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55198826_T_TCCTCC:55198826:0,0,0,1
chr6	55198827	.	AAT	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:55198826_T_TCCTCC:55198826:0,0,0,1
chr6	55216005	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=111,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:3,7:7,3:7,3,10,1
chr6	55266722	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0|1:55266722_C_T:55266722:0,1,1,4
chr6	55266744	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:55266722_C_T:55266722:0,4,0,1
chr6	55381262	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=181,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr6	55442033	.	GATAGAAAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	55625272	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.118:31:10,2:18,1:14,14,1,2
chr6	55739711	.	TA	T,TAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32,32;MFRL=133,187,178;MMQ=60,60,60;MPOS=26,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=3.94,8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,5:0.187,0.319:16:4,0,3:2,3,2:0,8,1,7
chr6	55922584	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:3,3:9,7:7,5,5,5
chr6	55929429	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,1:4,2:0,10,1,4
chr6	55966418	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=60.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,2,14
chr6	55988837	.	C	CT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.234:34:13,2:11,4:22,4,4,4
chr6	56006843	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=234,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,1:0,1,0,4
chr6	56047438	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.488:25:4,4:7,8:2,11,6,6
chr6	56327849	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:8,4:11,9:8,11,8,5
chr6	56329496	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=126,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:13,1:13,1:14,12,0,2
chr6	56334594	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:5,8:6,8:9,2,15,1
chr6	56347072	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=206,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.431:7:0,2:2,0:1,3,0,3
chr6	56354490	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	56359034	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,0,4
chr6	56365814	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=238,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr6	56374754	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=186,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:0,3,0,6
chr6	56381912	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr6	56394173	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	56417239	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,0:4,3:3,9,0,3
chr6	56425284	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr6	56427095	.	C	CTGAGTGTTGAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	56427110	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	56437465	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr6	56437686	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=146,70;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:81,3:0.046:84:41,0:38,3:45,36,1,2
chr6	56437902	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr6	56462840	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=51.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.948:15:0,8:0,7:0,0,1,14
chr6	56467586	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr6	56468238	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr6	56468537	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr6	56469764	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=131,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,3:8,4:9,5,6,2
chr6	56476262	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr6	56476456	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	56481864	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,1:6,2:5,5,2,1
chr6	56482704	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	56484448	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=169,105;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:5,0:12,3:8,10,0,3
chr6	56504477	.	TA	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.104:46:16,3:22,1:26,16,3,1
chr6	56507135	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr6	56818706	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	57061415	.	ACAAT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=138,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAAT;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:4,1:6,1:3,7,0,2
chr6	57244672	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:13,2:5,3:15,3,5,0
chr6	57244830	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=119,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:2,7,0,4
chr6	57244893	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=175,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr6	57246773	.	T	TAGG	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGG;STR;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:11,5:14,2:24,1,6,1
chr6	57246785	.	A	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,9:0.244:39:11,6:18,3:28,2,6,3
chr6	57246815	.	T	C	.	.	DP=75;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=158,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=58.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,23:0.337:69:18,11:28,12:34,12,12,11
chr6	57246969	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.457:39:9,8:12,8:5,16,3,15
chr6	57246982	.	G	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:8,7:10,9:3,15,1,15
chr6	57247022	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,3:7,3:0,12,0,6
chr6	57372199	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=60.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:5,4:3,13:8,0,16,2
chr6	57372361	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=146,157;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=93.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,28:0.645:43:7,14:8,13:6,9,7,21
chr6	57372365	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.308:40:13,7:14,5:7,21,4,8
chr6	57372374	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:14,1:14,6:6,22,0,7
chr6	57372436	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:0,6,0,6
chr6	57393125	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,21:0.595:35:6,11:7,10:12,2,15,6
chr6	57393199	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=5;MBQ=34,30;MFRL=125,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,18:0.345:53:17,9:18,9:11,24,5,13
chr6	57393216	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=135,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.527:40:7,9:10,12:6,13,1,20
chr6	57393222	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=137,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,9:0.227:42:13,4:20,5:0|1:57393222_A_G:57393222:6,27,1,8
chr6	57393228	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,8:0.219:39:13,3:18,4:0|1:57393222_A_G:57393222:5,26,1,7
chr6	57393278	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0,10,0,2
chr6	57398047	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=153,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr6	57398081	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=28,34;MFRL=176,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,0:2,5:8,0,5,0
chr6	57398117	.	T	TA	.	.	DP=41;ECNT=10;MBQ=32,30;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=45.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,13:0.341:39:16,7:10,6:0|1:57398117_T_TA:57398117:22,4,13,0
chr6	57398118	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=10;MBQ=35,30;MFRL=150,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=45.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,13:0.341:39:16,7:10,6:0|1:57398117_T_TA:57398117:22,4,13,0
chr6	57398154	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=10;MBQ=31,33;MFRL=134,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,28:0.500:56:18,14:9,12:0|1:57398154_T_C:57398154:18,10,23,5
chr6	57398157	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=29,34;MFRL=125,139;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,27:0.491:55:17,12:7,13:0|1:57398154_T_C:57398154:17,11,22,5
chr6	57398163	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=10;MBQ=31,27;MFRL=127,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=103.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,29:0.500:58:16,13:9,14:0|1:57398154_T_C:57398154:17,12,22,7
chr6	57398186	.	G	GA	.	.	DP=64;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,7:0.131:58:28,2:23,5:27,24,5,2
chr6	57398201	.	T	C	.	.	DP=66;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=125.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,34:0.515:66:21,11:11,23:17,15,22,12
chr6	57398226	.	T	A,G	.	.	DP=74;ECNT=10;MBQ=30,28,33;MFRL=139,117,149;MMQ=60,60,60;MPOS=22,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=28.91,70.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,15,24:0.221,0.360:69:15,1,12:11,12,12:15,15,20,19
chr6	57398335	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,8:0,7,0,11
chr6	57466987	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=222,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.686:10:2,4:0,3:3,0,7,0
chr6	57467279	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0|1:57467279_T_C:57467279:0,4,0,2
chr6	57467282	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=169,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,1:3,1:0|1:57467279_T_C:57467279:0,4,0,2
chr6	57467303	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=295,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,1:1,3:0,1,0,5
chr6	57472255	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=132,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=59.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:2,11:7,8:9,0,19,0
chr6	57472299	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,19:0.357:54:14,13:21,6:29,6,18,1
chr6	57472315	.	AG	GA,GG	.	.	DP=74;ECNT=4;MBQ=32,33,34;MFRL=119,141,138;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=68.43,51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,24,18:0.358,0.278:67:11,13,9:14,10,9:17,8,33,9
chr6	57472344	.	A	AT	.	.	DP=108;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=124,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=51.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:72,26:0.270:98:36,10:34,16:38,34,14,12
chr6	57472476	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=172,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.302:31:13,3:9,6:2,20,0,9
chr6	57472488	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,4:6,3:2,15,0,7
chr6	57472495	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,4:7,1:2,13,0,5
chr6	57472533	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=178,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr6	57498894	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr6	57498944	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,2:3,6:8,2,8,0
chr6	57499042	.	A	AT	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,16:0.335:49:19,9:13,7:12,21,9,7
chr6	57512439	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:10,7:6,6:16,0,13,0
chr6	57512476	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=104.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,33:0.667:49:8,18:8,15:12,4,25,8
chr6	57512565	.	T	C	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=131,149;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=119.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,37:0.628:59:12,15:8,22:10,12,12,25
chr6	57512678	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=125,104;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,36:0.616:58:12,13:10,22:11,11,15,21
chr6	57512711	.	G	A,C	.	.	DP=47;ECNT=7;MBQ=32,28,33;MFRL=142,97,131;MMQ=60,60,60;MPOS=8,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=31.26,39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,13,12:0.285,0.265:46:10,3,6:11,10,6:6,15,3,22
chr6	57512718	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=142,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.273:42:12,6:15,4:5,26,1,10
chr6	57512775	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,34;MFRL=188,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,2:3,2:0|1:57512775_T_G:57512775:0,8,0,4
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chr6	57512787	.	T	TCACCAAGGC	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:0|1:57512775_T_G:57512775:0,6,0,4
chr6	57512788	.	T	TTA	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,2:3,1:0|1:57512775_T_G:57512775:0,6,0,4
chr6	62757987	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	62887031	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	63921361	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	63921873	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=87,164;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.432:26:7,7:7,4:9,6,2,9
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chr6	63922376	.	T	TGG	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:6,0:6,0:0|1:63922376_T_TGG:63922376:0,13,4,0
chr6	63922380	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:5,1:6,1:0|1:63922376_T_TGG:63922376:1,12,4,0
chr6	63922385	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:6,1:6,2:0|1:63922376_T_TGG:63922376:5,12,4,0
chr6	63922389	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,13;MFRL=158,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:9,0:6,1:0|1:63922376_T_TGG:63922376:6,11,4,0
chr6	63922500	.	ATTTTTTT	A,AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,25,25;MFRL=58,131,104;MMQ=59,49,47;MPOS=18,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.08,10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,6:0.219,0.347:18:2,3,0:4,1,5:3,5,2,8
chr6	63922916	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=102,142;MMQ=60,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:3,8,2,3
chr6	63922929	.	A	AAAAT,AAAATAAATAAAT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31,34;MFRL=0,131,137;MMQ=60,50,40;MPOS=20,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,7,9;RU=AAAT;STR;TLOD=11.16,8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.464,0.442:6:0,1,0:0,2,2:0,0,0,6
chr6	63990250	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:6,6,1,1
chr6	63991183	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:63991183_G_A:63991183:0,3,0,1
chr6	63991185	.	C	CTGG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:63991183_G_A:63991183:0,3,0,1
chr6	63991189	.	GG	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:63991183_G_A:63991183:0,3,0,1
chr6	64288716	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=255,578;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64288716_G_GAA:64288716:1,0,1,0
chr6	64288721	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=255,578;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:64288716_G_GAA:64288716:1,0,1,0
chr6	64419024	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.612:8:1,4:2,1:3,0,4,1
chr6	64421443	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,1:3,1:9,2,2,0
chr6	64472270	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=158,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:8,0,3,0
chr6	64472339	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=163,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:15,1:13,1:22,6,0,2
chr6	64574304	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=168,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:64574304_CA_C:64574304:0,4,0,1
chr6	64574307	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=168,117;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:64574304_CA_C:64574304:0,4,0,1
chr6	64574315	.	A	AATTAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=162,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr6	64694544	.	ATGTGGAAAAGATGTAGGATGTTTGGTTCTGTAATTGGATGTGTTTTAATGTGTTTTTC	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=195,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.390:7:1,0:3,2:0,4,0,3
chr6	64694568	.	G	GTTTTTTACTATTTTGTGTGATTTTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=196,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.385:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr6	64694597	.	T	TCTTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.693:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	64708907	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,4:4,2:7,1,6,0
chr6	65016977	.	TGA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GA;STR;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.912:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	65098672	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,90;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:19,0:12,3:14,18,2,1
chr6	65098768	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr6	65303005	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=144,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:11,5,2,0
chr6	65303290	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	65611952	.	T	TATTA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:7,7:3,5:9,1,12,1
chr6	65612302	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:1,1,4,1
chr6	65655883	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=187,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr6	66005740	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=98,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.797:13:2,4:1,5:2,1,8,2
chr6	66005854	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=155,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:4,9,0,2
chr6	66005888	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr6	66045077	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	66053835	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr6	66115281	.	G	GAAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,18;MFRL=140,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=A;STR;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.830:13:1,4:0,0:0,2,3,8
chr6	66200400	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,10:6,3:10,0,13,0
chr6	69666520	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=135,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:3,12:9,5:7,5,13,4
chr6	69666747	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr6	69728452	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr6	69759148	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr6	69772817	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr6	69786046	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	70048739	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.482:21:6,6:4,4:11,0,9,1
chr6	70411513	.	A	AACACAAAAATTCAGCTAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.389:3:1,0:1,1:0|1:70411513_A_AACACAAAAATTCAGCTAAC:70411513:0,2,0,1
chr6	70411516	.	A	AG,T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32,32;MFRL=215,156,195;MMQ=60,60,60;MPOS=3,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,0:1,0,1:0,1,0,2
chr6	70411517	.	T	TAAAA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=205,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,1:2,0:1|0:70411513_A_AACACAAAAATTCAGCTAAC:70411513:0,2,0,1
chr6	70490518	.	A	AGGAGCAGGGAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=210,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	70840124	.	AT	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=117,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,10:0.176:56:23,7:12,2:20,26,4,6
chr6	70897949	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=150,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,2:0.062:46:22,1:21,1:16,28,0,2
chr6	70944123	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	70944340	.	AAAGAGAACATTGTTAAGTTGTAAACTGACAGACTCTGCAAGGAGCCAGGTGGCTGGATTTAC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:0,0:2,1:0,4,0,1
chr6	70944465	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	70949079	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	70950281	.	AAT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	70962044	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	70963232	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,9:0,0,1,16
chr6	70964745	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=90.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,15:0,11:0,0,9,17
chr6	70965125	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr6	70966421	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=206,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,5:1,2:1,0,7,1
chr6	70970299	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,7,3
chr6	70976538	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=75.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,14:0,7:0,0,2,20
chr6	70981794	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:10,6:6,7:4,12,5,8
chr6	70983644	.	TAATA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,150;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AATA;STR;TLOD=24.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.539:13:1,4:3,2:6,0,6,1
chr6	70983888	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.394:8:1,2:4,0:0,5,0,3
chr6	70984562	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr6	70990470	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:6,8:1,5:6,1,7,6
chr6	70991003	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr6	71011831	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	71137992	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:5,0,2,1
chr6	71185417	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=98,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.695:24:2,7:5,10:5,2,10,7
chr6	71190577	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,4:6,2:9,0,6,0
chr6	71236453	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:1,1:0,2:0|1:71236453_T_C:71236453:1,0,2,1
chr6	71236469	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:71236453_T_C:71236453:0,0,0,1
chr6	71248010	.	G	C	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,3:0.040:98:51,1:44,2:49,46,3,0
chr6	71269459	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,5:7,5:7,6,5,5
chr6	71269632	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=169,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,4:6,1:0,8,0,5
chr6	71482975	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,3:0,15:0,0,14,4
chr6	71508369	.	GA	G,GAA	.	.	DP=169;ECNT=1;MBQ=34,35,33;MFRL=136,131,141;MMQ=60,60,60;MPOS=25,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=19.04,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:100,15,5:0.116,0.045:120:47,6,2:36,8,2:74,26,16,4
chr6	71547435	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	71571511	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,25:0.578:43:6,10:12,15:13,5,10,15
chr6	71666146	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,9:0,2:0,0,3,8
chr6	72011086	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:7,8:5,7:10,2,11,4
chr6	72889472	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr6	72892257	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,0,19
chr6	73001673	.	AG	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=132,65;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.064:44:28,2:14,0:20,22,2,0
chr6	73102522	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.440:21:6,6:5,3:1,11,3,6
chr6	73843816	.	A	AAGCTCTTTCTTTTAGATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=199,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	73935135	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=111,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:6,4:0,6:0,6,2,8
chr6	73951987	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=185,125;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.452:14:3,4:2,2:1,7,2,4
chr6	74104111	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=126,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.172:21:10,0:8,3:0|1:74104111_A_C:74104111:7,11,2,1
chr6	74104119	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=140,94;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:8,0:5,1:0|1:74104111_A_C:74104111:6,10,1,1
chr6	74119084	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=71.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,2,17
chr6	74155491	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	74171893	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,234;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	74183000	.	C	CAGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=156,138;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AGAT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	74189574	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=97.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,13:0,16:0,0,10,19
chr6	74228006	.	A	G	.	.	DP=90;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=281.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,84:0.989:84:0,34:0,48:0,0,29,55
chr6	74228049	.	A	G	.	.	DP=81;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=251.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,70:0.987:70:0,38:0,32:0,0,30,40
chr6	74310231	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=182,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.224:7:3,0:2,1:0,6,0,1
chr6	74345313	.	A	ATAGATTATAATAAAAAACT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=18,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:74345313_A_ATAGATTATAATAAAAAACT:74345313:0,1,0,1
chr6	74345315	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74345313_A_ATAGATTATAATAAAAAACT:74345313:0,1,0,1
chr6	74351718	.	A	AACATATCCTCCAGGAATCTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.316:5:1,1:1,0:0,4,0,1
chr6	74440315	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=175,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	74468574	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=134,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:5,0,3,0
chr6	74476659	.	G	GT	.	.	DP=91;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=63.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,33:0.460:71:20,12:18,18:31,7,20,13
chr6	74481076	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	74491138	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr6	74493629	.	T	TAATGTTGAATATTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,16;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr6	74495257	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr6	74497237	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	74498432	.	TAAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,256;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	74502393	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr6	74533420	.	T	TACATGAGTA,A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,31,26;MFRL=150,124,300;MMQ=60,60,60;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,1,1:1,0,0:0,1,0,2
chr6	75795122	.	G	GCA,GCACA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26,33;MFRL=150,133,186;MMQ=60,60,60;MPOS=22,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=CA;STR;TLOD=7.59,18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,6:0.314,0.558:10:0,0,2:1,2,3:0,1,0,9
chr6	75796364	.	GTA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=14,14;MFRL=163,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TA;STR;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.792:7:0,0:0,1:0,1,0,6
chr6	75798785	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=183,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	75811880	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	75813440	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=143,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:18,0:18,3:30,6,0,3
chr6	75830974	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr6	75833876	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,10:0,5:0,0,7,8
chr6	75861717	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=145,38;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:16,0:18,2:13,22,1,1
chr6	75890933	.	T	TA,TAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=21,31,32;MFRL=85,181,187;MMQ=60,60,60;MPOS=21,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=A;STR;TLOD=9.64,4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,5,3:0.466,0.306:10:0,1,0:1,3,2:0,2,0,8
chr6	75893457	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,6:1,3:0,1,4,5
chr6	75904455	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr6	75947626	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:4,0,4,2
chr6	75950109	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=156,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:1,1:2,1:0,4,0,3
chr6	75968720	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr6	76022082	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:2,2:0|1:76022082_A_G:76022082:3,0,2,0
chr6	76022090	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:76022082_A_G:76022082:3,0,3,0
chr6	76023135	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:9,0:7,7,0,2
chr6	76024757	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=148,71;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:14,0:13,4:11,16,1,3
chr6	76373001	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,3:10,0:5,13,1,2
chr6	76385511	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,6:1,1:3,0,7,0
chr6	76388477	.	GTA	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:23,1:11,1:22,12,0,2
chr6	76405431	.	CA	TG	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=171,172;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:7,1:21,1:29,0,2,0
chr6	76405439	.	TG	CA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=171,167;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:7,2:23,0:30,0,2,0
chr6	76419438	.	TG	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=163,202;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	76419443	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=163,202;MMQ=60,53;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.595:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	76421003	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.575:38:9,10:7,12:13,3,19,3
chr6	76538403	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.518:15:4,3:3,3:0,7,1,7
chr6	76554593	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=127.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,25:0,14:0,0,27,12
chr6	76557997	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=192,121;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:11,1,2,0
chr6	76566734	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr6	76583113	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=30,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:2,1,0,4
chr6	76596728	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:2,5,1,4
chr6	76599857	.	G	GA	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=34,18;MFRL=128,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,4:0.060:79:39,1:27,0:54,21,1,3
chr6	76607983	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:5,8:9,8:14,0,16,0
chr6	76624741	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=117,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:3,3,0,6
chr6	76656978	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.536:11:5,0:0,6:5,0,3,3
chr6	76713754	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=119,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	76720990	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,2:4,4:0,7,0,6
chr6	76728583	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.321:10:2,0:3,3:0,7,0,3
chr6	76735065	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr6	76744298	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:3,3:5,2:8,0,5,1
chr6	76782049	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	78171941	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,7:0,9:0,0,13,3
chr6	79577644	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,5,19
chr6	79595167	.	A	ACTTAT	.	.	DP=111;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=437.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,100:0.991:100:0,30:0,63:0,0,46,54
chr6	79664440	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	79664748	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr6	79695003	.	T	TA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:13,1:10,3:24,0,4,0
chr6	79695029	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=147.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,44:0.979:44:0,22:0,21:0,0,40,4
chr6	79707209	.	CTTCTTGGTGCGTTGCTG	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=161,68;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:62,3:0.059:65:23,2:30,0:34,28,1,2
chr6	79707923	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:3,2:5,2:8,0,4,1
chr6	79727119	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.085:44:28,1:13,2:18,23,1,2
chr6	79752792	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	79913379	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,17;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.814:12:1,3:0,1:0,2,2,8
chr6	79944355	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr6	80228673	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,0,15
chr6	80341279	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,0:2,5:0,4,0,5
chr6	80341320	.	CG	GC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	80626375	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,27:0.451:60:14,11:19,16:10,23,10,17
chr6	80631539	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr6	80634848	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	80720487	.	GCAT	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,14:0.428:33:8,7:10,3:0|1:80720487_GCAT_G:80720487:13,6,11,3
chr6	80720491	.	T	TAAAGA	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,14:0.428:33:7,7:10,2:0|1:80720487_GCAT_G:80720487:13,6,11,3
chr6	80720733	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=173,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.501:10:2,1:2,4:0|1:80720733_G_A:80720733:0,5,0,5
chr6	80720742	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=169,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.501:8:1,1:2,3:0|1:80720733_G_A:80720733:0,4,0,4
chr6	80721497	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=144,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:25,1:15,1:24,18,1,1
chr6	80724312	.	A	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,25:0.473:53:10,9:18,15:5,23,7,18
chr6	80741328	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=58.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,20:0.525:38:11,10:7,10:2,16,1,19
chr6	80747582	.	TATAATA	T,TATA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,29,29;MFRL=154,179,221;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=ATA;STR;TLOD=41.59,5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,11,2:0.435,0.113:24:6,8,0:3,3,2:11,0,13,0
chr6	80749885	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,22:0.411:54:16,9:16,13:26,6,18,4
chr6	80750290	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,15:0.640:23:6,6:1,9:0|1:80750290_C_T:80750290:5,3,13,2
chr6	80750292	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=138,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,15:0.640:23:7,5:1,9:0|1:80750290_C_T:80750290:5,3,13,2
chr6	80751780	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=145,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=56.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.500:42:12,16:8,5:20,1,15,6
chr6	80837239	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=132,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,4:4,8:10,1,10,2
chr6	80837253	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.511:27:8,5:5,9:11,2,11,3
chr6	80910622	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr6	80912746	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr6	82461727	.	ACCGCCGAAGTCGCCGCCGCCGAAGTCGCCG	A,ACCGCCGAAGTCGCCG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29,30;MFRL=0,147,148;MMQ=60,60,57;MPOS=27,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=4,2,3;RU=CCGCCGAAGTCGCCG;STR;TLOD=25.30,11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,7,3:0.417,0.511:10:0,5,1:0,2,2:0,0,2,8
chr6	82882968	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=225,133;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr6	82882980	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=177,224;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,0:1,2:2,0,3,0
chr6	82883238	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=177,237;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr6	82906238	.	G	GCCATCCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:82906238_G_GCCATCCC:82906238:0,1,0,1
chr6	82906241	.	A	AGCAATCC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:82906238_G_GCCATCCC:82906238:0,1,0,1
chr6	82906245	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:82906238_G_GCCATCCC:82906238:0,1,0,1
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chr6	82922571	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr6	82924390	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=129,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:24,3:16,0:28,12,3,0
chr6	82924645	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=88,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.562:5:1,0:1,2:0,2,0,3
chr6	82930437	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=18,17;MFRL=132,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.603:13:0,1:1,0:0,5,0,8
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chr6	83075796	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:13,4:17,0:14,16,4,0
chr6	83077073	.	TATAAAG	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAAAG;STR;TLOD=46.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.382:35:7,3:13,10:2,20,5,8
chr6	83080386	.	C	CTTTG	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTG;STR;TLOD=81.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.700:28:5,10:3,8:3,5,2,18
chr6	83754094	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.903:18:1,6:0,11:1,0,17,0
chr6	83834957	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=117.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,18:0,16:0,0,6,29
chr6	83835175	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr6	83838973	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=91.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,9:0,0,17,7
chr6	83842055	.	C	CTCT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=89.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,10:0,0,6,16
chr6	83842097	.	CACACACAA	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=120,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr6	83842101	.	CACAA	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=118,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.625:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr6	83842104	.	A	ACACATGCCCACTACC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.776:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	83861930	.	TACAC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=AC;STR;TLOD=107.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,17:0,8:0,0,24,1
chr6	83863583	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,7:0,13:0,0,13,7
chr6	83877496	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr6	83880274	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr6	83896633	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=132.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,21:0,16:0,0,37,0
chr6	83898300	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.858:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	83947616	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=200,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:83947616_C_CAT:83947616:0,1,0,1
chr6	83947618	.	C	CATTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=200,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:83947616_C_CAT:83947616:0,1,0,1
chr6	83947622	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=200,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.496:2:1,0:0,1:0|1:83947616_C_CAT:83947616:0,1,0,1
chr6	84056108	.	AATTTCTGACTCT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	84061864	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=72,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.324:12:6,1:1,1:6,2,0,4
chr6	84266015	.	A	ATTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:84266015_A_ATTG:84266015:0,2,0,1
chr6	84266018	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:84266015_A_ATTG:84266015:0,2,0,1
chr6	84284664	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	84290087	.	TGA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=182,268;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=GA;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:5,1:11,0,2,0
chr6	84290137	.	TAAAG	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.324:16:7,4:3,1:10,1,2,3
chr6	84290262	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=128,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,0:15,2:13,17,0,2
chr6	84292139	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=241,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr6	84317533	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,21:0.500:42:15,14:6,7:9,12,3,18
chr6	84320246	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:5,1,5,0
chr6	84320467	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=111.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,13:0,18:0,0,0,39
chr6	84368819	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.596:8:1,2:0,3:0,3,0,5
chr6	84375377	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	84563410	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=152,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.517:17:5,6:3,1:6,2,6,3
chr6	84563840	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:4,4,1,1
chr6	84603226	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.556:32:8,13:6,4:11,3,14,4
chr6	84603422	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=212,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr6	84627810	.	A	G	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=103.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,38:0.517:73:19,22:16,14:3,32,7,31
chr6	84634210	.	G	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=125,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:16,2:24,0:20,20,1,1
chr6	84649734	.	GT	G,GTT	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,33,36;MFRL=149,53,113;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.37,3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:32,4,7:0.088,0.151:43:19,2,4:12,1,3:30,2,9,2
chr6	84650214	.	G	GT	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=153,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,19:0.464:41:8,12:14,7:21,1,19,0
chr6	84650364	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=59.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.667:28:3,8:6,10:1,8,2,17
chr6	84799185	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:8,2:7,7:4,12,1,8
chr6	84799194	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=140,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:7,0:11,2:0|1:84799194_G_GA:84799194:5,15,1,1
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chr6	84799231	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:6,1:0,2:2,5,0,4
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chr6	84835050	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=236,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:84835045_G_T:84835045:0,1,0,1
chr6	84835055	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=236,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:84835045_G_T:84835045:0,1,0,1
chr6	84856409	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,4:2,8:3,3,9,3
chr6	84873080	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,0:0,3:0,2,0,3
chr6	84884867	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=177,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:2,2:2,2:5,0,5,0
chr6	84903225	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=202,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,6:3,1:6,1,7,0
chr6	84903394	.	C	G	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=124.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,42:0.559:75:16,25:17,16:12,21,14,28
chr6	84911336	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:6,0,7,0
chr6	84913725	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=131,68;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:84913725_A_C:84913725:10,6,1,1
chr6	84913727	.	TTG	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=131,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,1:6,0:0|1:84913725_A_C:84913725:10,6,1,1
chr6	84922681	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.454:33:9,5:8,9:12,6,10,5
chr6	85466607	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.452:20:6,5:5,4:2,9,1,8
chr6	85470108	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,74;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,0:4,4:3,6,0,4
chr6	86195033	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,5:6,3:6,4,6,2
chr6	86251599	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr6	86257229	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,3:2,11:1,4,6,8
chr6	87796233	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr6	87797953	.	AAAC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr6	87970171	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,69;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:13,0:17,2:11,21,0,2
chr6	88046946	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=202,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:0,5,1,5
chr6	88108048	.	AGAT	A	.	.	DP=104;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=402.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,96:0.990:96:0,50:0,45:0,0,60,36
chr6	88170710	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=101.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,14:0,15:0,0,23,6
chr6	88221097	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,0:7,3:13,0,3,0
chr6	88224023	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=210,191;MMQ=44,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr6	88224029	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=191,210;MMQ=40,44;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr6	88224060	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,10;MFRL=193,198;MMQ=60,44;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,0:3,0:6,0,2,0
chr6	88226641	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,4,8
chr6	88255438	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr6	88273971	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,1:0,12:0,0,0,14
chr6	88300013	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	88303967	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr6	88315741	.	TA	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=108.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,12:0,21:0,0,5,29
chr6	88317292	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	88331299	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,0,10
chr6	88331572	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:13,0,2,0
chr6	88366602	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=84.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,14:0,0,10,13
chr6	88366771	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	88366788	.	T	TATTATAATTTGATAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=188,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	88375553	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=162,151;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:7,11,0,2
chr6	89387895	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr6	89511228	.	TAC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:10,1:11,1:23,0,2,0
chr6	89601706	.	A	ATTAAGAATGATGTTTCTTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr6	89614397	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=129,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:7,2:5,2:12,0,4,0
chr6	89638988	.	TA	T	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=15,17;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.184:41:5,0:5,3:7,26,2,6
chr6	89790559	.	CTTCA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=12,32;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCA;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:0,2:1,0,3,0
chr6	89814830	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,8:8,2:6,6,7,3
chr6	89862725	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,1:1,7:5,0,7,1
chr6	89864679	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,7:5,8:0,10,0,15
chr6	89867980	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:5,11:2,6:7,0,17,0
chr6	89868190	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:1,5:6,3:0,7,0,8
chr6	89871759	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,2:7,8:10,1,9,1
chr6	89888443	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	89888839	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	89891582	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	89894968	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr6	89909204	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr6	89913108	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:4,1:5,3:0|1:89913108_C_G:89913108:8,4,4,0
chr6	89913112	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:7,2:5,3:0|1:89913108_C_G:89913108:8,4,5,0
chr6	89913118	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=153,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:12,4,2,0
chr6	89913286	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=191,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr6	89974063	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	89975245	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	89975569	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=172,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr6	89977322	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	89977906	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=134,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr6	90045077	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=147,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,3:9,1:10,9,3,1
chr6	90326471	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	90340276	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,9,7
chr6	90347394	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,3:6,0:15,2,3,0
chr6	90360655	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:90360655_G_A:90360655:0,2,0,1
chr6	90360660	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:90360655_G_A:90360655:0,2,0,1
chr6	90361811	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	90365582	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,1:9,1:5,13,0,2
chr6	90371704	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	90371986	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,3:0,11:0,0,1,17
chr6	90381849	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	90385754	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr6	90387233	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	90390338	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=117,59;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:10,5,1,1
chr6	90394798	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90394798_T_A:90394798:0,0,0,1
chr6	90394799	.	CATT	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:90394798_T_A:90394798:0,0,0,1
chr6	90398197	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,7,0
chr6	90400292	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr6	90405306	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,5:0,0,12,2
chr6	90405993	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	90415764	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=121.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,12:0,22:0,0,29,5
chr6	90423050	.	A	AAGCATGGGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=232,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	90426270	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	90428968	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,1,12
chr6	90432584	.	A	AAT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=14,32;MFRL=185,259;MMQ=54,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:0,0:1,1:4,0,1,0
chr6	90432589	.	C	G,A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,18,15;MFRL=217,185,259;MMQ=60,44,43;MPOS=9,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.63,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.222:6:1,0,0:1,0,0:3,0,3,0
chr6	90432662	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=90.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,19,9
chr6	90437699	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr6	90450135	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	90452808	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.245:18:3,1:10,2:12,2,2,2
chr6	90453248	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr6	90453492	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr6	90455429	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr6	90459454	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr6	90463149	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=212,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:0,6:1,1:1,0,7,0
chr6	90468465	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr6	90468775	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	90491071	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr6	90604731	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=121,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,1:14,2:15,11,2,1
chr6	90605836	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,12:0,0,1,22
chr6	90660299	.	C	CAGTTTGGACAAAGACCTCTCTGAGCCGGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=145,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.185:15:7,0:6,2:8,5,1,1
chr6	90660319	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=198,137;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:2,2,6,2
chr6	90661576	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,136;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,18:0.472:38:11,7:9,10:7,13,9,9
chr6	91256928	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=84,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr6	91263200	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=138,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,3:0.050:77:39,2:32,1:47,27,2,1
chr6	91266349	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,5:4,3:1,4,0,8
chr6	91296420	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr6	93956769	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=200,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,0:0,3:0,4,0,3
chr6	93964319	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:4,1:4,1:6,3,2,0
chr6	93967851	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,8:4,3:7,4,6,5
chr6	94120192	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,5:0,2:2,0,4,3
chr6	96034881	.	A	ATG,ATATG	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=214,195,164;MMQ=60,60,60;MPOS=15,21;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.69,18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,2,7:0.128,0.317:24:8,0,2:7,2,4:12,3,7,2
chr6	96054201	.	G	GGGGCTGCCAACCATCATC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0|1:96054201_G_GGGGCTGCCAACCATCATC:96054201:0,3,1,1
chr6	96054206	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=156,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:96054201_G_GGGGCTGCCAACCATCATC:96054201:0,3,0,1
chr6	96054210	.	C	CTTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	96653730	.	C	CATTGATGGACA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:5,2:3,0:5,3,1,1
chr6	96654472	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=231,254;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:96654472_A_G:96654472:0,3,0,1
chr6	96654474	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=231,254;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:96654472_A_G:96654472:0,3,0,1
chr6	96654476	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,22;MFRL=231,254;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:96654472_A_G:96654472:0,3,0,1
chr6	96654481	.	G	GGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=208,231;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:96654481_G_GGT:96654481:0,1,0,1
chr6	96654486	.	GTA	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=208,231;MMQ=60,59;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:96654481_G_GGT:96654481:0,1,0,1
chr6	96655105	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	96656088	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=50.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.955:17:0,7:0,10:0,0,5,12
chr6	96656129	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,14:0,0,13,11
chr6	96656148	.	A	AT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=212,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=50.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.911:25:1,10:1,13:1,1,18,5
chr6	96656767	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,6:0,0,13,3
chr6	96656775	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=89,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.908:17:1,7:0,9:1,0,11,5
chr6	96656811	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.417:36:9,8:12,6:11,10,8,7
chr6	96659493	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,4:2,9:4,1,5,8
chr6	96661036	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,7:0,0,6,13
chr6	96661315	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,9,7
chr6	96969694	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:8,5:3,6:8,3,7,4
chr6	96971185	.	G	GT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=126,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.155:23:9,0:8,2:5,15,0,3
chr6	96974386	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.861:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	96976594	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=162,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:2,0:0|1:96976594_G_A:96976594:1,2,0,1
chr6	96976595	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=162,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:2,0:0|1:96976594_G_A:96976594:1,2,0,1
chr6	96976598	.	T	TGGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=162,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:96976594_G_A:96976594:1,2,0,1
chr6	96982111	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.273:12:6,3:2,0:8,1,3,0
chr6	96996228	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,0:4,6:0,8,0,6
chr6	96996244	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr6	96999220	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,16,0
chr6	96999643	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,5:4,4:12,0,8,1
chr6	97000341	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,1830766;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr6	97001444	.	A	ACCCTTGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:4,1:1,0:0,5,0,1
chr6	97246755	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,63;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:12,1:14,1:14,13,0,2
chr6	97339275	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=151,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,0:0,1,0,4
chr6	97562474	.	T	TTGGTGTCTATGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=190,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:97562474_T_TTGGTGTCTATGC:97562474:0,1,0,1
chr6	97562476	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=190,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:97562474_T_TTGGTGTCTATGC:97562474:0,1,0,1
chr6	97630017	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	97677356	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97677356_T_TG:97677356:0,0,0,1
chr6	97677357	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97677356_T_TG:97677356:0,0,0,1
chr6	97679540	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.852:11:0,7:1,3:0,1,2,8
chr6	97679605	.	T	TCAACTTCTCAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr6	97694582	.	A	ATAG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAG;STR;TLOD=104.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.965:24:0,11:0,12:0,0,7,17
chr6	97729256	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:97729256_T_A:97729256:0,2,0,1
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chr6	98472564	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,2:2,4:0,9,0,6
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chr6	98472601	.	T	TTGG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=220,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	99283376	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
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chr6	99353272	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.439:30:8,8:9,4:15,2,9,4
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chr6	99781259	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:8,3,2,0
chr6	99796886	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr6	99817601	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,9,10
chr6	99817699	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=90,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,0:0,1:2,1,0,2
chr6	99825227	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.496:26:7,10:6,2:11,2,11,2
chr6	99831542	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:4,1,4,2
chr6	99848994	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,0:6,2:8,5,0,2
chr6	99853849	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr6	99853866	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,13,3
chr6	99883842	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,5,9
chr6	99883979	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=237,207;MMQ=46,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99883979_T_A:99883979:0,1,0,1
chr6	99883985	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=237,207;MMQ=46,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:99883979_T_A:99883979:0,1,0,1
chr6	99894360	.	CAAAGA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAGA;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	99935975	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	99951750	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:0,1,0,8
chr6	99951768	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=192,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr6	99955243	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,3:0,7:0,0,10,1
chr6	99998287	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=182,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	99999019	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.467:32:7,4:10,10:0,17,0,15
chr6	100006244	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,5:0,0,9,0
chr6	100016240	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	100016340	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:3,3:3,7:3,4,8,2
chr6	100368759	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr6	100838544	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:11,6,2,0
chr6	100868721	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=99,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.473:42:9,13:12,5:9,13,10,10
chr6	100895344	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	100897639	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	100898062	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:100898062_A_C:100898062:0,0,1,0
chr6	100898064	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:100898062_A_C:100898062:0,0,1,0
chr6	100898066	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:100898062_A_C:100898062:0,0,1,0
chr6	100901535	.	GTT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=23,37;MFRL=175,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	100911072	.	ATATGT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr6	100957712	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=212,191;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr6	100958076	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=231,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100958076_C_A:100958076:0,1,0,1
chr6	100958081	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=227,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:100958076_C_A:100958076:0,2,0,1
chr6	101037718	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=170,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.429:10:2,0:2,4:4,2,3,1
chr6	101054999	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=129,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,5:5,8:2,6,1,12
chr6	101078974	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:9,2:3,6:8,4,6,2
chr6	101090377	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	101100528	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr6	101100783	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,3:5,2:0,9,1,4
chr6	101163433	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=97,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,1:2,3:2,6,0,5
chr6	101215223	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,4:0,0,2,13
chr6	101215244	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,7:1,0:0,4,0,7
chr6	101247503	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	101248474	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:101248474_T_C:101248474:0,0,0,2
chr6	101248480	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:101248474_T_C:101248474:0,0,0,2
chr6	101253788	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,2:5,1:0,6,1,2
chr6	101311908	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr6	101312097	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:101312097_C_T:101312097:0,0,1,4
chr6	101312104	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0|1:101312097_C_T:101312097:0,0,1,3
chr6	102133993	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=89,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr6	102134022	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,5:1,1:2,1,6,0
chr6	102307069	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	102376517	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,0,12
chr6	105219748	.	G	GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=93,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=42.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.867:20:1,7:0,11:2,0,17,1
chr6	105232204	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,15:0,6:0,0,18,3
chr6	105232233	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,16:0,8:0,0,21,3
chr6	105232460	.	C	CA,CAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34,34;MFRL=0,202,148;MMQ=60,60,60;MPOS=11,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=14.17,5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.636,0.273:8:0,1,1:0,4,1:0,0,0,8
chr6	105244526	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,10,8
chr6	105259111	.	CTTTA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTA;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	105290985	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:105290985_C_G:105290985:3,0,1,0
chr6	105290986	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:105290985_C_G:105290985:3,0,1,0
chr6	105300103	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GC;STR;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,0:0,0,4,0
chr6	105300250	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,10:0,5:0,0,6,9
chr6	105405220	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr6	105526496	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:3,6,1,1
chr6	105577172	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	105577224	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=74.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,14,6
chr6	105577401	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=74.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.963:23:0,9:0,13:0,0,4,19
chr6	105595261	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,10:0,0,9,8
chr6	105607753	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=22,35;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:105607753_G_C:105607753:0,1,0,1
chr6	105607755	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=13,34;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:0,1:0|1:105607753_G_C:105607753:0,1,0,1
chr6	105607758	.	GT	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:105607753_G_C:105607753:0,1,0,1
chr6	105607762	.	G	GTAC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:105607753_G_C:105607753:0,1,0,1
chr6	105607766	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=10,26;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:105607753_G_C:105607753:0,1,0,1
chr6	105607770	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:105607753_G_C:105607753:0,1,0,1
chr6	105609885	.	T	TGGGCTTGGGTAGATG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	105850763	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:4,4:3,2:1,6,1,6
chr6	106534484	.	A	AT	.	.	DP=75;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=135,112;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,5:0.114:49:23,1:18,2:7,37,0,5
chr6	106553246	.	C	CATTATAGTCTGTCTTCTCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:2,4,1,1
chr6	106634569	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=122,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:1,3,0,3
chr6	106727719	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=172,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:8,3:1,3:0,9,0,6
chr6	106960447	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.350:15:5,1:4,3:3,7,4,1
chr6	106975415	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:0,6,0,8
chr6	106989212	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	106992592	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=71.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,10:0,0,6,15
chr6	106992844	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,5:0,0,0,15
chr6	106999658	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr6	107001456	.	A	T	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=162.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,50:0.982:50:0,27:0,23:0,0,7,43
chr6	107003810	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,9:0,10:0,0,0,21
chr6	107006347	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:3,2,7,0
chr6	107009119	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr6	107035635	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,5:3,6:4,4,5,6
chr6	107050867	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=51.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,10:0,5:0,0,1,14
chr6	107069232	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr6	107069258	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:6,2,3,2
chr6	107100009	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=206,270;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:107100009_A_G:107100009:3,0,1,0
chr6	107100018	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=213,270;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:107100009_A_G:107100009:2,0,1,0
chr6	107113916	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,159;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:9,0:1,2:2,8,0,2
chr6	107351457	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr6	107361476	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr6	107365376	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:5,0,4,0
chr6	107365411	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,9:0,0,22,0
chr6	107372242	.	GTTTTC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,4:3,1:7,2,4,1
chr6	107390046	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,15101953;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,0:4,2:3,9,0,2
chr6	107420387	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,1:7,2:13,2,1,2
chr6	107533265	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=147,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr6	107811878	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=152,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:5,3:10,0:8,7,2,1
chr6	107908460	.	T	TTGTCTTGGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:107908460_T_TTGTCTTGGC:107908460:0,0,0,1
chr6	107908462	.	A	ATACAGGCT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:107908460_T_TTGTCTTGGC:107908460:0,0,0,1
chr6	108026317	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,6:0,3:0,0,11,0
chr6	108026344	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,5:2,3:4,0,8,0
chr6	108041801	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	108042180	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=155,49;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:16,2:13,0:7,22,1,1
chr6	108042213	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,4,17
chr6	108093328	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0,0,16,3
chr6	108093580	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	108193148	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr6	108243124	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr6	108277287	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	108279290	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	108370723	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,18;MFRL=213,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr6	108487877	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	108489462	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,1,4
chr6	108492570	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,34;MFRL=218,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TC;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:1,0,2,0
chr6	108495950	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=197,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	108502144	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:1,14,0,2
chr6	108676779	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=215,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr6	108677003	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr6	108797968	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr6	108840870	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,6:5,4:5,4,7,3
chr6	108986135	.	TG	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=191,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:2,0:3,2:0|1:108986135_TG_GT:108986135:1,7,0,2
chr6	108986141	.	G	GATGATATGGGCAACTCAACT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=191,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:108986135_TG_GT:108986135:1,7,0,2
chr6	109179351	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:6,6:5,1:11,0,7,0
chr6	109249206	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,2:3,0,5,0
chr6	109258284	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	109319741	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,0:11,2:17,8,2,0
chr6	109480681	.	CT	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.149:35:7,2:18,3:10,20,3,2
chr6	109665483	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,5:3,1:1,8,0,6
chr6	109689431	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:7,5:7,6:13,1,10,1
chr6	109740395	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=139,84;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.099:37:16,0:18,3:0|1:109740395_A_T:109740395:23,11,1,2
chr6	109740405	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=137,84;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:15,0:16,2:0|1:109740395_A_T:109740395:23,14,0,2
chr6	109763947	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:6,3:4,4:4,6,2,6
chr6	109764874	.	TGGA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:1,5:3,1,7,1
chr6	109765870	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,0:1,4:3,0,4,0
chr6	109767634	.	GGA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=94,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,0:0|1:109767634_GGA_G:109767634:0,3,0,2
chr6	109767639	.	GA	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=94,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:109767634_GGA_G:109767634:0,3,0,2
chr6	109767919	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=138,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:27,3:22,0:26,25,2,1
chr6	109767930	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=146,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,26:0.450:58:21,12:11,14:12,20,15,11
chr6	109768861	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.514:21:6,2:4,7:4,6,10,1
chr6	109773806	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.276:20:4,3:8,2:5,10,2,3
chr6	109775436	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=296,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr6	109787596	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:5,4:6,10:3,8,7,7
chr6	109787789	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=207,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109787789_T_A:109787789:0,1,0,1
chr6	109787791	.	A	AAAGAG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=207,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109787789_T_A:109787789:0,1,0,1
chr6	109787793	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=37,30;MFRL=207,189;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109787789_T_A:109787789:0,1,0,1
chr6	109797304	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:4,3:4,7:8,0,10,0
chr6	109830318	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=58,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr6	109835646	.	AC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:12,2:5,4:5,13,1,5
chr6	109837859	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:1,7,2,0
chr6	109863238	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:10,4:4,4:11,3,8,0
chr6	109867151	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=118,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:21,0:14,2:16,20,0,2
chr6	109935716	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=141,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:0,10,0,6
chr6	109954065	.	C	CATAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=273,186;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=ATAG;STR;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.844:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr6	109962904	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	109995505	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:19,0:25,3:12,32,0,3
chr6	109996751	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,4:1,1:4,0,5,0
chr6	110048489	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=137,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.451:11:5,0:1,5:0,6,0,5
chr6	110064780	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=238,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	110081618	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=119,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr6	110085110	.	TTTTTTAAAAGTGTTTA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:4,0:10,2:10,11,1,1
chr6	110085257	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr6	110087848	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr6	110112559	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=110,87;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,1,1
chr6	110113970	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	110146497	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=138,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,1,4
chr6	110301945	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=177,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,0:1,1,2,2
chr6	110530266	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,1:8,1,2,0
chr6	110550223	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:7,9:6,9:3,10,0,18
chr6	110643956	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr6	110644112	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	110679062	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	110714584	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	110736610	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	110736860	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	110746351	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,1,5
chr6	110746526	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,11,5
chr6	110752289	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=210,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr6	110759920	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=122,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:5,3:11,0:16,2,3,0
chr6	110778128	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:3,2:6,7:6,3,6,4
chr6	110778151	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,2:8,0:11,4,2,0
chr6	110797703	.	CCGCGGG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	110797821	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr6	110942653	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=109,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:0,1:5,3:0,5,0,4
chr6	110944196	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	110991549	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=175,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr6	110991770	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:1,14,1,1
chr6	110991802	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr6	110991832	.	T	TAGGATTGTTTTATATAGGTATGGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr6	111067438	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=143,203;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:0|1:111067438_A_C:111067438:0,7,0,3
chr6	111067442	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=152,203;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:0|1:111067438_A_C:111067438:0,6,0,3
chr6	111213692	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=168,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.352:9:2,1:3,1:0,6,0,3
chr6	111213927	.	T	TC	.	.	DP=117;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=80,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=230.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,101:0.957:106:2,47:3,47:2,3,48,53
chr6	111281581	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.490:29:5,7:8,7:11,4,9,5
chr6	111281584	.	GT	G,GTT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,34,26;MFRL=153,153,113;MMQ=60,60,60;MPOS=15,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=21.23,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,10,4:0.371,0.146:27:6,6,2:6,4,1:10,3,8,6
chr6	111281880	.	A	ATAAATAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAATAT;STR;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:3,1:6,3:1,8,0,4
chr6	111283592	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=118,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,28:0.454:62:14,12:20,16:21,13,18,10
chr6	111283718	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,13:0.354:37:11,8:13,4:7,17,4,9
chr6	111321037	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:3,2:4,2:1,7,0,4
chr6	111329221	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:8,9:4,5:11,2,15,1
chr6	111329233	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=155,128;MMQ=60,35;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:24,3:14,0:28,11,3,0
chr6	111499588	.	TTATTTC	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=130,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATTTC;STR;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:13,0:10,2:18,7,1,1
chr6	111499665	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=173,80;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:9,0:3,2:1,11,1,1
chr6	111499700	.	A	AAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:2,1:0,0:0|1:111499700_A_AAG:111499700:0,2,0,1
chr6	111499702	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:111499700_A_AAG:111499700:0,2,0,1
chr6	111527839	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:10,5:7,3:11,6,5,3
chr6	111527988	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,0,16
chr6	111628597	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=106,139;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,22:0.668:33:1,11:8,11:5,6,11,11
chr6	111628626	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=101,139;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,21:0.762:27:3,10:3,11:2,4,8,13
chr6	111643757	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,147;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:17,4:14,1:22,9,5,0
chr6	111711232	.	C	CG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,4:2,8:8,0,12,0
chr6	111714240	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,14;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.370:6:1,0:1,0:0|1:111714240_G_T:111714240:0,4,0,2
chr6	111714245	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:4,2:1,0:0|1:111714240_G_T:111714240:0,5,0,2
chr6	111732843	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=200,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,0:5,3:0,10,0,3
chr6	111896790	.	CAAAAA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=A;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.851:11:0,1:0,7:0,1,8,2
chr6	111983084	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,0:14,2:4,15,2,0
chr6	111995666	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:7,1,4,2
chr6	112024262	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,1:2,9:0,4,1,9
chr6	112457364	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,337826;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,1:7,1:9,9,1,1
chr6	112466145	.	A	AGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=164,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:2,4,1,1
chr6	112506375	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr6	112506583	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,0,19
chr6	112508769	.	TG	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,1,12
chr6	112535131	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr6	112537497	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr6	112672155	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.529:26:3,7:9,5:3,9,9,5
chr6	112672198	.	CAG	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,4:5,5:2,7,1,8
chr6	114178831	.	C	CGCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=13,32;MFRL=267,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCT;STR;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,4:0,0:1,0,4,0
chr6	114179081	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=188,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,1:1,0:0|1:114179081_G_A:114179081:0,1,0,1
chr6	114179084	.	GG	CA	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=188,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114179081_G_A:114179081:0,1,0,1
chr6	114179087	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,34;MFRL=188,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:114179081_G_A:114179081:0,1,0,1
chr6	114179091	.	AAGGCT	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,28;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:114179081_G_A:114179081:0,2,0,1
chr6	114179098	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:114179081_G_A:114179081:0,2,0,1
chr6	114179118	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	114181647	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.488:24:7,4:5,5:11,1,10,2
chr6	114378692	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,1:6,1:7,7,2,0
chr6	116264354	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=142,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.350:26:10,6:5,2:2,15,1,8
chr6	116288912	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.447:17:3,2:6,5:0,9,1,7
chr6	116427506	.	CTT	C,CT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,20,20;MFRL=143,214,174;MMQ=60,60,60;MPOS=21,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=T;STR;TLOD=3.75,11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,9:0.303,0.611:14:0,0,4:0,2,1:0,1,1,12
chr6	116429623	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,7:3,6:3,3,5,8
chr6	116439220	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:0,6,0,5
chr6	116441229	.	T	TGGG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=85.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,12:0,7:0,0,13,7
chr6	116443214	.	C	CCATCAGCTGTAGGGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=249,227;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:116443214_C_CCATCAGCTGTAGGGAA:116443214:0,2,1,1
chr6	116443217	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=249,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:116443214_C_CCATCAGCTGTAGGGAA:116443214:0,2,0,1
chr6	116575413	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	116599665	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=145,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,20:0.448:45:12,9:12,11:15,10,10,10
chr6	116601285	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:0,7,0,5
chr6	116720487	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.454:18:4,2:5,6:3,7,2,6
chr6	116754456	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr6	116782488	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,6,4
chr6	116836720	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=138,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.695:21:4,8:2,6:5,1,11,4
chr6	116837242	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	116875520	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=244,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:116875520_T_C:116875520:0,1,0,1
chr6	116875522	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=244,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:116875520_T_C:116875520:0,1,0,1
chr6	116878947	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=122,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.426:24:6,3:7,7:10,4,10,0
chr6	116901640	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=235,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	116911413	.	CT	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.195:39:14,4:16,3:30,2,4,3
chr6	116912033	.	CT	C,CTT	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=171,159,148;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=11.95,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,8,3:0.286,0.132:27:8,4,2:6,3,1:15,1,10,1
chr6	116914112	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:2,3:2,1:4,1,4,1
chr6	116957044	.	T	TCATACTGCTAGAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=160,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0,8,1,1
chr6	116982067	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=204,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.371:14:5,3:2,2:0,9,0,5
chr6	117047837	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=171,287;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:0,21,0,2
chr6	117073874	.	AATAT	A,AATATAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32,16;MFRL=0,151,138;MMQ=60,60,53;MPOS=27,33;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,12;RU=AT;STR;TLOD=7.34,9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.377,0.503:5:0,1,0:0,1,1:0,0,0,5
chr6	117083132	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=116,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.449:27:7,8:8,4:6,9,10,2
chr6	117113761	.	A	AGG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=137,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:2,5:4,3:0|1:117113761_A_AGG:117113761:1,5,3,5
chr6	117113762	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.529:15:2,4:3,3:0|1:117113761_A_AGG:117113761:2,5,3,5
chr6	117113765	.	T	TTCC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=156,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.499:14:2,4:5,3:0|1:117113761_A_AGG:117113761:2,5,3,4
chr6	117150008	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=126,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.501:18:5,3:4,6:7,2,3,6
chr6	117198347	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	117198858	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,188;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr6	117215300	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:0,7,0,7
chr6	117243399	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	117250194	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr6	117250225	.	C	CACACATAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=170,115;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:117250225_C_CACACATAG:117250225:0,4,0,1
chr6	117250227	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=170,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:117250225_C_CACACATAG:117250225:0,4,0,1
chr6	117622175	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:0|1:117622175_T_C:117622175:10,6,1,1
chr6	117622183	.	G	GCCCCGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:4,2:0|1:117622175_T_C:117622175:9,4,1,1
chr6	117639262	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	117678083	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,10:0,0,3,16
chr6	117681436	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=AC;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr6	117686192	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:1,4:5,9:6,0,11,2
chr6	117686943	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:4,0:1,6,0,2
chr6	117715369	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=185,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:2,1,2,1
chr6	117715761	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr6	117724462	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=115,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr6	117724499	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	117725383	.	C	CAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=167,128;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	117725578	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=112,126;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.567:21:5,6:4,6:2,7,7,5
chr6	117730673	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:4,1,4,0
chr6	117735716	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:1,3:0,0:1,3,1,3
chr6	117746919	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=250,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr6	117860058	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=120,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.691:14:2,3:2,7:1,3,0,10
chr6	117862048	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:5,8:3,4:4,4,6,6
chr6	117865827	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:2,1:0,3:0,2,0,5
chr6	117996818	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr6	118475798	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=109,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:6,2:8,3:3,11,2,3
chr6	118556628	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:8,1,10,0
chr6	118635122	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr6	118801174	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,6:5,2:0,12,0,8
chr6	118886615	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,4:3,0:6,0,4,0
chr6	118974042	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	119233019	.	A	AAAGACTGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=220,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	119287903	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,2:2,0,4,0
chr6	119288087	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=150,67;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:22,0:8,3:8,22,1,2
chr6	119296378	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	119327632	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,6:0,12:0,0,9,9
chr6	119344020	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	119346010	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,3,3
chr6	119399333	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=152,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:5,4,4,2
chr6	119501397	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	119509785	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr6	119510739	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr6	119510777	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=52.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr6	119522353	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:5,0,6,0
chr6	119522553	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:1,6,0,4
chr6	119611934	.	G	GA	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:5,7:4,5:0,11,0,16
chr6	119611989	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr6	119623079	.	AT	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr6	119623358	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr6	119627976	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr6	119628029	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=92.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,14:0,12:0,0,20,6
chr6	119628198	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr6	119628215	.	A	ATTTATGAAACTTCGCTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr6	121436422	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,6:0,5:0,0,2,10
chr6	121482295	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	121491472	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	121560155	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr6	121577525	.	G	GAAGATAAAATTTCAGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=258,212;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	121625669	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.117:40:13,2:23,2:25,11,3,1
chr6	121626079	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=98.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,16:0,10:0,0,0,26
chr6	121632008	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,5,11
chr6	122733496	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:16,0:8,3:25,0,3,0
chr6	122753413	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=186,362;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:0,13,0,2
chr6	122753464	.	T	TCCAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	122767817	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	122772921	.	A	AATATAT,AATATATAT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=154,138,164;MMQ=60,40,40;MPOS=17,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,12,13;RU=AT;STR;TLOD=5.42,20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,9:0.177,0.444:20:2,1,2:6,2,6:0,8,0,12
chr6	122775195	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.445:27:5,3:8,7:15,0,12,0
chr6	123022496	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	123038887	.	CT	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	123039171	.	TGGA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.686:1:0,1:0,0:0|1:123039171_TGGA_T:123039171:0,0,0,1
chr6	123039176	.	AG	CT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123039171_TGGA_T:123039171:0,0,0,1
chr6	123039180	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:123039171_TGGA_T:123039171:0,0,0,1
chr6	123101348	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	123122385	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=215,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:0,2:6,1:7,0,3,0
chr6	123318646	.	A	AGT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.481:2:1,1:0,0:0|1:123318646_A_AGT:123318646:0,1,0,1
chr6	123318648	.	C	CTTAAAGATGGCGACCCTGGAGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0|1:123318646_A_AGT:123318646:0,1,0,1
chr6	123319382	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	123369910	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr6	123539684	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=240,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr6	123580675	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,24:0.591:40:4,11:12,10:14,2,24,0
chr6	123581789	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,2:4,2:11,1,0,4
chr6	123590959	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.092:30:15,1:13,1:23,5,2,0
chr6	123591138	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,6:1,3:0,4,0,9
chr6	123592184	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=TG;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,2:1,0,4,0
chr6	123594510	.	T	TA	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=127,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=68.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,29:0.539:54:16,10:8,18:8,17,8,21
chr6	123595869	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=87.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,28:0.510:55:12,15:14,13:1,26,5,23
chr6	123658671	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,6:6,4:8,0,10,0
chr6	123703168	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=92.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,34:0.515:66:13,16:17,16:30,2,30,4
chr6	123714656	.	GC	TT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=151,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:3,2:4,2:8,0,5,0
chr6	123759967	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=228,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:4,0,6,0
chr6	123819847	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=256,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr6	123833457	.	G	C	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,42:0.443:95:24,20:29,22:23,30,20,22
chr6	123851538	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:10,0,8,0
chr6	123851590	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,11:0.320:35:9,4:14,6:0|1:123851590_G_A:123851590:22,2,10,1
chr6	123851610	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=148,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,17:0.367:47:12,7:15,10:0|1:123851590_G_A:123851590:25,5,13,4
chr6	123869769	.	TAA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=68,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=38.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.846:14:2,5:0,5:1,1,0,12
chr6	123892337	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	124979232	.	ACC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=118,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:124979232_ACC_A:124979232:1,0,1,0
chr6	124979235	.	C	CAAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=118,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:124979232_ACC_A:124979232:1,0,1,0
chr6	124979689	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,9:0,6:0,0,0,15
chr6	125139473	.	TG	GC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:0,3:4,4:4,0,6,1
chr6	125569405	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:2,3:5,8:6,2,9,2
chr6	125614022	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:6,0:6,4:5,7,0,4
chr6	126075709	.	AT	A,ATT	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=30,32,31;MFRL=118,133,144;MMQ=60,60,60;MPOS=15,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=8.82,4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,7,4:0.236,0.154:29:6,2,2:9,4,2:2,16,0,11
chr6	126196119	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,101;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:15,1:19,1:11,25,1,1
chr6	126242004	.	CG	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr6	126248757	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:17,2:11,0:0|1:126248757_C_A:126248757:23,9,2,0
chr6	126248766	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:20,2:15,0:0|1:126248757_C_A:126248757:25,13,2,0
chr6	126249755	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.405:12:1,2:5,1:7,0,5,0
chr6	126669479	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=170,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr6	127469852	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,70;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:7,0:12,4:7,12,1,3
chr6	127471533	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	127647822	.	T	TAACAGAAAAAC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=226,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.386:3:1,1:1,0:0|1:127647822_T_TAACAGAAAAAC:127647822:0,2,0,1
chr6	127647827	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=226,188;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:127647822_T_TAACAGAAAAAC:127647822:0,2,0,1
chr6	127647830	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=226,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:127647822_T_TAACAGAAAAAC:127647822:0,2,0,1
chr6	127768935	.	A	ATGGTCTCCAACTCCATCCAGGTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=186,112;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.314:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr6	127768950	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	127770923	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr6	127836627	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,14;MFRL=0,195;MMQ=60,47;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:127836627_A_C:127836627:0,1,1,0
chr6	127836634	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,13;MFRL=0,195;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:127836627_A_C:127836627:0,1,1,0
chr6	127836641	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,18;MFRL=142,195;MMQ=60,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:0|1:127836627_A_C:127836627:3,1,1,0
chr6	128176383	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:128176383_A_G:128176383:0,0,0,5
chr6	128176387	.	A	ACATGGACACAGGGAGGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:128176383_A_G:128176383:0,4,0,1
chr6	128297883	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=120,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:9,2:7,8,1,1
chr6	128297986	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr6	128302180	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	128307118	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr6	128319895	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:1,3,5,0
chr6	128324241	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	128330249	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,17,7
chr6	128383562	.	G	GA	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,23:0.436:53:8,10:19,11:21,9,17,6
chr6	128386054	.	A	AATTGCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=197,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	129370975	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr6	129380843	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:2,1:0,2:0|1:129380843_C_CG:129380843:2,0,5,0
chr6	129380844	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.668:7:2,2:0,3:0|1:129380843_C_CG:129380843:2,0,5,0
chr6	129465020	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,1:0,9:0,0,7,3
chr6	129468288	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	129486913	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	129571330	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,1:7,4:4,8,1,4
chr6	129619048	.	G	GCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=129,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:129619048_G_GCA:129619048:0,4,0,1
chr6	129619052	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=129,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:129619048_G_GCA:129619048:0,4,0,1
chr6	129649350	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr6	129724942	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:0|1:129724942_T_A:129724942:5,2,4,0
chr6	129724944	.	CT	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.387:11:3,3:3,1:0|1:129724942_T_A:129724942:5,2,4,0
chr6	129777382	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=208,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr6	129785391	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:6,0,5,0
chr6	129835814	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr6	129837320	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:7,8:1,4:7,1,10,2
chr6	129937431	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=135,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,2:12,0:6,19,1,1
chr6	129950417	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=209,148;MMQ=60,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:3,0:0,0:4,0,1,0
chr6	129955151	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:2,3:6,3:8,1,7,3
chr6	130164764	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=95.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,11:0,17:0,0,1,27
chr6	130164856	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	130370404	.	C	CCT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=117,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=73.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.919:20:0,13:1,5:1,0,13,6
chr6	130371055	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0|1:130371055_C_T:130371055:0,0,0,5
chr6	130371063	.	A	AGTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:130371055_C_T:130371055:0,3,0,1
chr6	130374102	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=135.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,15:0,25:0,0,2,41
chr6	130389464	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=135,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,5:0.080:72:36,5:30,0:44,23,3,2
chr6	130466413	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,9,1
chr6	130476095	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=125,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.118:36:12,2:20,1:17,15,0,4
chr6	130505374	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,5:6,3:0,13,0,8
chr6	130535420	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.579:19:4,6:3,5:7,1,11,0
chr6	130536494	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.592:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr6	130761733	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:21,1:17,1:11,27,0,2
chr6	131186578	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr6	131191509	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=115,56;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:12,2:17,0:0|1:131191509_C_T:131191509:13,16,2,0
chr6	131191510	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=107,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:30,2:0.088:32:13,1:16,1:1|0:131191509_C_T:131191509:15,15,0,2
chr6	131197990	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr6	131211616	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.910:8:0,1:0,2:0,0,0,8
chr6	131481394	.	CA	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=98.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,12:0,0,0,27
chr6	131490472	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr6	131540726	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:6,3:10,2:16,0,5,0
chr6	131900144	.	GC	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=135,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,4:2,2:4,0,7,0
chr6	131904704	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=201,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:0,6,1,7
chr6	131904719	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=212,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,3:3,4:0,6,2,5
chr6	131910827	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=186,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr6	131923421	.	CT	TC	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=150,61;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.064:44:21,0:21,2:20,22,2,0
chr6	131923428	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=148,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:20,0:21,1:22,20,0,2
chr6	131923464	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:14,1:14,1:12,17,1,1
chr6	131948469	.	GA	G,GAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35,30;MFRL=179,163,158;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=4.51,3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,3:0.286,0.234:14:3,2,1:2,2,2:5,2,7,0
chr6	131948816	.	TA	T,TAA	.	.	DP=122;ECNT=1;MBQ=31,31,31;MFRL=111,141,123;MMQ=60,60,60;MPOS=24,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=18.77,11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:42,19,15:0.219,0.182:76:16,8,6:21,9,6:2,40,3,31
chr6	131958485	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:9,11:6,7:14,1,17,1
chr6	131995209	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	132041605	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	132043349	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr6	132172467	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,37;MFRL=192,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr6	132172495	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:132172495_G_A:132172495:0,1,0,1
chr6	132172498	.	A	AATTAAGAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:132172495_G_A:132172495:0,1,0,1
chr6	132182633	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:132182633_TC_T:132182633:2,0,2,0
chr6	132182635	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:132182633_TC_T:132182633:2,0,2,0
chr6	132190717	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=196,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:18,2:4,1:0,23,0,3
chr6	132211745	.	G	GCATTTAAACAAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.674:1:0,1:0,0:0|1:132211745_G_GCATTTAAACAAGA:132211745:0,0,0,1
chr6	132211747	.	CGA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132211745_G_GCATTTAAACAAGA:132211745:0,0,0,1
chr6	132211751	.	C	CCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132211745_G_GCATTTAAACAAGA:132211745:0,0,0,1
chr6	132270728	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=138,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.725:4:0,1:0,1:0,1,2,1
chr6	132271740	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,1:4,5:0,6,1,5
chr6	132785071	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,0:12,2:20,4,2,0
chr6	132785224	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:8,6:8,4:3,13,0,10
chr6	132860522	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	132860543	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	132860550	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:132860550_A_T:132860550:0,2,0,1
chr6	132860552	.	GCAA	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:132860550_A_T:132860550:0,2,0,1
chr6	132860558	.	A	ATCC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=214,172;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:132860550_A_T:132860550:0,1,0,1
chr6	132910612	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.975:36:0,11:0,25:0,0,10,26
chr6	132967076	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,158;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,5:0.133:43:22,5:15,0:20,18,0,5
chr6	133013618	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=136,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.246:6:3,1:2,0:0|1:133013618_G_C:133013618:1,4,0,1
chr6	133013620	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=136,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0|1:133013618_G_C:133013618:1,4,0,1
chr6	133013622	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=136,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0|1:133013618_G_C:133013618:1,4,0,1
chr6	133032759	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	133032797	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=173,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:6,0,4,1
chr6	133048213	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,0,13
chr6	133049865	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=192,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:7,1,8,0
chr6	133055392	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:10,6:8,3:11,7,6,3
chr6	133055610	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.949:17:0,11:0,4:0|1:133055610_G_T:133055610:0,0,6,11
chr6	133055612	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.353:18:10,2:1,4:0|1:133055610_G_T:133055610:6,6,1,5
chr6	133073845	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:12,0:17,2:4,26,0,2
chr6	133076896	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:2,4:7,2:9,0,7,0
chr6	133105117	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=128,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,3:0.065:59:31,2:24,1:30,26,3,0
chr6	133108763	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=173,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:1,1:2,1:0,5,0,2
chr6	133135807	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	133136041	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=158.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,22:0,19:0,0,36,7
chr6	133138010	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	133138067	.	ATT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,5:0,6:0,1,9,2
chr6	133138249	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=94.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,0,25
chr6	133138749	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr6	133827148	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr6	133827354	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,4:3,6:1,3,1,9
chr6	133849789	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=133,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.354:18:5,3:5,3:10,2,4,2
chr6	133849966	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:4,8:7,7:5,7,2,13
chr6	134350088	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=165,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:0|1:134350088_G_T:134350088:15,7,1,1
chr6	134350089	.	T	TTA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=165,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:0|1:134350088_G_T:134350088:15,7,1,1
chr6	134494548	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=69.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,15:0,6:0,0,10,11
chr6	134494707	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=145,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.104:27:6,0:13,1:0|1:134494707_AG_A:134494707:6,19,0,2
chr6	134494708	.	GAA	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=17,19;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:2,0:2,1:3,12,0,3
chr6	134494709	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=145,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.106:27:8,0:16,0:0|1:134494707_AG_A:134494707:6,19,0,2
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chr6	135260303	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=193,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,1:2,2:5,0,4,0
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chr6	135286505	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr6	135290355	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=53.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:15,4:9,14:18,6,16,2
chr6	135299959	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:1,3:9,3:0,10,1,5
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chr6	135324051	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:0|1:135324051_T_C:135324051:0,7,0,6
chr6	135324052	.	TTTAAA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:0|1:135324051_T_C:135324051:0,7,0,6
chr6	135371813	.	C	T	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:87,9:0.102:96:40,5:46,4:32,55,1,8
chr6	135517047	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:15,1:11,1:8,18,1,1
chr6	135749682	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,3:5,3:7,1,6,0
chr6	135763866	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=122.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.977:38:0,21:0,17:0,0,12,26
chr6	135768162	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.163:28:10,1:9,0:0|1:135768162_T_G:135768162:11,13,4,0
chr6	135768164	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,18;MFRL=124,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.158:29:8,0:7,0:0|1:135768162_T_G:135768162:12,13,4,0
chr6	135768171	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,16;MFRL=123,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.133:25:10,0:8,0:10,12,3,0
chr6	135778856	.	A	AT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:12,0:5,2:0|1:135778856_A_AT:135778856:1,18,0,2
chr6	135778858	.	GC	TA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:4,2:0|1:135778856_A_AT:135778856:1,19,0,2
chr6	135778860	.	ATG	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:12,0:6,2:0|1:135778856_A_AT:135778856:1,18,0,2
chr6	135813251	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=66.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,16:0,5:0,0,17,4
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chr6	136582194	.	T	TAA,TAAA	.	.	DP=222;ECNT=3;MBQ=29,24,28;MFRL=135,146,135;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.59,70.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:163,6,34:0.033,0.174:203:71,2,15:76,2,9:76,87,21,19
chr6	136582203	.	T	C	.	.	DP=228;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=134.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:177,41:0.191:218:86,23:88,16:80,97,22,19
chr6	136589448	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=137,63;MMQ=60,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.201:33:18,2:8,4:7,20,2,4
chr6	136590698	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=142,135;MMQ=60,45;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,14:0.187:78:39,3:22,11:0|1:136590698_C_T:136590698:29,35,3,11
chr6	136590712	.	C	T	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=142,140;MMQ=60,39;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,11:0.150:78:38,3:23,8:0|1:136590698_C_T:136590698:29,38,2,9
chr6	136593183	.	G	C	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=149,1172;MMQ=60,29;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:85,5:0.065:90:40,1:45,4:23,62,1,4
chr6	136594292	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=128,626;MMQ=60,59;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,14:0.214:68:27,8:27,6:23,31,7,7
chr6	136594327	.	TGTTGA	T	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=149,2488;MMQ=60,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,4:0.091:53:21,2:26,2:0|1:136594327_TGTTGA_T:136594327:12,37,4,0
chr6	136594335	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=150,2488;MMQ=60,56;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.102:47:18,2:24,2:0|1:136594327_TGTTGA_T:136594327:9,34,4,0
chr6	136594337	.	G	C	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=150,2488;MMQ=60,56;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,4:0.104:46:17,2:24,1:0|1:136594327_TGTTGA_T:136594327:9,33,4,0
chr6	136597004	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=193,146;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,1:4,5:11,0,6,0
chr6	136599949	.	A	AAATCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=247,233;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:136599949_A_AAATCCC:136599949:0,1,0,1
chr6	136599952	.	G	GAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=247,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:0|1:136599949_A_AAATCCC:136599949:0,1,0,1
chr6	136683566	.	T	TG	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=51.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.619:29:3,11:6,6:7,4,13,5
chr6	136710669	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=123,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,0:2,2,1,1
chr6	136710692	.	ATC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,1,0
chr6	136904858	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=119,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,3:0.072:53:32,0:17,3:16,34,0,3
chr6	136963562	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=205,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,3:6,4:9,0,7,0
chr6	137026266	.	T	G	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=124,141;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=122.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,41:0.495:83:27,17:14,24:18,24,22,19
chr6	137147650	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:10,1:3,12,0,2
chr6	137166682	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=93.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,11:0,17:0,0,25,3
chr6	137193496	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=161,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:3,3:0,2:0,4,0,5
chr6	137295051	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:6,3,0,2
chr6	137325847	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,7:0,16:0,0,8,15
chr6	137325901	.	TAAA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.837:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	137330719	.	C	CGCCAAGCATCATG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=173,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:137330719_C_CGCCAAGCATCATG:137330719:0,1,0,1
chr6	137330721	.	A	ATC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=173,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:137330719_C_CGCCAAGCATCATG:137330719:0,1,0,1
chr6	137338276	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr6	137477823	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:6,1,4,0
chr6	137482982	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:3,2:2,2:0,5,0,5
chr6	137519546	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:16,8,1,1
chr6	137519780	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=215,100;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr6	137524870	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:0,0:0,3,0,2
chr6	137540335	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,5:5,1:7,0,6,0
chr6	137540370	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=65.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,7:0,0,14,4
chr6	137540520	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,9:0,10:0|1:137540520_A_G:137540520:0,0,3,16
chr6	137540536	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.530:15:2,2:5,6:0|1:137540520_A_G:137540520:0,7,0,8
chr6	137814705	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=208,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,2:1,0:2,1,1,1
chr6	137815375	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,1:4,1:1,3,1,1
chr6	138195961	.	TCTC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=71,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=79.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.951:22:0,11:1,9:1,0,15,6
chr6	138197331	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=105.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,13:0,17:0,0,5,25
chr6	138200243	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=142,44;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:14,0:9,2:0|1:138200243_G_T:138200243:11,12,1,1
chr6	138200249	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=149,44;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:0|1:138200243_G_T:138200243:11,11,1,1
chr6	138200253	.	T	TCCA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=149,44;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:0|1:138200243_G_T:138200243:11,11,1,1
chr6	138202339	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,0:6,1:0|1:138202339_T_G:138202339:0,13,4,0
chr6	138202345	.	C	CGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.261:17:6,0:6,0:0|1:138202339_T_G:138202339:0,13,4,0
chr6	138417415	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,2:4,7:10,0,9,0
chr6	138607244	.	G	GGAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	138620000	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=106,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	138628598	.	TAAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=151,71;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=A;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr6	138632506	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,4:4,4:5,2,6,2
chr6	138632518	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,4:5,6:6,2,8,2
chr6	138745981	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=97,85;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.387:3:0,1:2,0:0|1:138745981_G_GT:138745981:0,2,0,1
chr6	138745985	.	A	ATTTCTGTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=97,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:138745981_G_GT:138745981:0,2,0,1
chr6	138751547	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=125,91;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:15,0:9,14,0,2
chr6	138751629	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,1:3,6:7,1,2,5
chr6	138752421	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=100,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,1:3,1:2,4,2,0
chr6	138752428	.	C	CTGCTTGCCTTAGAACATAGCCATTAATG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=164,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.421:5:0,2:2,0:0,3,1,1
chr6	138820271	.	G	GAC	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=156,86;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=AC;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.141:18:13,2:2,0:16,0,1,1
chr6	138820289	.	CACACACAG	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACACACAG;STR;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.241:30:14,6:4,1:15,8,7,0
chr6	138820324	.	A	G	.	.	DP=72;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=113,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=107.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,39:0.560:69:17,17:13,16:15,15,20,19
chr6	139097174	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:6,2:7,1,2,1
chr6	139134558	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	139134565	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:139134565_A_AGT:139134565:0,1,0,1
chr6	139134566	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=142,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:139134565_A_AGT:139134565:0,1,0,1
chr6	139167579	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=169,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	139170331	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:13,0,2,0
chr6	139186081	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr6	139229743	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,15,0
chr6	139233946	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.389:29:9,6:8,5:10,8,3,8
chr6	139355580	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,138;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,4:3,4:2,4,2,6
chr6	139355740	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=74,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.769:8:1,4:1,2:1,1,2,4
chr6	139487394	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=117.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,19:0,15:0,0,28,6
chr6	139565799	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.068:42:17,1:23,1:11,29,0,2
chr6	139591505	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=206,229;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr6	139598061	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,0:1,3:1,3,0,4
chr6	142487263	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=65.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,18,0
chr6	142487469	.	C	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=163.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,27:0,24:0,0,10,41
chr6	142491463	.	C	CG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=49.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,9:0,0,10,6
chr6	142491584	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr6	142510676	.	GTATT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TATT;STR;TLOD=75.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,7:0,0,0,17
chr6	142725171	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=15,33;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:142725171_A_C:142725171:0,1,0,1
chr6	142725174	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:142725171_A_C:142725171:0,1,0,1
chr6	142725175	.	C	CATTTTGTTAATTGTTTTCTGGTTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=20,36;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:142725171_A_C:142725171:0,1,0,1
chr6	143074440	.	G	GAATGCACAGTGGTGTGGTGAAGGGAGAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.117:25:8,2:13,0:8,15,0,2
chr6	143081715	.	C	CACCACCA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:14,0:8,16,0,2
chr6	143081847	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	143090633	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=191,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:5,0,6,0
chr6	143093815	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,4:4,6:5,5,6,4
chr6	143654625	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=225,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr6	143784031	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=44.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.545:33:5,12:10,6:14,1,17,1
chr6	143789181	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=154,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:2,1,4,0
chr6	143806276	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:7,10:3,3:7,4,9,5
chr6	143825449	.	C	CTCCACTCCACTTCATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=201,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	144081609	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.444:36:8,8:12,7:7,13,7,9
chr6	144081753	.	AG	CC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=139,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,0:11,0:6,11,0,2
chr6	144081768	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=136,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,3:4,4:2,6,1,6
chr6	144086394	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=73,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,3,1
chr6	144093352	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:5,3,5,1
chr6	144104469	.	A	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,39:0.955:40:0,23:1,15:0,1,8,31
chr6	144128095	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,27,33;MFRL=160,189,166;MMQ=60,60,60;MPOS=0,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=4.96,7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,3,5:0.167,0.234:20:5,3,2:7,0,3:12,0,8,0
chr6	144128176	.	AT	A	.	.	DP=100;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=144,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,4:0.060:79:46,1:26,3:43,32,3,1
chr6	144165809	.	CT	C,CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,32,19;MFRL=134,155,189;MMQ=60,60,60;MPOS=17,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=15.59,3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,2:0.540,0.196:12:1,1,0:1,4,0:0,3,1,8
chr6	144178419	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:7,5:6,5:10,3,7,4
chr6	144178656	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,255;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,1:8,1:0,13,0,2
chr6	144207366	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,17;MFRL=192,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0,4,0,1
chr6	144509510	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,22:0.390:57:16,13:19,9:17,18,13,9
chr6	144512671	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.840:23:2,7:1,10:0,3,5,15
chr6	144758647	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr6	144814625	.	GTC	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TC;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:8,1:3,2:5,10,0,3
chr6	144835040	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:8,3:8,7:11,5,6,4
chr6	144843091	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=200,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.612:9:1,4:2,2:3,0,5,1
chr6	144854295	.	G	GGGAGCT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:18,2:17,0:17,19,0,2
chr6	144872051	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr6	144872272	.	G	GAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=176,141;MMQ=60,42;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=AC;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.482:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr6	145069287	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	145079197	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,2:1,7:0,4,0,9
chr6	145095502	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=125,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:145095502_T_A:145095502:8,12,0,2
chr6	145095505	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:7,2:0|1:145095502_T_A:145095502:8,11,0,2
chr6	145095545	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.511:6:3,1:0,2:1,2,1,2
chr6	145114935	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=106,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,6:4,2:3,2,7,1
chr6	145120682	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:3,9:6,7:2,7,4,12
chr6	145148690	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,12:0,6:0,0,17,1
chr6	145157497	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,2:10,0:17,7,2,0
chr6	145162001	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr6	145946913	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.317:17:5,2:6,3:3,9,0,5
chr6	146007166	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=192,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr6	146007223	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,4:4,2:4,2,5,1
chr6	146125466	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr6	146127029	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,6:3,4:5,5,4,6
chr6	146207465	.	A	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=64.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,25:0.530:47:7,14:15,11:20,2,23,2
chr6	146207502	.	G	GT	.	.	DP=75;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=81.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,33:0.498:67:16,13:18,18:20,14,24,9
chr6	146207657	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=161,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:5,2:8,7:1,12,1,8
chr6	146216184	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=262,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr6	146243581	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=220,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.486:6:3,1:0,1:0,3,0,3
chr6	146244743	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:3,4:7,7:9,1,9,2
chr6	146256315	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,19;MFRL=117,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:4,0:6,0:6,10,0,3
chr6	146262697	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=106,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:0,1:1,2:1,0,4,0
chr6	146268623	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.457:24:6,7:7,3:11,2,7,4
chr6	146273403	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,3:6,0:0|1:146273403_C_T:146273403:14,0,3,0
chr6	146273406	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.208:17:7,3:5,0:0|1:146273403_C_T:146273403:14,0,3,0
chr6	146480813	.	A	AAGTCTTTGATGCCAGGG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	146719883	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:6,3:0,0:5,1,3,0
chr6	146720157	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=116,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.390:41:14,4:10,10:14,11,7,9
chr6	146975456	.	TTA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TA;STR;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.905:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	146987930	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=198,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,2:2,6:3,0,7,1
chr6	146993306	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.241:19:6,1:8,3:14,1,4,0
chr6	147006845	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=90,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,8:4,2:5,2,7,3
chr6	147012191	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr6	147022227	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,7:5,5:1,9,2,10
chr6	147036626	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=154,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,1,4
chr6	147037984	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr6	147042695	.	A	AGGGAACATGCAATAATAAGATTTTTAGAGGC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=156,145;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:4,2:0,0:0,4,0,4
chr6	147042728	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=172,217;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:147042728_C_A:147042728:0,4,0,1
chr6	147042733	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=172,217;MMQ=60,30;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:147042728_C_A:147042728:0,4,0,1
chr6	147047341	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=124,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:8,4:3,10:7,4,8,6
chr6	147049641	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=200,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr6	147049899	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:0,1,2,8
chr6	147054241	.	A	ATTAATGTAC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=57.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.564:28:6,7:6,7:12,0,12,4
chr6	147054410	.	T	TA	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.590:20:6,8:2,4:0,8,1,11
chr6	147054450	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:4,1:0,3:0,5,0,4
chr6	147062220	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,5:1,4:2,1,7,2
chr6	147073639	.	TATA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,3:4,6:9,1,6,3
chr6	147073713	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,0:8,2:4,17,1,1
chr6	147103358	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=136,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=61.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.907:19:1,7:0,11:0,1,2,16
chr6	147103416	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	147103427	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:2,1:1,0:0|1:147103427_C_T:147103427:0,3,0,1
chr6	147103428	.	T	TGCATTTTTTTAAA	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:2,1:0,0:0|1:147103427_C_T:147103427:0,3,0,1
chr6	147128553	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,135;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=112.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,43:0.538:80:19,20:17,23:17,20,17,26
chr6	147136073	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,158;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:4,3:4,6:8,0,9,0
chr6	147635311	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.466:17:6,5:3,2:9,0,7,1
chr6	147635318	.	TAC	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,6:7,2:8,2,7,1
chr6	147637282	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,122;MMQ=60,30;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr6	147660433	.	G	C	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=95.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,31:0.443:70:17,18:22,12:21,18,10,21
chr6	148835416	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.787:7:0,2:1,3:0,1,5,1
chr6	148835436	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.229:20:8,1:7,3:8,8,3,1
chr6	148835594	.	TAAAAAAAAAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=31,30;MFRL=119,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=28,17;RU=A;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1,2,0,1
chr6	148835611	.	A	ACG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=205,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:148835611_A_ACG:148835611:1,2,0,1
chr6	148835616	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=205,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:148835611_A_ACG:148835611:1,2,0,1
chr6	148835618	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,27;MFRL=180,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:148835611_A_ACG:148835611:1,3,0,1
chr6	148835622	.	AGG	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,23;MFRL=205,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:148835611_A_ACG:148835611:0,3,0,1
chr6	148835628	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=205,119;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:148835611_A_ACG:148835611:0,3,0,1
chr6	148835642	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,35;MFRL=205,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	149274907	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=170,138;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.523:6:2,0:1,2:3,0,2,1
chr6	149275131	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.551:16:3,4:4,4:1,6,0,9
chr6	149285719	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,0:5,5:1,8,1,4
chr6	149285768	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=248,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:149285768_T_C:149285768:0,1,0,1
chr6	149285774	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:149285768_T_C:149285768:0,0,0,1
chr6	149340342	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,1:11,1:12,9,2,0
chr6	149340390	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,1,14
chr6	149718650	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr6	149722236	.	T	C	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,115;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,3:0.060:65:26,0:32,3:0|1:149722236_T_C:149722236:46,16,0,3
chr6	149722244	.	C	CCTTTCCATTCTTATTTTTACGGTATTTTATT	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=33,38;MFRL=150,115;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,3:0.055:70:32,0:32,3:0|1:149722236_T_C:149722236:46,21,0,3
chr6	149780695	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=96.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,22,5
chr6	149780737	.	G	GACTA	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTA;STR;TLOD=103.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.966:24:0,12:0,6:0,0,11,13
chr6	149782908	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr6	149795342	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,1:3,11:6,2,9,3
chr6	149846372	.	TA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.168:29:8,2:9,2:3,21,1,4
chr6	149856910	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=184,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.264:6:3,1:2,0:0|1:149856910_T_G:149856910:0,5,0,1
chr6	149856914	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=184,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.243:6:2,1:2,0:0|1:149856910_T_G:149856910:1,4,0,1
chr6	149856917	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=184,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.243:6:2,1:3,0:0|1:149856910_T_G:149856910:1,4,0,1
chr6	149893556	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=163,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:6,5,1,1
chr6	149901947	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=246,264;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.398:3:0,0:1,1:0|1:149901947_G_A:149901947:0,2,0,1
chr6	149901951	.	AATG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=246,264;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:149901947_G_A:149901947:0,2,0,1
chr6	149953835	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=200,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr6	149983083	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:12,1:22,1:19,15,1,1
chr6	150052698	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,122;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,1:0,4:2,0,3,2
chr6	150123540	.	C	CTTCTTCTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:2,10,0,2
chr6	150174278	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:6,7:11,8:2,15,2,13
chr6	150209805	.	TAAA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,10;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:1,0:0,0:0|1:150209805_TAAA_T:150209805:1,2,0,1
chr6	150209821	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr6	150209828	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:150209805_TAAA_T:150209805:1,3,0,1
chr6	150211123	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=119,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:9,8:5,10:6,9,7,11
chr6	150263186	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr6	150341990	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=59.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,9:0,4:0|1:150341990_A_G:150341990:0,0,13,1
chr6	150341993	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0|1:150341990_A_G:150341990:0,0,13,1
chr6	150342396	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	150386860	.	T	TATTTTCTTCCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=233,215;MMQ=57,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:150386860_T_TATTTTCTTCCC:150386860:0,2,0,1
chr6	150386861	.	G	GTTCAAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=233,215;MMQ=57,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:150386860_T_TATTTTCTTCCC:150386860:0,2,0,1
chr6	150386880	.	T	TCCCTTAACGCCTCATGAATTCACACTGAAGTGAAGA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	150387302	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr6	150387312	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr6	150387371	.	G	GAAAAAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150387371_G_GAAAAAA:150387371:0,0,0,1
chr6	150387372	.	G	GGAGGAT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:150387371_G_GAAAAAA:150387371:0,0,0,1
chr6	150390213	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:1,2:4,1:1,4,0,3
chr6	150569938	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=144,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,1:8,2:8,10,0,3
chr6	151054844	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=131,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:10,1:7,1:8,11,2,0
chr6	151125710	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=135,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.269:13:4,2:5,1:9,1,3,0
chr6	151125724	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.441:17:4,4:3,3:9,1,6,1
chr6	151125896	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:6,6:7,3:0,13,1,8
chr6	151130691	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,7:0,1:0,0,7,3
chr6	151130920	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:151130920_A_G:151130920:0,0,3,6
chr6	151130929	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=111,92;MMQ=60,43;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:0|1:151130920_A_G:151130920:1,5,1,1
chr6	151130944	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=128,92;MMQ=60,26;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:151130920_A_G:151130920:0,4,0,1
chr6	151130946	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=128,92;MMQ=60,26;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:151130920_A_G:151130920:0,4,0,1
chr6	151142261	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=91.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,16:0,10:0,0,24,2
chr6	151152656	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,10:0,0,10,4
chr6	151199071	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr6	151247439	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr6	151258127	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:0,5,1,4
chr6	151259770	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.306:24:14,1:3,6:12,5,6,1
chr6	151260002	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=206,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:0,3,0,4
chr6	151266504	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,12:0,6:0,0,18,0
chr6	151266564	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=135,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,18:0.312:59:24,11:16,7:28,13,13,5
chr6	151281567	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=88.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,12:0,14:0,0,9,17
chr6	151286224	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,2,12
chr6	151331085	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=137,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:10,12,1,1
chr6	151358011	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,14:0,4:0,0,16,2
chr6	151358299	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,14:0,8:0,0,2,23
chr6	151358325	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,2,15
chr6	151362895	.	CTTG	C	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=244,146;MMQ=48,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=207.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,48:0.962:49:0,27:1,19:1,0,23,25
chr6	151362942	.	T	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=205.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,31:0,23:0,0,29,25
chr6	151627096	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	151627133	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	151627134	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=154,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:151627134_TG_T:151627134:0,1,0,1
chr6	151627137	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:151627134_TG_T:151627134:0,0,0,1
chr6	151674116	.	T	TGAG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=61.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,7:0,0,11,4
chr6	151694560	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:14,3,2,0
chr6	151742541	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=143.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,23:0,21:0,0,0,45
chr6	151775782	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:75,3:0.050:78:34,0:39,3:18,57,0,3
chr6	151857370	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr6	151857594	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=121,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,1:7,3:7,5,2,2
chr6	151859382	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,0:10,2:8,13,0,3
chr6	151869645	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:3,6:10,9:4,9,3,12
chr6	151894278	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,10,4
chr6	151894340	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=125,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,4:6,7:5,6,4,7
chr6	151894716	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=170,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:2,1:2,2:0,5,0,3
chr6	151914421	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.428:7:3,1:1,1:0,4,0,3
chr6	151917660	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:4,2,5,4
chr6	151917781	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.454:16:4,0:3,7:0,9,0,7
chr6	151939350	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:0,5,1,2
chr6	152201875	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,13,5
chr6	152202007	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	152265282	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,4:2,1:8,0,6,0
chr6	152265352	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.418:26:11,6:4,3:13,2,9,2
chr6	152382087	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,3:3,2:3,0,5,1
chr6	152382311	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=160,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	152382325	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr6	152415676	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=184,112;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:1,8,0,2
chr6	152420171	.	C	CTGTAGTTTCTTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=223,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	152446316	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0|1:152446316_C_T:152446316:1,0,5,0
chr6	152446320	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0|1:152446316_C_T:152446316:1,0,5,0
chr6	152461048	.	CTGTT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=107,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,2:6,1:0|1:152461048_CTGTT_C:152461048:4,3,3,0
chr6	152461061	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=119,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:0|1:152461048_CTGTT_C:152461048:3,3,3,1
chr6	152476952	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=60.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,12:0,5:0,0,17,0
chr6	152522926	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:9,1,8,0
chr6	152523143	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr6	152534946	.	TT	AA,AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29,29;MFRL=0,160,87;MMQ=60,60,60;MPOS=8,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.46,5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.504,0.376:5:0,1,0:0,2,2:0,0,0,5
chr6	152539572	.	TAA	T,TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,33,30;MFRL=154,206,163;MMQ=60,60,60;MPOS=24,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.16,9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,5:0.174,0.385:13:5,0,3:0,2,1:0,6,0,7
chr6	152558111	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=198,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr6	152560916	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0|1:152560916_G_A:152560916:0,0,1,6
chr6	152560926	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:152560916_G_A:152560916:0,4,0,1
chr6	152570415	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,2,15
chr6	152570488	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:152570488_G_T:152570488:0,0,0,1
chr6	152570491	.	GC	TG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:152570488_G_T:152570488:0,0,0,1
chr6	152577752	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=120,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,2:6,4:8,1,3,3
chr6	152603139	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	152629586	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=121,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.414:27:10,9:6,2:14,2,11,0
chr6	152629617	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=117,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,12:0.371:33:11,8:10,4:15,6,10,2
chr6	152629772	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=10,17;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:0,0:0,0:0,1,0,3
chr6	152646993	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr6	152650928	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=147,95;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:10,0:6,4:8,9,0,4
chr6	152660310	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=176,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:5,0,5,0
chr6	152671475	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,37;MFRL=121,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,1:3,4:2,3,1,4
chr6	152671919	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:1,2:5,1:1,5,0,6
chr6	152671975	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=209,282;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr6	152673147	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:3,6:8,4:9,3,8,2
chr6	152673519	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:5,1:2,1:0,7,0,3
chr6	152674583	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,2,0
chr6	152683413	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=122,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:9,10:7,3:6,10,7,6
chr6	152688567	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	152690559	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:4,0,5,0
chr6	152697706	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	152698116	.	C	CTAAAAAAAACTACTAAAGAAAGAAAGAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	152711395	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=135,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,4:6,6:12,1,8,2
chr6	152717896	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=126,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:4,3:10,5:10,4,7,1
chr6	152721029	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=223,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr6	152722228	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=145,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:4,3,5,0
chr6	152722561	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:1,0:0,1:0|1:152722561_A_G:152722561:0,1,0,1
chr6	152722564	.	G	GTTTTTATGTGACTTTCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:152722561_A_G:152722561:0,1,0,1
chr6	152730216	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,83;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:17,3:8,0:13,12,3,0
chr6	152730679	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=192,93;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,4:7,0:9,2,4,0
chr6	152748654	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	152751398	.	C	CA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:9,2:8,0:0,17,0,3
chr6	152751426	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:0,5,0,8
chr6	152772203	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,45;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:9,1:10,10,1,1
chr6	152772410	.	GC	TT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0,3,0,1
chr6	153043418	.	C	CCTCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	153296772	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=186,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr6	153332926	.	AATAAT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:4,7:3,3:0,7,0,10
chr6	153345309	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=197,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	153345647	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,3:5,5:1,9,2,6
chr6	154412004	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	154414375	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr6	154414563	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0|1:154414563_A_G:154414563:0,0,3,12
chr6	154414573	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,3:0|1:154414563_A_G:154414563:0,0,1,10
chr6	154429085	.	AT	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=132.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.980:43:0,28:0,15:0,0,42,1
chr6	154431393	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	154535444	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:9,11:6,9:2,13,0,20
chr6	154542491	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,0:4,3:1,6,0,3
chr6	154567666	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=191,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr6	154727825	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,14:0,4:0,0,7,11
chr6	154735973	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr6	154736017	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,14;MFRL=209,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:3,0:0,0:0,3,0,1
chr6	154736022	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=219,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:154736022_G_A:154736022:0,3,0,1
chr6	154736024	.	C	A,G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32,30;MFRL=216,135,219;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:2,1,0:0,0,1:0,2,0,2
chr6	154736027	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=219,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:154736022_G_A:154736022:0,3,0,1
chr6	154749225	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=136,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=83.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.934:28:0,13:1,14:0,1,19,8
chr6	154751585	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:6,0:7,2:14,0,2,0
chr6	154762376	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=A;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	154762394	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=15,25;MFRL=84,110;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.762:8:0,1:0,4:1,1,6,0
chr6	154763165	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:2,2,1,1
chr6	155109168	.	GT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.194:19:6,1:8,2:1,15,0,3
chr6	155116285	.	TTC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,2:5,5:2,8,0,7
chr6	155124583	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,2:6,0,6,0
chr6	155129784	.	CCTTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:5,3:8,1,4,2
chr6	155148325	.	T	TGG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,18;MFRL=120,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.127:29:8,1:13,0:6,19,4,0
chr6	155152311	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr6	155451529	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:9,2:11,2:10,11,3,1
chr6	155470190	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	155485535	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	155485554	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr6	155565744	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr6	155566904	.	T	TTAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=194,174;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:2,1:0,6,0,2
chr6	155571113	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,4,12
chr6	155572986	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	155574207	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr6	155575538	.	TC	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.371:28:8,5:7,6:8,9,5,6
chr6	155577913	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:1,6:4,4:2,3,3,7
chr6	155578324	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=A;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr6	155579246	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,1:4,1:0,7,1,3
chr6	155581619	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	155596901	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,10:0,0,8,9
chr6	155597134	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=130,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:5,6:5,2:5,5,7,2
chr6	155597686	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	155618095	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,92;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,2:9,0:13,2,2,0
chr6	155635585	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=100.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,12:0,17:0,0,7,23
chr6	155635624	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr6	155635637	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr6	155750035	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.966:25:0,14:0,11:0|1:155750035_C_T:155750035:0,0,10,15
chr6	155750038	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.548:24:4,8:5,5:0|1:155750035_C_T:155750035:4,7,6,7
chr6	155750135	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,2:16,0:12,14,2,0
chr6	155750219	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr6	157100396	.	GCGC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CGC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	157150547	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:19,2:15,0:6,28,1,1
chr6	157222728	.	T	TATC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:157222728_T_TATC:157222728:0,2,0,1
chr6	157222731	.	CTGT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:157222728_T_TATC:157222728:0,2,0,1
chr6	157405761	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	157405930	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,17:0,14:0,0,12,20
chr6	157495951	.	ATT	A,AT	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=31,34,31;MFRL=162,174,142;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.11,7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:22,3,7:0.079,0.232:32:11,3,5:9,0,2:17,5,7,3
chr6	157496153	.	G	GT	.	.	DP=129;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:95,5:0.051:100:61,2:33,3:41,54,1,4
chr6	157744588	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:8,7:5,8:1,15,0,15
chr6	158013897	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.411:22:6,5:6,2:8,5,2,7
chr6	158014255	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr6	158049351	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.276:13:5,1:5,1:9,1,3,0
chr6	158049365	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=18,10;MFRL=145,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.255:15:2,0:1,0:9,2,4,0
chr6	158068481	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr6	158074504	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	158288505	.	A	AACTGT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTGT;STR;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:7,6:6,0:11,2,7,0
chr6	158322886	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,4:2,0:6,0,4,1
chr6	158327269	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:2,4:8,9:2,8,1,12
chr6	158331150	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=204,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr6	158358654	.	GAAAC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=171,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr6	158359813	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=80,108;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.496:18:2,4:7,4:0|1:158359813_GA_G:158359813:4,5,1,8
chr6	158359817	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,24;MFRL=80,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.495:18:2,4:7,4:0|1:158359813_GA_G:158359813:4,5,1,8
chr6	158361823	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr6	158361899	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=105,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:7,3,1,2
chr6	158475941	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=97,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:2,2,3,1
chr6	158485668	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=133,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:15,2:8,0:15,8,1,1
chr6	158487406	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:5,0,2,1
chr6	158489778	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=116,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.464:24:9,4:2,6:6,7,0,11
chr6	158489863	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=237,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	158490779	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,2:5,1:0,5,0,3
chr6	158492545	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,6,1
chr6	158502137	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=183,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,4:4,2:7,2,5,1
chr6	158502590	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,7:0,0,3,15
chr6	158504981	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=140,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:5,0,4,2
chr6	158507981	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	158508001	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	158514223	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=164,151;MMQ=60,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:158514223_A_T:158514223:0,2,0,1
chr6	158514230	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=164,151;MMQ=60,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:158514223_A_T:158514223:0,2,0,1
chr6	158514234	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=164,151;MMQ=60,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:158514223_A_T:158514223:0,2,0,1
chr6	158535720	.	T	TTATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA;STR;TLOD=77.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,4:0,0,10,8
chr6	158567716	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:158567716_A_G:158567716:1,0,1,0
chr6	158567722	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:158567716_A_G:158567716:1,0,1,0
chr6	158567732	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,14;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:158567716_A_G:158567716:1,0,1,0
chr6	158567734	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=14,28;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:158567716_A_G:158567716:1,0,1,0
chr6	158571655	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr6	158571706	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	158735087	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0|1:158735087_C_T:158735087:0,0,10,5
chr6	158735090	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,5:0|1:158735087_C_T:158735087:0,0,10,5
chr6	158925311	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	158994577	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=97.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,15:0,13:0,0,7,22
chr6	159029342	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:8,7:6,7:11,3,10,4
chr6	159046076	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,29;MFRL=90,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,4:6,3:6,2,6,1
chr6	159050889	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=189,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:1,1:3,1:0,5,0,2
chr6	159129476	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=107,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,6:0,4:1,3,0,10
chr6	159146690	.	CTTTTTTTG	C	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTTTTG;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.216:32:10,4:12,3:5,20,1,6
chr6	159184508	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=148,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:14,2:12,1:11,15,1,2
chr6	159188128	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,4:4,4:2,5,1,7
chr6	159190800	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,2:4,4:8,3,6,0
chr6	159192214	.	T	TGG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,652158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:5,0,1,1
chr6	159204786	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr6	159206424	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=151,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:11,0:15,3:19,7,1,2
chr6	159291343	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:11,0:17,3:8,21,0,3
chr6	159316430	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr6	159404932	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=214,136;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:159404932_G_A:159404932:0,1,0,1
chr6	159404936	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=214,136;MMQ=60,56;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:159404932_G_A:159404932:0,1,0,1
chr6	159404938	.	GGT	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:159404932_G_A:159404932:0,0,0,1
chr6	159407451	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,258;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:12,0:16,2:5,25,0,2
chr6	159464757	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=173,72;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.139:19:10,0:5,1:1,16,1,1
chr6	159590543	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	159636082	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=168,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:9,1:13,1:9,14,1,1
chr6	159653544	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,160;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:0,7,0,7
chr6	159654231	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,0:9,2:7,5,0,2
chr6	159655593	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	159657195	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	159659523	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	159659753	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0,3,0,1
chr6	159660779	.	GCCACCACCCGCCGCACGA	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCACCACCCGCCGCACGA;STR;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.893:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr6	159660879	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr6	159667972	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=124,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:5,5:6,0:3,9,2,3
chr6	159670276	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	159670303	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr6	159677498	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr6	159682206	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,10,4
chr6	159692321	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,13,1
chr6	159692559	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	160103470	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:12,1,2,0
chr6	160106088	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.665:19:4,9:2,3:0,6,1,12
chr6	160106125	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:2,2:2,1:0,5,0,3
chr6	160114360	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=159,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,0:0,2:0,1,0,3
chr6	160157277	.	CT	C,CTT	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=32,31,33;MFRL=127,53,81;MMQ=60,60,60;MPOS=14,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=3.32,5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:72,4,8:0.054,0.085:84:40,1,4:30,3,1:51,21,9,3
chr6	160163087	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.427:38:12,12:9,4:20,2,15,1
chr6	160163213	.	A	C	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=135,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,25:0.482:52:12,19:13,6:8,19,3,22
chr6	160174456	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.393:23:8,3:6,5:8,6,8,1
chr6	160189746	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	160199687	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.465:26:7,9:7,3:7,7,9,3
chr6	160201160	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr6	160201444	.	T	TA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=62.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,22:0.600:36:7,9:7,11:13,1,19,3
chr6	160201677	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr6	160202167	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:0,2,0,7
chr6	160206362	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=169,127;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,2:8,0:13,0,2,0
chr6	160207049	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:2,6,1,6
chr6	160208735	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:12,7:9,9:15,6,13,3
chr6	160211554	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=137,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,6:7,2:12,1,7,1
chr6	160211591	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:13,1:13,1:16,11,0,2
chr6	160211636	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=117,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,9:0.232:41:15,4:17,5:13,19,5,4
chr6	160211645	.	GGTT	G	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=115,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,9:0.244:39:15,4:14,5:11,19,5,4
chr6	160211728	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:0,8,0,7
chr6	160218605	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=182,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:0,3,0,4
chr6	160219035	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:1,4:3,4:4,0,9,0
chr6	160219169	.	T	TC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,125;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:9,0:11,2:3,17,0,2
chr6	160221279	.	GCGTGGGCAGCA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CGTGGGCAGCA;STR;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:1,1:7,4:9,0,5,0
chr6	160221475	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=120,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,3:1,6:0,1,1,8
chr6	160221690	.	GCTT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,3:2,0,5,0
chr6	160225205	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=205,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:6,1:2,1:0|1:160225205_G_A:160225205:0,8,0,2
chr6	160225209	.	TG	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=209,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:2,1:0|1:160225205_G_A:160225205:0,7,0,2
chr6	160225559	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=73.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,14:0,7:0,0,12,9
chr6	160229889	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,5:7,9:5,8,3,11
chr6	160232921	.	GTTTTGT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr6	160236976	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:3,0,3,0
chr6	160237489	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	160237662	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=14,20,19;MFRL=157,117,155;MMQ=35,60,57;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,16;RU=T;STR;TLOD=11.11,7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,7,4:0.520,0.364:12:0,1,0:0,3,1:0,1,1,10
chr6	160328892	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,115;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:7,0:12,4:9,11,4,0
chr6	160453561	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,16,2
chr6	160461793	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:5,3:0,2:1,4,0,5
chr6	160465456	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=189,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,6:7,4:9,0,10,0
chr6	160465486	.	TTGTC	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=177,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:8,5:4,8:13,0,13,0
chr6	160465753	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	160468383	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=197,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr6	160471451	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:7,1,2,0
chr6	160479030	.	T	C	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=133,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.094:50:23,0:23,4:29,17,2,2
chr6	160479882	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr6	160481537	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=104,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:2,4:5,3:5,2,7,0
chr6	160483636	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=130,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:28,2:11,2:11,29,2,2
chr6	160484487	.	G	GCATTAAGATTTTTTTCC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=154,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:10,0:16,2:13,14,1,1
chr6	160489215	.	CAG	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:3,5:7,2:9,1,6,2
chr6	160505252	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:2,5:4,3:0,6,0,8
chr6	160523640	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,129;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:17,1:27,2:20,24,2,1
chr6	160543316	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=194,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.495:4:0,2:2,0:0|1:160543316_C_CT:160543316:0,2,1,1
chr6	160543317	.	C	CCAT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=194,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:160543316_C_CT:160543316:0,2,1,1
chr6	160543318	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=194,58;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:160543316_C_CT:160543316:0,2,1,1
chr6	160543322	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=165,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:160543316_C_CT:160543316:0,3,1,1
chr6	160543325	.	C	CACCCCTGGCCG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=165,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,0:0|1:160543316_C_CT:160543316:0,3,1,1
chr6	160553496	.	G	GTTATAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160553496_G_GTTATAT:160553496:0,0,0,1
chr6	160553500	.	AGG	TTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160553496_G_GTTATAT:160553496:0,0,0,1
chr6	160553506	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:160553496_G_GTTATAT:160553496:0,0,0,1
chr6	160560824	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:2,4,3,2
chr6	160560845	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=179,104;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:3,2,1,2
chr6	160560897	.	CTGGTAAGT	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGTAAGT;STR;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:2,2:1,4,2,4
chr6	160575985	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=141,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:5,5:1,7,3,4
chr6	160663230	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	160666660	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,0:0,6:0,0,0,7
chr6	160670494	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0,0,0,13
chr6	160671500	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	160671793	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr6	160677614	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr6	160769423	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=155,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	160868687	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=183,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr6	160868701	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=184,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:5,0,8,0
chr6	160872151	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,2:1,2:0,1,0,5
chr6	160966408	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=131,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.433:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	160966409	.	C	CA,T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32,28;MFRL=0,262,237;MMQ=60,60,60;MPOS=16,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.06,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.306,0.373:4:0,0,1:1,1,1:1,0,3,0
chr6	161021998	.	GA	CG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=141,165;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,1:8,1:0|1:161021998_GA_CG:161021998:11,9,1,1
chr6	161022003	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=143,165;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,1:9,1:0|1:161021998_GA_CG:161021998:11,10,1,1
chr6	161128922	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=185,187;MMQ=58,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:3,4:9,4:0,12,1,7
chr6	161137663	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=118,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,5:4,6:7,1,6,5
chr6	161137779	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=166,116;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:2,8:2,3:1,3,4,7
chr6	161139480	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,5:3,8:1,9,2,11
chr6	161139502	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,4:2,5:1,6,0,9
chr6	161143376	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:5,1,4,0
chr6	161143608	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,22:0.461:48:13,11:12,10:4,22,7,15
chr6	161152294	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr6	161160083	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr6	161413211	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	161502094	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=106,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.742:25:4,15:2,4:4,2,3,16
chr6	161509003	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:1,6,0,3
chr6	161519350	.	CCTG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CTG;STR;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.901:6:0,1:0,4:0,0,3,3
chr6	161531006	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:0,5:5,3:0,5,0,8
chr6	161532855	.	CT	C	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.497:38:10,7:9,11:12,7,9,10
chr6	161557703	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	161557729	.	C	CCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,34;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:161557729_C_CCT:161557729:0,2,0,1
chr6	161557730	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:161557729_C_CCT:161557729:0,2,0,1
chr6	161557731	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:161557729_C_CCT:161557729:0,2,0,1
chr6	161575165	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=203,70;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr6	161771030	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=137,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:161771030_G_A:161771030:1,0,0,1
chr6	161771036	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=137,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:161771030_G_A:161771030:1,0,0,1
chr6	161990339	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:5,1:1,1:4,2,3,0
chr6	161990483	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr6	161990516	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	162475215	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:7,4:3,3:2,8,1,6
chr6	162622304	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr6	162683845	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=131,95;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.506:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	162683874	.	T	TAGAGTAAATATCTTATTCAGAACACCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=190,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	162683876	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	162864317	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=177,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:2,1,6,0
chr6	163836376	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:1,2:2,2:1,2,0,5
chr6	163899794	.	CT	C	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.208:26:6,2:11,2:17,4,4,1
chr6	163899807	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=25,10;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.191:33:10,0:4,0:16,10,7,0
chr6	163899809	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.108:35:11,0:9,0:21,10,4,0
chr6	163956225	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:22,0:12,2:0,34,0,2
chr6	165693624	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:2,4,1,2
chr6	165715006	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=96,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr6	165723166	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr6	165746424	.	T	TGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,248;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:165746424_T_TGGG:165746424:0,0,1,0
chr6	165746429	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,248;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:165746424_T_TGGG:165746424:0,0,1,0
chr6	165746446	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=120,248;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:3,0,1,0
chr6	165806114	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,4:0,13:0,0,12,5
chr6	165808605	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,18,1
chr6	165809963	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:0,2:5,5:0,5,1,6
chr6	165826899	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=A;STR;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr6	165827194	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=78.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,14:0,9:0,0,6,17
chr6	165845027	.	AATATACTATATATC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:5,6:6,8:0,12,0,14
chr6	165846658	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=112,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:8,7:5,9:4,9,4,12
chr6	165863695	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=60.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,9:0,0,15,4
chr6	165989776	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,10,0
chr6	166075362	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,3:0,0,9,0
chr6	166572045	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=149,67;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:2,1,1,2
chr6	166574246	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr6	166574308	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=96,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.563:32:4,11:9,7:9,5,11,7
chr6	166578025	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=90,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:7,5:0,3:6,1,6,2
chr6	166736235	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	166736362	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,25:0.473:53:11,17:17,8:11,17,11,14
chr6	166737980	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=132.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.976:38:0,22:0,16:0,0,31,7
chr6	166741921	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	166743760	.	G	C	.	.	DP=99;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=325.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,93:0.990:93:0,43:0,49:0,0,24,69
chr6	166780478	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=154,922;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr6	166796433	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=99,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.515:4:2,2:0,0:1,1,0,2
chr6	166827436	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=88,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:1,4,1,3
chr6	166831694	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:4,7:2,3:5,3,9,1
chr6	166836981	.	G	GACCTGCTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=220,116;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	166862136	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr6	167357368	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,175;MMQ=51,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:5,0:0,14,0,2
chr6	167447489	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.377:14:5,1:3,4:2,7,2,3
chr6	167453519	.	A	AT,ATT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31,32;MFRL=158,173,149;MMQ=60,60,60;MPOS=16,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=T;STR;TLOD=16.20,7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,8,5:0.528,0.306:15:0,3,2:2,5,3:0,2,0,13
chr6	167570528	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.609:18:4,7:2,4:2,5,4,7
chr6	167590454	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=144,128;MMQ=52,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.447:36:13,10:7,6:16,4,16,0
chr6	167592464	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr6	167592656	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	167594182	.	A	C,T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33,32;MFRL=0,100,167;MMQ=60,27,27;MPOS=22,27;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=24.44,3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,9,2:0.724,0.211:11:0,7,0:0,2,2:0,0,10,1
chr6	167594216	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=124,143;MMQ=27,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:6,15:9,5:7,8,10,10
chr6	167704944	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,6:4,3:4,1,7,2
chr6	167728719	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,230;MMQ=55,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:11,2:6,0:13,5,2,0
chr6	167752312	.	G	GTTCCTTCC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=TTCC;STR;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.858:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr6	167772755	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,3:0,9:0,0,10,2
chr6	167789404	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	167789590	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=117,168;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.830:10:1,5:0,2:0,1,1,8
chr6	167789622	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=180,189;MMQ=21,39;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr6	167789633	.	A	AGCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=170,189;MMQ=24,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:167789633_A_AGCT:167789633:0,4,0,1
chr6	167789634	.	A	ACTTGGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=170,189;MMQ=24,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:167789633_A_AGCT:167789633:0,4,0,1
chr6	167796182	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	167796415	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr6	168191841	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=245,96;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:168191841_AT_A:168191841:0,1,0,1
chr6	168191845	.	AC	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=245,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:168191841_AT_A:168191841:0,1,0,1
chr6	168191852	.	CC	TT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=245,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:168191841_AT_A:168191841:0,1,0,1
chr6	168272817	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=168,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr6	168297684	.	G	GTACTTTGTTTTGTCATTGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.299:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr6	168298875	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=128,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:5,1:13,11:11,7,5,7
chr6	168316118	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,0:0,4:0,1,1,5
chr6	168317994	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=191,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:1,3,1,6
chr6	168323664	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,1:4,4:4,5,2,3
chr6	168348504	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:2,1:2,1,3,0
chr6	168349254	.	T	TAAAAGAAAAAAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	168363207	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=121,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.068:55:22,0:30,3:20,32,1,2
chr6	168370691	.	G	GATACTGAATAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	168440639	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	168440746	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:2,0:4,3,0,2
chr6	168466504	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr6	168475822	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=182,173;MMQ=60,58;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr6	168479790	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	168708045	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=207,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:4,2:1,2:6,0,4,0
chr6	168708751	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,4,8
chr6	168711107	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=124,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,18:0.432:42:12,9:11,9:12,12,10,8
chr6	168711170	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,6:0,0,2,16
chr6	168928251	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr6	169008813	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=33,19;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.175:28:7,1:9,0:0|1:169008813_C_G:169008813:8,15,5,0
chr6	169008818	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,10;MFRL=128,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.152:32:8,0:11,0:0|1:169008813_C_G:169008813:9,18,5,0
chr6	169008821	.	TT	GA	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=130,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.185:33:9,0:12,0:0|1:169008813_C_G:169008813:8,19,6,0
chr6	169617776	.	CAGGAGGTG	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:0,4:4,3:5,0,7,0
chr6	169617889	.	G	A	.	.	DP=80;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=98.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,37:0.499:74:22,16:14,20:21,16,23,14
chr6	169617934	.	GA	G	.	.	DP=92;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=99,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=167.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,71:0.949:74:0,37:2,30:1,2,47,24
chr6	169620247	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr6	169628169	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=190,95;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:1,1:2,1,2,1
chr6	169629783	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.595:10:1,5:2,1:1,3,2,4
chr6	169634809	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=108,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:7,7:3,6:7,3,10,3
chr6	169635010	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=225,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:3,3:0,6,0,3
chr6	169635020	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=213,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:2,6,0,4
chr6	169646211	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr6	169646409	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,2:0,4:0,3,0,6
chr6	169857761	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=94,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:1,5,0,6
chr6	169982927	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.596:22:5,7:2,6:6,3,12,1
chr6	170049421	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr6	170065759	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=200,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,1,1
chr6	170068025	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,35;MFRL=118,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:0,1:2,1:2,1,2,0
chr6	170068058	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:0,1:3,2:3,1,3,0
chr6	170068086	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:2,5:4,1,5,2
chr6	170102513	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=222,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr6	170106419	.	CTT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=70.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,20:0.600:33:5,8:7,11:5,8,7,13
chr6	170118085	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=133.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,12:0,25:0,0,0,37
chr6	170144228	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=195,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:2,3,3,2
chr6	170155331	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:3,4:9,6:11,1,8,2
chr6	170159023	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,15,0
chr6	170162515	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:10,3:5,7:10,7,5,5
chr6	170162537	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=126,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:5,11:6,7:5,6,9,9
chr6	170169819	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,4:3,5:0,7,3,6
chr6	170176407	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=194,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:7,0,5,1
chr6	170176787	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=105,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:2,1:5,3:3,4,1,4
chr6	170176847	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=135,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr6	170179377	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=130,40;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:170179377_T_C:170179377:6,16,1,1
chr6	170179385	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,0:10,2:0|1:170179377_T_C:170179377:6,15,1,1
chr6	170179388	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:170179377_T_C:170179377:4,15,1,1
chr6	170179390	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=134,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:170179377_T_C:170179377:4,15,1,1
chr6	170181516	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.545:39:6,9:9,12:11,7,14,7
chr6	170592109	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.497:28:5,7:9,6:7,7,7,7
chr6	170592293	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=180,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,0:0,2:1,0,2,1
chr6	170594819	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0,0,1,10
chr6	170595430	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=76.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,6:0,15:0,0,2,19
chr6	170597276	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=179,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.661:13:1,1:3,6:3,1,7,2
chr6	170627651	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=16,29;MFRL=185,141;MMQ=38,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=133.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,52:0.963:54:0,19:0,20:1,1,27,25
chr6	170852784	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:15,0:16,3:15,17,0,3
chr6	170855176	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr6	170855352	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	170858045	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=50.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr6	170871037	.	GCAA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=157,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.420:12:3,3:4,2:4,3,2,3
chr6	170880684	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=168,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.408:5:0,1:3,0:0,3,0,2
chr6	170881389	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34,24;MFRL=161,147,143;MMQ=60,60,60;MPOS=24,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.35,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,3:0.208,0.205:15:1,2,0:7,1,2:1,8,1,5
chr6	170886898	.	T	TATAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.681:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	170892100	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,3:0,0,8,1
chr6	170892848	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,9:0,0,3,11
chr6	170892919	.	T	TACTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	197535	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr7	538130	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=149,81;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr7	538277	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=140,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,2:3,4:0|1:538277_G_C:538277:2,7,0,6
chr7	538284	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:5,2:2,4:0|1:538277_G_C:538277:1,7,0,6
chr7	538348	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=70,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr7	540741	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.546:16:3,3:4,4:7,0,9,0
chr7	589969	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,13;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:4,0:0|1:589969_G_C:589969:4,1,2,0
chr7	589974	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:1,0:0|1:589969_G_C:589969:4,1,2,0
chr7	589976	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=14,13;MFRL=174,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,0:1,0:0|1:589969_G_C:589969:4,1,2,0
chr7	591125	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,3:7,3:1,10,0,6
chr7	618855	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,7,2
chr7	618869	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,5,4
chr7	619064	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:619064_G_T:619064:0,0,0,1
chr7	619067	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:619064_G_T:619064:0,0,0,1
chr7	619072	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:619064_G_T:619064:0,0,0,1
chr7	619074	.	AA	CT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:619064_G_T:619064:0,0,0,1
chr7	751220	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=218,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr7	780980	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr7	794471	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=55.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,5,12
chr7	803342	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	803652	.	C	CGGGAAACAGCAGTGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=231,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:803652_C_CGGGAAACAGCAGTGAT:803652:0,1,0,1
chr7	803654	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=231,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:803652_C_CGGGAAACAGCAGTGAT:803652:0,1,0,1
chr7	808899	.	C	CAGGTCCAGAAATGTTGT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=157,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	813618	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr7	813650	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,14,3
chr7	813867	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr7	814612	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=64.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,10:0,0,11,8
chr7	825114	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,6:0,0,17,0
chr7	888238	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=218,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.405:10:2,3:4,0:0,6,0,4
chr7	890978	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:5,6:1,0:4,2,5,1
chr7	891184	.	C	CGAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:0,7,0,6
chr7	912755	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=198,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr7	939007	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:4,2:5,1:7,4,3,0
chr7	940113	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.747:2:0,1:0,0:0|1:940113_A_C:940113:0,0,2,0
chr7	940120	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,35;MFRL=158,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.593:3:0,1:1,0:0|1:940113_A_C:940113:1,0,2,0
chr7	940125	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=182,267;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:940113_A_C:940113:2,0,1,0
chr7	940128	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,0;MFRL=173,267;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:940113_A_C:940113:3,0,1,0
chr7	940129	.	C	CCCCCGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,0;MFRL=173,267;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:940113_A_C:940113:3,0,1,0
chr7	940258	.	G	GGGCAAAGGCA	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,19:0.475:40:11,8:7,8:0|1:940258_G_GGGCAAAGGCA:940258:16,5,11,8
chr7	940267	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=68.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,19:0.455:42:12,10:9,9:0|1:940258_G_GGGCAAAGGCA:940258:17,6,9,10
chr7	940298	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.471:32:11,10:6,5:8,9,2,13
chr7	940501	.	AGAAGGGCC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAGGGCC;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr7	940724	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr7	943699	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:3,0:3,3:7,0,2,1
chr7	943711	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=126,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,3:0,7:1,0,8,2
chr7	943998	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr7	944683	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=10,20;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.795:6:0,2:0,3:1,0,4,1
chr7	960450	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=105,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:6,1:5,6:7,4,3,4
chr7	974905	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,250;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:4,2,2,0
chr7	1015021	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.410:25:6,4:8,6:15,0,10,0
chr7	1024581	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=63,76;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr7	1024908	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=138,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:7,8,0,2
chr7	1037382	.	GC	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,0:3,5:3,5,3,2
chr7	1037467	.	C	CAGGTAACG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=187,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.256:9:3,2:4,0:4,3,1,1
chr7	1131356	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,24:0.525:46:11,11:9,13:14,8,14,10
chr7	1132237	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=113,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:5,6,1,1
chr7	1192831	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=94,79;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:12,0:16,3:17,11,0,3
chr7	1272683	.	G	GAGGCACAGCTCAAACAGTAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157552087;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	1474287	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.565:23:6,6:3,7:5,5,8,5
chr7	1513420	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1513420_A_C:1513420:0,0,0,1
chr7	1513422	.	G	GT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1513420_A_C:1513420:0,0,0,1
chr7	1513426	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1513420_A_C:1513420:0,0,0,1
chr7	1513429	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1513420_A_C:1513420:0,0,0,1
chr7	1517931	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,5:4,2:4,1,7,0
chr7	1519892	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=140,203;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	1519946	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:3,2:1,3:3,1,5,1
chr7	1522157	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr7	1522175	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	1522211	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=168,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:11,6,2,0
chr7	1523559	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr7	1526181	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=149,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr7	1527511	.	GC	TT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,0:3,4:6,0,1,3
chr7	1527687	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,1,3
chr7	1528947	.	T	TCCCGGGCCCGCCGAGGGGACGTGCGCACTCACTTCAGGCCCTGCTCCCAGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,1:0,0,12,1
chr7	1529201	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,4:4,1:8,0,5,0
chr7	1532631	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,6:3,3:7,3,9,0
chr7	1533556	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=153,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,16:0.382:43:7,7:7,9:0|1:1533556_T_C:1533556:7,20,5,11
chr7	1533566	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=57.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,16:0.396:41:12,8:9,8:0|1:1533556_T_C:1533556:5,20,4,12
chr7	1533610	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=158,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:4,3:4,4:0,8,0,8
chr7	1534579	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,17;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1534579_C_G:1534579:0,0,0,1
chr7	1534584	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1534579_C_G:1534579:0,0,0,1
chr7	1534593	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1534579_C_G:1534579:0,0,0,1
chr7	1535051	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,0:3,3:5,1,2,1
chr7	1538539	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,1,3
chr7	1538614	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=168,269;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr7	1538778	.	T	TCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=162,82;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:1538778_T_TCC:1538778:0,1,0,1
chr7	1538780	.	T	TCCTCTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=162,82;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:1538778_T_TCC:1538778:0,1,0,1
chr7	1538877	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=191,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:0,2:1,1:2,0,1,2
chr7	1539799	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=131,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,3:0,4:3,1,7,0
chr7	1543476	.	T	TCCCCAAAGAC	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=126,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCCCAAAGAC;STR;TLOD=49.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.549:23:5,2:1,6:0,10,0,13
chr7	1586653	.	A	AGCC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GCC;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0|1:1586653_A_AGCC:1586653:2,0,4,0
chr7	1586662	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0|1:1586653_A_AGCC:1586653:2,0,4,0
chr7	1588391	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr7	1589417	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:4,2,3,3
chr7	1590368	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	1590376	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr7	1590443	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=93,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:1,2,4,1
chr7	1733360	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=195,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1733360_C_T:1733360:2,2,1,0
chr7	1733364	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=195,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:1733360_C_T:1733360:2,2,1,0
chr7	1787003	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:2,3:2,3:3,1,7,0
chr7	1787236	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=132,179;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,0:1,2:2,4,2,0
chr7	1787519	.	TAA	T,TA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31,32;MFRL=158,123,132;MMQ=60,60,60;MPOS=14,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=9.91,8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,6:0.318,0.327:19:5,4,3:0,2,2:5,2,11,1
chr7	1886805	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	1976556	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:2,6,2,4
chr7	2041638	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr7	2119380	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.436:23:9,8:4,1:7,6,3,7
chr7	2188684	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	2258899	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	2260482	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=102,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:1,1,3,0
chr7	2260499	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=102,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,3:0,2:2,2,5,0
chr7	2264983	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr7	2269552	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	2290372	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=179,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.658:4:1,2:0,0:1,0,2,1
chr7	2290385	.	GC	AT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,30;MFRL=80,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:2290385_GC_AT:2290385:2,1,1,0
chr7	2290388	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=20,29;MFRL=80,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:2290385_GC_AT:2290385:2,1,1,0
chr7	2290433	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:6,3:0,0:5,2,3,0
chr7	2290601	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:2,2:4,2:4,2,2,3
chr7	2296493	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,0:0,9:0,0,6,5
chr7	2296696	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=209,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,0:1,3:0,1,1,3
chr7	2349608	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	2400306	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:2,1:4,2:5,1,4,0
chr7	2402821	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=178,162;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:2402821_G_C:2402821:0,4,0,1
chr7	2402826	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=178,162;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:2402821_G_C:2402821:0,4,0,1
chr7	2402831	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,28;MFRL=178,162;MMQ=60,57;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:2402821_G_C:2402821:0,4,0,1
chr7	2402834	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=178,162;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:2402821_G_C:2402821:0,4,0,1
chr7	2405885	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr7	2409035	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,12,1
chr7	2412493	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr7	2414142	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr7	2474220	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2474220_A_T:2474220:0,0,0,1
chr7	2474222	.	AA	CC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:2474220_A_T:2474220:0,0,0,1
chr7	2552986	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:6,2:1,6:2,6,0,8
chr7	2565268	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=134,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,0:6,5:4,6,4,1
chr7	2583622	.	G	GTTGCAGTGAGCTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=91,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	2621567	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=174,213;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:2,0:11,4:13,0,5,0
chr7	2621641	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=142,49;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.087:53:16,4:33,0:38,11,1,3
chr7	2622101	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=125,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,5,0
chr7	2625838	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:1,0,5,1
chr7	2626038	.	CCAGGGAATGG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAGGGAATGG;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.511:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr7	2699556	.	CACCCCGGG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=155,115;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:1,0,0,1
chr7	2699687	.	C	CG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=58.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,5:0,0,6,12
chr7	2771430	.	AAC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=32,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:2771430_AAC_A:2771430:3,1,0,1
chr7	2771434	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=32,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:2771430_AAC_A:2771430:3,1,0,1
chr7	2773035	.	C	CAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.622:16:4,5:2,5:5,1,10,0
chr7	2802173	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,2:6,3:15,0,5,0
chr7	2954801	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	2956880	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,2:4,0:3,1,2,0
chr7	2958987	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:8,2,2,0
chr7	2962459	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	2962753	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,5,3
chr7	2966334	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:3,2:8,4:10,1,4,2
chr7	2966445	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.631:22:5,7:2,6:4,4,5,9
chr7	2968195	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=232,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr7	2968361	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr7	2969795	.	AAG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=142,261;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:1,2,0,1
chr7	2969806	.	TGGG	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=15,17;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=G;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,0:0|1:2969806_TGGG_T:2969806:1,2,0,1
chr7	2969810	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:2969806_TGGG_T:2969806:1,2,0,1
chr7	2978507	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=101,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,0:0,1:1,0,0,2
chr7	2985361	.	GAC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AC;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	3179968	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0|1:3179968_T_G:3179968:0,0,1,10
chr7	3179973	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.923:10:0,3:0,7:0|1:3179968_T_G:3179968:0,0,1,9
chr7	3179991	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr7	3180657	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=70.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,16:0,5:0,0,8,13
chr7	3188513	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	3188549	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	3188576	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr7	3188712	.	A	C	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=207.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,62:0.985:62:0,15:0,43:0,0,32,30
chr7	3188738	.	G	C	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=146.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.981:47:0,16:0,30:0,0,9,38
chr7	4002204	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr7	4026944	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,5:0,13:0,0,5,13
chr7	4050731	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=132,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,1:2,1,2,3
chr7	4051677	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr7	4089103	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0,0,5,8
chr7	4116665	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,8,3
chr7	4116697	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=140,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:7,6:3,2:6,4,7,2
chr7	4119285	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr7	4169665	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=133,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:8,1:2,7:7,3,6,2
chr7	4169704	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=148,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.453:33:12,1:5,13:11,7,8,7
chr7	4172109	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr7	4185592	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,4:0,12:0,0,2,14
chr7	4189075	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,5,10
chr7	4189123	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr7	4218282	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=207,221;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	4259708	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:7,3,4,0
chr7	4259953	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	4259989	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	4304727	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	4304929	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=179,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:4,0:0,2:0,4,0,3
chr7	4794817	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=191,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr7	4798730	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=197,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr7	4800929	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=203,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr7	4820729	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr7	4821300	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:2,2,0,3
chr7	4821352	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr7	4822887	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr7	4825003	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,8,2
chr7	4825945	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=112,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:9,4:2,3:10,1,8,0
chr7	4827859	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=134,186;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,2:7,1:11,4,3,0
chr7	4827884	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:3,6:1,7:2,2,6,7
chr7	4827954	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0,6,1,1
chr7	4828593	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=138,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,3:0,2:1,1,1,4
chr7	4828628	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	4829371	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	4829633	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	4830048	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr7	4830078	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=143,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.430:16:3,1:6,4:5,4,4,3
chr7	4831061	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:1,7:0,6:0,1,1,12
chr7	4839163	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr7	4839993	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=153,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,1,2
chr7	4841289	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=214,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:4,0,2,1
chr7	4841313	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0,0,10,3
chr7	4841470	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=14,32;MFRL=223,207;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.823:7:0,4:0,2:0,1,5,1
chr7	4841655	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=75.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,6:0,15:0,0,5,16
chr7	4843171	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.871:6:0,1:0,2:0,0,6,0
chr7	4843213	.	C	CCTGCCAGGG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTGCCAGGG;STR;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,3:0,0,8,2
chr7	4845147	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=179,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	4855805	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr7	4862171	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=114,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:2,2,1,5
chr7	4862244	.	T	TGTGCTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4862244_T_TGTGCTC:4862244:0,2,0,1
chr7	4862248	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:4862244_T_TGTGCTC:4862244:0,2,0,1
chr7	4862259	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4862259_A_G:4862259:0,0,0,1
chr7	4862269	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4862259_A_G:4862259:0,0,0,1
chr7	4871879	.	C	CAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr7	4874502	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr7	4874729	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=135,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,5:5,2:4,4,3,4
chr7	4876210	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=152,72;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr7	4876307	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4876307_C_A:4876307:0,0,0,1
chr7	4876320	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4876307_C_A:4876307:0,0,0,1
chr7	4917798	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	4917841	.	G	GTGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=254,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	4946973	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,15,3
chr7	4949682	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=150,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4949682_A_AG:4949682:0,1,0,1
chr7	4949685	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=150,118;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:4949682_A_AG:4949682:0,1,0,1
chr7	5026170	.	TA	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,200;MMQ=27,33;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,13:0.294:46:20,7:13,6:29,4,11,2
chr7	5112174	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=201,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr7	5232881	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,12:0,11:0,0,1,22
chr7	5257490	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr7	5262385	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr7	5269424	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr7	5327680	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,176;MMQ=60,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:8,4:10,6:0,18,0,10
chr7	5330865	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,7:1,1:2,2,1,7
chr7	5334469	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=166,162;MMQ=60,42;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.526:19:6,3:3,6:0|1:5334469_G_T:5334469:8,1,8,2
chr7	5334472	.	C	CCT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=168,162;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=35.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.502:20:6,3:3,6:0|1:5334469_G_T:5334469:9,1,8,2
chr7	5334582	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,21:0.425:47:18,10:8,2:13,13,7,14
chr7	5336885	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	5364669	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=16,17;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.445:5:0,0:0,1:0|1:5364669_A_C:5364669:3,0,2,0
chr7	5364685	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=81,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:5364669_A_C:5364669:3,1,1,0
chr7	5364687	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=81,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:5364669_A_C:5364669:3,1,1,0
chr7	5369522	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,5:0,0,14,3
chr7	5396955	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	5416953	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,12;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:1,0:0|1:5416953_T_C:5416953:0,1,2,0
chr7	5416957	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:0,0:1,1:0|1:5416953_T_C:5416953:0,2,2,0
chr7	5416962	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,0:1,0:0|1:5416953_T_C:5416953:1,2,2,0
chr7	5427950	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=148,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,0,2
chr7	5429989	.	CAAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,153;MMQ=52,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.478:6:2,1:0,2:2,1,3,0
chr7	5430283	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,10:0,13:0,0,2,21
chr7	5529922	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,314;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	5530827	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,10:0,0,12,8
chr7	5545355	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	5567277	.	C	A	.	.	DP=65;ECNT=2;MBQ=30,13;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,15:0.206:62:10,0:20,1:38,9,15,0
chr7	5567282	.	C	A	.	.	DP=71;ECNT=2;MBQ=31,14;MFRL=145,164;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,11:0.147:64:17,1:23,3:43,10,11,0
chr7	5567596	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.567:35:7,9:8,11:10,5,12,8
chr7	5568366	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.586:39:7,10:9,13:2,14,3,20
chr7	5569327	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:7,3:6,8:8,5,3,8
chr7	5752506	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:1,8,0,4
chr7	5800769	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,39;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	5922056	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=202,215;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	5922100	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=121,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.618:19:3,5:3,6:7,0,11,1
chr7	5941209	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr7	5941354	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=149,141;MMQ=27,51;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:5,6:9,7:8,6,8,5
chr7	5941411	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=170,152;MMQ=55,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,5:5,6:3,6,2,9
chr7	5942461	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,199;MMQ=58,33;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:0,11,0,2
chr7	5944687	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,135;MMQ=45,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.409:42:17,8:8,9:23,2,13,4
chr7	5944913	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=213,244;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	5965214	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,159;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=75.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,30:0.492:61:18,12:13,18:21,10,22,8
chr7	5967738	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,182;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr7	5967801	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=149,167;MMQ=27,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.691:24:2,9:5,7:6,1,16,1
chr7	5968053	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=155,147;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,11:4,1:1,5,0,12
chr7	5983195	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,149;MMQ=60,39;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=57.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,1,16
chr7	5983678	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,185;MMQ=27,23;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:0,12,0,2
chr7	5984642	.	A	AAATTATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=253,178;MMQ=27,27;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	6006739	.	T	TCTCTCTTATGGAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	6022377	.	TT	AA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,175;MMQ=32,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:19,1:21,0:40,2,2,0
chr7	6029674	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=216,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6029674_T_C:6029674:0,2,0,1
chr7	6029681	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=216,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:6029674_T_C:6029674:0,2,0,1
chr7	6031773	.	CCAG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	6037057	.	GAA	G,GA	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=33,17,16;MFRL=108,182,139;MMQ=60,60,60;MPOS=18,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=12.86,10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,11,17:0.324,0.522:33:3,1,1:0,0,2:3,2,4,24
chr7	6038722	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,6:0,0,18,5
chr7	6057469	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=114,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:12,2:11,1:17,7,1,2
chr7	6062926	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,19;MFRL=189,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,0:2,0:4,1,1,0
chr7	6064495	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=176,199;MMQ=45,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:6064495_A_G:6064495:0,4,0,1
chr7	6064501	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=176,199;MMQ=45,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:6064495_A_G:6064495:0,4,0,1
chr7	6064508	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=176,199;MMQ=45,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:6064495_A_G:6064495:0,4,0,1
chr7	6066057	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0|1:6066057_G_GC:6066057:0,0,7,5
chr7	6066067	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=115,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.492:12:3,2:3,3:0|1:6066057_G_GC:6066057:3,3,2,4
chr7	6071277	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr7	6077163	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,2:3,0:1,5,1,1
chr7	6078376	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr7	6080853	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,3:0,2:0,0,4,8
chr7	6084310	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,1,10
chr7	6085880	.	AAA	TTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	6086951	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=160,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	6088339	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=79.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0|1:6088339_T_C:6088339:0,0,17,1
chr7	6088349	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=87.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.958:21:0,8:0,13:0|1:6088339_T_C:6088339:0,0,19,2
chr7	6088533	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=75.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,13:0,9:0,0,0,22
chr7	6094087	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=154,140;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.230:20:5,3:9,1:16,0,4,0
chr7	6094119	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=139,103;MMQ=60,42;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:10,2:16,0:25,4,1,1
chr7	6155166	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:6,9:6,5:1,11,3,11
chr7	6185968	.	TAAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.506:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	6193362	.	GTGTT	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=153,85;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGTT;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.065:43:16,2:21,0:24,17,1,1
chr7	6199166	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,1:5,4:2,4,2,3
chr7	6414266	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	6452725	.	C	CTCTTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=132,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr7	6452737	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=185,62;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	6472628	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=203,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:6472628_G_T:6472628:0,3,0,1
chr7	6472631	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=203,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:6472628_G_T:6472628:0,3,0,1
chr7	6472634	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=203,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:6472628_G_T:6472628:0,3,0,1
chr7	6485740	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.430:14:5,2:0,3:1,7,0,6
chr7	6487293	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr7	6537655	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr7	6545619	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	6550494	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=89.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,16:0,10:0,0,14,13
chr7	6641635	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr7	6647738	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr7	6730699	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=133,60;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:17,2:17,0:15,19,2,0
chr7	6798624	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,19;MFRL=194,136;MMQ=39,39;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.299:12:1,0:0,0:9,0,3,0
chr7	6845553	.	C	CA	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,142;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=74.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,35:0.542:64:13,22:15,13:28,1,26,9
chr7	7277807	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,8:0,5:0,0,13,0
chr7	7398457	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=92.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,14:0,12:0,0,12,15
chr7	7400239	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	7415217	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,0,8
chr7	7421310	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr7	7472117	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=122,52;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:10,0:13,2:15,10,0,2
chr7	7480376	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,13,1
chr7	7491873	.	AG	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr7	7528951	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=113.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,22:0,9:0,0,29,2
chr7	7557297	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr7	7622696	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=52.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr7	7628256	.	A	AAGAGAAAAAGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=209,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7628256_A_AAGAGAAAAAGC:7628256:0,3,0,1
chr7	7628259	.	CT	GG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=209,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:7628256_A_AAGAGAAAAAGC:7628256:0,3,0,1
chr7	7628275	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	7645535	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr7	7916817	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:0|1:7916817_A_G:7916817:1,0,2,0
chr7	7916824	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=147,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:7916817_A_G:7916817:2,0,3,0
chr7	7917269	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=221,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	8110475	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr7	8125964	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=112,155;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,16:0.501:32:8,9:7,7:5,11,4,12
chr7	8126242	.	AACTT	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8126242_AACTT_A:8126242:0,0,0,1
chr7	8126248	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:8126242_AACTT_A:8126242:0,0,0,1
chr7	8126252	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,26;MFRL=223,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:8126242_AACTT_A:8126242:0,1,0,1
chr7	8132252	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,109;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,6:4,4:5,3,7,3
chr7	8153521	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=123,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:0,0:4,2:3,2,2,0
chr7	8181555	.	C	CCA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=255,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CA;STR;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.841:10:1,6:0,2:0,1,0,9
chr7	8196529	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=167.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.981:51:0,20:0,29:0,0,25,26
chr7	8196566	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=129,83;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.139:26:12,1:11,2:9,14,1,2
chr7	8196567	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=121,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.726:19:3,6:1,8:3,2,6,8
chr7	10973362	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:1,5,0,5
chr7	10977630	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:1,0:10,4:10,1,4,0
chr7	11021976	.	T	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=119,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:28,3:27,0:49,6,3,0
chr7	11030274	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr7	11062487	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,23:0.471:49:9,11:16,12:14,12,14,9
chr7	11076514	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,5:2,7:6,0,12,0
chr7	11078498	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=119,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.447:34:7,5:11,10:6,13,6,9
chr7	11078528	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,6:3,4:1,8,2,8
chr7	11080312	.	C	T	.	.	DP=86;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,3:0.047:82:38,2:38,1:53,26,3,0
chr7	11091200	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,3:3,6:8,1,9,0
chr7	11101394	.	G	GT	.	.	DP=113;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=168,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=52.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,39:0.473:82:23,9:16,21:37,6,32,7
chr7	11151137	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=142,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,5:3,4:0,5,1,8
chr7	11208989	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:5,3:11,5:12,4,8,0
chr7	11209141	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,22:0.479:46:10,9:14,13:3,21,7,15
chr7	11418670	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:4,9:7,4:8,3,12,1
chr7	11418931	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,6:3,5:0,8,4,7
chr7	11419378	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr7	11441358	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	11441562	.	C	CCCCGG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=134,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:11441562_C_CCCCGG:11441562:11,8,0,2
chr7	11441563	.	T	TGTATGATGTTCC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=134,200;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:11441562_C_CCCCGG:11441562:11,8,0,2
chr7	11446843	.	A	ATTACTTAAATTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=182,299;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11446843_A_ATTACTTAAATTT:11446843:2,0,0,1
chr7	11446845	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=182,299;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11446843_A_ATTACTTAAATTT:11446843:2,0,0,1
chr7	11446849	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=182,299;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:11446843_A_ATTACTTAAATTT:11446843:2,0,0,1
chr7	11447138	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=132,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:11447138_G_A:11447138:0,1,0,1
chr7	11447144	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:11447138_G_A:11447138:0,0,0,1
chr7	11452204	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr7	11464297	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=79,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:2,1:2,2:3,2,3,1
chr7	11509561	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:9,1:7,7:8,8,5,3
chr7	11630194	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=140,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,0:10,2:6,13,1,1
chr7	11676107	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=178,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:3,2:2,3:5,0,3,2
chr7	12255335	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,3:0.044:81:41,2:35,1:0,78,0,3
chr7	12263799	.	TG	CA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=137.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,23:0,6:0,0,30,1
chr7	12269213	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=97.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,30:0.596:50:8,15:12,15:19,1,30,0
chr7	12269260	.	A	ATGTT	.	.	DP=101;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=290.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,96:0.990:96:0,44:0,50:0,0,71,25
chr7	12270565	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,4:0,0,9,0
chr7	12270583	.	CTTA	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,5:3,3:4,0,8,0
chr7	12270625	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,6:0,0,14,3
chr7	12270770	.	T	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=131.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,19:0,19:0,0,13,26
chr7	12270780	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=163,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,0:14,2:9,19,0,2
chr7	12270815	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,1,13
chr7	12271452	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=155.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,20:0,29:0,0,36,13
chr7	12271666	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=131,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr7	12271685	.	CCTTAA	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:0|1:12271685_CCTTAA_C:12271685:0,3,0,1
chr7	12271692	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12271685_CCTTAA_C:12271685:0,2,0,1
chr7	12370702	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr7	12372999	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=175,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:6,0,5,0
chr7	12373082	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:9,9:10,9:14,5,15,3
chr7	12382637	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,3:2,5:3,0,8,0
chr7	12383967	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.422:43:12,5:13,13:14,11,7,11
chr7	12391268	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=113,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.373:22:8,7:6,1:7,7,3,5
chr7	12397075	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:12,3:12,0:13,11,3,0
chr7	12399190	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=167,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.572:40:4,7:13,16:15,2,22,1
chr7	12400783	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.598:28:8,10:3,6:11,0,13,4
chr7	12400837	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=127,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:10,10:8,6:11,7,7,9
chr7	12401021	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:4,3:9,7:6,7,7,3
chr7	12407167	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,4:5,3:0,11,0,7
chr7	12409263	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,20:0.553:36:9,10:7,10:11,5,9,11
chr7	12409327	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.432:28:9,3:7,9:8,8,5,7
chr7	12409522	.	A	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.386:37:7,7:15,7:11,12,11,3
chr7	12409535	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,15:0.429:35:7,6:13,8:11,9,9,6
chr7	12410362	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,18:0.396:46:15,12:13,6:17,11,8,10
chr7	12414620	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:6,4:5,4:10,1,7,2
chr7	12414725	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.376:27:8,4:8,5:5,12,5,5
chr7	12417362	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr7	12419039	.	TCA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=213,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:2,2,3,0
chr7	12420092	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=133,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,1:6,2:6,2,2,1
chr7	12433195	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,2:6,3:9,3,5,0
chr7	12433347	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,4:6,1:4,6,2,3
chr7	12443390	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:1,2:2,2:3,0,5,0
chr7	12443542	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,5:3,4:2,4,2,7
chr7	12443621	.	G	GTAGAGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=216,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:12443621_G_GTAGAGT:12443621:0,1,0,1
chr7	12443622	.	C	CTGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=216,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:12443621_G_GTAGAGT:12443621:0,1,0,1
chr7	12617854	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:8,4:2,5:3,7,4,5
chr7	12644334	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr7	12644348	.	G	GGTGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=166,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=GT;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr7	12644363	.	G	GTGTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=189,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	12644366	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	12684340	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,4,5
chr7	12684419	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,12;MFRL=173,194;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:12684419_T_G:12684419:0,3,0,1
chr7	12684423	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=207,194;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:12684419_T_G:12684419:0,2,0,1
chr7	12727826	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=173,168;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:7,9:3,3:9,1,12,0
chr7	12729771	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=136,70;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.067:58:33,3:22,0:33,22,2,1
chr7	12729925	.	GT	G,TT,GTT	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=14,29,31,34;MFRL=135,142,66,221;MMQ=60,60,60,60;MPOS=19,12,16;PON;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=18.83,12.39,3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:11,11,7,3:0.331,0.134,0.133:32:2,4,2,1:3,2,5,1:3,8,11,10
chr7	12730250	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.340:7:2,1:1,1:2,3,0,2
chr7	12730281	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:3,2:2,4,1,2
chr7	13978645	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:13978645_C_T:13978645:0,0,5,0
chr7	13978648	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,2:0,2:0|1:13978645_C_T:13978645:0,0,5,0
chr7	14028245	.	GA	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:9,1:21,2:27,15,2,1
chr7	14622870	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr7	14737622	.	AAAAG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=217,141;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAAG;STR;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:1,3:0,6:1,0,7,2
chr7	14775821	.	TG	T	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=47.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,15:0.353:43:12,4:12,11:0|1:14775821_TG_T:14775821:5,23,4,11
chr7	14775823	.	G	GA	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:33,4:0.128:37:14,1:18,2:1|0:14775821_TG_T:14775821:6,27,0,4
chr7	14775824	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=144,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=47.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,15:0.353:43:13,4:13,11:0|1:14775821_TG_T:14775821:5,23,4,11
chr7	14793478	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.706:21:1,9:4,6:5,1,15,0
chr7	14797180	.	T	TAC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.731:15:3,5:1,6:4,0,11,0
chr7	15346196	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.732:9:1,5:1,1:0,2,1,6
chr7	15725797	.	ATGGTGG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=TGG;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,0:1,1:3,0,1,0
chr7	15726066	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=149,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:0,5,0,6
chr7	16131260	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr7	16255602	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=203,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr7	16317866	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:16317866_A_G:16317866:0,3,0,1
chr7	16317869	.	AAG	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:16317866_A_G:16317866:0,3,0,1
chr7	16317872	.	TTTTAAGTTTC	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=173,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:16317866_A_G:16317866:0,3,0,1
chr7	16317877	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1|0:16317866_A_G:16317866:0,1,0,1
chr7	16317897	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,20;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,1:0.667:1:0,0:0,1:1|0:16317866_A_G:16317866:0,0,0,1
chr7	16348059	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr7	16348091	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=162,77;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:3,1,5,1
chr7	16572051	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,7:1,1:2,0,8,0
chr7	16572376	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.899:7:0,3:0,4:0|1:16572376_TA_T:16572376:0,0,0,7
chr7	16572399	.	CA	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=155,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:16572376_TA_T:16572376:0,4,0,1
chr7	16572402	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=155,208;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:16572376_TA_T:16572376:0,4,0,1
chr7	16577376	.	G	A	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=227.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,69:0.987:69:0,39:0,30:0,0,10,59
chr7	16598655	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:9,5:4,9:3,11,1,13
chr7	16607177	.	TA	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.220:28:11,0:6,3:4,18,0,6
chr7	16640300	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	16640358	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr7	16650427	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr7	16676082	.	T	TA	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=18,9;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.271:37:5,1:8,2:5,22,2,8
chr7	16684247	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	16705132	.	TTG	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=14,29;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.167:21:3,0:4,3:2,16,0,3
chr7	16722392	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=145,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.187:24:8,3:11,1:12,8,4,0
chr7	16736479	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr7	16745589	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr7	16793504	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:1,1:4,1,3,0
chr7	16815786	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=89.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,22,2
chr7	16816000	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=158.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,19:0,24:0,0,5,38
chr7	16818799	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,1,11
chr7	16834444	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr7	16837404	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	16839501	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr7	16899342	.	C	CTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:16899342_C_CTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTGAT:16899342:0,0,0,1
chr7	16899344	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.670:1:0,1:0,0:0|1:16899342_C_CTGCCTTGCTAGGTTGGGGAAGTGAT:16899342:0,0,0,1
chr7	16901185	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	16901523	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=167,158;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,0:0,2:1,0,2,0
chr7	16913520	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	17373771	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=177,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,3:4,2:0,5,1,4
chr7	17379703	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:17,0:18,3:10,25,0,3
chr7	17854532	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=129,110;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:2,3:4,2:2,4,2,4
chr7	17854574	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=127,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.307:7:4,0:1,0:2,3,0,2
chr7	17854575	.	GA	AA,GAAA,TT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=17,33,35,34;MFRL=188,182,124,75;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,25,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=3.77,3.52,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,1,1:0.267,0.294,0.167:5:0,1,1,1:0,1,0,0:0,1,1,3
chr7	17854616	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	17874300	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,5:5,1:7,0,6,0
chr7	17879484	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=125,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,23:0.519:44:9,10:12,12:12,9,12,11
chr7	17890413	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:6,0,5,1
chr7	17908130	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.527:34:11,6:5,12:0,16,3,15
chr7	17913083	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	17933065	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=151,60;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:13,2:0|1:17933065_G_A:17933065:1,20,1,1
chr7	17933071	.	TTTAATCA	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=163,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:0|1:17933065_G_A:17933065:0,20,1,1
chr7	17933081	.	A	ATT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=167,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:5,0:13,2:0|1:17933065_G_A:17933065:0,18,1,1
chr7	17933082	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=167,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:4,0:12,2:0|1:17933065_G_A:17933065:0,18,1,1
chr7	17933086	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=170,60;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:12,1:0|1:17933065_G_A:17933065:0,15,1,1
chr7	17979793	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,10,0
chr7	18067479	.	ACT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr7	18630208	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=132,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr7	18631098	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30,31;MFRL=129,175,159;MMQ=60,60,40;MPOS=32,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=TG;STR;TLOD=4.18,7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.249,0.377:8:2,0,1:1,2,2:3,0,5,0
chr7	18674435	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:0,7,0,5
chr7	18688033	.	ATG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.484:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr7	18914251	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,1,13
chr7	19184748	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:19184748_C_T:19184748:1,1,0,1
chr7	19184753	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=197,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:19184748_C_T:19184748:0,1,0,1
chr7	19738359	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr7	19739947	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr7	19761868	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr7	19813338	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	20180717	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:4,5,1,3
chr7	20199888	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=175,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr7	20371395	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr7	20403353	.	AT	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=75.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.947:34:0,12:1,20:0,1,5,28
chr7	20406542	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,5:3,3:4,0,8,0
chr7	20418926	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,7:4,4:1,10,4,7
chr7	20430960	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,12:0,0,21,0
chr7	20441450	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:7,0:14,3:14,8,0,3
chr7	20444532	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,1,15
chr7	20668236	.	T	TTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TG;STR;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:5,1:2,2:7,0,3,0
chr7	20687075	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,2:7,0:10,1,2,0
chr7	20698213	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=122,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,2:8,0:11,10,1,1
chr7	20698799	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:20698799_T_A:20698799:0,3,0,1
chr7	20698801	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=94,89;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:20698799_T_A:20698799:0,3,0,1
chr7	20739774	.	AT	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=119,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=56.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,25:0.583:43:8,15:9,10:4,14,1,24
chr7	20768174	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=144,143;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr7	20778646	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,10,14
chr7	20778773	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr7	20782474	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr7	20802789	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:1,1:4,2:6,0,3,0
chr7	20802924	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=119,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,0:12,2:7,16,0,2
chr7	20803003	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:1,3,2,0
chr7	20825263	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr7	20825462	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=39,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:3,1,0,1
chr7	21468222	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=205,246;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr7	21468869	.	TCC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=C;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	21584820	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr7	21599233	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.353:35:10,5:12,7:15,8,8,4
chr7	21603750	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.416:8:1,1:3,2:3,2,3,0
chr7	21609623	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr7	21645945	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=161,144;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr7	21658855	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=115,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:6,2:7,7:4,9,3,6
chr7	21695649	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0,4,0,4
chr7	21723573	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=101,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.392:16:7,1:2,5:4,6,3,3
chr7	21727186	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:3,2:4,9:0,8,1,10
chr7	21765636	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr7	21775210	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr7	21779104	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	21779331	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,4:4,3:1,8,1,6
chr7	21781807	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,1:2,7:0,4,1,7
chr7	21789442	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,1,10
chr7	21805215	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,1,2
chr7	21818486	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr7	21824244	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	21826199	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,14,2
chr7	21847457	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr7	21856390	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr7	21858043	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr7	21892321	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr7	21907696	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,65302601;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr7	21908690	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr7	21923867	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,1:0,0,6,1
chr7	21932317	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	21940557	.	AACTT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTT;STR;TLOD=55.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,13,0
chr7	21941861	.	ATCTT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.343:33:10,5:11,6:18,4,7,4
chr7	21945086	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	21945840	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=95,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:3,2,4,3
chr7	21985347	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=184.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,57:0.983:57:0,28:0,28:0,0,32,25
chr7	22186700	.	G	GTCTTGAATGCCTGAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,319;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	22197422	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,183;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,2:7,0:8,1,2,0
chr7	22202134	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:1,10,0,2
chr7	22206774	.	GA	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=120,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:6,1:2,2:7,23,0,3
chr7	22330862	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=10,22;MFRL=136,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,1:0,0:0,4,1,1
chr7	22349761	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr7	22355069	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr7	22357488	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,7,1
chr7	22357716	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,6:0,4:0,0,0,11
chr7	22357746	.	G	GTAAGATCTGGGATGGCTTCCCTTGGAGGTATCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,190;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr7	22532321	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=121,126;MMQ=39,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.598:23:3,4:6,9:2,7,4,10
chr7	22533518	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=232,198;MMQ=40,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr7	22852643	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,5:3,1:10,0,6,0
chr7	22857504	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=197,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:8,4:2,6:10,1,10,0
chr7	22857589	.	T	C	.	.	DP=72;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=104.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,36:0.513:70:20,18:14,17:28,6,21,15
chr7	22862467	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:4,2:1,2:0,7,0,4
chr7	22986925	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=205,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:0,8,0,3
chr7	23000783	.	G	GCTCT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=CT;STR;TLOD=42.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:5,5:5,5:10,0,11,0
chr7	23180292	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	23183701	.	T	TACTGAGTCTAATCCATTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=232,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	23191846	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:10,0:10,3:0|1:23191846_T_C:23191846:4,16,1,2
chr7	23191852	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:23191846_T_C:23191846:3,16,1,1
chr7	23191856	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:23191846_T_C:23191846:2,17,1,1
chr7	23195555	.	CTTTAT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,8:0,16:0,0,16,9
chr7	23226660	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=154,85;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.130:25:6,1:8,0:12,10,2,1
chr7	23227632	.	AT	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.171:31:14,2:8,3:24,2,5,0
chr7	23352512	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=93.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.970:29:0,12:0,16:0,0,3,26
chr7	23385730	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr7	23545119	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=95;ECNT=1;MBQ=30,31,33,31;MFRL=105,135,134,125;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,29,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=20,18,19,21;RU=A;STR;TLOD=5.17,10.14,10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:21,6,10,12:0.118,0.215,0.249:49:10,4,6,6:6,1,2,5:13,8,19,9
chr7	23561363	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=146,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,2:0.057:50:20,0:26,2:24,24,0,2
chr7	23719766	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.598:18:3,3:4,7:7,0,10,1
chr7	23719779	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.642:29:4,8:6,9:10,0,19,0
chr7	23724364	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr7	23737795	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.407:52:17,11:14,10:24,7,18,3
chr7	23741876	.	CT	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.224:38:16,5:12,3:1,29,0,8
chr7	23794029	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,26:0.614:42:8,14:8,12:10,6,15,11
chr7	23794139	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=87.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,10:0,14:0,0,1,23
chr7	23802579	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:0,3:6,2:1,5,0,5
chr7	23810605	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0,0,9,4
chr7	23823355	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	23826066	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	23854717	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,8,4
chr7	23854838	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=72.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,11,11
chr7	23872024	.	C	CTTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTG;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr7	24324808	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	24663820	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr7	24718710	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr7	24719050	.	C	CTCTGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24719050_C_CTCTGT:24719050:0,1,0,1
chr7	24719051	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:24719050_C_CTCTGT:24719050:0,1,0,1
chr7	24720103	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=126,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:13,0:17,3:13,17,0,3
chr7	24746026	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=105,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,1:4,3:4,5,1,3
chr7	24747910	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:1,2,0,3
chr7	24756913	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:10,1,0,2
chr7	24758565	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	24758645	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,1:0,1:1,0,2,1
chr7	24784403	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0|1:24784403_C_T:24784403:0,0,1,3
chr7	24784404	.	G	GGTCACCTGGGGCTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,19;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.492:4:2,1:0,0:0|1:24784403_C_T:24784403:0,2,1,1
chr7	24784406	.	T	TGTGAGCCTCAGGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=133,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,0:0|1:24784403_C_T:24784403:0,2,1,1
chr7	24789082	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=231,156;MMQ=58,58;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr7	24844080	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,6:5,3:1,6,0,9
chr7	24859962	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:1,6:6,4:0,7,0,10
chr7	24870576	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,3:0,1,0,4
chr7	24873911	.	T	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=104,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,19:0.442:43:13,10:11,7:13,11,9,10
chr7	24880473	.	C	CAAAAAGCTTGCCAATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.675:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	24888620	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,3:0,7:1,0,7,3
chr7	24901470	.	G	GAATGGAAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=64,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr7	24911526	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=168,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:4,3:9,6:4,9,6,3
chr7	25175745	.	T	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=135,84;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,4:0.082:59:30,4:21,0:30,25,4,0
chr7	25194618	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,1:3,4:5,5,3,2
chr7	25194857	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:6,1:7,11:0,13,1,11
chr7	25197987	.	CAAA	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,199;MMQ=60,45;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	25264847	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:0,7,2,4
chr7	25266569	.	TTAA	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=125,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAA;STR;TLOD=99.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,25:0.635:39:6,11:7,14:9,5,11,14
chr7	25268094	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,3:4,7:0,10,0,10
chr7	25989520	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=180,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr7	26223294	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=130,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:6,8:6,5:9,3,12,2
chr7	26247984	.	CT	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.329:28:9,1:10,7:18,1,9,0
chr7	26251417	.	CT	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.141:40:17,1:18,4:4,31,1,4
chr7	26251843	.	C	T	.	.	DP=161;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,140;MMQ=60,43;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=180.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:82,67:0.450:149:29,31:53,36:19,63,25,42
chr7	26386122	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,2,12
chr7	26386154	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr7	26400526	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:26400526_T_G:26400526:4,0,1,0
chr7	26400529	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:26400526_T_G:26400526:4,0,1,0
chr7	26576535	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,14:0,0,14,18
chr7	26724279	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,6:3,5:8,0,10,1
chr7	27135314	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,7:0,5:0,0,10,4
chr7	27141055	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	27147451	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=258,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr7	27169280	.	G	GGCTGCCCAGGATGATGCTCGAGAAGTAAAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,13;MFRL=221,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr7	27170145	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	27186984	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.249:24:9,2:9,2:13,5,4,2
chr7	27203139	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr7	27222409	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=123,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.554:23:5,8:5,3:5,5,8,5
chr7	27224823	.	T	TTAC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=226,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27224823_T_TTAC:27224823:0,1,0,1
chr7	27224824	.	G	GTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=226,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27224823_T_TTAC:27224823:0,1,0,1
chr7	27224826	.	C	CAAATTTCTACT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=226,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:27224823_T_TTAC:27224823:0,1,0,1
chr7	27238691	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	27566053	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr7	27582783	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr7	27669192	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=203,223;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	27671899	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,8,1
chr7	27687447	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=185,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,1:2,0:0,7,0,2
chr7	27689258	.	TTCAATACATTATTTTCAATAGGGGCAAATAACATTTTTTATTGTAAACATTCATTTAATATTAGCAAG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.139:25:6,0:5,4:3,16,2,4
chr7	27886011	.	C	CATATACGTATACGTGTAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,4:0,0,8,0
chr7	28534501	.	C	CT	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=79,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=108.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,46:0.948:49:0,18:3,27:1,2,33,13
chr7	28997497	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr7	28997560	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=213,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:28997560_TG_CA:28997560:2,0,0,1
chr7	28997565	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=213,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:28997560_TG_CA:28997560:2,0,0,1
chr7	28997566	.	C	CATTACTTTAACTT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=213,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:28997560_TG_CA:28997560:2,0,0,1
chr7	28997596	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr7	29103867	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:29103867_T_C:29103867:0,0,0,6
chr7	29103877	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:29103867_T_C:29103867:0,0,0,4
chr7	29105776	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,6:0,2:0,0,0,9
chr7	29111578	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr7	29111620	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	29132212	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,10,2
chr7	29135921	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=21,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29135921_T_TA:29135921:1,0,0,1
chr7	29135922	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29135921_T_TA:29135921:1,0,0,1
chr7	29135924	.	GT	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:29135921_T_TA:29135921:1,0,0,1
chr7	29160434	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	29394220	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr7	29438109	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:0,5,0,3
chr7	29440502	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=221,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr7	29520042	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,96;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr7	29546763	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr7	29606597	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,7:0,5:0,0,6,7
chr7	29606896	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=192,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0,4,0,4
chr7	29606976	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr7	29915593	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:10,1:9,7:5,14,1,7
chr7	29923977	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=0,21;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.818:3:0,0:0,2:0|1:29923977_T_TG:29923977:0,0,3,0
chr7	29923981	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=135,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,0:0,2:0|1:29923977_T_TG:29923977:0,1,3,0
chr7	29923986	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,23;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,0:0,1:0|1:29923977_T_TG:29923977:0,2,3,0
chr7	29923989	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=30,22;MFRL=126,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:0,1:0|1:29923977_T_TG:29923977:0,4,2,0
chr7	29923995	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:29923977_T_TG:29923977:0,5,2,0
chr7	29923997	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=31,11;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,0:0|1:29923977_T_TG:29923977:0,5,2,0
chr7	29976385	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=187,151;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:29976385_G_A:29976385:0,3,0,1
chr7	29976391	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=191,185;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:29976385_G_A:29976385:0,4,0,2
chr7	30054574	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr7	30113604	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.410:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr7	30329453	.	CTGT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=144,98;MMQ=50,42;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGT;STR;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:11,3:12,1:9,15,1,3
chr7	30485703	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=115,52;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,0:2,1:0|1:30485703_G_GC:30485703:8,4,1,1
chr7	30485710	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=136,52;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,1:1,1:0|1:30485703_G_GC:30485703:9,4,1,1
chr7	30485741	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=91,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.404:30:13,6:4,5:15,3,8,4
chr7	30485949	.	C	CCCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.673:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	30538373	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,2:7,1:15,0,3,0
chr7	30540172	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=124,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.100:47:25,3:18,1:24,19,2,2
chr7	30544360	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=177,145;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,5:6,2:1,9,1,6
chr7	30651938	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr7	30655489	.	A	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=63.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,22:0.535:41:10,11:9,11:15,4,15,7
chr7	30662148	.	TGAGA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=180,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:30662148_TGAGA_T:30662148:0,3,0,1
chr7	30662153	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:30662148_TGAGA_T:30662148:0,2,0,1
chr7	30662155	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,34;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:30662148_TGAGA_T:30662148:0,2,0,1
chr7	30673512	.	TAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=15,16;MFRL=144,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:0,1:0,0:0,3,0,3
chr7	30701835	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=123,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:11,3:25,2:22,15,3,2
chr7	30701914	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:3,2:5,9:1,7,1,10
chr7	30728908	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=115,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:2,4:4,3:2,6,2,5
chr7	30739525	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.529:9:3,2:1,1:4,0,5,0
chr7	30805849	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=148,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr7	30805913	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=128,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:4,4:0,3:1,3,4,4
chr7	30817998	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=201,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:6,1,4,0
chr7	30830976	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=165,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,0:2,5,0,2
chr7	30876432	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr7	30922001	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:30922001_A_T:30922001:0,3,0,1
chr7	30922002	.	C	CAGGTGCTGTGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:30922001_A_T:30922001:0,3,0,1
chr7	30951936	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30951936_G_A:30951936:0,0,0,1
chr7	30951938	.	G	GACAACCTGTTGATTGCTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:30951936_G_A:30951936:0,0,0,1
chr7	30962213	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=130,77;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:11,1:12,3:9,14,1,3
chr7	31011485	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	31018852	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,2:1,1:0,4,1,3
chr7	31117755	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=120,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0|1:31117755_T_A:31117755:0,2,1,1
chr7	31117763	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=120,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:31117755_T_A:31117755:0,2,0,1
chr7	31117765	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,34;MFRL=120,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:31117755_T_A:31117755:0,2,0,1
chr7	31117767	.	TC	AG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=120,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:31117755_T_A:31117755:0,2,0,1
chr7	31120353	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,26;MFRL=240,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr7	31124425	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:13,3:8,0:9,12,3,0
chr7	31125082	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	31132325	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,126;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:2,5,0,2
chr7	31135471	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,102;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	31378933	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=133,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:2,0:1,4:1,2,0,4
chr7	31592715	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:31592715_G_T:31592715:3,2,2,0
chr7	31592733	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0|1:31592715_G_T:31592715:0,0,4,3
chr7	31594160	.	GCCTTACA	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:13,1:9,2:0|1:31594160_GCCTTACA_G:31594160:3,20,0,3
chr7	31594166	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=65.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,21:0.959:21:0,12:0,9:1|0:31594160_GCCTTACA_G:31594160:0,0,3,18
chr7	31594171	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.167:22:8,0:8,2:0|1:31594160_GCCTTACA_G:31594160:2,17,0,3
chr7	31594173	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,1:0|1:31594160_GCCTTACA_G:31594160:2,14,0,2
chr7	31594258	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr7	31681765	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=114.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.974:35:0,15:0,19:0,0,23,12
chr7	31683610	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr7	31683625	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	31691697	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=174.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,22:0,25:0,0,5,44
chr7	31692441	.	T	TTAGTTGCACGTTATAAACTAATAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:4,9,1,1
chr7	31735263	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=0,34;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,2,12
chr7	31735297	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:31735297_T_G:31735297:0,2,0,3
chr7	31735300	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,30;MFRL=140,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:31735297_T_G:31735297:0,2,0,3
chr7	31735307	.	T	TACAAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=169,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31735307_T_TACAAA:31735307:0,3,0,1
chr7	31735309	.	T	TCAC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=169,101;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:31735307_T_TACAAA:31735307:0,3,0,1
chr7	31735310	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=169,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:31735307_T_TACAAA:31735307:0,3,0,1
chr7	31793261	.	T	TTCTTA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31793261_T_TTCTTA:31793261:0,1,0,1
chr7	31793265	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31793261_T_TTCTTA:31793261:0,1,0,1
chr7	31862878	.	A	ATCATAACAGTCTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,15;MFRL=230,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0,3,0,1
chr7	31876766	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:7,1,4,0
chr7	32527009	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:7,7:3,0:0,10,1,6
chr7	32528366	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.636:14:4,6:0,3:0,5,0,9
chr7	32593234	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:6,5:0,2:7,0,8,0
chr7	32598524	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.585:15:2,5:3,3:3,3,7,2
chr7	32609565	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=190,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr7	32609782	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=147,52;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:20,2:10,0:10,20,1,1
chr7	32613119	.	TAC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,31;MFRL=155,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr7	32615553	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,2:1,5:5,0,6,1
chr7	32772520	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,182;MMQ=46,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:5,0,4,0
chr7	32908945	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:3,5:4,0,5,2
chr7	32914507	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=253,176;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32914507_T_C:32914507:2,0,1,0
chr7	32914510	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=253,176;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32914507_T_C:32914507:2,0,1,0
chr7	32997461	.	GG	TT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32997461_GG_TT:32997461:0,1,0,1
chr7	32997463	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32997461_GG_TT:32997461:0,1,0,1
chr7	32997467	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32997461_GG_TT:32997461:0,1,0,1
chr7	32997471	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=208,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:32997461_GG_TT:32997461:0,1,0,1
chr7	33014404	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,192;MMQ=52,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:0,5,0,5
chr7	33016120	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr7	33059407	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	33102462	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	33134883	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,172;MMQ=27,27;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=127.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,44:0.834:52:4,29:4,15:0,8,10,34
chr7	33136983	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,3,11
chr7	33138875	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,14,4
chr7	33139147	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	33186065	.	TT	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr7	33192502	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,0,14
chr7	33217071	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	33388618	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	33392380	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr7	33979638	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=187,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr7	33979664	.	T	TTATA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=174,259;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=TA;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:33979664_T_TTATA:33979664:0,4,0,1
chr7	33979668	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=174,259;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:33979664_T_TTATA:33979664:0,4,0,1
chr7	34101562	.	G	GTTTT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,36;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=15,19;RU=T;STR;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	34101587	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,13;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:2,0:0|1:34101587_C_A:34101587:4,3,2,0
chr7	34101591	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,0:0|1:34101587_C_A:34101587:4,3,2,0
chr7	34101593	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:2,0:0|1:34101587_C_A:34101587:4,3,2,0
chr7	34101597	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,16;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,0:0|1:34101587_C_A:34101587:3,4,2,0
chr7	34125622	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=102,114;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:5,6:7,11:4,8,8,9
chr7	34698210	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:10,1:3,4:3,10,0,6
chr7	34698234	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=132,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:1,5,0,6
chr7	34698251	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:0,5,0,3
chr7	34874047	.	C	CAT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=105,143;MMQ=60,50;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,1:12,0:6,19,2,0
chr7	34874050	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=97,143;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,2:12,0:5,19,2,0
chr7	34981591	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=196,211;MMQ=57,59;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:1,3,0,4
chr7	34989337	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=143,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr7	34989364	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.359:17:6,3:5,2:10,1,6,0
chr7	34995075	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.320:26:9,4:9,4:0,18,0,8
chr7	35009183	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,146;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,21:0.480:44:11,10:11,11:3,20,2,19
chr7	35013220	.	GA	G	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.096:49:22,1:20,3:12,33,1,3
chr7	35050217	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=151,153;MMQ=27,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=119.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,38:0.661:57:10,23:8,15:0|1:35050217_A_G:35050217:0,19,4,34
chr7	35050227	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=153,141;MMQ=51,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:33,15:0.319:48:18,6:14,9:1|0:35050217_A_G:35050217:2,31,0,15
chr7	35058177	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,29:0.544:53:10,10:14,18:15,9,13,16
chr7	35241962	.	A	AGGGGGGGGGGC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:35241962_A_AGGGGGGGGGGC:35241962:0,0,1,0
chr7	35241963	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:35241962_A_AGGGGGGGGGGC:35241962:0,0,1,0
chr7	35241967	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,130;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.717:2:0,0:0,1:0|1:35241962_A_AGGGGGGGGGGC:35241962:0,0,2,0
chr7	35280693	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,5:4,5:0,10,0,10
chr7	35288213	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=92,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	35288276	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:4,1,3,4
chr7	35289889	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr7	35709772	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=189,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,5:2,1,7,0
chr7	35840898	.	G	GC	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=189.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,54:0.983:54:0,22:0,30:0,0,26,28
chr7	35930260	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,3:1,2:2,0,6,0
chr7	36324436	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,2:2,4:0,6,1,5
chr7	36338564	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.888:7:0,0:0,4:0|1:36338564_G_A:36338564:0,0,7,0
chr7	36338589	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0|1:36338564_G_A:36338564:0,0,11,0
chr7	36338841	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr7	36366569	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=178,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr7	36370499	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr7	36370555	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.954:20:0,8:0,9:0,0,15,5
chr7	36373428	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:7,2:11,4,2,0
chr7	36373854	.	T	TGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36373854_T_TGA:36373854:0,1,0,1
chr7	36373855	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:36373854_T_TGA:36373854:0,1,0,1
chr7	36397244	.	C	CTTGAGTTCACATCTCAGCTTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=208,192;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr7	36447349	.	A	ACTT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=120.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,12:0,15:0,0,14,15
chr7	36447600	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr7	36455556	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=141,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:0,5,0,6
chr7	36456603	.	G	GA	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.165:40:18,4:14,2:33,1,6,0
chr7	36456613	.	AC	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.155:40:19,3:15,3:34,0,5,1
chr7	36456614	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=15,33;MFRL=245,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=88.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,45:0.978:46:0,25:0,20:0,1,44,1
chr7	36456870	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:6,4:7,8:0,13,0,12
chr7	36458828	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=100.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,13:0,17:0,0,22,9
chr7	36460419	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr7	36461442	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,18:0.529:34:6,4:10,14:14,2,17,1
chr7	36462205	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=57.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,14,3
chr7	36463335	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	36465192	.	TGC	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=133.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,13:0,15:0,0,30,0
chr7	36465570	.	T	C	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=266.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,75:0.987:75:0,37:0,31:0,0,53,22
chr7	36465606	.	CTT	C,CT	.	.	DP=78;ECNT=2;MBQ=33,33,33;MFRL=153,154,163;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=9.63,27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:24,8,19:0.152,0.384:51:9,5,5:13,3,11:10,14,12,15
chr7	36466655	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,15:0.467:32:7,8:9,6:0|1:36466655_C_A:36466655:5,12,4,11
chr7	36466669	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=72,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=100.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,27:0.944:28:1,13:0,12:0|1:36466655_C_A:36466655:1,0,6,21
chr7	36489477	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=135,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:4,2:2,2:0,7,0,4
chr7	36492045	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.925:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr7	36492212	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,9:8,4:0,12,1,12
chr7	36552790	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr7	36660351	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,80;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.070:54:25,3:26,0:35,16,2,1
chr7	36660502	.	CATGA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=163,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=ATGA;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:5,0:8,1:0,14,0,2
chr7	36661423	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,3,15
chr7	36698684	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	36713484	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=132,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:11,0:12,4,3,0
chr7	36726476	.	CGT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=GT;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.784:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	36934448	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,10:0,0,12,5
chr7	37272857	.	A	AGAAGTTATTAGACAGGGCAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.480:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	37355590	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,1,8
chr7	37780799	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:10,8:11,3:14,7,6,5
chr7	37890292	.	A	AC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=123,36;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:12,2:10,0:13,9,1,1
chr7	37901581	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=97.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,16:0,13:0,0,23,6
chr7	37902902	.	TATAAATATTTACTAG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=203,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:2,1,1,0
chr7	37903853	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,12,1
chr7	37903904	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=96.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,20:0,7:0,0,27,1
chr7	37904065	.	TAAC	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,9:0,0,0,17
chr7	37904099	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr7	37923849	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr7	37924737	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=65.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,9:0,0,15,3
chr7	37924879	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,2,11
chr7	37927779	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr7	37933983	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,11,1
chr7	37934234	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=113.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.974:34:0,19:0,14:0,0,7,27
chr7	37936384	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	37936765	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=232,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37936765_CT_C:37936765:0,1,0,1
chr7	37936768	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=232,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:37936765_CT_C:37936765:0,1,0,1
chr7	37947164	.	G	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,33:0.606:54:9,18:12,13:8,13,17,16
chr7	37960262	.	AAGGCAGTGGCAGC	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=141,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGCAGTGGCAGC;STR;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:1,5:2,4:4,3,7,2
chr7	37989775	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=162,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr7	38253923	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:8,4:2,4:8,2,7,1
chr7	38259354	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr7	38301741	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,2:4,6:11,1,6,2
chr7	38304926	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,153;MMQ=33,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,5:0,1:2,1,6,0
chr7	38305212	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,211;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,2:5,1:1,5,0,3
chr7	38471937	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr7	38500782	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	38501065	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,0,15
chr7	38505014	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,6:0,0,13,1
chr7	38505025	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,18,2
chr7	38505712	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,13,6
chr7	38530568	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=42.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr7	38530807	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	38543371	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	38574457	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	38766611	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,119;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,2:2,6:2,4,2,6
chr7	38781018	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=130.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,23:0,18:0,0,3,38
chr7	38782905	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	38782951	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,10:0,2:0,0,12,0
chr7	38785062	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr7	38813711	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr7	38829482	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:9,6:5,10:1,13,7,9
chr7	38908876	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,9:0,0,4,9
chr7	39125413	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:3,0,5,0
chr7	39243750	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=54,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	39247178	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:7,10,1,1
chr7	39379386	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=19,12;MFRL=139,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.560:5:1,0:0,0:0|1:39379386_G_C:39379386:2,0,3,0
chr7	39379396	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=16,21;MFRL=118,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,1:0,0:0|1:39379386_G_C:39379386:3,0,2,0
chr7	39379401	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=22,25;MFRL=97,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:0,2:0|1:39379401_A_C:39379401:3,0,3,0
chr7	39379405	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=49,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:3,1:2,1:0|1:39379386_G_C:39379386:6,0,2,0
chr7	39379416	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=96,178;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,1:0|1:39379401_A_C:39379401:7,0,2,0
chr7	39379698	.	CCA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CA;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,0:0,2,1,1
chr7	39472669	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:3,3:3,1:6,1,4,1
chr7	39472846	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,136;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:10,11:3,5:3,10,5,11
chr7	39500352	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=138,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr7	39500374	.	C	CCCGGACTCCGACTCGT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=169,110;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr7	39610177	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.656:28:7,4:2,9:4,5,6,13
chr7	39610241	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:0,6,1,5
chr7	39611819	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=133,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,2:1,7:5,0,6,3
chr7	40027190	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,8:0.191:45:17,4:20,4:27,10,7,1
chr7	40087320	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:0,2:6,1:6,0,3,0
chr7	40220507	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,0:2,5:7,1,4,1
chr7	40228034	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=158,186;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.202:21:4,1:11,3:14,3,4,0
chr7	40228055	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=36,15;MFRL=111,159;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,17:0.377:44:8,2:11,6:1,26,17,0
chr7	40229072	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:4,1,6,2
chr7	40234742	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=188,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,1:3,3:1,4,0,5
chr7	40356315	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:6,1,7,0
chr7	42064852	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=54.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr7	42088222	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=205.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,56:0.983:56:0,30:0,23:0,0,23,33
chr7	42088232	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,29:0.534:54:13,16:12,12:7,18,14,15
chr7	42262935	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=283,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.726:5:1,2:0,0:1,0,0,4
chr7	42957465	.	ATT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,5:0,14:0,0,0,19
chr7	42974827	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr7	42977195	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr7	42977243	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	43400656	.	CGTGT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=GT;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:2,2:2,0:0,4,0,3
chr7	43485248	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr7	43519248	.	A	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,70;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:20,0:18,3:21,18,1,2
chr7	43547694	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=127,51;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:11,2:15,2:8,18,1,3
chr7	43591955	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,4:7,3:4,8,2,5
chr7	43659182	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,7:3,5:5,1,8,4
chr7	43664477	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=134,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,4:0,2:0,3,0,6
chr7	43684803	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=161,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr7	43687296	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.763:15:2,8:1,3:0,3,0,12
chr7	43810695	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:6,11:7,5:8,5,11,5
chr7	43827414	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=170,259;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:4,2:1,1:5,0,4,0
chr7	43843403	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:6,0:9,2:4,11,0,2
chr7	43908853	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43908853_G_GC:43908853:0,0,1,0
chr7	43908860	.	GCC	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43908853_G_GC:43908853:0,0,1,0
chr7	43908866	.	C	CGGGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=2,10;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:43908853_G_GC:43908853:0,0,1,0
chr7	43918953	.	A	AAATCTGGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43918953_A_AAATCTGGG:43918953:0,0,0,1
chr7	43918955	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43918953_A_AAATCTGGG:43918953:0,0,0,1
chr7	43918958	.	G	GCACATAATGTT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:43918953_A_AAATCTGGG:43918953:0,0,0,1
chr7	43921261	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:6,5:8,3:7,7,4,4
chr7	43982341	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=120,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:7,5:11,4:13,5,6,3
chr7	44044907	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr7	44046844	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=173,177;MMQ=48,46;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,4:4,3:4,0,6,1
chr7	44047066	.	T	C	.	.	DP=109;ECNT=1;MBQ=23,23;MFRL=184,154;MMQ=44,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=162.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,69:0.971:71:0,16:1,25:1,1,30,39
chr7	44047211	.	G	GCAATAGCATTATGGGCA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=159,120;MMQ=24,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.317:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	44047219	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,31;MFRL=186,130;MMQ=23,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:44047219_G_A:44047219:1,1,0,1
chr7	44047220	.	A	ACTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=186,130;MMQ=23,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:44047219_G_A:44047219:1,1,0,1
chr7	44084292	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr7	44092612	.	CG	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:44092612_CG_GA:44092612:0,1,0,1
chr7	44092615	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,19;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:44092612_CG_GA:44092612:0,1,0,1
chr7	44097696	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=92.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,16:0,12:0,0,22,6
chr7	44146968	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	44147567	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,8,5
chr7	44147583	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,10;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.344:9:1,0:5,0:1,5,3,0
chr7	44147586	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=181,136;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:3,0:5,0:0|1:44147586_T_A:44147586:3,7,2,0
chr7	44147590	.	C	CCG	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=177,136;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,2:0|1:44147586_T_A:44147586:4,7,2,0
chr7	44147591	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=32,13;MFRL=177,136;MMQ=60,51;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:6,0:0|1:44147586_T_A:44147586:4,7,2,0
chr7	44147596	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=32,22;MFRL=175,136;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,0:7,1:0|1:44147586_T_A:44147586:1,8,2,0
chr7	44147599	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,12;MFRL=166,136;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:6,0:0|1:44147586_T_A:44147586:2,8,2,0
chr7	44148953	.	C	CCAAGCAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=163,5406868;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44148953_C_CCAAGCAT:44148953:1,2,1,0
chr7	44148955	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=163,5406868;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:44148953_C_CCAAGCAT:44148953:1,2,1,0
chr7	44151009	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	44152014	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=198,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44152014_A_AT:44152014:1,0,0,1
chr7	44152015	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=198,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44152014_A_AT:44152014:1,0,0,1
chr7	44152119	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=35.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,5:0,0,10,1
chr7	44152524	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr7	44152549	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=160,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr7	44153780	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.951:19:0,7:0,12:0,0,6,13
chr7	44154865	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=49.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,11,3
chr7	44156146	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr7	44156209	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44156209_A_C:44156209:0,1,0,1
chr7	44156213	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44156209_A_C:44156209:0,1,0,1
chr7	44156217	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,23;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44156209_A_C:44156209:0,1,0,1
chr7	44178626	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=117,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:3,4,0,2
chr7	44180079	.	A	AG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr7	44180226	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr7	44189321	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,6,1
chr7	44189709	.	C	CTGAGTAATTCATAAAGAAG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44189709_C_CTGAGTAATTCATAAAGAAG:44189709:0,0,0,1
chr7	44189713	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44189709_C_CTGAGTAATTCATAAAGAAG:44189709:0,0,0,1
chr7	44190468	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	44198669	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=135,106;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:2,2,1,0
chr7	44228429	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,66;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:6,1,2,0
chr7	44252008	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:44252008_G_A:44252008:0,0,0,1
chr7	44252012	.	TTC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44252008_G_A:44252008:0,1,0,1
chr7	44266077	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,6:0,0,14,4
chr7	44270510	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr7	44270764	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	44272314	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	44274342	.	C	CGCCCTGGGGCT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=170,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,2:9,0:3,11,1,2
chr7	44281475	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr7	44286880	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.490:2:0,1:1,0:0|1:44286880_C_CA:44286880:0,1,0,1
chr7	44286883	.	G	GTGGAGCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:44286880_C_CA:44286880:0,1,0,1
chr7	44286886	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44286880_C_CA:44286880:0,0,0,1
chr7	44294298	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,2:7,0:1,7,0,2
chr7	44561884	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	44571628	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,0:5,4:7,0,4,0
chr7	44575965	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=163,48;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:1,9,0,2
chr7	44606043	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=72,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,5:6,3:3,6,7,1
chr7	44606217	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	44610490	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr7	44611077	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr7	44611407	.	C	CCCCCAAGACATGCAACTTACCTAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=214,156;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	44612347	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,5,15
chr7	44612425	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=161,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:5,0:7,4:8,4,4,0
chr7	44612454	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,13:0,10:0,0,17,7
chr7	44613103	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,8:0,0:0,0,8,0
chr7	44613611	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	44619302	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	44715730	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:6,5:9,3:9,6,5,4
chr7	44715907	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=156,156;MMQ=54,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:44715907_C_CT:44715907:0,4,0,1
chr7	44715909	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=156,156;MMQ=54,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:44715907_C_CT:44715907:0,4,0,1
chr7	44715913	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=156,156;MMQ=54,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:44715907_C_CT:44715907:0,4,0,1
chr7	44715917	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=156,156;MMQ=54,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:44715907_C_CT:44715907:0,4,0,1
chr7	44715920	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	44734099	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=129,234;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:4,1:12,1:12,5,2,0
chr7	44739641	.	AG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr7	44747641	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,16;MFRL=203,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:44747641_A_T:44747641:1,1,0,1
chr7	44747644	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=203,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:44747641_A_T:44747641:1,1,0,1
chr7	44801300	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=112,103;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:7,9,0,2
chr7	44802400	.	AA	CC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44802400_AA_CC:44802400:0,0,1,0
chr7	44802407	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:44802400_AA_CC:44802400:0,0,1,0
chr7	44802412	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44802400_AA_CC:44802400:0,0,1,0
chr7	44836449	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,12;MFRL=132,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.601:6:1,1:1,0:2,0,0,4
chr7	44839331	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,3:7,2:7,7,3,2
chr7	44840864	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,4:0,14:0,0,10,10
chr7	44875043	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr7	44880684	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	44882961	.	CA	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:19,1:16,1:3,34,0,3
chr7	45010371	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=172,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:1,1,0,3
chr7	45011923	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	45077978	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:10,3:7,6:7,11,4,5
chr7	45113002	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=129,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:1,0:1,2:3,0,1,1
chr7	45122038	.	G	GATGGA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:45122038_G_GATGGA:45122038:0,0,0,1
chr7	45122040	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45122038_G_GATGGA:45122038:0,0,0,1
chr7	45122043	.	G	GAT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45122038_G_GATGGA:45122038:0,0,0,1
chr7	45122046	.	G	GAC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45122038_G_GATGGA:45122038:0,0,0,1
chr7	45122048	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:45122038_G_GATGGA:45122038:0,0,0,1
chr7	45124008	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=199,189;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:5,2,3,0
chr7	45197433	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	45223018	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr7	45697295	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:45697295_C_G:45697295:0,0,8,1
chr7	45697297	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:45697295_C_G:45697295:0,0,8,1
chr7	45725485	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	45743403	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	45747949	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,7:5,5:5,3,9,3
chr7	45753376	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=142,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:15,7,1,1
chr7	47319723	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:7,2:8,11:12,3,6,7
chr7	47319852	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.390:34:11,7:9,6:9,12,5,8
chr7	47336893	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=244,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	47408732	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:2,4,1,3
chr7	47436558	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr7	47451295	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=79.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,16:0,9:0,0,17,8
chr7	47453540	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,2:2,5:4,1,5,2
chr7	47463842	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,62;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr7	47467864	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=126,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:2,2,2,0
chr7	47474839	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:2,4,2,0
chr7	47835814	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr7	47840510	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,0:0,8:0,0,1,7
chr7	47853498	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr7	47859239	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=139,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:1,1:3,1:1,4,0,3
chr7	47869751	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:1,6,1,4
chr7	47878993	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,0:2,5:5,0,5,0
chr7	47884555	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,3:5,2:9,1,5,0
chr7	47886707	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	47898561	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,6:0,0,5,3
chr7	47904737	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=124,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:6,0,8,1
chr7	47917018	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:5,0,6,0
chr7	47917328	.	A	AAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	47943934	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=157,130;MMQ=60,59;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:3,1,2,0
chr7	47943953	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr7	47944295	.	ACTTT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47944295_ACTTT_A:47944295:0,2,0,1
chr7	47944304	.	GGA	CAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=143,182;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:47944295_ACTTT_A:47944295:0,2,0,1
chr7	47945394	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:4,7:2,3:5,1,9,1
chr7	47947863	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	47979922	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr7	47979977	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47979977_A_C:47979977:0,0,0,1
chr7	47979978	.	A	ATCTGCACCTTTTTCAGTGCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47979977_A_C:47979977:0,0,0,1
chr7	48005122	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=217,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr7	48017965	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=147,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,3:8,7:9,4,7,3
chr7	48017989	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,4:6,6:5,5,6,4
chr7	48018455	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.376:30:7,2:11,8:3,16,1,10
chr7	48046714	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=164,185;MMQ=48,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr7	48048724	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.355:15:2,2:7,3:0,10,2,3
chr7	48068553	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=189,71;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:0,8,1,2
chr7	48089394	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	48094346	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	48141357	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	48237802	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=164,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:4,3:5,5:8,1,8,1
chr7	48237824	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:3,5:5,5:7,3,7,3
chr7	48288001	.	G	GATTTCCAGTTTCATCCA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=136,131;MMQ=60,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,1:12,1:5,15,0,2
chr7	48314151	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:13,7:8,8:15,6,9,7
chr7	48317683	.	A	T	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,25:0.465:54:18,11:10,14:20,9,19,6
chr7	48319381	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:20,0:16,2:18,18,1,1
chr7	48335265	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:7,3:1,3:5,3,6,0
chr7	48412111	.	G	GGTTTTTGCATTTTTCTTTTTTCTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=14,33;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.402:3:0,1:0,0:0,2,0,1
chr7	48452254	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=89,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:48452254_G_T:48452254:1,1,0,1
chr7	48452256	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=89,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:48452254_G_T:48452254:1,1,0,1
chr7	48452258	.	A	ATGAATGGATG	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48452254_G_T:48452254:1,0,0,1
chr7	48452260	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48452254_G_T:48452254:1,0,0,1
chr7	48452264	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:48452254_G_T:48452254:1,0,0,1
chr7	48452272	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	48467355	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,2:1,4:3,3,5,2
chr7	48511297	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr7	48520780	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=119,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:11,3:9,5:6,15,2,7
chr7	48522845	.	CA	GG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=230,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	48684185	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.697:4:1,2:0,0:0,1,3,0
chr7	49951542	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AT;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	50023122	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,2,8
chr7	50023202	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	50070921	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr7	50144059	.	T	TTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.785:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	50175654	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,1:5,2:8,0,2,1
chr7	50175681	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.749:22:3,6:2,10:3,2,12,5
chr7	50179609	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr7	50191216	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=156,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.639:12:1,3:3,4:0,4,0,8
chr7	50198626	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,10,7
chr7	50468217	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=143,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,1:11,1:8,15,2,0
chr7	50512929	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr7	50514375	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,1:10,1:9,12,1,1
chr7	50537677	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=151,225;MMQ=60,56;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.402:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr7	50544269	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,5,3
chr7	50547584	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,2:0,9:0,0,6,7
chr7	50547661	.	AGCCCT	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCCCT;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.765:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	50611735	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,9,10
chr7	50663307	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=36,31;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50663307_C_T:50663307:0,3,0,1
chr7	50663309	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=36,35;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50663309_C_G:50663309:0,3,0,1
chr7	50663313	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,32;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50663307_C_T:50663307:0,3,0,1
chr7	50663314	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,33;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:50663314_A_G:50663314:0,2,0,1
chr7	50663315	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,31;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50663309_C_G:50663309:0,3,0,1
chr7	50663317	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,31;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50663307_C_T:50663307:0,3,0,1
chr7	50663319	.	C	CCAATGGGACTGGATAG	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=34,34;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:50663309_C_G:50663309:0,3,0,1
chr7	50663321	.	CAC	TGG	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=34,30;MFRL=162,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:50663307_C_T:50663307:0,3,0,1
chr7	50663325	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=149,168;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:50663314_A_G:50663314:0,2,0,1
chr7	50694429	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=178,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	50694457	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=178,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr7	50737606	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	50742118	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr7	50799889	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr7	51085127	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	51093013	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,15:0,8:0,0,10,15
chr7	51094216	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=105,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr7	51096147	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:6,2,7,1
chr7	51096263	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=162,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.144:25:8,2:14,1:8,14,2,1
chr7	51098567	.	GTCT	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=172,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.552:18:3,5:5,4:1,7,4,6
chr7	51153024	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.893:6:0,2:0,4:0|1:51153024_GT_G:51153024:0,0,1,5
chr7	51153027	.	CAATCAAAGTACTTTGTACCTATGAAGTACAAAGA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:51153024_GT_G:51153024:0,0,1,5
chr7	51251900	.	GA	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=144,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:13,3:12,1:5,21,0,4
chr7	53104078	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,3:0,0:1,2,2,2
chr7	54614596	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	54618010	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	54621526	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=125,108;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:7,7:13,4:19,1,10,2
chr7	55087139	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	55214443	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr7	55219159	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=68,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr7	55220177	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:3,3:0,5:3,0,7,1
chr7	55221655	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:1,1,4,1
chr7	55228053	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	55238283	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:55238283_C_T:55238283:2,2,0,1
chr7	55238284	.	A	ATATG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:55238283_C_T:55238283:2,2,0,1
chr7	55241755	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr7	55466371	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=155,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:3,3:0,6,0,5
chr7	55468773	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	55468816	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=130,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:7,1,3,0
chr7	55496175	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=76,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.411:15:5,2:4,4:0|1:55496175_T_C:55496175:3,6,0,6
chr7	55496179	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=143,49;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.187:14:7,0:4,2:1|0:55496175_T_C:55496175:2,10,1,1
chr7	55496183	.	A	AGTTAT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=143,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.187:14:7,0:5,2:1|0:55496175_T_C:55496175:2,10,1,1
chr7	55496186	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=143,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,2:0.187:14:7,0:4,2:1|0:55496175_T_C:55496175:2,10,1,1
chr7	55499058	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	55540791	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,8:0,10:0,0,2,17
chr7	55559875	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:6,0,6,0
chr7	55559930	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.448:29:8,7:8,5:13,3,11,2
chr7	55560190	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=144,202;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0|1:55560190_T_C:55560190:0,5,0,5
chr7	55560198	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=174,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0|1:55560190_T_C:55560190:0,6,0,3
chr7	55560207	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr7	55565247	.	TGGGGGG	T,TGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32,31;MFRL=0,207,160;MMQ=60,60,60;MPOS=33,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,10,12;RU=G;STR;TLOD=3.36,11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,3:0.286,0.571:4:0,1,2:0,0,1:0,0,4,0
chr7	55565286	.	AAGG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=154,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGG;STR;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:3,3:6,2,7,0
chr7	55873152	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=254,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:55873152_G_A:55873152:0,3,0,1
chr7	55873155	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=254,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:55873152_G_A:55873152:0,3,0,1
chr7	55873162	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=249,254;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:55873162_A_T:55873162:0,2,0,1
chr7	55873164	.	A	AGCCGAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=249,254;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:55873162_A_T:55873162:0,2,0,1
chr7	55902358	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=29,31;MFRL=242,165;MMQ=40,36;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:55902358_C_T:55902358:0,1,0,1
chr7	55902366	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=233,165;MMQ=45,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:55902358_C_T:55902358:0,2,0,1
chr7	55902370	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=233,165;MMQ=45,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:55902358_C_T:55902358:0,2,0,1
chr7	55902374	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,35;MFRL=194,242;MMQ=43,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:55902374_CG_C:55902374:0,2,0,1
chr7	55902375	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=223,165;MMQ=50,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55902358_C_T:55902358:0,1,0,1
chr7	55902376	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=194,242;MMQ=43,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:55902374_CG_C:55902374:0,2,0,1
chr7	55914417	.	ATTAGAATTGATTATCATTTGCTTAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=215,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	55990940	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=168,101;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,0:10,3:9,12,1,2
chr7	56082622	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=159.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.978:43:0,9:0,34:0,0,43,0
chr7	56119730	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=62.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,11:0,7:0,0,0,21
chr7	56122058	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=80.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,13,11
chr7	56124146	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=173,202;MMQ=60,38;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:6,0:10,3:0|1:56124146_A_T:56124146:1,15,2,1
chr7	56124154	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=172,206;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:0|1:56124146_A_T:56124146:0,13,1,2
chr7	56131910	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	56136393	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=19,20;MFRL=216,93;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr7	56136439	.	GGT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=181,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	56142519	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,0,9
chr7	56144656	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr7	56150051	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=178,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	56155219	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	56156467	.	ACT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:2,0:1,1:3,0,0,1
chr7	56183981	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,11;MFRL=125,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,0:0,0:0|1:56183981_A_C:56183981:0,3,2,0
chr7	56183985	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,12;MFRL=125,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:0,0:0|1:56183981_A_C:56183981:0,3,2,0
chr7	56183989	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=109,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0|1:56183981_A_C:56183981:0,2,2,0
chr7	57199906	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=124,92;MMQ=60,53;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.347:24:8,6:7,2:14,2,6,2
chr7	57528997	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,257;MMQ=60,52;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:5,3,3,3
chr7	63529174	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=133893,192;MMQ=48,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:3,6:1,3:4,0,9,0
chr7	63529450	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=133686,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:1,1:0,6,0,3
chr7	63537638	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:1,4:0,5:1,0,8,1
chr7	63673455	.	CT	C	.	.	DP=72;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,10:0.166:59:19,5:24,5:36,13,7,3
chr7	63673608	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,17:0.425:40:10,7:13,9:1,22,2,15
chr7	63673691	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=171,180;MMQ=44,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.620:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr7	63727328	.	T	TCAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=41,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:2,0,0,1
chr7	63982692	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=134,122;MMQ=60,43;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,2:0.046:63:30,2:28,0:35,26,0,2
chr7	63986854	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:63986854_A_G:63986854:2,2,0,1
chr7	63986856	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=152,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:63986854_A_G:63986854:2,2,0,1
chr7	64004817	.	AAC	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=110,153;MMQ=52,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=AC;STR;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,2:1,3:0,2,0,6
chr7	64166642	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr7	64166793	.	T	G	.	.	DP=102;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,75;MMQ=60,29;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:92,6:0.069:98:31,6:58,0:52,40,5,1
chr7	64168292	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=118,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,3:0.070:55:32,2:17,1:33,19,1,2
chr7	64169061	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr7	64275284	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,14:0,5:0,0,13,6
chr7	64276089	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,13:0,11:0,0,7,18
chr7	64291225	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.724:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	64291244	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:2,1:3,1:5,0,3,0
chr7	64291267	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr7	64291510	.	A	AAGGATTTTTTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64291510_A_AAGGATTTTTTT:64291510:0,1,0,1
chr7	64291511	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:64291510_A_AAGGATTTTTTT:64291510:0,1,0,1
chr7	64378768	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.476:11:2,1:2,4:0,6,0,5
chr7	64388472	.	C	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=148,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,27:0.483:56:14,11:15,16:6,23,9,18
chr7	64389067	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,125;MMQ=55,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:1,3:3,1:1,4,1,3
chr7	64389478	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:3,3,0,6
chr7	64438403	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr7	64438983	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=138,250;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:64438983_G_A:64438983:1,3,0,1
chr7	64438984	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=138,250;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:64438983_G_A:64438983:1,3,0,1
chr7	64439938	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr7	64852790	.	TTGTG	T,TTG	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32,27;MFRL=138,147,144;MMQ=60,60,60;MPOS=16,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=TG;STR;TLOD=60.77,6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,20,3:0.555,0.126:32:3,12,2:5,7,1:9,0,18,5
chr7	65419353	.	T	TTTA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TTA;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.383:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	65425894	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,10:0,10:0,0,13,8
chr7	65439879	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,8:0,0,11,10
chr7	65444359	.	T	TGA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=63.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,10,7
chr7	65551821	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr7	65552614	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	65554352	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr7	65554385	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	65556936	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	65599246	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.346:12:2,0:5,4:7,1,4,0
chr7	65599431	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,6:0,11:0,0,0,17
chr7	65610399	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,0:8,3:12,3,1,2
chr7	65705972	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:15,0:8,2:13,10,1,1
chr7	65817473	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,14:0,10:0,0,16,10
chr7	66147697	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,3:0,0,7,0
chr7	66147868	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=99,153;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,3:0,5:0,1,1,8
chr7	66262284	.	CTT	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=77.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,18,0
chr7	66262308	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=178,164;MMQ=54,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.843:15:1,7:1,6:2,0,12,1
chr7	66273789	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	66416137	.	TTG	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:7,1:8,2:0,16,1,3
chr7	66420409	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=139,77;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.209:27:10,0:10,5:17,5,5,0
chr7	66453577	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	66459399	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,0,10
chr7	66520726	.	CAA	C,CA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29,33;MFRL=217,174,179;MMQ=60,59,60;MPOS=5,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.67,40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,17:0.163,0.759:21:0,1,12:1,2,4:1,0,20,0
chr7	66532235	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	66770933	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,6:8,7:11,1,13,0
chr7	66774157	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr7	66785029	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=115.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,36:0.974:36:0,14:0,21:0,0,13,23
chr7	66785123	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=121,197;MMQ=51,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:3,8,0,2
chr7	69583231	.	TAA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,10;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=22,20;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.359:9:3,1:2,0:3,3,0,3
chr7	70229685	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=122.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,23:0,13:0,0,36,1
chr7	70236446	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	70246826	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr7	70250043	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr7	70250874	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:9,2,3,1
chr7	70252185	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:15,5:9,6:19,5,9,2
chr7	70880867	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=114,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,3:0,4:3,0,6,1
chr7	70885883	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:2,2,2,0
chr7	70886107	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr7	71036473	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr7	71135192	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=119,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	71142219	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=101,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.625:11:1,2:2,4:2,2,2,5
chr7	71176919	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr7	72093907	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,183;MMQ=40,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:4,11,1,1
chr7	72413389	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,189;MMQ=25,33;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.277:34:9,7:14,2:11,14,7,2
chr7	72416333	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr7	72416763	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,153;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.084:45:27,1:14,2:10,32,0,3
chr7	72419664	.	TACACA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=144,64;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.335:7:3,2:1,0:0|1:72419664_TACACA_T:72419664:0,5,1,1
chr7	72419671	.	C	CCTTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=144,64;MMQ=60,54;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:72419664_TACACA_T:72419664:0,5,1,1
chr7	72420626	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,190;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,3:0.078:49:19,0:27,3:11,35,1,2
chr7	72738350	.	C	CG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=55.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,7:0,0,14,3
chr7	72738749	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,42;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=156.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,40:0.976:40:0,20:0,20:0|1:72738749_A_G:72738749:0,0,24,16
chr7	72738762	.	CA	TG	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=132.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,11:0,15:0|1:72738749_A_G:72738749:0,0,15,16
chr7	72742181	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr7	72742406	.	C	CCTGAGTA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=168,151189;MMQ=25,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,2:0|1:72742406_C_CCTGAGTA:72742406:4,16,0,2
chr7	72742408	.	C	CTGGGACTACAGGTGCAT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=168,151189;MMQ=25,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:7,2:0|1:72742406_C_CCTGAGTA:72742406:4,16,0,2
chr7	72856466	.	TC	GG	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,10;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856470	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856474	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856478	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856482	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856483	.	A	ACAG	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856485	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,17;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72856488	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,17;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:72856466_TC_GG:72856466:0,0,1,0
chr7	72857230	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72857230_G_A:72857230:0,0,0,1
chr7	72857234	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72857230_G_A:72857230:0,0,0,1
chr7	72857237	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:72857230_G_A:72857230:0,0,0,1
chr7	72861796	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	72891754	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:6,2:4,2:4,7,1,3
chr7	72892843	.	C	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,3:0.077:50:24,3:22,0:21,26,3,0
chr7	72957777	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:0|1:72957777_A_G:72957777:8,0,2,0
chr7	72957779	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:0|1:72957777_A_G:72957777:8,0,2,0
chr7	72966422	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=143,153;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr7	72992894	.	T	C	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,27:0.465:58:13,13:18,13:19,12,17,10
chr7	72992926	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=21,17;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.294:26:5,1:5,0:8,10,1,7
chr7	73020011	.	GC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:7,1:10,1:12,6,0,2
chr7	73020342	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:11,1:2,1:8,6,1,1
chr7	73084471	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=216,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr7	73096993	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=117,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,2,1
chr7	73101137	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,25:0.482:52:18,13:9,12:6,21,9,16
chr7	73101223	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=126,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,1:11,1:6,15,1,1
chr7	73105144	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr7	73107003	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=89,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,5:4,2:2,6,3,4
chr7	73112066	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:73112066_G_C:73112066:1,2,0,1
chr7	73112068	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:73112066_G_C:73112066:1,2,0,1
chr7	73112069	.	G	GCACAT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:73112066_G_C:73112066:1,2,0,1
chr7	73118033	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=194,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:3,4:1,3:3,2,7,0
chr7	73118175	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:3,0:0|1:73118175_T_G:73118175:0,6,0,2
chr7	73118196	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:73118175_T_G:73118175:0,3,0,3
chr7	73118232	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr7	73118398	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	73118816	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr7	73123529	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,313;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73123529_C_T:73123529:0,0,0,1
chr7	73123542	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,313;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:73123529_C_T:73123529:0,0,0,1
chr7	73184435	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	73245519	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=202,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr7	73246461	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,4:3,6:5,0,6,4
chr7	73247070	.	G	GTGCA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73247070_G_GTGCA:73247070:0,0,0,1
chr7	73247074	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73247070_G_GTGCA:73247070:0,0,0,1
chr7	73247076	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:73247070_G_GTGCA:73247070:0,0,0,1
chr7	73254466	.	G	GTTGATGCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=193,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr7	73254910	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=14,32;MFRL=208,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.795:6:0,1:0,4:0,1,0,5
chr7	73275501	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,85;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:2,3:6,1,5,2
chr7	73275616	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=58,184;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,0,1
chr7	73279233	.	CAAAA	C,CAAAAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35,33;MFRL=183,168,125;MMQ=60,60,40;MPOS=26,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,10,15;RU=A;STR;TLOD=3.07,5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,4:0.222,0.544:6:0,0,0:1,1,3:1,0,4,1
chr7	73467650	.	CTGTG	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=19,26;MFRL=112,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=TG;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.647:3:0,1:0,0:0|1:73467650_CTGTG_C:73467650:0,1,0,2
chr7	73467685	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=216,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1|0:73467650_CTGTG_C:73467650:0,4,0,1
chr7	73467696	.	G	GAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,0:4,1:1|0:73467650_CTGTG_C:73467650:0,4,0,1
chr7	73470782	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=97.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,8:0,20:0,0,6,23
chr7	73472050	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.425:45:15,8:11,11:5,21,9,10
chr7	73479946	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=176,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.591:5:1,1:0,2:1,1,3,0
chr7	73480163	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,1:0,0:0|1:73480163_C_A:73480163:1,1,0,1
chr7	73480165	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:73480163_C_A:73480163:1,1,0,1
chr7	73530046	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	73604754	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=194,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	73752699	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr7	73790642	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.086:33:16,1:11,1:14,17,1,1
chr7	73801019	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	73803567	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=34,29;MFRL=172,76;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,0:2,2:0|1:73803567_C_T:73803567:1,10,0,2
chr7	73803569	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=171,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:73803567_C_T:73803567:1,11,0,2
chr7	73803570	.	G	GTA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=171,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:73803567_C_T:73803567:1,11,0,2
chr7	73803573	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=171,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:3,2:0|1:73803567_C_T:73803567:1,11,0,2
chr7	73803644	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=234,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr7	73933734	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=133,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:6,2:7,2:11,2,2,2
chr7	73944277	.	TG	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,155;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,0:2,2:1,7,0,2
chr7	73959173	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=141,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.217:18:9,1:4,1:1,13,4,0
chr7	73960026	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=137,3829130;MMQ=60,43;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:14,0:13,2:19,8,0,2
chr7	74005132	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,0:9,2:14,2,2,0
chr7	74103655	.	TTA	CAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	74105219	.	ATGT	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGT;STR;TLOD=110.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,14:0,10:0,0,25,0
chr7	74120860	.	G	GTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=208,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74120860_G_GTTT:74120860:0,1,0,1
chr7	74120861	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=208,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:74120860_G_GTTT:74120860:0,1,0,1
chr7	74120863	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=208,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:1,0:0,1:0|1:74120860_G_GTTT:74120860:0,1,0,1
chr7	74152563	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=307,273;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	74167356	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,120;MMQ=60,37;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.924:10:0,2:0,7:0,0,9,1
chr7	74170000	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,297;MMQ=60,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74170000_T_TG:74170000:0,0,0,1
chr7	74170001	.	T	TTGTTGTTG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,297;MMQ=60,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74170000_T_TG:74170000:0,0,0,1
chr7	74193668	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=137,150;MMQ=49,25;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:7,8:10,5:11,6,11,2
chr7	74251390	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,9:0,0,0,17
chr7	74251531	.	TGGCAAAAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=251,234;MMQ=27,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74251531_TGGCAAAAA_T:74251531:0,1,0,1
chr7	74251543	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=251,234;MMQ=27,27;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:74251531_TGGCAAAAA_T:74251531:0,1,0,1
chr7	74470190	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=224,248;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.313:10:5,1:2,1:2,5,1,2
chr7	74524951	.	CT	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=154,157;MMQ=27,23;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:24,0:15,4:1,38,0,4
chr7	75048564	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,138;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.660:21:4,5:2,9:6,1,12,2
chr7	75048750	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=148,160;MMQ=54,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.432:31:6,7:11,6:6,12,1,12
chr7	75048804	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=170,184;MMQ=52,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:3,3:9,3:0,13,0,6
chr7	75053572	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,153;MMQ=40,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.546:33:5,7:9,11:0,15,1,17
chr7	75055097	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,175;MMQ=27,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:5,4:2,6:1,6,0,11
chr7	75070642	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,154;MMQ=47,26;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:2,0:6,4:4,4,4,0
chr7	75145411	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=148.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,49:0.981:49:0,27:0,21:0,0,42,7
chr7	75155143	.	GAA	G,GAAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,34,35;MFRL=164,187,170;MMQ=60,58,60;MPOS=15,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=A;STR;TLOD=3.30,9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:21,2,6:0.090,0.206:29:8,0,2:13,2,4:21,0,8,0
chr7	75155300	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,167;MMQ=48,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:9,1:5,6:1,14,1,6
chr7	75168562	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	75182965	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=233,133;MMQ=50,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:75182965_C_T:75182965:0,2,0,1
chr7	75182967	.	CC	TG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=233,133;MMQ=50,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:75182965_C_T:75182965:0,2,0,1
chr7	75182969	.	ATC	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=233,133;MMQ=50,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:75182965_C_T:75182965:0,2,0,1
chr7	75182974	.	G	GTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=233,133;MMQ=50,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:75182965_C_T:75182965:0,2,0,1
chr7	75183403	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:5,2:2,1:5,3,3,0
chr7	75185985	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr7	75186901	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	75190526	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:8,0,3,0
chr7	75399196	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75399196_TA_T:75399196:0,0,0,1
chr7	75399198	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75399196_TA_T:75399196:0,0,0,1
chr7	75441108	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=146,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.499:12:5,2:1,3:0|1:75441108_C_T:75441108:2,4,4,2
chr7	75441111	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=146,107;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:5,4:1,3:0|1:75441108_C_T:75441108:2,4,4,3
chr7	75442855	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	75443129	.	C	CTTAG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=221,131;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	75610763	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr7	75612770	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=137,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,6:2,1:0|1:75612770_C_G:75612770:5,0,6,1
chr7	75612783	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:0|1:75612770_C_G:75612770:5,1,5,1
chr7	75613998	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,3:4,1:5,0,4,0
chr7	75614029	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.532:13:3,5:3,2:6,0,7,0
chr7	75614082	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=186,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:5,6:8,7:8,5,10,3
chr7	75614863	.	TG	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,0:3,0,1,2
chr7	75616727	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=136,33;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:7,2:4,0:5,8,1,1
chr7	75616817	.	GGACA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GACA;STR;TLOD=52.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr7	75617430	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:2,3,2,2
chr7	75621661	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr7	75633209	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,5:0,0,0,9
chr7	75689846	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=165,37;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,0:6,2:1,8,1,1
chr7	75692927	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=124,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:5,3:2,5,1,6
chr7	75693009	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=193,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr7	75694079	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=127,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:5,1,3,1
chr7	75694345	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:0,6,0,6
chr7	75889370	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=9,17;MFRL=233,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:75889370_C_G:75889370:0,1,1,0
chr7	75889376	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=13,36;MFRL=233,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:75889370_C_G:75889370:0,1,1,0
chr7	75889382	.	GCGCGC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=233,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:75889370_C_G:75889370:0,1,1,0
chr7	75910691	.	CTCTCTG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTCTG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	75914934	.	G	GC	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=146.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,45:0.979:45:0,23:0,21:0,0,25,20
chr7	75933441	.	A	C	.	.	DP=80;ECNT=1;MBQ=30,13;MFRL=149,178;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,12:0.154:70:24,2:20,2:22,36,12,0
chr7	75959499	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=118,40;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,0:4,2:0|1:75959499_C_CA:75959499:2,8,1,1
chr7	75959501	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=118,40;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:75959499_C_CA:75959499:2,8,1,1
chr7	75959509	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=117,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.337:10:3,1:3,2:0|1:75959499_C_CA:75959499:2,5,1,2
chr7	76023029	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	76023088	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	76023131	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,2:0,0,6,1
chr7	76026792	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76026792_G_C:76026792:0,0,1,0
chr7	76026796	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76026792_G_C:76026792:0,0,1,0
chr7	76026799	.	TG	AC	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,13;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:76026792_G_C:76026792:0,0,1,0
chr7	76026804	.	CGG	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76026792_G_C:76026792:0,0,1,0
chr7	76026811	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:76026792_G_C:76026792:0,0,1,0
chr7	76027235	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr7	76028163	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=128,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.411:22:4,3:9,5:3,10,2,7
chr7	76033544	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr7	76033805	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	76054405	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	76058767	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	76062770	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=132,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:2,4:5,6:7,1,6,5
chr7	76069481	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=202,221;MMQ=27,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:0,0:2,1:0|1:76069481_G_A:76069481:2,0,2,0
chr7	76069486	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=215,221;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0|1:76069481_G_A:76069481:1,0,2,0
chr7	76069553	.	G	T	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=166,231;MMQ=40,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:23,1:21,2:39,5,0,3
chr7	76069972	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,155;MMQ=52,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,5:3,3:2,5,0,8
chr7	76112487	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=246,160;MMQ=27,39;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr7	76133863	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=220,218;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr7	76140449	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=142,163;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.309:20:6,2:8,3:0,14,0,6
chr7	76142329	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=123,151;MMQ=53,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:10,0,5,1
chr7	76239480	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,27;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,8:0,0,17,0
chr7	76239503	.	G	GC	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=88.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,11:0,18:0,0,22,9
chr7	76240727	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr7	76240785	.	CA	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,15:0,15:0,0,22,8
chr7	76241144	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=170,171;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,5:5,3:11,0,0,8
chr7	76241211	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=195,170;MMQ=27,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,15:0.800:18:2,3:1,7:0|1:76241211_C_T:76241211:0,3,2,13
chr7	76241216	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=219,170;MMQ=31,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=65.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,17:0.857:19:1,7:1,9:0|1:76241211_C_T:76241211:0,2,2,15
chr7	76255032	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=134.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.975:37:0,14:0,23:0,0,2,35
chr7	76255452	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,1,15
chr7	76255491	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr7	76883989	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr7	76912016	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:16,2:16,1:23,11,1,2
chr7	76941547	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0|1:76941547_C_A:76941547:0,2,0,4
chr7	76941549	.	A	AAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0|1:76941547_C_A:76941547:0,2,0,4
chr7	76942959	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0,4,0,4
chr7	76950035	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=150,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:6,5:1,4:7,0,8,2
chr7	76955592	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr7	76958730	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=113.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,18:0,14:0,0,10,22
chr7	76984752	.	CAA	C,CA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,31,35;MFRL=154,109,175;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=4.77,6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,4:0.223,0.237:20:2,3,2:4,2,2:4,7,2,7
chr7	77210927	.	GA	AG,GCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,29,32;MFRL=187,194,161;MMQ=60,60,60;MPOS=5,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:1,1,0:1,0,1:0,4,0,2
chr7	77214964	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.183:14:6,0:6,2:0|1:77214964_T_C:77214964:0,12,1,1
chr7	77214971	.	T	TACACTTG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:77214964_T_C:77214964:0,10,1,1
chr7	77214973	.	A	ATTAGT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:77214964_T_C:77214964:0,10,1,1
chr7	77214975	.	C	CTACCT	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,1:0|1:77214964_T_C:77214964:0,10,1,1
chr7	77227338	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	77256805	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,7:4,2:3,3,6,3
chr7	77398201	.	G	GAAATTACTAGT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,2:7,0:0,16,0,2
chr7	77402479	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:10,2:13,0:17,8,2,0
chr7	77469472	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,3:2,5:5,0,8,0
chr7	77539744	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,2,18
chr7	77567008	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.286:22:7,4:8,2:16,0,6,0
chr7	77584159	.	AT	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.162:38:11,2:14,3:19,13,3,3
chr7	77708372	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,153;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:0|1:77708372_C_T:77708372:4,11,0,3
chr7	77708380	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=158,153;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,0:8,3:0|1:77708372_C_T:77708372:3,12,0,3
chr7	77755197	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr7	77756580	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr7	77756724	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	77762457	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	77764591	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	77830410	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.470:39:8,7:10,11:18,3,17,1
chr7	77885844	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:7,0:4,2:3,9,0,2
chr7	78119199	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr7	78119221	.	G	GAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,19;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.826:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr7	78119231	.	G	GGCTGGTTGTAGTGGCTCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=199,283;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.383:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	78256643	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	79818171	.	GGT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GT;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,1:6,0,2,0
chr7	79828450	.	CTT	C,CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32,31;MFRL=0,205,153;MMQ=60,60,60;MPOS=14,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=4.18,6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.375,0.500:5:0,2,1:0,0,2:0,0,5,0
chr7	79833074	.	A	G	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=72.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,26:0.413:63:24,8:13,17:13,24,8,18
chr7	79841954	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	80141069	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=52.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,10:0,5:0,0,9,6
chr7	80290369	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=78.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,12:0,10:0,0,15,7
chr7	80292315	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,1:8,1:15,6,2,0
chr7	80378148	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr7	80378175	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr7	80456708	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:5,2:0,1:5,1,3,0
chr7	80456841	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=149.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,43:0.979:43:0,19:0,23:0,0,8,35
chr7	81346660	.	ATC	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=177,68;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.266:9:3,2:3,0:0|1:81346660_ATC_A:81346660:4,3,1,1
chr7	81346665	.	G	GGGTA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=177,68;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:3,1:2,0:0|1:81346660_ATC_A:81346660:4,3,1,1
chr7	81346685	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,2:0,0,4,7
chr7	81350208	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,2:0,3:0,0,1,6
chr7	81350223	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	81359116	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.858:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	81372156	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr7	81374477	.	G	GTGAACACTTTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=185,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr7	81374500	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	81381326	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	81381621	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr7	81591826	.	TA	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=144,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,4:0.089:54:17,2:20,2:7,43,1,3
chr7	81593454	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:7,10:2,7:3,6,4,13
chr7	81596813	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=168,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:1,5:6,4:7,0,9,0
chr7	81603871	.	G	GAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=144,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,1:2,1:2,5,0,6
chr7	81641570	.	GA	G,GAAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34,25;MFRL=77,134,123;MMQ=60,60,60;MPOS=28,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,16;RU=A;STR;TLOD=3.26,8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.230,0.341:9:1,1,1:1,1,0:1,3,0,5
chr7	81642949	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=186,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:7,7:5,4:0,12,0,11
chr7	81693755	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=170,182;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:7,6:10,0:0,17,0,6
chr7	81693768	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.592:13:2,6:3,2:0,5,0,8
chr7	81765862	.	C	CTTAAAAACT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=213,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr7	81765996	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=213,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr7	82388117	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:82388117_T_A:82388117:0,1,0,1
chr7	82388120	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:82388117_T_A:82388117:0,1,0,1
chr7	82388122	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:82388117_T_A:82388117:0,1,0,1
chr7	82388124	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:82388117_T_A:82388117:0,1,0,1
chr7	82474581	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.095:29:11,0:15,2:20,7,2,0
chr7	82532115	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr7	82581488	.	T	TTCA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCA;STR;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr7	82763804	.	G	T	.	.	DP=80;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=130,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,5:0.064:73:40,1:26,3:33,35,3,2
chr7	82763813	.	A	G	.	.	DP=69;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,3:0.049:61:31,2:24,1:28,30,1,2
chr7	82764235	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=110,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=83.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,28:0.684:41:8,13:3,15:8,5,19,9
chr7	82784017	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=136,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:1,2,3,0
chr7	82785732	.	A	ATAGT,AGCCCCTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31,29;MFRL=168,112,158;MMQ=60,60,60;MPOS=14,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.08,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,0:2,1,1:0,4,0,2
chr7	82996831	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,2:3,3:7,0,6,0
chr7	82997412	.	A	AACAGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=172,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.390:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr7	83021799	.	TAAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.716:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	83023587	.	TAC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=226,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.853:11:1,6:0,4:1,0,8,2
chr7	83026100	.	C	CAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=116,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	83029280	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:1,9:6,2:7,0,11,0
chr7	83029438	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,30:0.659:45:10,15:5,14:8,7,16,14
chr7	83029639	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.346:9:4,1:2,1:0,6,0,3
chr7	83031907	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,6:0,0,15,0
chr7	83034899	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:7,4:0,2:1,6,0,6
chr7	83035177	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	83036363	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=162,166;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:2,1,1,0
chr7	83036367	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=163,164;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:2,0,1,1
chr7	83036602	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=190,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr7	83047666	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.414:32:8,6:10,7:19,0,12,1
chr7	83047883	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,1:4,6:0,7,0,7
chr7	83098714	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.776:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr7	83277699	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.397:13:5,3:3,2:8,0,5,0
chr7	83606353	.	T	TGA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GA;STR;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr7	83631376	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,5:1,2:1,4,1,6
chr7	83631414	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=149,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,0:0,4:0,2,0,4
chr7	83631449	.	CAAAG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=174,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr7	83643681	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=117,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0|1:83643681_A_T:83643681:1,5,0,2
chr7	83643687	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:83643681_A_T:83643681:0,6,0,2
chr7	83823737	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr7	84644346	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,13,2
chr7	84647477	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=84.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,16:0,8:0,0,23,1
chr7	84670012	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=121,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,30:0.554:54:9,17:15,13:13,11,15,15
chr7	84751259	.	TA	T,TAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32,30;MFRL=157,112,156;MMQ=60,60,60;MPOS=25,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.10,4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.227,0.304:10:1,1,2:2,1,0:0,5,0,5
chr7	86394719	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=159,172;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:5,0:14,2:13,9,2,0
chr7	86522420	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,60;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.214:15:3,2:7,1:1,11,0,3
chr7	86556236	.	CAAAAAAAA	C,CAAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26,19;MFRL=210,118,153;MMQ=60,60,60;MPOS=32,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=21,13,17;RU=A;STR;TLOD=3.51,3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.337,0.333:3:0,1,0:1,0,0:0,1,0,2
chr7	86556256	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	86567364	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=207,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr7	86574455	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=196,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr7	86594379	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,3:6,0:2,6,2,1
chr7	86594423	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=89,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr7	86795947	.	TAG	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=69.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.514:35:8,13:5,4:3,14,3,15
chr7	86803994	.	T	TG	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=55.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,20:0.456:44:8,12:16,8:3,21,2,18
chr7	86811456	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=125,191;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr7	86811525	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,8:4,5:7,2,12,1
chr7	86978347	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=177.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,51:0.982:51:0,32:0,19:0,0,46,5
chr7	86998842	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:6,9:4,5:4,6,1,13
chr7	87005287	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.662:16:3,5:2,4:0,5,0,11
chr7	87006567	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr7	87011349	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=101.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,13:0,0,19,10
chr7	87022024	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,10,1
chr7	87031690	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=192,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.476:11:2,0:3,5:0,6,0,5
chr7	87032613	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=84.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,14:0,9:0,0,3,20
chr7	87046896	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=174,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr7	87053206	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr7	87053465	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=200,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr7	87056011	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr7	87056242	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,67;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,2:7,0:5,15,1,1
chr7	87060795	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=130,103;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,0:5,2:7,9,0,2
chr7	87069425	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=203,189;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr7	87069758	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	87072840	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=194,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:2,2:0,4,1,3
chr7	87074281	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=146,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:1,1:4,0:0,5,0,1
chr7	87074294	.	GAG	CTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr7	87138511	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr7	87165697	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,3:5,0:7,0,3,0
chr7	87168749	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	87173667	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	87174066	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr7	87178626	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr7	87179086	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	87179143	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr7	87180198	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	87369106	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=145,76;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:7,5:7,0:10,4,4,1
chr7	87485539	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=168,203,154;MMQ=60,60,60;MPOS=13,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,13;RU=A;STR;TLOD=6.59,4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,4,2:0.208,0.130:20:7,2,1:7,2,1:14,0,6,0
chr7	87526550	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.890:7:0,3:0,2:0,0,6,1
chr7	87529688	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,174;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:20,0:19,3:8,31,0,3
chr7	87564277	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,4:8,6:12,0,9,1
chr7	87737592	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:5,4:3,6:6,3,5,5
chr7	87744034	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.464:11:5,3:1,2:0|1:87744034_T_TA:87744034:0,6,1,4
chr7	87744037	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:4,4:1,2:0|1:87744034_T_TA:87744034:0,6,1,5
chr7	87759588	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr7	87763538	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	87825689	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=149,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,6:6,1:7,1,8,0
chr7	87840158	.	G	GA	.	.	DP=85;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=101.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,45:0.603:74:15,24:14,21:23,6,32,13
chr7	87848350	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:87848350_C_G:87848350:1,0,0,1
chr7	87848351	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:87848350_C_G:87848350:1,0,0,1
chr7	87848352	.	C	CATCATCAT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:87848350_C_G:87848350:1,0,0,1
chr7	88424365	.	CAA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,2:5,4:1,6,0,6
chr7	88424404	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:0,7,0,4
chr7	88847450	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:8,3:5,2:0|1:88847450_TA_T:88847450:10,3,3,2
chr7	88847453	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:8,3:5,2:0|1:88847450_TA_T:88847450:10,3,3,2
chr7	88963213	.	AA	CC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=144,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.143:22:11,0:8,0:16,3,0,3
chr7	89792250	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=64.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,13,5
chr7	89797251	.	CT	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:89797251_CT_GA:89797251:0,1,0,1
chr7	89797259	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:89797251_CT_GA:89797251:0,1,0,1
chr7	89797261	.	CG	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=11,28;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:89797251_CT_GA:89797251:0,1,0,1
chr7	89861942	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr7	89867369	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=136,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,19:0.444:43:13,11:11,8:21,3,15,4
chr7	89867446	.	T	TCTG	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CTG;STR;TLOD=70.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.476:42:12,13:9,4:11,11,11,9
chr7	89901039	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,9:0,3:0,0,5,8
chr7	89927191	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr7	89929110	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:2,3:3,0:6,0,3,0
chr7	89929325	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=145,146;MMQ=60,33;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,2:0.052:55:27,2:21,0:0|1:89929325_G_A:89929325:27,26,2,0
chr7	89929331	.	A	G	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=145,146;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,2:0.054:54:28,2:22,0:0|1:89929325_G_A:89929325:25,27,2,0
chr7	89937027	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.495:8:2,0:2,4:4,0,3,1
chr7	89937210	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0,10,0,2
chr7	89976137	.	GTTC	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=125,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTC;STR;TLOD=78.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,22:0.443:50:15,9:11,13:8,20,7,15
chr7	89982132	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=135,167;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.448:29:10,5:6,7:12,4,11,2
chr7	90003694	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:0,1,2,6
chr7	90014111	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr7	90042857	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,4:4,1:1,6,0,5
chr7	90225928	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr7	90233618	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,5,12
chr7	90339089	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,96;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:6,2:12,0:17,2,2,0
chr7	90356175	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr7	90492639	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=157,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr7	90584944	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr7	90747315	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr7	90894252	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	90894459	.	A	ACCG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=196,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CCG;STR;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,2:1,0,6,0
chr7	90895968	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.374:11:2,1:4,0:6,1,4,0
chr7	90895977	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,13;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.341:12:4,1:3,0:7,1,4,0
chr7	90898870	.	T	A	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,36:0.599:60:13,21:10,15:12,12,13,23
chr7	90899650	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,1:8,1:18,1,2,0
chr7	90900521	.	G	C	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,23:0.484:48:14,11:9,12:13,12,10,13
chr7	91570290	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	91660989	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=179,281;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:91660989_T_C:91660989:0,3,0,1
chr7	91660995	.	CG	TA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=179,281;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:91660989_T_C:91660989:0,3,0,1
chr7	91669960	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:3,1:5,4:8,0,4,2
chr7	91681941	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=220,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr7	91694487	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:19,0,2,0
chr7	91725917	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=178,151;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr7	91725946	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=166,169;MMQ=60,33;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:9,0:12,0,2,0
chr7	91761050	.	GT	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=136,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:13,4:13,1:24,4,4,1
chr7	91863872	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,9:0.157:61:25,1:27,8:23,29,3,6
chr7	91864134	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=133,36;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:20,0:10,2:0|1:91864134_A_C:91864134:23,9,1,1
chr7	91864138	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=134,36;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:22,0:11,2:0|1:91864134_A_C:91864134:24,9,1,1
chr7	91980489	.	G	GACA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr7	92016022	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=193,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,1,2
chr7	92020452	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:6,1:7,2:12,1,3,0
chr7	92027187	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr7	92077203	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=207,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr7	92100581	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr7	92119284	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=125,178;MMQ=54,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr7	92129161	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,19;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:0,1:0,0:0,3,1,2
chr7	92135686	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,5:3,3:0,4,0,8
chr7	92136447	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,0:4,6:2,7,0,7
chr7	92140397	.	C	T	.	.	DP=73;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,30:0.464:65:20,14:14,16:8,27,8,22
chr7	92140455	.	CTT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:1,4:3,2:0,5,0,6
chr7	92147584	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=93.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,35:0.499:70:12,13:22,21:6,29,8,27
chr7	92157802	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr7	92166146	.	CT	C,CTT	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=33,32,33;MFRL=154,119,157;MMQ=60,60,60;MPOS=11,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.72,4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,8,5:0.147,0.106:49:18,3,4:15,5,1:28,8,11,2
chr7	92207339	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,17:0.489:35:11,8:6,9:17,1,17,0
chr7	92244422	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=67.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,19,0
chr7	92244630	.	TATACA	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATACA;STR;TLOD=110.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.967:25:0,11:0,14:0,0,1,24
chr7	92247333	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	92355033	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=70.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,23:0.559:41:7,7:11,16:8,10,8,15
chr7	92355120	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,154;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:2,12,0,3
chr7	92732200	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,122;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:13,0:18,3:13,18,0,3
chr7	92764393	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr7	92818503	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,4:7,4:11,3,6,2
chr7	92826772	.	AT	A	.	.	DP=87;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,6:0.097:69:33,1:28,5:32,31,3,3
chr7	92855628	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=73,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,1:4,0,3,0
chr7	92869138	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=154,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:7,2,2,0
chr7	92900512	.	G	GT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.251:29:8,6:12,2:17,4,7,1
chr7	93063694	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=187,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:93063694_G_C:93063694:0,3,0,1
chr7	93063695	.	C	CAGAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=187,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:93063694_G_C:93063694:0,3,0,1
chr7	93067334	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.463:26:8,4:5,7:13,1,10,2
chr7	93073147	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	93098135	.	T	TAAACAAACAAAC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,6;RU=AAAC;STR;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr7	93116138	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr7	93116391	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=204,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr7	93516077	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr7	93518486	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:2,4:8,7:5,5,7,4
chr7	93519390	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0|1:93519390_C_T:93519390:3,0,2,0
chr7	93519400	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=208,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.574:5:0,0:2,3:0|1:93519390_C_T:93519390:2,0,3,0
chr7	93519658	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,205;MMQ=60,37;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0,9,0,2
chr7	93519803	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=186,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr7	93551428	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=91.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,12:0,14:0,0,19,7
chr7	93555311	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr7	93623458	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=277,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	94027043	.	CT	C	.	.	DP=135;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,7:0.079:98:41,2:46,5:21,70,1,6
chr7	94030856	.	AT	A,ATT	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=145,145,150;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=10.79,4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,8,4:0.162,0.098:47:16,7,2:16,1,2:28,7,11,1
chr7	94033800	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr7	94034901	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=137,129;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,2:5,1:10,2,3,0
chr7	94038649	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:5,4:6,8:7,5,9,4
chr7	94039032	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=69.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,12:0,8:0,0,10,10
chr7	94039900	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr7	94040133	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,8:0,0,13,1
chr7	94040287	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,7:0,0,5,13
chr7	94040345	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,14;MFRL=123,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.533:6:2,0:0,1:2,1,0,3
chr7	94043493	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=82.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,18,7
chr7	94055933	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr7	94056244	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr7	94056251	.	GAA	G,AAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35,34;MFRL=0,153,166;MMQ=60,60,60;MPOS=17,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=22.37,5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.636,0.273:8:0,3,1:0,3,1:0,0,8,0
chr7	94146975	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=91.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,14:0,11:0,0,11,14
chr7	94157585	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,23;MFRL=75,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.542:9:2,3:2,2:2,2,0,5
chr7	94157605	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=155,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,2:4,0:0|1:94157605_A_T:94157605:0,8,1,1
chr7	94157608	.	C	CAGAATAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=155,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:94157605_A_T:94157605:0,6,1,1
chr7	94174854	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=136.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,16:0,21:0,0,25,13
chr7	94175073	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	94178749	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:94178749_T_C:94178749:0,0,8,0
chr7	94178761	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.904:8:0,3:0,5:0|1:94178749_T_C:94178749:0,0,8,0
chr7	94183953	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:6,0:8,2:0,15,0,2
chr7	94296075	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:12,2:6,0:5,13,2,0
chr7	94879662	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr7	94897801	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	94931675	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94931675_A_AC:94931675:0,3,0,1
chr7	94931676	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94931675_A_AC:94931675:0,3,0,1
chr7	94931678	.	C	CAACA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94931675_A_AC:94931675:0,3,0,1
chr7	94931680	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94931675_A_AC:94931675:0,3,0,1
chr7	94931684	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=148,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:94931675_A_AC:94931675:0,3,0,1
chr7	94947799	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr7	94953895	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=196,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr7	94991632	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,151;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,5:2,3:5,0,6,2
chr7	95024046	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:0,7,1,5
chr7	95034821	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.533:17:3,2:4,7:1,7,0,9
chr7	95125050	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,3:0,0:0,0,4,1
chr7	95165864	.	T	TTAGC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:95165864_T_TTAGC:95165864:0,1,0,1
chr7	95165866	.	A	ACAGAGACACCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:95165864_T_TTAGC:95165864:0,1,0,1
chr7	95165869	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:95165864_T_TTAGC:95165864:0,1,0,1
chr7	95167136	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=189,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr7	95167163	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=208,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr7	95216943	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,2108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,0:2,5:3,1,5,0
chr7	95221920	.	A	AGCACAAAACCTTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=124,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:0|1:95221920_A_AGCACAAAACCTTC:95221920:2,14,0,2
chr7	95221927	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=126,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:95221920_A_AGCACAAAACCTTC:95221920:2,16,0,2
chr7	95442420	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,20;MFRL=176,247;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.532:4:1,1:0,0:2,0,2,0
chr7	95442425	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=15,14;MFRL=173,321;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:95442425_T_A:95442425:3,0,1,0
chr7	95442428	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=13,14;MFRL=163,321;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:95442425_T_A:95442425:4,0,1,0
chr7	95442431	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,21;MFRL=152,261;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:1,0:3,0,2,0
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chr7	95709602	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr7	95709666	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:7,7:8,8:14,1,14,1
chr7	95775848	.	TA	T,TAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,24,32;MFRL=154,111,123;MMQ=60,60,60;MPOS=7,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=6.45,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,6,4:0.223,0.183:23:4,3,2:7,1,1:11,2,8,2
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chr7	96338910	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,3:0,0,7,1
chr7	96338929	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,11,2
chr7	96635363	.	GGCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=93,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GCA;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,2:2,0:2,1,0,2
chr7	96637153	.	GA	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=183,75;MMQ=60,55;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.230:12:7,0:2,2:3,7,1,1
chr7	96747192	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=140,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.426:38:11,9:10,7:9,13,5,11
chr7	97365522	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=183,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:13,2:1,2:13,1,4,0
chr7	97481812	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=254,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr7	97486213	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,5:5,3:0,7,1,7
chr7	97488146	.	G	GT	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=139,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,24:0.492:48:14,10:9,14:21,3,16,8
chr7	97488733	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr7	97780581	.	AT	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	97784061	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=146,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:4,2:6,3:7,3,2,4
chr7	97800993	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=202,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr7	97814274	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:8,3:9,0:17,1,2,1
chr7	97816327	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.633:22:4,5:3,9:1,7,2,12
chr7	97820868	.	CA	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:97820868_CA_C:97820868:0,0,1,0
chr7	97820891	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,17;MFRL=94,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:97820868_CA_C:97820868:1,1,1,0
chr7	97820899	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=187,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:97820868_CA_C:97820868:2,1,1,0
chr7	97820907	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,17;MFRL=187,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:97820868_CA_C:97820868:2,1,1,0
chr7	97821855	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,7:2,2:5,2,5,4
chr7	97822017	.	C	CATCCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=174,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:0|1:97822017_C_CATCCA:97822017:7,2,0,2
chr7	97822020	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=174,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:5,2:3,0:0|1:97822017_C_CATCCA:97822017:7,2,0,2
chr7	97823125	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:5,0,4,1
chr7	97823524	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,2:7,0:6,4,1,1
chr7	97823629	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,4:5,3:6,4,3,4
chr7	97823879	.	G	GCGATACTTTGTT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	97834917	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=207,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:97834917_G_C:97834917:0,1,0,1
chr7	97834919	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=26,35;MFRL=207,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:97834917_G_C:97834917:0,1,0,1
chr7	97834923	.	AT	GG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:97834917_G_C:97834917:0,0,0,1
chr7	97834931	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:97834917_G_C:97834917:0,0,0,1
chr7	97834933	.	GAA	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:97834917_G_C:97834917:0,0,0,1
chr7	97834938	.	G	GTT	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:97834917_G_C:97834917:0,0,0,1
chr7	97841618	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,24:0.585:41:7,17:9,7:9,8,18,6
chr7	97846856	.	CGAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr7	97847440	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=164,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr7	97851109	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=79.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,7:0,18:0,0,1,24
chr7	97852899	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr7	97862652	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,13;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,0:0|1:97862652_T_C:97862652:0,0,3,0
chr7	97862654	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,16;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr7	97862663	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=38,13;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,0:0,1:0|1:97862652_T_C:97862652:2,0,3,0
chr7	97862665	.	CT	GC	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,9;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,0:0,0:0|1:97862652_T_C:97862652:2,0,3,0
chr7	97862670	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=16,32;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:0,3:0|1:97862652_T_C:97862652:3,0,3,0
chr7	97862672	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=16,26;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:0,3:0|1:97862652_T_C:97862652:3,0,3,0
chr7	97862677	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=16,29;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:0,2:0|1:97862652_T_C:97862652:3,0,2,0
chr7	97862679	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=16,29;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:0,2:0|1:97862652_T_C:97862652:3,0,2,0
chr7	97870575	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=160,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:5,0:12,3:6,12,0,3
chr7	97911618	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.495:20:4,5:6,4:9,1,7,3
chr7	97920623	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr7	97921834	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=170,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:3,4:5,0,4,0
chr7	97922773	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,5:6,6:12,0,8,3
chr7	97935671	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr7	97935868	.	A	AAGTGGTCAGAGGTGATTGAATTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=230,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.356:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr7	97944744	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:1,2,3,2
chr7	97944933	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.396:8:2,1:3,2:0|1:97944933_A_AT:97944933:0,5,0,3
chr7	97944935	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.453:9:2,1:3,2:0|1:97944933_A_AT:97944933:0,5,0,4
chr7	97944937	.	A	ATAAT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=16.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,2:3,2:0|1:97944933_A_AT:97944933:0,4,0,5
chr7	97944986	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=160,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr7	97946450	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,166;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.394:15:3,0:6,4:9,0,6,0
chr7	97949650	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,18:0.513:35:7,10:10,8:5,12,6,12
chr7	97991792	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:7,10:5,8:0,12,0,18
chr7	98445674	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:20,0:15,1:23,13,2,0
chr7	98478974	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,175;MMQ=56,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	98495299	.	G	GTT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=186,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=T;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:9,2:3,1:11,1,3,0
chr7	98495304	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,4:4,1:10,2,5,0
chr7	98500956	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr7	98503707	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,1:1,6:2,0,6,1
chr7	98506669	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,107;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr7	98513300	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=123,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:3,3:4,2,3,1
chr7	98548682	.	C	CTGTGTGTGTG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=0,158;MMQ=32,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=17,22;RU=TG;STR;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.534:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr7	98556962	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=111,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,11:0.293:39:12,9:14,2:13,15,4,7
chr7	98558880	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:5,1,4,1
chr7	98562372	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:12,0:9,12,1,1
chr7	98581030	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.091:46:21,2:20,1:16,26,3,1
chr7	98587990	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,129;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr7	98602990	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=176,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,4:4,6:3,4,1,9
chr7	98609670	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr7	98630587	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.335:16:3,2:8,3:8,3,5,0
chr7	98637916	.	ACG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CG;STR;TLOD=34.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,2:1,8:3,0,10,0
chr7	98639904	.	ATT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=181,247;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.245:6:2,1:2,0:0,5,0,1
chr7	98643397	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,9:0.171:56:21,3:24,6:18,29,2,7
chr7	98648517	.	TGG	T,TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29,28;MFRL=87,145,118;MMQ=60,60,60;MPOS=31,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=G;STR;TLOD=3.61,16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,7:0.213,0.574:11:2,1,1:0,1,6:2,0,9,0
chr7	98650099	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,0:3,4:0,7,1,3
chr7	98655223	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,38599946;MMQ=60,44;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:98655223_G_T:98655223:0,0,0,1
chr7	98655225	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,38599946;MMQ=60,44;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:98655223_G_T:98655223:0,0,0,1
chr7	98775483	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:98775483_CT_C:98775483:0,0,3,0
chr7	98775485	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:98775483_CT_C:98775483:0,0,3,0
chr7	98779489	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=148,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:1,5:6,1:5,2,3,3
chr7	98779740	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr7	98782508	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr7	98790607	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.599:13:3,4:2,4:5,0,7,1
chr7	98931105	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=144,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:5,3:1,2:0,6,0,7
chr7	98936001	.	ATTTT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=127,219;MMQ=40,53;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=25,21;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr7	98951655	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,184;MMQ=52,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:3,5:3,1,4,4
chr7	98957078	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,18;MFRL=0,246;MMQ=60,44;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:98957078_A_G:98957078:0,0,1,0
chr7	98957086	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,17;MFRL=111,246;MMQ=60,44;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:98957078_A_G:98957078:1,0,1,0
chr7	98957094	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,18;MFRL=147,246;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:98957078_A_G:98957078:2,0,1,0
chr7	98957096	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,17;MFRL=147,246;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:98957078_A_G:98957078:2,0,1,0
chr7	98957101	.	AA	GC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=30,17;MFRL=147,246;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:98957078_A_G:98957078:2,0,1,0
chr7	98957104	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=147,246;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:2,0:0,0:0|1:98957078_A_G:98957078:2,0,1,0
chr7	98991944	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr7	98998012	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=71.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,26:0.574:45:8,13:11,12:8,11,9,17
chr7	99002595	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:5,4:5,2:4,7,2,4
chr7	99014984	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=174,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr7	99015233	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:99015233_T_G:99015233:0,2,0,1
chr7	99015235	.	A	AACTGTTCTTTAGG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:99015233_T_G:99015233:0,2,0,1
chr7	99015263	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	99022785	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.727:8:0,2:1,4:2,0,4,2
chr7	99023246	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr7	99026915	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=189,133;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:99026915_G_A:99026915:0,3,0,1
chr7	99026919	.	A	AGGTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=189,133;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:99026915_G_A:99026915:0,3,0,1
chr7	99026923	.	AGGAT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=189,133;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:99026915_G_A:99026915:0,3,0,1
chr7	99032813	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=134,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,3:0,0:0,1,1,2
chr7	99032874	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	99050039	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.554:12:3,1:2,3:3,2,4,3
chr7	99055940	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=123,155;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:6,2:6,1:10,4,3,0
chr7	99056099	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	99057701	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.408:32:13,7:6,5:12,7,9,4
chr7	99092152	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=166,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,3:5,0:4,2,2,1
chr7	99092194	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:2,1,3,1
chr7	99092352	.	T	TTTTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=220,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTTA;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr7	99118001	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:0,10,0,2
chr7	99161485	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=299,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,4:0,1:2,0,5,0
chr7	99161747	.	T	TCCAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=218,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.316:5:1,1:2,0:0|1:99161747_T_TCCAC:99161747:0,4,0,1
chr7	99161750	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=218,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.316:5:2,1:1,0:0|1:99161747_T_TCCAC:99161747:0,4,0,1
chr7	99217424	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.566:26:6,6:5,7:7,4,6,9
chr7	99219179	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,4:0.096:50:26,1:20,3:23,23,0,4
chr7	99220083	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=179,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,3:1,0:3,0,2,1
chr7	99226981	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=181,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr7	99227172	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:5,3,1,1
chr7	99245914	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=128,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:3,5:9,6:8,4,6,5
chr7	99262835	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.422:43:10,6:15,12:17,8,13,5
chr7	99264741	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0,12,0,2
chr7	99303094	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:5,1:8,4:10,3,6,0
chr7	99314986	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:0,5,0,6
chr7	99315276	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,5:4,6:3,5,1,10
chr7	99332830	.	G	GCCAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=191,256;MMQ=54,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	99361466	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,4:4,5:9,2,7,2
chr7	99361698	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=208,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,1:0|1:99361698_G_A:99361698:0,3,0,1
chr7	99361709	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=239,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:99361698_G_A:99361698:0,2,0,1
chr7	99365943	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=187,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,4:6,1:11,2,4,1
chr7	99447339	.	T	TTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=217,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TC;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:2,2:0,0:0,3,0,2
chr7	99454485	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,1:18,1:10,17,1,1
chr7	99459144	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr7	99473624	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:8,0,5,0
chr7	99474729	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	99501313	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:2,3,1,2
chr7	99514417	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=182,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.529:19:3,7:5,3:1,8,3,7
chr7	99521286	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,6:3,6:0,5,0,12
chr7	99662534	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,60;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:4,15,0,2
chr7	99672941	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=164,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr7	99686615	.	TGGC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=159,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGC;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:11,0,1,1
chr7	99687972	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=157,127;MMQ=41,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.644:6:0,2:2,1:2,0,3,1
chr7	99689385	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=121,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.390:39:16,9:8,6:7,17,7,8
chr7	99691007	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=90,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,2:2,1:5,4,1,2
chr7	99696370	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=168,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,1:7,2:2,9,1,2
chr7	99698790	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr7	99699626	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=87.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,31:0.473:67:13,18:14,11:10,26,4,27
chr7	99701640	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,2,1
chr7	99701881	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr7	99702417	.	G	GCACT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=191,128;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:1,2:7,0:8,0,3,0
chr7	99703505	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:7,1,7,1
chr7	99704124	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=120,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,2:9,0:4,8,1,1
chr7	99704165	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=91,114;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:99704165_T_C:99704165:1,2,0,1
chr7	99704166	.	C	CCAAGCCACCTAGCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=91,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,0:2,1:0|1:99704165_T_C:99704165:1,2,0,1
chr7	99704796	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,1:1,0:2,0,2,0
chr7	99704827	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr7	99707682	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=132,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:3,5:8,2:5,6,3,4
chr7	99707712	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=66,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,4:1,4:1,1,3,5
chr7	99707728	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,2:1,4:3,4,3,3
chr7	99707950	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:1,3,0,3
chr7	99710584	.	A	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=205,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:1,4,0,3
chr7	99711459	.	TCACC	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:3,1:0,0:0|1:99711459_TCACC_T:99711459:2,2,1,0
chr7	99711461	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.808:3:0,1:0,0:0,0,2,1
chr7	99711473	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:99711459_TCACC_T:99711459:2,2,1,0
chr7	99711614	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,4:5,2:7,3,5,1
chr7	99717534	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,43;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:1,5,2,0
chr7	99722419	.	CAGGAGG	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=AGG;STR;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.487:19:1,5:3,4:3,7,5,4
chr7	99755096	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=216,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,0:0,0:0,2,0,5
chr7	99758136	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=82,127;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,6:4,5:5,3,7,4
chr7	99768924	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,19;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.120:31:12,0:13,0:0|1:99768924_T_G:99768924:9,19,3,0
chr7	99768927	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=33,19;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:10,0:12,0:0|1:99768924_T_G:99768924:9,19,3,0
chr7	99768931	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:13,0:0|1:99768924_T_G:99768924:8,16,2,0
chr7	99768939	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.374:24:2,3:12,4:4,11,3,6
chr7	99774607	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:99774607_C_G:99774607:0,0,1,0
chr7	99774608	.	C	CGGGGGGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,12;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:99774607_C_G:99774607:0,0,1,0
chr7	99780282	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.686:10:1,4:1,3:3,0,6,1
chr7	99796057	.	A	G	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=146,147;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=89.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,31:0.464:67:16,12:20,19:24,12,21,10
chr7	99796072	.	T	C	.	.	DP=99;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=136,143;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=108.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,40:0.426:94:24,14:29,24:32,22,24,16
chr7	99797031	.	C	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,20:0.428:47:13,11:14,9:1,26,6,14
chr7	99797807	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,13;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:99797807_T_A:99797807:1,1,1,0
chr7	99797810	.	A	ACC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,13;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=C;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:99797807_T_A:99797807:1,1,1,0
chr7	99797816	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,10;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:99797807_T_A:99797807:1,1,1,0
chr7	99802812	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:2,1,3,2
chr7	99811313	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,171;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:2,4:4,1:6,0,6,0
chr7	99811464	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,2:8,5:6,9,3,4
chr7	99817585	.	G	T	.	.	DP=62;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=137,140;MMQ=57,57;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=98.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,38:0.618:61:15,16:6,19:6,17,11,27
chr7	99818137	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:4,4:0,2:2,2,3,3
chr7	99818374	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:2,2,0,3
chr7	99821381	.	C	G	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=234.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,67:0.986:67:0,40:0,27:0,0,18,49
chr7	99821470	.	A	G	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=229.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,75:0.987:75:0,38:0,36:0,0,54,21
chr7	99917254	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,6:5,4:6,2,9,1
chr7	99956031	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,69;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr7	100001978	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,171;MMQ=24,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr7	100002819	.	GAGTC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	100004394	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=124,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:10,3:9,2:6,13,1,4
chr7	100004446	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,1,17
chr7	100004755	.	T	TTGGATGTCCTCCTCCA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:4,0:2,2:6,0,1,1
chr7	100006965	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr7	100028484	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:4,2:3,5:5,4,4,3
chr7	100030832	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:7,3:0,5:3,4,7,1
chr7	100065527	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:4,4:1,5:4,2,3,6
chr7	100071867	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,13;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:100071867_A_C:100071867:0,1,1,0
chr7	100071869	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=33,13;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0,1,1,0
chr7	100071874	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=29,13;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:100071867_A_C:100071867:0,1,1,0
chr7	100071877	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,12;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:100071867_A_C:100071867:1,1,1,0
chr7	100071882	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,12;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:100071867_A_C:100071867:1,1,1,0
chr7	100071884	.	GA	CC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:100071867_A_C:100071867:1,1,1,0
chr7	100071891	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:100071867_A_C:100071867:3,1,1,0
chr7	100083078	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=124,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:5,11:6,9:1,10,0,20
chr7	100147963	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=156,146;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.221:19:6,0:7,0:0|1:100147963_A_T:100147963:10,5,4,0
chr7	100147970	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=149,142;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.149:22:7,0:10,1:0|1:100147963_A_T:100147963:12,7,3,0
chr7	100175473	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,6,7
chr7	100175505	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=154,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:6,0:5,2:5,7,0,2
chr7	100189618	.	TT	AA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:100189618_TT_AA:100189618:0,4,0,1
chr7	100189619	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=175,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:100189619_T_C:100189619:0,3,0,1
chr7	100189621	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:100189618_TT_AA:100189618:0,4,0,1
chr7	100189622	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:100189619_T_C:100189619:0,4,0,1
chr7	100189624	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:100189618_TT_AA:100189618:0,4,0,1
chr7	100192186	.	C	CAAATCACTAAGCCAATAAAAACA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	100197594	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,12;MFRL=69,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:100197594_A_C:100197594:0,4,1,0
chr7	100197598	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,12;MFRL=69,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:100197594_A_C:100197594:0,4,1,0
chr7	100197866	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.768:24:3,12:2,6:0,5,4,15
chr7	100198609	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=271,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100198609_G_A:100198609:0,1,0,1
chr7	100198611	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,16;MFRL=271,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:100198609_G_A:100198609:0,1,0,1
chr7	100200275	.	C	CACAAATATTTCCATAAAACAAATGATACA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr7	100201230	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=17,30;MFRL=97,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:0,1:1,1:0,5,0,2
chr7	100201247	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=99,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr7	100202682	.	C	CCCCCCCCCCCCCTACACTCG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=154,212;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.360:6:1,1:3,1:0,4,2,0
chr7	100212388	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:0,2:5,0:6,0,2,0
chr7	100225031	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,2:6,5:5,5,4,3
chr7	100225797	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=132,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.426:5:2,0:1,1:0|1:100225797_A_C:100225797:0,3,2,0
chr7	100225803	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=66,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,0:1,1:0|1:100225797_A_C:100225797:0,4,2,0
chr7	100225806	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=66,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,0:1,0:0|1:100225797_A_C:100225797:0,4,2,0
chr7	100230864	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:4,2:4,5:6,2,6,1
chr7	100239046	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:5,2:4,0:7,3,2,0
chr7	100240771	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr7	100273961	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,25;MFRL=107,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.436:21:3,6:9,3:4,8,4,5
chr7	100276112	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,0:9,4:9,7,0,4
chr7	100280896	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr7	100281685	.	AGCTGCT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=179,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=GCT;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:0,0:3,1:3,0,1,0
chr7	100282538	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,2:0,3,5,0
chr7	100282591	.	TTGAGCTGGGGCC	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,3:2,3:3,2,6,0
chr7	100284246	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=258,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr7	100284510	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=42.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,6:0,0,5,9
chr7	100284913	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.933:12:0,8:0,0:0,0,12,0
chr7	100285688	.	C	CAGACTCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:3,0,0,1
chr7	100285812	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=152,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:3,5:9,4:7,5,8,3
chr7	100285888	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=107,138;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,2:1,6:2,1,6,2
chr7	100285974	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,1:0,6:0,0,0,8
chr7	100319340	.	C	CAGCTGTTTCTGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=209,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100319340_C_CAGCTGTTTCTGCA:100319340:0,1,0,1
chr7	100319343	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=209,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100319340_C_CAGCTGTTTCTGCA:100319340:0,1,0,1
chr7	100320759	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.621:24:4,7:4,8:0,9,6,9
chr7	100344359	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=61,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.604:8:0,1:3,4:2,1,0,5
chr7	100345106	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=130,89;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,5:3,0:5,1,5,0
chr7	100346111	.	C	CTTTAGTAGTCAGGATAGGCCAAGTTAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=121,83;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr7	100348428	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=120,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:0|1:100348428_C_CA:100348428:4,4,1,1
chr7	100348432	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=120,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:100348428_C_CA:100348428:4,4,1,1
chr7	100357289	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr7	100359797	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=126,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,1:2,1:6,4,2,0
chr7	100361391	.	G	GC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.475:21:5,6:6,4:2,9,7,3
chr7	100361580	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:3,1,0,3
chr7	100363243	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:100363243_C_T:100363243:0,3,0,1
chr7	100363244	.	CTGCA	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,34;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:100363243_C_T:100363243:0,3,0,1
chr7	100363250	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:100363243_C_T:100363243:0,3,0,1
chr7	100363252	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:100363243_C_T:100363243:0,3,0,1
chr7	100363277	.	T	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	100364105	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,2:1,1:2,0,3,0
chr7	100364954	.	C	CTACTTCTGAAGTTGGT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	100365567	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=132,121;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:4,4:1,3:2,3,4,3
chr7	100365613	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,1,1
chr7	100366203	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,4:6,6:6,6,8,2
chr7	100366381	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.440:9:2,0:1,0:0|1:100366381_T_G:100366381:0,5,0,4
chr7	100366387	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.440:9:2,0:1,1:0|1:100366381_T_G:100366381:0,5,0,4
chr7	100369381	.	G	GTTTTAAGACATTTAAAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr7	100371474	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,19:0.645:29:5,8:5,11:0|1:100371474_G_A:100371474:4,6,6,13
chr7	100371476	.	T	TG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=129,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=79.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,20:0.656:30:5,7:5,11:0|1:100371474_G_A:100371474:4,6,6,14
chr7	100373271	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr7	100383815	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=181,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr7	100385532	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:5,2:4,2:4,6,2,2
chr7	100385536	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,2:7,0:0|1:100385536_C_A:100385536:5,7,1,1
chr7	100385537	.	G	GAAAAATGGTATAAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=145,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,2:6,0:0|1:100385536_C_A:100385536:5,7,1,1
chr7	100386812	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=124,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,2:5,4:5,4,3,3
chr7	100386900	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,13,4
chr7	100388741	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	100389928	.	GA	TT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=224,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr7	100390235	.	CACCA	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=198,250;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100390235_CACCA_C:100390235:0,1,0,1
chr7	100390242	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=198,250;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:100390235_CACCA_C:100390235:0,1,0,1
chr7	100390261	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100390261_G_C:100390261:0,0,0,1
chr7	100390264	.	T	TCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100390261_G_C:100390261:0,0,0,1
chr7	100391644	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr7	100391858	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=121,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:2,3,0,4
chr7	100395117	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=125,0;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:7,0,0,2
chr7	100395422	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=274,206;MMQ=60,30;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100395422_CA_TG:100395422:0,1,0,1
chr7	100395425	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=274,206;MMQ=60,30;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100395422_CA_TG:100395422:0,1,0,1
chr7	100395429	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=274,206;MMQ=60,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:100395422_CA_TG:100395422:0,1,0,1
chr7	100395431	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=223,206;MMQ=60,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:100395422_CA_TG:100395422:0,1,0,1
chr7	100395439	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=223,206;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100395422_CA_TG:100395422:0,1,0,1
chr7	100401270	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr7	100456605	.	G	GTGCATTCAACGAGTCCTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.253:6:2,1:2,0:1,4,0,1
chr7	100459585	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.453:11:4,4:2,1:1,5,0,5
chr7	100465243	.	G	GCTTACAACTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=227,944;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100465243_G_GCTTACAACTTC:100465243:0,1,1,0
chr7	100465245	.	G	GGCCTGCGTTTCTCCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=227,944;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100465243_G_GCTTACAACTTC:100465243:0,1,1,0
chr7	100465248	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=227,944;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:100465243_G_GCTTACAACTTC:100465243:0,1,1,0
chr7	100466091	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=126,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:7,0:8,4:9,7,3,1
chr7	100467975	.	C	CCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,3:0,0,9,3
chr7	100470435	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=191,139;MMQ=60,58;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr7	100479008	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.732:13:2,5:1,3:1,2,2,8
chr7	100481906	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,12;MFRL=106,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.567:7:1,0:0,0:0,3,0,4
chr7	100482222	.	G	GCAAT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:0|1:100482222_G_GCAAT:100482222:0,1,0,1
chr7	100482223	.	G	GA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:100482222_G_GCAAT:100482222:0,1,0,1
chr7	100482227	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100482222_G_GCAAT:100482222:0,0,0,1
chr7	100485620	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R